ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ ИЗОБРЕТЕНИЕ
Настоящее изобретение относится к гибридным нейротоксинам с улучшенными терапевтическими свойствами, в частности, с более селективной аффинностью связывания ганглиозидов.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Бактерии рода Clostridia вырабатывают высокоэффективные и специфичные белковые токсины, которые могут отравлять нейроны и другие клетки, в которые они попадают. Примеры таких токсинов клостридий включают нейротоксины, продуцируемые C. tetani (TeNT) и серотипами A-G C. botulinum (BoNT), а также те, которые продуцируются C. baratii и C. butyricum.
Среди нейротоксинов клостридий есть некоторые из самых сильных известных токсинов. Например, ботулинические нейротоксины имеют медианное значение летальной дозы (LD50) для мышей в диапазоне от 0,5 до 5 нг/кг, в зависимости от серотипа. Как столбнячный, так и ботулинический токсины действуют, подавляя функцию пораженных нейронов, в частности, высвобождение нейротрансмиттеров. В то время как ботулинический токсин действует на нервно-мышечное соединение и ингибирует холинергическую передачу в периферической нервной системе, столбнячный токсин действует в центральной нервной системе.
В природе нейротоксины клостридий синтезируются в виде одноцепочечного полипептида, который посттрансляционно модифицируется в результате протеолитического расщепления с образованием двух полипептидных цепей, соединенных друг с другом дисульфидной связью. Расщепление происходит по определенному сайту расщепления, часто называемому сайтом активации, который расположен между остатками цистеина, обеспечивающими межцепочечную дисульфидную связь. Именно эта двухцепочечная форма является активной формой токсина. Две цепи называются тяжелой цепью (H-цепью), которая имеет молекулярную массу приблизительно 100 кДа, и легкой цепью (L-цепью), которая имеет молекулярную массу приблизительно 50 кДа. H-цепь включает N-концевой транслоцирующий компонент (HN-домен) и С-концевой направляющий компонент (HC-домен). Сайт расщепления расположен между L-цепью и транслоцирующим доменом. После связывания HC-домена с его нейроном-мишенью и интернализации связавшегося токсина в клетку через эндосому HN-домен транслоцирует L-цепь через эндосомальную мембрану и в цитозоль, а L-цепь обеспечивает протеолитическую функцию (также известна как нецитотоксическая протеаза).
Нецитотоксические протеазы действуют путем протеолитического расщепления внутриклеточных транспортных белков, известных как белки SNARE (например, SNAP-25, VAMP или синтаксин) - см. Gerald K (2002) «Cell and Molecular Biology» (4-е издание) John Wiley & Sons, Inc. Акроним SNARE происходит от термина «растворимый рецептор прикрепления NSF», где NSF означает чувствительный к N-этилмалеимиду фактор. Белки SNARE необходимы для слияния внутриклеточных везикул и, таким образом, для секреции молекул посредством везикулярного транспорта из клетки. Протеолитическая функция представляет собой цинк-зависимую эндопептидазную активность и имеет высокую субстратную специфичность в отношении белков SNARE. Соответственно, после доставки в желаемую клетку-мишень нецитотоксическая протеаза способна ингибировать клеточную секрецию из клетки-мишени. Протеолитические L-цепи нейротоксинов клостридий представляют собой нецитотоксические протеазы, которые расщепляют белки SNARE. Протеолитические L-цепи из BoNT/B, BoNT/D, BoNT/F и BoNT/G расщепляют VAMP, протеолитические L-цепи из BoNT/A и BoNT/E расщепляют SNAP25, а протеолитическая L-цепь BoNT/C расщепляет как SNAP25, так и синтаксин, что приводит к ингибированию высвобождения нейротрансмиттера и последующему нейропараличу (Rossetto, O. et al., "Botulinum neurotoxins: genetic, structural and mechanistic insights." Nature Reviews Microbiology 12.8 (2014): 535-549).
Ввиду того, что белки SNARE экспрессируются во всех клетках, нейротоксины клостридий, такие как ботулинический токсин, успешно используются в широком спектре методов лечения. В настоящее время все утвержденные лекарственные средства/косметические препараты, содержащие BoNT, содержат природные нейротоксины, очищенные из штаммов клостридий (BoNT/A в случае DYSPORT®, BOTOX® или XEOMIN®, и BoNT/B в случае MYOBLOC®).
В качестве примера авторы изобретения приводят ссылку на William J. Lipham, Cosmetic and Clinical Applications of Botulinum Toxin (Slack, Inc., 2004), в которой описано использование нейротоксинов клостридий, таких как ботулинические нейротоксины (BoNT), BoNT/A, BoNT/B, BoNT/C1, BoNT/D, BoNT/E, BoNT/F и BoNT/G, а также столбнячного нейротоксина (TeNT), для ингибирования передачи сигнала в нейронах в ряде терапевтических и косметических или эстетических применений - например, доступные в продаже продукты ботулинического токсина в настоящее время одобрены в качестве терапевтических средств для показаний, включающих фокальную спастичность, спастичность верхних конечностей, спастичность нижних конечностей, шейную дистонию, блефароспазм, гемифациальный спазм, гипергидроз подмышечных впадин, хроническую мигрень, нейрогенную гиперактивность детрузора, глабелярных морщин и глубоких боковых периорбитальных морщин. Кроме того, терапия нейротоксинами клостридий описана для лечения нервно-мышечных расстройств (см. US 6872397); для лечения заболеваний матки (см. US 2004/0175399); для лечения язвеной и гастроэзофагеальной рефлюксной болезни (см. US 2004/0086531); для лечения дистонии (см. US 6319505); для лечения глазных болезней (см. US 2004/0234532); для лечения блефароспазма (см. US 2004/0151740); для лечения косоглазия (см. US 2004/0126396); для лечения боли (см. US 6869610, US 6641820, US 6464986 и US 6113915); для лечения фибромиалгии (см. US 6623742, US 2004/0062776); для лечения боли в пояснице (см. US 2004/0037852); для лечения мышечных травм (см. US 6423319); для лечения головной боли в области придаточных пазух носа (см. US 6838434); для лечения тензионной головной боли (см. US 677692); для лечения головной боли (см. US 6458365); для уменьшения головной боли при мигрени (см. US 5714469); для лечения сердечно-сосудистых заболеваний (см. US 6767544); для лечения неврологических заболеваний, таких как болезнь Паркинсона (см. US 6620415, US 6306403); для лечения психоневрологических заболеваний (см. US 2004/0180061, US 2003/0211121); для лечения эндокринных заболеваний (см. US 6827931); для лечения заболеваний щитовидной железы (см. US 6740321); для лечения холинергических заболеваний потовых желез (см. US 6683049); для лечения диабета (см. US 6337075, US 6416765); для лечения заболеваний поджелудочной железы (см. US 6261572, US 6143306); для лечения раковых заболеваний, таких как опухоли кости (см. US 6565870, US 6368605, US 6139845, US 2005/0031648); для лечения ушных заболеваний (см. US 6358926, US 6265379); для лечения вегетативных нарушений, таких как заболевания желудочно-кишечных мышц и другие нарушения функций гладких мышц (см. US 5437291); для лечения повреждений кожи, связанных с пролиферативными заболеваниями клеток кожи (см. US 5670484); для лечения нейрогенных воспалительных заболеваний (см. US 6063768); для уменьшения выпадения волос и стимуляции роста волос (см. US 6299893); для лечения опущенных уголков рта (см. US 6358917); для снижения аппетита (см. US 2004/40253274); при стоматологической терапии и процедурах (см. US 2004/0115139); для лечения нервно-мышечных заболеваний и расстройств (см. US 2002/0010138); для лечения различных заболеваний и расстройств и связанной с ними боли (см. US 2004/0013692); для лечения состояний, возникающих в результате повышенной секреции слизи, таких как астма и ХОБЛ (см. WO 00/10598); и для лечения ненейрональных заболеваний, таких как воспаление, эндокринные заболевания, экзокринные расстройства, иммунологические заболевания, сердечно-сосудистые заболевания, заболевания костей (см. WO 01/21213). Все вышеперечисленные публикации полностью включены в настоящее описание путем ссылки.
Тем не менее, нативные BoNT не различают пространственное распределение нейромышечных соединений или различных типов нейронов, что может привести к побочным эффектам. Например, лечение спастичности верхних конечностей с помощью BoNT может привести к нежелательным явлениям, таким как сухость во рту и дисфагия (Nair, K. P., and Jonathan Marsden. "The management of spasticity in adults." Bmj 349 (2014): g4737).
Повышение специфичности нейротоксинов клостридий к определенным популяциям нейронов позволит адаптировать нейротоксин клостридий к определенным патологиям с повышением безопасности и уменьшением побочных эффектов.
Настоящее изобретение относится к нейротоксинам с улучшенными терапевтическими свойствами, в частности, с более избирательной аффинностью связывания с определенными нейронами, обеспечивающими мышечные сокращения (нейромышечное соединение) или холинергическую секрецию.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
В первом аспекте настоящее изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий (L) и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент (GBM), где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к нуклеотидной последовательности, кодирующей гибридный нейротоксин по изобретению.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к вектору, содержащему нуклеотидную последовательность по изобретению.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к клетке, содержащей нуклеотидную последовательность или вектор по изобретению.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей гибридный нейротоксин по изобретению.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к гибридному нейротоксину или фармацевтической композиции по изобретению для применения в терапии.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к нетерапевтическому применению гибридного нейротоксина или фармацевтической композиции по изобретению для лечения эстетического или косметического нарушения.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GM1a, GM1b, GD1a и GalNAc-GD1a, для применения при лечении заболеваний конечностей, связанных с нежелательной нейрональной активностью.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GT1a и GQ1b, для применения при лечении заболеваний головы или шеи, связанных с нежелательной нейрональной активностью.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения, включающему введение терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина или фармацевтической композиции по изобретению нуждающемуся в этом пациенту.
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с GM1 для использования при лечении сиалореи (или избыточного слюноотделения или слюнотечения).
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из NeuAc GM3, NeuGc GM3, GM2, GM1, GD3 и GD2, для использования при лечении рака.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения заболевания конечностей, связанного с нежелательной нейрональной активностью, включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, содержащего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GM1a, GM1b, GD1a и GalNAc-GD1a.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения заболевания головы или шеи, связанного с нежелательной нейрональной активностью, включающему себя введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, содержащего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GT1a и GQ1b.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения сиалореи (или избыточного слюноотделения или слюнотечения), включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, включающего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с GM1.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения рака, включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, содержащего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из NeuAc GM3, NeuGc GM3, GM2, GM1, GD3 и GD2.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Настоящее изобретение основано на открытии авторами изобретения того, что селективность (избирательность) нейротоксина клостридий в отношении нервно-мышечных соединений можно изменять путем введения экзогенных (не принадлежащих клостридиям) ганглиозидсвязывающих доменов в нейротоксин клостридий.
Ботулинические нейротоксины (BoNT) взаимодействуют с нейронами, используя двойной механизм связывания рецепторов, включающий белковые рецепторы и ганглиозиды плазматической мембраны. Было показано, что BoNT/B/G и /DC распознают люминальный домен SytI и SytII (двух основных изоформ синаптотагмина). Было показано, что синаптические везикулярные гликопротеины 2 (SV2), включая три изоформы SV2A, SV2B и SV2C, являются белковыми рецепторами для BoNT/A, BoNT/D, BoNT/E, BoNT/F.
Ганглиозиды представляют собой олигогликозилцерамиды, образующиеся из лактозилцерамида и содержащие остаток сиаловой кислоты, такой как N-ацетилнейраминовая кислота («NANA», «SA», «Neu5Ac» или «NeuAc»). В некоторых случаях компонент сиаловой кислоты представляет собой N-гликолилнейраминовую кислоту (Neu5Gc) или аналог Neu5Ac, в котором аминогруппа заменена на OH (3-дезокси-D-глицеро-D-галактононулозоновая кислота, сокращенно называемая «KDN»). Ганглиозиды классифицируются в соответствии с системой номенклатуры, предложенной Свеннерхолмом, в которой M, D, T и Q относятся к моно-, ди-, три- и тетрасиалоганглиозидам соответственно, а числа 1, 2, 3 и т.д. относятся к порядку миграции ганглиозидов в тонкослойной хроматографии. Например, порядок миграции моносиалоганглиозидов - GM3> GM2> GM1. Чтобы указать различия в базовых структурах, добавляются дополнительные термины, например, GM1a, GD1b и т.д. Гликосфинголипиды, содержащие 0, 1, 2 и 3 остатка сиаловой кислоты, связанные с внутренним галактозным звеном, называются ганглиозидами асиало- (или 0-), a-, b- и c-серий, соответственно, тогда как ганглиозиды, имеющие остатки сиаловой кислоты, связанные с внутренним остатком N-галактозамина, классифицируются как ганглиозиды α-серий. Пути биосинтеза ганглиозидов серий 0, a, b и c включают последовательную активность сиалилтрансфераз и гликозилтрансфераз, что проиллюстрировано, например, в Ledeen et al., 2015 (Ledeen et al., 2015 (Ledeen, Robert W., and Gusheng Wu. "The multi-tasked life of GM1 ganglioside, a true factotum of nature." Trends in biochemical sciences 40.7 (2015): 407-418). Дополнительные остатки сиаловой кислоты могут присоединяться к каждой серии по разным положениям в углеводной цепи, что дает все более сложный и гетерогенный спектр продуктов, таких как ганглиозиды α-серии с остатком (ами) сиаловой кислоты, связанным с внутренним остатком N-ацетилгалактозамина.
Ганглиозиды переносятся на внешнюю сторону плазматической мембраны с помощью транспортной системы, включающей образование везикул. Ганглиозиды присутствуют и концентрируются на поверхности клеток, причем две углеводородные цепи церамидного фрагмента встроены в плазматическую мембрану, а олигосахариды находятся на внеклеточной поверхности, где они представляют сайты распознавания для внеклеточных молекул или поверхностей соседних клеток. Сиалогликановые компоненты ганглиозидов выступают над поверхностью клетки, где они могут участвовать в межмолекулярных взаимодействиях. Они функционируют, распознавая специфические молекулы на поверхности клетки и регулируя активность белков на плазматической мембране. Ганглиозиды также специфично связываются с вирусами и бактериальными токсинами, такими как ботулинический, столбнячный и холерный токсины. Например, специфическим рецептором на клеточной поверхности для холерного токсина является ганглиозид GM1 (или GM1a): Neu5Acα2-3(Galβ1-3GalNAcβ1-4)Galβ1-4Glcβ1Cer.
BoNT имеют в HCC-домене две независимые области связывания ганглиозидов и рецепторов нейрональных белков. BoNT/A/B/E/F и /G имеют консервативный ганглиозидсвязывающий сайт в HCC-домене, состоящий из мотива «E(Q) … H (K) … SXWY… G», тогда как BoNT/C/D и /DC имеют два независимых сайта связывания ганглиозидов. (Lam, Kwok-Ho, et al. "Diverse binding modes, same goal: The receptor recognition mechanism of botulinum neurotoxin." Progress in biophysics and molecular biology 117.2 (2015): 225-231.) Большинство BoNT связываются только с ганглиозидами, которые имеют 2,3-связанный остаток N-ацетилнейраминовой кислоты (обозначаемый Sia5), присоединенный к Gal4 олигосахаридного ядра, тогда как соответствующий ганглиозидсвязывающий карман на TeNT также может связываться с GM1a, ганглиозидом, в котором отсутствует остаток сахара Sia5. Было показано, что введение мутации H1241K в рекомбинантный BoNT/F обеспечивает способность связывания GM1 (Benson, Marc A., et al. "Unique ganglioside recognition strategies for clostridial neurotoxins." Journal of Biological Chemistry 286.39 (2011): 34015-34022). Было обнаружено, что BoNT/D связывает GM1a и GD1a (Kroken, Abby R., et al. "Novel ganglioside-mediated entry of botulinum neurotoxin serotype D into neurons." Journal of Biological Chemistry 286.30 (2011): 26828-26837).
Объединяя данные, полученные на мышах с дефицитом ганглиозидов и из биохимических анализов, можно заключить, что BoNT/A, E, F и G предпочтительно связываются с концевым фрагментом NAcGal-Gal-NAcNeu, присутствующим в GD1a и GT1b, тогда как для BoNT/B, C, D и TeNT требуется дисиалильный мотив, присутствующий в GD1b, GT1b и GQ1b. Таким образом, по-видимому, распространенные комплексные полисиалоганглиозиды, такие как GD1a, GD1b и GT1b, необходимы для специфического накопления всех серотипов BoNT и TeNT на поверхности нейрональных клеток в качестве первого этапа интоксикации. (Rummel, Andreas. "Double receptor anchorage of botulinum neurotoxins accounts for their exquisite neurospecificity." Botulinum Neurotoxins. Springer Berlin Heidelberg, 2012. 61-90.)
Авторы изобретения выдвинули гипотезу о том, что можно воспользоваться преимуществом дифференциальной локализации ганглиозидов в организме, чтобы повысить селективность нейротоксинов клостридий в отношении нейронов в определенных положениях. Авторы изобретения, в частности, показали, что B-субъединица холерного токсина может быть использована для переноса способности связывания GM1 в BoNT/A.
В первом аспекте настоящее изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий.
Используемый в настоящем документе термин «нейротоксин» означает любой полипептид, который входит в нейрон и ингибирует высвобождение нейротрансмиттера. Этот процесс включает связывание нейротоксина с низкоаффинным или высокоаффинным рецептором, интернализацию нейротоксина, транслокацию эндопептидазной части нейротоксина в цитоплазму и ферментативную модификацию субстрата нейротоксина. Более конкретно, термин «нейротоксин» охватывает любой полипептид, продуцируемый бактериями Clostridium (нейротоксины клостридий), который проникает в нейрон и ингибирует высвобождение нейротрансмиттера, и такие полипептиды, полученные рекомбинантными технологиями или химическими методами. Эта двухцепочечная форма является активной формой токсина. Две цепи называются тяжелой цепью (H-цепь), которая имеет молекулярную массу приблизительно 100 кДа, и легкой цепью (L-цепь), которая имеет молекулярную массу приблизительно 50 кДа.
Различные серотипы ботулинического нейротоксина (BoNT) можно различить по инактивации специфичными нейтрализующими антисыворотками, причем такая классификация по серотипу коррелирует с процентной идентичностью последовательностей на аминокислотном уровне. Белки BoNT данного серотипа далее делятся на различные подтипы на основе идентичности аминокислотных последовательностей в процентах. Пример аминокислотной последовательности BoNT/A представлен как SEQ ID NO: 1 (номер доступа в базе данных UniProt - A5HZZ9). Пример аминокислотной последовательности BoNT/B представлен как SEQ ID NO: 2 (номер доступа в базе данных UniProt - B1INP5). Пример аминокислотной последовательности BoNT/C представлен как SEQ ID NO: 3 (номер доступа в базе данных UniProt - P18640). Пример аминокислотной последовательности BoNT/D представлен как SEQ ID NO: 4 (номер доступа в базе данных UniProt - P19321). Пример аминокислотной последовательности BoNT/E представлен как SEQ ID NO: 5 (номер доступа в базе данных UniProt - Q00496). Пример аминокислотной последовательности BoNT/F представлен как SEQ ID NO: 6 (номер доступа в базе данных UniProt - Q57236). Пример аминокислотной последовательности BoNT/G представлен как SEQ ID NO: 7 (номер доступа в базе данных UniProt - Q60393). Пример аминокислотной последовательности TeNT (столбнячного нейротоксина) представлен как SEQ ID NO: 8 (номер доступа в базе данных UniProt - P04958).
Используемый в настоящем документе термин «легкая цепь нейротоксина клостридий» (или «L») означает эндопептидазный домен клостридий (или нецитотоксическую протеазу) с молекулярной массой приблизительно 50 кДа, которая обладает способностью расщеплять белок SNARE и тем самым нарушать высвобождение нейротрансмиттера из клетки-мишени.
Используемый в настоящем документе термин «HN-домен» означает функционально отличную область тяжелой цепи нейротоксина с молекулярной массой приблизительно 50 кДа, которая обладает способностью транслоцировать (переносить) легкую цепь нейротоксина клостридий в цитоплазму клетки-мишени.
Используемый в настоящем документе термин «LHN-домен» означает нейротоксин, который лишен HC-домена и состоит из эндопептидазного домена («L» или «легкой цепи») и домена, ответственного за транслокацию эндопептидазы в цитоплазму (HN-домен тяжелой цепи). LHN-домен содержит сайт активации между L-доменом и HN-доменом. При протеолитическом расщеплении сайта активации L-домен и HN-домен соединяются вместе дисульфидной связью.
Используемый в настоящем документе термин «HC-домен» означает функционально отличную область тяжелой цепи нейротоксина с молекулярной массой приблизительно 50 кДа, которая обеспечивает связывание нейротоксина с рецептором, расположенным на поверхности клетки-мишени. HC-домен состоит из двух структурно различных субдоменов, «HCN-субдомена» (N-концевая часть домена HC) и «HCC-субдомена» (C-концевая часть HC-домена), каждый из которых имеет молекулярную массу приблизительно 25 кДа.
Примеры доменов L, HN, HCN и HCC показаны в таблице 1.
Таблица 1 - Примеры доменов L, HN, HCN и HCC.
Вышеуказанные эталонные последовательности следует рассматривать в качестве примера, поскольку в зависимости от субсеротипов могут наблюдаться небольшие различия. В качестве примера, в US 2007/0166332 (таким образом полностью включенном путем ссылки) приводятся несколько отличающиеся последовательности из клостридий.
В одном варианте осуществления легкая цепь нейротоксина клостридий относится к BoNT типа A, типа B, типа C1, типа D, типа E, типа F или типа G, или к TeNT.
В одном варианте осуществления домен легкой цепи нейротоксина клостридий содержит последовательность, выбранную из:
- аминокислотных остатков с 1 по 448 из SEQ ID NO: 1 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1 по 441 из SEQ ID NO: 2 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1 по 449 из SEQ ID NO: 3 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1 по 442 из SEQ ID NO: 4 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1 по 423 из SEQ ID NO: 5 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1 по 439 из SEQ ID NO: 6 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1 по 446 из SEQ ID NO: 7 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними, и
- аминокислотных остатков с 1 по 456 из SEQ ID NO: 8 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними.
Понятно, что легкая цепь нейротоксина клостридий по изобретению обладает способностью расщеплять белок SNARE.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит транслоцирующий фрагмент.
Термин «транслоцирующий фрагмент» (или «транслоцирующий домен»), используемый в настоящем документе, означает группу, которая обладает способностью переносить (транслоцировать) легкую цепь нейротоксина клостридий в цитоплазму клетки-мишени.
Подходящие транслоцирующие фрагменты включают транслоцирующие домены бактериальных токсинов, такие как HN-домены клостридий и/или субъединица А2 холерного токсина (CtxA2), проникающие в клетку пептиды, в частности чувствительные к рН проникающие в клетку пептиды. Примером чувствительного к pH пептида, проникающего в клетки, является HBHAc (KKAAPAKKAAAKKAPAKKAAAKK), включающий pH-чувствительный маскирующий пептид, гистидинглутаминовую кислоту (HE) (Yeh et al, Mol Pharm 2016 ʺSelective Intracellular Delivery of Recombinant Arginine Deiminase (ADI) Using pH-Sensitive Cell Penetrating Peptides To Overcome ADI Resistance in Hypoxic Breast Cancer Cells.ʺ).
В предпочтительном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит транслоцирующий фрагмент, который представляет собой HN-домен клостридий. В более предпочтительном варианте гибридный нейротоксин содержит сайт активации между легкой цепью и HN-доменом клостридий.
В одном варианте осуществления HN-домен клостридий содержит последовательность, выбранную из:
- аминокислотных остатков с 449 по 872 из SEQ ID NO: 1 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 442 по 859 из SEQ ID NO: 2 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 450 по 867 из SEQ ID NO: 3 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 442 по 863 из SEQ ID NO: 4 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 423 по 846 из SEQ ID NO: 5 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 440 по 865 из SEQ ID NO: 6 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 447 по 864 из SEQ ID NO: 7 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними, и
- аминокислотных остатков с 457 по 880 из SEQ ID NO: 8 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними.
Понятно, что HN-домен клостридий по изобретению обладает способностью транслоцировать легкую цепь в цитоплазму клетки-мишени.
В одном варианте осуществления L- и HN-домены клостридий относятся к и тому же серотипу клостридий.
В одном варианте осуществления L- и HN-домены клостридий относятся к разным серотипам клостридий.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит направляющий фрагмент.
Используемый в настоящем документе термин «направляющий фрагмент» (или «направляющий домен») означает фрагмент, который обладает способностью связываться с рецептором на клетке-мишени. Предпочтительно, чтобы направляющий фрагмент был способен связываться с белковым рецептором на клетке-мишени.
Подходящие направляющие фрагменты включают направляющие домены бактериальных токсинов, такие как HC- или HCC-домены клостридий, пептиды, антитела или фрагменты антител.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит направляющий фрагмент (TM), которая связывается с рецептором, не связывающий нейротоксин клостридий. ТМ может заменить часть или весь HC- или HCC-домен тяжелой цепи нейротоксина клостридий. Гибридные нейротоксины, содержащие ТМ, не принадлежащий клостридиям, могут называться «перенаправленными нейротоксинами» (или «направленными ингибиторами секреции», «TSI», «TVEMP» или «TEM»). Примеры ТМ, подходящих для перенаправленных нейротоксинов, раскрыты в WO96/33273, WO98/07864, WO00/10598, WO01/21213, WO01/53336, WO02/07759, WO2005/023309, WO2006/026780, WO2006/099590, WO2006/056093, WO2006/059105, WO2006/059113, WO2007/138339, WO2007/106115, WO2007/106799, WO2009/150469, WO2009/150470, WO2010/055358, WO2010/020811, WO2010/138379, WO2010/138395, WO2010/138382, WO2011/020052, WO2011/020056, WO2011/020114, WO2011/020117, WO2011/20119, WO2012/156743, WO2012/134900, WO2012/134897, WO2012/134904, WO2012/134902, WO2012/135343, WO2012/135448, WO2012/135304, WO2012/134902, WO2014/033441, WO2014/128497, WO2014/053651, WO2015/004464, которые все включены в настоящий документ путем ссылки.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HCN- и/или HCC-домен клостридий. Предпочтительно, чтобы HCN- и/или HCC-домен клостридий относился к BoNT типа A, типа B, типа C1, типа D, типа E, типа F или типа G, или к TeNT.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HCN-домен клостридий, который содержит последовательность, выбранную из:
- аминокислотных остатков с 873 по 1094 из SEQ ID NO: 1 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 860 по 1081 из SEQ ID NO: 2 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 868 по 1095 из SEQ ID NO: 3 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 864 по 1082 из SEQ ID NO: 4 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 847 по 1069 из SEQ ID NO: 5 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 866 по 1087 из SEQ ID NO: 6 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 865 по 1089 из SEQ ID NO: 7 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними, или
- аминокислотных остатков с 881 по 1111 из SEQ ID NO: 8 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HCC-домен клостридий, который содержит последовательность, выбранную из:
- аминокислотных остатков с 1095 по 1296 из SEQ ID NO: 1 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1082 по 1291 из SEQ ID NO: 2 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1096 по 1291 из SEQ ID NO: 3 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1083 по 1276 из SEQ ID NO: 4 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1070 по 1252 из SEQ ID NO: 5 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1088 по 1278 из SEQ ID NO: 6 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними,
- аминокислотных остатков с 1090 по 1297 из SEQ ID NO: 7 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними, или
- аминокислотных остатков с 1112 по 1315 из SEQ ID NO: 8 или полипептидной последовательности, имеющей по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними.
