ПЕРЕКРЕСТНЫЕ ССЫЛКИ НА РОДСТВЕННЫЕ ЗАЯВКИ
В этой заявке заявлен приоритет предварительной заявки на патент США № 62/556,763, поданной 11 сентября 2017; и предварительной заявки на патент США № 62/711,959, поданной 30 июля 2018. Полное содержание указанных выше заявок включено сюда в качестве ссылки.
ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ
Эта заявка относится к ингибиторам RAD51 и способам их применения, например, для лечения состояний, включая рак, аутоиммунные заболевания, иммунодефициты и нейродегенеративные заболевания.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
RAD51 является эукариотным геном. Белок, кодируемый этим геном, является членом семейства белков RAD51, который помогает в восстановлении двухцепочечных разрывов ДНК. Члены семейства RAD51 гомологичны бактериальным RecA, RadA простейших и дрожжевым RAD51. Белок в значительной степени сохранен в большинстве эукариотов, от дрожжей до человека. У людей RAD51 представляет собой белок из 339 аминокислот, который играет основную роль в гомологичной рекомбинации ДНК во время репарации двухцепочечных разрывов (ДЦР). RAD51 катализирует перенос цепи между нарушенной последовательностью и ее неповрежденным гомологом, что позволяет повторно синтезировать поврежденную область (см. модели гомологичной рекомбинации).
Исследования продемонстрировали сенсибилизацию к некоторым терапиям, повреждающим ДНК, связанным с клеточными дефектами белков, которые способствуют восстановлению HR ДНК. Эта сенсибилизация особенно сильна для поперечно-сшивающих ДНК химиотерапевтических агентов (в 30-100 раз) и ионизирующего излучения (в 3-5 раз) (Godthelp et al., “Mammalian Rad51C contributes to DNA cross-link resistance, sister chromatid cohesion and genomic stability,” Nucleic Acids Res., 30:2172-2182, 2002; Tebbs et al., “Correction of chromosomal instability and sensitivity to diverse mutagens by a cloned cDNA of the XRCC3 DNA repair gene,” Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 92:6354-6358, 1995; Takata et al., “Chromosome instability and defective recombinational repair in knockout mutants of the five Rad51 paralogs,” Mol. Cell Biol., 21:2858-2866, 2001; Liu et al., “XRCC2 and XRCC3, new human Rad51-family members, promote chromosome stability and protect against DNA cross-links and other damages,” Mol. Cell, 1:783-793, 1998).
Несколько групп недавно продемонстрировали, что HR может быть частично ингибирован для повышения чувствительности клеток к терапии, повреждающей ДНК. Ингибирование XRCC3 (белка-паралога RAD51) было продемонстрировано с использованием синтетического пептида, соответствующего другому белку-паралогу. Этот пептид сенсибилизировал клетки яичника китайского хомячка (СНО) к цисплатину и ингибировал образование субъядерных очагов RAD51 в ответ на повреждение ДНК (Connell et al., Cancer Res., 64:3002-3005, 2004). Другие исследователи ингибировали экспрессию самого белка RAD51 (Russell et al., Cancer Res., 63:7377-7383, 2003; Hansen et al., Int. J. Cancer, 105:472-479, 2003; Ohnishi et al., Biochem. Biophys. Res. Commun., 245:319-324, 1998; Ito et al., J. Gene Med., 7(8):1044-1052, 2005; Collins et al., Nucleic Acids Res., 29:1534-1538, 2001) или блокировали его функцию через сверхэкспрессию доминантного отрицательного BRC пептидного фрагмента, полученного из BRCA2 (Chen et al., J. Biol. Chem., 274:32931-32935, 1999). Ввиду связи между повышенной чувствительностью к определенным терапиям, повреждающим ДНК и клеточными дефектами белков, связанных с репарацией HR ДНК, существует необходимость в дополнительных соединениях, которые ингибируют RAD51.
СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ
Заявитель обнаружил новые соединения, которые являются эффективными ингибиторами RAD51 (см. примеры 1-75). Ингибиторы RAD51 в соответствии с данным изобретением ингибируют гомологичную рекомбинацию через изменение нуклеоцитоплазматического распределения RAD51 после вызова повреждения ДНК. Ингибиторы RAD51 в соответствии с данным изобретением снижают восстановление вызванных AID двухцепочечных разрывов ДНК, приводящих к AID-зависимой цитотоксичности в нормальных и злокачественных B-лимфоцитах. Некоторые из этих ингибиторов RAD51 обладают превосходной клеточной проницаемостью, измеренной в клетках Caco-2 (см. пример 76). Среди ингибиторов RAD51 с хорошей клеточной проницаемостью, некоторые имеют превосходную метаболическую стабильность (измеренную в анализе микросом печени, см. пример 77) при введении, включая пероральное введение (см. пример 79).
В данном изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I:
I;
или его фармацевтически приемлемая соль. Определение каждой переменной представлено ниже.
В данном изобретении также представлена фармацевтическая композиция, содержащая соединение, описанное здесь, или его фармацевтически приемлемую соль и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
В данном изобретении также представлен способ лечения рака, аутоиммунного заболевания, иммунодефицита или нейродегенеративного заболевания. Способ включает введение субъекту, нуждающемуся в таковом, эффективного количества соединения, описанного здесь, или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции, описанной здесь.
Также представлено применение соединения, описанного здесь, или его фармацевтически приемлемой соли, или фармацевтической композиции, описанной здесь для получения лекарственного средства для лечения рака, аутоиммунного заболевания, иммунодефицита или нейродегенеративного заболевания.
Также представлено соединение, описанное здесь, или его фармацевтически приемлемая соль или фармацевтическая композиция, описанная здесь для применения для лечения рака, аутоиммунного заболевания, иммунодефицита или нейродегенеративного заболевания.
Хотя заявитель не желает быть связанным каким-либо механизмом, полагают, что соединения в соответствии с данным изобретением ингибируют RAD51 через связывание с MDC1 и снижение способности образовывать активные комплексы RAD51.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ
В первом варианте в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I:
I;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
триазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl;
Cy является -(C3—C7)циклоалкилом, мостиковым (C6—C12) циклоалкилом или 4-12-членным гетероциклическим кольцом, каждое из которых необязательно замещено одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -OH, (C1-C4)алкила и (C1-C4)алкокси;
если X5 соединен с атомом азота Cy, X5 отсутствует;
если X5 соединен с атомом углерода Cy, X5 является NRa или O;
X6 является NRa или O;
R1 является (C1—C5)алкилом;
R3 является (C1—C5)алкил, -CH2-фенилом, -(C3—C7)циклоалкилом, -CH2-(C3—C7)циклоалкилом, -CH2-моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом или моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом, где (C1—C5)алкил, -(C3—C7)циклоалкил, фенил или моноциклическое 3-7-членное гетероциклическое кольцо, представленные R3 или в группе, представленной R3, необязательно замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -OH, (C1-C4)алкила, галометила, галометокси, -CN и (C1-C4)алкокси;
R2 является -NRaC(O)O(C1-C4)алкилом; -NRaC(O)NRa(C1-C4)алкилом; -NRaC(O)O(C2-C4)алкенилом; -NRaC(O)NRa(C2-C4)алкенилом; -NRaC(O)O-(C3-C6)циклоалкилом; -NRaC(O)NRa-(C3-C7)циклоалкилом; -NRaC(O)O-фенилом; -NRaC(O)NRa-фенилом; -NRaC(O)O-моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом; -NRaC(O)NRa-моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом; -NRaC(O)O-моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом; -NRaC(O)NRa-моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом;
где (C1—C4)алкил и (C2-C4)алкенил в группе, представленной R2, каждый необязательно и независимо замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, N3, -ORa, -NRaRa, -(C3—C6)циклоалкила, фенила, моноциклического 3-7-членного гетероциклического кольца и моноциклического 5-6-членного гетероароматического кольца;
где (C3—C7)циклоалкил в группе, представленной R2, необязательно замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -CH3, =O, -ORa и -NRaRa;
где фенил в группе, представленной R2, необязательно замещен одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -CH3, галометила, галометокси, -CN, -ORa и -N3;
где гетероциклическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из =O, галогена, -ORa, -CH3, галометила и галометокси;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -CN, -CH3, галометила, галометокси, -ORa и -NRaRa; и
каждый Ra независимо является -H или -CH3.
Во втором варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой II:
II;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
триазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl;
Cy является циклогексилом или 6-членным моноциклическим гетероциклическим кольцом;
X5 и X6 каждый независимо является NRa или O;
R1 является (C1—C5)алкилом;
R3 является (C1—C5)алкилом или моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом;
R2 является -NRaC(O)O(C1-C4)алкилом; -NRaC(O)NRa(C1-C4)алкилом; -NRaC(O)O(C2-C4)алкенилом; -NRaC(O)NRa(C2-C4)алкенилом; -NRaC(O)-O(C3-C6)циклоалкилом; -NRaC(O)NRa-(C3-C6)циклоалкилом; -NRaC(O)O-фенилом; -NRaC(O)NRa-фенилом; -NRaC(O)O-моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом; -NRaC(O)NRa-моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом; -NRaC(O)O-моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом; -NRaC(O)NRa-моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом;
где (C1—C4)алкил и (C2-C4)алкенил в группе, представленной R2, каждый необязательно и независимо замещен одним или более галогеном, N3, -ORa, -NRaRa, -(C3—C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 3—7-членным гетероциклическим кольцом, или моноциклическим 5—6-членным гетероароматическим кольцом;
где -(C3—C6)циклоалкил в группе, представленной R2, необязательно замещен одним или более галогеном, -CH3, -ORa или -NRaRa;
где фенил в группе, представленной R2, необязательно замещен одним или более галогеном, -CH3, галометилом, галометокси, -ORa, или -N3;
где гетероциклическое кольцо в группе, представленной R2 необязательно замещено одним или более =O, галогеном, -CH3, галометилом или галометокси;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено одним или более галогеном, -CH3, галометилом, галометокси, -ORa или -NRaRa; и
каждый Ra независимо является -H или -CH3.
В третьем варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I или его фармацевтически приемлемая соль, где Cy циклопропила, циклобутила, циклопентила, циклогексила, циклогептила; азетидинила, азепанила, диазаспиро[4,4]нонила, диазаспиро[3.5]нонила, диазепанила, дигидроимидазол, дигидрофуранила, дигидропиранила, дигидропиридинила, дигидропиримидинила, дигидротиенила, дигидротиофенила, дигидротиопиранила, гексагидропиридазинила, гексагидропиримидинила, гидантоинила, индолинила, изоиндолинила, морфолинила, оксиранила, оксетанила, пиперидинила, пиперазинила, пирролидинонила, пирролидинила, тетрагидрофуранила, тетрагидроимидазол, тетрагидроиндолила, тетрагидропиранила, тетрагидротиенила, тетрагидропиридинила, тетрагидропиримидинила, тетрагидротиофенила, тетрагидротиопиранила, тиоморфолинила, тропанила, валеролактамила; бицикло[2.1.1]гексила, бицикло[2.2.1]гептила, бицикло[2.2.2]октила, бицикло[3.2.1]октила, бицикло[4.3.1]децила, бицикло[3.3.1]нонила, борнила, борненила, норборнила, норборненила, 6,6-диметилбицикло[3.1.1]гептила, трициклобутила, адамантила; азанорборнила, хинуклидинила, изохинуклидинила, тропанила, азабицикло[2.2.1]гептанила, 2-азабицикло[3.2.1]октанила, азабицикло[3.2.1]октанила, азабицикло[3.2.2]нонанила, азабицикло[3.3.0]нонанила, азабицикло[3.3.1]нонанила, диазабицикло[2.2.1]гептанила, диазабицикло[3.2.1]октанила, октагидропирроло[3,4-b]пирролила, октагидропирроло[3,4-с]пирролила; и остальные переменные такие, как определены в первом варианте.
В четвертом варианте, в изобретении представлены соединение структурной формулы I или II, или их фармацевтически приемлемая соль, где Cy является циклогексилом, морфолинила, тиоморфолинила, пиперидинила, пиперазинила, гексагидропиридазинила, гексагидропиримидинила, валеролактамила, дигидропиранила, дигидропиридинила, дигидропиримидинила, дигидротиопиранила, тетрагидропиранила, тетрагидропипиридинила, тетрагидропиримидинила или тетрагидротиопиранила; и оставшиеся переменные такие, как определены в первом, втором и/или третьем вариантах.
В четвертом вариант, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой III,
III,
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1—C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом;
где (C1—C4)алкил, представленный R4, необязательно замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, N3, -ORa, -NRaRa, -(C3—C6)циклоалкила, фенила, моноциклического 3-7-членного гетероциклического кольца и моноциклического 5-6-членного гетероароматического кольца,
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 3-7-членное гетероциклическое кольцо, представленное R4, (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 3-7-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -ORa, =O и -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -CH3, галометила, галометокси, -ORa и -N3;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена и -CH3; и оставшиеся переменные такие, как определены в первом, втором, третьем и/или четвертом вариантах.
В шестом варианте в изобретении представлено соединение структурной формулы III, или его фармацевтически приемлемая соль, где X7 является NH или O; R3 является (C1—C5)алкилом; и R4 является (C1—C4)алкилом, где (C1—C4)алкил, представленный R4, необязательно замещен одним или более галогеном, -ORa, -NRaRa, -(C3—C6)циклоалкилом, фенилом (необязательно замещенным одним или более галогеном, -CH3, галометилом, галометокси, ORa или N3), моноциклическим 3—7-членным гетероциклическим кольцом (необязательно замещенным =O, галогеном или -CH3), или моноциклическим 5—6-членным гетероароматическим кольцом (необязательно замещенным галогеном или -CH3); и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом и/или пятом вариантах.
В седьмом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой IV,
IV,
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В восьмом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой V,
V,
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В девятом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой VI:
VI;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В десятом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой VII:
VII;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В одиннадцатом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой VIII:
VIII;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В двенадцатом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой IX:
IX;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В тринадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I, II или III, или его фармацевтически приемлемая соль, где Cy является азетидинилом или пирролидинилом, и атом азота кольца соединен с тиазольным кольцом; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В четырнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I, II или III, или его фармацевтически приемлемая соль, где Cy является 1,7-диазаспиро[4.4]нонилом, 2,7-диазаспиро[4.4]нонилом, 2,7-диазаспиро[3.5]нонилом, 1,4-диазепанилом, 2,5-диазабицикло[2.2.1]гептанилом, 3,8-диазабицикло[3.2.1]октанилом, октагидропирроло[3,4-b]пирролилом или октагидропирроло[3,4-c]пирролилом, и два атома азота кольца соединены с тиазольным кольцом и -X5C(O)X6R3 группой, соответственно; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом и/или шестом вариантах.
В пятнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы III, IV, V, VI, VII, VIII или IX, или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1—C3)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом, где -(C1—C3)алкил необязательно замещен (i) фенилом, необязательно замещенным одним или более галогеном или -CH3; (ii) моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, необязательно замещенным одним или более галогеном или -CH3; или (iii) моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом, необязательно замещенным одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена и -CH3; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом и/или четырнадцатом вариантах.
В шестнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы III, IV, V, VI, VII, VIII или IX, или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1—C3)алкилом, -CHRa-фенилом, -CHRa-5-6-членным гетероароматическим кольцом или -CHRa-3-7-членным моноциклическим гетероциклическим кольцом, где фенил, 5-6-членное гетероароматическое кольцо или 3-7-членное моноциклическое гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена и -CH3; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом и/или четырнадцатом вариантах.
В семнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы III, IV, V, VI, VII, VIII или IX, или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1—C3)алкилом, необязательно замещенным (i) фенилом, необязательно замещенным одним или более галогеном, -CH3, галометилом, галометокси, ORa или N3; (ii) моноциклическим 5—6-членным гетероароматическим кольцом, необязательно замещенным одним или более галогеном или -CH3; или (iii) моноциклическим 3—7-членным гетероциклическим кольцом, необязательно замещенным одним или более =O или -CH3; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом и/или четырнадцатом вариантах.
В восемнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы III, IV, V, VI, VII, VIII или IX, или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1—C3)алкилом, необязательно замещенным (i) фенилом, необязательно замещенным одним или более галогеном, -CH3, галометилом, галометокси, ORa или N3; (ii) моноциклическим 5—6-членным гетероароматическим кольцом, необязательно замещенным одним или более галогеном или -CH3; или (iii) моноциклическим 3—7-членным гетероциклическим кольцом, необязательно замещенным одним или более =O или -CH3; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом, четырнадцатом и/или семнадцатом вариантах.
В девятнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I, III, IV, V, VI, VII, VIII или IX, или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является (C1—C4)алкилом, -(C4—C6)циклоалкилом, -CH2-фенилом, -CH2-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, где фенил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо, представленные R3, или в группе, представленной R3, необязательно замещены одной или более группами, выбранными из группы, состоящей из галогена, -ORa и -CH3; и остальные переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом, четырнадцатом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом и/или восемнадцатом вариантах.
В двадцатом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой X:
X;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом и/или девятнадцатом вариантах.
В двадцать первом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой XI:
XI;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом и/или девятнадцатом вариантах.
В двадцать втором варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой XII:
XII;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом и/или девятнадцатом вариантах.
В двадцать третьем варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой XIII(a) или XIII(b):
XIII(a) или
XIII(b);
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом и/или девятнадцатом вариантах.
В двадцать четвертом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой XIV:
XIV;
или его фармацевтически приемлемая соль; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом и/или девятнадцатом вариантах.
В двадцать пятом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I, II, III, IV, V, VI, VII, VIII, IX, X, XI, XII, XIII(a), XIII(b), XIV, или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является изопропилом, трет-бутилом, циклобутилом, циклопентилом, бензилом, оксетанилом, тетрагидро-2Н-пиранилом или ; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом, четырнадцатом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом, девятнадцатом, двадцатом, двадцать первом, двадцать втором, двадцать третьем и/или двадцать четвертом вариантах. В альтернативном варианте, R3 является изопропилом или оксетанилом. В другом альтернативном варианте, R3 является изопропилом.
В двадцать шестом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I, II, III, IV, V, VI, VII, VIII, IX, X, XI, XII, XIII(a), XIII(b), XIV, или его фармацевтически приемлемая соль, где R1 является трет-бутилом; и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом, четырнадцатом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом, девятнадцатом, двадцатом, двадцать первом, двадцать втором, двадцать третьем, двадцать четвертом и/или двадцать пятом вариантах.
В двадцать седьмом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы III, IV, V, VI, VII, VIII, IX, X, XI, XII, XIII(a), XIII(b), XIV, или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является
и переменные такие, как определены в первом, втором, третьем, четвертом, пятом, шестом, седьмом, восьмом, девятом, десятом, одиннадцатом, двенадцатом, тринадцатом, четырнадцатом, пятнадцатом, шестнадцатом, семнадцатом, восемнадцатом, девятнадцатом, двадцатом, двадцать первом, двадцать втором, двадцать третьем, двадцать четвертом, двадцать пятом и/или двадцать шестом вариантах. В альтернативном варианте, R4 является
. В другом альтернативном варианте, R4 является
. В другом альтернативном варианте, R4 является . В еще одном альтернативном варианте, R4 является . В еще одном альтернативном варианте, R4 является .
В данном изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I’.
В первом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I’:
I’;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
триазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl;
X4 является NRa или O;
X5 и X6 каждый независимо является NRb или O;
R1 является (C1—C5)алкилом;
R3 является (C1—C5)алкилом, -(C3—C7)циклоалкилом или -(CH2)qгетероциклилом (где гетероциклил является моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом, необязательно замещенным одним или более метилом), или бензилом (где бензильное кольцо необязательно замещено одним или более галогеном, метокси, галометокси, метилом, галометилом или циано);
каждый из Ra, Rb и Rc независимо является водородом или метилом;
Rd независимо является галогеном, метокси, галометокси, метилом, галометилом или циано;
m равно 0, 1, 2 или 3;
n равно 0, 1 или 2; и
q равно 0 или 1.
Во втором варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I’-1:
I’-1;
или его фармацевтически приемлемая соль, и переменные такие, как определены в первом варианте.
В третьем варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I’-2:
I’-2;
или его фармацевтически приемлемая соль и переменные такие, как определены в первом варианте.
В четвертом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I’-3:
I’-3;
или его фармацевтически приемлемая соль и переменные такие, как определены в первом варианте.
В пятом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой I’-4:
I’-4;
или его фармацевтически приемлемая соль и переменные такие, как определены в первом варианте.
В шестом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I’, I’-1, I’-2, I’-3 или I’-4, или его фармацевтически приемлемая соль, где X4 является NH и остальные переменные такие, как определены в первом варианте.
В седьмом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I’, I’-1, I’-2, I’-3 или I’-4, или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является (C1—C4)алкилом, -(C4—C6)циклоалкилом, -(CH2)qгетероциклилом (где гетероциклил является моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, необязательно замещенным одним метилом), или бензилом, и остальные переменные такие, как определены в первом и/или шестом вариантах. В одном конкретном варианте, R3 является изопропилом, трет-бутилом, циклобутилом, циклопентилом, оксетанилом, бензилом, тетрагидро-2Н-пиранилом или . В другом конкретном варианте, R3 является изопропилом или оксетанилом.
В восьмом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I’, I’-1, I’-2, I’-3 или I’-4, или его фармацевтически приемлемая соль, где Rd является галогеном и m равно 0 или 1, и остальные переменные такие, как определены в первом, шестом и/или седьмом вариантах. В одном конкретном варианте, является .
В девятом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы I’, I’-1, I’-2, I’-3 или I’-4, или его фармацевтически приемлемая соль, где R1 является трет-бутилом, и остальные переменные такие, как определены в первом, шестом, седьмом и/или восьмом вариантах.
В десятом варианте, в изобретении представлено соединение или его фармацевтически приемлемая соль, где соединение выбирают из группы, состоящей из:
,
и
.
В одиннадцатом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой II’:
II’;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
триазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl;
X4 является NRa или O;
X5 и X6 каждый независимо является NRb или O;
R1 является (C1—C5)алкилом;
R4 является (C1—C4)алкилом, -(C3—C7)циклоалкилом, -(CH(Rc))q-гетероциклилом (где гетероциклил является моноциклическим 3-7-членным гетероциклическим кольцом необязательно замещенным одним или более метилом), -(CH(Rc))q-фенилом (где фенильное кольцо необязательно замещено одним или более галогеном, метокси, галометокси, метилом, галометилом или циано) или -(CH(Rc))q-2-пиридинилом (где 2-пиридинильное кольцо необязательно замещено одним или более галогеном, метокси, галометокси, метилом, галометилом или циано);
каждый из Ra, Rb и Rc независимо является водородом или метилом;
n равно 0, 1 или 2; и
q равно 0 или 1.
В двенадцатом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой II’-1:
II’-1;
или его фармацевтически приемлемая соль, и переменные такие, как определены в одиннадцатом варианте.
В тринадцатом варианте, в изобретении описано соединение, представленное структурной формулой II’-2:
II’-2;
или его фармацевтически приемлемая соль, и переменные такие, как определены в одиннадцатом варианте.
В четырнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы II’, II’-1 или II’-2, или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является изопропилом, оксетанилом, циклобутилом, -CH2-2-пирролидинилом, -CH2-N-метил-2-пирролидинилом, -CH2-3-пиперидинилом, -CH2-2-пиразинилом, -CH2-2-пиримидинилом, -CH(Rc)-фенилом или -CH(Rc)-2-пиридинилом, и где фенильное и 2-пиридинильное кольца каждое независимо является и необязательно замещено одним или более галогеном, и оставшиеся переменные такие, как определены в одиннадцатом варианте. В одном конкретном варианте, R4 является или . В другом конкретном варианте, R4 является .
В пятнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы II’, II’-1 или II’-2, или его фармацевтически приемлемая соль, где X4 является NH и оставшиеся переменные такие, как определены в одиннадцатом и/или двенадцатом вариантах.
В шестнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение структурной формулы II’, II’-1 или II’-2, или его фармацевтически приемлемая соль, где R1 является трет-бутил, и оставшиеся переменные такие, как определены в одиннадцатом, четырнадцатом и пятнадцатом вариантах.
В семнадцатом варианте, в изобретении представлено соединение или его фармацевтически приемлемая соль, где соединение выбирают из группы, состоящей из:
и
.
Также включены соединения, описанные в экспериментальной части, в форме фармацевтически приемлемой соли и в нейтральной форме.
