ИНСЕКТИЦИДНЫЕ БЕЛКИ И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ Российский патент 2021 года по МПК A01H1/00 A01H5/00 C07H21/04 

ССЫЛКА НА ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ, ПРЕДСТАВЛЕННЫЙ В ЭЛЕКТРОННОМ ВИДЕ

Перечень последовательностей с названием файла "5914-PCT_seq_list.txt", созданный 19 ноября 2015 года, и размером 542 килобайта подается в машиночитаемой форме одновременно с настоящим описанием. Перечень последовательностей является частью настоящего описания и в полном объеме включен в данный документ с помощью ссылки.

Государственная поддержка

Государство имеет определенные права на настоящее изобретение в соответствии с соглашением № LB09005376.

ОБЛАСТЬ

Настоящее раскрытие относится к области молекулярной биологии. Предусматриваются новые гены, которые кодируют пестицидные белки. Эти пестицидные белки и последовательности нуклеиновой кислоты, которые их кодируют, применимы в приготовлении пестицидных составов и в получении трансгенных растений, устойчивых к вредителям.

ПРЕДПОСЫЛКИ

Биологический контроль насекомых-вредителей, имеющих сельскохозяйственное значение, с применением микробного агента, такого как грибы, бактерии или другие виды насекомых, представляет не оказывающую отрицательного влияния на окружающую среду и коммерчески привлекательную альтернативу синтетическим химическим пестицидам. В целом можно сказать, что применение биопестицидов приводит к меньшему риску загрязнения и неблагоприятных воздействий на окружающую среду, и биопестициды обеспечивают большую специфичность по отношению к мишени, чем та, которая характерна для традиционных химических инсектицидов широкого спектра действия. Кроме того, зачастую производство биопестицидов стоит дешевле, и, вследствие этого, улучшается экономически эффективный выход продукции для широкого спектра сельскохозяйственных культур.

Как известно, определенные виды микроорганизмов рода Bacillus обладают пестицидной активностью в отношении ряда насекомых-вредителей, в том числе Lepidoptera, Diptera, Coleoptera, Hemiptera и других. Bacillus thuringiensis (Bt) и Bacillus popilliae входят в число наиболее успешных средств биологического контроля, обнаруженных на сегодняшний день. Патогенность в отношении насекомых также приписывалась штаммам B. larvae, B. lentimorbus, B. sphaericus и B. cereus. Микробные инсектициды, в частности полученные из штаммов Bacillus, сыграли важную роль в сельском хозяйстве как альтернатива химическому контролю вредителей.

Были разработаны культурные растения с улучшенной устойчивостью к насекомым с помощью генной инженерии культурных растений для выработки пестицидных белков Bacillus. Например, с помощью генной инженерии были разработаны растения кукурузы и хлопчатника для выработки пестицидных белков, выделенных из штаммов Bt. Данные сельскохозяйственные культуры, разработанные с помощью генной инженерии, в настоящее время широко применяются в сельском хозяйстве и предоставляют фермеру не оказывающую отрицательного влияния на окружающую среду альтернативу традиционным способам контроля насекомых. В то время как они были признаны коммерчески очень успешными, данные разработанные с помощью генной инженерии устойчивые к насекомым культурные растения обеспечивают устойчивость только к узкому диапазону экономически важных насекомых-вредителей. В некоторых случаях насекомые могут развивать устойчивость к различным инсектицидным соединениям, что повышает необходимость в установлении альтернативных биологических средств контроля для контроля вредителей.

Соответственно, остается необходимость в новых пестицидных белках с различными диапазонами инсектицидной активности в отношении насекомых-вредителей, например инсектицидных белках, которые активны в отношении ряда насекомых из отряда Lepidoptera и отряда Coleoptera, в том числе без ограничения насекомых-вредителей, которые развили устойчивость к существующим инсектицидам.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ

Предусматриваются композиции и способы обеспечения пестицидной активности у бактерий, растений, растительных клеток, тканей и семян. Композиции включают молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие последовательности пестицидных и инсектицидных полипептидов, векторы, содержащие такие молекулы нуклеиновой кислоты, и клетки-хозяева, содержащие векторы. Композиции также включают последовательности пестицидных полипептидов и антитела к таким полипептидам. Последовательности нуклеиновой кислоты можно применять в ДНК-конструкциях или кассетах экспрессии для трансформации и экспрессии в организмах, в том числе микроорганизмах и растениях. Нуклеотидные или аминокислотные последовательности могут представлять собой синтетические последовательности, которые были сконструированы для экспрессии в организме, в том числе без ограничения микроорганизме или растении. Композиции также содержат трансформированные бактерии, растения, растительные клетки, ткани и семена.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-45-1 Pseudomonas (PIP-45-1), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-45-1. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-45-2 Pseudomonas (PIP-45-2), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-45-2. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-64-1 Pseudomonas (PIP-64-1), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-64-1. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-64-2 Pseudomonas (PIP-64-2), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-64-2. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-74-1 Pseudomonas (PIP-74-1), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-74-1. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-74-1 с SEQ ID NO: 73, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-74-1 с SEQ ID NO: 73, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-74-2 Pseudomonas (PIP-74-2), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-74-2. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-74-2 с SEQ ID NO: 74, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-74-2 с SEQ ID NO: 74, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-75 Pseudomonas (PIP-75), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-75. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-75 с SEQ ID NO: 79, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-75 с SEQ ID NO: 79, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

В частности, предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, кодирующие полипептиды, инсектицидный белок-77 Pseudomonas (PIP-77), в том числе аминокислотные замены, делеции, вставки и их фрагменты и их комбинации. Дополнительно, охватываются аминокислотные последовательности, соответствующие полипептидам PIP-77. Предусматриваются выделенные или рекомбинантные молекулы нуклеиновой кислоты, способные кодировать полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации. Также охватываются последовательности нуклеиновой кислоты, которые комплементарны последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или которые гибридизуются с последовательностью согласно вариантам осуществления. Также предусматриваются выделенные или рекомбинантные полипептиды PIP-77 с SEQ ID NO: 88, а также аминокислотные замены, делеции, вставки, их фрагменты и их комбинации.

Предусматриваются способы получения инсектицидных полипептидов и применения данных полипептидов для контроля или уничтожения вредителей из группы чешуекрылых, жесткокрылых, нематод, грибков и/или двукрылых. Трансгенные растения согласно вариантам осуществления экспрессируют одну или несколько пестицидных последовательностей, раскрытых в данном документе. В различных вариантах осуществления трансгенное растение дополнительно содержит один или несколько дополнительных генов для устойчивости к насекомым, например один или несколько дополнительных генов для контроля вредителей из группы жесткокрылых, чешуекрылых, полужесткокрылых или нематод. Специалисту в данной области будет понятно, что трансгенное растение может содержать какой-либо ген, обеспечивающий агрономический признак, представляющий интерес.

Также включены способы выявления нуклеиновых кислот и полипептидов согласно вариантам осуществления в образце. Предусматривается набор для выявления присутствия инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию или выявления присутствия нуклеотидной последовательности, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию в образце. Набор может предусматриваться вместе со всеми реагентами и контрольными образцами, необходимыми для осуществления способа выявления предполагаемого средства, а также с инструкциями по применению.

Композиции и способы согласно вариантам осуществления применимы для получения организмов с улучшенной устойчивостью к вредителям или переносимостью их. Эти организмы и композиции, содержащие организмы, подходят для сельскохозяйственных целей. Композиции согласно вариантам осуществления также применимы для получения измененных или улучшенных белков, которые обладают пестицидной активностью, или для выявления присутствия инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию или нуклеиновых кислот, кодирующих таковые в продуктах или организмах.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ГРАФИЧЕСКИХ МАТЕРИАЛОВ

На фигурах 1a-1m показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-45Aa-1 (SEQ ID NO: 1), PIP-45Ab-1 (SEQ ID NO: 3), PIP-45Ac-1 (SEQ ID NO: 5), PIP-45Ad-1 (SEQ ID NO: 7), PIP-45Ae-1 (SEQ ID NO: 9), PIP-45Af-1 (SEQ ID NO: 11), PIP-45Ba-1 (SEQ ID NO: 13), PIP-45Bb-1 (SEQ ID NO: 15), PIP-45Bc-1 (SEQ ID NO: 17), PIP-45Bd-1 (SEQ ID NO: 19), PIP-45Be-1 (SEQ ID NO: 21), PIP-45Bf-1 (SEQ ID NO: 23), PIP-45Bg-1 (SEQ ID NO: 25), PIP-45Bh-1 (SEQ ID NO: 27), PIP-45Bi-1 (SEQ ID NO: 29), PIP-45Bj-1 (SEQ ID NO: 31), PIP-45Bk-1 (SEQ ID NO: 33), PIP-45Bl-1 (SEQ ID NO: 232), PIP-45Bm-1 (SEQ ID NO: 234), PIP-45Ca-1 (SEQ ID NO: 35), PIP-45Cb-1 (SEQ ID NO: 37), PIP-45Cc-1 (SEQ ID NO: 39), PIP-45Cd-1 (SEQ ID NO: 41), PIP-45Ce-1 (SEQ ID NO: 43), PIP-45Cf-1 (SEQ ID NO: 236), PIP-45Da-1 (SEQ ID NO: 45), PIP-45Db-1 (SEQ ID NO: 47), PIP-45Ea-1 (SEQ ID NO: 49), и PIP-45Ga-1 (SEQ ID NO: 51). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-45-1 показано штриховкой.

На фигурах 2a-2l показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-45Aa-2 (SEQ ID NO: 2), PIP-45Ab-2 (SEQ ID NO: 4), PIP-45Ac-2 (SEQ ID NO: 6), PIP-45Ad-2 (SEQ ID NO: 8), PIP-45Ae-2 (SEQ ID NO: 10), PIP-45Af-2 (SEQ ID NO: 12), PIP-45Ba-2 (SEQ ID NO: 14), PIP-45Bb-2 (SEQ ID NO: 16), PIP-45Bc-2 (SEQ ID NO: 18), PIP-45Bd-2 (SEQ ID NO: 20), PIP-45Be-2 (SEQ ID NO: 22), PIP-45Bf-2 (SEQ ID NO: 24), PIP-45Bg-2 (SEQ ID NO: 26), PIP-45Bh-2 (SEQ ID NO: 28), PIP-45Bi-2 (SEQ ID NO: 30), PIP-45Bj-2 (SEQ ID NO: 32), PIP-45Bk-2 (SEQ ID NO: 34), PIP-45Bl-2 (SEQ ID NO: 233), PIP-45Bm-2 (SEQ ID NO: 235), PIP-45Ca-2 (SEQ ID NO: 36), PIP-45Cb-2 (SEQ ID NO: 38), PIP-45Cc-2 (SEQ ID NO: 40), PIP-45Cd-2 (SEQ ID NO: 42), PIP-45Ce-2 (SEQ ID NO: 44), PIP-45Cf-2 (SEQ ID NO: 237), PIP-45Da-2 (SEQ ID NO: 46), PIP-45Db-2 (SEQ ID NO: 48), PIP-45Ea-2 (SEQ ID NO: 50), и PIP-45Ga-2 (SEQ ID NO: 52). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-45-2 показано штриховкой.

На фигурах 3a-3b показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-64Aa-1 (SEQ ID NO: 53), PIP-64Ba-1 (SEQ ID NO: 238), PIP-64Ca-1 (SEQ ID NO: 56), PIP-64Ea-1 (SEQ ID NO: 58), PIP-64Eb-1 (SEQ ID NO: 60), PIP-64Ec-1 (SEQ ID NO: 62), PIP-64Ga-1 (SEQ ID NO: 64), PIP-64Ha-1 (SEQ ID NO: 65), PIP-64Hb-1 (SEQ ID NO: 67), PIP-64Hc-1 (SEQ ID NO: 69), и PIP-64Hd-1 (SEQ ID NO: 71). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-64-1 показано штриховкой.

На фигурах 4a-4b показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-64Aa-2 (SEQ ID NO: 54), PIP-64Ab-2 (SEQ ID NO: 55), PIP-64Ba-2 (SEQ ID NO: 239), PIP-64Ca-2 (SEQ ID NO: 57), PIP-64Ea-2 (SEQ ID NO: 59), PIP-64Eb-2 (SEQ ID NO: 61), PIP-64Ec-2 (SEQ ID NO: 63), PIP-64Ha-2 (SEQ ID NO: 66), PIP-64Hb-2 (SEQ ID NO: 68), PIP-64Hc-2 (SEQ ID NO: 70), и PIP-64Hd-2 (SEQ ID NO: 72). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-64-2 показано штриховкой.

На фигурах 5a-5b показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-74Aa-1 (SEQ ID NO: 73), PIP-74Ab-1 (SEQ ID NO: 75), и PIP-74Ca-1 (SEQ ID NO: 77). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-74-1 показано штриховкой.

На фигуре 6 показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-74Aa-2 (SEQ ID NO: 74), PIP-74Ab-2 (SEQ ID NO: 76), и PIP-74Ca-2 (SEQ ID NO: 78). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-74-2 показано штриховкой.

На фигуре 7 показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-75Aa (SEQ ID NO: 79), PIP-75Ba (SEQ ID NO: 80), PIP-75Da (SEQ ID NO: 81), PIP-75Ea (SEQ ID NO: 82), PIP-75Ga (SEQ ID NO: 83), PIP-75Gb (SEQ ID NO: 84), PIP-75Gc (SEQ ID NO: 85), PIP-75Gd (SEQ ID NO: 86), PIP-75Ge (SEQ ID NO: 87). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-75 показано штриховкой.

На фигурах 8a-8b показано выравнивание аминокислотных последовательностей PIP-77Aa (SEQ ID NO: 88, PIP-77Ab (SEQ ID NO: 89), PIP-77Ac (SEQ ID NO: 90), PIP-77Ad (SEQ ID NO: 91), PIP-77Ae (SEQ ID NO: 92), PIP-77Af (SEQ ID NO: 240), PIP-77Ba (SEQ ID NO: 93), PIP-77Bb (SEQ ID NO: 94), PIP-77Bc (SEQ ID NO: 95), PIP-77Bd (SEQ ID NO: 96), PIP-77Be (SEQ ID NO: 97), PIP-77Bf (SEQ ID NO: 98), PIP-77Bg (SEQ ID NO: 99), PIP-77Bh (SEQ ID NO: 241), PIP-77Bi (SEQ ID NO: 242), PIP-77Ca (SEQ ID NO: 100), PIP-77Ea (SEQ ID NO: 101), PIP-77Eb (SEQ ID NO: 102), PIP-77Ec (SEQ ID NO: 103), PIP-77Ed (SEQ ID NO: 104), PIP-77Ee (SEQ ID NO: 105), PIP-77Ef (SEQ ID NO: 106), PIP-77Eg (SEQ ID NO: 107), PIP-77Eh (SEQ ID NO: 243), PIP-77Ei (SEQ ID NO: 244), и PIP-77Ej (SEQ ID NO: 245). Несходство аминокислот между гомологами полипептидов PIP-77 показано штриховкой.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ

Следует понимать, что настоящее раскрытие не ограничивается конкретными описанными методиками, протоколами, клеточными линиями, родами и реагентами, в связи с этим они могут варьировать. Также следует понимать, что терминология, используемая в данном документе, предназначена лишь для описания конкретных вариантов осуществления и не подразумевается как ограничивающая объем настоящего раскрытия.

Используемая в данном документе форма единственного числа включает ссылки на множественное число, если контекст явно не указывает иное. Так, например, ссылка на "клетку" включает множество таких клеток, и ссылка на "белок" включает ссылку на один или несколько белков или их эквивалентов, известных специалистам в данной области, и т. д. Все технические и научные термины, используемые в данном документе, имеют то же значение, как обычно понимается специалистом обычной квалификации в данной области, к которой принадлежит настоящее раскрытие, если явно не указано иное.

Настоящее раскрытие представляет композиции и способы для контроля вредителей. Способы включают трансформацию организмов последовательностями нуклеиновой кислоты, кодирующими инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. В частности, последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления применимы для получения растений и микроорганизмов, которые обладают пестицидной активностью. Таким образом, предусматриваются трансформированные бактерии, растения, растительные клетки, растительные ткани и семена. Композиции представляют собой пестицидные нуклеиновые кислоты и белки из видов бактерий. Последовательности нуклеиновой кислоты находят применение в конструировании векторов экспрессии для последующей трансформации организмов, представляющих интерес, в качестве зондов для выделения других гомологичных (или частично гомологичных) генов и для образования измененных инсектицидных полипептидов с помощью способов, известных в уровне техники, таких как сайт-направленный мутагенез, замена доменов или ДНК-шаффлинг. Инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию находят применение при контроле или уничтожении популяций вредителей из группы чешуекрылых, жесткокрылых, двукрылых, грибов, полужесткокрылых и нематод и при получении композиций с пестицидной активностью. Насекомые-вредители, представляющие интерес, включают без ограничения виды из отряда Lepidoptera, в том числе без ограничения моль капустную, например Helicoverpa zea Boddie; соевую совку, например Pseudoplusia includens Walker, и гусеницу ночницы, питающуюся бархатными бобами, например Anticarsia gemmatalis Hübner, и виды из отряда Coleoptera, в том числе без ограничения западного кукурузного жука (Diabrotica virgifera) - WCRW, блошку одиннадцатиточечную Говарда (Diabrotica undecimpunctata howardi) -SCRW и северного кукурузного жука (Diabrotica barberi) - NCRW.

Под "пестицидным токсином" или "пестицидным белком", используемым в данном документе, подразумевают токсин, который характеризуется токсической активностью в отношении одного или нескольких вредителей, в том числе без ограничения представителей отрядов Lepidoptera, Diptera, Hemiptera и Coleoptera или типа Nematoda, или белок, который характеризуется гомологией с таким белком. Пестицидные белки были выделены из организмов, в том числе, например, Bacillus sp., Pseudomonas sp., Photorhabdus sp., Xenorhabdus sp., Clostridium bifermentans и Paenibacillus popilliae. Пестицидные белки включают без ограничения инсектицидные белки из Pseudomonas sp., такие как PSEEN3174 (Monalysin; (2011) PLoS Pathogens 7:1-13); из штамма CHA0 и Pf-5 Pseudomonas protegens (ранее fluorescens) (Pechy-Tarr, (2008) Environmental Microbiology 10:2368-2386; № доступа в GenBank EU400157); из Pseudomonas Taiwanensis (Liu, et al., (2010) J. Agric. Food Chem. 58:12343-12349) и из Pseudomonas pseudoalcligenes (Zhang, et al., (2009) Annals of Microbiology 59:45-50 и Li, et al., (2007) Plant Cell Tiss. Organ Cult. 89:159-168); инсектицидные белки из Photorhabdus sp. и Xenorhabdus sp. (Hinchliffe, et al., (2010) The Open Toxicology Journal 3:101-118 и Morgan, et al., (2001) Applied and Envir. Micro. 67:2062-2069); патент США № 6048838 и патент США № 6379946; полипептид PIP-1 из патентной публикации США № US2014-0007292A1; полипептид(-ы) AfIP-1A и/или AfIP-1B из патентной публикации США № US2014-0033361; полипептиды PHI-4 из патентного документа США с серийным № 13/839702; полипептиды PIP-47 из публикации согласно PCT с серийным № PCT/US14/51063; полипептид PHI-4 из патентной публикации США US20140274885 или патентной публикации согласно PCT WO2014/150914; полипептид PIP-72 из публикации согласно PCT с серийным № PCT/US14/55128; инсектицидные белки из патентных документов США с серийными №№ 61/863761 и 61/863763 и δ-эндотоксины, в том числе без ограничения: классы Cry1, Cry2, Cry3, Cry4, Cry5, Cry6, Cry7, Cry8, Cry9, Cry10, Cry11, Cry12, Cry13, Cry14, Cry15, Cry16, Cry17, Cry18, Cry19, Cry20, Cry21, Cry22, Cry23, Cry24, Cry25, Cry26, Cry27, Cry28, Cry29, Cry30, Cry31, Cry32, Cry33, Cry34, Cry35, Cry36, Cry37, Cry38, Cry39, Cry40, Cry41, Cry42, Cry43, Cry44, Cry45, Cry 46, Cry47, Cry49, Cry 51, Cry52, Cry 53, Cry 54, Cry55, Cry56, Cry57, Cry58, Cry59, Cry60, Cry61, Cry62, Cry63, Cry64, Cry65, Cry66, Cry67, Cry68, Cry69, Cry70, Cry71 и Cry72 генов δ-эндотоксинов и цитолитические гены cyt1 и cyt2 B. thuringiensis. Представители этих классов инсектицидных белков B. thuringiensis включают без ограничения Cry1Aa1 (№ доступа AAA22353); Cry1Aa2 (№ доступа № доступа AAA22552); Cry1Aa3 (№ доступа BAA00257); Cry1Aa4 (№ доступа CAA31886); Cry1Aa5 (№ доступа BAA04468); Cry1Aa6 (№ доступа AAA86265); Cry1Aa7 (№ доступа AAD46139); Cry1Aa8 (№ доступа I26149); Cry1Aa9 (№ доступа BAA77213); Cry1Aa10 (№ доступа AAD55382); Cry1Aa11 (№ доступа CAA70856); Cry1Aa12 (№ доступа AAP80146); Cry1Aa13 (№ доступа AAM44305); Cry1Aa14 (№ доступа AAP40639); Cry1Aa15 (№ доступа AAY66993); Cry1Aa16 (№ доступа HQ439776); Cry1Aa17 (№ доступа HQ439788); Cry1Aa18 (№ доступа HQ439790); Cry1Aa19 (№ доступа HQ685121); Cry1Aa20 (№ доступа JF340156); Cry1Aa21 (№ доступа JN651496); Cry1Aa22 (№ доступа KC158223); Cry1Ab1 (№ доступа AAA22330); Cry1Ab2 (№ доступа AAA22613); Cry1Ab3 (№ доступа AAA22561); Cry1Ab4 (№ доступа BAA00071 ); Cry1Ab5 (№ доступа CAA28405); Cry1Ab6 (№ доступа AAA22420); Cry1Ab7 (№ доступа CAA31620); Cry1Ab8 (№ доступа AAA22551); Cry1Ab9 (№ доступа CAA38701); Cry1Ab10 (№ доступа A29125); Cry1Ab11 (№ доступа I12419); Cry1Ab12 (№ доступа AAC64003); Cry1Ab13 (№ доступа AAN76494); Cry1Ab14 (№ доступа AAG16877); Cry1Ab15 (№ доступа AAO13302); Cry1Ab16 (№ доступа AAK55546); Cry1Ab17 (№ доступа AAT46415); Cry1Ab18 (№ доступа AAQ88259); Cry1Ab19 (№ доступа AAW31761); Cry1Ab20 (№ доступа ABB72460); Cry1Ab21 (№ доступа ABS18384); Cry1Ab22 (№ доступа ABW87320); Cry1Ab23 (№ доступа HQ439777); Cry1Ab24 (№ доступа HQ439778); Cry1Ab25 (№ доступа HQ685122); Cry1Ab26 (№ доступа HQ847729); Cry1Ab27 (№ доступа JN135249); Cry1Ab28 (№ доступа JN135250); Cry1Ab29 (№ доступа JN135251); Cry1Ab30 (№ доступа JN135252); Cry1Ab31 (№ доступа JN135253); Cry1Ab32 (№ доступа JN135254); Cry1Ab33 (№ доступа AAS93798); Cry1Ab34 (№ доступа KC156668); Cry1Ab-подобный (№ доступа AAK14336); Cry1Ab-подобный (№ доступа AAK14337); Cry1Ab-подобный (№ доступа AAK14338); Cry1Ab-подобный (№ доступа ABG88858); Cry1Ac1 (№ доступа AAA22331); Cry1Ac2 (№ доступа AAA22338); Cry1Ac3 (№ доступа CAA38098); Cry1Ac4 (№ доступа AAA73077); Cry1Ac5 (№ доступа AAA22339); Cry1Ac6 (№ доступа AAA86266); Cry1Ac7 (№ доступа AAB46989); Cry1Ac8 (№ доступа AAC44841); Cry1Ac9 (№ доступа AAB49768); Cry1Ac10 (№ доступа CAA05505 ); Cry1Ac11 (№ доступа CAA10270); Cry1Ac12 (№ доступа I12418); Cry1Ac13 (№ доступа AAD38701); Cry1Ac14 (№ доступа AAQ06607); Cry1Ac15 (№ доступа AAN07788); Cry1Ac16 (№ доступа AAU87037); Cry1Ac17 (№ доступа AAX18704); Cry1Ac18 (№ доступа AAY88347); Cry1Ac19 (№ доступа ABD37053); Cry1Ac20 (№ доступа ABB89046 ); Cry1Ac21 (№ доступа AAY66992 ); Cry1Ac22 (№ доступа ABZ01836); Cry1Ac23 (№ доступа CAQ30431); Cry1Ac24 (№ доступа ABL01535); Cry1Ac25 (№ доступа FJ513324); Cry1Ac26 (№ доступа FJ617446); Cry1Ac27 (№ доступа FJ617447); Cry1Ac28 (№ доступа ACM90319); Cry1Ac29 (№ доступа DQ438941); Cry1Ac30 (№ доступа GQ227507); Cry1Ac31 (№ доступа GU446674); Cry1Ac32 (№ доступа HM061081); Cry1Ac33 (№ доступа GQ866913); Cry1Ac34 (№ доступа HQ230364); Cry1Ac35 (№ доступа JF340157); Cry1Ac36 (№ доступа JN387137); Cry1Ac37 (№ доступа JQ317685); Cry1Ad1 (№ доступа AAA22340); Cry1Ad2 (№ доступа CAA01880); Cry1Ae1 (№ доступа AAA22410); Cry1Af1 (№ доступа AAB82749); Cry1Ag1 (№ доступа AAD46137); Cry1Ah1 (№ доступа AAQ14326); Cry1Ah2 (№ доступа ABB76664); Cry1Ah3 (№ доступа HQ439779); Cry1Ai1 (№ доступа AAO39719); Cry1Ai2 (№ доступа HQ439780); Cry1A-подобный (№ доступа AAK14339); Cry1Ba1 (№ доступа CAA29898); Cry1Ba2 (№ доступа CAA65003); Cry1Ba3 (№ доступа AAK63251); Cry1Ba4 (№ доступа AAK51084); Cry1Ba5 (№ доступа ABO20894); Cry1Ba6 (№ доступа ABL60921); Cry1Ba7 (№ доступа HQ439781); Cry1Bb1 (№ доступа AAA22344); Cry1Bb2 (№ доступа HQ439782); Cry1Bc1 (№ доступа CAA86568); Cry1Bd1 (№ доступа AAD10292); Cry1Bd2 (№ доступа AAM93496); Cry1Be1 (№ доступа AAC32850); Cry1Be2 (№ доступа AAQ52387); Cry1Be3 (№ доступа ACV96720); Cry1Be4 (№ доступа HM070026); Cry1Bf1 (№ доступа CAC50778); Cry1Bf2 (№ доступа AAQ52380); Cry1Bg1 (№ доступа AAO39720); Cry1Bh1 (№ доступа HQ589331); Cry1Bi1 (№ доступа KC156700); Cry1Ca1 (№ доступа CAA30396); Cry1Ca2 (№ доступа CAA31951); Cry1Ca3 (№ доступа AAA22343); Cry1Ca4 (№ доступа CAA01886); Cry1Ca5 (№ доступа CAA65457); Cry1Ca6 [1] (№ доступа AAF37224 ); Cry1Ca7 (№ доступа AAG50438); Cry1Ca8 (№ доступа AAM00264); Cry1Ca9 (№ доступа AAL79362); Cry1Ca10 (№ доступа AAN16462); Cry1Ca11 (№ доступа AAX53094); Cry1Ca12 (№ доступа HM070027); Cry1Ca13 (№ доступа HQ412621); Cry1Ca14 (№ доступа JN651493); Cry1Cb1 (№ доступа M97880); Cry1Cb2 (№ доступа AAG35409); Cry1Cb3 (№ доступа ACD50894 ); Cry1Cb-подобный (№ доступа AAX63901); Cry1Da1 (№ доступа CAA38099); Cry1Da2 (№ доступа I76415); Cry1Da3 (№ доступа HQ439784); Cry1Db1 (№ доступа CAA80234 ); Cry1Db2 (№ доступа AAK48937 ); Cry1Dc1 (№ доступа ABK35074); Cry1Ea1 (№ доступа CAA37933); Cry1Ea2 (№ доступа CAA39609); Cry1Ea3 (№ доступа AAA22345); Cry1Ea4 (№ доступа AAD04732); Cry1Ea5 (№ доступа A15535); Cry1Ea6 (№ доступа AAL50330); Cry1Ea7 (№ доступа AAW72936); Cry1Ea8 (№ доступа ABX11258); Cry1Ea9 (№ доступа HQ439785); Cry1Ea10 (№ доступа ADR00398); Cry1Ea11 (№ доступа JQ652456); Cry1Eb1 (№ доступа AAA22346); Cry1Fa1 (№ доступа AAA22348); Cry1Fa2 (№ доступа AAA22347); Cry1Fa3 (№ доступа HM070028); Cry1Fa4 (№ доступа HM439638); Cry1Fb1 (№ доступа CAA80235); Cry1Fb2 (№ доступа BAA25298); Cry1Fb3 (№ доступа AAF21767); Cry1Fb4 (№ доступа AAC10641); Cry1Fb5 (№ доступа AAO13295); Cry1Fb6 (№ доступа ACD50892); Cry1Fb7 (№ доступа ACD50893); Cry1Ga1 (№ доступа CAA80233); Cry1Ga2 (№ доступа CAA70506); Cry1Gb1 (№ доступа AAD10291); Cry1Gb2 (№ доступа AAO13756); Cry1Gc1 (№ доступа AAQ52381); Cry1Ha1 (№ доступа CAA80236); Cry1Hb1 (№ доступа AAA79694); Cry1Hb2 (№ доступа HQ439786); Cry1H-подобный (№ доступа AAF01213); Cry1Ia1 (№ доступа CAA44633); Cry1Ia2 (№ доступа AAA22354); Cry1Ia3 (№ доступа AAC36999); Cry1Ia4 (№ доступа AAB00958); Cry1Ia5 (№ доступа CAA70124); Cry1Ia6 (№ доступа AAC26910); Cry1Ia7 (№ доступа AAM73516); Cry1Ia8 (№ доступа AAK66742); Cry1Ia9 (№ доступа AAQ08616); Cry1Ia10 (№ доступа AAP86782); Cry1Ia11 (№ доступа CAC85964 ); Cry1Ia12 (№ доступа AAV53390); Cry1Ia13 (№ доступа ABF83202); Cry1Ia14 (№ доступа ACG63871); Cry1Ia15 (№ доступа FJ617445); Cry1Ia16 (№ доступа FJ617448); Cry1Ia17 (№ доступа GU989199); Cry1Ia18 (№ доступа ADK23801); Cry1Ia19 (№ доступа HQ439787); Cry1Ia20 (№ доступа JQ228426); Cry1Ia21 (№ доступа JQ228424); Cry1Ia22 (№ доступа JQ228427); Cry1Ia23 (№ доступа JQ228428); Cry1Ia24 (№ доступа JQ228429); Cry1Ia25 (№ доступа JQ228430); Cry1Ia26 (№ доступа JQ228431); Cry1Ia27 (№ доступа JQ228432); Cry1Ia28 (№ доступа JQ228433); Cry1Ia29 (№ доступа JQ228434); Cry1Ia30 (№ доступа JQ317686); Cry1Ia31 (№ доступа JX944038); Cry1Ia32 (№ доступа JX944039); Cry1Ia33 (№ доступа JX944040); Cry1Ib1 (№ доступа AAA82114); Cry1Ib2 (№ доступа ABW88019); Cry1Ib3 (№ доступа ACD75515); Cry1Ib4 (№ доступа HM051227); Cry1Ib5 (№ доступа HM070028); Cry1Ib6 (№ доступа ADK38579); Cry1Ib7 (№ доступа JN571740); Cry1Ib8 (№ доступа JN675714); Cry1Ib9 (№ доступа JN675715); Cry1Ib10 (№ доступа JN675716); Cry1Ib11 (№ доступа JQ228423); Cry1Ic1 (№ доступа AAC62933); Cry1Ic2 (№ доступа AAE71691); Cry1Id1 (№ доступа AAD44366); Cry1Id2 (№ доступа JQ228422); Cry1Ie1 (№ доступа AAG43526); Cry1Ie2 (№ доступа HM439636); Cry1Ie3 (№ доступа KC156647); Cry1Ie4 (№ доступа KC156681); Cry1If1 (№ доступа AAQ52382); Cry1Ig1 (№ доступа KC156701); Cry1I-подобный (№ доступа AAC31094); Cry1I-подобный (№ доступа ABG88859); Cry1Ja1 (№ доступа AAA22341); Cry1Ja2 (№ доступа HM070030); Cry1Ja3 (№ доступа JQ228425); Cry1Jb1 (№ доступа AAA98959); Cry1Jc1 (№ доступа AAC31092); Cry1Jc2 (№ доступа AAQ52372); Cry1Jd1 (№ доступа CAC50779); Cry1Ka1 (№ доступа AAB00376); Cry1Ka2 (№ доступа HQ439783); Cry1La1 (№ доступа AAS60191); Cry1La2 (№ доступа HM070031); Cry1Ma1 (№ доступа FJ884067); Cry1Ma2 (№ доступа KC156659); Cry1Na1 (№ доступа KC156648); Cry1Nb1 (№ доступа KC156678); Cry1-подобный (№ доступа AAC31091); Cry2Aa1 (№ доступа AAA22335); Cry2Aa2 (№ доступа AAA83516); Cry2Aa3 (№ доступа D86064); Cry2Aa4 (№ доступа AAC04867); Cry2Aa5 (№ доступа CAA10671); Cry2Aa6 (№ доступа CAA10672); Cry2Aa7 (№ доступа CAA10670); Cry2Aa8 (№ доступа AAO13734); Cry2Aa9 (№ доступа AAO13750 ); Cry2Aa10 (№ доступа AAQ04263); Cry2Aa11 (№ доступа AAQ52384); Cry2Aa12 (№ доступа ABI83671); Cry2Aa13 (№ доступа ABL01536); Cry2Aa14 (№ доступа ACF04939); Cry2Aa15 (№ доступа JN426947); Cry2Ab1 (№ доступа AAA22342); Cry2Ab2 (№ доступа CAA39075); Cry2Ab3 (№ доступа AAG36762); Cry2Ab4 (№ доступа AAO13296 ); Cry2Ab5 (№ доступа AAQ04609); Cry2Ab6 (№ доступа AAP59457); Cry2Ab7 (№ доступа AAZ66347); Cry2Ab8 (№ доступа ABC95996); Cry2Ab9 (№ доступа ABC74968); Cry2Ab10 (№ доступа EF157306); Cry2Ab11 (№ доступа CAM84575); Cry2Ab12 (№ доступа ABM21764); Cry2Ab13 (№ доступа ACG76120); Cry2Ab14 (№ доступа ACG76121); Cry2Ab15 (№ доступа HM037126); Cry2Ab16 (№ доступа GQ866914); Cry2Ab17 (№ доступа HQ439789); Cry2Ab18 (№ доступа JN135255); Cry2Ab19 (№ доступа JN135256); Cry2Ab20 (№ доступа JN135257); Cry2Ab21 (№ доступа JN135258); Cry2Ab22 (№ доступа JN135259); Cry2Ab23 (№ доступа JN135260); Cry2Ab24 (№ доступа JN135261); Cry2Ab25 (№ доступа JN415485); Cry2Ab26 (№ доступа JN426946); Cry2Ab27 (№ доступа JN415764); Cry2Ab28 (№ доступа JN651494); Cry2Ac1 (№ доступа CAA40536); Cry2Ac2 (№ доступа AAG35410); Cry2Ac3 (№ доступа AAQ52385); Cry2Ac4 (№ доступа ABC95997); Cry2Ac5 (№ доступа ABC74969); Cry2Ac6 (№ доступа ABC74793); Cry2Ac7 (№ доступа CAL18690); Cry2Ac8 (№ доступа CAM09325); Cry2Ac9 (№ доступа CAM09326); Cry2Ac10 (№ доступа ABN15104); Cry2Ac11 (№ доступа CAM83895); Cry2Ac12 (№ доступа CAM83896); Cry2Ad1 (№ доступа AAF09583); Cry2Ad2 (№ доступа ABC86927); Cry2Ad3 (№ доступа CAK29504); Cry2Ad4 (№ доступа CAM32331); Cry2Ad5 (№ доступа CAO78739 ); Cry2Ae1 (№ доступа AAQ52362); Cry2Af1 (№ доступа ABO30519); Cry2Af2 (№ доступа GQ866915); Cry2Ag1 (№ доступа ACH91610); Cry2Ah1 (№ доступа EU939453); Cry2Ah2 (№ доступа ACL80665); Cry2Ah3 (№ доступа GU073380); Cry2Ah4 (№ доступа KC156702); Cry2Ai1 (№ доступа FJ788388); Cry2Aj (№ доступа ); Cry2Ak1 (№ доступа KC156660); Cry2Ba1 (№ доступа KC156658); Cry3Aa1 (№ доступа AAA22336); Cry3Aa2 (№ доступа AAA22541); Cry3Aa3 (№ доступа CAA68482); Cry3Aa4 (№ доступа AAA22542); Cry3Aa5 (№ доступа AAA50255); Cry3Aa6 (№ доступа AAC43266); Cry3Aa7 (№ доступа CAB41411); Cry3Aa8 (№ доступа AAS79487); Cry3Aa9 (№ доступа AAW05659); Cry3Aa10 (№ доступа AAU29411); Cry3Aa11 (№ доступа AAW82872); Cry3Aa12 (№ доступа ABY49136 ); Cry3Ba1 (№ доступа CAA34983); Cry3Ba2 (№ доступа CAA00645); Cry3Ba3 (№ доступа JQ397327); Cry3Bb1 (№ доступа AAA22334); Cry3Bb2 (№ доступа AAA74198); Cry3Bb3 (№ доступа I15475); Cry3Ca1 (№ доступа CAA42469); Cry4Aa1 (№ доступа CAA68485); Cry4Aa2 (№ доступа BAA00179); Cry4Aa3 (№ доступа CAD30148); Cry4Aa4 (№ доступа AFB18317); Cry4A-подобный (№ доступа AAY96321); Cry4Ba1 (№ доступа CAA30312); Cry4Ba2 (№ доступа CAA30114); Cry4Ba3 (№ доступа AAA22337); Cry4Ba4 (№ доступа BAA00178); Cry4Ba5 (№ доступа CAD30095); Cry4Ba-подобный (№ доступа ABC47686); Cry4Ca1 (№ доступа EU646202); Cry4Cb1 (№ доступа FJ403208); Cry4Cb2 (№ доступа FJ597622); Cry4Cc1 (№ доступа FJ403207); Cry5Aa1 (№ доступа AAA67694); Cry5Ab1 (№ доступа AAA67693); Cry5Ac1 (№ доступа I34543); Cry5Ad1 (№ доступа ABQ82087); Cry5Ba1 (№ доступа AAA68598); Cry5Ba2 (№ доступа ABW88931); Cry5Ba3 (№ доступа AFJ04417); Cry5Ca1 (№ доступа HM461869); Cry5Ca2 (№ доступа ZP_04123426); Cry5Da1 (№ доступа HM461870); Cry5Da2 (№ доступа ZP_04123980); Cry5Ea1 (№ доступа HM485580); Cry5Ea2 (№ доступа ZP_04124038); Cry6Aa1 (№ доступа AAA22357); Cry6Aa2 (№ доступа AAM46849); Cry6Aa3 (№ доступа ABH03377); Cry6Ba1 (№ доступа AAA22358); Cry7Aa1 (№ доступа AAA22351); Cry7Ab1 (№ доступа AAA21120); Cry7Ab2 (№ доступа AAA21121); Cry7Ab3 (№ доступа ABX24522); Cry7Ab4 (№ доступа EU380678); Cry7Ab5 (№ доступа ABX79555); Cry7Ab6 (№ доступа ACI44005); Cry7Ab7 (№ доступа ADB89216); Cry7Ab8 (№ доступа GU145299); Cry7Ab9 (№ доступа ADD92572); Cry7Ba1 (№ доступа ABB70817); Cry7Bb1 (№ доступа KC156653); Cry7Ca1 (№ доступа ABR67863); Cry7Cb1 (№ доступа KC156698); Cry7Da1 (№ доступа ACQ99547); Cry7Da2 (№ доступа HM572236); Cry7Da3 (№ доступа KC156679); Cry7Ea1 (№ доступа HM035086); Cry7Ea2 (№ доступа HM132124); Cry7Ea3 (№ доступа EEM19403); Cry7Fa1 (№ доступа HM035088); Cry7Fa2 (№ доступа EEM19090); Cry7Fb1 (№ доступа HM572235); Cry7Fb2 (№ доступа KC156682); Cry7Ga1 (№ доступа HM572237); Cry7Ga2 (№ доступа KC156669); Cry7Gb1 (№ доступа KC156650); Cry7Gc1 (№ доступа KC156654); Cry7Gd1 (№ доступа KC156697); Cry7Ha1 (№ доступа KC156651); Cry7Ia1 (№ доступа KC156665); Cry7Ja1 (№ доступа KC156671); Cry7Ka1 (№ доступа KC156680); Cry7Kb1 (№ доступа BAM99306); Cry7La1 (№ доступа BAM99307); Cry8Aa1 (№ доступа AAA21117); Cry8Ab1 (№ доступа EU044830); Cry8Ac1 (№ доступа KC156662); Cry8Ad1 (№ доступа KC156684); Cry8Ba1 (№ доступа AAA21118); Cry8Bb1 (№ доступа CAD57542); Cry8Bc1 (№ доступа CAD57543); Cry8Ca1 (№ доступа AAA21119); Cry8Ca2 (№ доступа AAR98783); Cry8Ca3 (№ доступа EU625349); Cry8Ca4 (№ доступа ADB54826); Cry8Da1 (№ доступа BAC07226); Cry8Da2 (№ доступа BD133574); Cry8Da3 (№ доступа BD133575); Cry8Db1 (№ доступа BAF93483); Cry8Ea1 (№ доступа AAQ73470); Cry8Ea2 (№ доступа EU047597); Cry8Ea3 (№ доступа KC855216); Cry8Fa1 (№ доступа AAT48690); Cry8Fa2 (№ доступа HQ174208); Cry8Fa3 (№ доступа AFH78109); Cry8Ga1 (№ доступа AAT46073); Cry8Ga2 (№ доступа ABC42043); Cry8Ga3 (№ доступа FJ198072); Cry8Ha1 (№ доступа AAW81032); Cry8Ia1 (№ доступа EU381044); Cry8Ia2 (№ доступа GU073381); Cry8Ia3 (№ доступа HM044664); Cry8Ia4 (№ доступа KC156674); Cry8Ib1 (№ доступа GU325772); Cry8Ib2 (№ доступа KC156677); Cry8Ja1 (№ доступа EU625348); Cry8Ka1 (№ доступа FJ422558); Cry8Ka2 (№ доступа ACN87262); Cry8Kb1 (№ доступа HM123758); Cry8Kb2 (№ доступа KC156675); Cry8La1 (№ доступа GU325771); Cry8Ma1 (№ доступа HM044665); Cry8Ma2 (№ доступа EEM86551); Cry8Ma3 (№ доступа HM210574); Cry8Na1 (№ доступа HM640939); Cry8Pa1 (№ доступа HQ388415); Cry8Qa1 (№ доступа HQ441166); Cry8Qa2 (№ доступа KC152468); Cry8Ra1 (№ доступа AFP87548); Cry8Sa1 (№ доступа JQ740599); Cry8Ta1 (№ доступа KC156673); Cry8-подобный (№ доступа FJ770571); Cry8-подобный (№ доступа ABS53003); Cry9Aa1 (№ доступа CAA41122); Cry9Aa2 (№ доступа CAA41425); Cry9Aa3 (№ доступа GQ249293); Cry9Aa4 (№ доступа GQ249294); Cry9Aa5 (№ доступа JX174110); Cry9Aa like (№ доступа AAQ52376); Cry9Ba1 (№ доступа CAA52927); Cry9Ba2 (№ доступа GU299522); Cry9Bb1 (№ доступа AAV28716); Cry9Ca1 (№ доступа CAA85764); Cry9Ca2 (№ доступа AAQ52375); Cry9Da1 (№ доступа BAA19948); Cry9Da2 (№ доступа AAB97923); Cry9Da3 (№ доступа GQ249293); Cry9Da4 (№ доступа GQ249297); Cry9Db1 (№ доступа AAX78439); Cry9Dc1 (№ доступа KC156683); Cry9Ea1 (№ доступа BAA34908); Cry9Ea2 (№ доступа AAO12908); Cry9Ea3 (№ доступа ABM21765); Cry9Ea4 (№ доступа ACE88267); Cry9Ea5 (№ доступа ACF04743); Cry9Ea6 (№ доступа ACG63872 ); Cry9Ea7 (№ доступа FJ380927); Cry9Ea8 (№ доступа GQ249292); Cry9Ea9 (№ доступа JN651495); Cry9Eb1 (№ доступа CAC50780); Cry9Eb2 (№ доступа GQ249298); Cry9Eb3 (№ доступа KC156646); Cry9Ec1 (№ доступа AAC63366); Cry9Ed1 (№ доступа AAX78440); Cry9Ee1 (№ доступа GQ249296); Cry9Ee2 (№ доступа KC156664); Cry9Fa1 (№ доступа KC156692); Cry9Ga1 (№ доступа KC156699); Cry9-подобный (№ доступа AAC63366); Cry10Aa1 (№ доступа AAA22614); Cry10Aa2 (№ доступа E00614); Cry10Aa3 (№ доступа CAD30098); Cry10Aa4 (№ доступа AFB18318); Cry10A-подобный (№ доступа DQ167578); Cry11Aa1 (№ доступа AAA22352); Cry11Aa2 (№ доступа AAA22611); Cry11Aa3 (№ доступа CAD30081); Cry11Aa4 (№ доступа AFB18319); Cry11Aa-подобный (№ доступа DQ166531); Cry11Ba1 (№ доступа CAA60504); Cry11Bb1 (№ доступа AAC97162); Cry11Bb2 (№ доступа HM068615); Cry12Aa1 (№ доступа AAA22355); Cry13Aa1 (№ доступа AAA22356); Cry14Aa1 (№ доступа AAA21516); Cry14Ab1 (№ доступа KC156652); Cry15Aa1 (№ доступа AAA22333); Cry16Aa1 (№ доступа CAA63860); Cry17Aa1 (№ доступа CAA67841); Cry18Aa1 (№ доступа CAA67506); Cry18Ba1 (№ доступа AAF89667); Cry18Ca1 (№ доступа AAF89668); Cry19Aa1 (№ доступа CAA68875); Cry19Ba1 (№ доступа BAA32397); Cry19Ca1 (№ доступа AFM37572); Cry20Aa1 (№ доступа AAB93476); Cry20Ba1 (№ доступа ACS93601); Cry20Ba2 (№ доступа KC156694); Cry20-подобный (№ доступа GQ144333); Cry21Aa1 (№ доступа I32932); Cry21Aa2 (№ доступа I66477); Cry21Ba1 (№ доступа BAC06484); Cry21Ca1 (№ доступа JF521577); Cry21Ca2 (№ доступа KC156687); Cry21Da1 (№ доступа JF521578); Cry22Aa1 (№ доступа I34547); Cry22Aa2 (№ доступа CAD43579); Cry22Aa3 (№ доступа ACD93211); Cry22Ab1 (№ доступа AAK50456); Cry22Ab2 (№ доступа CAD43577); Cry22Ba1 (№ доступа CAD43578); Cry22Bb1 (№ доступа KC156672); Cry23Aa1 (№ доступа AAF76375); Cry24Aa1 (№ доступа AAC61891); Cry24Ba1 (№ доступа BAD32657); Cry24Ca1 (№ доступа CAJ43600); Cry25Aa1 (№ доступа AAC61892); Cry26Aa1 (№ доступа AAD25075); Cry27Aa1 (№ доступа BAA82796); Cry28Aa1 (№ доступа AAD24189); Cry28Aa2 (№ доступа AAG00235); Cry29Aa1 (№ доступа CAC80985); Cry30Aa1 (№ доступа CAC80986); Cry30Ba1 (№ доступа BAD00052); Cry30Ca1 (№ доступа BAD67157); Cry30Ca2 (№ доступа ACU24781); Cry30Da1 (№ доступа EF095955); Cry30Db1 (№ доступа BAE80088); Cry30Ea1 (№ доступа ACC95445); Cry30Ea2 (№ доступа FJ499389); Cry30Fa1 (№ доступа ACI22625 ); Cry30Ga1 (№ доступа ACG60020); Cry30Ga2 (№ доступа HQ638217); Cry31Aa1 (№ доступа BAB11757); Cry31Aa2 (№ доступа AAL87458); Cry31Aa3 (№ доступа BAE79808); Cry31Aa4 (№ доступа BAF32571); Cry31Aa5 (№ доступа BAF32572); Cry31Aa6 (№ доступа BAI44026); Cry31Ab1 (№ доступа BAE79809); Cry31Ab2 (№ доступа BAF32570); Cry31Ac1 (№ доступа BAF34368); Cry31Ac2 (№ доступа AB731600); Cry31Ad1 (№ доступа BAI44022); Cry32Aa1 (№ доступа AAG36711); Cry32Aa2 (№ доступа GU063849); Cry32Ab1 (№ доступа GU063850); Cry32Ba1 (№ доступа BAB78601); Cry32Ca1 (№ доступа BAB78602); Cry32Cb1 (№ доступа KC156708); Cry32Da1 (№ доступа BAB78603); Cry32Ea1 (№ доступа GU324274); Cry32Ea2 (№ доступа KC156686); Cry32Eb1 (№ доступа KC156663); Cry32Fa1 (№ доступа KC156656); Cry32Ga1 (№ доступа KC156657); Cry32Ha1 (№ доступа KC156661); Cry32Hb1 (№ доступа KC156666); Cry32Ia1 (№ доступа KC156667); Cry32Ja1 (№ доступа KC156685); Cry32Ka1 (№ доступа KC156688); Cry32La1 (№ доступа KC156689); Cry32Ma1 (№ доступа KC156690); Cry32Mb1 (№ доступа KC156704); Cry32Na1 (№ доступа KC156691); Cry32Oa1 (№ доступа KC156703); Cry32Pa1 (№ доступа KC156705); Cry32Qa1 (№ доступа KC156706); Cry32Ra1 (№ доступа KC156707); Cry32Sa1 (№ доступа KC156709); Cry32Ta1 (№ доступа KC156710); Cry32Ua1 (№ доступа KC156655); Cry33Aa1 (№ доступа AAL26871); Cry34Aa1 (№ доступа AAG50341); Cry34Aa2 (№ доступа AAK64560); Cry34Aa3 (№ доступа AAT29032); Cry34Aa4 (№ доступа AAT29030); Cry34Ab1 (№ доступа AAG41671); Cry34Ac1 (№ доступа AAG50118); Cry34Ac2 (№ доступа AAK64562); Cry34Ac3 (№ доступа AAT29029); Cry34Ba1 (№ доступа AAK64565); Cry34Ba2 (№ доступа AAT29033); Cry34Ba3 (№ доступа AAT29031); Cry35Aa1 (№ доступа AAG50342); Cry35Aa2 (№ доступа AAK64561); Cry35Aa3 (№ доступа AAT29028); Cry35Aa4 (№ доступа AAT29025); Cry35Ab1 (№ доступа AAG41672); Cry35Ab2 (№ доступа AAK64563); Cry35Ab3 (№ доступа AY536891); Cry35Ac1 (№ доступа AAG50117); Cry35Ba1 (№ доступа AAK64566); Cry35Ba2 (№ доступа AAT29027); Cry35Ba3 (№ доступа AAT29026); Cry36Aa1 (№ доступа AAK64558); Cry37Aa1 (№ доступа AAF76376 ); Cry38Aa1 (№ доступа AAK64559); Cry39Aa1 (№ доступа BAB72016); Cry40Aa1 (№ доступа BAB72018); Cry40Ba1 (№ доступа BAC77648); Cry40Ca1 (№ доступа EU381045); Cry40Da1 (№ доступа ACF15199); Cry41Aa1 (№ доступа BAD35157); Cry41Ab1 (№ доступа BAD35163); Cry41Ba1 (№ доступа HM461871); Cry41Ba2 (№ доступа ZP_04099652); Cry42Aa1 (№ доступа BAD35166); Cry43Aa1 (№ доступа BAD15301); Cry43Aa2 (№ доступа BAD95474 ); Cry43Ba1 (№ доступа BAD15303); Cry43Ca1 (№ доступа KC156676); Cry43Cb1 (№ доступа KC156695); Cry43Cc1 (№ доступа KC156696); Cry43-подобный (№ доступа BAD15305); Cry44Aa (№ доступа BAD08532); Cry45Aa (№ доступа BAD22577); Cry46Aa (№ доступа BAC79010); Cry46Aa2 (№ доступа BAG68906); Cry46Ab (№ доступа BAD35170); Cry47Aa (№ доступа AAY24695); Cry48Aa (№ доступа CAJ18351); Cry48Aa2 (№ доступа CAJ86545); Cry48Aa3 (№ доступа CAJ86546 ); Cry48Ab (№ доступа CAJ86548); Cry48Ab2 (№ доступа CAJ86549); Cry49Aa (№ доступа CAH56541); Cry49Aa2 (№ доступа CAJ86541); Cry49Aa3 (№ доступа CAJ86543); Cry49Aa4 (№ доступа CAJ86544); Cry49Ab1 (№ доступа CAJ86542); Cry50Aa1 (№ доступа BAE86999); Cry50Ba1 (№ доступа GU446675); Cry50Ba2 (№ доступа GU446676); Cry51Aa1 (№ доступа ABI14444); Cry51Aa2 (№ доступа GU570697); Cry52Aa1 (№ доступа EF613489); Cry52Ba1 (№ доступа FJ361760); Cry53Aa1 (№ доступа EF633476); Cry53Ab1 (№ доступа FJ361759); Cry54Aa1 (№ доступа ACA52194); Cry54Aa2 (№ доступа GQ140349); Cry54Ba1 (№ доступа GU446677); Cry55Aa1 (№ доступа ABW88932); Cry54Ab1 (№ доступа JQ916908); Cry55Aa2 (№ доступа AAE33526); Cry56Aa1 (№ доступа ACU57499); Cry56Aa2 (№ доступа GQ483512); Cry56Aa3 (№ доступа JX025567); Cry57Aa1 (№ доступа ANC87261); Cry58Aa1 (№ доступа ANC87260); Cry59Ba1 (№ доступа JN790647); Cry59Aa1 (№ доступа ACR43758); Cry60Aa1 (№ доступа ACU24782); Cry60Aa2 (№ доступа EAO57254); Cry60Aa3 (№ доступа EEM99278); Cry60Ba1 (№ доступа GU810818); Cry60Ba2 (№ доступа EAO57253); Cry60Ba3 (№ доступа EEM99279); Cry61Aa1 (№ доступа HM035087); Cry61Aa2 (№ доступа HM132125); Cry61Aa3 (№ доступа EEM19308); Cry62Aa1 (№ доступа HM054509); Cry63Aa1 (№ доступа BAI44028); Cry64Aa1 (№ доступа BAJ05397); Cry65Aa1 (№ доступа HM461868); Cry65Aa2 (№ доступа ZP_04123838); Cry66Aa1 (№ доступа HM485581); Cry66Aa2 (№ доступа ZP_04099945); Cry67Aa1 (№ доступа HM485582); Cry67Aa2 (№ доступа ZP_04148882); Cry68Aa1 (№ доступа HQ113114); Cry69Aa1 (№ доступа HQ401006); Cry69Aa2 (№ доступа JQ821388); Cry69Ab1 (№ доступа JN209957); Cry70Aa1 (№ доступа JN646781); Cry70Ba1 (№ доступа ADO51070); Cry70Bb1 (№ доступа EEL67276); Cry71Aa1 (№ доступа JX025568); Cry72Aa1 (№ доступа JX025569); Cyt1Aa (Номер доступа GenBank X03182); Cyt1Ab (Номер доступа GenBank X98793); Cyt1B (Номер доступа GenBank U37196); Cyt2A (Номер доступа GenBank Z14147); и Cyt2B (Номер доступа GenBank U52043).

Примеры δ-эндотоксинов также включают без ограничения белки Cry1A из патентов США №№ 5880275 и 7858849; токсин DIG-3 или DIG-11 (варианты белков cry с N-терминальной делецией α-спирали 1 и/или α-спирали 2, такие как Cry1A, Cry3A) из патентов США №№ 8304604, 8304605 и 8476226; Cry1B из заявки на выдачу патента США с серийным № 10/525318; Cry1C из патента США № 6033874; Cry1F из патентов США №№ 5188960 и 6218188; химеры Cry1A/F из патентов США №№ 7070982; 6962705 и 6713063); белок Cry2, такой как белок Cry2Ab из патента США № 7064249; белок Cry3A, в том числе без ограничения сконструированный гибридный инсектицидный белок (eHIP), созданный путем слияния уникальных комбинаций вариабельных участков и консервативных блоков по меньшей мере двух различных белков Cry (публикация заявки на выдачу патента США № 2010/0017914); белок Cry4; белок Cry5; белок Cry6; белки Cry8 из патентов США №№ 7329736, 7449552, 7803943, 7476781, 7105332, 7378499 и 7462760; белок Cry9, такой как представители семейств Cry9A, Cry9B, Cry9C, Cry9D, Cry9E и Cry9F; белок Cry15 из Naimov, et al., (2008) Applied and Environmental Microbiology, 74:7145-7151; Cry22, белок Cry34Ab1 из патентов США №№ 6127180, 6624145 и 6340593; белок CryET33 и cryET34 из патентов США №№ 6248535, 6326351, 6399330, 6949626, 7385107 и 7504229; гомологи CryET33 и CryET34 из публикации заявки на выдачу патента США № 2006/0191034, 2012/0278954 и публикации согласно PCT номер WO 2012/139004; белок Cry35Ab1 из патентов США №№ 6083499, 6548291 и 6340593; белок Cry46, белок Cry 51, бинарный токсин Cry; TIC901 или родственный токсин; TIC807 из публикации заявки на выдачу патента США № 2008/0295207; ET29, ET37, TIC809, TIC810, TIC812, TIC127, TIC128 из публикации согласно PCT US 2006/033867; токсины TIC853 из патента США № 8513494, AXMI-027, AXMI-036 и AXMI-038 из патента США № 8236757; AXMI-031, AXMI-039, AXMI-040, AXMI-049 из патента США № 7923602; AXMI-018, AXMI-020 и AXMI-021 из WO 2006/083891; AXMI-010 из WO 2005/038032; AXMI-003 из WO 2005/021585; AXMI-008 из публикации заявки на выдачу патента США № 2004/0250311; AXMI-006 из публикации заявки на выдачу патента США № 2004/0216186; AXMI-007 из публикации заявки на выдачу патента США № 2004/0210965; AXMI-009 из заявки на выдачу патента США № 2004/0210964; AXMI-014 из публикации заявки на выдачу патента США № 2004/0197917; AXMI-004 из публикации заявки на выдачу патента США № 2004/0197916; AXMI-028 и AXMI-029 из WO 2006/119457; AXMI-007, AXMI-008, AXMI-0080rf2, AXMI-009, AXMI-014 и AXMI-004 из WO 2004/074462; AXMI-150 из патента США № 8084416; AXMI-205 из публикации заявки на выдачу патента США № 2011/0023184; AXMI-011, AXMI-012, AXMI-013, AXMI-015, AXMI-019, AXMI-044, AXMI-037, AXMI-043, AXMI-033, AXMI-034, AXMI-022, AXMI-023, AXMI-041, AXMI-063 и AXMI-064 из публикации заявки на выдачу патента США № 2011/0263488; AXMI-R1 и родственные белки из публикации заявки на выдачу патента США № 2010/0197592; AXMI221Z, AXMI222z, AXMI223z, AXMI224z и AXMI225z из WO 2011/103248; AXMI218, AXMI219, AXMI220, AXMI226, AXMI227, AXMI228, AXMI229, AXMI230 и AXMI231 из WO 2011/103247; AXMI-115, AXMI-113, AXMI-005, AXMI-163 и AXMI-184 из патента США № 8334431; AXMI-001, AXMI-002, AXMI-030, AXMI-035 и AXMI-045 из публикации заявки на выдачу патента США № 2010/0298211; AXMI-066 и AXMI-076 из публикации заявки на выдачу патента США № 2009/0144852; AXMI128, AXMI130, AXMI131, AXMI133, AXMI140, AXMI141, AXMI142, AXMI143, AXMI144, AXMI146, AXMI148, AXMI149, AXMI152, AXMI153, AXMI154, AXMI155, AXMI156, AXMI157, AXMI158, AXMI162, AXMI165, AXMI166, AXMI167, AXMI168, AXMI169, AXMI170, AXMI171, AXMI172, AXMI173, AXMI174, AXMI175, AXMI176, AXMI177, AXMI178, AXMI179, AXMI180, AXMI181, AXMI182, AXMI185, AXMI186, AXMI187, AXMI188, AXMI189 из патента США № 8318900; AXMI079, AXMI080, AXMI081, AXMI082, AXMI091, AXMI092, AXMI096, AXMI097, AXMI098, AXMI099, AXMI100, AXMI101, AXMI102, AXMI103, AXMI104, AXMI107, AXMI108, AXMI109, AXMI110, AXMI111, AXMI112, AXMI114, AXMI116, AXMI117, AXMI118, AXMI119, AXMI120, AXMI121, AXMI122, AXMI123, AXMI124, AXMI1257, AXMI1268, AXMI127, AXMI129, AXMI164, AXMI151, AXMI161, AXMI183, AXMI132, AXMI138, AXMI137 из публикации заявки на выдачу патента США № 2010/0005543, белки cry, такие как Cry1A и Cry3A, имеющие модифицированные протеолитические участки, из патента США № 8319019; белок-токсин Cry1Ac, Cry2Aa и Cry1Ca из штамма VBTS 2528 Bacillus thuringiensis из публикации заявки на выдачу патента США № 2011/0064710. Другие белки Cry хорошо известны специалисту в данной области (см. Crickmore, et al., "Bacillus thuringiensis toxin nomenclature" (2011), на сайте по адресу lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). Инсектицидная активность белков Cry хорошо известна специалисту в данной области (для обзора см. van Frannkenhuyzen, (2009) J. Invert. Path. 101:1-16). Применение белков Cry в качестве признаков трансгенного растения хорошо известно специалисту в данной области, и трансгенные растения с Cry, в том числе без ограничения растения, экспрессирующие Cry1Ac, Cry1Ac+Cry2Ab, Cry1Ab, Cry1A.105, Cry1F, Cry1Fa2, Cry1F+Cry1Ac, Cry2Ab, Cry3A, mCry3A, Cry3Bb1, Cry34Ab1, Cry35Ab1, Vip3A, mCry3A, Cry9c и CBI-Bt, были разрешены контролирующими органами (см. Sanahuja, (2011) Plant Biotech Journal 9:283-300 и CERA (2010), базу данных ГМ растений центра по оценке риска для окружающей среды (CERA), Исследовательский фонд ILSI, город Вашингтон, на сайте по адресу cera-gmc.org/index.php?action=gm_crop_database, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). В растениях также может экспрессироваться два или более пестицидных белков, хорошо известных специалисту в данной области, таких как Vip3Ab и Cry1Fa (US2012/0317682); Cry1BE и Cry1F (US2012/0311746); Cry1CA и Cry1AB (US2012/0311745); Cry1F и CryCa (US2012/0317681); Cry1DA и Cry1BE (US2012/0331590); Cry1DA и Cry1Fa (US2012/0331589); Cry1AB и Cry1BE (US2012/0324606); Cry1Fa и Cry2Aa, а также Cry1I и Cry1E (US2012/0324605); Cry34Ab/35Ab и Cry6Aa (US20130167269); Cry34Ab/VCry35Ab и Cry3Aa (US20130167268) и Cry3A, а также Cry1Ab или Vip3Aa (US20130116170). Пестицидные белки включают также инсектицидные липазы, в том числе гидролазы омыляемых липидов из патента США № 7491869 и холестерин-оксидазы, как, например, из Streptomyces (Purcell et al. (1993) Biochem Biophys Res Commun 15:1406-1413). Пестицидные белки также включают токсины VIP (вегетативные инсектицидные белки) из патентов США №№ 5877012, 6107279, 6137033, 7244820, 7615686 и 8237020 и т. п. Другие белки VIP хорошо известны специалисту в данной области (см. сайт по адресу lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/vip.html, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). Пестицидные белки включают также белки токсинового комплекса (TC), которые можно получить из организмов, таких как Xenorhabdus, Photorhabdus и Paenibacillus (см. патенты США №№ 7491698 и 8084418). Некоторые TC-белки обладают "самостоятельной" инсектицидной активностью, а другие TC-белки повышают активность самостоятельных токсинов, вырабатываемых тем же данным организмом. Токсичность "самостоятельного" TC-белка (например, из Photorhabdus, Xenorhabdus или Paenibacillus) может повышаться с помощью одного или нескольких TC-белков-"усилителей", полученных из организма-источника из другого рода. Существуют три основных типа TC-белков. Как изложено в данном документе, белки класса A ("белок A") представляют собой самостоятельные токсины. Белки класса B ("белок B") и белки класса C ("белок C") повышают токсичность белков класса A. Примерами белков класса A являются TcbA, TcdA, XptA1 и XptA2. Примерами белков класса B являются TcaC, TcdB, XptB1Xb и XptC1Wi. Примерами белков класса C являются TccC, XptC1Xb и XptB1Wi. Пестицидные белки также включают белки яда пауков, змей и скорпионов. Примеры пептидов яда пауков включают без ограничения пептиды ликотоксин-1 и его мутантные формы (патент США № 8334366).

В некоторых вариантах осуществления инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию включают аминокислотные последовательности, выведенные из последовательностей нуклеиновой кислоты полной длины, раскрытых в данном документе, и аминокислотные последовательности, которые короче, чем последовательности полной длины, либо полученные в результате применения альтернативного сайта инициации, расположенного ниже, либо полученные в результате процессинга, дающего более короткий белок с пестицидной активностью. Процессинг может происходить в организме, в котором экспрессируется белок, или во вредителе после поглощения белка.

Таким образом, в данном документе предусматриваются новые выделенные или рекомбинантные последовательности нуклеиновой кислоты, которые обеспечивают пестицидную активность. Также предусматриваются аминокислотные последовательности инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию. Белок, полученный в результате трансляции генов этих инсектицидных полипептидов, обеспечивает возможность клеткам контролировать или уничтожать вредителей, которые их поглощают.

Молекулы нуклеиновой кислоты, а также их варианты и фрагменты

Один аспект настоящего раскрытия относится к выделенным или рекомбинантным молекулам нуклеиновой кислоты, содержащим последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующие инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию или их биологически активные части, а также к молекулам нуклеиновой кислоты, подходящим для применения в качестве гибридизационных зондов для идентификации молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих белки с участками гомологии последовательностей. Термин "молекула нуклеиновой кислоты", используемый в данном документе, относится к молекулам ДНК (например, рекомбинантной ДНК, кДНК, геномной ДНК, пластидной ДНК, митохондриальной ДНК), и молекулам РНК (например, mRNA), и аналогам ДНК или РНК, полученным с применением аналогов нуклеотидов. Молекула нуклеиновой кислоты может быть одноцепочечной или двухцепочечной, но предпочтительно представляет собой двухцепочечную ДНК.

"Выделенная" молекула нуклеиновой кислоты (или ДНК) используется в данном документе для обозначения последовательности нуклеиновой кислоты (или ДНК), которая больше не находится в своей естественной среде, например находится in vitro. "Рекомбинантная" молекула нуклеиновой кислоты (или ДНК) используется в данном документе для обозначения последовательности нуклеиновой кислоты (или ДНК), которая находится в рекомбинантной бактериальной или растительной клетке-хозяине. В некоторых вариантах осуществления "выделенная" или "рекомбинантная" нуклеиновая кислота не содержит последовательности (предпочтительно последовательности, кодирующие белок), которые в естественных условиях фланкируют нуклеиновую кислоту (т. е. последовательности, расположенные на 5′- и 3′-концах нуклеиновой кислоты) в геномной ДНК организма, из которого получена нуклеиновая кислота. Для целей настоящего раскрытия "выделенные" или "рекомбинантные", при использовании для обозначения молекул нуклеиновой кислоты, исключают выделенные хромосомы. Например, в различных вариантах осуществления рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая инсектицидный полипептид, может содержать менее приблизительно 5 т. н., 4 т. н., 3 т. н., 2 т. н., 1 т. н., 0,5 т. н. или 0,1 т. н. последовательностей нуклеиновой кислоты, которые в естественных условиях фланкируют молекулу нуклеиновой кислоты в геномной ДНК клетки, из которой получена нуклеиновая кислота.

В некоторых вариантах осуществления выделенная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, имеет одно или несколько изменений в последовательности нуклеиновой кислоты по сравнению с нативной или геномной последовательностью нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления изменение в нативной или геномной последовательности нуклеиновой кислоты включает без ограничения изменения в последовательности нуклеиновой кислоты вследствие вырожденности генетического кода; изменения в последовательности нуклеиновой кислоты вследствие аминокислотной замены, вставки, делеции и/или добавления относительно нативной или геномной последовательности; удаление одного или нескольких интронов; делецию одного или нескольких регуляторных участков, расположенных выше или ниже; и делецию 5'- и/или 3'-нетранслируемого участка, ассоциированного с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая инсектицидный полипептид, представляет собой последовательность, отличную от геномной.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-45-1, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-45-1. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-45-1 или родственные белки, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 220 или SEQ ID NO: 222, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 и SEQ ID NO: 236. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-45-1 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas, Thalassuspira, Paracoccus или Cellvibrio. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-45-1 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas monteilii, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas plecoglossicida, Pseudomonas putida, Pseudomonas poae, Pseudomonas trivialis, Pseudomonas libanensis, Pseudomonas fluorescens и Pseudomonas asplenii.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-45-1, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. Используемые в данном документе "последовательность нуклеиновой кислоты, отличная от геномной", или "молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной", или "полинуклеотид, отличный от геномного" относятся к молекуле нуклеиновой кислоты, которая имеет одно или несколько изменений в последовательности нуклеиновой кислоты по сравнению с нативной или геномной последовательностью нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления изменение по отношению к нативной или геномной молекуле нуклеиновой кислоты включает без ограничения изменения в последовательности нуклеиновой кислоты, обусловленные вырожденностью генетического кода; оптимизацию кодонов последовательности нуклеиновой кислоты для экспрессии в растениях; изменения в последовательности нуклеиновой кислоты для введения по меньшей мере одной аминокислотной замены, вставки, делеции и/или добавления по сравнению с нативной или геномной последовательностью; удаление одного или нескольких интронов, ассоциированных с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты; вставку одного или нескольких гетерологичных интронов; делецию одной или нескольких регуляторных областей, расположенных выше или ниже, которые ассоциированы с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты; вставку одного или нескольких гетерологичных регуляторных участков, расположенных выше или ниже; делецию 5'- и/или 3'-нетранслируемой области, ассоциированной с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты; вставку гетерологичной 5'- и/или 3'-нетранслируемой области и модификацию сайта полиаденилирования. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. Термин ʺприблизительноʺ, используемый в данном документе, при использовании в отношении идентичности последовательности означает±0,5%. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-1.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,6% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 19. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 21. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 88% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 23. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 27. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,8% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 29. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 92,3% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 31. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 91,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 33. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 95,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 93% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 97,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 43. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 45. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 94% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 234. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 236.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-45-2, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-45-2. Одним источником полинуклеотидов, кодирующих полипептид PIP-45-2 или родственный белок, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 221 или SEQ ID NO: 223, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-45-2 или родственный белок, происходит из штамма Pseudomonas, Thalassuspira, Paracoccus или Cellvibrio. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-45-2 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas monteilii, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas plecoglossicida, Pseudomonas putida, Pseudomonas poae, Pseudomonas trivialis, Pseudomonas libanensis, Pseudomonas fluorescens и Pseudomonas asplenii.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-45-2, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 99,2% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 20. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 22. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 81% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 24. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 99,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 28. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 30. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 92% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 32. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 91,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 34. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 36. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 90% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 40. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 94% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 44. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 46. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 91% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 235. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 93,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 237.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-64-1, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-64-1. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-64-1 или родственный белок, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 165 или SEQ ID NO: 224, кодирующий полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 и SEQ ID NO: 238. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-64-1 или родственный белок, происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Alcaligenes. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-64-1 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas или Alcaligenes, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas brassicacearum, Pseudomonas entomophila и Alcaligenes faecalis.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-64-1, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-1. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 53. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,7% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 58. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 238.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-64-2, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, которые кодируют полипептиды PIP-64-2. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-64-2 или родственный белок, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 166 или SEQ ID NO: 225, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 и SEQ ID NO: 239. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-64-2 или родственный белок, происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Alcaligenes. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-64-2 или родственный белок, происходит из штамма Pseudomonas или Alcaligenes, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas brassicacearum, Pseudomonas entomophila и Alcaligenes faecalis.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-64-2, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-2. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 91% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 59. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 239.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-74-1, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-74-1. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-74-1 или родственный белок, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 182 или SEQ ID NO: 184, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-1 с SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 и SEQ ID NO: 77,. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-74-1 или родственный белок, происходит из штамма Pseudomonas. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-74-1 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas rhodesiae и Pseudomonas orientalis.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-74-1, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-1. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 73. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 75. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 77.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-74-2, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-74-2. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-74-2 или родственный белок, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 185, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-2 с SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 и SEQ ID NO: 78. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-74-2 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas. Один источник полипептида PIP-74-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas rhodesiae и Pseudomonas orientalis.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-74-2, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 74. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 76. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 78.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-75, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-75. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-75 или родственный белок, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193 или SEQ ID NO: 194, кодирующий полипептид PIP-75 c SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 87. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-75 или родственный белок, происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Serratia. Один источник полипептида PIP-75 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Serratia, выбранного без ограничения из Pseudomonas Antarctica, Pseudomonas orientalis, Enterobacter asburiae, Serratia plymuthica и Serratia liquefaciens.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-75, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-75. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 79. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 80. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 81. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 84. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 85. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 86. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 87.

Полинуклеотиды, кодирующие полипептиды PIP-77, охвачены настоящим раскрытием. Предполагается ряд полинуклеотидов, кодирующих полипептиды PIP-77. Одним источником полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-77 или родственные белки, является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO:196, SEQ ID NO:197, SEQ ID NO:198, SEQ ID NO:199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228 или SEQ ID NO: 231, соответственно кодирующий полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 и SEQ ID NO: 245. Один источник полинуклеотида, кодирующего полипептид PIP-77 или родственные белки, происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter, Shewanella, Haemophilus или Aeromonas. Один источник полипептида PIP-77 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas chlororaphis, Pseudomonas brassicacearum, Pseudomonas fluorescens и Pseudomonas rhodesiae.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая полипептид PIP-77, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой синтетическую последовательность нуклеиновой кислоты.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-77. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 93% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 88. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 97% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 89. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 99% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 90. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 97% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 92. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 93. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 94. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 95. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 84% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 96. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 97. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 83% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 98. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 79% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 100.

Эти полинуклеотидные последовательности были выделены из Pseudomonas или других бактериальных хозяев и, таким образом, являются подходящими для экспрессии кодируемых инсектицидных полипептидов в других бактериальных хозяев, которые включают без ограничения бактериальные клетки-хозяева Agrobacterium, Bacillus, Escherichia, Salmonella, Pseudomonas и Rhizobium. Полинуклеотиды также применимы в качестве зондов для выделения гомологичных или практически гомологичных полинуклеотидов, которые кодируют инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию или родственные белки. Такие зонды можно применять для идентификации гомологичных или практически гомологичных полинуклеотидов, полученных из Pseudomonas или других родственных бактерий.

Полинуклеотиды, которые кодируют инсектицидный полипептид, также можно синтезировать de novo, исходя из полипептидной последовательности. Последовательность гена полинуклеотида можно вывести, исходя из полипептидной последовательности, благодаря применению генетического кода. Компьютерные программы, такие как ʺBackTranslateʺ (GCG™ Package, Acclerys, Inc., Сан-Диего, Калифорния), можно применять для перевода пептидной последовательности в соответствующую нуклеотидную последовательность, кодирующую пептид. Кроме того, можно разрабатывать синтетические полинуклеотидные последовательности по настоящему раскрытию таким образом, что они будут экспрессироваться в растениях. В патенте США № 5500365 описан способ синтеза генов растения для улучшения уровня экспрессии белка, кодируемого синтезированным геном. Данный способ относится к модификации последовательностей структурных генов экзогенного трансгена, что приводит к их более эффективным транскрипции, процессингу, трансляции и экспрессии в растении. Свойства генов, которые хорошо экспрессируются в растениях, включают удаление последовательностей, которые могут вызывать нежелательный сплайсинг интронов или полиаденилирование в кодирующем участке генного транскрипта, при этом в существенной мере сохраняется аминокислотная последовательность токсичной части инсектицидного белка. Аналогичный способ для получения усиленной экспрессии трансгенов в однодольных растениях раскрыт в патенте США № 5689052.

"Комплементарная последовательность" используется в данном документе для обозначения последовательности нуклеиновой кислоты, которая в достаточной степени комплементарна данной последовательности нуклеиновой кислоты, так что она может гибридизоваться с данной последовательностью нуклеиновой кислоты, с образованием тем самым стабильного дуплекса. "Варианты полинуклеотидной последовательности" используются в данном документе для обозначения последовательности нуклеиновой кислоты, которая без учета несходства, связанного с вырожденностью генетического кода, кодирует тот же полипептид.

В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, представляет собой последовательность нуклеиновой кислоты, отличную от геномной. Используемая в данном документе "последовательность нуклеиновой кислоты, отличная от геномной" или "молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной" относится к молекуле нуклеиновой кислоты, которая имеет одно или несколько изменений в последовательности нуклеиновой кислоты по сравнению с нативной или геномной последовательностью нуклеиновой кислоты. В некоторых вариантах осуществления изменение по отношению к нативной или геномной молекуле нуклеиновой кислоты включает без ограничения изменения в последовательности нуклеиновой кислоты, обусловленные вырожденностью генетического кода; оптимизацию кодонов последовательности нуклеиновой кислоты для экспрессии в растениях; изменения в последовательности нуклеиновой кислоты для введения по меньшей мере одной аминокислотной замены, вставки, делеции и/или добавления по сравнению с нативной или геномной последовательностью; удаление одного или нескольких интронов, ассоциированных с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты; вставку одного или нескольких гетерологичных интронов; делецию одной или нескольких регуляторных областей, расположенных выше или ниже, которые ассоциированы с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты; вставку одного или нескольких гетерологичных регуляторных участков, расположенных выше или ниже; делецию 5'- и/или 3'-нетранслируемой области, ассоциированной с геномной последовательностью нуклеиновой кислоты; вставку гетерологичной 5'- и/или 3'-нетранслируемой области и модификацию сайта полиаденилирования. В некоторых вариантах осуществления молекула нуклеиновой кислоты, отличная от геномной, представляет собой кДНК.

Также предусматриваются молекулы нуклеиновой кислоты, которые кодируют продукты транскрипции и/или трансляции, которые впоследствии подвергаются сплайсингу с образованием в конечном итоге функциональных инсектицидных полипептидов. Сплайсинг может осуществляться in vitro или in vivo, и он может включать цис- или транс-сплайсинг. Субстратом для сплайсинга могут быть полинуклеотиды (например, РНК-транскрипты) или полипептиды. Примером цис-сплайсинга полинуклеотида является ситуация, когда интрон, вставленный в кодирующую последовательность, удаляется и два фланкирующих экзонных участка соединяются с образованием последовательности кодирующей, инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. Примером транс-сплайсинга будет ситуация, когда полинуклеотид кодируется с разделением кодирующей последовательности на два или более фрагментов, которые могут транскрибироваться раздельно, а затем соединяться с образованием пестицидной кодирующей последовательности полной длины. Применение последовательности энхансера сплайсинга, которую можно вводить в конструкцию, может облегчать сплайсинг, как цис-, так и транс-сплайсинг полипептидов (патенты США №№ 6365377 и 6531316). Таким образом, в некоторых вариантах осуществления полинуклеотиды непосредственно не кодируют инсектицидный полипептид полной длины по настоящему раскрытию, а вернее кодируют фрагмент или фрагменты инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию. Эти полинуклеотиды можно применять для экспрессии функционального инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию посредством механизма, включающего сплайсинг, при этом сплайсинг может происходить на уровне полинуклеотида (например, интрон/экзон) и/или полипептида (например, интеин/экстеин). Это может быть полезным, например, при контроле экспрессии пестицидной активности, поскольку функциональный пестицидный полипептид будет экспрессироваться только в том случае, если все требуемые фрагменты экспрессируются в среде, которая обеспечивает возможность процессов сплайсинга с образованием функционального продукта. В другом примере введение одной или нескольких инсерционных последовательностей в полинуклеотид может облегчать рекомбинацию с полинуклеотидом с низкой гомологией; при этом применение интрона или интеина в отношении инсерционной последовательности облегчает удаление вставочной последовательности, что восстанавливает тем самым функцию кодируемого варианта.

Молекулы нуклеиновой кислоты, которые являются фрагментами этих последовательностей нуклеиновой кислоты, кодирующих инсектицидные полипептиды, также охватываются вариантами осуществления. ʺФрагментʺ, используемый в данном документе, относится к части последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. Фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты может кодировать биологически активную часть инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, или он может представлять собой фрагмент, который можно применять в качестве гибридизационного зонда или ПЦР-праймера с применением раскрытых ниже способов. Молекулы нуклеиновой кислоты, которые являются фрагментами последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, содержат по меньшей мере приблизительно 130, 140, 150, 160, 170, 180, 190, 200, 210, 220, 230, 240, 250 или 260 смежных нуклеотидов или вплоть до количества нуклеотидов, присутствующих в последовательности нуклеиновой кислоты полной длины, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, раскрытый в данном документе, в зависимости от предполагаемого применения. "Смежные нуклеотиды" используется в данном документе для обозначения нуклеотидных остатков, которые непосредственно прилегают друг к другу. Фрагменты последовательностей нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления будут кодировать фрагменты белка, которые сохраняют биологическую активность инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию и, вследствие этого, сохраняют инсектицидную активность. "Сохраняет инсектицидную активность" используют в данном документе для обозначения полипептида, обладающего по меньшей мере приблизительно 10%, по меньшей мере приблизительно 30%, по меньшей мере приблизительно 50%, по меньшей мере приблизительно 70%, 80%, 90%, 95% или более высокой инсектицидной активностью нативного полипептида полной длины. В одном варианте осуществления инсектицидная активность представляет собой активность в отношении Lepidoptera. В одном варианте осуществления инсектицидная активность представляет собой активность в отношении видов жесткокрылых. В одном варианте осуществления инсектицидная активность представляет собой активность в отношении вида Diabrotica. В одном варианте осуществления инсектицидная активность представляет собой активность в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из группы кукурузных жуков: западного кукурузного жука, Diabrotica virgifera virgifera; северного кукурузного жука, D. barberi: блошки одиннадцатиточечной Говарда или жука-блошки одиннадцатиточечной; Diabrotica undecimpunctata howardi, и мексиканского кукурузного жука, D. virgifera zeae. В одном варианте осуществления инсектицидная активность представляет собой активность в отношении западного кукурузного жука, Diabrotica virgifera virgifera.

В некоторых вариантах осуществления фрагмент последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, кодирующий биологически активную часть белка, будет кодировать по меньшей мере приблизительно 15, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 75, 76, 77, 78, 79, 80, 81, 82, 83, 84 или 85 смежных аминокислот или вплоть до общего количества аминокислот, присутствующих в инсектицидном полипептиде полной длины согласно вариантам осуществления. В некоторых вариантах осуществления фрагмент представляет собой таковой с N-терминальным и/или C-терминальным усечением по меньшей мере приблизительно 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 или более аминокислот с N-конца и/или C-конца путем протеолиза, вставкой старт-кодона, делецией кодонов, кодирующих удаляемые аминокислоты, с одновременной вставкой стоп-кодона или путем вставки стоп-кодона в кодирующую последовательность.

Настоящее раскрытие предусматривает выделенные или рекомбинантные полинуклеотиды, которые кодируют любые из инсектицидных полипептидов, раскрытых в данном документе. Специалисты обычной квалификации в данной области легко поймут, что вследствие вырожденности генетического кода существует множество нуклеотидных последовательностей, кодирующих инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию. Таблица 1 представляет собой таблицу кодонов, которая представляет синонимичные кодоны для каждой аминокислоты. Например, все кодоны AGA, AGG, CGA, CGC, CGG и CGU кодируют аминокислоту аргинин. Таким образом, в каждом положении в нуклеиновых кислотах по настоящему раскрытию, в котором аргинин обозначен кодоном, кодон может быть изменен на любой из соответствующих вышеописанных кодонов без изменения кодируемого полипептида. Понятно, что U в последовательности РНК соответствует T в последовательности ДНК.

Таблица 1

Аланин Ala GCA GCC GCG GCU Цистеин Cys UGC UGU Аспарагиновая кислота Asp GAC GAU Глутаминовая кислота Glu GAA GAG Фенилаланин Phe UUC UUU Глицин Gly GGA GGC GGG GGU Гистидин His CAC CAU Изолейцин Ile AUA AUC AUU Лизин Lys AAA AAG Лейцин Leu UUA UUG CUA CUC CUG CUU Метионин Met AUG Аспарагин Asn AAC AAU Пролин Pro CCA CCC CCG CCU Глутамин Gln CAA CAG Аргинин Arg AGA AGG CGA CGC CGG CGU Серин Ser AGC AGU UCA UCC UCG UCU Треонин Thr ACA ACC ACG ACU Валин Val GUA GUC GUG UU Триптофан Trp UGG Тирозин Tyr UAC UAU

Кроме того, специалист в данной области поймет, что изменения можно вводить путем внесения мутаций в последовательности нуклеиновой кислоты, что ведет, тем самым, к изменениям в аминокислотной последовательности кодируемых инсектицидных полипептидов без изменения биологической активности белков. Таким образом, вариантные молекулы нуклеиновой кислоты можно создавать путем введения одной или нескольких нуклеотидных замен, добавлений и/или делеций в соответствующую последовательность нуклеиновой кислоты, раскрытую в данном документе, так что одна или несколько аминокислотных замен, добавлений или делеций вводятся в кодируемый белок. Мутации можно вводить с помощью стандартных методик, таких как сайт-направленный мутагенез и ПЦР-опосредованный мутагенез. Такие вариантные последовательности нуклеиновой кислоты также охватываются настоящим раскрытием.

В качестве альтернативы, вариантные последовательности нуклеиновой кислоты можно получать путем введения мутаций случайным образом по всей или части кодирующей последовательности, как, например, путем сайт-насыщающего мутагенеза, и полученных мутантов можно подвергать скринингу в отношении способности обеспечивать пестицидную активность для идентификации мутантов, которые сохраняют активность. После мутагенеза кодируемый белок можно экспрессировать рекомбинантным способом, и активность белка можно определять с применением стандартных методик анализа.

Полинуклеотиды по настоящему раскрытию и их фрагменты необязательно применяют в качестве субстратов для ряда реакций рекомбинации и рекуррентной рекомбинации, в дополнение к стандартным способам клонирования, изложенным, например, в Ausubel, Berger и Sambrook, т. е. для получения дополнительных гомологов пестицидных полипептидов и их фрагментов с требуемыми свойствами. Известен ряд таких реакций, в том числе разработанные авторами настоящего изобретения и их сотрудниками. Способы получения варианта любой нуклеиновой кислоты, приведенной в данном документе, включают рекуррентную рекомбинацию такого полинуклеотида со вторым (или большим количеством) полинуклеотидом, таким образом, получение библиотеки вариантных полинуклеотидов также представляет собой варианты осуществления по настоящему раскрытию, также как и полученные библиотеки, клетки, содержащие библиотеки и любой рекомбинантный полинуклеотид, полученный такими способами. Дополнительно такие способы необязательно включают отбор вариантного полинуклеотида из таких библиотек на основе пестицидной активности, как есть, где такую рекуррентную рекомбинацию осуществляют in vitro или in vivo.

Ряд протоколов создания разнообразия, в том числе протоколы рекуррентной рекомбинации нуклеиновых кислот, доступен и полностью описан в уровне техники. Для получения одного или нескольких вариантов нуклеиновой кислоты или набора нуклеиновых кислот, а также вариантов кодируемых белков, процедуры можно применять отдельно и/или в комбинации. По отдельности и вместе эти процедуры обеспечивают надежные, широко применяемые способы создания диверсифицированных нуклеиновых кислот и наборов нуклеиновых кислот (в том числе, например, библиотек нуклеиновых кислот), применимых, например, для конструирования или быстрой эволюции нуклеиновых кислот, белков, метаболических путей, клеток и/или организмов с новыми и/или улучшенными характеристиками.

Хотя в ходе следующего обсуждения для ясности делают разграничение и классификацию, будет принято во внимание, что методики часто не являются взаимоисключающими. Более того, различные способы можно применять по отдельности или в комбинации, одновременно или последовательно, для получения доступа к различным вариантам последовательностей.

Результатом любой из процедур создания разнообразия, описанных в данном документе, может быть создание одной или нескольких нуклеиновых кислот, которые можно подвергнуть отбору или скринингу в отношении нуклеиновых кислот, имеющих требуемые свойства или обеспечивающих их, или нуклеиновых кислот, которые кодируют белки, имеющие требуемые свойства или обеспечивающие их. После диверсификации с помощью одного или нескольких способов, описанных в данном документе или иным образом доступных специалисту в данной области, любые получаемые нуклеиновые кислоты можно подвергать отбору в отношении требуемой активности или свойства, например пестицидной активности или такой активности при требуемом значении pH и т. д. Это может включать идентификацию любой активности, которую можно выявить, например в автоматизированном или автоматизируемом формате, посредством любого из анализов, известных в уровне техники, см., например, обсуждение проведения скрининга в отношении инсектицидной активности, ниже. Можно оценивать ряд связанных (или даже несвязанных) свойств последовательно или одновременно, на усмотрение специалиста-практика.

Описание ряда процедур создания разнообразия с целью создания модифицированных последовательностей нуклеиновой кислоты, например последовательностей, кодирующих полипептиды с пестицидной активностью или их фрагменты,находят в следующих публикациях и литературе, приводимой в них: Soong, et al., (2000) Nat Genet 25(4):436-439; Stemmer, et al., (1999) Tumor Targeting 4:1-4; Ness, et al., (1999) Nat Biotechnol 17:893-896; Chang, et al., (1999) Nat Biotechnol 17:793-797; Minshull and Stemmer, (1999) Curr Opin Chem Biol 3:284-290; Christians, et al., (1999) Nat Biotechnol 17:259-264; Crameri, et al., (1998) Nature 391:288-291; Crameri, et al., (1997) Nat Biotechnol 15:436-438; Zhang, et al., (1997) PNAS USA 94:4504-4509; Patten, et al., (1997) Curr Opin Biotechnol 8:724-733; Crameri, et al., (1996) Nat Med 2:100-103; Crameri, et al., (1996) Nat Biotechnol 14:315-319; Gates, et al., (1996) J Mol Biol 255:373-386; Stemmer, (1996) ʺSexual PCR and Assembly PCRʺ в: The Encyclopedia of Molecular Biology. VCH Publishers, New York. pp. 447-457; Crameri and Stemmer, (1995) BioTechniques 18:194-195; Stemmer, et al., (1995) Gene, 164:49-53; Stemmer, (1995) Science 270: 1510; Stemmer, (1995) Bio/Technology 13:549-553; Stemmer, (1994) Nature 370:389-391 и Stemmer, (1994) PNAS USA 91:10747-10751.

Мутационные способы создания разнообразия включают, например, сайт-направленный мутагенез (Ling, et al., (1997) Anal Biochem 254(2):157-178; Dale, et al., (1996) Methods Mol Biol 57:369-374; Smith, (1985) Ann Rev Genet 19:423-462; Botstein and Shortle, (1985) Science 229:1193-1201; Carter, (1986) Biochem J 237:1-7 и Kunkel, (1987) ʺThe efficiency of oligonucleotide directed mutagenesisʺ в Nucleic Acids & Molecular Biology (Eckstein and Lilley, eds., Springer Verlag, Berlin)); мутагенез с применением урацил-содержащих матриц (Kunkel, (1985) PNAS USA 82:488-492; Kunkel, et al., (1987) Methods Enzymol 154:367-382 и Bass, et al., (1988) Science 242:240-245); олигонуклеотид-направленный мутагенез (Zoller and Smith, (1983) Methods Enzymol 100:468-500; Zoller and Smith, (1987) Methods Enzymol 154:329-350 (1987); Zoller and Smith, (1982) Nucleic Acids Res 10:6487-6500), мутагенез фосфотиоат-модифицированной ДНК (Taylor, et al., (1985) Nucl Acids Res 13:8749-8764; Taylor, et al., (1985) Nucl Acids Res 13:8765-8787 (1985); Nakamaye and Eckstein, (1986) Nucl Acids Res 14:9679-9698; Sayers, et al., (1988) Nucl Acids Res 16:791-802 и Sayers, et al., (1988) Nucl Acids Res 16:803-814); мутагенез с применением дуплексной ДНК с гэпом (Kramer, et al., (1984) Nucl Acids Res 12:9441-9456; Kramer and Fritz, (1987) Methods Enzymol 154:350-367; Kramer, et al., (1988) Nucl Acids Res 16:7207 и Fritz, et al., (1988) Nucl Acids Res 16:6987-6999).

Дополнительные подходящие способы включают точечную репарацию ошибочно спаренных оснований (Kramer, et al., (1984) Cell 38:879-887), мутагенез с применением штаммов-хозяев с недостаточностью репарации (Carter, et al., (1985) Nucl Acids Res 13:4431-4443 и Carter, (1987) Methods in Enzymol 154:382-403), делеционный мутагенез (Eghtedarzadeh and Henikoff, (1986) Nucl Acids Res 14:5115), рестрикцию-отбор и рестрикцию-очистку (Wells, et al., (1986) Phil Trans R Soc Lond A 317:415-423), мутагенез посредством полного синтеза гена (Nambiar, et al., (1984) Science 223:1299-1301; Sakamar and Khorana, (1988) Nucl Acids Res 14:6361-6372; Wells, et al., (1985) Gene 34:315-323 и Grundström, et al., (1985) Nucl Acids Res 13:3305-3316), репарацию двухцепочечных разрывов (Mandecki, (1986) PNAS USA, 83:7177-7181 и Arnold, (1993) Curr Opin Biotech 4:450-455). Дополнительные сведения по многим из вышеуказанных способов можно найти в Methods Enzymol, том 154, в котором также описаны полезные руководства по поиску и устранению проблем в случае различных способов мутагенеза.

Дополнительные подробности, касающиеся различных способов создания разнообразия, можно найти в следующих патентах США, публикациях и заявках согласно PCT и публикациях EPO: патенте США № 5723323, патенте США № 5763192, патенте США № 5814476, патенте США № 5817483, патенте США № 5824514, патенте США № 5976862, патенте США № 5605793, патенте США № 5811238, патенте США № 5830721, патенте США № 5834252, патенте США № 5837458, WO 1995/22625, WO 1996/33207, WO 1997/20078, WO 1997/35966, WO 1999/41402, WO 1999/41383, WO 1999/41369, WO 1999/41368, EP 752008, EP 0932670, WO 1999/23107, WO 1999/21979, WO 1998/31837, WO 1998/27230, WO 1998/27230, WO 2000/00632, WO 2000/09679, WO 1998/42832, WO 1999/29902, WO 1998/41653, WO 1998/41622, WO 1998/42727, WO 2000/18906, WO 2000/04190, WO 2000/42561, WO 2000/42559, WO 2000/42560, WO 2001/23401 и PCT/US01/06775.

Нуклеотидные последовательности согласно вариантам осуществления также можно применять для выделения соответствующих последовательностей из других организмов, в частности других бактерий, в частности видов рода Pseudomonas и более конкретно Pseudomonas putida, Pseudomonas fulva или штамма Pseudomonas chlororaphis. Таким образом, такие способы как ПЦР, гибридизация и т. п. можно применять для идентификации таких последовательностей на основе гомологии их последовательности с последовательностями, изложенными в данном документе. Вариантами осуществления охватываются последовательности, выбранные на основе идентичности их последовательности полным последовательностям, изложенным в данном документе, или их фрагментам. Такие последовательности включают в себя последовательности, которые являются ортологами раскрытых последовательностей. Термин "ортологи" относится к генам, происходящим от общего предкового гена и выявляемым у различных видов вследствие видообразования. Гены, обнаруживаемые у различных видов, считаются ортологами, в случае если их нуклеотидные последовательности и/или кодируемые ими белковые последовательности имеют существенную степень идентичности, как определено в других разделах данного документа. Функции ортологов часто являются высококонсервативными среди видов.

В случае подхода, основанного на ПЦР, олигонуклеотидные праймеры можно сконструировать для применения в ПЦР-реакциях для амплификации соответствующих последовательностей ДНК, исходя из кДНК или геномной ДНК, извлеченных из какого-либо организма, представляющего интерес. Способы конструирования ПЦР-праймеров и ПЦР-клонирования, как правило, известны в уровне техники и раскрыты в Sambrook, et al., (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2d ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Plainview, New York), в дальнейшем "Sambrook". См. также Innis et al., eds. (1990) PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications (Academic Press, New York); Innis and Gelfand, eds. (1995) PCR Strategies (Academic Press, New York); и Innis and Gelfand, eds. (1999) PCR Methods Manual (Academic Press, New York). Известные способы ПЦР включают без ограничения способы с применением парных праймеров, гнездовых праймеров, одиночных специфичных праймеров, вырожденных праймеров, ген-специфичных праймеров, вектор-специфичных праймеров, частично ошибочно спаренных праймеров и т. п.

Для идентификации потенциальных инсектицидных полипептидов из коллекций бактерий, лизаты бактериальных клеток можно подвергать скринингу с применением антител, вырабатываемых в отношении инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию с применением способов вестерн-блоттинга и/или ELISA. Этот тип анализов можно проводить высокопроизводительным образом. Положительные образцы можно дополнительно анализировать с помощью различных методик, таких как очистка и идентификация белков с помощью антител. Способы получения антител хорошо известны в уровне техники, как обсуждается ниже.

В качестве альтернативы, для идентификации гомологов инсектицидных полипептидов можно применять способ идентификации белков на основе масс-спектрометрии с применением протоколов из литературных источников (Scott Patterson, (1998), 10.22, 1-24, Current Protocol in Molecular Biology, опубликованный John Wiley & Son Inc). Точнее говоря, способ идентификации белков на основе LC-MS/MS применяют для установления связи MS-данных указанных клеточных лизатов или образцов, обогащенных молекулами с требуемым молекулярным весом (вырезанных из геля SDS-PAGE с полосками с соответствующим молекулярным весом), с информацией о последовательности инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию. Любое совпадение в пептидных последовательностях указывает на возможность наличия гомологов в образцах. Дополнительные методики (очистки белка и методики молекулярной биологии) можно применять для выделения белка и идентификации последовательностей гомологов.

В способах гибридизации для скрининга кДНК или геномных библиотек можно применять всю или часть последовательности пестицидной нуклеиновой кислоты. Способы для конструирования таких кДНК и геномных библиотек, как правило, известны в уровне техники и раскрыты в Sambrook и Russell, (2001), выше. Так называемые гибридизационные зонды могут представлять собой фрагменты геномной ДНК, фрагменты кДНК, фрагменты РНК или другие олигонуклеотиды, и они могут быть помечены детектируемой группой, такой как 32P, или любым другим детектируемым маркером, таким как другие радиоактивные изотопы, флуоресцентное соединение, фермент или кофактор фермента. Зонды для гибридизации можно получать путем мечения синтетических олигонуклеотидов, основанных на последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей инсектицидный полипептид, раскрытой в данном документе. Дополнительно можно применять вырожденные праймеры, сконструированные на основе консервативных нуклеотидных или аминокислотных остатков в последовательности нуклеиновой кислоты или кодируемой аминокислотной последовательности. Как правило, зонд содержит участок последовательности нуклеиновой кислоты, который гибридизуется при жестких условиях по меньшей мере с приблизительно 12, по меньшей мере с приблизительно 25, по меньшей мере с приблизительно 50, 75, 100, 125, 150, 175 или 200 смежными нуклеотидами последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию или его фрагмент или вариант. Способы получения зондов для гибридизации, как правило, известны в уровне техники и раскрыты в Sambrook и Russell, (2001), выше, включенном в данный документ с помощью ссылки.

Например, полную последовательность нуклеиновой кислоты, кодирующую инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, раскрытую в данном документе, или одну или несколько ее частей можно применять в качестве зонда, способного специфично гибридизоваться с соответствующими последовательностями нуклеиновой кислоты, кодирующими последовательности, подобные инсектицидному полипептиду, и матричными РНК. Для достижения специфичной гибридизации при различных условиях такие зонды включают в себя последовательности, которые являются уникальными и предпочтительно состоят по меньшей мере из приблизительно 10 нуклеотидов в длину или по меньшей мере из приблизительно 20 нуклеотидов в длину. Такие зонды можно применять для амплификации соответствующих пестицидных последовательностей из выбранного организма с помощью ПЦР. Эту методику можно применять для выделения дополнительных кодирующих последовательностей из требуемого организма или в качестве диагностического анализа для определения присутствия кодирующих последовательностей в организме. Методики гибридизации включают гибридизационный скрининг высеянных ДНК-библиотек (либо бляшек, либо колоний; см., например, Sambrook, et al., (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2d ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.).

Гибридизацию таких последовательностей можно проводить в жестких условиях. "Жесткие условия" или "жесткие условия гибридизации" применяются в данном документе для обозначения условий, при которых зонд будет гибридизоваться со своей целевой последовательностью в явно большей степени, чем с другими последовательностями (например, по меньшей мере в 2 раза больше по сравнению с фоновой последовательностью). Жесткие условия являются зависимыми от последовательности и будут отличаться при различных обстоятельствах. Путем контроля жесткости условий гибридизации и/или отмывки можно идентифицировать целевые последовательности, которые на 100% комплементарны зонду (гибридизация с гомологичным зондом). В качестве альтернативы, условия жесткости можно откорректировать для обеспечения некоторого ошибочного спаривания в последовательностях с тем, чтобы выявлять более низкие степени сходства (гибридизация с гетерологичным зондом). В целом, зонд составляет менее приблизительно 1000 нуклеотидов в длину, предпочтительно менее 500 нуклеотидов в длину.

Как правило, жесткие условия будут такими, при которых концентрация соли составляет менее приблизительно 1,5 M ионов Na, обычно концентрация ионов Na (или других солей) составляет приблизительно 0,01-1,0 M при pH 7,0-8,3, а температура составляет по меньшей мере приблизительно 30°C для коротких зондов (например, 10-50 нуклеотидов) и по меньшей мере приблизительно 60°C для длинных зондов (например, более 50 нуклеотидов). Жесткие условия также могут быть достигнуты с помощью добавления дестабилизирующих средств, таких как формамид. Иллюстративные условия низкой жесткости включают гибридизацию в буферном растворе с 30-35% формамида, 1 M NaCl, 1% SDS (додецилсульфата натрия) при 37°C и отмывку в 1× - 2×SSC (20×SSC=3,0 M NaCl/0,3 M цитрата тринатрия) при 50-55°C. Иллюстративные условия умеренной жесткости включают гибридизацию в 40-45% формамиде, 1,0 M NaCl, 1% SDS при 37°C и отмывку в 0,5× - 1×SSC при 55-60°C. Иллюстративные условия высокой жесткости включают гибридизацию в 50% формамиде, 1 M NaCl, 1% SDS при 37°C и отмывку в 0,1×SSC при 60-65°C. Необязательно, отмывочные буферы могут содержать от приблизительно 0,1% до приблизительно 1% SDS. В целом, длительность гибридизации составляет менее приблизительно 24 часов, обычно от приблизительно 4 до приблизительно 12 часов.

Специфичность, как правило, зависит от процедур отмывки после гибридизации, причем ключевыми факторами являются ионная сила и температура конечного отмывающего раствора. Для гибридов ДНК-ДНК Tm можно примерно рассчитать из уравнения Meinkoth и Wahl, (1984) Anal. Biochem. 138:267-284: Tm=81,5°C+16,6 (log M)+0,41 (% GC) - 0,61 (% форм.) - 500/л; где M представляет собой молярность одновалентных катионов, % GC представляет собой процентную долю гуанозиновых и цитозиновых нуклеотидов в ДНК, % форм. представляет собой процентную долю формамида в растворе для гибридизации, и L представляет собой длину гибрида в парах оснований. Tm представляет собой температуру (при определенной ионной силе и pH), при которой 50% комплементарной целевой последовательности гибридизуется с идеально совпадающим зондом. Tm снижают на приблизительно 1°C для каждого 1% ошибочного спаривания; таким образом, Tm, условия гибридизации и/или отмывки можно откорректировать для гибридизации с последовательностями требуемой идентичности. Например, если необходимы последовательности, идентичные на ≧90%, то Tm можно снизить на 10°C. Как правило, жесткие условия выбирают так, чтобы они были приблизительно на 5°C ниже температуры плавления (Tm) конкретной последовательности и комплементарной ей последовательности при определенных ионной силе и значении pH. Однако при условиях сильной жесткости могут применяться гибридизация и/или отмывка при температуре на 1, 2, 3 или 4°C ниже температуры плавления (Tm); при условиях умеренной жесткости могут применяться гибридизация и/или отмывка при температуре на 6, 7, 8, 9 или 10°C ниже температуры плавления (Tm); при условиях низкой жесткости могут применяться гибридизация и/или отмывка при температуре на 11, 12, 13, 14, 15 или 20°C ниже температуры плавления (Tm). Специалистам будет понятно, что изменения жесткости растворов для гибридизации и/или отмывающих растворов по сути описаны с применением уравнения, композиций для гибридизации и отмывки и требуемой Tm. Если требуемая степень ошибочного спаривания приводит к Tm меньше 45°C (водный раствор) или 32°C (раствор формамида), то предпочтительно повысить концентрацию SSC так, чтобы можно было применять более высокую температуру. Исчерпывающее руководство по гибридизации нуклеиновых кислот приведено в Tijssen, (1993) Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology-Hybridization with Nucleic Acid Probes, Part I, Chapter 2 (Elsevier, N.Y.) и Ausubel, et al., eds. (1995) Current Protocols in Molecular Biology, Chapter 2 (Greene Publishing and Wiley-Interscience, New York). См. Sambrook, et al., (1989) Molecular Cloning: A Laboratory Manual (2d ed., Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, N.Y.).

Белки, а также их варианты и фрагменты

Один аспект настоящего раскрытия представляет собой выделенные инсектицидные полипептиды.

Полипептиды PIP-45-1 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 45-1 Pseudomonas ", "полипептид PIP-45-1" или "белок PIP-45-1", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 1. Предполагается ряд полипептидов PIP-45-1. Одним источником полипептида PIP-45-1 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 220 или SEQ ID NO: 222, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 и SEQ ID NO: 236. Один источник полипептида PIP-45-1 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Thalassuspira, Paracoccus или Cellvibrio. Один источник полипептида PIP-45-1 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas monteilii, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas plecoglossicida, Pseudomonas putida, Pseudomonas poae, Pseudomonas trivialis, Pseudomonas libanensis, Pseudomonas fluorescens и Pseudomonas asplenii.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-1.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 99,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 99,6% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 19. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 21. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 88% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 23. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 27. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 99,8% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 29. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 92,3% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 31. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 91,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 33. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 95,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 93% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 97,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 43. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-1 по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 45.

Полипептиды PIP-45-2 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 45-2 Pseudomonas ", "полипептид PIP-45-2" или "белок PIP-45-2", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 2. Предполагается ряд полипептидов PIP-45-2. Одним источником полипептида PIP-45-2 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 221 или SEQ ID NO: 223, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237. Один источник полипептида PIP-45-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Thalassuspira, Paracoccus или Cellvibrio. Один источник полипептида PIP-45-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas monteilii, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas plecoglossicida, Pseudomonas putida, Pseudomonas poae, Pseudomonas trivialis, Pseudomonas libanensis, Pseudomonas fluorescens и Pseudomonas asplenii.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-2. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 99,2% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 2. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 20. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 22. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 81% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 24. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 99,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 28. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 30. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 92% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 32. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 91,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 34. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 36. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 90% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 40. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 94% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 44. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-45-2 по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 46.

Полипептиды PIP-64-1 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 64-1 Pseudomonas ", "полипептид PIP-64-1" или "белок PIP-64-1", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 53. Предполагается ряд полипептидов PIP-64-1. Одним источником полипептида PIP-64-1 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 165 или SEQ ID NO: 224, который кодирует полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 и SEQ ID NO: 238. Один источник полипептида PIP-64-1 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Alcaligenes. Один источник полипептида PIP-64-1 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas или Alcaligenes, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas brassicacearum, Pseudomonas entomophila и Alcaligenes faecalis.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-1 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-1. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-1 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-1 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 53. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-1 по меньшей мере на 99,7% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 58. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-1 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 238.

Полипептиды PIP-64-2 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 64-2 Pseudomonas ", "полипептид PIP-64-2" или "белок PIP-64-2", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO:54. Предполагается ряд полипептидов PIP-64-2. Одним источником полипептида PIP-64-2 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 166 или SEQ ID NO: 225, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 и SEQ ID NO: 239. Один источник полипептида PIP-64-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Alcaligenes. Один источник полипептида PIP-64-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas или Alcaligenes, выбранного без ограничения из Pseudomonas brenneri, Pseudomonas gessardii, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas brassicacearum, Pseudomonas entomophila и Alcaligenes faecalis.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-2. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 по меньшей мере на 91% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 59. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-64-2 по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 239.

Полипептиды PIP-74-1 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 74-1 Pseudomonas ", "полипептид PIP-74-1" или "белок PIP-74-1", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 73. Предполагается ряд полипептидов PIP-74-1. Одним источником полипептида PIP-74-1 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 182 или SEQ ID NO: 184, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-1 с SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 и SEQ ID NO: 77. Один источник полипептида PIP-74-1 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas. Один источник полипептида PIP-74-1 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas rhodesiae и Pseudomonas orientalis.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-1 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-1. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-1 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-1 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 73. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-1 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 75. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-1 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 77.

Полипептиды PIP-74-2 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 74-2 Pseudomonas ", "полипептид PIP-74-2" или "белок PIP-74-2", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 74. Предполагается ряд полипептидов PIP-74-2. Одним источником полипептида PIP-74-2 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 185, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-2 с SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 и SEQ ID NO: 78. Один источник полипептида PIP-74-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas. Один источник полипептида PIP-74-2 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas rhodesiae и Pseudomonas orientalis.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-2 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-2. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-2 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-2 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 74. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-2 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 76. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-74-2 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 78.

Полипептиды PIP-75 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 75 Pseudomonas ", "полипептид PIP-75" или "белок PIP-75", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 79. Предполагается ряд полипептидов PIP-75. Одним источником полипептида PIP-75 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193 или SEQ ID NO: 194, соответственно кодирующий полипептид PIP-75 с SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 87. Один источник полипептида PIP-75 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Serratia. Один источник полипептида PIP-75 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter или Serratia, выбранного без ограничения из Pseudomonas Antarctica, Pseudomonas orientalis, Enterobacter asburiae, Serratia plymuthica и Serratia liquefaciens.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-75. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 79. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 80. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 81. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 84. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 85. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 86. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-75 по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 87.

Полипептиды PIP-77 охвачены настоящим раскрытием. "Инсектицидный белок 77 Pseudomonas", "полипептид PIP-77" или "белок PIP-77", используемые в данном документе взаимозаменяемо, относятся к полипептиду с инсектицидной активностью в отношении одного или нескольких насекомых-вредителей из отрядов Lepidoptera и/или Coleoptera и достаточно гомологичны белку с SEQ ID NO: 88. Предполагается ряд полипептидов PIP-77. Одним источником полипептида PIP-77 или родственных белков является бактериальный штамм, который содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO:196, SEQ ID NO:197, SEQ ID NO:198, SEQ ID NO:199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228 или SEQ ID NO: 231, соответственно кодирующий полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 и SEQ ID NO: 245. Один источник полипептида PIP-77 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, Enterobacter, Shewanella, Haemophilus или Aeromonas. Один источник полипептида PIP-77 или родственных белков происходит из штамма Pseudomonas, выбранного без ограничения из Pseudomonas chlororaphis, Pseudomonas brassicacearum, Pseudomonas fluorescens и Pseudomonas rhodesiae.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и он обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-77. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245.

В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 93% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 88. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 97% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 89. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 99% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 90. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 97% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 92. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 93. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 94. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 95. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 84% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 96. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 97. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 83% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 98. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 100. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 241. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 83% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 242. В некоторых вариантах осуществления последовательность полипептида PIP-77 по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 245.

Термины "белок", "пептидная молекула" или "полипептид", используемые в данном документе, включают в себя любую молекулу, которая содержит пять или более аминокислот. В уровне техники хорошо известно, что белковые, пептидные или полипептидные молекулы могут подвергаться модификации, в том числе посттрансляционным модификациям, таким как без ограничения образование дисульфидных связей, гликозилирование, фосфорилирование или олигомеризация. Таким образом, используемые в данном документе термины "белок", "пептидная молекула" или "полипептид" включают в себя любой белок, который модифицирован посредством какого-либо биологического или небиологического процесса. Термины "аминокислота" и "аминокислоты" относятся ко всем встречающимся в природе L-аминокислотам.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-45-1 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 40 кДа до приблизительно 80 кДа, от приблизительно 50 кДа до приблизительно 70 кДа, от приблизительно 60 кДа до приблизительно 65 кДа, от приблизительно 61 кДа до приблизительно 64 кДа, от приблизительно 62 кДа до приблизительно 63 кДа и от приблизительно 62,25 кДа до приблизительно 62,75 кДа. Термин ʺприблизительноʺ, используемый в данном документе в контексте молекулярного веса инсектицидного полипептида, обозначает±0,25 килодальтон.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-45-2 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 40 кДа до приблизительно 80 кДа, от приблизительно 50 кДа до приблизительно 64 кДа, от приблизительно 55 кДа до приблизительно 60 кДа, от приблизительно 56,5 кДа до приблизительно 59 кДа и от приблизительно 57,25 кДа до приблизительно 58 кДа.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-64-1 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 20 кДа до приблизительно 40 кДа, от приблизительно 25 кДа до приблизительно 32 кДа, от приблизительно 26 кДа до приблизительно 31 кДа, от приблизительно 27 кДа до приблизительно 30 кДа, от приблизительно 28 кДа до приблизительно 29 кДа и от приблизительно 28,1 кДа до приблизительно 28,7 кДа.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-64-2 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 20 кДа до приблизительно 40 кДа, от приблизительно 25 кДа до приблизительно 32 кДа, от приблизительно 26 кДа до приблизительно 31 кДа, от приблизительно 27 кДа до приблизительно 30 кДа и от приблизительно 28,25 кДа до приблизительно 29 кДа.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-74-1 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 40 кДа до приблизительно 80 кДа, от приблизительно 50 кДа до приблизительно 70 кДа, от приблизительно 55 кДа до приблизительно 73 кДа, от приблизительно 57 кДа до приблизительно 61 кДа, от приблизительно 58 кДа до приблизительно 60 кДа и от приблизительно 58,75 кДа до приблизительно 59,25 кДа. Термин ʺприблизительноʺ, используемый в данном документе в контексте молекулярного веса инсектицидного полипептида, обозначает±0,25 килодальтон.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-74-2 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 35 кДа до приблизительно 65 кДа, от приблизительно 45 кДа до приблизительно 51,5 кДа, от приблизительно 47,5 кДа до приблизительно 49,5 кДа и от приблизительно 48,25 кДа до приблизительно 48,75 кДа.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-75 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 6 кДа до приблизительно 14 кДа, от приблизительно 8 кДа до приблизительно 13,5 кДа, от приблизительно 9 кДа до приблизительно 12 кДа, от приблизительно 9,5 кДа до приблизительно 11,5 кДа и от приблизительно 10,4 кДа до приблизительно 10,8 кДа.