Понятно, что HCC-домен по изобретению способен связываться с белковым рецептором нейротоксина клостридий.
В одном варианте осуществления HCN- и/или HCC-домен клостридий относится к такому же серотипу клостридий, что и легкая цепь.
В одном варианте осуществления HCN- и/или HCC-домен клостридий относится к разным серотипа клостридий по сравнению с легкой цепью.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HCN- домен клостридий и HCC-домен клостридий. Соответственно, HCN- и/или HCC-домены клостридий могут относиться к одному и тому же серотипу. Соответственно, HCN- и/или HCC-домены клостридий могут относиться к разным серотипам. В одном варианте осуществления легкая цепь, HCN- и HCC-домен клостридий относятся к одному и тому же серотипу. В одном варианте осуществления легкая цепь, HCN-домен относятся к одному серотипу, а HCC-домен относится к другому серотипу.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HN-домен клостридий, HCN-домен клостридий и HCC-домен клостридий. Соответственно, HN-, HCN- и HCC-домены клостридий могут относиться к одному и тому же серотипу. Соответственно, HN-, HCN- и HCC-домены клостридий могут относиться к разным серотипам. В одном варианте осуществления легкая цепь, HN-, HCN- и HCC-домены клостридий относятся к одному и тому же серотип. В одном варианте осуществления легкая цепь, HN- и HCN-домены принадлежат к одному и тому же серотипу, а HCC-домен относится к другому серотипу. В одном варианте осуществления легкая цепь и HN-домен клостридий принадлежат к одному и тому же серотипу, а HCN- и HCC-домены относятся к другому серотипу.
В одном варианте осуществления, когда гибридный нейротоксин включает HCC-домен клостридий, его способность связываться с ганглиозидами снижена или совсем подавлена по сравнению с нативным HCC-доменом клостридий. Это может быть достигнуто, например, путем введения мутаций в ганглиозидсвязывающий мотив HCC-домена.
«Процент идентичности последовательностей» между двумя или большим числом нуклеотидных или аминокислотных последовательностей является функцией числа идентичных нуклеотидов/аминокислот в идентичных положениях, общих для выровненных последовательностей. Таким образом, % идентичности может быть рассчитан как количество идентичных нуклеотидов/аминокислот в каждой позиции в выравнивании, деленное на общее количество нуклеотидов/аминокислот в выровненной последовательности, умноженное на 100. При вычислении % идентичности последовательностей также можно учитывать количество разрывов и длину каждого разрыва, который необходимо ввести для оптимизации выравнивания двух или большего числа последовательностей. Сравнение последовательностей и определение процента идентичности между двумя или большим числом последовательностей могут быть выполнены с использованием определенных математических алгоритмов, которые известны специалисту в данной области, например, математический алгоритм глобального выравнивания (такой как описанный Needleman and Wunsch, J. Mol. Biol. 48 (3), 443-453, 1972).
Легкая цепь, домены HN, HCN и HCC могут иметь свое происхождение из мозаичного нейротоксина. Термин «мозаичный нейротоксин», используемый в данном контексте, относится к встречающемуся в природе нейротоксину клостридий, который содержит по меньшей мере один функциональный домен из другого типа нейротоксинов клостридий (например, нейротоксин клостридий другого серотипа), причем данный нейротоксин клостридий обычно не содержит по меньшей мере один функциональный домен. Примерами мозаичных нейротоксинов являются природные токсины BoNT/DC и BoNT/CD. BoNT/DC включает L-цепь и HN-домен серотипа D и HC-домен серотипа C, тогда как BoNT/CD состоит из L-цепи и HN-домена серотипа C и HC-домена серотипа D.
Легкая цепь, домены HN, HCN и HCC могут иметь свое происхождение из модифицированного нейротоксина и его производных, включая, но не ограничиваясь этим, описанные ниже нейротоксины. Модифицированный нейротоксин или его производное могут содержать одну или несколько аминокислот, которые были модифицированы по сравнению с нативной (немодифицированной) формой нейротоксина, или может содержать одну или несколько вставленных аминокислот, которые отсутствуют в нативной (немодифицированной) форме токсина. Например, модифицированный нейротоксин клостридий может иметь модифицированные аминокислотные последовательности в одном или нескольких доменах относительно нативной (немодифицированной) последовательности нейротоксина клостридий. Такие модификации могут менять функциональные свойства нейротоксина, например биологическую активность или устойчивость.
Модифицированный нейротоксин сохраняет по меньшей мере одну из функций нейротоксина, выбранных из способности связываться с низкоаффинным или высокоаффинным рецептором нейротоксина на клетке-мишени, транслоцировать эндопептидазную часть нейротоксина (легкую цепь) в цитоплазму клетки и расщеплять белок SNARE. Предпочтительно, чтобы модифицированный нейротоксин сохранял по меньшей мере две из этих функций. Более предпочтительно, чтобы модифицированный нейротоксин сохранял три эти функции.
Модифицированный нейротоксин может содержать одну или несколько модификаций в аминокислотной последовательности тяжелой цепи (такой как модифицированный HC-домен), где данная модифицированная тяжелая цепь связывается с нервными клетками-мишенями с более высокой или более низкой аффинностью, чем нативный (немодифицированный) нейротоксин. Такие модификации в HC-домене могут включать модификацию остатков в сайте связывания ганглиозидов в HC-домене или в сайте связывания белка (SV2 или синаптотагмина), которая изменяет связывание с ганглиозидным рецептором и/или белковым рецептором нервной клетки-мишени. Примеры таких модифицированных нейротоксинов описаны в WO 2006/027207 и WO 2006/114308, которые оба полностью включены в настоящее описание путем ссылки.
Модифицированный нейротоксин может иметь одну или несколько модификаций в аминокислотной последовательности легкой цепи, например модификации в субстрат-связывающем или каталитическом домене, которые могут изменять или модифицировать специфичность в отношении белка SNARE у модифицированного LC. Примеры таких модифицированных нейротоксинов описаны в WO 2010/120766 и US 2011/0318385, которые оба полностью включены в настоящее описание путем ссылки.
Модифицированный нейротоксин может содержать одну или несколько модификаций, которые увеличивают или уменьшают биологическую активность и/или биологическую устойчивость модифицированного нейротоксина. Например, модифицированный нейротоксин может содержать лейциновый или тирозиновый мотив, где данный мотив увеличивает или уменьшает биологическую активность и/или биологическую устойчивость модифицированного нейротоксина. Подходящие лейциновые мотивы включают xDxxxLL, xExxxLL, xExxxIL и xExxxLM (где x представляет собой любую аминокислоту). Подходящие тирозиновые мотивы включают Y-x-x-Hy (где Hy представляет собой гидрофобную аминокислоту). Примеры модифицированных нейротоксинов, содержащих лейциновые и тирозиновые мотивы, описаны в WO 2002/08268, который полностью включен в настоящее описание путем ссылки.
Используемый в настоящем документе термин «селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент» означает фрагмент, который связывается с одним типом ганглиозидов с более высокой аффинностью, чем с другими ганглиозидами. Аффинность связывания можно определить количественно путем определения равновесной константы диссоциации или Kd между ганглиозидом и связывающим фрагментом (чем ниже Kd, тем выше аффинность). Способы определения аффинности связывания с ганглиозидом хорошо известны в данной области и включают, например, поверхностный плазмонный резонанс (SPR), описанный, например, в Kuziemko, Geoffrey M. et al. "Cholera toxin binding affinity and specificity for gangliosides determined by surface plasmon resonance." Biochemistry 35.20 (1996): 6375-6384, или в MacKenzie, C. Roger, et al. "Quantitative analysis of bacterial toxin affinity and specificity for glycolipid receptors by surface plasmon resonance." Journal of Biological Chemistry 272.9 (1997): 5533-5538. В частности, Кузиемко и др. в 1996 г (цитируется выше) обнаружили с помощью SPR, что холерный токсин предпочтительно связывается с ганглиозидами в следующем порядке: GM1> GM2> GD1A> GM3> GT1B> GD1B> асиало-GM1, и что измеренная аффинность связывания (Kd) холерного токсина с ганглиозидной последовательностью составляет от 4,61×10-12 М для GM1 до 1,88×10-10 М для асиало-GM1. Маккензи и др. в 1997 г (цитируется выше) определили методом поверхностного плазмонного резонанса (SPR) с использованием метода захвата липосом, что CtxB связывается с GM1 и GD1b с аффинностью соответственно 7,3×10-10 М и 8×10-9 М, что термолабильный энтеротоксин (LT) из E. coli связывается с GM1 и GD1b с аффинностью соответственно 5,7×10-10 М и 3,0×10-9 М, и что С-фрагмент столбнячного токсина связывается с GD1b и GT1b со сродством соответственно 1,5×10-7 М и 1,7×10-7 м.
Аффинность связывания с ганглиозидом также можно определить с помощью конкурентного анализа ELISA, описанного, например, в Sinclair, Haydn R., et al. "Sialyloligosaccharides inhibit cholera toxin binding to the GM1 receptor." Carbohydrate research 343.15 (2008): 2589-2594. Другой способ определения аффинности связывания с ганглиозидом основан на использовании радиоактивно меченного лиганда (например, меченного 125I), как описано, например, в Nishiki, Tei-ichi, et al. "The high-affinity binding of Clostridium botulinum type B neurotoxin to synaptotagmin II associated with gangliosides GT1b/GD1a." FEBS letters 378.3 (1996): 253-257. Еще одним способом определения аффинности связывания с ганглиозидом является использование изотермической титрационной калориметрии, как описано в Turnbull, W. Bruce, et al. "Dissecting the cholera toxin-ganglioside GM1 interaction by isothermal titration calorimetry." Journal of the American Chemical Society 126.4 (2004): 1047-1054.
В одном варианте осуществления Kd между селективным ганглиозидсвязывающим фрагментом и ганглиозидом составляет примерно менее 10-9 М, предпочтительно, примерно менее 10-10 М, более предпочтительно, примерно менее 10-11 М, более предпочтительно, примерно менее 5×10-12 М.
Подходящие ганглиозидсвязывающие фрагменты (GBM) включают GBM бактериальных токсинов (помимо HC- или HCC-доменов клостридий), пептиды, белки или фрагменты белков, антитела или фрагменты антител.
В одном варианте осуществления GBM представляет собой пептид. Примеры пептидов, подходящих для использования в качестве GBM, включают β-амилоидный пептид (Aβ), накапливающийся при болезни Альцгеймера, который связывается с GM1, ассоциированный с болезнью Паркинсона белок α-синуклеин, который связывается с GM3, и описанные химерные пептиды, такие как α-синуклеин/Aβ, описанные в Yahi and Fantini 2014, который связывается с GM1 и GM3 (Yahi, Nouara, and Jacques Fantini. "Deciphering the glycolipid code of Alzheimer's and Parkinson's amyloid proteins allowed the creation of a universal ganglioside-binding Peptide." PloS one 9.8 (2014): e104751).
В одном варианте осуществления GBM представляет собой белок или фрагмент белка. Примеры белков, пригодных для использования в качестве GBM, включают рецепторы фактора роста, такие как рецептор эпидермального фактора роста (EGFR), который связывается с GM3, GM1, GM2, GM4, GD3, GD1a и GT1b и рецептор фактора роста сосудистого эндотелия (VEGFR), который связывается с GM3, GD1a и GT1b (Krengel, Ute, and Paula A. Bousquet. "Molecular recognition of gangliosides and their potential for cancer immunotherapies." Frontiers in Immunology, 2014, vol 5, article 325).
В предпочтительном варианте осуществления GBM получен из бактериального токсина, например, GBM выбран из В-субъединицы холерного токсина (CtxB) и термолабильного энтеротоксина (LT) E. coli.
GM1 (или GM1a) является единственным известным рецептором для В-субъединицы холерного токсина (CtxB). Поэтому, путем введения B-субъединицы холерного токсина в нейротоксин клостридий или его фрагмент, можно селективно направлять его на нейроны, содержащие GM1. GM1 также является рецептором термолабильного энтеротоксина из Escherichia coli. (Zoeteweij, J. Paul, et al. "GM1 binding-deficient exotoxin is a potent noninflammatory broad spectrum intradermal immunoadjuvant." The Journal of Immunology 177.2 (2006): 1197-1207).
Также предполагается, что гибридный нейротоксин по изобретению, в котором GBM получен из бактериального токсина, особенно подходит для местной доставки гибридного нейротоксина. Действительно, было также показано, что бактериальные экзотоксины можно безопасно применять местно на коже человека (Zoeteweij, J. Paul, et al. "GM1 binding-deficient exotoxin is a potent noninflammatory broad spectrum intradermal immunoadjuvant." The Journal of Immunology 177.2 (2006): 1197-1207).
В одном варианте осуществления ганглиозидом является GM1, а GBM выбран из CtxB и термолабильного энтеротоксина (LT) E. coli.
Холерный токсин (СТ) секретируется грамотрицательной бактерией Vibrio cholerae. CT принадлежит к большему семейству AB-токсинов, которые имеют ферментативно активный A-домен, ответственный за индукцию токсичности, и B-домен, связывающийся с клеткой, который отвечает за проникновение в клетку. CT принадлежит к подсемейству AB5, которое состоит из шести полипептидов - одной A-субъединицы и гомопентамерной B-субъединицы, которые самоорганизуются с образованием холотоксина до секреции. Другие токсины AB5 включают термолабильные энтеротоксины, шига-токсин, шигаподобные токсины и коклюшный токсин. Субъединицы CT, A и B (CtxA и CtxB соответственно), связаны нековалентно. A-субъединица 27 кДа содержит сайт расщепления сериновой протеазой, расположенный между остатками 192 и 195, который позволяет расщеплять A-субъединицу на два полипептида: цепь A2 и цепь A1. Дисульфидная связь между остатками 187 и 199 соединяет эти цепи вместе. Цепь А1 отвечает за ферментативную активность СТ. Пять В-субъединиц по 11,5 кДа собираются нековалентно, образуя гомопентамер, который связывается с ганглиозидом GM1 на плазматической мембране. Комплекс B5-субъединиц-GM1 переносит A-субъединицу в эндоплазматический ретикулум. После ретротранслокации цепь А1 входит в цитозоль в виде активной АДФ-рибозилтрансферазы, которая модифицирует гетеротримерный G-белок Gsα. Модификация этого G-белка приводит к конститутивной активации аденилатциклазы и быстрой продукции цАМФ. В клетках кишечника это вызывает секрецию хлорида в кишечнике, что сопровождается массивным движением воды и диареей, которая является отличительной чертой холеры. ((Wernick, Naomi LB, et al. "Cholera toxin: an intracellular journey into the cytosol by way of the endoplasmic reticulum." Toxins 2.3 (2010): 310-325.)
Пример аминокислотной последовательности В-субъединицы холерного токсина представлен как SEQ ID NO: 9 (номер доступа в UniProtKB - P01556), который состоит из сигнального пептида (аминокислотные остатки с 1 по 21 в SEQ ID NO: 9) и В-субъединицы (аминокислотные остатки с 22 по 124 в SEQ ID NO: 9).
Пример аминокислотной последовательности А-субъединицы холерного токсина представлен как SEQ ID NO: 10 (номер доступа в UniProtKB - P01555), который состоит из сигнального пептида (аминокислотные остатки с 1 по 18 в SEQ ID NO: 10), домена A1 (аминокислотные остатки с 19 по 212 в SEQ ID NO: 10) и домена А2 (аминокислотные остатки с 213 по 258 в SEQ ID NO: 10).
Было показано, что мономерной B-субъединицы достаточно для связывания с клетками и интоксикации (Jobling, Michael G., et al. "A single native ganglioside GM1-binding site is sufficient for cholera toxin to bind to cells and complete the intoxication pathway." MBio 3.6 (2012): e00401-12).
Авторы изобретения показали, что добавление домена CtxB к эндонегативному BoNT/A1 (BoNT/A1(0)) наделяет BoNT/A1 способностью связываться с GM1, ганглиозидом, который не является естественным рецептором для BoNT/A1.
Не желая быть связанными какой-либо теорией, авторы полагают, что субъединица CtxB приведет к увеличению силы действия вследствие того, что холерный токсин обладает большей аффинностью связывания с GM1, чем аффинность связывания BoNT с его соответствующими ганглиозидами. Например, было показано, что аффинность связывания BoNT/B с комплексом синаптотагмина, ассоциированного с GT1b/GD1a (модель двойного рецептора), находится в наномолярном диапазоне («высокая аффинность 0,4 нМ, низкая аффинность 4,1 нМ») (Nishiki et al, FEBS Letters 1996), что в 1000 раз выше пикомолярной аффинности связывания Ctx-B и GM1, опубликованной в Kuzimeko et al., Biochemistry 1996.
Домен CtxB по изобретению, предпочтительно, содержит аминокислотные остатки с 22 по 124 из SEQ ID NO: 9 или полипептидную последовательность, имеющую по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности с ними. Понятно, что домен CtxB по изобретению способен связываться с GM1.
В предпочтительном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько В-субъединиц холерного токсина (CtxB).
В одном варианте осуществления легкая цепь ковалентно связана с указанной одной или несколькими В-субъединицами холерного токсина (CtxB).
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну CtxB. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит две CtxB. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит три CtxB. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит четыре CtxB. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит пять CtxB.
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько CtxB, которые расположены на C-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько CtxB, которые расположены на N-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из одной CtxB, которая расположена на C-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из одной CtxB, которая расположена на N-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из двух CtxB, которые расположены на C-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из двух CtxB, которые расположены на N-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из трех CtxB, которые расположены на C-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из трех CtxB, которые расположены на N-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из четырех CtxB, которые расположены на C-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из четырех CtxB, которые расположены на N-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из пяти CtxB, которые расположены на C-конце легкой цепи нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из пяти CtxB, которые расположены на N-конце легкой цепи нейротоксина клостридий.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HN-домен клостридий, а селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько CtxB, которые расположены на C-конце HN-домена клостридий. В другом варианте осуществления одна или несколько CtxB расположены на N-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из одной CtxB, которая расположена на C-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из одной CtxB, которая расположена на N-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из двух CtxB, которые расположены на C-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из двух CtxB, которые расположены на N-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из трех CtxB, которые расположены на C-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из трех CtxB, которые расположены на N-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из четырех CtxB, которые расположены на C-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из четырех CtxB, которые расположены на N-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из пяти CtxB, которые расположены на C-конце HN-домена клостридий. В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент состоит из пяти CtxB, которые расположены на N-конце HN-домена клостридий.
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько В-субъединиц холерного токсина (CtxB), а гибридный нейротоксин дополнительно содержит A2-субъединицу холерного токсина (CtxA2). Предпочтительно, чтобы CtxA2 была ковалентно связана с легкой цепью клостридий. Кроме того, предпочтительно, чтобы CtxA2 была ковалентно связана с легкой цепью нейротоксина клостридий, а CtxB образовала нековалентную связь с легкой цепью нейротоксина клостридий. В частности, считается, что А2-субъединица холерного токсина (CtxA2) может действовать как связующее звено, образуя нековалентную связь с пентамером B-субъединиц (CtxB5), который будет связываться с ганглиозидом на клетке-мишени и интернализировать легкую цепь нейротоксина клостридий в клетку.
Не желая быть связанными какой-либо теорией, авторы предполагают, что такие варианты осуществления, где CtxB связывается с гибридным нейротоксином через нековалентную связь (с субъединицей CtxA2), допускают пентамерное расположение субъединицы CtxB (CtxB5) и, таким образом, обуславливают повышенную аффинность связывания гибридного нейротоксина с GM1.
Домен CtxA2 по изобретению предпочтительно содержит аминокислотные остатки с 213 по 258 из SEQ ID NO: 10 или полипептидную последовательность, имеющую по меньшей мере 70%, предпочтительно, по меньшей мере 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичности по последовательности к ними. Понятно, что домен CtxA2 по изобретению способен связываться с доменом CtxB. Предпочтительно, чтобы домен CtxA2 содержал остатки с 255 по 258 (KDEL) из SEQ ID NO: 10.
Домен CtxA2 может быть расположен на С-конце или N-конце к легкой цепи нейротоксина клостридий.
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит одну или несколько B-субъединиц холерного токсина (CtxB), которые нековалентно связаны с легкой цепью нейротоксина клостридий, и гибридный нейротоксин дополнительно содержит A2-субъединицу холерного токсина (CtxA2) и HN-домен, который ковалентно связаны с легкой цепью нейротоксина клостридий. В одном варианте осуществления домен CtxA2 расположен на N-конце HN-домена клостридий и предпочтительно расположен между сайтом активации и HN-доменом («центральное расположение»). В одном варианте осуществления домен CtxA2 расположен на C-конце HN-домена клостридий, и когда гибридный нейротоксин включает HCN- и/или HCC-домен, ганглиозидсвязывающий фрагмент может быть расположен на C-конце или N-конце HCN- и/или HCC-домена. Гибридный нейротоксин может содержать линкер между доменом CtxA2 и L-, HN-, HCN- и/или HCC-доменом.
В одном варианте осуществления легкая цепь нейротоксина клостридий ковалентно связана с селективным ганглиозидсвязывающим фрагментом. Селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент может быть расположен на С-конце или N-конце легкой цепи клостридий.
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин содержит HN-домен клостридий, а HN-домен клостридий ковалентно связан с селективным ганглиозидсвязывающим фрагментом. Селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент может быть расположен на С-конце или N-конце HN-домена клостридий. Когда селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент расположен на N-конце HN-домена клостридий, предпочтительно, чтобы он был расположен между сайтом активации и HN-доменом («центральное расположение»).
Когда селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент расположен на C-конце HN-домена клостридий, и когда гибридный нейротоксин дополнительно содержит HCN-домен и/или HCC-домен, ганглиозидсвязывающий фрагмент может быть расположен на C-конце или N-конце HCN- или HCC-домена.
Гибридный нейротоксин может содержать линкер между ганглиозидсвязывающим доменом и L-, HN-, HCN- и/или HCC-доменом. Не желая быть связанными какой-либо теорией, авторы предполагают, что присутствие линкера может повысить стабильность гибридного нейротоксина и/или доступность ганглиозидсвязывающего фрагмента для его ганглиозида-мишени и/или увеличить экспрессию.
Примеры подходящих линкеров включают GS-линкеры различной длины, например, GS5, GS10, GS15, GS18 и GS20, N10, HX27, (EAAAK)3 и A(EAAAK)4ALEA(EAAAK)4A. Дополнительные примеры приведены в литературе, например, в статье Chen, Xiaoying, et al. "Fusion protein linkers: property, design and functionality." Advanced drug delivery reviews 65.10 (2013): 1357-1369, включенной в настоящий документ путем ссылки.
Примеры структурного расположения гибридных нейротоксинов по изобретению приведены ниже (GBM: ганглиозидсвязывающий фрагмент; TD: транслоцирующий домен; BD: домен, связывающий белковый рецептор; L, HN, HCN, HCC: домены клостридий, описанные в настоящем документе; AS: сайт активации; слева направо: от C-конца к N-концу):
L - GBM
GBM - L
L - AS - GBM
GBM - AS - L
L - AS - GBM - TD
L - AS- TD - GBM
GBM - TD - AS -L
TD - GBM - AS -L
GBM - L - AS - TD
L - AS - GBM - TD - BD
L - AS - BD - TD - GBM
GBM - TD - BD - AS -L
BD - TD - GBM - AS -L
L - AS - GBM - HN
L - AS - HN - GBM
GBM - HN - AS -L
HN - GBM - AS -L
GBM - L - AS - HN
L - AS - GBM - HN - HCN
L - AS - GBM - HN - HCN - HCC
L - AS - HN - GBM
L - AS - HN - HCN - GBM
L - AS - HN - HCN - HCC- GBM
L - AS - GBM - линкер - HN
L - AS - GBM - линкер - HN - HCN
L - AS - GBM - линкер - HN - HCN - HCC
L - AS - HN - линкер - GBM
L - AS - HN - HCN - линкер - GBM
L - AS - HN - HCN - HCC - линкер - GBM
GBM -L - AS -HN -HCN -HCC
L - AS - линкер - GBM - HN
L - AS - линкер - GBM - HN - HCN
L - AS - линкер - GBM - HN - HCN - HCC
L - AS - линкер - GBM - линкер - HN
L - AS - линкер - GBM - линкер - HN - HCN
L - AS - линкер - GBM - линкер - HN - HCN - HCC
В одном варианте осуществления гибридный нейротоксин по изобретению содержит HN-домен и имеет двухцепочечную форму, и содержит дисульфидную связь между L-доменом и HN-доменом.
Предпочтительно, чтобы структурное расположение гибридного нейротоксина было таково, чтобы GBM имел свободный N- или C-конец. В вариантах осуществления, включающих сайт активации (AS), обеспечивающий превращение гибридного нейротоксина в двухцепочечную форму, структурное расположение гибридного нейротоксина предпочтительно является таким, чтобы GBM имел свободный N- или C-конец после превращения в двухцепочечную форму.
В вариантах осуществления, содержащих домен, связывающий белковый рецептор (BD), например HC- или HCC-домен, структурное расположение гибридного нейротоксина предпочтительно является таким, чтобы BD имел свободный N-конец или C-конец, и, более предпочтительно, чтобы оба GBM и BD имели свободный N- или C-конец. В вариантах осуществления, включающих сайт активации (AS), обеспечивающий превращение гибридного нейротоксина в двухцепочечную форму, структурное расположение гибридного нейротоксина предпочтительно является таким, чтобы BD имел свободный N- или C-конец после превращения в двухцепочечную форму и, более предпочтительно, чтобы оба GBM и BD имели свободный N-конец или C-конец после превращения в двухцепочечную форму.