Термин «фармацевтически приемлемая соль» относится к фармацевтической соли, которая, в рамках здравого медицинского суждения, подходит для использования в контакте с тканями людей и низших животных без чрезмерной токсичности, раздражения и аллергической реакции и соразмерна с разумным соотношением польза/риск. Фармацевтически приемлемые соли хорошо известны в данной области. Например, S. M. Berge et al. описывает фармакологически приемлемые соли в J. Pharm. Sci., 1977, 66, 1-19.
В данное изобретение включены фармацевтически приемлемые соли соединений, описанных здесь. Соединения, имеющие основные группы, могут образовывать фармацевтически приемлемые соли с фармацевтически приемлемой кислотой(ами). Подходящие фармацевтически приемлемые кислотно-аддитивные соли соединений, описанных здесь, включают соли неорганических кислот (таких как хлористоводородная кислота, бромистоводородная, фосфорная, метафосфорная, азотная и серная кислоты) и органических кислот (таких как уксусная кислота, бензолсульфоновая, бензойная, этансульфоновая, метансульфоновая, янтарная и трифторуксусная кислоты). Соединения в соответствии с данным изобретением с кислотными группами, такими как карбоновые кислоты, могут образовывать фармацевтически приемлемые соли с фармацевтически приемлемым основанием(ями). Подходящие фармацевтически приемлемые основные соли включают соли аммония, соли щелочных металлов (такие как соли натрия и калия) и соли щелочноземельных металлов (такие как соли магния и кальция).
Определения
Используемый здесь термин «галоген» означает галоген и включает фтор, хлор, бром и йод.
Термин «алкил», используемый отдельно или как часть более крупной группы, такой как «алкокси» или «галоалкил» и подобные, означает насыщенный алифатический прямой или разветвленный одновалентный углеводородный радикал. Если не указано иное, алкильная группа обычно имеет 1-5 атомов углерода, т.е. (C1-C5)алкил. Применяемая здесь, “(C1-C5)алкильная” группа означает радикал, имеющий 1-5 атомов углерода в прямой или разветвленной структуре. Примеры включают метил, этил, n-пропил, изо-пропил и подобные.
Термин “алкокси” означает алкильный радикал, присоединенный через связывающий атом кислорода, представленный как -O-алкил. Например, “(C1-C4)алкокси” включает метокси, этокси, пропокси и бутокси.
Термины «галоалкил» и «галоалкокси» означают алкил или алкокси, в зависимости от обстоятельств, замещенные одним или более атомами галогена.
«Алкиленовая группа» представляет собой насыщенный алифатический разветвленный или неразветвленный двухвалентный углеводородный радикал. Если не указано иное, алкиленовая группа обычно имеет 2-6 атомов углерода, например (C2-C6)алкилен.
Термин «алкенил» означает разветвленный или прямой одновалентный углеводородный радикал, содержащий, по крайней мере, одну двойную связь. Алкенил может быть моно- или полиненасыщенным и может существовать в конфигурации E или Z. Если не указано иное, алкенильная группа обычно имеет 2-6 атомов углерода, т.е., (C2-C6)алкенил. Например, “(C2-C4)алкенил” означает радикал, имеющий 2-4 атома углерода в прямой или разветвленной конфигурации.
Термин “циклоалкил” означает моноциклическую насыщенную углеводородную кольцевую систему. Например, C3-C6 циклоалкил включает циклопропил, циклобутил, циклопентил и циклогексил. Если не описано иное, “циклоалкил” имеет от трех до семи атомов углерода в кольце.
Мостиковый циклоалкил означает бициклическую неароматическую углеводородную кольцевую систему, в которой два кольца имеют, по крайней мере, три соседних атомов углерода в кольце. Мостиковый циклоалкил обычно имеет 6-12 атомов углерода в кольце. Примеры включают, но не ограничиваются ими, бицикло[2.1.1]гексил, бицикло[2.2.1]гептил, бицикло[2.2.2]октил, бицикло[3.2.1]октил, бицикло[4.3.1]децил, бицикло[3.3.1]нонил, борнил, борненил, норборнил, норборненил, 6,6-диметилбицикло[3.1.1]гептил, трициклобутил и адамантил.
Термины «гетероциклил», «гетероциклическое кольцо» и «гетероциклическая группа» используются здесь взаимозаменяемо и означают насыщенный или ненасыщенный неароматический 4-10-членный кольцевой радикал, содержащий от 1 до 4 кольцевых гетероатомов, которые могут быть одинаковыми или разными, выбранных из N, O или S. Он может быть моноциклическим, бициклическим или трициклическим (например, слитым или мостиковым бициклическим или трициклическим кольцом). Примеры включают, но не ограничены ими, азетидинил, морфолинил, тиоморфолинил, пирролидинонил, пирролидинил, пиперидинил, пиперазинил, гидантоинил, валеролактамил, оксиранил, оксетанил, дигидроимидазол, дигидрофуранил, дигидропиранил, дигидропиридинил, дигидропиримидинил, дигидротиенил, дигидротиофенил, дигидротиопиранил, тетрагидроимидазол, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, тетрагидротиенил, тетрагидропиридинил, тетрагидропиримидинил, тетрагидротиофенил и тетрагидротиопиранил. Гетероциклическое кольцо необязательно содержит одну или несколько двойных связей и/или необязательно конденсировано с одним или несколькими ароматическими кольцами (например, тетрагидронафтиридин, индолинон, дигидропирролотриазол, имидазопиримидин, хинолинон, диоксаспиродекан).
Примеры 3-7 членного моноциклического гетероциклического кольца, включают, но не ограничены ими, азетидинил, морфолинил, тиоморфолинил, пирролидинонил, пирролидинил, пиперидинил, пиперазинил, гидантоинил, валеролактамил, оксиранил, оксетанил, дигидроимидазол, дигидрофуранил, дигидропиранил, дигидропиридинил, дигидропириимидинил, дигидротиенил, дигидротиофенил, дигидротиопиранил, тетрагидроимидазол, тетрагидрофуранил, тетрагидропиранил, тетрагидротиенил, тетрагидропиридинил, тетрагидропиримидинил, тетрагидротиофенил и тетрагидротиопиранил.
Мостиковый гетероциклил означает бициклическую неароматическую кольцевую систему, содержащую от 1 до 4 кольцевых гетероатомов, в которых два кольца имеют, по крайней мере, три соседних кольцевых атома. Мостиковый гетероциклил обычно имеет 6-12 атомов в кольце. Примеры включают, но не ограничены ими, азанорборнил, хинуклидинил, изохинуклидинил, тропанил, азабицикло[3.2.1]октанил, азабицикло[2.2.1]гептанил, 2-азабицикло[3.2.1]октанил, азабицикло[3.2.1]октанил, азабицикло[3.2.2]нонанил, азабицикло[3.3.0]нонанил и азабицикло [3.3.1]нонанил.
Термины «гетероарил», «гетероароматический», «гетероарильное кольцо», «гетероарильная группа», «гетероароматическое кольцо» и «гетероароматическая группа» используются здесь взаимозаменяемо. «Гетероарил», когда он используется отдельно или как часть большей группы, как в «гетероаралкил» или «гетероарилалкокси», относится к ароматическим кольцевым группам, имеющим от пяти до десяти кольцевых атомов, выбранных из углерода, и, по крайней мере, одного (обычно от 1 до 4, более типично 1 или 2) гетероатома (например, кислорода, азота или серы). «Гетероарил» включает моноциклические кольца и полициклические кольца, в которых моноциклическое гетероароматическое кольцо конденсировано с одним или несколькими другими ароматическими или гетероароматическими кольцами. «Гетероарил» включает моноциклические и бициклические кольцевые системы.
“Моноциклическое 5—6-членное гетероароматическое кольцо (или гетероарил)” означает моноциклическое гетероароматическое кольцо, имеющее пять или шесть кольцевых атомов, выбранных из углерода и, по крайней мере, одного (обычно от 1 до 3, более типично 1 или 2) гетероатома (например, кислорода, азота или серы). Примеры моноциклической 5-6-членной гетероароматической кольцевой группы включают фуранил (например,, 2-фуранил, 3-фуранил), имидазолил (например, N-имидазолил, 2-имидазолил, 4-имидазолил, 5-имидазолил), изоксазолил (например, 3-изоксазолил, 4-изоксазолил, 5-изоксазолил), оксадиазолил (например, 2-оксадиазолил, 5-оксадиазолил), оксазолил (например, 2-оксазолил, 4-оксазолил, 5-оксазолил), пиразолил (например, 3-пиразолил, 4-пиразолил), пирролил (например, 1-пирролил, 2-пирролил, 3-пирролил), пиридил (например, 2-пиридил, 3-пиридил, 4-пиридил), пиримидинил (например, 2-пиримидинил, 4-пиримидинил, 5-пиримидинил), пиридазинил (например, 3-пиридазинил), тиазолил (например, 2-тиазолил, 4-тиазолил, 5-тиазолил), изотиазолил, триазолил (например, 2-триазолил, 5-триазолил), тетразолил (например, тетразолил) и тиенил (например, 2-тиенил, 3-тиенил).
Если группа описана как «замещенная», неводородный заместитель замещает водород на атоме углерода или азота заместителя. Таким образом, например, замещенным алкилом является алкил, где, по крайней мере, один неводородный заместитель находится вместо водородного заместителя на алкильном заместителе. Для иллюстрации, монофторалкилом является алкил, замещенный фторным заместителем, и дифторалкилом является алкил, замещенный двумя фторными заместителями. Следует признать, что если в заместителе имеется более одного замещения, каждый неводородный заместитель может быть одинаковым или разным (если не указано иное). Как здесь используется, многие группы (например, алкил, циклоалкил или гетероциклическое кольцо) называются либо «замещенными», либо «необязательно замещенными». Когда группа модифицирована одним из этих терминов, если не указано иное, это означает, что любая часть группы, которая известна специалисту в данной области как доступная для замещения, может быть замещена, что включает один или более заместителей. Если присутствует более одного заместителя, то каждый заместитель выбирают независимо. Такие средства замещения хорошо известны в данной области техники и/или описаны в настоящем описании. Необязательные заместители могут быть любыми заместителями, подходящими для присоединения к группе. Специалист в данной области поймет, что приведенные соединения и определения не включают недопустимые схемы замещения (например, метил, замещенный 5 различными группами, и подобные). Такие недопустимые схемы замещения четко распознаются специалистом в данной области. Когда группа описывается как необязательно замещенная «одним или более» заместителями, это означает, что группа необязательно замещена одним, двумя, тремя, четырьмя, пятью или шестью заместителями. В одном варианте, группа необязательно замещена 1-3 заместителями. В одном варианте, группа необязательно замещена 1-2 заместителями. В одном варианте, группа необязательно замещена одним заместителем.
Подходящими заместителями являются такие, которые не оказывают значительного вредного влияния на способность соединения ингибировать RAD51. Когда подходящие заместители конкретно не перечислены, типовые заместители включают, но не ограничены ими, галоген, -CN, алкил, алкокси, галометил, галометокси, (C1-C5)алкил, гало(C1-C5)алкил, (C1-C5)алкокси, -NO2, -ORc’, -NRa’Rb’, -S(O)iRa’, -NRaS(O)iRb’, -S(O)iNRa’Rb’, -C(=O)ORa’, -OC(=O)ORa’, -C(=S)ORa’, -O(C=S)Ra’, -C(=O)NRa’Rb’, -NRa’C(=O)Rb’, -C(=S)NRa’Rb’, -NRa’C(=S)Rb’, -NRa’(C=O)ORb’, -O(C=O)NRa’Rb’, -NRa’(C=S)ORb’, -O(C=S)NRa’Rb’, -NRa’(C=O)NRa’Rb’, -NRa’(C=S)NRa’Rb’, -C(=S)Ra’, -C(=O)Ra’, (C3-C6)циклоалкил, моноциклический гетероарил и фенил, где (C3-C6)циклоалкильный, моноциклический гетероарильный и фенильный заместители необязательно и независимо замещены-CH3, галометилом, галогеном, метокси или галометокси. Каждый Ra’ и каждый Rb’ независимо выбирают из -H и (C1—C5)алкила, где (C1—C5)алкильная группа, представленная Ra’ или Rb’, необязательно замещена гидроксилом или (C1—C3)алкокси; Rc’ является -H, гало(C1—C5)алкилом или (C1—C5)алкилом, где (C1—C5)алкильная группа, представленная Rc, необязательно замещена гидроксилом или (C1—C3)алкокси; и i равно 0, 1 или 2. =O также является подходящим заместителем для алкила, циклоалкила и гетероциклического кольца.
Соединения, имеющие один или несколько хиральных центров, могут существовать в различных стереоизомерных формах. Стереоизомерами являются соединения, которые отличаются только пространственным расположением. Стереоизомеры включают все диастереомерные, энантиомерные и эпимерные формы, а также рацематы и их смеси.
Термин «геометрический изомер» относится к циклическим соединениям, имеющим, по крайней мере, два заместителя, где два заместителя находятся на одной и той же стороне кольца (цис) или где заместители находятся на противоположных сторонах кольца (транс). Когда описанное соединение названо или изображено структурой без указания стереохимии, подразумевается, что название или структура охватывает один или более возможных стереоизомеров, или геометрических изомеров, или смесь охватываемых стереоизомеров или геометрических изомеров.
Когда геометрический изомер изображен по имени или структуре, следует понимать, что названный или изображенный изомер существует в большей степени, чем другой изомер, то есть геометрическая изомерная чистота названного или изображенного геометрического изомера больше, чем 50%, например, по крайней мере, 60%, 70%, 80%, 90%, 99% или 99,9% массовых. Геометрическая изомерная чистота определяется путем деления веса названного или изображенного геометрического изомера в смеси на общую массу всех геометрических изомеров в смеси.
Рацемическая смесь означает 50% одного энантиомера и 50% соответствующего энантиомера. Когда соединение с одним хиральным центром названо или изображено без указания стереохимии хирального центра, подразумевается, что название или структура охватывает обе возможные энантиомерные формы (например, обе энантиомерно чистые, энантиомерно обогащенные или рацемические) соединения. Когда соединение с двумя или более хиральными центрами названо или изображено без указания стереохимии хиральных центров, подразумевается, что название или структура охватывает все возможные диастереомерные формы (например, диастереомерно чистые, диастереомерно обогащенные и эквимолярные смеси одного или нескольких диастереомеров (например, рацемические смеси)) соединения.
Энантиомерные и диастереомерные смеси могут быть разделены на составляющие их энантиомеры или стереоизомеры хорошо известными методами, такими как газовая хроматография с хиральной фазой, высокоэффективная жидкостная хроматография с хиральной фазой, кристаллизация соединения в виде комплекса хиральной соли или кристаллизация соединения в хиральном растворителе. Энантиомеры и диастереомеры также могут быть получены из диастереомерно или энантиомерно чистых промежуточных соединений, реагентов и катализаторов хорошо известными способами асимметрического синтеза.
Когда соединение обозначается названием или структурой, которая указывает на один энантиомер, если не указано иное, соединение является, по крайней мере, на 60%, 70%, 80%, 90%, 99% или 99,9% оптически чистым (также обозначается как «энантиомерно чистое»). Оптическая чистота представляет собой массу в смеси названного или изображенного энантиомера, деленную на общую массу в смеси обоих энантиомеров.
Когда стереохимия раскрытого соединения названа или изображена структурой, а названная или изображенная структура охватывает более одного стереоизомера (например, как в диастереомерной паре), следует понимать, что включен один из охватываемых стереоизомеров или любая смесь охватываемых стереоизомеров. Также следует понимать, что стереоизомерная чистота названных или изображенных стереоизомеров составляет, по крайней мере, 60%, 70%, 80%, 90%, 99% или 99,9% массовых. Стереоизомерная чистота в этом случае определяется делением общей массы в смеси стереоизомеров, охватываемых названием или структурой, на общую массу в смеси всех стереоизомеров.
Фармацевтические композиции
Описанные здесь соединения являются ингибиторами RAD51. Фармацевтическая композиция в соответствии с данным изобретением содержит один или более ингибиторов RAD51 или его фармацевтически приемлемую соль, и фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель.
«Фармацевтически приемлемый носитель» и «фармацевтически приемлемый разбавитель» относятся к веществу, которое способствует составлению и/или введению активного агента и/или его абсорбции субъектом, и может быть включено в композиции в соответствии с данным изобретением, не вызывая значительного неблагоприятного токсикологического воздействия на субъект. Не ограничивающие примеры фармацевтически приемлемых носителей и/или разбавителей включают воду, NaCl, нормальные физиологические растворы, лактированный раствор Рингера, нормальную сахарозу, нормальную глюкозу, связующие вещества, наполнители, разрыхлители, смазывающие вещества, покрытия, подсластители, ароматизаторы, солевые растворы (такие как раствор Рингера), спирты, масла, желатины, углеводы, такие как лактоза, амилоза или крахмал, эфиры жирных кислот, гидроксиметилцеллюлозу, поливинилпирролидин и красители, и подобные. Такие препараты могут быть стерилизованы и, при желании, смешаны со вспомогательными агентами, такими как смазывающие вещества, консерванты, стабилизаторы, смачивающие агенты, эмульгаторы, соли для воздействия на осмотическое давление, буферы, красители и/или ароматические вещества и подобные, которые не взаимодействуют негативно с или не вмешиваются в активность соединений, представленных здесь. Специалист в данной области поймет, что другие фармацевтические эксципиенты подходят для использования с описанными соединениями.
Фармацевтические композиции в соответствии с данным изобретением необязательно включают один или несколько фармацевтически приемлемых носителей и/или разбавителей, таких как лактоза, крахмал, целлюлоза и декстроза. Другие эксципиенты, такие как ароматизаторы; подсластители; и консерванты, такие как метил-, этил-, пропил- и бутил-парабены, также могут быть включены. Более полные перечни подходящих эксципиентов можно найти в Handbook of Pharmaceutical Excipients (5th Ed., Pharmaceutical Press (2005)). Специалист в данной области техники должен знать, как приготовить составы, подходящие для различных способов введения. Обычные методы и ингредиенты для выбора и приготовления подходящих составов описаны, например, в Remington’s Pharmaceutical Sciences (2003-20th edition) и в The United States Pharmacopeia: The National Formulary (USP 24 NF19), опубликованной в 1999. Носители, разбавители и/или эксципиенты являются «приемлемыми» с точки зрения совместимости с другими ингредиентами фармацевтической композиции и не являются вредными для реципиента.
Способы лечения
Данное изобретение относится к способу лечения субъекта с заболеванием, которое можно облегчить ингибированием RAD51, через введение субъекту эффективного количества одного или нескольких описанных соединений или их фармацевтически приемлемой соли или соответствующей фармацевтической композиции. Заболевания, которые могут быть облегчены ингибированием RAD51, включают рак, аутоиммунное заболевание, иммунодефицит или нейродегенеративное заболевание.
В одном аспекте, описан способ лечения рака, аутоиммунного заболевания, иммунодефицита или нейродегенеративного заболевания, где способ включает введение терапевтически эффективной дозы композиции, описанной здесь, например, композиции, содержащей соединение в соответствии с данным изобретением, субъекту, нуждающемуся в лечении рака, аутоиммунного заболевания, иммунодефицита или нейродегенеративного заболевания.
В некоторых вариантах, субъектом может быть субъект, у которого определено наличие повышенного уровня повреждения ДНК, возникающего в одном или нескольких типах клеток, относительно ссылочного уровня. Используемый здесь термин «повреждение ДНК» относится к разрывам, порезами и мутациям ДНК, присутствующим в клетке. В некоторых вариантах, повреждение ДНК может включать один или несколько одноцепочечных разрывов (например, "ников"), двухцепочечных разрывов (ДЦР) и мутаций. В некоторых вариантах, повреждением ДНК может быть один или несколько ДЦР. Используемый здесь термин «мутация» относится к изменению или разнице в генетическом материале клетки по сравнению со ссылочной клеткой дикого типа, например, делеции, вставке, ОНП, перегруппировке генов и/или введению экзогенного гена или последовательности.
В некоторых вариантах, субъект может быть определен, как имеющий повышенный уровень повреждения ДНК, если определено, что субъект имеет повышенный уровень и/или активности процесса повреждения ДНК или фермента редактирования ДНК. Используемый здесь термин «процесс повреждения ДНК» относится к любой активности или процессу в клетке, которые вызывают один или несколько типов повреждения ДНК.
В некоторых вариантах, повышенным уровнем повреждения ДНК является повышенный уровень мутаций, например, определением общего статуса мутации во всем или части генома клетки. Общий статус мутации, по крайней мере, на 2% больше, например, на 2% больше или более, на 3% больше или более, на 5% больше или более, на 10% больше или более или на 20% больше или более, чем общий статус мутации в ссылочной клетке, может указывать на увеличенный, повышенный и/или значительный уровень активности фермента редактирования ДНК. В некоторых вариантах, может быть определен уровень гипермутаций. В некоторых вариантах, общий статус мутации во всем геноме или его части может быть определен с использованием FISH, секвенирования всего генома, секвенирования с высокой пропускной способностью, секвенирования экзома, гибридизации и/или ПЦР. В некоторых вариантах, активность фермента, редактирующего ДНК, можно измерять определением уровня гипермутации в специфических генах-мишенях, включая, но не ограничиваясь ими, IGH, BCL6, MYC, BCL11A, CD93, PIM1 и/или PAX5. В определенных вариантах, ферментом редактирования ДНК является AID. В некоторых вариантах, уровень мутации в специфических генах-мишенях, включая IGH, BCL6, MYC, BCL11А, CD93, PIM1 и/или PAX5, который, по крайней мере, на 2% больше, например, на 2% больше или более, на 3% больше или более, на 5% больше или более, на 10% больше или более, или на 20% больше или более, чем уровень мутации в IGH, BCL6, MYC, BCL11А, CD93, PIM1 и/или PAX5 в ссылочной клетке, может указывать на увеличенный, повышенный и/или значительный уровень активности AID.
В некоторых вариантах, повышенным уровнем повреждения ДНК может быть повышенный уровень двухцепочечных разрывов (ДЦР). Уровень ДЦР может быть определен, в качестве не ограничивающего примера, кариотипированием, образованием очагов γ-Η2ΑΧ и/или с помощью анализа FISH для обнаружения двухцепочечных разрывов ДНК, например, FISH обнаруживающего разрыва ДНК (DBD-FISH) (Volpi and Bridger, BioTechniques, Vol. 45, No. 4, October 2008, pp. 385-409).
В некоторых вариантах, повышенный уровень повреждения ДНК может быть повышенным уровнем одноцепочечных разрывов. Уровень одноцепочечных разрывов в ДНК может быть определен, в качестве не ограничивающего примера, с помощью анализов COMET, FISH или использования специфических для одноцепочечных разрывов датчиков. Обнаружение разрывов ДНК, как одноцепочечных, так и двухцепочечных, известно в данной области техники и описано дополнительно в, например, Kumari et al. EXCLI Journal 2009 7:44-62 и Motalleb et al. Research Journal of Applied Sciences, Engineering and Technology. 2012 4: 1888-1894; каждый из которых включен сюда в качестве ссылки полностью.
В некоторых вариантах, повышенный уровень активности процесса повреждения ДНК может включать повышенный уровень и/или активность фермента редактирования ДНК. В некоторых вариантах, технология, описанная здесь, направлена на обработку клеток, имеющих активный фермент редактирования ДНК, соединением в соответствии с данным изобретением. В некоторых вариантах, методика, описанная здесь, направлена на обработку клеток, имеющих повышенный уровень и/или активность фермента редактирования ДНК, соединением в соответствии с данным изобретением. Используемый здесь термин «фермент редактирования ДНК» относится к ферменту, который обычно катализирует мутацию, обмен или удаление сегментов ДНК, особенно ферментов, которые могут генерировать или способствовать генерации точечных мутаций, одноцепочечных разрывов ДНК, двухцепочечных разрывов ДНК или продуктов присоединения белок-ДНК. Фермент редактирования ДНК, как указано здесь, не обязательно является сайт-специфичным по своему действию. Также, он не обязательно является специфичным к клетке. В некоторых вариантах, клетка представляет собой B-клетку, экспрессирующую определяемое количество такого фермента.
Не ограничивающие примеры ферментов редактирования ДНК включают, но не ограничены ими, ген, активирующий рекомбинацию 1 (RAG1; ID гена по NCBI: 5896), ген, активирующий рекомбинацию 1 (RAG2; ID гена по NCBI: 5897), специфический к спорообразованию белок 11 (SPOl 1; ID гена по NCBI: 23626), члены семейства APOBEC топоизомеразы 1 типа; топоизомеразы 2 типа; и/или AID. В некоторых вариантах ферментом редактирования ДНК может быть AID.