В некоторых вариантах осуществления полипептид PIP-77 характеризуется расчетным молекулярным весом, составляющим от приблизительно 7 кДа до приблизительно 13 кДа, от приблизительно 8 кДа до приблизительно 12 кДа, от приблизительно 9 кДа до приблизительно 11 кДа, от приблизительно 9,5 кДа до приблизительно 10,3 кДа и от приблизительно 9,75 кДа до приблизительно 10,25 кДа.

В некоторых вариантах осуществления инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию характеризуются модифицированным физическим свойством. Термин "физическое свойство", используемый в данном документе, относится к любому параметру, который подходит для описания физико-химических характеристик белка. "Физическое свойство, представляющее интерес" и "свойство, представляющее интерес", используемые в данном документе, используются взаимозаменяемо для обозначения физических свойств белков, подлежащих исследованию и/или модификации. Примеры физических свойств включают без ограничения суммарный поверхностный заряд и распределение зарядов на поверхности белка, суммарную гидрофобность и распределение гидрофобных остатков на поверхности белка, плотность поверхностного заряда, плотность гидрофобности поверхности, общее число поверхностных ионизируемых групп, поверхностное натяжение, размер белка и его распределение в растворе, температуру плавления, теплоемкость и второй вириальный коэффициент. Примеры физических свойств также включают без ограничения растворимость, фолдинг, стабильность и усвояемость. В некоторых вариантах осуществления инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию характеризуется повышенной усвояемостью протеолитических фрагментов в кишечнике насекомого. Модели для расщепления с помощью искусственного желудочного сока известны специалисту в данной области (Fuchs, R.L. and J.D. Astwood. Food Technology 50: 83-88, 1996; Astwood, J.D., et al Nature Biotechnology 14: 1269-1273, 1996; Fu TJ et al J. Agric Food Chem. 50: 7154-7160, 2002).

В некоторых вариантах осуществления варианты включают полипептиды, которые отличаются по аминокислотной последовательности вследствие мутагенеза. Вариантные белки, охваченные настоящим раскрытием, являются биологически активными, то есть они все еще обладают требуемой биологической активностью (т. е. пестицидной активностью) нативного белка. В некоторых вариантах осуществления вариант будет обладать по меньшей мере приблизительно 10%, по меньшей мере приблизительно 30%, по меньшей мере приблизительно 50%, по меньшей мере приблизительно 70%, по меньшей мере приблизительно 80% или более инсектицидной активности нативного белка. В некоторых вариантах осуществления варианты могут обладать усиленной активностью по сравнению с нативным белком.

Бактериальные гены довольно часто имеют несколько метиониновых инициаторных кодонов поблизости от стартового сайта открытой рамки считывания. Зачастую, инициация трансляции по одному или нескольким из этих старт-кодонов будет приводить к образованию функционального белка. Эти старт-кодоны могут включать кодоны ATG. Однако бактерии, такие как Bacillus sp., также распознают кодон GTG в качестве старт-кодона, и белки, трансляция которых инициируется по кодонам GTG, в качестве первой аминокислоты содержат метионин. В редких случаях, трансляция в бактериальных системах может инициироваться по кодону TTG, хотя в таком случае TTG кодирует метионин. Кроме того, зачастую a priori не определяют, какой из этих кодонов естественным образом используется в бактерии. Таким образом понятно, что применение одного из взаимных метиониновых кодонов может также приводить к образованию пестицидных белков. Эти пестицидные белки охватываются настоящим раскрытием и могут применяться в способах по настоящему раскрытию. Будет понятно, что при экспрессии в растениях будет необходимо изменить взаимный старт-кодон на ATG для надлежащей трансляции.

В другом аспекте инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию может экспрессироваться в виде белка-предшественника со вставочной последовательностью, которая катализирует многостадийный посттрансляционный сплайсинг белка. Сплайсинг белка предусматривает вырезание вставочных последовательностей из полипептида с одновременным присоединением фланкирующих последовательностей с получением нового полипептида (Chong, et al., (1996) J. Biol. Chem., 271:22159-22168). Эта вставочная последовательность или элемент сплайсинга белка, называемые интеинами, которые катализируют свое собственное вырезание посредством трех согласованных реакций на N-терминальной и C-терминальной границах сплайсинга: ацильной перестройки N-терминального цистеина или серина; реакции переэтерификации между двумя концами с образованием разветвленного сложноэфирного или тиоэфирного промежуточного соединения и расщепления пептидной связи, сопряженного с образованием кольца с участием C-терминального аспарагина интеина с высвобождением интеина (Evans, et al., (2000) J. Biol. Chem., 275:9091-9094). Выяснение механизма сплайсинга белка привело к возникновению ряда применений, связанных с интеинами (Comb et al., патент США № 5496714; Comb et al., патент США № 5834247; Camarero and Muir, (1999) J. Amer. Chem. Soc. 121:5597-5598; Chong, et al., (1997) Gene 192:271-281, Chong, et al., (1998) Nucleic Acids Res. 26:5109-5115; Chong, et al., (1998) J. Biol. Chem. 273:10567-10577; Cotton, et al., (1999) J. Am. Chem. Soc. 121:1100-1101; Evans, et al., (1999) J. Biol. Chem. 274:18359-18363; Evans, et al., (1999) J. Biol. Chem. 274:3923-3926; Evans, et al., (1998) Protein Sci. 7:2256-2264; Evans, et al., (2000) J. Biol. Chem. 275:9091-9094; Iwai and Pluckthun, (1999) FEBS Lett. 459:166-172; Mathys, et al., (1999) Gene 231:1-13; Mills, et al., (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:3543-3548; Muir, et al., (1998) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:6705-6710; Otomo, et al., (1999) Biochemistry 38:16040-16044; Otomo, et al., (1999) J. Biolmol. NMR 14:105-114; Scott, et al., (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96:13638-13643; Severinov and Muir, (1998) J. Biol. Chem. 273:16205-16209; Shingledecker, et al., (1998) Gene 207:187-195; Southworth, et al., (1998) EMBO J. 17:918-926; Southworth, et al., (1999) Biotechniques 27:110-120; Wood, et al., (1999) Nat. Biotechnol. 17:889-892; Wu, et al., (1998a) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 95:9226-9231; Wu, et al., (1998b) Biochim Biophys Acta 1387:422-432; Xu, et al., (1999) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 96:388-393; Yamazaki, et al., (1998) J. Am. Chem. Soc., 120:5591-5592). Относительно применения интеинов в растительных трансгенах см. Yang, et al., (Transgene Res 15:583-593 (2006)) и Evans, et al., (Annu. Rev. Plant Biol. 56:375-392 (2005)).

В другом аспекте инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию может кодироваться двумя отдельными генами, при этом интеин белка-предшественника берет начало от двух генов, называемый сплит-интеином, и две части предшественника соединяются при образовании пептидной связи. Это образование пептидной связи осуществляется с помощью транс-сплайсинга, опосредованного интеином. С этой целью, первая и вторая кассеты экспрессии, содержащие два отдельных гена, дополнительно кодируют интеины, способные опосредовать транс-сплайсинг белков. С помощью транс-сплайсинга белки и полипептиды, кодируемые первым и вторым фрагментами, могут быть связаны путем образования пептидной связи. Интеины транс-сплайсинга можно выбирать из ядерного генома или генома органелл различных организмов, в том числе эукариот, архебактерий и эубактерий. Интеины, которые можно применять, перечислены на сайте по адресу neb.com/neb/inteins.html, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). Нуклеотидную последовательность, кодирующую интеин, можно разделять на 5′-часть и 3′-часть, которые кодируют соответственно 5′-часть и 3′-часть интеина. Части последовательности, которые не являются необходимыми для интеин-сплайсинга (например, домен хоминг-эндонуклеазы), могут быть удалены. Интеин-кодирующая последовательность расщепляется, так что 5′- и 3′-части способны к транс-сплайсингу. Для выбора подходящего сайта расщепления интеин-кодирующей последовательности можно следовать соображениям, опубликованным у Southworth, et al., (1998) EMBO J. 17:918-926. При конструировании первой и второй кассет экспрессии 5′ интеин-кодирующую последовательность соединяют с 3′-концом первого фрагмента, кодирующего N-терминальную часть инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, а 3′ интеин-кодирующую последовательность соединяют с 5′-концом второго фрагмента, кодирующего C-терминальную часть инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию.

В целом, партнеров для транс-сплайсинга можно конструировать с использованием любого сплит-интеина, в том числе любых встречающихся в природе или искусственно расщепленных сплит-интеинов. Известны несколько встречающихся в природе сплит-интеинов, например: сплит-интеин гена DnaE PCC6803 Synechocystis sp. (см. Wu, et al., (1998) Proc Natl Acad Sci USA. 95(16):9226-31 и Evans, et al., (2000) J Biol Chem. 275(13):9091-4 и гена DnaE из Nostoc punctiforme (см. Iwai, et al., (2006) FEBS Lett. 580(7):1853-8). Интеины, не относящиеся к сплит-интеинам, были искусственно расщеплены в лаборатории с созданием новых сплит-интеинов, например: искусственно расщепленный интеин Ssp DnaB (см. Wu, et al., (1998) Biochim Biophys Acta. 1387:422-32), и расщепленный интеин Sce VMA (см. Brenzel, et al., (2006) Biochemistry. 45(6):1571-8), и искусственно расщепленный грибной мини-интеин (см. Elleuche, et al., (2007) Biochem Biophys Res Commun. 355(3):830-4). Также доступны базы данных по интеинам, в которых перечислены известные интеины (см., например, базу данных, доступную в режиме реального времени на сайте по адресу: bioinformatics.weizmann.ac.il/˜pietro/inteins/Inteinstable.html, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www").

Встречающиеся в природе интеины, не относящиеся к сплит-интеинам, могут обладать эндонуклеазной или другими видами ферментативной активности, которые, как правило, можно устранять при конструировании искусственно расщепленного сплит-интеина. Такие мини-интеины или минимизированные сплит-интеины хорошо известны из уровня техники и, как правило, они состоят из менее чем 200 аминокислотных остатков в длину (см. Wu, et al., (1998) Biochim Biophys Acta. 1387:422-32). Подходящие сплит-интеины могут иметь другие обеспечивающие очистку полипептидные элементы, добавляемые к их структуре, при условии, что такие элементы не ингибируют сплайсинг сплит-интеина, или их добавляют таким способом, который дает возможность удалить их перед сплайсингом. Сообщалось о сплайсинге белка с применением белков, которые содержат бактериальные интеин-подобные (BIL) домены (см. Amitai, et al., (2003) Mol Microbiol. 47:61-73) и самопроцессирующиеся домены hedgehog (Hog) (последние при объединении с интеинами называют суперсемейством Hog/интеин или семейством HINT (см. Dassa, et al., (2004) J Biol Chem. 279:32001-7), и домены, такие как эти, можно также применять для получения искусственно расщепленных интеинов. В частности, не подвергающихся сплайсингу представителей таких семейств можно модифицировать с помощью методик молекулярной биологии для введения или восстановления активности сплайсинга в таких родственных разновидностях. Последние исследования показывают, что сплайсинг можно наблюдать при обеспечении реакции N-терминального компонента сплит-интеина с C-терминальным компонентом сплит-интеина, при этом в естественных условиях он не является его "партнером"; например, сплайсинг наблюдали при использовании партнеров, которые всего на 30-50% гомологичны "природному" сплайсинг-партнеру (см. Dassa, et al., (2007) Biochemistry. 46(1):322-30). Было показано, что другие такие смеси несовместимых партнеров сплит-интеинов не реагируют друг с другом (см. Brenzel, et al., (2006) Biochemistry. 45(6):1571-8). Однако, в пределах компетенции специалиста в соответствующей области определить, может ли конкретная пара полипептидов связываться друг с другом с обеспечением функционального интеина, с применением стандартных способов и без использования изобретательских навыков.

В другом аспекте инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию представляет собой вариант с круговыми перестановками. Разработка способов с применением рекомбинантной ДНК обеспечивала возможность исследовать эффекты транспозиции последовательностей на фолдинг, структуру и функцию белка. Подход, применяемый при создании новых последовательностей, напоминает то, что происходит со встречающимися в природе парами белков, которые связываются посредством линейной реорганизации их аминокислотных последовательностей (Cunningham, et al., (1979) Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 76:3218-3222; Teather and Erfle, (1990) J. Bacteriol. 172:3837-3841; Schimming, et al., (1992) Eur. J. Biochem. 204:13-19; Yamiuchi and Minamikawa, (1991) FEBS Lett. 260:127-130; MacGregor, et al., (1996) FEBS Lett. 378:263-266). Первое in vitro применение этого типа перестановки у белков описали Goldenberg и Creighton (J. Mol. Biol. 165:407-413, 1983). При создании варианта с круговыми перестановками новый N-конец выбирают во внутреннем сайте (точечный разрыв) оригинальной последовательности, при этом новая последовательность имеет такой же порядок аминокислот, как и оригинальная, от точечного разрыва до тех пор, пока она не достигает аминокислоты, которая находится в оригинальном C-конце или вблизи него. В данной точке новая последовательность присоединяется либо непосредственно, либо через дополнительную часть последовательности (линкер) к аминокислоте, которая находится на оригинальном N-конце или вблизи него, и новая последовательность продолжается такой же последовательностью, что и оригинальная до тех пор, пока она не достигнет точки, которая находится в аминокислоте, которая была N-терминальной по отношению к сайту точечного разрыва оригинальной последовательности, или вблизи него, причем этот остаток образует новый C-конец цепи. Длину аминокислотной последовательности линкера можно выбирать эмпирически, или исходя из информации о структуре, или путем применения комбинации двух этих подходов. Если информация о структуре является недоступной, то можно получить небольшие серии линкеров для тестирования с использованием конструирования, длина которого варьирует для охвата диапазона от 0 до 50 Å и последовательность которого выбрана таким образом, чтобы соответствовать доступности поверхностных групп (гидрофильность, Hopp and Woods, (1983) Mol. Immunol. 20:483-489; Kyte and Doolittle, (1982) J. Mol. Biol. 157:105-132; площади поверхности, доступной воздействию растворителя, Lee and Richards, (1971) J. Mol. Biol. 55:379-400) и способности принимать необходимую конформацию без нарушения конфигурации пестицидного полипептида (конформационно подвижный; Karplus and Schulz, (1985) Naturwissenschaften 72:212-213). При условии, что при трансляции средняя длина остатка составляет 2,0-3,8 Å, это будет означать, что длина, подлежащая тестированию, будет составлять от 0 до 30 остатков, при этом предпочтительным диапазоном является 0-15 остатков. Примером такой эмпирической серии будет конструирование линкеров с применением кассетной последовательности, такой как Gly-Gly-Gly-Ser, повторяемой n раз, где n составляет 1, 2, 3 или 4. Специалисты в данной области поймут, что существует множество таких последовательностей, варьирующихся по длине или составу, которые могут служить в качестве линкеров с первоочередным соображением, что они не являются ни чрезмерно длинными, ни чрезмерно короткими (см. Sandhu, (1992) Critical Rev. Biotech. 12:437-462); причем если они являются слишком длинными, то энтропийные эффекты вероятно будут дестабилизировать трехмерную укладку и также могут делать фолдинг кинетически невыполнимым, а если они являются слишком короткими, то они вероятно будут дестабилизировать молекулу вследствие скручивающей или стерической деформации. Специалисты, разбирающиеся в анализе информации о структуре белка, будут понимать, что при наличии расстояние между концами цепей, определяемое как расстояние между c-альфа атомами углерода, можно применять для определения длины используемой последовательности или по меньшей мере для ограничения числа возможностей, которые требуется протестировать при эмпирическом отборе линкеров. Они также будут понимать, что иногда встречается случай, когда положения концов полипептидной цепи являются нечеткими в структурных моделях, полученных по данным рентгеноструктурного анализа или ядерной магнитно-резонансной спектроскопии, и в случае такой ситуации, следовательно, ее необходимо принимать во внимание для правильной оценки длины требуемого линкера. На основании остатков, положение которых четко определено, выбирают два остатка, которые близки по последовательности к концам цепи, и расстояние между их c-альфа атомами углерода используют для расчета приблизительной длины для линкера между ними. С использованием расчетной длины в качестве предварительных данных, далее отбирают линкеры в пределах диапазона количества остатков (из расчета 2-3,8 Å на остаток). Эти линкеры можно составлять из оригинальной последовательности, укороченной или удлиненной при необходимости, и в случае удлинения можно выбирать дополнительные остатки, которые являются гибкими и гидрофильными, как описано выше; или необязательно оригинальная последовательность может замещаться с применением серии линкеров, причем одним примером является вышеупомянутый подход с использованием кассеты Gly-Gly-Gly-Ser; или необязательно можно применять комбинацию оригинальной последовательности и новой последовательности, имеющей подходящую общую длину. Последовательности пестицидных полипептидов, способных к фолдингу с образованием биологически активных состояний, можно получать путем соответствующего отбора начальных (амино-конец) и концевых (карбоксильный конец) положений из оригинальной полипептидной цепи, при этом с применением линкерной последовательности, которая описана выше. Амино-конец и карбоксильный конец выбирают из общего отрезка последовательности, называемого участком точечного разрыва, с использованием нижеописанных рекомендаций. Таким образом, новую аминокислотную последовательность получают путем отбора амино-конца и карбоксильного конца из одного участка точечного разрыва. Во многих случаях выбор новых концов будет таким, что оригинальное положение карбоксильного конца непосредственно предшествует положению амино-конца. Однако специалисты в данной области поймут, что выборы концов в каком-либо месте в пределах участка могут оказывать влияние, и что он фактически будет приводить либо к удалениям, либо к добавлениям к амино-части или карбоксильной части новой последовательности. Основным положением молекулярной биологии является то, что первичная аминокислотная последовательность белка обуславливает фолдинг в трехмерную структуру, необходимую для проявления его биологической функции. Специалистам в данной области известны способы получения и интерпретации информации о трехмерной структуре с применением рентгеноструктурного анализа одиночных кристаллов белка или ядерной магнитно-резонансной спектроскопии растворов белка. Примеры информации о структуре, которая подходит для идентификации участков точечного разрыва, включают расположение и тип вторичной структуры белка (альфа- и 3-10 спирали, параллельные и антипараллельные бета-слои, обращения или повороты цепи и петли; Kabsch and Sander, (1983) Biopolymers 22:2577-2637; степень доступности аминокислотных остатков для растворителя, масштаб и тип взаимодействий остатков друг с другом (Chothia, (1984) Ann. Rev. Biochem. 53:537-572), а также статическое и динамическое распределение конформаций на протяжении полипептидной цепи (Alber and Mathews, (1987) Methods Enzymol. 154:511-533). В некоторых случаях известна дополнительная информация о доступности остатков для растворителя; причем одним примером является сайт посттрансляционного прикрепления углеводов, который обязательно находится на поверхности белка. Если экспериментальная информация о структуре не доступна или ее невозможно получить, то также доступны способы для анализа первичной аминокислотной последовательности с тем, чтобы делать прогнозы о третичной и вторичной структуре белка, доступности для растворителя и наличии поворотов и петель. Для эмпирического определения доступности поверхностных групп также иногда применимы биохимические способы, если прямые способы определения структуры невозможны; например, применение идентификации сайтов деполимеризации после ограниченного протеолиза для того, чтобы делать заключение о доступности поверхностных групп (Gentile and Salvatore, (1993) Eur. J. Biochem. 218:603-621). Таким образом, путем применения либо информации о структуре, полученной экспериментальным путем, либо прогностических способов (например, Srinivisan and Rose, (1995) Proteins: Struct., Funct. & Genetics 22:81-99) проводят исследование исходной аминокислотной последовательности для классификации участков в отношении того, важны ли они для поддержания вторичной и третичной структур. Наличия последовательностей в участках, которые, как известно, участвуют в периодической вторичной структуре (альфа и 3-10 спирали, параллельные и антипараллельные бета-слои), следует избегать. Аналогично, участки аминокислотной последовательности, которые, как наблюдается или прогнозируется, обладают низкой степенью доступности для действия растворителя, наиболее вероятно являются частью так называемого гидрофобного ядра белка, и их следует также избегать при выборе амино-конца или карбоксильного конца. В отличие от этого, участки, которые, как известно или прогнозируется, находятся в поверхностных поворотах или петлях, и в частности те участки, о которых известно, что они не требуются для биологической активности, являются предпочтительными сайтами для расположения противоположных концов полипептидной цепи. Предпочтительные непрерывные отрезки аминокислотной последовательности, основанные на вышеприведенных критериях, называют участком точечного разрыва. Полинуклеотиды, кодирующие инсектицидные полипептиды с круговыми перестановками по настоящему раскрытию с новым N-концом/C-концом, которые содержат линкерный участок, отделяющий оригинальный C-конец и N-конец, фактически можно получать по способу, описанному в Mullins, et al., (1994) J. Am. Chem. Soc. 116:5529-5533. Несколько стадий амплификации посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР) применяют для перестройки последовательности ДНК, кодирующей первичную аминокислотную последовательность белка. Полинуклеотиды, кодирующие инсектицидные полипептиды с круговыми перестановками по настоящему раскрытию с новым N-концом/C-концом, которые содержат линкерный участок, отделяющий оригинальный C-конец и N-конец, можно получать опираясь на способ тандемных повторов, описанный в Horlick, et al., (1992) Protein Eng. 5:427-431. Амплификацию посредством полимеразной цепной реакции (ПЦР) генов с новыми N-концом/C-концом проводят с применением ДНК-матрицы с тандемными повторами.

В другом аспекте предусматриваются белки слияния, в аминокислотную последовательность которых включена аминокислотная последовательность, содержащая инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. Способы разработки и конструирования белков слияния (и кодирующих их полинуклеотидов) известны специалистам в данной области. Полинуклеотиды, кодирующие инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, могут быть слиты с сигнальными последовательностями, которые будут управлять локализацией инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию относительно инсектицидного полипептида согласно вариантам осуществления из прокариотической или эукариотической клетки. Например, в E. coli, может потребоваться направить экспрессию белка в периплазматическое пространство. Примеры сигнальных последовательностей или белков (или их фрагментов), с которыми можно сливать инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию с тем, чтобы направлять экспрессию полипептида в периплазматическое пространство бактерий, включают без ограничения сигнальную последовательность pelB, сигнальную последовательность белка, связывающего мальтозу (MBP), MBP, сигнальную последовательность ompA, сигнальную последовательность B-субъединицы периплазматического неустойчивого к нагреванию энтеротоксина E. coli и сигнальную последовательность щелочной фосфатазы. Для конструирования белков слияния коммерчески доступны несколько векторов, которые будут управлять локализацией белка, такие как серия векторов pMAL (в частности, серия pMAL-p), доступная от New England Biolabs^® (County Road, 240, Ипсуич, Массачусетс, 01938-2723). В определенном варианте осуществления инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию можно сливать с сигнальной последовательностью пектатлиазы pelB для увеличения эффективности экспрессии и очистки таких полипептидов у грамм-отрицательных бактерий (см. патенты США №№ 5576195 и 5846818). Слияния пластидный транзитный пептид растения/полипептид хорошо известны в уровне техники (см. патент США № 7193133). Апопластные транзитные пептиды, такие как сигнальная последовательность для секреции альфа-амилазы риса или ячменя, также хорошо известны в уровне техники. Пластидный транзитный пептид сливают, как правило, со стороны N-конца с полипептидом, подлежащим нацеливанию (например, партнером слияния). В одном варианте осуществления белок слияния фактически состоит из пластидного транзитного пептида и инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, подлежащего нацеливанию. В другом варианте осуществления белок слияния состоит из пластидного транзитного пептида и полипептида, подлежащего нацеливанию. В таких вариантах осуществления пластидный транзитный пептид, предпочтительно, находится на N-конце белка слияния. Однако дополнительные аминокислотные остатки могут находиться на N-конце относительно пластидного транзитного пептида при условии, что белок слияния по меньшей мере частично нацеливается на пластиду. В определенном варианте осуществления пластидный транзитный пептид находится на N-терминальной половине, N-терминальной трети или N-терминальной четверти белка слияния. Как правило, большая часть или весь пластидный транзитный пептид вырезается из белка слияния после вставки в пластиду. Положение расщепления может слегка варьировать между видами растений, на различных стадиях развития растения, в результате специфических внутриклеточных условий или конкретной комбинации применяемого транзитного пептида/партнера слияния. В одном варианте осуществления сайт расщепления пластидного транзитного пептида является гомогенным, так что сайт расщепления является идентичным в популяции белков слияния. В другом варианте осуществления сайт расщепления пластидного транзитного пептида не является гомогенным, так что сайт расщепления варьирует по 1-10 аминокислотам в популяции белков слияния. Пластидный транзитный пептид можно рекомбинантно сливать со вторым белком одним из нескольких путей. Например, сайт распознавания рестрикционной эндонуклеазы можно вводить в нуклеотидную последовательность транзитного пептида в положении, соответствующем его C-терминальному концу, и такой же или совместимый сайт можно вводить способами генной инженерии в нуклеотидную последовательность белка, подлежащего нацеливанию, по его N-терминальному концу. При конструировании этих сайтов нужно позаботиться о том, чтобы быть уверенными в том, что кодирующие последовательности транзитного пептида и второго белка содержатся "в рамке" для обеспечения синтеза требуемого белка слияния. В некоторых случаях предпочтительным может быть удаление инициаторного метионинового кодона второго белка при введении нового сайта рестрикции. Введение сайтов распознавания рестрикционной эндонуклеазы в обе исходные молекулы и их последующее соединение посредством методик с использованием рекомбинантной ДНК может приводить к добавлению одной или нескольких дополнительных аминокислот между транзитным пептидом и вторым белком. Как правило, это не влияет на нацеливающую активность, поскольку сайт расщепления транзитного пептида остается доступным и функционирование второго белка не изменится при добавлении этих дополнительных аминокислот по его N-концу. В качестве альтернативы, специалист в данной области может создать точный сайт расщепления между транзитным пептидом и вторым пептидом (с его инициирующим метионином или без него) с применением синтеза генов (Stemmer, et al., (1995) Gene 164:49-53) или аналогичных способов. В дополнение, слияние транзитного пептида может намеренно включать аминокислоты ниже сайта расщепления. Аминокислоты на N-конце зрелого белка могут воздействовать на способность транзитного пептида нацеливать белки в пластиды и/или эффективность расщепления после импорта белков. Это может зависеть от белка, подлежащего нацеливанию. См., например, Comai, et al., (1988) J. Biol. Chem. 263(29):15104-9.

В некоторых вариантах осуществления представлены белки слияния, содержащие инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию и инсектицидный полипептид, присоединенный аминокислотным линкером.

В некоторых вариантах осуществления предусматриваются белки слияния, представленные формулой, выбранной из группы, состоящей из:

R1-L-R2, R2-L- R1, R1- R2 или R2- R1,

где R¹ представляет собой инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. Полипептид R¹ слит либо непосредственно, либо через линкерный (L) сегмент с полипептидом R². Термин "непосредственно" обозначает слияния, в которых полипептиды соединены без пептидного линкера. Таким образом, "L" представляет собой химическую связь или полипептидный сегмент, с которым оба R¹ и R² слиты в рамке, при этом наиболее часто L представляет собой линейный пептид, с которым R¹ и R² связаны посредством амидных связей, связывающих карбокси-конец R¹ с амино-концом L и карбокси-конец L с амино-концом R². Под "слиты в рамке" подразумевают, что между рамками считывания R¹ и R² отсутствует сайт терминации трансляции или разрыв. Линкерная группа (L) представляет собой обычно полипептид, составляющий от 1 до 500 аминокислот в длину. Линкеры, соединяющие две молекулы, предпочтительно конструируют так, (1) чтобы они давали возможность двум молекулам сворачиваться и действовать независимо друг от друга, (2) чтобы они не имели склонности к развитию упорядоченной вторичной структуры, которая может вступать в конфликт с функциональными доменами двух белков, (3) чтобы они имели минимальную гидрофобную или зарядную характеристику, которая может вступать в конфликт с функциональными доменами белка, и (4) чтобы они обеспечивали стерическое разделение R¹ и R², так что R¹ и R² могли одновременно взаимодействовать со своими соответствующими рецепторами на одной клетке. Как правило, поверхностные аминокислоты в гибких участках белка включают Gly, Asn и Ser. По сути, любая перестановка аминокислотных последовательностей, содержащих Gly, Asn и Ser, как ожидается, будет удовлетворять вышеуказанным критериям для линкерной последовательности. Другие нейтральные аминокислоты, такие как Thr и Ala, также можно применять в линкерной последовательности. Дополнительные аминокислоты также можно включать в линкеры, поскольку добавление уникальных сайтов рестрикции в линкерную последовательность облегчает конструирование слияний.

В некоторых вариантах осуществления линкеры содержат последовательности, выбранные из группы формул: (Gly₃Ser)_n, (Gly₄Ser)_n, (Gly₅Ser)_n, (Gly_nSer)_n или (AlaGlySer)_n, где n представляет собой целое число. Одним примером очень гибкого линкера является спейсерный участок, богатый (GlySer), присутствующий в белке pIII нитевидных бактериофагов, например бактериофагов M13 или fd (Schaller, et al., 1975). Этот участок обеспечивает длинный гибкий спейсерный участок между двумя доменами поверхностного белка pIII. Также включены линкеры, в состав которых входит последовательность распознавания эндопептидазы. Такой сайт расщепления может быть очень важным для отделения отдельных компонентов слияния с целью определения того, являются ли они правильным образом свернутыми и активными in vitro. Примеры различных эндопептидаз включают без ограничения плазмин, энтерокиназу, калликреин, урокиназу, тканевой активатор плазминогена, клострипаин, химозин, коллагеназу, протеазу яда гадюки Рассела, фермент расщепления постпролина, протеазу V8, тромбин и фактор Xa. В некоторых вариантах осуществления линкер содержит аминокислоты EEKKN (SEQ ID NO: 215) из мультигенного экспрессионного "проводника" (MGEV), который расщепляется протеазами вакуолей, как раскрыто в публикации заявки на выдачу патента США № 2007/0277263. В других вариантах осуществления пептидные линкерные сегменты из шарнирного участка тяжелой цепи иммуноглобулинов IgG, IgA, IgM, IgD или IgE обеспечивают угловое взаимодействие между прикрепленными полипептидами. Особенно применимыми являются такие шарнирные участки, в которых остатки цистеина замещены на остатки серина. Линкеры по настоящему раскрытию включают последовательности, полученные из шарнирного участка IgG гамма 2b мыши, в котором остатки цистеина были заменены на остатки серина. Белки слияния не ограничиваются формой, размером или количеством используемых линкерных последовательностей, и единственным требованием для линкера является то, что функционально он отрицательно не затрагивает фолдинг и функционирование отдельных молекул слияния.

В другом аспекте предусматриваются химерные инсектицидные полипептиды, которые создают путем соединения двух или более частей генов инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию, изначально кодирующих отдельные инсектицидные белки, с созданием химерного гена. Трансляция химерного гена приводит к единому химерному инсектицидному полипептиду с участками, мотивами или доменами, полученными из каждого из исходных полипептидов.

Понятно, что последовательности ДНК можно изменять различными способами, и что эти изменения могут приводить к последовательностям ДНК, кодирующим белки с аминокислотными последовательностями, отличными от тех, которые кодируют пестицидный белок дикого типа (или нативный). В некоторых вариантах осуществления последовательность инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию можно изменять различными путями, в том числе с помощью аминокислотных замен, делеций, усечений и вставок одной или нескольких аминокислот, в том числе до 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15, 16, 17, 18, 19, 20, 21, 22, 23, 24, 25, 26, 27, 28, 29, 30, 31, 32, 33, 34, 35, 36, 37, 38, 39, 40, 41, 42, 43, 44, 45 или более аминокислотных замен, делеций и/или вставок или их комбинаций по сравнению с любой последовательностью под SEQ ID NO: 1 - SEQ ID NO: 107, и SEQ ID NO: 232 - SEQ ID NO: 245. В некоторых вариантах осуществления инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию предусматривает делецию 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14, 15 или более аминокислот с N-конца и/или C-конца инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию.

Способы осуществления таких манипуляций, как правило, известны в уровне техники. Например, варианты инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию можно получить с помощью мутаций в ДНК. Это также можно осуществлять с помощью одной из нескольких форм мутагенеза и/или путем направленной эволюции. В некоторых аспектах изменения, закодированные в аминокислотной последовательности, не будут существенно влиять на функцию белка. Такие варианты будут обладать требуемой пестицидной активностью. Однако понятно, что способность инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию обеспечивать пестицидную активность можно повышать путем применения таких методик в композициях по настоящему раскрытию.

Например, можно делать консервативные аминокислотные замены по одному или нескольким прогнозируемым несущественным аминокислотным остаткам. ʺНесущественныйʺ аминокислотный остаток представляет собой остаток, который можно изменять по сравнению с последовательностью дикого типа инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию без изменения биологической активности. "Консервативная аминокислотная замена" представляет собой замену, при которой аминокислотный остаток замещен на аминокислотный остаток, имеющий аналогичную боковую цепь. Семейства аминокислотных остатков, имеющие аналогичные боковые цепи, были определены в уровне техники. Такие семейства включают: аминокислоты с основными боковыми цепями (например, лизин, аргинин, гистидин); кислотными боковыми цепями (например, аспарагиновую кислоту, глутаминовую кислоту); полярными отрицательно заряженными остатками и их амидами (например, аспарагиновую кислоту, аспарагин, глутаминовую кислоту, глутамин); незаряженными полярными боковыми цепями (например, глицин, аспарагин, глутамин, серин, треонин, тирозин, цистеин); небольшими алифатическими неполярными или слабополярными остатками (например, аланин, серин, треонин, пролин, глицин); неполярными боковыми цепями (например, аланин, валин, лейцин, изолейцин, пролин, фенилаланин, метионин, триптофан); крупными алифатическими неполярными остатками (например, метионин, лейцин, изолейцин, валин, цистеин); бета-разветвленными боковыми цепями (например, треонин, валин, изолейцин); ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан, гистидин); крупными ароматическими боковыми цепями (например, тирозин, фенилаланин, триптофан).

Аминокислотные замены можно проводить в неконсервативных участках, которые сохраняют функцию. В целом, такие замены не следует проводить для консервативных аминокислотных остатков или для аминокислотных остатков, находящихся в консервативном мотиве, где такие остатки являются существенными для активности белка. Примеры остатков, которые являются консервативными и которые могут быть существенными для активности белка, включают, например, остатки, которые идентичны у всех белков, содержащихся в выравнивании аналогичных или родственных токсинов с последовательностями согласно вариантам осуществления (например, остатки, которые идентичны при выравнивании гомологов). Примеры остатков, которые являются консервативными, но которые могут обеспечивать консервативные аминокислотные замены и все еще сохранять активность, включают, например, остатки, которые характеризуются только консервативными заменами у всех белков, содержащихся в выравнивании аналогичных или родственных токсинов с последовательностями согласно вариантам осуществления (например, остатки, которые характеризуются только консервативными заменами у всех белков, содержащихся в выравнивании гомологов). Однако специалисту в данной области будет понятно, что функциональные варианты могут иметь незначительные консервативные или неконсервативные изменения по консервативным остаткам. Указания в отношении подходящих аминокислотных замен, которые не влияют на биологическую активность белка, представляющего интерес, можно найти в модели Dayhoff, et al., (1978) Atlas of Protein Sequence and Structure (Natl. Biomed. Res. Found., Washington, D.C.), включенном в данный документ с помощью ссылки.

При осуществлении таких изменений можно учитывать индекс гидропатичности аминокислот. Важность индекса гидропатичности аминокислот для обеспечения согласованной биологической функции белка, в целом, понятна в уровне техники (Kyte and Doolittle, (1982) J Mol Biol. 157(1):105-32). Признают, что относительная гидропатичность аминокислоты вносит вклад во вторичную структуру полученного в результате белка, что в свою очередь определяет взаимодействие белка с другими молекулами, например, ферментами, субстратами, рецепторами, ДНК, антителами, антигенами и т. п.

В уровне техники известно, что определенные аминокислоты можно замещать другими аминокислотами, имеющими аналогичный индекс или балл гидропатичности, и в результате это все еще получать белок с аналогичной биологической активностью, т. е. по-прежнему получают эквивалентный белок с биологической функцией. Каждой аминокислоте был присвоен индекс гидропатичности на основании ее гидрофобности и зарядных характеристик (Kyte and Doolittle, ibid). Они являются следующими: изолейцин (+4,5); валин (+4,2); лейцин (+3,8); фенилаланин (+2,8); цистеин/цистин (+2,5); метионин (+1,9); аланин (+1,8); глицин (-0,4); треонин (-0,7); серин (-0,8); триптофан (-0,9); тирозин (-1,3); пролин (-1,6); гистидин (-3,2); глутамат (-3,5); глутамин (-3,5); аспартат (-3,5); аспарагин (-3,5); лизин (-3,9) и аргинин (-4,5). При осуществлении таких изменений предпочтительной является замена аминокислот, индексы гидропатичности которых находятся в пределах до +2, особенно предпочтительной тех с индексами в пределах до +1 и даже более предпочтительной тех с индексами в пределах до +0,5.

В уровне техники также понятно, что замену подобных аминокислот можно эффективно проводить на основании гидрофильности. В патенте США № 4554101 заявляется, что наибольшая локальная средняя гидрофильность белка, определяемая гидрофильностью смежных аминокислот, коррелирует с биологическим свойством белка.

Как подробно описано в патенте США № 4554101, аминокислотным остаткам были присвоены следующие значения гидрофильности: аргинин (+3,0); лизин (+3,0); аспартат (+3,0.+0,1); глутамат (+3,0.+0,1); серин (+0,3); аспарагин (+0,2); глутамин (+0,2); глицин (0); треонин (-0,4); пролин (-0,5.+0,1); аланин (-0,5); гистидин (-0,5); цистеин (-1,0); метионин (-1,3); валин (-1,5); лейцин (-1,8); изолейцин (-1,8); тирозин (-2,3); фенилаланин (-2,5); триптофан (-3,4).

В качестве альтернативы, изменения можно совершать в белковой последовательности многих белков на амино- или карбокси-конце без существенного влияния на активность. Они могут включать вставки, делеции или изменения, введенные с помощью современных молекулярных способов, таких как ПЦР, в том числе амплификации посредством ПЦР, которые изменяют или расширяют последовательность, кодирующую белок, за счет включения последовательностей, кодирующих аминокислоты, в олигонуклеотиды, используемые при амплификации посредством ПЦР. В качестве альтернативы, добавленные белковые последовательности могут включать последовательности, кодирующие весь белок, например такие, которые обычно применяют в области техники для получения слияний белков. Такие белки слияния часто применяют для (1) усиления экспрессии белка, представляющего интерес, (2) введения связывающего домена, ферментативной активности или эпитопа для облегчения либо очистки белка, выявления белка либо других экспериментальных применений, известных в уровне техники, (3) нацеливания секреции или трансляции белка во внутриклеточную органеллу, такую как периплазматическое пространство грамотрицательных бактерий, митохондрия или хлоропласты растений или эндоплазматический ретикулум эукариотических клеток, причем последнее зачастую приводит к гликозилированию белка.

Вариантные нуклеотидные и аминокислотные последовательности по настоящему раскрытию также охватывают последовательности, полученные в результате процедур, связанных с мутациями и рекомбинациями, такими как ДНК-шаффлинг. С помощью такой процедуры один или несколько различных кодирующих участков инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию можно применять для создания нового инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, обладающего требуемыми свойствами. Таким образом, библиотеки рекомбинантных полинуклеотидов создают из популяции родственных по последовательностям полинуклеотидов, содержащих участки последовательностей, которые характеризуются значительной идентичностью последовательности и могут подвергаться гомологичной рекомбинации in vitro или in vivo. Например, с использованием данного подхода мотивы с кодирующими домен последовательностями, представляющий интерес, можно подвергать шаффлингу между пестицидным геном и другими известными пестицидными генами с получением нового гена, кодирующего белок с улучшенным свойством, представляющим интерес, таким как повышенная инсектицидная активность. Стратегии для такого ДНК-шаффлинга известны в уровне техники. См., например, Stemmer, (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:10747-10751; Stemmer, (1994) Nature 370:389-391; Crameri, et al., (1997) Nature Biotech. 15:436-438; Moore, et al., (1997) J. Mol. Biol. 272:336-347; Zhang, et al., (1997) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 94:4504-4509; Crameri, et al., (1998) Nature 391:288-291; и патенты США №№ 5605793 и 5837458.

Замена доменов или шаффлинг представляет собой другой механизм получения измененных инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию. Можно проводить замену доменов между инсектицидными полипептидами по настоящему раскрытию, что дает гибридные или химерные токсины с повышенной пестицидной активностью или расширенным спектром мишеней. Способы получения рекомбинантных белков и тестирования их в отношении пестицидной активности хорошо известны в уровне техники (см., например, Naimov, et al., (2001) Appl. Environ. Microbiol. 67:5328-5330; de Maagd, et al., (1996) Appl. Environ. Microbiol. 62:1537-1543; Ge, et al., (1991) J. Biol. Chem. 266:17954-17958; Schnepf, et al., (1990) J. Biol. Chem. 265:20923-20930; Rang, et al., 91999) Appl. Environ. Microbiol. 65:2918-2925).

Выравнивание гомологов инсектицидного полипептида (фигуры 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7 и 8) позволило идентифицировать остатки, которые являются высококонсервативными среди гомологов в этих семействах.

Композиции

Также предусматриваются композиции, содержащие инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию. Предполагаются композиции, содержащие полипептид PIP-45-1 по настоящему раскрытию и полипептид PIP-45-2 по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления композиции содержат инсектицидно эффективную концентрацию полипептида PIP-45-1 по настоящему раскрытию и полипептида PIP-45-2 по настоящему раскрытию. Предполагаются композиции, содержащие полипептид PIP-64-1 по настоящему раскрытию и полипептид PIP-64-2 по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления композиции содержат инсектицидно эффективную концентрацию полипептида PIP-64-1 по настоящему раскрытию и полипептида PIP-64-2 по настоящему раскрытию. Предполагаются композиции, содержащие полипептид PIP-74-1 по настоящему раскрытию и полипептид PIP-74-2 по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления композиции содержат инсектицидно эффективную концентрацию полипептида PIP-74-1 по настоящему раскрытию и полипептида PIP-74-2 по настоящему раскрытию. Предполагаются композиции, содержащие полипептид PIP-75 по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления композиции содержат инсектицидно эффективную концентрацию полипептида PIP-75 по настоящему раскрытию. Предполагаются композиции, содержащие полипептид PIP-77 по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления композиции содержат инсектицидно эффективную концентрацию полипептида PIP-77 по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления композиция дополнительно содержит приемлемый с точки зрения сельского хозяйства носитель.

Антитела

Также охвачены антитела к инсектицидному полипептиду по настоящему раскрытию согласно вариантам осуществления или к его вариантам или фрагментам. Антитела по настоящему раскрытию включают поликлональные и моноклональные антитела, а также их фрагменты, которые сохраняют способность связываться с инсектицидными белками, обнаруженными в кишечнике насекомого. Полагают, что антитело, моноклональное антитело или его фрагмент способны связывать молекулу, если они способны специфично реагировать с молекулой, связывая, тем самым, молекулу с антителом, моноклональным антителом или его фрагментом. Как подразумевается, термин "антитело" (Ab) или "моноклональное антитело" (Mab) включает интактные молекулы, а также их фрагменты, или связывающие участки, или домены (такие как, например, фрагменты Fab и F(ab)2), которые способны связывать гаптен. Как правило, такие фрагменты получают с помощью протеолитического расщепления, например с помощью папаина или пепсина. В качестве альтернативы, гаптен-связывающие фрагменты можно получать посредством применения технологии рекомбинантной ДНК или с помощью синтетической химии. Как правило, способы получения антител по настоящему раскрытию известны в уровне техники. Например, см. Antibodies, A Laboratory Manual, Ed Harlow and David Lane (eds.) Cold Spring Harbor Laboratory, N.Y. (1988), а также приводимые в нем литературные источники. Стандартные справочные работы, излагающие общие принципы иммунологии, включают: Klein, J. Immunology: The Science of Cell-Noncell Discrimination, John Wiley & Sons, N.Y. (1982); Dennett, et al., Monoclonal Antibodies, Hybridoma: A New Dimension in Biological Analyses, Plenum Press, N.Y. (1980) и Campbell, "Monoclonal Antibody Technology," в Laboratory Techniques in Biochemistry and Molecular Biology, Vol. 13, Burdon, et al., (eds.), Elsevier, Amsterdam (1984). См. также патенты США №№ 4196265; 4609893; 4713325; 4714681; 4716111; 4716117 и 4720459. Антитела к инсектицидным полипептидам по настоящему раскрытию или их антиген-связывающие части можно получать с помощью ряда методик, в том числе традиционных методик получения моноклональных антител, например стандартной методики гибридизации соматических клеток согласно Kohler and Milstein, (1975) Nature 256:495. Также можно использовать другие методики получения моноклонального антитела, такие как вирусная или онкогенная трансформация B-лимфоцитов. Животная система для получения гибридом представляет собой мышиную систему. В уровне техники известны протоколы иммунизации и методики для выделения спленоцитов иммунизированных животных для слияния. Также известны партнеры слияния (например, клетки миеломы мыши) и процедуры слияния. Антитело и моноклональные антитела по настоящему раскрытию в качестве антигенов можно получить путем использования инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию.

Предусматривается набор для выявления присутствия инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию или выявления присутствия нуклеотидной последовательности, кодирующей инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию в образце. В одном варианте осуществления в наборе имеются реагенты на основе антитела для выявления присутствия в образце ткани инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию. В другом варианте осуществления в наборе имеются меченые зонды из нуклеиновой кислоты, применяемые для выявления присутствия одного или нескольких полинуклеотидов, кодирующих инсектицидный(-ые) полипептид(-ы) по настоящему раскрытию. В наборе также имеются соответствующие реагенты и контрольные образцы для проведения способа выявления, а также инструкции для применения набора.

Идентификация и выделение рецепторов

Также охвачены рецепторы к инсектицидному полипептиду согласно вариантам осуществления или к его вариантам или фрагментам. Способы идентификации рецепторов, хорошо известные в уровне техники (см. Hofmann, et. al., (1988) Eur. J. Biochem. 173:85-91; Gill, et al., (1995) J. Biol. Chem. 27277-27282), можно использовать для идентификации и выделения рецептора, который распознает инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию с использованием мембранных пузырьков из щеточной каемки восприимчивых насекомых. В дополнение к способу радиоактивного мечения, приведенному в упомянутом литературном источнике, инсектицидный полипептид можно метить с помощью флуоресцентного красителя и других общепринятых меток, таких как стрептавидин. Мембранные пузырьки из щеточной каемки (BBMV) восприимчивых насекомых, таких как соевая совка и щитники, можно получать в соответствии с протоколами, приведенными в ссылочных документах, и разделять на геле SDS-PAGE, а также переносить на подходящую мембрану. Меченые инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию можно инкубировать с мембраной с перенесенными BBMV и при этом меченые инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию можно идентифицировать с помощью меченых репортеров. Идентификацию белковой(-ых) полоски(-сок), которая(-ые) взаимодействует(-ют) с инсектицидными полипептидами по настоящему раскрытию, можно проводить с помощью секвенирования N-терминальных аминокислотных остатков в газовой фазе или способа идентификации белков на основе масс-спектрометрии (Patterson, (1998) 10.22, 1-24, Current Protocol in Molecular Biology published by John Wiley & Son Inc). После идентификации белка соответствующий ген можно клонировать из библиотеки геномной ДНК или кДНК восприимчивых насекомых и сродство связывания можно оценивать непосредственно с помощью инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию. Рецепторную функцию в отношении инсектицидной активности у инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию можно подтвердить путем осуществления с помощью типа RNAi способа нокаута гена (Rajagopal, et al., (2002) J. Biol. Chem. 277:46849-46851).

Нуклеотидные конструкции, кассеты и векторы экспрессии

Использование термина "нуклеотидные конструкции" в данном документе не предназначено ограничивать варианты осуществления нуклеотидными конструкциями, содержащими ДНК. Специалистам обычной квалификации в данной области будет понятно, что нуклеотидные конструкции, в частности полинуклеотиды и олигонуклеотиды, состоящие из рибонуклеотидов и комбинаций рибонуклеотидов и дезоксирибонуклеотидов, также можно использовать в способах, раскрытых в данном документе. Нуклеотидные конструкции, нуклеиновые кислоты и нуклеотидные последовательности согласно вариантам осуществления дополнительно охватывают все комплементарные формы таких конструкций, молекул и последовательностей. Кроме того, нуклеотидные конструкции, нуклеотидные молекулы и нуклеотидные последовательности согласно вариантам осуществления охватывают все нуклеотидные конструкции, молекулы и последовательности, которые можно использовать в способах согласно вариантам осуществления для трансформации растений, в том числе без ограничения состоящие из дезоксирибонуклеотидов, рибонуклеотидов и их комбинаций. Такие дезоксирибонуклеотиды и рибонуклеотиды имеют в составе как встречающиеся в природе молекулы, так и синтетические аналоги. Нуклеотидные конструкции, нуклеиновые кислоты и нуклеотидные последовательности согласно вариантам осуществления также охватывают все формы нуклеотидных конструкций, в том числе без ограничения одноцепочечные формы, двухцепочечные формы, шпильки, структуры "стебель-и-петля" и т. п.

Дополнительный вариант осуществления относится к трансформированному организму, такому как организм, выбранный из растительных клеток или клеток насекомых, бактерий, дрожжей, бакуловируса, простейших, нематод и водорослей. Трансформированный организм содержит молекулу ДНК согласно вариантам осуществления, кассету экспрессии, содержащую молекулу ДНК, или вектор, содержащий кассету экспрессии, которые могут быть стабильно встроенными в геном трансформированного организма.

Последовательности согласно вариантам осуществления предусматриваются в составе ДНК-конструкций для экспрессии в организме, представляющем интерес. Конструкции будут включать 5' и 3' регуляторные последовательности, функционально связанные с последовательностью согласно вариантам осуществления. Термин "функционально связанный", используемый в данном документе, относится к функциональной связи между промотором и второй последовательностью, где последовательность промотора инициирует и опосредует транскрипцию последовательности ДНК, соответствующей второй последовательности. Как правило, функционально связанный означает, что связанные последовательности нуклеиновой кислоты являются смежными, и при необходимости соединяют два кодирующих белок участка в одной рамке считывания. Конструкция может дополнительно содержать по меньшей мере один дополнительный ген, подлежащий введению в организм путем котрансформации. В качестве альтернативы, дополнительный(-ые) ген(-ы) может(-гут) предусматриваться в нескольких ДНК-конструкциях.

Такая ДНК-конструкция снабжена несколькими сайтами рестрикции для вставки последовательности гена инсектицидного полипептида, транскрипция которой будет регулироваться регуляторными участками. ДНК-конструкция может дополнительно содержать селектируемые маркерные гены.

Как правило, в направлении транскрипции от 5' к 3' концу ДНК-конструкция будет включать: участок инициации транскрипции и трансляции (т. е. промотор), последовательность ДНК согласно вариантам осуществления и участок терминации транскрипции и трансляции (т. е. участок терминации), функционирующие в организме, служащем хозяином. Участок инициации транскрипции (т. е. промотор) может быть нативным, аналогичным, чужеродным или гетерологичным относительно организма-хозяина и/или последовательности согласно вариантам осуществления. Кроме того, промотор может представлять собой природную последовательность или, в качестве альтернативы, синтетическую последовательность. Термин "чужеродный", используемый в данном документе, указывает на то, что промотор не найден в нативном организме, в который введен промотор. Если промотор является "чужеродным" или "гетерологичным" относительно последовательности согласно вариантам осуществления, то предполагается, что промотор не является нативным или встречающимся в природе промотором для функционально связанной последовательности согласно вариантам осуществления. Используемый в данном документе химерный ген содержит кодирующую последовательность, функционально связанную с участком инициации транскрипции, который является гетерологичным для кодирующей последовательности. Если промотор представляет собой нативную или природную последовательностью, то экспрессия функционально связанной последовательности изменена по сравнению с экспрессией дикого типа, что приводит к изменению фенотипа.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция может также включать последовательность транскрипционного энхансера. Термин "энхансер", используемый в данном документе, относится к последовательности ДНК, которая может стимулировать активность промотора и которая может представлять собой характерный элемент промотора или гетерологичный элемент, вставленный для повышения уровня активности или тканевой специфичности промотора. В уровне техники известны различные энхансеры, в том числе, например, интроны со свойствами усиления экспрессии гена в растениях (публикация заявки на выдачу патента США № 2009/0144863, убиквитиновый интрон (т. е. убиквитиновый интрон 1 маиса (см., например, последовательность из NCBI S94464; Christensen and Quail (1996) Transgenic Res. 5:213-218; Christensen et al. (1992) Plant Molecular Biology 18:675-689)), энхансер омега и энхансер омега штрих (Gallie, et al., (1989) Molecular Biology of RNA ed. Cech (Liss, New York) 237-256 и Gallie, et al., (1987) Gene 60:217-25), энхансер CaMV 35S (см., например, Benfey, et al., (1990) EMBO J. 9:1685-96), интрон маиса AdhI (Kyozuka et al. (1991) Mol. Gen. Genet. 228:40-48; Kyozuka et al. (1990) Maydica 35:353-357), а также можно применять энхансеры из патента США № 7803992, каждый из которых включен с помощью ссылки. Вышеприведенный перечень транскрипционных энхансеров не предназначен для ограничения. В вариантах осуществления можно применять любой подходящий транскрипционный энхансер.

Участок терминации может быть нативным относительно участка инициации транскрипции, может быть нативным относительно функционально связанной последовательности ДНК, представляющей интерес, может быть нативным относительно растения-хозяина или может быть получен из другого источника (т. e. чужеродный или гетерологичный для промотора, последовательности, представляющей интерес, растения-хозяина или какой-либо их комбинации).

Подходящие участки терминации доступны из Ti-плазмиды A. tumefaciens, такие как участки терминации генов октопинсинтазы и нопалинсинтазы. См. также Guerineau et al. (1991) Mol. Gen. Genet. 262:141-144; Proudfoot (1991) Cell 64:671-674; Sanfacon et al. (1991) Genes Dev. 5:141-149; Mogen, et al., (1990) Plant Cell 2:1261-1272; Munroe, et al., (1990) Gene 91:151-158; Ballas, et al., (1989) Nucleic Acids Res. 17:7891-7903 и Joshi, et al., (1987) Nucleic Acid Res. 15:9627-9639.

При необходимости, нуклеиновую кислоту можно оптимизировать для усиления экспрессии в организме-хозяине. Таким образом, если организм-хозяин является растением, то для усиления экспрессии можно синтезировать синтетические нуклеиновые кислоты с применением кодонов, предпочтительных для растений. См. например Campbell and Gowri, (1990) Plant Physiol. 92:1-11, где обсуждается применение кодонов, предпочтительных для хозяина. Например, хотя последовательности нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления могут экспрессироваться как у видов однодольных, так и видов двудольных растений, последовательности можно модифицировать с учетом специфичных предпочтений кодонов и предпочтений по содержанию GC у однодольных или двудольных, если было показано, что предпочтения отличаются (Murray et al. (1989) Nucleic Acids Res. 17:477-498). Таким образом, кодон, предпочтительный для маиса, для конкретной аминокислоты можно получить из известных последовательностей генов маиса. Данные о частоте использования кодонов в маисе для 28 генов из растений маиса приведены в таблице 4 в Murray, et al., выше. В уровне техники доступны способы синтеза генов, предпочтительных для растений. См., например, патенты США №№ 5380831 и 5436391, а также Murray, et al., (1989) Nucleic Acids Res. 17:477-498 и Liu H et al. Mol Bio Rep 37:677-684, 2010, включенные в данный документ с помощью ссылки. Таблицу использования кодонов Zea maize также можно найти на сайте по адресу kazusa.or.jp/codon/cgi-bin/showcodon.cgi?species=4577, доступ к которому можно получить с использованием префикса www. В таблице 2 показан анализ оптимальных кодонов маиса (адаптировано из Liu H et al. Mol Bio Rep 37:677-684, 2010).

Таблица 2

Аминокислота Кодон Высокая встречаемость RSCU Низкая встречаемость RSCU Аминокислота Кодон Высокая встречаемость RSCU Низкая встречаемость RSCU Phe UUU 115 0.04 2,301 1.22 Ala GCU 629 0.17 3,063 1.59 UUC* 5,269 1.96 1,485 0.78 GCC* 8,057 2.16 1,136 0.59 Ser UCU 176 0.13 2,498 1.48 GCA 369 0.1 2,872 1.49 UCC* 3,489 2.48 1,074 0.63 GCG* 5,835 1.57 630 0.33 UCA 104 0.07 2,610 1.54 Tyr UAU 71 0.04 1,632 1.22 UCG* 1,975 1.4 670 0.4 UAC* 3,841 1.96 1,041 0.78 AGU 77 0.05 1,788 1.06 His CAU 131 0.09 1,902 1.36 AGC* 2,617 1.86 1,514 0.89 CAC* 2,800 1.91 897 0.64 Leu UUA 10 0.01 1,326 0.79 Cys UGU 52 0.04 1,233 1.12 UUG 174 0.09 2,306 1.37 UGC* 2,291 1.96 963 0.88 CUU 223 0.11 2,396 1.43 Gln CAA 99 0.05 2,312 1.04 CUC* 5,979 3.08 1,109 0.66 CAG* 3,557 1.95 2,130 0.96 CUA 106 0.05 1,280 0.76 Arg CGU 153 0.12 751 0.74 CUG* 5,161 2.66 1,646 0.98 CGC* 4,278 3.25 466 0.46 Pro CCU 427 0.22 1,900 1.47 CGA 92 0.07 659 0.65 CCC* 3,035 1.59 601 0.47 CGG* 1,793 1.36 631 0.62 CCA 311 0.16 2,140 1.66 AGA 83 0.06 1,948 1.91 CCG* 3,846 2.02 513 0.4 AGG* 1,493 1.14 1,652 1.62 Ile AUU 138 0.09 2,388 1.3 Asn AAU 131 0.07 3,074 1.26 AUC* 4,380 2.85 1,353 0.74 AAC* 3,814 1.93 1,807 0.74 AUA 88 0.06 1,756 0.96 Lys AAA 130 0.05 3,215 0.98 Thr ACU 136 0.09 1,990 1.43 AAG* 5,047 1.95 3,340 1.02 ACC* 3,398 2.25 991 0.71 Asp GAU 312 0.09 4,217 1.38 ACA 133 0.09 2,075 1.5 GAC* 6,729 1.91 1,891 0.62 ACG* 2,378 1.57 495 0.36 Gly GGU 363 0.13 2,301 1.35 Val GUU 182 0.07 2,595 1.51 GGC* 7,842 2.91 1,282 0.75 GUC* 4,584 1.82 1,096 0.64 GGA 397 0.15 2,044 1.19 GUA 74 0.03 1,325 0.77 GGG* 2,186 0.81 1,215 0.71 GUG* 5,257 2.08 1,842 1.07 Glu GAA 193 0.06 4,080 1.1 GAG* 6,010 1.94 3,307 0.9

Использование кодонов сравнивали с применением критерия сопряженности хи-квадрат для идентификации оптимальных кодонов. Кодоны, которые встречаются статистически более часто (P\0,01), обозначены звездочкой.

Таблица использования кодонов Glycine max показана в виде таблицы 3, и ее можно найти также на сайте по адресу kazusa.or.jp/codon/cgi-bin/showcodon.cgi?species=3847&aa=1&style=N, доступ к которому можно получить с использованием префикса www.

Таблица 3

TTT F 21.2 (10493) TCT S 18.4 (9107) TTC F 21.2 (10487) TCC S 12.9 (6409) TTA L 9.2 (4545) TCA S 15.6 (7712) TTG L 22.9 (11340) TCG S 4.8 (2397) CTT L 23.9 (11829) CCT P 18.9 (9358) CTC L 17.1 (8479) CCC P 10.1 (5010) CTA L 8.5 (4216) CCA P 19.1 (9461) CTG L 12.7 (6304) CCG P 4.7 (2312) ATT I 25.1 (12411) ACT T 17.1 (8490) ATC I 16.3 (8071) ACC T 14.3 (7100) ATA I 12.9 (6386) ACA T 14.9 (7391) ATG M 22.7 (11218) ACG T 4.3 (2147) GTT V 26.1 (12911) GCT A 26.7 (13201) GTC V 11.9 (5894) GCC A 16.2 (8026) GTA V 7.7 (3803) GCA A 21.4 (10577) GTG V 21.4 (10610) GCG A 6.3 (3123) TAT Y 15.7 (7779) TGT C 8.1 (3995) TAC Y 14.9 (7367) TGC C 8.0 (3980) TAA * 0.9 (463) TGA * 1.0 (480) TAG * 0.5 (263) TGG W 13.0 (6412) CAT H 14.0 (6930) CGT R 6.6 (3291) CAC H 11.6 (5759) CGC R 6.2 (3093) CAA Q 20.5 (10162) CGA R 4.1 (2018) CAG Q 16.2 (8038) CGG R 3.1 (1510) AAT N 22.4 (11088) AGT S 12.6 (6237) AAC N 22.8 (11284) AGC S 11.3 (5594) AAA K 26.9 (13334) AGA R 14.8 (7337) AAG K 35.9 (17797) AGG R 13.3 (6574) GAT D 32.4 (16040) GGT G 20.9 (10353) GAC D 20.4 (10097) GGC G 13.4 (6650) GAA E 33.2 (16438) GGA G 22.3 (11022) GAG E 33.2 (16426) GGG G 13.0 (6431)

В некоторых вариантах осуществления рекомбинантная молекула нуклеиновой кислоты, кодирующая инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, имеет кодоны, оптимизированные для маиса.

Известны дополнительные модификации последовательности для усиления экспрессии гена у клеточного хозяина. Они включают устранение последовательностей, кодирующих ложные сигналы полиаденилирования, сигналы сайта сплайсинга экзонов и интронов, транспозон-подобные повторы и другие хорошо изученные последовательности, которые могут быть вредны для экспрессии гена. Содержание GC в последовательности можно скорректировать до уровней, средних для данного клеточного хозяина, рассчитываемых с учетом известных генов, экспрессируемых в клетке-хозяине. Термин "клетка-хозяин", используемый в данном документе, относится к клетке, которая содержит вектор и которая поддерживает репликацию и/или экспрессию предполагаемых векторов экспрессии. Клетки-хозяева могут быть прокариотическими клетками, такими как E. coli, или эукариотическими клетками, такими как клетки дрожжей, насекомых, амфибий или млекопитающих, или клетками однодольных или двудольных растений. Примером клетки-хозяина, относящейся к однодольному растению, является клетка-хозяин маиса. Если возможно, последовательность модифицируют для того, чтобы избежать образования прогнозируемых шпилечных вторичных структур mRNA.

Кассеты экспрессии могут дополнительно содержать 5'-лидерные последовательности. Такие лидерные последовательности могут способствовать усилению трансляции. Лидерные последовательности трансляции известны в уровне техники и предусматривают лидерные последовательности пикорнавирусов, например лидерную последовательность EMCV (5'-некодирующий участок вируса энцефаломиокардита) (Elroy-Stein, et al., (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:6126-6130); лидерные последовательности потивирусов, например лидерную последовательность TEV (вируса гравировки табака) (Gallie, et al., (1995) Gene 165(2):233-238), лидерную последовательность MDMV (вируса карликовой мозаики кукурузы), последовательность белка, связывающего тяжелую цепь иммуноглобулина человека (BiP) (Macejak, et al., (1991) Nature 353:90-94); нетранслируемую лидерную последовательность из mRNA белка оболочки вируса мозаики люцерны (AMV RNA 4) (Jobling, et al., (1987) Nature 325:622-625); лидерную последовательность вируса табачной мозаики (TMV) (Gallie, et al., (1989) in Molecular Biology of RNA, ed. Cech (Liss, New York), pp. 237-256) и лидерную последовательность вируса хлорозной мозаики маиса (MCMV) (Lommel, et al., (1991) Virology 81:382-385). См. также Della Cioppa et al. (1987) Plant Physiology 84:965-968. Такие конструкции могут также содержать "сигнальную последовательность" или "лидерную последовательность" для облегчения сопряженного с трансляцией или посттрансляционного транспорта пептида в определенные внутриклеточные структуры, такие как хлоропласт (или другая пластида), эндоплазматический ретикулум или аппарат Гольджи.

"Сигнальная последовательность", используемая в данном документе, относится к последовательности, которая, как известно или как ожидается, приводит к сопряженному с трансляцией или посттрансляционному транспорту пептида через клеточную мембрану. У эукариот это обычно подразумевает секрецию в пузырьках аппарата Гольджи, при этом происходит гликолизирование до некоторой степени. Инсектицидные токсины бактерий зачастую синтезируются в виде протоксинов, которые активируются под действием протеолиза в кишечнике целевого вредителя (Chang, (1987) Methods Enzymol. 153:507-516). В некоторых вариантах осуществления сигнальная последовательность расположена в нативной последовательности или может быть получена из последовательности согласно вариантам осуществления. "Лидерная последовательность", используемая в данном документе, относится к любой последовательности, которая при трансляции приводит к аминокислотной последовательности, способной запускать сопряженный с трансляцией транспорт пептидной цепи во внутриклеточную органеллу. Таким образом, это предусматривает лидерные последовательности, нацеливающие транспорт и/или гликозилирование посредством перехода в эндоплазматический ретикулум, перехода в вакуоли, пластиды, в том числе хлоропласты, митохондрии и т. п. Кодируемые в ядре белки, нацеленные в компартмент полости тилакоида хлоропластов, имеют характерный двойной транзитный пептид, состоящий из сигнального пептида, нацеливающего на строму, и сигнального пептида, нацеливающего на полость. Информация для нацеливания на строму находится в ближайшей к амино-концу части транзитного пептида. Сигнальный пептид, нацеливающий на полость, находится в ближайшей к карбокси-концу части транзитного пептида и содержит всю информацию для нацеливания на полость. Последние исследования по протеомике хлоропластов высших растений добились успеха в идентификации многочисленных кодируемых в ядре белков полости (Kieselbach et al. FEBS LETT 480:271-276, 2000; Peltier et al. Plant Cell 12:319-341, 2000; Bricker et al. Biochim. Biophys Acta 1503:350-356, 2001), при этом их сигнальный пептид, нацеливающий на полость, можно потенциально применять в соответствии с настоящим раскрытием. О приблизительно 80 белках из Arabidopsis, а также гомологичных белках из шпината и гороха огородного, сообщается в Kieselbach et al., Photosynthesis Research, 78:249-264, 2003. В частности, в таблице 2 данной публикации, которая включена в настоящее описание с помощью ссылки, раскрыто 85 белков из полости хлоропласта, идентифицированных по их номеру доступа (см. также публикацию заявки на выдачу патента США 2009/09044298). В дополнение, опубликованная недавно предварительная версия генома риса (Goff et al, Science 296:92-100, 2002) является подходящим источником для информации о сигнальном пептиде, нацеливающим на полость, который можно применять в соответствии с настоящим раскрытием.

Подходящие транзитные пептиды хлоропластов (CTP), хорошо известные специалисту в данной области, включают также химерные CTP, содержащие без ограничения N-терминальный домен, центральный домен или C-терминальный домен из CTP из 1-дезокси-D-ксилоза-5-фосфатсинтазы Oryza sativa, супероксиддисмутазы Oryza sativa, синтазы растворимого крахмала Oryza sativa, NADP-зависимого фермента, действующего на яблочную кислоту, Oryza sativa, фосфо-2-дегидро-3-дезоксигептонатальдолазы 2 Oryza sativa, L-аскорбатпероксидазы 5 Oryza sativa, фосфоглюкан-вода-дикиназы Oryza sativa, ssRUBISCO Zea Mays, бета-глюкозидазы Zea Mays, малатдегидрогеназы Zea Mays, тиоредоксина M-типа Zea Mays (публикация заявки на выдачу патента США 2012/0304336). Транзитные пептиды хлоропластов из публикации заявки на выдачу патентов США US20130205440A1, US20130205441A1 и US20130210114A1.

Ген инсектицидного полипептида, подлежащего нацеливанию в хлоропласт, можно оптимизировать для экспрессии в хлоропласте с учетом отличий по использованию кодонов между растительным ядром и этой органеллой. Таким образом, нуклеиновые кислоты, представляющие интерес, можно синтезировать с применением кодонов, предпочтительных для хлоропласта. См., например, патент США № 5380831, включенный в данный документ с помощью ссылки.

При получении кассеты экспрессии с различными фрагментами ДНК можно проводить манипуляции так, чтобы получить последовательности ДНК в надлежащей ориентации и, при необходимости, в надлежащей рамке считывания. С данной целью для соединения фрагментов ДНК можно использовать адаптеры или линкеры или можно задействовать другие манипуляции для обеспечения подходящих сайтов рестрикции, удаления избыточной ДНК, удаления сайтов рестрикции и т. п. С данной целью можно задействовать мутагенез in vitro, репарацию с помощью праймеров, рестрикцию, гибридизацию, повторные замены, например транзиции и трансверсии.

При практическом осуществлении вариантов осуществления можно применять ряд промоторов. Промоторы можно выбирать, исходя из необходимого результата. Нуклеиновые кислоты можно комбинировать с конститутивными, предпочтительными для ткани, индуцируемыми или другими промоторами для экспрессии в организме-хозяине. Подходящие конститутивные промоторы для применения в растительной клетке-хозяине включают, например, основной промотор промотора Rsyn7 и других конститутивных промоторов, раскрытых в WO 1999/43838 и патенте США № 6072050; основной промотор 35S CaMV (Odell, et al., (1985) Nature 313:810-812); промотор актина риса (McElroy, et al., (1990) Plant Cell 2:163-171); убиквитиновый промотор (Christensen, et al., (1989) Plant Mol. Biol. 12:619-632 и Christensen, et al., (1992) Plant Mol. Biol. 18:675-689); pEMU (Last, et al., (1991) Theor. Appl. Genet. 81:581-588); MAS (Velten, et al., (1984) EMBO J. 3:2723-2730); промотор ALS (патент США № 5659026) и т. п. Другие конститутивные промоторы включают, например, раскрытые в патентах США №№ 5608149; 5608144; 5604121; 5569597; 5466785; 5399680; 5268463; 5608142 и 6177611. Подходящие конститутивные промоторы также включают промоторы, которые характеризуются значительной экспрессией почти во всех тканях, однако характеризуются низкой экспрессией в пыльце, в том числе без ограничения: промоторы вируса полосатости банана (Acuminata Yunnan) (BSV(AY)), раскрытые в патенте США US8338662; промоторы вируса полосатости банана (Acuminata Vietnam) (BSV(AV)), раскрытые в патенте США US8350121, и промоторы вируса полосатости банана (Mysore) (BSV(MYS)), раскрытые в патенте США US8395022.

В зависимости от требуемого результата, может быть полезно экспрессировать ген с помощью индуцируемого промотора. Особый интерес для регуляции экспрессии нуклеотидных последовательностей согласно вариантам осуществления у растений представляют собой индуцируемые ранением промоторы. Такие индуцируемые ранением промоторы могут реагировать на повреждение, вызванное питанием насекомого, и они включают промотор гена ингибитора протеиназы (pin II) картофеля (Ryan, (1990) Ann. Rev. Phytopath. 28:425-449; Duan, et al., (1996) Nature Biotechnology 14:494-498); wun1 и wun2, патент США № 5428148; win1 и win2 (Stanford, et al., (1989) Mol. Gen. Genet. 215:200-208); системин (McGurl, et al., (1992) Science 225:1570-1573); WIP1 (Rohmeier, et al., (1993) Plant Mol. Biol. 22:783-792; Eckelkamp, et al., (1993) FEBS Letters 323:73-76); ген MPI (Corderok, et al., (1994) Plant J. 6(2):141-150) и т. п., включенные в данный документ с помощью ссылки.

Кроме того, в способах и нуклеотидных конструкциях согласно вариантам осуществления можно использовать индуцируемые патогеном промоторы. Такие индуцируемые патогеном промоторы включают промоторы из белков, связанных с патогенезом (PR-белков), которые индуцируются после заражения патогеном; например PR-белков, SAR-белков, бета-1,3-глюканазы, хитиназы и т. д. См., например, Redolfi, et al., (1983) Neth. J. Plant Pathol. 89:245-254; Uknes, et al., (1992) Plant Cell 4: 645-656 и Van Loon, (1985) Plant Mol. Virol. 4:111-116. См. также WO 1999/43819, включенную в данный документ с помощью ссылки.

Представляют интерес промоторы, которые экспрессируются локально в месте заражения патогеном или рядом с ним. См., например, Marineau, et al., (1987) Plant Mol. Biol. 9:335-342; Matton, et al., (1989) Molecular Plant-Microbe Interactions 2:325-331; Somsisch, et al., (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:2427-2430; Somsisch, et al., (1988) Mol. Gen. Genet. 2:93-98 и Yang, (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 93:14972-14977. См. также Chen, et al., (1996) Plant J. 10:955-966; Zhang, et al., (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:2507-2511; Warner, et al., (1993) Plant J. 3:191-201; Siebertz, et al., (1989) Plant Cell 1:961-968; патент США № 5750386 (индуцируемый нематодами); а также источники, приведенные в данных документах. Особый интерес представляет индуцируемый промотор для гена PRms маиса, экспрессия которого индуцируется патогеном Fusarium moniliforme (см, например, Cordero, et al., (1992) Physiol. Mol. Plant Path. 41:189-200).

Регулируемые химическими веществами промоторы можно использовать для модулирования экспрессии гена в растении посредством применения экзогенного химического регулятора. В зависимости от цели, промотор может представлять собой индуцируемый химическим веществом промотор, при этом применение химического вещества индуцирует экспрессию гена, или репрессируемый химическим веществом промотор, при этом применение химического вещества подавляет экспрессию гена. Индуцируемые химическими веществами промоторы известны в уровне техники и включают без ограничения промотор In2-2 маиса, который активируется антидотами к бензолсульфонамидным гербицидам, промотор GST маиса, который активируется гидрофобными электрофильными соединениями, которые применяются в качестве предвсходовых гербицидов, и промотор PR-1a табака, который активируется салициловой кислотой. Другие регулируемые химическими веществами промоторы, представляющие интерес, включают чувствительные к стероидам промоторы (см., например, индуцируемый глюкокортикоидом промотор в Schena, et al., (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:10421-10425 и McNellis, et al., (1998) Plant J. 14(2):247-257), а также индуцируемые тетрациклинами и репрессируемые тетрациклинами промоторы (см., например, Gatz, et al., (1991) Mol. Gen. Genet. 227:229-237 и патенты США №№ 5814618 и 5789156), включенные в данный документ с помощью ссылки.

Для целенаправленного воздействия на усиленную экспрессию инсектицидного полипептида в конкретной ткани растения можно использовать предпочтительные для ткани промоторы. Предпочтительные для ткани промоторы включают промоторы, обсуждаемые в Yamamoto, et al., (1997) Plant J. 12(2)255-265; Kawamata, et al., (1997) Plant Cell Physiol. 38(7):792-803; Hansen, et al., (1997) Mol. Gen Genet. 254(3):337-343; Russell, et al., (1997) Transgenic Res. 6(2):157-168; Rinehart, et al., (1996) Plant Physiol. 112(3):1331-1341; Van Camp, et al., (1996) Plant Physiol. 112(2):525-535; Canevascini, et al., (1996) Plant Physiol. 112(2):513-524; Yamamoto, et al., (1994) Plant Cell Physiol. 35(5):773-778; Lam, (1994) Results Probl. Cell Differ. 20:181-196; Orozco, et al., (1993) Plant Mol Biol. 23(6):1129-1138; Matsuoka, et al., (1993) Proc Natl. Acad. Sci. USA 90(20):9586-9590 и Guevara-Garcia, et al., (1993) Plant J. 4(3):495-505. Такие промоторы можно модифицировать в случае необходимости для получения слабой экспрессии.

Промоторы, предпочтительные для листа, известны в уровне техники. См., например, Yamamoto, et al., (1997) Plant J. 12(2):255-265; Kwon, et al., (1994) Plant Physiol. 105:357-67; Yamamoto, et al., (1994) Plant Cell Physiol. 35(5):773-778; Gotor, et al., (1993) Plant J. 3:509-18; Orozco, et al., (1993) Plant Mol. Biol. 23(6):1129-1138 и Matsuoka, et al., (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90(20):9586-9590.

Известны промоторы, предпочтительные для корня, или промоторы, специфичные в отношении корня, и их можно выбирать из многих доступных из литературных источников или выделенных de novo из различных совместимых видов. См., например, Hire, et al., (1992) Plant Mol. Biol. 20(2):207-218 (специфичный в отношении корня сои ген глутаминсинтетазы); Keller and Baumgartner, (1991) Plant Cell 3(10):1051-1061 (специфичный в отношении корня регуляторный элемент в гене GRP 1.8 фасоли); Sanger, et al., (1990) Plant Mol. Biol. 14(3):433-443 (специфичный в отношении корня промотор гена маннопинсинтазы (MAS) из Agrobacterium tumefaciens) и Miao, et al., (1991) Plant Cell 3(1):11-22 (кДНК-клон полной длины, кодирующий цитозольную глутаминсинтетазу (GS), которая экспрессируется в корнях и корневых клубеньках сои). См. также Bogusz, et al., (1990) Plant Cell 2(7):633-641, где описаны два промотора, специфичные в отношении корня, выделенные из генов гемоглобина от азотфиксирующего растения Parasponia andersonii, не относящегося к бобовым, и родственного растения Trema tomentosa, не относящегося к бобовым и не являющегося азотфиксирующим. Промоторы этих генов были связаны с репортерным геном β-глюкуронидазы и введены как в растение Nicotiana tabacum, не относящееся к бобовым, так и в бобовое растение Lotus corniculatus, и при этом в обоих случаях специфичная в отношении корня активность промотора сохранялась. Leach и Aoyagi (1991) описывают свой анализ промоторов, обеспечивающих высокий уровень экспрессии генов roIC и roID Agrobacterium rhizogenes, индуцирующих разрастание корней (см. Plant Science (Limerick) 79(1):69-76). Они пришли к выводу, что в этих промоторах энхансер и предпочтительные для ткани ДНК-детерминанты разделены. Teeri et al. (1989) применяли слияние гена с lacZ для того, чтобы показать, что ген из T-DNA Agrobacterium, кодирующий октопинсинтазу, является особенно активным в эпидермисе кончика корня, и что ген TR2' является специфичным в отношении корня в интактном растении и стимулируется при ранении в ткани листа, что является особенно необходимой комбинацией характеристик для применения с инсектицидным или ларвицидным геном (см. EMBO J. 8(2):343-350). Ген TR1', слитый с nptII (неомицинфосфотрансферазой II), продемонстрировал аналогичные характеристики. Дополнительные промоторы, предпочтительные для корня, включают промотор гена VfENOD-GRP3 (Kuster, et al., (1995) Plant Mol. Biol. 29(4):759-772) и промотор rolB (Capana, et al., (1994) Plant Mol. Biol. 25(4):681-691. См. также, патенты США №№ 5837876; 5750386; 5633363; 5459252; 5401836; 5110732 и 5023179. Регуляторные последовательности, предпочтительные для корня, Arabidopsis thaliana раскрыты в US20130117883. Промоторы RCc3, предпочтительные для корней сорго (Sorghum bicolor), раскрыты в заявке на выдачу патента США US20120210463.

Промоторы, ʺпредпочтительные для семениʺ, включают как промоторы, ʺспецифичные в отношении семениʺ (промоторы, которые активны во время развития семени, такие как промоторы запасных белков семени), так и промоторы ʺпрорастания семениʺ (промоторы, которые активны во время прорастания семени). См. Thompson, et al., (1989) BioEssays 10:108, включенную в данный документ с помощью ссылки. Такие промоторы, предпочтительные для семени, включают без ограничения Cim1 (индуцируемый цитокинином транскрипт); cZ19B1 (зеин маиса весом 19 кДа) и milps (мио-инозитол-1-фосфатсинтаза); (см. патент США № 6225529, включенный в данный документ с помощью ссылки). Гамма-зеин и Glb-1 являются специфичными в отношении эндосперма промоторами. В случае двудольных растений, промоторы, специфические в отношении семени, включают без ограничения промотор гена ингибитора трипсина Кунитца 3 (KTi3) (Jofuku and Goldberg, (1989) Plant Cell 1:1079-1093), β-фазеолина бобов, напина, β-конглицинина, глицинина 1, лектина сои, круциферина и т. п. В случае однодольных растений, промоторы, специфичные в отношении семени, включают без ограничения промоторы из генов зеина весом 15 кДа, зеина весом 22 кДа, зеина весом 27 кДа, g-зеина, waxy, shrunken 1, shrunken 2, глобулина 1 маиса и т. д. См. также WO 2000/12733, где раскрыты промоторы, предпочтительные для семени, из генов end1 и end2, включенную в данный документ с помощью ссылки. У двудольных растений промоторы, специфичные в отношении семени, включают без ограничения промотор гена белков семенной оболочки из Arabidopsis, pBAN; а также промоторы генов раннего развития семян из Arabidopsis, p26, p63 и p63tr (патенты США №№ 7294760 и 7847153). Промотор, который характеризуется "предпочтительной" экспрессией в конкретной ткани, экспрессируется в такой ткани в большей степени, чем по меньшей мере в одной другой растительной ткани. Для некоторых предпочтительных для ткани промоторов показана экспрессия почти исключительно в конкретной ткани.

Если требуется низкий уровень экспрессии, то будут применять слабые промоторы. Как правило, используемый в данном документе термин "слабый промотор" относится к промотору, который управляет экспрессией кодирующей последовательности на низком уровне. Под низким уровнем экспрессии подразумевают уровни от приблизительно 1/1000 транскриптов до приблизительно 1/100000 транскриптов, до приблизительно 1/500000 транскриптов. В качестве альтернативы, понятно, что термин "слабые промоторы" также охватывает промоторы, которые управляют экспрессией только в небольшом количестве клеток и не управляют в других, при этом обеспечивается общий низкий уровень экспрессии. Если промотор управляет экспрессией на неприемлемо высоких уровнях, то части промоторной последовательности можно удалить или модифицировать для снижения уровней экспрессии.

Такие слабые конститутивные промоторы включают, например, основной промотор промотора Rsyn7 (WO 1999/43838 и патент США № 6072050), основной промотор 35S CaMV и т. п. Другие конститутивные промоторы включают, например, раскрытые в патентах США №№ 5608149; 5608144; 5604121; 5569597; 5466785; 5399680; 5268463; 5608142 и 6177611, включенных в данный документ с помощью ссылки.

Приведенный выше перечень промоторов не предназначен для ограничения. В вариантах осуществления можно применять любой подходящий промотор.

Как правило, кассета экспрессии будет содержать селектируемый маркерный ген для отбора трансформированных клеток. Селектируемые маркерные гены используют для отбора трансформированных клеток или тканей. Маркерные гены включают гены, кодирующие устойчивость к антибиотику, такие как гены, кодирующие неомицинфосфотрансферазу II (NEO) и гигромицинфосфотрансферазу (HPT), а также гены, обеспечивающие устойчивость к гербицидным соединениям, таким как глуфосинат аммония, бромоксинил, имидазолиноны и 2,4-дихлорфеноксиацетат (2,4-D). Дополнительные примеры подходящих селектируемых маркерных генов включают без ограничения гены, кодирующие устойчивость к хлорамфениколу (Herrera Estrella, et al., (1983) EMBO J. 2:987-992); метотрексату (Herrera Estrella, et al., (1983) Nature 303:209-213 и Meijer, et al., (1991) Plant Mol. Biol. 16:807-820); стрептомицину (Jones, et al., (1987) Mol. Gen. Genet. 210:86-91); спектиномицину (Bretagne-Sagnard, et al., (1996) Transgenic Res. 5:131-137); блеомицину (Hille, et al., (1990) Plant Mol. Biol. 7:171-176); сульфонамиду (Guerineau, et al., (1990) Plant Mol. Biol. 15:127-136); бромоксинилу (Stalker, et al., (1988) Science 242:419-423); глифосату (Shaw, et al., (1986) Science 233:478-481 и заявки на выдачу патентов США с серийными №№ 10/004357 и 10/427692); фосфинотрицин (DeBlock, et al., (1987) EMBO J. 6:2513-2518). См., в целом, Yarranton, (1992) Curr. Opin. Biotech. 3:506-511; Christopherson, et al., (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:6314-6318; Yao, et al., (1992) Cell 71:63-72; Reznikoff, (1992) Mol. Microbiol. 6:2419-2422; Barkley, et al., (1980) в The Operon, pp. 177-220; Hu, et al., (1987) Cell 48:555-566; Brown, et al., (1987) Cell 49:603-612; Figge, et al., (1988) Cell 52:713-722; Deuschle, et al., (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:5400-5404; Fuerst, et al., (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:2549-2553; Deuschle, et al., (1990) Science 248:480-483; Gossen, (1993) диссертация на соискание научной степени доктора, Гейдельбергский университет; Reines, et al., (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:1917-1921; Labow, et al., (1990) Mol. Cell. Biol. 10:3343-3356; Zambretti, et al., (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:3952-3956; Baim, et al., (1991) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 88:5072-5076; Wyborski, et al., (1991) Nucleic Acids Res. 19:4647-4653; Hillenand-Wissman, (1989) Topics Mol. Struc. Biol. 10:143-162; Degenkolb, et al., (1991) Antimicrob. Agents Chemother. 35:1591-1595; Kleinschnidt, et al., (1988) Biochemistry 27:1094-1104; Bonin, (1993) диссертация на соискание научной степени доктора, Гейдельбергский университет; Gossen, et al., (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:5547-5551; Oliva, et al., (1992) Antimicrob. Agents Chemother. 36:913-919; Hlavka, et al., (1985) Handbook of Experimental Pharmacology, Vol. 78 (Springer-Verlag, Berlin) и Gill, et al., (1988) Nature 334:721-724. Такие раскрытия включены в данный документ с помощью ссылки.

Приведенный выше перечень селектируемых маркерных генов не предназначен для ограничения. В вариантах осуществления можно применять любой селектируемый маркерный ген.

ДНК-конструкции

Охватываются ДНК-конструкции, содержащие полинуклеотид, кодирующий инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1 функционально связанный с гетерологичным регуляторным элементом. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 114, SEQ ID NO: 116, SEQ ID NO: 118, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 122, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 132, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 158, SEQ ID NO: 218, SEQ ID NO: 220 или SEQ ID NO: 222, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 234 и SEQ ID NO: 236. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 220 или SEQ ID NO: 222, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-1 c SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 и SEQ ID NO: 236. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-45-1. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-1.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,6% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 19. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 21. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 88% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 23. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 27. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,8% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 29. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 92,3% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 31. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 91,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 33. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 95,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 93% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 97,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 43. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 45.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 111, SEQ ID NO: 113, SEQ ID NO: 115, SEQ ID NO: 117, SEQ ID NO: 119, SEQ ID NO: 121, SEQ ID NO: 123, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 133, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 157, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 219, SEQ ID NO: 221 или SEQ ID NO: 223, соответственно кодирующий полипептиды PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 221 или SEQ ID NO: 223, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-45-2. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-2.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 99,2% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 2. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 20. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 22. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 81% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 24. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 99,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 28. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 30. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 92% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 32. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 91,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 34. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 36. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 90% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 40. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 94% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 44. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 46.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 163, SEQ ID NO: 165, SEQ ID NO: 167, SEQ ID NO: 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 172, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 178 или SEQ ID NO: 224, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71 и SEQ ID NO: 238. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 165 или SEQ ID NO: 224, кодирующий полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 и SEQ ID NO: 238. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-64-1. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71 или SEQ ID NO: 238, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-1. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71 или SEQ ID NO: 238. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 53. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,7% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 58. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 238.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 164, SEQ ID NO: 166, SEQ ID NO: 168, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 173, SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 179 или SEQ ID NO: 225, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72 и SEQ ID NO: 239. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 166 или SEQ ID NO: 225, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 и SEQ ID NO: 239. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-64-2. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-2. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 91% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 59. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 239.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 182 или SEQ ID NO: 184, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-1 с SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 и SEQ ID NO: 77. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-74-1. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-1. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 73. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 75. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 77.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 185, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-2 с SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 и SEQ ID NO: 78. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-74-2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 74. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 76. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 78.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193 или SEQ ID NO: 194, соответственно кодирующий полипептид PIP-75 с SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 87. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193 или SEQ ID NO: 194, соответственно кодирующий полипептид PIP-75 с SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 87. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-75. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-75. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 79. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 80. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 81. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 84. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 85. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 86. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 87.

ДНК-конструкции, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO:197, SEQ ID NO:198, SEQ ID NO:199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 206, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 208, SEQ ID NO: 209, SEQ ID NO: 210, SEQ ID NO: 211, SEQ ID ID NO: 212, SEQ ID NO: 213, SEQ ID NO: 214, SEQ ID NO: 226, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228, SEQ ID NO: 229, SEQ ID NO: 230 или SEQ ID NO: 231, соответственно кодирующий полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 и SEQ ID NO: 245. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид с SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO:196, SEQ ID NO:197, SEQ ID NO:198, SEQ ID NO:199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228 или SEQ ID NO: 231, соответственно кодирующий полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 и SEQ ID NO: 245. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-77.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 90% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 95% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 95% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 93% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 88. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 97% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 89. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 99% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 90. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 97% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 92. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 93. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 94. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 95. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 84% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 96. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 97. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 83% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 98. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 100. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 241. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 83% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 242. В некоторых вариантах осуществления ДНК-конструкция содержит полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 245.

Трансформация растений

Способы согласно вариантам осуществления включают введение полипептида или полинуклеотида в растение. "Введение", используемое в данном документе, означает включение в растение полинуклеотида или полипептида таким образом, что последовательность попадает внутрь клетки растения. Способы согласно вариантам осуществления не зависят от конкретного способа введения полинуклеотида или полипептида в растение, нужно лишь чтобы полинуклеотид или полипептиды проникали внутрь по меньшей мере одной клетки растения. В уровне техники известны способы введения полинуклеотида и/или полипептидов в растения, в том числе без ограничений способы стабильной трансформации, способы транзиентной трансформации и способы трансформации, опосредованной вирусами.

"Стабильная трансформация", используемая в данном документе, означает, что нуклеотидная конструкция, введенная в растение, интегрируется в геном растения и может наследоваться его потомством. "Транзиентная трансформация", используемая в данном документе, означает, что полинуклеотид вводят в растение, и он не интегрируется в геном растения, или в растение вводят полипептид. "Растение", используемое в данном документе, относится к целым растениям, органам растения (например, листьям, стеблям, корням и т. д.), семенам, растительным клеткам, частям растения для вегетативного размножения, зародышам и их потомству. Растительные клетки могут быть дифференцированными или недифференцированными (например, клетками каллюса, клетками суспензионных культур, протопластами, клетками листьев, клетками корней, клетками флоэмы и пыльцой).

Протоколы трансформации, а также протоколы для введения нуклеотидных последовательностей в растения, могут изменяться в зависимости от типа растения или растительной клетки, т. е. класса однодольных или двудольных, на которые нацелена трансформация. Подходящие способы введения нуклеотидных последовательностей в растительные клетки и последующая вставка в геном растения включают микроинъекцию (Crossway, et al., (1986) Biotechniques 4:320-334), электропорацию (Riggs, et al., (1986) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 83:5602-5606), трансформацию, опосредованную Agrobacterium (патенты США №№ 5563055 и 5981840), прямой перенос генов (Paszkowski, et al., (1984) EMBO J. 3:2717-2722) и баллистическое ускорение частиц (см., например, патенты США №№ 4945050; 5879918; 5886244 и 5932782; Tomes, et al., (1995) в Plant Cell, Tissue, and Organ Culture: Fundamental Methods, ed. Gamborg and Phillips, (Springer-Verlag, Berlin) и McCabe, et al., (1988) Biotechnology 6:923-926) и трансформацию гена Lecl (WO 00/28058). Относительно трансформации картофеля см. Tu, et al., (1998) Plant Molecular Biology 37:829-838 и Chong, et al., (2000) Transgenic Research 9:71-78. Дополнительные процедуры трансформации можно найти в Weissinger, et al., (1988) Ann. Rev. Genet. 22:421-477; Sanford, et al., (1987) Particulate Science and Technology 5:27-37 (лук репчатый); Christou, et al., (1988) Plant Physiol. 87:671-674 (соя); McCabe, et al., (1988) Bio/Technology 6:923-926 (соя); Finer and McMullen, (1991) In Vitro Cell Dev. Biol. 27P:175-182 (соя); Singh, et al., (1998) Theor. Appl. Genet. 96:319-324 (соя); Datta, et al., (1990) Biotechnology 8:736-740 (рис); Klein, et al., (1988) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:4305-4309 (маис); Klein, et al., (1988) Biotechnology 6:559-563 (маис); патенты США №№ 5240855; 5322783 и 5324646; Klein, et al., (1988) Plant Physiol. 91:440-444 (маис); Fromm, et al., (1990) Biotechnology 8:833-839 (маис); Hooykaas-Van Slogteren, et al., (1984) Nature (London) 311:763-764; патент США № 5736369 (злаки); Bytebier, et al., (1987) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 84:5345-5349 (Liliaceae); De Wet, et al., (1985) в The Experimental Manipulation of Ovule Tissues, ed. Chapman, et al., (Longman, New York), pp. 197-209 (пыльца); Kaeppler, et al., (1990) Plant Cell Reports 9:415-418 и Kaeppler, et al., (1992) Theor. Appl. Genet. 84:560-566 (трансформация, опосредованная прокалыванием клеток путем встряхивания их в суспензии микроигл); D'Halluin, et al., (1992) Plant Cell 4:1495-1505 (электропорация); Li, et al., (1993) Plant Cell Reports 12:250-255 и Christou and Ford, (1995) Annals of Botany 75:407-413 (рис); Osjoda, et al., (1996) Nature Biotechnology 14:745-750 (маис при участии Agrobacterium tumefaciens); все из которых включены в данный документ с помощью ссылки.

В конкретных вариантах осуществления последовательности согласно вариантам осуществления можно вводить в растение с применением ряда способов транзиентной трансформации. Такие способы транзиентной трансформации включают без ограничения введение белка инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию или его вариантов и фрагментов непосредственно в растение или введение транскрипта инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию в растение. Такие способы включают, например, микроинъекцию или бомбардировку частицами. См, например, Crossway, et al., (1986) Mol Gen. Genet. 202:179-185; Nomura, et al., (1986) Plant Sci. 44:53-58; Hepler, et al., (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. 91:2176-2180 и Hush, et al., (1994) The Journal of Cell Science 107:775-784, все из которых включены в данный документ с помощью ссылки. В альтернативном случае, растение может быть транзиентно трансформировано для экспрессии инсектицидного полипептида с полинуклеотида по настоящему раскрытию с помощью методик, известных в уровне техники. Такие методики включают применение вирусной векторной системы и осаждение полинуклеотида таким способом, который исключает последующее высвобождение ДНК. Таким образом, может происходить транскрипция ДНК, связанной с частицами, однако частота, с которой она высвобождается для интеграции в геном, в значительной степени снижена. Такие способы включают применение частиц, покрытых полиэтиленимином (PEI; № по кат. Sigma P3143).

В уровне техники известны способы нацеленной вставки полинуклеотида в конкретное местоположение в геноме растения. В одном варианте осуществления вставку полинуклеотида в требуемое местоположение в геноме выполняют с использованием системы сайт-специфичной рекомбинации. См., например, WO 1999/25821, WO 1999/25854, WO 1999/25840, WO 1999/25855 и WO 1999/25853, все из которых включены в данный документ с помощью ссылки. Вкратце, полинуклеотид согласно вариантам осуществления может содержаться в кассете для переноса, фланкированной двумя неидентичными сайтами рекомбинации. Кассету для переноса вводят в растение, имеющее в своем геноме стабильно встроенный целевой сайт, который фланкирован двумя неидентичными сайтами рекомбинации, которые соответствуют сайтам кассеты для переноса. Обеспечивают подходящую рекомбиназу, и кассета для переноса интегрируется в целевой сайт. Полинуклеотид, представляющий интерес, таким образом интегрируется в конкретное хромосомное положение в геноме растения.

Векторы для трансформации растений могут состоять из одного или нескольких ДНК-векторов, необходимых для достижения трансформации растения. Например, общепринятой практикой в области техники является использование векторов для трансформации растений, которые состоят из более одного смежного сегмента ДНК. В уровне техники эти векторы зачастую называют "бинарными векторами". Бинарные векторы, а также векторы с плазмидами-помощниками наиболее часто применяются при трансформации, опосредованной Agrobacterium, при этом размер и сложность сегментов ДНК, необходимых для достижения эффективной трансформации, являются очень большими, и предпочтительным является разделение функций на отдельных молекулах ДНК. Бинарные векторы обычно содержат плазмидный вектор, который содержит действующие в цис-положении последовательности, требуемые для переноса T-DNA (как, например, левой границы и правой границы), селектируемый маркер, который разрабатывают таким образом, что он способен экспрессироваться в растительной клетке, и "ген, представляющий интерес" (ген, разработанный таким образом, что он способен экспрессироваться в растительной клетке, из которой требуется получить трансгенные растения). Также в этом плазмидном векторе присутствуют последовательности, требуемые для репликации в бактериях. Действующие в цис-положении последовательности расположены так, чтобы обеспечить возможность эффективного переноса в растительные клетки и экспрессии в них. Например, селектируемый маркерный ген и пестицидный ген расположены между левой и правой границами. Часто второй плазмидный вектор содержит действующие в транс-положении факторы, которые опосредуют перенос T-DNA из Agrobacterium в растительные клетки. Эта плазмида часто содержит функции вирулентности (гены Vir), что обеспечивает возможность заражения растительных клеток Agrobacterium и перенос ДНК путем расщепления по граничным последовательностям и переноса ДНК, опосредованного vir, как понятно из уровня техники (Hellens and Mullineaux, (2000) Trends in Plant Science 5:446-451). Для трансформации растений можно применять несколько типов штаммов Agrobacterium (например, LBA4404, GV3101, EHA101, EHA105 и т. п.). Второй плазмидный вектор не является необходимым для трансформации растений другими способами, такими как бомбардировка микрочастицами, микроинъекция, электропорация, с помощью полиэтиленгликоля и т. д.

В целом, способы трансформации растений включают перенос гетерологичной ДНК в целевые растительные клетки (например, незрелые или зрелые зародыши, суспензионные культуры, недифференцированный каллюс, протопласты и т. д.), с последующим применением соответствующего отбора с максимальным пороговым значением (в зависимости от селектируемого маркерного гена) для выделения трансформированных растительных клеток из группы нетрансформированной клеточной массы. После интеграции гетерологичной чужеродной ДНК в растительные клетки затем применяют соответствующий отбор с максимальным пороговым значением в среде для уничтожения нетрансформированных клеток и отделения и размножения предположительно трансформированных клеток, которые переживают эту обработку с отбором, посредством регулярного переноса на свежую среду. С помощью продолжающегося пассирования и проверки с помощью соответствующего отбора идентифицируют и размножают клетки, которые трансформированы плазмидным вектором. Затем можно применять молекулярные и биохимические способы для подтверждения присутствия интегрированного гетерологичного гена, представляющего интерес, в геноме трансгенного растения.

Как правило, эксплантаты переносят на свежую порцию той же среды и культивируют обычным способом. Впоследствии трансформированные клетки дифференцируются в побеги после помещения в среду для регенерации, дополненную средством отбора с максимальным пороговым значением. Затем побеги переносят на селективную среду для выращивания растений с получением укоренившихся побегов или саженцев. Затем трансгенный саженец выращивают до зрелого растения и получают фертильные семена (например, Hiei, et al., (1994) The Plant Journal 6:271-282; Ishida, et al., (1996) Nature Biotechnology 14:745-750). Как правило, эксплантаты переносят на свежую порцию той же среды и культивируют обычным способом. Общее описание методик и способов для получения трансгенных растений приведены в Ayres and Park, (1994) Critical Reviews in Plant Science 13:219-239 и Bommineni and Jauhar, (1997) Maydica 42:107-120. Поскольку трансформированный материал содержит множество клеток, то как трансформированные, так и нетрансформированные клетки присутствуют в любой части подвергнутого воздействию целевого каллюса, или ткани, или группы клеток. Возможность уничтожать нетрансформированные клетки и обеспечивать размножение трансформированных клеток приводит в результате к трансформированным растительным культурам. Зачастую, возможность удаления нетрансформированных клеток является ограничивающим фактором для быстрого получения трансформированных растительных клеток и успешного выращивания трансгенных растений.

Из клеток, которые были трансформированы, можно вырастить растения в соответствии с традиционными способами. См., например, McCormick, et al., (1986) Plant Cell Reports 5:81-84. Эти растения затем можно выращивать и опылять либо с использованием такой же трансформированной линии, либо других линий, и получать гибрид с конститутивной или индуцируемой экспрессией требуемого идентифицированного фенотипического свойства. Можно вырастить два или более поколений для того, чтобы убедиться в том, что экспрессия требуемой фенотипической характеристики стабильно поддерживается и наследуется, а затем собрать семена, чтобы убедиться в том, что экспрессия требуемого фенотипического свойства была достигнута.

Нуклеотидные последовательности согласно вариантам осуществления можно обеспечить в растении путем приведения растения в контакт с вирусом или вирусными нуклеиновыми кислотами. Как правило, такие способы включают встраивание нуклеотидной конструкции, представляющей интерес, в вирусную молекулу ДНК или РНК. Понятно, что рекомбинантные белки согласно вариантам осуществления можно первоначально синтезировать как часть вирусного полипротеина, который позже может быть процессирован путем протеолиза in vivo или in vitro с получением требуемого инсектицидного полипептида. Также понятно, что такой вирусный полипротеин, содержащий по меньшей мере часть аминокислотной последовательности инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию согласно вариантам осуществления, может обладать требуемой пестицидной активностью. Такие вирусные полипротеины и нуклеотидные последовательности, которые их кодируют, охвачены вариантами осуществления. Способы получения растений с нуклеотидными конструкциями и продукции кодируемых белков в растениях, которые включают вирусные молекулы ДНК или РНК, известны в уровне техники. См., например, патенты США №№ 5889191; 5889190; 5866785; 5589367 и 5316931; включенные в данный документ с помощью ссылки.

Способы трансформации хлоропластов известны в уровне техники. См., например, Svab, et al., (1990) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 87:8526-8530; Svab and Maliga, (1993) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:913-917; Svab and Maliga, (1993) EMBO J. 12:601-606. Способ основан на доставке генной пушкой ДНК, содержащей селектируемый маркер, и нацеливании ДНК в геном пластид с помощью гомологичной рекомбинации. Кроме того, трансформацию пластид можно осуществлять трансактивацией молчащего трансгена, находящегося в пластидах, путем экспрессии, предпочтительной для определенной ткани, РНК-полимеразы, кодируемой ядерным геномом и функционирующей в пластиде. О такой системе сообщали в McBride, et al., (1994) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91:7301-7305.

Варианты осуществления дополнительно относятся к материалу для размножения трансформированного растения согласно вариантам осуществления, в том числе без ограничения семенам, клубням, клубнелуковицам, луковицам, листьям и черенкам корней и побегов.

Варианты осуществления можно применять для трансформации любых видов растений, в том числе без ограничения однодольных и двудольных. Примеры растений, представляющих интерес, включают без ограничений кукурузу (Zea mays), Brassica sp. (например, B. napus, B. rapa, B. juncea), в частности виды Brassica, пригодные в качестве источников масла из семян растений, люцерну (Medicago sativa), рис (Oryza sativa), рожь (Secale cereale), сорго (Sorghum bicolor, Sorghum vulgare), просо (например, пеннисетум рогозовидный (Pennisetum glaucum), просо культурное (Panicum miliaceum), щетинник итальянский (Setaria italica), просо пальчатое (Eleusine coracana)), подсолнечник (Helianthus annuus), сафлор (Carthamus tinctorius), пшеницу (Triticum aestivum), сою (Glycine max), табак (Nicotiana tabacum), картофель (Solanum tuberosum), разновидности арахиса (Arachis hypogaea), хлопчатник (Gossypium barbadense, Gossypium hirsutum), сладкий картофель (Ipomoea batatus), маниок (Manihot esculenta), кофейное дерево (Coffea spp.), кокосовую пальму (Cocos nucifera), ананас (Ananas comosus), цитрусовые деревья (Citrus spp.), шоколадное дерево (Theobroma cacao), чайный куст (Camellia sinensis), банан (Musa spp.), авокадо (Persea americana), инжир (Ficus casica), гуаву (Psidium guajava), манго (Mangifera indica), маслину (Olea europaea), папайю (Carica papaya), кешью (Anacardium occidentale), макадамию (Macadamia integrifolia), миндаль (Prunus amygdalus), разновидности сахарной свеклы (Beta vulgaris), сахарный тростник (Saccharum spp.), разновидности овса, ячмень, овощи, декоративные растения и хвойные деревья.

Овощи включают разновидности томата (Lycopersicon esculentum), латук (например, Lactuca sativa), разновидности зеленой фасоли (Phaseolus vulgaris), разновидности лимской фасоли (Phaseolus limensis), разновидности гороха (Lathyrus spp.) и представителей рода Cucumis, таких как огурец (C. sativus), канталупа (C. cantalupensis) и дыня мускусная (C. melo). Декоративные растения включают азалию (Rhododendron spp.), гортензию (Macrophylla hydrangea), гибискус (Hibiscus rosasanensis), розы (Rosa spp.), тюльпаны (Tulipa spp.), нарциссы (Narcissus spp.), петунии (Petunia hybrida), гвоздику (Dianthus caryophyllus), пуансеттию (Euphorbia pulcherrima) и хризантему. Хвойные, которые можно использовать при практическом осуществлении вариантов осуществления, включают, например, разновидности сосны, такие как сосна ладанная (Pinus taeda), сосна Эллиота (Pinus elliotii), сосна желтая (Pinus ponderosa), сосна скрученная широкохвойная (Pinus contorta) и сосна лучистая (Pinus radiata); псевдотсугу Мензиса (Pseudotsuga menziesii); тсугу канадскую (Tsuga canadensis); ель сизую (Picea glauca); секвойю (Sequoia sempervirens); разновидности пихты, такие как пихта миловидная (Abies amabilis) и пихта бальзамическая (Abies balsamea), и разновидности туйи, такие как туя гигантская (Thuja plicata) и каллитропсис нутканский (Chamaecyparis nootkatensis). Растения согласно вариантам осуществления включают культурные растения (например, кукурузу, люцерну, подсолнечник, Brassica, сою, хлопчатник, сафлор, арахис, сорго, пшеницу, просо, табак и т. д.), такие как растения кукурузы и сои.

Разновидности газонной травы включают без ограничения: мятлик однолетний (Poa annua); райграс однолетний (Lolium multiflorum); мятлик сплюснутый (Poa compressa); овсяницу красную Чуинга (Festuca rubra); полевицу тонкую (Agrostis tenuis); полевицу болотную (Agrostis palustris); житняк пустынный (Agropyron desertorum); житняк гребенчатый (Agropyron cristatum); овсяницу длиннолистную (Festuca longifolia); мятлик луговой (Poa pratensis); ежу сборную (Dactylis glomerata); плевел многолетний (Lolium perenne); овсяницу красную (Festuca rubra); полевицу белую (Agrostis alba); мятлик обыкновенный (Poa trivialis); овсяницу овечью (Festuca ovina); костер безостый (Bromus inermis); овсяницу тростниковую (Festuca arundinacea); тимофеевку луговую (Phleum pratense); полевицу собачью (Agrostis canina); бескильницу расставленную (Puccinellia distans); пырей Смита (Agropyron smithii); свинорой пальчатый (Cynodon spp.); узкобороздник однобокий (Stenotaphrum secundatum); зойсию (Zoysia spp.); гречку заметную (Paspalum notatum); аксонопус афинский (Axonopus affinis); эремохлою змеехвостую (Eremochloa ophiuroides); кикуйю (Pennisetum clandesinum); паспалум влагалищный (Paspalum vaginatum); москитную траву (Bouteloua gracilis); бизонову траву (Buchloe dactyloids); боковой овес (Bouteloua curtipendula).

Растения, представляющие интерес, включают зерновые растения, которые дают семена, представляющие интерес, масличные растения и бобовые растения. Семена, представляющие интерес, включают семена зерновых культур, таких как кукуруза, пшеница, ячмень, рис, сорго, рожь, просо и т. д. Масличные растения включают хлопчатник, сою, сафлор, подсолнечник, Brassica, маис, люцерну, пальму, кокосовую пальму, лен, клещевину, маслину и т. д. Бобовые растения включают разновидности бобов и разновидности гороха. Разновидности бобов включают гуар, рожковое дерево, пажитник, сою, разновидности обыкновенной фасоли, вигну китайскую, золотистую фасоль, лимскую фасоль, стручковую фасоль, разновидности чечевицы, турецкий горох и т. д.

Трансгенные растения

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий инсектицидный полипептид, также охвачены настоящим раскрытием. Настоящим раскрытием охвачены трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 110, SEQ ID NO: 112, SEQ ID NO: 114, SEQ ID NO: 116, SEQ ID NO: 118, SEQ ID NO: 120, SEQ ID NO: 122, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 132, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 148, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 154, SEQ ID NO: 156, SEQ ID NO: 158, SEQ ID NO: 218, SEQ ID NO: 220 или SEQ ID NO: 222, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 234 и SEQ ID NO: 236. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 108, SEQ ID NO: 124, SEQ ID NO: 126, SEQ ID NO: 128, SEQ ID NO: 130, SEQ ID NO: 134, SEQ ID NO: 136, SEQ ID NO: 138, SEQ ID NO: 140, SEQ ID NO: 142, SEQ ID NO: 146, SEQ ID NO: 150, SEQ ID NO: 152, SEQ ID NO: 220 или SEQ ID NO: 222, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-1 с SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 и SEQ ID NO: 236. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-45-1. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-1.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 3, SEQ ID NO: 5, SEQ ID NO: 7, SEQ ID NO: 9, SEQ ID NO: 11, SEQ ID NO: 13, SEQ ID NO: 15, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 25, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 37, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 41, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 47, SEQ ID NO: 49, SEQ ID NO: 51, SEQ ID NO: 232, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 17, SEQ ID NO: 19, SEQ ID NO: 21, SEQ ID NO: 23, SEQ ID NO: 27, SEQ ID NO: 29, SEQ ID NO: 31, SEQ ID NO: 33, SEQ ID NO: 35, SEQ ID NO: 39, SEQ ID NO: 43, SEQ ID NO: 45, SEQ ID NO: 234 или SEQ ID NO: 236, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 1. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 17. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,6% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 19. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 87% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 21. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 88% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 23. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 27. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,8% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 29. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 92,3% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 31. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 91,1% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 33. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 95,4% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 35. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 95% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 39. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 97,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 43. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 45. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 94% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 234. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-1, последовательность которого по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 236.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 111, SEQ ID NO: 113, SEQ ID NO: 115, SEQ ID NO: 117, SEQ ID NO: 119, SEQ ID NO: 121, SEQ ID NO: 123, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 133, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 149, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 155, SEQ ID NO: 157, SEQ ID NO: 159, SEQ ID NO: 219, SEQ ID NO: 221 или SEQ ID NO: 223, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 109, SEQ ID NO: 125, SEQ ID NO: 127, SEQ ID NO: 129, SEQ ID NO: 131, SEQ ID NO: 135, SEQ ID NO: 137, SEQ ID NO: 139, SEQ ID NO: 141, SEQ ID NO: 143, SEQ ID NO: 147, SEQ ID NO: 151, SEQ ID NO: 153, SEQ ID NO: 221 или SEQ ID NO: 223, соответственно кодирующий полипептид PIP-45-2 с SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-45-2. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 235 и SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-45-2.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 4, SEQ ID NO: 6, SEQ ID NO: 8, SEQ ID NO: 10, SEQ ID NO: 12, SEQ ID NO: 14, SEQ ID NO: 16, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 26, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 38, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 42, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 48, SEQ ID NO: 50, SEQ ID NO: 52, SEQ ID NO: 233, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 18, SEQ ID NO: 20, SEQ ID NO: 22, SEQ ID NO: 24, SEQ ID NO: 28, SEQ ID NO: 30, SEQ ID NO: 32, SEQ ID NO: 34, SEQ ID NO: 36, SEQ ID NO: 40, SEQ ID NO: 44, SEQ ID NO: 46, SEQ ID NO: 235 или SEQ ID NO: 237, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 99,2% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 2. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 18. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 96% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 20. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 22. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 81% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 24. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 99,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 28. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 98,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 30. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 92% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 32. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 91,5% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 34. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 36. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 90% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 40. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 94% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 44. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-45-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 46.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 163, SEQ ID NO: 165, SEQ ID NO: 167, SEQ ID NO: 169, SEQ ID NO: 171, SEQ ID NO: 172, SEQ ID NO: 174, SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 178 или SEQ ID NO: 224, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71 и SEQ ID NO: 238. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 160, SEQ ID NO: 165 или SEQ ID NO: 224, кодирующий полипептид PIP-64-1 с SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 и SEQ ID NO: 238. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-64-1. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71 или SEQ ID NO: 238, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-1. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 56, SEQ ID NO: 58, SEQ ID NO: 60, SEQ ID NO: 62, SEQ ID NO: 64, SEQ ID NO: 65, SEQ ID NO: 67, SEQ ID NO: 69, SEQ ID NO: 71 или SEQ ID NO: 238. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 58 или SEQ ID NO: 238.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 53. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 99,7% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 58. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 238.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 164, SEQ ID NO: 166, SEQ ID NO: 168, SEQ ID NO: 170, SEQ ID NO: 173, SEQ ID NO: 175, SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 179 или SEQ ID NO: 225, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72 и SEQ ID NO: 239. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 161, SEQ ID NO: 162, SEQ ID NO: 166 или SEQ ID NO: 225, соответственно кодирующий полипептид PIP-64-2 с SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 и SEQ ID NO: 239. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-64-2. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-64-2. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 57, SEQ ID NO: 59, SEQ ID NO: 61, SEQ ID NO: 63, SEQ ID NO: 66, SEQ ID NO: 68, SEQ ID NO: 70, SEQ ID NO: 72 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 55, SEQ ID NO: 59 или SEQ ID NO: 239, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 54. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 55. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 91% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 59. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-64-2, последовательность которого по меньшей мере на 70% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 239.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полипептид с SEQ ID NO: 180, SEQ ID NO: 182 или SEQ ID NO: 184, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-1 с SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 и SEQ ID NO: 77. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-74-1. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-1. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 75 или SEQ ID NO: 77.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 73. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 75. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-1, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 77.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полипептид с SEQ ID NO: 181, SEQ ID NO: 183, SEQ ID NO: 185, соответственно кодирующий полипептид PIP-74-2 с SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 и SEQ ID NO: 78. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-74-2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-74-2. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 76 или SEQ ID NO: 78.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 74. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 76. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-74-2, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 78.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 189, SEQ ID NO: 190, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193 или SEQ ID NO: 194, соответственно кодирующий полипептид PIP-75 с SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 87. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 186, SEQ ID NO: 187, SEQ ID NO: 188, SEQ ID NO: 191, SEQ ID NO: 192, SEQ ID NO: 193 или SEQ ID NO: 194, соответственно кодирующий полипептид PIP-75 с SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 и SEQ ID NO: 87. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат отличную от геномной молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую полипептид PIP-75. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-75. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 82, SEQ ID NO: 83, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид кодирует полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 79, SEQ ID NO: 80, SEQ ID NO: 81, SEQ ID NO: 84, SEQ ID NO: 85, SEQ ID NO: 86 или SEQ ID NO: 87, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 79. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 80. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 81. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 84. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 85. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 86. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-75, последовательность которого по меньшей мере на 75% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 87.