Гибридные нейротоксины по настоящему изобретению могут быть получены с использованием рекомбинантных технологий. Таким образом, в одном варианте осуществления гибридный нейротоксин по изобретению представляет собой рекомбинантный гибридный нейротоксин.
В другом аспекте изобретение относится к нуклеотидной последовательности, кодирующей гибридный нейротоксин по изобретению, например, к последовательности ДНК или РНК. В предпочтительном варианте осуществления нуклеотидная последовательность представляет собой последовательность ДНК.
Молекулы нуклеиновой кислоты по изобретению могут быть получены с использованием любого подходящего способа, известного в данной области. Таким образом, молекулы нуклеиновой кислоты могут быть получены с использованием методов химического синтеза. В альтернативном варианте молекулы нуклеиновой кислоты по изобретению могут быть получены с использованием методов молекулярной биологии.
Последовательность ДНК по настоящему изобретению предпочтительно конструируют in silico, а затем синтезируют обычными методами синтеза ДНК.
Вышеуказанную нуклеотидную последовательность необязательно модифицируют для изменения кодонов в соответствии с системой экспрессии конечной клетки-хозяина (например, E. coli), которая должна использоваться.
В другом аспекте изобретение относится к вектору, содержащему нуклеотидную последовательность по изобретению. В одном варианте нуклеотидную последовательность получают как часть ДНК-вектора, содержащего промотор и терминатор. В предпочтительном варианте осуществления вектор имеет промотор, выбранный из Tac, AraBAD, T7-Lac или T5-Lac.
Вектор может быть пригоден для экспрессии in vitro и/или in vivo вышеуказанной нуклеотидной последовательности. Вектор может быть вектором для транзиентной и/или стабильной экспрессии генов. Вектор может дополнительно содержать регуляторные элементы и/или селективные маркеры. Вектор может иметь вирусное происхождение, фаговое происхождение или бактериальное происхождение. Например, вектор экспрессии может представлять собой вектор pET, pJ401, pGEX или их производное.
В другом аспекте изобретение относится к клетке, содержащей нуклеотидную последовательность или вектор по изобретению. Подходящие типы клеток включают прокариотические клетки, например, E. coli, и эукариотические клетки, такие как клетки дрожжей, клетки млекопитающих, клетки насекомых. Предпочтительно, чтобы клетка представляла собой E. coli.
Гибридные нейротоксины по изобретению особенно подходят для применения в терапии.
Синдром Гийена-Барре представляет собой острое воспалительное заболевание, которое поражает периферическую нервную систему и вызывается связыванием антител, вырабатываемых иммунной системой, с ганглиозидами. Основываясь на результатах клинических подтипов синдрома Гийена-Барре, ганглиозиды GM1a, GM1b, GD1a, GalNAc-GD1a связаны с нервно-мышечным соединением конечностей, а ганглиозиды GT1a, GQ1b связаны с нервно-мышечным соединением головы и шеи ((Van Den Berg, Bianca, et al. " syndrome: pathogenesis, diagnosis, treatment and prognosis." Nature reviews. Neurology 10.8 (2014): 469; Willison, Hugh J., and Jaap J. Plomp. "Anti-ganglioside Antibodies and the Presynaptic Motor Nerve Terminal." Annals of the New York Academy of Sciences 1132.1 (2008): 114-123). Также было показано, что GM1 присутствует в околоушных железах (слюнных железах) (Nowroozi, Nakisa, et al. "HIGH LEVELS OF GM 1-GANGLIOSIDE AND GM 1-GANGLIOSIDE β-GALACTOSIDASE IN THE PAROTID GLAND: A New Model for Secretory Mechanisms of the Parotid Gland." Otolaryngologic Clinics of North America 32.5 (1999): 779-791).
Было опубликовано, что концентрации GM1 и GM2 в липидных рафтах из лобной и височной коры были выше у пациентов с болезнью Альцгеймера (AD). Кластеризация GM1 была продемонстрирована в ганглиозных нейронах дорсального корешка (сенсорных нейронах). ((Aureli, Massimo, et al. "GM1 ganglioside: past studies and future potential." Molecular neurobiology 53.3 (2016): 1824-1842.)
Было показано, что ганглиозиды NeuAc GM3, NeuGc GM3, GM2, GM1, GD3 и GD2 экспрессируются в опухолевых клетках человека (Krengel, Ute, and Paula A. Bousquet. "Molecular recognition of gangliosides and their potential for cancer immunotherapies." Frontiers in Immunology, July 2014, vol. 5, article 325).
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GM1a, GM1b, GD1a и GalNAc-GD1a. Полагают, что такие варианты осуществления особенно подходят для лечения расстройств конечностей, таких как спастичность верхних конечностей, спастичность нижних конечностей, очаговая дистония мышц конечностей, растяжение мышц конечностей, повторное травматическое растяжение (RSI), кумулятивная травма или синдром профессионального перенапряжения. Действительно, не желая быть связанными какой-либо теорией, авторы предполагают, что нацеливание гибридного нейротоксина на ганглиозиды, присутствующие в нервно-мышечном соединении конечностей, позволит повысить селективность в отношении нервно-мышечных соединений конечностей и избежать побочных эффектов из-за неспецифических эффектов.
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GT1a и GQ1b. Считаются, что такие варианты осуществления являются особенно подходящими для лечения заболеваний головы и шеи, таких как цервикальная дистония, блефароспазм, мигрень, миофасциальные боли, косоглазие, гемифациальный спазм, заболевание век, спазматическая дисфония, ларингеальная дистония, оромандибулярная дисфония, язычная дистония, бруксизм и дисфагия. Действительно, не желая быть связанными какой-либо теорией, авторы предполагают, что нацеливание гибридного нейротоксина на ганглиозиды, обнаруживаемые в нервно-мышечных соединениях головы и шеи, позволяет повысить селективность в отношении нервно-мышечных соединений головы и шеи и избежать побочных эффектов из-за неспецифических эффектов.
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с GM1. Считается, что этот вариант особенно подходит для лечения сиалореи (избыточного слюноотделения, слюнотечения). Также предполагается, что этот вариант осуществления может подходить для лечения пациентов, страдающих болезнью Альцгеймера или другими неврологическими расстройствами.
В одном варианте осуществления селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из NeuAc GM3, NeuGc GM3, GM2, GM1, GD3 и GD2. Считается, что такие варианты осуществления особенно подходят для лечения рака.
В другом аспекте изобретение относится к фармацевтической композиции, содержащей гибридный нейротоксин по изобретению. Предпочтительно, чтобы фармацевтическая композиция содержала гибридный нейротоксин вместе по меньшей мере с одним компонентом, выбранным из фармацевтически приемлемого носителя, вспомогательного вещества, адъюванта, пропеллента и/или соли.
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину или фармацевтической композиции по изобретению для применения в терапии.
Гибридный нейротоксин или фармацевтическая композиция по изобретению подходят для применения при лечении заболевания, связанного с нежелательной нейрональной активностью, например, заболевания, выбранного из группы, состоящей из спастической дисфонии, спастической кривошеи, ларингеальной дистонии, оромандибулярной дисфонии, лингвальной дистонии, цервикальной дистонии, фокальной дистонии кисти, блефароспазма, косоглазия, гемифациального спазма, заболевания век, церебрального паралича, фокальной спастичности и других нарушений голоса, спастического колита, нейрогенного мочевого пузыря, анизмуса, спастичности конечностей, тиков, тремора, бруксизма, дисфарцизма, анальных трещин, ахалазии, дисфагии и других нарушений мышечного тонуса и других нарушений, характеризующихся непроизвольными сокращениями мышечных групп, слезотечения, гипергидроза, избыточного слюноотделения, избыточной секреции в желудочно-кишечном тракте, секреторных нарушений, боли от мышечных спазмов, головной боли, мигрени и дерматологических заболеваний.
В другом аспекте изобретение относится к нетерапевтическому применению гибридного нейротоксина или фармацевтической композиции по изобретению для лечения эстетического или косметического нарушения. Согласно этому аспекту изобретения субъект, подлежащий лечению при эстетическом или косметическом нарушении, предпочтительно не страдает от каких-либо патологических нарушений или состояний, которые описаны в настоящем документе. Более предпочтительно, чтобы указанный субъект являлся здоровым субъектом (т.е. не страдал каким-либо патологическим заболеванием или состоянием).
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GM1a, GM1b, GD1a и GalNAc-GD1a, для применения при лечении заболеваний конечностей, связанных с нежелательной нейрональной активностью. В одном варианте осуществления заболевание конечностей выбирают из спастичности верхних конечностей, спастичности нижних конечностей и фокальной дистонии кисти. В предпочтительном варианте осуществления ганглиозид представляет собой GM1a.
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GT1a и GQ1b, для использования при лечении заболевания головы или шеи, связанного с нежелательной нейрональной активностью. В одном варианте осуществления заболевание головы или шеи выбирают из цервикальной дистонии, блефароспазма, мигрени, миофасциальной боли, косоглазия, гемифациального спазма, заболевания век, спастической дисфонии, ларингеальной дистонии, оромандибулярной дисфонии, лингвальной дистонии, бруксизма и дисфагии.
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с GM1, для применения при лечении сиалореи (или избыточного слюноотделения или слюнотечения).
В другом аспекте изобретение относится к гибридному нейротоксину, содержащему легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из NeuAc GM3, NeuGc GM3, GM2, GM1, GD3 и GD2, для применения при лечении рака.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения, включающему введение терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина или фармацевтической композиции по изобретению нуждающемуся в этом пациенту.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения заболевания конечностей, связанного с нежелательной нейрональной активностью, включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, содержащего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GM1a, GM1b, GD1a и GalNAc-GD1a.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения заболевания головы или шеи, связанного с нежелательной нейрональной активностью, включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, содержащего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из GT1a и GQ1b.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения сиалореи (или избыточного слюноотделения или слюнотечения), включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, включающего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с GM1.
В другом аспекте настоящее изобретение относится к способу лечения рака, включающему введение нуждающемуся в этом пациенту терапевтически эффективного количества гибридного нейротоксина, содержащего легкую цепь нейротоксина клостридий и селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент не является HCC- или HC-доменом клостридий, и где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент связывается с одним или несколькими ганглиозидами, выбранными из NeuAc GM3, NeuGc GM3, GM2, GM1, GD3 и GD2.
Следует понимать, что все другие разнообразные признаки, относящиеся к гибридному нейротоксину, описанному в настоящем документе и предпочтительным вариантам осуществления, применяются mutatis mutandis к терапевтическим и косметическим аспектам изобретения.
Также следует понимать, что фармацевтическая композиция по изобретению может использоваться для терапевтических и косметических целей по изобретению.
Генно-инженерные гибридные нейротоксины по настоящему изобретению могут быть представлены в виде препарата для перорального, парентерального, непрерывного инфузионного, ингаляционного или местного применения. Композиции, подходящие для инъекций, могут быть представлены в форме растворов, суспензий или эмульсий, или сухих порошков, которые растворяют или ресуспендируют в подходящем носителе перед использованием.
В случае гибридного нейротоксина, который должен вводиться локально, гибридный нейротоксин может быть изготовлен в виде крема (например, для местного применения) или изготовлен для подкожных инъекций.
Средства для местной доставки могут включать аэрозоль или другой спрей (например, небулайзер). В этом отношении аэрозольный состав гибридного нейротоксина обеспечивает доставку в легкие и/или другие носовые и/или бронхиальные или дыхательные пути.
Гибридные нейротоксины по изобретению могут вводиться пациенту путем интратекальной или эпидуральной инъекции в позвоночный столб на уровне спинного сегмента, участвующего в иннервации пораженного органа.
Предпочтительным путем введения является лапароскопическая и/или локализованная, в частности внутримышечная, инъекция.
Диапазоны доз для введения нейротоксинов по настоящему изобретению являются такими, чтобы обеспечить желаемый терапевтический эффект. Понятно, что требуемый диапазон доз зависит от природы конкретного гибридного нейротоксина или композиции, пути введения, типа препарата, возраста пациента, природы, степени или тяжести заболевания пациента, противопоказаний, если таковые имеются, и решения лечащего врача. Изменения в этих уровнях дозировки могут быть скорректированы с использованием стандартных эмпирических процедур для оптимизации.
Жидкие лекарственные формы обычно изготавливают с использованием гибридного нейротоксина и апирогенного стерильного носителя. Генно-инженерный гибридный нейротоксин в зависимости от используемого носителя и концентрации может быть либо растворен, либо ресуспендирован в носителе. При изготовлении растворов гибридный нейротоксин может быть растворен в носителе, при этом раствор при необходимости делают изотоническим путем добавления хлорида натрия и стерилизуют фильтрацией через стерильный фильтр с использованием асептических методов перед заполнением подходящих стерильных флаконов или ампул, и герметизацией. В качестве альтернативы, при достаточной стабильности раствора его в герметичных контейнерах можно стерилизовать в автоклаве. Предпочтительно, чтобы добавки, такие как буферные, солюбилизирующие, стабилизирующие, консервирующие или бактерицидные, суспендирующие или эмульгирующие агенты и/или местные анестетики, могли растворяться в носителе.
Сухие порошки, которые растворяют или ресуспендируют в подходящем носителе перед использованием, могут быть получены путем заполнения предварительно стерилизованными ингредиентами стерильного контейнера с использованием асептической техники в стерильной зоне. В альтернативном варианте, ингредиенты могут быть растворены в подходящих контейнерах с использованием асептической техники в стерильной зоне. Затем продукт высушивают при замораживании, и контейнеры герметично укупоривают.
Парентеральные суспензии, подходящие для внутримышечной, подкожной или внутрикожной инъекции, изготавливают по существу таким же образом, за исключением того, что стерильные компоненты ресуспендируют в стерильном носителе вместо растворения, и стерилизация не может быть выполнена фильтрацией. Компоненты могут быть выделены в стерильном состоянии или, в альтернативном варианте, они могут быть стерилизованы после выделения, например, гамма-излучением.
При введении согласно настоящему изобретению могут использоваться различные технологии доставки, включая инкапсуляцию в микрочастицы, вирусные системы доставки или введение с помощью аэрозоля под высоким давлением.
Данное изобретение не ограничено примерами способов и материалов, раскрытыми в данном документе, и любые способы и материалы, подобные или эквивалентные тем, которые описаны в данном документе, могут использоваться на практике или при тестировании вариантов осуществления этого изобретения. Числовые диапазоны включают числа, определяющие диапазон. Если не указано иное, то любые нуклеотидные последовательности пишутся слева направо в 5'-3'-ориентации; аминокислотные последовательности пишутся слева направо в ориентации от аминоконца к карбоксильному концу, соответственно.
Когда приводится диапазон значений, то подразумевается, что также специально раскрывается каждое промежуточное значение с точностью до десятой доли нижнего предела, если контекст явно не диктует иное, между верхним и нижним пределами этого диапазона. Каждый меньший диапазон между любым заявленным значением или промежуточным значением в указанном диапазоне и любым другим заявленным или промежуточным значением в указанном диапазоне входит в данное описание. Верхние и нижние пределы этих меньших диапазонов могут независимо включаться или исключаться из диапазона, и каждый диапазон, в котором любой, никакой или оба предела включены в меньшие диапазоны, также включен в данное описание при условии любого специально исключенного предела в заявленном диапазоне. В тех случаях, когда указанный диапазон включает один или оба предела, диапазоны, исключающие один или оба из этих включенных пределов, также включены в данное описание.
Следует отметить, что используемые в данном документе и в прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа включают ссылку на множественное число, если контекст явно не указывает иное. Таким образом, например, ссылка на «нейротоксин клостридий» включает множество таких агентов-кандидатов, а ссылка на «данный нейротоксин клостридий» включает ссылку на один или несколько нейротоксинов клостридий и их эквивалентов, известных специалистам в данной области, и т.д.
Информация о последовательностях
SEQ ID NO: 1 - BoNT/A1 - номер доступа в UniProtKB P10845 (Clostridium botulinum)
MPFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHELIHAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVRGIITSKTKSLDKGYNKALNDLCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPL
SEQ ID NO: 2 - BoNT/B1 - номер доступа в UniProtKB P10844 (Clostridium botulinum)