В некоторых вариантах, ферментом редактирования ДНК может быть член семейства APOBEC (фермент редактирования аполипопротеина B мРНК, подобный каталитическому полипептиду). Используемый здесь термин "семейство APOBEC" относится к семейству ферментов цитидиндеаминазы, имеющим N-концевой цинк-зависимый цитидиндеаминазный каталитический домен, и C-концевой псевдокаталитический домен. Не ограничивающие примеры членов семейства APOBEC включают AID, APOBEC 1 (например, ID гена по NCBI: 339), APOBEC2 (например, ID гена по NCBI: 10930), APOBEC3A (например, ID гена по NCBI: 200315), APOBEC3C (например, ID гена по NCBI: 27350), APOBEC3E (например, ID гена по NCBI: 140564), APOBEC3F (например, ID гена по NCBI:200316), APOBEC3G (например, ID гена по NCBI: 60489), APOBEC3H (например, ID гена по NCBI: 164668) и APOBEC4 (например, ID гена по NCBI: 403314).
В некоторых вариантах, ферментом редактирования ДНК может быть топоизомераза 1 типа. В некоторых вариантах, ферментом редактирования ДНК может быть топоизомераза 2 типа. Топоизомеразы вызывают разрывы в ДНК, чтобы помочь развернуть или расслабить нить. Топоизомеразы II типа гидролизуют АТФ с образованием ДЦР, тогда как топоизомеразы I типа образуют одноцепочечные разрывы. Не ограничивающие примеры топоизомеразы II типа могут включать топоизомеразу II (например, ID гена по NCBI: 7153 и 7155). Не ограничивающие примеры топоизомеразы I типа могут включать топоизомеразу I (например, ID гена по NCBI: 7150).
Варианты методики, описанной здесь, основаны на открытии, что соединения, описанные здесь, могут ингибировать механизмы восстановления ДНК, например, гомологичное восстановление. Индуцируемая активацией цитидиндеаминаза (AID или AICDA, также известная как ARP2, CDA2 или HIGM2), фермент редактирования ДНК, который является членом аполипопротеин В мРНК редактирующих ферментов, каталитических полипептидоподобных (APOBEC), вызывает широкое распространение геномных разрывов и гибель клеток в клетках с уменьшенной способностью к гомологичной рекомбинации (например, клетках с уменьшенной способностью к восстановлению двухцепочечных разрывов ДНК). Соответственно, здесь представлен способ вызывания гибели клеток, включающий обнаружение повышенной экспрессии фермента редактирования ДНК (например, AID) в клетке и последующего контактирования клетки с соединением в соответствии с данным изобретением; тем самым приводя к гибели клеток. Соответственно, здесь предложен способ вызывания гибели клеток, включающий повышение экспрессии фермента редактирования ДНК (например, AID), в клетке и последующего контактирования клетки с соединением в соответствии с данным изобретением; тем самым приводя к гибели клеток. Соответственно, здесь предложен способ вызывания гибели клеток, включающий введение в клетку терапевтически эффективного количества фермента редактирования ДНК (например, AID) и последующее контактирование клетки с соединением в соответствии с данным изобретением; тем самым приводя к гибели клеток.
AID, кодируемый геном AICDA (ID гена по NCBI: 57379), необходим для правильного функционирования В-клеток и наиболее заметно экспрессируется в В-клетках центробластов. Белок вовлечен в соматическую гипермутацию, конверсию генов и класс-свич рекомбинацию генов иммуноглобулинов. AID обычно экспрессируется почти исключительно в антиген-активированных В-клетках зародышевого центра, где он инициирует переключение класса изотипа иммуноглобулина (Manis et al. 2002, Trends Immunol, 23, 31-39; Chaudhuri and Alt, Nat Rev Immunol, 2004, 4, 541-552; Longerich et al., Curr Opin Immunol, 2006, 18, 164-174; Chaudhuri et al., Adv Immunol 2007, 94, 157-214). AID необходим для соматической гипермутации и переключения класса иммуноглобулинов в активированных В-клетках. Экспрессия AID регулируется лигандом CD40, В-клеточным рецептором, IL4R или стимуляцией Toll-подобного рецептора (Crouch et al., J Exp Med 2007 204: 1145-1156; Muramatsu et al., J Biol Chem 1999 274: 18470-6). После активации AID временно повышается, вызывает точечные мутации или двухцепочечные разрывы ДНК неспецифическим образом в генах иммуноглобулина и затем понижается (Longerich et al., Curr Opin Immunol, 2006, 18, 164-176; Chaudhuri et al., Adv Immunol 2007, 94, 157-214). В целом, AID активен только в крошечной популяции нормальных клеток (антиген-активированных B-клеток) в любой момент времени. Геномные перестройки и мутации, контролируемые AID, приводят к развитию разнообразия узнавания антигена, редактирования рецепторов и функционирования лимфоидного эффектора, необходимых для функционального адаптивного иммунитета (Mills, et al. Immunol Rev 2003 194:77-95). Recently it has been reported that AID has off-target point mutation activities (Liu, M. et al., Nature 2008, 451, 841-845; Liu and Schatz, Trends Immunol. 2009, 30, 173-181; Perez-Duran et al., Carcinogenesis. 2007, 28(12):2427-33). Robbiani et al. описал нецелевую активность AID в B-клетках, особенно c-myc/IgH транслокациях (Robbiani et al., Mol Cell 2009, 36(4):631-41). Экспрессия AID увеличивает скорость развития опухоли у Bcl6 трансгенных мышей (Pasqualucci et al., 2008, Nat. Genet. 40, 108-112). Однако нерегулируемый AID не обязательно вызывает злокачественную опухоль или транслокационный рак сам по себе в В-клетках (Muto et al., 2006, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 103, 2752-2757; Okazaki et al., 2003, J. Exp. Med. 197, 1173-1181; Shen et al., 2008, Mol. Immunol. 45, 1883-1892). Кроме того, несмотря на его обязательную роль в транслокации c-myc/IgH, AID не требуется для развития плазмоцитоза или плазмоцитомы у трансгенных или обработанных пристаном IL-6 мышей, соответственно (Kovalchuk et al., 2007, J. Exp. Med. 204, 2989-3001; Ramiro et al., 2004, J. Exp. Med. 200, 1103-1110). Однако большинство связанных с лимфомой транслокаций В-клеток не включают c-myc, и многие не включают Ig гены (Kuppers, 2005, Oncogene 20, 5580-5594).
Сверхэкспрессия AID была описана при хроническом лимфоцитарном лейкозе (ХЛЛ) (Hancer et al. Leuk Lymphoma. 2011 Jan;52(l):79-84; Heintel et al., Leukemia. 2004 Apr; 18(4):756-62). Кроме того было показано, что экспрессия AID коррелирует с бластным кризом В-клеточного лейкоза и резистентностью к терапии при миелоидном лейкозе, и в целом связана с плохим прогнозом при хроническом В-лимфоцитарном лейкозе (Mao et al., Br J Dermatol 2001, 145: 117-122; Chaudhuri et al., Nature 2004, 430:992-8). Также сообщалось об экспрессии AID в опухолевых клетках при различных видах рака, включая, но не ограничиваясь ими, рак легких, молочной железы, желудка, толстой кишки, кишечника, печени и хориангиокарциному (Greeve et al., Blood 2003, 1010, 3574-3580; Feldhahn et al., J Exp Med 2007, 204, 1157-1166; Kotani et al., PNAS USA 2007, 104, 1616-1620; Engels et al., 2008, Appl Immunohistochem Mol Morphol 16, 521-529; Klemm et al., 2009, Cancer Cell 6, 232-245; Palacios et al., 2010, Blood 115(22), 4488-4496; Leuenberger et al., 2009, Mod Pathol 32, 177-186; Gruber et al., 2010, Cancer Res 70, 7411-7420); воспалительный рак (Marusawa 2008, Int J Biochem Cell Biol.40, 399-402); фолликулярную лимфому (Hardianti et al., 2004, Leukemia 18, 826-831; Shikata et al., 2012, Cancer Sci. 103(3):415-21); рак щитовидной железы (Qiu et al. 2012, Mod Pathol 25(l),36-45); рак молочной железы (Borchert et al. 2011, BMC Cancer 11:347); Marusawa, et al., 2011, Adv Immunol 111 : 109-41; Zhang et al. 2012, Hum Pathol 43(3):423-34; Komori et al., 2008, Hepatology 47(3):888-896; Hockley 2010, Leukemia 24(5): 1084-6); Т-клеточный лейкоз у взрослых (Nakamura et al., 2011, Br J Dermatol. 165(2):437-9). Все ссылки в предыдущем абзаце полностью включены сюда в качестве ссылки.
Повышенные уровни AID были описаны при артрите (Xu et al. Scand. J. Immunol. 2009, 296, 2033-6) и в MRL/Fas(lpr/lpr) мышиной модели волчанки (White et al. 2011, Autoimmunity 44(8), 585-98). Все ссылки в предыдущем абзаце полностью включены сюда в качестве ссылки.
Когда восстановление ДЦР ингибируется, степень ДЦР, генерируемых AID, значительно выше, чем предполагалось ранее, и степень повреждения генома настолько серьезна, что может привести к гибели клеток. Соответственно, в одном варианте описанной здесь методики, представлен способ лечения, включающий: (а) отбор субъекта, имеющего клетки, которые экспрессируют повышенные уровни индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID); и (b) введение терапевтически эффективного количества ингибитора восстановления двухцепочечного разрыва (например, соединения в соответствии с данным изобретением) субъекту; где повышенным уровнем AID считается уровень AID, который выше, чем уровень AID в клетках того же типа от здорового человека. В некоторых вариантах, клетками, экспрессирующими повышенные уровни AID, являются B-клетки. В некоторых вариантах, В-клетки, экспрессирующие повышенные уровни AID, являются раковыми B-клетками или B-клетками, связанными с аутоиммунным заболеванием. В некоторых вариантах, субъектом может быть человек.
Способы, представленные здесь, лечат рак и/или аутоиммунные расстройства через ингибирование восстановления двухцепочечного разрыва ДНК. Это ингибирование оказывается летальным для клеток, экспрессирующих AID, так как AID генерирует широко распространенные геномные разрывы, и лечение ингибитором восстановления двухцепочечных разрывов предотвращает восстановление этих повреждений, которые генерируются самой клеткой. Это приводит к гибели клеток у субъекта, который специфичен для клеток, экспрессирующих AID, например, раковых B-клеток и/или аутоиммунных клеток. Соответственно, как описано здесь, в одном варианте предложена парадигма лечения, которая избирательно вызывает самоуничтожение определенных пораженных клеток при одновременном уменьшении непреднамеренных побочных эффектов в здоровых тканях.
В некоторых вариантах, повышенный уровень и/или активность фермента редактирования ДНК может быть повышенным уровнем мРНК фермента редактирования ДНК. Уровни мРНК могут быть оценены с использованием, например, методов биохимии и молекулярной биологии, таких как Нозерн блоттинг или другие анализы гибридизации, анализ с защитой от действия нуклеаз, методы обратной транскрипции (количественная ОТ-ПЦР), РНК-Seq, высокопроизводительное секвенирование и подобные. Такие анализы хорошо известны специалистам в данной области. В одном варианте используют ядерные анализы «продолжающейся» (или «прерванной») транскрипции (см., например, Methods in Molecular Biology, Volume: 49, Sep-27-1995, Page Range: 229-238). Также могут применяться чипы; чипы и способы анализа мРНК с применением таких чипов описаны ранее, например, в EP0834575, EP0834576, W096/31622, патенте США № 5,837,832 или WO98/30883. В WO97/10365 представлены способы отслеживания уровней экспрессии множества генов с применением анализа нуклеотидов высокой плотности.
В некоторых вариантах, можно определить, что у субъекта имеется повышенный уровень повреждения ДНК, происходящий в одном или нескольких типах клеток относительно ссылочного уровня, если субъект подвергался воздействию агента, о котором известно, что он вызывает такое повреждение ДНК. Не ограничивающие примеры таких агентов могут включать вирусную инфекцию с интегрирующим ДНК вирусом (например, аденоассоциированным вирусом, ретровирусом, T-лимфотропным вирусом человека, ВИЧ-1, онковирусом, вирусом гепатита, вирусом гепатита B); химические вещества, повреждающие ДНК (например, ацетальдегид, полициклические ароматические углеводороды, бензолы, нитрозамины, табачный дым, афлатоксин и подобные); химиотерапевтические агенты, повреждающие ДНК (например, блеомицин, митомицин, хлорметины (например, мехлорэтамин, циклофосфамид, мелфалан, хлорамбуцил, ифосфамид и бусульфан), нитрозомочевины (например, N-нитрозо-N-метилмочевина (MNU), кармустин (BCNU), ломустин (CCNU) и семустин (MeCCNU), фотемустин и стрептозотоцин), тетразины (например, дакарбазин, митозоломид и темозоломид), азиридины (например, тиотепа, митомицин и диазиквон (AZQ)), цисплатины (например, цисплатин, карбоплатин и оксалиплатин), прокарбазин и гексаметилмеламин); и ионизирующее или ультрафиолетовое излучение. Воздействие таких агентов может быть результатом несчастного случая, инфекции и/или воздействия окружающей среды или результатом терапевтического введения таких агентов.
В некоторых вариантах, повышенный уровень повреждения ДНК может возникать в типе клеток, пораженных раком, аутоиммунным заболеванием и/или нейродегенеративным заболеванием. В некоторых вариантах, субъект имеет повышенный уровень повреждения ДНК, возникающий в клетке, выбранной из группы, состоящей из: раковой клетки; клетки иммунной системы; или клетки нервной системы.
В некоторых вариантах, ферментом редактирования ДНК может быть AID. В некоторых вариантах, уровень AID может быть уровнем AID в клетке крови. В некоторых вариантах, уровень AID может быть уровнем AID в B-клетке.
В некоторых вариантах, повышенным уровнем AID может быть определяемый уровень AID, например, как описано ниже.
В некоторых вариантах, субъектом может быть человек.
Способы, предоставленные здесь, лечат рак и/или аутоиммунные расстройства путем ингибирования восстановления двухцепочечного разрыва ДНК. Это ингибирование оказывается летальным для клеток, экспрессирующих AID, так как AID генерирует широко распространенные геномные разрывы, и лечение ингибитором восстановления двухцепочечных разрывов предотвращает восстановление этих повреждений, которые генерируются самой клеткой. Это приводит к гибели клеток у субъекта, которая специфична для клеток, экспрессирующих AID, например, раковых B-клеток и/или аутоиммунных клеток. Соответственно, как описано здесь, в одном варианте предложена парадигма лечения, которая селективно индуцирует самоуничтожение определенных пораженных клеток при одновременном уменьшении непреднамеренных побочных эффектов в здоровых тканях.
Способы изменения рака у пациентов с повышенными уровнями повреждения ДНК или повышенными уровнями фермента редактирования ДНК описаны в WO2016/094897, включенном сюда в качестве ссылки.
В определенных вариантах, раком, подлежащим лечению, является тип с высокой экспрессией фермента редактирования ДНК. В некоторых вариантах, раком, подлежащим лечению, является В-клеточное новообразование.
В другой варианте представлен способ лечения рака введением субъекту эффективного количества одного или нескольких описанных соединений или их фармацевтически приемлемой соли или соответствующей фармацевтической композиции. В одном аспекте рак выбран из группы, состоящей из лимфомы, лейкоза и новообразования клеток плазмы. В другом аспекте рак выбран из группы, состоящей из карциномы и саркомы.
В определенных вариантах, раком, подлежащим лечению, является лимфома. Лимфомы, которые можно лечить описанными способами, включают неходжкинскую лимфому; лимфома Беркитта; малую лимфоцитарную лимфому; лимфоплазмацитарную лимфому; лимфому ЛТСО; фолликулярную лимфому; диффузную В-крупноклеточную лимфому; и Т-клеточную лимфому.
Лимфомой является злокачественная опухоль в лимфатических клетках иммунной системы (например, В-клетках, Т-клетках или естественных клетках-киллерах (NK)). Лимфомы часто возникают в лимфатических узлах и предстают в виде солидных опухолей. Они могут метастазировать в другие органы, такие как мозг, кости или кожа. Внеузловые участки часто располагаются в области живота. Лимфомы тесно связаны с лимфолейкозом и, в некоторых случаях, особая форма рака классифицируется и как лимфома и как лейкоз.
Лейкозы, которые можно лечить описанными способами, включают острый лимфобластный лейкоз (ОЛЛ); лейкоз Беркитта; В-клеточный лейкоз; В-клеточный острый лимфобластный лейкоз; хронический лимфолейкоз (ХЛЛ); острый миелогенный лейкоз (ОМЛ); хронический миелогенный лейкоз (ХМЛ); и Т-клеточный острый лимфобластный лейкоз (T-ОЛЛ).
В некоторых вариантах раками, подлежащими лечению, являются В-клеточные новообразования, В-клеточный лейкоз, В-клеточный острый лимфобластный лейкоз, хронический лимфоцитарный лейкоз, хронический миелогенный лейкоз, лейкоз Беркитта, острый миелогенный лейкоз и/или T-ОЛЛ. Созревание В-клеток, как правило, прекращается или существенно уменьшается после нейтрализации чужеродного антигена. Иногда, однако, пролиферация конкретной В-клетки остается неослабленной; такая пролиферация может привести к раку, называемому «В-клеточной лимфомой» или «В-клеточным лейкозом». В некоторых вариантах, раком, подлежащим лечению, является хронический лимфоцитарный лейкоз (ХЛЛ) или хронический миелогенный лейкоз (ХМЛ).
В определенных вариантах раком, подлежащим лечению, является новообразование клеток плазмы. Примеры новообразований клеток плазмы включают множественную миелому; миелому клеток плазмы; лейкоз клеток плазмы и плазмоцитому.
Карциномы, которые можно лечить описанными способами, включают рак толстой кишки; рак печени; рак желудка; рак кишечника; рак пищевода; рак молочной железы; рак яичников; рак головы и шеи; рак легких; и рак щитовидной железы.
Саркомы, которые можно лечить описанными способами, включают саркому мягких тканей и саркому костей.
Любой рак, характеризующийся высоким уровнем повреждения ДНК и/или экспрессией фермента редактирования ДНК, можно лечить соединением, как описано здесь, например, соединением в соответствии с данным изобретением. Например, саркомы, рак эпителиальных клеток (карциномы), рак толстой кишки, рак желудка, рак кишечника, рак печени, печеночно-клеточный рак, рак молочной железы, рак щитовидной железы, рак пищевода, рак легких, рак головного мозга, рак головы и шеи, меланому, рак почки, рак простаты, гемангиому, рабдомиосаркому, хондросаркому, остеосаркому, фибросаркому и холангиокарциному можно охарактеризовать высоким уровнем экспрессии фермента редактирования ДНК, например, AID. В некоторых вариантах раком, подлежащим лечению, является рак толстой кишки, рак печени, рак желудка, рак кишечника, рак молочной железы, рак легких, рак щитовидной железы и/или холангиокарцинома.
Конкретные виды рака, которые можно лечить описанными способами, включают рак мочевого пузыря, крови, кости, костного мозга, мозга, молочной железы, толстой кишки, пищевода, желудочно-кишечного тракта, десны, головы, почек, печени, легких, носоглотки, шеи, яичника, простаты, кожи, желудка, яичка, языка или матки. Кроме того, рак может быть определенного следующего гистологического типа, хотя он не ограничен ими: новообразование, злокачественное образование; карцинома; недифференцированная карцинома; гигантоклеточная и карциносаркома; саркомы; мелкоклеточная карцинома; папиллярная карцинома; плоскоклеточная карцинома; лимфоэпителиальная карцинома; базально-клеточная карцинома; пиломатриксная карцинома; переходно-клеточная карцинома; папиллярная переходно-клеточная карцинома; аденокарцинома; гастринома злокачественная; холангиокарцинома; печеночно-клеточная карцинома; комбинированная печеночно-клеточная карцинома и холангиокарцинома; трабекулярная аденокарцинома; аденоидная кистозная карцинома; аденокарцинома в аденоматозном полипе; аденокарцинома, семейный полипоз кишечника; твердая карцинома; злокачественная карциноидная опухоль; бранхиоло-альвеолярная аденокарцинома; папиллярная аденокарцинома; хромофобная карцинома; ацидофильная карцинома; оксифильная аденокарцинома; базофильная карцинома; светлоклеточная аденокарцинома; зернистоклеточная карцинома; фолликулярная аденокарцинома; папиллярная и фолликулярная аденокарцинома; неинкапсулирующая склерозирующая карцинома; карцинома коры надпочечников; эндометроидная карцинома; карцинома кожных отростков; апокринная аденокарцинома; сальная аденокарцинома; церуминозная аденокарцинома; мукоэпидермоидная карцинома; цистаденокарцинома; папиллярная цистаденокарцинома; папиллярная серозная цистаденокарцинома; муцинозная цистаденокарцинома; муцинозная аденокарцинома; слизистый рак; инфильтрирующая протоковая карцинома; медуллярная карцинома; лобулярная карцинома; воспалительная карцинома; болезнь Педжета, молочных желез; ацинозно-клеточная карцинома; аденосквамозная карцинома; аденокарцинома с плоскоклеточной метаплазией; тимома злокачественная; стромальная опухоль яичника, злокачественная; текома, злокачественная; фолликулома, злокачественная; андробластома, злокачественная; карцинома клеток Сертоли; опухоль клеток Лейдига, злокачественная; опухоль жировых клеток, злокачественная; параганглиома, злокачественная; внегрудная параганглиома, злокачественная; феохромоцитома; гломангиосаркома; злокачественная меланома; амеланотическая меланома; поверхностная распространяющаяся меланома; злокачественная меланома в гигантских пигментированных невусах; меланома эпителиоидных клеток; синий невус, злокачественный; саркома; фибросаркома; фиброзная гистиоцитома, злокачественная; миксосаркома; липосаркома; леймиосаркома; рабдомиосаркома; эмбриональная рабдомиосаркома; альвеолярная рабдомиосаркома; стромальная саркома; смешанная опухоль, злокачественная; смешанная опухоль Мюллера; нефробластома; гепатобластома; карциносаркома; мезенхимома, злокачественная; опухоль Бреннера, злокачественная; листофидная цистосаркома, злокачественная; синовиальная саркома; мезотелиома, злокачественная; дисгерминома; эмбриональная карцинома; тератома, злокачественная; гиперплазия яичников, злокачественная; хориокарцинома; мезонефрома, злокачественная; гемангиосаркома; гемангиоэндотелиома, злокачественная; саркома Капоши; гемангиоперицитома, злокачественная; лимфангиосаркома; остеосаркома; юкстакортикальная остеосаркома; хондросаркома; хондробластома, злокачественная; мезенхимальная хондросаркома; гигантоклеточная опухоль кости; саркома Юинга; одонтогенная опухоль, злокачественная; амелобластная одонтосаркома; амелобластома, злокачественная; амелобластная фибросаркома; пинеалома, злокачественная; хордома; глиома, злокачественная; эпендимома; астроцитома; протоплазматическая астроцитома; фибриллярная астроцитома; астробластома; глиобластома; олигодендроглиома; олигодендробластома; примитивная нейроэктодермальная; саркома мозжечка; ганглионейробластома; нейробластома; ретинобластома; обонятельная нейрогенная опухоль; менингиома, злокачественная; нейрофибросаркома; нейрилеммома, злокачественная; зернисто-клеточная опухоль, злокачественная; злокачественная лимфома; болезнь Ходжкина; Ходжкина; парагранулема; злокачественная лимфома, мелколимфоцитарная; злокачественная лимфома, крупноклеточная, диффузная; злокачественная лимфома, фолликулярная; грибовидный микоз; другие уточненные неходжкинские лимфомы; злокачественный гистиоцитоз; множественная миелома; тучноклеточная саркома; иммунопролиферативные заболевания тонкой кишки; лейкоз; лимфолейкоз; лейкоз клеток плазмы; эритролейкоз; лимфосаркомный клеточный лейкоз; миелоидный лейкоз; базофильный лейкоз; эозинофильный лейкоз; моноцитарный лейкоз; тучноклеточный лейкоз; мегакариобластный лейкоз; миелоидная саркома; и лейкоз ворсистых клеток.