Трансгенные растения или растительные клетки, содержащие полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, также охвачены настоящим раскрытием. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO: 196, SEQ ID NO:197, SEQ ID NO:198, SEQ ID NO:199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 206, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 208, SEQ ID NO: 209, SEQ ID NO: 210, SEQ ID NO: 211, SEQ ID ID NO: 212, SEQ ID NO: 213, SEQ ID NO: 214, SEQ ID NO: 226, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228, SEQ ID NO: 229, SEQ ID NO: 230 или SEQ ID NO: 231, соответственно кодирующий полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 и SEQ ID NO: 245. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид с SEQ ID NO: 195, SEQ ID NO:196, SEQ ID NO:197, SEQ ID NO:198, SEQ ID NO:199, SEQ ID NO: 200, SEQ ID NO: 201, SEQ ID NO: 202, SEQ ID NO: 203, SEQ ID NO: 204, SEQ ID NO: 205, SEQ ID NO: 207, SEQ ID NO: 227, SEQ ID NO: 228 или SEQ ID NO: 231, соответственно кодирующий полипептид PIP-77 с SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 и SEQ ID NO: 245. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого достаточно гомологична аминокислотной последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. "Достаточно гомологична" используется в данном документе для обозначения аминокислотной последовательности, последовательность которой по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более гомологична эталонной последовательности с применением одной из программ выравнивания, описанных в данном документе, с применением стандартных параметров. Специалисту в данной области будет понятно, что эти значения можно соответствующим образом скорректировать для определения соответствующей гомологии белков, принимая во внимание аминокислотное сходство и т. п. В некоторых вариантах осуществления гомологию последовательности определяют относительно последовательности полной длины полипептида PIP-77.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 91, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 101, SEQ ID NO: 102, SEQ ID NO: 103, SEQ ID NO: 104, SEQ ID NO: 105, SEQ ID NO: 106, SEQ ID NO: 107, SEQ ID NO: 240, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242, SEQ ID NO: 243, SEQ ID NO: 244 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на приблизительно 50%, 55%, 60%, 65%, 70%, 71%, 72%, 73%, 74%, 75%, 76%, 77%, 78%, 79%, 80%, 81%, 82%, 83%, 84%, 85%, 86%, 87%, 88%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более идентична последовательности под SEQ ID NO: 88, SEQ ID NO: 89, SEQ ID NO: 90, SEQ ID NO: 92, SEQ ID NO: 93, SEQ ID NO: 94, SEQ ID NO: 95, SEQ ID NO: 96, SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 98, SEQ ID NO: 100, SEQ ID NO: 241, SEQ ID NO: 242 или SEQ ID NO: 245, и который обладает инсектицидной активностью.

В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 86% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 88. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 89. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 90. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 91. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 92. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 93. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 94. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 85% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 95. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 96. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 97. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 98. В некоторых вариантах осуществления трансгенные растение или растительная клетка содержат полинуклеотид, кодирующий полипептид PIP-77, последовательность которого по меньшей мере на 80% или более идентична последовательности при сравнении с последовательностью под SEQ ID NO: 100.

Оценка трансформации растений

После введения гетерологичной чужеродной ДНК в растительные клетки трансформацию или интеграцию гетерологичного гена в геном растения подтверждают с помощью различных способов, таких как анализ нуклеиновых кислот, белков и метаболитов, связанных с интегрированным геном.

ПЦР-анализ представляет собой быстрый способ скрининга трансформированных клеток, ткани или побегов в отношении присутствия встроенного гена на ранней стадии перед высаживанием в почву (Sambrook and Russell, (2001) Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press, Cold Spring Harbor, NY). ПЦР проводят с применением олигонуклеотидных праймеров, специфичных в отношении гена, представляющего интерес, или исходных последовательностей вектора на основе Agrobacterium и т. д.

Трансформацию растений можно подтвердить с помощью Саузерн-блот анализа геномной ДНК (Sambrook and Russell, (2001) выше). В целом, общую ДНК экстрагируют из трансформанта, разрезают соответствующими ферментами рестрикции, фракционируют в агарозном геле и переносят на нитроцеллюлозную или найлоновую мембрану. Затем мембрану или "блот" анализируют с помощью зонда, например целевого фрагмента ДНК с радиоактивной меткой 32P, с целью подтверждения интеграции внедренного гена в геном растения в соответствии со стандартными методиками (Sambrook и Russell, (2001) выше).

При нозерн-блот анализе РНК выделяют из специфичных тканей трансформанта, фракционируют в агарозном геле, содержащем формальдегид, и переносят на найлоновый фильтр в соответствии со стандартными процедурами, которые обычно применяют в области техники (Sambrook and Russell, (2001) выше). Затем экспрессию РНК, кодируемой пестицидным геном, тестировали с помощью гибридизации фильтра с радиоактивным зондом, полученным из пестицидного гена, посредством способов, известных в уровне техники (Sambrook и Russell, (2001) выше).

Вестерн-блот, биохимические анализы и т. п. можно проводить в отношении трансгенных растений для подтверждения присутствия белка, кодируемого пестицидным геном, с помощью стандартных процедур (Sambrook и Russell, 2001, выше) с применением антител, которые связываются с одним или несколькими эпитопами, присутствующими на инсектицидном полипептиде по настоящему раскрытию.

Пакетирование признаков в трансгенном растении

Трансгенные растения могут содержать пакет из одного или нескольких инсектицидных полинуклеотидов, раскрытых в данном документе, с одним или несколькими дополнительными полинуклеотидами, приводящими к продуцированию или супрессии нескольких полипептидных последовательностей. Трансгенные растения, содержащие пакеты из последовательностей полинуклеотидов, можно получить либо с помощью традиционных способов скрещивания, либо посредством способов генной инженерии, либо применяя и то, и другое. Эти способы включают без ограничений размножение индивидуальных линий, при этом каждая содержит полинуклеотид, представляющий интерес, трансформацию трансгенного растения, содержащего ген, раскрытый в данном документе, добавочным геном и котрансформацию генов одной растительной клетки. Термин "пакетированный", используемый в данном документе, предусматривает состояние, при котором в одном растении присутствуют несколько признаков (т. е. оба признака включены в ядерный геном, один признак включен в ядерный геном и один признак включен в геном пластиды, или оба признака включены в геном пластиды). В одном неограничивающем примере "пакетированные признаки" предусматривают молекулярный пакет, в котором последовательности физически граничат друг с другом. "Признак", используемый в данном документе, относится к фенотипу, обусловленному конкретной последовательностью или группами последовательностей. Котрансформацию генов можно проводить с применением единых векторов для трансформации, содержащих несколько генов, или нескольких векторов, которые несут отдельные гены. Если последовательности пакетированы с помощью генетической трансформации растений, то представляющие интерес полинуклеотидные последовательности можно комбинировать в любое время и в любом порядке. Признаки можно вводить одновременно в протоколе котрансформации с представляющими интерес полинуклеотидами, представленными любой комбинацией кассет трансформации. Например, если будут вводиться две последовательности, то эти две последовательности могут содержаться в отдельных кассетах для трансформации (транс) или содержаться в одной кассете для трансформации (цис). Экспрессия этих последовательностей может управляться одним и тем же промотором или различными промоторами. В определенных случаях может потребоваться введение кассеты для трансформации, которая будет супрессировать экспрессию представляющего интерес полинуклеотида. Ее можно комбинировать с любой комбинацией других кассет супрессии или кассет сверхэкспрессии для получения требуемой комбинации признаков в растении. Кроме того, считается, что полинуклеотидные последовательности можно пакетировать в требуемом местоположении в геноме с применением системы для сайт-специфичной рекомбинации. См., например, WO 1999/25821, WO 1999/25854, WO 1999/25840, WO 1999/25855 и WO 1999/25853, все из которых включены в данный документ с помощью ссылки.

В некоторых вариантах осуществления полинуклеотиды, кодирующие инсектицидные полипептиды, раскрытые в данном документе, отдельно или пакетированные с одним или несколькими дополнительными признаками устойчивости к насекомым, можно пакетировать с одним или несколькими дополнительными вводимыми признаками (например, устойчивость к гербициду, устойчивость к грибам, устойчивость к вирусам, переносимость стрессов, устойчивость к заболеваниям, мужская стерильность, сила стебля и т. п.), или признаками, влияющими на выход (например, повышенная урожайность, разновидности модифицированного крахмала, улучшенный профиль масел, сбалансированные аминокислоты, высокое содержание лизина или метионина, повышенная усвояемость, улучшенное качество волокон, устойчивость к засухе и т. п.). Таким образом, варианты осуществления полинуклеотида можно применять для обеспечения полного комплекса агрономических признаков, обеспечивающих улучшенное качество сельскохозяйственной культуры, с возможностью гибкого и экономически эффективного контроля любого количества сельскохозяйственных вредителей.

Трансгены, пригодные для пакетирования, включают без ограничения приведенные ниже.

1. Трансгены, которые обеспечивают устойчивость к насекомым или заболеваниям и которые кодируют приведенные ниже.

(A) Гены устойчивости растения к заболеваниям. Защитные механизмы растений зачастую активируются посредством специфического взаимодействия между продуктом гена устойчивости к заболеваниям (R) в растении и продуктом соответствующего гена авирулентности (Avr) в патогене. Разновидность растения можно трансформировать с помощью клонированного гена устойчивости с целью разработки растений, которые устойчивы к специфичным штаммам патогена. См., например, Jones, et al., (1994) Science 266:789 (клонирование гена Cf-9 томата, обеспечивающего устойчивость к Cladosporium fulvum); Martin, et al., (1993) Science 262:1432 (ген Pto томата, обеспечивающий устойчивость к Pseudomonas syringae pv. томата, кодирует протеинкиназу); Mindrinos, et al., (1994) Cell 78:1089 (ген RSP2 Arabidopsis, обеспечивающий устойчивость к Pseudomonas syringae), McDowell and Woffenden, (2003) Trends Biotechnol. 21(4):178-83 и Toyoda, et al., (2002) Transgenic Res. 11(6):567-82. Растение, устойчивое к заболеванию, представляет собой растение, которое более устойчиво к патогену по сравнению с растением дикого типа.

(B) Гены, кодирующие белок Bacillus thuringiensis, его производное или синтетический полипептид, смоделированный на его основе. См., например, Geiser, et al., (1986) Gene 48:109, которые раскрывают клонирование и нуклеотидную последовательность гена дельта-эндотоксина Bt. Кроме того, молекулы ДНК, кодирующие гены дельта-эндотоксина, можно приобрести в Американской коллекции типовых культур (Роквилл, Мэриленд), например, под номерами доступа ATCC^® 40098, 67136, 31995 и 31998. Другие неограничивающие примеры трансгенов Bacillus thuringiensis, разработанных с помощью методик генной инженерии, приведены в следующих патентах и заявках на выдачу патентов, и тем самым включены с помощью ссылки для данной цели: патенты США №№ 5188960; 5689052; 5880275; 5986177; 6023013, 6060594, 6063597, 6077824, 6620988, 6642030, 6713259, 6893826, 7105332; 7179965, 7208474; 7227056, 7288643, 7323556, 7329736, 7449552, 7468278, 7510878, 7521235, 7544862, 7605304, 7696412, 7629504, 7705216, 7772465, 7790846, 7858849 и WO 1991/14778; WO 1999/31248; WO 2001/12731; WO 1999/24581 и WO 1997/40162.

Гены, кодирующие пестицидные белки, также можно пакетировать в том числе без ограничения: с инсектицидными белками из Pseudomonas sp., такими как PSEEN3174 (Monalysin, (2011) PLoS Pathogens, 7:1-13), из штамма CHA0 и Pf-5 Pseudomonas protegens (ранее fluorescens) (Pechy-Tarr, (2008) Environmental Microbiology 10:2368-2386: № доступа в GenBank EU400157); из Pseudomonas Taiwanensis (Liu, et al., (2010) J. Agric. Food Chem. 58:12343-12349) и из Pseudomonas pseudoalcligenes (Zhang, et al., (2009) Annals of Microbiology 59:45-50 и Li, et al., (2007) Plant Cell Tiss. Organ Cult. 89:159-168); инсектицидными белками из Photorhabdus sp. и Xenorhabdus sp. (Hinchliffe, et al., (2010) The Open Toxinology Journal 3:101-118 и Morgan, et al., (2001) Applied and Envir. Micro. 67:2062-2069); патент США № 6048838 и патент США № 6379946; полипептидом PIP-1 из патентной публикации США № US2014-0007297-A1; полипептидами AfIP-1A и/или AfIP-1B из патентной публикации США № US/2014-0033361; полипептидами PHI-4 из патентного документа США с серийным № 13/839702; полипептидами PIP-47 из публикации согласно PCT с серийным № PCT/US14/51063; полипептидом PHI-4 из патентной публикации США № US20140274885 или патентной публикации согласно PCT WO2014/150914; полипептидом PIP-72 из публикации согласно PCT с серийным № PCT/US14/55128; инсектицидными белками из патентных документов США с серийными №№ 61/863761 и 61/863763; и с δ-эндотоксинами, в том числе без ограничения: классы Cry1, Cry2, Cry3, Cry4, Cry5, Cry6, Cry7, Cry8, Cry9, Cry10, Cry11, Cry12, Cry13, Cry14, Cry15, Cry16, Cry17, Cry18, Cry19, Cry20, Cry21, Cry22, Cry23, Cry24, Cry25, Cry26, Cry27, Cry28, Cry29, Cry30, Cry31, Cry32, Cry33, Cry34, Cry35, Cry36, Cry37, Cry38, Cry39, Cry40, Cry41, Cry42, Cry43, Cry44, Cry45, Cry 46, Cry47, Cry49, Cry 51, Cry52, Cry 53, Cry 54, Cry55, Cry56, Cry57, Cry58, Cry59, Cry60, Cry61, Cry62, Cry63, Cry64, Cry65, Cry66, Cry67, Cry68, Cry69, Cry70, Cry71 и Cry72 генов δ-эндотоксинов, а также цитолитические гены Cyt1 и Cyt2 B. thuringiensis. Представители этих классов инсектицидных белков B. thuringiensis включают без ограничения Cry1Aa1 (№ доступа AAA22353); Cry1Aa2 (№ доступа № доступа AAA22552); Cry1Aa3 (№ доступа BAA00257); Cry1Aa4 (№ доступа CAA31886); Cry1Aa5 (№ доступа BAA04468); Cry1Aa6 (№ доступа AAA86265); Cry1Aa7 (№ доступа AAD46139); Cry1Aa8 (№ доступа I26149); Cry1Aa9 (№ доступа BAA77213); Cry1Aa10 (№ доступа AAD55382); Cry1Aa11 (№ доступа CAA70856); Cry1Aa12 (№ доступа AAP80146); Cry1Aa13 (№ доступа AAM44305); Cry1Aa14 (№ доступа AAP40639); Cry1Aa15 (№ доступа AAY66993); Cry1Aa16 (№ доступа HQ439776); Cry1Aa17 (№ доступа HQ439788); Cry1Aa18 (№ доступа HQ439790); Cry1Aa19 (№ доступа HQ685121); Cry1Aa20 (№ доступа JF340156); Cry1Aa21 (№ доступа JN651496); Cry1Aa22 (№ доступа KC158223); Cry1Ab1 (№ доступа AAA22330); Cry1Ab2 (№ доступа AAA22613); Cry1Ab3 (№ доступа AAA22561); Cry1Ab4 (№ доступа BAA00071 ); Cry1Ab5 (№ доступа CAA28405); Cry1Ab6 (№ доступа AAA22420); Cry1Ab7 (№ доступа CAA31620); Cry1Ab8 (№ доступа AAA22551); Cry1Ab9 (№ доступа CAA38701); Cry1Ab10 (№ доступа A29125); Cry1Ab11 (№ доступа I12419); Cry1Ab12 (№ доступа AAC64003); Cry1Ab13 (№ доступа AAN76494); Cry1Ab14 (№ доступа AAG16877); Cry1Ab15 (№ доступа AAO13302); Cry1Ab16 (№ доступа AAK55546); Cry1Ab17 (№ доступа AAT46415); Cry1Ab18 (№ доступа AAQ88259); Cry1Ab19 (№ доступа AAW31761); Cry1Ab20 (№ доступа ABB72460); Cry1Ab21 (№ доступа ABS18384); Cry1Ab22 (№ доступа ABW87320); Cry1Ab23 (№ доступа HQ439777); Cry1Ab24 (№ доступа HQ439778); Cry1Ab25 (№ доступа HQ685122); Cry1Ab26 (№ доступа HQ847729); Cry1Ab27 (№ доступа JN135249); Cry1Ab28 (№ доступа JN135250); Cry1Ab29 (№ доступа JN135251); Cry1Ab30 (№ доступа JN135252); Cry1Ab31 (№ доступа JN135253); Cry1Ab32 (№ доступа JN135254); Cry1Ab33 (№ доступа AAS93798); Cry1Ab34 (№ доступа KC156668); Cry1Ab-подобный (№ доступа AAK14336); Cry1Ab-подобный (№ доступа AAK14337); Cry1Ab-подобный (№ доступа AAK14338); Cry1Ab-подобный (№ доступа ABG88858); Cry1Ac1 (№ доступа AAA22331); Cry1Ac2 (№ доступа AAA22338); Cry1Ac3 (№ доступа CAA38098); Cry1Ac4 (№ доступа AAA73077); Cry1Ac5 (№ доступа AAA22339); Cry1Ac6 (№ доступа AAA86266); Cry1Ac7 (№ доступа AAB46989); Cry1Ac8 (№ доступа AAC44841); Cry1Ac9 (№ доступа AAB49768); Cry1Ac10 (№ доступа CAA05505 ); Cry1Ac11 (№ доступа CAA10270); Cry1Ac12 (№ доступа I12418); Cry1Ac13 (№ доступа AAD38701); Cry1Ac14 (№ доступа AAQ06607); Cry1Ac15 (№ доступа AAN07788); Cry1Ac16 (№ доступа AAU87037); Cry1Ac17 (№ доступа AAX18704); Cry1Ac18 (№ доступа AAY88347); Cry1Ac19 (№ доступа ABD37053); Cry1Ac20 (№ доступа ABB89046 ); Cry1Ac21 (№ доступа AAY66992 ); Cry1Ac22 (№ доступа ABZ01836); Cry1Ac23 (№ доступа CAQ30431); Cry1Ac24 (№ доступа ABL01535); Cry1Ac25 (№ доступа FJ513324); Cry1Ac26 (№ доступа FJ617446); Cry1Ac27 (№ доступа FJ617447); Cry1Ac28 (№ доступа ACM90319); Cry1Ac29 (№ доступа DQ438941); Cry1Ac30 (№ доступа GQ227507); Cry1Ac31 (№ доступа GU446674); Cry1Ac32 (№ доступа HM061081); Cry1Ac33 (№ доступа GQ866913); Cry1Ac34 (№ доступа HQ230364); Cry1Ac35 (№ доступа JF340157); Cry1Ac36 (№ доступа JN387137); Cry1Ac37 (№ доступа JQ317685); Cry1Ad1 (№ доступа AAA22340); Cry1Ad2 (№ доступа CAA01880); Cry1Ae1 (№ доступа AAA22410); Cry1Af1 (№ доступа AAB82749); Cry1Ag1 (№ доступа AAD46137); Cry1Ah1 (№ доступа AAQ14326); Cry1Ah2 (№ доступа ABB76664); Cry1Ah3 (№ доступа HQ439779); Cry1Ai1 (№ доступа AAO39719); Cry1Ai2 (№ доступа HQ439780); Cry1A-подобный (№ доступа AAK14339); Cry1Ba1 (№ доступа CAA29898); Cry1Ba2 (№ доступа CAA65003); Cry1Ba3 (№ доступа AAK63251); Cry1Ba4 (№ доступа AAK51084); Cry1Ba5 (№ доступа ABO20894); Cry1Ba6 (№ доступа ABL60921); Cry1Ba7 (№ доступа HQ439781); Cry1Bb1 (№ доступа AAA22344); Cry1Bb2 (№ доступа HQ439782); Cry1Bc1 (№ доступа CAA86568); Cry1Bd1 (№ доступа AAD10292); Cry1Bd2 (№ доступа AAM93496); Cry1Be1 (№ доступа AAC32850); Cry1Be2 (№ доступа AAQ52387); Cry1Be3 (№ доступа ACV96720); Cry1Be4 (№ доступа HM070026); Cry1Bf1 (№ доступа CAC50778); Cry1Bf2 (№ доступа AAQ52380); Cry1Bg1 (№ доступа AAO39720); Cry1Bh1 (№ доступа HQ589331); Cry1Bi1 (№ доступа KC156700); Cry1Ca1 (№ доступа CAA30396); Cry1Ca2 (№ доступа CAA31951); Cry1Ca3 (№ доступа AAA22343); Cry1Ca4 (№ доступа CAA01886); Cry1Ca5 (№ доступа CAA65457); Cry1Ca6 [1] (№ доступа AAF37224 ); Cry1Ca7 (№ доступа AAG50438); Cry1Ca8 (№ доступа AAM00264); Cry1Ca9 (№ доступа AAL79362); Cry1Ca10 (№ доступа AAN16462); Cry1Ca11 (№ доступа AAX53094); Cry1Ca12 (№ доступа HM070027); Cry1Ca13 (№ доступа HQ412621); Cry1Ca14 (№ доступа JN651493); Cry1Cb1 (№ доступа M97880); Cry1Cb2 (№ доступа AAG35409); Cry1Cb3 (№ доступа ACD50894 ); Cry1Cb-подобный (№ доступа AAX63901); Cry1Da1 (№ доступа CAA38099); Cry1Da2 (№ доступа I76415); Cry1Da3 (№ доступа HQ439784); Cry1Db1 (№ доступа CAA80234 ); Cry1Db2 (№ доступа AAK48937 ); Cry1Dc1 (№ доступа ABK35074); Cry1Ea1 (№ доступа CAA37933); Cry1Ea2 (№ доступа CAA39609); Cry1Ea3 (№ доступа AAA22345); Cry1Ea4 (№ доступа AAD04732); Cry1Ea5 (№ доступа A15535); Cry1Ea6 (№ доступа AAL50330); Cry1Ea7 (№ доступа AAW72936); Cry1Ea8 (№ доступа ABX11258); Cry1Ea9 (№ доступа HQ439785); Cry1Ea10 (№ доступа ADR00398); Cry1Ea11 (№ доступа JQ652456); Cry1Eb1 (№ доступа AAA22346); Cry1Fa1 (№ доступа AAA22348); Cry1Fa2 (№ доступа AAA22347); Cry1Fa3 (№ доступа HM070028); Cry1Fa4 (№ доступа HM439638); Cry1Fb1 (№ доступа CAA80235); Cry1Fb2 (№ доступа BAA25298); Cry1Fb3 (№ доступа AAF21767); Cry1Fb4 (№ доступа AAC10641); Cry1Fb5 (№ доступа AAO13295); Cry1Fb6 (№ доступа ACD50892); Cry1Fb7 (№ доступа ACD50893); Cry1Ga1 (№ доступа CAA80233); Cry1Ga2 (№ доступа CAA70506); Cry1Gb1 (№ доступа AAD10291); Cry1Gb2 (№ доступа AAO13756); Cry1Gc1 (№ доступа AAQ52381); Cry1Ha1 (№ доступа CAA80236); Cry1Hb1 (№ доступа AAA79694); Cry1Hb2 (№ доступа HQ439786); Cry1H-подобный (№ доступа AAF01213); Cry1Ia1 (№ доступа CAA44633); Cry1Ia2 (№ доступа AAA22354); Cry1Ia3 (№ доступа AAC36999); Cry1Ia4 (№ доступа AAB00958); Cry1Ia5 (№ доступа CAA70124); Cry1Ia6 (№ доступа AAC26910); Cry1Ia7 (№ доступа AAM73516); Cry1Ia8 (№ доступа AAK66742); Cry1Ia9 (№ доступа AAQ08616); Cry1Ia10 (№ доступа AAP86782); Cry1Ia11 (№ доступа CAC85964 ); Cry1Ia12 (№ доступа AAV53390); Cry1Ia13 (№ доступа ABF83202); Cry1Ia14 (№ доступа ACG63871); Cry1Ia15 (№ доступа FJ617445); Cry1Ia16 (№ доступа FJ617448); Cry1Ia17 (№ доступа GU989199); Cry1Ia18 (№ доступа ADK23801); Cry1Ia19 (№ доступа HQ439787); Cry1Ia20 (№ доступа JQ228426); Cry1Ia21 (№ доступа JQ228424); Cry1Ia22 (№ доступа JQ228427); Cry1Ia23 (№ доступа JQ228428); Cry1Ia24 (№ доступа JQ228429); Cry1Ia25 (№ доступа JQ228430); Cry1Ia26 (№ доступа JQ228431); Cry1Ia27 (№ доступа JQ228432); Cry1Ia28 (№ доступа JQ228433); Cry1Ia29 (№ доступа JQ228434); Cry1Ia30 (№ доступа JQ317686); Cry1Ia31 (№ доступа JX944038); Cry1Ia32 (№ доступа JX944039); Cry1Ia33 (№ доступа JX944040); Cry1Ib1 (№ доступа AAA82114); Cry1Ib2 (№ доступа ABW88019); Cry1Ib3 (№ доступа ACD75515); Cry1Ib4 (№ доступа HM051227); Cry1Ib5 (№ доступа HM070028); Cry1Ib6 (№ доступа ADK38579); Cry1Ib7 (№ доступа JN571740); Cry1Ib8 (№ доступа JN675714); Cry1Ib9 (№ доступа JN675715); Cry1Ib10 (№ доступа JN675716); Cry1Ib11 (№ доступа JQ228423); Cry1Ic1 (№ доступа AAC62933); Cry1Ic2 (№ доступа AAE71691); Cry1Id1 (№ доступа AAD44366); Cry1Id2 (№ доступа JQ228422); Cry1Ie1 (№ доступа AAG43526); Cry1Ie2 (№ доступа HM439636); Cry1Ie3 (№ доступа KC156647); Cry1Ie4 (№ доступа KC156681); Cry1If1 (№ доступа AAQ52382); Cry1Ig1 (№ доступа KC156701); Cry1I-подобный (№ доступа AAC31094); Cry1I-подобный (№ доступа ABG88859); Cry1Ja1 (№ доступа AAA22341); Cry1Ja2 (№ доступа HM070030); Cry1Ja3 (№ доступа JQ228425); Cry1Jb1 (№ доступа AAA98959); Cry1Jc1 (№ доступа AAC31092); Cry1Jc2 (№ доступа AAQ52372); Cry1Jd1 (№ доступа CAC50779); Cry1Ka1 (№ доступа AAB00376); Cry1Ka2 (№ доступа HQ439783); Cry1La1 (№ доступа AAS60191); Cry1La2 (№ доступа HM070031); Cry1Ma1 (№ доступа FJ884067); Cry1Ma2 (№ доступа KC156659); Cry1Na1 (№ доступа KC156648); Cry1Nb1 (№ доступа KC156678); Cry1-подобный (№ доступа AAC31091); Cry2Aa1 (№ доступа AAA22335); Cry2Aa2 (№ доступа AAA83516); Cry2Aa3 (№ доступа D86064); Cry2Aa4 (№ доступа AAC04867); Cry2Aa5 (№ доступа CAA10671); Cry2Aa6 (№ доступа CAA10672); Cry2Aa7 (№ доступа CAA10670); Cry2Aa8 (№ доступа AAO13734); Cry2Aa9 (№ доступа AAO13750 ); Cry2Aa10 (№ доступа AAQ04263); Cry2Aa11 (№ доступа AAQ52384); Cry2Aa12 (№ доступа ABI83671); Cry2Aa13 (№ доступа ABL01536); Cry2Aa14 (№ доступа ACF04939); Cry2Aa15 (№ доступа JN426947); Cry2Ab1 (№ доступа AAA22342); Cry2Ab2 (№ доступа CAA39075); Cry2Ab3 (№ доступа AAG36762); Cry2Ab4 (№ доступа AAO13296 ); Cry2Ab5 (№ доступа AAQ04609); Cry2Ab6 (№ доступа AAP59457); Cry2Ab7 (№ доступа AAZ66347); Cry2Ab8 (№ доступа ABC95996); Cry2Ab9 (№ доступа ABC74968); Cry2Ab10 (№ доступа EF157306); Cry2Ab11 (№ доступа CAM84575); Cry2Ab12 (№ доступа ABM21764); Cry2Ab13 (№ доступа ACG76120); Cry2Ab14 (№ доступа ACG76121); Cry2Ab15 (№ доступа HM037126); Cry2Ab16 (№ доступа GQ866914); Cry2Ab17 (№ доступа HQ439789); Cry2Ab18 (№ доступа JN135255); Cry2Ab19 (№ доступа JN135256); Cry2Ab20 (№ доступа JN135257); Cry2Ab21 (№ доступа JN135258); Cry2Ab22 (№ доступа JN135259); Cry2Ab23 (№ доступа JN135260); Cry2Ab24 (№ доступа JN135261); Cry2Ab25 (№ доступа JN415485); Cry2Ab26 (№ доступа JN426946); Cry2Ab27 (№ доступа JN415764); Cry2Ab28 (№ доступа JN651494); Cry2Ac1 (№ доступа CAA40536); Cry2Ac2 (№ доступа AAG35410); Cry2Ac3 (№ доступа AAQ52385); Cry2Ac4 (№ доступа ABC95997); Cry2Ac5 (№ доступа ABC74969); Cry2Ac6 (№ доступа ABC74793); Cry2Ac7 (№ доступа CAL18690); Cry2Ac8 (№ доступа CAM09325); Cry2Ac9 (№ доступа CAM09326); Cry2Ac10 (№ доступа ABN15104); Cry2Ac11 (№ доступа CAM83895); Cry2Ac12 (№ доступа CAM83896); Cry2Ad1 (№ доступа AAF09583); Cry2Ad2 (№ доступа ABC86927); Cry2Ad3 (№ доступа CAK29504); Cry2Ad4 (№ доступа CAM32331); Cry2Ad5 (№ доступа CAO78739 ); Cry2Ae1 (№ доступа AAQ52362); Cry2Af1 (№ доступа ABO30519); Cry2Af2 (№ доступа GQ866915); Cry2Ag1 (№ доступа ACH91610); Cry2Ah1 (№ доступа EU939453); Cry2Ah2 (№ доступа ACL80665); Cry2Ah3 (№ доступа GU073380); Cry2Ah4 (№ доступа KC156702); Cry2Ai1 (№ доступа FJ788388); Cry2Aj (№ доступа ); Cry2Ak1 (№ доступа KC156660); Cry2Ba1 (№ доступа KC156658); Cry3Aa1 (№ доступа AAA22336); Cry3Aa2 (№ доступа AAA22541); Cry3Aa3 (№ доступа CAA68482); Cry3Aa4 (№ доступа AAA22542); Cry3Aa5 (№ доступа AAA50255); Cry3Aa6 (№ доступа AAC43266); Cry3Aa7 (№ доступа CAB41411); Cry3Aa8 (№ доступа AAS79487); Cry3Aa9 (№ доступа AAW05659); Cry3Aa10 (№ доступа AAU29411); Cry3Aa11 (№ доступа AAW82872); Cry3Aa12 (№ доступа ABY49136 ); Cry3Ba1 (№ доступа CAA34983); Cry3Ba2 (№ доступа CAA00645); Cry3Ba3 (№ доступа JQ397327); Cry3Bb1 (№ доступа AAA22334); Cry3Bb2 (№ доступа AAA74198); Cry3Bb3 (№ доступа I15475); Cry3Ca1 (№ доступа CAA42469); Cry4Aa1 (№ доступа CAA68485); Cry4Aa2 (№ доступа BAA00179); Cry4Aa3 (№ доступа CAD30148); Cry4Aa4 (№ доступа AFB18317); Cry4A-подобный (№ доступа AAY96321); Cry4Ba1 (№ доступа CAA30312); Cry4Ba2 (№ доступа CAA30114); Cry4Ba3 (№ доступа AAA22337); Cry4Ba4 (№ доступа BAA00178); Cry4Ba5 (№ доступа CAD30095); Cry4Ba-подобный (№ доступа ABC47686); Cry4Ca1 (№ доступа EU646202); Cry4Cb1 (№ доступа FJ403208); Cry4Cb2 (№ доступа FJ597622); Cry4Cc1 (№ доступа FJ403207); Cry5Aa1 (№ доступа AAA67694); Cry5Ab1 (№ доступа AAA67693); Cry5Ac1 (№ доступа I34543); Cry5Ad1 (№ доступа ABQ82087); Cry5Ba1 (№ доступа AAA68598); Cry5Ba2 (№ доступа ABW88931); Cry5Ba3 (№ доступа AFJ04417); Cry5Ca1 (№ доступа HM461869); Cry5Ca2 (№ доступа ZP_04123426); Cry5Da1 (№ доступа HM461870); Cry5Da2 (№ доступа ZP_04123980); Cry5Ea1 (№ доступа HM485580); Cry5Ea2 (№ доступа ZP_04124038); Cry6Aa1 (№ доступа AAA22357); Cry6Aa2 (№ доступа AAM46849); Cry6Aa3 (№ доступа ABH03377); Cry6Ba1 (№ доступа AAA22358); Cry7Aa1 (№ доступа AAA22351); Cry7Ab1 (№ доступа AAA21120); Cry7Ab2 (№ доступа AAA21121); Cry7Ab3 (№ доступа ABX24522); Cry7Ab4 (№ доступа EU380678); Cry7Ab5 (№ доступа ABX79555); Cry7Ab6 (№ доступа ACI44005); Cry7Ab7 (№ доступа ADB89216); Cry7Ab8 (№ доступа GU145299); Cry7Ab9 (№ доступа ADD92572); Cry7Ba1 (№ доступа ABB70817); Cry7Bb1 (№ доступа KC156653); Cry7Ca1 (№ доступа ABR67863); Cry7Cb1 (№ доступа KC156698); Cry7Da1 (№ доступа ACQ99547); Cry7Da2 (№ доступа HM572236); Cry7Da3 (№ доступа KC156679); Cry7Ea1 (№ доступа HM035086); Cry7Ea2 (№ доступа HM132124); Cry7Ea3 (№ доступа EEM19403); Cry7Fa1 (№ доступа HM035088); Cry7Fa2 (№ доступа EEM19090); Cry7Fb1 (№ доступа HM572235); Cry7Fb2 (№ доступа KC156682); Cry7Ga1 (№ доступа HM572237); Cry7Ga2 (№ доступа KC156669); Cry7Gb1 (№ доступа KC156650); Cry7Gc1 (№ доступа KC156654); Cry7Gd1 (№ доступа KC156697); Cry7Ha1 (№ доступа KC156651); Cry7Ia1 (№ доступа KC156665); Cry7Ja1 (№ доступа KC156671); Cry7Ka1 (№ доступа KC156680); Cry7Kb1 (№ доступа BAM99306); Cry7La1 (№ доступа BAM99307); Cry8Aa1 (№ доступа AAA21117); Cry8Ab1 (№ доступа EU044830); Cry8Ac1 (№ доступа KC156662); Cry8Ad1 (№ доступа KC156684); Cry8Ba1 (№ доступа AAA21118); Cry8Bb1 (№ доступа CAD57542); Cry8Bc1 (№ доступа CAD57543); Cry8Ca1 (№ доступа AAA21119); Cry8Ca2 (№ доступа AAR98783); Cry8Ca3 (№ доступа EU625349); Cry8Ca4 (№ доступа ADB54826); Cry8Da1 (№ доступа BAC07226); Cry8Da2 (№ доступа BD133574); Cry8Da3 (№ доступа BD133575); Cry8Db1 (№ доступа BAF93483); Cry8Ea1 (№ доступа AAQ73470); Cry8Ea2 (№ доступа EU047597); Cry8Ea3 (№ доступа KC855216); Cry8Fa1 (№ доступа AAT48690); Cry8Fa2 (№ доступа HQ174208); Cry8Fa3 (№ доступа AFH78109); Cry8Ga1 (№ доступа AAT46073); Cry8Ga2 (№ доступа ABC42043); Cry8Ga3 (№ доступа FJ198072); Cry8Ha1 (№ доступа AAW81032); Cry8Ia1 (№ доступа EU381044); Cry8Ia2 (№ доступа GU073381); Cry8Ia3 (№ доступа HM044664); Cry8Ia4 (№ доступа KC156674); Cry8Ib1 (№ доступа GU325772); Cry8Ib2 (№ доступа KC156677); Cry8Ja1 (№ доступа EU625348); Cry8Ka1 (№ доступа FJ422558); Cry8Ka2 (№ доступа ACN87262); Cry8Kb1 (№ доступа HM123758); Cry8Kb2 (№ доступа KC156675); Cry8La1 (№ доступа GU325771); Cry8Ma1 (№ доступа HM044665); Cry8Ma2 (№ доступа EEM86551); Cry8Ma3 (№ доступа HM210574); Cry8Na1 (№ доступа HM640939); Cry8Pa1 (№ доступа HQ388415); Cry8Qa1 (№ доступа HQ441166); Cry8Qa2 (№ доступа KC152468); Cry8Ra1 (№ доступа AFP87548); Cry8Sa1 (№ доступа JQ740599); Cry8Ta1 (№ доступа KC156673); Cry8-подобный (№ доступа FJ770571); Cry8-подобный (№ доступа ABS53003); Cry9Aa1 (№ доступа CAA41122); Cry9Aa2 (№ доступа CAA41425); Cry9Aa3 (№ доступа GQ249293); Cry9Aa4 (№ доступа GQ249294); Cry9Aa5 (№ доступа JX174110); Cry9Aa like (№ доступа AAQ52376); Cry9Ba1 (№ доступа CAA52927); Cry9Ba2 (№ доступа GU299522); Cry9Bb1 (№ доступа AAV28716); Cry9Ca1 (№ доступа CAA85764); Cry9Ca2 (№ доступа AAQ52375); Cry9Da1 (№ доступа BAA19948); Cry9Da2 (№ доступа AAB97923); Cry9Da3 (№ доступа GQ249293); Cry9Da4 (№ доступа GQ249297); Cry9Db1 (№ доступа AAX78439); Cry9Dc1 (№ доступа KC156683); Cry9Ea1 (№ доступа BAA34908); Cry9Ea2 (№ доступа AAO12908); Cry9Ea3 (№ доступа ABM21765); Cry9Ea4 (№ доступа ACE88267); Cry9Ea5 (№ доступа ACF04743); Cry9Ea6 (№ доступа ACG63872 ); Cry9Ea7 (№ доступа FJ380927); Cry9Ea8 (№ доступа GQ249292); Cry9Ea9 (№ доступа JN651495); Cry9Eb1 (№ доступа CAC50780); Cry9Eb2 (№ доступа GQ249298); Cry9Eb3 (№ доступа KC156646); Cry9Ec1 (№ доступа AAC63366); Cry9Ed1 (№ доступа AAX78440); Cry9Ee1 (№ доступа GQ249296); Cry9Ee2 (№ доступа KC156664); Cry9Fa1 (№ доступа KC156692); Cry9Ga1 (№ доступа KC156699); Cry9-подобный (№ доступа AAC63366); Cry10Aa1 (№ доступа AAA22614); Cry10Aa2 (№ доступа E00614); Cry10Aa3 (№ доступа CAD30098); Cry10Aa4 (№ доступа AFB18318); Cry10A-подобный (№ доступа DQ167578); Cry11Aa1 (№ доступа AAA22352); Cry11Aa2 (№ доступа AAA22611); Cry11Aa3 (№ доступа CAD30081); Cry11Aa4 (№ доступа AFB18319); Cry11Aa-подобный (№ доступа DQ166531); Cry11Ba1 (№ доступа CAA60504); Cry11Bb1 (№ доступа AAC97162); Cry11Bb2 (№ доступа HM068615); Cry12Aa1 (№ доступа AAA22355); Cry13Aa1 (№ доступа AAA22356); Cry14Aa1 (№ доступа AAA21516); Cry14Ab1 (№ доступа KC156652); Cry15Aa1 (№ доступа AAA22333); Cry16Aa1 (№ доступа CAA63860); Cry17Aa1 (№ доступа CAA67841); Cry18Aa1 (№ доступа CAA67506); Cry18Ba1 (№ доступа AAF89667); Cry18Ca1 (№ доступа AAF89668); Cry19Aa1 (№ доступа CAA68875); Cry19Ba1 (№ доступа BAA32397); Cry19Ca1 (№ доступа AFM37572); Cry20Aa1 (№ доступа AAB93476); Cry20Ba1 (№ доступа ACS93601); Cry20Ba2 (№ доступа KC156694); Cry20-подобный (№ доступа GQ144333); Cry21Aa1 (№ доступа I32932); Cry21Aa2 (№ доступа I66477); Cry21Ba1 (№ доступа BAC06484); Cry21Ca1 (№ доступа JF521577); Cry21Ca2 (№ доступа KC156687); Cry21Da1 (№ доступа JF521578); Cry22Aa1 (№ доступа I34547); Cry22Aa2 (№ доступа CAD43579); Cry22Aa3 (№ доступа ACD93211); Cry22Ab1 (№ доступа AAK50456); Cry22Ab2 (№ доступа CAD43577); Cry22Ba1 (№ доступа CAD43578); Cry22Bb1 (№ доступа KC156672); Cry23Aa1 (№ доступа AAF76375); Cry24Aa1 (№ доступа AAC61891); Cry24Ba1 (№ доступа BAD32657); Cry24Ca1 (№ доступа CAJ43600); Cry25Aa1 (№ доступа AAC61892); Cry26Aa1 (№ доступа AAD25075); Cry27Aa1 (№ доступа BAA82796); Cry28Aa1 (№ доступа AAD24189); Cry28Aa2 (№ доступа AAG00235); Cry29Aa1 (№ доступа CAC80985); Cry30Aa1 (№ доступа CAC80986); Cry30Ba1 (№ доступа BAD00052); Cry30Ca1 (№ доступа BAD67157); Cry30Ca2 (№ доступа ACU24781); Cry30Da1 (№ доступа EF095955); Cry30Db1 (№ доступа BAE80088); Cry30Ea1 (№ доступа ACC95445); Cry30Ea2 (№ доступа FJ499389); Cry30Fa1 (№ доступа ACI22625 ); Cry30Ga1 (№ доступа ACG60020); Cry30Ga2 (№ доступа HQ638217); Cry31Aa1 (№ доступа BAB11757); Cry31Aa2 (№ доступа AAL87458); Cry31Aa3 (№ доступа BAE79808); Cry31Aa4 (№ доступа BAF32571); Cry31Aa5 (№ доступа BAF32572); Cry31Aa6 (№ доступа BAI44026); Cry31Ab1 (№ доступа BAE79809); Cry31Ab2 (№ доступа BAF32570); Cry31Ac1 (№ доступа BAF34368); Cry31Ac2 (№ доступа AB731600); Cry31Ad1 (№ доступа BAI44022); Cry32Aa1 (№ доступа AAG36711); Cry32Aa2 (№ доступа GU063849); Cry32Ab1 (№ доступа GU063850); Cry32Ba1 (№ доступа BAB78601); Cry32Ca1 (№ доступа BAB78602); Cry32Cb1 (№ доступа KC156708); Cry32Da1 (№ доступа BAB78603); Cry32Ea1 (№ доступа GU324274); Cry32Ea2 (№ доступа KC156686); Cry32Eb1 (№ доступа KC156663); Cry32Fa1 (№ доступа KC156656); Cry32Ga1 (№ доступа KC156657); Cry32Ha1 (№ доступа KC156661); Cry32Hb1 (№ доступа KC156666); Cry32Ia1 (№ доступа KC156667); Cry32Ja1 (№ доступа KC156685); Cry32Ka1 (№ доступа KC156688); Cry32La1 (№ доступа KC156689); Cry32Ma1 (№ доступа KC156690); Cry32Mb1 (№ доступа KC156704); Cry32Na1 (№ доступа KC156691); Cry32Oa1 (№ доступа KC156703); Cry32Pa1 (№ доступа KC156705); Cry32Qa1 (№ доступа KC156706); Cry32Ra1 (№ доступа KC156707); Cry32Sa1 (№ доступа KC156709); Cry32Ta1 (№ доступа KC156710); Cry32Ua1 (№ доступа KC156655); Cry33Aa1 (№ доступа AAL26871); Cry34Aa1 (№ доступа AAG50341); Cry34Aa2 (№ доступа AAK64560); Cry34Aa3 (№ доступа AAT29032); Cry34Aa4 (№ доступа AAT29030); Cry34Ab1 (№ доступа AAG41671); Cry34Ac1 (№ доступа AAG50118); Cry34Ac2 (№ доступа AAK64562); Cry34Ac3 (№ доступа AAT29029); Cry34Ba1 (№ доступа AAK64565); Cry34Ba2 (№ доступа AAT29033); Cry34Ba3 (№ доступа AAT29031); Cry35Aa1 (№ доступа AAG50342); Cry35Aa2 (№ доступа AAK64561); Cry35Aa3 (№ доступа AAT29028); Cry35Aa4 (№ доступа AAT29025); Cry35Ab1 (№ доступа AAG41672); Cry35Ab2 (№ доступа AAK64563); Cry35Ab3 (№ доступа AY536891); Cry35Ac1 (№ доступа AAG50117); Cry35Ba1 (№ доступа AAK64566); Cry35Ba2 (№ доступа AAT29027); Cry35Ba3 (№ доступа AAT29026); Cry36Aa1 (№ доступа AAK64558); Cry37Aa1 (№ доступа AAF76376 ); Cry38Aa1 (№ доступа AAK64559); Cry39Aa1 (№ доступа BAB72016); Cry40Aa1 (№ доступа BAB72018); Cry40Ba1 (№ доступа BAC77648); Cry40Ca1 (№ доступа EU381045); Cry40Da1 (№ доступа ACF15199); Cry41Aa1 (№ доступа BAD35157); Cry41Ab1 (№ доступа BAD35163); Cry41Ba1 (№ доступа HM461871); Cry41Ba2 (№ доступа ZP_04099652); Cry42Aa1 (№ доступа BAD35166); Cry43Aa1 (№ доступа BAD15301); Cry43Aa2 (№ доступа BAD95474 ); Cry43Ba1 (№ доступа BAD15303); Cry43Ca1 (№ доступа KC156676); Cry43Cb1 (№ доступа KC156695); Cry43Cc1 (№ доступа KC156696); Cry43-подобный (№ доступа BAD15305); Cry44Aa (№ доступа BAD08532); Cry45Aa (№ доступа BAD22577); Cry46Aa (№ доступа BAC79010); Cry46Aa2 (№ доступа BAG68906); Cry46Ab (№ доступа BAD35170); Cry47Aa (№ доступа AAY24695); Cry48Aa (№ доступа CAJ18351); Cry48Aa2 (№ доступа CAJ86545); Cry48Aa3 (№ доступа CAJ86546 ); Cry48Ab (№ доступа CAJ86548); Cry48Ab2 (№ доступа CAJ86549); Cry49Aa (№ доступа CAH56541); Cry49Aa2 (№ доступа CAJ86541); Cry49Aa3 (№ доступа CAJ86543); Cry49Aa4 (№ доступа CAJ86544); Cry49Ab1 (№ доступа CAJ86542); Cry50Aa1 (№ доступа BAE86999); Cry50Ba1 (№ доступа GU446675); Cry50Ba2 (№ доступа GU446676); Cry51Aa1 (№ доступа ABI14444); Cry51Aa2 (№ доступа GU570697); Cry52Aa1 (№ доступа EF613489); Cry52Ba1 (№ доступа FJ361760); Cry53Aa1 (№ доступа EF633476); Cry53Ab1 (№ доступа FJ361759); Cry54Aa1 (№ доступа ACA52194); Cry54Aa2 (№ доступа GQ140349); Cry54Ba1 (№ доступа GU446677); Cry55Aa1 (№ доступа ABW88932); Cry54Ab1 (№ доступа JQ916908); Cry55Aa2 (№ доступа AAE33526); Cry56Aa1 (№ доступа ACU57499); Cry56Aa2 (№ доступа GQ483512); Cry56Aa3 (№ доступа JX025567); Cry57Aa1 (№ доступа ANC87261); Cry58Aa1 (№ доступа ANC87260); Cry59Ba1 (№ доступа JN790647); Cry59Aa1 (№ доступа ACR43758); Cry60Aa1 (№ доступа ACU24782); Cry60Aa2 (№ доступа EAO57254); Cry60Aa3 (№ доступа EEM99278); Cry60Ba1 (№ доступа GU810818); Cry60Ba2 (№ доступа EAO57253); Cry60Ba3 (№ доступа EEM99279); Cry61Aa1 (№ доступа HM035087); Cry61Aa2 (№ доступа HM132125); Cry61Aa3 (№ доступа EEM19308); Cry62Aa1 (№ доступа HM054509); Cry63Aa1 (№ доступа BAI44028); Cry64Aa1 (№ доступа BAJ05397); Cry65Aa1 (№ доступа HM461868); Cry65Aa2 (№ доступа ZP_04123838); Cry66Aa1 (№ доступа HM485581); Cry66Aa2 (№ доступа ZP_04099945); Cry67Aa1 (№ доступа HM485582); Cry67Aa2 (№ доступа ZP_04148882); Cry68Aa1 (№ доступа HQ113114); Cry69Aa1 (№ доступа HQ401006); Cry69Aa2 (№ доступа JQ821388); Cry69Ab1 (№ доступа JN209957); Cry70Aa1 (№ доступа JN646781); Cry70Ba1 (№ доступа ADO51070); Cry70Bb1 (№ доступа EEL67276); Cry71Aa1 (№ доступа JX025568); Cry72Aa1 (№ доступа JX025569).

Примеры δ-эндотоксинов также включают без ограничения белки Cry1A из патентов США №№ 5880275 и 7858849; токсин DIG-3 или DIG-11 (варианты белков cry с N-терминальной делецией α-спирали 1 и/или α-спирали 2, такие как Cry1A) из патентов США №№ 8304604 и 8304605, Cry1B из заявки на выдачу патента США с серийным номером 10/525318; Cry1C из патента США № 6033874; Cry1F из патентов США №№ 5188960, 6218188; химеры Cry1A/F из патентов США №№ 7070982; 6962705 и 6713063; белок Cry2, такой как белок Cry2Ab из патента США № 7064249); белок Cry3A, в том числе без ограничения разработанный гибридный инсектицидный белок (eHIP), созданный путем слияния уникальных комбинаций вариабельных участков и консервативных блоков по меньшей мере двух различных белков Cry (публикация заявки на выдачу патента США №2010/0017914); белок Cry4; белок Cry5; белок Cry6; белки Cry8 из патентов США №№ 7329736, 7449552, 7803943, 7476781, 7105332, 7378499 и 7462760; белок Cry9, такой как представители семейств Cry9A, Cry9B, Cry9C, Cry9D, Cry9E и Cry9F; белок Cry15 из Naimov, et al., (2008) Applied and Environmental Microbiology 74:7145-7151; белок Cry22, белок Cry34Ab1 из патентов США №№ 6127180, 6624145 и 6340593; белки CryET33 и CryET34 из патентов США №№ 6248535, 6326351, 6399330, 6949626, 7385107 и 7504229; гомологи CryET33 и CryET34 из публикации заявки на выдачу патента США №№ 2006/0191034, 2012/0278954 и публикации согласно PCT номер WO 2012/139004; белок Cry35Ab1 из патентов США №№ 6083499, 6548291 и 6340593; белок Cry46, белок Cry 51, бинарный токсин Cry; TIC901 или родственный токсин; TIC807 из US 2008/0295207; ET29, ET37, TIC809, TIC810, TIC812, TIC127, TIC128 из публикации согласно PCT US 2006/033867; TIC807 из US2040194351, токсины TIC853 из патента США № 8513494, AXMI-027, AXMI-036 и AXMI-038 из патента США № 8236757; AXMI-031, AXMI-039, AXMI-040, AXMI-049 из US7923602; AXMI-018, AXMI-020 и AXMI-021 из WO 2006/083891; AXMI-010 из WO 2005/038032; AXMI-003 из WO 2005/021585; AXMI-008 из US 2004/0250311; AXMI-006 из US 2004/0216186; AXMI-007 из US 2004/0210965; AXMI-009 из US 2004/0210964; AXMI-014 из US 2004/0197917; AXMI-004 из US 2004/0197916; AXMI-028 и AXMI-029 из WO 2006/119457; AXMI-007, AXMI-008, AXMI-0080rf2, AXMI-009, AXMI-014 и AXMI-004 из WO 2004/074462; AXMI-150 из патента США № 8084416; AXMI-205 из US20110023184; AXMI-011, AXMI-012, AXMI-013, AXMI-015, AXMI-019, AXMI-044, AXMI-037, AXMI-043, AXMI-033, AXMI-034, AXMI-022, AXMI-023, AXMI-041, AXMI-063 и AXMI-064 из US 2011/0263488; AXMI-R1 и родственные белки из US 2010/0197592; AXMI221Z, AXMI222z, AXMI223z, AXMI224z и AXMI225z из WO 2011/103248; AXMI218, AXMI219, AXMI220, AXMI226, AXMI227, AXMI228, AXMI229, AXMI230 и AXMI231 из WO11/103247; AXMI-115, AXMI-113, AXMI-005, AXMI-163 и AXMI-184 из патента США № 8334431; AXMI-001, AXMI-002, AXMI-030, AXMI-035 и AXMI-045 из US 2010/0298211; AXMI-066 и AXMI-076 из US20090144852; AXMI128, AXMI130, AXMI131, AXMI133, AXMI140, AXMI141, AXMI142, AXMI143, AXMI144, AXMI146, AXMI148, AXMI149, AXMI152, AXMI153, AXMI154, AXMI155, AXMI156, AXMI157, AXMI158, AXMI162, AXMI165, AXMI166, AXMI167, AXMI168, AXMI169, AXMI170, AXMI171, AXMI172, AXMI173, AXMI174, AXMI175, AXMI176, AXMI177, AXMI178, AXMI179, AXMI180, AXMI181, AXMI182, AXMI185, AXMI186, AXMI187, AXMI188, AXMI189 из патента США № 8318900; AXMI079, AXMI080, AXMI081, AXMI082, AXMI091, AXMI092, AXMI096, AXMI097, AXMI098, AXMI099, AXMI100, AXMI101, AXMI102, AXMI103, AXMI104, AXMI107, AXMI108, AXMI109, AXMI110, AXMI111, AXMI112, AXMI114, AXMI116, AXMI117, AXMI118, AXMI119, AXMI120, AXMI121, AXMI122, AXMI123, AXMI124, AXMI1257, AXMI1268, AXMI127, AXMI129, AXMI164, AXMI151, AXMI161, AXMI183, AXMI132, AXMI138, AXMI137 из US 2010/0005543; AXMI221 из US2014/0196175; AXMI345 из US 20140373195 и белки Cry, такие как Cry1A и Cry3A, имеющие модифицированные протеолитические сайты, из патента США № 8319019; а также белок-токсин Cry1Ac, Cry2Aa и Cry1Ca из штамма VBTS 2528 Bacillus thuringiensis из публикации заявки на выдачу патента США № 2011/0064710. Другие белки Cry хорошо известны специалисту в данной области (см. Crickmore, et al., "Bacillus thuringiensis toxin nomenclature" (2011), на сайте по адресу lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/intro.html, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). Инсектицидная активность белков Cry хорошо известна специалисту в данной области (для обзора см. van Frannkenhuyzen, (2009) J. Invert. Path. 101:1-16). Применение белков Cry в качестве признаков трансгенного растения хорошо известно специалисту в данной области, и трансгенные растения с Cry, в том числе без ограничения с Cry1Ac, Cry1Ac+Cry2Ab, Cry1Ab, Cry1A.105, Cry1F, Cry1Fa2, Cry1F+Cry1Ac, Cry2Ab, Cry3A, mCry3A, Cry3Bb1, Cry34Ab1, Cry35Ab1, Vip3A, mCry3A, Cry9c и CBI-Bt были разрешены контролирующими органами (см. Sanahuja, (2011) Plant Biotech Journal 9:283-300 и CERA (2010), базу данных ГМ растений центра по оценке риска для окружающей среды (CERA), Исследовательский фонд ILSI, город Вашингтон, на сайте по адресу cera-gmc.org/index.php?action=gm_crop_database, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). В растениях также может экспрессироваться два или более пестицидных белков, хорошо известных специалисту в данной области, таких как Vip3Ab и Cry1Fa (US2012/0317682), Cry1BE и Cry1F (US2012/0311746), Cry1CA и Cry1AB (US2012/0311745), Cry1F и CryCa (US2012/0317681), Cry1DA и Cry1BE (US2012/0331590), Cry1DA и Cry1Fa (US2012/0331589), Cry1AB и Cry1BE (US2012/0324606), а также Cry1Fa и Cry2Aa, Cry1I или Cry1E (US2012/0324605). Пестицидные белки также включают инсектицидные липазы, в том числе гидролазы омыляемых липидов из патента США № 7491869 и холестерин-оксидазы, например из Streptomyces (Purcell et al. (1993) Biochem Biophys Res Commun 15:1406-1413). Пестицидные белки также включают токсины VIP (вегетативные инсектицидные белки) из патентов США №№ 5877012, 6107279, 6137033, 7244820, 7615686 и 8237020 и т. п. Другие белки VIP хорошо известны специалисту в данной области (см. сайт по адресу lifesci.sussex.ac.uk/home/Neil_Crickmore/Bt/vip.html, доступ к которому можно получить через всемирную сеть Интернет с использованием префикса "www"). Пестицидные белки также включают белки токсинового комплекса (TC), которые можно получить из организмов, таких как Xenorhabdus, Photorhabdus и Paenibacillus (см. патенты США №№ 7491698 и 8084418). Некоторые TC-белки обладают "самостоятельной" инсектицидной активностью, а другие TC-белки повышают активность самостоятельных токсинов, вырабатываемых тем же данным организмом. Токсичность "самостоятельного" TC-белка (например, из Photorhabdus, Xenorhabdus или Paenibacillus) может повышаться с помощью одного или нескольких TC-белков-"усилителей", полученных из организма-источника из другого рода. Существуют три основных типа TC-белков. Как изложено в данном документе, белки класса A ("белок A") представляют собой самостоятельные токсины. Белки класса B ("белок B") и белки класса C ("белок C") повышают токсичность белков класса A. Примерами белков класса A являются TcbA, TcdA, XptA1 и XptA2. Примерами белков класса B являются TcaC, TcdB, XptB1Xb и XptC1Wi. Примерами белков класса C являются TccC, XptC1Xb и XptB1Wi. Пестицидные белки также включают белки яда пауков, змей и скорпионов. Примеры пептидов яда пауков включают без ограничения пептиды ликотоксин-1 и его мутантные формы (патент США № 8334366).

(C) Полинуклеотид, кодирующий специфичный в отношении насекомых гормон или феромон, такой как экдистероид и ювенильный гормон, его вариант, миметик на его основе или его антагонист или агонист. См., например, раскрытие Hammock, et al., (1990) Nature 344:458 бакуловирусной экспрессии клонированной эстеразы ювенильного гормона, инактиватора ювенильного гормона.

(D) Полинуклеотид, кодирующий специфичный в отношении насекомых пептид, который при экспрессии нарушает физиологию насекомого, на которого оказывают воздействие. Например, см. раскрытия Regan, (1994) J. Biol. Chem. 269:9 (экспрессионное клонирование приводит к ДНК, кодирующей рецептор диуретического гормона насекомых); Pratt, et al., (1989) Biochem. Biophys. Res. Comm. 163:1243 (аллостатин, обнаруженный у Diploptera puntata); Chattopadhyay, et al., (2004) Critical Reviews in Microbiology 30(1):33-54; Zjawiony, (2004) J Nat Prod 67(2):300-310; Carlini and Grossi-de-Sa, (2002) Toxicon 40(11):1515-1539; Ussuf, et al., (2001) Curr Sci. 80(7):847-853 и Vasconcelos and Oliveira, (2004) Toxicon 44(4):385-403. См. также патент США № 5266317, Tomalski, et al., в котором раскрыты гены, кодирующие специфичные для насекомых токсины.

(E) Полинуклеотид, кодирующий фермент, ответственный за гипернакопление монотерпена, сесквитерпена, стероида, гидроксамовой кислоты, производного фенилпропаноида или другой небелковой молекулы с инсектицидной активностью, в том числе без ограничения с 7-эпизингиберенсинтазой (публикация патента США № 20140157456).

(F) Полинуклеотид, кодирующий фермент, вовлеченный в модификацию, в том числе посттрансляционную модификацию, биологически активной молекулы; например, гликолитический фермент, протеолитический фермент, липолитический фермент, нуклеаза, циклаза, трансаминаза, эстераза, гидролаза, фосфатаза, киназа, фосфорилаза, полимераза, эластаза, хитиназа и глюканаза, либо натуральные, либо синтетические. См. заявку согласно PCT WO 1993/02197 на имя Scott, et al., в которой раскрыта нуклеотидная последовательность гена каллазы. Молекулы ДНК, которые содержат последовательности, кодирующие хитиназу, можно получить, например, из ATCC^® под номерами доступа 39637 и 67152. См. также Kramer, et al., (1993) Insect Biochem. Molec. Biol. 23:691, в которой содержатся сведения о нуклеотидной последовательности кДНК, кодирующей хитиназу табачного бражника, и Kawalleck, et al., (1993) Plant Molec. Biol. 21:673, в которой предложена нуклеотидная последовательность гена полиубиквитина ubi4-2 петрушки, и патенты США №№ 6563020; 7145060 и 7087810.

(G) Полинуклеотид, кодирующий молекулу, которая стимулирует сигнальную трансдукцию. Например, см. раскрытие в Botella, et al., (1994) Plant Molec. Biol. 24:757, каcающееся нуклеотидных последовательностей клонов кДНК кальмодулина из фасоли золотистой, и Griess, et al., (1994) Plant Physiol. 104:1467, в которой представлена нуклеотидная последовательность клона кДНК кальмодулина маиса.

(H) Полинуклеотид, кодирующий пептид с гидрофобным моментом. См. заявку согласно PCT WO 1995/16776 и патент США № 5580852, раскрывающие пептидные производные тахиплезина, которые ингибируют грибковые патогены растений, и заявку согласно PCT WO 1995/18855, а также патент США № 5607914 (в котором раскрыты синтетические противомикробные пептиды, которые придают устойчивость к заболеваниям).

(I) Полинуклеотид, кодирующий мембранную пермеазу, каналообразователь или блокатор каналов. Например, см. раскрытие в Jaynes, et al., (1993) Plant Sci. 89:43 гетерологичной экспрессии аналога цекропин-бета литического пептида для придания трансгенным растениям табака устойчивости к Pseudomonas solanacearum.

(J) Ген, кодирующий вирусный инвазивный белок или сложный токсин, полученный из него. Например, накопление белков вирусной оболочки в трансформированных растительных клетках придает устойчивость к вирусной инфекции и/или развитию заболевания, вызванного вирусом, из которого получен ген белка оболочки, а также родственными вирусами. См. Beachy, et al., (1990) Ann. Rev. Phytopathol. 28:451. Устойчивость, опосредованную белком оболочки, придавали трансформированным растениям в отношении вируса мозаики люцерны, вируса мозаики огурца, вируса полосатости табака, вируса X картофеля, вируса Y картофеля, вируса гравировки табака, вируса погремковости табака и вируса табачной мозаики. Там же.

(K) Ген, кодирующий антитело, специфичное в отношении насекомого, или полученный из него иммунотоксин. Таким образом, антитело, нацеленное на критическую метаболическую функцию в кишке насекомого, будет инактивировать фермент, на который оказывается воздействие, с уничтожением насекомого. См. также Taylor, et al., Abstract #497, SEVENTH INT′L SYMPOSIUM ON MOLECULAR PLANT-MICROBE INTERACTIONS (Эдинбург, Шотландия, 1994) (ферментативная инактивация в трансгенном табаке посредством выработки одноцепочечных фрагментов антител).

(L) Ген, кодирующий антитело, специфичное в отношении вируса. См., например, Tavladoraki, et al., (1993) Nature 366:469, где показано, что трансгенные растения, экспрессирующие гены рекомбинантного антитела, защищены от поражения вирусом.

(M) Полинуклеотид, кодирующий белок, останавливающий развитие, вырабатываемый в природе патогеном или паразитом. Таким образом, грибные эндо-альфа-1,4-D-полигалактуроназы облегчают грибную колонизацию и высвобождение питательных веществ для растений путем солюбилизации гомо-альфа-1,4-D-галактуроназы клеточной стенки растения. См. Lamb, et al., (1992) Bio/Technology 10:1436. Клонирование и определение характеристик гена, который кодирует белок, ингибирующий эндополигалактуроназу бобов, описан в Toubart, et al., (1992) Plant J. 2:367.

(N) Полинуклеотид, кодирующий белок, останавливающий развитие, вырабатываемый в природе растением. Например, Logemann, et al., (1992) Bio/Technology 10:305 показали, что трансгенные растения, экспрессирующие ген ячменя, инактивирующий рибосомы, обладали повышенной устойчивостью к грибковым заболеваниям.

(O) Гены, вовлеченные в реакцию системной приобретенной устойчивости (SAR) и/или гены, связанные с патогенезом. Briggs, (1995) Current Biology 5(2), Pieterse and Van Loon, (2004) Curr. Opin. Plant Bio. 7(4):456-64, и Somssich, (2003) Cell 113(7):815-6.

(P) Противогрибковые гены (Cornelissen and Melchers, (1993) Pl. Physiol. 101:709-712, и Parijs, et al., (1991) Planta 183:258-264, и Bushnell, et al., (1998) Can. J. of Plant Path. 20(2):137-149. Также см. публикации заявок на выдачу патентов США с серийными №№ 09/950933; 11/619645; 11/657710; 11/748994; 11/774121 и патенты США №№ 6891085 и 7306946. Киназы, подобные рецептору LysM, для распознавания фрагментов хитина, как первая стадия в защитной реакции растения в отношении грибков-патогенов (US 2012/0110696).

(Q) Гены системы детоксикации, такие как кодирующие фумонизин, беауверицин, монилиформин и зеараленон и их структурно родственные производные. Например, см. патенты США №№ 5716820; 5792931; 5798255; 5846812; 6083736; 6538177; 6388171 и 6812380.

(R) Полинуклеотид, кодирующий цистатин и ингибиторы цистеинпротеиназы. См. патент США № 7205453.

(S) Гены дефензинов. См. WO 2003/000863 и патенты США №№ 6911577; 6855865; 6777592 и 7238781.

(T) Гены, обеспечивающие устойчивость к нематодам. См., например, заявку согласно PCT WO 1996/30517; заявку согласно PCT WO 1993/19181, WO 2003/033651 и Urwin, et al., (1998) Planta 204:472-479, Williamson, (1999) Curr Opin Plant Bio. 2(4):327-31; патенты США №№ 6284948 и 7301069 и гены miR164 (WO 2012/058266).

(U) Гены, которые обеспечивают устойчивость к корневой гнили, вызываемой Phytophthora, такие как Rps 1, Rps 1-a, Rps 1-b, Rps 1-c, Rps 1-d, Rps 1-e, Rps 1-k, Rps 2, Rps 3-a, Rps 3-b, Rps 3-c, Rps 4, Rps 5, Rps 6, Rps 7 и другие гены Rps. См., например, Shoemaker, et al., Phytophthora Root Rot Resistance Gene Mapping in Soybean, Plant Genome IV Conference, San Diego, Calif. (1995).

(V) Гены, которые обеспечивают устойчивость к бурой стеблевой гнили, такие как описаны в патенте США № 5689035, включенном с помощью ссылки с этой целью.

(W) Гены, которые обеспечивают устойчивость к Colletotrichum, такие как описанные в публикации заявки на выдачу патента США US 2009/0035765, включенной с помощью ссылки с этой целью. Они включают локус Rcg, который можно использовать как конверсию одного локуса.

2. Трансгены, которые обеспечивают устойчивость к гербициду, например приведенные ниже

(A) Полинуклеотид, кодирующий устойчивость к гербициду, который ингибирует конус нарастания или меристему, такому как имидазолинон или сульфонилмочевина. Иллюстративные гены в этой категории кодируют мутантный фермент ALS и AHAS, как описано, например, соответственно у Lee, et al., (1988) EMBO J. 7:1241 и Miki, et al., (1990) Theor. Appl. Genet. 80:449. См. также патенты США №№ 5605011; 5013659; 5141870; 5767361; 5731180; 5304732; 4761373; 5331107; 5928937 и 5378824; заявку на выдачу патента США с серийным № 11/683737 и публикацию международной заявки WO 1996/33270.

(B) Полинуклеотид, кодирующий белок для устойчивости к глифосату (устойчивость придают мутантные гены 5-енолприрувил-3-фосфошикиматсинтазы (EPSP) и aroA соответственно), и другим фосфоновым соединениям, таким как глуфосинат (гены фосфинотрицинацетилтрансферазы (PAT) и фосфинотрицинацетилтрансферазы (bar) Streptomyces hygroscopicus), и пиридинокси- или феноксипропионовым кислотам и циклогексонам (гены, кодирующие ингибитор ACCазы). См., например, патент США № 4940835, Shah, et al., в котором раскрыта нуклеотидная последовательность формы EPSPS, которая может придавать устойчивость к глифосату. В патенте США № 5627061, Barry, et al., также описаны гены, кодирующие ферменты EPSPS. См. также патенты США №№ 6566587; 6338961; 6248876 B1; 6040497; 5804425; 5633435; 5145783; 4971908; 5312910; 5188642; 5094945, 4940835; 5866775; 6225114 B1; 6130366; 5310667; 4535060; 4769061; 5633448; 5510471; Re. 36449; RE 37287 E и 5491288 и публикации международных заявок EP 1173580; WO 2001/66704; EP 1173581 и EP 1173582, которые включены в данный документ с помощью ссылки для данной цели. Устойчивость к глифосату также придается растениям, которые экспрессируют ген, кодирующий фермент глифосат-оксидоредуктазу, как более подробно описано в патентах США №№ 5776760 и 5463175, которые включены в данный документ для данной цели с помощью ссылки. Кроме того, устойчивость к глифосату может придаваться растениям посредством сверхэкспрессии генов, кодирующих глифосат-N-ацетилтрансферазу. См., например, патенты США №№ 7462481; 7405074 и публикацию заявки на выдачу патента США № US 2008/0234130. Молекулу ДНК, кодирующую мутантный ген aroA, можно получить под номером доступа ATCC^® 39256, а нуклеотидная последовательность мутантного гена раскрыта в патенте США № 4769061, выданном Comai. В заявке EP № 0333033, выданном Kumada, et al. и патенте США № 4975374, выданном Goodman, et al., раскрыты нуклеотидные последовательности генов глутаминсинтетазы, придающие устойчивость к гербицидам, таким как L-фосфинотрицин. Нуклеотидная последовательность гена фосфинотрицин-ацетилтрансферазы представлена в заявках EP №№ 0242246 и 0242236, Leemans, et al.; De Greef, et al., (1989) Bio/Technology 7:61, где описано получение трансгенных растений, которые экспрессируют химерные гены bar, кодирующие фосфинотрицинацетилтрансферазную активность. См. также патенты США №№ 5969213; 5489520; 5550318; 5874265; 5919675; 5561236; 5648477; 5646024; 6177616 B1 и 5879903, которые включены в данный документ для данной цели с помощью ссылки. Иллюстративные гены, придающие устойчивость к феноксипропионовым кислотам и циклогексонам, таким как сетоксидим и галоксифоп, представляют собой гены Acc1-S1, Acc1-S2 и Acc1-S3, описанные у Marshall, et al., (1992) Theor. Appl. Genet. 83:435.

(C) Полинуклеотид, кодирующий белок, обеспечивающий устойчивость к гербициду, который ингибирует фотосинтез, такому как триазин (гены psbA и gs+) и бензонитрил (ген нитрилазы). Przibilla, et al., (1991) Plant Cell 3:169 описывают трансформацию Chlamydomonas с помощью плазмид, кодирующих мутантные гены psbA. Нуклеотидные последовательности генов нитрилазы раскрыты в патенте США № 4810648, выданном Stalker, и молекулы ДНК, содержащие эти гены, доступны под номерами доступа ATCC^® 53435, 67441 и 67442. Клонирование и экспрессия ДНК, кодирующей глутатион-S-трансферазу, описаны у Hayes, et al., (1992) Biochem. J. 285:173.

(D) В ряд растений был введен полинуклеотид, кодирующий белок, обеспечивающий устойчивость к синтазе ацетогидроксикислот, которая, как было обнаружено, делает растения, которые экспрессируют данный фермент, устойчивыми к нескольким типам гербицидов (см., например, Hattori, et al., (1995) Mol Gen Genet. 246:419). Другие гены, которые придают устойчивость к гербицидам, включают в себя ген, кодирующий химерный белок цитохрома P4507A1 крысы и NADPH-цитохром-P450-оксидоредуктазы дрожжей (Shiota, et al., (1994) Plant Physiol 106:17), гены, кодирующие глутатионредуктазу и супероксиддисмутазу (Aono, et al., (1995) Plant Cell Physiol 36:1687), и гены, кодирующие различные фосфотрансферазы (Datta, et al., (1992) Plant Mol Biol 20:619).

(E) Полинуклеотид, кодирующий устойчивость к гербициду, целенаправленно воздействующему на протопорфириногеноксидазу (protox), которая необходима для выработки хлорофилла. Фермент protox служит в качестве мишени для ряда гербицидных соединений. Эти гербициды также ингибируют рост всех присутствующих различных видов растений, вызывая их полное разрушение. Разработка растений, характеризующихся измененной protox-активностью, которые устойчивы к этим гербицидам, описана в патентах США №№ 6288306 B1; 6282837 B1 и 5767373 и публикации международной заявки WO 2001/12825.

(F) Ген aad-1 (изначально из Sphingobium herbicidovorans) кодирует белок арилоксиалканоатдиоксигеназу (AAD-1). Признак обеспечивает переносимость гербицидов на основе 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и арилоксифеноксипропионата (обычно называемых "фоп"-гербициды, таких как квизалофоп). Ген aad-1, как таковой, обеспечивающий переносимость гербицида у растений, впервые был раскрыт в WO 2005/107437 (см. также US 2009/0093366). Ген aad-12, полученный от Delftia acidovorans, который кодирует белок арилоксиалканоатдиоксигеназу (AAD-12), приводящий к переносимости гербицидов на основе 2,4-дихлорфеноксиуксусной кислоты и пиридилоксиацетата путем инактивации некоторых гербицидов с арилоксиалканоатным фрагментом, в том числе фенокси-ауксина (например, 2,4-D, MCPA), а также видов пиридилокси-ауксина (например, флуроксипира, триклопира).

(G) Полинуклеотид, кодирующий устойчивую к гербициду дикамба-монооксигеназу, раскрытый в публикации заявки на выдачу патента США 2003/0135879, для придания переносимости дикамбы.

(H) Полинуклеотидная молекула, кодирующая бромоксинилнитрилазу (Bxn), раскрытая в патенте США № 4810648, для придания переносимости бромоксинила.

(I) Полинуклеотидная молекула, кодирующая фитоен (crtl), описанный у Misawa, et al., (1993) Plant J. 4:833-840 и у Misawa, et al., (1994) Plant J. 6:481-489, для переносимости норфлуразона.

3. Трансгены, которые обеспечивают измененные характеристики зерна или вносят в них вклад

Например.

(A) Измененное содержание жирных кислот, например с помощью приведенного ниже.

(1) Подавления стеароил-ACP для повышения содержания стеариновой кислоты в растении. См. Knultzon, et al., (1992) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:2624 и WO 1999/64579 (Genes to Alter Lipid Profiles in Corn).

(2) Повышения содержания олеиновой кислоты посредством модификации гена FAD-2 и/или снижения содержания линоленовой кислоты посредством модификации гена FAD-3 (см. патенты США №№ 6063947; 6323392; 6372965 и WO 1993/11245).

(3) Изменения содержания конъюгированных линоленовой или линолевой кислоты, как, например, в WO 2001/12800.

(4) Изменения LEC1, AGP, Dek1, Superal1, mi1 ps, различных генов Ipa, таких как Ipa1, Ipa3, hpt или hggt. Например, см. WO 2002/42424, WO 1998/22604, WO 2003/011015, WO 2002/057439, WO 2003/011015, патенты США №№ 6423886, 6197561, 6825397 и публикации заявок на выдачу патентов США с номерами US 2003/0079247, US 2003/0204870 и Rivera-Madrid, et al., (1995) Proc. Natl. Acad. Sci. 92:5620-5624.

(5) Генов, кодирующих дельта-8-десатуразу для получения длинноцепочечных полиненасыщенных жирных кислот (патенты США №№ 8058571 и 8338152), дельта-9 десатуразу для снижения содержания насыщенных жиров (патент США № 8063269), Δ6-десатуразу примулы для улучшения профилей омега-3-жирных кислот.

(6) Выделенных нуклеиновых кислот и белков, ассоциированных с регуляцией метаболизма липидов и сахаров, в частности белка липидного метаболизма (LMP), применяемых в способах получения трансгенных растений и модуляции уровней запасных веществ семени, в том числе липидов, жирных кислот, видов крахмала или запасных белков семени, и их применения в способах модуляции размера семени, количества семян, веса семян, длины корней и размера листьев растений (EP 2404499).

(7) Изменения экспрессии белка с высоким уровнем экспрессии, индуцируемого сахарами 2 (HSI2), в растении для повышения или снижения экспрессии HSI2 в растении. Повышение экспрессии HSI2 повышает содержание масла, тогда как понижение экспрессии HSI2 снижает восприимчивость к абсцизовой кислоте и/или повышает устойчивость к засухе (публикация заявки на выдачу патента США № 2012/0066794).

(8) Экспрессии цитохрома b5 (Cb5) отдельно или вместе с FAD2 для модуляции содержания масла в семени растения, в частности для повышения уровней омега-3-жирных кислот и улучшения соотношения омега-6- и омега-3-жирных кислот (публикация заявки на выдачу патента США № 2011/0191904).

(9) Молекул нуклеиновой кислоты, кодирующих wrinkled1-подобные полипептиды для модуляции метаболизма сахаров (патент США № 8217223).

(B) Измененное содержание фосфора, например с помощью приведенного ниже.

(1) Введения гена, кодирующего фитазу, при этом будет улучшаться распад фитата, что приводит к большему количеству свободного фосфата в трансформированном растении. Например, см. Van Hartingsveldt, et al., (1993) Gene 127:87 относительно раскрытия нуклеотидной последовательности гена фитазы Aspergillus niger.

(2) Модуляции гена, который снижает содержание фитата. У маиса это можно осуществлять, например, с помощью клонирования, а затем повторного введения ДНК, ассоциированной с одним или несколькими аллелями, такими как аллели LPA, обнаруженные у мутантов маиса, характеризующихся низкими уровнями фитиновой кислоты, как например в WO 2005/113778, и/или посредством изменения активности инозитолкиназы, как в WO 2002/059324, публикации заявки на выдачу патента США № 2003/0009011, WO 2003/027243, публикации заявки на выдачу патента США № 2003/0079247, WO 1999/05298, патенте США № 6197561, патенте США № 6291224, патенте США № 6391348, WO 2002/059324, публикации заявки на выдачу патента США № 2003/0079247, WO 1998/45448, WO 1999/55882, WO 2001/04147.

(C) Измененные углеводы, на которые воздействовали, например, путем изменения гена, кодирующего фермент, который воздействует на паттерн ветвления крахмала, или гена, изменяющего тиоредоксин, такого как NTR и/или TRX (см. патент США № 6531648, который включен для данной цели с помощью ссылки), и/или нокаута гамма-зеина или использования мутанта, такого как cs27, или TUSC27, или en27 (см. патент США № 6858778 и публикацию заявки на выдачу патента США № 2005/0160488, публикацию заявки на выдачу патента США № 2005/0204418, которые включены для данной цели с помощью ссылки). См. Shiroza, et al., (1988) J. Bacteriol. 170:810 (нуклеотидная последовательность мутантного гена фруктозилтрансферазы Streptococcus), Steinmetz, et al., (1985) Mol. Gen. Genet. 200:220 (нуклеотидная последовательность гена левансахаразы Bacillus subtilis), Pen, et al., (1992) Bio/Technology 10:292 (получение трансгенных растений, которые экспрессируют альфа-амилазу Bacillus licheniformis), Elliot, et al., (1993) Plant Molec. Biol. 21:515 (нуклеотидные последовательности генов инвертазы томата), Søgaard, et al., (1993) J. Biol. Chem. 268:22480 (сайт-направленный мутагенез гена альфа-амилазы ячменя) и Fisher, et al., (1993) Plant Physiol. 102:1045 (фермент II ветвления крахмала эндосперма маиса), WO 1999/10498 (улучшенная усвояемость и/или извлечение крахмала путем модификации UDP-D-ксилоза 4-эпимеразы, Fragile 1 и 2, Ref1, HCHL, C4H), патент США № 6232529 (способ получения семян с высоким содержанием масла путем модификации уровней крахмала (AGP)). Гены модификации жирных кислот, упомянутые в данном документе, можно применять также для воздействия на содержание и/или состав крахмала благодаря взаимосвязи путей метаболизма крахмала и масла.

(D) Измененное содержание или состав антиоксидантов, как, например, изменение токоферола или токотриенолов. Например, см. патент США № 6787683, публикацию заявки на выдачу патента США № 2004/0034886 и WO 2000/68393, предусматривающие манипуляцию с уровнями антиоксидантов, и WO 2003/082899, благодаря изменению гомогентизатгеранилгеранилтрансферазы (hggt).

(E) Измененное содержание незаменимых аминокислот в семени. Например, см. патент США № 6127600 (способ повышения накопления незаменимых аминокислот в семенах), патент США № 6080913 (бинарные способы повышения накопления незаменимых аминокислот в семенах), патент США № 5990389 (высокое содержание лизина), WO 1999/40209 (изменение аминокислотного состава семян), WO 1999/29882 (способы изменения аминокислотного состава белков), патент США № 5850016 (изменение аминокислотного состава семян), WO 1998/20133 (белки с повышенными уровнями незаменимых аминокислот), патент США № 5885802 (высокое содержание метионина), патент США № 5885801 (высокое содержание треонина), патент США № 6664445 (растительные ферменты биосинтеза аминокислот), патент США № 6459019 (повышенное содержание лизина и треонина), патент США № 6441274 (бета-субъединица растительной триптофансинтазы), патент США № 6346403 (ферменты метаболизма метионина), патент США № 5939599 (высокое содержание серы), патент США № 5912414 (повышенное содержание метионина), WO 1998/56935 (растительные ферменты биосинтеза аминокислот), WO 1998/45458 (разработанный с помощью генной инженерии белок семени, имеющий более высокую процентную долю незаменимых аминокислот), WO 1998/42831 (повышенное содержание лизина), патент США № 5633436 (повышение содержания серосодержащих аминокислот), патент США № 5559223 (синтетические запасные белки с определенной структурой, содержащие программируемые уровни незаменимых аминокислот для улучшения питательной ценности растений), WO 1996/01905 (повышенное содержание треонина), WO 1995/15392 (повышенное содержание лизина), публикацию заявки на выдачу патента США № 2003/0163838, публикацию заявки на выдачу патента США № 2003/0150014, публикацию заявки на выдачу патента США № 2004/0068767, патент США № 6803498, WO 2001/79516.

4. Гены, контролирующие мужскую стерильность

Доступно несколько способов обеспечения генетической мужской стерильности, как, например, несколько мутантных генов в отдельных положениях в пределах генома, которые придают мужскую стерильность, как раскрыто в патентах США №№ 4654465 и 4727219, Brar, et al., и хромосомные транслокации, как описано Patterson в патенте США №№ 3861709 и 3710511. В дополнение к этим способам, Albertsen, et al. в патенте США № 5432068 описывают систему ядерной мужской стерильности, которая включает: идентификацию гена, который крайне важен для мужской фертильности; сайленсинг этого нативного гена, который крайне важен для мужской фертильности; удаление нативного промотора из гена, важного для мужской фертильности, и замещение его на индуцируемый промотор; вставку этого полученного с помощью генной инженерии гена обратно в растение, и таким образом создание растения, которое характеризуется мужской стерильностью, поскольку индуцируемый промотор не "включен", в результате чего ген мужской фертильности не транскрибируется. Фертильность восстанавливают посредством индуцирования или "включения" промотора, который, в свою очередь, осуществляет транскрипцию гена, обеспечивающего мужскую фертильность.

(A) Введение гена деацетилазы под управлением промотора, специфичного в отношении тапетума, и с применением химического N-Ac-PPT (WO 2001/29237).

(B) Введение различных промоторов, специфичных в отношении тычинок (WO 1992/13956, WO 1992/13957).

(C) Введение барназы и гена барстара (Paul, et al., (1992) Plant Mol. Biol. 19:611-622).

Дополнительные примеры систем и генов ядерной мужской и женской стерильности см. также в патентах США №№ 5859341; 6297426; 5478369; 5824524; 5850014 и 6265640, все из которых тем самым включены с помощью ссылки.

5. Гены, которые создают сайт для сайт-специфичной интеграции ДНК

Подразумевается введение сайтов FRT, которые можно применять в системе FLP/FRT, и/или сайтов Lox, которые можно применять в системе Cre/Loxp. Например, см. Lyznik, et al., (2003) Plant Cell Rep 21:925-932 и WO 1999/25821, которые включены в данный документ с помощью ссылки. Другие системы, которые можно применять, включают рекомбиназу Gin из фага Mu (Maeser, et al., (1991) Vicki Chandler, The Maize Handbook ch. 118 (Springer-Verlag 1994), рекомбиназу Pin из E. coli (Enomoto, et al., 1983) и систему R/RS из плазмиды pSRi (Araki, et al., 1992).

6. Гены, которые воздействуют на устойчивость к абиотическому стрессу

В том числе без ограничений на цветение, развитие початка и семени, улучшение эффективности использования азота, измененную реактивность в отношении азота, устойчивость к засухе или ее переносимость, устойчивость к холоду или его переносимость, а также устойчивость к засолению или ее переносимость и повышенную урожайность при стрессе.

(A) Например, см. WO 2000/73475, где эффективность использования воды изменена благодаря изменению содержания малата; патенты США №№ 5892009, 5965705, 5929305, 5891859, 6417428, 6664446, 6706866, 6717034, 6801104, WO 2000/060089, WO 2001/026459, WO 2001/035725, WO 2001/034726, WO 2001/035727, WO 2001/036444, WO 2001/036597, WO 2001/036598, WO 2002/015675, WO 2002/017430, WO 2002/077185, WO 2002/079403, WO 2003/013227, WO 2003/013228, WO 2003/014327, WO 2004/031349, WO 2004/076638, WO 199809521.

(B) WO 199938977, в которой описаны гены, в том числе гены CBF, и факторы транскрипции, эффективные в ослаблении отрицательных эффектов замораживания, высокого содержания солей и засухи на растения, а также обеспечивающие другие положительные эффекты в отношении фенотипа растения.

(C) Публикация заявки на выдачу патента США № 2004/0148654 и WO 2001/36596, где в растениях изменяют содержание абсцизовой кислоты, что приводит к улучшенному фенотипу растения, такому как повышенная урожайность и/или повышенная переносимость абиотического стресса.

(D) WO 2000/006341, WO 2004/090143, патенты США №№ 7531723 и 6992237, где экспрессия цитокинина модифицируется, что приводит к растениям с повышенной переносимостью стрессов, как, например, переносимостью засухи и/или повышенной урожайностью. Также см. WO 2002/02776, WO 2003/052063, JP 2002/281975, патент США № 6084153, WO 2001/64898, патент США № 6177275 и патент США № 6107547 (улучшение использования азота и измененная реактивность в отношении азота).

(E) Что касается изменения содержания этилена, см. публикацию заявки на выдачу патента США № 2004/0128719, публикацию заявки на выдачу патента США № 2003/0166197 и WO 2000/32761.

(F) Что касается растительных факторов транскрипции или транскрипционных регуляторов, связанных с реакцией на абиотический стресс, см., например, публикацию заявки на выдачу патента США № 2004/0098764 или публикацию заявки на выдачу патента США № 2004/0078852.

(G) Гены, которые повышают экспрессию вакуолярной пирофосфатазы, такие как AVP1 (патент США № 8058515), для повышенной урожайности; нуклеиновая кислота, кодирующая полипептиды HSFA4 или HSFA5 (фактор теплового шока класса A4 или A5), полипептид, подобный белку транспортера олигопептидов (OPT4-подобный); пластохрон-2-подобный (PLA2-подобный) полипептид или Wuschel-родственный гомеобокс 1-подобный (WOX1-подобный) полипептид (публикация заявки на выдачу патента США № US 2011/0283420).

(H) Подавление полинуклеотидов, кодирующих белки поли-(АДФ-рибоза)-полимеразы (PARP) для модуляции запрограммированной клеточной смерти (патент США № 8058510), для повышения мощности.

(I) Полинуклеотид, кодирующий полипептиды DTP21, для обеспечения устойчивости к засухе (публикация заявки на выдачу патента США № US 2011/0277181).

(J) Нуклеотидные последовательности, кодирующие белки ACC синтазы 3 (ACS3) для модуляции развития, модуляции реакции на стресс и модуляции переносимости стрессов (публикация заявки на выдачу патента США № US 2010/0287669).

(K) Полинуклеотиды, кодирующие белки, которые приводят к фенотипу переносимости засухи (DTP), для обеспечения устойчивости к засухе (WO 2012/058528).

(L) Гены токоферолциклазы (TC) для обеспечения переносимости засухи и засоления (публикация заявки на выдачу патента США № 2012/0272352).

(M) Белки семейства протеаз, нацеленные на CAAX-концевые аминокислоты, для придания переносимости стрессов (патент США № 8338661).

(N) Мутации в гене, кодирующем SAL1, характеризовались повышенной переносимостью стрессов, в том числе характеризовались повышенной устойчивостью к засухе (публикация заявки на выдачу патента США № 2010/0257633).

(O) Экспрессия последовательности нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, выбранный из группы, состоящей из: полипептида GRF, RAA1-подобного полипептида, полипептида SYR, полипептида ARKL и полипептида YTP, усиливающих признаки, связанные с урожайностью (публикация заявки на выдачу патента США № 2011/0061133).

(P) Модуляция экспрессии в растении нуклеиновой кислоты, кодирующей полипептид трегалоза-фосфатфосфатазу (TPP) класса III для улучшения у растений признаков, связанных с урожайностью, в частности повышения урожайности семян (публикация заявки на выдачу патента США № 2010/0024067).

Другие гены и факторы транскрипции, которые воздействуют на рост и агрономические признаки растений, такие как урожайность, цветение, рост растения и/или структура растения, можно вводить или интрогрессировать в растения, см., например, WO 1997/49811 (LHY), WO 1998/56918 (ESD4), WO 1997/10339 и патент США № 6573430 (TFL), патент США № 6713663 (FT), WO 1996/14414 (CON), WO 1996/38560, WO 2001/21822 (VRN1), WO 2000/44918 (VRN2), WO 1999/49064 (GI), WO 2000/46358 (FR1), WO 1997/29123, патент США № 6794560, патент США № 6307126 (GAI), WO 1999/09174 (D8 и Rht) и WO 2004/076638, а также WO 2004/031349 (факторы транскрипции).

7. Гены, которые обеспечивают повышенную урожайность

(A) Трансгенное культурное растение, трансформированное с помощью нуклеиновой кислоты, кодирующей 1-аминоциклопропан-1-карбоксилатдезаминаза-подобный полипептид (ACCDP), где экспрессия последовательности нуклеиновой кислоты в культурном растении приводит к повышенному росту корней, и/или повышенной урожайности, и/или повышенной переносимости стрессов под влиянием факторов среды у растения, по сравнению с разновидностью дикого типа растения (патент США № 8097769).

(B) Как было показано, сверхэкспрессия гена белков "цинковых пальцев" маиса (Zm-ZFP1) с применением промотора, активного преимущественно в семенах, усиливает рост растения, увеличивает количество зерен и общий вес зерен на растение (публикация заявки на выдачу патента США № 2012/0079623).

(C) Как было показано, конститутивная сверхэкспрессия белка с доменом границ латеральных органов (LOB) (Zm-LOBDP1) маиса увеличивает количество зерен и общий вес зерен на растение (публикация заявки на выдачу патента США № 2012/0079622).

(D) Улучшение у растений признаков, связанных с урожайностью, с помощью модуляции экспрессии у растения нуклеиновой кислоты, кодирующей VIM1 (вариант с метилированием 1)-подобный полипептид, или VTC2-подобный (GDP-L-галактоза-фосфорилаза) полипептид, или полипептид DUF1685, или ARF6-подобный (восприимчивый к ауксину фактор) полипептид (WO 2012/038893).

(E) Модуляция экспрессии в растении нуклеиновой кислоты, кодирующей Ste20-подобный полипептид или его гомолог, позволяет растениям обеспечивать повышенную урожайность относительно контрольных растений (EP 2431472).

(F) Гены, кодирующие полипептиды нуклеозиддифосфаткиназы (NDK) и их гомологи для модификации строения корня растения (публикация заявки на выдачу патента США № 2009/0064373).

8. Гены, которые обеспечивают усвояемость растения

(A) Изменение уровня ксилана, присутствующего в клеточной стенке растения, с помощью модуляции экспрессии ксилансинтазы (патент США № 8173866).

В некоторых вариантах осуществления пакетированный признак может представлять собой признак или трансгенный объект, который получил разрешение контролирующих органов, в том числе без ограничения является трансгенным объектом из таблицы 4A - 4F.

Таблица 4A. Подсолнечник Helianthus annuus

Трансгенный объект Компания Описание X81359 BASF Inc. Переносимость имидазолиноновых гербицидов при помощи отбора встречающегося в природе мутанта.

Таблица 4B. Рис Oryza sativa

Трансгенный объект Компания Описание CL121, CL141, CFX51 BASF Inc. Переносимость имидазолинонового гербицида, имазетапира, индуцированная химическим мутагенезом фермента ацетолактатсинтазы (ALS) с применением этилметансульфоната (EMS). IMINTA-1, IMINTA-4 BASF Inc. Переносимость имидазолиноновых гербицидов, индуцированная химическим мутагенезом фермента ацетолактатсинтазы (ALS) с применением азида натрия. LLRICE06, LLRICE62 Aventis CropScience Рис с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученный с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из почвенной бактерии Streptomyces hygroscopicus). LLRICE601 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Рис с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученный с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из почвенной бактерии Streptomyces hygroscopicus). PWC16 BASF Inc. Переносимость имидазолинонового гербицида, имазетапира, индуцированная химическим мутагенезом фермента ацетолактатсинтазы (ALS) с применением этилметансульфоната (EMS).

Таблица 4C. Соя Glycine max L.

Трансгенный объект Компания Описание A2704-12, A2704-21, A5547-35 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Соя с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученная с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из почвенной бактерии Streptomyces viridochromogenes. A5547-127 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Соя с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученная с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из почвенной бактерии Streptomyces viridochromogenes. BPS-CV127-9 BASF Inc. Введенный ген csr1-2 из Arabidopsis thaliana кодирует белок ацетогидроксикислота-синтазу, который обеспечивает переносимость имидазолиноновых гербицидов вследствие точечной мутации, которая приводит к замене одной аминокислоты, при которой остаток серина в положении 653 замещен аспарагином (S653N). DP-305423 Pioneer Hi-Bred International Inc. Соя с высоким содержанием олеиновой кислоты, полученная с помощью вставки дополнительных копий части гена, кодирующего омега-6-десатуразу, gm-fad2-1, что приводит к сайленсингу гена эндогенной омега-6-десатуразы (FAD2-1). DP356043 Pioneer Hi-Bred International Inc. Трансгенный объект сои с двумя генами переносимости гербицидов: геном глифосат-N-ацетилтрансферазы, которая нейтрализует глифосат, и геном модифицированной ацетолактатсинтазы (ALS), которая не восприимчива к ALS-ингибирующим гербицидам. G94-1, G94-19, G168 DuPont Canada Agricultural Products Соя с высоким содержанием олеиновой кислоты, полученная с помощью вставки второй копии гена, кодирующего десатуразу жирной кислоты (GmFad2-1), из сои, что приводит к "сайленсингу" эндогенного гена хозяина. GTS 40-3-2 Monsanto Company Сорт сои с переносимостью глифосата, полученный с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS), из почвенной бактерии Agrobacterium tumefaciens. GU262 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Соя с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученная с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из почвенной бактерии Streptomyces viridochromogenes. MON87701 Monsanto Company Устойчивость к чешуекрылым вредителям сои, в том числе к гусенице, питающейся бархатными бобами (Anticarsia gemmatalis), и соевой совке (Pseudoplusia includens). MON87701 x MON89788 Monsanto Company Переносимость гербицида глифосата благодаря экспрессии гена, кодирующего EPSPS, из штамма CP4 A. tumefaciens и устойчивость к чешуекрылым вредителям сои, в том числе к гусенице, питающейся бархатными бобами (Anticarsia gemmatalis), и соевой совке (Pseudoplusia includens), благодаря экспрессии гена, кодирующего Cry1Ac, из B. thuringiensis. MON89788 Monsanto Company Соя с переносимостью глифосата, полученная с помощью вставки гена aroA (epsps), кодирующего модифицированную 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS), из Agrobacterium tumefaciens CP4. OT96-15 Agriculture & Agri-Food Canada Соя с низким содержанием линоленовой кислоты, полученная благодаря традиционному кроссбридингу для введения нового признака, обусловленного встречающимся в природе мутантом гена fan1, который отбирали в отношении низкого содержания линоленовой кислоты. W62, W98 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Соя с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученная с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из почвенной бактерии Streptomyces hygroscopicus.

Таблица 4D. Пшеница Triticum aestivum

Трансгенный объект Компания Описание AP205CL BASF Inc. Отбор в отношении подвергнутой мутагенезу версии фермента ацетогидроксикислота-синтазы (AHAS), также известной как ацетолактатсинтаза (ALS) или ацетолактат-пируват-лиаза. AP602CL BASF Inc. Отбор в отношении подвергнутой мутагенезу версии фермента ацетогидроксикислота-синтазы (AHAS), также известной как ацетолактатсинтаза (ALS) или ацетолактат-пируват-лиаза. BW255-2, BW238-3 BASF Inc. Отбор в отношении подвергнутой мутагенезу версии фермента ацетогидроксикислота-синтазы (AHAS), также известной как ацетолактатсинтаза (ALS) или ацетолактат-пируват-лиаза. BW7 BASF Inc. Переносимость имидазолиноновых гербицидов, индуцированная посредством химического мутагенеза гена ацетогидроксикислота-синтазы (AHAS) с применением азида натрия. MON71800 Monsanto Company Сорт пшеницы с переносимостью глифосата, полученный с помощью вставки гена, кодирующего модифицированную 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS), из штамма CP4 почвенной бактерии Agrobacterium tumefaciens. SWP965001 Cyanamid Crop Protection Отбор в отношении подвергнутой мутагенезу версии фермента ацетогидроксикислота-синтазы (AHAS), также известной как ацетолактатсинтаза (ALS) или ацетолактат-пируват-лиаза. Teal 11A BASF Inc. Отбор в отношении подвергнутой мутагенезу версии фермента ацетогидроксикислота-синтазы (AHAS), также известной как ацетолактатсинтаза (ALS) или ацетолактат-пируват-лиаза.

Таблица 4E. Люцерна Medicago sativa

Трансгенный объект Компания Описание J101, J163 Monsanto Company и Forage Genetics International Люцерна (люцерна посевная) с переносимостью гербицида глифосата, полученная с помощью вставки гена, кодирующего фермент 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS) из штамма CP4 Agrobacterium tumefaciens.

Таблица 4F. Маис Zea mays L.

Трансгенный объект Компания Описание 176 Syngenta Seeds, Inc. Маис с устойчивостью к насекомым, полученный с помощью вставки гена Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki. Генетическая модификация придает устойчивость к нападению огневки кукурузной (ECB). 3751IR Pioneer Hi-Bred International Inc. Отбор сомаклональных вариантов путем культивирования зародышей на среде, содержащей имидазолинон. 676, 678, 680 Pioneer Hi-Bred International Inc. Маис с мужской стерильностью и переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученный с помощью вставки генов, кодирующих ДНК-аденин-метилазу и фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT) соответственно из Escherichia coli и Streptomyces viridochromogenes. B16 (DLL25) Dekalb Genetics Corporation Маис с переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученный с помощью вставки гена, кодирующего фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT), из Streptomyces hygroscopicus. BT11 (X4334CBR, X4734CBR) Syngenta Seeds, Inc. Маис с устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью вставки гена Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki, и гена, кодирующего фосфинотрицин-N-ацетилтрансферазу (PAT), из S. viridochromogenes. BT11 x GA21 Syngenta Seeds, Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий BT11 (уникальный идентификатор OECD: SYN-BTO11-1) и GA21 (уникальный идентификатор OECD: MON-OOO21-9). BT11 x MIR162 x MIR604 x GA21 Syngenta Seeds, Inc. Устойчивость к жесткокрылым вредителям, в частности к вредителям кукурузным жукам (Diabrotica spp.) и к нескольким чешуекрылым вредителям кукурузы, в том числе к огневке кукурузной (ECB, Ostrinia nubilalis), хлопковой совке (CEW, Helicoverpa zea), кукурузной листовой совке (FAW, Spodoptera frugiperda) и совке-ипсилон (BCW, Agrotis ipsilon); переносимость гербицидов, содержащих глифосат и глуфосинат-аммоний. BT11 x MIR162 Syngenta Seeds, Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий BT11 (уникальный идентификатор OECD: SYN-BTO11-1) и MIR162 (уникальный идентификатор OECD: SYN-IR162-4). Устойчивость к огневке кукурузной и переносимость гербицида глуфосината аммония (Liberty) получают от BT11, которая содержит ген Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki, и ген, кодирующий фосфинотрицин-N-ацетилтрансферазу (PAT), из S. viridochromogenes. Устойчивость к другим чешуекрылым вредителям, в том числе H. zea, S. frugiperda, A. ipsilon и S. albicosta, получают от MIR162, которая содержит ген vip3Aa из штамма AB88 Bacillus thuringiensis. BT11 x MIR162 x MIR604 Syngenta Seeds, Inc. Белок дельта-эндотоксин Cry1Ab от Bacillus thuringiensis и генетический материал, необходимый для его выработки (с помощью элементов вектора pZO1502) в трансгенном объекте Bt11 кукурузы (уникальный идентификатор OECD: SYN-BTO11-1), x инсектицидный белок Vip3Aa20 от Bacillus thuringiensis и генетический материал, необходимый для его выработки (с помощью элементов вектора pNOV1300) в трансгенном объекте MIR162 маиса (уникальный идентификатор OECD: SYN-IR162-4), x модифицированный белок Cry3A и генетический материал, необходимый для его выработки (с помощью элементов вектора pZM26) в трансгенном объекте MIR604 кукурузы (уникальный идентификатор OECD: SYN-IR6O4-5). CBH-351 Aventis CropScience Маис с устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицида глуфосината аммония, разработанный посредством вставки генов, кодирующих белок Cry9C из Bacillus thuringiensis, подвид tolworthi, и фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT) из Streptomyces hygroscopicus. DAS-06275-8 DOW AgroSciences LLC Маис с устойчивостью к чешуекрылым насекомым и переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученный с помощью вставки гена Cry1F из Bacillus thuringiensis вар. aizawai и фосфинотрицинацетилтрансферазы (PAT) из Streptomyces hygroscopicus. BT11 x MIR604 Syngenta Seeds, Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий BT11 (уникальный идентификатор OECD: SYN-BTO11-1) и MIR604 (уникальный идентификатор OECD: SYN-IR6O5-5). Устойчивость к огневке кукурузной и переносимость гербицида глуфосината аммония (Liberty) получают от BT11, которая содержит ген Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki, и ген, кодирующий фосфинотрицин-N-ацетилтрансферазу (PAT), из S. viridochromogenes. Устойчивость к кукурузному жуку получают от MIR604, которая содержит ген mCry3A из Bacillus thuringiensis. BT11 x MIR604 x GA21 Syngenta Seeds, Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий BT11 (уникальный идентификатор OECD: SYN-BTO11-1), MIR604 (уникальный идентификатор OECD: SYN-IR6O5-5) и GA21 (уникальный идентификатор OECD: MON-OOO21-9). Устойчивость к огневке кукурузной и переносимость гербицида глуфосината аммония (Liberty) получают от BT11, которая содержит ген Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki, и ген, кодирующий фосфинотрицин-N-ацетилтрансферазу (PAT), из S. viridochromogenes. Устойчивость к кукурузному жуку получают от MIR604, которая содержит ген mCry3A из Bacillus thuringiensis. Переносимость гербицида глифосата получают от GA21, которая содержит ген модифицированной EPSPS из маиса. DAS-59122-7 DOW AgroSciences LLC и Pioneer Hi-Bred International Inc. Маис с устойчивостью к кукурузному жуку, полученный с помощью вставки генов Cry34Ab1 и Cry35Ab1 из штамма PS149B1 Bacillus thuringiensis. Ген, кодирующий PAT, из Streptomyces viridochromogenes вводили в качестве селектируемого маркера. DAS-59122-7 x TC1507 x NK603 DOW AgroSciences LLC и Pioneer Hi-Bred International Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий DAS-59122-7 (уникальный идентификатор OECD: DAS-59122-7) и TC1507 (уникальный идентификатор OECD: DAS-O15O7-1) с NK603 (уникальный идентификатор OECD: MON-OO6O3-6). Устойчивость к кукурузному жуку получают от DAS-59122-7, которая содержит гены Cry34Ab1 и Cry35Ab1 из штамма PS149B1 Bacillus thuringiensis. Устойчивость к чешуекрылым и переносимость гербицида глуфосината аммония получают от TC1507. Переносимость гербицида глифосата получают от NK603. DBT418 Dekalb Genetics Corporation Маис с устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицида глуфосината аммония, разработанный посредством вставки генов, кодирующих белок Cry1AC из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki, и фосфинотрицинацетилтрансферазу (PAT) из Streptomyces hygroscopicus. MIR604 x GA21 Syngenta Seeds, Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий MIR604 (уникальный идентификатор OECD: SYN-IR6O5-5) и GA21 (уникальный идентификатор OECD: MON-OOO21-9). Устойчивость к кукурузному жуку получают от MIR604, которая содержит ген mCry3A из Bacillus thuringiensis. Переносимость гербицида глифосата получают от GA21. MON80100 Monsanto Company Маис с устойчивостью к насекомым, полученный с помощью вставки гена Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki. Генетическая модификация придает устойчивость к нападению огневки кукурузной (ECB). MON802 Monsanto Company Маис с устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицида глифосата, полученный с помощью вставки генов, кодирующих белок Cry1Ab из Bacillus thuringiensis и 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS) из штамма CP4 A. tumefaciens. MON809 Pioneer Hi-Bred International Inc. Устойчивость к огневке кукурузной (Ostrinia nubilalis) с помощью введения синтетического гена Cry1Ab. Устойчивость к глифосату с помощью введения бактериальной версии растительного фермента, 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазы (EPSPS). MON810 Monsanto Company Маис с устойчивостью к насекомым, полученный с помощью вставки усеченной формы гена Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki HD-1. Генетическая модификация придает устойчивость к нападению огневки кукурузной (ECB). MON810 x LY038 Monsanto Company Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и увеличенным содержанием лизина, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий MON810 (идентификатор OECD: MON-OO81O-6) и LY038 (идентификатор OECD: REN-OOO38-3). MON810 x MON88017 Monsanto Company Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью глифосата, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий MON810 (идентификатор OECD: MON-OO81O-6) и MON88017 (идентификатор OECD: MON-88O17-3). Устойчивость к огневке кукурузной (ECB) получена благодаря усеченной форме гена Cry1Ab из Bacillus thuringiensis, подвид kurstaki HD-1, присутствующего в MON810. Устойчивость к кукурузному жуку получают благодаря гену Cry3Bb1 из штамма EG4691 Bacillus thuringiensis, подвид kumamotoensis, присутствующему в MON88017. Переносимость глифосата получают благодаря гену, кодирующему 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS), из штамма CP4 Agrobacterium tumefaciens, присутствующему в MON88017. MON832 Monsanto Company Введение посредством бомбардировки частицами глифосатоксидазы (GOX) и модифицированной 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазы (EPSPS), фермента, вовлеченного в биохимический метаболический путь шикимата, для выработки ароматических аминокислот. MON863 Monsanto Company Маис с устойчивостью к кукурузному жуку, полученный с помощью вставки гена Cry3Bb1 из Bacillus thuringiensis, подвид kumamotoensis. MON863 x MON810 Monsanto Company Гибрид кукурузы с пакетированной устойчивостью к насекомым, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий MON863 (идентификатор OECD: MON-OO863-5) и MON810 (идентификатор OECD: MON-OO81O-6) MON863 x MON810 x NK603 Monsanto Company Гибрид кукурузы с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный в результате традиционного кроссбридинга гибрида с пакетированными генами MON-OO863-5 x MON-OO81O-6 и NK603 (идентификатор OECD:MON-OO6O3-6). MON863 x NK603 Monsanto Company Гибрид кукурузы с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий MON863 (идентификатор OECD:MON-OO863-5) и NK603 (идентификатор OECD: MON-OO6O3-6). MON87460 Monsanto Company MON 87460 разрабатывали для обеспечения сниженной потери урожая в условиях ограниченного количества воды относительно традиционного маиса. Эффективность по отношению к MON 87460 получают с помощью экспрессии вставленного белка холодового шока B (CspB) Bacillus subtilis. MON88017 Monsanto Company Маис с устойчивостью к кукурузному жуку, полученный с помощью вставки гена Cry3Bb1 из штамма EG4691 Bacillus thuringiensis, подвид kumamotoensis. Переносимость глифосата получают с помощью вставки гена, кодирующего 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS), из штамма CP4 Agrobacterium tumefaciens. MON89034 Monsanto Company Трансгенный объект маиса, экспрессирующий два различных инсектицидных белка из Bacillus thuringiensis, обеспечивающий устойчивость к ряду чешуекрылых вредителей. MON89034 x MON88017 Monsanto Company Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью глифосата, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий MON89034 (идентификатор OECD: MON-89O34-3) и MON88017 (идентификатор OECD:MON-88O17-3). Устойчивость к чешуекрылым насекомым получают благодаря двум генам Cry, присутствующим в MON89043. Устойчивость к кукурузному жуку получают благодаря одному гену Cry, и переносимость глифосата получают благодаря гену, кодирующему 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазу (EPSPS) из Agrobacterium tumefaciens, присутствующему в MON88017. MON89034 x NK603 Monsanto Company Пакетированный маис с устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий MON89034 (идентификатор OECD: MON-89O34-3) с NK603 (уникальный идентификатор OECD: MON-OO6O3-6). Устойчивость к чешуекрылым насекомым получают благодаря двум генам Cry, присутствующим в MON89043. Переносимость гербицида глифосата получают от NK603. NK603 x MON810 Monsanto Company Гибрид кукурузы с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий NK603 (идентификатор OECD: MON-OO6O3-6) и MON810 (идентификатор OECD: MON-OO81O-6). MON89034 x TC1507 x MON88017 x DAS-59122-7 Monsanto Company и Mycogen Seeds c/o Dow AgroSciences LLC Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий: MON89034, TC1507, MON88017 и DAS-59122. Устойчивость к наземным и подземным насекомым-вредителям и переносимость гербицидов глифосата и глуфосината аммония. MS3 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Мужская стерильность, вызванная экспрессией гена рибонуклеазы барназы из Bacillus amyloliquefaciens; устойчивость к PPT присутствовала благодаря PPT-ацетилтрансферазе (PAT). MS6 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Мужская стерильность, вызванная экспрессией гена рибонуклеазы барназы из Bacillus amyloliquefaciens; устойчивость к PPT присутствовала благодаря PPT-ацетилтрансферазе (PAT). NK603 Monsanto Company Введение путем бомбардировки частицами модифицированной 5-енолпирувилшикимат-3-фосфатсинтазы (EPSPS), фермента, вовлеченного в биохимический метаболический путь шикимата, для выработки ароматических аминокислот. NK603 x T25 Monsanto Company Гибрид маиса с пакетированной переносимостью гербицида глуфосината аммония и глифосата, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий NK603 (идентификатор OECD: MON-OO6O3-6) и T25 (идентификатор OECD: ACS-ZM003-2). T25 x MON810 Bayer CropScience (Aventis CropScience (AgrEvo)) Гибрид кукурузы с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий T25 (идентификатор OECD: ACS-ZMOO3-2) и MON810 (идентификатор OECD:MON-OO81O-6). TC1507 Mycogen (c/o Dow AgroSciences); Pioneer (c/o DuPont) Маис с устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицида глуфосината аммония, полученный с помощью вставки гена Cry1F из Bacillus thuringiensis вар. aizawai и гена, кодирующего фосфинотрицин-N-ацетилтрансферазу, из Streptomyces viridochromogenes. TC1507 x NK603 DOW AgroSciences LLC Гибрид кукурузы с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный в результате традиционного кроссбридинга родительских линий 1507 (идентификатор OECD: DAS-O15O7-1) и NK603 (идентификатор OECD: MON-OO6O3-6). TC1507 x DAS-59122-7 DOW AgroSciences LLC и Pioneer Hi-Bred International Inc. Маис с пакетированной устойчивостью к насекомым и переносимостью гербицидов, полученный с помощью традиционного кроссбридинга родительских линий TC1507 (уникальный идентификатор OECD: DAS-O15O7-1) с DAS-59122-7 (уникальный идентификатор OECD: DAS-59122-7). Устойчивость к чешуекрылым насекомым получают от TC1507 вследствие присутствия гена Cry1F из Bacillus thuringiensis вар. aizawai. Устойчивость к кукурузному жуку получают от DAS-59122-7, которая содержит гены Cry34Ab1 и Cry35Ab1 из штамма PS149B1 Bacillus thuringiensis. Переносимость гербицида глуфосината аммония получают от TC1507 благодаря гену, кодирующему фосфинотрицин-N-ацетилтрансферазу из Streptomyces viridochromogenes.

Другие трансгенные объекты, разрешенные контролирующими органами, хорошо известны специалисту в данной области и их можно найти на сайте Центра оценки риска для окружающей среды (cera-gmc.org/?action=gm_crop_database, доступ к которому можно получить с использованием префикса www) и на сайте Международной службы по приобретению агробиотехнологических приложений (isaaa.org/gmapprovaldatabase/default.asp, доступ к которому можно получить с использованием префикса www).

Сайленсинг генов

В некоторых вариантах осуществления пакетированный признак может быть в форме, применяемой для сайленсинга одного или нескольких полинуклеотидов, представляющих интерес, что приводит к супрессии одного или нескольких целевых полипептидов вредителя. В некоторых вариантах осуществления сайленсинг достигается благодаря применению супрессионной ДНК-конструкции.

В некоторых вариантах осуществления один или несколько полинуклеотидов, кодирующих полипептиды из инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию или их фрагментов или вариантов, могут быть пакетированы с одним или несколькими полинуклеотидами, кодирующими один или несколько полипептидов, характеризующихся инсектицидной активностью или агрономическими признаками, изложенными выше, и необязательно может дополнительно предусматривать один или несколько полинуклеотидов, предусмотренных для сайленсинга генов одного или нескольких целевых полинуклеотидов, как обсуждается ниже.

"Супрессионная ДНК-конструкция" представляет собой рекомбинантную ДНК-конструкцию, которая при трансформации или стабильной интеграции в геном растения приводит в результате к "сайленсингу" целевого гена в растении. Целевой ген может быть эндогенным или трансгенным по отношению к растению. "Сайленсинг", используемый в данном документе по отношению к целевому гену, обычно относится к супрессии уровней mRNA или белка/фермента, экспрессируемых целевым геном, и/или уровня активности фермента или функционирования белка. Термин "супрессия" предусматривает понижение, снижение, ухудшение, уменьшение, ингибирование, устранение и предотвращение. "Сайленсинг" или "сайленсинг генов" не определяет механизм и включают без ограничения супрессию, опосредованную антисмысловыми олигонуклеотидами, косупрессию, супрессию, опосредованную вирусами, супрессию, опосредованную шпильками, супрессию, опосредованную структурами типа "стебель-петля", подходы на основе RNAi и подходы на основе низкомолекулярных РНК.