MPVTINNFNYNDPIDNNNIIMMEPPFARGTGRYYKAFKITDRIWIIPERYTFGYKPEDFNKSSGIFNRDVCEYYDPDYLNTNDKKNIFLQTMIKLFNRIKSKPLGEKLLEMIINGIPYLGDRRVPLEEFNTNIASVTVNKLISNPGEVERKKGIFANLIIFGPGPVLNENETIDIGIQNHFASREGFGGIMQMKFCPEYVSVFNNVQENKGASIFNRRGYFSDPALILMHELIHVLHGLYGIKVDDLPIVPNEKKFFMQSTDAIQAEELYTFGGQDPSIITPSTDKSIYDKVLQNFRGIVDRLNKVLVCISDPNININIYKNKFKDKYKFVEDSEGKYSIDVESFDKLYKSLMFGFTETNIAENYKIKTRASYFSDSLPPVKIKNLLDNEIYTIEEGFNISDKDMEKEYRGQNKAINKQAYEEISKEHLAVYKIQMCKSVKAPGICIDVDNEDLFFIADKNSFSDDLSKNERIEYNTQSNYIENDFPINELILDTDLISKIELPSENTESLTDFNVDVPVYEKQPAIKKIFTDENTIFQYLYSQTFPLDIRDISLTSSFDDALLFSNKVYSFFSMDYIKTANKVVEAGLFAGWVKQIVNDFVIEANKSNTMDKIADISLIVPYIGLALNVGNETAKGNFENAFEIAGASILLEFIPELLIPVVGAFLLESYIDNKNKIIKTIDNALTKRNEKWSDMYGLIVAQWLSTVNTQFYTIKEGMYKALNYQAQALEEIIKYRYNIYSEKEKSNINIDFNDINSKLNEGINQAIDNINNFINGCSVSYLMKKMIPLAVEKLLDFDNTLKKNLLNYIDENKLYLIGSAEYEKSKVNKYLKTIMPFDLSIYTNDTILIEMFNKYNSEILNNIILNLRYKDNNLIDLSGYGAKVEVYDGVELNDKNQFKLTSSANSKIRVTQNQNIIFNSVFLDFSVSFWIRIPKYKNDGIQNYIHNEYTIINCMKNNSGWKISIRGNRIIWTLIDINGKTKSVFFEYNIREDISEYINRWFFVTITNNLNNAKIYINGKLESNTDIKDIREVIANGEIIFKLDGDIDRTQFIWMKYFSIFNTELSQSNIEERYKIQSYSEYLKDFWGNPLMYNKEYYMFNAGNKNSYIKLKKDSPVGEILTRSKYNQNSKYINYRDLYIGEKFIIRRKSNSQSINDDIVRKEDYIYLDFFNLNQEWRVYTYKYFKKEEEKLFLAPISDSDEFYNTIQIKEYDEQPTYSCQLLFKKDEESTDEIGLIGIHRFYESGIVFEEYKDYFCISKWYLKEVKRKPYNLKLGCNWQFIPKDEGWTE
SEQ ID NO: 3 - BoNT/C1 - номер доступа в UniProtKB P18640 (Clostridium botulinum)
MPITINNFNYSDPVDNKNILYLDTHLNTLANEPEKAFRITGNIWVIPDRFSRNSNPNLNKPPRVTSPKSGYYDPNYLSTDSDKDPFLKEIIKLFKRINSREIGEELIYRLSTDIPFPGNNNTPINTFDFDVDFNSVDVKTRQGNNWVKTGSINPSVIITGPRENIIDPETSTFKLTNNTFAAQEGFGALSIISISPRFMLTYSNATNDVGEGRFSKSEFCMDPILILMHELNHAMHNLYGIAIPNDQTISSVTSNIFYSQYNVKLEYAEIYAFGGPTIDLIPKSARKYFEEKALDYYRSIAKRLNSITTANPSSFNKYIGEYKQKLIRKYRFVVESSGEVTVNRNKFVELYNELTQIFTEFNYAKIYNVQNRKIYLSNVYTPVTANILDDNVYDIQNGFNIPKSNLNVLFMGQNLSRNPALRKVNPENMLYLFTKFCHKAIDGRSLYNKTLDCRELLVKNTDLPFIGDISDVKTDIFLRKDINEETEVIYYPDNVSVDQVILSKNTSEHGQLDLLYPSIDSESEILPGENQVFYDNRTQNVDYLNSYYYLESQKLSDNVEDFTFTRSIEEALDNSAKVYTYFPTLANKVNAGVQGGLFLMWANDVVEDFTTNILRKDTLDKISDVSAIIPYIGPALNISNSVRRGNFTEAFAVTGVTILLEAFPEFTIPALGAFVIYSKVQERNEIIKTIDNCLEQRIKRWKDSYEWMMGTWLSRIITQFNNISYQMYDSLNYQAGAIKAKIDLEYKKYSGSDKENIKSQVENLKNSLDVKISEAMNNINKFIRECSVTYLFKNMLPKVIDELNEFDRNTKAKLINLIDSHNIILVGEVDKLKAKVNNSFQNTIPFNIFSYTNNSLLKDIINEYFNNINDSKILSLQNRKNTLVDTSGYNAEVSEEGDVQLNPIFPFDFKLGSSGEDRGKVIVTQNENIVYNSMYESFSISFWIRINKWVSNLPGYTIIDSVKNNSGWSIGIISNFLVFTLKQNEDSEQSINFSYDISNNAPGYNKWFFVTVTNNMMGNMKIYINGKLIDTIKVKELTGINFSKTITFEINKIPDTGLITSDSDNINMWIRDFYIFAKELDGKDINILFNSLQYTNVVKDYWGNDLRYNKEYYMVNIDYLNRYMYANSRQIVFNTRRNNNDFNEGYKIIIKRIRGNTNDTRVRGGDILYFDMTINNKAYNLFMKNETMYADNHSTEDIYAIGLREQTKDINDNIIFQIQPMNNTYYYASQIFKSNFNGENISGICSIGTYRFRLGGDWYRHNYLVPTVKQGNYASLLESTSTHWGFVPVSE
SEQ ID NO: 4 - BoNT/D - номер доступа в UniProtKB P19321 (Clostridium botulinum)
MTWPVKDFNYSDPVNDNDILYLRIPQNKLITTPVKAFMITQNIWVIPERFSSDTNPSLSKPPRPTSKYQSYYDPSYLSTDEQKDTFLKGIIKLFKRINERDIGKKLINYLVVGSPFMGDSSTPEDTFDFTRHTTNIAVEKFENGSWKVTNIITPSVLIFGPLPNILDYTASLTLQGQQSNPSFEGFGTLSILKVAPEFLLTFSDVTSNQSSAVLGKSIFCMDPVIALMHELTHSLHQLYGINIPSDKRIRPQVSEGFFSQDGPNVQFEELYTFGGLDVEIIPQIERSQLREKALGHYKDIAKRLNNINKTIPSSWISNIDKYKKIFSEKYNFDKDNTGNFVVNIDKFNSLYSDLTNVMSEVVYSSQYNVKNRTHYFSRHYLPVFANILDDNIYTIRDGFNLTNKGFNIENSGQNIERNPALQKLSSESVVDLFTKVCLRLTKNSRDDSTCIKVKNNRLPYVADKDSISQEIFENKIITDETNVQNYSDKFSLDESILDGQVPINPEIVDPLLPNVNMEPLNLPGEEIVFYDDITKYVDYLNSYYYLESQKLSNNVENITLTTSVEEALGYSNKIYTFLPSLAEKVNKGVQAGLFLNWANEVVEDFTTNIMKKDTLDKISDVSVIIPYIGPALNIGNSALRGNFNQAFATAGVAFLLEGFPEFTIPALGVFTFYSSIQEREKIIKTIENCLEQRVKRWKDSYQWMVSNWLSRITTQFNHINYQMYDSLSYQADAIKAKIDLEYKKYSGSDKENIKSQVENLKNSLDVKISEAMNNINKFIRECSVTYLFKNMLPKVIDELNKFDLRTKTELINLIDSHNIILVGEVDRLKAKVNESFENTMPFNIFSYTNNSLLKDIINEYFNSINDSKILSLQNKKNALVDTSGYNAEVRVGDNVQLNTIYTNDFKLSSSGDKIIVNLNNNILYSAIYENSSVSFWIKISKDLTNSHNEYTIINSIEQNSGWKLCIRNGNIEWILQDVNRKYKSLIFDYSESLSHTGYTNKWFFVTITNNIMGYMKLYINGELKQSQKIEDLDEVKLDKTIVFGIDENIDENQMLWIRDFNIFSKELSNEDINIVYEGQILRNVIKDYWGNPLKFDTEYYIINDNYIDRYIAPESNVLVLVQYPDRSKLYTGNPITIKSVSDKNPYSRILNGDNIILHMLYNSRKYMIIRDTDTIYATQGGECSQNCVYALKLQSNLGNYGIGIFSIKNIVSKNKYCSQIFSSFRENTMLLADIYKPWRFSFKNAYTPVAVTNYETKLLSTSSFWKFISRDPGWVE
SEQ ID NO: 5 - BoNT/E - номер доступа WP_003372387 (Clostridium botulinum)
MPKINSFNYNDPVNDRTILYIKPGGCQEFYKSFNIMKNIWIIPERNVIGTTPQDFHPPTSLKNGDSSYYDPNYLQSDEEKDRFLKIVTKIFNRINNNLSGGILLEELSKANPYLGNDNTPDNQFHIGDASAVEIKFSNGSQDILLPNVIIMGAEPDLFETNSSNISLRNNYMPSNHGFGSIAIVTFSPEYSFRFNDNSMNEFIQDPALTLMHELIHSLHGLYGAKGITTKYTITQKQNPLITNIRGTNIEEFLTFGGTDLNIITSAQSNDIYTNLLADYKKIASKLSKVQVSNPLLNPYKDVFEAKYGLDKDASGIYSVNINKFNDIFKKLYSFTEFDLATKFQVKCRQTYIGQYKYFKLSNLLNDSIYNISEGYNINNLKVNFRGQNANLNPRIITPITGRGLVKKIIRFCKNIVSVKGIRKSICIEINNGELFFVASENSYNDDNINTPKEIDDTVTSNNNYENDLDQVILNFNSESAPGLSDEKLNLTIQNDAYIPKYDSNGTSDIEQHDVNELNVFFYLDAQKVPEGENNVNLTSSIDTALLEQPKIYTFFSSEFINNVNKPVQAALFVSWIQQVLVDFTTEANQKSTVDKIADISIVVPYIGLALNIGNEAQKGNFKDALELLGAGILLEFEPELLIPTILVFTIKSFLGSSDNKNKVIKAINNALKERDEKWKEVYSFIVSNWMTKINTQFNKRKEQMYQALQNQVNAIKTIIESKYNSYTLEEKNELTNKYDIKQIENELNQKVSIAMNNIDRFLTESSISYLMKLINEVKINKLREYDENVKTYLLNYIIQHGSILGESQQELNSMVTDTLNNSIPFKLSSYTDDKILISYFNKFFKRIKSSSVLNMRYKNDKYVDTSGYDSNININGDVYKYPTNKNQFGIYNDKLSEVNISQNDYIIYDNKYKNFSISFWVRIPNYDNKIVNVNNEYTIINCMRDNNSGWKVSLNHNEIIWTLQDNAGINQKLAFNYGNANGISDYINKWIFVTITNDRLGDSKLYINGNLIDQKSILNLGNIHVSDNILFKIVNCSYTRYIGIRYFNIFDKELDETEIQTLYSNEPNTNILKDFWGNYLLYDKEYYLLNVLKPNNFIDRRKDSTLSINNIRSTILLANRLYSGIKVKIQRVNNSSTNDNLVRKNDQVYINFVASKTHLFPLYADTATTNKEKTIKISSSGNRFNQVVVMNSVGNNCTMNFKNNNGNNIGLLGFKADTVVASTWYYTHMRDHTNSNGCFWNFISEEHGWQEK
SEQ ID NO: 6 - BoNT/F - номер доступа в UniProtKB YP_001390123 (Clostridium botulinum)
MPVVINSFNYNDPVNDDTILYMQIPYEEKSKKYYKAFEIMRNVWIIPERNTIGTDPSDFDPPASLENGSSAYYDPNYLTTDAEKDRYLKTTIKLFKRINSNPAGEVLLQEISYAKPYLGNEHTPINEFHPVTRTTSVNIKSSTNVKSSIILNLLVLGAGPDIFENSSYPVRKLMDSGGVYDPSNDGFGSINIVTFSPEYEYTFNDISGGYNSSTESFIADPAISLAHELIHALHGLYGARGVTYKETIKVKQAPLMIAEKPIRLEEFLTFGGQDLNIITSAMKEKIYNNLLANYEKIATRLSRVNSAPPEYDINEYKDYFQWKYGLDKNADGSYTVNENKFNEIYKKLYSFTEIDLANKFKVKCRNTYFIKYGFLKVPNLLDDDIYTVSEGFNIGNLAVNNRGQNIKLNPKIIDSIPDKGLVEKIVKFCKSVIPRKGTKAPPRLCIRVNNRELFFVASESSYNENDINTPKEIDDTTNLNNNYRNNLDEVILDYNSETIPQISNQTLNTLVQDDSYVPRYDSNGTSEIEEHNVVDLNVFFYLHAQKVPEGETNISLTSSIDTALSEESQVYTFFSSEFINTINKPVHAALFISWINQVIRDFTTEATQKSTFDKIADISLVVPYVGLALNIGNEVQKENFKEAFELLGAGILLEFVPELLIPTILVFTIKSFIGSSENKNKIIKAINNSLMERETKWKEIYSWIVSNWLTRINTQFNKRKEQMYQALQNQVDAIKTVIEYKYNNYTSDERNRLESEYNINNIREELNKKVSLAMENIERFITESSIFYLMKLINEAKVSKLREYDEGVKEYLLDYISEHRSILGNSVQELNDLVTSTLNNSIPFELSSYTNDKILILYFNKLYKKIKDNSILDMRYENNKFIDISGYGSNISINGDVYIYSTNRNQFGIYSSKPSEVNIAQNNDIIYNGRYQNFSISFWVRIPKYFNKVNLNNEYTIIDCIRNNNSGWKISLNYNKIIWTLQDTAGNNQKLVFNYTQMISISDYINKWIFVTITNNRLGNSRIYINGNLIDEKSISNLGDIHVSDNILFKIVGCNDTRYVGIRYFKVFDTELGKTEIETLYSDEPDPSILKDFWGNYLLYNKRYYLLNLLRTDKSITQNSNFLNINQQRGVYQKPNIFSNTRLYTGVEVIIRKNGSTDISNTDNFVRKNDLAYINVVDRDVEYRLYADISIAKPEKIIKLIRTSNSNNSLGQIIVMDSIGNNCTMNFQNNNGGNIGLLGFHSNNLVASSWYYNNIRKNTSSNGCFWSFISKEHGWQEN
SEQ ID NO: 7 - BoNT/G - номер доступа в UniProtKB WP_039635782 (Clostridium botulinum)
MPVNIKNFNYNDPINNDDIIMMEPFNDPGPGTYYKAFRIIDRIWIVPERFTYGFQPDQFNASTGVFSKDVYEYYDPTYLKTDAEKDKFLKTMIKLFNRINSKPSGQRLLDMIVDAIPYLGNASTPPDKFAANVANVSINKKIIQPGAEDQIKGLMTNLIIFGPGPVLSDNFTDSMIMNGHSPISEGFGARMMIRFCPSCLNVFNNVQENKDTSIFSRRAYFADPALTLMHELIHVLHGLYGIKISNLPITPNTKEFFMQHSDPVQAEELYTFGGHDPSVISPSTDMNIYNKALQNFQDIANRLNIVSSAQGSGIDISLYKQIYKNKYDFVEDPNGKYSVDKDKFDKLYKALMFGFTETNLAGEYGIKTRYSYFSEYLPPIKTEKLLDNTIYTQNEGFNIASKNLKTEFNGQNKAVNKEAYEEISLEHLVIYRIAMCKPVMYKNTGKSEQCIIVNNEDLFFIANKDSFSKDLAKAETIAYNTQNNTIENNFSIDQLILDNDLSSGIDLPNENTEPFTNFDDIDIPVYIKQSALKKIFVDGDSLFEYLHAQTFPSNIENLQLTNSLNDALRNNNKVYTFFSTNLVEKANTVVGASLFVNWVKGVIDDFTSESTQKSTIDKVSDVSIIIPYIGPALNVGNETAKENFKNAFEIGGAAILMEFIPELIVPIVGFFTLESYVGNKGHIIMTISNALKKRDQKWTDMYGLIVSQWLSTVNTQFYTIKERMYNALNNQSQAIEKIIEDQYNRYSEEDKMNINIDFNDIDFKLNQSINLAINNIDDFINQCSISYLMNRMIPLAVKKLKDFDDNLKRDLLEYIDTNELYLLDEVNILKSKVNRHLKDSIPFDLSLYTKDTILIQVFNNYISNISSNAILSLSYRGGRLIDSSGYGATMNVGSDVIFNDIGNGQFKLNNSENSNITAHQSKFVVYDSMFDNFSINFWVRTPKYNNNDIQTYLQNEYTIISCIKNDSGWKVSIKGNRIIWTLIDVNAKSKSIFFEYSIKDNISDYINKWFSITITNDRLGNANIYINGSLKKSEKILNLDRINSSNDIDFKLINCTDTTKFVWIKDFNIFGRELNATEVSSLYWIQSSTNTLKDFWGNPLRYDTQYYLFNQGMQNIYIKYFSKASMGETAPRTNFNNAAINYQNLYLGLRFIIKKASNSRNINNDNIVREGDYIYLNIDNISDESYRVYVLVNSKEIQTQLFLAPINDDPTFYDVLQIKKYYEKTTYNCQILCEKDTKTFGLFGIGKFVKDYGYVWDTYDNYFCISQWYLRRISENINKLRLGCNWQFIPVDEGWTE
SEQ ID NO: 8 - TeNT - номер доступа в UniProtKB P04958 (Clostridium tetani)
MPITINNFRYSDPVNNDTIIMMEPPYCKGLDIYYKAFKITDRIWIVPERYEFGTKPEDFNPPSSLIEGASEYYDPNYLRTDSDKDRFLQTMVKLFNRIKNNVAGEALLDKIINAIPYLGNSYSLLDKFDTNSNSVSFNLLEQDPSGATTKSAMLTNLIIFGPGPVLNKNEVRGIVLRVDNKNYFPCRDGFGSIMQMAFCPEYVPTFDNVIENITSLTIGKSKYFQDPALLLMHELIHVLHGLYGMQVSSHEIIPSKQEIYMQHTYPISAEELFTFGGQDANLISIDIKNDLYEKTLNDYKAIANKLSQVTSCNDPNIDIDSYKQIYQQKYQFDKDSNGQYIVNEDKFQILYNSIMYGFTEIELGKKFNIKTRLSYFSMNHDPVKIPNLLDDTIYNDTEGFNIESKDLKSEYKGQNMRVNTNAFRNVDGSGLVSKLIGLCKKIIPPTNIRENLYNRTASLTDLGGELCIKIKNEDLTFIAEKNSFSEEPFQDEIVSYNTKNKPLNFNYSLDKIIVDYNLQSKITLPNDRTTPVTKGIPYAPEYKSNAASTIEIHNIDDNTIYQYLYAQKSPTTLQRITMTNSVDDALINSTKIYSYFPSVISKVNQGAQGILFLQWVRDIIDDFTNESSQKTTIDKISDVSTIVPYIGPALNIVKQGYEGNFIGALETTGVVLLLEYIPEITLPVIAALSIAESSTQKEKIIKTIDNFLEKRYEKWIEVYKLVKAKWLGTVNTQFQKRSYQMYRSLEYQVDAIKKIIDYEYKIYSGPDKEQIADEINNLKNKLEEKANKAMININIFMRESSRSFLVNQMINEAKKQLLEFDTQSKNILMQYIKANSKFIGITELKKLESKINKVFSTPIPFSYSKNLDCWVDNEEDIDVILKKSTILNLDINNDIISDISGFNSSVITYPDAQLVPGINGKAIHLVNNESSEVIVHKAMDIEYNDMFNNFTVSFWLRVPKVSASHLEQYGTNEYSIISSMKKHSLSIGSGWSVSLKGNNLIWTLKDSAGEVRQITFRDLPDKFNAYLANKWVFITITNDRLSSANLYINGVLMGSAEITGLGAIREDNNITLKLDRCNNNNQYVSIDKFRIFCKALNPKEIEKLYTSYLSITFLRDFWGNPLRYDTEYYLIPVASSSKDVQLKNITDYMYLTNAPSYTNGKLNIYYRRLYNGLKFIIKRYTPNNEIDSFVKSGDFIKLYVSYNNNEHIVGYPKDGNAFNNLDRILRVGYNAPGIPLYKKMEAVKLRDLKTYSVQLKLYDDKNASLGLVGTHNGQIGNDPNRDILIASNWYFNHLKDKILGCDWYFVPTDEGWTND
SEQ ID NO: 9 - В-субъединица холерного токсина (Vibrio cholera)
MIKLKFGVFFTVLLSSAYAHGTPQNITDLCAEYHNTQIYTLNDKIFSYTESLAGKREMAIITFKNGAIFQVEVPGSQHIDSQKKAIERMKDTLRIAYLTEAKVEKLCVWNNKTPHAIAAISMAN
SEQ ID NO: 10 - А-субъединица холерного токсина (Vibrio cholera)
MVKIIFVFFIFLSSFSYANDDKLYRADSRPPDEIKQSGGLMPRGQSEYFDRGTQMNINLYDHARGTQTGFVRHDDGYVSTSISLRSAHLVGQTILSGHSTYYIYVIATAPNMFNVNDVLGAYSPHPDEQEVSALGGIPYSQIYGWYRVHFGVLDEQLHRNRGYRDRYYSNLDIAPAADGYGLAGFPPEHRAWREEPWIHHAPPGCGNAPRSSMSNTCDEKTQSLGVKFLDEYQSKVKRQIFSGYQSDIDTHNRIKDEL
SEQ ID NO: 11 - BoNT/A1(0)-CtxBCP (Искусственная последовательность)
MGSMEFVNKQFNYKDPVNGVDIAYIKIPNAGQMQPVKAFKIHNKIWVIPERDTFTNPEEGDLNPPPEAKQVPVSYYDSTYLSTDNEKDNYLKGVTKLFERIYSTDLGRMLLTSIVRGIPFWGGSTIDTELKVIDTNCINVIQPDGSYRSEELNLVIIGPSADIIQFECKSFGHEVLNLTRNGYGSTQYIRFSPDFTFGFEESLEVDTNPLLGAGKFATDPAVTLAHQLIYAGHRLYGIAINPNRVFKVNTNAYYEMSGLEVSFEELRTFGGHDAKFIDSLQENEFRLYYYNKFKDIASTLNKAKSIVGTTASLQYMKNVFKEKYLLSEDTSGKFSVDKLKFDKLYKMLTEIYTEDNFVKFFKVLNRKTYLNFDKAVFKINIVPKVNYTIYDGFNLRNTNLAANFNGQNTEINNMNFTKLKNFTGLFEFYKLLCVDGIITSKTKSDDDDKTPQNITDLCAEYHNTQIHTLNDKIFSYTESLAGKREMAIITFKNGATFQVEVPGSQHIDSQKKAIERMKDTLRIAYLTEAKVEKLCVWNNKTPHAIAAISMANSGGGGSGGGGSGGGGSPRGSALNLQCIKVNNWDLFFSPSEDNFTNDLNKGEEITSDTNIEAAEENISLDLIQQYYLTFNFDNEPENISIENLSSDIIGQLELMPNIERFPNGKKYELDKYTMFHYLRAQEFEHGKSRIALTNSVNEALLNPSRVYTFFSSDYVKKVNKATEAAMFLGWVEQLVYDFTDETSEVSTTDKIADITIIIPYIGPALNIGNMLYKDDFVGALIFSGAVILLEFIPEIAIPVLGTFALVSYIANKVLTVQTIDNALSKRNEKWDEVYKYIVTNWLAKVNTQIDLIRKKMKEALENQAEATKAIINYQYNQYTEEEKNNINFNIDDLSSKLNESINKAMININKFLNQCSVSYLMNSMIPYGVKRLEDFDASLKDALLKYIYDNRGTLIGQVDRLKDKVNNTLSTDIPFQLSKYVDNQRLLSTFTEYIKNIINTSILNLRYESNHLIDLSRYASKINIGSKVNFDPIDKNQIQLFNLESSKIEVILKNAIVYNSMYENFSTSFWIRIPKYFNSISLNNEYTIINCMENNSGWKVSLNYGEIIWTLQDTQEIKQRVVFKYSQMINISDYINRWIFVTITNNRLNNSKIYINGRLIDQKPISNLGNIHASNNIMFKLDGCRDTHRYIWIKYFNLFDKELNEKEIKDLYDNQSNSGILKDFWGDYLQYDKPYYMLNLYDPNKYVDVNNVGIRGYMYLKGPRGSVMTTNIYLNSSLYRGTKFIIKKYASGNKDNIVRNNDRVYINVVVKNKEYRLATNASQAGVEKILSALEIPDVGNLSQVVVMKSKNDQGITNKCKMNLQDNNGNDIGFIGFHQFNNIAKLVASNWYNRQIERSSRTLGCSWEFIPVDDGWGERPLRKSFHHHHHH
Далее изобретение будет описано только в качестве примера на основе нижеследующих фигур и примеров.
ФИГУРЫ
Фигура 1: примеры гибридных нейротоксинов Ctx-BoNT
Фигура 2: фракции, проанализированные с помощью электрофореза в ДСН-ПААГ, после захватывающей колонки HisTrap HP. Целевая конструкция элюируется во фракциях E3-F6 (250-500 мМ имидазол).
Фигура 3: фракции, проанализированные с помощью электрофореза в ДСН-ПААГ, после второй хроматографической стадии, анионообменной хроматографии. Целевой белок элюируется во фракциях 13-30 (при увеличении концентрации NaCl).
Фигура 4: фракции, проанализированные с помощью электрофореза в ДСН-ПААГ, после активации энтерокиназой. Анализ показывает, что белок нестабилен до протеолитической активации, хотя некоторые из конструкций действительно остаются интактными. Активация энтерокиназой действительно расщепляет конструкцию между легкой и тяжелой цепью, и из анализа методом электрофореза в ДСН-ПААГ можно предположить, что по меньшей мере часть продукта имеет предсказанный состав, т.е. интактные легкую и тяжелую цепи, а также прикрепленные GS20 и CtxB в центральном положении.
Фигура 5: анализ методом Вестерн-блотинга после активации энтерокиназой. 5А - блоты, окрашенные моноклональным антителом к тетрагистидину и вторичным антимышиным конъюгатом; 5B - блоты, окрашенные анти-LcA антителом и вторичным антикроличьим конъюгатом.
Фигура 6: оценка свободного Ctx-B, BoNT/A1(0)-CtxBCP и BoNT/A1(0) в анализе конкурентного связывания GM1.
ПРИМЕРЫ
Пример 1 - Экспрессия и очистка BoNT/A1(0)-CtxBCP
Конструкцию, оптимизированную по кодонам (для E. coli), конструировали на основе последовательности первичного белка CtxB (остатки с 22 по 103 в SEQ ID NO: 11) и субклонировали в эндонегативный BoNT/A в плазмиде pJ401 с T5-промотором для получения конструкции с центрально расположенным CtxB (BoNT/A1(0)-CtxBCP) с сайтом активации энтерокиназы (EK), линкером GS20 и C-концевым His-тэгом: LcA(0)-EK-CtxB-GS20-Hc-A-6HT.
Конструкцией трансформировали штамм E. coli BL21 (DE3) в среде mTB (триптон 12 г/л, дрожжевой экстракт 24 г/л, дикалийфосфат 9,4 г/л, монокалийфосфат 2,2 г/л, Melford) с добавлением глицерина (0,4%, Sigma), глюкозамина (0,2%, Sigma) и 30 мкг/мл канамицина (Sigma). Отдельную колонию отбирали для заражения флакона с микробанком на шариках. Зараженные шарики хранили при -80°С до использования. Один шарик использовали для заражения 100 мл среды mTB при 37°С. Когда оптическая плотность при 600 нм достигла 4,6, 10 мл из 100 мл культуры добавляли к 1 л среды в колбе объемом 2 л, и культуру выращивали при 37°С до OD 600≥1,0. Температуру снижали до 16°С, и культуре давали остыть в течение 1 часа перед добавлением IPTG до конечной концентрации 1 мМ. Индукция продолжалась 20 часов. Культуру затем собирали центрифугированием при 6000×g в течение 20 минут при 4°С. Отработанный носитель декантировали, а осадок замораживали и хранили при -80°С, пока он не потребовался.
Клеточный осадок и ресуспендировали в буфере для лизиса до концентрации 6 мл/г (50 мМ Tris, рН 8,0, 200 мМ NaCl). Клетки лизировали однократным пропусканием через гомогенизатор при 20 kpsi. Клеточный дебрис и нерастворимый материал отделяли центрифугированием при 30000×g в течение 30 минут. Супернатант собирали и наносили на колонку HisTrap объемом 5 мл (предварительно заполненную смолой Ni2+ и уравновешенную лизирующим буфером). После нанесения колонку промывали 50 мл буфера для лизиса перед элюцией белка ступенчатым градиентом с увеличением концентрации имидазола: 25 мл 40 мМ имидазола, 50 мл 80 мМ имидазола, 25 мл 125 мМ имидазола, 25 мл 250 мМ имидазола и 25 мл 500 мМ имидазола. Фракции по 2,5 мл собирали на протяжении всей элюции, и местоположение целевой химеры определяли электрофорезом в ДСН-ПААГ (фигура 2).
Фракции E3-F6 (250-500 мМ имидазола), содержащие целевой белок, объединяли и обессоливали с использованием колонки для обессоливания 26/10 с объемом 53 мл. Материал обессоливали в QHP-буфере для связывания (50 мМ Tris, рН 8,0). Материал в новом буфере хранили в виде единого пула и далее очищали на анионообменнике.
Для дополнительной очистки химеры использовали колонку HiTrap QHP объемом 5 мл. Колонку предварительно уравновешивали в связывающем буфере (50 мМ Tris, рН 8,0) перед нанесением пула после обессоливания. Колонку промывали в течение 25 мл буфером для связывания, после чего элюировали белок в линейном градиенте от 0 до 350 мМ NaCl на 100 мл. Затем колонку промывали 25 мл буфера с линейны градиентом высокого содержания соли 350 мМ - 1 М NaCl. Фракции по 2,5 мл собирали в течение всей элюции и анализировали электрофорезом в ДСН-ПААГ, чтобы определить, какие фракции содержали целевой белок (фигура 3).
Фракции 13-30, содержащие целевой белок, объединяли и концентрировали перед активацией энтерокиназой в течение 18 часов при 4°С, и реакцию останавливали добавлением AEBSF.
Этот конечный материал анализировали электрофорезом в ДСН-ПААГ (фигура 4).
Анализ показывает, что белок был нестабилен до протеолитической активации, хотя некоторые из конструкций действительно остаются интактными. Активация энтерокиназой действительно расщепляет конструкцию между легкой и тяжелой цепью, и из анализа электрофорезом в ДСН-ПААГ можно предположить, что по меньшей мере часть продукта имеет предсказанный состав, т.е. интактные легкую и тяжелую цепи, а также прикрепленные GS20 и CtxB в центральном положении.
Образцы также были проанализировали методом вестерн-блоттинга для подтверждения наличия легкой цепи и гистидинового тэге (фигура 5). Белок переносили из геля на нитроцеллюлозную мембрану с использованием системы для переноса Bio-Rad Trans-Blot Turbo. Блоты блокировали в буфере PBST, содержащем 0,5% BSA. Блоты окрашивали либо моноклональным анти-тетраHis антителом и вторичным антимышиным конъюгатом, либо их анти-LcA антителом и вторичным антикроличьим конъюгатом. Для генерации сигнала использовали субстрат Super signal, и сигнал детектировали в системе гель-документации Pxi 4. Вестерн-блоттинг давал положительный сигнал для полноразмерного целевого продукта, а также для укороченных продуктов.
Пример 2 - Связывание BoNT/A1(0)-CtxBCP с GM1
Кратко, прозрачный планшет F96 Maxisorp покрывали 100 нг/мл GM1 в течение ночи, блокировали 2%-м раствором BSA-PBS и сначала инкубировали со свободной В-субъединицей холерного токсина (свободная Ctx-B), BoNT/A1(0)-CtxBCP или BoNT/A1(0) в указанных концентрациях. Затем планшеты инкубировали с 40 мкг/мл В-субъединицы холерного токсина, конъюгированной с пероксидазой хрена (Ctx-B-HRP). Активность HRP на планшете после промывки определяли с помощью проявляющего раствора, а оптическую плотность при 450 нм определяли после остановки реакции. Данные представляют собой среднее значение±стандартная ошибка средного для трех лунок (фигура 6).
На фигуре 6 показано, что:
BoNT/A1(0) не конкурировал за связывание Ctx-B (Ctx-B-HRP) с GM1, как ожидалось;
Свободный Ctx-B конкурировал с Ctx-B-HRP, как и ожидалось, с pEC50 0,2 мкг/мл;
BoNT/A1(0)-CtxBCP был способен конкурировать с Ctx-B-HRP, демонстрируя pEC50 примерно в 100 раз ниже, чем свободный Ctx-B (49 мкг/мл).
Можно сделать вывод о том, что добавление домена Ctx-B наделяет BoNT/A1(0) способностью связываться с GM1, ганглиозидом, который не является естественным рецептором для BoNT/A1(0).