В другом варианте описанного способа, рак характеризуется мутациями в гомологах mutS (например, MSH2, MSH3 и MSH6), гомологах mutL (например, MLH1) или несовпадением восстановительной эндонуклеазы PMS2. Мутациями являются изменения в генетическом коде. Они включают точечные мутации и знаковые мутации. При точечной мутации один нуклеотид заменяется другим. Следовательно, мутация происходит в одной точке или месте внутри цепи ДНК. Знаковые мутации обусловлены либо вставками, либо делециями нуклеотидов. Это приводит к удлинению или уменьшению всей цепи ДНК. Таким образом, знаковые мутации могут изменять все кодоны, возникающие после удаления или вставки. Мутации, упомянутые здесь, включают, но не ограничиваются ими, вставки, делеции, дупликации, инверсии или другие распознанные точечные мутации. В настоящее время обнаружено, что ингибиторы RAD51 особенно эффективны при лечении рака с мутациями в MSH (например, MSH6), MLH или PMS2.
MutS Homolog 2 (MSH2) является белком, который у человека кодирован геном MSH2, который расположен на хромосоме 2. MSH2 является геном-супрессором опухоли, и более конкретно, геном-смотрителем, который кодирует для белка исправления ошибок спаривания ДНК (MMR), MSH2, который образует гетеродимер с MSH6, чтобы образовать комплекс для исправления ошибок спаривания человеческого MutSα. Он также димеризуется с MSH3 с образованием комплекса восстановления ДНК MutSβ. MSH2 вовлечен во множество разных форм восстановления ДНК, включая репарацию, сопряженную с транскрипцией, гомологичную рекомбинацию и эксцизионную репарацию оснований ДНК. Примеры мутаций в MSH2 включают, но не ограничены ими, g.47630253_47630254del, g.47702411_47702421del, g.47709913_47709915inv, g.47635629_47635634del, g.47637227_47637236dup, g.47639550_47639561del, g.(?_47630206)_(47710367_?)del, g.(?_47630206)_(47643569_47656880)del, g.47630263_47643568del, g.(?_47630206)_(47657081_47672686)del, g.47630263_47657080del, g.(?_47630206)_(47672797_47690169)del, g.47630263_47672796del, g.(?_47630206)_(47672797_47690169)del, g.(?_47630206)_(47693948_47698103)del, g.47630263_47693947del, g.(?_47630206)_(47698202_47702163)del, g.(?_47630206)_(47630542_47635539)del, g.(?_47630206)_(47708011_47709917)del, g.(?_47630206)_(47635695_47637232)del, g.(?_47630206)_(47635695_47637232)del, g.(?_47630206)_(47637512_47639552)del, g.(?_47630206)_(47639700_47641407)del, g.(?_47630206)_(47641558_47643434)del, g.47618487_47650860delins(155), g.47628578_47638433del, g.47595033_47662777del, g.47583175_47667707del, g.47625602_47636880del, g.47554933_47699909del, g.47629508_47649552del, g.47629375_47651274del, g.(?_47630206)_(47630542_47635539)del, g.(?_47630206)_(47635695_47637232)del, g.47643509_47643510del, g.47643529_47643530dup, g.47656746_47657199dup, g.47656661_47663325del, g.(47643569_47656880)_(47710367_?)del, g.(47643569_47656880)_(47710367_?)del, g.47656881_47657080del, g.(47643569_47656880)_(47657081_47672686)del, g.(47643569_47656880)_(47657081_47672686)del, g.(47643569_47656880)_(47657081_47672686)del, g.(47643569_47656880)_(47657081_47672686)dup, g.(47643569_47656880)_(47657081_47672686)dup, g.(47643569_47656880)_(47672797_47690169)del, g.(47643569_47656880)_(47693948_47698103)del, g.47656881_47693947del, g.(47643569_47656880)_(47702410_47703505)del, g.47656881_47656882ins(173), g.47656901_47656902insA, g.47656903del, g.47656912del, g.47630440del, g.47656923del, g.47656931_47656932dup, g.47656943del, g.47656943_47656949delinsCCCAGA, g.47656948dup, g.47656996dup, g.47657000_47657001dup, g.47630449del, g.47657007dup, g.47657008del, g.47657020_47657023dup, g.47657025_47657026del, g.47657026dup, g.47657030_47657031del, g.47657047_47657050del, g.47657053del, g.47657053_47657057del, g.47657064del, g.47657073dup, g.47657312_47676594del, g.47668611_47674615del, g.47672116_47675123del, g.47666463_47677632del, g.47666403_47677572del, g.(47657081_47672686)_(47710367_?)del, g.(47657081_47672686)_(47710367_?)inv, g.47671507_47675022delinsCATTCTCTTTGAAAA, g.47657278_47676557del, g.47672687_47672796del, g.(47657081_47672686)_(47672797_47690169)del, g.(47657081_47672686)_(47672797_47690169)del, g.(47657081_47672686)_(47693948_47698103)del, g.(47657081_47672686)_(47698202_47702163)del, g.(47657081_47672686)_(47708011_47709917)del, g.47672691dup, g.47672697dup, g.47672721_47672744delins47672748_47672771inv, g.47672728_47672729del, g.47672731dup, g.47672750_47672751insGG, g.47672755_47672758del, g.47672762_47672763del, g.47630466_47630494del, g.47686194_47697740del, g.(47672797_47690169)_(47710367_?)del, g.(47672797_47690169)_(47690294_47693796)del, g.(47672797_47690169)_(47693948_47698103)del, g.47690170_47693947del, g.(47672797_47690169)_(47693948_47698103)del, g.(47672797_47690169)_(47693948_47698103)dup, g.(47672797_47690169)_(47705659_47707834)del, g.47690173del, g.47690191del, g.47690216_47690217dup, g.47690227del, g.47690227dup, g.47690228_47690232del, g.47690230_47690231del, g.47690240del, g.47690240_47690243del, g.47630475del, g.47630475_47630476del, g.47690259_47690260delinsCT, g.47690277dup, g.47690280del, g.47690283dup, g.(47690294_47693796)_(47702410_47703505)del, g.47630484_47630485insG, g.47693838_47693839del, g.47693862del, g.47693864del, g.47693873del, g.47693880dup, g.47693913del, g.47693924_47693925dup, g.47630493del, g.47697730_47706125del, g.(47693948_47698103)_(47710367_?)del, g.(47693948_47698103)_(47698202_47702163)del, g.(47693948_47698103)_(47705659_47707834)del, g.47698107del, g.47698109del, g.47698109_47698110insA, g.47630496del, g.47698118del, g.47698125del, g.47698129dup, g.47698138_47698139del, g.47698142_47698146del, g.47698144dup, g.47698147_47698148del, g.47698147_47698148dup, g.47698147_47698148insT, g.47698159del, g.47698162del, g.47698506_47703472del, g.47701803_47708848del, g.(47698202_47702163)_(47710367_?)del, g.(47698202_47702163)_(47702410_47703505)del, g.(47698202_47702163)_(47703711_47705410)del, g.(47698202_47702163)_(47705659_47707834)del, g.47702164del, g.47702175_47702176insA, g.47702183_47702186del, g.47702185_47702186insCT, g.47702190_47702192del, g.47702191dup, g.47702192_47702193del, g.47702213del, g.47702231del, g.47702242dup, g.47702257del, g.47702262_47702263dup, g.47630516_47630517dup, g.47630517del, g.47630517dup, g.47702289_47702290inv, g.47702293_47702296del, g.47702301dup, g.47702315del, g.47702315del, g.47702328_47702329del, g.47630522dup, g.47702339del, g.47702371_47702374dup, g.47702384_47702385del, g.47702386_47702389del, g.47702388del, g.47702388_47702389del, g.47702390del, g.47702390_47702391del, g.47702400_47702401del, g.47703506_47703710del, g.47703506_47708010del, g.47703510del, g.47703515del, g.47703521_47703522del, g.47703535_47703536del, g.47703546_47703547del, g.47703548_47703611dup, g.47630534del, g.47703571dup, g.47703574_47703581del, g.47703585dup, g.47630350del, g.47632107_47668733del, g.47703613del, g.(47630542_47635539)_(47643569_47656880)del, g.(47630542_47635539)_(47643569_47656880)inv, g.(47630542_47635539)_(47657081_47672686)del, g.47635540_47657080del, g.(47630542_47635539)_(47672797_47690169)del, g.(47630542_47635539)_(47690294_47693796)del, g.(47630542_47635539)_(47705659_47707834)del, g.47635540_47635694del, g.(47630542_47635539)_(47635695_47637232)del, g.(47630542_47635539)_(47635695_47637232)del, g.(47630542_47635539)_(47637512_47639552)del, g.47703635dup, g.47703641dup, g.47635542_47635549del, g.47703660_47703663del, g.47703667dup, g.47630351dup, g.47703704del, g.47703826_47707938del, g.(47703711_47705410)_(47705659_47707834)del, g.47705428_47705431del, g.47705437_47705438insA, g.47635551_47635552del, g.47705440_47705441del, g.47705461del, g.47705490del, g.47705494del, g.47705495del, g.47635557_47635558del, g.47705505del, g.47705535dup, g.47705547del, g.47705560_47705561dup, g.47705561dup, g.47705562dup, g.47705588del, g.47705608_47705609del, g.47705618dup, g.47705627dup, g.47635571_47635601delins(217), g.(47705659_47707834)_(47710367_?)del, g.(47705659_47707834)_(47708011_47709917)del, g.47707842_47707843del, g.47707861del, g.47707861_47707874dup, g.47707878_47707884del, g.47707878_47707884del, g.47707883del, g.47707895_47707905del, g.47707897del, g.47707901_47707902del, g.47707905_47707906del, g.47707921del, g.47635583dup, g.47635583_47635584del, g.47707969_47707973del, g.47707996_47707997ins(115), g.47708009_47708010del, g.(47708011_47709917)_(47710367_?)del, g.47635591_47635592del, g.47635597_47635618dup, g.47635606_47635607del, g.47630359dup, g.47635672del, g.47635675_47635678del, g.47630364dup, g.47635680dup, g.47636862_47639040del, g.47636781_47638831del, g.47636753_47638155del, g.47636552_47638597del, g.(47635695_47637232)_(47643569_47656880)del, g.(47635695_47637232)_(47643569_47656880)del, g.(47635695_47637232)_(47657081_47672686)del, g.(47635695_47637232)_(47672797_47690169)del, g.(47635695_47637232)_(47698202_47702163)del, g.(47635695_47637232)_(47637512_47639552)del, g.(47635695_47637232)_(47641558_47643434)del, g.47637234del, g.47637246_47637247del, g.47637253_47637254del, g.47637254_47637255del, g.47637254_47637255del, g.47637265del, g.47637274del, g.47637282del, g.47637320del, g.47637372_47637375del, g.47637377_47637449dup, g.47637379del, g.47637384del, g.47637394_47637395del, g.47637396_47637397del, g.47637417del, g.47637427_47637435del, g.47637437_47637439del, g.47637453del, g.47637458dup, g.47637479_47637482dup, g.47637482dup, g.47637504_47637505del, g.47637508_47637511del, g.47638050_47653430del, g.47638302_47648462del, g.47638478_47648643del, g.(47637512_47639552)_(47710367_?)del, g.(47637512_47639552)_(47643569_47656880)del, g.47639553_47643568del, g.(47637512_47639552)_(47657081_47672686)del, g.(47637512_47639552)_(47657081_47672686)del, g.(47637512_47639552)_(47672797_47690169)del, g.(47637512_47639552)_(47639700_47641407)del, g.(47637512_47639552)_(47641558_47643434)del, g.47639557_47639561del, g.47639582_47639586delinsTAAT, g.47639583_47639584del, g.47639594del, g.47639594dup, g.47639598del, g.47639603_47639604del, g.47639611_47639612del, g.47639612del, g.47639618_47639621del, g.47639624_47639628delinsTTA, g.47630401dup, g.47639632dup, g.47639638_47639641dup, g.47639638_47639641dup, g.47639639del, g.47639639del, g.47639642dup, g.47630403_47630404insC, g.47639653del, g.47639666del, g.47639666_47639669del, g.47639668del, g.47639670_47639673delinsTT, g.47639674_47639675dup, g.47639695_47639696del, g.47639707_47642985del, g.47641402_47642007del, g.(47639700_47641407)_(47643569_47656880)del, g.47641408_47643568del, g.(47639700_47641407)_(47657081_47672686)del, g.(47639700_47641407)_(47672797_47690169)del, g.(47639700_47641407)_(47641558_47643434)del, g.(47639700_47641407)_(47641558_47643434)del, g.47641410del, g.47641425_47641426del, g.47641426_47641429del, g.47630412del, g.47641451del, g.47641454dup, g.47641455dup, g.47641469del, g.47641478del, g.47641488_47641491del, g.47641496_47641497del, g.47641503del, g.47641513_47641514dup, g.47641530_47641537dup, g.47642509_47655432del, g.(47641558_47643434)_(47643569_47656880)del, g.(47641558_47643434)_(47693948_47698103)del, g.47630424_47630433del, g.47643450dup, g.47643462_47643463del, g.47643462_47643463ins(4), g.47643464_47643465insNC_000022.10:35788169_35788352, g.47643465dup.
MutS Homolog 3 (MSH3) является человеческим гомологом бактериального белка репарации ошибочно спаренных оснований MutS, который участвует в системе репарации ошибочно спаренных оснований (MMR). MSH3 обычно образует гетеродимер MutSβ с MSH2, чтобы исправить длинные петли вставки/делеции и ошибочные спаривания основание-основание в микросателлитах во время синтеза ДНК. Дефицитная емкость для MMR обнаруживается приблизительно в 15% случаев колоректального рака, и соматические мутации в гене MSH3 обнаруживаются почти в 50% случаев MMR-дефицитного колоректального рака. Примеры мутаций в MSH3 включают, но не ограничиваются ими, g.79970809del.
MSH6 кодирует MutS гомолог 6 (MSH6), член семейства белков Mutator S (MutS), которые вовлечены в репарацию ошибочно спаренных оснований ДНК (MMR). Белок MSH6 образует гетеродимер с MutS гомологом 2 (MSH2) у человека и в дрожжах. Человеческий MSH2/6 распознает одиночные ошибочные спаривания основание-основание и короткие петли вставки/делеции. При распознавании ошибочного спаривания, MSH2/6 комплекс связывается и изменяет АДФ на АТФ, что дает конформационное изменение в комплексе, которое предшествует растворению пары оснований, исключению основания и восстановлению.
MSH6 мутации включают знаковые и/или нонсенс-мутации и могут давать не функциональный MSH6 и потерю экспрессии белка. Примеры включают знаковую мутацию на MSH6 аминокислотном остатке 290 и бессмысленное смешивание T1189I.
Инактивация мутаций MSH6 может быть определена при раке обычными способами диагностики. Эти способы включают, но не ограничены ими, получение раковых клеток и других диагностических индикаторов, таких как одноядерные клетки периферической крови (PBMC), субпопуляции PBMC, циркулирующие бласты (CD34+ клетки), циркулирующие опухолевые клетки и циркулирующие экзосомы раковых клеток биопсией и анализами крови, и получением лимфатических или других жидкостей тела. Из раковых клеток и других диагностических индикаторов затем определяют, проявляет ли рак инактивирующую MSH6 мутацию, методами, известными в данной области техники, например, прямым секвенированием ДНК и мультиплексной амплификацией лигированных зондов, секвенированием РНК (RNA-Seq), микроматричным анализом, количественной ПЦР или с применением панелей экспрессии генов NanoString™, или белок MSH6 иммуногистохимией, проточной цитометрией, иммуноцитохимией или вестерн-блоттингом. Способы идентификации инактивирующих мутаций MSH6 описаны у Houlleberghs H, Goverde A, Lusseveld J, Dekker M, Bruno MJ, et al. (2017) Suspected Lynch syndrome associated MSH6 variants: A functional assay to determine their pathogenicity. PLOS Genetics 13(5): e1006765. https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1006765.
Примеры мутаций в MSH6 включают, но не ограничены ими, g.48032846_48032849del, g.48032846_48032849del, g.48032846_48032849del, g.48033337_48033342del, g.48033420_48033422del, g.(?_48010221)_(48034092)del, g.(?_48010221)_(48018263_48023032)del, g.47998510_48020183del, g.48007276_48020272del, g.48026207del, g.48026223del, g.48026223del, g.48026257_48026261del, g.48026261_48026265del, g.48026312_48026313del, g.48026398del, g.48026543_48026544dup, g.48026693dup, g.48026702del, g.48026712del, g.48026718dup, g.48026736_48026737delinsAG, g.48026736_48026737delinsG, g.48026750_48026751del, g.48026754_48026757del, g.48026756_48026759del, g.48026759_48026760del, g.48026906del, g.48026928_48026931del, g.48026941dup, g.48026991del, g.48027023_48027024del, g.48027079del, g.48027079_48027082dup, g.48027167_48027168del, g.48027172_48027173dup, g.48027178_48027185del, g.48027184_48027185del, g.48027272_48027275del, g.48027470_48027471del, g.48027501_48027502del, g.48027501_48027502delTG, g.48027657dup, g.48027691_48027694del, g.48027733_48027736dup, g.48027794_48027796delinsC, g.48027841_48027842del, g.48027887del, g.48027890dup, g.48027973_48027980del, g.48028067del, g.48028098del, g.48028106del, g.48028175_48028176del, g.48028241_48028242del, g.48028241_48028242delTT, g.48028272_48028284dup, g.48028277_48028278del, g.48030558_48030559del, g.48030126_48032394del, g.48030568del, g.48030581_48030584del, g.48030584_48030585dup, g.48030607del, g.48030645_48030646insT, g.48030647del, g.48030647dup, g.48030649dup, g.48030654_48030660del, g.48030659dup, g.48030697_48030698del, g.48030698del, g.48030706del, g.48030710dup, g.48030727_48030728insC, g.48030765_48030829del, c.3438+797_3438+798insTATins1839_3439-428, c.3438+797_3438+798insTATins1839_3439-428, g.48032121_48032122del, g.48032123_48032124del, g.48032124dup, g.48032126_48032129del, g.48032129_48032130insA, g.48032129_48032132dup, g.(48032167_48032756)_(48034092_?)del, g.48032809_48032812del, g.48032835dup, g.48032846_48032849del, g.48033374_48033402dup, g.48033395_48033398del, g.48033421_48033433del, g.48033425_48033428dup, g.48033453_48033454insA, g.48033494_48033523del, g.48033495_48033496del, g.48033593dup, g.48033610_48033613dup, g.48033629_48033635del, g.48033636_48033639dup, g.48033676_48033682del, g.48033707dup, g.48033709_48033716dup, g.48033721_48033724dup, g.48033727_48033730dup, g.48033728_48033746dup, g.(48033742_48033743)_(48033742_48033743)ins(32), g.48033746dup, g.48033748_48033751del, g.48033758_48033768del, g.48033773_48033774insATCA, g.48033773_48033776dup, g.48033785_48033789dup, g.48033887_48033910inv, g.(48018263_48023032)_(48032167_48032756)del, g.(48018263_48023032)_(48023203_48025749)del, g.48023097_48023098del, g.48025773dup, g.48025832del, g.48025860_48025861insT, g.48025884_48025885del, g.48025967dup.
MutL гомолог 1, рак толстой кишки, неполипозный тип 2 (E. coli) является белком, который у человека кодирован MLH1 геном, расположенным на хромосоме 3. Он является геном, обычно связанным с наследственным неполипозным колоректальным раком.
Примеры мутаций в MSH6 включают, но не ограничены ими, g.37089113_37089115del, g.37089175del, g.37090379_37090393del, g.37038201_37038202del, g.37042531_37042542del, g.37053339_37053355del, g.37053354del, g.37053590_37053591insT, g.37034841_37092337del, g.(?_37034841)_(37092337_?)del, g.(?_37034841)_(37061955_37067127)del, g.(?_37034841)_(37035155_37038109)del, g.(?_37034841)_(37035155_37038109)del, g.(?_37034841)_(37070424_37081676)del, g.(?_37034841)_(37083823_37089009)del, g.37034841_37083822del, g.(?_37034841)_(37038201_37042445)del, g.(?_37034841)_(37042545_37045891)del, g.37034841_37042544del, g.(?_37034841)_(37042545_37045891)del, g.(?_37034841)_(37042545_37045891)del, g.(?_37034841)_(37045966_37048481)del, g.(?_37034841)_(37050397_37053310)del, g.(?_37034841)_(37059091_37061800)del, g.37034658_37038806del, g.36961079_37138741del, g.37061923del, g.37061927del, g.37061933del, g.37061939del, g.37061942dup, g.37035140_37035141del, g.37070417del, g.37070417_37070418insT, g.37070419dup, g.37070422_37070423insT, g.37080355_37083368del, g.(37070424_37081676)_(37092337_?)del, g.(37070424_37081676)_(37081786_37083758)del, g.(37070424_37081676)_(37083823_37089009)del, g.37038148_37038151del, g.37038149del, g.37038149dup, g.37081690_37081691del, g.37081691_37081692del, g.37081706_37081708del, g.37081710_37081711del, g.37035053_37035066del, g.37038154del, g.37038154_37038157del, g.37081738_37081739del, g.37081740del, g.37081753dup, g.37081757_37081761dup, g.37081782_37081783insAAGT, g.37081787_37081793delinsATTT, g.(37081786_37083758)_(37083823_37089009)del, g.(37081786_37083758)_(37089175_37090007)del, g.37083759del, g.37083780dup, g.37083781_37083784del, g.37083781_37083784delCTCA, g.37083808_37083809del, g.37083816del, g.37086069_37089606del, g.37084092_37089247del, g.37084590_37089786del, g.(37083823_37089009)_(37092337_?)del, g.(37083823_37089009)_(37089175_37090007)del, g.37089010_37089174del, g.(37083823_37089009)_(37090509_37091976)del, g.37089023del, g.37089026_37089027del, g.37089027del, g.37089036del, g.37089036dup, g.37038168dup, g.37089042del, g.37089047del, g.37089050_37089053del, g.37089056_37089057del, g.37089061_37089062del, g.37089078_37089096del, g.37089090dup, g.37089099dup, g.37089107_37089110dup, g.37089109_37089110del, g.37089130_37089132del, g.37089130_37089132delAAG, g.37089131delinsTTCTT, g.37089133del, g.37089133delG, g.37089144del, g.37089155del, g.37089155_37089161del, g.37089158_37089161del, g.37089162_37089166del, g.37089171del, g.(37089175_37090007)_(37090101_37090394)del, g.37035056_37035072del, g.37090013del, g.37090015dup, g.37038183_37038184del, g.37090024_37090037dup, g.37090025_37090053dup, g.37090027dup, g.37038184dup, g.37090031_37090032insT, g.37090041del, g.37090057del, g.37090064_37090067del, g.37038188del, g.37090082del, g.37090086_37090087del, g.37090087_37090088del, g.37090097_37090101delinsC, g.37090099del, g.37038191dup, g.(37090101_37090394)_(37092337_?)del, g.37035057_37035073del, g.37090405dup, g.37090411_37090415del, g.37090414del, g.37038194del, g.37038198del, g.37090472_37090478del, g.37039445_37059613dup, g.37039760_37052440del, g.37090481_37090482del, g.37090483_37090484del, g.37090483_37092045del, g.37040732_37043185delinsACATAGTA, g.37042445_37042446del, g.(37038201_37042445)_(37042545_37045891)del, g.(37038201_37042445)_(37048555_37050304)del, g.(37038201_37042445)_(37050397_37053310)del, g.(37038201_37042445)_(37053591_37055922)del, g.37090497_37090498del, g.37090497_37090498delTC, g.37090504_37090507del, g.(37090509_37091976)_(37092337_?)del, g.(37090509_37091976)_(37092337_?)dup, g.37091977_37091978del, g.37091978_37091987del, g.37042448_37042451del, g.37091984_37091990del, g.37042451_37042453del, g.37092020_37092021del, g.37092022_37092068dup, g.37092027_37092028del, g.37092027_37092028dup, g.37092030dup, g.37092052_37092055del, g.37092054_37092055del, g.37092068_37092071dup, g.37092091dup, g.37092094_37092097delins(30), g.37092096_37092106del, g.37092097del, g.37092125_37092126delAA, g.37092125_37092126del, g.37092139_37092142dup, g.37092142dup, g.37035060dup, g.37042469_37042470del, g.37042470del, g.37042482dup, g.37042485del, g.37042499del, g.37042546dup, g.37044472_37046589del, g.37045648_37049941del, g.37045095_37054651del, g.37045072_37046861del, g.(37042545_37045891)_(37045966_37048481)del, g.(37042545_37045891)_(37092337_?)del, g.(37042545_37045891)_(37048555_37050304)del, g.(37042545_37045891)_(37050397_37053310)del, g.37045892_37050396del, g.37035069del, g.37045926del, g.37045931del, g.37045939_37045940dup, g.37045957_37045958del, g.37045963del, g.37035075del, g.37048067_37049287del, g.(37045966_37048481)_(37048555_37050304)del, g.(37045966_37048481)_(37050397_37053310)del, g.37048483del, g.37048483_37048503delinsT, g.37048486_37048487delinsGTT, g.37048489del, g.37048490del, g.37035076_37035077insCCCA, g.37035077_37035078dup, g.37048505_37048508del, g.37048521del, g.37048529dup, g.37035082dup, g.37049873_37052281del, g.37049839_37052249del, g.37049800_37052209del, g.37049640_37050445del, g.37050305_37050396del, g.(37048555_37050304)_(37050397_37053310)del, g.37050305_37050396del, g.37050319_37050320del, g.37050339del, g.37050348del, g.37050353_37050354del, g.37050354dup, g.37050364del, g.37050375_37050376insGA, g.37035090del, g.37050382_37050383delinsAT, g.37050382_37050383delinsCT, g.37050390_37050396del, g.37052950_37060990del, g.(37050397_37053310)_(37067499_37070274)dup, g.(37050397_37053310)_(37053591_37055922)del, g.(37050397_37053310)_(37056036_37058996)del, g.37053353del, g.37053510_37053511del, g.37035099del, g.37053545_37053546insT, g.37053562del, g.37053578del, g.37053578dup, g.37053585del, g.37053586_37053589del, g.37053591del, g.37053590_37053591delinsAT, g.37055920_37055921del, g.37055914_37055938del, g.(37053591_37055922)_(37070424_37081676)del, g.(37053591_37055922)_(37083823_37089009)del, g.(37053591_37055922)_(37059091_37061800)del, g.37035105del, g.37055928dup, g.37035106_37035116del, g.37055938del, g.37035108del, g.37055972_37055975del, g.37055976_37055979del, g.37035111del, g.37055990dup, g.37035114del, g.37035116del, g.37056036del, g.37056037dup, g.37058993_37059001del, g.(37056036_37058996)_(37070424_37081676)del, g.(37056036_37058996)_(37059091_37061800)del, g.37058997_37059000del, g.37059014_37059017del, g.37059017_37059021del, g.37059027_37059030dup, g.37035122del, g.37059062_37059063insT, g.37059065_37059066del, g.37059066del, g.37059066dup, g.37059072_37059073del, g.37059072_37059073dup, g.37059090_37059093del, g.37061595_37061913del, g.37061308_37066756del, g.37061207_37063077del, g.(37059091_37061800)_(37092337_?)del, g.(37059091_37061800)_(37061955_37067127)del, g.37061801_37061954del, g.(37059091_37061800)_(37083823_37089009)del, g.37061803dup, g.37061804del, g.37061817del, g.37061837_37061838dup, g.37061844del, g.37061851dup, g.37061855dup, g.37061870del, g.37061904_37061906del, g.37061910del, g.37035047del, g.[37049179_37051317delinsTG;37051667_37054327delinsCA].