Супрессионная ДНК-конструкция может содержать участок, происходящий от целевого гена, представляющего интерес, и может содержать всю или часть последовательности нуклеиновой кислоты смысловой нити (или антисмысловой нити) целевого гена, представляющего интерес. В зависимости от подхода, который будет использоваться, участок может быть на 100% идентичным или менее, чем на 100% идентичным (например, по меньшей мере на 50% или на любое целое число от 51% до 100% идентичным) всей смысловой нити (или антисмысловой нити) гена, представляющего интерес, или ее части.

Супрессионные ДНК-конструкции хорошо известны в уровне техники, легко конструируются сразу после выбора целевого гена, представляющего интерес, и включают без ограничения косупрессионные конструкции, антисмысловые конструкции, вирусные супрессионные конструкции, шпильковые супрессионные конструкции, супрессионные конструкции типа "стебель-петля", конструкции, вырабатывающие двухнитевые РНК, и в более общем смысле конструкции для RNAi (РНК-интерференции) и конструкции на основе небольших РНК, такие как конструкции на основе siRNA (коротких интерферирующих РНК) и miRNA (микроРНК).

"Антисмысловое ингибирование" относится к продуцированию антисмысловых РНК-транскриптов, способных супрессировать экспрессию целевого белка.

"Антисмысловая РНК" относится к РНК-транскрипту, который комплементарен всему или части целевого первичного транскрипта или mRNA, и который блокирует экспрессию фрагмента целевой выделенной нуклеиновой кислоты (патент США № 5107065). Комплементарность антисмысловой РНК может быть с любой частью конкретного генного транскрипта, т. е. с 5'-некодирующей последовательностью, 3'-некодирующей последовательностью, интронами или кодирующей последовательностью.

"Косупрессия" относится к выработке смысловых РНК-транскриптов, способных супрессировать экспрессию целевого белка. "Смысловая" РНК относится к РНК-транскрипту, который включает mRNA, и она может быть транслирована с образованием белка в клетке или in vitro. Конструкции для косупрессии у растений ранее разрабатывались с основным вниманием к сверхэкспрессии последовательностей нуклеиновой кислоты, имеющих гомологию с нативной мРНК, в смысловой ориентации, что приводит к снижению уровней всех РНК, имеющих гомологию со сверхэкспрессированной последовательностью (см., Vaucheret, et al., (1998) Plant J. 16:651-659 и Gura, (2000) Nature 404:804-808).

В другом варианте описывается применение последовательностей растительных вирусов для управления супрессией проксимальных последовательностей, кодирующих mRNA (публикация согласно PCT WO 1998/36083).

В недавней работе было описано применение "шпильковых" структур, которые включают всю или часть mRNA-кодирующей последовательности в комплементарной ориентации, что приводит к потенциальной структуре "стебель-петля" у экспрессированной РНК (публикация согласно PCT WO 1999/53050). В данном случае стебель формируется полинуклеотидами, соответствующими гену, представляющему интерес, в смысловой или в антисмысловой ориентации по отношению к промотору, а петля формируется несколькими полинуклеотидами гена, представляющего интерес, которые не имеют комплементарной последовательности в конструкции. Это повышает частоту косупрессии или сайленсинга в регенерированных трансгенных растениях. Обзор шпильковой супрессии см. в Wesley, et al., (2003) Methods in Molecular Biology, Plant Functional Genomics: Methods and Protocols 236:273-286.

Конструкция, в которой стебель образован по меньшей мере 30 нуклеотидами из гена, который подлежит супрессии, и петля образована случайной нуклеотидной последовательностью, также эффективно применялась для супрессии (публикация согласно PCT WO 1999/61632).

Также было описано применение последовательностей поли-T и поли-A для получения стебля в структуре "стебель-петля" (публикация согласно PCT WO 2002/00894).

Еще один вариант включает применение синтетических повторов для содействия образованию стебля в структуре "стебель-петля". Было показано, что трансгенные организмы, полученные с такими фрагментами рекомбинантной ДНК, характеризуются сниженными уровнями белка, кодируемого нуклеотидным фрагментом, который образует петлю, как описано в публикации согласно РСТ WO 2002/00904.

РНК-интерференция относится к процессу, специфичному в отношении последовательности посттранскрипционного сайленсинга генов у животных, который опосредован короткими интерферирующими РНК (siRNA) (Fire, et al., (1998) Nature 391:806). Соответствующий процесс у растений обычно называют посттранскрипционным сайленсингом генов (PTGS) или РНК-опосредованным сайленсингом, и также называют подавлением у грибов. Процесс посттранскрипционного сайленсинга генов считается эволюционно-консервативным механизмом клеточной защиты, применяющимся для предотвращения экспрессии чужеродных генов, и он широко распространен у различных представителей растительного мира и типов животных (Fire, et al., (1999) Trends Genet. 15:358). Такая защита от экспрессии чужеродных генов могла развиться в ответ на выработку двухцепочечных РНК (dsRNA), полученных в результате вирусной инфекции или в результате случайной интеграции транспозонных элементов в геном хозяина, путем клеточного ответа, который специфически разрушает гомологичную одноцепочечную РНК вирусной геномной РНК. Присутствие dsRNA в клетках вызывает RNAi-ответ через механизм, который полностью еще не охарактеризован.

Присутствие длинных dsRNA в клетках стимулирует активность фермента рибонуклеазы III, называемого ʺдайсерʺ. Дайсер вовлекается в процессинг dsRNA с образованием коротких фрагментов dsRNA, называемых короткими интерферирующими РНК (siRNA) (Berstein et al., Nature 409:363, 2001). Как правило, короткие интерферирующие РНК, полученные в результате активности дайсер, имеют длину от приблизительно 21 до приблизительно 23 нуклеотидов, и включают дуплексы из приблизительно 19 пар оснований (Elbashir, et al., (2001) Genes Dev. 15:188). Кроме того, дайсер был вовлечен в вырезание 21- и 22-нуклеотидных небольших временных РНК (stRNA) из РНК-предшественника консервативной структуры, которые вовлечены в контроль на уровне трансляции (Hutvagner, et al., (2001) Science 293:834). Для RNAi-ответа также характерен эндонуклеазный комплекс, обычно называемый комплексом РНК-индуцированного сайленсинга (RISC), который опосредует расщепление одноцепочечной РНК, последовательность которой комплементарна антисмысловой цепи дуплекса siRNA. Расщепление целевой РНК происходит в середине участка, комплементарного антисмысловой цепи дуплекса siRNA (Elbashir et al., Genes Dev. 15:188). Кроме того, РНК-интерференция также может подразумевать сайленсинг генов, опосредованный небольшими РНК (например, miRNA), предположительно посредством клеточных механизмов, которые регулируют структуру хроматина, и тем самым предотвращают транскрипцию последовательностей целевых генов (см., например, Allshire, (2002) Science 297:1818-1819; Volpe, et al., (2002) Science 297:1833-1837; Jenuwein, (2002) Science 297:2215-2218 и Hall, et al., (2002) Science 297:2232-2237). Таким образом, молекулы miRNA по настоящему раскрытию можно применять для опосредования сайленсинга генов путем взаимодействия с РНК-транскриптами или, в качестве альтернативы, взаимодействия с конкретными генными последовательностями, где такое взаимодействие приводит к сайленсингу генов либо на транскрипционном, либо на посттранскрипционном уровне.

Дополнительно предусмотрены способы и композиции, которые обеспечивают возможность повышения уровня RNAi, получаемой с помощью элемента сайленсинга. В таких вариантах осуществления в способах и композициях используется первый полинуклеотид, содержащий элемент сайленсинга для целевой последовательности вредителя, функционально связанный с промотором, активным в растительной клетке; и второй полинуклеотид, содержащий усиливающий супрессию элемент, содержащий целевую последовательность вредителя или ее активный вариант или фрагмент, функционально связанные с промотором, активным в растительной клетке. Объединенная экспрессия элемента сайленсинга с усиливающим супрессию элементом ведет к увеличению амплификации ингибиторных РНК, вырабатываемых на основе элемента сайленсинга сверх того уровня, который достигается при экспрессии только элемента сайленсинга самого по себе. В дополнение к увеличенной амплификации специфических видов молекул для RNAi самих по себе, способы и композиции дополнительно обеспечивают возможность выработки отличающейся группы видов молекул для RNAi, которые могут улучшать эффективность нарушения экспрессии целевого гена. Таким образом, когда усиливающий супрессию элемент экспрессируется в растительной клетке в комбинации с элементом сайленсинга, способы и композиции могут обеспечивать возможность системной выработки молекул для RNAi по всему растению; выработку больших количеств молекул для RNAi, чем можно было бы наблюдать в случае только конструкции элемента сайленсинга отдельно; и улучшенную загрузку молекул для RNAi во флоэму растения, таким образом обеспечивается лучший контроль насекомых, питающихся флоэмой, с помощью подхода с RNAi. Таким образом, различные способы и композиции обеспечивают улучшенные способы доставки ингибиторных РНК целевому организму. См., например, публикацию заявки на выдачу патента США 2009/0188008.

"Усиливающий супрессию элемент", используемый в данном документе, включает полинуклеотид, содержащий целевую последовательность, подлежащую супрессии, или ее активный фрагмент или вариант. Понятно, что усиливающий супрессию элемент не должен быть идентичным целевой последовательности, но усиливающий супрессию элемент скорее может содержать вариант целевой последовательности, при условии что последовательность усиливающего супрессию элемента в достаточной степени идентична целевой последовательности, чтобы обеспечить возможность повышенного уровня RNAi, получаемой с помощью элемента сайленсинга, сверх того уровня, который достигается при экспрессии только элемента сайленсинга. Аналогично, усиливающий супрессию элемент может содержать фрагмент целевой последовательности, где фрагмент имеет достаточную длину, чтобы обеспечить возможность повышенного уровня RNAi, получаемой с помощью элемента сайленсинга, сверх того уровня, который достигается при экспрессии только элемента сайленсинга.

Понятно, что можно использовать несколько усиливающих супрессию элементов из одной целевой последовательности, или из различных целевых последовательностей, или из различных участков одной целевой последовательности. Например, используемые усиливающие супрессию элементы могут содержать фрагменты целевой последовательности, полученные из другого участка целевой последовательности (т. е. из 3′UTR, кодирующей последовательности, интрона и/или 5′UTR). Кроме того, усиливающий супрессию элемент может содержаться в кассете экспрессии, как описано в другом месте данного документа, и в определенных вариантах осуществления усиливающий супрессию элемент находится на одном или на другом ДНК-векторе или -конструкции по отношению к элементу сайленсинга. Усиливающий супрессию элемент может быть функционально связан с промотором, раскрытым в данном документе. Понятно, что усиливающий супрессию элемент может экспрессироваться конститутивно, или, в качестве альтернативы, он может вырабатываться способом, зависящим от стадии, с использованием различных индуцируемых, или предпочительных для ткани, или регулируемых развитием промоторов, которые обсуждаются в другом месте данного документа.

В определенных вариантах осуществления при использовании как элемента сайленсинга, так и усиливающего супрессию элемента системная выработка молекул для RNAi происходит по всему растению. В дополнительных вариантах осуществления растение или части растения по настоящему раскрытию имеют повышенную нагрузку молекул для RNAi во флоэме растения, что можно было наблюдать при экспрессии конструкции элемента сайленсинга отдельно, и таким образом обеспечивается лучший контроль насекомых, питающихся флоэмой, с помощью подхода с использованием RNAi. В определенных вариантах осуществления растения, части растения и растительные клетки по настоящему раскрытию можно дополнительно охарактеризовать как обеспечивающие возможность выработки разнообразных видов молекул для RNAi, которые могут улучшать эффективность нарушения экспрессии целевого гена.

В определенных вариантах осуществления объединенная экспрессия элемента сайленсинга и усиливающего супрессию элемента повышает концентрацию ингибиторных РНК в растительной клетке, растении, части растения, растительной ткани или флоэме сверх того уровня, который достигается при экспрессии элемента сайленсинга отдельно.

"Повышенный уровень ингибиторных РНК", используемое в данном документе, включает какое-либо статистически значимое повышение уровня молекул для RNAi, вырабатываемых в растении, обладающем комбинированной экспрессией по сравнению с соответствующим контрольным растением. Например, повышение уровня RNAi в растении, части растения или растительной клетке может предусматривать по меньшей мере приблизительно 1%, приблизительно 1% - 5%, приблизительно 5% - 10%, приблизительно 10% - 20%, приблизительно 20% - 30%, приблизительно 30% - 40%, приблизительно 40% - 50%, приблизительно 50% - 60%, приблизительно 60-70%, приблизительно 70% - 80%, приблизительно 80% - 90%, приблизительно 90% - 100% или большее повышение уровня RNAi в растении, части растения, растительной клетке или флоэме по сравнению с соответствующим контролем. В других вариантах осуществления повышение уровня RNAi в растении, части растения, растительной клетке или флоэме может предусматривать по меньшей мере приблизительно 1-кратное, приблизительно 1-кратное - 5-кратное, приблизительно 5-кратное - 10-кратное, приблизительно 10-кратное - 20-кратное, приблизительно 20-кратное - 30-кратное, приблизительно 30-кратное - 40-кратное, приблизительно 40-кратное - 50-кратное, приблизительно 50-кратное - 60-кратное, приблизительно 60-кратное - 70-кратное, приблизительно 70-кратное - 80-кратное, приблизительно 80-кратное - 90-кратное, приблизительно 90-кратное - 100-кратное или большее повышение уровня RNAi в растении, части растения, растительной клетке или флоэме по сравнению с подходящим контролем. Примеры объединенной экспрессии элемента сайленсинга с усиливающим супрессию элементом для контроля щитников и Lygus можно найти в публикации заявки на выдачу патента США 2011/0301223 и публикации заявки на выдачу патента США 2009/0192117.

Некоторые варианты осуществления относятся к понижающей регуляции экспрессии целевых генов у видов насекомых-вредителей с помощью интерферирующих молекул рибонуклеиновой кислоты (РНК). В публикации согласно PCT WO 2007/074405 описаны способы ингибирования экспрессии целевых генов у беспозвоночных вредителей, в том числе колорадского жука. В публикации согласно PCT WO 2005/110068 описаны способы ингибирования экспрессии целевых генов у беспозвоночных вредителей, в том числе, в частности, у западного кукурузного жука, в качестве средства контроля заражения насекомыми. Кроме того, в публикации согласно PCT WO 2009/091864 описаны композиции и способы супрессии целевых генов из видов насекомых-вредителей, в том числе вредителей из рода Lygus. Молекулы нуклеиновой кислоты, в том числе молекулы для RNAi для нацеливания на H-субъединицу вакуолярной АТФазы, пригодны для контроля популяции и заражения жесткокрылыми вредителями, как описано в публикации заявки на выдачу патента США 2012/0198586. В публикации согласно PCT WO 2012/055982 описана рибонуклеиновая кислота (РНК или двухцепочечная РНК), которая ингибирует или обеспечивает подавление экспрессии целевого гена, который кодирует: рибосомальный белок насекомого, такой как рибосомальный белок L19, рибосомальный белок L40 или рибосомальный белок S27A; субъединицу протеасомы насекомого, такую как белок Rpn6, Pros 25, белок Rpn2, белок бета 1 субъединицы протеасомы или белок бета 2 Pros; β-коатомер COPI-везикулы насекомого, γ-коатомер COPI-везикулы, β'-коатомерный белок или ζ-коатомер COPI-везикулы; белок тетраспанин 2 A насекомого, который представляет собой предполагаемый белок трансмембранного домена; белок насекомого, принадлежащий к семейству актина, такой как актин 5C; белок убиквитин-5E насекомого; белок Sec23 насекомого, который представляет собой активатор ГТФазы, вовлеченной во внутриклеточный транспорт белков; белок "crinkled" насекомого, который представляет собой нестандартный миозин, который вовлечен в двигательную активность; белок "crooked neck" насекомого, который вовлечен в регуляцию ядерного альтернативного сплайсинга mRNA; белок G-субъединицы вакуолярной H+-АТФазы насекомого и Tbp-1 насекомого, такой как Tat-связывающий белок. В публикациях заявок на выдачу патентов США 2012/029750, US 20120297501 и 2012/0322660 описаны интерферирующие рибонуклеиновые кислоты (РНК или двухцепочечная РНК), которые функционируют при поглощении видами насекомых-вредителей с понижающей регуляцией экспрессии целевого гена в указанном насекомом-вредителе, где РНК содержит по меньшей мере один элемент сайленсинга, где элемент сайленсинга представляет собой участок двухцепочечной РНК, содержащий гибридизованные комплементарные цепи, из которых одна цепь содержит или состоит из последовательности нуклеотидов, которая по меньшей мере частично комплементарна целевой нуклеотидной последовательности в пределах целевого гена. В публикации заявки на выдачу патента США 2012/0164205 описаны потенциальные мишени для интерферирующих двухцепочечных рибонуклеиновых кислот для подавления беспозвоночных вредителей, в том числе: гомологичная последовательность Chd3, гомологичная последовательность бета-тубулина, гомологичная последовательность весом 40 кДа V-АТФазы, гомологичная последовательность EF1α, гомологичная последовательность субъединицы p28 протеосомы 26S, гомологичная последовательность эпоксидгидролазы ювенильного гормона, гомологичная последовательность белка хлоридных каналов, зависимых от набухания, гомологичная последовательность белка глюкоза-6-фосфат-1-дегидрогеназы, гомологичная последовательность белка Act42A, гомологичная последовательность фактора 1 АДФ-рибозилирования, гомологичная последовательность белка фактора транскрипции IIB, гомологичные последовательности хитиназы, гомологичная последовательность фермента, конъюгирующего убиквитин, гомологичная последовательность глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы, гомологичная последовательность убиквитина B, гомолог эстеразы ювенильного гормона и гомологичная последовательность альфа-тубулина.

Применение в пестицидном контроле

В уровне техники известны общие способы использования штаммов, содержащих последовательность нуклеиновой кислоты согласно вариантам осуществления или ее вариант, в пестицидном контроле или при конструировании других организмов в качестве пестицидных средств. См., например, патент США № 5039523 и EP 0480762A2.

Могут быть выбраны микроорганизмы-хозяева, которые как известно заселяют "фитосферу" (филлоплан, филлосферу, ризосферу и/или ризоплан) одной или нескольких сельскохозяйственных культур, представляющих интерес. Эти микроорганизмы выбирают таким образом, чтобы они могли успешно конкурировать в конкретной среде с микроорганизмами дикого типа, обеспечивать стабильное поддержание и экспрессию гена, экспрессирующего инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, и желательно обеспечивать улучшенную защиту пестицида от разрушения и инактивации в окружающей среде.

Такие микроорганизмы включают в себя бактерии, водоросли и грибы. Особый интерес представляют микроорганизмы, такие как бактерии, например, Pseudomonas, Erwinia, Serratia, Klebsiella, Xanthomonas, Streptomyces, Rhizobium, Rhodopseudomonas, Methylius, Agrobacterium, Acetobacter, Lactobacillus, Arthrobacter, Azotobacter, Leuconostoc, и Alcaligenes, грибы, в частности дрожжи, например, Saccharomyces, Cryptococcus, Kluyveromyces, Sporobolomyces, Rhodotorula, и Aureobasidium. Особый интерес представляют такие виды бактерий фитосферы как as Pseudomonas syringae, Pseudomonas fluorescens, Pseudomonas chlororaphis, Serratia marcescens, Acetobacter xylinum, Agrobacteria, Rhodopseudomonas spheroides, Xanthomonas campestris, Rhizobium melioti, Alcaligenes entrophus, Clavibacter xyli и Azotobacter vinelandii, а также виды дрожжей фитосферы, такие как Rhodotorula rubra, R. glutinis, R. marina, R. aurantiaca, Cryptococcus albidus, C. diffluens, C. laurentii, Saccharomyces rosei, S. pretoriensis, S. cerevisiae, Sporobolomyces roseus, S. odorus, Kluyveromyces veronae, и Aureobasidium pollulans. Особый интерес представляют пигментированные микроорганизмы. Организмы-хозяева, представляющие особый интерес, включают дрожжи, такие как Rhodotorula spp., Aureobasidium spp., Saccharomyces spp. (такие как S. cerevisiae), Sporobolomyces spp., организмы филлоплана, такие как Pseudomonas spp. (такие как P. aeruginosa, P. fluorescens, P. chlororaphis), Erwinia spp., и Flavobacterium spp., и другие такие организмы, в том числе Agrobacterium tumefaciens, E. coli, Bacillus subtilis, Bacillus cereus и т. п.

Гены, кодирующие инсектицидные полипептиды согласно вариантам осуществления можно вводить в микроорганизмы, которые размножаются на растениях (эпифиты) для доставки инсектицидного полипептида в организм потенциальных целевых вредителей. Например, эпифиты могут представлять собой грамм-положительные или грамм-отрицательные бактерии.

Например, бактерии, колонизирующие корни, можно выделять из растений, представляющих интерес, с помощью способов, известных в уровне техники. А именно, штамм Bacillus cereus, который колонизирует корни, можно выделять из корней растения (см. например Handelsman et al. (1991) Appl. Environ. Microbiol. 56:713-718). Гены, кодирующие инсектицидные полипептиды согласно вариантам осуществления, можно вводить в Bacillus cereus, колонизирующую корни, с помощью стандартных способов, известных в уровне техники.

Гены, кодирующие инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию, можно вводить например в Bacillus, колонизирующую корни, посредством электротрансформации. А именно, гены, кодирующие инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию можно клонировать в челночный вектор, например pHT3101 (Lerecius, et al., (1989) FEMS Microbiol. Letts. 60:211-218. С помощью челночного вектора pHT3101, содержащего кодирующую последовательность конкретного гена инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, можно, например, трансформировать Bacillus, колонизирующую корни, посредством электропорации (Lerecius, et al., (1989) FEMS Microbiol. Letts. 60:211-218).

Экспрессирующие системы можно разрабатывать таким образом, что инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию секретируются снаружи цитоплазмы грамм-отрицательных бактерий, таких как, например, E. coli. Преимуществами обеспечения секреции инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию являются: (1) возможность избежать потенциальных цитотоксических эффектов инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию и (2) улучшение эффективности очистки инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, в том числе без ограничения повышение эффективности выделения и очистки белка в расчете на объем клеточного бульона и снижение времени и/или затрат на извлечение и очистку в пересчете на единицу белка.

Инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию можно создавать так, чтобы они секретировались в E. coli, например путем слияния подходящего сигнального пептида E. coli с амино-терминальным концом инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию. Сигнальные пептиды, распознаваемые E. coli, можно найти в белках, которые, как уже известно, секретируются в E. coli, например белок OmpA (Ghrayeb, et al., (1984) EMBO J, 3:2437-2442). OmpA представляет собой главный белок внешней мембраны E. coli, и, таким образом, полагают, что его сигнальный пептид является эффективным в процессе транслокации. Также, сигнальный пептид OmpA не нужно модифицировать перед процессингом, как может быть в случае других сигнальных пептидов, например сигнального пептида липопротеинов (Duffaud, et al., (1987) Meth. Enzymol. 153:492).

Инсектицидные полипептиды согласно вариантам осуществления можно ферментировать в бактерии-хозяине, а полученные бактерии обрабатывать и использовать в виде микробных распыляемых растворов тем же способом, что и штаммы Bt, которые применялись в виде инсектицидных распыляемых растворов. В случае инсектицидного полипептида по настоящему(-им) раскрытию(-ям), который секретируется Bacillus, сигнал секреции удаляют или подвергают мутации с применением процедур, известных в уровне техники. Такие мутации и/или делеции предотвращают секрецию инсектицидного(-ых) полипептида(-ов) в ростовую среду в ходе ферментации. Инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию остаются в клетке, и затем клетки обрабатывают с целью получения инкапсулированных инсектицидных полипептидов. С данной целью можно применять любой подходящий микроорганизм. Для экспрессии Bt-токсинов в качестве инкапсулированных белков применяли Pseudomonas, и полученные клетки обрабатывали и распыляли в качестве инсектицида (Gaertner, et al., (1993), в Advanced Engineered Pesticides, ed. Kim).

В качестве альтернативы, инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию получают путем введения в клеточного хозяина гетерологичных генов. Экспрессия гетерологичного гена приводит, непосредственно или опосредованно, к выработке и сохранению пестицида внутри клетки. Эти клетки затем обрабатывают при условиях, которые продлевают активность токсина, вырабатываемого в клетке, когда осуществляют применение клетки по отношению к среде целевого(-ых) вредителя(-ей). Полученный продукт сохраняет токсичность токсина. Эти естественным образом инкапсулированные инсектицидные полипептиды можно затем составлять в соответствии с традиционными методиками для внесения в среду пребывания целевого вредителя, например в почву, воду и на листву растений. См., например, EPA 0192319 и ссылочные документы, приведенные в нем.

Пестицидные композиции

В некоторых вариантах осуществления активные ингредиенты можно наносить в форме композиции, и можно наносить на возделываемую площадь или растение, подлежащие обработке, одновременно или последовательно с другими соединениями. Эти соединения могут представлять собой удобрения, средства борьбы с сорняками, криопротекторы, поверхностно-активные вещества, детергенты, пестицидные мыла, масла, применяемые во время состояния покоя, полимеры и/или составы с носителем с замедленным высвобождением или биоразлагаемым носителем, который обеспечивает длительное дозированное внесение в целевой области после однократного нанесения состава. Они также могут представлять собой селективные гербициды, химические инсектициды, вируциды, микробициды, амебоциды, пестициды, фунгициды, бактерициды, нематоциды, моллюскоциды или смеси из нескольких этих препаратов, при необходимости вместе с дополнительными приемлемыми с точки зрения сельского хозяйства носителями, поверхностно-активными веществами или вспомогательными средствами, способствующими нанесению, традиционно используемыми в области техники, связанной с получением составов. Подходящие носители и вспомогательные средства могут быть твердыми или жидкими и соответствуют веществам, обычно используемым в технологии составления, например природным или регенерированным минеральным веществам, растворителям, диспергирующим веществам, смачивающим средствам, веществам, придающим клейкость, связующим или удобрениям. Аналогично, составы можно готовить в виде съедобных "приманок" или формировать в "ловушки" для вредителей, что обеспечивает поедание или заглатывание пестицидного состава целевым вредителем.

Способы нанесения активного ингредиента или агрохимической композиции, которая содержит по меньшей мере один из инсектицидных полипептидов по настоящему раскрытию, вырабатываемых штаммами бактерий, включают нанесение на листья, покрытие семян и внесение в почву. Количество применений и норма применения зависят от интенсивности поражения соответствующим вредителем.

Композицию можно составлять в виде порошка, дуста, пеллеты, гранулы, распыляемого раствора, эмульсии, коллоидного вещества, раствора и т. п., и ее можно получать с помощью таких традиционных способов как сушка, лиофилизация, гомогенизация, экстракция, фильтрация, центрифугирование, осаждение или концентрирование культуры клеток, содержащих полипептид. Во всех таких композициях, которые содержат по меньшей мере один такой пестицидный полипептид, полипептид может присутствовать в концентрации от приблизительно 1% до приблизительно 99% по весу.

Вредителей группы чешуекрылых, двукрылых, настоящих клопов, нематод, полужесткокрылых или жесткокрылых можно уничтожать или снижать их количество в указанной области с помощью способов по настоящему раскрытию или средства можно наносить профилактически на область окружающей среды с целью предотвращения заражения восприимчивым вредителем. Предпочтительно, вредитель заглатывает пестицидно эффективное количество полипептида или контактирует с ним. "Пестицидно эффективное количество", используемое в данном документе, относится к количеству пестицида, которое может приводить к гибели по меньшей мере одного вредителя или к заметно сниженному росту, питанию или нормальному физиологическому развитию вредителя. Данное количество будет варьировать в зависимости от таких факторов, как, например, специфические целевые вредители, подлежащие контролю, специфическая среда, местоположение, растение, культура или сельскохозяйственный участок, подлежащий обработке, условия окружающей среды и способ, норма, концентрация, стабильность и количество применений пестицидно эффективной полипептидной композиции. Составы также могут варьировать в зависимости от климатических условий, экологических соображений, и/или частоты нанесения, и/или тяжести заражения вредителями.

Описанные пестицидные композиции можно получать путем составления либо суспензии бактериальных клеток, кристаллов и/или спор, либо выделенного белкового компонента с требуемым носителем, приемлемым с точки зрения сельского хозяйства. Композиции можно составлять перед введением с помощью надлежащих способов, таких как лиофилизация, сублимационная сушка, высушивание, или в водном носителе, среде или подходящем растворителе, таком как солевой раствор или другой буфер. Составленные композиции могут находиться в форме дуста, или гранулированного материала, или суспензии в масле (растительном или минеральном), или водных эмульсий или эмульсий масло/вода, или в виде смачиваемого порошка, или в комбинации с любым другим материалом носителя, подходящим для сельскохозяйственного применения. Подходящие носители, приемлемые с точки зрения сельского хозяйства, могут быть твердыми или жидкими и хорошо известны из уровня техники. Термин "приемлемый с точки зрения сельского хозяйства носитель" охватывает все вспомогательные средства, инертные компоненты, диспергирующие вещества, поверхностно-активные вещества, вещества, придающие клейкость, связующие и т. д., которые обычно применяют в технологии составления пестицидов; причем они хорошо известны специалистам по составлению пестицидов. Составы можно смешивать с одним или несколькими твердыми или жидкими вспомогательными средствами и получать с помощью различных способов, например, путем равномерного перемешивания, смешивания и/или размалывания пестицидной композиции с подходящими вспомогательными средствами с применением традиционных методик составления. Подходящие составы и способы нанесения описаны в патенте США № 6468523, включенном в данный документ с помощью ссылки. Растения можно также обрабатывать одной или несколькими химическими композициями, в том числе одним или несколькими гербицидами, инсектицидами или фунгицидами. Иллюстративные химические композиции включают следующее. Гербициды для фруктов/овощей: атразин, бромацил, диурон, глифосат, линурон, метрибузин, симазин, трифлуралин, флуазифоп, глуфосинат, галосульфурон от Gowan, паракват, пропизамид, сетоксидим, бутафенацил, галосульфурон, индазифлам; инсектициды для фруктов/овощей: алдикарб, Bacillus thuriengiensis, карбарил, карбофуран, хлорпирифос, циперметрин, дельтаметрин, диазинон, малатион, абамектин, цифлутрин/бета-цифлутрин, эсфенвалерат, лямбда-цигалотрин, ацеквиноцил, бифеназат, метоксифенозид, новалурон, кромафенозид, тиаклоприд, динотефуран, флуакрипирим, толфенпирад, клотианидин, спиродиклофен, гамма-цигалотрин, спиромезифен, спиносад, ринаксипир, циазипир, спинотерам, трифлумурон, спиротетрамат, имидаклоприд, флубендиамид, тиодикарб, метафлумизон, сульфоксафлор, цифлуметофен, цианопирафен, имидаклоприд, клотианидин, тиаметоксам, спиноторам, тиодикарб, флоникамид, метиокарб, эмамектин-бензоат, индоксакарб, фортиазат, фенамифос, кадусафос, пирипроксифен, фенбутатин-оксид, гекстиазокс, метомил, 4-[[(6-хлорпиридин-3-ил)метил](2,2-дифторэтил)амино]фуран-2(5H)-он; фунгициды для фруктов/овощей: карбендазим, хлороталонил, EBDC, сера, тиофанат-метил, азоксистробин, цимоксанил, флуазинам, фосетил, ипродион, крезоксим-метил, металаксил/мефеноксам, трифлоксистробин, этабоксам, ипроваликарб, трифлоксистробин, фенгексамид, окспоконазола фумарат, циазофамид, фенамидон, зоксамид, пикоксистробин, пираклостробин, цифлуфенамид, боскалид; гербициды для злаков: изопротурон, бромоксинил, иоксинил, фенокси-соединения, хлорсульфурон, клодинафоп, диклофоп, дифлуфеникан, феноксапроп, флорасулам, флуроксипир, метсульфурон, триасульфурон, флукарбазон, йодосульфурон, пропоксикарбазон, пиколинафен, мезосульфурон, бефлубутамид, пиноксаден, амидосульфурон, тифенсульфурон-метил, трибенурон, флупирсульфурон, сульфосульфурон, пирасульфотол, пироксулам, флуфенацет, тралкоксидим, пироксасульфон; фунгициды для злаков: карбендазим, хлороталонил, азоксистробин, ципроконазол, ципродинил, фенпропиморф, эпоксиконазол, крезоксим-метил, квиноксифен, тебуконазол, трифлоксистробин, симеконазол, пикоксистробин, пираклостробин, димоксистробин, протиоконазол, флуоксастробин; инсектициды для злаков: диметоат, лямбда-цигалотрин, дельтаметрин, альфа-циперметрин, β-цифлутрин, бифентрин, имидаклоприд, клотианидин, тиаметоксам, тиаклоприд, ацетамиприд, динетофуран, хлорпирифос, метамидофос, оксидеметон-метил, пиримикарб, метиокарб; гербициды для маиса: атразин, алахлор, бромоксинил, ацетохлор, дикамба, клопиралид, (S-)диметенамид, глуфосинат, глифосат, изоксафлутол, (S-)метолахлор, мезотрион, никосульфурон, примисульфурон, римсульфурон, сулькотрион, форамсульфурон, топрамезон, темботрион, сафлуфенацил, тиенкарбазон, флуфенацет, пироксасульфон; инсектициды для маиса: карбофуран, хлорпирифос, бифентрин, фипронил, имидаклоприд, лямбда-цигалотрин, тефлутрин, тербуфос, тиаметоксам, клотианидин, спиромезифен, флубендиамид, трифлумурон, ринаксипир, дельтаметрин, тиодикарб, β-цифлутрин, циперметрин, бифентрин, люфенурон, трифлуморон, тефлутрин, тебупиримфос, этипрол, циазипир, тиаклоприд, ацетамиприд, динетофуран, авермектин, метиокарб, спиродиклофен, спиротетрамат; фунгициды для маиса: фенитропан, тирам, протиоконазол, тебуконазол, трифлоксистробин; гербициды для риса: бутахлор, пропанил, азимсульфурон, бенсульфурон, цигалофоп, даимурон, фентразамид, имазосульфурон, мефенацет, оксазикломефон, пиразосульфурон, пирибутикарб, квинклорак, тиобенкарб, инданофан, флуфенацет, фентразамид, галосульфурон, оксазикломефон, бензобициклон, пирифталид, пеноксулам, биспирибак, оксадиаргил, этоксисульфурон, претилахлор, мезотрион, тефурилтрион, оксадиазон, феноксапроп, пиримисульфан; инсектициды для риса: диазинон, фенитротион, фенобукарб, монокротофос, бенфуракарб, бупрофезин, динотефуран, фипронил, имидаклоприд, изопрокарб, тиаклоприд, кромафенозид, тиаклоприд, динотефуран, клотианидин, этипрол, флубендиамид, ринаксипир, дельтаметрин, ацетамиприд, тиаметоксам, циазипир, спиносад, спиноторам, эмамектин-бензоат, циперметрин, хлорпирифос, картап, метамидофос, этофенпрокс, триазофос, 4-[[(6-хлорпиридин-3-ил)метил](2,2-дифторэтил)амино]фуран-2(5H)-он, карбофуран, бенфуракарб; фунгициды для риса: тиофанат-метил, азоксистробин, карпропамид, эдифенфос, феримзон, ипробенфос, изопротиолан, пенцикурон, пробеназол, пироквилон, трициклазол, трифлоксистробин, диклоцимет, феноксанил, симеконазол, тиадинил; гербициды для хлопчатника: диурон, флуометурон, MSMA, оксифлуорфен, прометрин, трифлуралин, карфентразон, клетодим, флуазифоп-бутил, глифосат, норфлуразон, пендиметалин, пиритиобак-натрий, трифлоксисульфурон, тепралоксидим, глуфосинат, флумиоксазин, тидиазурон; инсектициды для хлопчатника: ацефат, алдикарб, хлорпирифос, циперметрин, дельтаметрин, малатион, монокротофос, абамектин, ацетамиприд, эмамектин бензоат, имидаклоприд, индоксакарб, лямбда-цигалотрин, спиносад, тиодикарб, гамма-цигалотрин, спиромезифен, пиридалил, флоникамид, флубендиамид, трифлумурон, ринаксипир, бета-цифлутрин, спиротетрамат, клотианидин, тиаметоксам, тиаклоприд, динетофуран, флубендиамид, циазипир, спиносад, спиноторам, гамма-цигалотрин, 4-[[(6-хлорпиридин-3-ил)метил](2,2-дифторэтил)амино]фуран-2(5H)-он, тиодикарб, авермектин, флоникамид, пиридалил, спиромезифен, сульфоксафлор, профенофос, триазофос, эндосульфан; фунгициды для хлопчатника: этридиазол, металаксил, квинтозен; гербициды для сои: алахлор, бентазон, трифлуралин, хлоримурон-этил, хлорансулам-метил, феноксапроп, фомесафен, флуазифоп, глифосат, имазамокс, имазаквин, имазетапир, (S-)метолахлор, метрибузин, пендиметалин, тепралоксидим, глуфосинат; инсектициды для сои: лямбда-цигалотрин, метомил, паратион, тиокарб, имидаклоприд, клотианидин, тиаметоксам, тиаклоприд, ацетамиприд, динетофуран, флубендиамид, ринаксипир, циазипир, спиносад, спиноторам, эмамектин-бензоат, фипронил, этипрол, дельтаметрин, β-цифлутрин, гамма- и лямбда-цигалотрин, 4-[[(6-хлорпиридин-3-ил)метил](2,2-дифторэтил)амино]фуран-2(5H)-он, спиротетрамат, спинодиклофен, трифлумурон, флоникамид, тиодикарб, бета-цифлутрин; фунгициды для сои: азоксистробин, ципроконазол, эпоксиконазол, флутриафол, пираклостробин, тебуконазол, трифлоксистробин, протиоконазол, тетраконазол; гербициды для сахарной свеклы: хлоридазон, десмедифам, этофумезат, фенмедифам, триаллат, клопиралид, флуазифоп, ленацил, метамитрон, квинмерак, циклоксидим, трифлусульфурон, тепралоксидим, квизалофоп; инсектициды для сахарной свеклы: имидаклоприд, клотианидин, тиаметоксам, тиаклоприд, ацетамиприд, динетофуран, дельтаметрин, β-цифлутрин, гамма/лямбда-цигалотрин, 4-[[(6-хлорпиридин-3-ил)метил](2,2-дифторэтил)амино]фуран-2(5H)-он, тефлутрин, ринаксипир, циаксипир, фипронил, карбофуран; гербициды для канолы: клопиралид, диклофоп, флуазифоп, глуфосинат, глифосат, метазахлор, трифлуралин, этаметсульфурон, квинмерак, квизалофоп, клетодим, тепралоксидим; фунгициды для канолы: азоксистробин, карбендазим, флудиоксонил, ипродион, прохлораз, винклозолин; инсектициды для канолы: карбофурановые фосфороорганические соединения, пиретроиды, тиаклоприд, дельтаметрин, имидаклоприд, клотианидин, тиаметоксам, ацетамиприд, динетофуран, β-цифлутрин, гамма и лямбда-цигалотрин, тау-флувалериат, этипрол, спиносад, спиноторам, флубендиамид, ринаксипир, циазипир, 4-[[(6-хлорпиридин-3-ил)метил](2,2-дифторэтил)амино]фуран-2(5H)-он.

В некоторых вариантах осуществления гербицид представляет собой атразин, бромацил, диурон, хлорсульфурон, метсульфурон, тифенсульфурон-метил, трибенурон, ацетохлор, дикамбу, изоксафлутол, никосульфурон, римсульфурон, пиритиобак-натрий, флумиоксазин, хлоримурон-этил, метрибузин, квизалофоп, S-метолахлор, гексазинон или их комбинацию.

В некоторых вариантах осуществления инсектицид представляет собой эсфенвалерат, хлорантранилипрол, метомил, индоксакарб, оксамил или их комбинацию.

Пестицидная и инсектицидная активность

"Вредитель" включает без ограничения насекомых, грибки, бактерии, нематод, клещей, иксодовых клещей и т. п. Насекомые-вредители включают насекомых, выбранных из отрядов Coleoptera, Diptera, Hymenoptera, Lepidoptera, Mallophaga, Homoptera, Hemiptera, Orthroptera, Thysanoptera, Dermaptera, Isoptera, Anoplura, Siphonaptera, Trichoptera и т. д., в частности Lepidoptera и Coleoptera.

Специалистам в данной области будет понятно, что не все соединения в равной степени эффективны в отношении всех вредителей. Соединения согласно вариантам осуществления проявляют активность в отношении насекомых-вредителей, которые могут включать экономически важных вредителей агрономических, лесных, тепличных продуктов, продуктов питомников декоративных растений, продуктов пищи и волокнистых продуктов, продуктов, связанных со здоровьем людей и животных, продуктов, связанных с домашней и коммерческой структурой, товаров для дома и продуктов для хранения.

Личинки из отряда Lepidoptera включают без ограничения совок, подгрызающих совок, пядениц и гелиотин семейства Noctuidae Spodoptera frugiperda JE Smith (совка травяная); S. exigua Hübner (совка малая); S. litura Fabricius (табачная совка, гусеница, пожирающая соцветия); Mamestra configurata Walker (совка Берта); M. brassicae Linnaeus (совка капустная); Agrotis ipsilon Hufnagel (совка-ипсилон); A. orthogonia Morrison (совка прямоугольная); A. subterranea Fabricius (совка зернистая); Alabama argillacea Hübner (совка хлопковая американская); Trichoplusia ni Hübner (совка ни); Pseudoplusia includens Walker (соевая совка); Anticarsia gemmatalis Hübner (совка бархатных бобов); Hypena scabra Fabricius (совка клеверная); Heliothis virescens Fabricius (табачная листовертка); Pseudaletia unipuncta Haworth (совка луговая); Athetis mindara Barnes и Mcdunnough (шершавая совка); Athetis lepigone; Euxoa messoria Harris (чернобокая гусеница совки); Earias insulana Boisduval (совка хлопковая египетская); E. vittella Fabricius (совка пятнистая); Helicoverpa armigera Hübner (совка щетинконогая резедовая); H. zea Boddie (совка кукурузная или хлопковая совка); Melanchra picta Harris (совка); Egira (Xylomyges) curialis Grote (цитрусовая совка); огневок, чехлоносок, бабочек, строящих паутинные гнезда, конусных бабочек Sesamia inferens (азиатский розовый стеблевой точильщик) и вредителей, скелетирующих листья, из семейства Pyralidae Ostrinia nubilalis Hübner (мотылек стеблевой кукурузный); Amyelois transitella Walker (гусеницы, повреждающие рубчики цитрусовых); Anagasta kuehniella Zeller (огневка мельничная); Cadra cautella Walker (огневка сухофруктовая); Chilo suppressalis Walker (желтая рисовая огневка); C. partellus (сорговая огневка); Corcyra cephalonica Stainton (огневка рисовая); Crambus caliginosellus Clemens (огневка кукурузная); C. teterrellus Zincken (огневка мятликовая); Cnaphalocrocis medinalis Guenée (листовертка рисовая); Desmia funeralis Hübner (виноградная листовертка); Diaphania hyalinata Linnaeus (дынная огневка); D. nitidalis Stoll (огневка огурцов-пикули); Diatraea grandiosella Dyar (огневка кукурузная юго-западная), D. saccharalis Fabricius (огневка сахарного тростника); Eoreuma loftini Dyar (мексиканская рисовая огневка); Ephestia elutella Hübner (огневка зерновая (какао)); Galleria mellonella Linnaeus (большая восковая моль); Herpetogramma licarsisalis Walker (огневка-травянка); Homoeosoma electellum Hulst (огневка подсолнечниковая); Elasmopalpus lignosellus Zeller (малая кукурузная огневка); Achroia grisella Fabricius (малая восковая моль); Loxostege sticticalis Linnaeus (луговой мотылек); Orthaga thyrisalis Walker (чайная моль); Maruca testulalis Geyer (огневка акациевая); Plodia interpunctella Hübner (моль индийская мучная); Scirpophaga incertulas Walker (стеблевая рисовая огневка); Udea rubigalis Guenée (огневка ржаво-коричневая); и листоверток, листоверток-почкоедов, плодожорок и гусениц-вредителей плодов из семейства Tortricidae Acleris gloverana Walsingham (западная черноголовая листовертка); A. variana Fernald (восточная черноголовая листовертка); Archips argyrospila Walker (листовертка плодовых деревьев); A. rosana Linnaeus (европейская листовертка) и другие виды Archips, Adoxophyes orana Fischer von Rösslerstamm (листовертка сетчатая); Cochylis hospes Walsingham (полосатая подсолнечниковая моль); Cydia latiferreana Walsingham (лещинная плодожорка); C. pomonella Linnaeus (яблонная плодожорка); Platynota flavedana Clemens (листовертка изменчивая); P. stultana Walsingham (листовертка всеядная); Lobesia botrana Denis & Schiffermüller (листовертка европейская виноградная); Spilonota ocellana Denis & Schiffermüller (листовертка почковая); Endopiza viteana Clemens (листовертка виноградная); Eupoecilia ambiguella Hübner (листовертка гроздевая); Bonagota salubricola Meyrick (листовертка бразильская яблочная); Grapholita molesta Busck (плодожорка восточная персиковая); Suleima helianthana Riley (листовертка подсолнечниковая); Argyrotaenia spp.; Choristoneura spp.

Другие выбранные сельскохозяйственные вредители из отряда Lepidoptera включают в себя без ограничения Alsophila pometaria Harris (осенний плодовый червь); Anarsia lineatella Zeller (моль фруктовая полосатая); Anisota senatoria J.E. Smith (сатурния оранжевая дубовая); Antheraea pernyi Guérin-Méneville (китайский дубовый шелкопряд); Bombyx mori Linnaeus (тутовый шелкопряд); Bucculatrix thurberiella Busck (кривоусая хлопковая моль); Colias eurytheme Boisduval (люцерновая желтушка); Conogethes punctiferalis (желтая персиковая моль); Datana integerrima Grote & Robinson (хохлатка ореховая); Dendrolimus sibiricus Tschetwerikov (сибирский шелкопряд), Ennomos subsignaria Hübner (пяденица ильмовая); Erannis tiliaria Harris (пяденица липовая); Euproctis chrysorrhoea Linnaeus (шелкопряд золотистый); Harrisina americana Guérin-Méneville (пироморфида американская); Hemileuca oliviae Cockrell (гусеница бабочки-сатурнии); Hyphantria cunea Drury (американская белая бабочка); Keiferia lycopersicella Walsingham (томатная моль); Lambdina fiscellaria fiscellaria Hulst (пяденица гемлоковая восточная); L. fiscellaria lugubrosa Hulst (пяденица гемлоковая западная); Leucoma salicis Linnaeus (волнянка ивовая); Lymantria dispar Linnaeus (непарный шелкопряд); Manduca quinquemaculata Haworth (бражник пятиточечный, томатный бражник); M. sexta Haworth (томатный бражник, табачный бражник); Operophtera brumata Linnaeus (пяденица зимняя); Paleacrita vernata Peck (пяденица весенняя); Papilio cresphontes Cramer (парусник кресфонтес, «апельсиновая собака»); Phryganidia californica Packard (коконопряд кольчатый калифорнийский); Phyllocnistis citrella Stainton (цитрусовая минирующая мушка); Phyllonorycter blancardella Fabricius (моль-пестрянка плодовая нижнесторонняя); Pieris brassicae Linnaeus (белянка капустная большая); P. rapae Linnaeus (белянка капустная малая); P. napi Linnaeus (белянка брюквенная); Platyptilia carduidactyla Riley (пальцекрылка артишоковая); Plutella xylostella Linnaeus (моль капустная); Pectinophora gossypiella Saunders (розовый коробочный червь); Pontia protodice Boisduval и Leconte (клетчатая белянка); Sabulodes aegrotata Guenée (всеядная пяденица); Schizura concinna J.E. Smith (хохлатка); Sitotroga cerealella Olivier (моль ячменная ангумуазская); Thaumetopoea pityocampa Schiffermuller (походный шелкопряд сосновый); Tineola bisselliella Hummel (моль комнатная); Tuta absoluta Meyrick (томатная моль); Yponomeuta padella Linnaeus (горностаевая моль плодовая); Heliothis subflexa Guenée; Malacosoma spp. и Orgyia spp.

Представляют интерес личинки и имаго из отряда Coleoptera, в том числе долгоносики из семейств Anthribidae, Bruchidae и Curculionidae (в том числе без ограничения: Anthonomus grandis Boheman (долгоносик хлопковый); Lissorhoptrus oryzophilus Kuschel (долгоносик рисовый водяной); Sitophilus granarius Linnaeus (долгоносик амбарный); S. oryzae Linnaeus (долгоносик рисовый); Hypera punctata Fabricius (долгоносик точечный); Cylindrocopturus adspersus LeConte (долгоносик подсолнечниковый стеблевой); Smicronyx fulvus LeConte (красный подсолнечниковый долгоносик); S. sordidus LeConte (серый подсолнечниковый долгоносик); Sphenophorus maidis Chittenden (долгоносик маисовый)); земляные блошки, огуречные листоеды, корневые черви, листоеды, картофельные жуки и листовые минеры семейства Chrysomelidae (в том числе без ограничения: Leptinotarsa decemlineata Say (колорадский жук); Diabrotica virgifera virgifera LeConte (западный кукурузный жук); D. barberi Smith and Lawrence (северный кукурузный жук); D. undecimpunctata howardi Barber (южный кукурузный жук); Chaetocnema pulicaria Melsheimer (земляная кукурузная блошка); Phyllotreta cruciferae Goeze (блошка крестоцветная); Phyllotreta striolata (полосатая блошка); Colaspis brunnea Fabricius (листоед виноградный); Oulema melanopus Linnaeus (пьявица красногрудая); Zygogramma exclamationis Fabricius (подсолнечниковый листоед)); жуки из семейства Coccinellidae (в том числе без ограничения Epilachna varivestis Mulsant (мексиканская фасолевая коровка)); хрущи и другие жуки из семейства Scarabaeidae (в том числе без ограничения: Popillia japonica Newman (хрущик японский); Cyclocephala borealis Arrow (дупляк северный, хрущ); C. immaculata Olivier (дупляк южный, хрущ); Rhizotrogus majalis Razoumowsky (хрущ европейский); Phyllophaga crinita Burmeister (личинка хруща); Ligyrus gibbosus De Geer (жук морковный)); кожееды семейства Dermestidae; проволочники из семейства Elateridae, Eleodes spp., Melanotus spp.; Conoderus spp.; Limonius spp.; Agriotes spp.; Ctenicera spp.; Aeolus spp.; короеды из семейства Scolytidae и жуки из семейства Tenebrionidae.

Представляют интерес имаго и незрелые особи отряда Diptera, в том числе минирующие мушки Agromyza parvicornis Loew (кукурузная минирующая мушка); галлицы (в том числе без ограничения: Contarinia sorghicola Coquillett (галлица сорговая); Mayetiola destructor Say (гессенская муха); Sitodiplosis mosellana Géhin (злаковая оранжевая галлица); Neolasioptera murtfeldtiana Felt, (подсолнечниковая галлица)); плодовые мушки (Tephritidae), Oscinella frit Linnaeus (плодовые мушки); цветочные мухи (в том числе без ограничения: Delia platura Meigen (муха ростковая); D. coarctata Fallen (муха озимая) и другие Delia spp., Meromyza americana Fitch (американская меромиза); Musca domestica Linnaeus (комнатные мухи); Fannia canicularis Linnaeus, F. femoralis Stein (малые комнатные мухи); Stomoxys calcitrans Linnaeus (жигалки осенние)); мухи полевые, жигалки, мухи мясные, Chrysomya spp.; Phormia spp. и другие мухи-вредители надсемейства Muscoidea, слепни Tabanus spp.; носоглоточные оводы Gastrophilus spp.; Oestrus spp.; бычьи оводы Hypoderma spp.; пестряки Chrysops spp.; Melophagus ovinus Linnaeus (кровососки овечьи) и другие Brachycera, комары Aedes spp.; Anopheles spp.; Culex spp.; мошки Prosimulium spp.; Simulium spp.; мокрецы, москиты, сциариды и другие Nematocera.

В качестве представляющих интерес насекомых включены имаго и насекомые на стадии нимфы отрядов Hemiptera и Homoptera, такие как без ограничения хермесы из семейства Adelgidae, слепняки из семейства Miridae, цикады из семейства Cicadidae, цикадки, Empoasca spp.; из семейства Cicadellidae, насекомые надсемейства Fulgoroidea из семейств Cixiidae, Flatidae, Fulgoroidea, Issidae и Delphacidae, горбатки из семейства Membracidae, листоблошки из семейства Psyllidae, белокрылки из семейства Aleyrodidae, тли из семейства Aphididae, филлоксеры из семейства Phylloxeridae, мучнистые червецы из семейства Pseudococcidae, червецы из семейств Asterolecanidae, Coccidae, Dactylopiidae, Diaspididae, Eriococcidae Ortheziidae, Phoenicococcidae и Margarodidae, кружевницы из семейства Tingidae, щитники из семейства Pentatomidae, клопы-черепашки, Blissus spp.; и другие наземники из семейства Lygaeidae, пенницы из семейства Cercopidae, краевики из семейства Coreidae, а также красноклопы и красноклопы хлопковые из семейства Pyrrhocoridae.

Важные с точки зрения сельского хозяйства представители отряда Homoptera дополнительно включают без ограничения: Acyrthisiphon pisum Harris (тля гороховая); Aphis craccivora Koch (тля люцерновая); A. fabae Scopoli (тля свекловичная); A. gossypii Glover (тля хлопковая, тля бахчевая); A. maidiradicis Forbes (тля кукурузная корневая); A. pomi De Geer (тля яблоневая); A. spiraecola Patch (тля зеленая цитрусовая); Aulacorthum solani Kaltenbach (тля картофельная обыкновенная); Chaetosiphon fragaefolii Cockerell (тля земляничная американская); Diuraphis noxia Kurdjumov/Mordvilko (русская пшеничная тля); Dysaphis plantaginea Paaserini (тля яблоневая розовая); Eriosoma lanigerum Hausmann (тля яблоневая кровяная); Brevicoryne brassicae Linnaeus (капустная тля); Hyalopterus pruni Geoffroy (тля сливовая опыленная); Lipaphis erysimi Kaltenbach (тля ложнокапустная); Metopolophium dirrhodum Walker (розанно-злаковая тля); Macrosiphum euphorbiae Thomas (большая картофельная тля); Myzus persicae Sulzer (тля персиковая, тля оранжерейная); Nasonovia ribisnigri Mosley (тля салатная зеленая); Pemphigus spp. (тли корневые и тли галловые); Rhopalosiphum maidis Fitch (тля сорговая); R. padi Linnaeus (тля черемуховая обыкновенная); Schizaphis graminum Rondani (тля злаковая обыкновенная); Sipha flava Forbes (тля желтая сахарного тростника); Sitobion avenae Fabricius (тля листовая); Therioaphis maculata Buckton (пятнистая люцерновая тля); Toxoptera aurantii Boyer de Fonscolombe (тля померанцевая) и T. citricida Kirkaldy (тля цитрусовая); Adelges spp. (хермесы); Phylloxera devastatrix Pergande (филлоксера гикори); Bemisia tabaci Gennadius (белокрылка табачная, белокрылка хлопковая); B. argentifolii Bellows и Perring (белокрылка магнолиевая); Dialeurodes citri Ashmead (белокрылка цитрусовая); Trialeurodes abutiloneus (белокрылка полосатокрылая) и T. vaporariorum Westwood (белокрылка тепличная); Empoasca fabae Harris (цикадка картофельная); Laodelphax striatellus Fallen (темная цикадка); Macrolestes quadrilineatus Forbes (цикадка астровая); Nephotettix cinticeps Uhler (цикадка зеленая); N. nigropictus Stål (рисовая цикадка); Nilaparvata lugens Stål (бурая рисовая цикадка); Peregrinus maidis Ashmead (цикадка кукурузная); Sogatella furcifera Horvath (цикадка белоспинная); Sogatodes orizicola Muir (дельфацид рисовый); Typhlocyba pomaria McAtee (цикадка яблоневая); Erythroneoura spp. (цикадки виноградные); Magicicada septendecim Linnaeus (периодическая цикада); Icerya purchasi Maskell (червец австралийский желобчатый); Quadraspidiotus perniciosus Comstock (щитовка калифорнийская); Planococcus citri Risso (мучнистый червец виноградный); Pseudococcus spp. (другие мучнистые червецы); Cacopsylla pyricola Foerster (листоблошка грушевая); Trioza diospyri Ashmead (листоблошка хурмовая).

Виды, представляющие интерес с точки зрения сельского хозяйства, из отряда Hemiptera включают без ограничения: Acrosternum hilare Say (щитник зеленый); Anasa tristis De Geer (клоп-ромбовик печальный); Blissus leucopterus leucopterus Say (клоп-черепашка); Corythuca gossypii Fabricius (кружевница хлопковая); Cyrtopeltis modesta Distant (клоп томатный); Dysdercus suturellus Herrich-Schäffer (красноклоп хлопковый); Euschistus servus Say (клоп коричневый вонючий); E. variolarius Palisot de Beauvois (щитник однопятнистый); Graptostethus spp. (комплекс клопов-наземников); Leptoglossus corculus Say (клоп-краевик сосновый); Lygus lineolaris Palisot de Beauvois (клоп луговой); L. Hesperus Knight (слепняк западный матовый); L. pratensis Linnaeus (клопик полевой); L. rugulipennis Poppius (клоп травяной европейский); Lygocoris pabulinus Linnaeus (зеленый слепняк); Nezara viridula Linnaeus (зеленый овощной клоп); Oebalus pugnax Fabricius (клоп-щитник рисовый); Oncopeltus fasciatus Dallas (клоп молочайный большой); Pseudatomoscelis seriatus Reuter (клоп-слепняк хлопковый).

Кроме того, варианты осуществления могут быть эффективными в отношении Hemiptera, таких как Calocoris norvegicus Gmelin (клопик картофельный); Orthops campestris Linnaeus; Plesiocoris rugicollis Fallen (клоп яблоневый северный); Cyrtopeltis modestus Distant (томатный клоп); Cyrtopeltis notatus Distant (клоп-слепняк); Spanagonicus albofasciatus Reuter (слепняк белоточечный); Diaphnocoris chlorionis Say (клоп-слепняк гледичии); Labopidicola allii Knight (слепняк луковый); Pseudatomoscelis seriatus Reuter (слепняк хлопковый); Adelphocoris rapidus Say (клоп быстрый); Poecilocapsus lineatus Fabricius (слепняк четырехлинейный); Nysius ericae Schilling (низиус вересковый); Nysius raphanus Howard (ложная черепашка); Nezara viridula Linnaeus (зеленый овощной клоп); Eurygaster spp.; Coreidae spp.; Pyrrhocoridae spp.; Tinidae spp.; Blostomatidae spp.; Reduviidae spp. и Cimicidae spp.

Также включены имаго и личинки из отряда Acari (клещи), такие как Aceria tosichella Keifer (галловый клещ пшеничный); Petrobia latens Müller (петробия многоядная); клещики паутинные и клещики красные семейства Tetranychidae, Panonychus ulmi Koch (красный плодовый клещ); Tetranychus urticae Koch (обыкновенный паутинный клещ); (T. mcdanieli McGregor (клещик Макданиела); T. cinnabarinus Boisduval (красный паутинный клещик); T. turkestani Ugarov & Nikolski (туркестанский паутинный клещик); плоские клещи семейства Tenuipalpidae, Brevipalpus lewisi McGregor (оранжевый клещ); ржавчинные и почковые клещи семейства Eriophyidae и другие клещи, питающиеся листьями, а также клещи, важные для здоровья человека и животных, т. е. пылевые клещи семейства Epidermoptidae, железницы семейства Demodicidae, зерновые клещи семейства Glycyphagidae, иксодовые клещи отряда Ixodidae. Ixodes scapularis Say (черноногий клещ); I. holocyclus Neumann (австралийский паралитический клещ); Dermacentor variabilis Say (клещ иксодовый собачий); Amblyomma americanum Linnaeus (иксодовый клещ Amblyomma) и конские и чесоточные клещи семейств Psoroptidae, Pyemotidae и Sarcoptidae.

Представляющими интерес насекомыми-вредителями из отряда Thysanura являются, например, Lepisma saccharina Linnaeus (чешуйница); Thermobia domestica Packard (термобия).

Дополнительные охватываемые вредители-артроподы включают: пауков из отряда Araneae, таких как Loxosceles reclusa Gertsch and Mulaik (бурый паук-отшельник) и Latrodectus mactans Fabricius (черная вдова), а также многоножек из отряда Scutigeromorpha, таких как Scutigera coleoptrata Linnaeus (обыкновенная мухоловка).

Насекомое-вредитель, представляющее интерес, включает надсемейство щитников и других родственных насекомых, в том числе без исключения виды, принадлежащие к семейству Pentatomidae (Nezara viridula, Halyomorpha halys, Piezodorus guildini, Euschistus servus, Acrosternum hilare, Euschistus heros, Euschistus tristigmus, Acrosternum hilare, Dichelops furcatus, Dichelops melacanthus, и Bagrada hilaris (клоп из рода Bagrada)), семейству Plataspidae (Megacopta cribraria - полушаровидный щитник) и семейству Cydnidae (Scaptocoris castanea - коричневый клоп-землекоп), а также виды Lepidoptera, в том числе без ограничения: моль капустную, например Helicoverpa zea Boddie; соевую совку, например Pseudoplusia includens Walker, и совку бархатных бобов, например Anticarsia gemmatalis Hübner.

Способы измерения пестицидной активности хорошо известны в уровне техники. См., например, Czapla and Lang, (1990) J. Econ. Entomol. 83:2480-2485; Andrews, et al., (1988) Biochem. J. 252:199-206; Marrone, et al., (1985) J. of Economic Entomology 78:290-293 и патент США № 5743477, все из которых включены в данный документ с помощью ссылки во полном объеме. Как правило, белок смешивают и применяют в анализах питания. См., например, Marrone, et al., (1985) J. of Economic Entomology 78:290-293. Такие анализы могут включать приведение растений в контакт с одним или несколькими вредителями и определение способности растения выживать и/или вызывать гибель вредителей.

Нематоды включают паразитических нематод, таких как галловые, цистообразующие и ранящие нематоды, в том числе Heterodera spp., Meloidogyne spp. и Globodera spp.; в частности, представителей цистообразующих нематод, в том числе без ограничения Heterodera glycines (соевая цистообразующая нематода); Heterodera schachtii (цистообразующая нематода свеклы); Heterodera avenae (цистообразующая нематода злаков), а также Globodera rostochiensis и Globodera pailida (цистообразующые нематоды картофеля). Ранящие нематоды включают Pratylenchus spp.

Средство для обработки семян

Для защиты и для повышения продукции урожая и улучшения технологий усовершенствования признаков дополнительные средства для обработки семян могут обеспечивать дополнительную гибкость культурных растений и экономически эффективный контроль в отношении насекомых, сорняков и заболеваний. Семенной материал можно обрабатывать, обычно обрабатывать поверхность с помощью композиции, содержащей комбинации химических или биологических гербицидов, антидотов гербицидов, инсектицидов, фунгицидов, ингибиторов и усилителей прорастания, питательных веществ, регуляторов и активаторов роста растений, бактерицидов, нематоцидов, авицидов и/или моллюскоцидов. Эти соединения обычно составляют вместе с дополнительными носителями, поверхностно-активными веществами или вспомогательными средствами, способствующими нанесению, традиционно используемыми в области техники, связанной с получением составов. Покрытия можно наносить с помощью пропитки материала для размножения жидким составом или с помощью покрытия комбинированным влажным или сухим составом. Примеры различных типов соединений, которые можно применять в качестве средств для обработки семян, представлены в The Pesticide Manual: A World Compendium, C.D.S. Tomlin Ed., Published by the British Crop Production Council, который включен в данный документ с помощью ссылки.

Некоторые средства для обработки семян, которые можно применять в отношении семян культур, включают без ограничения один или несколько из абсцизовой кислоты, ацибензолар-S-метила, авермектина, амитрола, азаконазола, азоспириллума, азадирахтина, азоксистробина, Bacillus spp. (в том числе один или несколько из видов cereus, firmus, megaterium, pumilis, sphaericus, subtilis и/или thuringiensis), Bradyrhizobium spp. (в том числе один или несколько из betae, canariense, elkanii, iriomotense, japonicum, liaonigense, pachyrhizi и/или yuanmingense), каптана, карбоксина, хитозана, клотианидина, меди, циазипира, дифеноконазола, этидиазола, фипронила, флудиоксонила, флуоксастробина, флуквинконазола, флуразола, флуксофенима, белка гарпина, имазалила, имидаклоприда, ипконазола, изофлавеноидов, липохитоолигосахарида, манкозеба, марганца, манеба, мефеноксама, металаксила, метконазола, миклобутанила, PCNB, пенфлуфена, пинециллума, пентиопирада, перметрина, пикоксистробина, протиоконазола, пираклостробина, ринаксипира, S-метолахлора, сапонина, седаксана, TCMTB, тебуконазола, тиабендазола, тиаметоксама, тиокарба, тирама, толклофос-метила, триадименола, триходермы, трифлоксистробина, тритиконазола и/или цинка. Покрытие семян PCNB, относящееся к номеру регистрации EPA 00293500419, содержит квинтозен и терразол. TCMTB обозначает 2-(тиоцианометилтио)бензотиазол.

Сорта семян и семена со специфическими трансгенными признаками можно тестировать для определения того, какие дополнительные варианты обработки семян и нормы внесения могут дополнять такие сорта и трансгенные признаки для повышения урожайности. Например, сорт с хорошей потенциальной урожайностью, но восприимчивостью к пыльной головне, может выиграть от применения средства для обработки семян, которое обеспечивает защиту от пыльной головни, сорт с хорошей потенциальной урожайностью, но восприимчивостью к цистообразующим нематодам, может выиграть от применения средства обработки семян, которое обеспечивает защиту от цистообразующей нематоды и т. д. Аналогично, сорт, включающий трансгенный признак, который обеспечивает устойчивость к насекомым, может выиграть от второго механизма действия, придаваемого средством для обработки семян, сорт, включающий трансгенный признак, который придает устойчивость к гербициду, может выиграть от средства обработки семян с антидотом, который повышает устойчивость растений к такому гербициду и т. д. Кроме того, хорошее укоренение и ранняя всхожесть, которые являются результатом правильного применения средства для обработки семян, могут приводить к более эффективному использованию азота, лучшей способности переносить засуху и общему повышению потенциальной урожайности сорта или сортов, содержащих определенный признак, в комбинации со средством для обработки семян.

Способы уничтожения насекомого-вредителя и контроля популяции насекомых

В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы уничтожения насекомого-вредителя, включающие приведение насекомого-вредителя в контакт с инсектицидно эффективным количеством рекомбинантного инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы уничтожения насекомого-вредителя, включающие приведение насекомого-вредителя в контакт с инсектицидно эффективным количеством полипептида PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-75 согласно вариантам осуществления и/или полипептида PIP-77 согласно вариантам осуществления.

В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы контроля популяции насекомых-вредителей, включающие приведение популяции насекомых-вредителей в контакт с инсектицидно эффективным количеством рекомбинантного инсектицидного полипептида согласно вариантам осуществления. В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы контроля популяции насекомых-вредителей, включающие приведение популяции насекомых-вредителей в контакт с инсектицидно эффективным количеством полипептида PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-75 согласно вариантам осуществления и/или полипептида PIP-77 согласно вариантам осуществления. "Осуществление контроля популяции вредителей" или "контроль вредителя", используемые в данном документе, относятся к любому эффекту в отношении вредителя, который приводит к ограничению вреда, который наносит вредитель. Контроль вредителя включает без ограничений уничтожение вредителя, подавление развития вредителя, изменение плодовитости или роста вредителя таким образом, что вредитель оказывает меньше вреда в отношении растения, снижение количества производимого потомства, получение менее приспособленных вредителей, получение вредителей, более восприимчивых к нападению хищников или удержание вредителей от поедания растения.

В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы контроля популяции насекомых-вредителей, устойчивых к пестицидному белку, включающие приведение популяции насекомых-вредителей в контакт с инсектицидно эффективным количеством рекомбинантного инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы контроля популяции насекомых-вредителей, устойчивых к пестицидному белку, включающие приведение популяции в контакт насекомых-вредителей с инсектицидно эффективным количеством полипептида PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-75 согласно вариантам осуществления и/или полипептида PIP-77 согласно вариантам осуществления.

В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы защиты растения от насекомого-вредителя, включающие экспрессию в растении или его клетке рекомбинантного полинуклеотида, кодирующего инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. В некоторых вариантах осуществления предусматриваются способы защиты растения от насекомого-вредителя, включающие экспрессию в растении или его клетке рекомбинантного полинуклеотида, кодирующего пестицидный белок полипептида PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-75 согласно вариантам осуществления и/или полипептида PIP-77 согласно вариантам осуществления.

Стратегии управления устойчивостью насекомых (IRM)

Было доказано, что экспрессия δ-эндотоксинов B. thuringiensis в трансгенных растениях кукурузы является эффективным средством контроля важных с точки зрения сельского хозяйства насекомых-вредителей (Perlak, et al., 1990; 1993). Однако, возникли насекомые, которые устойчивы к δ-эндотоксинам B. thuringiensis, экспрессирующимся в трансгенных растениях. Такая устойчивость, если она станет широко распространенной, будет явно ограничивать коммерческое значение идиоплазмы, содержащей гены, кодирующие такие δ-эндотоксины B. thuringiensis.

Одним способом повышения эффективности трансгенных инсектицидов в отношении целевых вредителей и одновременного снижения развития устойчивых к инсектицидам вредителей является применение полученных нетрансгенных (т. е. с неинсектицидным белком) рефугиев (раздел неинсектицидных сельскохозяйственных культур/кукурузы) для применения трансгенных сельскохозяйственных культур, вырабатывающих один инсектицидный белок, активный в отношении целевых вредителей. Управление по охране окружающей среды Соединенных Штатов Америки (epa.gov/oppbppdl/biopesticides/pips/bt_corn_refuge_2006.htm, доступ к которому можно получить с использованием префикса www) публикует требования по применению трансгенных сельскохозяйственных культур, вырабатывающих один Bt-белок, активный в отношении целевых вредителей. В дополнение, Национальная ассоциация кукурузоводов на своем веб-сайте: (ncga.com/insect-resistance-management-fact-sheet-bt-corn, доступ к которому можно получить с использованием префикса www) также предлагает аналогичные руководства, касающиеся требований к рефугиям. Из-за потерь, обусловленных насекомыми в пределах зоны регуфиев, более крупные рефугии могут снижать общую урожайность.

Другим способом повышения эффективности трансгенных инсектицидов в отношении целевых вредителей и одновременного снижения развития устойчивых к инсектицидам вредителям будет хранилище инсектицидных генов, которые эффективны в отношении групп насекомых-вредителей и которые проявляют свои эффекты посредством отличающихся механизмов действия.

Экспрессия в растении двух или более инсектицидных композиций, токсичных для одного вида насекомых, при этом каждый инсектицид экспрессируется на эффективных уровнях, будет представлять собой другой способ для достижения контроля развития устойчивости. Это основано на принципе, что эволюция устойчивости к двум отдельным механизмам действия значительно менее вероятна, чем только к одному. Например, Roush описывает стратегию двух токсинов, также называемую "создание пирамиды" или "пакетирование," для управления инсектицидными трансгенными сельскохозяйственными культурами. (The Royal Society. Phil. Trans. R. Soc. Lond. B. (1998) 353:1777-1786). Пакетирование или создание пирамиды из двух различных белков, каждый из которых эффективен в отношении целевых вредителей, и при этом отсутствует перекрестная устойчивость или она невелика, может обеспечивать возможность применения меньшего рефугия. Управление по охране окружающей среды США требует существенно меньший (как правило 5%) структурированный рефугий для высаживания кукурузы, не являющейся Bt, чем для продуктов с одним признаком (как правило 20%). Существуют различные способы обеспечения эффектов IRM рефугия, в том числе различные геометрические паттерны высаживания в полях и смеси семян "в мешке", как дополнительно обсуждается у Roush.

В некоторых вариантах осуществления инсектицидные полипептиды по настоящему раскрытию применимы в качестве стратегии управления устойчивостью насекомых в комбинации (т. е. в составе пирамиды) с другими пестицидными белками, включающими без ограничения Bt-токсины, инсектицидные белки Xenorhabdus sp. или Photorhabdus sp. и т. п.

Предусматриваются способы контроля в отношении заражения(-ий) трансгенного растения насекомыми отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, которые обеспечивают управление устойчивостью насекомых, включающие экспрессию в растении по меньшей мере двух различных инсектицидных белков, характеризующихся отличающимися механизмами действия.

В некоторых вариантах осуществления способы контроля в отношении заражения трансгенного растения насекомыми из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera и содействия в управлении устойчивостью насекомых по меньшей мере к одному из инсектицидных белков включают инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, инсектицидный в отношении насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera.

В некоторых вариантах осуществления способы контроля в отношении заражения трансгенного растения насекомыми из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera и содействия в управлении устойчивостью насекомых включают экспрессию в трансгенном растении инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию и белка Cry, инсектицидных в отношении насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, причем они характеризуются отличающимися механизмами действия.

В некоторых вариантах осуществления способы контроля в отношении заражения трансгенного растения насекомыми из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera и содействия в управлении устойчивостью насекомых включают экспрессию в трансгенном растении полипептида PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-75 согласно вариантам осуществления или полипептида PIP-77 согласно вариантам осуществления и белка Cry, инсектицидных в отношении насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, причем они характеризуются отличающимися механизмами действия.

Также предусматриваются способы снижения вероятности появления устойчивости у насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera к трансгенным растениям, экспрессирующим в растениях инсектицидные белки для контроля видов насекомых, включающие экспрессию инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию, инсектицидного в отношении вида насекомых, в комбинации со вторым белком, инсектицидным в отношении вида насекомых, причем они характеризуются отличающимися механизмами действия.

Также предусматриваются способы снижения вероятности появления устойчивости у насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera к трансгенным растениям, экспрессирующим в растениях инсектицидные белки для контроля видов насекомых, включающие экспрессию полипептида PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептида PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептида PIP-75 согласно вариантам осуществления или полипептида PIP-77 согласно вариантам осуществления, инсектицидным в отношении вида насекомых в комбинации со вторым инсектицидным белком, характеризующимся отличающимся механизмом действия

Также предусматриваются средства для эффективного управления устойчивостью насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera к трансгенным растениям, включающие совместную экспрессию на высоких уровнях в растениях двух или более инсектицидных белков, токсичных для насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, но при этом каждый характеризуется отличающимся механизмом осуществления его активности применительно к уничтожению, где два или более инсектицидных белка включают инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию и белок Cry. Также предусматриваются средства для эффективного управления устойчивостью насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera к трансгенным растениям, включающие совместную экспрессию на высоких уровнях в растениях двух или более инсектицидных белков, токсичных для насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, но при этом каждый характеризуется отличающимся механизмом осуществления его активности в отношении уничтожения, где два или более инсектицидных белков включают полипептид PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептид PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептид PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептид PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептид PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептид PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептид PIP-75 согласно вариантам осуществления или полипептид PIP-77 согласно вариантам осуществления, а также белок Cry.

В дополнение, предусматриваются способы получения разрешения контролирующих органов для выращивания или коммерческой реализации растений, экспрессирующих белки, инсектицидные в отношении насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, включающие стадию обращения, предоставления или ссылки на данные анализов связывания белков насекомых, демонстрирующие, что инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию не конкурирует с сайтами связывания белков Cry у данных насекомых. В дополнение, предусматриваются способы получения разрешения контролирующих органов для выращивания или коммерческой реализации растений, экспрессирующих белки, инсектицидные в отношении насекомых из отряда Lepidoptera и/или Coleoptera, включающие стадию обращения, предоставления или ссылки на данные анализов связывания белков насекомых, демонстрирующие, что полипептид PIP-45-1 согласно вариантам осуществления и полипептид PIP-45-2 согласно вариантам осуществления, полипептид PIP-64-1 согласно вариантам осуществления и полипептид PIP-64-2 согласно вариантам осуществления, полипептид PIP-74-1 согласно вариантам осуществления и полипептид PIP-74-2 согласно вариантам осуществления, полипептид PIP-75 согласно вариантам осуществления или полипептид PIP-77 согласно вариантам осуществления не конкурирует с сайтами связывания белков Cry у данных насекомых.

Способы повышения урожайности у растений

Предусматриваются способы повышения урожайности. Способы включают получение растения или растительной клетки, экспрессирующих полинуклеотид, кодирующий пестицидную полипептидную последовательность, раскрытую в данном документе, и выращивание растения или его семени в поле, зараженном вредителем, в отношении которого полипептид характеризуется пестицидной активностью. В некоторых вариантах осуществления полипептид характеризуется пестицидной активностью в отношении вредителя из группы чешуекрылых, жесткокрылых, двукрылых, полужесткокрылых или нематод, и при этом поле заражено вредителем из группы чешуекрылых, полужесткокрылых, жесткокрылых, двукрылых или нематод.

Как определено в данном документе, "урожайностью" растения называют качество и/или количество биомассы, продуцируемой растением. "Биомасса", используемая в данном документе, относится к любому измеренному продукту растения. Увеличением продукции биомассы является любое улучшение урожайности измеренного продукта растения. Увеличение урожайности растения имеет несколько коммерческих применений. Например, увеличение биомассы листьев растения может приводить к увеличению урожайности листовых овощей для потребления человеком или животными. Кроме того, увеличение биомассы листьев можно применять для увеличения производства фармацевтических или промышленных продуктов растительного происхождения. Увеличение урожайности может предусматривать любое статистически значимое увеличение, в том числе без ограничения по меньшей мере 1% повышение, по меньшей мере 3% повышение, по меньшей мере 5% повышение, по меньшей мере 10% повышение, по меньшей мере 20% повышение, по меньшей мере 30% повышение, по меньшей мере 50% повышение, по меньшей мере 70% повышение, по меньшей мере 100% или большее повышение урожайности по сравнению с растением, не экспрессирующим пестицидную последовательность.

В конкретных способах урожайность растения повышается в результате улучшенной устойчивости к вредителю растения, экспрессирующего инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, раскрытый в данном документе. Экспрессия инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию приводит к сниженной способности вредителя к заражению растения или питанию на растении, улучшая таким образом урожайность растения.

Способы переработки

Дополнительно предусматриваются способы переработки растения, части растения или семени с получением пищевого или кормового продукта из растения, части растения или семени, содержащих инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию. Растения, части растения или семена, предусматриваемые в данном документе, можно перерабатывать с получением масла, белковых продуктов и/или побочных продуктов, которые являются производными, полученными путем переработки, которые имеют коммерческое значение. Неограничивающие примеры включают трансгенные семена, содержащие молекулу нуклеиновой кислоты, кодирующую инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, который можно перерабатывать с получением соевого масла, соевых продуктов и/или соевых побочных продуктов.

"Переработка" относится к любым физическим и химическим способам, применяемым для получения какого-либо соевого продукта, и включает без ограничения кондиционирование нагреванием, вальцевание и измельчение, экструзию, экстракцию растворителем или вымачивание в воде и экстракцию цельных или дробленых семян.

Следующие примеры представлены для иллюстрации, а не для ограничения.

ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНАЯ ЧАСТЬ

Пример 1. Анализы с кормлением насекомых

Биологические скрининг-анализы инсектицидной активности проводили с очищенным лизатом для оценки эффектов инсектицидных белков в отношении ряда видов Lepidoptera (огневки кукурузной (Ostrinia nubilalis), хлопковой совки (Helicoverpa zea), совки-ипсилон (Agrotis ipsilon), совки травяной (Spodoptera frugiperda), соевой совки (Pseudoplusia includens) и совки, гусеница которой питается бархатными бобами (Anticarsia gemmatalis)), вида Coleoptera (западного кукурузного жука (Diabrotica virgifera), и двух видов Hemiptera, Lygus hesperus и Nezara viridula (зеленого овощного клопа).

Анализы с использованием видов отряда Lepidoptera

Анализы с кормлением видов отряда Lepidoptera проводили на искусственном рационе, содержащем очищенные лизаты бактериальных штаммов в установке с 96-луночным планшетом. Очищенный лизат включали в специфичный для чешуекрылых искусственный рацион в соотношении 20 мкл очищенного лизата и 40 мкл пищевой смеси. Две из пяти новорожденных личинок помещали в каждую лунку для питания в течение 5 дней. Результаты выражали как положительные в отношении реакций личинок, таких как остановка развития и/или смерть. Результаты выражали как отрицательные, если личинки были подобны отрицательному контролю, который питался рационом, в который вносили только вышеуказанный буфер. Каждый очищенный лизат анализировали на огневке кукурузной (Ostrinia nubilalis), хлопковой совке (Helicoverpa zea), совке-ипсилон (Agrotis ipsilon), совке травяной (Spodoptera frugiperda), соевой совке (Pseudoplusia includens) и совке, гусеница которой питается бархатными бобами (Anticarsia gemmatalis). Серии концентраций образцов очищенного белка анализировали в отношении этих насекомых и рассчитывали концентрации для 50% смертности (LC50) или ингибирования роста 50% особей (IC50).

Анализы с использованием видов отряда Coleoptera

Анализы с кормлением видов отряда Coleoptera проводили на искусственном рационе, содержащем очищенные лизаты бактериальных штаммов в установке с 96-луночным планшетом. Очищенный лизат включали в специфичный для жесткокрылых искусственный рацион в соотношении 10 мкл очищенного лизата и 50 мкл пищевой смеси. Две из пяти новорожденных личинок западного кукурузного жука (Diabrotica virgifera) помещали в каждую лунку для питания в течение 5 дней. Результаты выражали как положительные в отношении реакций личинок, таких как остановка развития и/или смерть. Результаты выражали как отрицательные, если личинки были подобны отрицательному контролю, который питался рационом, в который вносили только вышеуказанный буфер. Серии концентраций образцов очищенного белка анализировали в отношении этих насекомых и рассчитывали концентрации для 50% смертности (LC50) или ингибирования роста 50% особей (IC50).

Биологический анализ с использованием вида рода Lygus ( Lygus hesperus )

20 мкл образцов очищенного лизата смешивали с 75 мкл рациона вида рода Lygus (Bio-Serv F9644B) в каждой лунке 96-луночного планшета для биологических анализов (BD Falcon 353910) и покрывали листом парафильма. Различные количества нимф на стадии второго возраста Lygus hesperus (2-7) помещали в каждую лунку 96-луночного фильтровального планшета. Затем планшет с образцами переворачивали на фильтровальный планшет и держали вместе с резиновыми полосками. Анализ проводили в течение четырех дней при 25⁰C и затем проводили оценку смертности насекомых и/или остановку роста насекомых. Серии концентраций образцов очищенного белка анализировали в отношении этих насекомых и рассчитывали концентрации для 50% смертности (LC50) или ингибирования роста 50% особей (IC50).

Биологический анализ с использованием зеленого овощного клопа ( Nezara viridula ) и коричневого мраморного щитника ( Halyomorpha haly)

40 мкл образцов очищенного лизата смешивали с 360 мкл рациона вида рода Lygus (Bio-Serv F9644B) в пакетах Parafilm®. 10-15 недавно полинявших насекомых на стадии нимфы помещали в чашки Петри из полистирола (100 мм x 20 мм), выстеленных влажной фильтровальной бумагой Whatman® (диаметр 100 мм). В чашку добавляли источник воды. Посуду с биологическим анализом инкубировали при 25⁰C в темноте в течение четырех дней. Результаты биологического анализа оценивали на смертность и остановку роста. Для получения данных ILC50 или LC50 анализировали серию концентраций очищенных белков в отношении насекомых, и концентрация, при которой 50% насекомых получили серьезный ущерб, составляла ILC50, а концентрация, при которой 50% насекомых погибали, составляла LC50.

Биологический анализ с использованием колорадского жука ( Leptinotarsa decemlineata )

20 мкл образцов очищенного лизата смешивали с 75 мкл модифицированного рациона жесткокрылых (Bio-Serv F9800B) в каждой лунке 96-луночного планшета для биологических анализов (BD Falcon 353910) и давали затвердеть. В каждую лунку помещали одну новорожденную личинку и планшет запечатывали покрытием Mylar®. Отверстия пробивали в листе Mylar® и планшет инкубировали при 25°C без света в течение четырех дней. Результаты биологического анализа оценивали на смертность и/или остановку роста.

Пример 2. Идентификация штаммов инсектицидной активностью

Инсектицидные активности в отношении SBL, CEW, BCW, VBC, ECB, Lygus, SGSB и WCRW наблюдали с очищенным клеточным лизатом бактериальных штаммов, выращенных либо в среде LB (10 г/л триптона, 5 г/л дрожжевого экстракта и 10 г/л NaCl), либо среде TSB (триптического соевого бульона) (17 г/л триптона, 3 г/л сойтона, 2,5 г/л декстрозы, 2,5 г/л K₂HPO₄ и 5 г/л NaCl) и культивированных в течение ночи при 26°C со встряхиванием при 250 об./мин. Эта инсектицидная активность была чувствительна к теплу и протеиназе, что указывало на ее белковый характер. Активные штаммы и их инсектицидные активности приведены в таблице 5.

Таблица 5

Штамм Вид Целевые насекомые Ген № послед. LBV5480 Pseudomonas brenneri WCRW PIP-45Aa-1/2 SEQ ID NO: 1/SEQ ID NO: 2 LBV9691 Pseudomonas brenneri WCRW исключительно PIP-64Aa-1 SEQ ID NO: 53 LBV9691 Pseudomonas brenneri SBL, CEW, BCW, VBC, ECB, Lygus, SGSB PIP-64Aa-1/2 SEQ ID NO: 53/SEQ ID NO: 54 SS135B4b Pseudomonas rhodesiae WCRW PIP-74Aa-1/2 SEQ ID NO: 73/SEQ ID NO: 74 LBV6019 Pseudomonas antarctica WCRW PIP-75Aa SEQ ID NO: 79 SSP344E5a Pseudomonas chlororaphis WCRW PIP-77Aa SEQ ID NO: 88

Пример 3. Идентификация видов и секвенирование генома активных штаммов

Геномную ДНК из активных штаммов экстрагировали с помощью набора Sigma® для экстракции бактериальной геномной ДНК (номер по кат. NA2110-KT, Sigma-Aldrich, почтовый ящик 14508, Сент-Луис, Миссури, 63178) в соответствии с инструкциями изготовителя. Концентрацию ДНК определяли с помощью спектрофотометра NanoDrop™ (Thermo Scientific, 3411 Silverside Road, Bancroft Building, Suite 100, Уилмингтон, Делавер, 19810) и геномную ДНК разбавляли до 40 нг/мкл стерилизованной водой. 25 мкл смеси для ПЦР-реакции получали путем объединения 80 нг геномной ДНК, 2 мкл (5 мкМ) праймеров 16S рибосомальных ДНК TACCTTGTTACGACTT (SEQ ID NO: 216) и AGAGTTTGATCMTGGCTCAG (SEQ ID NO: 217), 1 мкл 10 мМ dNTP, 1x буфера Phusion® HF и 1 единицы высокоточной ДНК-полимеразы Phusion® (New England Biolabs, номер по кат. M0530L, 240 County Road, Ипсуич, Массачусетс, 01938-2723). ПЦР-реакцию проводили в термоциклере MJ Research PTC-200 (Bio-Rad Laboratories, Inc., 1000 Alfred Nobel Drive, Херкулиз, Калифорния, 94547, США) со следующей программой: 96°C 1 мин.; 30 циклов 96°C 15 секунд, 52°C 2 минуты и 72°C 2 минуты; 72°C 10 минут; и удерживали при 4°C. ПЦР-продукты очищали с помощью набора для очистки ДНК Qiaquick® (номер по кат. 28104, QIAGEN Inc., 27220 Turnberry Lane, Валенсия, Калифорния, 91355). Очищенный ПЦР-образец подвергали ДНК-секвенированию и полученную последовательность 16S рибосомальной ДНК подвергали поиску BLAST в отношении базы данных NCBI. Первые результаты поиска показывали вид штамма (см. таблицу 5).

Геномную ДНК активных штаммов также получали в соответствии с протоколом конструирования библиотеки, разработанным Illumina, и секвенировали с использованием Illumina MiSeq™. Собирали последовательности контигов нуклеиновых кислот и получали открытые рамки считывания.

Пример 4. Идентификация инсектицидных белков с помощью LC-MS/MS

Все инсектицидные белки фракционировали и обогащали, как описано. С целью идентификации полоски с кандидатными белками вырезали, обрабатывали трипсином и анализировали с помощью нано-жидкостной хроматографии/тандемной масс-спектрометрии (нано-LC/ESI-MS/MS) на масс-спектрометре Thermo Q Exactive™ Orbitrap™ (Thermo Fisher Scientific), сопряженного с системой Eksigent® NanoLC-1D™ Plus nanoLC™ (AB Sciex). Десять спектров ионов-продуктов собирали в зависимом от информации режиме обнаружения после MS1-обзорного сканирования.

Идентификацию белка осуществляли с помощью поисков по базам данных с использованием Mascot (Matrix Science). Поиски проводили в отношении лабораторной базы данных Bacteria-Plus, которая объединяет все бактериальные белковые последовательности и последовательности кератина из неизбыточной базы данных NCBI (nr), а также лабораторных белковых последовательностей.

Пример 5. Выделение и идентификация инсектицидных белков

Выделение и идентификация PIP-45-Aa-1 и PIP-45-Aa-2

Инсектицидную активность в отношении WCRW (Diabrotica virgifera) наблюдали с очищенным клеточным лизатом штамма LBV 5480 Pseudomonas brenneri, выращенного в питательном бульоне (пептон- 5 г/л, мясной экстракт - 1 г/л, дрожжевой экстракт - 2 г/л, хлорид натрия - 5 г/л) и культивированного в течение ночи при 26°C со встряхиванием при 250 об./мин. Эта инсектицидная активность была чувствительна к теплу и протеазе, что указывало на ее белковый характер.

Клеточную массу LBV 5480 гомогенизировали при ~20000 фунтов/кв. дюйм после повторного суспендирования в трис-буфере, pH 8. Неочищенный лизат очищали центрифугированием и загружали в колонку HiTrap® Q-FF (GE Healthcare). Связанный белок элюировали линейным градиентом хлорида натрия и фракционировали. Фракции, которые содержали белок, представляющий интерес, объединяли и доводили до концентрации 1 М сульфата аммония в 50 мМ трис (буфер А). Данный материал загружали на колонку с фенилсефарозой HP HiTrap® (GE Healthcare), уравновешенную в буфере A. Активный белок элюировали линейным градиентом от 1 М до 0 М сульфата аммония и далее очищали с помощью эксклюзионной хроматографии. С этой целью фенил-пул концентрировали и загружали в колонку Superdex® 200 (GE Healthcare), уравновешенную в 20 мМ трис, 150 мМ NaCl, pH 8. Анализ способом SDS-PAGE фракций с активностью в отношении WCRW показал 2 преобладающие полосы после окрашивания голубым красителем Coomassie®. Для идентификации двух новых генов, кодируемых штаммом LBV 5480, использовали LC-MS/MS. Эти гены образуют оперон, и оба продукта гена необходимы для инсектицидной активности, что подтверждалось рекомбинантным белком. Эти белки обозначали как PIP-45-Aa-1 (SEQ ID NO: 1) и PIP-45-Aa-2 (SEQ ID NO: 2).

Выделение и идентификация PIP-64-Aa-1 и PIP-64-Aa-2

Инсектицидную активность в отношении WCRW (Diabrotica virgifera) и соевой совки (SBL Chrysodeixis includes) наблюдали с очищенным клеточным лизатом штамма LBV 9691 Pseudomonas brenneri, выращенного в среде 2x YT (16 г/л триптона, 10 г/л дрожжевого экстракта, 5 г/л NaCl) и культивированного в течение 3 дней при 26°C со встряхиванием при 250 об./мин. Эта инсектицидная активность была чувствительна к теплу и протеазе, что указывало на ее белковый характер.

Условия роста и активность насекомых сильно различались. Более высокая активность также коррелировала с повышенными уровнями экспрессии белка, соответствующего полосе ~28 кДа, определяемой с помощью SDS-PAGE. Чтобы дополнительно подтвердить данную полосу с кандидатом, клеточную массу LVB 9691 гомогенизировали при 30000 фунтов/кв. дюйм после повторного суспендирования в 20 мМ трис-буфере, рН 8. Неочищенный лизат очищали центрифугированием и загружали в колонку Superdex® 75 (GE Healthcare). Типы активности в отношении WCRW и SBL были сильно связаны с полосой 28 кДа во фракциях элюирования. Полосу белка идентифицировали с помощью LC-MS/MS. С помощью поиска в базе данных идентифицировали два новых белка аналогичного размера, закодированных в опероне штаммом LBV 9691, обозначенные PIP-64-Aa-1 (SEQ ID NO: 53) и PIP-64-Aa-2 (SEQ ID NO: 54). Рекомбинантная экспрессия показала, что при тестируемых концентрациях оба белка необходимы для активности в отношении видов чешуекрылых и жесткокрылых. Было установлено, что активность была оптимальной при молярном соотношении соответственно PIP-64Aa-1 (SEQ ID NO: 53) и PIP-64Aa-2 (SEQ ID NO: 54), составляющем 5:1. Для активности в отношении WCRW было достаточно только PIP-64-Aa-1 (SEQ ID NO: 53).

Выделение и идентификация PIP-74-Aa-1 и PIP-74-Aa-2

Инсектицидную активность в отношении WCRW (Diabrotica virgifera) наблюдали с очищенным клеточным лизатом штамма SS135B4 Pseudomonas brenneri, выращенного в среде 2x YT и культивированного в течение 2 дней при 26°C со встряхиванием при 250 об./мин. Эта инсектицидная активность была чувствительна к теплу и протеазе, что указывало на ее белковый характер.

Клеточную массу SS135B4 гомогенизировали при 30000 фунтов/кв. дюйм после повторного суспендирования в 25 мМ трис-буфере, pH 9. Неочищенный лизат очищали центрифугированием, доводили до 0,5 М сульфата аммония и загружали на колонку Phenyl Sepharose FF (GE Healthcare). Активный белок в отношении WCRW элюировали линейным градиентом до 0 М сульфата аммония, объединяли и диализировали в 50 мМ натрий-ацетатном буфере, рН 5. Скорректированный пул затем загружали на колонку S-Sepharose FF (GE Healthcare), которую уравновешивали тем же буфером. В несвязанной белковой фракции, содержаще активный белок в отношении WCRW, заменяли буфер на 50 мМ CAPS, pH 10, загружали на колонку MonoQ® (GE Healthcare) и элюировали линейным градиентом хлорида натрия в 50 мМ CAPS, pH 10. Анализ способом SDS-PAGE этих фракций показал несколько полос после окрашивания голубым красителем Coomassie®. Полосы белка вырезали и идентифицировали с помощью LC-MS/MS. С помощью поиска в базе данных идентифицировали два новых белка, закодированных в опероне штаммом SS135B4, обозначенные PIP-74-Aa-1 (SEQ ID NO: 73) и PIP-74-Aa-2 (SEQ ID NO: 74) соответственно. Рекомбинантная экспрессия показала, что при тестируемых концентрациях оба белка необходимы для активности в отношении WCRW.

Выделение и идентификация PIP-75-Aa

Инсектицидную активность в отношении WCRW (Diabrotica virgifera) наблюдали с очищенным клеточным лизатом штамма LBV 6019 Pseudomonas antarctica, выращенного в среде 2x YT в течение 1 дня при 26°C со встряхиванием при 250 об./мин. Эта инсектицидная активность была чувствительна к теплу и протеазе, что указывало на ее белковый характер.

Клеточную массу LBV 6019 гомогенизировали при ~30000 фунтов/кв. дюйм после повторного суспендирования в 25 мМ трис-буфере, pH 8,5. Неочищенный лизат очищали центрифугированием и загружали в колонку POROS® Q (Life Technologies). В несвязанной белковой фракции, содержащей активный белок в отношении WCRW, заменяли буфер путем диализа относительно 10 мМ MES, pH 6, и затем загружали на колонку HiTrap® S-HP (GE Healthcare) и элюировали линейным градиентом хлорида натрия. Фракции, содержащие активный белок, объединяли, корректировали буфером и подвергали повторной стадии анионного обмена при рН 8,5. В неограниченной фракции снова заменяли буфер перед заключительной стадией фракционирования на колонке Mono S® (GE Healthcare), уравновешенной 20 мМ MES, pH 6. После элюирования с помощью линейного градиента до 0,3 М NaCl получали несколько активных фракций. Анализ способом SDS-PAGE фракций с активностью в отношении WCRW показал несколько преобладающих полос после окрашивания голубым красителем Coomassie®. Полосы белка вырезали и идентифицировали посредством LC-MS/MS.

С помощью поиска в базе данных выявляли 3 новых кандидатных гена, кодируемых штаммом LBV 6019. С помощью клонирования и рекомбинантной экспрессии подтверждали инсектицидную активность одного из кандидатов. Данный белок обозначали как PIP-75-Aa (SEQ ID NO: 79).

Выделение и идентификация PIP-77-Aa

Инсектицидную активность в отношении WCRW (Diabrotica virgifera) наблюдали с очищенным клеточным лизатом штамма SS344E5 Pseudomonas chlororaphis, выращенного в триптическом соевом бульоне (TSB, пептон из казеина 15 г/л; пептон из соевых продуктов 5 г/л; хлорид натрия 5,0 г/л) в течение 1 дня при 26°C со встряхиванием при 250 об./мин. Эта инсектицидная активность была чувствительна к теплу и протеазе, что указывало на ее белковый характер.

Клеточную массу SS344E5 гомогенизировали при 30000 фунтов/кв. дюйм после повторного суспендирования в 25 мМ трис-буфере, pH 8,5. Неочищенный лизат очищали центрифугированием и загружали в колонку POROS® Q (Life Technologies). Несвязанную белковую фракцию, содержащую активный белок в отношении WCRW, подвергали диализу относительно 10 мМ MES, pH 6, загружали в колонку HiTrap® S-HP (GE Healthcare) и элюировали линейным градиентом хлорида натрия до 0,5 М. Фракции, содержащие активный белок в отношении WCRW, объединяли и затем разделяли с помощью эксклюзионной хроматографии с использованием колонки Superdex® 75 (GE Healthcare). Анализ способом SDS-PAGE фракций с активностью в отношении WCRW показал преобладающую полосу в 7 кДа после окрашивания голубым красителем Coomassie®. Для идентификации двух новых генов, кодируемых штаммом SS344E5, использовали LC-MS/MS. Клонирование и рекомбинантная экспрессия подтверждали инсектицидную активность данного генного продукта, который обозначили как PIP-77-Aa (SEQ ID NO: 88).

Пример 6. Идентификация гомологов

Геномную ДНК экстрагировали из различных внутренних штаммов, вид идентифицировали и геном представлял собой последовательности, как описано в примере 3. Генную идентичность можно определить посредством проведения поисков BLAST (средство поиска основного локального выравнивания; Altschul, et al., (1993) J. Mol. Biol. 215:403-410; см. также ncbi.nlm.nih.gov/BLAST/, доступ к которому можно получить с применением префикса www) с параметрами по умолчанию относительно сходства с последовательностями, которые содержатся во внутренних геномах и в публично доступной "nr" базе данных BLAST (содержащей все неизбыточные CDS-трансляции из GenBank, последовательности, полученные на основании 3-мерной структуры базы данных белков Brookhaven, последней главной версии базы данных белковых последовательностей SWISS-PROT, баз данных EMBL и DDBJ). Анализировали полипептидные последовательности под SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 2, SEQ ID NO: 53, SEQ ID NO: 54, SEQ ID NO: 73, SEQ ID NO: 74, SEQ ID NO: 79 и SEQ ID NO: 88.

В таблице 6 показаны идентифицированные гомологи полипептида PIP-45-1 и полипептида PIP-45-2, идентификационные номера последовательностей для каждого и штаммы бактерий, из которых они были идентифицированы. В таблице 7 показан процент идентичности последовательности между гомологами полипептида PIP-45-1. На фигурах 1a-1m показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-45-1.

Таблица 6

Ген № последовательности Источник Вид Активность PIP-45Aa-1 SEQ ID NO: 1 LBV5480 Pseudomonas brenneri да PIP-45Aa-2 SEQ ID NO: 2 PIP-45Ab-1 SEQ ID NO: 3 LBV2335-5 (1-2aa различие); LBV8526-5; гипотетический белок NCBI ZP_10476580 и ZP_10476581 Pseudomonas sp. Ag1 н.о. ^† PIP-45Ab-2 SEQ ID NO: 4 PIP-45Ac-1 SEQ ID NO: 5 Гипотетический белок NCBI ZP_10430003 и ZP_10430004 Pseudomonas sp. PAMC 25886 н.о. PIP-45Ac-2 SEQ ID NO: 6 PIP-45Ad-1 SEQ ID NO: 7 Гипотетический белок NCBI ZP_10430003, JGI_XylAfBL_518010 Pseudomonas sp. PAMC 25886 да PIP-45Ad-2 SEQ ID NO: 8 PIP-45Ae-1 SEQ ID NO: 9 Внутренний штамм SSP143E2; LBV9925-5;
EMBL K1AVN2_PSEFL; NCBI ZP_1559991; Pseudomonas fluorescens н.о. PIP-45Ae-2 SEQ ID NO: 10 Внутренний штамм SSP143E2;
EMBL K1B453_PSEFL; NCBI ZP_15599912; PIP-45Af-1 SEQ ID NO: 11 Гипотетический белок NCBI WP_017475319 Pseudomonas sp. PAMC 26793 н.о. PIP-45Af-2 SEQ ID NO: 12 Гипотетический белок NCBI WP_017475320 PIP-45Ba-1 SEQ ID NO: 13 Гипотетический белок NCBI PPs_2675 (YP_004702108.1) и PPS_2674 (YP_004702107.1) Pseudomonas putida да PIP-45Ba-2 SEQ ID NO: 14 PIP-45Bb-1 SEQ ID NO: 15 JGI - гипотетический белок AECFG_342250 Fungus garden combined н.о. PIP-45Bb-2 SEQ ID NO: 16 JGI - гипотетический белок AECFG_342240 PIP-45Bc-1 SEQ ID NO: 17 Внутренняя коллекция SSP145B2; SSP469C8a Pseudomonas monteilii н.о. PIP-45Bc-2 SEQ ID NO: 18 PIP-45Bd-1 SEQ ID NO: 19 Внутренняя коллекция - SS160F12; SSP165H7; SS153D5a; SS165D11-2; JH23144-1; Pseudomonas monteilii да PIP-45Bd-2 SEQ ID NO: 20 PIP-45Be-1 SEQ ID NO: 21 LBV9691 Pseudomonas brenneri да PIP-45Be-2 SEQ ID NO: 22 PIP-45Bf-1 SEQ ID NO: 23 LBV11272; LBV11224: LBV10925 Pseudomonas gessardii н.о. PIP-45Bf-2 SEQ ID NO: 24 PIP-45Bg-1 SEQ ID NO: 25 NCBI B479_12925 Pseudomonas putida н.о. PIP-45Bg-2 SEQ ID NO: 26 NCBI B479_12920 PIP-45Bh-1 SEQ ID NO: 27 Внутренняя коллекция - SSP339E12-1 Pseudomonas plecoglossicida н.о. PIP-45Bh-2 SEQ ID NO: 28 PIP-45Bi-1 SEQ ID NO: 29 Внутренняя коллекция - SSP340D9a Pseudomonas putida н.о. PIP-45Bi-2 SEQ ID NO: 30 PIP-45Bj-1 SEQ ID NO: 31 Внутренняя коллекция - JH27606-2, SSP4C8 Pseudomonas putida н.о. PIP-45Bj-2 SEQ ID NO: 32 PIP-45Bk-1 SEQ ID NO: 33 Внутренняя коллекция - SSP4E8 Pseudomonas monteilii н.о. PIP-45Bk-2 SEQ ID NO: 34 PIP-45Bl-1 SEQ ID NO: 232 Внутренняя коллекция - JH59565-1; гипотетические белки NCBI YP_008763564 и WP_023380724 Pseudomonas sp. VLB120 н.о. PIP-45Bl-2 SEQ ID NO: 233 PIP-45Bm-1 SEQ ID NO: 234 Внутренняя коллекция - JH58750-1 Pseudomonas putida н.о. PIP-45Bm-2 SEQ ID NO: 235 PIP-45Ca-1 SEQ ID NO: 35 Внутренняя коллекция - SSi43B5; SSi44A10; SSP259D11-1; SSP429D11a; SSP429D6a; SS143D2; LBV8661 (различие 2aa для 45-2) Pseudomonas poae да PIP-45Ca-2 SEQ ID NO: 36 PIP-45Cb-1 SEQ ID NO: 37 JGI - гипотетический белок DPOB_377060 и DPOB_377050 Mountain Pine Beetle microbial communities да PIP-45Cb-2 SEQ ID NO: 38 PIP-45Cc-1 SEQ ID NO: 39 Внутренняя коллекция - SS137B2 Pseudomonas trivialis н.о. PIP-45Cc-2 SEQ ID NO: 40 PIP-45Cd-1 SEQ ID NO: 41 NCBI-ZP_11188561 Pseudomonas sp. R81 н.о. PIP-45Cd-2 SEQ ID NO: 42 NCBI-ZP_11188562 PIP-45Ce-1 SEQ ID NO: 43 Внутренняя коллекция - SSP493B7b Pseudomonas libanensis н.о. PIP-45Ce-2 SEQ ID NO: 44 PIP-45Cf-1 SEQ ID NO: 236 Внутренняя коллекция - SSP557A12-2 Pseudomonas poae н.о. PIP-45Cf-2 SEQ ID NO: 237 Pseudomonas poae н.о. PIP-45Da-1 SEQ ID NO: 45 Внутренний активный штамм - SSP347B8a Pseudomonas asplenii н.о. PIP-45Da-2 SEQ ID NO: 46 PIP-45Db-1 SEQ ID NO: 47 NCBI-ZP_11115718 Thalassospira xiamenensis н.о. PIP-45Db-2 SEQ ID NO: 48 NCBI-ZP_11115719 PIP-45Ea-1 SEQ ID NO: 49 Гипотетический белок NCBI Pden_4642
(YP_918399.1) и Pden_4641 (YP_918398.1) Paracoccus denitrificans PD1222 да PIP-45Ea-2 SEQ ID NO: 50 PIP-45Ga-1 SEQ ID NO: 51 Гипотетический белок NCBI YP_001984231.1 и YP_001984230.1 Cellvibrio japonicus Ueda107 нет PIP-45Ga-2 SEQ ID NO: 52

^{† н.о.=не определено}

Таблица 7

PIP-45Ab-1 SEQ ID NO: 3 PIP-45Ac-1 SEQ ID NO: 5 PIP-45Ad-1 SEQ ID NO: 7 PIP-45Ae-1 SEQ ID NO: 9 PIP-45Af-1 SEQ ID NO: 11 PIP-45Ba-1 SEQ ID NO: 13 PIP-45Bb-1 SEQ ID NO: 15 PIP-45Bc-1 SEQ ID NO: 17 PIP-45Bd-1 SEQ ID NO: 19 PIP-45Aa-1 98.6 96.5 96.9 98.6 99.0 88.6 88.4 88.4 87.9 PIP-45Ab-1 - 96.5 97.2 99.7 98.3 88.1 87.9 87.9 87.7 PIP-45Ac-1 - - 99.0 96.5 96.0 87.2 87.0 87.0 87.6 PIP-45Ad-1 - - - 97.2 96.4 87.4 87.2 87.2 87.7 PIP-45Ae-1 - - - - 98.3 88.1 87.9 87.9 87.7 PIP-45Af-1 - - - - - 88.6 88.4 88.4 87.9 PIP-45Ba-1 - - - - - - 99.1 99.3 95.5 PIP-45Bb-1 - - - - - - - 99.1 95.2 PIP-45Bc-1 - - - - - - - - 95.2 PIP-45Bd-1 - - - - - - - - - PIP-45Be-1 - - - - - - - - - PIP-45Bf-1 - - - - - - - - - PIP-45Bg-1 - - - - - - - - - PIP-45Bh-1 - - - - - - - - - PIP-45Bi-1 - - - - - - - - - PIP-45Bj-1 - - - - - - - - - PIP-45Bk-1 - - - - - - - - - PIP-45Bl-1 - - - - - - - - - PIP-45Bm-1 - - - - - - - - - PIP-45Ca-1 - - - - - - - - - PIP-45Cb-1 - - - - - - - - - PIP-45Cc-1 - - - - - - - - - PIP-45Cd-1 - - - - - - - - - PIP-45Ce-1 - - - - - - - - - PIP-45Cf-1 - - - - - - - - - PIP-45Da-1 - - - - - - - - - PIP-45Db-1 - - - - - - - - - PIP-45Ea-1

Таблица 7 продолж.

PIP-45Be-1 SEQ ID NO: 21 PIP-45Bf-1 SEQ ID NO: 23 PIP-45Bg-1 SEQ ID NO: 25 PIP-45Bh-1 SEQ ID NO: 27 PIP-45Bi-1 SEQ ID NO: 29 PIP-45Bj-1 SEQ ID NO: 31 PIP-45Bk-1 SEQ ID NO: 33 PIP-45Bl-1 SEQ ID NO: 232 PIP-45Bm-1 SEQ ID NO: 234 PIP-45Aa-1 87.1 87.5 87.7 88.4 88.2 86.0 86.2 86.5 87.4 PIP-45Ab-1 86.6 87.5 87.2 87.9 87.7 86.2 86.2 86.5 87.4 PIP-45Ac-1 85.9 87.0 86.4 87.0 86.9 85.3 85.8 86.0 86.7 PIP-45Ad-1 86.1 87.2 86.5 87.2 87.0 85.8 85.3 86.0 86.7 PIP-45Ae-1 86.8 87.7 87.2 87.9 87.7 85.8 86.0 86.7 87.5 PIP-45Af-1 86.6 87.0 87.7 88.4 88.2 86.0 85.8 85.8 87.4 PIP-45Ba-1 84.7 86.3 98.6 99.0 99.1 92.2 91.0 91.7 93.6 PIP-45Bb-1 84.4 86.0 99.1 98.8 99.7 91.7 90.8 91.5 93.8 PIP-45Bc-1 84.4 85.8 98.6 98.6 99.1 91.9 91.0 91.9 93.3 PIP-45Bd-1 84.2 86.3 94.6 95.3 95.2 92.9 90.0 90.8 92.6 PIP-45Be-1 - 92.6 84.2 85.1 84.7 81.6 83.8 82.3 83.0 PIP-45Bf-1 - - 85.5 86.5 86.0 83.6 86.0 84.3 85.3 PIP-45Bg-1 - - - 98.3 99.5 91.2 90.3 91.0 92.9 PIP-45Bh-1 - - - - 98.8 92.0 91.2 91.2 93.3 PIP-45Bi-1 - - - - - 91.7 90.8 91.5 93.4 PIP-45Bj-1 - - - - - - 88.6 87.9 90.3 PIP-45Bk-1 - - - - - - - 90.1 90.8 PIP-45Bl-1 - - - - - - - - 91.0 PIP-45Bm-1 - - - - - - - - - PIP-45Ca-1 - - - - - - - - - PIP-45Cb-1 - - - - - - - - - PIP-45Cc-1 - - - - - - - - - PIP-45Cd-1 - - - - - - - - - PIP-45Ce-1 - - - - - - - - - PIP-45Cf-1 - - - - - - - - - PIP-45Da-1 - - - - - - - - - PIP-45Db-1 - - - - - - - - - PIP-45Ea-1

Таблица 7 продолж.

PIP-45Ca-1 SEQ ID NO: 35 PIP-45Cb-1 SEQ ID NO: 37 PIP-45Cc-1 SEQ ID NO: 39 PIP-45Cd-1 SEQ ID NO: 41 PIP-45Ce-1 SEQ ID NO: 43 PIP-45Cf-1 SEQ ID NO: 236 PIP-45Da-1 SEQ ID NO: 45 PIP-45Db-1 SEQ ID NO: 47 PIP-45Ea-1 SEQ ID NO: 49 PIP-45Ga-1 SEQ ID NO: 51 PIP-45Aa-1 77.9 77.3 76.8 76.8 77.9 78.5 65.1 63.5 59.8 38.8 PIP-45Ab-1 77.9 76.8 76.5 76.8 77.3 78.2 65.1 63.9 59.8 38.8 PIP-45Ac-1 77.2 77.0 76.9 76.7 77.4 77.7 64.3 63.9 59.1 38.0 PIP-45Ad-1 77.0 76.5 76.3 76.0 76.9 77.7 64.0 63.7 59.0 37.9 PIP-45Ae-1 77.9 77.2 76.6 76.9 77.7 78.4 65.3 64.0 59.9 39.0 PIP-45Af-1 77.2 76.6 76.1 76.1 77.2 77.9 65.5 63.5 59.9 38.6 PIP-45Ba-1 77.3 76.8 76.5 76.1 77.0 78.0 67.0 65.1 59.9 38.4 PIP-45Bb-1 77.3 76.8 76.5 76.1 77.2 78.0 66.8 64.9 59.8 38.4 PIP-45Bc-1 77.3 76.8 76.5 76.1 77.0 78.0 67.5 65.1 60.1 38.2 PIP-45Bd-1 77.0 76.1 75.8 75.4 76.5 77.2 66.5 64.4 59.4 38.3 PIP-45Be-1 75.6 73.9 73.4 73.9 74.2 75.3 65.4 63.1 57.9 38.8 PIP-45Bf-1 77.4 76.0 76.0 75.5 76.0 76.9 66.7 64.2 59.6 37.9 PIP-45Bg-1 76.8 76.3 75.8 75.4 76.5 77.5 66.7 64.4 59.7 38.3 PIP-45Bh-1 77.7 77.2 76.8 76.5 77.5 78.2 67.0 64.7 60.1 38.5 PIP-45Bi-1 77.3 76.8 76.3 76.0 77.0 78.0 67.0 64.9 60.1 38.3 PIP-45Bj-1 77.0 75.8 75.4 75.8 75.4 77.2 66.1 64.4 59.6 37.7 PIP-45Bk-1 77.7 76.3 76.1 76.0 76.1 76.8 66.1 64.4 59.4 39.4 PIP-45Bl-1 77.3 76.6 77.0 76.3 76.6 77.9 64.6 64.4 59.6 39.1 PIP-45Bm-1 76.5 76.0 76.3 75.6 76.5 77.0 66.0 64.8 60.2 38.7 PIP-45Ca-1 - 95.3 92.7 94.3 94.6 98.1 64.9 66.8 60.8 38.7 PIP-45Cb-1 - - 94.3 96.0 97.4 95.3 64.2 66.1 59.5 37.7 PIP-45Cc-1 - - - 92.9 93.6 92.9 63.1 65.6 59.5 38.1 PIP-45Cd-1 - - - - 96.2 93.8 64.4 65.4 59.4 37.9 PIP-45Ce-1 - - - - - 94.6 64.4 65.9 59.8 37.6 PIP-45Cf-1 - - - - - - 65.2 67.0 61.0 38.8 PIP-45Da-1 - - - - - - - 66.6 59.9 37.6 PIP-45Db-1 - - - - - - - - 66.2 37.0 PIP-45Ea-1 35.7

В таблице 8 показан процент идентичности последовательности между гомологами полипептида PIP-45-2. На фигурах 2a-2l показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-45-2.