--->
СПИСОК ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> IPSEN BIOPHARM LIMITED
<120> ГИБРИДНЫЕ НЕЙРОТОКСИНЫ
<130> IBL 005-EP-PCT
<150> EP16191468.4
<151> 2016-09-29
<160> 11
<170> PatentIn version 3.5
<210> 1
<211> 1296
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 1
Met Pro Phe Val Asn Lys Gln Phe Asn Tyr Lys Asp Pro Val Asn Gly
1 5 10 15
Val Asp Ile Ala Tyr Ile Lys Ile Pro Asn Ala Gly Gln Met Gln Pro
20 25 30
Val Lys Ala Phe Lys Ile His Asn Lys Ile Trp Val Ile Pro Glu Arg
35 40 45
Asp Thr Phe Thr Asn Pro Glu Glu Gly Asp Leu Asn Pro Pro Pro Glu
50 55 60
Ala Lys Gln Val Pro Val Ser Tyr Tyr Asp Ser Thr Tyr Leu Ser Thr
65 70 75 80
Asp Asn Glu Lys Asp Asn Tyr Leu Lys Gly Val Thr Lys Leu Phe Glu
85 90 95
Arg Ile Tyr Ser Thr Asp Leu Gly Arg Met Leu Leu Thr Ser Ile Val
100 105 110
Arg Gly Ile Pro Phe Trp Gly Gly Ser Thr Ile Asp Thr Glu Leu Lys
115 120 125
Val Ile Asp Thr Asn Cys Ile Asn Val Ile Gln Pro Asp Gly Ser Tyr
130 135 140
Arg Ser Glu Glu Leu Asn Leu Val Ile Ile Gly Pro Ser Ala Asp Ile
145 150 155 160
Ile Gln Phe Glu Cys Lys Ser Phe Gly His Glu Val Leu Asn Leu Thr
165 170 175
Arg Asn Gly Tyr Gly Ser Thr Gln Tyr Ile Arg Phe Ser Pro Asp Phe
180 185 190
Thr Phe Gly Phe Glu Glu Ser Leu Glu Val Asp Thr Asn Pro Leu Leu
195 200 205
Gly Ala Gly Lys Phe Ala Thr Asp Pro Ala Val Thr Leu Ala His Glu
210 215 220
Leu Ile His Ala Gly His Arg Leu Tyr Gly Ile Ala Ile Asn Pro Asn
225 230 235 240
Arg Val Phe Lys Val Asn Thr Asn Ala Tyr Tyr Glu Met Ser Gly Leu
245 250 255
Glu Val Ser Phe Glu Glu Leu Arg Thr Phe Gly Gly His Asp Ala Lys
260 265 270
Phe Ile Asp Ser Leu Gln Glu Asn Glu Phe Arg Leu Tyr Tyr Tyr Asn
275 280 285
Lys Phe Lys Asp Ile Ala Ser Thr Leu Asn Lys Ala Lys Ser Ile Val
290 295 300
Gly Thr Thr Ala Ser Leu Gln Tyr Met Lys Asn Val Phe Lys Glu Lys
305 310 315 320
Tyr Leu Leu Ser Glu Asp Thr Ser Gly Lys Phe Ser Val Asp Lys Leu
325 330 335
Lys Phe Asp Lys Leu Tyr Lys Met Leu Thr Glu Ile Tyr Thr Glu Asp
340 345 350
Asn Phe Val Lys Phe Phe Lys Val Leu Asn Arg Lys Thr Tyr Leu Asn
355 360 365
Phe Asp Lys Ala Val Phe Lys Ile Asn Ile Val Pro Lys Val Asn Tyr
370 375 380
Thr Ile Tyr Asp Gly Phe Asn Leu Arg Asn Thr Asn Leu Ala Ala Asn
385 390 395 400
Phe Asn Gly Gln Asn Thr Glu Ile Asn Asn Met Asn Phe Thr Lys Leu
405 410 415
Lys Asn Phe Thr Gly Leu Phe Glu Phe Tyr Lys Leu Leu Cys Val Arg
420 425 430
Gly Ile Ile Thr Ser Lys Thr Lys Ser Leu Asp Lys Gly Tyr Asn Lys
435 440 445
Ala Leu Asn Asp Leu Cys Ile Lys Val Asn Asn Trp Asp Leu Phe Phe
450 455 460
Ser Pro Ser Glu Asp Asn Phe Thr Asn Asp Leu Asn Lys Gly Glu Glu
465 470 475 480
Ile Thr Ser Asp Thr Asn Ile Glu Ala Ala Glu Glu Asn Ile Ser Leu
485 490 495
Asp Leu Ile Gln Gln Tyr Tyr Leu Thr Phe Asn Phe Asp Asn Glu Pro
500 505 510
Glu Asn Ile Ser Ile Glu Asn Leu Ser Ser Asp Ile Ile Gly Gln Leu
515 520 525
Glu Leu Met Pro Asn Ile Glu Arg Phe Pro Asn Gly Lys Lys Tyr Glu
530 535 540
Leu Asp Lys Tyr Thr Met Phe His Tyr Leu Arg Ala Gln Glu Phe Glu
545 550 555 560
His Gly Lys Ser Arg Ile Ala Leu Thr Asn Ser Val Asn Glu Ala Leu
565 570 575
Leu Asn Pro Ser Arg Val Tyr Thr Phe Phe Ser Ser Asp Tyr Val Lys
580 585 590
Lys Val Asn Lys Ala Thr Glu Ala Ala Met Phe Leu Gly Trp Val Glu
595 600 605
Gln Leu Val Tyr Asp Phe Thr Asp Glu Thr Ser Glu Val Ser Thr Thr
610 615 620
Asp Lys Ile Ala Asp Ile Thr Ile Ile Ile Pro Tyr Ile Gly Pro Ala
625 630 635 640
Leu Asn Ile Gly Asn Met Leu Tyr Lys Asp Asp Phe Val Gly Ala Leu
645 650 655
Ile Phe Ser Gly Ala Val Ile Leu Leu Glu Phe Ile Pro Glu Ile Ala
660 665 670
Ile Pro Val Leu Gly Thr Phe Ala Leu Val Ser Tyr Ile Ala Asn Lys
675 680 685
Val Leu Thr Val Gln Thr Ile Asp Asn Ala Leu Ser Lys Arg Asn Glu
690 695 700
Lys Trp Asp Glu Val Tyr Lys Tyr Ile Val Thr Asn Trp Leu Ala Lys
705 710 715 720
Val Asn Thr Gln Ile Asp Leu Ile Arg Lys Lys Met Lys Glu Ala Leu
725 730 735
Glu Asn Gln Ala Glu Ala Thr Lys Ala Ile Ile Asn Tyr Gln Tyr Asn
740 745 750
Gln Tyr Thr Glu Glu Glu Lys Asn Asn Ile Asn Phe Asn Ile Asp Asp
755 760 765
Leu Ser Ser Lys Leu Asn Glu Ser Ile Asn Lys Ala Met Ile Asn Ile
770 775 780
Asn Lys Phe Leu Asn Gln Cys Ser Val Ser Tyr Leu Met Asn Ser Met
785 790 795 800
Ile Pro Tyr Gly Val Lys Arg Leu Glu Asp Phe Asp Ala Ser Leu Lys
805 810 815
Asp Ala Leu Leu Lys Tyr Ile Tyr Asp Asn Arg Gly Thr Leu Ile Gly
820 825 830
Gln Val Asp Arg Leu Lys Asp Lys Val Asn Asn Thr Leu Ser Thr Asp
835 840 845
Ile Pro Phe Gln Leu Ser Lys Tyr Val Asp Asn Gln Arg Leu Leu Ser
850 855 860
Thr Phe Thr Glu Tyr Ile Lys Asn Ile Ile Asn Thr Ser Ile Leu Asn
865 870 875 880
Leu Arg Tyr Glu Ser Asn His Leu Ile Asp Leu Ser Arg Tyr Ala Ser
885 890 895
Lys Ile Asn Ile Gly Ser Lys Val Asn Phe Asp Pro Ile Asp Lys Asn
900 905 910
Gln Ile Gln Leu Phe Asn Leu Glu Ser Ser Lys Ile Glu Val Ile Leu
915 920 925
Lys Asn Ala Ile Val Tyr Asn Ser Met Tyr Glu Asn Phe Ser Thr Ser
930 935 940
Phe Trp Ile Arg Ile Pro Lys Tyr Phe Asn Ser Ile Ser Leu Asn Asn
945 950 955 960
Glu Tyr Thr Ile Ile Asn Cys Met Glu Asn Asn Ser Gly Trp Lys Val
965 970 975
Ser Leu Asn Tyr Gly Glu Ile Ile Trp Thr Leu Gln Asp Thr Gln Glu
980 985 990
Ile Lys Gln Arg Val Val Phe Lys Tyr Ser Gln Met Ile Asn Ile Ser
995 1000 1005
Asp Tyr Ile Asn Arg Trp Ile Phe Val Thr Ile Thr Asn Asn Arg
1010 1015 1020
Leu Asn Asn Ser Lys Ile Tyr Ile Asn Gly Arg Leu Ile Asp Gln
1025 1030 1035
Lys Pro Ile Ser Asn Leu Gly Asn Ile His Ala Ser Asn Asn Ile
1040 1045 1050
Met Phe Lys Leu Asp Gly Cys Arg Asp Thr His Arg Tyr Ile Trp
1055 1060 1065
Ile Lys Tyr Phe Asn Leu Phe Asp Lys Glu Leu Asn Glu Lys Glu
1070 1075 1080
Ile Lys Asp Leu Tyr Asp Asn Gln Ser Asn Ser Gly Ile Leu Lys
1085 1090 1095
Asp Phe Trp Gly Asp Tyr Leu Gln Tyr Asp Lys Pro Tyr Tyr Met
1100 1105 1110
Leu Asn Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Tyr Val Asp Val Asn Asn Val
1115 1120 1125
Gly Ile Arg Gly Tyr Met Tyr Leu Lys Gly Pro Arg Gly Ser Val
1130 1135 1140
Met Thr Thr Asn Ile Tyr Leu Asn Ser Ser Leu Tyr Arg Gly Thr
1145 1150 1155
Lys Phe Ile Ile Lys Lys Tyr Ala Ser Gly Asn Lys Asp Asn Ile
1160 1165 1170
Val Arg Asn Asn Asp Arg Val Tyr Ile Asn Val Val Val Lys Asn
1175 1180 1185
Lys Glu Tyr Arg Leu Ala Thr Asn Ala Ser Gln Ala Gly Val Glu
1190 1195 1200
Lys Ile Leu Ser Ala Leu Glu Ile Pro Asp Val Gly Asn Leu Ser
1205 1210 1215
Gln Val Val Val Met Lys Ser Lys Asn Asp Gln Gly Ile Thr Asn
1220 1225 1230
Lys Cys Lys Met Asn Leu Gln Asp Asn Asn Gly Asn Asp Ile Gly
1235 1240 1245
Phe Ile Gly Phe His Gln Phe Asn Asn Ile Ala Lys Leu Val Ala
1250 1255 1260
Ser Asn Trp Tyr Asn Arg Gln Ile Glu Arg Ser Ser Arg Thr Leu
1265 1270 1275
Gly Cys Ser Trp Glu Phe Ile Pro Val Asp Asp Gly Trp Gly Glu
1280 1285 1290
Arg Pro Leu
1295
<210> 2
<211> 1291
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 2
Met Pro Val Thr Ile Asn Asn Phe Asn Tyr Asn Asp Pro Ile Asp Asn
1 5 10 15
Asn Asn Ile Ile Met Met Glu Pro Pro Phe Ala Arg Gly Thr Gly Arg
20 25 30
Tyr Tyr Lys Ala Phe Lys Ile Thr Asp Arg Ile Trp Ile Ile Pro Glu
35 40 45
Arg Tyr Thr Phe Gly Tyr Lys Pro Glu Asp Phe Asn Lys Ser Ser Gly
50 55 60
Ile Phe Asn Arg Asp Val Cys Glu Tyr Tyr Asp Pro Asp Tyr Leu Asn
65 70 75 80
Thr Asn Asp Lys Lys Asn Ile Phe Leu Gln Thr Met Ile Lys Leu Phe
85 90 95
Asn Arg Ile Lys Ser Lys Pro Leu Gly Glu Lys Leu Leu Glu Met Ile
100 105 110
Ile Asn Gly Ile Pro Tyr Leu Gly Asp Arg Arg Val Pro Leu Glu Glu
115 120 125
Phe Asn Thr Asn Ile Ala Ser Val Thr Val Asn Lys Leu Ile Ser Asn
130 135 140
Pro Gly Glu Val Glu Arg Lys Lys Gly Ile Phe Ala Asn Leu Ile Ile
145 150 155 160
Phe Gly Pro Gly Pro Val Leu Asn Glu Asn Glu Thr Ile Asp Ile Gly
165 170 175
Ile Gln Asn His Phe Ala Ser Arg Glu Gly Phe Gly Gly Ile Met Gln
180 185 190
Met Lys Phe Cys Pro Glu Tyr Val Ser Val Phe Asn Asn Val Gln Glu
195 200 205
Asn Lys Gly Ala Ser Ile Phe Asn Arg Arg Gly Tyr Phe Ser Asp Pro
210 215 220
Ala Leu Ile Leu Met His Glu Leu Ile His Val Leu His Gly Leu Tyr
225 230 235 240
Gly Ile Lys Val Asp Asp Leu Pro Ile Val Pro Asn Glu Lys Lys Phe
245 250 255
Phe Met Gln Ser Thr Asp Ala Ile Gln Ala Glu Glu Leu Tyr Thr Phe
260 265 270
Gly Gly Gln Asp Pro Ser Ile Ile Thr Pro Ser Thr Asp Lys Ser Ile
275 280 285
Tyr Asp Lys Val Leu Gln Asn Phe Arg Gly Ile Val Asp Arg Leu Asn
290 295 300
Lys Val Leu Val Cys Ile Ser Asp Pro Asn Ile Asn Ile Asn Ile Tyr
305 310 315 320
Lys Asn Lys Phe Lys Asp Lys Tyr Lys Phe Val Glu Asp Ser Glu Gly
325 330 335
Lys Tyr Ser Ile Asp Val Glu Ser Phe Asp Lys Leu Tyr Lys Ser Leu
340 345 350
Met Phe Gly Phe Thr Glu Thr Asn Ile Ala Glu Asn Tyr Lys Ile Lys
355 360 365
Thr Arg Ala Ser Tyr Phe Ser Asp Ser Leu Pro Pro Val Lys Ile Lys
370 375 380
Asn Leu Leu Asp Asn Glu Ile Tyr Thr Ile Glu Glu Gly Phe Asn Ile
385 390 395 400
Ser Asp Lys Asp Met Glu Lys Glu Tyr Arg Gly Gln Asn Lys Ala Ile
405 410 415
Asn Lys Gln Ala Tyr Glu Glu Ile Ser Lys Glu His Leu Ala Val Tyr
420 425 430
Lys Ile Gln Met Cys Lys Ser Val Lys Ala Pro Gly Ile Cys Ile Asp
435 440 445
Val Asp Asn Glu Asp Leu Phe Phe Ile Ala Asp Lys Asn Ser Phe Ser
450 455 460
Asp Asp Leu Ser Lys Asn Glu Arg Ile Glu Tyr Asn Thr Gln Ser Asn
465 470 475 480
Tyr Ile Glu Asn Asp Phe Pro Ile Asn Glu Leu Ile Leu Asp Thr Asp
485 490 495
Leu Ile Ser Lys Ile Glu Leu Pro Ser Glu Asn Thr Glu Ser Leu Thr
500 505 510
Asp Phe Asn Val Asp Val Pro Val Tyr Glu Lys Gln Pro Ala Ile Lys
515 520 525
Lys Ile Phe Thr Asp Glu Asn Thr Ile Phe Gln Tyr Leu Tyr Ser Gln
530 535 540
Thr Phe Pro Leu Asp Ile Arg Asp Ile Ser Leu Thr Ser Ser Phe Asp
545 550 555 560
Asp Ala Leu Leu Phe Ser Asn Lys Val Tyr Ser Phe Phe Ser Met Asp
565 570 575
Tyr Ile Lys Thr Ala Asn Lys Val Val Glu Ala Gly Leu Phe Ala Gly
580 585 590
Trp Val Lys Gln Ile Val Asn Asp Phe Val Ile Glu Ala Asn Lys Ser
595 600 605
Asn Thr Met Asp Lys Ile Ala Asp Ile Ser Leu Ile Val Pro Tyr Ile
610 615 620
Gly Leu Ala Leu Asn Val Gly Asn Glu Thr Ala Lys Gly Asn Phe Glu
625 630 635 640
Asn Ala Phe Glu Ile Ala Gly Ala Ser Ile Leu Leu Glu Phe Ile Pro
645 650 655
Glu Leu Leu Ile Pro Val Val Gly Ala Phe Leu Leu Glu Ser Tyr Ile
660 665 670
Asp Asn Lys Asn Lys Ile Ile Lys Thr Ile Asp Asn Ala Leu Thr Lys
675 680 685
Arg Asn Glu Lys Trp Ser Asp Met Tyr Gly Leu Ile Val Ala Gln Trp
690 695 700
Leu Ser Thr Val Asn Thr Gln Phe Tyr Thr Ile Lys Glu Gly Met Tyr
705 710 715 720
Lys Ala Leu Asn Tyr Gln Ala Gln Ala Leu Glu Glu Ile Ile Lys Tyr
725 730 735
Arg Tyr Asn Ile Tyr Ser Glu Lys Glu Lys Ser Asn Ile Asn Ile Asp
740 745 750
Phe Asn Asp Ile Asn Ser Lys Leu Asn Glu Gly Ile Asn Gln Ala Ile
755 760 765
Asp Asn Ile Asn Asn Phe Ile Asn Gly Cys Ser Val Ser Tyr Leu Met
770 775 780
Lys Lys Met Ile Pro Leu Ala Val Glu Lys Leu Leu Asp Phe Asp Asn
785 790 795 800
Thr Leu Lys Lys Asn Leu Leu Asn Tyr Ile Asp Glu Asn Lys Leu Tyr
805 810 815
Leu Ile Gly Ser Ala Glu Tyr Glu Lys Ser Lys Val Asn Lys Tyr Leu
820 825 830
Lys Thr Ile Met Pro Phe Asp Leu Ser Ile Tyr Thr Asn Asp Thr Ile
835 840 845
Leu Ile Glu Met Phe Asn Lys Tyr Asn Ser Glu Ile Leu Asn Asn Ile
850 855 860
Ile Leu Asn Leu Arg Tyr Lys Asp Asn Asn Leu Ile Asp Leu Ser Gly
865 870 875 880
Tyr Gly Ala Lys Val Glu Val Tyr Asp Gly Val Glu Leu Asn Asp Lys
885 890 895
Asn Gln Phe Lys Leu Thr Ser Ser Ala Asn Ser Lys Ile Arg Val Thr
900 905 910
Gln Asn Gln Asn Ile Ile Phe Asn Ser Val Phe Leu Asp Phe Ser Val
915 920 925
Ser Phe Trp Ile Arg Ile Pro Lys Tyr Lys Asn Asp Gly Ile Gln Asn
930 935 940
Tyr Ile His Asn Glu Tyr Thr Ile Ile Asn Cys Met Lys Asn Asn Ser
945 950 955 960
Gly Trp Lys Ile Ser Ile Arg Gly Asn Arg Ile Ile Trp Thr Leu Ile
965 970 975
Asp Ile Asn Gly Lys Thr Lys Ser Val Phe Phe Glu Tyr Asn Ile Arg
980 985 990
Glu Asp Ile Ser Glu Tyr Ile Asn Arg Trp Phe Phe Val Thr Ile Thr
995 1000 1005
Asn Asn Leu Asn Asn Ala Lys Ile Tyr Ile Asn Gly Lys Leu Glu
1010 1015 1020
Ser Asn Thr Asp Ile Lys Asp Ile Arg Glu Val Ile Ala Asn Gly
1025 1030 1035
Glu Ile Ile Phe Lys Leu Asp Gly Asp Ile Asp Arg Thr Gln Phe
1040 1045 1050
Ile Trp Met Lys Tyr Phe Ser Ile Phe Asn Thr Glu Leu Ser Gln
1055 1060 1065
Ser Asn Ile Glu Glu Arg Tyr Lys Ile Gln Ser Tyr Ser Glu Tyr
1070 1075 1080
Leu Lys Asp Phe Trp Gly Asn Pro Leu Met Tyr Asn Lys Glu Tyr
1085 1090 1095
Tyr Met Phe Asn Ala Gly Asn Lys Asn Ser Tyr Ile Lys Leu Lys
1100 1105 1110
Lys Asp Ser Pro Val Gly Glu Ile Leu Thr Arg Ser Lys Tyr Asn
1115 1120 1125
Gln Asn Ser Lys Tyr Ile Asn Tyr Arg Asp Leu Tyr Ile Gly Glu
1130 1135 1140
Lys Phe Ile Ile Arg Arg Lys Ser Asn Ser Gln Ser Ile Asn Asp
1145 1150 1155
Asp Ile Val Arg Lys Glu Asp Tyr Ile Tyr Leu Asp Phe Phe Asn
1160 1165 1170
Leu Asn Gln Glu Trp Arg Val Tyr Thr Tyr Lys Tyr Phe Lys Lys
1175 1180 1185
Glu Glu Glu Lys Leu Phe Leu Ala Pro Ile Ser Asp Ser Asp Glu
1190 1195 1200
Phe Tyr Asn Thr Ile Gln Ile Lys Glu Tyr Asp Glu Gln Pro Thr
1205 1210 1215
Tyr Ser Cys Gln Leu Leu Phe Lys Lys Asp Glu Glu Ser Thr Asp
1220 1225 1230
Glu Ile Gly Leu Ile Gly Ile His Arg Phe Tyr Glu Ser Gly Ile
1235 1240 1245
Val Phe Glu Glu Tyr Lys Asp Tyr Phe Cys Ile Ser Lys Trp Tyr
1250 1255 1260
Leu Lys Glu Val Lys Arg Lys Pro Tyr Asn Leu Lys Leu Gly Cys
1265 1270 1275
Asn Trp Gln Phe Ile Pro Lys Asp Glu Gly Trp Thr Glu
1280 1285 1290
<210> 3
<211> 1291
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 3
Met Pro Ile Thr Ile Asn Asn Phe Asn Tyr Ser Asp Pro Val Asp Asn
1 5 10 15
Lys Asn Ile Leu Tyr Leu Asp Thr His Leu Asn Thr Leu Ala Asn Glu
20 25 30
Pro Glu Lys Ala Phe Arg Ile Thr Gly Asn Ile Trp Val Ile Pro Asp
35 40 45
Arg Phe Ser Arg Asn Ser Asn Pro Asn Leu Asn Lys Pro Pro Arg Val
50 55 60
Thr Ser Pro Lys Ser Gly Tyr Tyr Asp Pro Asn Tyr Leu Ser Thr Asp
65 70 75 80
Ser Asp Lys Asp Pro Phe Leu Lys Glu Ile Ile Lys Leu Phe Lys Arg
85 90 95
Ile Asn Ser Arg Glu Ile Gly Glu Glu Leu Ile Tyr Arg Leu Ser Thr
100 105 110
Asp Ile Pro Phe Pro Gly Asn Asn Asn Thr Pro Ile Asn Thr Phe Asp
115 120 125
Phe Asp Val Asp Phe Asn Ser Val Asp Val Lys Thr Arg Gln Gly Asn
130 135 140
Asn Trp Val Lys Thr Gly Ser Ile Asn Pro Ser Val Ile Ile Thr Gly
145 150 155 160
Pro Arg Glu Asn Ile Ile Asp Pro Glu Thr Ser Thr Phe Lys Leu Thr
165 170 175
Asn Asn Thr Phe Ala Ala Gln Glu Gly Phe Gly Ala Leu Ser Ile Ile
180 185 190
Ser Ile Ser Pro Arg Phe Met Leu Thr Tyr Ser Asn Ala Thr Asn Asp
195 200 205
Val Gly Glu Gly Arg Phe Ser Lys Ser Glu Phe Cys Met Asp Pro Ile
210 215 220
Leu Ile Leu Met His Glu Leu Asn His Ala Met His Asn Leu Tyr Gly
225 230 235 240
Ile Ala Ile Pro Asn Asp Gln Thr Ile Ser Ser Val Thr Ser Asn Ile
245 250 255
Phe Tyr Ser Gln Tyr Asn Val Lys Leu Glu Tyr Ala Glu Ile Tyr Ala
260 265 270
Phe Gly Gly Pro Thr Ile Asp Leu Ile Pro Lys Ser Ala Arg Lys Tyr
275 280 285
Phe Glu Glu Lys Ala Leu Asp Tyr Tyr Arg Ser Ile Ala Lys Arg Leu
290 295 300
Asn Ser Ile Thr Thr Ala Asn Pro Ser Ser Phe Asn Lys Tyr Ile Gly
305 310 315 320
Glu Tyr Lys Gln Lys Leu Ile Arg Lys Tyr Arg Phe Val Val Glu Ser
325 330 335
Ser Gly Glu Val Thr Val Asn Arg Asn Lys Phe Val Glu Leu Tyr Asn
340 345 350
Glu Leu Thr Gln Ile Phe Thr Glu Phe Asn Tyr Ala Lys Ile Tyr Asn
355 360 365
Val Gln Asn Arg Lys Ile Tyr Leu Ser Asn Val Tyr Thr Pro Val Thr
370 375 380
Ala Asn Ile Leu Asp Asp Asn Val Tyr Asp Ile Gln Asn Gly Phe Asn
385 390 395 400
Ile Pro Lys Ser Asn Leu Asn Val Leu Phe Met Gly Gln Asn Leu Ser
405 410 415
Arg Asn Pro Ala Leu Arg Lys Val Asn Pro Glu Asn Met Leu Tyr Leu
420 425 430
Phe Thr Lys Phe Cys His Lys Ala Ile Asp Gly Arg Ser Leu Tyr Asn
435 440 445
Lys Thr Leu Asp Cys Arg Glu Leu Leu Val Lys Asn Thr Asp Leu Pro
450 455 460
Phe Ile Gly Asp Ile Ser Asp Val Lys Thr Asp Ile Phe Leu Arg Lys
465 470 475 480
Asp Ile Asn Glu Glu Thr Glu Val Ile Tyr Tyr Pro Asp Asn Val Ser
485 490 495
Val Asp Gln Val Ile Leu Ser Lys Asn Thr Ser Glu His Gly Gln Leu
500 505 510
Asp Leu Leu Tyr Pro Ser Ile Asp Ser Glu Ser Glu Ile Leu Pro Gly
515 520 525
Glu Asn Gln Val Phe Tyr Asp Asn Arg Thr Gln Asn Val Asp Tyr Leu
530 535 540
Asn Ser Tyr Tyr Tyr Leu Glu Ser Gln Lys Leu Ser Asp Asn Val Glu
545 550 555 560
Asp Phe Thr Phe Thr Arg Ser Ile Glu Glu Ala Leu Asp Asn Ser Ala
565 570 575
Lys Val Tyr Thr Tyr Phe Pro Thr Leu Ala Asn Lys Val Asn Ala Gly
580 585 590
Val Gln Gly Gly Leu Phe Leu Met Trp Ala Asn Asp Val Val Glu Asp
595 600 605
Phe Thr Thr Asn Ile Leu Arg Lys Asp Thr Leu Asp Lys Ile Ser Asp
610 615 620
Val Ser Ala Ile Ile Pro Tyr Ile Gly Pro Ala Leu Asn Ile Ser Asn
625 630 635 640
Ser Val Arg Arg Gly Asn Phe Thr Glu Ala Phe Ala Val Thr Gly Val
645 650 655
Thr Ile Leu Leu Glu Ala Phe Pro Glu Phe Thr Ile Pro Ala Leu Gly
660 665 670
Ala Phe Val Ile Tyr Ser Lys Val Gln Glu Arg Asn Glu Ile Ile Lys
675 680 685
Thr Ile Asp Asn Cys Leu Glu Gln Arg Ile Lys Arg Trp Lys Asp Ser