Человеческие PMS2 родственные гены расположены на дисках 7p12, 7p13, 7q11 и 7q22. Экзоны 1-5 этих гомологов разделяют высокую степень идентичности с человеческим PMS2. Продукт этого гена вовлечен в репарацию ошибочно спаренных оснований ДНК. Белок образует гетеродимер с MLH1, и этот комплекс взаимодействует с MSH2, связанным с ошибочно спаренными основаниями. Дефекты в этом гене связаны с наследственным неполипозным колоректальным раком, с синдромом Турко, и вызывают супратенториальные примитивные нейроэктодермальные опухоли.
Примеры мутаций в PMS2 включают, но не ограничены ими, g.(?_6012870)_(6048737_?)del, g.6012870_6048737del, g.(6027252_6029430)_(6048737_?)del, g.(6045663_6048627)_(6048737_?)del, g.6029554del, g.6029499dup, g.6029495_6029496del, g.6029462_6029463delinsTAAA, g.5992485_6028601del, g.(6018328_6022454)_(6027252_6029430)del, g.(6013174_6017218)_(6027252_6029430)del, g.6027226_6027227ins(20), g.6027175del, g.6027090dup, g.6036705_6044207delinsCG, g.6026666dup, g.6026628del, g.6043671del, g.6026565dup, g.6026565dupT, g.6018315_6018316del, g.6018306_6018310del, g.6018306_6018310delAGTTA, g.6043633_6043634dup, g.6018256_6018259del, g.6015623_6017501del, g.6016429_6017479del, g.6017300_6017303del, g.6045579_6045674delinsATTT, g.(6043690_6045522)_(6045663_6048627)del, g.(?_6012870)_(6042268_6043320)del, g.(6035265_6036956)_(6042268_6043320)del, g.6038283_6039384del, g.6038901del, g.6038851dup, g.(6035265_6036956)_(6037055_6038738)del, g.6037019_6037024delinsCTTCACACACA, g.6036980del, g.6036958dup, g.6035323_6035324insJN866832.1, g.(6022623_6026389)_(6035265_6036956)del, g.(6031689_6035164)_(6035265_6036956)del, g.6035204_6035207del, g.6035205_6035206del, g.(?_6012870)_(6031689_6035164)del, g.(6027252_6029430)_(6031689_6035164)del, g.(6029587_6031603)_(6031689_6035164)del, g.6028725_6029882del, g.(?_6012870)_(6029587_6031603)del.
В данном изобретении представлен способ лечения пациентов с синдромом Линча для снижения вероятности развития или лечения рака, вызванного синдромом Линча, путем введения субъекту эффективного количества одного или нескольких описанных соединений или их фармацевтически приемлемой соли или соответствующей фармацевтической композиции.
Синдром Линча является наследственным заболеванием, вызванным мутацией в гене репараций ошибочно спаренных оснований, при котором у пораженных людей выше, чем обычно, вероятность развития колоректального рака, рака эндометрия и различных других агрессивных форм рака, часто в молодом возрасте, также называемым наследственным неполипозным раком толстой кишки (HNPCC).
Мутации специфических генов репарации ошибочно спаренных оснований (MMR), включающие, но не ограниченные ими, делеции MLH1, MSH2, MSH6, PMS2 и EPCAM-TACSTD1, ответственны за синдром Линча. Эти гены исправляют ошибки, допущенные при копировании ДНК при подготовке к делению клеток. Дефекты в генах препятствуют восстановлению ошибок ДНК, и, поскольку клетки делятся, ошибки суммируются и неконтролируемый рост клеток может привести к раку.
Пациенты с синдромом Линча имеют до 85% риск заражения раком толстой кишки, а также выше, чем средний, риск развития рака эндометрия, рака желудка, рака поджелудочной железы, рака почки/мочеточника, рака гепатобилиарного тракта, рака желудка, рака простаты, рака яичников, рака желчного пузыря, рака головного мозга, рака тонкой кишки, рака молочной железы и рака кожи.
Таким образом, в одном варианте описанного способа, способ представляет собой способ лечения рака, вызванного синдромом Линча, выбранного из группы, состоящей из рака толстой кишки, рака эндометрия, рака желудка, рака поджелудочной железы, рака почки/мочеточника, рака гепатобилиарного тракта, рака желудка, рака простаты, рака яичников, рака желчного пузыря, рака головного мозга, рака тонкой кишки, рака молочной железы и рака кожи.
В еще одном варианте способ представляет собой способ лечения аутоиммунного заболевания. Типовые аутоиммунные заболевания включают красную волчанку; синдром Вискотта-Олдрича; аутоиммунный лимфопролиферативный синдром; миастению гравис; ревматоидный артрит (РА); волчаночный нефрит; рассеянный склероз; системную красную волчанку; дискоидную волчанку; подострую кожную красную волчанку; кожную красную волчанку, включая ознобленную волчанку; хронический артрит; синдром Шегрена; воспалительный хронический риносинусит; колит; целиакию; воспалительное заболевание кишечника; пищевод Барретта; воспалительный гастрит; аутоиммунный нефрит; аутоиммунный васкулит; аутоиммунный гепатит; аутоиммунный кардит; аутоиммунный энцефалит; аутоиммунный диабет; аутоиммунный диабет нефрит; псориаз; болезнь «трансплантат против хозяина» (GvHD); и аутоиммунное медиированное гематологическое заболевание.
В одном аспекте этого варианта способ представляет собой способ лечения иммунодефицита, выбранного из группы, состоящей из аутоиммунного лимфопролиферативного синдрома (ALPS), аутоиммунного полигландулярного синдрома типа 1 (APS-1), болезни BENTA, состояния дефицита каспазы восемь (CEDS), хронической гранулематозной болезни (CGD), общего вариабельного иммунодефицита (CVID), синдромов наследственного агранулоцитоза, дефицит CTLA4, дефицита DOCK8, дефицита GATA2, нарушений гликозилирования с иммунодефицитом, синдрома гипериммуноглобулина E (HIES), синдромов гиперимуноглобулина M (Hyper-IgM), нарушения адгезии лейкоцитов (LAD), дефицита LRBA, PI3 киназной болезни, дефицита PLCG2-ассоциированного антитела и иммунной дисрегуляции (PLAID), тяжелого комбинированного иммунодефицита (SCID), болезни мутации с приобретением функции STAT3, кожных наростов, гипогаммаглобулинемии, инфекций и синдрома миелокатексиса (WHIMS), X-связанной агаммаглобулинемии (XLA), X-связанной лимфопролиферативной болезни (XLP) и XMEN болезни.
Используемый здесь термин «иммунодефицит» относится к состоянию, при котором часть или некоторые части клеточных компонентов, составляющих иммунную систему, являются дефектными или дисфункциональными так, что нормальный иммунный механизм нарушен. Другими словами, «иммунодефицит» означает состояние, при котором: врожденный иммунитет и/или приобретенный иммунитет подавляются и/или уменьшаются. В некоторых вариантах субъектом с иммунодефицитом является субъект с ослабленным иммунитетом. Не ограничивающие примеры иммунодефицита могут включать СПИД, гипогаммаглобулинемию, агаммаглобулинемию, дефицит гранулоцитов, хроническое гранулематозное заболевание, асплению, ТКИД, недостаточность комплемента и/или серповидно-клеточную анемию.
В другом аспекте этого варианта способом является способ лечения нейродегенеративного расстройства, выбранного из группы, состоящей из рассеянного склероза, болезни Паркинсона (БП), болезни Альцгеймера (БА), дентаторубро-паллидолюисовой атрофии (DRPLA), болезни Хантингтона (БХ), спинально-церебеллярной атаксии типа 1 (SCA1), спинально-церебеллярной атаксии типа 2 (SCA2), спинально-церебеллярной атаксии типа 3 (SCA3), спинально-церебеллярной атаксии типа 6 (SCA6), спинально-церебеллярной атаксии типа 7 (SCA7), спинально-церебеллярной атаксии типа 8 (SCA8), спинально-церебеллярной атаксии типа 12 (SCA12), спинально-церебеллярной атаксии типа 17 (SCA17), спинобульбарной мышечной атаксии/болезни Кеннеди (SBMA), синдрома хрупкой Х-хромосомы (FRAXA), олигофрения хрупкой XE-хромосомы (FRAXE) и миотонической дистрофии (DM).
«Субъектом» является млекопитающее, предпочтительно человек, но также может быть животное, нуждающееся в ветеринарном лечении, например, домашние животные (например, собаки, кошки и подобные), сельскохозяйственные животные (например, коровы, овцы, свиньи, лошади и подобные) и лабораторные животные (например, крысы, мыши, морские свинки и подобные).
В некоторых вариантах способы, описанные здесь, дополнительно включают совместное введение эффективного количества ингибитора восстановления ДНК, ингибитора ответа на повреждение ДНК (DDR), агента, повреждающего ДНК или иммуномодулирующего агента субъекту, лечимому от рака, в дополнение к эффективному количеству описанного ингибитора RAD51.
Термин «ингибитор восстановления ДНК» относится к любому агенту, который нацелен на компоненты/процессы, которые клетка использует для восстановления мутаций или изменений в ДНК и восстановления ДНК до ее первоначального состояния, и предотвращает восстановление ДНК. Примеры ингибиторов восстановления ДНК включают: ингибиторы RPA, ингибиторы APE1, ингибиторы ДНК-лигазы, ингибиторы ДНК-полимеразы, ингибиторы Parp и т.д.
Термин «ингибитор ответа на повреждение ДНК» относится к любому агенту, который нацелен на компоненты/процессы, участвующие в обнаружении повреждений ДНК, сигнализирующие о наличии повреждения ДНК и/или способствующие восстановлению повреждения ДНК. Примеры ингибиторов ответа на повреждение ДНК включают ингибиторы контрольных точек, ингибиторы ATM и ATR, ингибиторы ДНК-ПК и т.д.
Термин «агент, повреждающий ДНК» относится к любому агенту, который прямо или косвенно повреждает ДНК, для которого гомологичная рекомбинация может восстановить повреждение. Повреждающие ДНК агенты выбирают из группы, состоящей из: воздействия химического вещества, повреждающего ДНК; воздействия химиотерапевтического агента; воздействия радиохимиотерапии и воздействия ионизирующего или ультрафиолетового излучения. Конкретные примеры повреждающих ДНК химиотерапевтических агентов включают алкилатирующие агенты, нитрозомочевины, антиметаболиты, растительные алкалоиды, растительные экстракты и радиоизотопы. Конкретные примеры химиотерапевтических агентов также включают ДНК-повреждающие лекарственные средства, например, 5-фторурацил (5-FU), капецитабин, S-1 (Тегафур, 5-хлор-2,4-дигидроксипиридин и оксоновую кислоту), 5-этинилурацил, арабинозилцитозин (ara-C), 5-азацитидин (5-AC), 2',2'-дифтор-2'-дезоксицитидин (dFdC), пуриновые антиметаболиты (меркаптопурин, азатиопурин, тиогуанин), гемцитабин гидрохлорин (Гемзар), пентостатин, аллопуринол, 2-фторабинозиладенин (2F-ара-А), гидроксимочевину, иприт (бисхлорэтигилсульфид), мехлорэтамин, мелфалан, хлорамбуцил, циклофосфамид, ифосфамид, тиотепа, AZQ, митомицин C, диангидрогалактит, дибромдуцит, алкилсульфонат (бусульфан), нитрозомочевины (BCNU, CCNU, антацин, 4-метил CCNU), прокарбазин, декарбазин, ребеккамицин, антрациклины, такие как доксорубицин (адриамицин; ADR), даунорубицин (Церубицин), идарубицин (Идамицин) и эпирубицин (Элленц), аналоги антрациклина, такие как митоксантрон, актинимицин D, неинтеркалирующие ингибиторы топоизомеразы, такие как эпиподофиллотоксины (этопозид или VP16, тенипозид или VM-26), подофилотоксин, блеомицин (Блео), пеплеомицин, соединения, которые образуют аддукты с нуклеиновой кислотой, включая производные платины, например, цисплатин (CDDP), транс аналог цисплатина, карбоплатин, ипроплатин, тетраплатин и оксалиплатин, а также камптотецин, топотекан, иринотекан (СРТ-11) и SN-38. Конкретные примеры лечения, повреждающего нуклеиновые кислоты, включают облучение, например, ультрафиолетовое (УФ), инфракрасное (ИК), или альфа-, бета-, или гамма-излучение, а также экологический шок, например, гипертермию.
«Иммуномодулирующий агент» означает агент, который модулирует иммунный ответ на антиген, но не является антигеном или не получен из антигена. «Модулирование» в данном описании относится к индукции, усилению, подавлению, направлению или перенаправлению иммунного ответа. Такие агенты включают иммуностимулирующие агенты, такие как адъюванты, которые стимулируют (или усиливают) иммунный ответ на антиген, но не являются антигеном или получены из антигена. Существует несколько различных типов иммуномодулирующих агентов, которые включают, но не ограничиваются ими, агонисты Toll-подобного рецептора (TLR) и антагонисты Toll-подобного рецептора (TLR). Такие агенты также включают иммунодепрессанты. Иммуномодулирующий агент выбирают из группы, состоящей из модуляторов иммунной контрольной точки, агонистов Toll-подобного рецептора (TLR), клеточной терапии, цитокинов и противораковых вакцин.
В определенных вариантах, у субъекта определен повышенный уровень и/или активность процесса повреждения ДНК или фермента редактирования ДНК. В одном аспекте этого варианта, фермент редактирования ДНК выбран из группы, состоящей из индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID или AICDA), APOBEC2, APOBEC3A, APOBEC3C, APOBEC3D, APOBEC3F, APOBEC3G, APOBEC3H, APOBEC4, топоизомеразы типа 1, топоизомеразы типа 2, гена, активирующего рекомбинацию 1 (RAG 1) и гена, активирующего рекомбинацию 2 (RAG2).
В определенных вариантах было определено, что клетки крови, полученные от субъекта, имеют определяемый уровень индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID).
В определенных вариантах было определено, что В-клетки, полученные от субъекта, имеют определяемый уровень индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID).
В некоторых вариантах определяемый уровень индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID) статистически значительно выше, чем уровень AID, экспрессируемого в неактивированных B-клетках или нормальных неиммунных клетках здорового субъекта.
Способы введения и дозированные формы
Точное количество соединения, вводимого для обеспечения «эффективного количества» субъекту, зависит от способа введения, типа и тяжести заболевания и от характеристик субъекта, таких как общее состояние здоровья, возраст, пол, масса тела и переносимость лекарственных средств. Специалист в данной области сможет определить подходящие дозы в зависимости от этих и других факторов. При введении в сочетании с другими терапевтическими агентами, например, при введении в сочетании с противораковым агентом, «эффективное количество» любого дополнительного терапевтического агента(ов) будет зависеть от типа используемого лекарственного средства. Подходящие дозы известны для одобренных терапевтических агентов и могут быть скорректированы специалистом в данной области техники в соответствии с состоянием субъекта, типом лечимого состояния(ий) и количеством используемого соединения в соответствии с данным изобретением, следуя, например, дозам, описанным в литературе, и рекомендованным в Physician’s Desk Reference (57th ed., 2003).
Термин «эффективное количество» означает количество которое при введении субъекту дает полезные или желаемые результаты, включая клинические результаты, например, ингибирует, подавляет или уменьшает симптомы лечимого состояния у субъекта, по сравнению с контролем. Например, терапевтически эффективное количество может быть дано в единичной дозированной форме (например, от 0,1 до 50 г в день или от 1 до 5 г в день).
Термины «вводить», «вводимый», «введение» и подобные, используемые здесь, относятся к способам, которые могут использоваться для обеспечения доставки композиций к желаемому участку биологического действия. Эти способы включают, но не ограничены ими, внутрисуставные (в суставы), внутривенные, внутримышечные, внутриопухолевые, внутрикожные, внутрибрюшинные, подкожные, пероральные, местные, интратекальные, ингаляционные, чрезкожные, ректальные и подобные. Методы введения, которые могут применяться для агентов и способов, описанных здесь, найдены в, например, Goodman and Gilman, The Pharmacological Basis of Therapeutics, current ed.; Pergamon; and Remington’s, Pharmaceutical Sciences (current edition), Mack Publishing Co., Easton, Pa.
Кроме того, описанные ингибиторы RAD51 могут быть введены совместно с другими терапевтическими агентами. Используемые здесь термины «совместное введение», «вводимый в сочетании с» и их грамматические эквиваленты предназначены для охвата введения двух или более терапевтических агентов одному субъекту и включают схемы лечения, в которых агенты вводятся одинаковыми или разными путями введения или в одно и то же или в разное время. В некоторых вариантах одно или несколько соединений, описанных здесь, вводят совместно с другими агентами. Эти термины включают введение субъекту двух или более агентов, так что оба агента и/или их метаболиты присутствуют у субъекта одновременно. Они включают одновременное введение в отдельных композициях, введение в разное время в отдельных композициях и/или введение в композиции, в которой присутствуют оба агента. Таким образом, в некоторых вариантах, соединения, описанные здесь, и другой агент(ы) вводят в одной композиции. В некоторых вариантах, соединения, описанные здесь, и другой агент(ы) смешивают в композиции.
Конкретный способ введения и режим дозирования будут выбираться лечащим врачом с учетом особенностей конкретного случая (например, субъекта, заболевания, состояния заболевания, конкретного лечения). Лечение может включать ежедневные или многодневные или менее чем дневные (например, еженедельные или ежемесячные и т. д.) дозы в течение периода от нескольких дней до месяцев или даже лет. Однако специалист в данной области техники сразу же распознает подходящие и/или эквивалентные дозы, используя дозы одобренных композиций для лечения медиированного RAD51 заболевания с использованием описанных ингибиторов RAD51 в качестве руководства.
Соединения или соответствующие фармацевтические композиции, описанные здесь, могут быть введены пациенту в различных формах в зависимости от выбранного пути введения, как будет понятно специалистам в данной области. Соединения в соответствии с данным изобретением могут вводиться, например, перорально, парентерально, буккально, сублингвально, назально, ректально, пластырем, помпой или чрескожным введением, и фармацевтические композиции составляются соответствующим образом. Парентеральное введение включает внутривенный, внутрибрюшинный, подкожный, внутримышечный, трансэпителиальный, назальный, внутрилегочный, интратекальный, ректальный и местный способы введения. Парентеральное введение может осуществляться путем непрерывной инфузии в течение выбранного периода времени.
Фармацевтическая композиция в соответствии с данным изобретением составлена так, чтобы быть совместимой с предполагаемым путем введения. В одном варианте композиция составлена в соответствии с обычными методами в виде фармацевтической композиции, адаптированной для внутривенного, подкожного, внутримышечного, перорального, интраназального или местного введения человеку. В предпочтительных вариантах фармацевтическая композиция составлена для внутривенного введения.
Как правило, для перорального терапевтического введения соединение в соответствии с данным изобретением может быть объединено с эксципиентом и использовано в форме глотаемых таблеток, буккальных таблеток, пастилок, капсул, эликсиров, суспензий, сиропов, вафель и подобных.
Обычно для парентерального введения растворы соединения в соответствии с данным изобретением обычно готовят в воде, подходящим образом смешанной с поверхностно-активным веществом, таким как гидроксипропилцеллюлоза. Дисперсии также могут быть приготовлены в глицерине, жидких полиэтиленгликолях, ДМСО и их смесях с или без спирта и в маслах. В обычных условиях хранения и использования эти препараты содержат консервант для предотвращения роста микроорганизмов.
Как правило, для инъекций подходят стерильные водные растворы или дисперсии и стерильные порошки соединения, описанного здесь, для немедленного приготовления стерильных инъекционных растворов или дисперсий.
ПРИМЕРЫ
Аббревиатуры:
Пример 1. Синтез (S)-(1-метилпирролидин-2-ил)метил (4-(2-(4-((бензилкарбамоил)окси)пиперидин-1-ил)тиазол-5-ил)-3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)карбамат
Схема 1:
Общий способ D получения соединения сульфонамида 12.
К раствору 5-амино-2-(2-бромтиазол-5-ил)-N-трет-бутилбензолсульфонамида (5 г, 12,8 ммоль, 1 экв.) в ДХМ (30 мл) добавляют ДМАП (156 мг, 1,3 ммоль, 0,1 экв.) и Ac2O (1,96 г, 19,2 ммоль, 1,5 экв.). Смесь перемешивают при 20°C в течение 1 ч и затем промывают 1M HCl (50 мл) и насыщ. водн. Na2CO3 (50 мл). Органический слой сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=5:1-2:1) с получением N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]ацетамида (1,5 г, 3,5 ммоль, 27% выход) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 433,9/431,9
Общий способ A получения соединения сульфонамида 13.