Таблица 8

. PIP-45Ab-2 SEQ ID NO: 4 PIP-45Ac-2 SEQ ID NO: 6 PIP-45Ad-2 SEQ ID NO: 8 PIP-45Ae-2 SEQ ID NO: 10 PIP-45Af-2 SEQ ID NO: 12 PIP-45Ba-2 SEQ ID NO: 14 PIP-45Bb-2 SEQ ID NO: 16 PIP-45Bc-2 SEQ ID NO: 18 PIP-45Bd-2 SEQ ID NO: 20 PIP-45Be-2 SEQ ID NO: 22 PIP-45Aa-2 98.7 96.3 94.4 98.7 99.1 84.0 83.9 83.4 84.3 78.0 PIP-45Ab-2 - 96.1 94.2 99.6 98.9 84.2 84.1 83.6 84.1 78.2 PIP-45Ac-2 - - 95.7 96.1 96.4 84.3 84.3 83.8 84.1 79.1 PIP-45Ad-2 - - - 94.6 94.6 84.0 83.7 83.6 83.4 79.5 PIP-45Ae-2 - - - - 98.9 84.2 84.1 83.6 84.1 78.2 PIP-45Af-2 - - - - - 84.1 84.1 83.6 84.7 78.2 PIP-45Ba-2 - - - - - - 99.3 98.3 95.5 76.2 PIP-45Bb-2 - - - - - - - 98.3 95.9 75.9 PIP-45Bc-2 - - - - - - - - 95.0 75.6 PIP-45Bd-2 - - - - - - - - - 76.3 PIP-45Be-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bf-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bg-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bh-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bi-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bj-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bk-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bl-2 - - - - - - - - - - PIP-45Bm-2 - - - - - - - - - - PIP-45Ca-2 - - - - - - - - - - PIP-45Cb-2 - - - - - - - - - - PIP-45Cc-2 - - - - - - - - - - PIP-45Cd-2 - - - - - - - - - - PIP-45Ce-2 - - - - - - - - - - PIP-45Cf-2 - - - - - - - - - - PIP-45Da-2 - - - - - - - - - - PIP-45Db-2 - - - - - - - - - - PIP-45Ea-2 - - - - - - - - - -

Таблица 8 продолж.

. PIP-45Bf-2 SEQ ID NO: 24 PIP-45Bg-2 SEQ ID NO: 26 PIP-45Bh-2 SEQ ID NO: 28 PIP-45Bi-2 SEQ ID NO: 30 PIP-45Bj-2 SEQ ID NO: 32 PIP-45Bk-2 SEQ ID NO: 34 PIP-45Bl-2 SEQ ID NO: 233 PIP-45Bm-2 SEQ ID NO: 235 PIP-45Ca-2 SEQ ID NO: 36 PIP-45Aa-2 80.1 83.6 83.9 83.4 83.0 83.7 82.4 82.6 67.0 PIP-45Ab-2 79.9 83.8 84.1 83.6 83.0 83.6 82.8 82.6 66.9 PIP-45Ac-2 79.7 83.9 84.3 83.7 83.7 83.6 82.8 82.6 67.7 PIP-45Ad-2 80.8 83.4 83.9 83.6 83.6 83.9 82.4 82.1 67.3 PIP-45Ae-2 79.9 83.8 84.1 83.6 83.0 83.6 82.6 82.5 66.9 PIP-45Af-2 79.9 83.7 84.1 83.6 83.4 83.9 82.6 82.8 67.2 PIP-45Ba-2 76.7 98.9 99.3 97.9 91.2 90.1 91.6 90.1 67.2 PIP-45Bb-2 76.5 99.3 99.3 98.3 91.4 90.1 91.6 90.1 67.3 PIP-45Bc-2 76.4 97.9 98.3 99.6 90.8 89.2 90.7 89.9 67.3 PIP-45Bd-2 76.7 95.5 95.7 94.9 91.8 89.7 91.8 90.1 67.2 PIP-45Be-2 88.7 75.6 76.1 75.6 75.9 75.9 76.5 75.7 67.9 PIP-45Bf-2 - 76.1 76.7 76.3 77.2 77.4 77.1 76.3 68.7 PIP-45Bg-2 - - 98.9 98.3 91.0 89.7 91.2 89.7 67.3 PIP-45Bh-2 - - - 98.3 91.4 90.3 91.8 90.3 67.2 PIP-45Bi-2 - - - - 90.8 89.1 90.6 89.9 67.3 PIP-45Bj-2 - - - - - 88.2 88.8 87.5 68.3 PIP-45Bk-2 - - - - - - 89.0 86.5 66.6 PIP-45Bl-2 - - - - - - - 88.2 68.3 PIP-45Bm-2 - - - - - - - - 66.8 PIP-45Ca-2 - - - - - - - - - PIP-45Cb-2 - - - - - - - - - PIP-45Cc-2 - - - - - - - - - PIP-45Cd-2 - - - - - - - - - PIP-45Ce-2 - - - - - - - - - PIP-45Cf-2 - - - - - - - - - PIP-45Da-2 - - - - - - - - - PIP-45Db-2 - - - - - - - - - PIP-45Ea-2 - - - - - - - - -

Таблица 8 продолж.

. PIP-45Cb-2 SEQ ID NO: 38 PIP-45Cc-2 SEQ ID NO: 40 PIP-45Cd-2 SEQ ID NO: 42 PIP-45Ce-2 SEQ ID NO: 44 PIP-45Cf-2 SEQ ID NO: 237 PIP-45Da-2 SEQ ID NO: 46 PIP-45Db-2 SEQ ID NO: 48 PIP-45Ea-2 SEQ ID NO: 50 PIP-45Ga-2 SEQ ID NO: 52 PIP-45Aa-2 66.8 68.6 67.7 68.3 66.8 56.6 51.3 47.4 30.6 PIP-45Ab-2 66.9 68.5 67.6 68.1 66.7 56.5 51.4 47.7 30.1 PIP-45Ac-2 67.5 68.8 68.1 68.1 67.3 56.4 51.8 47.7 30.8 PIP-45Ad-2 67.5 68.8 67.9 68.1 67.0 57.3 52.6 48.4 29.8 PIP-45Ae-2 66.7 68.5 67.8 68.1 66.7 56.5 51.4 47.7 30.1 PIP-45Af-2 66.8 68.6 67.9 68.5 67.0 56.4 51.3 47.8 30.6 PIP-45Ba-2 67.4 67.9 67.3 67.9 67.1 58.1 52.6 49.3 30.5 PIP-45Bb-2 67.9 68.3 67.5 68.0 67.2 57.8 52.4 49.5 30.2 PIP-45Bc-2 67.9 68.3 67.5 68.0 67.2 58.0 52.3 49.8 30.8 PIP-45Bd-2 68.1 67.9 67.3 67.7 67.2 57.6 52.6 50.2 31.1 PIP-45Be-2 67.7 70.2 67.7 68.9 67.7 58.8 51.9 48.3 30.8 PIP-45Bf-2 69.1 69.9 69.7 70.2 68.8 58.6 53.4 47.9 32.1 PIP-45Bg-2 68.1 68.3 67.7 68.1 67.2 57.6 52.5 49.5 30.4 PIP-45Bh-2 67.4 67.9 67.2 67.7 66.7 58.3 52.5 49.7 30.5 PIP-45Bi-2 67.9 68.3 67.5 68.0 67.2 58.0 52.6 49.9 30.9 PIP-45Bj-2 69.0 68.5 68.3 68.5 67.9 56.7 52.0 48.0 31.8 PIP-45Bk-2 67.3 67.5 66.8 67.0 66.3 57.8 53.5 49.4 31.2 PIP-45Bl-2 68.5 68.6 67.3 67.9 67.5 56.7 53.4 49.4 31.5 PIP-45Bm-2 66.2 67.3 67.0 67.5 66.7 57.0 51.8 48.7 31.9 PIP-45Ca-2 93.0 89.0 92.1 93.6 96.6 56.8 53.6 46.4 30.1 PIP-45Cb-2 - 89.4 91.7 93.8 93.2 56.6 53.0 46.5 31.5 PIP-45Cc-2 - - 88.3 90.3 89.8 58.3 53.1 46.2 31.8 PIP-45Cd-2 - - - 93.6 92.6 56.5 51.9 46.1 31.6 PIP-45Ce-2 - - - - 94.7 56.9 53.6 46.7 32.5 PIP-45Cf-2 - - - - - 57.2 53.7 47.0 32.1 PIP-45Da-2 - - - - - - 55.6 48.6 32.0 PIP-45Db-2 - - - - - - - 49.1 30.4 PIP-45Ea-2 - - - - - - - - 32.5

В таблице 9 показаны идентифицированные гомологи полипептида PIP-64-1 и полипептида PIP-64-2, идентификационные номера последовательностей для каждого и штаммы бактерий, из которых они были идентифицированы. В таблице 10 показан процент идентичности последовательности между гомологами полипептида PIP-64-1. На фигурах 3a-3b показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-64-1. В таблице 11 показан процент идентичности последовательности между гомологами полипептида PIP-64-2. На фигурах 4a-4b показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-64-2.

Таблица 9

Ген Источник Вид PIP-64Aa-1 SEQ ID NO: 53 LBV9691 Pseudomonas brenneri PIP-64Aa-2 SEQ ID NO: 54 PIP-64Aa-1 SEQ ID NO: 53 LBV10925; LBV10914 Pseudomonas gessardii PIP-64Ab-2 SEQ ID NO: 55 PIP-64Ba-1 SEQ ID NO: 238 Внутренняя коллекция - SSP560F2b Pseudomonas entomophila PIP-64Ba-2 SEQ ID NO: 239 PIP-64Ca-1 SEQ ID NO: 56 Гипотетический белок NCBI WP_016977798 Pseudomonas fluorescens PIP-64Ca-2 SEQ ID NO: 57 Гипотетический белок NCBI WP_016977799 PIP-64Ea-1 SEQ ID NO: 58 Внутренняя коллекция DuPont P4G7 Alcaligenes faecalis PIP-64Ea-2 SEQ ID NO: 59 PIP-64Eb-1 SEQ ID NO: 60 ATCC33950 - внутренняя геномная последовательность Alcaligenes faecalis PIP-64Eb-2 SEQ ID NO: 61 PIP-64Ec-1 SEQ ID NO: 62 EMBL - неохарактеризованный белок M5J334_9BURK и M5IW68_9BURK Alcaligenes sp. HPC1271 PIP-64Ec-2 SEQ ID NO: 63 PIP-64Ga-1 SEQ ID NO: 64 EMBL R9VGC3_9ENTR Enterobacter PIP-64Ha-1 SEQ ID NO: 65 Гипотетический белок NCBI PSF113_0646 (YP_005206077.1) и PSF113_0647 (YP_005206078.1) Pseudomonas fluorescens PIP-64Ha-2 SEQ ID NO: 66 PIP-64Hb-1 SEQ ID NO: 67 Гипотетический белок NCBI PSEBR_a622 (YP_004351774.1) и PSEBR_a623 (YP_004351775.1) Pseudomonas brassicacearum PIP-64Hb-2 SEQ ID NO: 68 PIP-64Hc-1 SEQ ID NO: 69 JGI - гипотетический белок SwiRh_808460 Микробное сообщество ризосферы проса прутьевидного из Мичигана PIP-64Hc-2 SEQ ID NO: 70 JGI - гипотетический белок SwBS_00338360 PIP-64Hd-1 SEQ ID NO: 71 JGI - гипотетический белок SwiRh_668170 Микробное сообщество ризосферы мискантуса из Келлогга PIP-64Hd-2 SEQ ID NO: 72 JGI - гипотетический белок MRS2a_00580520

Таблица 10

PIP-64Ba-1 SEQ ID NO: 238 PIP-64Ca-1 SEQ ID NO: 56 PIP-64Ea-1 SEQ ID NO: 58 PIP-64Eb-1 SEQ ID NO: 60 PIP-64Ec-1 SEQ ID NO: 62 PIP-64Ga-1 SEQ ID NO: 64 PIP-64Ha-1 SEQ ID NO: 65 PIP-64Hb-1 SEQ ID NO: 67 PIP-64Hc-1 SEQ ID NO: 69 PIP-64Hd-1 SEQ ID NO: 71 PIP-64Aa-1 84.0 72.3 59.1 59.1 59.1 33.2 27.8 27.4 28.6 27.9 PIP-64Ba-1 - 74.2 56.4 56.8 56.4 31.4 25.7 26.9 26.0 27.2 PIP-64Ca-1 - - 55.6 55.6 55.6 32.1 23.7 23.4 25.2 26.4 PIP-64Ea-1 - - - 99.2 99.6 31.6 25.4 24.6 25.3 26.0 PIP-64Eb-1 - - - - 98.8 31.6 25.0 24.6 25.3 26.0 PIP-64Ec-1 - - - - - 31.6 25.4 24.6 25.3 26.0 PIP-64Ga-1 - - - - - - 22.1 23.1 22.4 22.6 PIP-64Ha-1 - - - - - - - 94.6 66.2 62.1 PIP-64Hb-1 - - - - - - - - 66.2 62.1 PIP-64Hc-1 - - - - - - - - - 76.8

Таблица 11

. PIP-64Ab-2 SEQ ID NO: 55 PIP-64Ba-2 SEQ ID NO: 239 PIP-64Ca-2 SEQ ID NO: 57 PIP-64Ea-2 SEQ ID NO: 59 PIP-64Eb-2 SEQ ID NO: 61 PIP-64Ec-2 SEQ ID NO: 63 PIP-64Ha-2 SEQ ID NO: 66 PIP-64Hb-2 SEQ ID NO: 68 PIP-64Hc-2 SEQ ID NO: 70 PIP-64Hd-2 SEQ ID NO: 72 PIP-64Aa-2 95.8 66.9 54.8 38.9 40.0 39.6 24.0 24.8 24.0 23.0 PIP-64Ab-2 - 66.2 54.8 39.6 41.2 40.8 25.9 23.1 22.3 22.3 PIP-64Ba-2 - - 49.8 38.5 41.1 39.6 21.3 24.4 24.0 19.0 PIP-64Ca-2 - - - 39.0 42.5 40.6 22.5 24.5 23.8 22.5 PIP-64Ea-2 - - - - 85.4 90.7 22.3 18.2 22.0 21.9 PIP-64Eb-2 - - - - - 93.4 25.5 21.6 22.7 21.9 PIP-64Ec-2 - - - - - - 23.3 19.0 23.0 21.7 PIP-64Ha-2 - - - - - - - 72.3 49.2 35.7 PIP-64Hb-2 - - - - - - - - 52.5 38.5 PIP-64Hc-2 - - - - - - - - - 41.2

В таблице 12 показаны идентифицированные гомологи полипептида PIP-74-1 и полипептида PIP-74-2, идентификационные номера последовательностей для каждого и штаммы бактерий, из которых они были идентифицированы. В таблице 13 показан процент идентичности последовательности между представителями семейства полипептидов PIP-74-1. На фигурах 5a-5b показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-74-1. В таблице 14 показан процент идентичности последовательности между представителями семейства полипептидов PIP-74-2. На фигуре 6 показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-74-2.

Таблица 12

Ген Источник Вид PIP-74Aa-1 SEQ ID NO: 73 Внутренняя коллекция - SS135B4b Pseudomonas rhodesiae PIP-74Aa-2 SEQ ID NO: 74 PIP-74Ab-1 SEQ ID NO: 75 Внутренняя коллекция - SSP427D6-1 Pseudomonas orientalis PIP-74Ab-2 SEQ ID NO: 76 PIP-74Ca-1 SEQ ID NO: 77 Внутренняя коллекция - JH21146-1 Pseudomonas sp. PKRS11 PIP-74Ca-2 SEQ ID NO: 78

Таблица 13

PIP-74Ab-1 PIP-74Ca-1 PIP-74Aa-1 99.6 74.5 PIP-74Ab-1 - 74.5

Таблица 14

PIP-74Ab-2 PIP-74Ca-2 PIP-74Aa-2 98.0 66.3 PIP-74Ab-2 - 66.3

В таблице 15 показаны идентифицированные гомологи полипептида PIP-75, идентификационные номера последовательностей для каждого и штаммы бактерий, из которых они были идентифицированы. В таблице 16 показан процент идентичности последовательности между представителями семейства полипептидов PIP-75. На фигуре 7 показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-75.

Таблица 15

Ген Источник Вид PIP-75Aa SEQ ID NO: 79 LBV6019 Pseudomonas antarctica PIP-75Ba SEQ ID NO: 80 LBV2669 Pseudomonas orientalis PIP-75Da SEQ ID NO: 81 Внутренний - JH34920-1 Enterobacter asburiae PIP-75Ea SEQ ID NO: 82 NCBI A936_14984 Enterobacter sp. PIP-75Ga SEQ ID NO: 83 NCBI-YP_004234966 Acidovorax avenae subsp. avenae ATCC 19860 PIP-75Gb SEQ ID NO: 84 Внутренняя коллекция - SSP443E10-1 Serratia plymuthica PIP-75Gc SEQ ID NO: 85 Внутренняя коллекция - JH20785-4 Serratia liquefaciens PIP-75Gd SEQ ID NO: 86 Внутренняя коллекция - SSP291H3-2 Serratia sp. PIP-75Ge SEQ ID NO: 87 Внутренняя коллекция - JH20487-2 Serratia sp.

Таблица 16

. PIP-75Ba PIP-75Da PIP-75Ea PIP-75Ga PIP-75Gb PIP-75Gc PIP-75Gd PIP-75Ge PIP-75Aa 83.3 65.6 60.4 33.6 36.7 33.7 33.7 32.7 PIP-75Ba - 65.6 59.4 33.6 34.0 32.0 38.1 31.6 PIP-75Da - - 85.3 35.2 39.6 38.5 32.3 34.4 PIP-75Ea - - - 35.8 37.5 35.4 30.2 31.2 PIP-75Ga - - - - 24.8 25.2 24.6 23.8 PIP-75Gb - - - - - 86.2 67.0 75.5 PIP-75Gc - - - - - - 61.3 73.1 PIP-75Gd - - - - - - - 82.1

В таблице 17 показаны идентифицированные гомологи полипептида PIP-77, идентификационные номера последовательностей для каждого и штаммы бактерий, из которых они были идентифицированы. В таблице 18 показан процент идентичности последовательности между представителями семейства полипептидов PIP-77. На фигурах 8a-8b показано выравнивание аминокислотных последовательностей гомологов полипептида PIP-77.

Таблица 17

Ген Источник Вид PIP-77Aa SEQ ID NO: 88 SSP344E5 и другие 29 внутренних штаммов Pseudomonas chlororaphis PIP-77Ab SEQ ID NO: 89 SSP346A11a Pseudomonas chlororaphis PIP-77Ac SEQ ID NO: 90 JH19897-4; JH19820-2; JH19887-2; JH20257-4; JH19881-4; JH19896-4; JH20401-2; Pseudomonas brassicacearum PIP-77Ad SEQ ID NO: 91 SSP423G5-1; SSP344E7a; SSP283E1-2; SSP283E2-1; SSP283E6-1; SSP259H3-2; JH20450-1; SSP459A9-4; SSP459B9-3; JH21227-2; JH22700-1; NCBI-WP_007925627; Pseudomonas chlororaphis PIP-77Ae SEQ ID NO: 92 SSP346D1a Pseudomonas chlororaphis PIP-77Af SEQ ID NO: 240 Гипотетический белок NCBI WP_023965133.1; внутренняя коллекция - SSP555A5b Pseudomonas chlororaphis PIP-77Ba SEQ ID NO: 93 JH17731-2; JH17330-1; JH17729-3; JH17728-1; JH17574-1; JH17564-4 Pseudomonas fluorescens PIP-77Bb SEQ ID NO: 94 JH20704-3; JH20495-2 Pseudomonas fluorescens PIP-77Bc SEQ ID NO: 95 JH18994-3; JH18447-2 Pseudomonas fluorescens PIP-77Bd SEQ ID NO: 96 JH17494-4; JH17581-1; JH19353-3; JH17541-1; JH17554-4; JH16392-2; JH17546-4; JH17696-1; JH17549-1; JH17110-1; SSP454G12-1; JH17430-2 Pseudomonas fluorescens PIP-77Be SEQ ID NO: 97 SSP347B8a Pseudomonas fluorescens PIP-77Bf SEQ ID NO: 98 JH18110-4; JH18354-4; JH18107-3; SSP450C9-1 Pseudomonas rhodesiae PIP-77Bg SEQ ID NO: 99 NCBI-WP_007969132 Pseudomonas-sp PIP-77Bh SEQ ID NO: 241 Внутренняя коллекция - SSP535F3b Pseudomonas rhodesiae PIP-77Bi SEQ ID NO: 242 Внутренняя коллекция - SSP557G7-4 Pseudomonas rhodesiae PIP-77Ca SEQ ID NO: 100 SS154F1; SSP154F5a Pseudomonas fluorescens PIP-77Ea SEQ ID NO: 101 NCBI-WP_008458969 Enterobacter-sp PIP-77Eb SEQ ID NO: 102 NCBI-YP_564720 Shewanella denitrificans PIP-77Ec SEQ ID NO: 103 NCBI-WP_005351930 Aeromonas diversa PIP-77Ed SEQ ID NO: 104 NCBI-YP_001141694 Aeromonas salmonicida PIP-77Ee SEQ ID NO: 105 NCBI-YP_004392889 Aeromonas veronii PIP-77Ef SEQ ID NO: 106 NCBI-WP_005909090 Aeromonas molluscorum PIP-77Eg SEQ ID NO: 107 NCBI-WP_010633780 Aeromonas aquariorum PIP-77Eh SEQ ID NO: 243 Гипотетический белок NCBI AH4AK4_1885 AHE49340 Aeromonas hydrophila PIP-77Ei SEQ ID NO: 244 EMBL-U1H356_9GAMM Aeromonas veronii PIP-77Ej SEQ ID NO: 245 Внутренняя коллекция - JH58766-1 Haemophilus piscium

Таблица 18

PIP-77Ab
SEQ ID NO: 89 PIP-77Ac
SEQ ID NO: 90 PIP-77Ad
SEQ ID NO: 91 PIP-77Ae
SEQ ID NO: 92 PIP-77Af
SEQ ID NO: 240 PIP-77Ba
SEQ ID NO: 93 PIP-77Bb
SEQ ID NO: 94 PIP-77Bc
SEQ ID NO: 95 PIP-77Bd
SEQ ID NO: 96 PIP-77Be
SEQ ID NO: 97 PIP-77Bf
SEQ ID NO: 98 PIP-77Bg
SEQ ID NO: 99 PIP-77Bh
SEQ ID NO: 241 PIP-77Aa 94.4 93.3 92.1 92.1 92.1 87.6 86.5 85.4 84.3 84.3 83.1 85.4 86.5 PIP-77Ab - 95.5 96.6 94.4 95.5 86.5 85.4 84.3 83.1 83.1 82.0 84.3 85.4 PIP-77Ac - - 98.9 95.5 98.9 85.4 84.3 83.1 82.0 83.1 80.9 82.0 84.3 PIP-77Ad - - - 96.6 98.9 86.5 85.4 84.3 83.1 84.3 82.0 82.0 85.4 PIP-77Ae - - - - 95.5 85.4 84.3 83.1 82.0 84.3 80.9 84.3 84.3 PIP-77Af - - - - - 85.4 84.3 83.1 82.0 83.1 80.9 82.0 84.3 PIP-77Ba - - - - - - 97.8 96.6 95.5 88.8 94.4 80.9 98.9 PIP-77Bb - - - - - - - 98.9 97.8 86.5 96.6 82.0 96.6 PIP-77Bc - - - - - - - - 96.6 85.4 95.5 80.9 95.5 PIP-77Bd - - - - - - - - - 84.3 98.9 79.8 94.4 PIP-77Be - - - - - - - - - - 83.1 78.7 89.9 PIP-77Bf - - - - - - - - - - - 78.7 93.3 PIP-77Bg - - - - - - - - - - - - 82.0 PIP-77Bh - - - - - - - - - - - - - PIP-77Bi - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ca - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ea - - - - - - - - - - - - - PIP-77Eb - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ec - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ed - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ee - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ef - - - - - - - - - - - - - PIP-77Eg - - - - - - - - - - - - - PIP-77Eh - - - - - - - - - - - - - PIP-77Ei - - - - - - - - - - - - -

Таблица 18 продолжение

PIP-77Bi
SEQ ID NO: 242 PIP-77Ca
SEQ ID NO: 100 PIP-77Ea
SEQ ID NO: 101 PIP-77Eb
SEQ ID NO: 102 PIP-77Ec
SEQ ID NO: 103 PIP-77Ed
SEQ ID NO: 104 PIP-77Ee
SEQ ID NO: 105 PIP-77Ef
SEQ ID NO: 106 PIP-77Eg
SEQ ID NO: 107 PIP-77Eh
SEQ ID NO: 243 PIP-77Ei
SEQ ID NO: 244 PIP-77Ej
SEQ ID NO: 245 PIP-77Aa 84.3 78.0 56.5 55.1 55.6 55.6 56.7 51.1 56.7 56.7 55.6 55.6 PIP-77Ab 83.1 76.9 58.7 55.1 56.7 55.6 56.7 51.1 56.7 56.7 55.6 55.6 PIP-77Ac 80.9 79.1 60.9 56.2 55.6 54.4 55.6 50.0 55.6 55.6 54.4 54.4 PIP-77Ad 82.0 78.0 60.9 56.2 55.6 53.3 54.4 48.9 54.4 54.4 53.3 53.3 PIP-77Ae 80.9 78.0 58.7 55.1 54.4 52.2 53.3 47.8 53.3 53.3 52.2 52.2 PIP-77Af 80.9 78.0 60.9 56.2 55.6 53.3 54.4 48.9 54.4 54.4 53.3 53.3 PIP-77Ba 94.4 74.7 57.6 51.7 54.4 53.3 54.4 47.8 53.3 53.3 52.2 53.3 PIP-77Bb 96.6 75.8 57.6 51.7 55.6 54.4 55.6 48.9 54.4 54.4 53.3 54.4 PIP-77Bc 95.5 74.7 57.6 51.7 54.4 53.3 54.4 47.8 53.3 53.3 52.2 53.3 PIP-77Bd 98.9 73.6 55.4 49.4 53.3 52.2 53.3 48.9 52.2 52.2 51.1 52.2 PIP-77Be 83.1 78.0 57.6 53.9 51.1 48.9 50.0 45.6 51.1 51.1 48.9 48.9 PIP-77Bf 97.8 72.5 54.3 49.4 52.2 52.2 53.3 48.9 52.2 52.2 51.1 52.2 PIP-77Bg 79.8 75.8 56.5 55.1 56.7 55.6 56.7 51.1 56.7 56.7 55.6 55.6 PIP-77Bh 93.3 75.8 58.7 52.8 53.3 52.2 53.3 46.7 52.2 52.2 51.1 52.2 PIP-77Bi - 72.5 55.4 49.4 53.3 52.2 53.3 48.9 52.2 52.2 51.1 52.2 PIP-77Ca - - 62.4 57.1 57.6 54.3 55.4 51.1 56.5 56.5 54.3 54.3 PIP-77Ea - - - 57.6 53.8 54.8 54.8 50.0 55.9 55.9 53.8 55.9 PIP-77Eb - - - - 53.3 51.1 51.1 46.7 53.3 53.3 53.3 51.1 PIP-77Ec - - - - - 86.7 85.6 70.3 85.6 84.4 84.4 86.7 PIP-77Ed - - - - - - 96.7 75.8 88.9 90.0 94.4 90.0 PIP-77Ee - - - - - - - 75.6 87.8 88.9 97.8 88.9 PIP-77Ef - - - - - - - - 84.6 85.7 75.6 80.2 PIP-77Eg - - - - - - - - - 98.9 87.8 95.6 PIP-77Eh - - - - - - - - - - 88.9 94.4 PIP-77Ei - - - - - - - - - - - 86.7

Пример 7. Функциональный тест компонентов PIP-45-1 и PIP-45-2 из разных источников происхождения

Чтобы протестировать функциональность компонентов PIP-45-1 и PIP-45-2 из разных гомологов PIP-45, пять выбранных пар активных гомологов экспрессировали отдельно (перечислены в таблице 19). Каждый компонент PIP-45-1 смешивали с каждым из пяти компонентов PIP-45-2. Все пары тестировали на инсектицидную активность в отношении WCRW в анализах на основе рациона, как описано выше. Результаты показаны в таблице 19, что указывало на то, что при совместном спаривании компонентов PIP-45-1 и PIP-45-2 из разных источников можно обеспечить инсектицидную активность.

Таблица 19

Активность PIP045Aa-2
SEQ ID NO:2 PIP045Ad-2
SEQ ID NO:8 PIP045Ba-2
SEQ ID NO:14 PIP045Ca-2
SEQ ID NO:36 PIP045Cb-2
SEQ ID NO:38 PIP045Aa-1
SEQ ID NO: 1 Активный Активный Активный Активный Активный PIP045Ad-1
SEQ ID NO: 7 Активный Активный Активный Активный Активный PIP045Ba-1
SEQ ID NO:13 Активный Неактивный Активный Неактивный Неактивный PIP045Ca-1 SEQ ID NO:35 Неактивный Неактивный Неактивный Активный Активный PIP045Cb-1
SEQ ID NO:37 Неактивный Неактивный Неактивный Активный Активный

Активный жирным шрифтом=от исходной пары; активный=инсектицидная активность, выявленная с компонентами из разных источников происхождения

Пример 8. Субклонирование генов и экспрессия E. coli

Целевые гены, кодирующие инсектицидные белки, сначала амплифицировали с помощью ПЦР с использованием в качестве матриц их геномной ДНК. ПЦР-праймеры конструировали на основе 5'- и 3'-концевых последовательностей со встроенными соответствующими сайтами рестрикции. После расщепления рестрикционным ферментом продукты ПЦР клонировали в различные векторы экспрессии E.coli, т. е. pCOLD™ 1 с меткой N-His, вектор pMAL™ с MBP-слиянием или без него или векторы pCOLD™ с His-меткой или без нее. Белки экспрессировались в клетках-хозяевах BL21 (DE3) или C41 E.coli при индукции 1 мМ IPTG в течение ночи при 16^°C.

Рекомбинантный белок экстрагировали из культуры E. coli после индукции, очищали и анализировали на насекомых-мишенях, как описано в примере 1.

Пример 9. Транзиентная экспрессия и биологический анализ с использованием насекомого на тканях листьев с транзиентной экспрессией

Полинуклеотиды, кодирующие как PIP-64Aa-1 (SEQ ID NO: 160), так и PIP-64Aa-2 (SEQ ID NO: 161) клонировали в вектор для транзиентной экспрессии под управлением соответственно вирусного промотора pDMMV (Dav, et. al., (1999) Plant Mol. Biol. 40:771-782). В уровне техники хорошо известен способ инфильтрации агробактериями путем введения клеточной суспензии Agrobacterium в растительные клетки интактных тканей для того, чтобы можно было измерить или изучить воспроизводимые инфицирование и дальнейшую экспрессию трансгена, полученного из растения (Kapila, et. al., (1997) Plant Science 122:101-108). Вкратце, молодые проростки кустовой фасоли (фасоль обыкновенная, Phaseolus vulgaris) и сои (Glycine max), подвергали инфильтрации агробактериями с помощью нормализованных культур бактериальных клеток тестируемых и контрольных штаммов. Для каждого проростка создавали 10 дисков из листов и заражали 3 новорожденными личинками как совки кукурузной (SBL) (Pseudoplusia includes), так и совки, гусеница которой питается бархатными бобами (VBC) (Velvet Anticarsia gemmatalis), отдельно с двумя контрольными дисками из листов, образованными только с Agrobacterium и вектором экспрессии с флуоресцентным маркером DsRed2 (Clontech, Маунтин-Вью, Калифорния) в Agrobacterium. Потребление зеленых тканей листа оценивали через два дня после заражения. Транзиентные экспрессии белков как PIP-64-1 (SEQ ID NO: 53), так и PIP-64-2 (SEQ ID NO: 54) подтверждали способом идентификации белка на основе масс-спектрометрии с использованием экстрагированных белковых лизатов из подвергнутых ко-инфильтрации тканей листа (Patterson, (1998) 10(22):1-24, Current Protocol in Molecular Biology published by John Wiley & Son Inc). Транзиентно ко-экспрессируемые PIP-64-1 (SEQ ID NO: 53) и PIP-64-2 (SEQ ID NO: 54) защищали диски из листьев от потребления насекомыми, которыми их заражали, в то же время общее потребление зеленой ткани наблюдали для двух отрицательных контролей.

Пример 10. Опосредованная Agrobacterium стабильная трансформация маиса

Для опосредованной Agrobacterium трансформации инсектицидных полипептидов маиса применяли способ Zhao (патент США № 5981840 и международная патентная публикация WO 1998/32326, содержание которых тем самым включено в данный документ с помощью ссылки). Вкратце, незрелые зародыши выделяли из маиса и зародыши приводили в контакт с суспензией Agrobacterium, где бактерии были способны переносить полинуклеотид, кодирующий инсектицидный полипептид по настоящему раскрытию, по меньшей мере в одну клетку по меньшей мере одного из незрелых зародышей (стадия 1: стадия инфицирования). На данной стадии незрелые зародыши погружали в суспензию Agrobacterium для инициации инокуляции. Зародыши в течение определенного времени культивировали совместно с Agrobacterium (стадия 2: стадия совместного культивирования). Незрелые зародыши культивировали на твердой среде с антибиотиком, но без селективного средства, для исключения Agrobacterium и для обеспечения фазы покоя для инфицированных клеток. Затем инокулированные зародыши культивировали на среде, содержащей средство для отбора, и выделяли растущий трансформированный каллюс (стадия 4: стадия отбора). Незрелые зародыши культивировали на твердой среде со средством для отбора, что приводило к выборочному росту трансформированных клеток. Затем каллюс регенерировали в растения (стадия 5: стадия регенерации) и каллюсы, выросшие на селективной среде, культивировали на твердой среде для регенерации растений.

Для выявления инсектицидного полипептида в ткани листьев, 4 лиофилизированных высеченных с помощью штамповочного пресса кругов из листьев/образца листа растирали в порошок и повторно суспендировали в 100 мкл PBS, содержащего 0,1% TWEEN™ 20 (PBST), 1% бета-меркаптоэтанола, содержащего 1 таблетку/7 мл ингибитора протеиназы Complete Mini (Roche 1183615301). Суспензию обрабатывали ультразвуком в течение 2 мин. и затем центрифугировали при 4°C, 20000 g в течение 15 минут. К надосадочной жидкости добавляли аликвоту из 1/3 объема 3X NuPAGE^® LDS буфера для образца (Invitrogen™ (Калифорния, США), 1% B-ME, содержащего 1 таблетку/7 мл ингибитора протеиназы complete Mini. Реакционную смесь нагревали при 80°C в течение 10 мин. и затем центрифугировали. Образец надосадочной жидкости загружали на гели 4-12% Bis-Tris Midi с подвижным буфером MES в соответствии с инструкциями производителя (Invitrogen™) и переносили на нитроцеллюлозную мембрану с применением устройства iBlot® (Invitrogen™). Нитроцеллюлозную мембрану инкубировали в PBST, содержащем 5% порошка обезжиренного молока, в течение 2 часов перед инкубацией в течение ночи с очищенным с помощью аффинной хроматографии антителом кролика к инсектицидному полипептиду в PBST на протяжении ночи. Мембрану три раза промывали PBST и затем инкубировали в PBST в течение 15 мин., а затем дважды по 5 мин. перед инкубацией в течение 2 часов в PBST с антителом козы к Ig кролика, конъюгированным с HRP, на протяжении 3 часов. Выявленные белки визуализировали с применением реагентов для вестерн-блоттинга ECL (GE Healthcare, № по кат. RPN2106) и пленки Kodak® Biomax® MR. Для выявления инсектицидного белка в корнях, корни лиофилизировали и 2 мг порошка на образец повторно суспендировали в LDS, добавляли 1% бета-меркаптоэтанола, содержащего 1 таблетку/7 мл ингибитора протеиназы Complete Mini. Реакционную смесь нагревали при 80°C в течение 10 мин. и затем центрифугировали при 4°C, 20000 g в течение 15 мин. Образец надосадочной жидкости загружали на гели 4-12% Bis-Tris Midi с подвижным буфером MES в соответствии с инструкциями производителя (Invitrogen™) и переносили на нитроцеллюлозную мембрану с применением устройства iBlot® (Invitrogen™). Нитроцеллюлозную мембрану инкубировали в PBST, содержащем 5% порошка обезжиренного молока, в течение 2 часов перед инкубацией в течение ночи с очищенным с помощью аффинной хроматографии поликлональным антителом кролика к инсектицидному полипептиду в PBST на протяжении ночи. Мембрану трижды промывали PBST и затем инкубировали в PBST в течение 15 мин., а затем дважды по 5 мин. перед инкубацией в течение 2 часов в PBST с антителом козы к Ig кролика, конъюгированным с HRP, на протяжении 3 ч. Связанные с антителом инсектицидные белки выявляли с применением реагентов для вестерн-блоттинга ECL™ (GE Healthcare, № по кат. RPN2106) и пленки Kodak® Biomax® MR.

Трансгенные растения маиса, положительные в отношении экспрессии инсектицидных белков, тестировали на пестицидную активность с использованием стандартных биологических анализов, известных в уровне техники. Такие способы включали, например, биологические анализы с иссечением корня и биологические анализы целого растения. См., например, публикацию заявки на выдачу патента США № US 2003/0120054 и международную публикацию № WO 2003/018810.

Пример 11. Конструкции вектора экспрессии для экспрессии инсектицидных полипептидов в растениях

Векторы экспрессии для растений могут быть сконструированы так, чтобы включать в себя трансгенную кассету, содержащую кодирующую последовательность инсектицидного полипептида под контролем промотора вируса мозаики мирабилис (MMV) [Dey N and Maiti IB, 1999, Plant Mol. Biol. 40(5):771-82] в сочетании с энхансерным элементом. Эти конструкции могут быть использованы для генерации трансгенных событий маиса с целью тестирования эффективности в отношении кукурузных червей, обеспечиваемой экспрессией инсектицидного полипептида по настоящему раскрытию.

Эффективность в теплицах T0 трансгенных событий может быть измерена по защите корней от западного кукурузного жука. Защиту корня оценивали, основываясь на количестве узлов пораженных корней (CRWNIS=показатель поражения узлов кукурузным жуком), с применением способа, разработанного Oleson, et al. (2005) [J. Econ Entomol. 98(1):1-8]. Показатель поражения корня оценивали от ʺ0ʺ до ʺ3ʺ, при этом ʺ0ʺ указывал на отсутствие видимого поражения корня, ʺ1ʺ означало 1 узел корневого повреждения, ʺ2ʺ означало 2 узла корневого повреждения, и ʺ3ʺ означало максимальный показатель в 3 узла корневого повреждения. Средние показатели (например, 1,5) указывают на дополнительную долю узлов повреждения (например, один и половина пораженного узла).

--->

СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> Pioneer Hi-Bred International INc.

Steve, Gruver

Heather, Kozy

Jessica, O'Rear

Rosen, Barbara

Schellenberger, Ute

Wei, Zun-Zhi

Xie, Weiping

Zhong, Xiaohong

Zhu, Genhai

<120> ИНСЕКТИЦИДНЫЕ БЕЛКИ И СПОСОБЫ ИХ ПРИМЕНЕНИЯ

<130> 5914-PCT

<150> 62/103787

<151> 2015-01-15

<160> 245

<170> PatentIn версия 3.5

<210> 1

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 1

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Pro Thr Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Ser Leu Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Ile Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Thr Ile Asp Trp Gln Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asp Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Gln Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ala Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ser Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Ser Val Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Lys Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Val Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Ser Gly Gln Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Thr Thr Pro Ile

420 425 430

Ser Pro Thr Pro Asp Ser Cys Pro Cys Val Lys Asp Arg Val Asn Gly

435 440 445

Val Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Thr Ser Gly

465 470 475 480

Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr Thr Ala Glu

485 490 495

Thr Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Gly Tyr Leu Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp Asn

545 550 555 560

Pro Ser Ala Thr Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 2

<211> 535

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 2

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Val Leu Ser Leu Leu Thr Ser Val Val

1 5 10 15

Leu Ser Leu Phe Ala Met Gln Ala Ala Tyr Ala Ser Pro Thr Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Lys Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Ile Asn Asn Phe Asn Ala Thr Gly Gln Ser Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Pro Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Thr Ala Ser Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Ala Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Arg Ala Ile Ser Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Arg

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gln Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Ser Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Thr Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Asn Gln Asn Pro Gly Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Asn Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Val Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr

290 295 300

Leu Gln Cys Thr Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asn Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asp Ser Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asn Cys Gly Thr Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Glu Pro Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Leu Pro Thr Glu Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln Gln Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Thr Pro Asn Pro Pro Thr

435 440 445

Gln Pro Glu Pro Gly Val Ser Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Ala Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Ser Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Asp Ser Ala Ser Lys Asn Ser Leu Val Lys Arg Val Lys Ala Phe

515 520 525

Gln Thr Leu Lys Asp Gln Pro

530 535

<210> 3

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. Ag1

<400> 3

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Pro Thr Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Ser Met Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Ile Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Gln Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asp Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Thr Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Gln Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ser Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Ser Val Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Lys Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Val Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Glu Ile Thr Ile Ser Gly Gln Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Thr Thr Pro Ile

420 425 430

Ser Pro Thr Pro Asp Ser Cys Pro Cys Val Thr Asp Arg Val Asn Gly

435 440 445

Val Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Thr Ser Gly

465 470 475 480

Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr Thr Ala Glu

485 490 495

Thr Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Lys Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Gly Tyr Leu Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp Asn

545 550 555 560

Pro Ser Ala Ala Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 4

<211> 536

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. Ag1

<400> 4

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Val Leu Ser Leu Leu Thr Ser Val Val

1 5 10 15

Leu Ser Leu Phe Ala Met Gln Ala Ala Tyr Ala Ser Pro Thr Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Lys Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Ile Asn Asn Phe Asn Ala Thr Gly Gln Ser Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Pro Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Thr Ala Ser Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Ala Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Arg Ala Met Ser Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Arg

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gln Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Ser Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Asn Gln Asn Pro Gly Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Asn Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Val Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr

290 295 300

Leu Gln Cys Thr Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asp Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asp Ser Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asn Cys Gly Thr Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Gln His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Glu Pro Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Leu Pro Thr Glu Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln Gln Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Thr Pro Asn Pro Pro Thr

435 440 445

Gln Pro Glu Pro Gly Val Ser Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Ala Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Ser Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Asp Ser Ala Ser Lys Lys Ser Leu Val Lys Arg Val Lys Ala Phe

515 520 525

Gln Thr Leu Lys Asp Gly Ser Pro

530 535

<210> 5

<211> 579

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 5

Met Ser Thr Pro Phe Asn Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Pro Thr Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Thr Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Gln Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Pro Gly Thr Gln Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr

180 185 190

Cys Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn

195 200 205

Ala Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Gln Val Gln Leu

210 215 220

Glu Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Pro Thr Gly Asn Lys

225 230 235 240

Gly Asp Pro Val Met Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr

245 250 255

Val Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly

260 265 270

Gly Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val

275 280 285

Tyr Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ala Ser Ser Gln

290 295 300

Asn Ser Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg

305 310 315 320

Asn Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Ser Val Ala Val Asn

325 330 335

Asn Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro

340 345 350

Thr Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln

355 360 365

Tyr Trp Lys Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser

370 375 380

Asp Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Val Ser Ala Gly Phe

385 390 395 400

Ser Ile Asn Asp Ile Thr Ile Ser Gly Gln Ser Ile Asp Tyr Val Trp

405 410 415

Val Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Thr Thr Pro

420 425 430

Ile Ser Pro Thr Pro Glu Ser Cys Pro Cys Val Thr Asp Arg Val Thr

435 440 445

Gly Val Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr

450 455 460

Gly Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Thr Ser

465 470 475 480

Gly Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr Thr Ala

485 490 495

Glu Thr Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Val Val

500 505 510

Thr Lys Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser

515 520 525

Gly Gly Thr Gln Gly Tyr Leu Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala

530 535 540

Ala Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp

545 550 555 560

Asn Pro Ser Ala Ala Gln His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val

565 570 575

Pro Gly Ala

<210> 6

<211> 535

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 6

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Val Leu Ser Leu Leu Thr Ser Val Val

1 5 10 15

Leu Ser Leu Phe Ala Val Gln Ser Ala Tyr Ala Thr Pro Gln Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Gly Gln Ser Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Pro Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met His

85 90 95

Ser Ser Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Pro Ala Ser Gly Gln Pro Met

100 105 110

Thr Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Val Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Met Ala Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Arg

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Lys Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Ser Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Thr Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Asn Gln Asn Pro Gly Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Asp Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Val Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr

290 295 300

Leu Gln Cys Thr Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asp Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asp Ser Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asn Cys Gly Thr Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Glu Pro Tyr Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Leu Pro Thr Glu Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln Gln Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Thr Pro Asn Pro Pro Thr

435 440 445

Gln Pro Glu Pro Gly Val Ser Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Ala Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Ser Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Asp Ser Ala Ser Lys Lys Ser Leu Val Lys Arg Val Lys Ala Phe

515 520 525

Glu Thr Leu Lys Asp Gln Pro

530 535

<210> 7

<211> 579

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 7

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Pro Thr Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Thr Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Gln Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Pro Gly Thr Gln Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr

180 185 190

Cys Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn

195 200 205

Ala Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Gln Val Gln Leu

210 215 220

Glu Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Pro Thr Gly Asn Lys

225 230 235 240

Gly Asp Pro Val Met Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr

245 250 255

Val Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly

260 265 270

Gly Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val

275 280 285

Tyr Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ser Ser Ser Gln

290 295 300

Asn Ser Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg

305 310 315 320

Asn Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Ser Val Ala Val Asn

325 330 335

Asn Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro

340 345 350

Thr Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln

355 360 365

Tyr Trp Lys Ile Thr Arg Gly Ala Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser

370 375 380

Asp Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Val Ser Ala Gly Phe

385 390 395 400

Ser Ile Asn Asp Ile Thr Ile Ser Gly Gln Ser Ile Asp Tyr Val Trp

405 410 415

Val Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Thr Thr Pro

420 425 430

Ile Ser Pro Thr Pro Asp Ser Cys Pro Cys Val Thr Asp Arg Val Asn

435 440 445

Gly Val Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr

450 455 460

Gly Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Thr Ser

465 470 475 480

Gly Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr Thr Ala

485 490 495

Glu Thr Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Val Val

500 505 510

Thr Lys Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser

515 520 525

Gly Gly Thr Gln Gly Tyr Leu Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala

530 535 540

Ala Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp

545 550 555 560

Asn Pro Ser Ala Ala Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val

565 570 575

Pro Gly Ala

<210> 8

<211> 535

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 8

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Val Leu Ser Leu Leu Ala Ser Val Val

1 5 10 15

Leu Ser Leu Phe Ala Leu Gln Ser Ala Tyr Ala Thr Pro Gln Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Lys Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Gly Gln Ser Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Thr Thr Ala Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Ser Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Thr Thr Ala Gly Gln Pro Met

100 105 110

Thr Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Val Pro Ser Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Met Ser Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Arg

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Thr Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Gln Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Ser Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Asn Gln Asn Pro Gly Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Thr Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr

290 295 300

Leu Gln Cys Thr Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asn Gln Leu Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asp Ser Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asn Cys Gly Thr Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Gln Gln His His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Glu Pro Tyr Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Leu Pro Thr Glu Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln Gln Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Thr Pro Asn Pro Pro Val

435 440 445

Gln Pro Glu Pro Gly Val Ser Ala Ala Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Ala Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Ser Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Asp Ser Ala Ser Lys Lys Ser Leu Val Lys Arg Val Lys Ala Phe

515 520 525

Glu Thr Leu Lys Asp Gln Pro

530 535

<210> 9

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 9

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Pro Thr Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Ser Met Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Ile Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Lys Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Gln Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asp Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Thr Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Gln Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ser Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Ser Val Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Lys Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Val Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Ser Gly Gln Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Thr Thr Pro Ile

420 425 430

Ser Pro Thr Pro Asp Ser Cys Pro Cys Val Thr Asp Arg Val Asn Gly

435 440 445

Val Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Thr Ser Gly

465 470 475 480

Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr Thr Ala Glu

485 490 495

Thr Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Lys Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Gly Tyr Leu Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp Asn

545 550 555 560

Pro Ser Ala Ala Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 10

<211> 536

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 10

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Val Leu Ser Leu Leu Thr Ser Val Val

1 5 10 15

Leu Ser Leu Phe Ala Met Gln Ala Ala Tyr Ala Ser Pro Thr Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Lys Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Ile Asn Asn Phe Asn Ala Thr Gly Gln Ser Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Pro Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Thr Ala Ser Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Val Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Arg Ala Met Ser Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Arg

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gln Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Ser Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Asn Gln Asn Pro Gly Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Asn Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Val Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr

290 295 300

Leu Gln Cys Thr Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asn Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asp Ser Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asn Cys Gly Thr Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Gln His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Glu Pro Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Leu Pro Thr Glu Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln Gln Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Thr Pro Asn Pro Pro Thr

435 440 445

Gln Pro Glu Pro Gly Val Ser Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Ala Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Ser Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Asp Ser Ala Ser Lys Lys Ser Leu Val Lys Arg Val Lys Ala Phe

515 520 525

Gln Thr Leu Lys Asp Gly Ser Pro

530 535

<210> 11

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 26793

<400> 11

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Pro Ser Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Ser Met Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Ile Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Thr Ile Asp Trp Gln Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Gln Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ala Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ser Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Ser Val Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Lys Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Val Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Ser Gly Gln Pro Ile Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Thr Thr Pro Ile

420 425 430

Ser Pro Thr Pro Asp Ser Cys Pro Cys Val Thr Asp Arg Val Asn Gly

435 440 445

Val Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Thr Ser Gly

465 470 475 480

Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr Thr Ala Glu

485 490 495

Thr Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Ser Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Gly Tyr Leu Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp Asn

545 550 555 560

Pro Ser Ala Thr Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 12

<211> 535

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 26793

<400> 12

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Val Leu Ser Leu Leu Thr Ser Val Val

1 5 10 15

Leu Ser Leu Phe Ala Met Gln Ala Ala Tyr Ala Ser Pro Thr Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Lys Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Ile Asn Asn Phe Asn Ala Thr Gly Gln Ser Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Pro Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Pro Ala Ser Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Ala Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Arg Ala Met Ser Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Arg

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gln Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Ser Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Ile Asp Asn Gln Asn Pro Gly Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Asn Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Val Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr

290 295 300

Leu Gln Cys Thr Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asn Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asp Ser Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asn Cys Gly Thr Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Glu Pro Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Leu Pro Thr Glu Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln Gln Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Thr Pro Asn Pro Pro Thr

435 440 445

Gln Pro Glu Pro Gly Val Ser Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Ala Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Ser Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Asp Ser Ala Ser Lys Lys Ser Leu Val Lys Arg Val Lys Ala Phe

515 520 525

Gln Thr Leu Lys Asp Gln Pro

530 535

<210> 13

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 13

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Ala Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Ala Thr Leu Gln Ala Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Thr Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 14

<211> 535

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 14

Met Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Pro Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile

1 5 10 15

Leu Leu Cys Leu Ser Thr Leu Gln Pro Ala Thr Ala Ala Thr Leu Ser

20 25 30

Asp Ala Asp Thr Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser

35 40 45

Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe

50 55 60

Met Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val

65 70 75 80

Asn Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met

85 90 95

Gln Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Ala Pro Gly Gln Pro

100 105 110

Met Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile

115 120 125

Phe Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu

130 135 140

Val Pro Ser Gly Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val

145 150 155 160

Gly Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala

165 170 175

Leu His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp

180 185 190

Pro Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys

195 200 205

Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile

210 215 220

Val Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln

225 230 235 240

Asn Leu Asp Gly Gln Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu

245 250 255

Pro Met Arg Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly

260 265 270

Ala Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu

275 280 285

Leu Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp

290 295 300

Thr Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile

305 310 315 320

Ile Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu

325 330 335

Gln Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr

340 345 350

Pro Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Asp Gly Pro

355 360 365

Glu Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Thr His Pro

370 375 380

Asp Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr

385 390 395 400

Thr Arg Glu His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala

405 410 415

Val Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln

420 425 430

Tyr Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro

435 440 445

Ser Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Gly Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe

515 520 525

Glu Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530 535

<210> 15

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Грибной сад комбинированный

<400> 15

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Ala Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Ala Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Thr Thr Pro Gln Ala Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Arg Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Ala Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Thr Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 16

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Грибной сад комбинированный

<400> 16

Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Thr Pro Gln Pro Ala Thr Ala Ala Thr Leu Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Thr Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Gln

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Ala Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Gly Cys Ser Thr Gln Gly Asn Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Gly Gln Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Asp Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Thr His Pro Asp

370 375 380

Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Gly Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530

<210> 17

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 17

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Ala Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Ala Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Ala Thr Pro Gln Ala Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Ala Leu Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Thr Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 18

<211> 535

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 18

Met Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile

1 5 10 15

Leu Leu Cys Leu Ser Thr Pro Gln Pro Ala Thr Ala Ala Thr Leu Ser

20 25 30

Asp Ala Asp Thr Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser

35 40 45

Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe

50 55 60

Met Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val

65 70 75 80

Asn Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met

85 90 95

Gln Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Thr Pro Gly Gln Pro

100 105 110

Met Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile

115 120 125

Phe Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu

130 135 140

Val Pro Ser Asp Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Thr Leu Lys Val

145 150 155 160

Gly Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala

165 170 175

Leu His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp

180 185 190

Pro Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys

195 200 205

Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile

210 215 220

Val Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Arg

225 230 235 240

Asn Leu Asp Gly Gln Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu

245 250 255

Pro Met Arg Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly

260 265 270

Ala Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu

275 280 285

Leu Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp

290 295 300

Thr Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile

305 310 315 320

Ile Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu

325 330 335

Gln Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr

340 345 350

Pro Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Asn Gly Pro

355 360 365

Glu Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Thr His Pro

370 375 380

Asp Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr

385 390 395 400

Thr Arg Glu His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala

405 410 415

Val Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln

420 425 430

Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro

435 440 445

Ser Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro

450 455 460

Phe Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr

465 470 475 480

Tyr Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile

485 490 495

Ala Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser

500 505 510

Ala Gly Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe

515 520 525

Glu Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530 535

<210> 19

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 19

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Ala Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Thr Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Lys Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Lys Arg Cys Pro Ser Ile Ala Trp Asn Gly Thr Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Thr Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Glu Tyr Ile Asp Pro Ser Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Ala Glu Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Met Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Val Thr Pro Gln Ser Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Asn Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Lys Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ala Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Asp Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 20

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 20

Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Thr Pro Gln Pro Ala Met Ala Ala Thr Leu Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Ala Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Gly Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ser Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Arg Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Gln Asp Gly Lys Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Asn Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Ala Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Ser Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp

370 375 380

Lys Gln Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Ile Pro Ser Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Gly Ser Ala Ser Thr Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe Gln

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Gln Pro

530

<210> 21

<211> 581

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 21

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Ile Thr Gly Trp Thr Glu Ala Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Tyr Asp Ala Pro Arg Ser Ala Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Asp Thr Thr Leu Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Asn Lys Ala Met Thr Leu Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Ile Asn Gly Thr Leu

115 120 125

Tyr Thr Leu Tyr Asp Pro Asp Lys Lys Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Thr Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Thr Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Ser

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Gln

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Cys Lys Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Leu Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ser Gly Thr Ala Cys Thr Pro Gly Gln Phe Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Met Arg Pro Leu Lys Ser Ser Gln Ser

290 295 300

Ala Gln Ala Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ala Ala Asn Gly Ala Thr Asn Asp Gly

325 330 335

Ala Thr Pro Ser Arg Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Ala Leu Tyr Leu

340 345 350

Gln Gln Pro Thr Asn Phe Asn Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp

355 360 365

Val Ser Gln Tyr Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ile

370 375 380

Asn Gly Ser Asp Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser

385 390 395 400

Ala Gly Phe Ser Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Gly Gln Ala Val Asp

405 410 415

Tyr Val Trp Val Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr

420 425 430

Thr Met Pro Ser Thr Ala Gln Gln Gln Ser Pro Cys Val Gln Asp Arg

435 440 445

Val Asn Gly Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu

450 455 460

Phe Tyr Gly Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly

465 470 475 480

Thr Ser Gly Gln Phe Ala Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Lys Thr

485 490 495

Thr Ala Ala Thr Ala Arg Ile Gln Phe Asn Asn Pro Gly Val Thr Ala

500 505 510

Gln Val Thr Glu Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr

515 520 525

Asn Ala Gly Gly Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Ile Thr Val Ala Lys

530 535 540

Asp Ala Ala Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu

545 550 555 560

Ala Asp Asn Val Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala

565 570 575

Leu Val Pro Ser Thr

580

<210> 22

<211> 532

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 22

Met Tyr Arg Phe Arg Leu Arg Gly Leu Leu Leu Val Gly Thr Leu Leu

1 5 10 15

Ser Leu Phe Leu Leu Pro Thr Ala Gln Ala Ser Asp Ala Asp Thr Cys

20 25 30

Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asp Pro Asn Ser Gly Gly Phe Leu Pro

35 40 45

Val Asn Asn Phe Asn Thr Thr Gly Gln Ser Phe Met Asn Cys Phe Gly

50 55 60

Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asp Pro Gly Trp Pro

65 70 75 80

Ala Asn Ala Ala Leu Ala Gly Glu Pro Asn Arg Lys Ile Ser Met Ala

85 90 95

Gln Phe Gly Val Pro Gln Val Ala Gly Gln Pro Met Thr Thr Ala Pro

100 105 110

Val Trp Ala Ser Phe Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe Leu Pro Gly Ala

115 120 125

Arg Pro Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val Pro Ser Asn Cys

130 135 140

Ser Ser Glu Gly Ser Leu Lys Ala Leu Ser Val Gly Ala Arg Lys Phe

145 150 155 160

Met Asn Ala Thr Ser Glu Ser Ala Thr Asn Ala Lys His Arg Phe His

165 170 175

Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro Ile Met Glu Ala

180 185 190

Ala Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Thr Gly Asn Leu Val Tyr Phe Glu

195 200 205

Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val Lys Tyr Gly Leu

210 215 220

Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Met Val Val Ala Gln Asn Ser Asp Gly Asn

225 230 235 240

His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly Glu Leu Met Arg Ser Met

245 250 255

Pro Ala Gln Pro Leu Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala Leu Glu Leu Lys

260 265 270

Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Gln Leu Tyr Gly Arg Tyr

275 280 285

Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr Leu Gln Cys Thr

290 295 300

Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile Asn Lys Thr Gln

305 310 315 320

Ser Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln Val Asp Asn Val

325 330 335

Gln Glu Pro Gly Gln Val Pro Ala Gln Gln Thr Pro Pro Asp Gly Phe

340 345 350

Thr Phe Tyr Asn Pro Asn Cys Thr Gly Gly Pro Asp Val Cys Thr Pro

355 360 365

Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Gln Gln His His Pro Asp Arg Glu Cys

370 375 380

Thr Glu Pro Tyr Pro Arg Asn Gln Pro Val Gln Thr Thr Arg Glu His

385 390 395 400

Pro Leu Pro Ser Asp Met Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val Gln Ala Asn

405 410 415

Phe Ala Gln Gln Thr Asn Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu

420 425 430

Val Asn Val Leu Trp Ile Thr Ala Pro Thr Ala Pro Asp Pro Glu Pro

435 440 445

Gly Ala Gly Ala Lys Val Pro Leu Ser Tyr Gly Ala Phe Ile Ser Asp

450 455 460

Ser Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Val Gln Ser

465 470 475 480

Met Asp Cys Asn Ala Cys His Gln Gln Ala Thr Ile Ala Gly Ser Ser

485 490 495

Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Asn Ala Asp Ser Ala

500 505 510

Lys Gln Lys Ser Leu Ile Lys Arg Val Asn Ala Phe Glu Thr Leu Lys

515 520 525

Asp Gly Pro Pro

530

<210> 23

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 23

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Val Thr Gly Trp Thr Glu Ala Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Tyr Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Tyr Gly Asp Thr Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Ser Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp Asn Gly Gln Ile Thr Ile Asn Asp Thr Leu

115 120 125

Tyr Thr Leu Tyr Asp Pro Asp Lys Lys Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Val Thr Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asp Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Ser

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Ala Thr Asp Cys Pro Thr Gly Asn Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Leu Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Thr Pro Gly Gln Phe Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Met Arg Pro Leu Lys Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Pro Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ala Ala Asn Glu Ala Ala Ile Ser Asn

325 330 335

Arg Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Ala Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asn Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ile Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Gln Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Gly Gln Ala Val Asp Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Met Pro Ser

420 425 430

Thr Thr Ala Ala Pro Ser Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Asn Gly Leu

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Gly Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Leu Gln Thr Thr Ala Ala Thr

485 490 495

Ala Arg Ile Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr Lys

500 505 510

Phe Met Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ala Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Ile Ser Val Ala Ala Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Ala Asp Asn Val

545 550 555 560

Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Ser

565 570 575

Thr

<210> 24

<211> 532

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 24

Met Ser Arg Phe Arg Leu Ser Arg Leu Leu Leu Val Ser Thr Leu Leu

1 5 10 15

Ser Leu Phe Ile Leu Pro Leu Ala His Ala Ser Asp Ala Asp Asn Cys

20 25 30

Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Lys Ser Gly Gly Phe Met Pro

35 40 45

Val Asn Asn Phe Asn Thr Thr Gly Gln Ser Phe Met Asn Cys Phe Gly

50 55 60

Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asp Pro Gly Trp Pro

65 70 75 80

Ala Asn Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Arg Thr Ile Thr Val Ala

85 90 95

Gln Phe Gly Val Pro Thr Thr Ala Gly Gln Pro Met Ser Val Ala Pro

100 105 110

Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Glu Ile Phe Leu Pro Gly Ala

115 120 125

Pro Lys Pro Ser Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val Pro Pro Asn Cys

130 135 140

Ser Ser Gln Asp Ser Leu Gln Ala Leu Ser Val Gly Ala Arg Lys Phe

145 150 155 160

Met Asn Ala Thr Ser Glu Ser Ala Thr Asn Ala Lys His Arg Phe His

165 170 175

Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro Ile Met Glu Ala

180 185 190

Ala Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Thr Gly Asn Leu Val Tyr Phe Glu

195 200 205

Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val Asp Asn Gly Leu

210 215 220

Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val Ala Gln Asn Ser Asp Gly Lys

225 230 235 240

His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly Glu Leu Met Arg Ser Met

245 250 255

Pro Thr Thr Pro Leu Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala Leu Glu Leu Lys

260 265 270

Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Gln Pro Gln Leu Tyr Gly Arg Tyr

275 280 285

Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Asn Pro Ala Thr Leu Gln Cys Thr

290 295 300

Gln Gln Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile Asn Lys Thr Gln

305 310 315 320

Ser Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu His Val Asp Asn Val

325 330 335

Pro Glu Pro Gly Gln Val Pro Ala Gln Gln Leu Pro Pro Asp Gly Tyr

340 345 350

Thr Phe Asn Asn Pro Asn Cys Thr Gly Gly Pro Asp Val Cys Thr Pro

355 360 365

Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp Arg Glu Cys

370 375 380

Thr Glu Pro Tyr Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr Arg Glu His

385 390 395 400

Pro Leu Ser Ser Asp Met Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val Gln Ala Ser

405 410 415

Phe Ala Gln Gln Thr Asn Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu

420 425 430

Ile Asn Val Leu Trp Ile Thr Ala Pro Thr Pro Pro Asp Pro Glu Pro

435 440 445

Gly Pro Asn Ala Lys Val Pro Leu Ser Tyr Gly Ala Phe Ile Ser Asp

450 455 460

Ser Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr Tyr Val Gln Gly

465 470 475 480

Met Asn Cys Asn Asp Cys His Gln Gln Ala Thr Ile Ala Gly Ser Ala

485 490 495

Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Asn Ala Asp Ser Ala

500 505 510

Lys His Thr Ser Leu Ile Lys Arg Val His Ala Phe Glu Thr Leu Lys

515 520 525

Asp Gly Gln Pro

530

<210> 25

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 25

Met Ser Ala Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Ala Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Ala Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Gly Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Thr Ala Pro Gln Ala Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Ser Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Ala Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Thr Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 26

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 26

Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Thr Pro Gln Pro Ala Thr Ala Ala Thr Leu Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Thr Cys Val Gln Lys Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Gln

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Ala Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Glu Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Gly Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Gly Gln Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Asp Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Thr His Pro Asp

370 375 380

Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Val His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Gly Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530

<210> 27

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas plecoglossicida

<400> 27

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Ala Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Arg Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Gly Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Phe Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Thr Thr Pro Gln Ala Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Thr Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 28

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas plecoglossicida

<400> 28

Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Thr Leu Gln Pro Ala Thr Ala Ala Thr Leu Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Thr Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Gln

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Ala Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Gly Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Gly Gln Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Asp Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Asn Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Thr His Pro Asp

370 375 380

Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Gly Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530

<210> 29

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 29

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Ala Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Ala Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Met Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Thr Val Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Lys Val Asn Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ser Thr Ala Pro Gln Ala Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Thr Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Ala Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Thr Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 30

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 30

Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Cys Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Thr Pro Gln Pro Ala Thr Ala Ala Thr Leu Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Thr Cys Val Gln Lys Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Gln

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Thr Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Asp Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Thr Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Asp Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Arg Asn

225 230 235 240

Leu Asp Gly Gln Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Thr Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Asn Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Thr His Pro Asp

370 375 380

Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asn Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Gly Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530

<210> 31

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 31

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Thr Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Ala Asp His Gly Gln Ile Ser Leu Asp Asn Thr Val

115 120 125

Tyr Arg Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Gln Gly Asn Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Ala Trp Asn Gly Pro Tyr Lys Asp Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Gly Asn Gly Lys Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Glu Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Glu Asp Gly Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Glu Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Lys Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Val Ser Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Ser Thr Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp His Ile Thr Arg Gly Ala Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Ile Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Glu Val Thr Ile Asn Lys Gln Pro Val Asn His Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu

420 425 430

Ala Ala Thr Pro Ala Ser Tyr Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Ala Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Asn Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Glu Asn Thr Thr Ala Glu

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Tyr Leu Pro Asp Ala Thr Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Thr Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Asp Glu Asp Ala Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 32

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 32

Met Ser Ser Leu Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Ser Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Ala Gln Gln Thr Ala Thr Ala Ala Thr Gln Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ser Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Ala Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Leu Gly Trp Pro Gly Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Leu Asn

85 90 95

Ser Ser Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ala Thr Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Ser Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ala Asn Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Lys Ser Ala Ile Asn Val Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Ser Pro Asp Pro

180 185 190

Phe Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Asp Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Gln Asp Gly Lys Ser Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Ala Ala Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Val Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Ala Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Ala Gln Ala Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Ser Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Thr Pro Asn Gln Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp

370 375 380

Lys Asp Cys Thr Asp Arg Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Val Pro Gly Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ala Asn Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Asp Ser Ala Ser Asn Lys Ser Leu Ile Lys Ser Val Lys Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Leu Pro

530

<210> 33

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 33

Met Ser Thr Pro Phe Asn Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Ser Asp Trp Asn Asn Tyr Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Ser Leu Tyr Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Val Val Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Ile Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Gln Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Ala Asp Tyr Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asp Thr Leu

115 120 125

Tyr Thr Leu Tyr Asp Pro Asp Asn Lys Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Lys Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Tyr Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Glu Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Leu Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Phe Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Thr Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Ser Lys Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Val Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Glu Ile Thr Ile Asn Lys Gln Pro Val Asp Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Ser Ala Leu Pro Pro

420 425 430

Ala Thr Thr Pro Pro Ser Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Val Thr Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Cys Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Gln Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Ala Gln

485 490 495

Ser Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Ser Ala Gln Val Thr

500 505 510

Gln Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ala Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Ser Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Gly Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 34

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 34

Met Ser Arg Leu Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Ser Gly Met Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Ser Thr Leu Pro Ala Ala Thr Ala Ala Pro Met Thr Glu

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Ser Asn Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Ala Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Asp Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Lys Pro Ser Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Gly Cys Gly Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn Ala Val

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Leu Ala Ser Leu Pro Asp Ser

180 185 190

Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ala Gly Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Gly Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Ala Asp Gly Thr Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Thr Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Gly Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ala Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Ser Gly Pro Glu

355 360 365

Cys Glu Pro Asn Gln Pro Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp

370 375 380

Arg Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Val Pro Ser Asp Leu Gln Ala Leu Asn Gly Ala Val

405 410 415

Gln Ala Thr Phe Ala Gln His Ser Gln Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Pro Val Pro Leu Ser Tyr Gly Ala Tyr

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Ser Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Ser Ser Ala Ser Lys His Ser Leu Ile Lys Arg Val Gln Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Arg Arg

530

<210> 35

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas poae

<400> 35

Met Ser Thr Pro Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Ala Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Val Thr Gly Trp Thr Gln Met Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Glu Ser Gly Tyr Gly Thr Leu Thr Pro Lys Thr Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Glu Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asp Thr Leu

115 120 125

Tyr Ser Leu Tyr Pro Asp Pro Lys Ala Thr Gln Leu Gln Ile Pro Ser

130 135 140

Val Leu Cys Lys Ser Ile Asn Trp Asn Gly Pro Tyr Ala Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Arg Asp Pro Asp Gly Asn Met Arg Ser Ile Met Phe Thr Ser Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Asn Ile Asp Pro Gly Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Gln Ala Tyr Val Asp Pro Gln Val Lys Leu Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Gly Pro Thr Gly Lys Ala Gly Glu

225 230 235 240

Pro Val Leu Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ser Gly Thr Val Arg Ile Pro Gly Val Ser Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Thr Ser Ser Gln Asn Gln

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Gln Ala Ala Val Asn Asn Leu

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Ser

340 345 350

Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Ser Tyr Trp

355 360 365

Arg Val Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Asn Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Ala Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Glu Ile Thr Ile Asn Gly Thr Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Asn Glu Leu Asn Val Ala Leu Ser Val Thr Pro Ala Pro Leu Thr

420 425 430

Ala Gln Pro Lys Glu Cys Ala Cys Val Ala Ala Asn Thr Thr Asp Ala

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Ile Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Ser Phe Ala Pro Gly Ser Ser Gly Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Ala Ala Asp

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Thr Ala Gln Val Thr Gln

500 505 510

Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp Gly Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Ile Thr Val Ser Ser Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Ser Glu Ala Ala Asn Pro

545 550 555 560

Ser Ala Ser Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Ser

565 570 575

Ala

<210> 36

<211> 529

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas poae

<400> 36

Met Asn Gly Trp Leu Arg Pro Leu Arg Arg Ala Arg Leu Arg Ile Ala

1 5 10 15

Cys Ala Ile Thr Cys Thr Leu Leu Pro Leu Leu Ala Ala Thr Pro Ala

20 25 30

Asn Ala Ala Ser Asp Ala Gln Ser Cys Val Ser Gln Leu Val Phe Asp

35 40 45

Pro Thr Ser Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Gly Thr Glu Gln

50 55 60

Ala Phe Leu Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Met Asn Trp

65 70 75 80

Pro Val Asn Pro Gly Trp Pro Ala Asn Pro Ser Leu Ala Gly Glu Pro

85 90 95

Asp Thr Gln Ser Ser Ala Ala Gln Phe Gly Val Pro Pro Thr Pro Gly

100 105 110

Gln Pro Met Ser Asn Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Ser

115 120 125

Glu Ile Phe Leu Pro Gly Ala Ala Lys Pro Ser Gly Trp Gly Val Glu

130 135 140

Thr Leu Val Pro Ser Asn Cys Thr Ala Thr Gly Asn Leu Lys Ala Phe

145 150 155 160

Ala Thr Gly Ala Arg Lys Phe Ile Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile

165 170 175

Asn Arg Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Gln Val Thr Leu

180 185 190

Pro Asp Ser Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser

195 200 205

Gly Asn Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp

210 215 220

Tyr Ile Val Asp Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val

225 230 235 240

Ala Gln Asn Ser Asp Asn Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala

245 250 255

Gly Lys Pro Val Arg Glu Leu Pro Ala Lys Ala Leu Pro Gln Glu Glu

260 265 270

Leu Gly Ala Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Asn Lys

275 280 285

Pro Asp Leu Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Gln Arg

290 295 300

Pro Asp Thr Leu Gln Cys Thr Gln Glu Val Ile Gly Leu Val Gly Leu

305 310 315 320

His Ile Ile Asn Lys Thr Gln Thr Gln Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr

325 330 335

Phe Glu Gln Ile Asp Asn Val Pro Asp Gly Gly Ala Ala Pro Pro Gln

340 345 350

Gly Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Glu Cys Thr Gly Asp Ala Cys Ala Pro

355 360 365

Asn Val Ala Arg Val Gln Cys Asp Ala Thr His Thr Pro Pro Asp Cys

370 375 380

Thr Pro Leu Asp Gln Pro Val Gln Ala Thr Arg Leu Asn Ala Thr Pro

385 390 395 400

Gln Asp Met Gln Ala Leu Asn Thr Ala Val Gln Gln Thr Phe Ala Gln

405 410 415

Gln Thr Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val

420 425 430

Leu Trp Ser Lys Thr Pro Asn Ala Pro Asn Asp Pro Gly Pro Gly Pro

435 440 445

Asn Val Lys Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Val Ser Asp Gln Ser

450 455 460

Val Val Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Val Gln Thr Asp Asn

465 470 475 480

Cys Asn Asp Cys His Gln Tyr Ala Ala Ile Ala Gly Lys Ser Gly Leu

485 490 495

Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Gly Asn Ala Asp Ser Ala Lys Asn

500 505 510

Thr Arg Leu Ile Lys Arg Ile Glu Ser Phe Lys Thr Leu Lys Asp Asn

515 520 525

Pro

<210> 37

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробные сообщества лубоеда сосны горной

<400> 37

Met Ser Thr Pro Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Thr Phe Glu

20 25 30

Thr Asn Trp Asn Asn Asn Val Thr Gly Trp Thr Gln Met Ser Val Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Glu Ser Gly Tyr Gly Thr Gln Thr Pro Val Thr Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Ser Leu Tyr Pro Asp Pro Lys Ala Thr Gln Leu Gln Ile Pro Ser

130 135 140

Val Leu Cys Lys Ser Ile Asn Trp Asn Gly Pro Tyr Ala Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Arg Asp Pro Asp Gly Asn Met Arg Ser Ile Met Phe Thr Ser Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Asn Ile Asp Pro Gln Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Lys Ala Tyr Val Asp Pro Gln Val Lys Ile Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asn Gly Pro Thr Gly Gln Ala Gly Glu

225 230 235 240

Pro Val Leu Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ser Gly Thr Val Arg Ile Pro Gly Val Ser Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Asn Ser Ser Arg Asn Gln

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Gln Ala Ala Val Asn Asn Leu

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Ser

340 345 350

Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Ser Tyr Trp

355 360 365

Arg Val Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Asn Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Gln Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Asp Ile Thr Ile Asn Gly Thr Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Asn Glu Leu Asn Val Ala Leu Ser Val Thr Pro Ala Pro Leu Pro

420 425 430

Ala Pro Pro Lys Glu Cys Asp Cys Val Ala Ala Asn Asn Thr Asp Ala

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Ile Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Ser Phe Ala Pro Gly Ser Ser Gly Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Ala Ala Asp

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Thr Ala Gln Val Thr Gln

500 505 510

Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp Ser Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Val Thr Val Ser Ser Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Ser Glu Gly Ala Asn Pro

545 550 555 560

Ser Ala Thr Gln His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Asp

565 570 575

Ala

<210> 38

<211> 529

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробные сообщества лубоеда сосны горной

<400> 38

Met Asn Gly Trp Leu Arg Pro Leu Arg Arg Ala Arg Leu Arg Val Phe

1 5 10 15

Cys Trp Ile Thr Cys Ala Leu Leu Pro Leu Leu Ala Pro Ser Pro Ala

20 25 30

Asn Ala Ala Thr Asp Ala Gln Ser Cys Val Ser Gln Leu Val Phe Asp

35 40 45

Pro Thr Ser Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Gly Thr Glu Gln

50 55 60

Asp Phe Leu Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Met Asn Trp

65 70 75 80

Pro Val Asn Pro Gly Trp Pro Ala Asn Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro

85 90 95

Asp Thr Gln Ser Ser Val Ala Gln Phe Gly Val Pro Ala Thr Pro Gly

100 105 110

Gln Pro Met Ser Asn Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Ser

115 120 125

Glu Ile Phe Leu Pro Gly Ala Pro Lys Pro Ser Gly Trp Gly Leu Glu

130 135 140

Thr Leu Val Pro Ser Asn Cys Thr Ala Ser Gly Asn Leu Lys Ala Tyr

145 150 155 160

Ala Thr Gly Ala Arg Lys Phe Ile Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile

165 170 175

Asn Arg Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Gln Val Thr Leu

180 185 190

Pro Asp Ser Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser

195 200 205

Gly Asn Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp

210 215 220

Tyr Ile Val Asp Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val

225 230 235 240

Ala Gln Asn Ser Asp Asn Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala

245 250 255

Gly Lys Leu Val Arg Glu Leu Pro Ala Gln Ala Leu Pro Gln Glu Glu

260 265 270

Leu Gly Ala Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Asn Lys

275 280 285

Pro Glu Leu Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Gln Arg

290 295 300

Pro Asp Thr Leu Gln Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu

305 310 315 320

His Ile Ile Asn Lys Thr Gln Thr Gln Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr

325 330 335

Phe Glu Gln Val Asp Asn Val Pro Asp Ala Gly Pro Thr Pro Pro Gln

340 345 350

Gly Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Ala Cys Ser Gly Thr Ala Cys Thr Pro

355 360 365

Asn Val Ala Arg Val Gln Cys Asp Ala Thr His Ala Pro Pro Asn Cys

370 375 380

Thr Pro Leu Asp Gln Pro Val Gln Ala Thr Arg Val Asn Ala Thr Pro

385 390 395 400

Gln Asp Leu Gln Ala Leu Asn Thr Ala Val Gln Gln Thr Phe Ala Gln

405 410 415

Lys Thr Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val

420 425 430

Leu Trp Ser Lys Thr Pro Asn Ala Pro Asn Asp Pro Gly Pro Gly Pro

435 440 445

Asn Val Lys Thr Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Val Ser Asp Gln Ser

450 455 460

Val Val Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Val Gln Ala Asp Asn

465 470 475 480

Cys Asn Asp Cys His Gln Tyr Ala Ala Ile Ala Gly Lys Ser Gly Leu

485 490 495

Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Gly Asn Ala Asp Ser Ala Lys Asn

500 505 510

Thr Arg Leu Ile Lys Arg Ile Glu Gly Phe Lys Thr Leu Lys Asp Asp

515 520 525

Gln

<210> 39

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas trivialis

<400> 39

Met Ser Thr Pro Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Ser Thr Phe Glu

20 25 30

Thr Asn Trp Asn Asn Asn Val Thr Gly Trp Thr Gln Met Ser Val Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Glu Ser Gly Tyr Gly Thr Gln Thr Pro Leu Thr Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Gly Thr Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Ser Leu Tyr Pro Asp Pro Ala Ala Thr Gln Leu Gln Ile Pro Lys

130 135 140

Val Leu Cys Lys Ser Ile Asn Trp His Gly Pro Tyr Ala Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Arg Asp Pro Asp Gly Asn Met Arg Ser Ile Met Phe Thr Ser Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Asn Ile Asp Pro Asn Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Gln Ala Tyr Val Asp Pro Gln Val Lys Leu Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asn Gly Pro Thr Gly Asn Ala Gly Asp

225 230 235 240

Pro Val Ile Asp Glu Thr Thr Gly Arg Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ala Gly Thr Val Arg Ile Pro Gly Val Ser Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Ile Gln Ser Ser Gly Asn Gln

290 295 300

Gln Asn Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Gln Ala Ala Val Lys Asn Leu

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Ser

340 345 350

Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Ser Tyr Trp

355 360 365

Arg Val Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Asn Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Gln Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Asp Ile Thr Ile Asn Gly Thr Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Asn Glu Leu Asn Val Ala Leu Ser Val Thr Pro Ala Pro Leu Thr

420 425 430

Ala Thr Pro Lys Glu Cys Asp Cys Val Ala Ala Asn Asn Thr Asp Ala

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Ser Phe Ala Pro Gly Ser Ser Ala Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Val Ala Asp

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Ser Ala Gln Val Thr Gln

500 505 510

Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp Ser Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Val Met Thr Val Asn Val Ser Gly Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Ser Glu Ala Ala Asn Pro

545 550 555 560

Ser Ala Ala Gln His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Gly

565 570 575

Ala

<210> 40

<211> 528

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas trivialis

<400> 40

Met Tyr Gly Trp Pro Arg Pro Leu Cys Arg Ala Arg Leu Asn Val Phe

1 5 10 15

Ser Leu Leu Ala Gly Ala Leu Leu Ser Leu Val Ala Pro Pro Pro Ala

20 25 30

Ser Ala Ser Asp Ala Gln Thr Cys Val Gln Gln Leu Val Phe Asp Pro

35 40 45

Ala Ser Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Gly Thr Glu Gln Asp

50 55 60

Phe Leu Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Met Asn Trp Pro

65 70 75 80

Val Asn Pro Gly Trp Pro Ala Asp Pro Thr Leu Ala Gly Glu Pro Asp

85 90 95

Thr Gln Ser Ser Ala Ala Gln Phe Gly Val Pro Gln Thr Pro Gly Lys

100 105 110

Pro Met Ser Asn Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp

115 120 125

Ile Phe Leu Pro Gly Ala Pro Lys Pro Thr Gly Trp Gly Val Glu Thr

130 135 140

Leu Val Pro Ser Asn Cys Thr Ala Thr Gly Asn Leu Lys Ala Leu Ser

145 150 155 160

Thr Gly Ala Arg Lys Phe Ile Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn

165 170 175

Arg Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Gln Val Thr Leu Pro

180 185 190

Asp Ser Ile Met Glu Ala Ala Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly

195 200 205

Asn Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr

210 215 220

Ile Val Asn Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val Ala

225 230 235 240

Gln Asn Ser Asp Asn Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly

245 250 255

Lys Leu Val Arg Glu Leu Pro Ala Lys Ala Leu Pro Gln Glu Glu Leu

260 265 270

Gly Ala Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr His Lys Pro

275 280 285

Glu Leu Tyr Ala Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Gln Arg Pro

290 295 300

Asp Thr Leu Gln Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His

305 310 315 320

Ile Ile Asn Lys Thr Gln Thr Gln Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe

325 330 335

Glu Gln Val Asp Asn Val Pro Asp Gly Gly Ala Thr Pro Pro Gln Gly

340 345 350

Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Ala Cys Thr Gly Asp Ala Cys Thr Pro Asn

355 360 365

Val Ala Arg Val Gln Cys Asp Ala Thr His Thr Pro Pro Asn Cys Thr

370 375 380

Pro Phe Asn Gln Pro Val Gln Ala Thr Arg Ala Asn Ala Thr Pro Glu

385 390 395 400

Asp Met Gln Ala Leu Asn Thr Ala Val Gln Gln Thr Phe Ala Gln Gln

405 410 415

Thr Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu

420 425 430

Trp Ser Lys Thr Pro Asn Ala Pro Asn Asp Pro Gly Pro Gly Pro Asn

435 440 445

Val Lys Thr Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Val Ser Asp Gln Ser Val

450 455 460

Ala Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr Tyr Val Gln Thr Glu Asn Cys

465 470 475 480

Asn Asp Cys His Gln Tyr Ala Ala Ile Ala Gly Gly Ser Lys Leu Ala

485 490 495

Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Gly Ser Ala Asp Ser Ala Lys Asn Thr

500 505 510

Arg Leu Ile Lys Arg Ile Glu Ala Phe Lys Thr Leu Lys Asp Asp His

515 520 525

<210> 41

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. R81

<400> 41

Met Ser Thr Pro Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Thr Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Val Thr Gly Trp Thr Gln Met Ser Val Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Asp Ser Gly Tyr Gly Thr Gln Thr Pro Val Thr Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asp Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Ser Leu Tyr Pro Asp Pro Lys Ala Thr Gln Leu Gln Ile Pro Ser

130 135 140

Val Leu Cys Lys Ser Ile Asn Trp Asn Gly Pro Tyr Ala Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Arg Asp Pro Asp Gly Asn Met Arg Ser Ile Met Phe Thr Ser Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Asn Ile Asp Pro Gln Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Lys Ala Tyr Val Asp Pro Gln Val Lys Ile Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asn Gly Pro Thr Gly Lys Ala Gly Glu

225 230 235 240

Pro Val Leu Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ser Gly Thr Val Arg Ile Pro Gly Val Ser Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Ile Lys Ser Ser Ala Asn Gln

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Gln Glu Ala Val Lys Ala Leu

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Ser

340 345 350

Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Ser Tyr Trp

355 360 365

His Val Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Lys Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Gln Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Glu Ile Thr Ile Asn Gly Thr Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Asn Glu Leu Ser Val Ala Leu Ser Val Thr Pro Ala Pro Leu Thr

420 425 430

Ala Thr Pro Glu Glu Cys Asp Cys Val Ala Ala Asn Thr Thr Asp Ala

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Ile Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Ser Phe Ala Pro Gly Ser Ser Gly Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Ala Ala Asp

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Thr Ala Gln Val Thr Glu

500 505 510

Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp Ser Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Val Thr Val Ser Ser Asn Ala Val Pro

530 535 540

Gly Leu Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Ser Glu Ala Ala Asn Pro

545 550 555 560

Ser Ala Thr Gln His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Gly

565 570 575

Val

<210> 42

<211> 528

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. R81

<400> 42

Met Asn Lys Trp Leu Arg Pro Leu Arg Arg Ala Arg Leu Ser Val Leu

1 5 10 15

Cys Trp Ile Pro Cys Ala Leu Leu Pro Leu Ala Pro Ala Pro Ala Ile

20 25 30

Ala Ala Ser Asp Ala Gln Ser Cys Val Ser Gln Leu Val Phe Asp Pro

35 40 45

Thr Ser Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Gly Thr Glu Gln Asp

50 55 60

Phe Leu Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Met Asn Trp Pro

65 70 75 80

Val Asn Pro Gly Trp Pro Ala Asp Pro Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp

85 90 95

Thr Gln Ser Thr Ala Ala Gln Phe Gly Val Pro Pro Thr Ser Gly Gln

100 105 110

Pro Met Gly Asn Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Ser Glu

115 120 125

Ile Phe Leu Pro Gly Ala Pro Lys Pro Ser Gly Trp Gly Val Glu Thr

130 135 140

Leu Val Pro Ser Asn Cys Thr Ala Thr Gly Asn Leu Lys Ala Phe Ala

145 150 155 160

Thr Gly Ala Arg Lys Phe Met Ala Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn

165 170 175

Arg Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Gln Val Thr Leu Pro

180 185 190

Asp Ser Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly

195 200 205

Asn Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr

210 215 220

Ile Val Asp Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val Ala

225 230 235 240

Gln Asn Ser Asp Asn Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly

245 250 255

Lys Leu Val Arg Glu Leu Pro Ala Lys Ala Leu Pro Gln Glu Glu Leu

260 265 270

Gly Ala Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Asn Lys Pro

275 280 285

Gln Leu Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Gln Arg Pro

290 295 300

Asp Thr Leu Gln Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His

305 310 315 320

Ile Ile Asn Lys Thr Gln Thr Gln Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe

325 330 335

Glu Gln Val Asp Asn Val Pro Asp Asn Gly Thr Ala Ala Pro Glu Gly

340 345 350

Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Thr Cys Thr Gly Asp Ala Cys Thr Pro Asn

355 360 365

Val Ala Arg Val Gln Cys Asp Ala Thr His Thr Pro Pro Asp Cys Thr

370 375 380

Pro Leu Asp Gln Pro Val Gln Ala Thr Arg Val Asn Ala Thr Pro Gln

385 390 395 400

Asp Leu Gln Met Leu Asn Thr Ala Val Gln Gln Thr Phe Ala Gln Lys

405 410 415

Thr Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu

420 425 430

Trp Ser Lys Thr Pro Asn Ala Pro Asn Asp Pro Gly Pro Gly Pro Asn

435 440 445

Val Lys Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Val Ser Asp Gln Ser Val

450 455 460

Val Val Ala Asn Thr Thr Leu Glu Thr Tyr Val Gln Asn Lys Asn Cys

465 470 475 480

Asn Asp Cys His Gln Tyr Ala Ala Ile Ala Gly Thr Ser Gln Leu Thr

485 490 495

Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Gly Asn Ala Asp Ser Ala Lys Asn Ala

500 505 510

Arg Leu Ile Lys Arg Ile Glu Ala Phe Lys Thr Leu Lys Asp Ser Pro

515 520 525

<210> 43

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas libanensis

<400> 43

Met Ser Thr Pro Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asn Gln Leu Pro Thr Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Val Thr Gly Trp Thr Gln Met Ser Val Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Ile Glu Ser Gly Tyr Gly Thr Gln Thr Pro Val Thr Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Ser Leu Tyr Pro Asp Pro Lys Ala Thr Gln Leu Gln Ile Pro Ser

130 135 140

Val Leu Cys Lys Ser Ile Asn Trp Asn Gly Pro Tyr Ala Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Arg Asp Pro Asp Gly Asn Met Arg Ser Ile Met Phe Thr Ser Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Asn Ile Asp Pro Gln Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Lys Ala Tyr Val Asp Pro Gln Val Lys Ile Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asn Gly Pro Thr Gly Lys Ala Gly Asp

225 230 235 240

Pro Val Leu Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ser Gly Thr Val Arg Ile Pro Gly Val Ser Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Asn Ser Ser Arg Asn Gln

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Tyr Ser Ala Asn Gln Glu Ala Val Lys Ala Leu

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Ser

340 345 350

Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Ser Tyr Trp

355 360 365

Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Asn Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Ala Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Asp Ile Thr Ile Asn Gly Thr Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Asn Glu Leu Asn Val Ala Leu Ser Val Thr Pro Ala Pro Leu Ser

420 425 430

Gly Thr Pro Lys Glu Cys Asp Cys Val Ala Ala Asn Asn Thr Asp Ala

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Ile Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Ser Phe Ala Pro Gly Ser Ser Gly Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Ala Ala Asp

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Thr Ala Gln Val Thr Gln

500 505 510

Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp Ser Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Val Thr Val Ser Ser Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Ser Glu Ala Ala Asn Pro

545 550 555 560

Ser Ala Thr Gln His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Val

565 570 575

Ala

<210> 44

<211> 528

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas libanensis

<400> 44

Met Asn Gly Trp Leu Arg Pro Leu Arg Arg Ala Arg Leu Asn Val Leu

1 5 10 15

Cys Trp Ile Thr Cys Ala Leu Leu Pro Phe Ala Pro Ala Pro Val Ser

20 25 30

Ala Ala Ser Asp Ala Gln Ser Cys Val Ser Gln Leu Val Phe Asp Pro

35 40 45

Thr Ser Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Gly Thr Glu Gln Asp

50 55 60

Phe Leu Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Met Asn Trp Pro

65 70 75 80

Val Asn Pro Gly Trp Pro Ala Asn Pro Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp

85 90 95

Thr Gln Ser Thr Ala Ala Gln Phe Gly Val Pro Pro Thr Pro Gly Gln

100 105 110

Pro Met Ser Asn Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Ser Glu

115 120 125

Ile Phe Leu Pro Gly Ala Pro Lys Pro Ser Gly Trp Gly Val Glu Thr

130 135 140

Arg Val Pro Ser Asn Cys Thr Ala Thr Gly Asn Leu Lys Ala Phe Ser

145 150 155 160

Thr Gly Ala Arg Lys Phe Ile Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile Asn

165 170 175

Arg Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Gln Val Thr Leu Pro

180 185 190

Asp Ser Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly

195 200 205

Asn Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr

210 215 220

Ile Val Asp Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val Ala

225 230 235 240

Gln Asn Ser Asp Asn Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly

245 250 255

Lys Leu Val Arg Glu Leu Pro Ala Gln Ala Leu Pro Gln Glu Glu Leu

260 265 270

Gly Ala Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Asn Lys Pro

275 280 285

Glu Leu Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Gln Arg Pro

290 295 300

Asp Thr Leu Gln Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His

305 310 315 320

Ile Ile Asn Lys Thr Gln Thr Gln Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe

325 330 335

Glu Gln Val Asp Asn Val Pro Asp Gly Gly Ala Thr Pro Pro Gly Gly

340 345 350

Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Ala Cys Thr Gly Asp Thr Cys Thr Pro Asn

355 360 365

Val Ala Arg Val Gln Cys Asp Ala Thr His Thr Pro Pro Asn Cys Thr

370 375 380

Pro Leu Asp Gln Pro Val Gln Ala Thr Arg Val Asn Ala Thr Pro Gln

385 390 395 400

Asp Met Gln Ala Leu Asn Thr Ala Val Gln Gln Thr Phe Ala Gln Lys

405 410 415

Thr Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu

420 425 430

Trp Ser Lys Thr Pro Asn Ala Pro Asn Asp Pro Gly Pro Gly Pro Asn

435 440 445

Val Lys Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Val Ser Asp Gln Ser Val

450 455 460

Val Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Val Gln Ser Asp Asn Cys

465 470 475 480

Asn Asp Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala Gly Gly Ser Lys Leu Ala

485 490 495

Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Gly Asn Ala Asp Ser Ala Lys Asn Thr

500 505 510

Arg Leu Ile Lys Arg Ile Glu Ala Phe Lys Thr Leu Lys Asp Asn Pro

515 520 525

<210> 45

<211> 576

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas asplenii

<400> 45

Met Ser Ile Pro Phe Thr Arg Phe Ser Pro Pro Ala Asn Gln Ala Gln

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Gln Lys Leu Gly Leu Glu Gln Gln Gln Ala Gln Phe Asp

20 25 30

Thr Asp Trp Ser Asn Asn Leu Ala Gly Trp Thr Glu Ala Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Thr Gly Leu Asn Asp Ala Pro Arg Thr Gly Tyr Phe

50 55 60

Asn Pro Leu Ile Ser Gly Phe Gly Asp Ala Pro Pro Ala Val Ile Asp

65 70 75 80

Trp Thr Pro Phe Pro Asn Arg Leu Ile Thr Tyr Leu Thr Gln Ala Asp

85 90 95

Ser Ala Lys Asn Pro Gln Leu Gly Gly Lys Pro Leu Thr Met Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Ala Asp Thr Gly Glu Ile Asp Ile Asn Gly Thr Pro

115 120 125

Leu Lys Leu Tyr Asp Pro Leu Gly Ser Asn Thr Leu Gln Leu Pro Ser

130 135 140

Ile Arg Cys Pro Gln Ile Asp Trp Thr Gly Pro Tyr Ala Ala Phe Thr

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Leu Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Ser Val Met Phe Thr Cys Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Tyr Leu Thr Met Trp Arg Ile Asp Pro Lys Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Arg Met Tyr Ile Asp Ser Ala Val Gln Leu Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Pro Val Asp Gln Pro Thr Gly Lys Gln Gly Glu

225 230 235 240

Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Leu Pro Ala Tyr Asp Val Thr Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ser Gly Thr Ala Arg Lys Pro Gly Leu Phe Gly Gly Ala

260 265 270

Leu His Leu Thr Ser Ala Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Gly Ala Ser Thr Ile Gln Arg Ser Asp Lys Ser Ser Glu Thr Pro

290 295 300

Gln Thr Leu Ile Cys Cys Ala Lys Tyr Gly Arg Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Tyr Val Ala Asn Gly Ile Ala Tyr Gly Asn Arg

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asp Pro Val Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Asn

340 345 350

Phe Ser Lys Trp Lys Asp Pro Gln Gly Asn Ser Val Ser Gln Tyr Trp

355 360 365

Gln Ile Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Leu Gly Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu His Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Gln Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Asp Ile Thr Ile Asp Gly Gln Lys Ile Thr His Val Gly Val Ile

405 410 415

Ala Asn Gln Met Lys Val Ala Leu Ser Ala Ser Pro Leu Asp Ala Ile

420 425 430

Lys Pro Val Ile Gln Pro Cys Val Thr Asp Arg Ser Thr Gly Leu Gln

435 440 445

Pro Cys Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Ser Leu Phe Tyr Gly Leu Ser

450 455 460

Pro Ser Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Ser Ser Ser Asn Gln Phe

465 470 475 480

Ile Leu Leu Val Gln Gly Ser Asp Ala Ala Thr Thr Ala Ala Asn Ala

485 490 495

Arg Ile Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Lys Ala Gln Val Ile Glu Phe

500 505 510

Gln Thr Asn Ala Thr Pro Ile Ala Gly Thr Thr Asp Asn Ser Gly Thr

515 520 525

Gln Gly Tyr Ile Ile Thr Ile Thr Val Ala Ala Asn Ala Ala Pro Gly

530 535 540

Leu Val Gln Leu Arg Val Leu Asn Pro Asp Glu Pro Val Asn Pro Ser

545 550 555 560

Asp Thr Asp His Pro Trp Ala Ser Ser Leu Ala Ile Val Pro Ala Leu

565 570 575

<210> 46

<211> 518

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas asplenii

<400> 46

Met Phe Ser Leu Asp Cys Ser Arg Gly Asn Gly Arg Phe Cys Leu Pro

1 5 10 15

Pro Leu Leu Leu Ile Ile Trp Leu Leu Gly Ser Leu Val Ala Arg Asn

20 25 30

Ala Tyr Ala Leu Ser Asp Pro Glu Thr Pro Ala Gln Cys Val Gln Gln

35 40 45

Leu Val Phe Asp Pro Thr Asn Gly Ser Phe Leu Thr Ser Asp Thr Pro

50 55 60

Phe Val Ala Gln Gln Ala Thr Phe Asn Cys Tyr Ala Trp Gln Met Phe

65 70 75 80

Ile Ala Met Asn Trp Pro Val Asn Pro Gly Trp Pro Thr His Pro Glu

85 90 95

Leu Ala Gly Glu Pro Asp Thr Lys Ser Pro Ala Ala Gln Phe Gly Val

100 105 110

Pro Thr Ile Ala Asp Gln Pro Met Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser

115 120 125

Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe Leu His Gly Ala Ala Ile Pro Thr

130 135 140

Ala Trp Gly Met Gln Pro Pro Glu Pro Val Gly Cys Gln Thr Lys Pro

145 150 155 160

Ser Leu Leu Ser Leu Arg Val Gly Ala Arg Lys Phe Met Thr Ala Thr

165 170 175

Ser Glu Ser Ala Val Asn Ala Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Ser

180 185 190

Thr Leu Val Thr Ala Ser Asp Pro Thr Leu Glu Ala Thr Gly Gly Trp

195 200 205

Leu Thr Asp Gln Ala Gly Lys Leu Val Tyr Phe Glu Arg Lys Val Gly

210 215 220

Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val Ser Asn Glu Leu Tyr Asp Ala Ala

225 230 235 240

Asn Gln Leu Gln Val Ala Lys Asn Gln Gly Leu Ser Leu Pro Ala Gly

245 250 255

Ala His Phe Arg Ser Pro Pro Thr Ser Pro Ile Ala Gln Glu Lys Leu

260 265 270

Gly Ala Phe Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Ile Leu Thr Asp Lys Pro

275 280 285

Gln Leu Tyr Asp Arg Tyr Leu Thr Thr Val Thr Trp Leu Lys His Pro

290 295 300

Glu Thr Gly Gln Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His

305 310 315 320

Ile Ile His Lys Thr Ala Ser Gln Pro Asp Phe Ile Trp Thr Thr Phe

325 330 335

Glu His Val Asp Asn Val Pro Asp Gly Gly Ser Thr Pro Thr Ala Gly

340 345 350

Tyr Thr Phe Asn Asn Pro Lys Cys Thr Gly Pro Asp Cys Thr Pro Asn

355 360 365

Gln Arg Arg Ile Thr Cys Thr Ala Leu Gly Cys Lys Asp Asn Tyr Pro

370 375 380

Arg Asn Glu Pro Val Gln Val Thr Arg Glu Asp Ser Val Pro Ser Thr

385 390 395 400

Ile Asn Asp Leu Asn Thr Val Val Gln Gln Ala Ile Ser Thr Lys Thr

405 410 415

Ala Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu Trp

420 425 430

Asp Ala Ser Pro His Ile Pro Asp Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Thr

435 440 445

Val Pro Leu Val Tyr Gly Ser Phe Ser Ser Asp Gly Asn Asn Thr Pro

450 455 460

Val Ser Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Ile Gln Asn Arg Ser Cys Asp

465 470 475 480

Phe Cys His Arg Asn Ala Lys Val Ala Gly Ser Lys Ser Leu Thr Ser

485 490 495

Asp Phe Ser Phe Leu Phe Glu Ser Ala Asp Ser Ser Lys Ile Pro Thr

500 505 510

Leu Ile Lys Lys Met Pro

515

<210> 47

<211> 580

<212> БЕЛОК

<213> Thalassospira xiamenensis

<400> 47

Met Ser Thr Pro Phe Ala Arg Phe Thr Ser Pro Ala His Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Lys Lys Leu Gly Met Glu Asn Glu Leu Ser Ala Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Val Ala Gly Trp Thr Glu Met Ala Ile Ile

35 40 45

Gly Asp Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ala Asp Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Thr Glu Gly Phe Gly Glu Ala Gly Asp Ala Val Ile Ser

65 70 75 80

Trp Thr Pro Phe Pro Asn Arg Leu Ile Ala Phe Leu Thr Pro Pro Glu

85 90 95

Ala Ser Asn Asn Pro Gln Leu His Arg Pro Leu Thr Met Asp Glu Val

100 105 110

Met Ser Leu Ala Asp Ser Gly Glu Ile Thr Val Asp Gly Thr Leu Tyr

115 120 125

Lys Leu Tyr Asp Pro Ser Gly Ser Ala Pro Ile Leu Lys Ile Pro Ala

130 135 140

Lys Arg Cys Pro Glu Ile Asp Trp Thr Gly Glu Tyr Val Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Tyr Asp Ala Ser Gly Ser Lys Met Gln Ser Val Met Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Tyr Leu Thr Met Trp Arg Ile Asn Pro Glu Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Gln Met Tyr Val Asp Pro Ala Val Lys Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Gln Pro Thr Gly Lys Lys Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Met Asp Pro Thr Thr Gly Arg Pro Ala Tyr Asp Val Thr

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Arg Gly Thr Val Arg Val Pro Gly Gln Ser Gly Gly

260 265 270

Ala Leu His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Ile Gln Arg Pro Asp Leu Ser Ser Arg Asp

290 295 300

Pro Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Ile Ala Asn Arg Ala Ala Ala Arg Tyr

325 330 335

Arg Ile Ser Leu Thr Asp Pro Val Gly Leu Tyr Ile Gln Gln Pro Gln

340 345 350

Asn Leu Ser Asn Trp Lys Gly Pro Asn Gly Glu Asp Ile Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Lys Ile Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Asn Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu His Ala Val Phe Asp Ile Pro Pro Ser Ala Gly Phe Thr

385 390 395 400

Ile Asn Asp Cys Thr Ile Asn Gly Gln Lys Ile Ala His Ile Gly Asp

405 410 415

Ile Ala Asn Gln Met Lys Ile Ala Leu Ser Ala Thr Gln Met Thr Pro

420 425 430

Asn Gln Pro Leu Gln Ser Pro Met Lys Cys Val Ser Ser Arg Ser Ser

435 440 445

Gly Ser Met Gln Pro Trp Pro Val Gln Phe Val Pro Ile Asp Leu Phe

450 455 460

Tyr Gly Glu Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Leu Met Val Pro Gly Thr

465 470 475 480

Val Asn Ser Phe Val Leu Ile Val Gln Gly Ala Asp Lys Asn Thr Thr

485 490 495

Ile Asp Asn Ala Arg Ile Glu Phe Ser Asn Pro Gly Ile Lys Ala Lys

500 505 510

Val Thr Lys Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp

515 520 525

Gly Gly Gly Thr Gln Gly Phe Ile Met Asp Val Ala Val Ser Ser Ser

530 535 540

Ala Lys Pro Gly Ser Val Ser Leu Arg Val Leu Asn Pro Asn Glu Pro

545 550 555 560

Ala Asn Pro Ser Asp Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Val

565 570 575

Ile Pro Ser His

580

<210> 48

<211> 539

<212> БЕЛОК

<213> Thalassospira xiamenensis

<400> 48

Met Asn Arg Leu His Leu Gly Ala Gly Cys Val Ile Ala Gly Phe Cys

1 5 10 15

Ile Leu Ala Ile Ala Gly Leu Leu Trp Val Ile Asp Val Pro Ala Gly

20 25 30

Arg Ala Asp Glu Ile Asn Ile Ser Arg Val Thr Glu Ile Ala Gln Ser

35 40 45

Ala Gln Gln Cys Pro Asp Gln Leu Val Phe Asp Pro Thr Ser Gly Ser

50 55 60

Phe Met Thr Ser Asp Asn Leu Phe Leu Pro Thr Gln Gln Gly Asn Asn

65 70 75 80

Cys Tyr Ala Trp Gln Met Phe Ile Ala Met Asn Trp Pro Val Ser Ser

85 90 95

Ser Trp Pro Gly Thr Pro Ser Ala Ala Gly Glu Pro Asp Gln Asn Val

100 105 110

Ser Val Glu Asn Trp Gly Val Pro Glu Asn Pro Thr Ser Pro Leu Thr

115 120 125

Ser Val Pro Val Trp Gly Ser Phe Lys Asp Ala Gln Ala Ile Phe Leu

130 135 140

Pro Asp Ala Ala Lys Pro Thr Asp Trp Gly Val Pro Gln Ala Val Pro

145 150 155 160

Ser Gly Cys Lys Ser Asp Lys Met Leu Leu Gly Tyr Pro Ala Gly Ser

165 170 175

Ala Lys Ile Leu Thr Thr Leu Ser Lys Asn Ala Val Asn Thr Ala His

180 185 190

Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Arg Asp Thr Gln Ser Asp Glu Ile

195 200 205

Met Glu Ala Thr Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Asn Gly Asn Leu Val

210 215 220

Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Met Asn

225 230 235 240

Asn Ala Leu Tyr Asp Ala Ala Tyr Gln Met Arg Val Ala Thr Asn Ala

245 250 255

Asp Gly Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ser Gly Lys Phe Leu

260 265 270

Arg Val Pro Pro Thr Glu Pro Gln Gly Gln Asp Ala Leu Gly Ala Phe

275 280 285

Glu Ile Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Gln Ser Asp Ile Tyr

290 295 300

Asp Arg Tyr Leu Thr Ser Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr Gly

305 310 315 320

Glu Cys Ser Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile His

325 330 335

Lys Thr Asp Thr Phe Pro Asp Leu Ile Trp Ala Thr Phe Glu Gln Val

340 345 350

Asp Asn Val Pro Asp Gly Gln Ala Thr Leu Pro Pro Gly Gly Tyr Ser

355 360 365

Phe Asn Asn Pro Asn Cys Thr Gly Pro Asp Cys Lys Pro Asn Gln Pro

370 375 380

Arg Ile Asp Cys Asn Asp Gln Asn Gln Cys Lys Asp Leu Tyr Pro Arg

385 390 395 400

Asp Gln Pro Val Gln Val Thr Arg Glu Gln Ala Leu Thr Ser Glu Met

405 410 415

Asp Thr Leu Asn Ala Gly Val Ala Gln Lys Ile Ala Ser Gln Thr Gly

420 425 430

Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val Leu Trp Asp

435 440 445

Gly Ser Pro Ser Pro Pro Val Met Glu Pro Gly Ala Asn Ala Ser Ile

450 455 460

Pro Leu Arg Tyr Gly Thr Phe Glu Ser Glu Gly Asn Leu Lys Val Ala

465 470 475 480

Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Ile Gln Asp Gln Ser Cys Asp Phe Cys

485 490 495

His Ala Asn Ala Thr Ile Ala Gly Ser Asp Thr Leu Ala Ser Asp Phe

500 505 510

Ser Phe Ile Phe Arg Asp Ala Gly Ser Ala Lys Asn Pro Ser Leu Val

515 520 525

Glu Glu Val Lys Gln Phe Met Glu Gln Ala Gln

530 535

<210> 49

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Paracoccus denitrificans

<400> 49

Met Thr Ile Phe Thr Glu Phe Ser Thr Pro Ala Gln Gln Gly Pro Lys

1 5 10 15

Asp Tyr Gln Leu Leu Gly Leu Pro Ala Ala Asp Leu Ala Ala Phe Glu

20 25 30

Ala Asp Trp Ser Ala Asn Ile Ala Gly Trp Thr Gln Met Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Thr Pro Arg Asp Asn Tyr Tyr

50 55 60

Asp Pro Leu Val Glu Gly Met Gly Glu Ala Thr Ala Ala Val Ile Ser

65 70 75 80

Trp Pro Pro Phe Pro Asn Arg Leu Ile Gln Phe Leu Thr Asn Pro Gly

85 90 95

Ile Val Lys Gly Gly Gln Leu Thr Ala Pro Leu Ser Gln Asp Ala Val

100 105 110

Gln Glu Leu Ala Asp Ser Gly Arg Ile Thr Gln Gly Gly Thr Ser Phe

115 120 125

Val Leu Phe Asp Pro Glu Pro Gly Gln Val Leu Leu Lys Ile Pro Ala

130 135 140

Asp Arg Cys Pro Ala Ile Asp Trp Asp Gly Lys Tyr Val Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Gln Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Leu Arg Asn Ala Gln Gly Lys Met Gln Ser Ile Ala Phe Thr Cys Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Tyr Leu Thr Met Trp Arg Gln Asn Pro Lys Ala Val

195 200 205

Leu Gly Ile Tyr Gln Arg Tyr Ile Asp Pro Ala Val Gln Leu Glu Asp

210 215 220

Leu Phe Leu Arg Tyr Glu Tyr Asp Gln Pro Thr Gly Lys Lys Gly Asp

225 230 235 240

Pro Val Leu Asp Pro Thr Thr Gly Asn Pro Ala Tyr Asp Pro Thr Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Arg Gly Pro Ala Arg Val Pro Gly Ser Phe Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Pro Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Gln Arg Pro Ser Ser Val Asn Gly Asn Pro

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Phe Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro Asn Ile Gly Tyr Gly Ala Asn Val Ala Ala Arg Thr Ala Arg

325 330 335

Leu Thr Leu Thr Asp Pro Val Gly Leu Tyr Ile Gln Gln Pro Gln Asn

340 345 350

Phe Gln Gly Trp Ser Gly Pro Asn Gly Glu Asp Val Ser Gly Tyr Trp

355 360 365

Gln Ile Leu Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Gly Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu His Ala Val Phe Ala Ile Pro Glu Ser Ala Gly Tyr Ser Ile

385 390 395 400

Glu Asp Cys Thr Ile Tyr Gly Leu Pro Ile Ser His Val Gly Val Ile

405 410 415

Leu Asp Gln Met Lys Val Ala Leu Ala Val Thr Pro Asn Asn Ala Ala

420 425 430

Pro Asp Thr Thr Ala Phe Ala Cys Val Thr Asp Arg Thr Asp Gly Thr

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Met Val Pro Glu Ser Leu Phe Tyr Gly Glu

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Leu Leu Arg Pro Gly Ser Lys Phe Arg

465 470 475 480

Phe Val Leu Ile Val Gln Gly Ala Asp Glu Asn Thr Thr Pro Ala Thr

485 490 495

Ala Arg Val Glu Phe Ser Asp Pro Asn Ile Thr Val Thr Val Glu Gln

500 505 510

Phe Leu Lys Asn Ala Ser Ala Val Pro Gly Gln Thr Asn Gly Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Val Met Asp Ile Ala Val Gly Ala Asn Ala Gln Pro

530 535 540

Gly Pro Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Ser Glu Gly Pro Ala Pro

545 550 555 560

Thr Pro Glu Gln His Pro Trp Glu Ala Gly Leu Ala Val Ile Ser Ser

565 570 575

Arg

<210> 50

<211> 502

<212> БЕЛОК

<213> Paracoccus denitrificans

<400> 50

Met Arg Thr Gly Gln Ile Leu Ile Ala Leu Val Ala Gly Val Met Leu

1 5 10 15

Ala Phe Ala Ala Ser Gly Gly Lys Ala Gln Thr Ala Cys Ser Ala Met

20 25 30

Leu Ile Thr Asp Pro Thr Ser Ala Asp Phe Leu Thr Gly Asp Thr Pro

35 40 45

Phe Gly His Thr Gln Asp Gly Met Asn Cys Tyr Gly Trp Gln Met Phe

50 55 60

Leu Ser Leu Asn Trp Pro Ala Asp Pro Gly Trp Pro Gln Thr Pro Ala

65 70 75 80

Met Ala Gly Glu Pro Asp Arg Ser Ala Thr Ile Ala Asp Phe Gly Leu

85 90 95

Pro Gly Pro Ala Gly Gln Pro Met Gln Arg Pro Thr Val Trp Gln Ser

100 105 110

Phe Met Pro Ala Pro Glu Ile Phe Lys Pro Phe Ala Ala Met Pro Thr

115 120 125

Gly Trp Gly Glu Thr Ser Pro Pro Pro Ala Ser Cys Gly Ser Ala Ser

130 135 140

Leu Ala Ala Ser Ala Gly Ser Ile Arg Met Leu Asn Ala Val Ser Lys

145 150 155 160

Ser Ala Val Ser Pro Arg His Gly Phe Asn Leu Asp Thr Gly Thr Met

165 170 175

Ser Ser Ile Ser Asp Glu Ile Glu Glu Ala Thr Gly Gly Trp Leu Thr

180 185 190

Asp Gln Lys Gly Lys Leu Val Phe Phe Glu Arg Met Ile Gly Lys Ala

195 200 205

Glu Tyr Asp Tyr Ile Val Ala Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln

210 215 220

Leu Lys Val Ala Thr Asn Ala Asp Gly Ala Thr Pro Glu Gly Leu Ser

225 230 235 240

Leu Pro Lys Gly Thr Pro Pro Gly Ser Ala Val Gln Asn Gln Asp Glu

245 250 255

Leu Gly Ala Phe Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Asn Leu Thr Gly Leu

260 265 270

Asp Asp Leu Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Ser Thr Val Tyr Leu Leu Tyr

275 280 285

Pro Asp Gly Ser Cys Glu Lys Ala Val Val Gly Leu Val Gly Leu His

290 295 300

Ile Ile His Lys Thr Ala Ser Met Pro Asp Phe Val Trp Ser Thr Phe

305 310 315 320

Glu Gln Ile Asp Asn Val Pro Gly Ala Ser Ala Pro Glu Val Asp Phe

325 330 335

Ser Phe Asn Asn Pro Ala Ser Asn Ala Lys Pro Asn Gln Met Pro His

340 345 350

Cys Val Asn Gly Val Cys Asp Tyr Ser Leu Pro Ile Gln Val Thr Arg

355 360 365

Glu Val Ala Ile Pro Ala Gly Val Ala Gln Thr Asn Arg Asp Val Gln

370 375 380

Gln Leu Leu Ala Asp Arg Thr Gly Gly Lys Ser Val Phe Gln Tyr Tyr

385 390 395 400

Gln Leu Val Asn Val Leu Trp Asp Gly Ala Pro Thr Pro Pro Ser Pro

405 410 415

Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Val Tyr Gly Thr Phe Gln

420 425 430

Thr Asp Gly Ser Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Ala

435 440 445

Gln Gln Phe Thr Pro Gly Leu Gly Pro Ser Cys Thr Ala Cys His Lys

450 455 460

Gly Ala Thr Ile Ala Asn Ser Ala Thr Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe

465 470 475 480

Leu Phe Ser Thr Ala Ser Ser Ala Thr Lys Leu Pro Gly Leu Phe Ile

485 490 495

Ser Arg Asp Phe Val Pro

500

<210> 51

<211> 580

<212> БЕЛОК

<213> Cellvibrio japonicus

<400> 51

Met Ser Ala Phe Thr Phe Ser Thr Pro Ala Leu Ile Gln Asp Phe Ser

1 5 10 15

Asp Asn Pro Ser Leu Gln Gln Gln Leu Asn Gln Asn Trp Asp Leu Ala

20 25 30

Ile Asp Ala Tyr Thr Gln Ala Ala Leu Val Ser Asn Pro Trp Thr Val

35 40 45

Asp Tyr Gln Ala Pro Cys Asp Trp Tyr Val Asn Pro Lys Gln Ala Asp

50 55 60

Ile Thr Ala Ala Asn Pro Val Glu Pro Ile Phe Trp Thr Ala Phe Pro

65 70 75 80

Asn Arg Leu Lys Ile Tyr Phe Ser Ala Ala Glu Lys Ser Pro Tyr Gln

85 90 95

Met Ala Asn Ala Gln Val Phe Ala Leu Ala Asp Phe Gly Asn Val Pro

100 105 110

Gln Ser Lys Ala Phe Pro Thr Gly Leu Pro Phe Ile Ile Pro Ser Lys

115 120 125

Arg Cys Pro Asn Leu Asn Trp Gln Gln Ser Ile Ala Glu Trp Val Gln

130 135 140

Tyr Asp Pro Lys Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp

145 150 155 160

Ser Val Thr Arg Asn Ala Asp Gly Lys Ile Thr Lys Ile Ala Phe Thr

165 170 175

Cys Glu Asn Pro Glu Tyr Trp Phe Thr Leu Trp Gln Val Ser Pro Glu

180 185 190

Lys Val Leu Ala Leu Tyr Gln Gln Leu Val Ser Pro Asn Val Val Leu

195 200 205

Glu Asp Leu Gln Leu Pro Ser Ala Asp Gly Lys Gly Phe Val Ile Asp

210 215 220

Pro Thr Thr Gly Arg Pro Ala Tyr Asn Pro Leu Asn Lys Trp Asn Ser

225 230 235 240

Gly Thr Val Ala Thr Glu Thr Tyr Gly Gly Ala Val His Leu Thr Ser

245 250 255

Pro Pro Asn Thr Ile Gly Ala Glu Ile Met Leu Ala Ala Gln Ala Thr

260 265 270

Leu Leu Arg Asp Leu Pro Pro Asp Gln Tyr Asn Met Gln Arg Met Val

275 280 285

Cys Ala Gly Ala Tyr Gly Arg Ala Tyr Arg Asn Ser Asp Pro His Ile

290 295 300

Gly Leu Gln Ala Asn Gln Leu Val Lys Asn Leu Gly Val Lys Ile Thr

305 310 315 320

Leu Thr Asn Pro Val Gly Leu Tyr Leu Gln Arg Pro Asp Phe Ser Ser

325 330 335

Tyr Lys Thr Pro Asp Gly Lys Asp Ala Gly Gln Phe Tyr Lys Val Ile

340 345 350

Arg Gly Arg Thr Ala Gln Gln Ala Gly Thr Thr Tyr Asp Gln Ile Leu

355 360 365

His Ala Glu Phe Ser Val Pro Glu Glu Leu Gly Tyr Thr Val Ser Asp

370 375 380

Ile Leu Ile Gly Asn Ala Val Pro Gly Ser Ser Gln Val Pro Val Pro

385 390 395 400

Ile Leu Tyr Ala Gly Gln Ile Ala Glu Thr Phe His Val Cys Leu Ala

405 410 415

Gly Thr Ala Ile Ala Pro Ala Thr Gly Glu Pro Ser Gln Ala Phe Leu

420 425 430

Pro Pro Val Thr Asp Lys Thr Gly Asn Thr Asn Gly Gln Val Ser Met

435 440 445

Leu Leu Ala Asn Pro Val Leu Leu Ala Met Gln Ala Val Asn Pro Phe

450 455 460

Pro Pro Phe Val Gln Leu Pro Val Gln Ile Ala Gln Gly Gln Thr Leu

465 470 475 480

Thr Asn Met Ala Leu Gln Val Ser Tyr Ala Asn Asp Asn Phe Gln Glu

485 490 495

Ala Gln Ile Ala Phe Trp Asp Ala Gln Gly Asn Ser Glu Pro Gly Ile

500 505 510

Ser Val Thr Val Thr Ala Ile Glu Thr Ala Asp Gly Thr Pro Ala Gly

515 520 525

Lys Ser Ala Gly Gly Asp Gly Leu Phe Asn Tyr Ile Ile Ser Ile Ser

530 535 540

Val Ala Pro Gly Val Ser Pro Gly Phe Lys Gly Val Thr Val Arg Asn

545 550 555 560

Pro Ala Cys Asp Met Pro Leu Pro Leu Pro Gly Val Leu Phe Val Thr

565 570 575

Ala Lys Gly Asn

580

<210> 52

<211> 506

<212> БЕЛОК

<213> Cellvibrio japonicus

<400> 52

Met Lys His Thr Leu Leu Ile Gly Val Thr Thr Gly Leu Leu Val Ala

1 5 10 15

Ala Cys Gln Gln Pro Val Gln Glu Ser Ser Ala Ala Val Asp Ala Pro

20 25 30

Ala Val Ser Thr Val Ser Ser Ser Ser Ala Pro Ile Ser Phe Pro Cys

35 40 45

Leu Asn Lys Pro Ala Val Asn Tyr Asn Thr Pro Gly Asp Thr Pro Ile

50 55 60

Thr Ser Gln Asp Gly Val Asn Cys Phe Ala Trp Gln Thr Phe Ile Gly

65 70 75 80

Leu Asn Trp Pro Val Asp Ala Ser His Pro Gly Glu Pro Asp Lys Thr

85 90 95

Ala Ser Ala Ser Val Phe Gly Glu Pro Gly Leu His Gln Thr Ser Val

100 105 110

Trp Glu Thr Tyr Ala Asn Ser Lys Ser Val Phe Arg Ala Asn Ala Gln

115 120 125

Pro Pro Leu Pro Trp Gly His Thr Pro Asp Val Pro Ser Ser Cys Gln

130 135 140

Lys Ile Ser Gln Thr Leu Gly Leu Arg Val Met Gln Ala Ser Arg Met

145 150 155 160

Pro Gly Ser Phe Asn Met Ser Lys Glu Ala Ser Gln Ala Phe Pro Gly

165 170 175

Asn Asn Pro Asn Trp Leu Ala Asp Lys Ser Gly Asn Leu Val Tyr Tyr

180 185 190

Glu Ile Leu Ile Gly Lys Asp Glu Tyr Asp Tyr Ile Asn Asn Asn Gly

195 200 205

Leu Tyr Asn Ala Asn Thr Gln Ala Ala His Ile Gln Gln Asn Lys Asn

210 215 220

Ile Ala Met Pro Leu Gly His Asp Lys Val Leu Gly Gly Leu Glu Ile

225 230 235 240

Lys Ala Ala Trp Leu Ser Val Ser Asp Pro Gln Asn Pro Lys Trp Lys

245 250 255

Asn Tyr Lys Leu Ser Thr Ser Val Ile Tyr Asp Pro Val Ser Lys Asp

260 265 270

Cys His Ala Ser Thr Ile Ala Leu Val Gly Met His Ile Ile Arg Lys

275 280 285

Thr Ala Ser Gln Pro Gln Trp Ile Trp Ala Thr Phe Glu His Lys Asp

290 295 300

Asn Ala Pro Asp Thr Ala Ser Ile Lys Ser Asp Gly Thr Val Asp Gly

305 310 315 320

Asp Tyr Thr Phe Tyr Ser Asn Ser Cys Thr Val Lys Pro Val Pro Ala

325 330 335

Gly Cys Lys Ala Lys Val Glu Asn Gly Thr Ser Val Thr Gln Thr Ser

340 345 350

Cys His Val Asn Val Ser Pro Ala Tyr Tyr Leu Asp Thr Ser Gly Asn

355 360 365

Cys Pro Ala Tyr Pro Ile Gln Val Ser Arg Asp Phe Ala Ile Lys Asp

370 375 380

Ser Thr Asp Asn His Val Ala Ser Leu Asn Arg Ala Val Gln Gln Leu

385 390 395 400

Ile Ala Ser Ser Asn Ala Asp Ser Val Tyr Thr His Tyr Gln Leu Val

405 410 415

Asn Val Leu Trp Ser Ser Ala Ala Val Asn Asp Asn Ala Pro Pro Gly

420 425 430

Asn Pro Pro Leu Thr Pro Leu Ser Ile Ser Gly Glu Thr Pro Ser Leu

435 440 445

Asn Thr Val Pro Val Ala Asn Thr Met Leu Glu Thr Tyr Ala Gln Gly

450 455 460

Phe Asn Cys Leu Ser Cys His Ala Tyr Ala Ser Val Ala Arg Asp Ala

465 470 475 480

Arg Ala Gln Leu Gly Gly Lys Ala Tyr Ala Thr Asp Tyr Ser Phe Ile

485 490 495

Phe Ser Phe Ala Thr Ser Pro Ala Ala Lys

500 505

<210> 53

<211> 256

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 53

Met Gly Ser Ile Thr Asp His Asn Gln Leu Leu Ala Trp Val Ala Ser

1 5 10 15

Leu Asp Ile Pro Glu Ala Ser Gly Val Lys Thr Arg Ser Arg Asn Val

20 25 30

Val Ala Arg Ala Asn Ala Glu Asp Glu Gly Ala Ala Val Val Arg Gly

35 40 45

Ser Ile Thr Ser Phe Val Thr Gly Leu Ser Gln Gln Ala Arg Asp Asp

50 55 60

Val Gln Asn Ser Thr Leu Leu Met Gln Leu Ala Ala Asp Lys Lys Phe

65 70 75 80

Asn Pro Glu Lys Gln Arg Glu Glu Trp Phe Lys Phe Tyr Thr Asp Gly

85 90 95

Leu Ala Asn Leu Gly Trp Gly Arg Val Ser Ser Tyr Tyr Gln Ser Tyr

100 105 110

Gln Pro Arg Asn Thr Asn Val Thr Met Asp Gln Val Val Leu Glu Val

115 120 125

Ile Ala Ala Val Val Gly Ala Asp Ser Ala Val Tyr Lys Val Thr Glu

130 135 140

Lys Thr Phe Ser Ser Leu Gln Asp Asn Pro Lys Asn Gln Ala Pro Leu

145 150 155 160

Lys Leu Phe Asp Ser Ser Ser Thr Arg Asp Ser Val Gly Thr Phe Gln

165 170 175

Ile Leu Pro Val Met Gln Asp Arg Asp Gly Asn Val Val Met Val Leu

180 185 190

Thr Thr Val Asn Ala Ser Thr Thr Val Gln Arg Gly Ser Phe Leu Phe

195 200 205

Trp Ser Trp Ser Lys Thr Thr Ala Trp Met Tyr Arg Ala Ala Gln Gln

210 215 220

Thr Val Leu Asn Glu Ser Val Tyr Ala Thr Val Arg Gln Ser Val Ile

225 230 235 240

Lys Lys Leu Gly Lys Asn Ala Glu Glu Phe Ile Asp Asp Leu Glu Ile

245 250 255

<210> 54

<211> 260

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 54

Met Lys Leu Ser Ala Asp Glu Val Tyr Val Ile Ser Gly Asn Leu Leu

1 5 10 15

Ser Ala Thr Pro Ser Leu Thr Asp Pro Thr Val Leu Glu Asp Ile Ala

20 25 30

Asn Ser Asn Leu Leu Cys Gln Leu Ala Ala Asp Lys Asn Gln Gly Thr

35 40 45

Arg Phe Ile Asp Pro Ala Ala Trp Leu Asp Phe Tyr Arg Ser Ser Leu

50 55 60

Gly Arg Leu Phe Trp Arg Ile Ser Asn Ser Gly Thr Val Ser Tyr Ala

65 70 75 80

Ile Pro Gln Leu Val His Lys Ile Thr Val Lys Glu Val Leu Glu Lys

85 90 95

Thr Phe Tyr Lys Thr Leu Asp Arg Pro Gln Arg Ile Arg Val Glu Glu

100 105 110

Ser Ile Glu Leu Leu Gly Glu Gln Ser Ala Asp Ser Pro Ser Ala Thr

115 120 125

Leu Tyr Ser Leu Lys Thr Gln Val Asn Phe Asn Glu Thr Thr Ser Ser

130 135 140

Pro Gly Leu Leu Pro His Ser Ile Ser Ser Val Asn Leu Gln Leu Ser

145 150 155 160

Val Val His Ser Glu Thr Cys Ile Ser Val Cys Ser Val Tyr Phe Lys

165 170 175

Thr Ser Thr Arg Ile Gly Asp Asp Val Phe Asn Gln Lys Phe Pro Val

180 185 190

Lys Glu Leu Leu Gly Asn Val Ser Val Ser Thr Phe Glu Ala Lys Leu

195 200 205

Leu Glu Ser Ser Tyr Ala Gly Ile Arg Gln Ser Ile Ile Asp Lys Leu

210 215 220

Gly Glu Asp Asn Ile Arg Glu Asn Ile Leu Leu Val Pro Ala Val Ser

225 230 235 240

Pro Ser Leu Ser Asn Thr Arg His Ala Gly Ala Leu Gln Phe Val Gln

245 250 255

Glu Leu Asp Ile

260

<210> 55

<211> 260

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 55

Met Lys Leu Ser Thr Asp Glu Val Tyr Val Ile Ser Gly Asn Leu Leu

1 5 10 15

Ser Ala Thr Pro Ser Leu Thr Asp Pro Ala Val Leu Glu Asp Ile Ala

20 25 30

Asn Ser Asn Leu Leu Cys Gln Leu Ala Ala Asp Lys Asn Gln Gly Thr

35 40 45

Arg Phe Ile Asp Pro Ala Ala Trp Leu Asp Phe Tyr Arg Asn Ser Leu

50 55 60

Gly Lys Leu Phe Trp Arg Ile Ser Asn Ser Gly Thr Val Ser Tyr Ala

65 70 75 80

Ile Pro Gln Leu Val His Lys Ile Thr Val Lys Glu Val Leu Glu Lys

85 90 95

Thr Phe Tyr Lys Asn Leu Asp Arg Pro Gln Arg Ile Arg Val Glu Asp

100 105 110

Ser Ile Glu Leu Leu Gly Glu Gln Ser Val Asp Ser Pro Ser Ala Thr

115 120 125

Leu Tyr Ser Leu Lys Thr Gln Val Asn Phe Asn Glu Thr Thr Ser Ser

130 135 140

Pro Gly Leu Leu Pro His Ser Val Ser Ser Val Asn Leu Gln Leu Ser

145 150 155 160

Val Val His Ser Glu Thr Cys Ile Ser Val Cys Ser Val Tyr Phe Lys

165 170 175

Thr Ser Thr Arg Ile Gly Asp Asp Val Phe Asn Gln Lys Phe Pro Val

180 185 190

Lys Glu Leu Leu Gly Asn Val Ser Val Ser Thr Phe Glu Ala Lys Leu

195 200 205

Leu Glu Ser Ser Tyr Ala Ser Ile Arg Gln Ser Ile Ile Asp Lys Leu

210 215 220

Gly Glu Asp Asn Ile Arg Glu Asn Ile Leu Leu Val Pro Ala Val Ser

225 230 235 240

Pro Ser Leu Ser Asn Ser Arg His Ala Gly Ala Arg Gln Phe Val Gln

245 250 255

Glu Leu Asp Ile

260

<210> 56

<211> 260

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 56

Met Gly Ser Ile Thr Asp His Gly Lys Leu Leu Ala Trp Val Glu Ser

1 5 10 15

Leu Asp Val Pro Lys Ser Thr Gly Asn Ala Asn Leu Lys Arg Ala Ser

20 25 30

Ala Val Leu Arg Ser Ala Ala Gln Asn Ser Asp Glu Asp Gly Ala Ala

35 40 45

Val Val Arg Gly Ser Ile Thr Ser Phe Val Thr Gly Leu Thr Pro Gln

50 55 60

Ala Arg Asp Asp Val Gln Asn Ser Thr Leu Leu Met Gln Leu Ala Ala

65 70 75 80

Asp Lys Lys Tyr Asn Pro Asp Thr Gln Arg Glu Glu Trp Phe Lys Phe

85 90 95

Tyr Thr Asp Gly Leu Ala Asn Leu Gly Trp Gly Arg Val Ser Ser Ala

100 105 110

Tyr Gln Lys Tyr Lys Pro Thr Asn Thr Asn Ala Thr Met Asp Gln Val

115 120 125

Val Leu Glu Ile Ile Ser Ser Val Val Ser Pro Glu Ser Ala Leu Tyr

130 135 140

Lys Val Thr Glu Lys Thr Phe Leu Ala Leu Lys Asn Asn Pro Asn Asn

145 150 155 160

Lys Asp Ala Leu Lys Leu Phe Asp Val Ser Ser Thr Arg Asn Asp Leu

165 170 175

Gly Thr Phe Gln Ile Leu Pro Val Met Gln Asp Lys Asp Gly Asn Val

180 185 190

Val Thr Val Leu Thr Cys Ile Asn Ala His Thr Glu Val Gln Lys Gly

195 200 205

Ser Phe Leu Phe Trp His Trp Ser Ser Thr Ser Ala Glu Met Tyr Arg

210 215 220

Ala Ala Gln Gln Val Val Leu Asn Gln Asn Val Tyr Ala Thr Val Arg

225 230 235 240

Gln Ser Val Leu Lys Lys Leu Gly Lys Asn Ala Glu Asp Phe Ile Asp

245 250 255

Gly Leu Asp Ile

260

<210> 57

<211> 259

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 57

Met Ser Phe Thr Ala Pro Glu Val His Val Val Ser Gly Asn Leu Ile

1 5 10 15

Ser Ala Met Pro Ser Val Asn Ser Pro Gln Val Leu Glu Asp Ile Leu

20 25 30

Glu Ser Asn Leu Leu Cys Gln Met Ala Ala Asp Lys Ser Leu Gly Ser

35 40 45

Arg Phe Asn Asn Pro Ala Ala Trp Leu Asp Phe Tyr Arg Asn Ser Leu

50 55 60

Gly Lys Leu Phe Trp Lys Ile Thr Asn Phe Asn Thr Val Ser Tyr Pro

65 70 75 80

Val Pro Ser Pro Thr Arg Ser Val Ser Val Met Gly Ile Leu Glu His

85 90 95

Thr Phe Phe Lys Val Leu Ala Gln Pro Leu Arg His Gln Ile Glu Ala

100 105 110

Asp Ile Glu Leu Leu Met Glu Leu Pro Leu Thr Ser Pro Ala Ser Gln

115 120 125

Leu Tyr Thr Ser Lys Thr His Val Glu Met Ser Thr Arg Ala Arg Ser

130 135 140

Ser Phe Asp Gly Arg Ser Glu Ser Val Ile Ser Leu Gln Ile Ser Val

145 150 155 160

Val His Ser Gly Ser Leu Ile Ser Val Cys Ser Val Tyr Phe Lys Thr

165 170 175

Ala Glu Pro Val Ala Ala Asp Val Phe Ser Gln Lys Phe Lys Val Arg

180 185 190

Asp Leu Leu Gly Asn Ile Ser Val Asn Ser Phe Glu Ala Asp Leu Leu

195 200 205

Glu Gly Ser Tyr Glu Gly Val Arg Gln Gln Ile Lys Thr Lys Leu Gly

210 215 220

Glu Ala Asn Ile Arg Glu Asn Ile Leu Leu Ile Ala Asp Asn Pro Ile

225 230 235 240

Pro Val Asp Glu Leu Pro His Ala Asn Ala His Gln Phe Leu Lys Gly

245 250 255

Leu Asp Ile

<210> 58

<211> 255

<212> БЕЛОК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 58

Met Ser Thr Ile Thr Asp His Lys Gln Val Leu Ala Trp Ile Asn Ala

1 5 10 15

Leu Asp Ile Pro Asp Ala Pro Ala Gly Gly Asn Arg Val Ala Ala Arg

20 25 30

Ala Thr Ser Ser Ala Asp Glu Asp Gly Ala Val Val Ala Lys Ala Ser

35 40 45

Ile Pro Cys Phe Val Ser Gly Leu Thr Glu Gln Ser Arg Ala Asp Val

50 55 60

Gln Asn Ser Thr Leu Leu Met Gln Leu Ala Ala Asp Lys Lys Tyr Pro

65 70 75 80

Asn Glu Asn Asp Arg Glu Lys Trp Phe Lys Phe Tyr Ser Asp Gly Leu

85 90 95

Thr Asn Leu Gly Trp Gly Ser Ser Ser Ser Phe Phe Glu Arg Phe Gln

100 105 110

Pro Lys Asn Thr Asp Val Thr Met Asp Gln Val Val Leu Glu Val Ile

115 120 125

Leu Thr Val Val Asn Asn Val Asn Asn Pro Leu Tyr Lys Ile Ala Gln

130 135 140

Glu Thr Phe Gly Ala Leu Asn Lys Pro Ala Asn Gln Lys Pro Met Lys

145 150 155 160

Leu Phe Asp His Ser Ser Thr Lys Glu Asp Arg Gly Lys Phe Gln Ile

165 170 175

Leu Pro Ala Gly Gln Asp Gln His Gly Thr Val Ser Met Val Leu Thr

180 185 190

Ala Ile Asn Ala Arg Thr Asp Ile Gln Ser Gly Ser Phe Leu Phe Trp

195 200 205

Lys Trp Ser Lys Ser Thr Ala Trp Leu Tyr Arg Ala Ala Asn Leu Ile

210 215 220

Val Leu Asn Glu Ser Val Tyr Ser Lys Val Arg Gln Ala Val Ile Asp

225 230 235 240

Lys Leu Gly Asp Asn Ala Val Asn Phe Val Leu Asp Leu Asp Ile

245 250 255

<210> 59

<211> 268

<212> БЕЛОК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 59

Met Ala Phe Ser Thr Glu Gln Thr Tyr Val Val Ser Gly Asn Leu Ile

1 5 10 15

Ser Ala Thr Thr Glu Asp Thr Asn Thr Leu Ser Tyr Glu Asp Phe Ile

20 25 30

His Ser Asn Leu Leu Ala Gln Met Gly Ala Asp Lys Lys Leu Gly Ser

35 40 45

Arg Phe Val Asp Pro Ala Gly Trp Leu Ser Phe Phe Lys Asn Thr Val

50 55 60

Gly Asn Leu Phe Trp Asn Leu Ser Glu Gln Gly Thr Ser Thr Leu Lys

65 70 75 80

Ile Ser Ala Gly Thr Ala Ser Ile Thr Val Gln Gln Ile Leu Glu Gln

85 90 95

Ser Phe Phe Lys Arg Leu Asn Gln Ala Gln Ile Asp Ser Ala Thr Ala

100 105 110

Ser Val Asp Leu Phe Ser Gln Leu Ser Glu Asp Asp Pro Ala Phe Ile

115 120 125

Leu Tyr Asn Ala Lys Ser His Ala Gln Ile Ser Thr Ala Thr Lys Val

130 135 140

Ile Lys Pro Pro Gln Lys Glu Thr Tyr Ser Val Asn Leu Gln Ile Ser

145 150 155 160

Ile Ala His Thr Gly Ser Glu Ile Ala Leu Cys Asn Ile Phe Phe Gln

165 170 175

Thr Ser Gln Ala Val Ser Asp Glu Leu Phe Thr Gln Lys Phe Ala Ile

180 185 190

Lys Asp Leu Ile Gly Asn Ile Asn Val Phe Tyr Leu Lys Ala Leu Leu

195 200 205

Ser Glu Thr Asn Tyr Gly His Ile Arg Gln Gln Val Ile Glu Lys Leu

210 215 220

Gly Glu Asn Ile Asn Thr Asn Ile Val Leu Val Ala Asp Asn Ser Asp

225 230 235 240

Lys Pro Ser Pro Pro Phe Ser His Arg Gly Ala Gln Phe His Thr Gln

245 250 255

Pro Glu Asn Leu Ile Gln Gln Arg Thr Gly Pro Pro

260 265

<210> 60

<211> 255

<212> БЕЛОК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 60

Met Ser Thr Ile Thr Asp His Lys Gln Val Leu Ala Trp Ile Asn Ala

1 5 10 15

Leu Asp Ile Pro Asp Ala Pro Ala Gly Gly Asn Arg Val Ala Ala Arg

20 25 30

Ala Ser Ser Ser Ala Asp Glu Asp Gly Ala Val Val Ala Lys Ala Ser

35 40 45

Ile Pro Cys Phe Val Ser Gly Leu Thr Glu Gln Ser Arg Ala Asp Val

50 55 60

Gln Asn Ser Thr Leu Leu Met Gln Leu Ala Ala Asp Lys Lys Tyr Pro

65 70 75 80

Asp Glu Asn Asp Arg Glu Lys Trp Phe Lys Phe Tyr Ser Asp Gly Leu

85 90 95

Thr Asn Leu Gly Trp Gly Ser Ser Ser Ser Phe Phe Glu Arg Phe Gln

100 105 110

Pro Lys Asn Thr Asp Val Thr Met Asp Gln Val Val Leu Glu Val Ile

115 120 125

Leu Thr Val Val Asn Asn Val Asn Asn Pro Leu Tyr Lys Ile Ala Gln

130 135 140

Glu Thr Phe Gly Ala Leu Asn Lys Pro Ala Asn Gln Lys Pro Met Lys

145 150 155 160

Leu Phe Asp His Ser Ser Thr Lys Glu Asp Arg Gly Lys Phe Gln Ile

165 170 175

Leu Pro Ala Gly Gln Asp Gln His Gly Thr Val Ser Met Val Leu Thr

180 185 190

Ala Ile Asn Ala Arg Thr Asp Ile Gln Ser Gly Ser Phe Leu Phe Trp

195 200 205

Lys Trp Ser Lys Ser Thr Ala Trp Leu Tyr Arg Ala Ala Asn Leu Ile

210 215 220

Val Leu Asn Glu Ser Val Tyr Ser Lys Val Arg Gln Ala Val Ile Asp

225 230 235 240

Lys Leu Gly Asp Asn Ala Val Asn Phe Val Leu Asp Leu Asp Ile

245 250 255

<210> 61

<211> 259

<212> БЕЛОК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 61

Met Ala Phe Ser Thr Glu Gln Thr Tyr Val Val Ser Gly Asn Leu Ile

1 5 10 15

Ser Ala Thr Thr Lys Asp Thr Asn Thr Leu Ser Tyr Glu Asp Phe Ile

20 25 30

His Ser Asn Leu Leu Ala Gln Met Gly Ala Asp Lys Lys Leu Gly Ser

35 40 45

Arg Phe Val Asp Pro Ala Gly Trp Leu Ser Phe Phe Lys Asn Thr Val

50 55 60

Gly Asn Leu Phe Trp Asn Leu Ser Glu Gln Gly Thr Ser Thr Leu Lys

65 70 75 80

Ile Ser Ala Gly Thr Ala Ser Ile Thr Val Leu Gln Ile Leu Glu Gln

85 90 95

Ser Phe Phe Lys Arg Leu Asn Gln Ala Gln Ile Asp Ser Ala Thr Ala

100 105 110

Ser Ile Asp Leu Phe Asp Gln Leu Pro Glu Asp Asp Pro Ala Phe Ile

115 120 125

Leu Tyr Asn Val Lys Ser His Ala Gln Ile Ser Ala Ala Ala Lys Ala

130 135 140

Ile Lys Pro Pro Gln Lys Ala Thr Tyr Ser Val Asn Leu Gln Ile Ser

145 150 155 160

Ile Ala His Thr Gly Ser Glu Ile Ala Leu Cys Asn Val Phe Phe Gln

165 170 175

Thr Ser Gln Ala Val Ser Asp Glu Leu Phe Thr Gln Lys Phe Ala Ile

180 185 190

Lys Asp Leu Ile Gly Asn Ile Asn Ile Phe Tyr Leu Lys Ala Gln Leu

195 200 205

Ser Glu Thr Asn Tyr Gly Gln Ile Arg Gln Gln Val Ile Glu Lys Leu

210 215 220

Gly Glu Asn Ile Asn Thr Asn Ile Leu Leu Val Ala Asp Asn Ser Glu

225 230 235 240

Thr Pro Ser Pro Pro Ser Pro Ala Glu Ala Arg Ser Phe Ile Arg Ser

245 250 255

Leu Lys Ile

<210> 62

<211> 255

<212> БЕЛОК

<213> Alcaligenes sp. HPC1271

<400> 62

Met Ser Thr Ile Thr Asp His Lys Gln Val Leu Ala Trp Ile Asn Ala

1 5 10 15

Leu Asp Ile Pro Asp Ala Pro Ala Gly Gly Asn Arg Val Thr Ala Arg

20 25 30

Ala Thr Ser Ser Ala Asp Glu Asp Gly Ala Val Val Ala Lys Ala Ser

35 40 45

Ile Pro Cys Phe Val Ser Gly Leu Thr Glu Gln Ser Arg Ala Asp Val

50 55 60

Gln Asn Ser Thr Leu Leu Met Gln Leu Ala Ala Asp Lys Lys Tyr Pro

65 70 75 80

Asn Glu Asn Asp Arg Glu Lys Trp Phe Lys Phe Tyr Ser Asp Gly Leu

85 90 95

Thr Asn Leu Gly Trp Gly Ser Ser Ser Ser Phe Phe Glu Arg Phe Gln

100 105 110

Pro Lys Asn Thr Asp Val Thr Met Asp Gln Val Val Leu Glu Val Ile

115 120 125

Leu Thr Val Val Asn Asn Val Asn Asn Pro Leu Tyr Lys Ile Ala Gln

130 135 140

Glu Thr Phe Gly Ala Leu Asn Lys Pro Ala Asn Gln Lys Pro Met Lys

145 150 155 160

Leu Phe Asp His Ser Ser Thr Lys Glu Asp Arg Gly Lys Phe Gln Ile

165 170 175

Leu Pro Ala Gly Gln Asp Gln His Gly Thr Val Ser Met Val Leu Thr

180 185 190

Ala Ile Asn Ala Arg Thr Asp Ile Gln Ser Gly Ser Phe Leu Phe Trp

195 200 205

Lys Trp Ser Lys Ser Thr Ala Trp Leu Tyr Arg Ala Ala Asn Leu Ile

210 215 220

Val Leu Asn Glu Ser Val Tyr Ser Lys Val Arg Gln Ala Val Ile Asp

225 230 235 240

Lys Leu Gly Asp Asn Ala Val Asn Phe Val Leu Asp Leu Asp Ile

245 250 255

<210> 63

<211> 259

<212> БЕЛОК

<213> Alcaligenes sp. HPC1271

<400> 63

Met Ala Phe Ser Thr Glu Gln Thr Tyr Val Val Ser Gly Asn Leu Ile

1 5 10 15

Ser Ala Thr Thr Glu Asp Thr Asn Thr Leu Ser Tyr Glu Asp Phe Ile

20 25 30

His Ser Asn Leu Leu Ala Gln Met Gly Ala Asp Lys Lys Leu Gly Ser

35 40 45

Arg Phe Val Asp Pro Ala Gly Trp Leu Ser Phe Phe Lys Asn Thr Val

50 55 60

Gly Asn Leu Phe Trp Asn Leu Ser Glu Gln Gly Thr Ser Thr Leu Lys

65 70 75 80

Ile Ser Ala Gly Thr Ala Ser Ile Thr Val Leu Gln Ile Leu Glu Gln

85 90 95

Ser Phe Phe Lys Arg Leu Asn Gln Ala Gln Ile Asp Ser Ala Thr Ala

100 105 110

Ser Val Asp Leu Phe Ser Gln Leu Ser Glu Asp Asp Pro Ala Phe Ile

115 120 125

Leu Tyr Asn Ala Lys Ser His Ala Gln Ile Ser Ala Ala Thr Lys Val

130 135 140

Ile Lys Pro Pro Gln Lys Glu Thr Tyr Ser Val Asn Leu Gln Ile Ser

145 150 155 160

Ile Ala His Thr Gly Ser Glu Ile Ala Leu Cys Asn Ile Phe Phe Gln

165 170 175

Thr Ser Gln Ala Val Ser Asp Glu Leu Phe Thr Gln Lys Phe Ala Ile

180 185 190

Lys Asn Leu Ile Gly Asn Ile Asn Val Phe Tyr Leu Lys Ala Leu Leu

195 200 205

Ser Glu Thr Asn Tyr Gly His Ile Arg Gln Gln Val Ile Glu Lys Leu

210 215 220

Gly Glu Asn Ile Asn Thr Asn Ile Val Leu Val Ala Asp Asn Ser Asp

225 230 235 240

Lys Pro Ser Pro Pro Ser Pro Thr Glu Ala Arg Ser Phe Ile Arg Ser

245 250 255

Leu Lys Ile

<210> 64

<211> 260

<212> БЕЛОК

<213> Enterobacter sp.

<400> 64

Met Asn Thr Asn Ala Leu Asp Phe Val Leu Lys Thr Pro Ile Glu Thr

1 5 10 15

Thr Ala Asp Leu Ala Pro Leu Leu Glu Arg Leu Lys Gly Val Pro Asp

20 25 30

His Gly Gln Ser Lys Arg Lys Thr Met Leu Thr Asp Asn Lys Val Ser

35 40 45

Ala Gln Val Asn Ala Gly Ser Leu Ile Ser Phe Thr Glu Arg Leu Asp

50 55 60

Gly Gln Asn Lys Gln Asp Val Gln Asn Ser Thr Leu Phe Ala Gln Leu

65 70 75 80

Ala Ala Asp Lys His Cys Asn Arg Tyr Thr Ala Pro Met Asp Trp Tyr

85 90 95

Arg Phe Tyr Val Asn Val Leu Gly Gln Ile Gly Trp Asn Gln Pro Ala

100 105 110

Phe Ala Phe Asp Thr Tyr Thr Ser Gly Ala Ser Thr Val Lys Leu Asp

115 120 125

Glu Ala Val Leu Gly Ile Ile Ala Gln Ile Ala Thr Val Gly Glu Val

130 135 140

Ala Leu Val Ala Ala Ala Met Lys Ala Leu Ser Ser Leu Ser Asp Thr

145 150 155 160

Ser Lys Gln Met Leu Ile Trp Asp Ala Lys Ser Asn Ser Glu Asn Thr

165 170 175

Gly Asn Phe Gln Ile Phe Pro Ala Asp Leu Leu Pro Asn Gly Asp Val

180 185 190

Val Met Met Leu Asp Gly Met Gln Phe Asp Ala Lys Arg Asn Glu Gly

195 200 205

Arg Phe Leu Trp Val Thr Trp Gln Ser Thr Ser Ile Lys Ile Gln Arg

210 215 220

Ala Ala Asn Lys Phe Val Leu Asn Glu Gly Val Tyr Lys Gly Val Arg

225 230 235 240

Gln Ala Val Ile Asp Lys Leu Gly Asp Arg Ala Ile Asp Met Ile Ala

245 250 255

Asn Ile Glu Ile

260

<210> 65

<211> 258

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 65

Met Ser Phe Glu Val Cys Asp Ser Ser Val Ala Ala Cys Val Ala Arg

1 5 10 15

Leu Glu Ser Tyr Asp Ile Tyr Pro Asp Ile Ser Pro Arg Ser Leu Tyr

20 25 30

Ser Gly Asp Ile Glu Pro Pro Ala Lys Gly Ser Val Val Gly Glu Gly

35 40 45

Ile Leu Ala Phe Ala Gly Gly Leu Ser Ser Gln His Gln Glu Asp Ala

50 55 60

Gln His Ala Phe Leu Phe Ala Ser Leu Val Ala Asn Arg Gln Tyr Pro

65 70 75 80

Leu Glu Ser Gln Gly Arg Glu Trp Tyr Tyr Lys Phe Val Glu Val Met

85 90 95

Thr Asn Ala Gly Trp Val Ala Thr Gln Arg Phe Tyr Asp Asp Leu Ser

100 105 110

Ile Ala Gly Asn Thr Val Arg Met Asp Lys Leu Val Leu Asp Ile Leu

115 120 125

Ala Ser Val Val Ser Gly Ile Ala Leu Gly Ser Ala Thr Ser Ala Leu

130 135 140

Leu Leu Arg Val Ala Asp Ser Ala Ile Thr Ala Leu Gln Lys Lys Glu

145 150 155 160

Lys Thr Leu Thr Leu Phe Glu Arg Asn Leu Leu Glu His Gly Val Gly

165 170 175

Gly Met Ala Ala Gly Thr Cys Val Glu Ile Asp Gly Glu Val Ser Met

180 185 190

Leu Leu Gly Thr Val Arg Phe Ile Arg Arg Asn Ser Ala Thr Gln Val

195 200 205

Leu Phe Ala Asp Trp Asn Ser Arg Glu Val Lys Leu Tyr Lys Gly Glu

210 215 220

Ser Val Phe Arg Lys Val Pro Ser Ile Val Glu Arg Thr Arg Gly Ile

225 230 235 240

Ile Ile Gly Arg Leu Gly Asn His Ala Val Ser Lys Ile Glu Glu Tyr

245 250 255

Glu Ile

<210> 66

<211> 242

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 66

Met Asp Lys Ala Tyr Ser Ile Phe Val Asn Ala Ala Ala Ile Val Leu

1 5 10 15

Val Ser Ser Thr Val Arg Gly Thr Gly Val Glu Asp Leu Met Asn Ser

20 25 30

Val Leu Leu Ala Gln Leu Val Ala Asn Lys Asn Leu Gln Arg Ile Pro

35 40 45

Ser Ala Asp Trp Tyr Ala Ser Tyr Met Asp Val Leu Ser Val Ala Trp

50 55 60

Val Ala Gly Ala Lys Arg Arg Lys Asp Leu Leu Pro Lys Gln Asp Ala

65 70 75 80

Ala Ser Ser Pro Val Glu Trp Val Thr Ala Ile Pro Leu Asp Asp Arg

85 90 95

Pro Asp Gln Gln Gln Gln Ile Met Ala Val Leu Asp Arg Val Ala Ala

100 105 110

Leu Pro Gly Ser Leu Pro Ala Leu Ser Ile Leu Arg Lys His Met Gln

115 120 125

Lys Pro Asn Glu Pro Glu Pro Thr Gln Ser Pro Ser Ala Ser Ser Pro

130 135 140

Val Arg Leu Leu Val Ile Val Ala His Ser Pro Val Ser Met Thr Gly

145 150 155 160

Ile Cys Leu Gln Phe Asn Thr Gly Lys Ala Ile Asn Ala Asn Pro Trp

165 170 175

Gly Gln Cys Phe Asp Gly Lys Asp Ile Asp Gly Cys Val Ser Ala Arg

180 185 190

Tyr Leu Arg Met Gln Leu Ser Glu Thr Leu Phe Ala Pro Ala Arg Glu

195 200 205

Val Ile Ala Arg Lys Val Gly Thr Val Val Gly Asp Asn Val Val Asp

210 215 220

Ile Thr Gly Ala Ile Glu Asp Ser Val Val Arg Pro Ala Glu Glu Val

225 230 235 240

Gly Arg

<210> 67

<211> 258

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brassicacearum

<400> 67

Met Ser Phe Glu Met Cys Asp Ser Ala Val Ala Ala Cys Val Ala Arg

1 5 10 15

Leu Glu Ser Tyr Asp Ile Tyr Pro Asp Val Ser Pro Arg Ser Leu Tyr

20 25 30

Val Asp Asp Val Glu Pro Pro Ala Lys Gly Ser Val Val Gly Glu Gly

35 40 45

Ile Leu Ala Phe Ala Gly Gly Leu Ser Pro Gln His Gln Glu Asp Ala

50 55 60

Gln His Ala Phe Leu Phe Ala Ser Leu Val Ala Asn Arg Gln Tyr Pro

65 70 75 80

Leu Glu Ser Gln Gly Arg Glu Trp Tyr Tyr Lys Phe Val Glu Val Met

85 90 95

Thr Asn Ala Gly Trp Val Ala Thr Gln Arg Phe Tyr Asp Asp Leu Ser

100 105 110

Val Gly Gly Asn Thr Val Arg Met Asp Lys Leu Val Leu Asp Ile Leu

115 120 125

Ala Ser Val Val Ser Gly Ile Ala Leu Gly Ser Ala Thr Ser Ala Leu

130 135 140

Leu Leu Arg Val Val Asp Ser Ala Ile Thr Ala Leu Gln Lys Lys Glu

145 150 155 160

Glu Thr Leu Thr Leu Phe Glu Arg Asn Leu Leu Glu His Gly Val Gly

165 170 175

Gly Met Ala Ala Gly Thr Cys Val Glu Ile Asp Gly Glu Val Ser Met

180 185 190

Met Leu Gly Thr Val Arg Phe Ile Arg Arg Asn Ser Ala Thr Gln Val

195 200 205

Leu Phe Ala Asp Trp Asn Ser Arg Glu Val Lys Leu Tyr Lys Gly Glu

210 215 220

Ser Val Phe Arg Lys Val Pro Ser Val Val Glu Arg Thr Arg Asp Ile

225 230 235 240

Ile Ile Gly Arg Leu Gly Asn His Ala Val Ser Lys Ile Glu Glu Tyr

245 250 255

Glu Ile

<210> 68

<211> 242

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brassicacearum

<400> 68

Met Asp Lys Glu Tyr Ser Val Phe Val Asn Ala Ala Ala Ile Val Leu

1 5 10 15

Ala Pro Cys Ala Leu Arg Arg Thr Glu Val Asp Asp Leu Met Asn Ser

20 25 30

Val Leu Leu Ala Gln Leu Val Ala Asp Lys Ser Leu Leu Arg Ala Pro

35 40 45

Ala Val Asp Trp Tyr Ala Thr Tyr Leu Glu Val Leu Ser Val Ala Trp

50 55 60

Ile Ser Ala Ala Lys Arg Arg Lys Asp Leu Gln Pro Gln Lys Glu Asp

65 70 75 80

Thr His Ser Pro Leu Glu Trp Val Ala Ala Ile Pro Leu Asp Asp Gln

85 90 95

Val Asp Gln Gln Gln Arg Ile Met Ala Val Met Glu Arg Ile Ala Ala

100 105 110

Leu Pro Gly Ser Leu Pro Ala Met Gly Ile Val Arg Lys His Val Gln

115 120 125

Lys Gln Tyr Glu Pro Asp Ala Ala Gln Ser Pro Ser Ser Ser Ser Pro

130 135 140

Val Arg Leu Leu Val Ile Val Ala Gln Ser Pro Val Ser Met Ala Gly

145 150 155 160

Val Tyr Leu Gln Phe Asn Thr Ala Lys Val Ile Glu Ala Asn Pro Trp

165 170 175

Arg Gln Cys Phe Asp Gly Lys Asp Ile Asp Gly Cys Val Thr Ala Arg

180 185 190

Tyr Phe Arg Thr Gln Leu Ser Glu Thr Leu Phe Ala Pro Ala Arg Glu

195 200 205

Val Ile Ala Arg Lys Val Ala Ala Ala Val Gly Asp Asn Ile Val Asp

210 215 220

Ile Thr Lys Ala Ile Asp Asp Ser Gly Val Leu Pro Ala Glu Glu Val

225 230 235 240

Cys Arg

<210> 69

<211> 263

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы проса прутьевидного из Мичигана

<400> 69

Met Ser Val Asn Met Ile Asp Ser Ala Thr Val Ala Ala Cys Val Arg

1 5 10 15

Arg Leu Glu Ser Tyr Glu Ile Asp Glu Val Pro Val Val Arg Ser Arg

20 25 30

Ala Phe Ala Ala Ser Gly Ile Val Val Glu Glu Pro Ser Lys Gly Ala

35 40 45

Val Val Gly Glu Gly Ile Leu Ser Phe Val Gly Asn Leu Ser Glu Gln

50 55 60

Asn Gln Val Asp Ala Met His Ala Phe Leu Phe Ala Ser Leu Val Ala

65 70 75 80

Asn Lys Gln Phe Pro Tyr Glu Tyr Gln Gly Lys Glu Trp Tyr Tyr Lys

85 90 95

Phe Val Glu Val Met Thr Ser Ala Gly Trp Leu Thr Ser Gln Lys Tyr

100 105 110

Tyr Asn Asp Ile Glu Ile Ser Gly Asn Thr Val Arg Met Asp Gln Leu

115 120 125

Val Leu Glu Ile Leu Gly Ser Val Val Ala Gly Leu Ala Ile Pro Gly

130 135 140

Thr Ala Ser Ala Leu Met Leu Lys Val Ala Gly Asp Ala Ile Thr Ala

145 150 155 160

Leu Lys Lys Lys Glu Thr Ala Leu Thr Leu Tyr Glu Arg Asn Leu Leu

165 170 175

Glu His Gly Val Gly Gly Met Ala Ala Gly Thr Cys Thr Glu Val Asn

180 185 190

Gly Glu Val Thr Leu Ala Leu Gly Thr Val Arg Phe Ile Arg Lys Asn

195 200 205

Thr Ala Thr Gln Val Leu Phe Met Asp Trp Asp Ser Arg Asp Val Gln

210 215 220

Leu Tyr Lys Gly Glu Ser Val Phe Arg Lys Val Pro Tyr Ile Ala Asp

225 230 235 240

Gln Thr Arg Asp Leu Ile Arg Thr Lys Leu Gly Thr Asn Ala Val Ser

245 250 255

Lys Ile Glu Gly Tyr Glu Ile

260

<210> 70

<211> 242

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы проса прутьевидного из Мичигана

<400> 70

Met Ala Arg Glu Tyr Ser Val Phe Val Asn Ala Ala Ala Ile Val Leu

1 5 10 15

Leu Pro Ser Asn Pro Val Glu Ser Ala Thr Asn Asp Leu Met Asn Ser

20 25 30

Val Leu Leu Ala Gln Leu Val Ala Asn Lys Arg Ala Glu Ala Thr Ser

35 40 45

Ala Val Asp Trp Tyr Glu Thr Tyr Val Gly Val Leu Gly Asp Phe Trp

50 55 60

Leu Thr Arg Ala Arg Ser Arg Gln Asp Ile Gln Pro Gly Lys Asp Asp

65 70 75 80

Thr Ala Ser Pro Leu Glu Trp Ile Ala Ala Val Leu Ala Ser Ser Thr

85 90 95

Glu Asp Glu Ala Arg Leu Val Thr Ala Leu Leu Lys Gly Ile Ala Arg

100 105 110

Leu Ser Asp Ser Leu Pro Ala Met Ser Leu Leu Arg Lys His Val Gln

115 120 125

Lys Glu Ser Asp Asp Glu Pro Ala Glu Ile Ser Leu Gln Ser Lys Pro

130 135 140

Val Arg Leu Val Val Ile Val Ala Gln Asp Asn Ala Ser Met Thr Ser

145 150 155 160

Val Cys Leu Gln Phe Lys Thr Arg Gln Met Leu Asp Pro Asn Pro Trp

165 170 175

Gly Gln Arg Phe His Val Glu Asp Met Glu Gly Cys Val Ser Ala His

180 185 190

Phe Phe His Ala His Leu Ser Glu Thr Leu Tyr Ala Pro Ala Arg Glu

195 200 205

Ala Val Ala Arg Lys Val Glu Gly Val Leu Ser Asp Asn Ile Val Asp

210 215 220

Ile Thr Glu Ala Ile Asp Ala Leu Ala Phe Leu Pro Thr Glu Glu Ala

225 230 235 240

Gly Thr

<210> 71

<211> 261

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы мискантуса из Келлогга

<400> 71

Met Asn Val His Asp Val Glu Asp Cys Thr Val Ala Glu Cys Ile His

1 5 10 15

Arg Leu Glu Ser Tyr Glu Leu Asp Gly Ala Glu Val Met Arg Pro Arg

20 25 30

Ser Phe Ser Val Pro Val Val Asn Glu Pro Gly Lys Gly Ser Ile Val

35 40 45

Gly Glu Gly Ile Leu Ser Phe Thr Gly Asn Leu Ser Glu Gln Asn Arg

50 55 60

Glu Asp Val Gln His Ala Phe Leu Phe Ala Ser Leu Val Ala Asn Lys

65 70 75 80

Lys Tyr Pro Tyr Glu Tyr Gln Gly Lys Glu Trp Tyr Tyr Gln Phe Leu

85 90 95

Glu Val Met Thr His Ala Gly Trp Leu Pro Thr Ser Lys Tyr Tyr Asn

100 105 110

Asp Met Asn Ile Ser Gly Asn Thr Val Arg Met Asp Gln Leu Val Leu

115 120 125

Glu Ile Leu Gly Ser Val Val Ala Gly Leu Ala Val Pro Gly Ser Ala

130 135 140

Ser Val Leu Met Leu Lys Val Ala Gly Asp Ala Ile Thr Ala Leu Lys

145 150 155 160

Lys Arg Glu Thr Ala Leu Thr Leu Tyr Glu Arg Asn Met Leu Glu His

165 170 175

Gly Val Gly Gly Met Ala Ala Gly Thr Cys Thr Glu Val Asn Gly Glu

180 185 190

Val Thr Met Ala Leu Gly Thr Val Arg Phe Ile Arg Lys Asn Thr Ala

195 200 205

Lys Gln Val Leu Phe Met Asp Trp Asp Ser Arg Glu Val Lys Leu Tyr

210 215 220

Arg Gly Asp Ser Val Phe Arg Lys Val Pro Tyr Ile Val Glu Gln Thr

225 230 235 240

Arg Asp Thr Ile Arg Ala Lys Leu Gly Leu Asn Ala Lys Pro Lys Ile

245 250 255

Glu Asp Tyr Asp Ile

260

<210> 72

<211> 240

<212> БЕЛОК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы мискантуса из Келлогга

<400> 72

Met Ser Tyr Glu Tyr Ser Val Leu Ile Val Gly Ala Cys Val Val Ile

1 5 10 15

Ile Pro Ala Ala Asp Gly Ala Ala Gln Tyr Thr Asp Leu Val Asn Ser

20 25 30

Val Leu Leu Ala Gln Leu Ile Ala Asn Lys Lys Ile Glu Lys Ala Pro

35 40 45

Glu Ile Asp Trp Tyr Asn Ala Tyr Val Glu Phe Leu Asp Asp Tyr Trp

50 55 60

Leu Arg Arg Thr Arg Ala Arg Gln Asp Trp Ser Ile Ala Gln Asp Arg

65 70 75 80

Val Glu Ser Val Ser Asp Trp Val Ile Ala Ala Ile Ser Gln Asp Ala

85 90 95

Val Asp Lys Gly Ser Ala Thr Ala Ala Thr Leu Gln Arg Leu Ala Arg

100 105 110

Leu Ser Gly Asn Glu Pro Ala Met Gly Leu Leu Arg Gly His Met Gln

115 120 125

Lys Ile Ser Thr Asp Glu Ser Gly Asp Val Leu Ala Pro Ala Lys Ala

130 135 140

Val Arg Leu Leu Val Val Ile Ala Gln Thr Pro Thr Ser Val Ala Ser

145 150 155 160

Val Tyr Ile Glu Leu Lys Thr Arg Gln Ile Ile Ser Ala Asn Pro Leu

165 170 175

Ala Gln Arg His Leu Ala Glu Asp Val Gln Gly Ser Val Cys Met Arg

180 185 190

Tyr Ala Ala Ala Asn Leu Ser Glu Thr Leu Tyr Ser Pro Val Arg Asp

195 200 205

Ala Ile Ala Leu Lys Val Arg Asp Lys Tyr Gln Asp Asn Val Ala Met

210 215 220

Leu Thr Leu Ser Asp Asp Ala Ser Ala Met Glu Ile Cys Ala Val Asp

225 230 235 240

<210> 73

<211> 555

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 73

Met Ala Lys Leu Thr Gln Phe Ser Thr Pro Ala Asp Ile Gln Asp Phe

1 5 10 15

Ser Asp Ser Pro Ala Gln Gln Glu Arg Met Asn Ala Ala Trp Ser Gly

20 25 30

Asn Ile Asn Arg Trp Val Asn Ala Ala Leu Val Gly Asp Val Trp Asp

35 40 45

Leu Ile Asn Tyr Gly Pro Arg Pro Ala Phe Tyr Asn Pro Leu Asp Thr

50 55 60

Asp Thr Pro Ser Thr Ser Val Asn Ala Pro Ile Thr Trp Asn Ala Phe

65 70 75 80

Pro Gly Arg Ile Pro Ala Leu Phe Pro Asn Gln Ser Ala Asn Trp Leu

85 90 95

Gln Trp Ala Asp Gln Gly Val Pro Ala Asn Val Thr Thr Asn Leu Cys

100 105 110

Thr Gln Gln Ser Val Pro Pro Ala Pro Tyr Ser Pro Thr Gly Pro Arg

115 120 125

Gly Trp Gln Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Val Thr Arg Asn Ala Ala

130 135 140

Gly Gln Ile Thr Ser Val Met Phe Thr Cys Glu Asn Pro Glu Tyr Trp

145 150 155 160

Met Thr Leu Trp Gln Val Asp Pro Gly Lys Val Leu Gln Arg Tyr Gln

165 170 175

Gln Leu Ile Asn Pro Ala Val Gln Leu Ala Asp Leu Ser Leu Lys Asp

180 185 190

Ala Gln Gly Gln Thr Val Ile Asp Pro Val Thr Gly Ala Pro Cys Tyr

195 200 205

Asn Pro Leu Asn Lys Trp Asn Ser Gly Thr Gln Thr Leu Pro Gly Ser

210 215 220

Gly Gly Ala Met His Leu Thr Ser Ser Pro Asn Thr Leu Gly Ala Glu

225 230 235 240

Tyr Asp Leu Ala Ala Ala Ala Thr Met Pro Arg Glu Leu Asn Asn Glu

245 250 255

Pro Val Thr Ser Ala Ser Gln Leu Val Cys Tyr Ala Arg Tyr Gly Arg

260 265 270

Ile Gly Arg His Ser Asp Pro Thr Ile Gly Gln Asn Val Asn Gln Tyr

275 280 285

Val Asn Tyr Thr Ser Gly Leu Thr Glu Val Arg Ala Thr Leu Thr Asn

290 295 300

Pro Pro Gly Leu Tyr Ile Gln Thr Pro Asp Phe Ser Gly Tyr Thr Thr

305 310 315 320

Pro Asp Gly Ser Pro Ala Ala Ala Cys Trp Thr Ile Asn Arg Gly His

325 330 335

Leu Ala Gln Thr Ser Asp Asp Ile Asp Arg Ile Leu His Ala Thr Phe

340 345 350

Ser Val Pro Ala Gly Lys Asn Phe Thr Val Ser Asp Ile Ser Ile Asn

355 360 365

Gly Ala Lys Ile Gln Tyr Ala Ser Gln Ile Ala Gly Thr Ile Thr Met

370 375 380

Gly Leu Met Ala Thr Val Phe Gly Asn Ser Gly Val Thr Gln Gln Pro

385 390 395 400

Val Ala Gly Thr Leu Asp Ser Asp Asn Pro Ser Pro Ser Val Ser Ala

405 410 415

Leu Gln Pro Leu Ser Val Phe Asn Ala Tyr Arg Ala Gln Glu Leu Ala

420 425 430

Ser Asn Glu Gln Ala Leu Ser Ile Pro Ile Leu Ala Leu Ala Ile Arg

435 440 445

Pro Gly Gln Gln Val Asp Asn Ile Ala Leu Leu Leu Asn Thr Ser Gln

450 455 460

Thr Pro Asn Gly Ala Ser Phe Ser Val Val Glu Gly Gly Val Ser Ile

465 470 475 480

Ser Ile Thr Gly Thr Gln Asp Leu Pro Gly Leu Asp Met Ser Leu Tyr

485 490 495

Leu Val Ser Ile Ser Ala Asp Ala Asn Ala Ala Pro Gly Asp Arg Thr

500 505 510

Val Leu Ala Ser Val Pro Gly Met Ala Ser Thr Gln Gln Ala Ala Ile

515 520 525

Gly Leu Leu Thr Val Gly Gly Pro Thr Leu Val Thr Ser Gln Thr Gly

530 535 540

Pro Ser Lys Pro Asn Phe Arg Arg Gly Arg Gly

545 550 555

<210> 74

<211> 451

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 74

Met Arg Arg Arg Pro Thr Val Leu Leu Gly Leu Ala Leu Leu Leu Gly

1 5 10 15

Leu Pro Ala Thr Gln Ala Met Gly Ala Pro Leu Cys Gly Ser Pro Phe

20 25 30

Val Pro Ser Pro Thr Leu Gln Pro Thr Leu Ala Pro Pro Asn Phe Ser

35 40 45

Ala Ser Asp Ser Ala Val Asp Cys Phe Met Trp Gln Thr Met Val Tyr

50 55 60

Leu Asn Trp Pro Ala Thr Pro Gly Gln Arg Gly Val Pro Asn Ala Ala

65 70 75 80

Ala Ser Leu Gly Ser Pro Gly Pro Ser Val Trp Gln Thr Tyr Lys Asp

85 90 95

Tyr Asn Glu Leu Tyr Leu Pro Asn Gly Gln Gln Pro Pro Ala Trp Asn

100 105 110

Asp Asn Phe Leu Ser Val Gln Arg Leu Gln Thr Arg Gly Val Ala Arg

115 120 125

Ala Leu Pro Ser Ile Arg Leu Leu Asn Ser Thr Ser Lys Val Phe Arg

130 135 140

Ala Ala Asn Ala Asn Glu Ser Pro Ala Leu Arg Glu Ile Glu Gln Val

145 150 155 160

Gly Gly Gly Val Leu Tyr Asp Gln Ala Gly Ser Pro Val Tyr Tyr Glu

165 170 175

Met Leu Val Asn Glu Val Asn Phe Asp Phe Ile Tyr Asn Asn Gln Leu

180 185 190

Tyr Asn Pro Ala Gln Gln Asn Leu Tyr Ala Lys Gln Lys Gly Ile Val

195 200 205

Leu Pro Asn Asn Ser Ile Glu Ile Lys Ala Ala Trp Lys Val Leu Ser

210 215 220

Asp Pro Asp Asn Pro Gln Arg Phe Leu Thr Ala Gln Ala Leu Leu Pro

225 230 235 240

Gly Ser Ser Thr Pro Val Thr Val Gly Leu Val Gly Leu His Val Phe

245 250 255

Gln Met Pro Ser Ser Ala Phe Asn Gln Gly Phe Trp Ala Thr Phe Gln

260 265 270

Gln Leu Asp Asn Ala Pro Thr Val Ala Gly Ala Thr Pro Gly Ala His

275 280 285

Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Gln Cys Ala Pro Ala Gln Cys Pro Pro Asn

290 295 300

Asp Lys Thr Ser Asn Pro Thr Gln Val Val Gln Asn Phe Pro Pro Thr

305 310 315 320

Pro Glu Ala Gln Asn Ile Asn His Tyr Met Gln Asn Leu Ile Ala Gln

325 330 335

Gln Ala Pro Gly Ser Ala Leu Gln Tyr Tyr Gln Leu Val Asp Val Gln

340 345 350

Trp Pro Thr Ser Pro Gln Ala Ile Gly Gln Pro Gly Ala Thr Ala Pro

355 360 365

Ala Pro Ser Gly Thr Pro Asn His Asp Thr Leu Ile Asn Pro Val Leu

370 375 380

Glu Thr Phe Leu Gln Ala Asn His Lys Ser Cys Leu Gly Cys His Val

385 390 395 400

Tyr Ala Ser Val Ala Ala Asp Gly Ser Asn Pro Pro Thr His Tyr Gln

405 410 415

Ala Ser Phe Ser Phe Leu Leu Gly His Ala Lys Ser Pro Ala Leu Gly

420 425 430

Ser Asn Leu Lys Ser Leu Ala Gln Gln Ile Glu Asp Ala Ser Leu Ser

435 440 445

Leu Gln His

450

<210> 75

<211> 555

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas orientalis

<400> 75

Met Ala Lys Leu Thr Gln Phe Ser Thr Pro Ala Asp Ile Gln Asp Phe

1 5 10 15

Ser Asp Ser Pro Ala Gln Gln Glu Arg Met Asn Ala Ala Trp Ser Gly

20 25 30

Asn Ile Asn Arg Trp Val Asn Ala Ala Leu Val Gly Asp Val Trp Asp

35 40 45

Leu Ile Asn Tyr Gly Pro Arg Pro Ala Phe Tyr Asn Pro Leu Asp Thr

50 55 60

Asp Thr Pro Ser Thr Ser Val Asn Ala Pro Ile Thr Trp Asn Ala Phe

65 70 75 80

Pro Gly Arg Ile Pro Ala Leu Phe Pro Asn Gln Ser Ala Asn Trp Leu

85 90 95

Gln Trp Ala Asp Gln Gly Val Pro Ala Asn Val Thr Thr Asn Leu Cys

100 105 110

Thr Gln Gln Ser Ile Pro Ala Ala Pro Tyr Ser Pro Thr Gly Pro Arg

115 120 125

Gly Trp Gln Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Val Thr Arg Asn Ala Ala

130 135 140

Gly Gln Ile Thr Ser Val Met Phe Thr Cys Glu Asn Pro Glu Tyr Trp

145 150 155 160

Met Thr Leu Trp Gln Val Asp Pro Gly Lys Val Leu Gln Arg Tyr Gln

165 170 175

Gln Leu Ile Asn Pro Ala Val Gln Leu Ala Asp Leu Ser Leu Lys Asp

180 185 190

Ala Gln Gly Gln Thr Val Ile Asp Pro Val Thr Gly Ala Pro Cys Tyr

195 200 205

Asn Pro Leu Asn Lys Trp Asn Ser Gly Thr Gln Thr Leu Pro Gly Ser

210 215 220

Gly Gly Ala Met His Leu Thr Ser Ser Pro Asn Thr Leu Gly Ala Glu

225 230 235 240

Tyr Asp Leu Ala Ala Ala Ala Thr Met Pro Arg Glu Leu Asn Asn Glu

245 250 255

Pro Val Thr Ser Ala Ser Gln Leu Val Cys Tyr Ala Arg Tyr Gly Arg

260 265 270

Ile Gly Arg His Ser Asp Pro Thr Ile Gly Gln Asn Val Asn Gln Tyr

275 280 285

Val Asn Tyr Thr Ser Gly Leu Thr Glu Val Arg Ala Thr Leu Thr Asn

290 295 300

Pro Pro Gly Leu Tyr Ile Gln Thr Pro Asp Phe Ser Gly Tyr Thr Thr

305 310 315 320

Pro Asp Gly Ser Pro Ala Ala Ala Cys Trp Thr Ile Asn Arg Gly His

325 330 335

Leu Ala Gln Thr Ser Asp Asp Ile Asp Arg Ile Leu His Ala Thr Phe

340 345 350

Ser Val Pro Ala Gly Lys Asn Phe Thr Val Ser Asp Ile Ser Ile Asn

355 360 365

Gly Ala Lys Ile Gln Tyr Ala Ser Gln Ile Ala Gly Thr Ile Thr Met

370 375 380

Gly Leu Met Ala Thr Val Phe Gly Asn Ser Gly Val Thr Gln Gln Pro

385 390 395 400

Val Ala Gly Thr Leu Asp Ser Asp Asn Pro Ser Pro Ser Val Ser Ala

405 410 415

Leu Gln Pro Leu Ser Val Phe Asn Ala Tyr Arg Ala Gln Glu Leu Ala

420 425 430

Ser Asn Glu Gln Ala Leu Ser Ile Pro Ile Leu Ala Leu Ala Ile Arg

435 440 445

Pro Gly Gln Gln Val Asp Asn Ile Ala Leu Leu Leu Asn Thr Ser Gln

450 455 460

Thr Pro Asn Gly Ala Ser Phe Ser Val Val Glu Gly Gly Val Ser Ile

465 470 475 480

Ser Ile Thr Gly Thr Gln Asp Leu Pro Gly Leu Asp Met Ser Leu Tyr

485 490 495

Leu Val Ser Ile Ser Ala Asp Ala Asn Ala Ala Pro Gly Asp Arg Thr

500 505 510

Val Leu Ala Ser Val Pro Gly Met Ala Ser Thr Gln Gln Ala Ala Ile

515 520 525

Gly Leu Leu Thr Val Gly Gly Pro Thr Leu Val Thr Ser Gln Thr Gly

530 535 540

Pro Ser Lys Pro Asn Phe Arg Arg Gly Arg Gly

545 550 555

<210> 76

<211> 451

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas orientalis

<400> 76

Met Arg Arg Arg Pro Thr Val Leu Leu Gly Leu Ala Leu Leu Leu Gly

1 5 10 15

Leu Pro Ala Thr Gln Ala Met Gly Ala Pro Leu Cys Gly Ser Pro Phe

20 25 30

Val Pro Ser Pro Thr Leu Gln Pro Thr Leu Ala Asn Pro Asn Phe Ser

35 40 45

Ala Ser Asp Ser Ala Val Asp Cys Phe Met Trp Gln Thr Met Val Tyr

50 55 60

Leu Asn Trp Pro Ala Thr Pro Gly Gln Arg Gly Val Pro Asn Ala Ala

65 70 75 80

Ala Ser Leu Gly Ser Pro Gly Pro Ser Val Trp Gln Thr Tyr Lys Asp

85 90 95

Tyr Asn Glu Leu Tyr Leu Pro Asn Gly Gln Gln Pro Pro Ala Trp Asn

100 105 110

Asp Asn Phe Leu Ser Val Gln Arg Leu Gln Thr Arg Gly Val Ala Arg

115 120 125

Ala Leu Pro Ser Ile Arg Leu Leu Asn Ser Thr Ser Lys Val Phe Arg

130 135 140

Ala Ala Asn Ala Asn Glu Ser Pro Ala Leu Arg Glu Ile Glu Gln Val

145 150 155 160

Gly Gly Gly Val Leu Tyr Asp Gln Ala Gly Ser Pro Val Tyr Tyr Glu

165 170 175

Met Leu Val Asn Glu Val Asn Phe Asp Phe Ile Tyr Asn Asn Gln Leu

180 185 190

Tyr Asn Pro Ala Gln Gln Asn Leu Tyr Ala Lys Gln Lys Gly Ile Val

195 200 205

Leu Pro Asn Asn Ser Ile Glu Ile Lys Ala Ala Trp Lys Val Leu Ser

210 215 220

Ala Pro Asp Asn Pro Gln Arg Phe Leu Thr Ala Gln Ala Leu Leu Pro

225 230 235 240

Gly Ser Ser Thr Pro Val Thr Val Gly Leu Val Gly Leu His Val Phe

245 250 255

Gln Met Pro Ser Ser Ala Phe Asn Gln Gly Phe Trp Ala Thr Phe Gln

260 265 270

Gln Leu Asp Asn Ala Pro Thr Val Ala Gly Ala Ser Pro Gly Ala His

275 280 285

Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Gln Cys Ala Pro Ala Gln Cys Pro Pro Asn

290 295 300

Asp Lys Thr Ser Asn Pro Thr Gln Val Val Gln Asn Phe Pro Pro Thr

305 310 315 320

Pro Glu Ala Gln Asn Ile Asn Gln Tyr Met Gln Asn Leu Ile Ala Gln

325 330 335

Gln Ala Pro Gly Ser Ala Leu Gln Tyr Tyr Gln Leu Val Asp Val Gln

340 345 350

Trp Pro Thr Ser Pro Gln Ala Ile Gly Gln Pro Gly Ala Thr Ala Pro

355 360 365

Ala Pro Ser Gly Thr Pro Asn His Asp Thr Leu Ile Asn Pro Val Leu

370 375 380

Glu Thr Phe Leu Gln Thr Asn His Thr Ser Cys Leu Gly Cys His Val

385 390 395 400

Tyr Ala Ser Val Ala Ala Asp Gly Ser Lys Pro Ala Thr Asp Tyr Gln

405 410 415

Ala Ser Phe Ser Phe Leu Leu Gly His Ala Lys Ser Pro Ala Leu Gly

420 425 430

Ser Asn Leu Lys Ser Leu Ala Gln Gln Ile Glu Asp Ala Ser Leu Ser

435 440 445

Leu Gln His

450

<210> 77

<211> 556

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PKRS11

<400> 77

Met Ala Lys Leu Ala Gln Phe Ser Pro Pro Ala Arg Ile Gln Asp Phe

1 5 10 15

Ser Asn Asp Pro Ala Gln Gln Glu Cys Leu Asn Ala Ala Trp Ser Gly

20 25 30

Asn Ile Asn Arg Trp Val Asn Ala Ala Leu Leu Gly Asp Val Trp Asp

35 40 45

Arg Ile Asn Tyr Gly Pro Arg Pro Ala Phe Tyr Asn Pro Leu Val Thr

50 55 60

Asp Thr Pro Asp Thr Ala Gly Asn Val Pro Ile Thr Trp Asn Ala Phe

65 70 75 80

Pro Gly Arg Leu Gln Ala Leu Phe Pro Asn Gln Gly Ala Ser Trp Gln

85 90 95

Gln Trp Ala Asp Gln Gly Val Pro Asp Lys Val Thr Thr Asp Leu Cys

100 105 110

Ser Gly Lys Pro Ile Asp Pro Ala Pro Tyr Ser Pro Thr Gly Pro Arg

115 120 125

Gly Trp Gln Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Val Thr Arg Asn Gly Ala

130 135 140

Gly Gln Ile Thr Ser Val Met Phe Thr Cys Glu Asn Pro Glu Tyr Trp

145 150 155 160

Met Thr Leu Trp Gln Val Asp Pro Gly Lys Val Leu Gln Ile Tyr Gln

165 170 175

Gln Val Ile Asn Pro Ala Val Gln Leu Ser Asp Leu Cys Leu Lys Asp

180 185 190

Ser His Gly Gln Thr Val Asn Asp Pro Leu Thr Gly Gln Pro Cys Tyr

195 200 205

Asn Pro Leu Asn Lys Trp Asn Ser Gly Thr Arg Thr Leu Ala Asn Ser

210 215 220

Gly Gly Ala Met His Leu Thr Ser Ser Pro Asn Thr Leu Gly Ala Glu

225 230 235 240

Tyr Asp Leu Ala Ala Ala Ala Thr Met Pro Arg Glu Lys Asp His Asp

245 250 255

Pro Val Thr Ser Ala Ala Ala Leu Val Cys Phe Ala Arg Tyr Gly Arg

260 265 270

Ile Gly Arg His Ser Asp Pro Thr Ile Gly Gln Asn Val Asn Gln Tyr

275 280 285

Ala Asn Tyr Thr Pro Thr Leu Pro His Pro Gln Ala Thr Leu Ala Asp

290 295 300

Pro Pro Gly Leu Tyr Met Gln Thr Pro Gln Phe Ser Asp Tyr Val Thr

305 310 315 320

Pro Asp Asn Thr Pro Ala Gln Thr Phe Trp Thr Val Val Arg Gly Ser

325 330 335

Leu Lys Asp Pro Asn Thr Ser Glu Asp Ile Asp Arg Ile Leu His Ala

340 345 350

Thr Phe Ser Val Pro Pro Glu Leu Gly Tyr Thr Val Ser Asp Ile Lys

355 360 365

Ile Gly Asn Gln Pro Ile Arg Tyr Gly Ser Gln Ile Ala Ala Thr Ile

370 375 380

Thr Met Ala Leu Leu Ala Thr Ala Phe Pro Asn Ser Gly Val Val Gln

385 390 395 400

Thr Pro Val Gly Ala Thr Leu Asp Asn Ser Asn Pro Ser Pro Ser Val

405 410 415

Ser Ala Leu Gln Ala Leu Ala Val Phe Thr Ala Tyr Arg Ala Gln Glu

420 425 430

Leu Ala Ser Asn Glu Gln Pro Leu Ser Ile Pro Val Leu Ala Leu Ala

435 440 445

Val Ser Pro Gly Gln Gln Val Ser Asn Ile Ala Leu Leu Leu Asn Thr

450 455 460

Ser Asp Thr Pro Asp Gly Ala Val Phe Thr Val Pro Glu Gly Gly Val

465 470 475 480

Ser Ile Arg Ile Asp Gly Thr Gln Ala Leu Pro Asn Ala Glu Leu Ser

485 490 495

Leu Tyr Gln Val Thr Leu Cys Val Asp Ala Asn Ala Ala Ile Gly Asp

500 505 510

Arg Ser Ile Leu Ala Ser Val Pro Ser Met Pro Ala Thr Gln Gln Ala

515 520 525

Ala Ile Gly Leu Leu Thr Val Val Ala Pro Pro Gln Val Arg Leu Ala

530 535 540

Gly Gly Pro Arg Lys Pro His Ala Arg His Ser Arg

545 550 555

<210> 78

<211> 448

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. PKRS11

<400> 78

Met Arg Ala Ile Leu Ala Leu Leu Leu Tyr Ala Gly Leu Ser Leu Ala

1 5 10 15

Pro Val Ala Ala Arg Ala Ala Gly Asn Pro Cys Gly Ser Pro Phe Ser

20 25 30

Pro Glu Pro Val Ile Gln Pro Val Leu Ala Asn Pro Gln Ile Ser Asn

35 40 45

Leu Asp Pro Ser Val Asp Cys Phe Met Trp Gln Thr Met Val Tyr Leu

50 55 60

Asn Trp Pro Ala Gln Ala Gly Gln Arg Gly Leu Pro Asn Thr Asp Ala

65 70 75 80

His Leu Gly Asp Pro Gly Pro Thr Val Trp Gln Thr Phe Lys Asp Phe

85 90 95

Asn Glu Leu Tyr Leu Pro Gly Gly Gln Arg Pro Ala Pro Trp Asn Asp

100 105 110

Asn Phe Leu Thr Met Gln Arg Leu Glu Leu Arg Gly Val Glu Arg Pro

115 120 125

Arg Pro Ser Ile Arg Leu Leu Asn Ser Thr Ser Lys Val Phe Arg Asn

130 135 140

Ala Asp Ala Ser Glu Gln Lys Ala Leu Asp Glu Phe Lys Gln Val Gly

145 150 155 160

Gly Gly Val Leu Tyr Asp Gln Asn Gly Gln Pro Val Tyr Tyr Glu Met

165 170 175

Leu Ile Asn Gln Ile Asn Phe Asp Tyr Ile Tyr Ser Asn Gln Leu Tyr

180 185 190

Asn Ala Ala Gln Gln Asn Leu His Ala Ala Lys Gln Gly Ile Val Leu

195 200 205

Pro Ser Asn Ser Ile Glu Leu Lys Ala Ala Trp Lys Val Leu Ser Pro

210 215 220

Gln Glu Ala Ala Pro Pro Leu Arg Phe Leu Thr Ala Gln Ala Leu Leu

225 230 235 240

Pro Gly Ser Gln Val Pro Val Thr Val Gly Leu Val Gly Leu His Val

245 250 255

Phe Gln Met Pro Ser Lys Asp Phe Ala Gln Gly Phe Trp Ala Thr Phe

260 265 270

Ser Gln Val Asp Asn Ala Pro Thr Leu Asn Thr Pro Gly Gln Ala His

275 280 285

Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Gln Cys Ser Gln Cys Pro Val Asn Asp Leu

290 295 300

Gly Ser Lys Pro Thr Gln Val Val Gln Val Gln Ala Asn Ala Val Tyr

305 310 315 320

Ala Gln Ala Val Asn Gln Tyr Met Gln Ala Leu Ile Gln Gln Gln Ala

325 330 335

Pro Asn Ser Ala Leu Gln Tyr Tyr Gln Leu Ile Asn Val Gln Trp Pro

340 345 350

Asn Ser Ser Val Pro Ile Gly Gln Pro Gly Gln Pro Thr Pro Ala Pro

355 360 365

Thr Gly Ser Pro Ser Thr Asp Thr Leu Val Asn Pro Val Leu Glu Thr

370 375 380

Phe Met Gln Val Ser Asn Met Ser Cys Leu Gly Cys His Lys Ser Ala

385 390 395 400

Ser Val Ala Asp Asn Gly Thr Gln Pro Pro Ser Gly Tyr Gln Ala Ser

405 410 415

Tyr Ser Phe Leu Leu Gly His Ala Gln Asn Pro Pro Pro Gln Gly Ser

420 425 430

Leu Lys Ser Leu Ala Arg Gln Val Glu Glu Ala Ser Thr Ala Arg Gln

435 440 445

<210> 79

<211> 96

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas Antarctica

<400> 79

Met Lys Leu Ser Asn Val Leu Leu Leu Ser Ile Val Phe Ala Trp Gln

1 5 10 15

Gly Met Ala Phe Ala Asp Thr Gln Lys Ser Asn Ala Glu Thr Leu Leu

20 25 30

Ser Asn Asp Lys Pro Pro Leu Thr Gln Ala Ala Gln Glu Lys Glu Gln

35 40 45

Glu Asn Val Glu Ala Asp Arg Asn Glu Cys Trp Ser Ala Lys Asn Cys

50 55 60

Ser Gly Lys Ile Leu Asn Asn Lys Asp Ala His Asn Cys Lys Leu Ser

65 70 75 80

Gly Gly Lys Ser Trp Arg Ser Lys Thr Thr Gly Gln Cys Thr Asn Leu

85 90 95

<210> 80

<211> 96

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas orientalis

<400> 80

Met Lys Met Ser Ser Val Leu Leu Met Ser Ile Ala Phe Val Cys Gln

1 5 10 15

Gly Met Val Phe Ala Asp Thr Gln Lys Ser Asn Thr Glu Thr Leu Phe

20 25 30

Ser Asn Asp Lys Pro Pro Leu Ile Gln Thr Ala Gln Glu Gln Glu Gln

35 40 45

Lys Glu Val Glu Val Asp Arg Asn Gln Cys Trp Ser Ala Lys Asn Cys

50 55 60

Ser Gly Lys Ile Leu Asn Asn Lys Asp Ala His Asn Cys Lys Leu Ser

65 70 75 80

Gly Gly Lys Ser Trp Arg Ser Lys Thr Thr Gly Gln Cys Thr Asn Leu

85 90 95

<210> 81

<211> 95

<212> БЕЛОК

<213> Enterobacter asburiae

<400> 81

Met Lys Thr Leu Val Ile Ala Ile Leu Thr Ala Val Leu Cys Gln Gly

1 5 10 15

Met Ala Met Ala Asp Thr Gln Lys Pro Ala Thr Gly Ala Leu Pro Ala

20 25 30

Asn Glu Lys Pro Pro Leu Val Gln Pro Ala Asp Glu His Lys Thr Ser

35 40 45

Glu Ala Asn Ala Asn Arg Asn Glu Cys Trp Ser Ala Lys Asn Cys Thr

50 55 60

Gly Lys Ile Leu Asn Asn Lys Asp Ala His Asn Cys Lys Asn Ser Gly

65 70 75 80

Gly Lys Ser Trp Arg Ser Lys Thr Thr Gly Gln Cys Thr Asn Leu

85 90 95

<210> 82

<211> 95

<212> БЕЛОК

<213> Enterobacter sp.

<400> 82

Met Lys Thr Leu Val Ile Ala Ile Leu Thr Ala Val Leu Cys Gln Gly

1 5 10 15

Met Ala Met Ala Glu Thr Gln Gln Pro Ala Ser Gly Ala Leu Pro Ala

20 25 30

Asn Glu Lys Pro Pro Leu Val Leu Thr Ala Asp Glu Lys Lys Ala Ser

35 40 45

Glu Ala Asn Ala Asp Arg Asn Glu Cys Trp Ser Ala Arg Asn Cys Ser

50 55 60

Gly Lys Ile Leu Asn Asn Lys Asp Ala His Asn Cys Lys Asn Ser Gly

65 70 75 80

Gly Lys Ser Trp Arg Gly Lys Asn Ser Ser Gln Cys Thr Asn Leu

85 90 95

<210> 83

<211> 105

<212> БЕЛОК

<213> Acidovorax avenae

<400> 83

Met Lys Lys Leu Leu Leu Ile Ala Ser Leu Leu Val Ser Ile Ser Gly

1 5 10 15

Ala Asn Val Phe Ala Gln Ala Pro Ser Ser Gly Asp Ala Pro Ala Ala

20 25 30

Val Ala Gly Lys Gln Asp Gly Ala Ser His Lys Asp Thr Glu Gln Ala

35 40 45

Ala Asn Val Glu Cys Asp Val Asn Ala Thr Val Gln Gln Cys Cys Ser

50 55 60

Ala Ala Lys Cys Gln Gly Lys Val Leu Ser Asn Arg Asp Ala His Asn

65 70 75 80

Cys Lys Asp Lys Ser Lys Gly Lys Ser Trp His Ala Ala Ala Gln Gly

85 90 95

Gly Gln Pro Ala Ala Cys Gln Arg Met

100 105

<210> 84

<211> 94

<212> БЕЛОК

<213> Serratia plymuthica

<400> 84

Met Gln Cys Asn Gly Ala Ile Leu Lys Leu Leu Cys Ala Gln Arg Lys

1 5 10 15

Asp Gln Phe Met Asn Leu Arg Ile Arg Thr His Ala Met Lys Asn Leu

20 25 30

Ser Ile Leu Val Val Leu Ser Ser Cys Leu Leu Leu Pro Leu Thr Ala

35 40 45

Ser Ala Ala Ala Gly Thr Cys Tyr Ser Ala Lys Asn Cys Ser Gly Lys

50 55 60

Val Leu Ser His Arg Asp Ala His Asn Cys Lys Val Lys Asp Lys Gly

65 70 75 80

Lys Ser Trp Arg Ser Asp Ile Thr Asn Gln Cys Thr Asn Leu

85 90

<210> 85

<211> 93

<212> БЕЛОК

<213> Serratia liquefaciens

<400> 85

Met Arg Glu Glu Ala Ile Leu Lys Leu Leu Cys Ala Gln Arg Lys Asp

1 5 10 15

Gln Phe Met Asn Ser Arg Ile Arg Thr His Ala Met Lys Asn Leu Ser

20 25 30

Ile Leu Val Val Leu Ser Ser Cys Leu Leu Leu Pro Leu Thr Ala Ser

35 40 45

Ala Ala Ser Gly Lys Cys Tyr Ser Ala Lys Asn Cys Ser Gly Lys Val

50 55 60

Leu Ser Lys Arg Asp Ala His Asn Cys Lys Val Lys Asp Arg Gly Lys

65 70 75 80

Ser Trp Leu Ser Asp Val Thr Gly Lys Cys Thr Asn Leu

85 90

<210> 86

<211> 78

<212> БЕЛОК

<213> Serratia sp.

<400> 86

Met Lys Leu Lys Tyr Glu Arg Ile Arg Ile Tyr Val Met Lys Ser Leu

1 5 10 15

Ser Ile Val Ile Thr Leu Ala Ser Cys Leu Leu Leu Pro Leu Thr Ala

20 25 30

Ser Ala Ala Ala Gly Thr Cys Tyr Ser Ala Lys Asn Cys Ser Gly Lys

35 40 45

Val Leu Ser His Arg Asp Ala His Asn Cys Lys Val Lys Asp Lys Gly

50 55 60

Lys Ser Trp Arg Ser Asp Ile Thr Gly Gln Cys Thr Asn Leu

65 70 75

<210> 87

<211> 75

<212> БЕЛОК

<213> Serratia sp.

<400> 87

Met Asn Ser Arg Ile Arg Thr Tyr Ala Met Lys Asn Leu Ser Ile Leu

1 5 10 15

Val Val Leu Ser Ser Cys Leu Leu Leu Pro Leu Thr Ala Ser Ala Ala

20 25 30

Ala Gly Thr Cys Tyr Ser Ala Lys Asn Cys Ser Gly Lys Val Leu Ser

35 40 45

His Arg Asp Ala His Asn Cys Lys Val Lys Asp Lys Gly Lys Ser Trp

50 55 60

Arg Ser Asp Ile Thr Gly Lys Cys Thr Asn Leu

65 70 75

<210> 88

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 88

Met Ser Ala Gln Glu Asn Phe Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Thr Pro Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Ser Lys Ala Thr Leu Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Glu Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 89

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 89

Met Ser Ala Gln Glu Asn Phe Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Pro Glu Gln Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Leu Ser Lys Ala Thr Val Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asp Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 90

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas brassicacearum

<400> 90

Met Ser Ala Gln Glu Asn Phe Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Arg Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Thr Pro Glu Lys Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Leu Ser Lys Ala Thr Val Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asp Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 91

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 91

Met Ser Ala Gln Glu Asn Phe Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Arg Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Pro Glu Lys Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Leu Ser Lys Ala Thr Val Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asp Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 92

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 92

Met Ser Ala Gln Glu His Phe Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Lys Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Pro Glu Lys Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Leu Ser Lys Ala Thr Leu Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asp Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 93

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 93

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Glu Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Thr Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 94

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 94

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Glu Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Ala Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Pro

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 95

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 95

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Glu Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Ala Gln Ala Thr Gln Pro Gly Ser Pro

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 96

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 96

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Glu Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Ala Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Pro

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro Tyr Val Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 97

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 97

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Gly Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Lys Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Glu Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Pro Glu Leu Val Ser Ser Gln Ile Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Thr Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Thr Ser Trp Gln Ala Ile Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 98

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 98

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Val Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Ala Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Pro

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro Tyr Val Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 99

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas-sp

<400> 99

Met Thr Ala Gln Glu His Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Ser Tyr Thr Pro Glu Glu Val Ser Ser Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Lys Ser Lys Ala Thr Leu Pro Gly Ser Pro

50 55 60

Asn Gly Trp Gln Ala Ile Val Glu Ile Tyr Ala Pro Thr Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 100

<211> 91

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 100

Met Ser Ala Gln Glu Asn His Val Gly Val Gly Gly Trp Thr Ala Tyr

1 5 10 15

His Glu Leu Thr Pro Lys Asp His Ala Val Phe Lys Glu Ala Leu Glu

20 25 30

Gly Phe Val Gly Val Gln Tyr Thr Pro Glu Thr Val Ser Thr Gln Val

35 40 45

Val Ala Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr His Ser Lys Ala Gln Gln Pro Gly

50 55 60

Ser Pro Ala Ile Trp Ala Ala Ile Val Glu Ile Tyr Ala Pro Leu Lys

65 70 75 80

Gly Lys Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85 90

<210> 101

<211> 92

<212> БЕЛОК

<213> Enterobacter-sp

<400> 101

Met Ser Glu Gln Gln Thr Leu Leu Pro Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His

1 5 10 15

Pro Leu Thr Ala Gln Asp Arg Lys Val Phe Glu Glu Ala Leu Asn Gly

20 25 30

His Leu Gly Val Asp Tyr Glu Pro Gln Lys Val Lys Thr Gln Val Val

35 40 45

Ala Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Leu Cys Glu Ala Ser Val Pro Pro Ser

50 55 60

Thr Ala Val Trp Glu Ala Ile Val Glu Ile Tyr Ala Pro Leu Pro Gly

65 70 75 80

Gln Gly Ala Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85 90

<210> 102

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Shewanella denitrificans

<400> 102

Met Ser Asn Asn Glu Thr Ile Val Gly Gly Trp Thr Ala Tyr Asn Ala

1 5 10 15

Ile Thr Ser Ala Glu Arg Glu Ile Phe Asn Lys Ala Met Glu Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Ser Tyr Met Pro Glu Thr Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Met Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Glu Ala Ser Met Pro Pro Ser Glu

50 55 60

Val Leu Trp Glu Ala Ile Val Glu Ile Tyr Gln Pro Leu Lys Gly Ile

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Asn Ile Thr Lys Ile

85

<210> 103

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas diversa

<400> 103

Met Ser Asp Gln Ala Val Leu Val Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Arg

1 5 10 15

Leu Thr Ala Glu Asp Gln Ala Val Phe Gln Glu Ala Leu Lys Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Glu Tyr Lys Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Met Asn Tyr Arg Tyr Lys Cys Lys Thr Thr Val Pro Leu Pro Thr

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Gln Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Ser Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<210> 104

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas salmonicida

<400> 104

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Val Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Thr Ala Glu Asp Gln Ala Val Phe Asp Gln Ala Leu Lys Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Val Pro Phe Glu Val Cys Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Ser Thr Val Pro Leu Ala Lys

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Gln Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Ser Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<210> 105

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas veronii

<400> 105

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Val Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Thr Ala Glu Asp Gln Ala Val Phe Asp Gln Ala Leu Lys Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Val Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Ser Thr Val Pro Leu Ala Lys

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Lys Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Asp Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<210> 106

<211> 88

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas molluscorum

<400> 106

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Leu Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Ser Ala Lys Asp Gln Ala Val Phe Asn Gln Ala Leu Glu Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Thr Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Ser Thr Val Pro Leu Pro Asn

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Gln Ala Leu Phe Pro

65 70 75 80

Lys Ser Met Gln Leu Glu Trp Asn

85

<210> 107

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas aquariorum

<400> 107

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Leu Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Ser Ala Lys Asp Gln Ala Val Phe Asn Gln Ala Leu Glu Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Thr Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Thr Thr Val Pro Leu Pro Asn

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Gln Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Ser Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<210> 108

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 108

atgagcacac ccttcaaaca attcacctcc cccgccgggc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gctgccgcag tttgaaaccg actggaacaa tgacctcacc 120

ggctggaccc agtccgcgat catcggcaac ccgtggtcgg gcctcaatga cgcgccgcgc 180

tcgggctatt acaacccgct ggtggaaggc tacggcccca ccacgccgcc ggcgattacc 240

tgggcgccct tccccaatcg gctgtggacg ttcttctaca acaacggcac ggcggtgatt 300

ccgcaattgg gcggcaaggc catgtccctg caacaggtga tggagctgac cgacaacggc 360

cagattacga tcaacaacac cctgtacatg ctctacgacc cgaacaagca aggcaccctg 420

ctgcaactgc ccgtcacccg ctgcccgacc atcgactggc aaggcaagta caaggatttc 480

tcgccctcgg ggccccgtgg ctggcttgac gaatactgcg agtggtccat cgtgcgcgat 540

gccgacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa acccggcgta tttcctggcc 600

atgtggcgca ttgatccaaa tgcagtgctg ggcctgtacc gcgactacat cgacccgcag 660

gtgcagctcg aagacctcta cctgcgctac accgccgact gtccgaccgg caaagcgggc 720

gatccggtca tcgaccctac caccggccaa ccggcctacg acacggtcaa caaatggaac 780

gccggcaccg cctgcgtacc cggccaatac ggcggggcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aacaccctga gcgccgaggt gtacctggcc gccgcggcga ccatcctgcg tccactggcc 900

agcagccaga attcccaggc attgatctgc tgcgcgcaat acgggcagaa ctaccgcaac 960

tccgacccgc atatcggttt ctcggccaac agcgtggcgg tgaataaccg gctgtccctg 1020

accaatccca tcggccttta cctgcaacaa cccaccgatt tctcggcgtg gaaaggccct 1080

caaggccagg acgtcagcca gtactggaaa atcacccgtg gcaccgccaa gtccgccgcc 1140

aacggctccg accagatcct gcaagcggtg tttgaagtgc cggtcagcgc cgggttttcg 1200

atcaacgaca tcaccatcag tggccagccg atcgactatg tgtgggtgat tgcccagcag 1260

ttgctggtgg gcctgagtgt gacaaccacg cccatcagcc cgacgccgga ttcctgcccc 1320

tgcgtgaagg atcgggtcaa cggcgtgcaa ccctggccgg tgcaactgct gcccctggat 1380

ctgttctacg ggcagtcgcc taccgacctg ccggcctggc tggcacccgg caccagcgga 1440

cagttcgccc tggtggtgca aggcgccgat ctcaagacca ccgccgagac ggcgcgggtg 1500

caattttcca atcccggcgt gacggcgcag gtcacccagt tcctgccgga tgcctccgcc 1560

atccccgggc aaaccaactc cggcggcacc cagggctact tgctgaccat caccgtaagc 1620

cccactgccg ctccggggct ggtgacggtg cgcgcgctca acccgggcga agccgataac 1680

cccagcgcga cggaacaccc atgggaatcc ggattggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 109

<211> 1608

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 109

atgtccaggt tacgcttaag tgttttatcg ctgctgacca gtgtggtgct gagcctgttc 60

gccatgcagg ccgcctacgc atcccccacg tccgacgccg acgcttgcgt gcagcaacag 120

ttggtgttca atccgaaaag cggcggtttc ctgccgatta acaacttcaa cgccaccggc 180

cagagcttta tgaattgctt tggctggcag ttgttcattg ccctgaactg gccggtgaat 240

cccggttggc cagccacgcc cgccctcgcg ggtgagccgg acatgaacag tacattggcg 300

caattcggtg taccgactgc ctccgggcag ccgatgagcg tggcgcccgt gtgggccagc 360

tacaaggatg ccaacgatat cttcctgccc ggcgcgcccg cgcccaccgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccgtccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcagggcgat atcggtgggg 480

gcgcgcaagt tcatgaccgc cacctccgaa agcgcgatca acgcgcgtca tgggtttcac 540

ctgtccagcg gcaccctcgc ctcgattcca gacccgatca tggaagcctc cggcggctgg 600

ctgacggacc agtcgcagaa cctggtgttt tttgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcagcaaagg gctgtacgac gcagccaacc agctgacagt cgcgcagaac 720

ctcgacaacc agaacccggg cgggctgtct ctgcccatcg gtgaacccat gcgctcgctg 780

ccgcccaacc cggtgccgca ggagcaactg ggagcgctgg aggtcaaggc ggcgtggcgg 840

atccttaccg gcaaacccga gctctacggg cgttacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

aacccggcca ccttgcagtg cacccaacaa gtggtgggcc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aagcctcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

ccggaaccca accaggtgcc gccacaacag acgccgcccg acagctttgc cttcaacaac 1080

ccgaactgcg gcaccggccc cgaatgcacg ccgaacgtgg cgcgtatcca gtgcaaacag 1140

caccatcccg accgcgactg caccgagccg tttccacggg accaacccgt gcagaccacc 1200

cgggaacatc cgctgcccac tgaactgcag gcgcttaacg gcgcggtgca ggccaacttt 1260

gcccagcaga gccagggcaa gtcggtgttc cagtactaca aactgatcaa cgtactctgg 1320

accctcaccc ccaacccgcc cacccagccg gaaccgggtg tcagtgcgca agtgccgctg 1380

tcctacgggc cgtttatcag ccagggcaac gtaccggtgg ccaacaccac cctggagacc 1440

tacgtccagg gcgataactg caatgcctgt catcagtacg cgaccatcgc cggcagctcc 1500

accctggctt cggacttttc gttcctgttc aacagcgccg actcggccag caagaacagc 1560

ctggtcaagc gcgtgaaagc cttccagacc ctcaaggatc aaccgtga 1608

<210> 110

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. Ag1

<400> 110

atgagcacac ccttcaaaca attcacctct cccgccgggc aagctcccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa cgacctcacc 120

ggctggaccc agtccgcgat catcggcaac ccgtggtcgg gcctcaatga cgcgccgcgc 180

tcgggctatt acaacccact ggtggaaggc tacggcccca ccacgccgcc ggcgattacc 240

tgggcgccct tccccaatcg gctgtggacg tttttctaca acaacggcac ggcggtgatt 300

ccacagttgg gcggcaaggc catgtccatg caacaggtga tggagctgac cgacaacggc 360

cagattacga tcaacaacac cctgtacatg ctctacgacc cgaacaagca aggcaccctg 420

ctgcaactcc ccgtcactcg ctgcccgagc atcgactggc aaggcaagta caaggatttc 480

tcgccttcgg gcccccgtgg ctggcttgac gaatattgcg agtggtccat agtgcgcgat 540

gccgacggca acatgcgcaa gatcaccttc acttgcgaaa acccggcgta tttcctggcc 600

atgtggcgca tcgatccgac tgctgtactg gggctgtatc gcgactacat cgacccgcag 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgccgact gcccgaccgg taaggccggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggtcaa ccggcctacg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggcaccg cctgtgtgcc aggccaatac ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aacaccctga gcgccgaggt gtacctggct gccgcggcga ccatcctgcg gccattgagc 900

agcagccaga attcccaggc gttgatctgc tgcgcgcaat acgggcagaa ctaccgcaac 960

tccgatccgc atatcggttt ctcggccaac agcgtggcag tgaataaccg gctgtcgctg 1020

acgaacccca tcggcctgta cctgcaacaa cccaccgact tctcggcgtg gaaaggcccc 1080

cagggccagg acgtcagcca gtactggaaa atcacccgtg gcaccgccaa gtccgccgcc 1140

aacggctccg accagattct gcaagcggtg tttgaagtgc cggtcagcgc cgggttttcg 1200

atcaacgaga tcaccatcag cggccagccg atcgactacg tgtgggtgat tgcccagcag 1260

ttgctggtgg gcctgagtgt gacaaccacg cccatcagcc cgacgccgga ttcctgcccg 1320

tgcgtgacgg accgggtcaa cggcgtgcaa ccctggccgg tacagctgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggcagtcacc caccgacctg ccggcctggc tggcacccgg caccagcggg 1440

cagtttgccc tggtggtgca aggcgccgac ctcaagacca ccgccgagac ggcgcgggtg 1500

caattctcca atcctggggt gacggcgcag gtcacaaagt tcctgccgga tgcctcggcc 1560

atccccgggc aaaccaactc cggtggcacc cagggctacc tgctgaccat caccgtaagc 1620

cccactgccg caccggggct ggtgacagtg cgcgccctca acccgggcga agccgataac 1680

cccagcgcgg cggaacaccc atgggaatcc ggattggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 111

<211> 1611

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. Ag1

<400> 111

atgtccaggt tacgcttgag tgttttatcg ctgctgacca gtgtggtgct gagcctgttc 60

gccatgcagg ccgcctacgc atcccccact tccgacgccg acgcttgcgt gcagcaacag 120

ttggtgttca acccgaaaag cggcggcttc ctgccgatca acaacttcaa cgccaccggc 180

cagagcttca tgaattgctt tggctggcag ttgttcattg ccctgaactg gccggtgaat 240

cccggttggc cagccacacc tgccctcgcg ggtgagccgg acatgaacag taccctggcg 300

caattcggcg taccgactgc ctccgggcag ccgatgagcg tggcgccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgatat cttcctgccc ggcgcgcccg cgcccaccgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccgtccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcagggcgat gtcggtgggg 480

gcgcgcaagt tcatgaccgc cacctccgaa agcgcgatca acgcgcggca tgggtttcac 540

ctgtccagcg gcaccctggc ctcgattccg gacccgatca tggaagcctc cggcggctgg 600

ctgacggacc agtcgcagaa cctggtgttt tttgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcagcaaagg gctgtacgac gcggccaacc agctgaaagt cgcgcagaac 720

ctcgacaacc agaaccccgg cgggctgtcc ttgcccatcg gtgaacccat gcgctcgctg 780

ccgcccaacc cggtgccgca ggagcaactg ggagctctgg aggtcaaggc agcatggcga 840

atcctcaccg gcaaacccga gctctacggg cgttacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

aacccggcca ccttgcagtg cacccagcaa gtggtgggcc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcctcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt agacaacgtg 1020

ccggaacccg accaggtgcc gccacaacaa acgccgcccg acagctttgc cttcaataac 1080

ccgaactgcg gcaccggccc cgaatgcacg ccgaacgtgg cgcgtatcca gtgcaagcag 1140

cagcatccgg accgcgactg caccgagccg tttccacggg accaacccgt gcagaccacc 1200

cgggaacatc cgctgcccac tgaactgcag gcgcttaacg gcgcggtgca ggccaatttt 1260

gcccagcaga gccagggcaa gtcggtgttc cagtactaca aactgatcaa cgtactctgg 1320

accctcaccc ccaacccgcc cacccagccg gaaccgggtg tcagtgcgca agtgccgctg 1380

tcctacgggc cgtttatcag ccagggcaac gtaccggtgg ccaacaccac cctggagacc 1440

tacgtccagg gcgataactg caatgcctgt catcagtacg cgaccatcgc cggcagctcg 1500

accctggcct cggacttttc gttcctgttc aacagtgccg attcggccag caagaaaagc 1560

ctggtcaagc gcgtaaaagc cttccagacc ctcaaggacg gttcaccctg a 1611

<210> 112

<211> 1740

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 112

atgagcacac ccttcaatca attcacctcg cccgccgggc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa cgacctcacc 120

ggctggaccc agtccgcgat catcggcaac ccgtggtcgg gcctcaatga cgcgccgcgc 180

tcgggctatt acaacccgct ggtggaaggc tacggcccca ccacgccacc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctgtggacg ttcttctaca acaatggcac cgcggtgatt 300

ccgcaattgg gcggcaaggc catgacgttg cagcaggtga tggagctgac cgacaacggc 360

cagataaccc tcaacaacac cttgtacacg ctctacgatc cgaacaagca aggcaccctg 420

ctgcaactgc ccgtgacccg ctgcccgagc atcgactggc aaggcaagta caaggatttc 480

tcgccctcgg ggccccgtgg ctggctggac gaatattgcg agtggtcgat cgtgcgcgac 540

cccggtaccc agaacatgcg caagatcacc tttacctgcg aaaacccggc gtatttcctc 600

gccatgtggc gcatcgaccc gaacgcggtg ctgggcctgt atcgcgacta catcgacccg 660

caggtgcaac tcgaggacct gtacttgcga tacaccgccg actgcccgac cggcaacaaa 720

ggcgatccgg tcatggaccc caccaccggc caaccggcct atgacacggt caacaaatgg 780

aacgccggca ccgcctgcgt gcccggccaa tatggcgggg caatgcacct gacctccggc 840

cccaataccc tgagcgccga ggtgtacctg gcggccgcag caaccatcct gcgtccactg 900

gccagcagcc agaattccca ggcgttgatc tgctgcgcgc aatacgggca gaactaccgc 960

aactccgacc cgcatatcgg cttttcggcc aacagcgtgg cggtgaataa ccggctgtcc 1020

ctgaccaacc ccatcggcct gtacctgcaa caacccaccg acttctcggc gtggaaaggt 1080

cctcagggcc aggacgtcag ccagtactgg aaaatcaccc ggggcaccgc aaaatctgcg 1140

gccaacggct ccgaccagat cctgcaggcg gtgttcgaag tgccggtcag cgccgggttc 1200

tcgatcaacg acatcaccat cagcggccag tccatcgact acgtgtgggt gattgcccag 1260

caactgctgg tggggctgag cgtgaccacc acgcccatca gcccgacacc ggaatcctgc 1320

ccgtgcgtga ccgatcgggt caccggtgtg caaccctggc cggtacaact gctgccgctg 1380

gatctgttct acgggcagtc gcccaccgac ctgcccgcgt ggctggcacc cggtaccagc 1440

gggcagtttg ccctggtggt gcaaggcgcc gacctcaaga ccaccgccga gacggcgcgg 1500

gtgcagtttt ccaatcccgg cgtcacggcg gtggtcacga agttcctgcc cgacgcctcg 1560

gccatccccg ggcaaaccaa ctccggcggc acccagggct acctgctgac catcaccgtg 1620

agccccaccg ccgcaccggg gctggtgacg gtgcgcgcgc tcaacccggg cgaagccgat 1680

aaccccagcg cggcgcagca cccatgggaa tccgggttgg cgctggtgcc tggcgcctga 1740

<210> 113

<211> 1608

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 113

atgtccaggt tacgcttgag tgttttatcg ctgctgacca gtgtggtgct gagcctgttt 60

gcggtgcagt cggcctatgc gacgccacaa tccgatgccg acgcctgcgt ccagcaacag 120

ttggtgttca acccggccag cggtggattc ctgccggtca ataacttcaa cgccaccggc 180

cagagcttta tgaactgctt cggctggcag ttgttcattg ccctgaactg gccggtgaat 240

cccggttggc cagccacgcc cgccctggcg ggtgagccgg acatgcacag cagcctcgcc 300

cagttcggcg tgccgcccgc ctccgggcag ccgatgaccg tggcgccggt gtgggccagt 360

tacaaggacg ccaacgatat cttcctgccc ggcgcccccg tgcccaccgg atggggcgtg 420

caaaccctgg taccgtccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcaaggcgat ggcggtgggg 480

gcgcgcaagt tcatgaccgc cacctcggaa agcgcgatca acgcgcggca cgggtttcac 540

ctgtccagcg gcaccctggc ctcgattccg gacccgatca tggaagcctc cggcggctgg 600

ctgacggacc agtcgaagaa cctggtgttt tttgaacgca aggtcggcaa ggccgagttt 660

gactacatcg tcagcaaagg gctgtacgac gccgccaacc agctgacagt ggcgcagaac 720

ctcgacaacc agaacccggg cgggctgtcc ctgcccatcg gtgaacccat gcgctcgctg 780

ccgccagacc cggtgccgca ggagcaactc ggggccctgg aggtcaaggc cgcgtggcgg 840

atcctcaccg gtaaacccga gctctacggg cgctacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

aacccggcca cgttgcagtg cacccagcaa gtggtgggcc tggtgggcct gcacatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

ccggaacccg accaggtgcc gccacagcag acaccgcccg acagctttgc cttcaacaac 1080

ccgaactgtg gcaccggccc cgaatgcacg ccgaacgtgg cgcgtatcca gtgcaaacag 1140

catcatcccg accgcgactg caccgagccg tatccacgtg accaaccggt gcaaaccacc 1200

cgggaacatc cgctgcccac tgagctgcag gccctgaacg gcgcggtgca ggccaacttc 1260

gctcagcaga gccagggcaa gtcggtgttc cagtactaca aactgatcaa cgtgctctgg 1320

accctcacgc ccaacccgcc cacccagccg gagccgggcg tcagcgcgca ggtgccgctg 1380

tcctacgggc cgtttatcag ccagggcaat gtgcccgtgg ccaacaccac cctggagacc 1440

tacgtccagg gcgacaactg caacgcctgt caccagtacg cgaccatcgc cggcagctcg 1500

accctggcct cggacttttc gttcctgttc aacagcgccg actcggccag caagaaaagc 1560

ctggtcaagc gggtgaaggc gttcgagacc ctcaaggacc agccctga 1608

<210> 114

<211> 1740

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 114

atgagcacac ccttcaaaca gttcacctcg cccgccgggc aagcgcccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa cgacctcacc 120

ggctggaccc agtccgcgat catcggcaac ccgtggtcgg gcctcaatga cgcgccgcgt 180

tcgggctatt acaacccgct ggtggagggc tacggcccca ccacgccacc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctgtggacg tttttctaca acaacggcac cgcggtgatt 300

ccgcagctgg gcggcaaggc catgacgttg cagcaggtga tggagctgac cgacaacggc 360

cagatcaccc tcaacaacac cctgtacacg ctctacgatc caaacaagca aggcaccctg 420

ctgcaactgc ccgtgacccg ctgcccgagc attgactggc aaggcaagta caaggatttc 480

tcgccctcgg gcccgcgcgg ctggctggac gaatactgcg agtggtcgat cgtgcgcgac 540

cccggtaccc agaacatgcg caagatcacc tttacctgcg aaaacccggc gtatttcctc 600

gccatgtggc gcatcgaccc gaacgcggta ctgggcctgt atcgcgacta catcgacccg 660

caggtgcaac tcgaggacct gtacttgcgc tacaccgccg actgcccgac cggcaacaag 720

ggcgacccgg tgatggaccc caccaccggc cagccagcct atgacacggt gaacaaatgg 780

aacgccggca ccgcctgcgt gcccggccaa tatggcggcg cgatgcacct gacctccggc 840

cccaacaccc tgagcgccga ggtgtacctg gcggccgcgg ccaccatcct gcggccgctg 900

agcagcagcc agaactccca ggcgctgatc tgctgcgcac aatacgggca gaactatcgc 960

aactccgacc cgcatatcgg tttttcggcc aacagcgtgg cggtgaataa ccggctgtcc 1020

ctgaccaacc ccatcggcct gtacctgcag caacccaccg acttctcggc gtggaaaggt 1080

ccacaaggcc aggacgtcag ccagtactgg aaaattaccc ggggcgccgc aaagtccgcc 1140

gccaacggct ccgaccagat cctgcaggcg gtgttcgagg tgccggtcag cgccgggttc 1200

tcgatcaacg acatcaccat cagcggccag tccatcgact acgtgtgggt gattgcccag 1260

caattgctgg tggggctgag cgtgaccacc acgcccatca gcccgacacc ggattcttgc 1320

ccgtgcgtga cggatcgggt caacggtgtg caaccctggc cggtacaact gctgccgctg 1380

gatctgttct acgggcagtc gcccaccgac ctgcccgcgt ggctggctcc cggtaccagc 1440

gggcagtttg ccctggtggt gcaaggcgcc gacctcaaga ccaccgccga gacggcgcgg 1500

gtgcagtttt ccaatcccgg cgtcacggcg gtggtcacga aattcctgcc cgacgcctcg 1560

gccatccccg ggcagaccaa ctccggcggc acccagggct acctgctgac catcactgtg 1620

agccccaccg ccgcaccggg gctggtgacg gtgcgcgcgc tcaacccggg cgaagccgat 1680

aaccccagcg cggcggagca cccatgggaa tccgggttgg cgctggtgcc tggcgcctga 1740

<210> 115

<211> 1608

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 25886

<400> 115

atgtccaggt tacgcttgag tgttttatcg ctgctggcca gtgtggtgct gagcctgttt 60

gcgctgcagt cggcctatgc aacaccccaa tccgatgccg acgcctgcgt gcagcaacag 120

ctggtgttca atccgaaaag cggcggcttc ctgccggtca acaacttcaa cgccaccggc 180

cagagcttca tgaactgctt tggctggcag ctgttcattg ccctgaactg gccggtgaac 240

cccggctggc cgaccaccgc cgccctggcg ggcgaaccgg acatgaacag cagcctggcg 300

cagttcggcg tgccgaccac cgccgggcaa ccgatgacgg tggcgccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgatat cttcctgccg ggtgcgcctg tgccctcggg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccgtccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcaaggcgat gtcggtgggg 480

gcgcgcaagt tcatgactgc cacctcggaa agcgcgatca acgcccgcca cggtttccac 540

ttgtccagcg gcaccctggc gacgattccc gacccgatca tggaagcctc cggcggctgg 600

ctgacggatc aggcgggcca gctggtgttt tttgaacgca aagtcggcaa ggccgagttt 660

gattacatcg tcagcaaagg gctgtacgac gccgccaatc agttgaaggt ggcgcaaaac 720

ctcgacaacc agaacccggg cgggctgtcc ttgcccattg gcgaaccgat gcgctccctg 780

ccgccgaccc cggtgccaca ggaacaactc ggggcgctgg agctcaaggc cgcgtggcgc 840

attctcaccg gcaagcccga actctacgga cgctacctga ccaccgtcgc ctggctgaaa 900

aacccggcca ccttgcagtg cacccagcaa gtggtgggcc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aagcctcgcc gaacttcatc tggaccacct tcgaacaggt ggacaacgtc 1020

ccggaaccca accagctgcc gccacagcag acgccgcccg acagctttgc cttcaacaac 1080

cccaactgcg gcaccggccc ggaatgcacg ccgaacgtgg cacgcatcca gtgccaacag 1140

caccatcccg atcgcgattg caccgagccg tacccacggg accaaccggt gcaaaccacc 1200

cgggaacatc cgctgcccac ggagctgcag gccctgaacg gcgcggtgca ggccaacttc 1260

gcccagcaga gccagggtaa atcggtgttc cagtactaca aactgatcaa cgtactctgg 1320

accctcaccc ccaacccgcc cgtccagccg gagccggggg tcagtgcggc ggtgccgctg 1380

tcctacgggc cgtttatcag ccagggcaat gtgccggtgg ccaacacgac cctggaaacc 1440

tatgtgcagg gcgataactg caacgcctgt caccagtacg cgaccatcgc cggcagctcg 1500

accctggcct cggacttttc attcctgttc aacagcgccg actcggccag caagaaaagc 1560

ctggtcaagc gggtgaaggc gtttgaaacc ctcaaggacc aaccctga 1608

<210> 116

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 116

atgagcacac ccttcaaaca attcacctct cccgccgggc aagctcccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa cgacctcacc 120

ggctggaccc agtctgcgat catcggcaac ccgtggtcgg gcctcaatga cgcgccgcgc 180

tcgggctatt acaacccact ggtggaaggc tacggcccca ccacgccgcc ggcgattacc 240

tgggcgccct tccccaatcg gctgtggacg tttttctaca acaacggcac ggcggtgatt 300

ccgcagttgg gcggcaaggc catgtccatg caacaggtga tggagctgac cgacaacggc 360

cagattacga tcaacaacac cctgtacatg ctctacgacc cgaagaagca aggcaccctg 420

ctgcaactcc ccgtcactcg ctgcccgagc atcgactggc aaggcaagta caaggatttc 480

tcgccctctg gcccccgtgg ctggcttgac gaatattgcg agtggtccat cgtgcgcgat 540

gccgacggca acatgcgcaa gatcaccttc acttgcgaaa acccggcgta tttcctggcc 600

atgtggcgca tcgatccgac tgctgtactg gggctgtatc gcgactacat cgacccacag 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgccgact gcccgaccgg taaggccggc 720

gatccggtca tcgaccccac caccggtcaa ccggcctacg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggcaccg cctgtgtgcc tggccagtac ggcggtgcga tgcatctgac ctccggcccc 840

aacaccctga gcgccgaggt gtacctggct gccgcggcga ccatcctgcg gccattgagc 900

agcagccaga attcccaggc gttgatctgc tgtgcgcaat acgggcagaa ctaccgcaac 960

tccgatccgc atatcggttt ctcggccaac agcgtggcag tgaacaaccg gctgtcgctg 1020

accaacccca tcggcctgta cctgcaacaa cccaccgact tctcggcgtg gaaaggcccc 1080

cagggccagg acgtcagcca gtactggaaa atcacccgtg gcaccgccaa gtccgccgcc 1140

aacggctccg accagattct gcaagcggtg tttgaagtgc cggtcagcgc cgggttctcg 1200

atcaacgaca tcaccatcag cggccagccg atcgactacg tgtgggtgat tgcccagcag 1260

ttgctggtgg gcctgagtgt gacaaccacg cccatcagcc cgacgccgga ttcctgcccg 1320

tgcgtgacgg accgggtcaa cggtgtgcaa ccctggccgg tacagctgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggcagtcacc caccgacctg ccggcctggc tggcacccgg caccagcggg 1440

cagtttgccc tggtggtgca aggcgccgac ctcaagacca ccgccgagac ggcgcgggtg 1500

caattctcca atcctggggt gacggcgcag gtcacaaagt tcctgccgga tgcctcggcc 1560

atccccgggc aaaccaactc cggtggcacc cagggctacc tgctgaccat caccgtaagc 1620

cccactgccg caccggggct ggtgacagtg cgcgccctca acccgggcga agccgataac 1680

cccagcgcgg cggaacaccc atgggaatcc ggattggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 117

<211> 1611

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 117

atgtccaggt tacgcttgag tgttttatcg ctgctgacca gtgtggtgct gagcctgttc 60

gccatgcagg ccgcctacgc atcccccact tccgacgccg acgcttgcgt gcagcaacag 120

ttggtgttca acccgaaaag cggcggcttc ctgccgatca acaacttcaa cgccaccggc 180

cagagcttca tgaattgctt tggctggcag ttgttcattg ccctgaactg gccggtgaat 240

cccggttggc cagccacgcc tgccctcgcg ggtgagccgg acatgaacag taccctggcg 300

caattcggcg taccgactgc ctccgggcag ccgatgagcg tggcgccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgatat cttcctgccc ggcgcgcccg tgcccaccgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccgtccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcagggcgat gtcggtgggg 480

gcgcgcaagt tcatgaccgc cacctccgaa agcgcgatca acgcgcggca tgggtttcac 540

ctgtccagcg gcaccctggc ctcgattccg gacccgatca tggaagcctc cggcggctgg 600

ctgacggacc agtcgcagaa cctggtgttt tttgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcagcaaagg gctgtacgac gcggccaacc agctgaaagt cgcgcagaac 720

ctcgacaacc agaaccccgg cgggctgtcc ttgcccatcg gtgaacccat gcgctcgctg 780

ccgcccaacc cggtgccgca ggagcaactg ggagctctgg aggtcaaggc agcatggcga 840

atcctcaccg gtaaacccga gctctacgga cgttacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

aacccggcca ccttgcagtg cacccagcag gtggtgggcc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcctcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaagt ggacaacgtg 1020

ccggaaccca accaggtgcc gccacaacaa acgccgcccg acagctttgc cttcaacaac 1080

ccgaactgcg gcaccggccc cgaatgcacg ccgaacgtgg cgcgtatcca gtgcaagcag 1140

cagcatccgg accgcgactg caccgagccg tttccacggg accaacccgt gcagaccacc 1200

cgggaacatc cgctgcccac tgaactgcag gcgcttaacg gcgcggtgca ggccaatttt 1260

gcccagcaga gccagggcaa gtcggtgttc cagtactaca aactgatcaa cgtactctgg 1320

accctcaccc ccaacccgcc cacccagccg gaaccgggtg tcagtgcgca agtgccgctg 1380

tcctacgggc catttatcag ccagggcaac gtaccggtgg ccaacaccac cctggagacc 1440

tacgtccagg gcgacaactg caatgcctgt catcagtacg cgaccatcgc cggcagctcg 1500

accctggcct cggacttttc gttcctgttc aacagtgccg attcggccag caagaaaagc 1560

ctggtcaagc gcgtaaaagc cttccagacc ctcaaggacg gttcaccctg a 1611

<210> 118

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 26793

<400> 118

atgagcacac ccttcaaaca attcacctct cccgccgggc aagcacccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gctgccgcag tttgaaaccg actggaacaa cgacctcacc 120

ggctggaccc agtccgcaat catcggcaac ccgtggtcgg gcctcaatga cgcaccgcgc 180

tcgggctatt acaacccgct ggtggaaggc tacggcccca gcacgccgcc ggcgattacc 240

tgggcgccct tccccaatcg gctgtggacg ttcttctaca acaacggcac ggcggtgatt 300

ccgcaattgg gcggcaaggc catgtccatg caacaggtga tggaactgac cgacaacggc 360

cagattacga tcaacaacac cctgtacatg ctctacgacc cgaacaagca aggcaccctg 420

ctgcaactgc ccgtcacccg ctgcccgacc atcgactggc aaggcaagta caaggatttc 480

tcgccctcgg ggccccgtgg ctggcttgac gaatactgcg agtggtccat cgtgcgtgac 540

gccaatggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa acccggcgta tttcctggcc 600

atgtggcgca ttgatccaaa tgcagtgctg ggcctgtacc gcgactacat cgacccgcag 660

gtgcaactcg aagacctgta cttgcgctac accgccgact gcccgaccgg caaagccggc 720

gatccggtca tcgaccctac caccggccaa ccggcctacg acacggtcaa caaatggaac 780

gccggcaccg cctgcgtacc cggccaatac ggcggggcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aacaccttga gcgccgaggt gtacctggcc gccgcagcga ccatcctgcg tccactggcc 900

agcagccaga attcccaggc attgatctgc tgcgcgcaat acgggcagaa ctaccgcaac 960

tctgacccgc atatcggttt ctcggccaac agcgtggcgg tgaataaccg gctgtccctg 1020

accaacccca tcggccttta cctgcaacaa cccaccgatt tctcggcgtg gaaaggccct 1080

caaggccagg acgtcagcca gtactggaaa atcacccgtg gcaccgccaa gtccgccgcc 1140

aacggctccg accagattct gcaagcggtg tttgaagtgc cggtcagcgc cgggttttcg 1200

atcaacgaca tcaccatcag tggccagccg atcaactatg tgtgggtgat tgcccagcag 1260

ttgctggtgg gcctgagtgt gacaaccacg cccatcagcc cgacgccgga ttcctgcccc 1320

tgcgtgacgg atcgggtcaa cggcgtgcaa ccctggccgg tgcaactgct gcccctggat 1380

ctgttctacg ggcagtcgcc taccgacctg ccggcgtggc tggcacccgg caccagcggg 1440

cagttcgctc tggtggtgca aggcgccgac ctcaagacca ccgccgagac ggcgcgggtg 1500

cagttttcca atcctagcgt gacggcgcag gtcacccagt tcctgccgga tgcctccgcc 1560

atcccagggc aaaccaactc cggtggcacc cagggctacc tgctgaccat caccgtaagc 1620

cccactgccg ctccgggact ggtgacggtg cgcgcgctca acccgggcga agccgataac 1680

cccagcgcga cggaacatcc atgggagtcc ggattggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 119