690 695 700
Tyr Glu Trp Met Met Gly Thr Trp Leu Ser Arg Ile Ile Thr Gln Phe
705 710 715 720
Asn Asn Ile Ser Tyr Gln Met Tyr Asp Ser Leu Asn Tyr Gln Ala Gly
725 730 735
Ala Ile Lys Ala Lys Ile Asp Leu Glu Tyr Lys Lys Tyr Ser Gly Ser
740 745 750
Asp Lys Glu Asn Ile Lys Ser Gln Val Glu Asn Leu Lys Asn Ser Leu
755 760 765
Asp Val Lys Ile Ser Glu Ala Met Asn Asn Ile Asn Lys Phe Ile Arg
770 775 780
Glu Cys Ser Val Thr Tyr Leu Phe Lys Asn Met Leu Pro Lys Val Ile
785 790 795 800
Asp Glu Leu Asn Glu Phe Asp Arg Asn Thr Lys Ala Lys Leu Ile Asn
805 810 815
Leu Ile Asp Ser His Asn Ile Ile Leu Val Gly Glu Val Asp Lys Leu
820 825 830
Lys Ala Lys Val Asn Asn Ser Phe Gln Asn Thr Ile Pro Phe Asn Ile
835 840 845
Phe Ser Tyr Thr Asn Asn Ser Leu Leu Lys Asp Ile Ile Asn Glu Tyr
850 855 860
Phe Asn Asn Ile Asn Asp Ser Lys Ile Leu Ser Leu Gln Asn Arg Lys
865 870 875 880
Asn Thr Leu Val Asp Thr Ser Gly Tyr Asn Ala Glu Val Ser Glu Glu
885 890 895
Gly Asp Val Gln Leu Asn Pro Ile Phe Pro Phe Asp Phe Lys Leu Gly
900 905 910
Ser Ser Gly Glu Asp Arg Gly Lys Val Ile Val Thr Gln Asn Glu Asn
915 920 925
Ile Val Tyr Asn Ser Met Tyr Glu Ser Phe Ser Ile Ser Phe Trp Ile
930 935 940
Arg Ile Asn Lys Trp Val Ser Asn Leu Pro Gly Tyr Thr Ile Ile Asp
945 950 955 960
Ser Val Lys Asn Asn Ser Gly Trp Ser Ile Gly Ile Ile Ser Asn Phe
965 970 975
Leu Val Phe Thr Leu Lys Gln Asn Glu Asp Ser Glu Gln Ser Ile Asn
980 985 990
Phe Ser Tyr Asp Ile Ser Asn Asn Ala Pro Gly Tyr Asn Lys Trp Phe
995 1000 1005
Phe Val Thr Val Thr Asn Asn Met Met Gly Asn Met Lys Ile Tyr
1010 1015 1020
Ile Asn Gly Lys Leu Ile Asp Thr Ile Lys Val Lys Glu Leu Thr
1025 1030 1035
Gly Ile Asn Phe Ser Lys Thr Ile Thr Phe Glu Ile Asn Lys Ile
1040 1045 1050
Pro Asp Thr Gly Leu Ile Thr Ser Asp Ser Asp Asn Ile Asn Met
1055 1060 1065
Trp Ile Arg Asp Phe Tyr Ile Phe Ala Lys Glu Leu Asp Gly Lys
1070 1075 1080
Asp Ile Asn Ile Leu Phe Asn Ser Leu Gln Tyr Thr Asn Val Val
1085 1090 1095
Lys Asp Tyr Trp Gly Asn Asp Leu Arg Tyr Asn Lys Glu Tyr Tyr
1100 1105 1110
Met Val Asn Ile Asp Tyr Leu Asn Arg Tyr Met Tyr Ala Asn Ser
1115 1120 1125
Arg Gln Ile Val Phe Asn Thr Arg Arg Asn Asn Asn Asp Phe Asn
1130 1135 1140
Glu Gly Tyr Lys Ile Ile Ile Lys Arg Ile Arg Gly Asn Thr Asn
1145 1150 1155
Asp Thr Arg Val Arg Gly Gly Asp Ile Leu Tyr Phe Asp Met Thr
1160 1165 1170
Ile Asn Asn Lys Ala Tyr Asn Leu Phe Met Lys Asn Glu Thr Met
1175 1180 1185
Tyr Ala Asp Asn His Ser Thr Glu Asp Ile Tyr Ala Ile Gly Leu
1190 1195 1200
Arg Glu Gln Thr Lys Asp Ile Asn Asp Asn Ile Ile Phe Gln Ile
1205 1210 1215
Gln Pro Met Asn Asn Thr Tyr Tyr Tyr Ala Ser Gln Ile Phe Lys
1220 1225 1230
Ser Asn Phe Asn Gly Glu Asn Ile Ser Gly Ile Cys Ser Ile Gly
1235 1240 1245
Thr Tyr Arg Phe Arg Leu Gly Gly Asp Trp Tyr Arg His Asn Tyr
1250 1255 1260
Leu Val Pro Thr Val Lys Gln Gly Asn Tyr Ala Ser Leu Leu Glu
1265 1270 1275
Ser Thr Ser Thr His Trp Gly Phe Val Pro Val Ser Glu
1280 1285 1290
<210> 4
<211> 1276
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 4
Met Thr Trp Pro Val Lys Asp Phe Asn Tyr Ser Asp Pro Val Asn Asp
1 5 10 15
Asn Asp Ile Leu Tyr Leu Arg Ile Pro Gln Asn Lys Leu Ile Thr Thr
20 25 30
Pro Val Lys Ala Phe Met Ile Thr Gln Asn Ile Trp Val Ile Pro Glu
35 40 45
Arg Phe Ser Ser Asp Thr Asn Pro Ser Leu Ser Lys Pro Pro Arg Pro
50 55 60
Thr Ser Lys Tyr Gln Ser Tyr Tyr Asp Pro Ser Tyr Leu Ser Thr Asp
65 70 75 80
Glu Gln Lys Asp Thr Phe Leu Lys Gly Ile Ile Lys Leu Phe Lys Arg
85 90 95
Ile Asn Glu Arg Asp Ile Gly Lys Lys Leu Ile Asn Tyr Leu Val Val
100 105 110
Gly Ser Pro Phe Met Gly Asp Ser Ser Thr Pro Glu Asp Thr Phe Asp
115 120 125
Phe Thr Arg His Thr Thr Asn Ile Ala Val Glu Lys Phe Glu Asn Gly
130 135 140
Ser Trp Lys Val Thr Asn Ile Ile Thr Pro Ser Val Leu Ile Phe Gly
145 150 155 160
Pro Leu Pro Asn Ile Leu Asp Tyr Thr Ala Ser Leu Thr Leu Gln Gly
165 170 175
Gln Gln Ser Asn Pro Ser Phe Glu Gly Phe Gly Thr Leu Ser Ile Leu
180 185 190
Lys Val Ala Pro Glu Phe Leu Leu Thr Phe Ser Asp Val Thr Ser Asn
195 200 205
Gln Ser Ser Ala Val Leu Gly Lys Ser Ile Phe Cys Met Asp Pro Val
210 215 220
Ile Ala Leu Met His Glu Leu Thr His Ser Leu His Gln Leu Tyr Gly
225 230 235 240
Ile Asn Ile Pro Ser Asp Lys Arg Ile Arg Pro Gln Val Ser Glu Gly
245 250 255
Phe Phe Ser Gln Asp Gly Pro Asn Val Gln Phe Glu Glu Leu Tyr Thr
260 265 270
Phe Gly Gly Leu Asp Val Glu Ile Ile Pro Gln Ile Glu Arg Ser Gln
275 280 285
Leu Arg Glu Lys Ala Leu Gly His Tyr Lys Asp Ile Ala Lys Arg Leu
290 295 300
Asn Asn Ile Asn Lys Thr Ile Pro Ser Ser Trp Ile Ser Asn Ile Asp
305 310 315 320
Lys Tyr Lys Lys Ile Phe Ser Glu Lys Tyr Asn Phe Asp Lys Asp Asn
325 330 335
Thr Gly Asn Phe Val Val Asn Ile Asp Lys Phe Asn Ser Leu Tyr Ser
340 345 350
Asp Leu Thr Asn Val Met Ser Glu Val Val Tyr Ser Ser Gln Tyr Asn
355 360 365
Val Lys Asn Arg Thr His Tyr Phe Ser Arg His Tyr Leu Pro Val Phe
370 375 380
Ala Asn Ile Leu Asp Asp Asn Ile Tyr Thr Ile Arg Asp Gly Phe Asn
385 390 395 400
Leu Thr Asn Lys Gly Phe Asn Ile Glu Asn Ser Gly Gln Asn Ile Glu
405 410 415
Arg Asn Pro Ala Leu Gln Lys Leu Ser Ser Glu Ser Val Val Asp Leu
420 425 430
Phe Thr Lys Val Cys Leu Arg Leu Thr Lys Asn Ser Arg Asp Asp Ser
435 440 445
Thr Cys Ile Lys Val Lys Asn Asn Arg Leu Pro Tyr Val Ala Asp Lys
450 455 460
Asp Ser Ile Ser Gln Glu Ile Phe Glu Asn Lys Ile Ile Thr Asp Glu
465 470 475 480
Thr Asn Val Gln Asn Tyr Ser Asp Lys Phe Ser Leu Asp Glu Ser Ile
485 490 495
Leu Asp Gly Gln Val Pro Ile Asn Pro Glu Ile Val Asp Pro Leu Leu
500 505 510
Pro Asn Val Asn Met Glu Pro Leu Asn Leu Pro Gly Glu Glu Ile Val
515 520 525
Phe Tyr Asp Asp Ile Thr Lys Tyr Val Asp Tyr Leu Asn Ser Tyr Tyr
530 535 540
Tyr Leu Glu Ser Gln Lys Leu Ser Asn Asn Val Glu Asn Ile Thr Leu
545 550 555 560
Thr Thr Ser Val Glu Glu Ala Leu Gly Tyr Ser Asn Lys Ile Tyr Thr
565 570 575
Phe Leu Pro Ser Leu Ala Glu Lys Val Asn Lys Gly Val Gln Ala Gly
580 585 590
Leu Phe Leu Asn Trp Ala Asn Glu Val Val Glu Asp Phe Thr Thr Asn
595 600 605
Ile Met Lys Lys Asp Thr Leu Asp Lys Ile Ser Asp Val Ser Val Ile
610 615 620
Ile Pro Tyr Ile Gly Pro Ala Leu Asn Ile Gly Asn Ser Ala Leu Arg
625 630 635 640
Gly Asn Phe Asn Gln Ala Phe Ala Thr Ala Gly Val Ala Phe Leu Leu
645 650 655
Glu Gly Phe Pro Glu Phe Thr Ile Pro Ala Leu Gly Val Phe Thr Phe
660 665 670
Tyr Ser Ser Ile Gln Glu Arg Glu Lys Ile Ile Lys Thr Ile Glu Asn
675 680 685
Cys Leu Glu Gln Arg Val Lys Arg Trp Lys Asp Ser Tyr Gln Trp Met
690 695 700
Val Ser Asn Trp Leu Ser Arg Ile Thr Thr Gln Phe Asn His Ile Asn
705 710 715 720
Tyr Gln Met Tyr Asp Ser Leu Ser Tyr Gln Ala Asp Ala Ile Lys Ala
725 730 735
Lys Ile Asp Leu Glu Tyr Lys Lys Tyr Ser Gly Ser Asp Lys Glu Asn
740 745 750
Ile Lys Ser Gln Val Glu Asn Leu Lys Asn Ser Leu Asp Val Lys Ile
755 760 765
Ser Glu Ala Met Asn Asn Ile Asn Lys Phe Ile Arg Glu Cys Ser Val
770 775 780
Thr Tyr Leu Phe Lys Asn Met Leu Pro Lys Val Ile Asp Glu Leu Asn
785 790 795 800
Lys Phe Asp Leu Arg Thr Lys Thr Glu Leu Ile Asn Leu Ile Asp Ser
805 810 815
His Asn Ile Ile Leu Val Gly Glu Val Asp Arg Leu Lys Ala Lys Val
820 825 830
Asn Glu Ser Phe Glu Asn Thr Met Pro Phe Asn Ile Phe Ser Tyr Thr
835 840 845
Asn Asn Ser Leu Leu Lys Asp Ile Ile Asn Glu Tyr Phe Asn Ser Ile
850 855 860
Asn Asp Ser Lys Ile Leu Ser Leu Gln Asn Lys Lys Asn Ala Leu Val
865 870 875 880
Asp Thr Ser Gly Tyr Asn Ala Glu Val Arg Val Gly Asp Asn Val Gln
885 890 895
Leu Asn Thr Ile Tyr Thr Asn Asp Phe Lys Leu Ser Ser Ser Gly Asp
900 905 910
Lys Ile Ile Val Asn Leu Asn Asn Asn Ile Leu Tyr Ser Ala Ile Tyr
915 920 925
Glu Asn Ser Ser Val Ser Phe Trp Ile Lys Ile Ser Lys Asp Leu Thr
930 935 940
Asn Ser His Asn Glu Tyr Thr Ile Ile Asn Ser Ile Glu Gln Asn Ser
945 950 955 960
Gly Trp Lys Leu Cys Ile Arg Asn Gly Asn Ile Glu Trp Ile Leu Gln
965 970 975
Asp Val Asn Arg Lys Tyr Lys Ser Leu Ile Phe Asp Tyr Ser Glu Ser
980 985 990
Leu Ser His Thr Gly Tyr Thr Asn Lys Trp Phe Phe Val Thr Ile Thr
995 1000 1005
Asn Asn Ile Met Gly Tyr Met Lys Leu Tyr Ile Asn Gly Glu Leu
1010 1015 1020
Lys Gln Ser Gln Lys Ile Glu Asp Leu Asp Glu Val Lys Leu Asp
1025 1030 1035
Lys Thr Ile Val Phe Gly Ile Asp Glu Asn Ile Asp Glu Asn Gln
1040 1045 1050
Met Leu Trp Ile Arg Asp Phe Asn Ile Phe Ser Lys Glu Leu Ser
1055 1060 1065
Asn Glu Asp Ile Asn Ile Val Tyr Glu Gly Gln Ile Leu Arg Asn
1070 1075 1080
Val Ile Lys Asp Tyr Trp Gly Asn Pro Leu Lys Phe Asp Thr Glu
1085 1090 1095
Tyr Tyr Ile Ile Asn Asp Asn Tyr Ile Asp Arg Tyr Ile Ala Pro
1100 1105 1110
Glu Ser Asn Val Leu Val Leu Val Gln Tyr Pro Asp Arg Ser Lys
1115 1120 1125
Leu Tyr Thr Gly Asn Pro Ile Thr Ile Lys Ser Val Ser Asp Lys
1130 1135 1140
Asn Pro Tyr Ser Arg Ile Leu Asn Gly Asp Asn Ile Ile Leu His
1145 1150 1155
Met Leu Tyr Asn Ser Arg Lys Tyr Met Ile Ile Arg Asp Thr Asp
1160 1165 1170
Thr Ile Tyr Ala Thr Gln Gly Gly Glu Cys Ser Gln Asn Cys Val
1175 1180 1185
Tyr Ala Leu Lys Leu Gln Ser Asn Leu Gly Asn Tyr Gly Ile Gly
1190 1195 1200
Ile Phe Ser Ile Lys Asn Ile Val Ser Lys Asn Lys Tyr Cys Ser
1205 1210 1215
Gln Ile Phe Ser Ser Phe Arg Glu Asn Thr Met Leu Leu Ala Asp
1220 1225 1230
Ile Tyr Lys Pro Trp Arg Phe Ser Phe Lys Asn Ala Tyr Thr Pro
1235 1240 1245
Val Ala Val Thr Asn Tyr Glu Thr Lys Leu Leu Ser Thr Ser Ser
1250 1255 1260
Phe Trp Lys Phe Ile Ser Arg Asp Pro Gly Trp Val Glu
1265 1270 1275
<210> 5
<211> 1252
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 5
Met Pro Lys Ile Asn Ser Phe Asn Tyr Asn Asp Pro Val Asn Asp Arg
1 5 10 15
Thr Ile Leu Tyr Ile Lys Pro Gly Gly Cys Gln Glu Phe Tyr Lys Ser
20 25 30
Phe Asn Ile Met Lys Asn Ile Trp Ile Ile Pro Glu Arg Asn Val Ile
35 40 45
Gly Thr Thr Pro Gln Asp Phe His Pro Pro Thr Ser Leu Lys Asn Gly
50 55 60
Asp Ser Ser Tyr Tyr Asp Pro Asn Tyr Leu Gln Ser Asp Glu Glu Lys
65 70 75 80
Asp Arg Phe Leu Lys Ile Val Thr Lys Ile Phe Asn Arg Ile Asn Asn
85 90 95
Asn Leu Ser Gly Gly Ile Leu Leu Glu Glu Leu Ser Lys Ala Asn Pro
100 105 110
Tyr Leu Gly Asn Asp Asn Thr Pro Asp Asn Gln Phe His Ile Gly Asp
115 120 125
Ala Ser Ala Val Glu Ile Lys Phe Ser Asn Gly Ser Gln Asp Ile Leu
130 135 140
Leu Pro Asn Val Ile Ile Met Gly Ala Glu Pro Asp Leu Phe Glu Thr
145 150 155 160
Asn Ser Ser Asn Ile Ser Leu Arg Asn Asn Tyr Met Pro Ser Asn His
165 170 175
Gly Phe Gly Ser Ile Ala Ile Val Thr Phe Ser Pro Glu Tyr Ser Phe
180 185 190
Arg Phe Asn Asp Asn Ser Met Asn Glu Phe Ile Gln Asp Pro Ala Leu
195 200 205
Thr Leu Met His Glu Leu Ile His Ser Leu His Gly Leu Tyr Gly Ala
210 215 220
Lys Gly Ile Thr Thr Lys Tyr Thr Ile Thr Gln Lys Gln Asn Pro Leu
225 230 235 240
Ile Thr Asn Ile Arg Gly Thr Asn Ile Glu Glu Phe Leu Thr Phe Gly
245 250 255
Gly Thr Asp Leu Asn Ile Ile Thr Ser Ala Gln Ser Asn Asp Ile Tyr
260 265 270
Thr Asn Leu Leu Ala Asp Tyr Lys Lys Ile Ala Ser Lys Leu Ser Lys
275 280 285
Val Gln Val Ser Asn Pro Leu Leu Asn Pro Tyr Lys Asp Val Phe Glu
290 295 300
Ala Lys Tyr Gly Leu Asp Lys Asp Ala Ser Gly Ile Tyr Ser Val Asn
305 310 315 320
Ile Asn Lys Phe Asn Asp Ile Phe Lys Lys Leu Tyr Ser Phe Thr Glu
325 330 335
Phe Asp Leu Ala Thr Lys Phe Gln Val Lys Cys Arg Gln Thr Tyr Ile
340 345 350
Gly Gln Tyr Lys Tyr Phe Lys Leu Ser Asn Leu Leu Asn Asp Ser Ile
355 360 365
Tyr Asn Ile Ser Glu Gly Tyr Asn Ile Asn Asn Leu Lys Val Asn Phe
370 375 380
Arg Gly Gln Asn Ala Asn Leu Asn Pro Arg Ile Ile Thr Pro Ile Thr
385 390 395 400
Gly Arg Gly Leu Val Lys Lys Ile Ile Arg Phe Cys Lys Asn Ile Val
405 410 415
Ser Val Lys Gly Ile Arg Lys Ser Ile Cys Ile Glu Ile Asn Asn Gly
420 425 430
Glu Leu Phe Phe Val Ala Ser Glu Asn Ser Tyr Asn Asp Asp Asn Ile
435 440 445
Asn Thr Pro Lys Glu Ile Asp Asp Thr Val Thr Ser Asn Asn Asn Tyr
450 455 460
Glu Asn Asp Leu Asp Gln Val Ile Leu Asn Phe Asn Ser Glu Ser Ala
465 470 475 480
Pro Gly Leu Ser Asp Glu Lys Leu Asn Leu Thr Ile Gln Asn Asp Ala
485 490 495
Tyr Ile Pro Lys Tyr Asp Ser Asn Gly Thr Ser Asp Ile Glu Gln His
500 505 510
Asp Val Asn Glu Leu Asn Val Phe Phe Tyr Leu Asp Ala Gln Lys Val
515 520 525
Pro Glu Gly Glu Asn Asn Val Asn Leu Thr Ser Ser Ile Asp Thr Ala
530 535 540
Leu Leu Glu Gln Pro Lys Ile Tyr Thr Phe Phe Ser Ser Glu Phe Ile
545 550 555 560
Asn Asn Val Asn Lys Pro Val Gln Ala Ala Leu Phe Val Ser Trp Ile
565 570 575
Gln Gln Val Leu Val Asp Phe Thr Thr Glu Ala Asn Gln Lys Ser Thr
580 585 590
Val Asp Lys Ile Ala Asp Ile Ser Ile Val Val Pro Tyr Ile Gly Leu
595 600 605
Ala Leu Asn Ile Gly Asn Glu Ala Gln Lys Gly Asn Phe Lys Asp Ala
610 615 620
Leu Glu Leu Leu Gly Ala Gly Ile Leu Leu Glu Phe Glu Pro Glu Leu
625 630 635 640
Leu Ile Pro Thr Ile Leu Val Phe Thr Ile Lys Ser Phe Leu Gly Ser
645 650 655
Ser Asp Asn Lys Asn Lys Val Ile Lys Ala Ile Asn Asn Ala Leu Lys
660 665 670
Glu Arg Asp Glu Lys Trp Lys Glu Val Tyr Ser Phe Ile Val Ser Asn
675 680 685
Trp Met Thr Lys Ile Asn Thr Gln Phe Asn Lys Arg Lys Glu Gln Met
690 695 700
Tyr Gln Ala Leu Gln Asn Gln Val Asn Ala Ile Lys Thr Ile Ile Glu
705 710 715 720
Ser Lys Tyr Asn Ser Tyr Thr Leu Glu Glu Lys Asn Glu Leu Thr Asn
725 730 735
Lys Tyr Asp Ile Lys Gln Ile Glu Asn Glu Leu Asn Gln Lys Val Ser
740 745 750
Ile Ala Met Asn Asn Ile Asp Arg Phe Leu Thr Glu Ser Ser Ile Ser
755 760 765
Tyr Leu Met Lys Leu Ile Asn Glu Val Lys Ile Asn Lys Leu Arg Glu
770 775 780
Tyr Asp Glu Asn Val Lys Thr Tyr Leu Leu Asn Tyr Ile Ile Gln His
785 790 795 800
Gly Ser Ile Leu Gly Glu Ser Gln Gln Glu Leu Asn Ser Met Val Thr
805 810 815
Asp Thr Leu Asn Asn Ser Ile Pro Phe Lys Leu Ser Ser Tyr Thr Asp
820 825 830
Asp Lys Ile Leu Ile Ser Tyr Phe Asn Lys Phe Phe Lys Arg Ile Lys
835 840 845
Ser Ser Ser Val Leu Asn Met Arg Tyr Lys Asn Asp Lys Tyr Val Asp
850 855 860
Thr Ser Gly Tyr Asp Ser Asn Ile Asn Ile Asn Gly Asp Val Tyr Lys
865 870 875 880
Tyr Pro Thr Asn Lys Asn Gln Phe Gly Ile Tyr Asn Asp Lys Leu Ser
885 890 895
Glu Val Asn Ile Ser Gln Asn Asp Tyr Ile Ile Tyr Asp Asn Lys Tyr
900 905 910
Lys Asn Phe Ser Ile Ser Phe Trp Val Arg Ile Pro Asn Tyr Asp Asn
915 920 925
Lys Ile Val Asn Val Asn Asn Glu Tyr Thr Ile Ile Asn Cys Met Arg
930 935 940
Asp Asn Asn Ser Gly Trp Lys Val Ser Leu Asn His Asn Glu Ile Ile
945 950 955 960
Trp Thr Leu Gln Asp Asn Ala Gly Ile Asn Gln Lys Leu Ala Phe Asn
965 970 975
Tyr Gly Asn Ala Asn Gly Ile Ser Asp Tyr Ile Asn Lys Trp Ile Phe
980 985 990
Val Thr Ile Thr Asn Asp Arg Leu Gly Asp Ser Lys Leu Tyr Ile Asn
995 1000 1005
Gly Asn Leu Ile Asp Gln Lys Ser Ile Leu Asn Leu Gly Asn Ile
1010 1015 1020
His Val Ser Asp Asn Ile Leu Phe Lys Ile Val Asn Cys Ser Tyr
1025 1030 1035
Thr Arg Tyr Ile Gly Ile Arg Tyr Phe Asn Ile Phe Asp Lys Glu
1040 1045 1050
Leu Asp Glu Thr Glu Ile Gln Thr Leu Tyr Ser Asn Glu Pro Asn
1055 1060 1065
Thr Asn Ile Leu Lys Asp Phe Trp Gly Asn Tyr Leu Leu Tyr Asp
1070 1075 1080
Lys Glu Tyr Tyr Leu Leu Asn Val Leu Lys Pro Asn Asn Phe Ile
1085 1090 1095
Asp Arg Arg Lys Asp Ser Thr Leu Ser Ile Asn Asn Ile Arg Ser
1100 1105 1110
Thr Ile Leu Leu Ala Asn Arg Leu Tyr Ser Gly Ile Lys Val Lys
1115 1120 1125
Ile Gln Arg Val Asn Asn Ser Ser Thr Asn Asp Asn Leu Val Arg
1130 1135 1140
Lys Asn Asp Gln Val Tyr Ile Asn Phe Val Ala Ser Lys Thr His
1145 1150 1155
Leu Phe Pro Leu Tyr Ala Asp Thr Ala Thr Thr Asn Lys Glu Lys
1160 1165 1170
Thr Ile Lys Ile Ser Ser Ser Gly Asn Arg Phe Asn Gln Val Val
1175 1180 1185
Val Met Asn Ser Val Gly Asn Asn Cys Thr Met Asn Phe Lys Asn
1190 1195 1200
Asn Asn Gly Asn Asn Ile Gly Leu Leu Gly Phe Lys Ala Asp Thr
1205 1210 1215
Val Val Ala Ser Thr Trp Tyr Tyr Thr His Met Arg Asp His Thr
1220 1225 1230
Asn Ser Asn Gly Cys Phe Trp Asn Phe Ile Ser Glu Glu His Gly
1235 1240 1245
Trp Gln Glu Lys
1250
<210> 6
<211> 1278
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 6
Met Pro Val Val Ile Asn Ser Phe Asn Tyr Asn Asp Pro Val Asn Asp
1 5 10 15
Asp Thr Ile Leu Tyr Met Gln Ile Pro Tyr Glu Glu Lys Ser Lys Lys
20 25 30
Tyr Tyr Lys Ala Phe Glu Ile Met Arg Asn Val Trp Ile Ile Pro Glu
35 40 45
Arg Asn Thr Ile Gly Thr Asp Pro Ser Asp Phe Asp Pro Pro Ala Ser
50 55 60
Leu Glu Asn Gly Ser Ser Ala Tyr Tyr Asp Pro Asn Tyr Leu Thr Thr
65 70 75 80
Asp Ala Glu Lys Asp Arg Tyr Leu Lys Thr Thr Ile Lys Leu Phe Lys
85 90 95
Arg Ile Asn Ser Asn Pro Ala Gly Glu Val Leu Leu Gln Glu Ile Ser
100 105 110
Tyr Ala Lys Pro Tyr Leu Gly Asn Glu His Thr Pro Ile Asn Glu Phe
115 120 125
His Pro Val Thr Arg Thr Thr Ser Val Asn Ile Lys Ser Ser Thr Asn
130 135 140
Val Lys Ser Ser Ile Ile Leu Asn Leu Leu Val Leu Gly Ala Gly Pro
145 150 155 160
Asp Ile Phe Glu Asn Ser Ser Tyr Pro Val Arg Lys Leu Met Asp Ser
165 170 175
Gly Gly Val Tyr Asp Pro Ser Asn Asp Gly Phe Gly Ser Ile Asn Ile
180 185 190
Val Thr Phe Ser Pro Glu Tyr Glu Tyr Thr Phe Asn Asp Ile Ser Gly