К раствору N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]ацетамида (700 мг, 1,6 ммоль, 1 экв.) в ДМФ (20 мл) добавляют K2CO3 (448 мг, 3,3 ммоль, 2 экв.) и пиперидин-4-ол (246 мг, 2,4 ммоль, 1,5 экв.). Смесь перемешивают при 100°C в течение 12 ч и затем выливают в H2O (100 мл). Водную фазу экстрагируют EtOAc (50 мл x 3), объединенные органические слои промывают насыщенным раствором соли (100 мл), сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=1:2) с получением N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-(4-гидрокси-1-пиперидил)тиазол-5-ил]фенил]ацетамида (550 мг, 1,2 ммоль, 13,2% выход) в виде желтого твердого вещества, 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=8,26 (дд, J=2,2, 8,6 Гц, 2H), 7,93 (д, J=2,4 Гц, 1H), 7,37 (д, J=8,4 Гц, 1H), 7,31 (с, 1H), 4,02-3,94 (м, 1H), 3,88-3,80 (м, 2H), 3,30 (ддд, J=3,5, 9,2, 13,1 Гц, 2H), 2,21 (с, 3H), 2,03-1,95 (м, 2H), 1,67 (дтд, J=4,0, 8,7, 13,0 Гц, 2H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 453,1
Общий способ F получения соединения сульфонамида 15
[1-[5-[4-ацетамидо-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-бензилкарбамат (380 мг, 649 мкмоль, 1 экв.) растворяют в HCl/MeOH (4 M, 20 мл) и смесь перемешивают при 20°C в течение 1 ч. Смесь концентрируют, разбавляют насыщ. водн.Na2CO3 (20 мл) и экстрагируют EtOAc(20 мл x 3). Объединенные органические слои промывают насыщенным раствором соли (20 мл), сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=10:1-1:1) с получением [1-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-бензилкарбамата (300 мг, 552 мкмоль, 85% выход) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 544,2
Общий способ H получения Примера 1
К раствору [(2S)-1-метилпирролидин-2-ил]метанола (42 мг, 367 мкмоль, 2 экв.) и ДИЭА (71,11 мг, 550 мкмоль, 3 экв.) в MeCN (5мл) добавляют раствор [1-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[(4-нитрофенокси)карбониламино]фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-бензилкарбамата (130 мг, 184 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (2 мл) и смесь кипятят с обратным холодильником в течение 1 ч. Смесь концентрируют, и остаток очищают преп-ВЭЖХ с получением (S)-(1-метилпирролидин-2-ил)метил (4-(2-(4-((бензилкарбамоил)окси)пиперидин-1-ил)тиазол-5-ил)-3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)карбамата (19,87 мг, 28,8 мкмоль, 15,7% выход, 99,3% чистота) в виде бледно-желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,06 (с, 1H), 8,26 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,71 (т, J=6,2 Гц, 1H), 7,60 (дд, J=2,3, 8,5 Гц, 1H), 7,37-7,14 (м, 7H), 6,94 (с, 1H), 4,81-4,71 (м, 1H), 4,16 (шд, J=6,2 Гц, 2H), 4,10-4,03 (м, 1H), 4,02-3,96 (м, 1H), 3,73-3,63 (м, 2H), 3,28 (шс, 2H), 2,94-2,87 (м, 1H), 2,44-2,37 (м, 1H), 2,30 (с, 3H), 2,18-2,05 (м, 1H), 1,99-1,82 (м, 3H), 1,68-1,52 (м, 5H), 1,12-1,03 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 685,2
Пример 2. Синтез [1-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[[(2R)-1-метилпирролидин-2-ил]метоксикарбониламино]фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-бензилкарбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 16.
[1-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[[(2R)-1-метилпирролидин-2-ил]метоксикарбониламино]фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-бензилкарбамат . 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,07 (с, 1H), 8,29 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,73 (т, J=6,2 Гц, 1H), 7,63 (дд, J=2,3, 8,5 Гц, 1H), 7,39-7,19 (м, 7H), 6,94 (с, 1H), 4,80 (тд, J=4,1, 8,0 Гц, 1H), 4,20 (шд, J=6,1 Гц, 2H), 4,14-4,07 (м, 1H), 4,06-3,99 (м, 1H), 3,72 (шд, J=13,6 Гц, 2H), 3,29-3,22 (м, 2H), 2,98-2,92 (м, 1H), 2,45-2,41 (м, 1H), 2,33 (с, 3H), 2,22-2,13 (м, 1H), 2,02-1,79 (м, 3H), 1,72-1,56 (м, 5H), 1,20-1,03 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 685,2
Пример 3. Синтез [1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-изопропилкарбамат
Схема 2:
Получение соединения 23.
Общий способ A, 1-бензил-3-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-(4-гидрокси-1-пиперидил)тиазол-5-ил]фенил]мочевина. ИЭР [M+H] = 544,1
Получение пр. 3.
К раствору 1-бензил-3-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-(4-гидрокси-1-пиперидил)тиазол-5-ил]фенил]мочевины (50 мг, 91,96 мкмоль, 1 экв.) в Тол. (2 мл), добавляют ДМАП (22,47 мг, 183,92 мкмоль, 2 экв.) и [изопропил(метил)азанилиден]метанон (78,26 мг, 919,62 мкмоль, 10 экв.). Смесь перемешивают при 100°C в течение 4 ч и затем концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (Петролейный эфир/EtOAc=1:3) и затем кислотной преп-ВЭЖХ с получением [1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил] N-изопропилкарбамата (28,31 мг, 99,2% чистота) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,29 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,71 (дд, J=2,0, 8,3 Гц, 1H), 7,43 (д, J=8,8 Гц, 1H), 7,35 (д, J=3,9 Гц, 5H), 7,27 (дт, J=2,7, 5,7 Гц, 1H), 4,98-4,93 (м, 1H), 4,43 (с, 2H), 3,90-3,59 (м, 5H), 2,19-2,07 (м, 2H), 1,99-1,86 (м, 2H), 1,22 (с, 9H), 1,16 (д, J=6,8 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 629,1
Пример 4. Синтез изопропил 4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(2-пиридилметилкарбамоиламино)фенил]тиазол-2-ил]пиперидин-1-карбоксилат
Схема 3:
Получение соединения 45
Общий способ D, 4-нитрофенил (4-бром-3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)карбамат. ИЭР [M+H] = 474,1
Общий способ E получения соединения сульфонамида 46.
К раствору 2-пиридилметанамина (352 мг, 3,3 ммоль, 5 экв.) и ДИЭА (84 мг, 650 мкмоль,1 экв.) в ДХМ (3 мл) добавляют раствор (4-нитрофенил) N-[4-бром-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамата (307 мг, 650 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (3мл). Смесь перемешивают при 25°C в течение 1 ч, затем разбавляют ДХМ (30 мл) и промывают H2O (20 мл x 2). Органический слой концентрируют, и остаток очищают преп-ТСХ (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=0:1) с получением 1-[4-бром-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-3-(2-пиридилметил)мочевины (180 мг, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 441,2/443,2
Получение соединения 47
Смесь 1-[4-бром-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-3-(2-пиридилметил)мочевины (140 мг, 317,21 мкмоль, 1 экв.), 4,4,5,5-тетраметил-2-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)-1,3,2-диоксаборолана (322,21 мг, 1,27 ммоль, 4 экв.), Pd(dppf)Cl2 (116,05 мг, 158,61 мкмоль, 0,5 экв.) и KOAc (93,39 мг, 951,64 мкмоль, 3 экв.) в диоксане (4 мл) дегазируют и продувают N2 3 раза, и затем смесь перемешивают при 80°C в течение 12 ч в атмосфере N2. Смесь концентрируют, и остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=1/0-1:1) с получением 1-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)фенил]-3-(2-пиридилметил)мочевины (50 мг, 89,37 мкмоль, 28,17% выход, 87,3% чистота). ИЭР [M+H] =489,4
Общий способ K получения соединения Пр. 4
Смесь 1-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)фенил]-3-(2-пиридилметил)мочевины (26,38 мг, 54,01 мкмоль, 1,2 экв.), изопропил 4-(5-бромтиазол-2-ил)пиперидин-1-карбоксилата (15 мг, 45,01 мкмоль, 1 экв.), Na2CO3 (9,54 мг, 90,02 мкмоль, 2 экв.), KF (7,85 мг, 135,04 мкмоль, 3 экв.) и Pd(PPh3)4 (5,20 мг, 4,50 мкмоль, 0,1 экв.) в H2O (0,1 мл)/EtOH (0,3 мл)/Тол. (0,3 мл) дегазируют и продувают N2 3 раза, и затем смесь перемешивают при 85°C в течение 12 ч в атмосфере N2. Реакционную смесь фильтруют и концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=1/2) и затем преп-ВЭЖХ (ТФК условия) с получением изопропил 4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(2-пиридилметилкарбамоиламино)фенил]тиазол-2-ил]пиперидин-1-карбоксилата (6,36 мг, 8,21 мкмоль, 18,24% выход, 94,07% чистота, ТФК) в виде бледно-желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,75 (шд, J=5,6 Гц, 1H), 8,53 (шт, J=7,9 Гц, 1H), 8,34 (д, J=2,0 Гц, 1H), 8,04 (шд, J=8,1 Гц, 1H), 7,92 (шт, J=6,5 Гц, 1H), 7,75 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,3, 8,4 Гц, 1H), 7,39 (д, J=8,3 Гц, 1H), 4,94-4,92 (м, 1H), 4,77 (с, 2H), 4,24 (шд, J=13,4 Гц, 2H), 3,31-3,25 (м, 1H), 3,02 (шс, 2H), 2,15 (шд, J=11,5 Гц, 2H), 1,76 (дкв, J=4,2, 12,3 Гц, 2H), 1,28 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 615,2
Пример 5. Синтез изопропил 4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилат
Схема 4:
Получение соединения 56
Общий способ A, трет-бутил 4-[5-[4-ацетамидо-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 538,2
Общий способ C получения соединения сульфонамида 57.
К раствору трет-бутил 4-[5-[4-ацетамидо-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилата (110 мг, 205 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (2 мл) добавляют ТФК (1 мл) и смесь перемешивают при 25°C в течение 30 мин. Смесь концентрируют с получением N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-(2-пиперазин-1-илтиазол-5-ил)фенил]ацетамида (80 мг, 183 мкмоль, 89,4% выход) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 438,2
Получение соединения 58
Общий способ D, изопропил 4-[5-[4-ацетамидо-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 524,1
Получение соединения 59
Общий способ F, изопропил 4-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 482,1
Получение соединения Пр. 5
Общий способ D, изопропил 4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,22 (д, J=2,1 Гц, 1H), 7,56 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,30 (д, J=8,3 Гц, 1H), 7,20 (с, 1H), 4,94-4,81 (м, 2H), 3,61-3,43 (м, 8H), 1,20 (дд, J=6,2, 14,5 Гц, 12H), 1,07 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 568,3
Пример 6. Синтез изопропил 4-[5-[4-(бензилоксикарбониламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилата
Схема 5:
Получение соединения Пр. 6
Общий способ D, изопропил 4-[5-[4-(бензилоксикарбониламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]пиперазин-1-карбоксилат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,33 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,68 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,45-7,27 (м, 7H), 5,21 (с, 2H), 4,94-4,88 (м, 1H), 3,68-3,51 (м, 8H), 1,27 (д, J=6,4 Гц, 6H), 1,19-1,11 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 616,3
Пример 7. Синтез транс-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(циклопентоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат
Схема 6:
Общий способ B получения соединения сульфонамида 83.
К смеси трет-бутил (транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил)карбамата (1,3 г, 3,6 ммоль, 2 экв.) и изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)фенил]карбамата (800 мг, 1,8 ммоль, 1 экв.) в диоксане (12 мл) и H2O (2 мл) добавляют Na2CO3 (579 мг, 5,5 ммоль, 3 экв.) и Pd(dppf)Cl2 (133 мг, 182 мкмоль, 0,1 экв.). Смесь перемешивают при 80°C в течение 12 ч в атмосфере N2 и затем концентрируют. Остаток разбавляют H2O (5 мл) и экстрагируют этилацетатом (5 мл x 3), сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=1:0-3:1) с получением транс-изопропил-N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамата (660 мг, неочищенное), в котором 60 мг очищают преп-ВЭЖХ (колонка: Agela Durashell C18 150X25 5 мк; подвижная фаза: [вода(0,04% NH3H2O)-АЦН]; B%: 60%-90%, 10 мин) с получением чистого соединения 83 (40,92 мг, 99,64% чистота) в виде белого твердого вещества для доставки. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,06 (с, 1H), 8,32 (д, J=2,1 Гц, 1H), 7,70-7,60 (м, 2H), 7,38 (д, J=8,4 Гц, 1H), 6,96 (с, 1H), 6,81 (шд, J=7,9 Гц, 1H), 4,99-4,87 (м, 1H), 3,27 (шс, 1H), 2,94-2,84 (м, 1H), 2,13 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 1,90 (шд, J=11,1 Гц, 2H), 1,63-1,49 (м, 2H), 1,39 (с, 9H), 1,33 (шд, J=14,4 Гц, 2H), 1,28 (д, J=6,4 Гц, 6H), 1,07 (с, 9H). ИЭР [M+H] =595,3
Получение соединения 84
Общий способ F, транс-изопропил N-[4-[2-(4-аминоциклогексил)тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 495,2
Получение пр. 7
Общий способ D, транс-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(циклопентоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,04 (с, 1H), 8,29 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,61-7,59 (м, 2H),7,35 (д, J=8,8 Гц, 1H), 7,00 (шд, J=7,9 Гц, 1H), 6,96-6,93 (м, 1H), 4,96-4,87 (м, 2H), 3,29-3,22 (м, 1H), 2,87 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,10 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 1,88 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 1,75 (шс, 2H), 1,61-1,48 (м, 8H), 1,36-1,27 (м, 2H), 1,25 (д, J=6,1 Гц, 6H), 1,04 (с, 9H). ИЭР [M+Na] = 629,3
Пример 8. Синтез [(2R)-1-метилпирролидин-2-ил]метил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 7:
Получение соединения 85
Общий способ D, транс-(4-нитрофенил) N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. ИЭР [M+H] = 660,2
Получение соединения Пр. 8
Общий способ H, [(2R)-1-метилпирролидин-2-ил]метил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,38 (с, 1H), 7,80-7,73 (м, 1H), 7,69 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,40 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,05-5,00 (м, 1H), 4,48 (шдд, J=3,0, 12,8 Гц, 1H), 4,21 (шдд, J=7,2, 12,6 Гц, 1H), 3,78-3,66 (м, 2H), 3,57-3,46 (м, 1H), 3,22 (тд, J=8,3, 11,2 Гц, 1H), 3,07-3,01 (м, 3H), 2,43-1,99 (м, 8H), 1,98-1,88 (м, 1H), 1,80-1,66 (м, 2H), 1,47 (кв, J=12,5 Гц, 2H), 1,34 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,20-1,12 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 636,2
Пример 9. Синтез изопропил (3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(2-((1S,4r)-4-(((((S)-1-метилпирролидин-2-ил)метокси)карбонил)амино)циклогексил)тиазол-5-ил)фенил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 85.
1H ЯМР (МЕТАНОЛ-d4, 400 МГц): δ=8,34 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,71 (с, 1H), 7,66 (дд, J=8,5, 2,1 Гц, 1H), 7,36 (д, J=8,4 Гц, 1H), 4,93-5,04 (м, 1H), 4,46 (дд, J=13,0, 2,9 Гц, 1H), 4,18 (дд, J=13,0, 7,1 Гц, 1H), 3,64-3,75 (м, 2H), 3,42-3,58 (м, 1H), 3,12-3,25 (м, 1H), 3,00-3,06 (м, 3H), 1,97-2,39 (м, 8H), 1,84-1,96 (м, 1H), 1,64-1,77 (м, 2H), 1,44 (кв, J=12,6 Гц, 2H), 1,31 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 636,3
Пример 10. Синтез транс-трет-бутил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Общий способ B, транс-трет-бутил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,4 Гц, 1H), 7,72-7,66 (м, 2H), 7,37-7,29 (м, 5H), 7,28-7,21 (м, 1H), 4,40 (с, 2H), 3,39 (шт, J=11,6 Гц, 1H), 2,98 (тт, J=3,4, 12,1 Гц, 1H), 2,25-2,17 (м, 2H), 2,04 (шд, J=11,5 Гц, 2H), 1,67 (дкв, J=2,9, 12,9 Гц, 2H), 1,44 (с, 9H), 1,41-1,32 (м, 2H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 642,3
Пример 11. Синтез [(2R)-1-метилпирролидин-2-ил]метил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 8:
Получение соединения 86
Общий способ F, транс-1-[4-[2-(4-аминоциклогексил)тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-3-бензил-мочевина. ИЭР [M+H] = 542,3
Получение соединения 87
Общий способ D, транс-(4-нитрофенил) N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат.
Получение пр. 11
Общий способ H, [(2R)-1-метилпирролидин-2-ил]метил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,30 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,79 (с, 1H), 7,70 (дд, J=2,3, 8,4 Гц, 1H), 7,42-7,31 (м, 5H), 7,27 (дт, J=2,6, 5,7 Гц, 1H), 4,54-4,41 (м, 3H), 4,21 (дд, J=7,1, 12,7 Гц, 1H), 3,79-3,66 (м, 2H), 3,52 (шт, J=11,6 Гц, 1H), 3,26-3,17 (м, 1H), 3,04 (с, 3H), 2,42-1,98 (м, 8H), 1,97-1,87 (м, 1H), 1,80-1,65 (м, 2H), 1,54-1,40 (м, 2H), 1,15 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 683,3
Пример 12. Синтез ((S)-1-метилпирролидин-2-ил)метил ((1r,4S)-4-(5-(4-(3-бензилуреидо)-2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 87.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,29 (д, J=2,3 Гц, 1H), 7,83-7,74 (м, 1H), 7,73-7,65 (м, 1H), 7,43-7,31 (м, 5H), 7,30-7,22 (м, 1H), 4,55-4,35 (м, 3H), 4,21 (шдд, J=7,1, 12,7 Гц, 1H), 3,79-3,61 (м, 2H), 3,58-3,42 (м, 1H), 3,23 (шс, 1H), 3,08-3,02 (м, 3H), 2,43-1,98 (м, 8H), 1,97-1,86 (м, 1H), 1,80-1,65 (м, 2H), 1,54-1,39 (м, 2H), 1,19-1,07 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 683,3
Пример 13. Синтез изопропил (S)-(4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(1-фенилэтил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил)карбамата
Схема 9:
Получение соединения 89
Общий способ D, 4-(изопропоксикарбониламино)бицикло[2,2,2]октан-1-карбоксилат.
Общий способ O получения соединения 90
К раствору метил 4-(изопропоксикарбониламино)бицикло[2,2,2]октан-1-карбоксилата (400 мг, 1,49 ммоль, 1 экв.) в MeOH (5 мл), добавляют LiOH (106,70 мг, 4,46 ммоль, 3 экв.) в H2O (5 мл), и смесь перемешивают при 50°C в течение 1 ч. Смесь концентрируют для удаления MeOH и затем экстрагируют МТБЭ (10 мл х 2). pH водной фазы доводят до 1-2 добавлением 4 N раствора HCl и затем экстрагируют EtOAc (10 мл х 3). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 4-(изопропоксикарбониламино)бицикло[2,2,2]октан-1-карбоновой кислоты (270 мг, неочищенное) в виде желтого твердого вещества, 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=4,86 (шд, J=6,4 Гц, 1H), 4,46 (шс, 1H), 2,00-1,80 (м, 12H), 1,23 (шд, J=5,9 Гц, 6H).
Общий способ N получения соединения 91
К раствору 4-(изопропоксикарбониламино)бицикло[2,2,2]октан-1-карбоновой кислоты (270 мг, 1,06 ммоль, 1 экв.) в ДХМ (5 мл), добавляют ДМФ (7,73 мг, 105,75 мкмоль, 0,1 экв.) и (COCl)2 (201,34 мг, 1,59 ммоль, 1,5 экв.). Смесь перемешивают при 26°C в течение 0,2 ч и затем концентрируют. Остаток растворяют в ТГФ (5 мл) и добавляют в NH3.H2O (741,24 мг, 5,29 ммоль, 5 экв.) в диоксане (5 мл) по каплям. Затем смесь перемешивают при 26°C в течение 0,3 ч. Смесь концентрируют и разбавляют EtOAc (20 мл) и промывают H2O (10 мл). Органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением изопропил N-(1-карбамоил-4-бицикло[2,2,2]октанил)карбамата в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=5,43 (шс, 1H), 5,17 (шс, 1H), 4,85-4,71 (м, 1H), 4,35 (шс, 1H), 1,82 (с, 12H), 1,13 (д, J=6,2 Гц, 6H). ИЭР[M+H]=255,2
Общий способ L получения соединения 92
К раствору изопропил N-(1-карбамоил-4-бицикло[2,2,2]октанил)карбамата (60 мг, 235,92 мкмоль, 1 экв.)в 2-Me-ТГФ (2 мл), добавляют 2,4-бис(4-метоксифенил)-2,4-дитиоксо-1,3,2,4-дитиадифосфетан (95,42 мг, 235,92 мкмоль, 1 экв.) и смесь перемешивают при 80°C в течение 0,5 ч. Смесь выливают в насыщ. водн. Na2CO3 (10 мл) и экстрагируют EtOAc (10 мл х 3). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (Петролейный эфир/Этилацетат=2:3) с получением изопропил N-(1-карбамотиоил-4-бицикло[2,2,2]октанил)карбамата (30 мг, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР[M+H]=271,1
Общий способ M получения соединения 93
К раствору изопропил N-(1-карбамотиоил-4-бицикло[2,2,2]октанил)карбамата (85 мг, 314,36 мкмоль, 1 экв.) в EtOH (2 мл), добавляют TsOH.H2O (119,59 мг, 628,72 мкмоль, 2 экв.) и 2-бром-1,1-диэтоксиэтан (123,90 мг, 628,72 мкмоль, 2 экв.). Смесь перемешивают при 80°C в течение 1 ч и затем концентрируют и разбавляют EtOAc (30 мл). Смесь промывают насыщ. водн. Na2CO3 (10 мл х 2), и объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют and концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (Петролейный эфир/Этилацетат=3:1) с получением изопропил N-(1-тиазол-2-ил-4-бицикло[2,2,2]октанил)карбамата (80 мг, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР[M+H]=295,3
Получение соединения 94
Общий способ J, изопропил N-[1-(5-бромтиазол-2-ил)-4-бицикло[2,2,2]октанил]карбамат. ИЭР[M+H]=375,2/373,2
Получение соединения 95
Общий способ B, изопропил N-[1-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-бицикло[2,2,2]октанил]карбамат. ИЭР [M+H] = 521,2
Получение соединения 96
Общий способ D, (4-нитрофенил) N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)-1-бицикло[2,2,2]октанил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 686,4
Получение пр. 13
Общий способ E, изопропил N-[1-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[[(1S)-1-фенилэтил]карбамоиламино]фенил]тиазол-2-ил]-4-бицикло[2,2,2]октанил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,21 (д, J=2,3 Гц, 1H), 7,75 (с, 1H), 7,67 (дд, J=2,3, 8,3 Гц, 1H), 7,41-7,32 (м, 5H), 7,29-7,23 (м, 1H), 4,99-4,93 (м, 1H), 4,83-4,76 (м, 1H), 2,17-2,08 (м, 6H), 2,07-1,99 (м, 6H), 1,51 (д, J=7,0 Гц, 3H), 1,22 (шд, J=6,0 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 668,3
Пример 14. Синтез изопропил (R)-(4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(1-фенилэтил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 96.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,18 (д, J=2,6 Гц, 1H), 7,74-7,69 (м, 1H), 7,64 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,38-7,29 (м, 5H), 7,26-7,19 (м, 1H), 4,92 (кв, J=7,0 Гц, 1H), 4,82-4,71 (м, 1H), 2,15-2,05 (м, 6H), 2,04-1,95 (м, 6H), 1,48 (д, J=7,0 Гц, 3H), 1,20 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 668,3
Пример 15. Синтез изопропил (S)-(4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(1-(пиридин-2-ил)этил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 96.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,72 (д, J=5,6 Гц, 1H), 8,46 (т, J=7,9 Гц, 1H), 8,28 (д, J=2,3 Гц, 1H), 8,02 (д, J=7,9 Гц, 1H), 7,85 (т, J=6,6 Гц, 1H), 7,72 (с, 1H), 7,63 (дд, J=2,3, 8,4 Гц, 1H), 7,35 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,13 (кв, J=7,1 Гц, 1H), 4,84-4,74 (м, 1H), 2,15-2,07 (м, 6H), 2,07-1,98 (м, 6H), 1,65 (д, J=7,1 Гц, 3H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 669,2
Пример 16. Синтез изопропил (R)-(4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(1-(пиридин-2-ил)этил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 96.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,75 (д, J=5,1 Гц, 1H), 8,57 (дт, J=1,5, 7,9 Гц, 1H), 8,29 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,11 (д, J=8,1 Гц, 1H), 7,98-7,90 (м, 1H), 7,75 (с, 1H), 7,62 (дд, J=2,3, 8,3 Гц, 1H), 7,36 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,15 (кв, J=7,1 Гц, 1H), 4,84-4,75 (м, 1H), 2,16-2,07 (м, 6H), 2,06-1,97 (м, 6H), 1,67 (д, J=7,2 Гц, 3H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 669,2
Пример 17. Синтез изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)-1-бицикло[2,2,2]октанил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 10:
Получение соединения Пр. 17
Общий способ B, изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)-1-бицикло[2,2,2]октанил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,33 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,74 (с, 1H), 7,66 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,36 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,03-4,91 (м, 1H), 4,78 (шд, J=6,4 Гц, 1H), 2,16-2,05 (м, 6H), 2,04-1,95 (м, 6H), 1,31 (д, J=6,4 Гц, 6H), 1,20 (шд, J=6,0 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] =607,3
Пример 18. Синтез изопропил (4-(5-(4-(3-бензилуреидо)-2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 94.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,26 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,77 (с, 1H), 7,72 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,38-7,33 (м, 5H), 7,27 (тд, J=2,6, 8,6 Гц, 1H), 4,80 (шд, J=5,7 Гц, 1H), 4,43 (с, 2H), 2,17-2,10 (м, 6H), 2,06-2,00 (м, 6H), 1,25-1,20 (м, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] =654,1
Пример 19. Синтез изопропил (4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(пиридин-2-илметил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 94.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,73 (д, J=5,7 Гц, 1H), 8,51 (дт, J=1,3, 7,9 Гц, 1H), 8,31 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,02 (д, J=8,3 Гц, 1H), 7,90 (т, J=6,8 Гц, 1H), 7,72 (с, 1H), 7,66 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,35 (д, J=8,3 Гц, 1H), 4,75 (с, 3H), 2,15-1,93 (м, 12H), 1,20 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,07 (с, 9H). ИЭР [M+H] =655,3
Пример 20. Синтез транс-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропилкарбамоилокси)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 11:
Получение соединения 111.