<211> 1608

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PAMC 26793

<400> 119

atgtccaggt tacgcttaag tgttttatcg ctgctgacca gtgtggtgct gagcctgttc 60

gccatgcagg ccgcctacgc atcccccact tccgacgccg acgcttgcgt gcagcaacag 120

ttggtgttca acccgaaaag cggcgggttc ctgccgatca acaacttcaa cgccaccggc 180

cagagcttta tgaattgctt tggctggcag ttgttcattg ccctgaactg gccggtgaat 240

cccggttggc cagccacgcc cgccctcgcg ggtgagccgg acatgaacag taccctggcg 300

caattcggtg tgccgcccgc ctccgggcag ccaatgagcg tcgcgccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgatat cttcctgccc ggcgcccccg cgcccaccgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccgtccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcagggcgat gtcggtgggg 480

gcgcgcaagt tcatgaccgc cacctccgaa agcgcgatca acgcccgcca tggttttcac 540

ctgtccagcg gcaccttggc ctcgattcca gacccgatca tggaagcctc cggcggctgg 600

ctgacggacc agtcgcagaa cctggtgttt tttgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcagcaaagg gctgtacgac gcagccaacc agctgaaagt cgcgcagaac 720

atcgacaacc agaacccggg cgggctgtcc ttgcccatcg gtgagcccat gcgctcgctg 780

ccgcccaacc cggtgccgca ggagcaactg ggagccctgg aggtcaaggc ggcgtggcgg 840

atcctcaccg gcaaacccga gctctacggg cgttacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

aacccggcca ccttgcagtg cacccagcaa gtggtgggcc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aagcctcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

ccggaaccca accaggtgcc gccacaacag acgccgcccg acagctttgc cttcaacaac 1080

ccgaactgcg gcaccggccc cgaatgcacg ccgaacgtgg cgcgtatcca gtgcaaacag 1140

caccatcccg accgcgactg caccgagccg tttccacggg accaacccgt gcagaccacc 1200

cgggaacatc cgctgcccac tgaactgcag gcgcttaacg gcgcggtgca ggccaacttc 1260

gcccagcaga gccagggcaa gtcggtgttc caatactaca aattgatcaa cgtactctgg 1320

accctcaccc ccaacccgcc cacccagccg gaaccgggtg tcagtgcgca agtgccactg 1380

tcctacgggc cgtttatcag ccagggcaac gtaccggtgg ccaacaccac cctggagacc 1440

tacgtccagg gcgataactg caatgcctgt catcagtacg caaccatcgc cggcagctcc 1500

accctggctt cggacttttc gttcctcttc aacagcgccg actcggccag caagaaaagc 1560

ctggtcaagc gcgtgaaagc cttccagacc ctcaaggatc aaccgtga 1608

<210> 120

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 120

atgagcacgc ccttcaagca gttcacctct cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtcgat catcggcaac ccctggtcgg gcctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggt ttcggcgacg tgaccgcccc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacg ttcttctaca acaacggtgc ggcggtcatt 300

ccccagctgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggaattgac cgaccacggc 360

cagatcaccc tcgacaacac cctctacatg ctctacgacc ccaacaagca aggtaccgtg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgactgga acggcaaata cacggcgttc 480

tcgccttccg gcccgcgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtacgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa accccgcgta cttcctgacc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgcagtactg gggctgtacc gcgactacat cgacccgaac 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgtcgact gcccgaccgg caaggccggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaacgg cctgtgtacc cggccagtac ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccattctgcg cccggtgagc 900

agcagccaga acgcccagtc gttgatctgc tgcgcgcagt acgggcaaaa ctatcgcaac 960

tctgatccgc acatcggttt catggccaat accacggcag tgaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cttgcagcag cccaccgatt tcagcgcctg gaagggcccg 1080

caaggccagg acgtgagcca gtattggcgc atcacgcgcg gtacggccaa gtcggctgcc 1140

aatggttccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc cggcttctcg 1200

atcaatgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctggtcg gcctgagtgt caccgtcaag ccgctcagcg ccacgcttca agcattccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggcctgcaa ccctggccag tgcaactgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggcaatcccc aaccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg tagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggggccgac ccgactacca cggcgcagaa tgcaagggtg 1500

caattctcca accccggggt gacggcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcgtcggcc 1560

attcccggcc agaccaactc gggcggcacc caggcctaca ttctgaccat cacggtcagc 1620

ccctccgcag cacccggcct ggtgacagtg cgtgccctca acccgggtga agatgtgaac 1680

gtgagcgcga cagaccaccc ttgggaatct ggcctggcgc tggtgccggg ggcctga 1737

<210> 121

<211> 1608

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 121

atgatgtcca ggtcacgctt gagtcctctg tcgctgctgt gcggcattct actgtgcctg 60

tcgaccctgc aacccgccac ggcggccacg ctgtcggacg ccgatacctg tgtacagcag 120

caattggtgt tcaacccggc cagcggggga ttcctgccgg tcaacaactt caatgccacc 180

agccaggcgt tcatgaactg ctttggctgg caattgttca ttgccttgaa ctggccggtg 240

aaccccggtt ggccggccac cgccagcctg gcgggtgaac ccgacatgca aagcacgctg 300

gcgcagttcg gggtcccctc cgcaccgggt cagcccatga gcgtggcccc ggtatgggcc 360

agctacaagg acgccaacga catcttcctg cccggcgcac ccacgcccac cggctggggt 420

gtgcaaaccc tggtgccgtc cggctgcagc acccagggta gcctcaaggc gctcaaggtg 480

ggcgcacgca agttcatgaa cgccacctcc gaaggcgcga tcaatgcctt gcacggtttc 540

cacctgtcga ccgggacact tgcgtccatt cccgacccgg tcatggaggc gtccggcggc 600

tggctgacgg accaggcggg caaactggta ttttttgagc gcaaggtggg caaggccgag 660

ttcgactaca tcgtcgacaa ggggctctac gacgccgcca accagttgaa ggtcgcgcaa 720

aacctcgacg gccagacacc ggagggcctg tcgttgccca tcggcgaacc gatgcgctca 780

ctgccaacct ccccagtgcc acaggaacaa ctgggcgcga tcgagctcaa ggccgcctgg 840

cgggtgctga ccggcaaacc cgagctgttc ggccgctacc tgactaccgt cgcctggctc 900

aaacgccccg acacgctgga gtgcacccag gaggtggtgg ggctggtggg cctgcatatc 960

atcaacaaga cccaggcttc gcccaacttc atctggacca ccttcgagca ggtggacaac 1020

gtgcccgaac cggcccaggt cccgccgcaa caaaccccgc cgaacgggtt cgccttcaac 1080

aaccctgact gtggcgacgg ccccgagtgc acaccgaacc aagcccgtat ccagtgcaag 1140

caaacgcatc ccgacaagga ctgcaccgat ctcttcccac gcgaccagcc ggtacagacc 1200

acccgcgaac accccgtgcc cggcgacctg caagccctca acagcgcggt acaagccaac 1260

ttcgcgcagc acagccaagg caagtcggtg ttccagtact acaagctgat caacgtactc 1320

tggaccctcg ctcccaatcc gcccagcccg gaaccgggcg ccaacgcgca agtgccgctg 1380

tcgtacgggc ccttcatcag ccagggcaac gtgccggtgg ccaacaccac catggagacc 1440

tacgtgcagg gtgatgactg caatcagtgc catcagtacg cgacgattgc cggcagcccg 1500

tcattggcct cggatttctc tttcctgttc aacagtgccg gttccgccag caacaaaagc 1560

ctgatcaaaa gcgtcaaagc cttcgaaacc ctcaaggacc gtccctga 1608

<210> 122

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Грибной сад комбинированный

<400> 122

atgagcacgc ccttcaagca gttcacctct cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtcgat catcggcaac ccctggtcag gcctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggt ttcggcgacg tgaccgcccc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacg ttcttctaca acaacggtgc ggcggtcatt 300

ccccagctag gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtaa tggcgttgac cgaccacggc 360

cagatcaccc tcgacaacac cctctacatg ctctacgacc ccaacaagca aggtactgtg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgactgga acggcaagta cacggcgttc 480

tcgccttccg ggcctcgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtacgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa accccgcgta cttcctgacc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgcagtactg ggcctgtacc gcgactacat cgacccgaac 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgtcgact gcccgaccgg caaagccggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaacgg cctgtgtgcc cggccagtac ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccatcctgcg cccggtgagc 900

agcagccaga acgcccagtc gttgatctgc tgcgcgcagt acgggcaaaa ctatcgcaac 960

tctgatccgc acatcggttt catggccaat accacggcag tgaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cttgcaacag cccaccgatt tcagcgcctg gaagggcccg 1080

caaggccagg acgtgagcca gtactggcgc atcacgcgcg gtacggccaa gtcggctgcc 1140

aacggttccg accagatcct ccaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc tggtttctcg 1200

atcaatgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctagtcg gcctgagcgt caccgtcaag ccgctcagca ccacgcctca agcgttccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggccggcaa ccctggccag tgcaactgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggcaatcccc caccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg tagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggtgccgac ccgactacca cggcgcagaa tgcaagggtg 1500

caattctcca accctggggt gacggcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcatcggcc 1560

attcctggcc agaccaactc gggcggcacc caggcctaca ttctgaccat cacggtcagc 1620

ccctccgcag cacccggctt ggtggcagtg cgtgccctca atccgggtga agacgttaac 1680

gtgagcgcga cagaccaccc ttgggagtct ggcctggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 123

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Грибной сад комбинированный

<400> 123

atgtccaggt cacgcttgag tcttctgtcg ctgctgtgcg gcattctact gtgcctgtcg 60

accccgcaac ccgccacggc ggccacgctg tcggacgccg atacctgtgt acagcagcaa 120

ttggtgttca acccggccag cgggggattc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccagc 180

caggcgttca tgaactgctt tggctggcaa ttgttcattg ccttgaactg gccggtgaac 240

cccggttggc cagccaccgc cagcctggcg ggtgaacccg acatgcaaag cacgctggcg 300

cagttcgggg tcccctccgc accgggtcag cccatgagcg tggccccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgacat cttcctgccc ggcgcaccca cgcctaccgg ttggggcgtg 420

caaaccctgg tgccgtccgg ctgcagcacc cagggtaacc tcaaggcgct caaggtgggc 480

gcacgcaagt tcatgaacgc cacctccgaa ggcgcgatca atgccttgca cggtttccac 540

ctgtcgaccg ggacacttgc gtccattccc gacccggtca tggaggcgtc cggcggctgg 600

ctgacggacc aggcgggcaa gctggtgttt ttcgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcgacaaggg gctctacgac gcagccaacc agttgaaggt cgcgcaaaac 720

ctcgacggcc agacaccgga gggcctgtcg ctgcccatcg gcgaaccgat gcgctcactg 780

ccgacctccc cagtgccaca ggagcaactt ggcgcgatcg agctcaaggc cgcctggcgg 840

gtgctgaccg gcaaacccga gctgttcggg cgctacctga ctaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgccccgaca cgctggagtg tacccaggag gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

cccgaaccgg cccaggtccc gccgcaacaa accccgccga acgggttcgc cttcaacaac 1080

cctgactgtg gcgacggccc cgagtgcaca ccgaaccaag cccgtatcca gtgcaagcaa 1140

acgcatcccg acaaggactg caccgatctc ttcccacgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgcgaacacc ccgtgcccgg cgacctgcaa gccctcaaca gcgcggtaca agccaacttc 1260

gcgcagcaca gccaaggcaa gtcggtgttc cagtactaca agctgatcaa cgtactctgg 1320

accctcgccc ccaatccgcc cagcccggaa ccgggcgcca acgcgcaagt gccgttgtcg 1380

tacgggccgt tcatcagcca gggcaacgta ccggtggcca acaccaccat ggagacctac 1440

gtgcagggtg atgactgcaa tcagtgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcccgtca 1500

ttggcctcgg atttctcttt cctgttcaac agtgccggct ccgccagcaa caaaagcctg 1560

atcaaaagcg tcaaagcctt cgaaaccctc aaggaccgcc cctga 1605

<210> 124

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 124

atgagcacgc ccttcaagca gttcacatct cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtcgat catcggcaac ccctggtcgg gcctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggt ttcggcgacg tgaccgcccc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacg ttcttctaca acaacggtgc agcggtcatt 300

ccccagctgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggagttgac cgaccacggc 360

cagatcaccc tcgataacac cctctacatg ctctacgacc ccaacaagca aggtaccgtg 420

ttgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgactgga acggcaagta cacggcgttc 480

tcgccttccg ggcctcgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtacgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa accccgcgta cttcctgacc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgcagtactg gggctgtacc gcgactacat cgacccgaac 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgtcgact gcccgaccgg caaagccggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaacgg cctgtgtgcc cggccagtat ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccatcctgcg cccggtgagc 900

agcagccaga acgcccagtc gttgatctgc tgcgcgcagt acgggcaaaa ctatcgcaac 960

tctgatccgc acatcggttt catggccaat accacggcgg tgaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cttgcaacag cccaccgatt tcagcgcctg gaagggccca 1080

caaggccagg acgtgagcca gtactggcgc atcacgcgcg gtacggccaa gtcggctgcc 1140

aacggttccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc tggtttctcg 1200

atcaatgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgttggtcg gcctgagcgt caccgccaag ccgctcagcg ccacgcccca agcattccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggcctgcaa ccctggccag tgcaactgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggcaatcccc caccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg tagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggtgccgac ccgactacca cggcgcagaa tgccagggtg 1500

caattctcca accccggggt gacggcgcag gtaacccagt acctgcccga cgcgtcggcc 1560

attcccggcc agaccaactc gggcggcacc caggcctaca ttctgaccat cacggtcagc 1620

ccctccgcag cacccggcct ggtggcattg cgtgccctca acccgggtga agatgtgaac 1680

gtgagcgcga cagaccaccc ttgggaatct ggcctggcgc tggtgcctgg cgcc 1734

<210> 125

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 125

atgatgtcca ggtcacgctt gagtcttctg tcgctgctgt gcggcattct actgtgcctg 60

tcgaccccgc aacccgccac ggcggccacg ctgtcggacg ccgatacctg tgtacagcag 120

caattggtgt tcaacccggc cagcggggga ttcctgccgg tcaacaactt caatgccacc 180

agccaggcgt tcatgaactg ctttggctgg cagttgttca ttgccttgaa ctggccggtg 240

aaccccggtt ggccggccac cgccagcctg gcgggcgaac ccgacatgca aagcacgctg 300

gcgcagttcg gggtcccctc cacaccgggt caacccatga gcgtggcccc ggtatgggcc 360

agctacaagg acgccaacga catcttcctg cccggcgccc ccacgcccac cggctggggc 420

gtgcaaaccc tggtaccgtc cgactgcagc acccaaggta gcctcaagac actcaaggtg 480

ggcgcgcgca agttcatgaa cgccacctcc gaaggcgcga tcaatgcctt gcacggtttc 540

cacctgtcga ccgggacact tgcctccatt cccgacccgg tcatggaagc gtccggcggc 600

tggctgacgg accaggcggg caaactggtg ttttttgaac gcaaggtggg caaggccgag 660

ttcgactaca tcgtcgacaa ggggctctac gacgccgcca accaattgaa ggtcgcgcga 720

aacctcgacg gccagacacc ggagggtctg tcactgccca tcggcgaacc gatgcgctca 780

ctgcctacct ccccagtgcc acaggagcaa ctgggcgcga tcgagctcaa ggccgcctgg 840

cgggtactga ctggcaaacc cgagctgttc gggcgctacc tgactaccgt cgcctggctc 900

aaacgtcccg acacgctgga gtgcacccag gaggtggtgg ggctggtggg cctgcatatc 960

atcaacaaga cccaggcttc gcccaacttc atctggacca ccttcgagca ggtggacaac 1020

gtgcccgaac cggcccaggt tccgccgcaa caaaccccgc caaacgggtt tgccttcaac 1080

aaccctgact gtggcaacgg ccccgagtgc acaccaaacc aagcccgtat ccagtgcaag 1140

caaacgcatc ccgacaagga ctgcaccgat ctcttcccgc gcgaccagcc ggtacagacc 1200

acccgcgaac accccgtgcc cggcgacctg caagccctca acagcgcggt acaagccaac 1260

ttcgcgcagc acagccaagg caagtcggtg ttccagtact acaagctggt caacgtactc 1320

tggaccctcg ctcccaaccc gcccagcccg gaaccgggcg ccaacgcgca agtgccgctg 1380

tcgtacgggc cgttcatcag ccaggggaac gtgccggtgg ccaacaccac catggagacc 1440

tacgtgcagg gtgataactg caatcagtgc catcagtacg cgacgattgc cggcagcccg 1500

tcattggcct cggatttctc ttttctgttc aacagtgccg gctccgccag caacaaaagc 1560

ctgatcaaaa gcgtcaaagc cttcgaaacc ctcaaggacc gcccc 1605

<210> 126

<211> 1738

<212> ДНК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 126

atgagcacac ccttcaaaca attcacctct cccgccggac aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccc aatcgtccat catcggcaac ccttggtcgg gcctgaacga cgctccccgc 180

tcgggctact acaacccgct cgtagagggc ttcggcgacg tgaccccacc cgcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg cctgtggacg ttcttctaca acaacggtgc ggcggtcatt 300

ccccagttgg gcggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggaattggc cgaccacggc 360

cagatcaccc tcgacaacac cctctacacg ctttacgacc cgaacaaaaa gggcactgtg 420

ctgcaactgc cggtcaagcg ctgccccagc atcgcctgga atggcacgta caaggatttc 480

acgccttccg gcccacgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtgcgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgtgaaa accccgcgta cttcctggcc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgcggtcctg ggcctgtacc gcgaatacat cgacccgagc 660

gtgcagctcg aagacctgta cctgcgctat gccgaagact gcccgaccgg caaggccggc 720

gatccggtca tggaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaaccg cctgtgtgcc cggccagtac ggcggagcga tgcacctgac atccggcccc 840

aataccctca gtgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccatcctgcg cccggtgagc 900

agcagccaga atgcccagtc gctgatctgc tgcgcgcagt acgggcagaa ctatcgcaac 960

tccgacccgc acatcggctt catggccaat accacggcgg tcaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccta ttggcctgta cttgcaacaa cccaccgact tcagcgcctg gaagggcccg 1080

caaggccagg acgtgagcca gtactggcgc atcacccgcg gtacggccaa gtcggccgcc 1140

aacggctccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc cggcttctcg 1200

atcaatgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgttggtgg gcctgagcgt caccgtcaaa ccgctcagcg tcacacctca atccttccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggcctgcaa ccctggccgg tgcaactgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggaactcccc caccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg cagcagcaat 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggcgccgac aagaccacca cggcgcagaa tgccagggtg 1500

caattctcca accccggggt taccgcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcgtcggcc 1560

attcccggcc agaccaacgc cggcggcaca caggcctaca tcctgaccat cacggtcagc 1620

cccaccgcag cccccggcct ggtgacggtg cgtgcgctca atccggatga agacgtgaac 1680

gtgagcgcgg cagaccaccc ttgggaatcc ggcctggcgc tggtgcctgg cgcctgaa 1738

<210> 127

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 127

atgtccaggt cacgcttgag tcttctgtcg ctgctgtgcg gcattttact gtgcctgtcg 60

accccgcaac ccgccatggc agccacgctg tcggatgccg acgcctgtgt gcagcagcag 120

ttggtgttca acccggccag cgggggattc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccagc 180

caggcgttca tgaactgctt tggctggcag ctgttcattg ccttgaactg gccggtgaac 240

cccggctggc cggccaccgc cagcctggcg ggcgaacccg acatgaacag cacgctggcg 300

cagttcggtg tcccctccgc accgggccaa cccatgagcg tggccccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaatgacat cttcctgccc ggcgcgccca cgcccactgg ctggggcgta 420

caaaccctgg tgccgtccgg ttgcagcact cagggtagcc tcaagtcact caaggtaggc 480

gcacgcaagt tcatgaacgc cacctccgaa ggcgcgatca atgccttgca ccgattccac 540

ctgtctaccg gaacactcgc gtccattccc gacccggtca tggaagcgtc cggcggctgg 600

ttgacggacc agtctggcaa cctggtgttt tttgagcgca aggtaggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcgacaaggg gctctacgac gccgccaacc agttgaaggt ggcgcaaaac 720

caggacggca agacaccgga ggggctgtcg ctgccaatcg gcgaaccgat gcgctcgctg 780

cctccgtccc ctgtcccgca ggagcagctg ggcgcgatcg agctcaaggc cgcctggcgg 840

gtgctgaccg gcaaacccga actgttcggg cgctacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgccccgata ccctgaactg cacccaggaa gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccactt tcgagcaggt cgacaacgtg 1020

cctgaaccgg cccaggcccc gccgcaacaa accccaccga acggttttgc cttcaacaac 1080

cctgactgtg gcagtggccc cgagtgcaca ccgaaccaag cccgtatcca gtgcaagcaa 1140

caccatcccg ataagcaatg caccgatctc ttcccacgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgcgaacacc ccatacccag cgacctgcag gccctcaaca gcgcggtgca agccaacttc 1260

gcgcagcaca gtcaaggcca gtcggtgttc cagtactaca agctgatcaa cgtactctgg 1320

accctcgccc ccaatccgcc cagcccggaa ccgggcgcca acgcgcaagt gccgctgtcg 1380

tacgggccat tcatcagcca gggcaacgtg ccggtggcca acaccaccat ggagacttac 1440

gtacagggtg atgactgcaa ccagtgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcccttcg 1500

ttggcctcgg acttctcttt cctgttcaac agtgccggtt ctgccagcac caaaagcctg 1560

atcaaaagcg tcaaagcctt ccagaccctc aaggatcaac cgtga 1605

<210> 128

<211> 1746

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 128

atgagcacgc ccttcaagca attcacctcc cccgctgggc aagcgccaaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccacaa ttcgaaaccg actggaacaa cgacataacc 120

ggctggaccg aagcggcgat catcggcaac ccctggtcgg gcctgtatga cgcgccccgc 180

tcggcctatt acaacccgct ggtcgaaggc tatggcgaca ccaccctgcc ggcgattacc 240

tggcaaccct ttcccaaccg gctgtggacc tttttctaca acaacggcac ggcggtgatt 300

ccccaactgg gcaacaaggc catgaccctg caacaggtca tggagctgac cgacaacggc 360

cagatcacca tcaacggcac cctgtacacc ctgtacgacc cggacaagaa aggcaccctg 420

ctgcaactgc ccgtaacccg ctgcccgact atcgactgga acggcaaata caaagacttc 480

tcaccctcgg ggccacgggg ctggctggac gaatactgcg agtggtcgat cgtgcgcgat 540

accaacggca acatgcgcaa gatcaccttt accagtgaaa acccggcgta cttcctggcc 600

atgtggcgca tcgatccgaa tgccgtgctg ggcttgtatc gcgactacat cgacccgaat 660

gtgcaactgc aagatctcta tctgcgctac accgccgact gcaagaccgg caaggccggt 720

gacccggtga ttgacccgac cacgggcctg ccggcctacg acacggtcaa caaatggaac 780

tccggcactg cctgcacccc cggccagttc ggcggcgcga tgcacctgac ctctgggccc 840

aacactctca gcgccgaggt gtacctggcg gcggcggcca ctatcatgcg gcccctgaaa 900

agcagccaga gcgcccaggc gctgatctgc tgcgcgcaat atgggcagaa ctatcgcaac 960

tccgacccgc atatcggctt tgcagccaac ggggcgacaa atgatggggc cacccccagc 1020

cggatttccc tgaccaaccc catcgccctg tacctgcaac agccgaccaa cttcaatgcc 1080

tggaaaggcc cccaaggcca ggatgtgagc cagtactggc gcatcacccg cggtaccgcc 1140

aaatcggcga tcaacggctc cgaccagatc ctgcaggcgg tgttcgaggt accggaaagt 1200

gccgggttct cgatcaacga catcaccatc aatggccagg cggtggacta tgtgtgggtg 1260

attgcccagc aattgctggt gggcctgagt gtcaccacca tgccgagcac cgcgcagcag 1320

caatcgcctt gcgtgcagga tcgggtcaat ggcctgcagc cctggccggt gcagttgttg 1380

ccgctggacc tgttctacgg ccagtcgccc accgacctgc cggcctggct ggccccaggt 1440

accagcgggc aattcgcgct ggtggtacaa ggcgcggacc tcaagaccac cgccgccacc 1500

gcacggatcc agttcaacaa ccccggggtc acggcgcagg tcacggagtt cctgcccgac 1560

gcctcggcca ttcccggcca gaccaatgcg ggcggcaccc agggctacat catgaccatc 1620

accgtcgcaa aagacgcggc gccgggactg gtgacagtgc gcgcgctcaa tccgggcgag 1680

gcggataacg tcagcgcggc ggaccaccct tgggagtccg ggctggcgct ggtgccatcc 1740

acttaa 1746

<210> 129

<211> 1602

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 129

atgatgtaca gatttcgctt acgtggtctg ctgctggtcg gcacgctgct gtcgctgttt 60

ctcctgccca cggcccaggc atcggatgcc gatacctgcg tccagcagca gttggtgttc 120

gaccccaaca gcggcggttt tctacccgtc aacaatttca acaccactgg ccagagcttc 180

atgaactgtt ttggctggca gctgtttatt gccctgaact ggcccgtgga tcccggatgg 240

ccagccaatg cagccctcgc gggcgagccg aaccgcaaga tcagcatggc gcaatttggc 300

gtgccccagg tcgccgggca acccatgacc accgcgccgg tgtgggcaag ctttaaagac 360

gctaacgata tattcctgcc cggcgcccga ccgcccacag gctggggcgt gcagacattg 420

gtgccgtcca attgcagcag cgagggcagc ctcaaagcgt tgtcggtggg ggcgcgcaag 480

ttcatgaacg ccacctcgga aagcgcgacc aacgccaagc atcgcttcca cttgtccagc 540

ggtaccctgg cgtcgattcc cgacccgatc atggaagccg ccggtggctg gctgacggac 600

cagaccggca acctggtgta tttcgagcgc aaggtgggca aggccgagtt tgactatatc 660

gtcaagtacg ggctgtacga tgccgccaat caaatggtcg ttgcacaaaa cagcgatggc 720

aatcatccgg ccgggctgtc cctgcccgcc ggcgagctga tgcgctcgat gccggcgcaa 780

cccctgcccc aggagcaact gggcgccctg gaactcaagg ccgcctggcg tatcctcacc 840

ggcaagcccc agctctacgg gcgctacctg accaccgtgg cctggctcaa gaaccccgcc 900

accctgcagt gcacccaaca ggtggtgggc ctggtgggcc tgcatatcat caacaagacc 960

cagagttcac cgaactttat ctggaccaca ttcgagcaag tagacaacgt acaagagcca 1020

ggccaggtgc ccgcgcaaca gacaccgccc gacggtttta ccttctacaa ccccaattgc 1080

accggtggcc ctgacgtgtg cacgcccaac gtggcccgta tccagtgcca gcagcaccac 1140

cctgatcgcg aatgcaccga gccctatcca cgcaaccaac cggtccagac cactcgcgaa 1200

caccccctgc cttcggacat gcaggccctc aacggcgccg tgcaggctaa cttcgcccag 1260

cagaccaacg gccagtcggt gttccagtac tacaaactgg tcaatgtgct gtggatcacc 1320

gccccgaccg caccggaccc ggagccgggc gcgggtgcga aggtgcccct gtcctatggc 1380

gcctttatca gcgatagcaa cgtaccggtg gccaatacca ccatggagac ctacgtccag 1440

agcatggact gcaatgcctg ccatcagcag gcgacgattg ccggcagcag cagcctggcc 1500

tcggacttct cgttcctgtt caacaacgcc gattcggcca agcaaaaaag cctgatcaaa 1560

cgcgtaaatg ccttcgaaac cctcaaggat ggcccaccat ga 1602

<210> 130

<211> 1851

<212> ДНК

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 130

atgcccgctg cctggcttta tcgcccaact ggtgtgggac gacccgcgcc agaccgttgc 60

cgaccctccc tcgagtgccg gttgctgctc cgtttctacc ccccatggag atctgacatg 120

agcacgccct tcaagcaatt cacctccccc gccgggcaag cgccaaagga ctacaacaag 180

ctgggcctgg aagaccagtt gccgcaattt gaaaccgact ggaacaacga cgtcaccggc 240

tggaccgaag cggcgatcat cggcaaccca tggtcgggcc tgtacgacgc gccacgctcg 300

ggctattaca acccgctggt cgagggctat ggcgacacca ccccgccggc gattacctgg 360

caaccctttc ccaaccggct gtggacgttt ttttatagca acggcacggc ggtgattccg 420

caactgggcg gcaaggccat gaccctgcaa caggtcatgg aactgaccga caatggccag 480

atcaccatca acgacaccct gtacaccctg tacgacccgg acaagaaagg caccctgctg 540

caactgccgg tgacccgttg cccgagtatc gactggaacg gcaagtacaa ggatttctca 600

ccctcgggcc cacggggctg gctggacgag tattgcgagt ggtcgattgt ccgcgatgcc 660

aatggcgaca tgcgcaaaat caccttcacc agtgaaaacc cggcgtattt cctggccatg 720

tggcgcatcg acccgaatgc cgtgctgggg ctgtatcgcg actacatcga cccgaacgtc 780

caactcgaag acctctacct gcgctatgcc accgactgcc cgaccggcaa tgccggggat 840

ccggtgattg acccgaccac gggcctgccc gcctacgaca ctgtcaacaa atggaacgcc 900

ggcaccgcct gtacgcccgg ccagttcggc ggcgcgatgc acctgacgtc cggccccaac 960

accctcagcg ccgaggtgta cctggcggcg gcggccacga tcatgcggcc cctgaaaagc 1020

agccagaacc ctcagtcgct gatctgctgc gcgcaatatg ggcagaacta tcgcaactcc 1080

gacccgcata tcggttttgc ggccaatgag gcggccatca gcaaccgtat ctccctgacc 1140

aatcccatcg ccctgtacct gcagcaaccg accaacttca gcgcgtggaa aggcccgcag 1200

ggccaggatg tgagtcagta ctggcgcatt acccgcggca ccgccaaatc ggcgatcaac 1260

ggctccgacc agatcctcca ggcggtgttc gaggtgccgc aaagcgcggg gttctcgatc 1320

aatgacatca ccatcaacgg ccaggccgtg gactatgtgt gggtgattgc ccagcaactg 1380

ctggtgggcc tgagtgtgac cgtcatgccg agcaccacgg cggcgccgtc tccttgcgta 1440

caagaccggg tcaatggcct gcaaccctgg ccggtgcagt tattgccgct ggacctgttc 1500

tacggccagt cgcctaccga cctgccggcc tggctggccc ctggcagcag cgggcagttt 1560

gtcctggtgg tgcaaggcgc cgatctgcag accaccgccg ccacggcgag gatccagttc 1620

agcaatcccg gggtgacggc acaggtcacg aagttcatgc ccgacgcctc ggccattccc 1680

ggccagacca acgcgggcgg cacccagggt tacatcatga ccatcagcgt cgcggcgaac 1740

gcggcgccgg gactggtgac ggtacgcgcg ctcaacccgg gcgaggcgga taacgtcagc 1800

gcggcggacc acccgtggga atccgggctg gcgctggtgc catccaccta a 1851

<210> 131

<211> 1602

<212> ДНК

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 131

atgatgtcca ggtttcgctt gagtcgtctg ctgctggtca gcaccctgct gtcactgttt 60

atcctgccct tggcccacgc gtccgatgcc gataactgcg tccagcagca actggtgttc 120

aaccccaaga gcggcgggtt tatgccggtc aacaacttca acaccaccgg ccagagcttt 180

atgaattgct ttggctggca attgttcatc gccctgaact ggccggtgga ccccggctgg 240

ccggccaatg ccagcctggc gggcgagccg gacagaacca tcaccgtcgc gcaattcggc 300

gtgcccacca ccgccgggca gcccatgagc gtggcgccgg tatgggccag ctacaaagac 360

gccaatgaga ttttcctgcc cggtgcaccc aagcccagcg gttggggggt gcaaaccctg 420

gtgccgccca attgcagcag ccaggacagc ctccaggccc tgtcggtagg ggcgcgtaaa 480

ttcatgaatg ccacctcgga aagcgcgacc aacgccaagc atcgcttcca cttgtccagc 540

ggcaccctgg cgtcgattcc cgacccgatc atggaagccg ccggtggctg gctcacggac 600

cagaccggca acctggtgta tttcgaacgc aaggtgggca aggccgagtt cgactacatc 660

gtcgacaacg gtctgtacga tgccgccaat caactgatcg tcgcgcaaaa cagcgatggc 720

aaacacccgg ccggcctgtc gctgcccgcc ggtgagctga tgcgctcgat gcccaccacc 780

ccgctgcccc aggagcaact gggcgccctg gaactcaagg ccgcctggcg catcctcacc 840

ggccagcccc agctctacgg gcgctacctg accactgtgg cctggctcaa gaaccccgcc 900

accctgcaat gcacccaaca ggtggtgggc ctggtgggcc tgcatatcat caacaagacc 960

cagagctcac cgaactttat ctggaccacc ttcgagcacg tggacaacgt accggaaccg 1020

ggccaggtgc ccgcgcaaca gctgcccccg gacggctaca ccttcaacaa tcccaactgc 1080

accggcggcc ccgatgtgtg tacgccgaac gtggcgcgca tccagtgcaa acagcaccac 1140

ccggatcgcg aatgcaccga accctatcca cgggaccaac cggtgcagac cacccgcgaa 1200

cacccactgt cgtcggacat gcaggcgctc aacggcgcag tgcaggcaag cttcgcccaa 1260

cagaccaacg gccagtcggt gttccagtac tacaagctga tcaatgtgct gtggatcacc 1320

gccccgacgc cgcccgaccc cgagccgggc ccgaatgcga aggttcccct gtcctacggt 1380

gcttttatca gcgacagcaa cgtacccgtg gccaatacca ccctggagac gtacgtccag 1440

ggcatgaact gcaatgactg ccatcagcaa gcgaccattg ccggcagcgc caccctggcc 1500

tcggacttct cgttcctgtt caacaacgcc gattcggcca agcatacaag cctgatcaaa 1560

cgcgtacatg ccttcgaaac cctcaaggac ggccaaccat ga 1602

<210> 132

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 132

atgagcgcgc ccttcaagca gttcacctct cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtcgat catcggcaac ccctggtcgg gcctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggt ttcggcgacg tgaccgcccc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacg ttcttctaca acaacggtgc ggcggtcatt 300

ccccagctgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggcgttgac cgaccacggc 360

cagatcacgc tcgacaacac cctctacatg ctctacgacc ccaacaagca aggtactgtg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgactgga acggcaagta cacggcgttc 480

tcgccttccg gcccgcgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtacgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa accccgcgta cttcctgacc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgcagtgctg ggcctgtacc gcgactacat cgacccgaac 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgtcgact gcccgaccgg caaggccggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaacgg cctgtgtgcc cggccagtac ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccatcctggg cccggtgagc 900

agcagtcaga acgcccagtc gttgatctgc tgcgcgcagt acgggcaaaa ctatcgcaac 960

tctgatccgc acatcggttt catggccaat accacggcag tgaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cttgcagcag cccaccgatt tcagcgcctg gaagggcccg 1080

caaggccagg acgtgagcca gtactggcgc atcacgcgcg gtacggcgaa gtcggccgcc 1140

aatggttccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc cggcttctcg 1200

atcaacgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctggtcg gcctgagcgt caccgtcaag ccgctcagca ctgcgcctca agcgttccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggcctgcaa ccctggccag tgcaactgct gccgctggat 1380

ctgttctacg ggcaatcccc caccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg tagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggtgccgac ccgactacca cggcgcagaa tgcaagggtg 1500

caattctcca accctggggt gacggcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcatcggcc 1560

attcctagcc agaccaactc gggcggcacc caggcctaca ttctgaccat cacggtcagc 1620

ccctccgcag cacccggcct ggtggcagtg cgtgccctca acccgggtga agatgtgaac 1680

gtgagcgcga cagaccaccc ttgggaatct ggcctggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 133

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 133

atgtccaggt cacgcttgag tcttctgtcg ctgctgtgcg gcattctact gtgcctgtcg 60

accccgcaac ccgccacggc ggccacgctg tcggacgccg atacctgtgt acagaagcaa 120

ttggtgttca acccggccag cgggggattc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccagc 180

caggcgttca tgaactgctt tggctggcag ttgttcattg ccttgaactg gccggtgaac 240

cccggttggc cagccaccgc cagcctggcg ggtgaacccg acatgcaaag cacgctggcg 300

cagttcgggg tcccctctgc accgggtcag cccatgagcg tggccccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgacat cttcctgccc ggcgcaccca cgcctaccgg ctggggcgtg 420

gaaaccctgg tgccgtccgg ctgcagcacc cagggtagcc tcaaggcgct caaggtgggc 480

gcacgcaagt tcatgaacgc cacctccgaa ggcgcgatca atgccttgca cggtttccac 540

ctgtcgaccg ggacacttgc gtccattccc gacccggtca tggaggcgtc cggcggctgg 600

ctgacggacc aggcgggcaa actggtattt tttgagcgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcgacaaggg gctctacgac gctgccaacc agttgaaggt cgcgcaaaac 720

ctcgacggcc agacaccgga gggcctgtcg ctgcccatcg gcgaaccgat gcgctcactg 780

ccgacctccc cagtgccaca ggagcaactg ggcgcgatcg agctcaaggc cgcctggcgg 840

gtgctgaccg gcaaacccga gctgttcggg cgctacctga ctaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgccccgaca cgctggagtg cacccaggag gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

cccgaaccgg cccaggtccc gccgcaacaa accccgccaa acgggtttgc cttcaacaac 1080

cctgactgtg gcgacggccc cgagtgcaca ccgaaccaag cccgtatcca gtgcaagcaa 1140

acgcatcccg acaaggactg caccgatctc ttcccacgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgcgtacacc ccgtgcccgg cgacctgcaa gccctcaaca gcgcggtaca agccaacttc 1260

gcgcagcaca gccaaggcaa gtcggtgttt cagtactaca agctgatcaa cgtactctgg 1320

accctcgccc ccaatccgcc cagcccggaa ccgggcgcca acgcgcaagt gccgctgtcg 1380

tacgggccgt tcatcagcca gggcaacgtg ccggtggcca acaccaccat ggagacctac 1440

gtgcagggtg atgactgcaa tcagtgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcccgtca 1500

ttggcctcgg atttctcttt cctgttcaac agtgccggct ccgccagcaa caaaagcctg 1560

atcaaaagcg tcaaagcctt cgaaaccctc aaggaccgcc cctga 1605

<210> 134

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas plecoglossicida

<400> 134

atgagcacgc ccttcaagca gttcacctct cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtccat catcggcaac ccttggtcgg gcctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggc ttcggcgacg tgaccgcccc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacc ttcttctaca acaacggtgc ggcggtcatt 300

ccccagttgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggagttgac cgaccacggc 360

cagatcaccc tcgacaacac cctctacatg ctctacgacc ccaacaaacg aggtaccgtg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgactgga acggcaagta cacggcgttc 480

tcgccttccg gcccacgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtgcgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa accccgcgta cttcctgacc 600

atgtggcgta tcgacccgaa cgcagtattg ggcctgtacc gcgactacat cgacccgaac 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgccgacg gcccgaccgg caaggccggt 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaacgg cctgtgtgcc cggccagttc ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccatcctgcg cccggtgagc 900

agcagccaga acgcccagtc gttgatctgc tgcgcgcagt acgggcagaa ctatcgcaac 960

tctgatccgc acatcggttt catggccaat accacggcgg tgaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cttgcaacag cccaccgact tcagcgcctg gaagggcccg 1080

caaggccagg acgtgagcca gtactggcgc atcacgcgtg gtacggccaa gtcggctgcc 1140

aacggttccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc cggcttctcg 1200

atcaatgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctggtcg gcctgagcgt caccgtcaag ccgctcagca ccacgcctca agcgttccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggcctgcaa ccctggccag tgcagctgct gccgctggac 1380

ctgttctacg ggcaatcccc aaccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg cagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggcgccgac ccgactacca cggcgcagaa tgccagggtg 1500

caattctcca accctggggt gacggcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcgtcggcc 1560

attcccggcc agaccaactc gggcggcacc caggcctaca ttctgaccat cacggtcagc 1620

ccctccgcag cacccggcct ggtgacagtg cgtgccctca acccgggtga agatgtgaac 1680

gtgagcgcga cagaccatcc ttgggaatct ggcctggcgc tggtgccggg ggcctga 1737

<210> 135

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas plecoglossicida

<400> 135

atgtccaggt cacgcttgag tcttctgtcg ctgctgtgcg gcattctgct gtgcctgtcg 60

accctgcaac ccgccacggc ggccacgctg tcggacgccg atacctgtgt gcagcagcaa 120

ttggtgttca acccggccag cgggggattc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccagc 180

caggcgttca tgaactgctt tggctggcag ctgttcattg ccttgaactg gccggtgaac 240

cccggttggc cggccaccgc cagcctggcg ggcgaacccg acatgcaaag cacgctggcg 300

cagttcgggg tcccctccgc accgggtcaa cccatgagcg tggccccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgacat cttcctgccc ggcgcaccca cgcccaccgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccatccgg ctgcagcacc cagggtagcc tcaaggcact caaggtcggc 480

gcacgcaagt tcatgaacgc cacctccgaa ggcgcgatca atgccttgca cggtttccac 540

ctgtcgaccg ggacacttgc gtccattccc gacccggtca tggaggcgtc cggcggctgg 600

ctgacggacc aggcgggcaa actggtgttt ttcgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcgacaaggg gctctacgac gccgccaacc agttgaaggt cgcgcaaaac 720

ctcgacggcc agacaccgga gggcctgtcg ctgcccatcg gcgaaccgat gcgctcactg 780

ccgacctccc cagtgccaca ggagcaactg ggcgcgatcg agctcaaggc tgcctggcgg 840

gtactgaccg acaaacccga gctgttcggg cgctacctga ctaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgccccgaca cgctggagtg tacccaggag gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

cccgaaccgg cccaggtccc gccgcaacaa accccgccga acgggtttgc cttcaacaac 1080

cctgactgtg gcaacggccc cgagtgcaca ccaaaccaag cccgtatcca gtgcaagcaa 1140

acgcatcccg acaaggactg caccgatctc ttcccacgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgcgaacacc ccgtgcccgg cgacctgcaa gccctcaaca gcgcggtaca agccaacttc 1260

gcgcagcaca gccaaggcaa gtcggtgttc cagtactaca agctgatcaa cgtactctgg 1320

accctcgccc ccaatccgcc cagcccggaa ccgggcgcca acgcgcaagt gccgttgtcg 1380

tacgggccgt tcatcagcca gggcaatgtg ccggtggcca acaccaccat ggagacctac 1440

gtgcagggtg acgactgcaa ccagtgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcccctcg 1500

ttggcctcgg acttctcctt cctgttcaac agtgccggct ccgccagcaa caaaagcctg 1560

atcaaaagcg tcaaagcctt cgaaaccctc aaggaccgcc cctga 1605

<210> 136

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 136

atgagcacgc ccttcaagca gttcacctct cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtcgat catcggcaac ccctggtcgg gcctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggt ttcggcgacg tgaccgcccc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacg ttcttctaca acaacggtgc ggcggtcatt 300

ccccagctgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggcgttgac cgaccacggc 360

cagatcacgc tcgacaacac cctctacatg ctctacgacc ccaacaagca aggtactgtg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgactgga acggcaagta cacggcgttc 480

tcgccttccg gcccgcgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtcgat cgtacgcgat 540

gccaacggca acatgcgcaa gatcaccttc acctgcgaaa accccgcgta cttcctgacc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgcagtgctg ggcctgtacc gcgactacat cgacccgaac 660

gtgcaactcg aagacctgta cctgcgctac accgtcgact gcccgaccgg caaggccggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcaag ccggcctatg acaccgtcaa caaatggaac 780

gccggaacgg cctgtgtgcc cggccagtac ggcggtgcga tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcca ccatcctgcg cccggtgagc 900

agcagtcaga acgcccagtc gttgatctgc tgcgcgcagt acgggcaaaa ctatcgcaac 960

tctgatccgc acatcggttt catggccaat accacggcag tgaacaaccg actgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cttgcagcag cccaccgatt tcagcgcctg gaagggcccg 1080

caaggccagg acgtgagcca gtactggcgc atcacgcgcg gtacggcgaa gtcggccgcc 1140

aatggttccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggtgc cggaaagcgc cggcttctcg 1200

atcaacgaca tcaccatcaa caaccagaag gtcaactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctggtcg gcctgagcgt caccgtcaag ccgctcagca ctgcgcctca agcgttccca 1320

tgcgtgcagg accgggtggc cggcctgcaa ccctggccag tgcaactgct gccgctggat 1380

ctgttctacg ggcaatcccc caccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg tagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtgca aggtgccgac ccgactacca cggcgcagaa tgcaagggtg 1500

caattctcca accctggggt gacggcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcatcggcc 1560

attcctggcc agaccaactc gggcggcacc caggcctaca ttctgaccat cacggtcagc 1620

ccctccgcag cacccggcct ggtggcagtg cgtgccctca acccgggtga agatgtgaac 1680

gtgagcgcga cagaccaccc ttgggaatct ggcctggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 137

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 137

atgtccaggt cacgcttgag tcttctgtcg ctgctgtgcg gcattctact gtgcctgtcg 60

accccgcaac ccgccacggc ggccacgctg tcggacgccg atacctgtgt acagaagcaa 120

ttggtgttca acccggccag cgggggattc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccagc 180

caggcgttca tgaactgctt tggctggcag ttgttcattg ccttgaactg gccggtgaac 240

cccggttggc cggccaccgc cagcctggcg ggcgaacccg acatgcaaag cacgctggcg 300

cagttcgggg tcccctccac accgggtcaa cccatgagcg tggccccggt atgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgacat cttcctgccc ggcgccccca cgcccaccgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg taccgtccga ctgcagcacc caaggtagcc tcaagacact caaggtgggc 480

gcgcgcaagt tcatgaacgc cacctccgaa ggcgcgatca atgccttgca cggtttccac 540

ctgtcgaccg ggacacttgc ctccattccc gacccggtca tggaagcgtc cggcggctgg 600

ctgacggacc aggcgggcaa actggtgttt tttgaacgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcgacaaggg gctctacgac gccgccaacc aattgaaggt cgcgcgaaac 720

ctcgacggcc agacaccgga gggtctgtca ctgcccatcg gcgaaccgat gcgctcactg 780

cctacctccc cagtgccaca ggagcaactg ggcgcgatcg agctcaaggc cgcctggcgg 840

gtactgactg gcaaacccga gctgttcggg cgctacctga ctaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgtcccgaca cgctggagtg cacccaggag gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

cccgaaccgg cccaggttcc gccgcaacaa accccgccaa acgggtttgc cttcaacaac 1080

cctgactgtg gcaacggccc cgagtgcaca ccaaaccaag cccgtatcca gtgcaagcaa 1140

acgcatcccg acaaggactg caccgatctc ttcccgcgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgcgaacacc ccgtgcccgg cgacctgcaa gccctcaaca gcgcggtaca agccaacttc 1260

gcgcagcaca gccaaggcaa gtcggtgttc cagtactaca agctggtcaa cgtactctgg 1320

accctcgctc ccaacccgcc cagcccggaa ccgggcgcca acgcgcaagt gccgctgtcg 1380

tacgggccgt tcatcagcca ggggaacgtg ccggtggcca acaccaccat ggagacctac 1440

gtgcagggtg ataactgcaa tcagtgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcccgtca 1500

ttggcctcgg atttctcttt tctgttcaac agtgccggct ccgccagcaa caaaagtctg 1560

atcaaaagcg tcaaagcctt cgaaaccctc aaggaccgcc cctga 1605

<210> 138

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 138

atgagcacgc ccttcaagca gttcacctcg cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tagaagacca gctgccgcag ttcgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccg agtcgtcgat catcggcaac ccctggtcgg gcctgaacga tgcgccccgc 180

tcgggttact acaacccgct ggtggaaggc ttcggcgacg tgaccccgcc ggcaatcacc 240

tgggcgcctt tccccaaccg actgtggacg ttcttctaca acaatggcac ggcggtcatt 300

ccgcagctgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tggagttggc cgaccatggc 360

cagatcagcc tcgacaacac cgtctacagg ctctatgacc cgaacaagca aggcaacctg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgcccgagc atcgcctgga acggcccgta caaggatttc 480

tcgccttccg gcccacgggg ctggctcgac gaatactgcg agtggtccat cgtgcgcgat 540

ggcaacggca aaatgcgcaa gatcaccttc acctgtgaaa acccggcgta tttcctgacc 600

atgtggcgca tcgacccgaa tgcggtgctg ggcctgtacc gcgaatacat cgacccgaac 660

gtgcagctcg aagacctgta cctgcgctat accgaagacg gcccgaccgg caaggccggt 720

gagccggtca tcgatcccac caccggcaag ccggcgtacg acaccgtcaa caaatggaat 780

gccggcacgg tcagtgtgcc cggccagtat ggcggggcaa tgcacctgac ctccggcccc 840

aataccctca gtgccgaggt gtacctcgcc gccgccgcca ccatcctgcg accggtcagc 900

agcagccaga acgcccagtc gctgatctgc tgcgcgcagt acgggcagaa ctaccgcaac 960

tccgacccgc acatcggttt catggccaac agcacggcgg tgaacaaccg cctgtcgctg 1020

accaacccga ttggcctgta cttgcaacaa cccaccgact tcagtacctg gaagggcccg 1080

caaggccagg atgtgagcca gtactggcat atcacgcgcg gcgcggccaa gtccgcggcc 1140

aacggttccg accagatcct tcaggcggtg ttcgaaatac cggaaagcgc cggtttctcg 1200

atcaacgagg tcaccatcaa caaacaaccg gtcaaccatg tgtgggtcat cgcccaacag 1260

ttgctggtgg gcctgagcgt caccgtcaag ccactcgccg ccacgcctgc ttcctacccc 1320

tgcgtgcagg accgggtggc aggcctgcaa ccctggccgg tgcagctgct gccgttggac 1380

ctgttctacg gcaactcacc caccgacctg cccgcctggc ttgccccggg cagcagcaac 1440

caattcgtgc tggtggtgca aggcgccgac gagaacacca ccgcagagaa cgcccgggtg 1500

caattctcca accccggggt taccgcgcag gtcacccagt acctgcccga cgcaacggcc 1560

atacccggcc agaccaatac cggcggcacc caggcttaca tcctgacgat cacggtcagc 1620

cccactgccg cacccggcct ggtgacggta cgtgcgctca acccggacga agacgccaac 1680

gtgagcgcgg cagaccaccc ttgggaatcc ggcctggcgc tggtgcctgg cgcctga 1737

<210> 139

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 139

atgtccagcc tacgcttgag tcttctgtcg ctgctaagcg gcattctcct gtgcctgtcc 60

gcccagcaaa cagccacggc ggccacgcag tccgacgccg atagctgtgt gcagcagcaa 120

ctggtgttca acccggccag tggcgggttc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccagc 180

caggcgttca tgaactgctt tgcctggcag ttgttcattg ccctgaactg gccggtgaac 240

ctcggttggc caggcactgc cagcctggcc ggggaacccg acctgaacag cagcctggcg 300

cagttcgggg tacctgccac accgggtcaa cccatgagcg tggcgccggt gtgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgacat cttcctgccc ggcgcaccca cgcccagcgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg taccggccaa ttgcagcacc cagggcagcc tcaaggcact caaggtcggc 480

gcgcgcaagt tcatgaacgc aacctccaag agcgcgatca acgtcttgca cggtttccac 540

ctgtccagcg ggacgctggc atccagcccc gacccgttca tggaggcgtc tggcggctgg 600

ctgacagacc agtcgggcaa cctggtgttt ttcgaacgca aggtgggcaa ggccgaattc 660

gactacatcg tcgacaacgg cctctacgac gcggccaacc agctgaaggt cgcgcaaaac 720

caggacggca agtccccggc ggggctgtcg ctgcccgccg gcgaaccgat gcgctccctg 780

cctgccgccc cggtcccgca ggagcaactg ggggcgatcg aagtcaaagc cgcctggcgg 840

gtgctgaccg gcaaacccga gctgttcggg cgctacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgccccgaca cgctggcctg cacccaggaa gtggttggcc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcttcgcc caacttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

cccgaaccgg cccaggcccc gccgcaacaa accccgccga acgggtttgc cttcaacaac 1080

cccgactgtg gcagcggccc cgagtgcaca ccgaaccagg cccgtatcca gtgcaagcaa 1140

caccaccccg acaaggactg caccgatcgc ttcccacgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgcgaacacc ccgtgcccgg cgacctgcaa gcgctcaaca gcgcggtaca agccaacttc 1260

gcgcagcaca gccaaggcca gtcggtgttc cagtactaca agctgatcaa cgtactctgg 1320

accctcgccc ccaatccgcc cagcccggaa ccgggcgcca acgcgcaagt gccgctgtca 1380

tacgggccgt tcataagcca gggcaacgtg ccggtggcca ataccaccct ggagacctat 1440

gtacagggtg atgactgcaa ccagtgccac cagtacgcga cgattgccgg cagcccgtcg 1500

ttggcctcgg acttctcttt cctgttcaac agtgccgatt ccgccagcaa caaaagcctg 1560

atcaaaagcg tcaaagcctt cgaaaccctc aaggacctcc cctga 1605

<210> 140

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 140

atgagcacgc ccttcaacca gttcacttct cccgccgaac aagcacccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gctgccgcag ttcgagagcg actggaacaa ctacctcacc 120

ggctggaccg aatcgtccat catcggcaac ccgtggtcga gcctgtacga cgcgccgcgc 180

tcgggctact acaacccgct ggtggaaggt ttcggtgatg tggttgtgcc ggcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctatggacg ttcttttaca acaacggtgc cgcagtcatt 300

ccccagctgg gtggcaaagc catgaccctg caacaggtga tggagctggc cgactacggc 360

cagatcaccc tcaacgacac cctctacacg ctgtacgacc cggacaacaa aggcaccctg 420

ctgcaactgc cggccaaacg ctgccccagc atcgactgga acggcaagta caccgcgttc 480

tcgccctccg gcccacgcgg ctggcttgat gaatactgcg agtggtcgat cgtgcgcgac 540

gccaacggca acatgcgcaa gattaccttc acctgcgaaa acccggcgta ctacctggcc 600

atgtggcgca tcgacccgaa cgccgtgctg ggcctgtacc gtgaatacat cgaccccaac 660

gtgcagctcg aagacctgta cctgcgctac accgtcgatt gcccgaccgg caaggctggc 720

gacccggtca tcgaccccac caccggcctg ccggcctatg acacggtgaa caagtggaat 780

gccggcacgg cctgtgtgcc cggccaattt ggcggggcca tgcacctgac ctcaggcccc 840

aacaccctca gcgccgaggt gtacctggcc gccgccgcta ccatcctgcg cccggtgacc 900

agcagccaga acgcccagtc gctgatctgc tgcgcccagt atgggcagaa ctatcgcaac 960

tccgacccgc acatcggttt catggccaat tccaaggcag tgaacaaccg cttgtcactg 1020

accaatccga ttggcctgta cctgcagcag cccaccgact tcagcacctg gaaaggcccg 1080

caaggccagg atgtgagcca gtattggcgg gttacgcgcg gcactgccaa gtcggccgcc 1140

aacggctccg accaaatcct ccaggccgtg ttcgaagtgc cggaaagcgc aggcttctcg 1200

atcaacgaga tcacgatcaa caagcaaccg gttgactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctggtgg gcctgagcgt cagtgctcta ccgcccgcca ccacccctcc atccttcccc 1320

tgcgtgcagg accgggtgac gggcctgcag ccctggccgg tgcagttgct gccgctggac 1380

ctgttctacg gccagtcacc caccgacctg ccggcctgtc ttgcgccggg cagcagcaac 1440

cagttcgtgc tggtggtaca aggcgccgac ccgaacacca cggcgcagag tgccagggtg 1500

cagttctcca accctggcat cagcgcgcag gtcacccagt tcctgcctga cgcctcagcc 1560

attcccgggc agaccaatgc gggcggcacc caggcctaca tcctgaccat cacggtcagc 1620

cccagcgccg cccccggcct ggtgacggtg cgtgccctca atccgggcga agacgggaac 1680

gtgagcgcag cagaccaccc gtgggaatcc ggcctggcgc tggtacctgg cgcctga 1737

<210> 141

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas monteilii

<400> 141

atgtccaggt tacgcttgag tcttctgtcg ctactaagcg gcatgctgct gtgcctgtcg 60

accctgccag ccgccacggc ggcgccaatg acggaggccg acgcctgtgt acagcaacag 120

ttggtgttca acccggccag cggcgggttc ctgccggtca acaacttcaa tgccagcaac 180

caggcgttca tgaactgttt tgcctggcag ctgttcattg ccctgaactg gccggtgaat 240

cccggctggc cagccaccgc cagcctggcc ggcgaacccg acatgaacag caccctggcg 300

cagttcggtg tgccctccga cccggggcaa ccgatgagcg tggcgccggt gtgggccagc 360

tacaaggacg ccaacgacat cttcctgccc ggcgccccca agcccagcgg ctggggcgtg 420

caaaccctgg tgccatccgg ttgcggcacc cagggcagcc tcaaggcgct caaggtgggg 480

gcacgcaagt tcatgaacgc cacctccgaa agcgcgatca acgccgtgca cggtttccac 540

ctgtccagcg ggacgctcgc atcccttccc gactcgatca tggaagcatc cggtggctgg 600

ctgaccgacc aggcgggcaa cctggtgttc ttcgagcgca aggtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcggcaaggg gctgtacgac gccgccaacc agttgaaggt cgcgcaaaac 720

gccgacggca ctacaccgga ggggttgtcg ttgcccattg gcgagccgat gcgctcgctg 780

ccgccatccc cggtgccgca ggaacaactc ggcgcgatcg aactcaaggc cgcctggcgc 840

atactgaccg gcaaacccga actgttcggg cgctacctga ccaccgtcgc ctggctcaag 900

cgccccgaca cgctgacgtg tacccaggaa gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcctcgcc gaacttcatc tggaccactt tcgagcaggt cgacaacgtg 1020

cccgagccgg gtcaggtacc gccgcaacaa accccgccga acggcttcgc cttcaacaac 1080

ccggactgcg gcagcggccc tgagtgtgaa ccgaaccagc cccgtatcca atgcaagcaa 1140

caccaccccg accgggactg caccgatctg ttcccacgcg accagccagt gcagaccacg 1200

cgcgagcatc ctgtgccgag cgacctgcaa gcgctgaacg gcgcagtgca agccaccttc 1260

gcgcagcaca gccagggcaa gtcggtgttc cagtactaca aactgatcaa cgtactctgg 1320

accctcgcgc ccaacccgcc cagcccggaa ccaggagcca acgcgccggt gccgttgtcg 1380

tacggggcgt acatcagcca gggcaatgtg ccggtggcca acaccaccct ggaaacctat 1440

gtgcagggtg atgactgcaa ccagtgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcagttcg 1500

ctggcctcgg acttctcgtt cctgttcaac agtgccagct cagccagcaa gcacagcctg 1560

atcaagcgtg tccaagcctt cgaaacgctg aaggaccgtc gctga 1605

<210> 142

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas poae

<400> 142

atgagcacac ccttcaccca attcacctcc cctgccgaac aagcgcccaa ggactacaac 60

aagttgggcc tggaggacca gttgccggcg ttcgaaaccg actggaacaa caacgtcacc 120

ggctggaccc agatgtcgat catcggcaac ccctggtcca acctcaacga tgcaccgcgc 180

tcgggctatt acaacccgct ggagagcggc tacggcacgc tgacgccaaa gaccatcacc 240

tggcagccct tccccaatcg gctgtggacg tttttctata acgagggcgc tgccgtggtc 300

ccgcaactgg gcggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tgcaactgac cgaccacggc 360

cagatcaccc tcaacgacac cctctattcg ctgtacccgg accccaaggc cacccaactg 420

cagatcccca gcgtgctgtg caaatccatc aactggaacg gcccctacgc cgacttttcg 480

ccctcgggtc cacggggctg gctggacgaa tactgcgagt ggtcgatcac ccgcgacccc 540

gacggcaaca tgcgcagcat catgttcacc agcgagaacc cggcgtattt cctgaccatg 600

tggaacatcg acccgggtgc cgtgctgggc ctgtaccagg cgtatgtcga cccgcaggtg 660

aaactcgaag acctgtacct gcgctacacc gccgacggcc cgaccggcaa ggccggcgaa 720

ccggtactcg accccaccac cggccagccc gcctacgaca ccgtgaacaa atggaacagc 780

ggcaccgtgc gcataccggg cgtatcgggc ggcgcgatgc acctgacttc cggccccaat 840

accctgagtg ccgagatcta cctggcggcg gcggccacca tcctgcggcc actcaccagc 900

agccagaacc agcagagcct gatctgctgc gcgcaatacg ggcagaacta ccgcaactcc 960

gacccgcata tcgggttctc cgcgaaccag gcggcggtca acaacctgat ctcgttgacc 1020

aaccctatcg gcctgtacct gcagcaaccc aagtccttca gcacctggaa gggcccgcaa 1080

ggccaggatg tcagcagcta ctggcgcgtt acccgtggca ccgccggcac cggcccgaac 1140

aactccgacc agattctcca ggcggtcttc gaggtgccgg ccagcgcggg gttctcgatc 1200

aatgagatca ccatcaacgg cacgccgatc gactacgtgt gggtgatcgc caacgaactg 1260

aacgtggccc tcagcgtgac ccctgcgccg ctcacggccc agcccaagga gtgtgcctgc 1320

gtggcggcca acaccaccga tgcgcaaccc tggcccgtgc agttgctgcc gattgacctg 1380

ttctacggcc aatcccccag cgacttgccg gccagttttg cccccggcag ctcaggccag 1440

ttcgtattgg tggtacaagg cgccgacccg aacaccacgg cggcggatgc acgggtgcag 1500

ttctccaacc cgggcatcac ggcccaggtc acgcagttcc tgccggatgc ctcggcgatt 1560

cccggccaga ccgacggcgg cggcacccag ggctacatca tgaccatcac cgtcagcagc 1620

aacgcggcgc cggggctggt cagtgtgcgt gcgctgaacc ccagcgaagc ggccaacccg 1680

agtgcctccg agcacccctg ggaaagcggc ctggccctgg tgcccagcgc ctga 1734

<210> 143

<211> 1587

<212> ДНК

<213> Pseudomonas poae

<400> 143

atgaacggat ggcttcgccc gctgcgccgg gcacgcttgc gtattgcctg cgcaatcacc 60

tgcacccttc tcccactgct ggccgccaca ccggccaatg ccgcctcgga cgcccagagc 120

tgcgtcagcc agctggtgtt cgatcccacc agcggcggct tcctgccggt gaacaatttc 180

ggcaccgagc aggcttttct caattgtttc ggctggcagt tgttcatcgc catgaactgg 240

ccggtcaatc ccggctggcc ggccaaccca agcctggccg gtgagccgga cacccaaagc 300

agcgcggccc agttcggcgt gccgccaacc cccggccaac cgatgagcaa tgccccggtg 360

tgggccagct acaaggatgc cagcgaaatc ttcctgcccg gcgcggccaa gccgtccggc 420

tggggcgtgg aaaccctggt gccgtccaat tgcaccgcca ccggcaacct caaggcgttt 480

gccacggggg cgcgtaaatt catcaccgcc acctcggaaa gcgcgatcaa ccgcaagcac 540

cgcttccacc tgtccagcgg cacccaggtg accctgccgg attcgatcat ggaagcgtcc 600

ggcggctggc tcacggacca gtcgggcaac ctggtgtttt tcgagcgcaa ggtgggcaag 660

gccgagttcg actacatcgt cgacaacggt ttgtacgacg ccgccaacca actgatcgtg 720

gcgcaaaaca gcgacaaccg acaccccgcc ggcctgtcac tgccggccgg caagccggtg 780

cgcgagctgc cagccaaggc gctaccccag gaggagctgg gtgccctgga actcaaggcg 840

gcctggcgcg tgctcaccaa caagcccgac ttgtacgggc gctacctgac caccgtggcc 900

tggctgcaac gcccggacac gctgcaatgc acccaggaag tgataggcct ggtagggctg 960

catatcatca acaagaccca gacccagccg aacttcatct ggaccacctt cgagcagatc 1020

gacaacgtgc ccgatggcgg cgccgcccca ccccagggct acagcttcaa caaccccgag 1080

tgcaccggcg atgcctgcgc gccaaacgtc gcccgcgtgc agtgcgacgc cacccacacg 1140

ccgcccgact gcacgcccct ggaccagccg gtgcaggcca cccggctcaa cgccacgccc 1200

caggacatgc aggcgctgaa cacggcggtg cagcagacct tcgcccagca gacccagggc 1260

cagtcggtgt tccagtacta caaactggtg aacgtgctgt ggtccaagac gcccaacgcc 1320

cccaacgatc caggccctgg gccgaacgtg aaggtgccgc tgtcctatgg gccgtttgtc 1380

agcgaccaga gtgtcgtggt cgccaacacc acgatggaaa cctacgtgca gacagacaac 1440

tgcaatgact gccaccagta cgcggcgatt gccggcaaat ccgggctggc gtcggacttc 1500

tcgttcctgt tcggcaatgc cgactcggcg aaaaatacgc ggctgatcaa acgcatcgag 1560

tcgttcaaga ccctcaagga caacccg 1587

<210> 144

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробные сообщества лубоеда сосны горной

<400> 144

atgagcacgc ccttcaccca attcacctcc cctgccgaac aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggagaacca actgcccacc ttcgaaacca actggaacaa caacgtcacc 120

ggctggaccc agatgtcggt gatcggcaac ccgtggtcca acctcaacga cgcaccgcgc 180

tcgggctact acaacccgct ggagagcggc tacggcacgc agacgccagt gaccatcacc 240

tggcagccct tccccaatcg gctgtggacg ttcttctaca acaacggcgc cgccgtggtc 300

ccgcaactgg gcggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tgcagttgac tgaccatggc 360

cagatcaccc tgaacaacac cctctattcg ctgtacccgg accccaaggc aacccaactg 420

cagatcccca gcgtgctgtg caagtccatc aactggaacg gtccttacgc cgacttttca 480

ccctcgggcc cacggggctg gctggatgaa tactgcgagt ggtcgatcac ccgcgatccc 540

gacggcaaca tgcgcagcat catgttcacc agcgagaacc cggcgtactt cctgaccatg 600

tggaacatcg atccgcaggc cgtgctgggg ttgtacaagg cgtatgtcga cccgcaagtg 660

aagatcgaag acctgtacct gcgctacacc gccaacggcc cgaccggcca ggccggcgaa 720

ccggtgctcg accccaccac cggccagccc gcctatgaca cggtgaacaa atggaacagc 780

ggcaccgtgc gtatcccagg ggtgtcgggc ggcgccatgc acctgacctc cgggcccaat 840

accctgagtg ctgagatcta cctggcggcg gccgccacta tcctgcggcc gctcaacagc 900

agccgtaacc agcagagcct gatctgctgc gcgcagtacg ggcagaacta tcgcaactcc 960

gacccgcata tcggcttttc cgccaaccag gcggcggtca acaacctgat ctcattgacc 1020

aaccccatcg gcctgtacct gcaacagccg aaatccttca gcacctggaa aggcccgcaa 1080

ggccaggatg tcagcagcta ctggcgcgtc acccgtggca cggccggcac cggtccaaac 1140

aactccgacc agatcctgca ggcggtgttc gaggtgccac aaagcgcggg gttctcgatc 1200

aatgacatta ccatcaacgg cacgccgatc gactacgtgt gggtgatcgc caatgaattg 1260

aatgtggccc tgagcgtcac cccggcgccg ctccccgcac cgcccaagga atgcgattgc 1320

gtggcggcca acaacaccga tgcgcaaccc tggccggtgc agttgctgcc gatcgacctg 1380

ttctacggcc agtctcccag cgacttgccg gccagctttg cccccggcag ttccggccag 1440

ttcgtgctgg tggtgcaagg cgccgacccg aacaccacgg cggcggatgc gcgggtgcag 1500

ttttccaacc cagggattac cgcccaggtc acccagttct tgccggatgc gtcggccatt 1560

ccagggcaga ccgacagcgg cggcacccag ggctacatca tgacggtcac cgtcagcagc 1620

aacgcggcac cggggctggt cagcgtgcgt gcgctgaacc ccagcgaagg cgccaacccg 1680

agtgccaccc agcacccatg ggaaagcggc ctggccctgg tgcccgacgc ctga 1734

<210> 145

<211> 1590

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробные сообщества лубоеда сосны горной

<400> 145

atgaacggat ggcttcgccc gctgcgtcgg gcacgcttgc gtgtgttctg ctggatcacc 60

tgcgcccttc tcccactgct ggccccgtca ccggccaatg cggctaccga tgcccagagc 120

tgcgtcagcc agctggtgtt cgaccccacc agcggcggct tcctgccggt gaataacttc 180

ggcaccgagc aggactttct caattgtttc ggctggcagc tgttcatcgc catgaactgg 240

cccgtcaacc ctggctggcc ggccaacgcg agcctggccg gcgagccgga cacccaaagc 300

agcgtggccc aattcggcgt gccggcaaca cccggccagc caatgagcaa cgccccggtg 360

tgggccagct ataaggatgc cagcgagatc ttcctgcctg gtgcgcccaa accctctggc 420

tggggcttgg aaaccctggt gccgtccaat tgcaccgcca gcggcaacct caaggcctat 480

gccaccggcg cacgtaagtt catcaccgcc acctcggaaa gcgcgatcaa ccgcaagcac 540

cgtttccacc tgtccagcgg cacccaggtg accctgccgg actcgatcat ggaagcctcc 600

ggcggctggc tgacggacca gtcgggcaac ctggtgtttt tcgagcgcaa ggtcggcaaa 660

gccgagttcg actacatcgt cgataacggg ctgtacgacg ctgccaacca attgatcgtg 720

gcgcagaaca gcgacaaccg gcaccccgcc gggctgtcct tgcccgccgg caaactggtg 780

cgtgaactgc cagcccaggc actgccccaa gaggaattgg gcgccctgga gctgaaggcg 840

gcctggcgcg tactcaccaa caagcccgaa ttgtacgggc gctacctgac caccgtcgcg 900

tggctgcaac gcccggacac gctgcagtgc acccaggaag tggtgggcct ggtgggcctg 960

catatcatca acaagaccca gacccagccg aacttcatct ggaccacctt cgagcaggtc 1020

gacaacgtgc ccgacgccgg cccgacaccg ccccaaggct acagcttcaa caacccggca 1080

tgcagcggca ctgcctgcac gcccaacgtc gcccgcgtgc agtgcgacgc cacccacgcc 1140

ccgcccaact gcacgcccct ggatcagccg gtgcaggcca cgcgggtcaa tgccacgccc 1200

caggacctgc aggccttgaa tacggctgta cagcaaacct tcgcccagaa aacccagggc 1260

cagtcggtgt tccagtacta caaactggtg aatgtgctgt ggtccaagac gcccaatgcg 1320

cccaacgatc caggccctgg gcccaacgtg aaaacgccgc tgtcctacgg gccgtttgtc 1380

agcgaccaga gcgtcgtcgt cgccaatacc acgatggaaa cctacgtgca ggcagacaac 1440

tgcaacgact gtcaccagta cgcggcgatt gccggcaagt cgggcctggc atcagacttt 1500

tcgttcctgt tcggcaatgc cgattcggcg aagaacaccc gcctgatcaa acgcatcgag 1560

gggttcaaga ccctcaagga tgatcaatag 1590

<210> 146

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas trivialis

<400> 146

atgagcacgc ccttcaccca attcacctcc cctgccgaac aagcgcccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaggacca gctatcgacc ttcgaaacca attggaacaa caacgtcacc 120

ggctggaccc aaatgtcggt catcggcaac ccctggtcga acctcaatga cgcaccgcgt 180

tcgggctact acaacccgct ggaaagcggc tacggcacgc agacaccgct gaccattacc 240

tggcagccct tccccaatcg actgtggacg tttttctaca acaatggcgc cgccgtggtt 300

ccgcaactgg gcggcacggc catgaccctg gaccaggtga tgcagttgac cgatcacggc 360

cagatcaccc ttaacaacac gctttattcg ctgtacccgg acccggcggc aacccaactg 420

cagatcccca aagtgttgtg caagtccatc aactggcacg gcccctatgc cgatttttcg 480

ccctcgggtc cacggggctg gctggatgag tattgcgagt ggtccatcac ccgcgacccc 540

gacggcaaca tgcgcagcat catgttcacc agcgagaacc cggcctactt cctgaccatg 600

tggaacatcg acccaaatgc cgtgctgggg ctgtaccagg cgtacgtcga cccgcaggtg 660

aaactcgaag acctgtacct gcgctacacc gccaacggcc cgaccggcaa tgccggtgac 720

ccggtgatcg atgaaaccac cgggcggccc gcctatgaca ccgtcaacaa atggaacgcc 780

ggcaccgtgc gtataccggg cgtctcaggc ggcgcgatgc acctgacctc cgggcccaac 840

accctgagtg ccgagatcta cctggcggcc gcggctacca tccttcggcc gatccaaagc 900

agcggcaacc aacagaacct gatctgttgc gctcaatacg ggcagaacta tcgcaactcc 960

gacccgcata tcggcttttc cgccaaccag gctgcggtta aaaacctgat ctcgttgacc 1020

aatcccatcg gcctgtacct gcaacagccg aaatccttca gcacctggaa aggccctcaa 1080

ggccaggatg tgagcagcta ctggcgcgtc acccgtggca ctgccggcac cggcccgaac 1140

aactccgacc agatcttgca ggcggtgttc gaggtgccgc aaagcgcggg gttctcgatc 1200

aatgacatca ccatcaacgg cacaccgatc gactacgtgt gggtgattgc caacgaattg 1260

aatgtcgcct tgagcgtgac gccagcaccg ttgaccgcca cgcccaagga atgcgattgc 1320

gtggccgcca ataacaccga tgcccaaccc tggcccgtgc aactgctgcc attggacctg 1380

ttctacggcc agtcacccag tgacttgccg gccagttttg cacccggcag ctcagctcag 1440

ttcgtgctgg tggtgcaagg ggcagacccg aacaccaccg tggcggatgc gcgggtgcag 1500

ttttccaacc cggggatcag cgcccaggtc acgcagttct tgccggatgc ctcggcgatt 1560

cccgggcaga ccgacagtgg cggcacgcaa ggctacgtca tgaccgtcaa cgtcagcggc 1620

aacgctgcgc cggggctggt cagcgtgcgg gcgctgaacc ccagcgaagc cgccaacccc 1680

agcgcggccc aacacccatg ggaaagcggc cttgcgctgg tgccaggcgc ctga 1734

<210> 147

<211> 1587

<212> ДНК

<213> Pseudomonas trivialis

<400> 147

atgtacggat ggcctcgccc gctgtgtcgg gctcgcttga atgttttctc gttactggcc 60

ggcgccctgc tgtcactggt ggcgccgcca ccggccagcg cttcggacgc gcagacctgc 120

gtccagcaac tggtgttcga ccccgcaagt gggggcttcc tgccggtgaa caatttcggc 180

accgagcagg actttctcaa ttgtttcggc tggcaactgt tcatcgccat gaactggccg 240

gtcaatcccg gctggccggc cgacccgacc ctggcgggcg agccagacac gcaaagcagc 300

gctgcacagt tcggcgtgcc gcaaacgccc ggcaagccga tgagcaacgc gccggtgtgg 360

gccagctaca aggacgccaa cgacattttc ctgcccggtg cacccaaacc gaccggctgg 420

ggcgtggaaa ccctggtgcc gtccaattgc accgccaccg gcaacctgaa agcgctctcc 480

accggcgcgc gcaaattcat taccgccacg tcggaaagcg cgatcaaccg caagcaccgc 540

ttccacctgt ccagcggcac ccaggtgacc ctgcccgatt cgatcatgga agccgccggc 600

ggctggctga cggaccagtc gggcaacctg gtgtttttcg agcgcaaggt cggcaaggcc 660

gagttcgact acatcgtcaa taacggcttg tacgacgccg ccaatcaatt gatcgtggcg 720

cagaacagcg acaaccgaca ccccgccggc ctgtcgttgc ctgcgggcaa gctggtgcgt 780

gagctgccgg ccaaggcgct gccccaggaa gagttgggcg ccctggaact caaggcggcc 840

tggcgcgtcc tcacccacaa acccgagctg tacgcacgct acctgaccac cgtcgcctgg 900

ctgcaacgcc ctgacacgct gcaatgcacc caggaagtcg tgggtctggt gggcctgcat 960

atcatcaaca agacccagac ccagccgaac ttcatctgga ccacgttcga gcaggtcgac 1020

aacgtgcctg acggcggcgc tacaccgccg cagggctaca gcttcaacaa cccggcctgc 1080

accggtgatg cctgcacacc caacgtcgcc cgcgtgcaat gtgacgccac ccacacgccg 1140

cccaactgca cgccatttaa ccaaccggta caggccacac gggccaatgc cacgcctgag 1200

gacatgcaag cgttaaacac ggcggtgcag cagaccttcg cccagcagac ccagggccaa 1260

tcagtgttcc agtactacaa actggtgaac gtgctgtggt ctaaaacgcc caacgcacct 1320

aacgatccag gccctgggcc gaacgtgaag acgccgctgt cctatgggcc gtttgtcagc 1380

gatcaaagtg ttgccgtcgc caataccacc ctggaaacct atgtgcagac agagaactgc 1440

aacgactgcc accagtacgc ggccattgcc ggtggttcca aattggcgtc ggacttctcc 1500

ttcctgttcg gcagcgccga ctccgcgaag aacactcgcc tgatcaaacg catcgaggcg 1560

ttcaagaccc tcaaggatga tcattag 1587

<210> 148

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. R81

<400> 148

atgagcacgc ccttcaccca attcacctcg cctgccgagc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaaaacca gctgccgacc ttcgaaaccg actggaacaa caacgtcacc 120

ggctggaccc agatgtcggt gatcggcaac ccctggtcca acctcaatga cgcaccgcgt 180

tcgggctatt acaacccgct ggacagcgga tacggcacgc agacgccagt gaccatcacc 240

tggcagccct tccccaaccg gctgtggacg tttttctaca acgacggcgc cgccgtggtc 300

ccacaattgg gcggcaaggc catgaccctt gaccaggtga tgcagttgac cgaccacggt 360

cagatcacgc tcaacaacac cctgtattcg ctgtacccgg acccgaaagc gacccagctg 420

cagatcccca gcgtgctgtg caagtccatc aactggaacg gcccctacgc tgacttttca 480

ccctcgggcc cacggggctg gctggatgaa tattgcgagt ggtcgatcac ccgcgacccc 540

gacggcaaca tgcgcagcat catgttcacc agcgagaacc cggcctattt cctgaccatg 600

tggaacatcg acccgcaggc cgtgctcggg ctgtacaaag cgtacgtcga cccgcaagtg 660

aagatcgaag acctgtacct gcgctacacc gccaacggcc cgaccggcaa ggccggcgag 720

ccggtgcttg acccgaccac cggccagccc gcctacgaca ccgtgaacaa atggaacagc 780

ggcactgtgc gtataccggg cgtgtcgggc ggcgcgatgc acctgacctc cggccccaat 840

accttgagtg ccgagatcta cctcgcggcc gcggccacca tcctgcggcc gatcaagagc 900

agcgccaacc aacagagcct gatctgctgc gcccaatacg ggcagaacta ccgcaactcc 960

gatccgcata tcggtttctc cgctaaccag gaagccgtca aagccctgat ttcactgacc 1020

aaccccatcg gcctgtacct gcaacaaccg aaatccttca gcacctggaa aggccctcaa 1080

ggccaggatg tcagcagcta ctggcatgtc acccgaggca ctgctggcac cgggccgaac 1140

aagtccgacc agatcctgca agccgtcttc gaggtgcccc aaagcgcggg gttctcgatc 1200

aacgaaatca ccatcaacgg cacgccgatt gattacgtgt gggtgatcgc caacgagctg 1260

agtgtggccc tcagcgtcac cccggcaccg ctcaccgcca cgcccgagga atgcgattgc 1320

gtagcggcga acaccaccga tgcgcaaccc tggccggtgc agttgctgcc gattgacctg 1380

ttctacggac agtcccccag cgacttgccg gccagctttg cccccggcag ctcaggccag 1440

ttcgtgctgg tggtgcaagg ggccgatccg aataccactg cggcggatgc gcgggtgcag 1500

ttttccaatc cagggatcac tgcccaggtc acggaattcc tgccggatgc ctcggcgatt 1560

ccagggcaga ccgacagcgg cggcacccag ggctacatca tgaccgtcac cgtcagcagc 1620

aacgcggtgc cggggctggt cagcgtgcgc gcgcttaacc ccagcgaagc cgccaacccc 1680

agcgccaccc agcacccgtg ggaaagcggc ctggcgctgg tgcctggcgt ctga 1734

<210> 149

<211> 1587

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. R81

<400> 149

atgaacaaat ggcttcgccc gctgcgtcgg gcacgcttga gtgtgttgtg ctggataccc 60

tgcgcccttc tccccctcgc ccccgcaccg gccattgcgg cctcggacgc ccagagctgc 120

gtcagtcaac tggtgttcga tcccaccagc ggcggcttcc tgccggtcaa caactttggc 180

accgagcagg actttctcaa ttgtttcggc tggcagttgt tcatcgccat gaactggccg 240

gtcaatcccg gctggccagc cgacccgagc ctggccggtg agccggacac gcaaagcacc 300

gcggcccagt tcggcgtacc gccaacgtcc ggccagccca tgggcaatgc cccggtgtgg 360

gccagctaca aggatgccag cgagatcttc ctgcccggcg cccccaaacc ctcgggttgg 420

ggcgtggaaa ccctggtgcc gtccaattgc accgccaccg gcaacctcaa ggcgtttgcc 480

acgggcgcgc gtaaattcat ggcggccacg tctgaaagcg cgatcaaccg caagcaccgt 540

ttccatttgt ccagcggcac ccaggtgacc ttgccggact cgatcatgga ggcttccggt 600

ggctggctta cggaccagtc gggcaacctg gtgtttttcg agcgcaaggt cggcaaggcc 660

gagttcgatt acatcgtcga taacgggctg tacgacgccg ccaaccaact gatcgtggcg 720

cagaacagcg acaaccggca ccccgccggc ctgtcattgc ccgccggcaa actggtgcgc 780

gagctgccgg ccaaagctct gccccaggaa gaactcggcg ccctggaact caaggcggcc 840

tggcgcgtac tcaccaacaa accccagctg tacgggcgtt atctgaccac cgtcgcctgg 900

ctgcagcgcc ccgacacgct gcagtgcacc caggaagtgg tggggctggt gggcttgcac 960

atcatcaaca agacccagac tcagccgaac ttcatctgga ccaccttcga gcaggtcgac 1020

aacgtgccgg acaacggcac ggctgcgccc gagggctaca gtttcaacaa cccgacctgc 1080

accggtgatg cctgcacgcc caacgtcgca cgggtgcaat gcgatgccac ccacacgccg 1140

cccgactgca cgccccttga tcagccggtg caggccacgc gggtcaatgc cacgccccag 1200

gacctgcaga tgctgaacac cgctgtgcag cagaccttcg cccaaaagac ccagggccaa 1260

tcggtgttcc agtactacaa actggtgaat gtgctgtggt ccaaaacgcc taacgcgccc 1320

aacgatccgg gccctgggcc caacgtgaag gtgccgctgt cctatggacc gtttgtcagc 1380

gaccagagtg tcgtcgtcgc caacaccacc ctcgaaacct acgtgcaaaa caagaactgc 1440

aacgactgcc accagtacgc ggcgattgcc ggcacctccc aactgacatc ggacttctcc 1500

ttcctgtttg gtaatgccga ttcggcgaag aacgcgcgcc tgatcaaacg catcgaggcg 1560

ttcaagaccc tcaaggacag cccgtaa 1587

<210> 150

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas libanensis

<400> 150

atgagcacgc ccttcaccca attcacctcc ccggccgaac aagcccccaa ggactacaac 60

aagctaggcc tggaaaacca gttgccgacc ttcgaaaccg actggaacaa caacgtcacc 120

ggctggaccc agatgtcggt gatcggcaac ccctggtcca acctcaacga cgcaccacgc 180

tcgggctact acaacccgat cgaaagcggc tacggcacac agacgccagt gaccatcacc 240

tggcagccct tccccaaccg gctgtggacg tttttctata acaatggcgc cgccgtggtc 300

ccgcaactgg gtggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tgcagttgac cgatcacggc 360