195 200 205
Gly Tyr Asn Ser Ser Thr Glu Ser Phe Ile Ala Asp Pro Ala Ile Ser
210 215 220
Leu Ala His Glu Leu Ile His Ala Leu His Gly Leu Tyr Gly Ala Arg
225 230 235 240
Gly Val Thr Tyr Lys Glu Thr Ile Lys Val Lys Gln Ala Pro Leu Met
245 250 255
Ile Ala Glu Lys Pro Ile Arg Leu Glu Glu Phe Leu Thr Phe Gly Gly
260 265 270
Gln Asp Leu Asn Ile Ile Thr Ser Ala Met Lys Glu Lys Ile Tyr Asn
275 280 285
Asn Leu Leu Ala Asn Tyr Glu Lys Ile Ala Thr Arg Leu Ser Arg Val
290 295 300
Asn Ser Ala Pro Pro Glu Tyr Asp Ile Asn Glu Tyr Lys Asp Tyr Phe
305 310 315 320
Gln Trp Lys Tyr Gly Leu Asp Lys Asn Ala Asp Gly Ser Tyr Thr Val
325 330 335
Asn Glu Asn Lys Phe Asn Glu Ile Tyr Lys Lys Leu Tyr Ser Phe Thr
340 345 350
Glu Ile Asp Leu Ala Asn Lys Phe Lys Val Lys Cys Arg Asn Thr Tyr
355 360 365
Phe Ile Lys Tyr Gly Phe Leu Lys Val Pro Asn Leu Leu Asp Asp Asp
370 375 380
Ile Tyr Thr Val Ser Glu Gly Phe Asn Ile Gly Asn Leu Ala Val Asn
385 390 395 400
Asn Arg Gly Gln Asn Ile Lys Leu Asn Pro Lys Ile Ile Asp Ser Ile
405 410 415
Pro Asp Lys Gly Leu Val Glu Lys Ile Val Lys Phe Cys Lys Ser Val
420 425 430
Ile Pro Arg Lys Gly Thr Lys Ala Pro Pro Arg Leu Cys Ile Arg Val
435 440 445
Asn Asn Arg Glu Leu Phe Phe Val Ala Ser Glu Ser Ser Tyr Asn Glu
450 455 460
Asn Asp Ile Asn Thr Pro Lys Glu Ile Asp Asp Thr Thr Asn Leu Asn
465 470 475 480
Asn Asn Tyr Arg Asn Asn Leu Asp Glu Val Ile Leu Asp Tyr Asn Ser
485 490 495
Glu Thr Ile Pro Gln Ile Ser Asn Gln Thr Leu Asn Thr Leu Val Gln
500 505 510
Asp Asp Ser Tyr Val Pro Arg Tyr Asp Ser Asn Gly Thr Ser Glu Ile
515 520 525
Glu Glu His Asn Val Val Asp Leu Asn Val Phe Phe Tyr Leu His Ala
530 535 540
Gln Lys Val Pro Glu Gly Glu Thr Asn Ile Ser Leu Thr Ser Ser Ile
545 550 555 560
Asp Thr Ala Leu Ser Glu Glu Ser Gln Val Tyr Thr Phe Phe Ser Ser
565 570 575
Glu Phe Ile Asn Thr Ile Asn Lys Pro Val His Ala Ala Leu Phe Ile
580 585 590
Ser Trp Ile Asn Gln Val Ile Arg Asp Phe Thr Thr Glu Ala Thr Gln
595 600 605
Lys Ser Thr Phe Asp Lys Ile Ala Asp Ile Ser Leu Val Val Pro Tyr
610 615 620
Val Gly Leu Ala Leu Asn Ile Gly Asn Glu Val Gln Lys Glu Asn Phe
625 630 635 640
Lys Glu Ala Phe Glu Leu Leu Gly Ala Gly Ile Leu Leu Glu Phe Val
645 650 655
Pro Glu Leu Leu Ile Pro Thr Ile Leu Val Phe Thr Ile Lys Ser Phe
660 665 670
Ile Gly Ser Ser Glu Asn Lys Asn Lys Ile Ile Lys Ala Ile Asn Asn
675 680 685
Ser Leu Met Glu Arg Glu Thr Lys Trp Lys Glu Ile Tyr Ser Trp Ile
690 695 700
Val Ser Asn Trp Leu Thr Arg Ile Asn Thr Gln Phe Asn Lys Arg Lys
705 710 715 720
Glu Gln Met Tyr Gln Ala Leu Gln Asn Gln Val Asp Ala Ile Lys Thr
725 730 735
Val Ile Glu Tyr Lys Tyr Asn Asn Tyr Thr Ser Asp Glu Arg Asn Arg
740 745 750
Leu Glu Ser Glu Tyr Asn Ile Asn Asn Ile Arg Glu Glu Leu Asn Lys
755 760 765
Lys Val Ser Leu Ala Met Glu Asn Ile Glu Arg Phe Ile Thr Glu Ser
770 775 780
Ser Ile Phe Tyr Leu Met Lys Leu Ile Asn Glu Ala Lys Val Ser Lys
785 790 795 800
Leu Arg Glu Tyr Asp Glu Gly Val Lys Glu Tyr Leu Leu Asp Tyr Ile
805 810 815
Ser Glu His Arg Ser Ile Leu Gly Asn Ser Val Gln Glu Leu Asn Asp
820 825 830
Leu Val Thr Ser Thr Leu Asn Asn Ser Ile Pro Phe Glu Leu Ser Ser
835 840 845
Tyr Thr Asn Asp Lys Ile Leu Ile Leu Tyr Phe Asn Lys Leu Tyr Lys
850 855 860
Lys Ile Lys Asp Asn Ser Ile Leu Asp Met Arg Tyr Glu Asn Asn Lys
865 870 875 880
Phe Ile Asp Ile Ser Gly Tyr Gly Ser Asn Ile Ser Ile Asn Gly Asp
885 890 895
Val Tyr Ile Tyr Ser Thr Asn Arg Asn Gln Phe Gly Ile Tyr Ser Ser
900 905 910
Lys Pro Ser Glu Val Asn Ile Ala Gln Asn Asn Asp Ile Ile Tyr Asn
915 920 925
Gly Arg Tyr Gln Asn Phe Ser Ile Ser Phe Trp Val Arg Ile Pro Lys
930 935 940
Tyr Phe Asn Lys Val Asn Leu Asn Asn Glu Tyr Thr Ile Ile Asp Cys
945 950 955 960
Ile Arg Asn Asn Asn Ser Gly Trp Lys Ile Ser Leu Asn Tyr Asn Lys
965 970 975
Ile Ile Trp Thr Leu Gln Asp Thr Ala Gly Asn Asn Gln Lys Leu Val
980 985 990
Phe Asn Tyr Thr Gln Met Ile Ser Ile Ser Asp Tyr Ile Asn Lys Trp
995 1000 1005
Ile Phe Val Thr Ile Thr Asn Asn Arg Leu Gly Asn Ser Arg Ile
1010 1015 1020
Tyr Ile Asn Gly Asn Leu Ile Asp Glu Lys Ser Ile Ser Asn Leu
1025 1030 1035
Gly Asp Ile His Val Ser Asp Asn Ile Leu Phe Lys Ile Val Gly
1040 1045 1050
Cys Asn Asp Thr Arg Tyr Val Gly Ile Arg Tyr Phe Lys Val Phe
1055 1060 1065
Asp Thr Glu Leu Gly Lys Thr Glu Ile Glu Thr Leu Tyr Ser Asp
1070 1075 1080
Glu Pro Asp Pro Ser Ile Leu Lys Asp Phe Trp Gly Asn Tyr Leu
1085 1090 1095
Leu Tyr Asn Lys Arg Tyr Tyr Leu Leu Asn Leu Leu Arg Thr Asp
1100 1105 1110
Lys Ser Ile Thr Gln Asn Ser Asn Phe Leu Asn Ile Asn Gln Gln
1115 1120 1125
Arg Gly Val Tyr Gln Lys Pro Asn Ile Phe Ser Asn Thr Arg Leu
1130 1135 1140
Tyr Thr Gly Val Glu Val Ile Ile Arg Lys Asn Gly Ser Thr Asp
1145 1150 1155
Ile Ser Asn Thr Asp Asn Phe Val Arg Lys Asn Asp Leu Ala Tyr
1160 1165 1170
Ile Asn Val Val Asp Arg Asp Val Glu Tyr Arg Leu Tyr Ala Asp
1175 1180 1185
Ile Ser Ile Ala Lys Pro Glu Lys Ile Ile Lys Leu Ile Arg Thr
1190 1195 1200
Ser Asn Ser Asn Asn Ser Leu Gly Gln Ile Ile Val Met Asp Ser
1205 1210 1215
Ile Gly Asn Asn Cys Thr Met Asn Phe Gln Asn Asn Asn Gly Gly
1220 1225 1230
Asn Ile Gly Leu Leu Gly Phe His Ser Asn Asn Leu Val Ala Ser
1235 1240 1245
Ser Trp Tyr Tyr Asn Asn Ile Arg Lys Asn Thr Ser Ser Asn Gly
1250 1255 1260
Cys Phe Trp Ser Phe Ile Ser Lys Glu His Gly Trp Gln Glu Asn
1265 1270 1275
<210> 7
<211> 1297
<212> Белок
<213> Clostridium botulinum
<400> 7
Met Pro Val Asn Ile Lys Asn Phe Asn Tyr Asn Asp Pro Ile Asn Asn
1 5 10 15
Asp Asp Ile Ile Met Met Glu Pro Phe Asn Asp Pro Gly Pro Gly Thr
20 25 30
Tyr Tyr Lys Ala Phe Arg Ile Ile Asp Arg Ile Trp Ile Val Pro Glu
35 40 45
Arg Phe Thr Tyr Gly Phe Gln Pro Asp Gln Phe Asn Ala Ser Thr Gly
50 55 60
Val Phe Ser Lys Asp Val Tyr Glu Tyr Tyr Asp Pro Thr Tyr Leu Lys
65 70 75 80
Thr Asp Ala Glu Lys Asp Lys Phe Leu Lys Thr Met Ile Lys Leu Phe
85 90 95
Asn Arg Ile Asn Ser Lys Pro Ser Gly Gln Arg Leu Leu Asp Met Ile
100 105 110
Val Asp Ala Ile Pro Tyr Leu Gly Asn Ala Ser Thr Pro Pro Asp Lys
115 120 125
Phe Ala Ala Asn Val Ala Asn Val Ser Ile Asn Lys Lys Ile Ile Gln
130 135 140
Pro Gly Ala Glu Asp Gln Ile Lys Gly Leu Met Thr Asn Leu Ile Ile
145 150 155 160
Phe Gly Pro Gly Pro Val Leu Ser Asp Asn Phe Thr Asp Ser Met Ile
165 170 175
Met Asn Gly His Ser Pro Ile Ser Glu Gly Phe Gly Ala Arg Met Met
180 185 190
Ile Arg Phe Cys Pro Ser Cys Leu Asn Val Phe Asn Asn Val Gln Glu
195 200 205
Asn Lys Asp Thr Ser Ile Phe Ser Arg Arg Ala Tyr Phe Ala Asp Pro
210 215 220
Ala Leu Thr Leu Met His Glu Leu Ile His Val Leu His Gly Leu Tyr
225 230 235 240
Gly Ile Lys Ile Ser Asn Leu Pro Ile Thr Pro Asn Thr Lys Glu Phe
245 250 255
Phe Met Gln His Ser Asp Pro Val Gln Ala Glu Glu Leu Tyr Thr Phe
260 265 270
Gly Gly His Asp Pro Ser Val Ile Ser Pro Ser Thr Asp Met Asn Ile
275 280 285
Tyr Asn Lys Ala Leu Gln Asn Phe Gln Asp Ile Ala Asn Arg Leu Asn
290 295 300
Ile Val Ser Ser Ala Gln Gly Ser Gly Ile Asp Ile Ser Leu Tyr Lys
305 310 315 320
Gln Ile Tyr Lys Asn Lys Tyr Asp Phe Val Glu Asp Pro Asn Gly Lys
325 330 335
Tyr Ser Val Asp Lys Asp Lys Phe Asp Lys Leu Tyr Lys Ala Leu Met
340 345 350
Phe Gly Phe Thr Glu Thr Asn Leu Ala Gly Glu Tyr Gly Ile Lys Thr
355 360 365
Arg Tyr Ser Tyr Phe Ser Glu Tyr Leu Pro Pro Ile Lys Thr Glu Lys
370 375 380
Leu Leu Asp Asn Thr Ile Tyr Thr Gln Asn Glu Gly Phe Asn Ile Ala
385 390 395 400
Ser Lys Asn Leu Lys Thr Glu Phe Asn Gly Gln Asn Lys Ala Val Asn
405 410 415
Lys Glu Ala Tyr Glu Glu Ile Ser Leu Glu His Leu Val Ile Tyr Arg
420 425 430
Ile Ala Met Cys Lys Pro Val Met Tyr Lys Asn Thr Gly Lys Ser Glu
435 440 445
Gln Cys Ile Ile Val Asn Asn Glu Asp Leu Phe Phe Ile Ala Asn Lys
450 455 460
Asp Ser Phe Ser Lys Asp Leu Ala Lys Ala Glu Thr Ile Ala Tyr Asn
465 470 475 480
Thr Gln Asn Asn Thr Ile Glu Asn Asn Phe Ser Ile Asp Gln Leu Ile
485 490 495
Leu Asp Asn Asp Leu Ser Ser Gly Ile Asp Leu Pro Asn Glu Asn Thr
500 505 510
Glu Pro Phe Thr Asn Phe Asp Asp Ile Asp Ile Pro Val Tyr Ile Lys
515 520 525
Gln Ser Ala Leu Lys Lys Ile Phe Val Asp Gly Asp Ser Leu Phe Glu
530 535 540
Tyr Leu His Ala Gln Thr Phe Pro Ser Asn Ile Glu Asn Leu Gln Leu
545 550 555 560
Thr Asn Ser Leu Asn Asp Ala Leu Arg Asn Asn Asn Lys Val Tyr Thr
565 570 575
Phe Phe Ser Thr Asn Leu Val Glu Lys Ala Asn Thr Val Val Gly Ala
580 585 590
Ser Leu Phe Val Asn Trp Val Lys Gly Val Ile Asp Asp Phe Thr Ser
595 600 605
Glu Ser Thr Gln Lys Ser Thr Ile Asp Lys Val Ser Asp Val Ser Ile
610 615 620
Ile Ile Pro Tyr Ile Gly Pro Ala Leu Asn Val Gly Asn Glu Thr Ala
625 630 635 640
Lys Glu Asn Phe Lys Asn Ala Phe Glu Ile Gly Gly Ala Ala Ile Leu
645 650 655
Met Glu Phe Ile Pro Glu Leu Ile Val Pro Ile Val Gly Phe Phe Thr
660 665 670
Leu Glu Ser Tyr Val Gly Asn Lys Gly His Ile Ile Met Thr Ile Ser
675 680 685
Asn Ala Leu Lys Lys Arg Asp Gln Lys Trp Thr Asp Met Tyr Gly Leu
690 695 700
Ile Val Ser Gln Trp Leu Ser Thr Val Asn Thr Gln Phe Tyr Thr Ile
705 710 715 720
Lys Glu Arg Met Tyr Asn Ala Leu Asn Asn Gln Ser Gln Ala Ile Glu
725 730 735
Lys Ile Ile Glu Asp Gln Tyr Asn Arg Tyr Ser Glu Glu Asp Lys Met
740 745 750
Asn Ile Asn Ile Asp Phe Asn Asp Ile Asp Phe Lys Leu Asn Gln Ser
755 760 765
Ile Asn Leu Ala Ile Asn Asn Ile Asp Asp Phe Ile Asn Gln Cys Ser
770 775 780
Ile Ser Tyr Leu Met Asn Arg Met Ile Pro Leu Ala Val Lys Lys Leu
785 790 795 800
Lys Asp Phe Asp Asp Asn Leu Lys Arg Asp Leu Leu Glu Tyr Ile Asp
805 810 815
Thr Asn Glu Leu Tyr Leu Leu Asp Glu Val Asn Ile Leu Lys Ser Lys
820 825 830
Val Asn Arg His Leu Lys Asp Ser Ile Pro Phe Asp Leu Ser Leu Tyr
835 840 845
Thr Lys Asp Thr Ile Leu Ile Gln Val Phe Asn Asn Tyr Ile Ser Asn
850 855 860
Ile Ser Ser Asn Ala Ile Leu Ser Leu Ser Tyr Arg Gly Gly Arg Leu
865 870 875 880
Ile Asp Ser Ser Gly Tyr Gly Ala Thr Met Asn Val Gly Ser Asp Val
885 890 895
Ile Phe Asn Asp Ile Gly Asn Gly Gln Phe Lys Leu Asn Asn Ser Glu
900 905 910
Asn Ser Asn Ile Thr Ala His Gln Ser Lys Phe Val Val Tyr Asp Ser
915 920 925
Met Phe Asp Asn Phe Ser Ile Asn Phe Trp Val Arg Thr Pro Lys Tyr
930 935 940
Asn Asn Asn Asp Ile Gln Thr Tyr Leu Gln Asn Glu Tyr Thr Ile Ile
945 950 955 960
Ser Cys Ile Lys Asn Asp Ser Gly Trp Lys Val Ser Ile Lys Gly Asn
965 970 975
Arg Ile Ile Trp Thr Leu Ile Asp Val Asn Ala Lys Ser Lys Ser Ile
980 985 990
Phe Phe Glu Tyr Ser Ile Lys Asp Asn Ile Ser Asp Tyr Ile Asn Lys
995 1000 1005
Trp Phe Ser Ile Thr Ile Thr Asn Asp Arg Leu Gly Asn Ala Asn
1010 1015 1020
Ile Tyr Ile Asn Gly Ser Leu Lys Lys Ser Glu Lys Ile Leu Asn
1025 1030 1035
Leu Asp Arg Ile Asn Ser Ser Asn Asp Ile Asp Phe Lys Leu Ile
1040 1045 1050
Asn Cys Thr Asp Thr Thr Lys Phe Val Trp Ile Lys Asp Phe Asn
1055 1060 1065
Ile Phe Gly Arg Glu Leu Asn Ala Thr Glu Val Ser Ser Leu Tyr
1070 1075 1080
Trp Ile Gln Ser Ser Thr Asn Thr Leu Lys Asp Phe Trp Gly Asn
1085 1090 1095
Pro Leu Arg Tyr Asp Thr Gln Tyr Tyr Leu Phe Asn Gln Gly Met
1100 1105 1110
Gln Asn Ile Tyr Ile Lys Tyr Phe Ser Lys Ala Ser Met Gly Glu
1115 1120 1125
Thr Ala Pro Arg Thr Asn Phe Asn Asn Ala Ala Ile Asn Tyr Gln
1130 1135 1140
Asn Leu Tyr Leu Gly Leu Arg Phe Ile Ile Lys Lys Ala Ser Asn
1145 1150 1155
Ser Arg Asn Ile Asn Asn Asp Asn Ile Val Arg Glu Gly Asp Tyr
1160 1165 1170
Ile Tyr Leu Asn Ile Asp Asn Ile Ser Asp Glu Ser Tyr Arg Val
1175 1180 1185
Tyr Val Leu Val Asn Ser Lys Glu Ile Gln Thr Gln Leu Phe Leu
1190 1195 1200
Ala Pro Ile Asn Asp Asp Pro Thr Phe Tyr Asp Val Leu Gln Ile
1205 1210 1215
Lys Lys Tyr Tyr Glu Lys Thr Thr Tyr Asn Cys Gln Ile Leu Cys
1220 1225 1230
Glu Lys Asp Thr Lys Thr Phe Gly Leu Phe Gly Ile Gly Lys Phe
1235 1240 1245
Val Lys Asp Tyr Gly Tyr Val Trp Asp Thr Tyr Asp Asn Tyr Phe
1250 1255 1260
Cys Ile Ser Gln Trp Tyr Leu Arg Arg Ile Ser Glu Asn Ile Asn
1265 1270 1275
Lys Leu Arg Leu Gly Cys Asn Trp Gln Phe Ile Pro Val Asp Glu
1280 1285 1290
Gly Trp Thr Glu
1295
<210> 8
<211> 1315
<212> Белок
<213> Clostridium tetani
<400> 8
Met Pro Ile Thr Ile Asn Asn Phe Arg Tyr Ser Asp Pro Val Asn Asn
1 5 10 15
Asp Thr Ile Ile Met Met Glu Pro Pro Tyr Cys Lys Gly Leu Asp Ile
20 25 30
Tyr Tyr Lys Ala Phe Lys Ile Thr Asp Arg Ile Trp Ile Val Pro Glu
35 40 45
Arg Tyr Glu Phe Gly Thr Lys Pro Glu Asp Phe Asn Pro Pro Ser Ser
50 55 60
Leu Ile Glu Gly Ala Ser Glu Tyr Tyr Asp Pro Asn Tyr Leu Arg Thr
65 70 75 80
Asp Ser Asp Lys Asp Arg Phe Leu Gln Thr Met Val Lys Leu Phe Asn
85 90 95
Arg Ile Lys Asn Asn Val Ala Gly Glu Ala Leu Leu Asp Lys Ile Ile
100 105 110
Asn Ala Ile Pro Tyr Leu Gly Asn Ser Tyr Ser Leu Leu Asp Lys Phe
115 120 125
Asp Thr Asn Ser Asn Ser Val Ser Phe Asn Leu Leu Glu Gln Asp Pro
130 135 140
Ser Gly Ala Thr Thr Lys Ser Ala Met Leu Thr Asn Leu Ile Ile Phe
145 150 155 160
Gly Pro Gly Pro Val Leu Asn Lys Asn Glu Val Arg Gly Ile Val Leu
165 170 175
Arg Val Asp Asn Lys Asn Tyr Phe Pro Cys Arg Asp Gly Phe Gly Ser
180 185 190
Ile Met Gln Met Ala Phe Cys Pro Glu Tyr Val Pro Thr Phe Asp Asn
195 200 205
Val Ile Glu Asn Ile Thr Ser Leu Thr Ile Gly Lys Ser Lys Tyr Phe
210 215 220
Gln Asp Pro Ala Leu Leu Leu Met His Glu Leu Ile His Val Leu His
225 230 235 240
Gly Leu Tyr Gly Met Gln Val Ser Ser His Glu Ile Ile Pro Ser Lys
245 250 255
Gln Glu Ile Tyr Met Gln His Thr Tyr Pro Ile Ser Ala Glu Glu Leu
260 265 270
Phe Thr Phe Gly Gly Gln Asp Ala Asn Leu Ile Ser Ile Asp Ile Lys
275 280 285
Asn Asp Leu Tyr Glu Lys Thr Leu Asn Asp Tyr Lys Ala Ile Ala Asn
290 295 300
Lys Leu Ser Gln Val Thr Ser Cys Asn Asp Pro Asn Ile Asp Ile Asp
305 310 315 320
Ser Tyr Lys Gln Ile Tyr Gln Gln Lys Tyr Gln Phe Asp Lys Asp Ser
325 330 335
Asn Gly Gln Tyr Ile Val Asn Glu Asp Lys Phe Gln Ile Leu Tyr Asn
340 345 350
Ser Ile Met Tyr Gly Phe Thr Glu Ile Glu Leu Gly Lys Lys Phe Asn
355 360 365
Ile Lys Thr Arg Leu Ser Tyr Phe Ser Met Asn His Asp Pro Val Lys
370 375 380
Ile Pro Asn Leu Leu Asp Asp Thr Ile Tyr Asn Asp Thr Glu Gly Phe
385 390 395 400
Asn Ile Glu Ser Lys Asp Leu Lys Ser Glu Tyr Lys Gly Gln Asn Met
405 410 415
Arg Val Asn Thr Asn Ala Phe Arg Asn Val Asp Gly Ser Gly Leu Val
420 425 430
Ser Lys Leu Ile Gly Leu Cys Lys Lys Ile Ile Pro Pro Thr Asn Ile
435 440 445
Arg Glu Asn Leu Tyr Asn Arg Thr Ala Ser Leu Thr Asp Leu Gly Gly
450 455 460
Glu Leu Cys Ile Lys Ile Lys Asn Glu Asp Leu Thr Phe Ile Ala Glu
465 470 475 480
Lys Asn Ser Phe Ser Glu Glu Pro Phe Gln Asp Glu Ile Val Ser Tyr
485 490 495
Asn Thr Lys Asn Lys Pro Leu Asn Phe Asn Tyr Ser Leu Asp Lys Ile
500 505 510
Ile Val Asp Tyr Asn Leu Gln Ser Lys Ile Thr Leu Pro Asn Asp Arg
515 520 525
Thr Thr Pro Val Thr Lys Gly Ile Pro Tyr Ala Pro Glu Tyr Lys Ser
530 535 540
Asn Ala Ala Ser Thr Ile Glu Ile His Asn Ile Asp Asp Asn Thr Ile
545 550 555 560
Tyr Gln Tyr Leu Tyr Ala Gln Lys Ser Pro Thr Thr Leu Gln Arg Ile
565 570 575
Thr Met Thr Asn Ser Val Asp Asp Ala Leu Ile Asn Ser Thr Lys Ile
580 585 590
Tyr Ser Tyr Phe Pro Ser Val Ile Ser Lys Val Asn Gln Gly Ala Gln
595 600 605
Gly Ile Leu Phe Leu Gln Trp Val Arg Asp Ile Ile Asp Asp Phe Thr
610 615 620
Asn Glu Ser Ser Gln Lys Thr Thr Ile Asp Lys Ile Ser Asp Val Ser
625 630 635 640
Thr Ile Val Pro Tyr Ile Gly Pro Ala Leu Asn Ile Val Lys Gln Gly
645 650 655
Tyr Glu Gly Asn Phe Ile Gly Ala Leu Glu Thr Thr Gly Val Val Leu
660 665 670
Leu Leu Glu Tyr Ile Pro Glu Ile Thr Leu Pro Val Ile Ala Ala Leu
675 680 685
Ser Ile Ala Glu Ser Ser Thr Gln Lys Glu Lys Ile Ile Lys Thr Ile
690 695 700
Asp Asn Phe Leu Glu Lys Arg Tyr Glu Lys Trp Ile Glu Val Tyr Lys
705 710 715 720
Leu Val Lys Ala Lys Trp Leu Gly Thr Val Asn Thr Gln Phe Gln Lys
725 730 735
Arg Ser Tyr Gln Met Tyr Arg Ser Leu Glu Tyr Gln Val Asp Ala Ile
740 745 750
Lys Lys Ile Ile Asp Tyr Glu Tyr Lys Ile Tyr Ser Gly Pro Asp Lys
755 760 765
Glu Gln Ile Ala Asp Glu Ile Asn Asn Leu Lys Asn Lys Leu Glu Glu
770 775 780
Lys Ala Asn Lys Ala Met Ile Asn Ile Asn Ile Phe Met Arg Glu Ser
785 790 795 800
Ser Arg Ser Phe Leu Val Asn Gln Met Ile Asn Glu Ala Lys Lys Gln
805 810 815
Leu Leu Glu Phe Asp Thr Gln Ser Lys Asn Ile Leu Met Gln Tyr Ile
820 825 830
Lys Ala Asn Ser Lys Phe Ile Gly Ile Thr Glu Leu Lys Lys Leu Glu
835 840 845
Ser Lys Ile Asn Lys Val Phe Ser Thr Pro Ile Pro Phe Ser Tyr Ser
850 855 860
Lys Asn Leu Asp Cys Trp Val Asp Asn Glu Glu Asp Ile Asp Val Ile
865 870 875 880
Leu Lys Lys Ser Thr Ile Leu Asn Leu Asp Ile Asn Asn Asp Ile Ile
885 890 895
Ser Asp Ile Ser Gly Phe Asn Ser Ser Val Ile Thr Tyr Pro Asp Ala
900 905 910
Gln Leu Val Pro Gly Ile Asn Gly Lys Ala Ile His Leu Val Asn Asn
915 920 925
Glu Ser Ser Glu Val Ile Val His Lys Ala Met Asp Ile Glu Tyr Asn
930 935 940
Asp Met Phe Asn Asn Phe Thr Val Ser Phe Trp Leu Arg Val Pro Lys
945 950 955 960
Val Ser Ala Ser His Leu Glu Gln Tyr Gly Thr Asn Glu Tyr Ser Ile
965 970 975