К раствору транс-4-гидроксициклогексанкарбоновой кислоты (1 г, 6,94 ммоль, 1 экв.) в MeCN (10 мл), добавляют ГБТУ (2,89 г, 7,63 ммоль, 1,1 экв.) и ТЭА (2,11 г, 20,81 ммоль, 2,90 мл, 3 экв.), затем добавляют NH4Cl (742,07 мг, 13,87 ммоль, 2 экв.) и смесь перемешивают при 26°C в течение 1 ч. Смесь затем фильтруют и сушат с получением транс-4-гидроксициклогексанкарбоксамида (1 г, неочищенное) в виде белого твердого вещества, которое может применяться без какой-либо очистки.
Получение соединения 112.
К раствору транс-4-гидроксициклогексанкарбоксамида (12 г, 83,81 ммоль, 1 экв.) в ДХМ (150 мл), добавляют ИМИДАЗОЛ (11,41 г, 167,62 ммоль, 2 экв.) и трет-бутилхлордифенилсилан (27,64 г, 100,57 ммоль, 25,83 мл, 1,2 экв.). Смесь перемешивают при 26°C в течение 12 ч и затем выливают в 1N HCl (200 мл), и органическую фазу промывают насыщ. водн. Na2CO3 (100 мл). Органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток промывают раствором (петролейный эфир:EtOAc=10:1, 100 мл) и затем фильтруют. Фильтровальную лепешку сушат с получением транс 4-[трет-бутил(дифенил)силил]оксициклогексанкарбоксамида (31,5 г, неочищенное). 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,72-7,64 (м, 4H), 7,49-7,36 (м, 6H), 3,69-3,55 (м, 1H), 2,21-2,08 (м, 1H), 1,96-1,83 (м, 2H), 1,82-1,69 (м, 2H), 1,50-1,23 (м, 4H), 1,12-0,98 (м, 9H).
Получение соединения 113.
Общий способ L, транс-4-[трет-бутил(дифенил)силил]оксициклогексанкарботиоамид. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,73-7,64 (м, 4H), 7,52-7,36 (м, 6H), 3,73-3,59 (м, 1H), 2,59-2,44 (м, 1H), 1,91 (шд, J=8,3 Гц, 2H), 1,80-1,66 (м, 2H), 1,57-1,35 (м, 4H), 1,08-1,04 (м, 9H). ИЭР [M+H] =398,1
Получение соединения 114.
Общий способ M, транс-третбутилдифенил(4-тиазол-2-илциклогексокси)силан. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,63-7,55 (м, 5H), 7,42-7,25 (м, 7H), 4,05-3,96 (м, 1H), 2,97 (тт, J=3,7, 11,7 Гц, 1H), 2,05 (дкв, J=3,2, 12,5 Гц, 2H), 1,84-1,62 (м, 4H), 1,44 (тт, J=2,9, 13,5 Гц, 2H), 1,01-0,98 (м, 9H). ИЭР [M+H] =422,2
Получение соединения 114A.
Общий способ J, транс[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексокси]-трет-бутилдифенилсилан (1,8 г, неочищенное). ИЭР [M+H] =502,0
Получение соединения 115.
К раствору транс[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексокси]трет-бутилдифенилсилана (1,5 г, 3,00 ммоль, 1 экв.) в ТГФ (10 мл), добавляют ФТБА (1 M, 4,49 мл, 1,5 экв.), и смесь перемешивают при 26°C в течение 12 ч и затем концентрируют. Остаток очищают хроматографией на силикагеле (Петролейный эфир/Этилацетат=20:1-1:1) с получением транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексанола (500 мг, 1,91 ммоль, 63,64% выход) в виде желтого твердого вещества.
Получение соединения 116.
К раствору транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексанола (500 мг, 1,91 ммоль, 1 экв.) в ДМФ (5 мл), добавляют 2-изоцианатопропан (486,93 мг, 5,72 ммоль, 3 экв.) и ДИЭА (739,47 мг, 5,72 ммоль, 3 экв.). Смесь перемешивают при 100°C в течение 40 ч и затем выливают в H2O (50 мл) и экстрагируют EtOAc (10 мл х 3). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на силикагеле (Петролейный эфир/Этилацетат=10:1-1:1) с получением транс-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил] N-изопропилкарбамата (180 мг, 518,33 мкмоль, 27,18% выход) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,61 (с, 1H), 3,85-3,64 (м, 2H), 3,15-2,99 (м, 1H), 1,98-1,83 (м, 6H), 1,73 (шд, J=13,5 Гц, 2H), 1,14-1,12 (м, 6H). ИЭР [M+H] =347,1/349,1
Получение пр. 20.
Общий способ B, транс-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропилкарбамоилокси)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,34 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,75 (с, 1H), 7,67 (дд, J=2,0, 8,4 Гц, 1H), 7,37 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,05-4,93 (м, 1H), 4,89 (шс, 1H), 3,83-3,64 (м, 1H), 3,15 (шс, 1H), 2,12-1,88 (м, 6H), 1,84-1,64 (м, 2H), 1,31 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,19-1,04 (м, 15H). ИЭР [M+H] =581,4
Пример 21. Синтез (1r,4r)-4-(5-(4-(3-бензилуреидо)-2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)тиазол-2-ил)циклогексилизопропилкарбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 116.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,74 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,40-7,28 (м, 5H), 7,28-7,17 (м, 1H), 4,89 (шс, 1H), 4,41 (с, 2H), 3,79-3,64 (м, 1H), 3,14 (шс, 1H), 2,04-1,94 (м, 6H), 1,84-1,65 (м, 2H), 1,16-1,08 (м, 15H). ИЭР [M+H] = 628,4
Пример 22. Синтез транс-изопропил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(4-пиридилметилкарбамоиламино)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 12:
Получение соединения 117.
Общий способ K, транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат, 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,68-7,57 (с, 1H), 7,43 (д, J=2,4 Гц, 1H), 7,13 (д, J=8,2 Гц, 1H), 6,82 (дд, J=2,4, 8,2 Гц, 1H), 4,84-4,77 (м, 1H), 3,44 (тт, J=3,9, 11,5 Гц, 1H), 2,97 (тт, J=3,6, 12,1 Гц, 1H), 2,26-2,13 (м, 2H), 2,11-2,02 (м, 2H), 1,67 (дкв, J=3,0, 12,9 Гц, 2H), 1,49-1,32 (м, 2H), 1,22 (дд, J=2,5, 6,7 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] =495,2
Получение соединения118.
Общий способ D, транс-(4-нитрофенил) N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 660,1
Получение пр. 22.
Общий способ E, транс-изопропил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(4-пиридилметилкарбамоиламино)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,79 (д, J=6,7 Гц, 2H), 8,34 (д, J=2,3 Гц, 1H), 8,07 (д, J=6,6 Гц, 2H), 7,76 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,3, 8,4 Гц, 1H), 7,39 (д, J=8,3 Гц, 1H), 4,85-4,83 (м, 1H), 4,73 (с, 2H), 3,47 (тт, J=3,6, 11,5 Гц, 1H), 3,04 (тт, J=3,4, 12,0 Гц, 1H), 2,30-2,19 (м, 2H), 2,09 (шд, J=10,1 Гц, 2H), 1,71 (дкв, J=3,0, 12,9 Гц, 2H), 1,43 (дкв, J=3,3, 12,6 Гц, 2H), 1,24 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] =629,2
Пример 23. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(4-фторбензил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,27 (д, J=2,3 Гц, 1H), 7,77 (с, 1H), 7,71 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,38 (тд, J=2,7, 8,6 Гц, 3H), 7,12-7,04 (м, 2H), 5,00-4,92 (м, 1H), 4,41 (с, 2H), 3,54-3,41 (м, 1H), 3,05 (тт, J=3,5, 12,0 Гц, 1H), 2,13-2,05 (м, 2H), 2,05-2,04 (м, 2H), 1,72 (дкв, J=3,0, 12,8 Гц, 2H), 1,43 (дкв, J=3,2, 12,5 Гц, 2H), 1,24 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 646,2
Пример 24. Синтез изопропил ((1R,4r)-4-(5-(2-(N-изопропилсульфамоил)-4-(3-((R)-1-фенилэтил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,20 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,73 (с, 1H), 7,64 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,38-7,29 (м, 5H), 7,26-7,19 (м, 1H), 4,94-4,89 (м, 1H), 4,81 (шд, J=6,2 Гц, 1H), 3,44 (тт, J=3,9, 11,6 Гц, 1H), 3,01 (тт, J=3,5, 12,0 Гц, 1H), 2,26-2,17 (м, 2H), 2,10-2,01 (м, 2H), 1,68 (дкв, J=2,9, 12,8 Гц, 2H), 1,48 (д, J=7,1 Гц, 3H), 1,43-1,33 (м, 2H), 1,21 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M+H] =642,3
Пример 25. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(пиридин-3-илметил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,84 (с, 1H), 8,74 (д, J=5,7 Гц, 1H), 8,60 (д, J=8,2 Гц, 1H), 8,30 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,04 (дд, J=5,8, 7,8 Гц, 1H), 7,72 (с, 1H), 7,65 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,36 (д, J=8,4 Гц, 1H), 4,85-4,77 (м, 1H), 4,60 (с, 2H), 3,44 (тт, J=3,9, 11,5 Гц, 1H), 3,10-2,93 (м, 1H), 2,28-2,17 (м, 2H), 2,13-2,01 (м, 2H), 1,69 (дкв, J=3,0, 12,8 Гц, 2H), 1,50-1,33 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 629,3
Пример 26. Синтез изопропил ((1S,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((S)-1-фенилэтил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,19 (д, J=2,4 Гц, 1H), 7,70 (с, 1H), 7,65 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,39-7,30 (м, 5H), 7,26-7,21 (м, 1H), 4,93 (кв, J=6,5 Гц, 1H), 4,83-4,81 (м, 1H), 3,49-3,40 (м, 1H), 3,05-2,96 (м, 1H), 2,22 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 2,06 (шд, J=11,5 Гц, 2H), 1,73-1,62 (м, 2H), 1,49 (д, J=6,8 Гц, 3H), 1,43-1,36 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,0 Гц, 6H), 1,10 (с, 9H). ИЭР[M+H] = 642,3
Пример 27. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(3-фторбензил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,27 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,74 (с, 1H), 7,71 (дд, J=2,3, 8,3 Гц, 1H), 7,40-7,32 (м, 2H), 7,18 (д, J=7,7 Гц, 1H), 7,10 (шд, J=9,9 Гц, 1H), 6,99 (дт, J=2,2, 8,5 Гц, 1H), 4,87 (шс, 1H), 4,44 (с, 2H), 3,47 (тт, J=3,8, 11,6 Гц, 1H), 3,02 (тт, J=3,5, 12,0 Гц, 1H), 2,24 (шд, J=12,2 Гц, 2H), 2,14-2,04 (м, 2H), 1,71 (дкв, J=3,0, 12,9 Гц, 2H), 1,50-1,36 (м, 2H), 1,24 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 646,2
Пример 28. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(2-фторбензил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,23 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,71 (с, 1H), 7,68 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,41 (дт, J=1,5, 7,6 Гц, 1H), 7,35 (д, J=8,4 Гц, 1H), 7,29 (ддт, J=1,8, 5,5, 7,7 Гц, 1H), 7,15 (дт, J=1,0, 7,6 Гц, 1H), 7,11-7,05 (м, 1H), 4,81 (шс, 1H), 4,46 (с, 2H), 3,45 (тт, J=3,7, 11,6 Гц, 1H), 3,00 (тт, J=3,5, 12,0 Гц, 1H), 2,27-2,18 (м, 2H), 2,06 (шд, J=10,1 Гц, 2H), 1,69 (дкв, J=3,1, 12,9 Гц, 2H), 1,46-1,34 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] =646,2
Пример 29. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(пиридин-2-илметил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,79-8,73 (м, 1H), 8,56 (дт, J=1,5, 7,9 Гц, 1H), 8,35 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,06 (д, J=8,1 Гц, 1H), 7,94 (т, J=6,4 Гц, 1H), 7,77 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,3, 8,4 Гц, 1H), 7,39 (д, J=8,3 Гц, 1H), 4,86-4,83 (м, 1H), 4,79 (с, 2H), 3,47 (тт, J=3,9, 11,6 Гц, 1H), 3,05 (тт, J=3,5, 12,0 Гц, 1H), 2,29-2,21 (м, 2H), 2,09 (шд, J=10,1 Гц, 2H), 1,71 (дкв, J=2,9, 12,8 Гц, 2H), 1,43 (дкв, J=3,3, 12,6 Гц, 2H), 1,24 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 629,3
Пример 30. Синтез изопропил ((1R,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((R)-1-(пиридин-2-ил)этил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,73 (д, J=5,7 Гц, 1H), 8,53 (дт, J=1,8, 7,9 Гц, 1H), 8,28 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,08 (д, J=8,3 Гц, 1H), 7,94-7,85 (м, 1H), 7,80-7,68 (м, 1H), 7,61 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,35 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,13 (кв, J=7,0 Гц, 1H), 4,85-4,78 (м, 1H), 3,49-3,39 (м, 1H), 3,08-2,96 (м, 1H), 2,22 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,06 (шд, J=10,1 Гц, 2H), 1,76-1,61 (м, 5H), 1,49-1,34 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14-1,02 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 643,3
Пример 31. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((3-фторпиридин-2-ил)метил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,42 (д, J=4,8 Гц, 1H), 8,28 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,78-7,62 (м, 3H), 7,44 (тд, J=4,4, 8,5 Гц, 1H), 7,38 (д, J=8,4 Гц, 1H), 4,86-4,81 (м, 1H), 4,65 (с, 2H), 3,47 (ддд, J=4,0, 7,7, 11,4 Гц, 1H), 3,10-3,00 (м, 1H), 2,25 (шд, J=12,1 Гц, 2H), 2,09 (шд, J=10,5 Гц, 2H), 1,72 (дкв, J=3,0, 12,9 Гц, 2H), 1,43 (дкв, J=3,2, 12,6 Гц, 2H), 1,24 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 647,2
Пример 32. Синтез изопропил ((1S,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((S)-1-(пиридин-2-ил)этил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,72 (д, J=5,3 Гц, 1H), 8,50 (дт, J=1,8, 7,9 Гц, 1H), 8,27 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,05 (д, J=8,3 Гц, 1H), 7,88 (т, J=6,6 Гц, 1H), 7,72 (с, 1H), 7,61 (дд, J=2,6, 8,3 Гц, 1H), 7,34 (д, J=8,8 Гц, 1H), 5,12 (кв, J=7,0 Гц, 1H), 4,87-4,68 (м, 1H), 3,51-3,38 (м, 1H), 3,01 (тт, J=3,3, 12,0 Гц, 1H), 2,21 (шд, J=11,8 Гц, 2H), 2,10-1,97 (м, 2H), 1,76-1,57 (м, 5H), 1,48-1,33 (м, 2H), 1,22 (д, J=6,1 Гц, 6H), 1,13-1,00 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 643,3
Пример 33. Синтез транс-4-пиперидилметил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 13:
Получение соединения 119.
Общий способ H, транс-трет-бутил 4-[[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамоилоксиметил]пиперидин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 736,5
Получение пр. 33.
Общий способ C, транс-4-пиперидилметил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,37 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,78 (с, 1H), 7,68 (шд, J=7,9 Гц, 1H), 7,40 (д, J=8,4 Гц, 1H), 4,86-4,78 (м, 1H), 4,11 (д, J=6,2 Гц, 2H), 3,50-3,39 (м, 3H), 3,11-2,96 (м, 3H), 2,23 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,13-1,98 (м, 5H), 1,70 (дкв, J=2,8, 12,8 Гц, 2H), 1,60-1,34 (м, 4H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M/2+H] = 318,6
Пример 34. Синтез изопропил ((1R,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(((((R)-1-метилпирролидин-2-ил)метокси)карбонил)амино)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,41 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,80-7,73 (м, 2H), 7,45 (д, J=8,4 Гц, 1H), 4,86-4,81 (м, 1H), 4,67 (дд, J=3,2, 12,8 Гц, 1H), 4,35 (дд, J=7,1, 12,8 Гц, 1H), 3,85-3,71 (м, 2H), 3,47 (тт, J=3,9, 11,6 Гц, 1H), 3,26 (тд, J=8,1, 11,5 Гц, 1H), 3,10 (с, 3H), 3,08-2,98 (м, 1H), 2,46-2,35 (м, 1H), 2,30-2,18 (м, 3H), 2,15-1,95 (м, 4H), 1,72 (дкв, J=3,1, 12,9 Гц, 2H), 1,43 (дкв, J=3,3, 12,6 Гц, 2H), 1,25 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 636,3
Пример 35. Синтез изопропил ((1S,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(((((S)-1-метилпирролидин-2-ил)метокси)карбонил)амино)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,41 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,80-7,71 (м, 2H), 7,44 (д, J=8,3 Гц, 1H), 4,86-4,79 (м, 1H), 4,67 (дд, J=3,2, 13,0 Гц, 1H), 4,40-4,31 (м, 1H), 3,87-3,66 (м, 2H), 3,47 (тт, J=3,8, 11,6 Гц, 1H), 3,26 (тд, J=8,3, 11,4 Гц, 1H), 3,10 (с, 3H), 3,04 (тт, J=3,4, 12,0 Гц, 1H), 2,48-2,33 (м, 1H), 2,30-2,16 (м, 3H), 2,15-1,92 (м, 4H), 1,72 (дкв, J=2,7, 12,8 Гц, 2H), 1,51-1,36 (м, 2H), 1,25 (шд, J=6,4 Гц, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M/2+H] = 318,6
Пример 36. Синтез изопропил ((1R,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(((((R)-пирролидин-2-ил)метокси)карбонил)амино)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,38 (шд, J=2,2 Гц, 1H), 7,75-7,66 (м, 2H), 7,41 (д, J=8,4 Гц, 1H), 4,81 (шс, 1H), 4,48 (шдд, J=3,4, 12,5 Гц, 1H), 4,33 (дд, J=7,8, 12,5 Гц, 1H), 3,93 (дкв, J=3,6, 8,0 Гц, 1H), 3,49-3,33 (м, 3H), 3,00 (ддд, J=3,5, 8,5, 12,0 Гц, 1H), 2,30-2,18 (м, 3H), 2,10-2,00 (м, 3H), 1,85 (квд, J=8,5, 12,9 Гц, 2H), 1,74-1,61 (м, 2H), 1,46-1,34 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M/2+H] = 311,6
Пример 37. Синтез изопропил ((1S,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(((((S)-пирролидин-2-ил)метокси)карбонил)амино)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,38 (д, J=1,8 Гц, 1H), 7,79-7,68 (м, 2H), 7,41 (д, J=8,2 Гц, 1H), 4,85-4,78 (м, 1H), 4,49 (дд, J=3,4, 12,5 Гц, 1H), 4,33 (дд, J=7,9, 12,3 Гц, 1H), 3,94 (дкв, J=3,4, 8,0 Гц, 1H), 3,49-3,40 (м, 1H), 3,40-3,33 (м, 2H), 3,08-2,97 (м, 1H), 2,31-2,19 (м, 3H), 2,17-2,00 (м, 4H), 1,85 (квд, J=8,5, 13,0 Гц, 1H), 1,75-1,62 (м, 2H), 1,46-1,35 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M/2+H] = 311,6
Пример 38. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(((оксетан-3-илокси)карбонил)амино)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (МЕТАНОЛ-d4, 400 МГц): δ=8,33 (с, 1H), 7,63-7,72 (м, 2H), 7,38 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,50 (шт, J=5,5 Гц, 1H), 4,92 (т, J=6,9 Гц, 2H), 4,81-4,83 (м, 1H), 4,64-4,73 (м, 2H), 3,44 (шт, J=11,7 Гц, 1H), 2,99 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,21 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,06 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 1,59-1,75 (м, 2H), 1,30-1,47 (м, 2H), 1,21 (шд, J=6,0 Гц, 6H), 1,10 ч./млн. (с, 9H). ИЭР [M+H] = 595,1
Пример 39. Синтез бензил (3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(2-((1r,4r)-4-((изопропоксикарбонил)амино)циклогексил)тиазол-5-ил)фенил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,36 (с, 1H), 7,75-7,67 (м, 2H), 7,46-7,28 (м, 6H), 5,28-5,14 (м, 2H), 4,85-4,76 (м, 1H), 3,47 (шд, J=11,8 Гц, 1H), 3,01 (шс, 1H), 2,23 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=14,5 Гц, 2H), 1,70 (шд, J=11,0 Гц, 2H), 1,40 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 629,2
Пример 40. Синтез 2-фторбензил (3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(2-((1r,4r)-4-((изопропоксикарбонил)амино)циклогексил)тиазол-5-ил)фенил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,36 (с, 1H), 7,77-7,63 (м, 2H), 7,52 (т, J=7,0 Гц, 1H), 7,44-7,31 (м, 2H), 7,23-7,08 (м, 2H), 5,29 (с, 2H), 4,83 (шс, 1H), 3,46 (шд, J=11,8 Гц, 1H), 3,00 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,22 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=11,4 Гц, 2H), 1,76-1,62 (м, 2H), 1,47-1,35 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 647,2
Пример 41. Синтез (S)-1-фенилэтил (3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(2-((1r,4S)-4-((изопропоксикарбонил)амино)циклогексил)тиазол-5-ил)фенил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,35 (шс, 1H), 7,81-7,65 (м, 2H), 7,48-7,36 (м, 5H), 7,31 (шд, J=6,8 Гц, 1H), 5,89 (шд, J=6,2 Гц, 1H), 4,85 (шд, J=5,5 Гц, 1H), 3,47 (шс, 1H), 3,03 (шс, 1H), 2,24 (шд, J=11,2 Гц, 2H), 2,08 (шд, J=11,0 Гц, 2H), 1,71 (кв, J=11,9 Гц, 2H), 1,61 (шд, J=6,4 Гц, 3H), 1,49-1,37 (м, 2H), 1,24 (шд, J=5,4 Гц, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] =643,2
Пример 42. Синтез пиридин-2-илметил (3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(2-((1r,4r)-4-((изопропоксикарбонил)амино)циклогексил)тиазол-5-ил)фенил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,56 (шд, J=4,5 Гц, 1H), 8,38 (д, J=1,8 Гц, 1H), 7,94-7,87 (м, 1H), 7,78-7,72 (м, 2H), 7,59 (шд, J=7,8 Гц, 1H), 7,44-7,38 (м, 2H), 5,32 (с, 2H), 4,85 (тд, J=5,9, 12,0 Гц, 1H), 3,47 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 3,07-2,96 (м, 1H), 2,24 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,13-2,04 (м, 2H), 1,77-1,65 (м, 2H), 1,48-1,37 (м, 2H), 1,24 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 630,2
Пример 43. Синтез (R)-1-фенилэтил (3-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(2-((1r,4R)-4-((изопропоксикарбонил)амино)циклогексил)тиазол-5-ил)фенил)карбамат
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 118.