cagatcaccc tcaacaacac cctgtattcg ctctacccgg acccgaaggc gacccaactg 420

cagatcccca gcgtgctgtg caagtccatc aactggaacg gcccctacgc cgacttttca 480

ccttcgggcc caaggggctg gctggatgaa tactgcgagt ggtcgatcac ccgcgacccc 540

gacggcaaca tgcgcagcat catgttcacc agcgagaacc cggcgtattt cctgaccatg 600

tggaacatcg acccgcaggc cgtgctgggg ctgtacaaag cctatgtcga cccacaagtg 660

aagatcgaag acctgtacct gcgctacacc gccaacggcc cgaccggcaa ggccggtgac 720

ccggtgcttg accccaccac cggccagccc gcctacgaca ccgtgaacaa atggaattcc 780

ggcaccgtgc gtattcccgg cgtatcgggc ggcgcgatgc acctgacctc cggccccaat 840

accttgagtg ccgaaatcta cctggcagcg gcggcgacta tcttgcgccc gctcaacagc 900

agccgtaacc agcaaagcct gatctgctgc gcccagtacg ggcagaacta ccgcaactcc 960

gatccgcata tcggttattc cgccaaccag gaagccgtga aagccctgat ttccttgacc 1020

aaccccatcg gcctgtacct gcaacaaccc aagtccttca gcacctggaa aggcccgcaa 1080

ggccaggacg tgagcagcta ctggcgcatc acccgtggca ccgccggcac cgggccgaac 1140

aactccgacc agattctgca ggcggtgttc gaggtgccgg ccagcgcggg gttctcgatc 1200

aatgacatca ccatcaacgg cacgccgatt gactacgtgt gggtgatcgc caacgagctg 1260

aatgtggcct tgagcgtcac cccggcaccg ctcagcggca cgcccaagga gtgcgattgc 1320

gtggcggcca acaataccga tgcgcaaccc tggcccgtgc agttgctgcc gattgacctg 1380

ttctacggcc aatcccccag cgacttgccg gccagctttg cgcccggcag ctcaggccag 1440

ttcgtgctgg tggtgcaagg cgccgacccg aacaccacgg cggcggatgc acgggtgcag 1500

ttctccaacc caggcatcac ggcccaggtc acgcagtttc tgccggatgc ttcggcgatt 1560

cctgggcaga ccgacagcgg cggcacccag ggctacatca tgaccgtcac cgtcagcagc 1620

aacgcggcgc cggggctggt cagcgtgcgc gcgctgaacc ccagcgaagc cgccaacccc 1680

agcgccaccc agcacccatg ggaaagtggc ctggcgctgg tgcccgtcgc ctga 1734

<210> 151

<211> 1587

<212> ДНК

<213> Pseudomonas libanensis

<400> 151

atgaacggat ggcttcgccc gctgcgccgg gcacgcttga atgtgttgtg ctggatcacc 60

tgcgcccttc tccccttcgc acccgcaccg gtcagcgcgg cgtcagatgc ccagagctgc 120

gtcagtcagt tggtgttcga ccccaccagc ggcggcttcc tgccggtgaa caacttcggc 180

accgagcagg actttctcaa ctgtttcggc tggcagttgt tcatcgccat gaactggccg 240

gtcaaccccg gctggccagc caacccgagc ctggccgggg agccggacac gcaaagcacc 300

gcggcccagt tcggcgtgcc gccaacgccc ggccagccca tgagcaatgc cccggtgtgg 360

gccagctaca aggatgccag cgagatcttc ctgcccgggg cgcccaagcc ctccggctgg 420

ggcgtggaaa cccgggtgcc gtccaattgc accgccaccg gcaacctcaa ggcgttttcc 480

acgggcgcgc gtaaattcat cacggccact tccgaaagcg cgatcaaccg caaacaccgc 540

ttccacttgt ccagcggcac ccaggtgacc ttgccggatt cgatcatgga ggcttccggc 600

ggctggctca cggaccagtc gggcaacctg gtgtttttcg agcgcaaggt cggcaaggcc 660

gagttcgact acatcgtcga caacgggctg tacgacgccg ccaaccaact gatcgtggcg 720

cagaacagcg acaaccggca cccggccggc ctgtcactgc cggccggcaa actggtgcgc 780

gagctgccgg cccaggcgct gccccaggaa gaactcggcg ccctggaact caaggcggcc 840

tggcgcgtac tcaccaacaa acccgagctg tacgggcgtt acctgaccac cgtcgcctgg 900

ctgcaacgcc cggatacgct gcaatgcacc caggaagtgg tgggcctggt gggcctgcac 960

atcatcaaca agacccagac ccagccgaac ttcatctgga ccaccttcga gcaggtcgac 1020

aacgtgcccg acggcggcgc caccccgccc ggcggctaca gcttcaacaa cccggcctgc 1080

accggtgaca cgtgcacgcc caacgtcgca cgggtgcagt gcgatgccac ccacacaccg 1140

cccaactgca cgccccttga tcagccggtg caggccacgc gggtcaatgc cacgcctcag 1200

gacatgcaag cgctgaacac ggcggtgcag cagactttcg cgcagaagac ccagggccag 1260

tcggtgttcc agtactacaa actggtgaat gtgctgtggt ccaagacgcc caacgcgccc 1320

aacgatccag gccctgggcc caacgtgaag gtgccgctgt cctatgggcc gtttgtcagc 1380

gaccagagtg tcgtcgtcgc caacaccacg atggaaacct atgtgcagag cgacaactgc 1440

aacgactgcc atcagtacgc gacgattgcc ggcgggtcca aactggcgtc ggatttctcg 1500

ttcctgttcg gcaatgccga ctccgcgaaa aatacgcgcc tgatcaaacg catcgaggcg 1560

ttcaagaccc tcaaggacaa tccgtag 1587

<210> 152

<211> 1731

<212> ДНК

<213> Pseudomonas asplenii

<400> 152

atgagcatcc cgttcacacg attcagccca cccgccaatc aggctcagaa ggactaccag 60

aaactgggcc tggaacagca acaagcgcaa ttcgataccg actggagcaa caatctagca 120

ggctggaccg aagcagcaat cattggcaac ccatggaccg gcctgaacga cgcaccgcgc 180

acgggatact tcaacccgct gatttcgggc tttggtgatg cccctccagc ggtcatcgac 240

tggacgccgt tccccaatcg actgattacc tacctcacgc aagccgactc ggcaaaaaac 300

ccacaactgg gtggcaagcc actgaccatg gaccaggtca tgcaactggc cgataccggc 360

gaaatcgata tcaatggtac cccgctcaaa ctctacgacc cgctaggcag caacaccctg 420

cagttgcctt ccattcgctg cccccagatc gactggaccg gcccctacgc ggccttcacc 480

ccgtccggcc cacgcggatg gctggacgaa tactgcgagt ggtcgatcac cctcgacgcc 540

aacggcaaca tgcgcagtgt gatgttcacc tgcgagaacc cggcctacta cctgaccatg 600

tggcgcatcg accccaaggc ggtgttaggc ctgtaccgaa tgtacatcga ctcggccgtg 660

cagttggaag acctgtacct gcgctacccg gtcgaccagc cgaccggcaa gcagggcgaa 720

ccggtgatcg accctaccac tgggctgccc gcatacgacg tgaccaacaa gtggaactcg 780

ggtaccgcgc gcaagcccgg cctgtttgga ggtgccctgc accttacttc cgcccccaac 840

accctcagcg ccgagatcta cctggcgggt gcttcgacca tccagcgctc ggataagagt 900

agtgaaaccc cacagacgct gatctgctgc gctaagtacg ggcggaacta ccgtaactcc 960

gacccgcaca tcggctacgt cgccaacggg atagcctacg gcaaccgcat ttccctgacc 1020

gacccagtcg gtctgtacct gcaacagccc aagaacttca gcaaatggaa agacccgcag 1080

ggcaatagcg tcagccagta ctggcagatc acccgtggca ccgccggaac cgggccactg 1140

ggctccgacc agatcctgca tgccgtattc gaagtgcctg agcaggcagg tttctcgatc 1200

aacgacatta ccattgacgg tcagaagatc acccatgtcg gggtgatcgc caaccagatg 1260

aaggtcgccc tatcggcctc gcctctggac gccatcaagc ccgtcatcca gccttgcgtg 1320

acagaccgca gcacggggct gcagccatgt ccggttcaac tactgccgct ctcgctgttc 1380

tacggtctct cgcccagcga tctacccgcc tggctagcgc cgagcagcag caaccagttc 1440

atcctccttg tacagggttc ggatgctgcc accaccgctg ccaatgcgcg tatccagttc 1500

tccaacccgg gcgtgaaagc acaggtcatt gagttccaga ccaacgccac gccaattgcg 1560

ggcacgaccg acaacagcgg tacccagggc tacatcatca ccatcactgt ggcggccaat 1620

gctgcaccgg gcctggtgca gctgcgggtg ctcaaccccg acgagccggt caatccaagc 1680

gataccgatc acccatgggc cagttcactg gcgatcgtgc cagcgcttta g 1731

<210> 153

<211> 1557

<212> ДНК

<213> Pseudomonas asplenii

<400> 153

atgttctcac tcgattgttc ccgggggaat ggccggttct gcctgcctcc cttgttactg 60

atcatttggc tgctcggcag cctggtcgcc cgaaacgcct atgcgctatc cgaccccgaa 120

acaccggccc aatgcgtgca gcagttggtg ttcgacccaa ccaacggcag cttcctgacc 180

agcgacaccc cctttgtagc tcaacaggcc accttcaact gctatgcctg gcagatgttc 240

atcgccatga actggccggt gaacccgggc tggcccaccc acccagagct ggcgggcgaa 300

cccgatacca aaagcccggc cgcccagttc ggtgtgccga cgatagcgga ccagcccatg 360

agcgttgcac cggtctgggc cagctacaag gacgccaacg acatcttcct gcacggcgcg 420

gccattccta ccgcctgggg catgcagccc cctgagccgg tcggctgcca gacaaaaccc 480

tcgcttctgt ccctgcgggt cggggcacgc aagttcatga ccgccacctc agagagcgcg 540

gtgaacgcca aacatcgttt ccacctgtcc agcagtaccc tggtgaccgc ctccgacccg 600

accctggaag ccaccggcgg ctggctaacc gatcaggccg gtaagctggt ctatttcgag 660

cgcaaggtgg gaaaggccga gttcgactat atcgtaagca atgaactgta tgacgcggct 720

aaccagttgc aggtggcgaa gaaccagggg ctgtccctac ccgccggggc gcattttcgc 780

agcccgccga cgtcacccat tgcgcaggaa aaactcggcg catttgaact taaggcagcg 840

tggcgcatcc tcaccgacaa accccagctg tacgaccgtt acctgaccac cgtcacctgg 900

ctgaaacacc cggaaaccgg ccagtgcaca caggaagtgg taggcctagt ggggctgcat 960

atcattcaca agaccgccag ccaaccggac ttcatatgga ccacgtttga acacgtggac 1020

aacgtgccag atggcggttc tacacccacc gctggctata cgttcaacaa ccccaagtgc 1080

accggccctg attgcacgcc aaatcaacgg cgcatcactt gcacggcctt gggctgcaaa 1140

gacaactatc cccgcaacga gccggtgcag gttacccgtg aagattcagt acccagcact 1200

atcaacgacc tcaacactgt cgtgcagcaa gccatctcca ccaagaccgc cggtaagtcg 1260

gtgttccagt actacaaact ggtcaatgtg ctgtgggacg cctcaccaca cataccggac 1320

ccagaacccg gcgccaatgc aacagtgccg ctggtctacg gcagcttcag cagcgacggc 1380

aacaacacac ccgtgtccaa taccaccatg gagacctaca tccagaacag gtcgtgcgac 1440

ttctgccaca ggaatgccaa ggtagcgggg agcaagagcc tgacctcgga cttttcgttc 1500

ctgttcgaga gtgccgactc gtccaagata ccgacactga tcaagaagat gccctag 1557

<210> 154

<211> 1743

<212> ДНК

<213> Thalassospira xiamenensis

<400> 154

atgagcacac cctttgccag atttacgtcg cccgcccatc aggcacccaa ggattacaaa 60

aagcttggta tggaaaacga actgtcggct tttgaaaccg attggaacaa taatgttgcc 120

ggttggaccg agatggcgat cattggtgat ccgtggtcga acctgaatga tgcaccacgg 180

gcggattact ataacccgct gaccgaggga tttggtgaag ccggtgacgc agtcatcagt 240

tggaccccgt tcccgaaccg cttgatcgcc tttctgaccc cacccgaggc atccaacaac 300

ccgcaactgc atcgaccatt gaccatggat gaggttatga gccttgccga tagtggcgag 360

atcaccgtcg atggcacgct ttacaagctc tatgatccga gcggttcggc tccgatcctg 420

aaaatcccgg ccaaacggtg tccggagatc gactggaccg gggaatacgt tgatttctcg 480

ccatccggcc cacgtggctg gcttgatgaa tattgtgaat ggtcgattac ctatgatgcg 540

tcgggcagca agatgcaaag cgtcatgttt acctgcgaaa acccggccta ttacctgacg 600

atgtggcgga tcaatcccga ggcggtcctt ggcctttatc agatgtatgt tgatccggcg 660

gtcaagcttg aagaccttta tttgcgttac acggttgatc agccgaccgg taaaaaaggc 720

gatcctgtca tggatccgac caccggacgt ccggcctatg acgtgaccaa caagtggaac 780

cgcggcacgg tgcgggttcc cggccagtcg ggcggggcgc tgcatctgac gtcaggcccc 840

aatacgctga gtgctgaaat ttaccttgcc gcggcggcaa ccattcagcg tccggattta 900

agcagccgcg atccgcaaag cctgatttgt tgtgcgcaat acggtcagaa ctatcgtaat 960

tccgatccgc atatcggttt catcgccaac cgggctgcgg cacgttaccg tatttcactg 1020

accgatccgg tcgggcttta tatccagcag ccccagaacc tttcgaactg gaaggggccg 1080

aatggcgagg atatcagcca gtattggaaa atcacccgtg gcacggcggg aaccggtccg 1140

aacaattcgg accagatact gcatgcggtg tttgatattc cgccaagtgc cggtttcacg 1200

atcaatgact gcacgatcaa tggtcagaag attgctcata ttggcgatat cgccaaccag 1260

atgaaaattg ccctttcggc aacgcagatg actccgaacc aaccgttgca gtcaccgatg 1320

aaatgcgttt caagccgcag cagcggcagt atgcagccct ggccggttca gtttgtgccg 1380

attgatctgt tttatgggga atctccgacc gatcttccgg cattgatggt accgggaacg 1440

gtgaatagct ttgttctgat cgtgcaggga gcggataaaa acaccacgat cgacaacgcg 1500

cggattgagt tttccaaccc cgggatcaag gccaaagtga ccaagttcct gccagatgca 1560

tcggcgattc cgggccagac cgacggcggc ggtacgcagg gcttcattat ggatgttgct 1620

gtatcgtcat cggcaaagcc gggatccgtc agtctccggg ttctgaaccc gaatgaaccg 1680

gccaatccat cggatgctga tcatccgtgg gaaagtggtt tggcggttat tcccagtcat 1740

taa 1743

<210> 155

<211> 1620

<212> ДНК

<213> Thalassospira xiamenensis

<400> 155

atgaaccgat tacatttggg ggcaggctgt gtgattgcgg ggttttgtat cctggcgatt 60

gcgggacttc tttgggtgat tgatgttccg gctggcaggg cggatgaaat caatatcagc 120

cgggtgacgg aaatagccca atcggcacag caatgcccgg atcaactggt tttcgatccg 180

acaagcgggt cgttcatgac cagtgacaat ctgttcctgc caacccagca gggtaacaat 240

tgttatgcgt ggcaaatgtt catcgcgatg aactggccgg tcagcagttc atggccggga 300

acaccatcgg ccgcaggtga gccagatcaa aacgtttcgg tggaaaattg gggggtaccg 360

gaaaatccga cctcaccctt aaccagcgta ccggtctggg gcagtttcaa ggatgcgcag 420

gcgatcttcc tgcctgatgc ggccaagccg accgattggg gcgtgccgca agccgtgccg 480

tcgggatgta aaagtgacaa gatgttgctg ggttatccgg ctggttcggc aaagatttta 540

acaacgcttt caaaaaatgc ggtcaatact gcccatcggt tccatctttc aagtggtacg 600

cgtgataccc agtccgacga gatcatggaa gccaccggcg gatggttgac agatcagaac 660

ggcaatctgg tgtttttcga acgaaaggtc ggcaaggccg agttcgatta catcatgaac 720

aatgcgcttt atgacgctgc ctatcagatg cgggtcgcaa ccaatgctga tggtcgacat 780

ccggcgggat tgtccctgcc aagtggcaag ttcctgcgtg ttccaccgac ggaaccgcaa 840

ggtcaggatg cgcttggagc gttcgagatc aaggcagcgt ggcgggtcct gacagggcaa 900

agcgacattt atgaccggta tctgacatcg gttgcatggc tgaaacgtcc tgataccggt 960

gaatgcagcc aagaagttgt cggtttggtc gggcttcata tcattcacaa gaccgataca 1020

ttccccgatc tgatctgggc aaccttcgag caggtcgaca atgtgcccga cgggcaggca 1080

actttaccgc ctggcggata ttcctttaac aacccgaatt gtaccggacc ggattgcaaa 1140

cccaatcagc cgcgcattga ctgtaacgat cagaaccagt gcaaggatct ttatccccgc 1200

gatcagcccg tacaggttac gcgcgaacag gccctaacca gtgaaatgga tacgctaaat 1260

gccggtgttg cccaaaagat cgcatcgcaa accggcggga aatcggtgtt tcagtattac 1320

aagctggtca atgtgttgtg ggatggcagc ccaagccccc cagtcatgga gcccggtgcg 1380

aatgcatcga taccgctgcg ctatggcacc tttgagtccg agggtaatct gaaagtcgcc 1440

aatacaacca tggaaaccta catccaggat caatcctgcg atttttgtca tgccaatgcg 1500

acgattgctg gcagcgatac gctagcatcg gatttctcat tcattttccg cgatgccgga 1560

tcggcgaaaa acccgtcact ggtggaagag gtaaaacaat tcatggagca ggcacaatga 1620

<210> 156

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Paracoccus denitrificans

<400> 156

atgaccatat tcacggaatt ttcgaccccc gcacagcagg gcccgaagga ttaccagctt 60

ctcggcctgc cagccgccga tctggccgcg ttcgaggcgg actggagcgc gaatatcgcc 120

ggctggaccc agatgtcgat catcggcaat ccctggtcca acctgaacga cacaccgcgc 180

gacaactact atgatccgct ggtcgagggg atgggcgagg ccacggcggc cgtcatcagc 240

tggccgccct ttccgaaccg gctgatccag ttcctaacca atcccggcat cgtcaagggc 300

gggcagttga cggcaccgct tagccaggat gcggtgcagg aactggccga tagcggccgg 360

atcacccagg gcgggacgag tttcgtgctg ttcgatccag aaccgggtca ggtattgctg 420

aagatccccg ccgaccgctg cccggccatc gattgggacg gcaagtatgt cgacttctcg 480

ccctcggggc cgcgcggctg gcaggacgaa tattgcgaat ggtcgatcct gcgcaatgcc 540

cagggaaaaa tgcagtccat cgccttcacc tgcgagaatc cggcctatta cctgaccatg 600

tggcggcaga acccgaaggc ggtgctgggc atctatcagc gctatatcga cccggcggtg 660

cagctggagg atctgttcct gcgctatgaa tacgatcagc cgacgggcaa gaagggcgat 720

ccggtccttg atccgacaac gggcaatccg gcctatgacc cgacgaacaa atggaacagg 780

ggccccgcac gggtgcccgg ttcgttcggg ggagcgatgc atctgacgtc gccgcccaat 840

acgctgtcgg cagagatcta tcttgccgcc gccgcgacga tccagcgccc ctcctcggtc 900

aatggcaatc cgcaatcgct gatctgctgc gcgcaatacg gccagaactt ccgcaactcg 960

gatcccaata tcggctatgg cgcgaatgtc gccgcgcgga ccgccaggct gacgctgacc 1020

gatccggtcg gcctctacat ccagcagccg cagaactttc agggttggag cggtccgaat 1080

ggcgaagatg tctcaggcta ttggcaaatc ctgcgcggga cggcgggcac cgggccgaac 1140

gggtccgacc agatcctgca cgcggtcttt gccatccccg aaagcgccgg ctattcgatc 1200

gaggattgca ccatctacgg cctgccgatt tcgcatgtcg gcgtcattct ggaccagatg 1260

aaggtcgcgc tggcggtcac gccgaacaat gccgccccgg acacgaccgc attcgcctgc 1320

gtgaccgacc gaaccgacgg cacacaaccc tggccggtgc agatggtgcc ggagagcctg 1380

ttctatggtg aatcaccctc ggatctgccg gcgcttctgc ggcccggaag caagttccgc 1440

tttgtcctga tcgtgcaggg ggcggatgag aacaccacgc ccgcaaccgc aagggtcgaa 1500

ttctccgatc cgaatatcac cgtcacggtc gagcagttcc tgaaaaacgc ctcggcagtg 1560

ccggggcaga ccaatggcgg cggcacgcag ggttatgtca tggacatcgc cgttggcgcg 1620

aacgcgcaac ccggtccggt ctcggttcgg gcgttgaacc cgtccgaagg gccggcgccg 1680

acgcccgagc agcacccctg ggaagcgggc cttgcggtca tctcgtctcg gtaa 1734

<210> 157

<211> 1509

<212> ДНК

<213> Paracoccus denitrificans

<400> 157

atgcgcacag gtcagatcct catcgcactg gtcgcaggcg tcatgcttgc ctttgccgca 60

tccggcggca aggcccagac cgcctgcagc gccatgctca tcaccgatcc gacctcggcc 120

gatttcctga ccggagacac gcccttcggc catacccagg acggaatgaa ctgctatgga 180

tggcagatgt tcctgtcgct gaactggccg gccgatcccg gatggccgca aacgcccgcc 240

atggccggcg agccggatcg cagcgcgaca atcgccgatt tcggcctgcc cggcccggcg 300

ggacagccga tgcagcgacc cacggtctgg caaagcttca tgccggcgcc cgagatattc 360

aagccctttg cggccatgcc gaccggctgg ggagaaacct cgccgccgcc cgccagttgc 420

ggctccgcct cgctggcagc ctcggccggg tcgatccgca tgctgaacgc ggtctccaaa 480

tccgccgtga gcccgcgtca cggcttcaac ctcgacaccg gaacgatgtc atccatatcg 540

gacgaaatcg aagaggctac gggtggctgg ctgaccgatc agaagggcaa gctggtgttt 600

ttcgaacgga tgatcggcaa ggccgaatac gactatatcg tcgcgaaggg cctgtatgac 660

gcggccaacc agttgaaagt ggcgaccaat gccgacggag ccacccccga aggcctgtcc 720

ctgcccaaag gcacgccacc gggatcggcc gttcagaacc aggatgagct tggcgccttc 780

gagctgaagg ccgcctggcg gaacctgacc gggctggatg acctttatgg ccgctatctg 840

acctccacgg tctatctgct gtatcccgac ggctcttgcg aaaaggctgt cgtcgggctg 900

gtcggtctcc atatcattca caagaccgcc tccatgccag atttcgtctg gtccaccttc 960

gagcagatcg acaatgttcc gggcgcgtcc gcgccggaag tggatttcag tttcaacaac 1020

ccggcctcga atgcgaagcc gaaccagatg ccgcactgtg tgaatggtgt ctgcgactat 1080

tccctcccca tccaggtcac gcgcgaagtc gcgatcccgg ccggtgtggc gcagaccaac 1140

cgcgacgtgc agcagttgct tgcggaccgg acggggggca agtcggtgtt ccagtactac 1200

cagctcgtga acgtgctgtg ggacggcgca ccgaccccgc cgtcaccgga acccggcgcg 1260

aatgcccagg ttccgctggt ctatggcacc ttccagacgg atggcagcgt gccggtcgcc 1320

aatacgacga tggagaccta tgcgcagcaa ttcacccccg gtctggggcc gtcctgcacc 1380

gcctgccaca agggcgccac catcgccaac agcgcaacgc tggcgtcgga tttttccttc 1440

ctgttctcga ccgcgtccag cgccacgaaa ctgccgggcc tgttcatatc ccgcgacttt 1500

gttccatga 1509

<210> 158

<211> 1743

<212> ДНК

<213> Cellvibrio japonicus

<400> 158

atgtcagcgt ttacattttc cactcctgca ttaattcagg atttcagcga caacccctcc 60

ctgcagcagc aactcaacca aaattgggat ttggcaattg atgcgtatac ccaggctgcc 120

ctggttagca atccctggac tgtggattac caggctccct gcgattggta tgtgaatccc 180

aaacaggcgg atattaccgc agctaatccg gttgaaccta ttttttggac ggcttttccc 240

aaccgcttga aaatttattt ttcggcggct gaaaaaagtc cttatcaaat ggcgaatgcg 300

caggtttttg cgctggcgga ttttggcaat gttccgcaat cgaaggcgtt tcccacaggt 360

ttgccgttta ttattcccag caagcgctgc cctaatttga attggcagca gtcgattgct 420

gagtgggtac agtacgatcc taaagggccg cgcggttggt tggatgaata ttgtgagtgg 480

tccgtgacgc gcaatgccga tggaaaaatt accaagattg cgtttacctg cgagaatccg 540

gagtactggt ttaccctgtg gcaggtttca ccggaaaaag tattggcgct ttaccagcaa 600

ttggtgagcc cgaatgtggt gctggaggat ttgcaattgc catcagccga tggcaaggga 660

tttgttatcg atccgacaac agggcgccct gcctataacc ccttgaataa atggaattcc 720

ggtacggtgg cgacagaaac ctatggcggt gctgtgcatc tcaccagccc accgaacacc 780

atcggtgcgg aaattatgtt ggcggcacag gcaaccctgt tgcgcgattt gccgccggac 840

cagtacaaca tgcagcgtat ggtatgcgcc ggtgcctatg gacgcgctta tcgcaacagt 900

gatccgcata tcggtttgca ggcaaaccag ttggtgaaaa acctgggtgt gaaaatcacc 960

ttaaccaacc cggtgggttt gtatttgcag cgcccggatt tcagcagcta taagacaccc 1020

gatggtaagg atgccggcca attctataag gtcattcgcg gtcgcaccgc ccaacaggca 1080

ggtacgactt acgaccagat attgcatgcg gaattttcag taccggaaga actgggttat 1140

accgtcagtg atattttgat tggcaacgcc gtgcccggca gttcccaggt gcctgtgccg 1200

attctctatg cgggtcaaat tgcagaaaca ttccatgtat gcctggcggg aacagcgatt 1260

gcccccgcta caggtgaacc ttcgcaagca tttttaccac cggtgactga taaaaccggt 1320

aataccaacg gccaggtgag catgctgttg gcaaacccgg tattgctggc catgcaggca 1380

gtgaacccct ttcccccgtt tgtgcaattg ccggtacaaa ttgcccaggg tcaaacactc 1440

accaatatgg ctttgcaggt cagttacgcc aatgacaatt tccaggaggc gcaaattgca 1500

ttctgggatg cacagggcaa tagcgagccg ggcatcagtg tgacagtaac ggccatagag 1560

actgctgatg ggacaccggc gggaaaaagc gccggtggtg atggactgtt taattacatt 1620

atcagcatca gtgtcgcgcc gggggtaagt cccggcttta aaggtgtgac ggtgcgcaac 1680

cccgcatgtg atatgccctt gccgttgccg ggtgtgttgt ttgtgactgc aaaaggaaac 1740

taa 1743

<210> 159

<211> 1521

<212> ДНК

<213> Cellvibrio japonicus

<400> 159

atgaagcata cattactgat aggggttacc accggtttgc tggtggctgc ctgccagcaa 60

ccggtacagg agtcatccgc agcggttgac gctcccgccg tgagcacggt gtccagcagc 120

agtgcgccaa tcagctttcc ctgcctgaat aaaccggcgg ttaattacaa cacaccgggg 180

gatacaccca tcacttcgca agatggtgtg aattgttttg cctggcaaac gtttattggc 240

ctgaactggc cggtcgatgc cagccatccg ggtgagccgg ataagacggc gtctgcgtct 300

gtgtttggtg agccgggttt gcaccaaacc tcggtgtggg aaacctatgc caatagcaag 360

agtgtatttc gtgcaaacgc ccaaccaccc ctgccctggg gacatacgcc cgatgtgcca 420

tccagctgtc aaaaaatatc ccagacactg ggcttgcgcg ttatgcaggc gagccgcatg 480

ccgggcagtt ttaatatgag taaggaggcc tcgcaggcat ttcccggcaa caatcccaat 540

tggctggcgg ataagagtgg caacctggtg tattacgaaa tcctgattgg caaggacgag 600

tacgattaca tcaataataa tggtttgtat aacgccaata cccaggctgc ccatatccag 660

cagaacaaga atattgccat gcccctgggc cacgacaagg tgctgggtgg gttggagatt 720

aaagcggcct ggctgagcgt gagcgatcca caaaatccca agtggaaaaa ttacaagctc 780

agtaccagtg tgatttacga tccggtttcc aaggattgcc acgcgagcac gattgcgtta 840

gtgggcatgc acattatccg caagaccgca tcgcaaccgc agtggatctg ggccacgttt 900

gagcacaagg acaatgcgcc ggatactgcc agtattaaaa gtgatggcac ggtggatggc 960

gattacacct tctatagcaa cagctgcacg gtcaaaccgg tgccggcggg ttgcaaggcc 1020

aaggttgaaa atggcacatc ggttacccaa acctcctgcc acgtgaatgt atcgcccgcg 1080

tattatctgg atactagcgg caactgtccg gcctatccca tccaggtgag ccgcgatttt 1140

gcgatcaagg attccaccga taaccacgtg gcctcgctca accgcgcagt acaacaactg 1200

attgccagca gcaatgccga ttcggtgtat acccattacc agctggtgaa tgtgctctgg 1260

tcatcggcgg cggtgaatga caatgcacca ccgggcaatc cgccgctgac gcccttatcg 1320

atcagcggtg aaacgccatc gctcaatacc gtgccggttg ccaataccat gctggaaacc 1380

tacgcacagg gttttaactg tttgtcctgc catgcctatg ccagtgtcgc gcgcgatgcc 1440

agggcacagc tgggcggtaa ggcttacgca acggattaca gttttatttt tagttttgcg 1500

acgtcacccg ctgccaaata g 1521

<210> 160

<211> 771

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 160

atgggttcca ttactgatca taatcaactg ctggcctggg tagcatcctt ggatattccc 60

gaagcttccg gagtaaaaac ccgttcgcgt aatgtggttg cgcgtgctaa tgccgaggac 120

gaaggcgcgg cagtagtacg cggtagtatt acttcgtttg tgaccggcct gagtcaacaa 180

gcgcgtgatg acgtgcaaaa cagcacgttg ttgatgcagt tggctgcgga taaaaaattc 240

aatccggaaa aacaacggga agagtggttc aagttctata ccgatggcct tgctaacctg 300

ggctgggggc gtgttagctc gtattatcag agctatcagc cgcgtaatac caatgtcacc 360

atggaccagg tcgtacttga ggtgattgct gcagtcgtgg gcgctgacag cgctgtgtac 420

aaggtgactg aaaaaacctt ctcgtcactc caagacaatc cgaagaacca ggccccgctg 480

aaactgttcg acagtagcag cactcgggac agcgtgggca cgttccagat actcccagtg 540

atgcaggata gggacggaaa cgtggtaatg gtactgacta ccgtcaacgc cagtaccacg 600

gtacagcgag gcagcttcct gttctggagt tggagcaaga ccaccgcgtg gatgtatcgg 660

gctgcacagc agactgtgct caatgagtcg gtatatgcga ctgttcgcca atctgtcatc 720

aagaagctgg gcaaaaacgc cgaagaattc atcgatgatc tggaaattta a 771

<210> 161

<211> 783

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brenneri

<400> 161

atgaaattgt ctgccgacga agtttatgtg atttcgggta acttgctatc cgcgacgcct 60

tcgctcaccg atcctacggt acttgaagat atcgccaatt caaacctttt gtgccagttg 120

gcagccgata agaatcaagg cacgcggttt atcgatccag ctgcgtggct ggacttctat 180

cgaagctcac taggtaggtt gttctggcgc atcagtaatt caggcacggt tagttatgct 240

ataccgcaac tcgtgcataa aattaccgtg aaagaagttt tggaaaaaac gttctacaag 300

actctggatc gcccccagcg catccgggtt gaagaaagta ttgaattgtt gggtgagcaa 360

tcagccgata gcccgtcggc gacattgtac agcctcaaga cccaggtcaa tttcaatgag 420

acgacatcat ctccaggtct cttgccccac tctatatcgt ccgttaactt gcaactcagt 480

gtggtgcaca gtgagacgtg catttcggtg tgcagtgttt acttcaaaac gtcgacccgg 540

atcggtgatg atgtattcaa tcagaagttc ccggtaaaag aactgctggg caatgttagt 600

gtgagtacgt tcgaagccaa gctgctggaa tcgagttatg ccggcataag gcagagcatc 660

atcgataagt tgggtgagga caatattcgc gagaacattc tgcttgtccc cgccgtttca 720

ccgtcgttgt ccaacacgcg ccacgcgggg gcgctgcagt tcgtgcagga actggatatt 780

tag 783

<210> 162

<211> 783

<212> ДНК

<213> Pseudomonas gessardii

<400> 162

atgaaattgt ctaccgacga agtttatgtg atttcgggta acttgctttc cgcgacgcct 60

tcgctcaccg atcctgcggt acttgaagat atcgccaatt caaacctttt gtgccagttg 120

gcagccgata agaatcaagg cacgcggttt atcgacccag ctgcgtggct ggacttctat 180

agaaactcac taggtaagtt gttctggcga atcagtaatt caggcacggt tagttatgct 240

ataccgcaac tcgtgcataa aattaccgtg aaagaagttc tggaaaaaac gttctacaag 300

aatctggacc gcccccagcg catccgggtt gaagatagta ttgaattatt gggtgagcaa 360

tcagtcgaca gtccgtcggc gacattgtac agcctcaaga cccaggtcaa tttcaatgag 420

acgacatcat ctccaggtct cttgccccac tctgtatcgt ccgttaactt gcaactcagt 480

gtggtgcaca gtgagacgtg catttcggtg tgcagtgttt acttcaaaac gtcgacccgg 540

atcggtgatg atgtattcaa tcagaagttc ccggtaaaag aactgctggg caatgttagt 600

gtgagtacgt tcgaagccaa gctgctggaa tcgagttatg ccagcataag gcagagcatc 660

atcgataagt tgggtgagga caatattcgc gagaacattc tgcttgtccc cgccgtttca 720

ccgtcgttgt ccaactcgcg ccacgcgggg gcgcggcagt tcgtgcagga actggatatt 780

tag 783

<210> 163

<211> 783

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 163

atggggtcaa ttactgatca tggaaaactg ttggcttggg tcgagtcgct ggatgtaccc 60

aagtcgaccg gcaatgccaa cctcaagcgc gcttcggctg tgctgcgcag tgccgcgcag 120

aacagtgatg aagatggcgc cgcagtcgtg cgcggcagta tcacttcgtt tgtgaccggc 180

ctgacgcccc aggcacggga tgacgtgcaa aacagcacgt tgttgatgca attggcggcg 240

gacaagaaat acaacccgga tacacaacgg gaagagtggt tcaagttcta caccgatggt 300

ttggccaacc tgggttgggg acgtgtgtct tcggcgtacc agaaatacaa gccgaccaac 360

accaatgcca ccatggacca ggttgtgctt gaaatcatca gctccgtggt cagcccggaa 420

agcgcgctgt acaaggtgac tgaaaaaacc ttcctggcac tcaagaacaa cccgaacaac 480

aaagatgcgc tgaagctgtt cgatgtcagc agcacccgca acgacctggg caccttccag 540

atcttgccgg tgatgcagga caaggacggc aacgtggtca cggtgctgac ctgcatcaac 600

gcccataccg aggtacaaaa gggtagcttc ctgttctggc actggagctc gaccagtgcg 660

gaaatgtacc gcgccgcgca acaagttgta ctcaatcaga atgtgtacgc caccgtgcgc 720

cagtcggtat tgaagaagct tgggaaaaat gccgaagact tcattgatgg tctggacatc 780

taa 783

<210> 164

<211> 780

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 164

atgagtttta ctgcccctga agttcatgtg gtttcaggca acctgatatc ggcgatgccg 60

tcggtcaaca gccctcaggt acttgaagat attcttgaat cgaatttgtt gtgccagatg 120

gcggcggata aaagtttggg ttcgcgattc aataatccgg ctgcctggct ggatttttat 180

cgcaactcgc tgggcaagct gttctggaaa atcaccaact tcaacacggt cagttatccc 240

gtgccgtcac ctacgcgttc cgtgagcgtc atgggcatac tggagcacac tttcttcaag 300

gtgttggcgc agccacttcg tcatcagata gaagcggata tcgagttgct gatggagctg 360

ccgctgacga gcccagcatc gcagctatac acctcaaaga cccatgtgga aatgagcacg 420

cgtgcgcgct caagttttga tgggcgctct gagtcggtga tcagcctgca aatcagcgtt 480

gtccacagcg ggtcgctgat ttcggtgtgc agtgtctact tcaagaccgc agagccggtg 540

gcagctgatg tgttcagtca gaagttcaag gtgagggatt tgctgggcaa catcagcgtc 600

aactcgttcg aggctgattt gttggagggt agttacgaag gcgttcgaca gcaaatcaag 660

acgaagctgg gtgaagccaa tatccgcgag aatatcctgt tgatcgctga caaccccatc 720

ccggtggacg aattgcccca cgcaaatgcc catcagtttc tcaaagggtt ggatatctga 780

<210> 165

<211> 768

<212> ДНК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 165

atgagcacga ttactgacca caagcaggta ttggcatgga ttaacgccct ggacattccc 60

gacgccccgg ccggcggcaa ccgtgtagcc gcacgagcga ccagcagtgc cgacgaagat 120

ggtgccgtcg ttgccaaagc cagcatccct tgctttgtca gcggactgac cgaacaatcc 180

cgcgccgacg tgcaaaacag caccttgttg atgcaactgg ccgctgacaa gaaatacccc 240

aacgaaaatg atcgcgaaaa atggttcaag ttttactccg atgggctgac caacctgggc 300

tggggtagca gcagcagctt ctttgaacgc ttccaaccca agaatacgga cgtcaccatg 360

gaccaggtcg tactggaggt gatactgaca gtggttaaca acgtcaataa tccgctatac 420

aaaatcgccc aggaaacatt cggcgccttg aacaagcctg ccaatcaaaa gcccatgaag 480

ctgtttgacc acagcagcac caaagaagac cgcggcaaat tccagattct gcctgctggc 540

caggaccagc acggcaccgt cagcatggtg ctgaccgcca tcaatgcacg gaccgacatc 600

caatccggca gcttcctgtt ctggaaatgg agcaaatcca ccgcttggct ctaccgcgca 660

gccaacctga ttgtgctcaa tgaatcggtg tactcgaagg tacgccaggc agtcatcgac 720

aagctcggcg ataacgctgt gaactttgtg ctggatctgg atatttaa 768

<210> 166

<211> 807

<212> ДНК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 166

atggcttttt ctactgagca aacctatgtg gtgtcaggca atctgatttc tgccaccaca 60

gaagacacca atacgctgag ctatgaagac tttatccatt ccaacctttt ggcccagatg 120

ggcgccgaca aaaaactggg ctcccgcttt gttgaccccg caggctggct gagttttttc 180

aagaatacag taggcaatct gttctggaac ctgagcgagc agggaaccag cacgttgaaa 240

atctcagccg gtaccgcaag catcaccgtg cagcaaatac tggagcagag ttttttcaaa 300

cggctcaacc aagcgcaaat cgatagcgcc acggcaagtg ttgatctgtt tagtcaactc 360

tctgaagatg atcctgcctt catcctctat aacgcgaaat cacatgccca gatctctacg 420

gctaccaagg tgatcaagcc accccaaaaa gagacttata gcgtcaactt gcaaatcagc 480

attgcccata cagggtcgga aatcgcactg tgcaatattt tcttccaaac cagccaggca 540

gtcagcgacg aattattcac acagaaattc gcaatcaaag atctgattgg aaacattaat 600

gtgttttatt taaaggctct actctccgag accaattacg gccacatcag gcaacaggtt 660

atcgaaaagc tgggtgagaa catcaacacc aatattgtgc tggtagccga taacagcgat 720

aagccctccc cccccttctc ccacagaggc gcgcagtttc atacgcagcc tgaaaatcta 780

atccagcaac gcacaggccc accatga 807

<210> 167

<211> 768

<212> ДНК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 167

atgagcacga ttactgatca caagcaggta ttggcatgga ttaacgccct ggacattccc 60

gacgctccgg ccggcggcaa ccgcgtcgcc gcacgagcaa gcagcagtgc cgacgaagat 120

ggtgccgtcg tcgccaaggc cagcatcccg tgctttgtca gcggactgac cgaacaatcc 180

cgcgccgacg tgcaaaacag caccttgttg atgcaactgg ccgctgacaa gaaatacccc 240

gacgaaaatg atcgggaaaa atggttcaag ttttactccg atgggctgac caacctgggc 300

tggggtagca gcagcagctt ctttgagcgc ttccaaccca agaacacgga cgtcaccatg 360

gaccaggtcg tactggaggt gatattgacg gtcgttaaca acgtcaataa tccgctgtac 420

aaaatcgccc aggaaacatt tggcgccctg aacaagcctg ccaatcaaaa gcccatgaag 480

ctgtttgacc acagcagcac caaagaagac cgcggcaaat tccagattct gcctgcaggc 540

caggaccagc acggcaccgt cagcatggtg ctgaccgcca tcaatgcacg gaccgacatc 600

caatccggca gcttcctgtt ctggaaatgg agcaaatcca ccgcttggct ctatcgcgcc 660

gccaacctga ttgtgctcaa tgaatcggtg tactcgaagg tacgtcaggc agtcatcgac 720

aagctcggcg ataacgccgt gaactttgtg ctggatctgg atatttaa 768

<210> 168

<211> 780

<212> ДНК

<213> Alcaligenes faecalis

<400> 168

atggcttttt ctactgagca aacctatgtg gtgtcaggca acctgatttc tgccaccacg 60

aaagatacca atacgctgag ctatgaagac tttattcatt ccaatctttt ggctcagatg 120

ggcgccgata aaaaactggg ttcccgcttt gttgaccccg caggctggct gagttttttc 180

aagaatacag taggcaatct gttctggaac ctgagcgagc aaggaaccag cacgctgaaa 240

atctcagccg gtaccgcaag catcaccgtg ctgcaaatac tggagcagag ttttttcaaa 300

cgactaaacc aagcacaaat cgatagcgcc acggcaagta ttgatctgtt tgatcaactc 360

cctgaagatg atcctgcctt catcctctat aacgtgaaat cacatgccca gatctctgcg 420

gctgccaagg caatcaagcc gccccaaaaa gcgacatata gcgtcaactt gcaaatcagc 480

attgcccata ccgggtctga aattgcactg tgcaacgttt tcttccaaac cagccaagcc 540

gtcagcgatg aactgttcac tcagaaattc gcaatcaaag atctgattgg caacatcaat 600

atcttttatt taaaggctca gctctccgag accaactacg gccaaatcag gcagcaggtt 660

atcgagaagc tgggtgagaa catcaacacc aatattttgc tggtagccga taacagcgaa 720

acgccctccc ctccttctcc tgcagaagcg cgcagtttca tacgcagcct gaaaatctaa 780

<210> 169

<211> 768

<212> ДНК

<213> Alcaligenes sp. HPC1271

<400> 169

atgagcacga ttactgacca caagcaggta ttggcatgga ttaacgccct ggacattccc 60

gacgccccgg ccggcggcaa ccgtgtaacc gcacgagcga ccagcagtgc cgacgaagat 120

ggtgccgtcg ttgccaaagc cagcatccct tgctttgtca gcggactgac cgaacaatcc 180

cgcgccgacg tgcaaaacag caccttgttg atgcaactgg ccgctgacaa gaaatacccc 240

aacgaaaatg atcgcgaaaa atggttcaag ttttactcgg atgggctgac caacctgggc 300

tggggtagca gcagtagctt ctttgaacgc ttccaaccca agaatacgga cgtcaccatg 360

gaccaggtcg tactggaggt gatactgaca gtggttaaca acgtcaataa tccgctatac 420

aaaatcgccc aggaaacatt cggcgccttg aacaagcctg ccaatcaaaa acccatgaag 480

ctgtttgacc acagcagcac caaagaagac cgcggcaaat tccagattct gcctgctggc 540

caggaccagc acggcaccgt cagcatggtg ctgaccgcca tcaatgcacg gaccgacatc 600

caatccggca gcttcctgtt ctggaaatgg agcaaatcca ccgcttggct ctaccgcgca 660

gccaacctga ttgtgctcaa tgaatcggtg tactcgaaag tacgccaggc agtcatcgac 720

aagctcggcg ataacgccgt gaactttgtg ctggatctgg atatttaa 768

<210> 170

<211> 780

<212> ДНК

<213> Alcaligenes sp. HPC1271

<400> 170

atggcttttt ctactgagca aacctatgtg gtgtcaggca atctgatttc tgccaccacg 60

gaagacacca atacgctgag ctatgaagac tttatccatt ccaacctttt ggcccagatg 120

ggcgccgata aaaaactggg ctcccgcttt gttgaccccg caggctggct gagttttttc 180

aaaaatacag taggcaatct gttctggaac ctgagcgagc agggaaccag cacgctgaaa 240

atctcagccg gtaccgcaag catcaccgtg ctgcaaatac tggagcagag ttttttcaaa 300

cggctcaacc aagcgcaaat cgatagcgcc acggcaagtg ttgatctgtt tagtcaactc 360

tctgaagatg atcctgcctt catcctctat aacgcgaaat cacatgccca gatctctgcg 420

gctaccaagg tgatcaaacc gccccaaaaa gagacttata gcgtcaactt gcaaatcagt 480

attgcccata cagggtcgga aatcgcactg tgcaatattt tcttccaaac cagccaggca 540

gtcagcgacg aattattcac acagaaattc gcaatcaaaa atctgattgg aaacattaat 600

gtgttttatt taaaggctct actctccgag accaattacg gccacatcag gcaacaagtt 660

atcgaaaagc tgggtgagaa catcaacacc aatattgtgc tggtagccga taacagcgat 720

aagccctccc ccccttcccc cacagaggcg cgcagtttca tacgcagcct gaaaatttaa 780

<210> 171

<211> 783

<212> ДНК

<213> Enterobacter sp.

<400> 171

atgaatacta acgctttgga ttttgtgctt aaaacaccga ttgaaaccac tgccgatctg 60

gcaccgttac tggaacgtct aaagggggta ccggatcatg gtcagtcaaa aagaaaaacc 120

atgctgactg ataataaagt atctgcacaa gtcaatgccg gcagcctcat ctcatttacc 180

gaacgtttgg atgggcagaa taaacaagat gtgcagaact caacactgtt cgctcaactg 240

gcggcggata aacactgcaa ccgttatact gcgcccatgg attggtatcg tttttatgtc 300

aatgtactgg gccaaattgg ctggaaccaa cctgctttcg cgtttgatac ctatacgtca 360

ggtgccagta ccgtaaaact ggatgaggct gtgttgggga tcattgcgca aatcgctact 420

gtcggtgagg ttgcattagt ggcagcggca atgaaggcgt tatccagcct gagcgatacc 480

tcaaagcaaa tgcttatctg ggacgcgaaa tcaaattcgg aaaacaccgg taattttcaa 540

attttcccgg cagatctgtt accaaatggc gatgtggtaa tgatgcttga tggtatgcaa 600

tttgatgcaa agcgcaatga ggggcgtttt ctgtgggtaa cctggcaatc cacctcgatc 660

aaaattcaac gcgcggcaaa taaattcgtc ttaaacgaag gtgtttataa gggggtgcgc 720

caggccgtta ttgataaact gggtgatcgg gcaatcgata tgattgcaaa tattgaaatc 780

tga 783

<210> 172

<211> 777

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 172

atgagttttg aagtgtgtga cagcagcgtg gccgcctgtg tggcgcgtct ggaaagttat 60

gatatctatc cagatatcag tccccgctcg ttgtattcgg gtgatatcga gcctccggcg 120

aaggggtcgg ttgtcggtga aggtatcctg gccttcgccg gtggtctttc ttcgcaacac 180

caggaagatg cgcagcatgc ctttctcttt gcgtccctgg tcgccaacag gcagtaccct 240

ctcgaatccc aggggcgaga gtggtactac aagtttgttg aagtcatgac gaacgccggt 300

tgggtcgcca cgcagcgctt ctacgatgat ctgagcatcg ccggcaacac cgtgcgaatg 360

gacaagctgg tgttggacat cctcgcttcc gtagtgtcgg ggattgccct cggaagcgcg 420

acttcggcgt tgctattgag ggtcgccgac agtgcaatca cggccctgca gaagaaggaa 480

aagaccctga cccttttcga gcgaaacctg ctggaacatg gtgtgggcgg aatggcggcc 540

gggacctgtg ttgaaatcga cggtgaggtc agcatgctgc ttggcactgt gcgctttatc 600

cggcgcaaca gcgcgaccca ggtcttgttt gcagattgga acagtcgcga agtgaagttg 660

tataaaggtg agtcggtttt caggaaagtg ccgagtattg tcgagcgaac ccgaggcatc 720

attattggtc ggctgggtaa tcatgccgtc agcaagatcg aagagtacga aatctaa 777

<210> 173

<211> 729

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 173

atggacaagg catattcgat ttttgttaac gcggcggcga ttgttttagt ttcctccact 60

gtgcggggaa caggggttga agacctgatg aattcggtct tgctcgcgca attggtggct 120

aacaagaatc tgcagcgcat accaagcgct gattggtacg ctagttatat ggacgtcctg 180

agtgtcgcct gggtagcggg tgccaaacgc cgaaaggacc tgctaccgaa acaagacgct 240

gccagctcgc cagtggagtg ggttacagca atacctttgg acgatcggcc ggaccagcaa 300

cagcagatca tggcggtgtt ggaccgtgtc gccgcgttac ccggctcgct gccggcgctg 360

agtatcctgc gcaagcatat gcaaaaacca aacgaacctg agccgacgca gagcccttca 420

gcgtccagcc ccgtgcgctt gttggtgatc gtagcgcaca gccccgtttc gatgaccggt 480

atctgtttgc aattcaacac agggaaagcg atcaatgcca acccttgggg gcaatgcttt 540

gatggaaagg acatcgacgg ttgtgtgtcg gcgcgttatt tgcgcatgca actgagcgaa 600

acattgttcg cgccggcccg tgaggttatc gcccgtaagg tagggactgt cgtgggcgac 660

aacgtggtgg atatcaccgg ggctatcgag gattcggttg ttcgtcctgc cgaggaggtc 720

gggcgatga 729

<210> 174

<211> 777

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brassicacearum

<400> 174

atgagttttg aaatgtgtga tagcgctgta gccgcctgtg tggcgcggtt ggaaagttat 60

gatatttacc ctgatgtcag tcctcgttcg ttgtatgtgg acgatgttga gccaccggcg 120

aagggatcgg ttgtcggtga aggcatcctg gcgttcgccg gtggtctttc tccccagcat 180

caagaggatg cgcagcatgc ttttctcttt gcttccctgg tcgccaacag gcaataccct 240

ctcgaatccc aaggacgaga gtggtactac aagtttgttg aagtcatgac gaacgccggt 300

tgggtcgcta cgcagcgctt ctatgatgac ctgagcgtcg gcggtaacac cgtgcggatg 360

gacaagctgg tgttggacat cctcgcctcc gtagtgtcgg gtattgccct cggaagcgcg 420

acttcggcgt tgctgttgag ggtcgtcgac agtgcaatca ctgccttgca gaagaaggaa 480

gagaccctga ccctttttga gcgaaacctg ctggagcatg gggtaggcgg aatggcagcg 540

ggtacctgtg tcgaaattga cggtgaagtc agcatgatgc ttggcaccgt gcgctttatc 600

cggcgcaaca gcgcaaccca ggtcttgttt gcggattgga atagccgcga agtgaagtta 660

tataaaggcg agtcggtttt tcgaaaagtt ccaagtgttg tcgagcgaac tcgagatatc 720

attattgggc ggctgggtaa tcatgccgta agcaagatcg aagagtacga aatctaa 777

<210> 175

<211> 729

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brassicacearum

<400> 175

atggataagg aatattcggt ttttgttaac gctgcggcga ttgttttagc gccctgcgca 60

ctacggcgca cggaagttga cgacctgatg aattcggtct tgctcgcaca actggttgct 120

gataagagtc tgctgcgtgc accagcggtt gattggtacg ccacttattt ggaggtcttg 180

agtgtcgcct ggatatcagc tgccaaaagg cgaaaggatc tgcagccgca aaaagaagat 240

acccattcgc cattggagtg ggtggcggcc atccccttgg atgatcaggt ggatcagcaa 300

cagcggatca tggcggtgat ggagcgtatc gcagcgttac ccggctcgct gcctgcgatg 360

gggattgtgc gcaagcatgt gcaaaaacaa tacgagcctg acgcggcaca gagcccgtca 420

tcttccagcc ccgtgcgctt gctggtgatc gtggcgcaaa gccctgtttc gatggctggt 480

gtctatttgc aattcaacac agcgaaagtg atcgaggcca atccttggag gcagtgcttt 540

gatggcaaag acatcgacgg ttgtgtgacg gcacgttatt tccgcacgca actgagcgaa 600

acattgttcg cgcctgcccg tgaggttatc gcccgtaagg tcgcggctgc cgtgggtgac 660

aacattgtcg atatcaccaa ggctatcgat gattcaggtg ttcttcctgc cgaagaggtc 720

tgcagatga 729

<210> 176

<211> 792

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы проса прутьевидного из Мичигана

<400> 176

atgagtgtaa atatgatcga tagtgctact gttgctgcct gtgtaaggcg tctggaaagt 60

tacgaaattg atgaagtgcc agttgtacgt tctcgtgcat ttgctgcaag tgggattgtt 120

gttgaggagc cttcgaaggg ggctgtcgtt ggcgaaggca ttttgtcctt cgtaggcaac 180

ctgtccgagc aaaatcaagt agatgcgatg cacgcctttc tttttgccag ccttgttgcg 240

aataagcaat ttccttacga gtatcagggc aaggaatggt actacaagtt tgtcgaagtt 300

atgacctccg ccggttggct gacgagccaa aaatattaca acgacattga aattagcgga 360

aataccgttc ggatggacca gttggtactg gaaatccttg gctcggtggt cgctggcctc 420

gctataccag gcactgcttc tgcactgatg ctgaaggttg ccggtgatgc cattaccgcc 480

ttgaaaaaga aagaaacggc tttaacgctg tatgaacgga atttgttgga acatggcgta 540

ggcggtatgg ctgcaggaac ctgtaccgaa gtcaatggtg aggtaaccct ggcactaggg 600

actgtacgtt ttattcgcaa aaatacagca acccaagtcc tgttcatgga ttgggatagt 660

cgtgatgtgc agctgtataa aggtgaatct gttttcagaa aggttcctta tatcgctgac 720

caaacccgag acctgattcg gacaaaactt gggacgaatg cagtcagtaa aatcgaaggc 780

tacgagatct ga 792

<210> 177

<211> 729

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы проса прутьевидного из Мичигана

<400> 177

atggcaaggg aatattcggt atttgttaat gccgctgcta tcgttttatt gccgagcaat 60

cccgtggagt cagcaactaa cgacctgatg aattcagtcc tgcttgcaca actggtcgcc 120

aataagcgtg ccgaagccac gagcgcggtc gattggtatg agacctatgt gggggtgctg 180

ggtgatttct ggttaacgag ggccagaagc aggcaagata tccagccggg aaaagacgat 240

accgcttcac cgcttgaatg gatcgctgcg gtgctggcaa gtagcactga ggatgaggcg 300

cggctggtga cggcgttgtt gaagggtatc gcacgactat ccgattcttt gcccgcgatg 360

agtttgctgc gcaagcatgt gcaaaaagag tccgatgatg aaccggcaga aatctccttg 420

cagtccaagc ctgttcgctt ggtcgtgatc gtggcccaag acaacgcttc gatgaccagc 480

gtctgcctcc aattcaaaac acggcaaatg cttgacccca atccctgggg gcagcgcttc 540

catgtcgagg atatggaggg ctgcgtttcg gcccattttt tccatgcgca cctgtccgag 600

acattgtacg cgcccgcccg tgaagcggtc gcccgcaagg ttgagggcgt tttgagcgac 660

aacatcgtgg atatcacgga ggccatcgat gctttggcct ttctgcccac tgaggaggct 720

ggcacatga 729

<210> 178

<211> 786

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы мискантуса из Келлогга

<400> 178

atgaatgttc atgatgtcga agattgcact gtagccgaat gtattcatcg tttggaaagt 60

tatgagctgg acggcgctga agttatgcgc cctcgcagtt tctcggtacc ggttgtcaat 120

gaacccggca aaggttccat cgtgggtgag ggcatcttgt cctttaccgg caacctgagt 180

gagcaaaatc gggaagatgt tcaacacgct tttctattcg cgagtctggt cgcaaacaaa 240

aagtacccgt atgagtatca gggtaaggaa tggtattacc agttcctgga agtcatgacc 300

catgcaggct ggctgccgac cagtaagtac tacaacgaca tgaacatcag cggtaacacc 360

gtacggatgg atcaattggt gctggagatc ctcggcagtg tggttgccgg gcttgccgtg 420

cctggctccg cctccgtcct gatgctgaag gtggcaggcg atgcaatcac cgcattgaaa 480

aaacgtgaaa ccgcgttgac cctgtatgag cgcaacatgc tggagcacgg tgtgggtggt 540

atggcggccg gcacctgcac cgaagtcaac ggtgaagtca ccatggcatt gggtactgtt 600

cgtttcatcc gcaagaacac cgcaaagcaa gtgctgttca tggattggga ctcccgcgag 660

gtgaaactgt atcgcggtga ctctgtcttc aggaaagtgc cttatatcgt cgagcaaacc 720

cgcgacacga ttcgtgcaaa acttggtttg aatgcgaaac caaagatcga agattacgac 780

atctga 786

<210> 179

<211> 723

<212> ДНК

<213> Неустановленное

<220>

<223> Микробное сообщество ризосферы мискантуса из Келлогга

<400> 179

atgagttacg aatattctgt attgatcgtt ggggcttgtg tcgtgattat tccggccgcg 60

gatggggcgg cccaatatac ggatctggtc aattccgtgt tgctggcgca actgattgcc 120

aataagaaga tcgaaaaagc tccggaaatt gactggtaca acgcttatgt agaatttctg 180

gatgattact ggctgcgacg tacaagagcg cgacaggatt ggtctatcgc ccaagacaga 240

gtcgagtctg tcagcgactg ggtcattgca gcgatttcac aagatgctgt ggataaagga 300

agcgctactg cggcaacatt gcagcggctg gcaaggttgt ccggcaacga gcctgcaatg 360

ggtttgctgc gcggtcacat gcagaaaata tccactgacg agtcgggtga tgtacttgcg 420

cccgcaaagg ctgtgcgttt gctggtggtt atcgcgcaga cgccgacatc ggtcgcaagc 480

gtctacatcg agcttaagac ccgccagatc atcagtgcca atccgctggc ccagcgacat 540

ctggctgagg atgtacaagg cagcgtttgc atgcgctacg ccgctgctaa cttgtccgaa 600

actctctaca gccctgtgcg cgacgccatt gccttgaagg tcagggacaa gtatcaggac 660

aacgtagcga tgttgacatt gagcgatgat gcttcggcca tggagatctg tgcggtagat 720

tga 723

<210> 180

<211> 1668

<212> ДНК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 180

atggccaaac tcacgcaatt ttccaccccc gccgacatcc aggacttcag tgacagcccc 60

gcccagcaag agcggatgaa cgccgcctgg agcggcaaca tcaatcgctg ggtcaacgca 120

gcactggtgg gcgacgtctg ggacctgatc aactacggcc cgcgcccggc cttctacaac 180

cctctggaca ccgacacccc gagcacctcg gtgaatgccc ccatcacctg gaacgccttc 240

cccgggcgca tccccgcgtt gttccccaac cagtcggcga actggctgca atgggccgac 300

cagggcgtgc cggccaacgt caccaccaac ctctgcaccc aacagagcgt ccccccggcg 360

ccctactcgc ccaccggccc ccggggctgg caggacgaat actgtgaatg gagcgtgacc 420

cgcaacgccg ccgggcagat caccagcgtg atgttcacct gtgagaaccc ggaatactgg 480

atgaccctgt ggcaagtgga cccgggcaaa gtgctgcagc gctaccagca gttgatcaac 540

ccggcggtgc aactggccga cctgagcctc aaggacgccc agggccaaac ggtgatcgac 600

ccggtgaccg gagcgccgtg ctacaacccg ctgaacaagt ggaacagcgg cacccagacc 660

ctgcccggca gcggcggcgc catgcacctg accagctcgc ccaacaccct gggtgccgag 720

tacgacctgg cagcggccgc gaccatgccc cgggagctga acaacgaacc ggtgacctcg 780

gcctcgcaac tggtgtgcta cgcccgttac gggcgcatcg gccgccacag cgacccgacc 840

atcggccaga acgtcaacca gtacgtcaac tacacctccg ggctgaccga ggtccgggcg 900

accctgacca acccgccggg tctgtacatc cagaccccgg acttcagcgg ctacaccacc 960

cccgacggca gcccggcggc ggcctgctgg accatcaacc gaggccacct ggcgcagacc 1020

tcggacgaca tcgaccgcat cctccacgcg accttcagcg tgcccgcggg caaaaacttc 1080

accgtcagcg acatcagcat caacggtgca aaaatccagt acgcctcgca gatcgccggc 1140

accatcacca tgggcttgat ggccacggtg tttggcaaca gcggcgtgac ccagcaaccg 1200

gtggccggca ccctggacag cgacaacccc agcccgtcgg tatcggcgct gcaaccgctg 1260

tcggtgttca acgcctaccg ggcccaggaa ctggccagca acgagcaggc gctgtcgatt 1320

ccaatcctgg ccctggccat ccgccccgga cagcaagtgg acaacatcgc cttgctgctc 1380

aacaccagcc agaccccgaa cggcgccagc ttcagcgtgg tcgaaggcgg cgtcagcatc 1440

agcatcaccg gcacccagga cctgccgggg ttggacatga gcctgtacct ggtgagcatc 1500

agcgccgacg ccaacgccgc cccgggggat cgcacggtcc tcgccagcgt gcctggcatg 1560

gccagcaccc aacaggcggc gatcggcctg ctgaccgtcg gcggcccaac cctggtcacc 1620

tcccagaccg gcccgagcaa gccgaacttc cgtcgcggtc gcggctga 1668

<210> 181

<211> 1356

<212> ДНК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 181

atgcgccgtc gtcccacggt gttactcggc ctggccctgc tactcggttt accggccacc 60

caggccatgg gcgcgccgct gtgcggcagc ccgttcgtcc cctcgccgac cctgcaaccg 120

acactcgccc cccccaattt cagcgccagc gacagcgcgg tggactgctt catgtggcaa 180

accatggtct acctcaactg gccggccacc ccaggccaac ggggcgtacc gaatgccgcc 240

gccagcctgg gcagcccggg ccccagcgtc tggcagacct acaaggatta caacgagctg 300

tacctgccca atggccagca accgccagcc tggaacgaca acttcctgtc ggtgcagcgc 360

ttgcagaccc gaggcgtggc acgggcgttg ccgtcgatcc gcctgcttaa cagcaccagc 420

aaggtctttc gcgccgccaa tgccaacgaa tccccggcgc tacgggaaat cgagcaggtc 480

ggcggcggcg tgctctacga ccaggccggc agcccggtgt actacgaaat gctggtgaat 540

gaggtcaact tcgacttcat ctacaacaac cagctgtaca accccgccca gcagaacctc 600

tatgccaagc aaaaaggcat cgtgctgccg aacaactcca tcgagatcaa ggccgcctgg 660

aaggtgctga gcgacccgga taacccccag cgctttctca ccgcccaagc gttgctgccc 720

ggcagcagca cgccggtgac cgtgggcctg gtcgggctgc atgtgttcca gatgccttcc 780

agcgcgttca accaggggtt ctgggcgacc ttccagcagc tcgacaacgc ccccacggtg 840

gccggcgcca ccccaggggc gcactactcg ttcaacaacc cgcagtgcgc gccggcccag 900

tgcccgccca atgacaaaac cagcaatccg acccaggtgg tgcagaactt cccgccgacg 960

ccagaggcgc agaacatcaa ccactacatg cagaacctga tcgcccagca ggccccgggc 1020

tccgcgttgc agtactacca gttggtggac gtgcaatggc cgacttcgcc acaagccatc 1080

ggtcagcccg gggccacggc gccggcgccc agtggcacgc cgaaccacga caccctgatc 1140

aacccggtgc tggaaacctt tctccaggcc aatcacaaga gctgcctggg ttgccatgtg 1200

tacgccagcg tggcggcgga cggcagcaac ccgcccaccc actaccaggc cagcttcagc 1260

ttcctgctgg gccacgccaa aagcccggcc ctgggaagca acctgaaaag cctggcgcaa 1320

cagatcgagg acgcgtccct gagcctgcaa cactga 1356

<210> 182

<211> 1668

<212> ДНК

<213> Pseudomonas orientalis

<400> 182

atggccaaac tcacgcaatt ttccaccccc gccgacatcc aggacttcag tgacagcccc 60

gcccagcaag agcggatgaa cgccgcctgg agcggcaaca tcaatcgctg ggtcaacgcg 120

gcactggtgg gcgacgtctg ggacttgatc aactacggcc cgcgcccggc cttctacaac 180

cctctggaca ccgacacccc gagcacttcg gtgaatgccc ccatcacctg gaacgccttc 240

cccgggcgca tccccgcgct gttccccaac cagtcggcga actggctgca atgggccgac 300

cagggcgtgc cggccaacgt caccaccaac ctctgcaccc agcagagcat ccccgcggcg 360

ccctactcgc ccaccggccc ccggggctgg caggacgaat actgtgaatg gagcgtgacc 420

cgcaacgccg ccgggcagat caccagcgtg atgttcacct gtgagaaccc ggaatactgg 480

atgaccctgt ggcaagtgga cccgggcaaa gtgctgcagc gctaccagca gttgatcaac 540

ccggcggtgc agttggccga cctgagcctc aaggatgccc agggacaaac ggtgatcgac 600

ccggtgaccg gagcgccgtg ctacaacccg ctgaacaagt ggaacagcgg cacccagacc 660

ctgcccggca gcggcggcgc catgcacctg accagctcgc ccaacaccct gggtgccgag 720

tacgacctgg cagcggccgc gaccatgccc cgggagctga acaacgaacc ggtgacctcg 780

gcctcgcaac tggtgtgcta cgcccgttac gggcgcatcg gccgccacag cgacccgacc 840

atcggccaga acgtcaacca gtacgtcaac tacacctccg ggctgaccga ggtccgggcg 900

accctgacca acccgccggg gctgtacatc cagaccccgg acttcagcgg ctacaccacc 960

cctgacggca gcccggcggc ggcctgctgg accatcaacc gaggccacct ggcgcagacc 1020

tcggacgaca tcgaccgcat cctccacgcg accttcagcg tgcccgcggg caaaaacttc 1080

accgtcagcg acatcagcat caacggtgca aaaatccagt acgcctcgca gatcgccggc 1140

accatcacca tgggcttgat ggccacggtg tttggcaaca gcggcgtgac ccagcaaccg 1200

gtggccggca ccctggacag cgacaacccc agcccgtcgg tatcggcact gcaaccgctg 1260

tcggtgttca acgcctaccg ggcccaggaa ctggccagca acgagcaggc actgtcgatt 1320

ccgatcctgg ccctggccat ccgccccggg cagcaagtgg acaacatcgc cttgctgctc 1380

aacaccagcc agaccccgaa cggcgccagc ttcagcgtgg tcgaaggcgg cgtcagcatc 1440

agcatcaccg gcacccagga cctgccgggg ctggacatga gcctgtacct ggtgagcatc 1500

agcgccgacg ccaacgccgc cccgggggat cgcacggttc tcgccagcgt gcctggcatg 1560

gccagcaccc aacaggcggc gatcggcctg ctgaccgtcg gcggcccaac cctggtcacc 1620

tcccagaccg gcccgagcaa gccgaacttc cgtcgcggtc gcggctga 1668

<210> 183

<211> 1356

<212> ДНК

<213> Pseudomonas orientalis

<400> 183

atgcgccgtc gtcctacggt gttactcggc ctggccctgc tactcggctt accggccacc 60

caggccatgg gcgcgccgct atgcggcagc ccgttcgtcc cctcgccaac cctgcaaccg 120

acactcgcca accccaattt cagcgccagc gacagcgcgg tggactgctt catgtggcaa 180

accatggtct acctcaactg gccggccacc ccaggccaac ggggcgtacc gaatgccgcc 240

gccagcctgg gcagcccggg ccccagcgtc tggcagacct acaaggatta caacgagctg 300

tacctgccca atggccagca accgccagcc tggaacgaca acttcctgtc ggtgcagcgc 360

ttgcagaccc gaggcgtggc acgggcgttg ccgtcgatcc gcctgcttaa cagcaccagc 420

aaggtctttc gcgccgccaa tgccaacgaa tccccggcgc tacgggaaat cgagcaggtc 480

ggcggcggcg tgctctacga ccaggccggc agcccggtgt actacgaaat gctggtgaat 540

gaggtcaact tcgacttcat ctacaacaac cagctgtaca accccgccca gcagaacctc 600

tatgccaagc aaaaaggcat cgtgctgccg aacaactcca tcgagatcaa ggccgcctgg 660

aaggtgctga gcgccccgga taacccccag cgctttctca ccgcccaagc gttgctgccc 720

ggcagcagca cgccggtgac cgtgggcctg gtcgggctgc atgtgttcca gatgccttcc 780

agcgccttca accagggatt ctgggcgacc ttccagcagc tcgacaacgc ccccacggtg 840

gccggcgcca gcccaggggc acactactcg ttcaacaacc cgcagtgcgc gccggcccag 900

tgcccgccca atgacaaaac cagcaatccg acccaggtgg tgcagaactt cccgccgacg 960

ccagaggcgc agaacatcaa ccaatacatg cagaacctga tcgcccaaca ggccccgggc 1020

tccgccttgc agtactacca gttggtggac gtgcaatggc cgacttcgcc acaagccatc 1080

ggtcagcccg gggccacggc accggcgccc agtggcacgc cgaaccacga caccctgatc 1140

aacccggtgc tggaaacctt cctccagacc aatcacacga gctgcctggg ttgccatgtg 1200

tacgccagcg tggcggcgga cggcagcaag ccggccaccg actaccaggc cagcttcagc 1260

ttcctgctgg gccacgccaa aagcccggcc ctgggcagca acctgaaaag cctggcgcaa 1320

cagatcgagg acgcgtccct gagcctgcaa cactga 1356

<210> 184

<211> 1671

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PKRS11

<400> 184

atggccaaac tcgcgcaatt ctcgcctccc gcccgtatcc aggacttcag caacgacccc 60

gcccagcagg agtgtttgaa cgctgcctgg agcggcaaca tcaatcgctg ggtcaacgcc 120

gccctgctgg gggacgtctg ggatcgaatc aattacggac cgcgcccggc gttctacaat 180

ccgttggtga ccgatacccc cgacaccgcg ggcaatgtgc cgatcacctg gaacgccttc 240

cccggccgcc tgcaagcgct gtttccgaac cagggcgcgt cgtggcaaca gtgggccgac 300

cagggcgtgc cggataaagt caccaccgac ctctgcagcg gcaagcccat tgacccggcc 360

ccctactcgc ccaccggtcc acggggctgg caggacgaat actgcgaatg gagcgtgacc 420

cgcaacggtg ccggacagat caccagcgtg atgttcacct gcgaaaaccc cgagtactgg 480

atgaccctgt ggcaggtcga tccgggcaag gtgctgcaga tctaccagca ggtgatcaac 540

ccggcggtgc aactgtcgga cctgtgcctg aaagacagcc atggccagac ggtcaacgat 600

ccgctcaccg gccagccgtg ctacaacccg ctgaacaaat ggaacagcgg cacccgcacc 660

ctggcgaaca gcggtggcgc catgcacctg accagctccc ccaataccct cggcgcggaa 720

tacgacctgg ccgccgcggc caccatgccg cgcgaaaagg accacgaccc ggtgacctcg 780

gccgcagccc tggtgtgctt tgcccgctat ggccggatcg gccgccacag cgatccgacc 840

attggccaga acgtcaacca gtacgccaac tacaccccga ccctaccgca tccccaggcc 900

accctcgccg accctccggg gctgtacatg cagaccccgc agttcagcga ctacgtcacc 960

cccgacaaca ccccggcgca gactttctgg accgtggtgc gtggcagcct gaaagacccg 1020

aatacgtccg aggacatcga tcgcatcctg cacgccacct tcagtgtccc tccggaactg 1080

ggctacaccg tcagcgacat caagatcggc aaccagccga tccggtacgg ctcgcagatc 1140

gccgccacca tcaccatggc cctgctggcc acggcctttc ccaacagtgg agtggtgcag 1200

accccggtcg gcgcgacgct cgacaactcg aaccccagcc cctcggtcag cgccctgcag 1260

gcacttgcgg tgttcaccgc gtaccgggcc caggagctgg ccagcaatga acaaccgctg 1320

tcgataccgg tactggctct ggccgtcagt ccggggcagc aggtgagcaa tatcgccctg 1380

ctgctcaaca ccagcgacac cccggatggc gcggtgttca cggtgcccga aggcggggta 1440

agcatccgta tcgacggcac ccaagcgcta cccaatgcgg agctgagcct gtatcaggtg 1500

acgctgtgcg tcgacgccaa tgccgccatc ggcgaccgca gcatcctggc cagcgtgccg 1560

agcatgccag ccacccaaca ggcggccatc ggcctgctga cggtcgtcgc cccgccccag 1620

gtccggcttg ccggcggacc gcgcaaacct cacgcccgtc acagtcgcta a 1671

<210> 185

<211> 1350

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. PKRS11

<400> 185

atgcgtgcca ttctcgccct cttgctgtac gccggattgt cgctggcgcc ggtcgcggcc 60

cgggccgccg gcaatccctg tggcagcccc ttcagcccgg aaccggtcat ccagccggtc 120

ctggccaacc cgcagataag caacctggac ccgtcggtgg actgcttcat gtggcaaacc 180

atggtctacc tcaactggcc ggcccaggcc ggccagcgtg gtctccccaa taccgacgcg 240

cacctgggcg accccggccc cacggtctgg caaaccttca aggacttcaa cgaactctac 300

ctgcccggtg gccagcgccc ggccccctgg aacgacaact tcctcaccat gcaacgcctg 360

gaattgcgcg gcgtggagcg gccaaggcca tcgatccgcc tgctcaacag caccagcaag 420

gtgtttcgca atgccgatgc cagcgaacaa aaggccctgg acgaattcaa gcaagtgggc 480

ggcggcgtgc tctacgacca gaacggccag ccggtgtact acgagatgct gatcaaccag 540

atcaacttcg attacatcta cagcaatcag ctgtacaacg ctgcccagca gaatctccac 600

gccgccaagc agggcatcgt cctgcccagc aactccatcg aactcaaggc ggcctggaaa 660

gtcctcagcc cccaggaagc cgcgccgccc ttgcgctttc tcactgccca ggccctgctc 720

ccgggcagcc aggtgccggt taccgtcggc ctggtgggcc tgcacgtgtt ccagatgccc 780

tccaaggact tcgcccaggg cttctgggcg accttttccc aggtggacaa cgcccccacc 840

ctgaatacac ctggccaggc ccattactcg ttcaataacc cgcagtgcag ccagtgtccg 900

gtcaacgacc ttggcagcaa gccgacgcag gtggtgcagg tccaggccaa cgccgtctac 960

gcccaggccg tcaaccagta catgcaggcg ctgatccagc agcaggcgcc gaactcggcc 1020

ttgcagtatt accaactgat caacgtgcag tggcccaact catcggtacc catcggccag 1080

cccggccagc cgacacctgc gccaaccggc agcccgagca ccgacaccct ggtcaatccg 1140

gtgctggaaa cctttatgca ggtcagcaac atgagctgcc tgggttgcca caagtccgcc 1200

agcgttgccg acaatggcac gcagccgccc agcggctatc aggcaagcta cagtttcctc 1260

ctgggccacg cccagaaccc gccgccgcaa ggcagcctca agagccttgc gcgacaggtg 1320

gaagaagcct cgacagcccg tcaacggtag 1350

<210> 186

<211> 291

<212> ДНК

<213> Pseudomonas Antarctica

<400> 186

atgaaattat caaatgtctt actattgagt atcgtatttg cttggcaagg catggccttc 60

gccgatacac agaagtctaa tgccgaaacc ttgttatcta acgacaaacc accgctaaca 120

caggcggcgc aggagaagga acaagaaaat gttgaggctg accggaatga atgttggtcc 180

gctaagaatt gttctggaaa gatcctaaac aataaagatg cgcacaactg taaattatcc 240

ggcggtaagt catggcggag caagactaca gggcaatgca ctaatcttta a 291

<210> 187

<211> 291

<212> ДНК

<213> Pseudomonas orientalis

<400> 187

atgaaaatgt ccagcgtctt actgatgagt attgcgtttg tatgtcaagg catggtcttc 60

gctgatacac agaagtccaa tactgaaacc ttgttttcca acgacaagcc accgctgata 120

cagacggccc aagagcagga acaaaaagag gttgaggttg accgcaatca atgttggtcc 180

gccaagaatt gctctggaaa gatcctgaac aataaagatg cacataactg taagttgtcc 240

ggcggtaagt cttggcggag caagactaca gggcagtgca ccaatctgta g 291

<210> 188

<211> 288

<212> ДНК

<213> Enterobacter asburiae

<400> 188

atgaaaacac tcgttatcgc aattctcacc gctgttcttt gccagggcat ggcgatggct 60

gatacacaga aaccagcaac cggggctttg ccagcaaatg aaaaaccccc tctcgttcag 120

ccagctgacg aacataaaac gagcgaggca aatgccaatc gtaatgaatg ctggtcagca 180

aaaaattgta ccggaaaaat ccttaataat aaggatgcgc ataattgcaa aaactccggg 240

ggtaaatcat ggcggagtaa aaccaccgga cagtgtacca atctttga 288

<210> 189

<211> 288

<212> ДНК

<213> Enterobacter sp.

<400> 189

atgaaaacac tcgttatcgc aattcttacc gctgttctgt gccagggcat ggcgatggcc 60

gaaacgcagc aaccggcatc cggggctttg cctgccaatg aaaagccgcc cctggtgctg 120

acggccgacg aaaaaaaagc gagtgaggct aatgccgaca ggaatgaatg ctggtcggcc 180

agaaattgta gcgggaaaat ccttaataat aaggatgcgc ataactgcaa aaactccggg 240

ggtaaatcct ggcggggtaa aaactccagc cagtgcacca atctttaa 288

<210> 190

<211> 318

<212> ДНК

<213> Acidovorax avenae

<400> 190

atgaaaaagc tgttgctcat cgcttcgtta ctcgtttcca tttccggtgc gaatgtgttc 60

gcccaggcac cgtcatccgg cgatgctccc gcagccgtcg cgggcaagca ggatggggcc 120

tcgcacaaag acacggaaca ggcggccaat gtggaatgcg acgtcaatgc gaccgtccag 180

cagtgctgct ctgccgccaa atgccagggg aaagtgctca gcaatcgcga tgcccacaac 240

tgcaaggaca agtccaaggg caagagctgg catgcggcgg cgcaaggggg acagcccgct 300

gcgtgccagc ggatgtaa 318

<210> 191

<211> 285

<212> ДНК

<213> Serratia plymuthica

<400> 191

atgcagtgta atggggctat tttaaagttg ttgtgcgcgc aacgaaaaga ccaatttatg 60

aacttacgca taaggacaca tgctatgaaa aatttgtcga ttttagttgt tctatcttcc 120

tgcctcttac ttcctttaac cgcgtctgcg gctgctggta cgtgctatag tgcgaagaac 180

tgctccggta aagtgttaag ccatcgagat gcacataact gcaaggtcaa ggataagggt 240

aagtcttggc gcagtgatat cacaaatcaa tgtaccaacc tgtga 285

<210> 192

<211> 282

<212> ДНК

<213> Serratia liquefaciens

<400> 192

atgcgtgagg aggctatttt aaagttgttg tgcgcgcaac gaaaagacca atttatgaat 60

tcacgcataa ggacacatgc tatgaaaaat ttgtcgattt tagttgttct atcttcatgc 120

ctcttacttc ctctaactgc gtcggcggcg tccggtaagt gctacagtgc taagaactgt 180

tctggaaaag ttttaagcaa aagagacgcg cataactgca aggtcaagga tcggggcaaa 240

tcttggctta gtgatgtcac aggcaaatgt accaacctgt ga 282

<210> 193

<211> 237

<212> ДНК

<213> Serratia sp.

<400> 193

atgaaactta aatatgaacg aataaggata tatgttatga aaagtctatc gattgttatt 60

actctcgctt catgcttact gctacctctg actgcgtctg cggccgcagg cacatgttat 120

agcgcaaaga actgttccgg gaaggtgctt agccaccggg atgcccataa ctgcaaggtt 180

aaggacaaag gtaaatcctg gcgcagtgat attacaggcc aatgcacgaa tctttga 237

<210> 194

<211> 228

<212> ДНК

<213> Serratia sp.

<400> 194

atgaattcac gcataaggac atatgctatg aaaaatttgt cgattttagt tgtactatct 60

tcatgcctct tactccctct aaccgcttct gcagctgctg gcacatgcta tagcgcaaag 120

aactgctctg gaaaagtttt aagccatcga gacgcgcata actgcaaggt caaggacaag 180

ggtaaatctt ggcgcagtga tatcactggc aagtgtacca atctgtaa 228

<210> 195

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 195

atgtcggctc aagagaactt tgttggcgga tggactcctt atcacaaact gaccccaaag 60

gatcaggaag tattcaaaga agccctggcc gggttcgtgg gtgtgcagta cacacctgaa 120

ctggtttcga cccaggtcgt caacggcacg aactatcgct atcaatcgaa agcgacgctg 180

cctggctcgt cggaaagttg gcaagcggta gtggaaatct acgcgcctat caaaggcaag 240

ccgcacatca cccagatcca ccggatctaa 270

<210> 196

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 196

atgtcggctc aagagaactt tgttggcgga tggactcctt accacaaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcaaaga agccctggcc ggattcgtgg gtgtgcacta cacgcctgaa 120

caggtttcaa cccaggtcgt caacggtacg aactaccgtt atctgtcgaa agcaacggtg 180

cctggctcgt cggacagctg gcaagcggtc gtagaaatct acgcgcctat caagggcaag 240

ccgcacatca cccagatcca ccggatctaa 270

<210> 197

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas brassicacearum

<400> 197

atgtcggctc aagagaactt tgttggcgga tggactcctt accacgaact gactccaaag 60

gatcgggaag tattcaaaga ggccctggcc gggttcgtgg gtgtgcaata cacccctgaa 120

aaagtttcga cccaagtcgt caacggcacg aactatcgtt atctgtcgaa agcaacggtg 180

cctggctcgt cggacagctg gcaagccgta gtggaaatct acgcgcctat taaaggcaag 240

ccgcacatca cccagatcca ccggatctaa 270

<210> 198

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 198

atgtcggctc aagagaactt tgttggcgga tggactcctt accacgaact gactccaaag 60

gatcgggaag tattcaaaga ggccctggcc gggttcgtgg gtgtgcacta cacccctgaa 120

aaagtttcga cccaagtcgt caacggcacg aactatcgct atctgtcgaa agcaacggtg 180

cctggctcgt cggacagctg gcaggccgta gtggaaatct acgcgcctat taaaggcaag 240

ccgcacatca cccagatcca ccggatctaa 270

<210> 199

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 199

atgtcggctc aagaacattt tgttggcgga tggactcctt accacgaact gacgccaaag 60

gataaagaag tattcaagga agccctggcc gggttcgtgg gtgtgcacta cacccctgaa 120

aaggtttcga cccaggtcgt caacggcact aactaccgtt atctgtccaa agccacgctg 180

cctggctcct ctgacagctg gcaggcggta gtggaaatct acgcgccgat caaaggcaag 240

ccgcacatca cccagatcca tcggatctaa 270

<210> 200

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 200

atgtcggctc aagaaaatct tgttggcgga tggactcctt accacgaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatga agccctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta caccgccgag 120

ctggtttcga cccaggtcgt taacggcacc aactatcgtt atcagacgaa agcaacgcag 180

ccgggttcat caaacagctg gcaagcggtc gtggaaattt acgcgcctat taacggcaag 240

ccgcatatca cccagatcat tcggatctaa 270

<210> 201

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 201

atgtcggctc aagaaaatct tgttggcgga tggactcctt accacgaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatga agccctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta caccgctgag 120

ctggtttcga cccaggtcgt taacggtacc aactatcgtt atcaggctaa agcaacgcaa 180

cctggttcgc caaacagctg gcaagcggtc gtggaaattt acgcgcctat taacggcaag 240

ccgcatatca cccagatcat ccggatctaa 270

<210> 202

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 202

atgtcggctc aagagaatct cgttggcgga tggactcctt atcacgaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatga agccctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta cacggctgaa 120

ctggtttcca cccaggtcgt caacggcacc aactatcgtt atcaggcgca agcaacgcag 180

cctggttcgc caaacagctg gcaagcggtc gtggaaattt acgcgcctat taacggcaaa 240

ccgcacatca cccagatcat ccggatctaa 270

<210> 203

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 203

atgtcggctc aagaaaatct cgttggcgga tggactcctt atcacgaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatga agccctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta caccgctgag 120

ctggtttcga cccaggtcgt taacggtacc aactatcgtt atcaggcgaa agcaacgcag 180

cctggttcac caaacagctg gcaagcggtc gtggaaattt acgcgccgat taacggcaag 240

ccgtatgtca cccagatcat ccggatctaa 270

<210> 204

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 204

atgtcggctc aagaaaacct cgttggcgga tggactggct accacgaact gactccaaaa 60

gataaggaag tattcaaaga agctctggag ggactcgtcg gtgtgcatta cacacctgaa 120

ctggtttcga gccagatcgt taatggcact aattatcgct atcaaactaa agcgacccag 180

ccaggctcgt caacgagctg gcaagccatc gtggaaattt acgcgcctat caagggcaag 240

ccgcatatca ctcagatcat ccggatctaa 270

<210> 205

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 205

atgtcggctc aagaaaatct cgttggcgga tggactcctt atcacgaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatgt agctctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta caccgctgag 120

ctggtttcga cccaggtcgt taacggtacc aactatcgtt atcaggcgaa agcaacgcag 180

cctggttcac caaacagctg gcaagcggtc gtggaaattt acgcgcctat caacggcaag 240

ccgtatgtca cccagatcat ccggatctaa 270

<210> 206

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp.

<400> 206

atgacagctc aagaacatct tgttggtgga tggacccctt accacaaact gactcccaag 60

gatcaggaag tcttcaaaga agcactggcc ggcttcgttg gcgtgagcta cacgcccgaa 120

gaggtttcca gccaagtcgt taatggcacc aactatcgct acaagtcgaa agccacgctt 180

ccgggttcgc caaacggctg gcaagcgatc gtagaaatct acgcgccaac taatggcaag 240

ccgcacatca ctcagatcca tcggatctaa 270

<210> 207

<211> 276

<212> ДНК

<213> Pseudomonas fluorescens

<400> 207

atgtcagctc aagaaaacca cgttggcgtt ggcggatgga ctgcttacca cgaactgacc 60

ccaaaggacc atgctgtatt caaagaggcc ttggaaggct ttgtgggggt gcaatacacc 120

cctgagacgg tttcgactca ggtcgtcgcc ggcacaaact atcgctatca ctcgaaagca 180

cagcagcctg gttcgccagc aatctgggca gcaatcgtgg aaatctacgc ccccctcaaa 240

ggtaaaccgc acatcaccca gatcatccgc atctaa 276

<210> 208

<211> 279

<212> ДНК

<213> Enterobacter-sp

<400> 208

atgtcggaac aacaaacgct gctgcctggc ggctggacgg cttatcatcc gctgactgct 60

caggaccgaa aagtgttcga agaggcgctc aacgggcatc tgggcgtgga ttacgagcca 120

caaaaggtaa aaacccaggt cgtggccgga acaaactacc gcttcctttg tgaggcttcg 180

gtcccgccgt ctacggccgt ctgggaagcg atagtggaaa tttatgcgcc attaccggga 240

cagggcgccc cgcatattac tcaaattatc agaatttag 279

<210> 209

<211> 270

<212> ДНК

<213> Shewanella denitrificans

<400> 209

atgtcaaata atgaaactat cgttggtggt tggacagctt acaacgcaat cacatctgct 60

gaaagagaaa ttttcaataa agccatggag ggttttgttg gtgtaagtta catgccagag 120

acggtttcaa cccaggttgt tgcgggaatg aattatcgtt ttaaatgcga agcgtctatg 180

ccaccatcag aagtgttatg ggaagcaatt gttgaaatat atcagccatt aaagggcatc 240

ccgcacatca caaacatcac aaaaatataa 270

<210> 210

<211> 273

<212> ДНК

<213> Aeromonas diversa

<400> 210

atgtcggatc aagctgtgct ggttggcgga tggactgcat atcacaggct gactgcggaa 60

gaccaagcgg tgtttcagga agcgctgaaa ggatttgttg gggtggagta taagcccttt 120

gaagtttcca cccaggtggt agcgggtatg aactaccgct acaagtgcaa gaccacggta 180

cccttgccga ctccgatcca tggcgaagcc gtggtacaga tcttccagtc gctggacggc 240

tctgcccata tcacctccat cactcccatc taa 273

<210> 211

<211> 273

<212> ДНК

<213> Aeromonas salmonicida

<400> 211

atgtcagaac aagcagtgtt ggtgggtgga tggaccgcat atcacaagct gaccgccgag 60

gatcaggcgg tatttgacca ggcgctgaaa ggatttgtcg gggtgcagta cgtacccttt 120

gaagtctgca cccaggtggt ggccggcacc aactaccgct tcaagtgcaa gagcacagtg 180

ccgcttgcca aaccgatcca tggcgaagcc gtggtgcaga tcttccagtc tctggatggc 240

tcggcccata tcacctccat taccccgatc tga 273

<210> 212

<211> 273

<212> ДНК

<213> Aeromonas veronii

<400> 212

atgtcagaac aagcagtgtt ggtgggtgga tggaccgcat atcacaagct gaccgccgag 60

gatcaggcgg tatttgatca ggcgctgaaa ggatttgtcg gggtgcagta cgtacccttt 120

gaagtctcca ctcaagtggt ggctggcacc aactaccgct tcaagtgcaa gagcactgtg 180

ccgcttgcca aaccgatcca tggcgaagcc gtggtacaga tcttcaaatc actggacggg 240

gatgcccata tcacctccat taccccgatc tga 273

<210> 213

<211> 267

<212> ДНК

<213> Aeromonas molluscorum

<400> 213

atgtcagaac aagcagtgct gttgggcgga tggactgcct accacaagct gagcgccaag 60

gatcaggcgg tattcaacca ggcgctggaa ggatttgtcg gggtgcagta cacacccttt 120

gaagtctcca cccaggtcgt cgccggtacc aactaccgct tcaaatgcaa gagcactgtg 180

ccgctgccca accccatcca cggggaagcc gtggtgcaga tcttccaggc gttgtttccc 240

aaatcgatgc agcttgaatg gaactaa 267

<210> 214

<211> 273

<212> ДНК

<213> Aeromonas aquariorum

<400> 214

atgtcagaac aagcagtgtt gttgggcgga tggactgcct accacaagct gagcgccaaa 60

gatcaggccg tattcaacca ggcgctggaa ggatttgtcg gggtgcagta cacccccttt 120

gaagtctcca cccaggtcgt cgccggcacc aactaccgtt tcaaatgcaa aactactgtg 180

ccgctgccta acccgatcca cggagaagcc gtagtgcaga tcttccagtc gctggatggc 240

tcggcccata tcacctccat taccccgatc tga 273

<210> 215

<211> 5

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> Линкер расщепления

<400> 215

Glu Glu Lys Lys Asn

1 5

<210> 216

<211> 16

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> 16S-рибосомный праймер

<400> 216

taccttgtta cgactt 16

<210> 217

<211> 20

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<223> 16S-рибосомный праймер

<400> 217

agagtttgat cmtggctcag 20

<210> 218

<211> 1737

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. VLB120

<400> 218

atgagcacgt ccttcacaca gttcacctcg cccgccggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctgggcc tggaagacca gttgccgcag tttgaaaccg actggaacaa caacctcacc 120

ggctggaccc aatcgtccat catcggcaac ccctggtcca acctgaacga cgccccccgc 180

tcgggttact acaatccgct cgtcgaaggc ttcggtgacg tgactgtccc cgcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctctggacg tttttctaca acaacggtgc ggcgatcgtt 300

ccccaactgg gcggcaacgc catgactctg gagcaggtga tggaattggc cgatcacggc 360

cagatcaccc tcaacaacac cctctacaaa ctctacgatc ccgacaacca agggaccttg 420

ctgcaactgc cggccaagcg ctgccccagc atcgactgga aaggccagta cacggcgttc 480

tcgccctccg gcccacgggg ctggctcgac gagtactgcg agtggtccat cgtgcgcgat 540

accgacggca acatgcgcaa gatcacattc acctgcgaaa accccgccta tttcctggcc 600

atgtggcgca tcgatccgaa cgcggtactg ggcctgtacc gggactacat cgacccgaac 660

gtacaactcg aagacctgta cctgcgctat gccgtcgatt gcccgaccgg caaggccgga 720

gatccagtga tcgaccccac caccggccag ccggcctatg acacggtcaa caaatggaac 780

gccggtacgg cctgtgtacc cggccagtac ggcggcgcga tgcacctgac gtccggcccc 840

aacaccctca gtgccgaggt gtacctggct gccgccgcca ccctcctgcg accggtgagc 900

agcagccaga acgcccagtc gctgatctgc tgcgcgcagt acggacagaa ctatcgcaac 960

tccgacccgc acatcggctt catggccaat accaaggcgg tgaacaatcg gctgtcgctg 1020

accaacccca ttggcctgta cctgcaacag cccaccgatt tcagcgcctg gaaaggcccg 1080

cagggccagg acgtgagcca gtattggcgc atcacgcgcg gcacggccaa gtcggcggcc 1140

aacggctccg accagatcct gcaggcggtg ttcgaggttc cgcaaagcgc aggcttctcg 1200

atcaatgaca tcaccatcaa tggccaacgg gtcgactatg tgtgggtcat cgcccaacaa 1260

ctgctggtgg gcctgagcgt caccgccaag ccgatcaccg tcacaccccc gtcgttccct 1320

tgcgtacagg cgcgggttga ggggctgcaa ccctggccgg ttcaactgct gccagtagac 1380

ctgttctacg gacaatcacc caccgacctg cccgcctggc ttgcaccggg aagcagcaac 1440

tcgttcgtac tggtggtgca gggcgccgac ccgagcacca cgacgcagaa tgcacgggtg 1500

caattctcca accccggcat cacggcgcag gtcacccact acctgccaga cgcatccgcc 1560

attcccggac agaccaactc cggcggtacc caggcctaca tcctcaccat cacggtgagc 1620

ccgacggcag cacccggtct ggtcatggtg cgcgcgctca atccgggcga agacgcgaac 1680

gtgagcgcgg ccgatcaccc ttgggaggcc ggcctggcgc tggtgcccgg cgcctga 1737

<210> 219

<211> 1605

<212> ДНК

<213> Pseudomonas sp. VLB120

<400> 219

atgtccaggt cacgcttgag tctcatctcg ctgttgagcg gcatgttgct gtatctgtcg 60

gccctgcctc ccgctgcggc agccacgatg tcggatgccg acagctgtgt gcagcagcaa 120

ttggtgttca atccggccag tggagggttc ctgccggtca acaacttcaa tgccaccaac 180

caggcattca tgaactgttt tgcctggcag ttgttcatcg ccctgaattg gccggtcaat 240

cccggctggc ctgccaccgc cagcctggcg ggtgaacccg acatgaacag caccctggcg 300

caattcggag tgccctcttc cccggggcaa cccatgagcg tggcgcccgt gtgggccagc 360

tacaaagatg ccaacgacat cttcctgccc ggcgcgccca cgcccaccgg ttggggcgtg 420

caaaccatgg taccgtccgg ttgcagcacc cagggcagtc tgaaggccct gaaggtaggt 480

gcacgcaagt tcatgaatgc cacctcagaa ggcgcgatca acgccttgca tggtttccac 540

ctctcgaccg ggacggtcgc ttctattccc gaccccgtca tggaagcgtc cggcggctgg 600

ctgacggacc agtctggcaa cttggtgttc tttgaacgca aagtgggcaa ggccgagttc 660

gactacatcg tcgagaaggg gctctatgat gccgccaatc agttgaaggt cgcgcaaaac 720

ctcgatggca atacaccgga aggcctgtcg ctgcccctcg gcgagccaat gcgttcgctg 780

ccgccgaccc ctgtgccaca ggagcagctg ggcgcgcttg agctcaaggc cgcgtggcgt 840

gtgctgaccg gcaaacccga gctgttcggg cgctacctga ccaccgtcgc ctggctcaaa 900

cgccccgaca cactggagtg cacccaggaa gtggtggggc tggtgggcct gcatatcatc 960

aacaagaccc aggcgtcgcc caatttcatc tggaccacct tcgagcaggt ggacaacgtg 1020

cccgaaccgg accaggcccc gccgcaagga accccgccga acggtttctc tttcaacaac 1080

cccgactgtg ggagcggccc tgcgtgtgaa cccaatgtgg ctcgtatcca gtgcaagcaa 1140

taccaccccg acaaggactg caccgatctc tttccacgcg accagccggt acagaccacc 1200

cgtgagcacc ccgtccccag cgacctgcaa gccctgaaca gcgcggtgca atccaacttt 1260

gcacagcaga cccacggcca gtcggtgttc cagtactaca agctgatcaa cgtactgtgg 1320

accctcgcgc ccaatcctcc cagcccggag ccgggcgcca atgcccaggt gccgctgtca 1380

tacgggccgt tcatcagtca gggcaacgtg ccggtggcca acaccaccat ggagacttac 1440

gtacagggcg atgactgcaa caaatgccat cagtacgcga cgattgccgg cagcccctcc 1500

ttggcctcgg acttctcctt cctgttcaac agcgcgagtt ccgccggcca taaaagcctg 1560

atcaagcgcg tcaaagcctt cgaaacgctc aaggaccgcc cctga 1605

<210> 220

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 220

atgagcacgc ccttcaagca gttcacctct cccgctggcc aagcccccaa ggactacaac 60

aagctaggcc tggaggacca gttgcagcag tttgaaaccg actggaacaa cgacctcacc 120

ggctggaccg agtcgtcgat catcggcaac ccttggtcgg gccagaacga cgcgcctcgc 180

tctggctatt acaacccgct ggtggagggt ttcggtgaag tgaccccgcc cgcgatcacc 240

tgggcgccct tccccaaccg gctgtggacg ttcttctaca acaacggtgc agcggtcgtt 300

ccgcaacttg gcagagccat gaccctgaac caggtgatgg agctggccga ccgcggccag 360

atcaccctcg acaacaccct ctacacgcta tacgacccgg acaaacaggg caccctgctg 420

caactaccgg ccaagcgctg cccaagtatc gactggaacg gcaggtacac ggcgttctca 480

ccttccggcc cgcggggctg gctcgacgag tattgcgagt ggtcgatcgt acgcgatgcc 540

aacggcaaca tgcgcaagat caccttcacc tgcgaaaacc ccgcctactt cctggccatg 600

tggcgcatcg acccgcaggc agtattgggc ctgtaccgcg actacataga ccccagcgtg 660

caactcgagg acctgtacct gcgctacacc gtcgactgcc cgaccggcaa agccggcgat 720

ccggtcatcg acccgaccac tggccagccg gcctatgaca ccgtcaacaa atggaacgcc 780

ggcaccgcct gcgttcccgg gcaatacggt ggtgcgatgc acctgacctc cggccccaac 840

accctcagtg ccgaggtgta cctggccgcc gccgccacca tcctgcgccc ggtcagcagc 900

agccagaatg cccagtcgct gatctgctgc gcgcagtatg ggcagaacta ccgcaactcc 960

gacccgcaca tcggcttcat ggccaattcg acggcagtga aaaatcgcct gtcgctgacc 1020

aacccgattg gcctctacct gcagcaacct accgatttca gtggctggaa aggcccgcaa 1080

ggccaggacg taagccagta ctggcgcatc acccgcggca ccgccaagtc ggccgccaac 1140

gggtccgacc aaatcctgca ggcggtgttc gaagtcccag aaagcgccgg tttctcgatc 1200

aacgacatca ccatcaacaa ccagccggtc aactatgtgt gggtcatcgc ccagcaactg 1260

ttggtgggcc tgagcgtcac cgtcaagccg cttgctacca caccgccctc cttcccgtgc 1320

gtgcaggacc ggcagaccgg ccggcaaccc tggccggtgc agctgctgcc actggacttg 1380

ttctacgggc agtcccccac cgacctgccc gcctggctgg caccgggtag cagcaactcg 1440

ttcgtgcttg tggtgcaagg cgcagacgcc aacaccacgg cgcagaacgc cagggtgcaa 1500

ttctccaacc ctggggtgac ggcacaggtc acccagtacc tgcccgacgc gtcggcgatt 1560

cctggccaga ccaactctgg tggcactcaa gcctacatgc tgaccatcac ggtcagcccc 1620

aacgcagcac ccggcctggt gacggtgcgt gcactgaacc cgggcgaaga cgtgaacgta 1680

agcgcggcag accacccgtg ggaatccggc ctggcgctgg tgcctggcgc ctga 1734

<210> 221

<211> 1590

<212> ДНК

<213> Pseudomonas putida

<400> 221

atgatgtcca gcttacgcct gagccttctg tcgctgctca gcggcatcct gctttgcctg 60

cagaccctgc aacccgctgc tgcggccacg ctgtcggacg ccgatgcctg tgtgcagcaa 120

cagttggtgt tcaaccctgc gagcgggggg tttctgccgg tcaataactt caatgccacc 180

agccaggcgt tcatgaactg cttcggctgg caactgttca ttgccttgaa ctggccagta 240

aaccccggct ggccggccac ccccagcctg gcgggcgaac ccgacaggca aagcaccctg 300

gcgcagttcg gtgtgccgac cacggcgggt gaaccgatga gcgtggcccc ggtgtgggcc 360

agctacaagg acgccaacga tatctttctg ccaggcgcgc ccgcgcccac cggttggggg 420

gtacaaaccc tggtaccaag cagctgcaat agccagggta gcctgaaggc gctcaaggtg 480

ggtgcgcgca aattcatgaa cgctacctca gaaggcgcga tcaacgccct gcacgggttc 540

cacctgtcta ccgggacact ggcatccatt cccgacccgg tcatggaagc gtccggcggc 600

tggctgacgg atcagtcggg caacctggta tttttcgaac gcaaggtagg caaggccgaa 660

ttcgactaca tcgtcgagca tgggctatat gacgcggcca accagttgaa gctcgcccaa 720

accgaggggc tgtcgctgcc catcggtgaa gcgatgcgcg aactgccgcc gtcgcctgtg 780

ccgcaggagc aactgggcgc aatcgagctc aaggccgcct ggcgggtgct gactggcaaa 840

cccgaactgt tcggtcgcta cctcaccacc gtcgcctggc tcaagcgccc cgacaccctg 900

gcatgcaccc aggaagtggt gggcctggtg ggcctgcaca tcatcaacaa gacccaggct 960

tcgcccaact tcatctggac cacgttcgag caggtggaca acgtgcccga acctgcccag 1020

gtgccgccgc agcaaacccc gccgggcggt tttgcgttca acaaccccga atgtggcacc 1080

ggccccgagt gtaaaccgaa cgtggcccgt atccagtgca agcaacacca ccccgaccgc 1140

gactgcagcg acctcttccc gcgcgaccag ccggtacaga ccacccgtga ataccccgtg 1200

cccagtgccc tgcaggccct gaacagcgca gtgcaagcca acttcgcgca gcaaagccag 1260

ggccagtcgg tgttccagta ctacaagctg atcaatgtgc tgtggaccct tgcccccaac 1320

ccacccagcc cagaaccggg tgccaacgca caggtgccgt tgtcctacgg gccgttcatc 1380

agcgagggcc ccgtgccagt ggccaacacc accatggaaa cctacgtgca gggtgatgac 1440

tgcaaccagt gccatcagta cgcgaccatt gccggcagtc cctcgctggc ttcggacttc 1500

tcgttcctgt tcaacactgc cagctcggcc agccagaaaa gcctgatcaa gcgcgtcaaa 1560

gccttcgaga ccctcaagga ccggccctga 1590

<210> 222

<211> 1734

<212> ДНК

<213> Pseudomonas poae

<400> 222

atgagcacac ccttcaccca attcacctcc cctgccgaac aagcgcccaa ggactacaac 60

aagctcggcc tggaggacca attgccgacc ttcgagaccg actggaacaa caacgtcacc 120

ggctggaccc agatgtcgat catcggcaac ccctggtcca acctcaacga tgcaccgcgc 180

tcgggctatt acaacccgct ggagagcggc tacggcacgc tgacgccgaa gaccatcacc 240

tggcagccct ttcccaatcg cctctggacg ttcttctaca acaacggcgc cgccgtggtc 300

ccgcaactgg gcggcaaggc catgaccctg gaccaggtga tgcaactgac cgaccacggc 360

cagatcaccc tcaataacac cctgtattcg ctgtacccgg acccgcaggc gacccaactg 420

cagatcccca gcgtgctgtg caaatccatc aactggaacg gcccctacgc cgacttttcg 480

ccctctggcc cacggggctg gctggatgaa tactgcgagt ggtcgatcac ccgcgacccc 540

gacggcaaca tgcgcagcat catgttcacc agcgagaacc cggcgtactt cctgaccatg 600

tggaacatcg acccgggtgc cgtgctgggc ctgtaccagg cgtatgtcga cccgcaggtg 660

aaactcgaag acctgtacct gcgctacacc gccgacggcc cgaccggcaa ggccggcgaa 720

ccggtgctcg accccaccac cggccagccc gcctacgaca ccgtgaacaa atggaacagc 780

ggcaccgtgc gcataccggg cgtgtcgggc ggcgcgatgc acctgacctc cggccccaat 840

accctgagtg ccgagatcta cctggcggcg gccgccacca tcctgcggcc gctcagcagc 900

agccagaacc agcagagcct gatctgctgc gcgcagtacg ggcagaacta ccgcaactcc 960

gacccgcata tcgggttctc cgccaaccag gcggcggtca acaacctgat ctcgttgacc 1020

aaccccatcg gcctgtacct gcagcaaccc aagtccttca gcacctggaa aggcccgcaa 1080

ggcgaggatg tcagcagcta ctggcgcgtc acccgtggca ccgccggcac cggcccgaac 1140

aactccgacc agatcctcca ggcggtcttc gaagtgccgg ccagtgcagg gttctcgatc 1200

aatgacatca ccatcagcgg cacgccgatc gactacgtgt gggtgatcgc caacgaactg 1260

aatgtggccc tcagcgtgac cccggcaccg ctcaccgccc agcccaagga gtgcgcctgc 1320

gtggcggcca acaccaccga tgcgcagccc tggccggtgc agttgctgcc gattgacctg 1380

ttctacggcc aatcccccag cgacttgccg gccagctttg cgcccggcag ctcaagccag 1440

ttcgtgctgg tggtgcaagg cgccgacccg aacaccacgg cggcggatgc acgggtgcag 1500

ttctccaacc cgggcatcac ggcccaggtc acgcagttcc tgccggatgc ctcggcgatt 1560

cccgggcaga ccgacggcgg cggcacccag ggctacatca tgaccattac cgtcagcagc 1620

aacgcggcgc cggggctggt cagcgtgcgt gcgctcaacc ccaacgaagc ggccaacccg 1680

agtgccaccg agcacccatg ggaaagcggc ctggccctgg tgcccagcgc ctga 1734

<210> 223

<211> 1590

<212> ДНК

<213> Pseudomonas poae

<400> 223

atgaacggat ggcttcgccc gctgcgccgg gcacgcttgc gtattgtctg cacaatcacc 60

tgcgcccttc tcccgtggct ggcccccgca ccggcaagtg ccgcctcgga tgcccagagc 120

tgcgtcagcc agttggtgtt cgaccccacc agcggcggct tcctgccggt gaacaatttc 180

ggcaccgagc aggcttttct caattgtttc ggctggcagt tgttcatcgc catgaactgg 240

ccggtcaacc ccggctggcc cgccaacccg agcctggccg gtgagccgga tacgcaaagc 300

agcgcggccc agttcggcgt gccgccaacc ccaggccaac cgatgagcaa tgccccggtg 360

tgggccagct acaaggatgc cagcgagatc ttcctgcccg gcgcggccaa gccgtccggc 420

tggggcgtgg aaaccctggt gccgtccaat tgcaccgcca ccggcaatct caaggcgttt 480

gccacgggcg cgcgtaaatt catcaccgcc acctcggaaa gcgcgatcaa ccgcaagcac 540

cgcttccacc tgtccagcgg cacccaggtg accctgcccg attcgatcat ggaagcctcc 600

ggcggttggc taacggacca gtccggcaac ctggtgtttt tcgagcgcaa ggtgggcaag 660

gccgagttcg actacatcgt cgacaacggc ttgtacgacg ccgccaacca gctgatcgtg 720

gcgcagaaca gcgacaaccg gcaccccgcc ggcctgtcac tgccggccgg caagctggtg 780

cgtgaactgc cggccaaggc gctaccccag gaggaactcg gcgccctgga actcaaggcc 840

gcctggcgcg tgctcaccaa caagcccgcc ctatacgggc gctacctgac caccgtggcc 900

tggctgcaac gcccggacac gctgcaatgc acccaggaag tgattggcct ggtgggcctg 960

catatcatca acaagaccca gacccagccg aatttcatct ggaccacctt cgagcaggtc 1020

gacaacgtgc ctgacggtgg tgccgcgccg cccgagggct acagcttcaa caacccggca 1080

tgcaccggtg atgcctgcac gccgaatgtg ccccgcgtgc agtgcgacgc cacgcacacg 1140

ccgcccaact gcacgcccct cgaccagccg gtgcaggcca cccgcgccaa cgccacgccc 1200

caggacatgc aggcgctgaa caccgcggtg cagcagacct tcgcccagca gacccagggc 1260

cagtcggtat tccagtacta caaactggtg aatgtgctgt ggtccaagac gcccaatgcg 1320

cccaacgacc caggcccagg gccgaacgtg caggtaccgc tgtcctatgg gccgtttgtc 1380

agcgaccaga gtgtcgtcgt cgccaacacc accatggaaa cctacgtgca gaccgacaac 1440

tgcaacgact gccaccagta cgcggcgatt gccggaaaat ccgggctggc gtcggacttc 1500

tccttcctgt tcagcaatgc cgactcggcg aagaacacgc ggctgatcaa acgcatcgag 1560

tcgttcaaga ccctcaagga caacccgtaa 1590

<210> 224

<211> 771

<212> ДНК

<213> Pseudomonas entomophila

<400> 224

atgggttcta ttactgatca tgatcaactg atcgcttggg ttcaatcgct ggatattcct 60

gagcccacga aaagtattgc gcggtcacgc aatgcggtgg ttcgcgccag cagcgaagaa 120

gaaggagctg cggtggtgcg cggtagcgtg acatcgttcg ttactggatt gaaacagcaa 180

gcgcgcgatg atgtgcagaa cagtacgctg ctgatgcaac tggcggccga caagaaatat 240

aatcccgaca cgcaacggga ggagtggttc aagttctaca ccgatggctt agccaacctg 300

ggctgggggc gcgtcagttc gatttaccag aaatataacc cgcgtaatac caatgtcacc 360

atggatgaag tggtgctgga ggtgatcgct gcggttgtcg gtgctgacag tgccgtgtac 420

aaggtcaccg agaagacctt cgcggcgctg gaaagcaacc cgaagaatca gggggcgctg 480

aagctgttcg acagtaccac cactcgcgac gacatcggca cgttccagat ccttccggtc 540

atgcaggacc gggatggcaa cgtggtcatg gtactgacca cagtcaacgc cagcaccact 600

gtgcaaaagg gtagcttcct gttctggagc tggagcaaga ccacggcctg gatgtatcgg 660

gctgcgcagc agacggtgct caacgaatcg gtgtactcac gcgtgcgtga gtcggtgatc 720

cagaaattgg gcaagaatgc cgaagatttt attgatggtc tcgatatcta a 771

<210> 225

<211> 783

<212> ДНК

<213> Pseudomonas entomophila

<400> 225

atggcattat cagccgatga agtttatgtg gtttcgggca acctgctgtc tgcaatgccc 60

aagcttgttg atcctgtgat gttcgaagat tttgccaatt ccaatttgct ctgccaattg 120

gcggcggaca agaaccaagg cacgcggttt gttgatccgc ccgcctggct agacttctac 180

aggaatgcat tgggcaaggt gttctggagg atcagtaatt ccgggacggt cagttttaac 240

ataccgcctc tggttcgcag cataacgata aaggaagtgc tggagaagac gttctataaa 300

acactggatc atgaagtctc gctgcaatta gatagcagta tcgagcgttt ggaagagcag 360

ccagaagaga gtgctgctgc acgcttgtat cgtgcgaaga cccaggtcac ttacaagtcc 420

gccgtctcgg acctggccgt ccggccgcac cccatctcga ccattaatct gcagataagc 480

gcggtgcaga gtggaggtaa aatatcggtc tgtagtgtct attttacaac gtcggctgat 540

attgaaagtg atgtgttcaa ccagaagttt ctggtcagtc agctccgggg caatgtcagc 600

gtgagtacgt ttgatgcaaa attgctggag tcgagttacg cgggtatccg acagagcgtt 660

atcgaaaagt tggggcctga aaatatccgc gagaacatca tccaggtgtc agctgaggtg 720

ttctccctcg cgggcccgcg ccatgccggt gccaagcagt tcattcagga actggaaatc 780

tag 783

<210> 226

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 226

atgtcggctc aagaaaactt tgttggcgga tggactcctt atcacgaact gactccaaag 60

gatcgggaag tattcaaaga ggccctggcc gggttcgtgg gtgtgaacta cacccctgaa 120

aaagtttcga cccaggtcgt caacggcacg aactatcgtt atctgtcgaa agcaacggtg 180

cctggctcct cggacagctg gcaagcggta gtggaaatct acgcgcctat caaaggcaag 240

ccgcacatca cccagatcca ccggatctaa 270

<210> 227

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 227

atgtcggctc aagagaatct cgttggcgga tggactcctt atcacgaact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatga agccctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta caccgccgag 120

ttggtttcga cccaggtcgt taacggcacc aactatcgtt atcagacgaa agcaacgcag 180

ccgggttcat caaacagctg gcaagcgatc gtggaaattt acgcgccgat taatggcaag 240

ccacatatca cccagatcat ccggatctaa 270

<210> 228

<211> 270

<212> ДНК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 228

atgtcggctc aagaaaatct cgttggcgga tggactcctt atcacgtact gactccaaag 60

gatcaggaag tattcgatga agccctggcc gggctcgtgg gtgtgcacta caccgccgag 120

ctggtttcga cccaggtcgt taacggcacc aactatcgtt atcaggcgaa agccacgcag 180

cctggttcgc caaacagctg gcaagcggtc gtggaaattt acgcgccgat taacggcaag 240

ccgtatgtca cccagatcat ccggatctaa 270

<210> 229

<211> 273

<212> ДНК

<213> Aeromonas hydrophila

<400> 229

atgtcagaac aagcagtgtt gttgggtgga tggactgcct accacaagct gagcgccaag 60

gatcaggccg tattcaacca ggcgctggaa ggatttgtcg gggtgcagta cacacccttt 120

gaagtctcca cccaggtcgt cgccggcacc aactaccgtt tcaaatgcaa aagcactgtg 180

ccgctgccca acccgatcca cggggaagcc gtggtgcaga tcttccaatc cctggatggg 240

tcggcccata tcacctccat caccccgatt tga 273

<210> 230

<211> 273

<212> ДНК

<213> Aeromonas veronii

<400> 230

atgtcagaac aagcagtgtt ggtgggtgga tggaccgcat atcacaagct gaccgccgag 60

gatcaggcag tgttcaacca ggcgatgaaa ggatttgtcg gggtgcagta cgtacccttt 120

gaagtctcca ctcaagtggt ggctggcacc aactaccgct tcaagtgcaa gagcactgtg 180

ccgcttgcca aaccgatcca tggcgaagcc gtggtacaga tcttcaaatc actggacggg 240

gatgcccata tcacctccat taccccaatc tga 273

<210> 231

<211> 273

<212> ДНК

<213> Haemophilus piscium

<400> 231

atgtcagaac aagcagtgtt gttgggtgga tggaccgcat accacaagct gagcgcaaaa 60

gatcaggcgg tatttgacct ggcactgaaa ggatttgtcg gggtgcagta ccagccgttt 120

gaagtctcca cccaggtggt ggctggcacc aactaccgtt tcaaatgcaa aaccacggtg 180

ccgctgccca acccgatcca cggggaagcc gtggtgcaga tcttccagtc tctggatggc 240

tctgctcata tcacctccat caccccgatc tga 273

<210> 232

<211> 578

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. VLB120

<400> 232

Met Ser Thr Ser Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Leu Thr Gly Trp Thr Gln Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Asp Val Thr Val Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Ile Val Pro Gln Leu Gly Gly Asn Ala Met Thr Leu Glu Gln

100 105 110

Val Met Glu Leu Ala Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Lys Leu Tyr Asp Pro Asp Asn Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro

130 135 140

Ala Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Lys Gly Gln Tyr Thr Ala Phe

145 150 155 160

Ser Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser

165 170 175

Ile Val Arg Asp Thr Asp Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys

180 185 190

Glu Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Asn Ala

195 200 205

Val Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Asn Val Gln Leu Glu

210 215 220

Asp Leu Tyr Leu Arg Tyr Ala Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly

225 230 235 240

Asp Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val

245 250 255

Asn Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly

260 265 270

Ala Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr

275 280 285

Leu Ala Ala Ala Ala Thr Leu Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn

290 295 300

Ala Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn

305 310 315 320

Ser Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Thr Lys Ala Val Asn Asn

325 330 335

Arg Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr

340 345 350

Asp Phe Ser Ala Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr

355 360 365

Trp Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp

370 375 380

Gln Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Gln Ser Ala Gly Phe Ser

385 390 395 400

Ile Asn Asp Ile Thr Ile Asn Gly Gln Arg Val Asp Tyr Val Trp Val

405 410 415

Ile Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Ala Lys Pro Ile

420 425 430

Thr Val Thr Pro Pro Ser Phe Pro Cys Val Gln Ala Arg Val Glu Gly

435 440 445

Leu Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Val Asp Leu Phe Tyr Gly

450 455 460

Gln Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn

465 470 475 480

Ser Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Ser Thr Thr Thr Gln

485 490 495

Asn Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Thr Ala Gln Val Thr

500 505 510

His Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly

515 520 525

Gly Thr Gln Ala Tyr Ile Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Thr Ala Ala

530 535 540

Pro Gly Leu Val Met Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Ala Asn

545 550 555 560

Val Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ala Gly Leu Ala Leu Val Pro

565 570 575

Gly Ala

<210> 233

<211> 534

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas sp. VLB120

<400> 233

Met Ser Arg Ser Arg Leu Ser Leu Ile Ser Leu Leu Ser Gly Met Leu

1 5 10 15

Leu Tyr Leu Ser Ala Leu Pro Pro Ala Ala Ala Ala Thr Met Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ser Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Asn Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Ala Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Ala Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Met Asn

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Ser Ser Pro Gly Gln Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Thr Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Met Val

130 135 140

Pro Ser Gly Cys Ser Thr Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Val Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Glu Lys Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Val Ala Gln Asn

225 230 235 240

Leu Asp Gly Asn Thr Pro Glu Gly Leu Ser Leu Pro Leu Gly Glu Pro

245 250 255

Met Arg Ser Leu Pro Pro Thr Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala

260 265 270

Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu

275 280 285

Phe Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr

290 295 300

Leu Glu Cys Thr Gln Glu Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile

305 310 315 320

Asn Lys Thr Gln Ala Ser Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln

325 330 335

Val Asp Asn Val Pro Glu Pro Asp Gln Ala Pro Pro Gln Gly Thr Pro

340 345 350

Pro Asn Gly Phe Ser Phe Asn Asn Pro Asp Cys Gly Ser Gly Pro Ala

355 360 365

Cys Glu Pro Asn Val Ala Arg Ile Gln Cys Lys Gln Tyr His Pro Asp

370 375 380

Lys Asp Cys Thr Asp Leu Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr

385 390 395 400

Arg Glu His Pro Val Pro Ser Asp Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val

405 410 415

Gln Ser Asn Phe Ala Gln Gln Thr His Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr

420 425 430

Tyr Lys Leu Ile Asn Val Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser

435 440 445

Pro Glu Pro Gly Ala Asn Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe

450 455 460

Ile Ser Gln Gly Asn Val Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr

465 470 475 480

Val Gln Gly Asp Asp Cys Asn Lys Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala

485 490 495

Gly Ser Pro Ser Leu Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Ser Ala

500 505 510

Ser Ser Ala Gly His Lys Ser Leu Ile Lys Arg Val Lys Ala Phe Glu

515 520 525

Thr Leu Lys Asp Arg Pro

530

<210> 234

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 234

Met Ser Thr Pro Phe Lys Gln Phe Thr Ser Pro Ala Gly Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Gln Gln Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asp Leu Thr Gly Trp Thr Glu Ser Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Gly Gln Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Val Glu Gly Phe Gly Glu Val Thr Pro Pro Ala Ile Thr

65 70 75 80

Trp Ala Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Arg Ala Met Thr Leu Asn Gln Val

100 105 110

Met Glu Leu Ala Asp Arg Gly Gln Ile Thr Leu Asp Asn Thr Leu Tyr

115 120 125

Thr Leu Tyr Asp Pro Asp Lys Gln Gly Thr Leu Leu Gln Leu Pro Ala

130 135 140

Lys Arg Cys Pro Ser Ile Asp Trp Asn Gly Arg Tyr Thr Ala Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Val Arg Asp Ala Asn Gly Asn Met Arg Lys Ile Thr Phe Thr Cys Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Ala Met Trp Arg Ile Asp Pro Gln Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Arg Asp Tyr Ile Asp Pro Ser Val Gln Leu Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Val Asp Cys Pro Thr Gly Lys Ala Gly Asp

225 230 235 240

Pro Val Ile Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ala Gly Thr Ala Cys Val Pro Gly Gln Tyr Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Val Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Val Ser Ser Ser Gln Asn Ala

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Phe Met Ala Asn Ser Thr Ala Val Lys Asn Arg

325 330 335

Leu Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Thr Asp

340 345 350

Phe Ser Gly Trp Lys Gly Pro Gln Gly Gln Asp Val Ser Gln Tyr Trp

355 360 365

Arg Ile Thr Arg Gly Thr Ala Lys Ser Ala Ala Asn Gly Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Glu Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Asp Ile Thr Ile Asn Asn Gln Pro Val Asn Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Gln Gln Leu Leu Val Gly Leu Ser Val Thr Val Lys Pro Leu Ala

420 425 430

Thr Thr Pro Pro Ser Phe Pro Cys Val Gln Asp Arg Gln Thr Gly Arg

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Leu Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Thr Asp Leu Pro Ala Trp Leu Ala Pro Gly Ser Ser Asn Ser

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Ala Asn Thr Thr Ala Gln Asn

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Val Thr Ala Gln Val Thr Gln

500 505 510

Tyr Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asn Ser Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Ala Tyr Met Leu Thr Ile Thr Val Ser Pro Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Thr Val Arg Ala Leu Asn Pro Gly Glu Asp Val Asn Val

545 550 555 560

Ser Ala Ala Asp His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Gly

565 570 575

Ala

<210> 235

<211> 528

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas putida

<400> 235

Met Ser Ser Leu Arg Leu Ser Leu Leu Ser Leu Leu Ser Gly Ile Leu

1 5 10 15

Leu Cys Leu Gln Thr Leu Gln Pro Ala Ala Ala Ala Thr Leu Ser Asp

20 25 30

Ala Asp Ala Cys Val Gln Gln Gln Leu Val Phe Asn Pro Ala Ser Gly

35 40 45

Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Asn Ala Thr Ser Gln Ala Phe Met

50 55 60

Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Leu Asn Trp Pro Val Asn

65 70 75 80

Pro Gly Trp Pro Ala Thr Pro Ser Leu Ala Gly Glu Pro Asp Arg Gln

85 90 95

Ser Thr Leu Ala Gln Phe Gly Val Pro Thr Thr Ala Gly Glu Pro Met

100 105 110

Ser Val Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Asn Asp Ile Phe

115 120 125

Leu Pro Gly Ala Pro Ala Pro Thr Gly Trp Gly Val Gln Thr Leu Val

130 135 140

Pro Ser Ser Cys Asn Ser Gln Gly Ser Leu Lys Ala Leu Lys Val Gly

145 150 155 160

Ala Arg Lys Phe Met Asn Ala Thr Ser Glu Gly Ala Ile Asn Ala Leu

165 170 175

His Gly Phe His Leu Ser Thr Gly Thr Leu Ala Ser Ile Pro Asp Pro

180 185 190

Val Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser Gly Asn Leu

195 200 205

Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp Tyr Ile Val

210 215 220

Glu His Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Lys Leu Ala Gln Thr

225 230 235 240

Glu Gly Leu Ser Leu Pro Ile Gly Glu Ala Met Arg Glu Leu Pro Pro

245 250 255

Ser Pro Val Pro Gln Glu Gln Leu Gly Ala Ile Glu Leu Lys Ala Ala

260 265 270

Trp Arg Val Leu Thr Gly Lys Pro Glu Leu Phe Gly Arg Tyr Leu Thr

275 280 285

Thr Val Ala Trp Leu Lys Arg Pro Asp Thr Leu Ala Cys Thr Gln Glu

290 295 300

Val Val Gly Leu Val Gly Leu His Ile Ile Asn Lys Thr Gln Ala Ser

305 310 315 320

Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr Phe Glu Gln Val Asp Asn Val Pro Glu

325 330 335

Pro Ala Gln Val Pro Pro Gln Gln Thr Pro Pro Gly Gly Phe Ala Phe

340 345 350

Asn Asn Pro Glu Cys Gly Thr Gly Pro Glu Cys Lys Pro Asn Val Ala

355 360 365

Arg Ile Gln Cys Lys Gln His His Pro Asp Arg Asp Cys Ser Asp Leu

370 375 380

Phe Pro Arg Asp Gln Pro Val Gln Thr Thr Arg Glu Tyr Pro Val Pro

385 390 395 400

Ser Ala Leu Gln Ala Leu Asn Ser Ala Val Gln Ala Asn Phe Ala Gln

405 410 415

Gln Ser Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Ile Asn Val

420 425 430

Leu Trp Thr Leu Ala Pro Asn Pro Pro Ser Pro Glu Pro Gly Ala Asn

435 440 445

Ala Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Ile Ser Glu Gly Pro Val

450 455 460

Pro Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Val Gln Gly Asp Asp Cys

465 470 475 480

Asn Gln Cys His Gln Tyr Ala Thr Ile Ala Gly Ser Pro Ser Leu Ala

485 490 495

Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Asn Thr Ala Ser Ser Ala Ser Gln Lys

500 505 510

Ser Leu Ile Lys Arg Val Lys Ala Phe Glu Thr Leu Lys Asp Arg Pro

515 520 525

<210> 236

<211> 577

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas poae

<400> 236

Met Ser Thr Pro Phe Thr Gln Phe Thr Ser Pro Ala Glu Gln Ala Pro

1 5 10 15

Lys Asp Tyr Asn Lys Leu Gly Leu Glu Asp Gln Leu Pro Thr Phe Glu

20 25 30

Thr Asp Trp Asn Asn Asn Val Thr Gly Trp Thr Gln Met Ser Ile Ile

35 40 45

Gly Asn Pro Trp Ser Asn Leu Asn Asp Ala Pro Arg Ser Gly Tyr Tyr

50 55 60

Asn Pro Leu Glu Ser Gly Tyr Gly Thr Leu Thr Pro Lys Thr Ile Thr

65 70 75 80

Trp Gln Pro Phe Pro Asn Arg Leu Trp Thr Phe Phe Tyr Asn Asn Gly

85 90 95

Ala Ala Val Val Pro Gln Leu Gly Gly Lys Ala Met Thr Leu Asp Gln

100 105 110

Val Met Gln Leu Thr Asp His Gly Gln Ile Thr Leu Asn Asn Thr Leu

115 120 125

Tyr Ser Leu Tyr Pro Asp Pro Gln Ala Thr Gln Leu Gln Ile Pro Ser

130 135 140

Val Leu Cys Lys Ser Ile Asn Trp Asn Gly Pro Tyr Ala Asp Phe Ser

145 150 155 160

Pro Ser Gly Pro Arg Gly Trp Leu Asp Glu Tyr Cys Glu Trp Ser Ile

165 170 175

Thr Arg Asp Pro Asp Gly Asn Met Arg Ser Ile Met Phe Thr Ser Glu

180 185 190

Asn Pro Ala Tyr Phe Leu Thr Met Trp Asn Ile Asp Pro Gly Ala Val

195 200 205

Leu Gly Leu Tyr Gln Ala Tyr Val Asp Pro Gln Val Lys Leu Glu Asp

210 215 220

Leu Tyr Leu Arg Tyr Thr Ala Asp Gly Pro Thr Gly Lys Ala Gly Glu

225 230 235 240

Pro Val Leu Asp Pro Thr Thr Gly Gln Pro Ala Tyr Asp Thr Val Asn

245 250 255

Lys Trp Asn Ser Gly Thr Val Arg Ile Pro Gly Val Ser Gly Gly Ala

260 265 270

Met His Leu Thr Ser Gly Pro Asn Thr Leu Ser Ala Glu Ile Tyr Leu

275 280 285

Ala Ala Ala Ala Thr Ile Leu Arg Pro Leu Ser Ser Ser Gln Asn Gln

290 295 300

Gln Ser Leu Ile Cys Cys Ala Gln Tyr Gly Gln Asn Tyr Arg Asn Ser

305 310 315 320

Asp Pro His Ile Gly Phe Ser Ala Asn Gln Ala Ala Val Asn Asn Leu

325 330 335

Ile Ser Leu Thr Asn Pro Ile Gly Leu Tyr Leu Gln Gln Pro Lys Ser

340 345 350

Phe Ser Thr Trp Lys Gly Pro Gln Gly Glu Asp Val Ser Ser Tyr Trp

355 360 365

Arg Val Thr Arg Gly Thr Ala Gly Thr Gly Pro Asn Asn Ser Asp Gln

370 375 380

Ile Leu Gln Ala Val Phe Glu Val Pro Ala Ser Ala Gly Phe Ser Ile

385 390 395 400

Asn Asp Ile Thr Ile Ser Gly Thr Pro Ile Asp Tyr Val Trp Val Ile

405 410 415

Ala Asn Glu Leu Asn Val Ala Leu Ser Val Thr Pro Ala Pro Leu Thr

420 425 430

Ala Gln Pro Lys Glu Cys Ala Cys Val Ala Ala Asn Thr Thr Asp Ala

435 440 445

Gln Pro Trp Pro Val Gln Leu Leu Pro Ile Asp Leu Phe Tyr Gly Gln

450 455 460

Ser Pro Ser Asp Leu Pro Ala Ser Phe Ala Pro Gly Ser Ser Ser Gln

465 470 475 480

Phe Val Leu Val Val Gln Gly Ala Asp Pro Asn Thr Thr Ala Ala Asp

485 490 495

Ala Arg Val Gln Phe Ser Asn Pro Gly Ile Thr Ala Gln Val Thr Gln

500 505 510

Phe Leu Pro Asp Ala Ser Ala Ile Pro Gly Gln Thr Asp Gly Gly Gly

515 520 525

Thr Gln Gly Tyr Ile Met Thr Ile Thr Val Ser Ser Asn Ala Ala Pro

530 535 540

Gly Leu Val Ser Val Arg Ala Leu Asn Pro Asn Glu Ala Ala Asn Pro

545 550 555 560

Ser Ala Thr Glu His Pro Trp Glu Ser Gly Leu Ala Leu Val Pro Ser

565 570 575

Ala

<210> 237

<211> 529

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas poae

<400> 237

Met Asn Gly Trp Leu Arg Pro Leu Arg Arg Ala Arg Leu Arg Ile Val

1 5 10 15

Cys Thr Ile Thr Cys Ala Leu Leu Pro Trp Leu Ala Pro Ala Pro Ala

20 25 30

Ser Ala Ala Ser Asp Ala Gln Ser Cys Val Ser Gln Leu Val Phe Asp

35 40 45

Pro Thr Ser Gly Gly Phe Leu Pro Val Asn Asn Phe Gly Thr Glu Gln

50 55 60

Ala Phe Leu Asn Cys Phe Gly Trp Gln Leu Phe Ile Ala Met Asn Trp

65 70 75 80

Pro Val Asn Pro Gly Trp Pro Ala Asn Pro Ser Leu Ala Gly Glu Pro

85 90 95

Asp Thr Gln Ser Ser Ala Ala Gln Phe Gly Val Pro Pro Thr Pro Gly

100 105 110

Gln Pro Met Ser Asn Ala Pro Val Trp Ala Ser Tyr Lys Asp Ala Ser

115 120 125

Glu Ile Phe Leu Pro Gly Ala Ala Lys Pro Ser Gly Trp Gly Val Glu

130 135 140

Thr Leu Val Pro Ser Asn Cys Thr Ala Thr Gly Asn Leu Lys Ala Phe

145 150 155 160

Ala Thr Gly Ala Arg Lys Phe Ile Thr Ala Thr Ser Glu Ser Ala Ile

165 170 175

Asn Arg Lys His Arg Phe His Leu Ser Ser Gly Thr Gln Val Thr Leu

180 185 190

Pro Asp Ser Ile Met Glu Ala Ser Gly Gly Trp Leu Thr Asp Gln Ser

195 200 205

Gly Asn Leu Val Phe Phe Glu Arg Lys Val Gly Lys Ala Glu Phe Asp

210 215 220

Tyr Ile Val Asp Asn Gly Leu Tyr Asp Ala Ala Asn Gln Leu Ile Val

225 230 235 240

Ala Gln Asn Ser Asp Asn Arg His Pro Ala Gly Leu Ser Leu Pro Ala

245 250 255

Gly Lys Leu Val Arg Glu Leu Pro Ala Lys Ala Leu Pro Gln Glu Glu

260 265 270

Leu Gly Ala Leu Glu Leu Lys Ala Ala Trp Arg Val Leu Thr Asn Lys

275 280 285

Pro Ala Leu Tyr Gly Arg Tyr Leu Thr Thr Val Ala Trp Leu Gln Arg

290 295 300

Pro Asp Thr Leu Gln Cys Thr Gln Glu Val Ile Gly Leu Val Gly Leu

305 310 315 320

His Ile Ile Asn Lys Thr Gln Thr Gln Pro Asn Phe Ile Trp Thr Thr

325 330 335

Phe Glu Gln Val Asp Asn Val Pro Asp Gly Gly Ala Ala Pro Pro Glu

340 345 350

Gly Tyr Ser Phe Asn Asn Pro Ala Cys Thr Gly Asp Ala Cys Thr Pro

355 360 365

Asn Val Pro Arg Val Gln Cys Asp Ala Thr His Thr Pro Pro Asn Cys

370 375 380

Thr Pro Leu Asp Gln Pro Val Gln Ala Thr Arg Ala Asn Ala Thr Pro

385 390 395 400

Gln Asp Met Gln Ala Leu Asn Thr Ala Val Gln Gln Thr Phe Ala Gln

405 410 415

Gln Thr Gln Gly Gln Ser Val Phe Gln Tyr Tyr Lys Leu Val Asn Val

420 425 430

Leu Trp Ser Lys Thr Pro Asn Ala Pro Asn Asp Pro Gly Pro Gly Pro

435 440 445

Asn Val Gln Val Pro Leu Ser Tyr Gly Pro Phe Val Ser Asp Gln Ser

450 455 460

Val Val Val Ala Asn Thr Thr Met Glu Thr Tyr Val Gln Thr Asp Asn

465 470 475 480

Cys Asn Asp Cys His Gln Tyr Ala Ala Ile Ala Gly Lys Ser Gly Leu

485 490 495

Ala Ser Asp Phe Ser Phe Leu Phe Ser Asn Ala Asp Ser Ala Lys Asn

500 505 510

Thr Arg Leu Ile Lys Arg Ile Glu Ser Phe Lys Thr Leu Lys Asp Asn

515 520 525

Pro

<210> 238

<211> 256

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas entomophila

<400> 238

Met Gly Ser Ile Thr Asp His Asp Gln Leu Ile Ala Trp Val Gln Ser

1 5 10 15

Leu Asp Ile Pro Glu Pro Thr Lys Ser Ile Ala Arg Ser Arg Asn Ala

20 25 30

Val Val Arg Ala Ser Ser Glu Glu Glu Gly Ala Ala Val Val Arg Gly

35 40 45

Ser Val Thr Ser Phe Val Thr Gly Leu Lys Gln Gln Ala Arg Asp Asp

50 55 60

Val Gln Asn Ser Thr Leu Leu Met Gln Leu Ala Ala Asp Lys Lys Tyr

65 70 75 80

Asn Pro Asp Thr Gln Arg Glu Glu Trp Phe Lys Phe Tyr Thr Asp Gly

85 90 95

Leu Ala Asn Leu Gly Trp Gly Arg Val Ser Ser Ile Tyr Gln Lys Tyr

100 105 110

Asn Pro Arg Asn Thr Asn Val Thr Met Asp Glu Val Val Leu Glu Val

115 120 125

Ile Ala Ala Val Val Gly Ala Asp Ser Ala Val Tyr Lys Val Thr Glu

130 135 140

Lys Thr Phe Ala Ala Leu Glu Ser Asn Pro Lys Asn Gln Gly Ala Leu

145 150 155 160

Lys Leu Phe Asp Ser Thr Thr Thr Arg Asp Asp Ile Gly Thr Phe Gln

165 170 175

Ile Leu Pro Val Met Gln Asp Arg Asp Gly Asn Val Val Met Val Leu

180 185 190

Thr Thr Val Asn Ala Ser Thr Thr Val Gln Lys Gly Ser Phe Leu Phe

195 200 205

Trp Ser Trp Ser Lys Thr Thr Ala Trp Met Tyr Arg Ala Ala Gln Gln

210 215 220

Thr Val Leu Asn Glu Ser Val Tyr Ser Arg Val Arg Glu Ser Val Ile

225 230 235 240

Gln Lys Leu Gly Lys Asn Ala Glu Asp Phe Ile Asp Gly Leu Asp Ile

245 250 255

<210> 239

<211> 260

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas entomophila

<400> 239

Met Ala Leu Ser Ala Asp Glu Val Tyr Val Val Ser Gly Asn Leu Leu

1 5 10 15

Ser Ala Met Pro Lys Leu Val Asp Pro Val Met Phe Glu Asp Phe Ala

20 25 30

Asn Ser Asn Leu Leu Cys Gln Leu Ala Ala Asp Lys Asn Gln Gly Thr

35 40 45

Arg Phe Val Asp Pro Pro Ala Trp Leu Asp Phe Tyr Arg Asn Ala Leu

50 55 60

Gly Lys Val Phe Trp Arg Ile Ser Asn Ser Gly Thr Val Ser Phe Asn

65 70 75 80

Ile Pro Pro Leu Val Arg Ser Ile Thr Ile Lys Glu Val Leu Glu Lys

85 90 95

Thr Phe Tyr Lys Thr Leu Asp His Glu Val Ser Leu Gln Leu Asp Ser

100 105 110

Ser Ile Glu Arg Leu Glu Glu Gln Pro Glu Glu Ser Ala Ala Ala Arg

115 120 125

Leu Tyr Arg Ala Lys Thr Gln Val Thr Tyr Lys Ser Ala Val Ser Asp

130 135 140

Leu Ala Val Arg Pro His Pro Ile Ser Thr Ile Asn Leu Gln Ile Ser

145 150 155 160

Ala Val Gln Ser Gly Gly Lys Ile Ser Val Cys Ser Val Tyr Phe Thr

165 170 175

Thr Ser Ala Asp Ile Glu Ser Asp Val Phe Asn Gln Lys Phe Leu Val

180 185 190

Ser Gln Leu Arg Gly Asn Val Ser Val Ser Thr Phe Asp Ala Lys Leu

195 200 205

Leu Glu Ser Ser Tyr Ala Gly Ile Arg Gln Ser Val Ile Glu Lys Leu

210 215 220

Gly Pro Glu Asn Ile Arg Glu Asn Ile Ile Gln Val Ser Ala Glu Val

225 230 235 240

Phe Ser Leu Ala Gly Pro Arg His Ala Gly Ala Lys Gln Phe Ile Gln

245 250 255

Glu Leu Glu Ile

260

<210> 240

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas chlororaphis

<400> 240

Met Ser Ala Gln Glu Asn Phe Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Arg Glu Val Phe Lys Glu Ala Leu Ala Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Asn Tyr Thr Pro Glu Lys Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Leu Ser Lys Ala Thr Val Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asp Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Lys Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile His Arg Ile

85

<210> 241

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 241

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Glu

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Glu Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Thr Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Ser

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Ile Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro His Ile Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 242

<211> 89

<212> БЕЛОК

<213> Pseudomonas rhodesiae

<400> 242

Met Ser Ala Gln Glu Asn Leu Val Gly Gly Trp Thr Pro Tyr His Val

1 5 10 15

Leu Thr Pro Lys Asp Gln Glu Val Phe Asp Glu Ala Leu Ala Gly Leu

20 25 30

Val Gly Val His Tyr Thr Ala Glu Leu Val Ser Thr Gln Val Val Asn

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Tyr Gln Ala Lys Ala Thr Gln Pro Gly Ser Pro

50 55 60

Asn Ser Trp Gln Ala Val Val Glu Ile Tyr Ala Pro Ile Asn Gly Lys

65 70 75 80

Pro Tyr Val Thr Gln Ile Ile Arg Ile

85

<210> 243

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas hydrophila

<400> 243

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Leu Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Ser Ala Lys Asp Gln Ala Val Phe Asn Gln Ala Leu Glu Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Thr Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Ser Thr Val Pro Leu Pro Asn

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Gln Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Ser Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<210> 244

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Aeromonas veronii

<400> 244

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Val Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Thr Ala Glu Asp Gln Ala Val Phe Asn Gln Ala Met Lys Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Val Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Ser Thr Val Pro Leu Ala Lys

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Lys Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Asp Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<210> 245

<211> 90

<212> БЕЛОК

<213> Haemophilus piscium

<400> 245

Met Ser Glu Gln Ala Val Leu Leu Gly Gly Trp Thr Ala Tyr His Lys

1 5 10 15

Leu Ser Ala Lys Asp Gln Ala Val Phe Asp Leu Ala Leu Lys Gly Phe

20 25 30

Val Gly Val Gln Tyr Gln Pro Phe Glu Val Ser Thr Gln Val Val Ala

35 40 45

Gly Thr Asn Tyr Arg Phe Lys Cys Lys Thr Thr Val Pro Leu Pro Asn

50 55 60

Pro Ile His Gly Glu Ala Val Val Gln Ile Phe Gln Ser Leu Asp Gly

65 70 75 80

Ser Ala His Ile Thr Ser Ile Thr Pro Ile

85 90

<---