Ile Ser Ser Met Lys Lys His Ser Leu Ser Ile Gly Ser Gly Trp Ser
980 985 990
Val Ser Leu Lys Gly Asn Asn Leu Ile Trp Thr Leu Lys Asp Ser Ala
995 1000 1005
Gly Glu Val Arg Gln Ile Thr Phe Arg Asp Leu Pro Asp Lys Phe
1010 1015 1020
Asn Ala Tyr Leu Ala Asn Lys Trp Val Phe Ile Thr Ile Thr Asn
1025 1030 1035
Asp Arg Leu Ser Ser Ala Asn Leu Tyr Ile Asn Gly Val Leu Met
1040 1045 1050
Gly Ser Ala Glu Ile Thr Gly Leu Gly Ala Ile Arg Glu Asp Asn
1055 1060 1065
Asn Ile Thr Leu Lys Leu Asp Arg Cys Asn Asn Asn Asn Gln Tyr
1070 1075 1080
Val Ser Ile Asp Lys Phe Arg Ile Phe Cys Lys Ala Leu Asn Pro
1085 1090 1095
Lys Glu Ile Glu Lys Leu Tyr Thr Ser Tyr Leu Ser Ile Thr Phe
1100 1105 1110
Leu Arg Asp Phe Trp Gly Asn Pro Leu Arg Tyr Asp Thr Glu Tyr
1115 1120 1125
Tyr Leu Ile Pro Val Ala Ser Ser Ser Lys Asp Val Gln Leu Lys
1130 1135 1140
Asn Ile Thr Asp Tyr Met Tyr Leu Thr Asn Ala Pro Ser Tyr Thr
1145 1150 1155
Asn Gly Lys Leu Asn Ile Tyr Tyr Arg Arg Leu Tyr Asn Gly Leu
1160 1165 1170
Lys Phe Ile Ile Lys Arg Tyr Thr Pro Asn Asn Glu Ile Asp Ser
1175 1180 1185
Phe Val Lys Ser Gly Asp Phe Ile Lys Leu Tyr Val Ser Tyr Asn
1190 1195 1200
Asn Asn Glu His Ile Val Gly Tyr Pro Lys Asp Gly Asn Ala Phe
1205 1210 1215
Asn Asn Leu Asp Arg Ile Leu Arg Val Gly Tyr Asn Ala Pro Gly
1220 1225 1230
Ile Pro Leu Tyr Lys Lys Met Glu Ala Val Lys Leu Arg Asp Leu
1235 1240 1245
Lys Thr Tyr Ser Val Gln Leu Lys Leu Tyr Asp Asp Lys Asn Ala
1250 1255 1260
Ser Leu Gly Leu Val Gly Thr His Asn Gly Gln Ile Gly Asn Asp
1265 1270 1275
Pro Asn Arg Asp Ile Leu Ile Ala Ser Asn Trp Tyr Phe Asn His
1280 1285 1290
Leu Lys Asp Lys Ile Leu Gly Cys Asp Trp Tyr Phe Val Pro Thr
1295 1300 1305
Asp Glu Gly Trp Thr Asn Asp
1310 1315
<210> 9
<211> 124
<212> Белок
<213> Vibrio cholerae
<400> 9
Met Ile Lys Leu Lys Phe Gly Val Phe Phe Thr Val Leu Leu Ser Ser
1 5 10 15
Ala Tyr Ala His Gly Thr Pro Gln Asn Ile Thr Asp Leu Cys Ala Glu
20 25 30
Tyr His Asn Thr Gln Ile Tyr Thr Leu Asn Asp Lys Ile Phe Ser Tyr
35 40 45
Thr Glu Ser Leu Ala Gly Lys Arg Glu Met Ala Ile Ile Thr Phe Lys
50 55 60
Asn Gly Ala Ile Phe Gln Val Glu Val Pro Gly Ser Gln His Ile Asp
65 70 75 80
Ser Gln Lys Lys Ala Ile Glu Arg Met Lys Asp Thr Leu Arg Ile Ala
85 90 95
Tyr Leu Thr Glu Ala Lys Val Glu Lys Leu Cys Val Trp Asn Asn Lys
100 105 110
Thr Pro His Ala Ile Ala Ala Ile Ser Met Ala Asn
115 120
<210> 10
<211> 258
<212> Белок
<213> Vibrio cholerae
<400> 10
Met Val Lys Ile Ile Phe Val Phe Phe Ile Phe Leu Ser Ser Phe Ser
1 5 10 15
Tyr Ala Asn Asp Asp Lys Leu Tyr Arg Ala Asp Ser Arg Pro Pro Asp
20 25 30
Glu Ile Lys Gln Ser Gly Gly Leu Met Pro Arg Gly Gln Ser Glu Tyr
35 40 45
Phe Asp Arg Gly Thr Gln Met Asn Ile Asn Leu Tyr Asp His Ala Arg
50 55 60
Gly Thr Gln Thr Gly Phe Val Arg His Asp Asp Gly Tyr Val Ser Thr
65 70 75 80
Ser Ile Ser Leu Arg Ser Ala His Leu Val Gly Gln Thr Ile Leu Ser
85 90 95
Gly His Ser Thr Tyr Tyr Ile Tyr Val Ile Ala Thr Ala Pro Asn Met
100 105 110
Phe Asn Val Asn Asp Val Leu Gly Ala Tyr Ser Pro His Pro Asp Glu
115 120 125
Gln Glu Val Ser Ala Leu Gly Gly Ile Pro Tyr Ser Gln Ile Tyr Gly
130 135 140
Trp Tyr Arg Val His Phe Gly Val Leu Asp Glu Gln Leu His Arg Asn
145 150 155 160
Arg Gly Tyr Arg Asp Arg Tyr Tyr Ser Asn Leu Asp Ile Ala Pro Ala
165 170 175
Ala Asp Gly Tyr Gly Leu Ala Gly Phe Pro Pro Glu His Arg Ala Trp
180 185 190
Arg Glu Glu Pro Trp Ile His His Ala Pro Pro Gly Cys Gly Asn Ala
195 200 205
Pro Arg Ser Ser Met Ser Asn Thr Cys Asp Glu Lys Thr Gln Ser Leu
210 215 220
Gly Val Lys Phe Leu Asp Glu Tyr Gln Ser Lys Val Lys Arg Gln Ile
225 230 235 240
Phe Ser Gly Tyr Gln Ser Asp Ile Asp Thr His Asn Arg Ile Lys Asp
245 250 255
Glu Leu
<210> 11
<211> 1430
<212> Белок
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> BoNT/A1(0)-CtxBCP
<400> 11
Met Gly Ser Met Glu Phe Val Asn Lys Gln Phe Asn Tyr Lys Asp Pro
1 5 10 15
Val Asn Gly Val Asp Ile Ala Tyr Ile Lys Ile Pro Asn Ala Gly Gln
20 25 30
Met Gln Pro Val Lys Ala Phe Lys Ile His Asn Lys Ile Trp Val Ile
35 40 45
Pro Glu Arg Asp Thr Phe Thr Asn Pro Glu Glu Gly Asp Leu Asn Pro
50 55 60
Pro Pro Glu Ala Lys Gln Val Pro Val Ser Tyr Tyr Asp Ser Thr Tyr
65 70 75 80
Leu Ser Thr Asp Asn Glu Lys Asp Asn Tyr Leu Lys Gly Val Thr Lys
85 90 95
Leu Phe Glu Arg Ile Tyr Ser Thr Asp Leu Gly Arg Met Leu Leu Thr
100 105 110
Ser Ile Val Arg Gly Ile Pro Phe Trp Gly Gly Ser Thr Ile Asp Thr
115 120 125
Glu Leu Lys Val Ile Asp Thr Asn Cys Ile Asn Val Ile Gln Pro Asp
130 135 140
Gly Ser Tyr Arg Ser Glu Glu Leu Asn Leu Val Ile Ile Gly Pro Ser
145 150 155 160
Ala Asp Ile Ile Gln Phe Glu Cys Lys Ser Phe Gly His Glu Val Leu
165 170 175
Asn Leu Thr Arg Asn Gly Tyr Gly Ser Thr Gln Tyr Ile Arg Phe Ser
180 185 190
Pro Asp Phe Thr Phe Gly Phe Glu Glu Ser Leu Glu Val Asp Thr Asn
195 200 205
Pro Leu Leu Gly Ala Gly Lys Phe Ala Thr Asp Pro Ala Val Thr Leu
210 215 220
Ala His Gln Leu Ile Tyr Ala Gly His Arg Leu Tyr Gly Ile Ala Ile
225 230 235 240
Asn Pro Asn Arg Val Phe Lys Val Asn Thr Asn Ala Tyr Tyr Glu Met
245 250 255
Ser Gly Leu Glu Val Ser Phe Glu Glu Leu Arg Thr Phe Gly Gly His
260 265 270
Asp Ala Lys Phe Ile Asp Ser Leu Gln Glu Asn Glu Phe Arg Leu Tyr
275 280 285
Tyr Tyr Asn Lys Phe Lys Asp Ile Ala Ser Thr Leu Asn Lys Ala Lys
290 295 300
Ser Ile Val Gly Thr Thr Ala Ser Leu Gln Tyr Met Lys Asn Val Phe
305 310 315 320
Lys Glu Lys Tyr Leu Leu Ser Glu Asp Thr Ser Gly Lys Phe Ser Val
325 330 335
Asp Lys Leu Lys Phe Asp Lys Leu Tyr Lys Met Leu Thr Glu Ile Tyr
340 345 350
Thr Glu Asp Asn Phe Val Lys Phe Phe Lys Val Leu Asn Arg Lys Thr
355 360 365
Tyr Leu Asn Phe Asp Lys Ala Val Phe Lys Ile Asn Ile Val Pro Lys
370 375 380
Val Asn Tyr Thr Ile Tyr Asp Gly Phe Asn Leu Arg Asn Thr Asn Leu
385 390 395 400
Ala Ala Asn Phe Asn Gly Gln Asn Thr Glu Ile Asn Asn Met Asn Phe
405 410 415
Thr Lys Leu Lys Asn Phe Thr Gly Leu Phe Glu Phe Tyr Lys Leu Leu
420 425 430
Cys Val Asp Gly Ile Ile Thr Ser Lys Thr Lys Ser Asp Asp Asp Asp
435 440 445
Lys Thr Pro Gln Asn Ile Thr Asp Leu Cys Ala Glu Tyr His Asn Thr
450 455 460
Gln Ile His Thr Leu Asn Asp Lys Ile Phe Ser Tyr Thr Glu Ser Leu
465 470 475 480
Ala Gly Lys Arg Glu Met Ala Ile Ile Thr Phe Lys Asn Gly Ala Thr
485 490 495
Phe Gln Val Glu Val Pro Gly Ser Gln His Ile Asp Ser Gln Lys Lys
500 505 510
Ala Ile Glu Arg Met Lys Asp Thr Leu Arg Ile Ala Tyr Leu Thr Glu
515 520 525
Ala Lys Val Glu Lys Leu Cys Val Trp Asn Asn Lys Thr Pro His Ala
530 535 540
Ile Ala Ala Ile Ser Met Ala Asn Ser Gly Gly Gly Gly Ser Gly Gly
545 550 555 560
Gly Gly Ser Gly Gly Gly Gly Ser Pro Arg Gly Ser Ala Leu Asn Leu
565 570 575
Gln Cys Ile Lys Val Asn Asn Trp Asp Leu Phe Phe Ser Pro Ser Glu
580 585 590
Asp Asn Phe Thr Asn Asp Leu Asn Lys Gly Glu Glu Ile Thr Ser Asp
595 600 605
Thr Asn Ile Glu Ala Ala Glu Glu Asn Ile Ser Leu Asp Leu Ile Gln
610 615 620
Gln Tyr Tyr Leu Thr Phe Asn Phe Asp Asn Glu Pro Glu Asn Ile Ser
625 630 635 640
Ile Glu Asn Leu Ser Ser Asp Ile Ile Gly Gln Leu Glu Leu Met Pro
645 650 655
Asn Ile Glu Arg Phe Pro Asn Gly Lys Lys Tyr Glu Leu Asp Lys Tyr
660 665 670
Thr Met Phe His Tyr Leu Arg Ala Gln Glu Phe Glu His Gly Lys Ser
675 680 685
Arg Ile Ala Leu Thr Asn Ser Val Asn Glu Ala Leu Leu Asn Pro Ser
690 695 700
Arg Val Tyr Thr Phe Phe Ser Ser Asp Tyr Val Lys Lys Val Asn Lys
705 710 715 720
Ala Thr Glu Ala Ala Met Phe Leu Gly Trp Val Glu Gln Leu Val Tyr
725 730 735
Asp Phe Thr Asp Glu Thr Ser Glu Val Ser Thr Thr Asp Lys Ile Ala
740 745 750
Asp Ile Thr Ile Ile Ile Pro Tyr Ile Gly Pro Ala Leu Asn Ile Gly
755 760 765
Asn Met Leu Tyr Lys Asp Asp Phe Val Gly Ala Leu Ile Phe Ser Gly
770 775 780
Ala Val Ile Leu Leu Glu Phe Ile Pro Glu Ile Ala Ile Pro Val Leu
785 790 795 800
Gly Thr Phe Ala Leu Val Ser Tyr Ile Ala Asn Lys Val Leu Thr Val
805 810 815
Gln Thr Ile Asp Asn Ala Leu Ser Lys Arg Asn Glu Lys Trp Asp Glu
820 825 830
Val Tyr Lys Tyr Ile Val Thr Asn Trp Leu Ala Lys Val Asn Thr Gln
835 840 845
Ile Asp Leu Ile Arg Lys Lys Met Lys Glu Ala Leu Glu Asn Gln Ala
850 855 860
Glu Ala Thr Lys Ala Ile Ile Asn Tyr Gln Tyr Asn Gln Tyr Thr Glu
865 870 875 880
Glu Glu Lys Asn Asn Ile Asn Phe Asn Ile Asp Asp Leu Ser Ser Lys
885 890 895
Leu Asn Glu Ser Ile Asn Lys Ala Met Ile Asn Ile Asn Lys Phe Leu
900 905 910
Asn Gln Cys Ser Val Ser Tyr Leu Met Asn Ser Met Ile Pro Tyr Gly
915 920 925
Val Lys Arg Leu Glu Asp Phe Asp Ala Ser Leu Lys Asp Ala Leu Leu
930 935 940
Lys Tyr Ile Tyr Asp Asn Arg Gly Thr Leu Ile Gly Gln Val Asp Arg
945 950 955 960
Leu Lys Asp Lys Val Asn Asn Thr Leu Ser Thr Asp Ile Pro Phe Gln
965 970 975
Leu Ser Lys Tyr Val Asp Asn Gln Arg Leu Leu Ser Thr Phe Thr Glu
980 985 990
Tyr Ile Lys Asn Ile Ile Asn Thr Ser Ile Leu Asn Leu Arg Tyr Glu
995 1000 1005
Ser Asn His Leu Ile Asp Leu Ser Arg Tyr Ala Ser Lys Ile Asn
1010 1015 1020
Ile Gly Ser Lys Val Asn Phe Asp Pro Ile Asp Lys Asn Gln Ile
1025 1030 1035
Gln Leu Phe Asn Leu Glu Ser Ser Lys Ile Glu Val Ile Leu Lys
1040 1045 1050
Asn Ala Ile Val Tyr Asn Ser Met Tyr Glu Asn Phe Ser Thr Ser
1055 1060 1065
Phe Trp Ile Arg Ile Pro Lys Tyr Phe Asn Ser Ile Ser Leu Asn
1070 1075 1080
Asn Glu Tyr Thr Ile Ile Asn Cys Met Glu Asn Asn Ser Gly Trp
1085 1090 1095
Lys Val Ser Leu Asn Tyr Gly Glu Ile Ile Trp Thr Leu Gln Asp
1100 1105 1110
Thr Gln Glu Ile Lys Gln Arg Val Val Phe Lys Tyr Ser Gln Met
1115 1120 1125
Ile Asn Ile Ser Asp Tyr Ile Asn Arg Trp Ile Phe Val Thr Ile
1130 1135 1140
Thr Asn Asn Arg Leu Asn Asn Ser Lys Ile Tyr Ile Asn Gly Arg
1145 1150 1155
Leu Ile Asp Gln Lys Pro Ile Ser Asn Leu Gly Asn Ile His Ala
1160 1165 1170
Ser Asn Asn Ile Met Phe Lys Leu Asp Gly Cys Arg Asp Thr His
1175 1180 1185
Arg Tyr Ile Trp Ile Lys Tyr Phe Asn Leu Phe Asp Lys Glu Leu
1190 1195 1200
Asn Glu Lys Glu Ile Lys Asp Leu Tyr Asp Asn Gln Ser Asn Ser
1205 1210 1215
Gly Ile Leu Lys Asp Phe Trp Gly Asp Tyr Leu Gln Tyr Asp Lys
1220 1225 1230
Pro Tyr Tyr Met Leu Asn Leu Tyr Asp Pro Asn Lys Tyr Val Asp
1235 1240 1245
Val Asn Asn Val Gly Ile Arg Gly Tyr Met Tyr Leu Lys Gly Pro
1250 1255 1260
Arg Gly Ser Val Met Thr Thr Asn Ile Tyr Leu Asn Ser Ser Leu
1265 1270 1275
Tyr Arg Gly Thr Lys Phe Ile Ile Lys Lys Tyr Ala Ser Gly Asn
1280 1285 1290
Lys Asp Asn Ile Val Arg Asn Asn Asp Arg Val Tyr Ile Asn Val
1295 1300 1305
Val Val Lys Asn Lys Glu Tyr Arg Leu Ala Thr Asn Ala Ser Gln
1310 1315 1320
Ala Gly Val Glu Lys Ile Leu Ser Ala Leu Glu Ile Pro Asp Val
1325 1330 1335
Gly Asn Leu Ser Gln Val Val Val Met Lys Ser Lys Asn Asp Gln
1340 1345 1350
Gly Ile Thr Asn Lys Cys Lys Met Asn Leu Gln Asp Asn Asn Gly
1355 1360 1365
Asn Asp Ile Gly Phe Ile Gly Phe His Gln Phe Asn Asn Ile Ala
1370 1375 1380
Lys Leu Val Ala Ser Asn Trp Tyr Asn Arg Gln Ile Glu Arg Ser
1385 1390 1395
Ser Arg Thr Leu Gly Cys Ser Trp Glu Phe Ile Pro Val Asp Asp
1400 1405 1410
Gly Trp Gly Glu Arg Pro Leu Arg Lys Ser Phe His His His His
1415 1420 1425
His His
1430
<---
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
ГЕНЕТИЧЕСКИ СКОНСТРУИРОВАННЫЕ КЛЕТКИ, ЧУВСТВИТЕЛЬНЫЕ К КЛОСТРИДИАЛЬНЫМ НЕЙРОТОКСИНАМ | 2020 |
|
RU2824389C2 |
НОВЫЕ СПОСОБЫ ПРИМЕНЕНИЯ БОТУЛИНИЧЕСКОГО НЕЙРОТОКСИНА ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ ТРЕМОРА | 2020 |
|
RU2826569C2 |
СКОНСТРУИРОВАННЫЙ БОТУЛИНИЧЕСКИЙ НЕЙРОТОКСИН | 2017 |
|
RU2789302C2 |
СКОНСТРУИРОВАННЫЙ БОТУЛИНИЧЕСКИЙ НЕЙРОТОКСИН | 2016 |
|
RU2746736C2 |
БИОГИБРИД БОТУЛИНИЧЕСКОГО НЕЙРОТОКСИНА | 2019 |
|
RU2816855C2 |
СПОСОБЫ ПРОИЗВОДСТВА ПРОТЕОЛИТИЧЕСКИ ПРОЦЕССИРОВАННЫХ ПОЛИПЕПТИДОВ | 2018 |
|
RU2719164C1 |
СПОСОБЫ ПРОИЗВОДСТВА ПРОТЕОЛИТИЧЕСКИ ПРОЦЕССИРОВАННЫХ ПОЛИПЕПТИДОВ | 2019 |
|
RU2727402C1 |
ТЕРАПЕВТИЧЕСКОЕ И КОСМЕТИЧЕСКОЕ ПРИМЕНЕНИЕ НЕЙРОТОКСИНА БОТУЛИНА СЕРОТИПА E | 2019 |
|
RU2800604C2 |
Однодоменное антитело и его модификации, специфически связывающиеся с ботулиническим нейротоксином типа А, и способ их применения для терапии или экстренной профилактики интоксикации, вызванной ботулиническим нейротоксином типа А. | 2021 |
|
RU2766348C1 |
КОМБИНИРОВАННАЯ КОМПОЗИЦИЯ, СОДЕРЖАЩАЯ СОЕДИНЕНИЕ FGF-18 | 2016 |
|
RU2745453C2 |
Изобретение относится к области биотехнологии и биохимии, конкретно к гибридному полипептиду для связывания с ганглиозидом. Гибридный полипептид содержит легкую цепь нейротоксина клостридий (L), HN-домен нейротоксина клостридий, HCN-домен нейротоксина клостридий, HCC-домен нейротоксина клостридий с аминокислотными последовательностями, идентичными по меньшей мере на 95% последовательностям с аминокислотными остатками, соответственно, 1-448 SEQ ID NO: 1, 449-872 SEQ ID NO: 1, 873-1094 SEQ ID NO: 1, 1095-1296 SEQ ID NO: 1; и селективный, способный связываться с GM1 ганглиозидсвязывающий фрагмент с аминокислотной последовательностью, идентичной на по меньшей мере 95% последовательности с аминокислотными остатками 22-124 SEQ ID NO: 9. Также изобретение относится к нуклеотидной последовательности, кодирующей указанный гибридный полипептид, вектору экспрессии, содержащему указанную последовательность, и клетке для экспрессии указанного гибридного полипептида, содержащей указанный вектор. Изобретение позволяет повысить селективность аффинности связывания ганглиозидов. 4 н. и 7 з.п. ф-лы, 6 ил., 1 табл., 2 пр.
1. Гибридный полипептид для связывания с ганглиозидом, содержащий:
легкую цепь нейротоксина клостридий (L), содержащую аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 1-448 SEQ ID NO: 1;
HN-домен нейротоксина клостридий, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 449-872 SEQ ID NO: 1,
HCN-домен нейротоксина клостридий, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 873-1094 SEQ ID NO: 1;
HCC-домен нейротоксина клостридий, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 1095-1296 SEQ ID NO: 1; и
селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент способен связываться с GM1, и причем селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 22-124 SEQ ID NO: 9.
2. Гибридный полипептид по п. 1, дополнительно содержащий сайт активации.
3. Гибридный полипептид по п. 2, где гибридный полипептид содержит от N-конца к С-концу:
легкую цепь нейротоксина клостридий (L), содержащую аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 1-448 SEQ ID NO: 1;
сайт активации;
селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент, где указанный селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент способен связываться с GM1 и содержит аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 22-124 SEQ ID NO: 9;
HN-домен нейротоксина клостридий, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 449-872 SEQ ID NO: 1;
HCN-домен нейротоксина клостридий, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 873-1094 SEQ ID NO: 1; и
HCC-домен нейротоксина клостридий, содержащий аминокислотную последовательность, имеющую по меньшей мере 95% идентичности последовательности с аминокислотными остатками 1095-1296 SEQ ID NO: 1.
4. Гибридный полипептид по п. 3, дополнительно содержащий линкер между селективным ганглиозидсвязывающим фрагментом и HN-доменом нейротоксина клостридий.
5. Гибридный полипептид по п. 4, где линкер представляет собой линкер GS20.
6. Гибридный полипептид по любому из пп. 2-5, где сайт активации представляет собой сайт активации энтерокиназы.
7. Гибридный полипептид по любому из пп. 1-6, где селективный ганглиозидсвязывающий фрагмент содержит аминокислотные остатки 22-124 SEQ ID NO: 9.
8. Гибридный полипептид по любому из пп. 1-7, где:
легкая цепь нейротоксина клостридий (L) содержит аминокислотные остатки 1-448 SEQ ID NO: 1;
HN-домен нейротоксина клостридий содержит аминокислотные остатки 449-872 SEQ ID NO: 1;
HCN-домен нейротоксина клостридий содержит аминокислотные остатки 873-1094 SEQ ID NO: 1; а также
HCC-домен нейротоксина клостридий содержит аминокислотные остатки 1095-1296 SEQ ID NO: 1.
9. Нуклеотидная последовательность, кодирующая гибридный полипептид по любому из пп. 1-8.
10. Вектор экспрессии, содержащий нуклеотидную последовательность по п. 9.
11. Клетка для экспрессии гибридного полипептида, содержащая вектор экспрессии по п. 10.
CHADDOCK J | |||
A | |||
et al., "Inhibition of vesicular secretion in both neuronal and nonneuronal cells by a retargeted endopeptidase derivative of Clostridium botulinum neurotoxin type A", Infection and immunity, 2000, V | |||
Способ получения смеси хлоргидратов опийных алкалоидов (пантопона) из опийных вытяжек с любым содержанием морфия | 1921 |
|
SU68A1 |
Кипятильник для воды | 1921 |
|
SU5A1 |
DOLLY J | |||
O | |||
et al., "The structure and mode of action of different botulinum toxins", European journal of |
Авторы
Даты
2022-10-26—Публикация
2017-09-28—Подача