1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=8,28 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,70-7,57 (м, 2H), 7,47-7,24 (м, 7H), 7,05-6,84 (м, 2H), 5,82 (кв, J=6,6 Гц, 1H), 4,79-4,65 (м, 1H), 3,35-3,24 (м, 1H), 2,88 (тт, J=3,4, 11,9 Гц, 1H), 2,11 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 1,89 (шд, J=9,9 Гц, 2H), 1,54 (д, J=6,6 Гц, 5H), 1,30 (шс, 2H), 1,14 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,08-0,99 (м, 9H). ИЭР [M+H] = 643,3
Пример 44. Синтез транс-изопропил N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамата
Схема 14:
Общий способ B, транс-изопропил N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,06 (с, 1H), 8,32 (д, J=2,1 Гц, 1H), 7,70-7,60 (м, 2H), 7,38 (д, J=8,4 Гц, 1H), 6,96 (с, 1H), 6,81 (шд, J=7,9 Гц, 1H), 4,99-4,87 (м, 1H), 3,27 (шс, 1H), 2,94-2,84 (м, 1H), 2,13 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 1,90 (шд, J=11,1 Гц, 2H), 1,63-1,49 (м, 2H), 1,39 (с, 9H), 1,33 (шд, J=14,4 Гц, 2H), 1,28 (д, J=6,4 Гц, 6H), 1,07 (с, 9H). ИЭР [M+H] =595,1
Пример 45. Синтез трет-бутил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(пиридин-2-илметил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 82.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,17 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,75-7,59 (м, 2H), 7,43-7,22 (м, 3H), 7,21-7,03 (м, 2H), 4,53 (м, 2H), 3,43 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,99 (шт, J=12,1 Гц, 1H), 2,22 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 2,06 (шд, J=10,5 Гц, 2H), 1,77-1,60 (м, 2H), 1,58-1,34 (м, 11H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] =643,3
Пример 46. Синтез изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[3-(изопропоксикарбониламино)azetidin-1-ил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 15:
Получение соединения 129.
Смесь трет-бутил N-(азетидин-3-ил)карбамата; гидрохлорида (72,40 мг, 346,94 мкмоль, 1,50 экв.), N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]ацетамида (100 мг, 231,29 мкмоль, 1 экв.), t-BuONa (66,68 мг, 693,87 мкмоль, 3 экв.), [2-(2-аминоэтил)фенил]хлорпалладия; ди-трет-бутил[2-(2,4,6-триизопропилфенил)фенил]фосфана (15,88 мг, 23,13 мкмоль, 0,1 экв.) в трет-амиловом спирте (2 мл) дегазируют и продувают N2 3 раза. и затем смесь перемешивают при 100°C в течение 12 ч в атмосфере N2, и затем концентрируют. Остаток разбавляют этилацетатом (20 мл) и промывают H2O (20 мл). Органический слой сушат и концентрируют, и остаток очищают преп-ТСХ (EtOAc) с получением трет-бутил N-[1-[5-[4-ацетамидо-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]азетидин-3-ил]карбамата (46 мг, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 524,3
Получение соединения 130.
Общий способ F, 5-амино-2-[2-(3-аминоазетидин-1-ил)тиазол-5-ил]-N-трет-бутилбензолсульфонамид. ИЭР [M+H] = 382,0
Получение примера 46
Общий способ D, изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[3-(изопропоксикарбониламино)азетидин-1-ил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,35 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,67 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,45-7,32 (м, 2H), 5,04-4,94 (м, 1H), 4,92-4,88 (м, 1H), 4,73-4,63 (м, 1H), 4,56 (шт, J=8,5 Гц, 2H), 4,27 (шс, 2H), 1,31 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,27-1,19 (м, 15H). ИЭР [M+H] =554,2
Пример 47. Синтез транс-оксетан-3-ил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 16:
Получение соединения 131.
Общий способ F, транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексанамин. ИЭР [M+H] = 260,9/262,9
Получение соединения 132.
К раствору оксетан-3-ола (1,15 г, 15,51 ммоль, 3 экв.) в ДХЭ (10 мл) добавляют ДИЭА (3,34 г, 25,84 ммоль, 4,50 мл, 5 экв.) и ТРИФОСГЕН (1,53 г, 5,17 ммоль, 1 экв.). Смесь перемешивают при 25-50°C в течение 1 ч и затем добавляют раствор транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексанамина (1,35 г, 5,17 ммоль, 1 экв.), ДИЭА (3,34 г, 25,84 ммоль, 4,50 мл, 5 экв.) в ДХЭ (10 мл). Смесь перемешивают при 25°C в течение 0,5 ч. Смесь концентрируют, и остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=30/1-5:1) с получением транс-оксетан-3-ил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (1,5 г, неочищенное) в виде белого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 363,1/361,1
Получение пр. 47
Общий способ K, транс-оксетан-3-ил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,23 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,71-7,66 (м, 2H), 7,37-7,29 (м, 5H), 7,24 (шс, 1H), 5,40-5,27 (м, 2H), 4,66-4,55 (м, 3H), 4,40 (с, 2H), 3,45 (шд, J=11,0 Гц, 1H), 3,00 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,22 (шд, J=13,0 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=11,2 Гц, 2H), 1,74-1,63 (м, 2H), 1,47-1,37 (м, 2H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 642,3
Пример 48. Синтез оксетан-3-ил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-((изопропоксикарбонил)амино)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 132.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,33 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,71-7,64 (м, 2H), 7,36 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,41-5,27 (м, 2H), 4,98 (тд, J=6,4, 12,6 Гц, 1H), 4,87 (шс, 1H), 4,63-4,56 (м, 2H), 3,45 (шд, J=12,3 Гц, 1H), 3,00 (шт, J=12,0 Гц, 1H), 2,22 (шд, J=13,0 Гц, 2H), 2,11-2,02 (м, 2H), 1,74-1,63 (м, 2H), 1,42 (кв, J=12,7 Гц, 2H), 1,31 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 595,3
Пример 49. Синтез транс-оксетан-3-ил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(оксетан-3-илоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 17:
Получение соединения 133.
Общий способ K, транс-оксетан-3-ил N-[4-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. ИЭР [M+H] = 509,0
Получение соединения 134.
Общий способ D, транс-оксетан-3-ил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[(4-нитрофенокси)карбониламино]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. ИЭР [M+H] = 674,2
Получение примера 49.
Общий способ H, транс-оксетан-3-ил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(оксетан-3-илоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,39 (с, 1H), 8,28 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,71-7,58 (м, 2H), 7,48-7,34 (м, 2H), 6,97 (с, 1H), 5,50-5,39 (м, 1H), 5,32-5,20 (м, 1H), 4,87-4,68 (м, 4H), 4,61-4,36 (м, 4H), 3,30-3,23 (м, 1H), 3,01-2,82 (м, 1H), 2,12 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 1,90 (шд, J=10,4 Гц, 2H), 1,66-1,47 (м, 2H), 1,43-1,26 (м, 2H), 1,04 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 609,2
Пример 50. Синтез оксетан-3-ил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(пиридин-2-илметил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 134.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,49 (д, J=4,8 Гц, 1H), 8,25 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,82 (дт, J=1,8, 7,7 Гц, 1H), 7,73-7,63 (м, 2H), 7,45 (д, J=7,9 Гц, 1H), 7,38-7,26 (м, 2H), 5,39-5,28 (м, 1H), 4,84 (шс, 1H), 4,70-4,56 (м, 3H), 4,53 (с, 2H), 3,44 (шт, J=12,1 Гц, 1H), 3,06-2,92 (м, 1H), 2,22 (шд, J=13,2 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=11,0 Гц, 2H), 1,79-1,60 (м, 2H), 1,50-1,35 (м, 2H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 643,2
Пример 51. Синтез оксетан-3-ил ((1S,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((S)-1-фенилэтил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 134.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,19 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,70-7,63 (м, 2H), 7,39-7,30 (м, 5H), 7,27-7,20 (м, 1H), 5,35 (т, J=5,7 Гц, 1H), 4,92 (кв, J=6,8 Гц, 2H), 4,84 (шс, 1H), 4,60 (т, J=6,4 Гц, 2H), 3,49-3,38 (м, 1H), 3,05-2,95 (м, 1H), 2,22 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,10-2,02 (м, 2H), 1,74-1,61 (м, 2H), 1,49 (д, J=7,1 Гц, 3H), 1,45-1,34 (м, 2H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 656,3
Пример 52. Синтез оксетан-3-ил ((1R,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((R)-1-фенилэтил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 134.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,19 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,75-7,61 (м, 2H), 7,42-7,18 (м, 6H), 5,35 (квин, J=5,7 Гц, 1H), 5,01-4,87 (м, 3H), 4,70-4,52 (м, 2H), 3,51-3,38 (м, 1H), 3,06-2,92 (м, 1H), 2,22 (шд, J=11,9 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=11,7 Гц, 2H), 1,77-1,62 (м, 2H), 1,54-1,35 (м, 5H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 656,2
Пример 53. Синтез оксетан-3-ил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(2-фторбензил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 134.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,23 (д, J=2,4 Гц, 1H), 7,75-7,63 (м, 2H), 7,46-7,24 (м, 3H), 7,20-7,03 (м, 2H), 5,43-5,28 (м, 1H), 4,85 (шс, 2H), 4,67-4,56 (м, 2H), 4,47 (с, 2H), 3,53-3,37 (м, 1H), 3,08-2,93 (м, 1H), 2,29-1,99 (м, 4H), 1,78-1,61 (м, 2H), 1,53-1,35 (м, 2H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 660,2
Пример 54. Синтез оксетан-3-ил ((1R,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((R)-1-(2-фторфенил)этил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 134.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,20 (д, J=2,3 Гц, 1H), 7,73-7,65 (м, 2H), 7,45-7,39 (м, 1H), 7,38-7,26 (м, 2H), 7,21-7,04 (м, 2H), 5,37 (квин, J=5,7 Гц, 1H), 5,20 (кв, J=7,0 Гц, 1H), 4,89-4,86 (м, 2H), 4,65-4,59 (м, 2H), 3,52-3,41 (м, 1H), 3,08-2,96 (м, 1H), 2,24 (шд, J=12,2 Гц, 2H), 2,13-2,05 (м, 2H), 1,76-1,64 (м, 2H), 1,52 (д, J=7,0 Гц, 3H), 1,47-1,39 (м, 2H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 674,2
Пример 55. Синтез оксетан-3-ил ((1S,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-((S)-1-(2-фторфенил)этил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)циклогексил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 134.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,17 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,75-7,59 (м, 2H), 7,43-7,22 (м, 3H), 7,21-7,03 (м, 2H), 5,39-5,28 (м, 1H), 5,17 (кв, J=7,0 Гц, 1H), 4,90-4,87 (м, 1H), 4,84 (с, 1H), 4,66-4,54 (м, 2H), 3,43 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,99 (шт, J=12,1 Гц, 1H), 2,22 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 2,06 (шд, J=10,5 Гц, 2H), 1,77-1,60 (м, 2H), 1,58-1,34 (м, 5H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 674,2
Пример 56. Синтез 4-пиперидилметил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[5-(изопропоксикарбониламино)-3-метокси-2-пиридил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 18:
Получение соединения 136.
Na (8,75 г, 380,60 ммоль, 9,02 мл, 1,51 экв.) добавляют в MeOH (300 мл) порциями и затем растворяют Na, смесь концентрируют досуха. Полученное серое твердое вещество (NaOMe) добавляют в ДМФ (300 мл) и 3-хлорпиридин-2-карбонитрил (35 г, 252,61 ммоль, 1 экв.) добавляют при 0°C. Реакционную смесь перемешивают при 20°C в течение 12 ч и затем разбавляют H2O (800 мл) и фильтруют. Лепешку сушат с получением 3-метоксипиридин-2-карбонитрила (25 г, неочищенное) в виде белого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 135,1
Получение соединения 137
К раствору 3-метоксипиридин-2-карбонитрила (24,5 г, 182,65 ммоль, 1 экв.) в ДХМ (450 мл) добавляют смесь Bu4NNO3 (83,30 г, 273,59 ммоль, 1,5 экв.) и ТФУА (57,54 г, 273,98 ммоль, 38,11 мл, 1,5 экв.) в ДХМ (150 мл) по каплям при 0°C. Смесь перемешивают при 20°C в течение 12 ч и затем выливают в насыщ. водн. NaHCO3 (300мл) при 0°C, и органический слой сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=20/1-10:1) с получением 3-метокси-5-нитропиридин-2-карбонитрила (27 г, неочищенное) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=9,06 (д, J=2,2 Гц, 1H), 8,13 (д, J=2,2 Гц, 1H), 4,16-4,08 (м, 3H). ИЭР [M+H] = 180,1
Общий способ G получения соединения 138.
К раствору 3-метокси-5-нитропиридин-2-карбонитрила (27 г, 151 ммоль, 1 экв.) в ТГФ (100 мл)/EtOH (500 мл) добавляют Fe (4 г, 754 ммоль, 5 экв.) и раствор NH4Cl (24,2 г, 452 ммоль, 3 экв.) в H2O (50 мл). Смесь перемешивают при 80°C в течение 30 мин, затем разбавляют ТГФ (500 мл) и фильтруют. Фильтрат концентрируют, разбавляют H2O (500 мл) и затем экстрагируют ДХМ (400 мл x 3). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 5-амино-3-метоксипиридин-2-карбонитрила (14,5 г, неочищенное) в виде бледно-желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 150,1
Получение соединения 139.
Общий способ D, изопропил N-(6-циано-5-метокси-3-пиридил)карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,13 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,95 (д, J=1,8 Гц, 1H), 5,04-4,95 (м, 1H), 3,96 (с, 3H), 1,31 (д, J=6,2 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 236,1
Получение соединения 140.
К раствору изопропил N-(6-циано-5-метокси-3-пиридил)карбамата (16 г, 68,02 ммоль, 1 экв.) в ДМФ (200 мл) добавляют NaHS (19,06 г, 340,08 ммоль, 5 экв.) и затем MgCl2 (19,43 г, 204,05 ммоль, 8,37 мл, 3 экв.). Смесь перемешивают при 25°C в течение 12 ч и затем выливают в H2O (500 мл) и экстрагируют ДХМ (40 мл х 3). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток промывают раствором (Петролейный эфир:EtOAc=8:1), фильтруют, и фильтровальную лепешку сушат с получением изопропил N-(6-карбамотиоил-5-метокси-3-пиридил)карбамата (21 г, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=9,92-9,84 (м, 2H), 9,38 (шс, 1H), 8,08 (д, J=1,8 Гц, 1H), 7,66 (с, 1H), 4,89 (спт, J=6,3 Гц, 1H), 3,74 (с, 3H), 1,24 (д, J=6,1 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 270,0
Получение соединения 141.
Общий способ M, изопропил N-(5-метокси-6-тиазол-2-ил-3-пиридил)карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,07 (с, 1H), 8,26 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,88 (д, J=3,1 Гц, 1H), 7,85 (д, J=1,3 Гц, 1H), 7,71 (д, J=3,3 Гц, 1H), 4,91 (спт, J=6,2 Гц, 1H), 3,88 (с, 3H), 1,26 (д, J=6,4 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 294,1
Получение соединения 142.
Общий способ J, изопропил N-[6-(5-бромтиазол-2-ил)-5-метокси-3-пиридил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,17 (с, 1H), 8,28 (д, J=1,8 Гц, 1H), 8,08-7,86 (м, 2H), 4,99 (шс, 1H), 3,93 (с, 3H), 1,29 (д, J=6,4 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 371,8/373,8
Получение соединения 143.
Общий способ B, изопропил N-[6-[5-[4-ацетамидо-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-5-метокси-3-пиридил]карбамат. ИЭР [M+H] = 562,0
Получение соединения 144.
Общий способ F, изопропил N-[6-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-5-метокси-3-пиридил]карбамат. ИЭР [M+H] = 520,2
Получение соединения 145.
Общий способ D, (4-нитрофенил) N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[5-(изопропоксикарбониламино)-3-метокси-2-пиридил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 685,1
Получение соединения 146.
Общий способ H, трет-бутил 4-[[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[5-(изопропоксикарбониламино)-3-метокси-2-пиридил]тиазол-5-ил]фенил]карбамоилоксиметил]пиперидин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 761,4
Получение пр. 56
Общий способ C, 4-пиперидилметил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[5-(изопропоксикарбониламино)-3-метокси-2-пиридил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=10,19-10,10 (м, 2H), 8,35 (д, J=2,1 Гц, 1H), 8,30 (д, J=1,8 Гц, 1H), 7,89 (с, 2H), 7,68 (дд, J=2,0, 8,4 Гц, 1H), 7,46 (д, J=8,4 Гц, 1H), 7,12 (шс, 1H), 4,95 (тд, J=6,2, 12,5 Гц, 1H), 3,98 (д, J=6,5 Гц, 2H), 3,93 (с, 3H), 3,00 (шд, J=12,1 Гц, 2H), 2,70-2,56 (м, 2H), 1,77 (шд, J=4,0 Гц, 1H), 1,67 (шд, J=12,1 Гц, 2H), 1,30 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,16 (шдд, J=3,4, 12,0 Гц, 2H), 1,09 (с, 9H). ИЭР [M+H] =661,3
Пример 57. Синтез транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-4-фтор-тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 19:
Получение соединения 147
К раствору транс-изопропил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (1,50 г, 4,32 ммоль, 1 экв.)в АЦН (20 мл) добавляют 1-(хлорметил)-4-фтор-1,4-диазониабицикло[2,2,2]октан; дитетрафторборат (3,06 г, 8,64 ммоль, 2 экв.) и смесь перемешивают при 80°C в течение 12 ч. Смесь затем концентрируют, и остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=3/1-3:1) с получением транс-изопропил N-[4-(5-бром-4-фтортиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (0,2 г, 547,55 мкмоль, 12,68% выход) в виде желтой камеди. ИЭР [M+H] = 365,1/367,1
Получение пр. 57
Общий способ B, транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-4-фтортиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,67 (дд, J=2,0, 8,4 Гц, 1H), 7,37-7,29 (м, 5H), 7,24 (шд, J=2,6 Гц, 1H), 4,82-4,77 (м, 1H), 4,40 (с, 2H), 3,42 (шт, J=11,6 Гц, 1H), 2,87 (шт, J=12,0 Гц, 1H), 2,20 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,05 (шд, J=11,0 Гц, 2H), 1,69-1,57 (м, 2H), 1,43-1,30 (м, 2H), 1,21 (шд, J=5,7 Гц, 6H), 1,15 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 646,2
Пример 58. Синтез изопропил ((1r,4r)-4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-((изопропоксикарбонил)амино)фенил)-4-фтортиазол-2-ил)циклогексил)карбамат
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 147.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,35 (с, 1H), 7,69 (шд, J=8,1 Гц, 1H), 7,37 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,01 (тд, J=6,1, 12,4 Гц, 1H), 4,83 (шс, 1H), 3,53-3,39 (м, 1H), 2,96-2,85 (м, 1H), 2,23 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,08 (шд, J=10,5 Гц, 2H), 1,75-1,60 (м, 2H), 1,47-1,38 (м, 2H), 1,34 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,24 (шд, J=6,0 Гц, 6H), 1,18 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 599,2
Пример 59. Синтез транс-изопропил N-[6-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]тетрагидропиран-3-ил]карбамат
Схема 20:
Получение соединения 149
К раствору этил 2-оксоацетата (250 г, 1,22 моль, 1 экв.) в Тол. (1,5 L) добавляют бута-1,3-диен (92,72 г, 1,71 моль, 149,55 мл, 1,4 экв.) и 2,6-ди-трет-бутил-4-метилфенол (5,40 г, 24,49 ммоль, 0,02 экв.). Смесь перемешивают при 170°C в течение 8 ч в пробирке под высоким давлением 1 МПа, и затем концентрируют. Остаток очищают хроматографией на силикагеле (Петролейный эфир/Этилацетат=100:1-10:1) с получением этил 3,6-дигидро-2H-пиран-2-карбоксилата (26 г, 166,48 ммоль, 13,60% выход) в виде желтого масла. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=5,82-5,74 (м, 1H), 5,71-5,64 (м, 1H), 4,36-4,27 (м, 1H), 4,23-4,12 (м, 4H), 2,39-2,23 (м, 2H), 1,24 (т, J=7,1 Гц, 3H).
Получение соединения 150
Общий способ O, 3,6-дигидро-2H-пиран-2-карбоновая кислота. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=5,88 (квдд, J=2,3, 5,1, 10,2 Гц, 1H), 5,80-5,71 (м, 1H), 4,43-4,19 (м, 3H), 2,53-2,31 (м, 2H)
Получение соединения 151
Общий способ N, 3,6-дигидро-2H-пиран-2-карбоксамид. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=6,50 (шс, 1H), 5,89-5,76 (м, 1H), 5,67 (шд, J=9,8 Гц, 1H), 5,50 (шс, 1H), 4,22 (шс, 2H), 3,97 (дд, J=3,9, 10,8 Гц, 1H), 2,49-2,35 (м, 1H), 2,28-2,09 (м, 1H)
Получение соединения 152
Общий способ L, 3,6-дигидро-2H-пиран-2-карботиоамид. ИЭР[M+H]=144,1
Получение соединения 153
Общий способ M, 2-(3,6-дигидро-2H-пиран-2-ил)тиазол. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=7,69 (д, J=2,9 Гц, 1H), 7,26 (д, J=2,9 Гц, 1H), 5,93-5,83 (м, 1H), 5,70-5,63 (м, 1H), 4,86 (дд, J=3,9, 9,8 Гц, 1H), 4,33 (шс, 2H), 2,61-2,37 (м, 2H). ИЭР [M+H]=168,1
Получение соединения 154
К раствору 2-(3,6-дигидро-2H-пиран-2-ил)тиазола (13 г, 77,74 ммоль, 1 экв.) в ТГФ (150 мл), добавляют BH3-Me2S (10 M, 15,55 мл, 2 экв.) при 0°C по каплям, и смесь перемешивают при 26°C в течение 2 ч. Затем смесь гасят NaOH (62,19 г, 1,55 моль, 20 экв.) в H2O (150 мл) медленно при 0°C, затем добавляют H2O2 (264,42 г, 2,33 моль, 224,09 мл, 30% чистота, 30 экв.). Смесь перемешивают при 26°C в течение еще 12 ч. Смесь гасят насыщ. водн. раствором Na2SO3 (1 л) и экстрагируют EtOAc (1 л х 2). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают на колонке (Петролейный эфир:EtOAc=5:1-1:1) с получением 6-тиазол-2-илтетрагидропиран-3-ола (7 г, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР[M+H]=186,2
Получение соединения 155
К раствору 6-тиазол-2-илтетрагидропиран-3-ола (7 г, 37,79 ммоль, 1 экв.) в ДХМ (100 мл) добавляют ТЭА (7,65 г, 75,58 ммоль, 10,52 мл, 2 экв.) и метансульфонилхлорид (6,49 г, 56,68 ммоль, 4,39 мл, 1,5 экв.) по каплям при 0°C, и смесь перемешивают при 26°C в течение 2 ч. Смесь разбавляют ДХМ (100 мл) и промывают водой (200 мл). Органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением неочищенного (6-тиазол-2-илтетрагидропиран-3-ил)метансульфоната (7 г, неочищенное) в виде желтого масла, которое может использоваться сразу.
К раствору (6-тиазол-2-илтетрагидропиран-3-ил)метансульфоната (7 г, 26,58 ммоль, 1 экв.) в ДМФ (60 мл), добавляют азидонатрий (8,64 г, 132,91 ммоль, 5 экв.), и смесь перемешивают при 80°C в течение 12 ч и затем выливают в насыщ. водн. Na2CO3 (500 мл) и экстрагируют EtOAc (200 мл х 3). Объединенную органическую фазу промывают насыщенным раствором соли (200 мл) и сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением неочищенного 2-(5-азидотетрагидропиран-2-ил)тиазола (5 г, неочищенное) в виде желтого масла, которое может применяться без какой-либо очистки.
Получение соединения 156
К раствору 2-(5-азидотетрагидропиран-2-ил)тиазола (5 г, 23,78 ммоль, 1 экв.) в ТГФ (80 мл) и H2O (40 мл), добавляют PPh3 (9,36 г, 35,67 ммоль, 1,5 экв.). Смесь перемешивают при 50°C в течение 12 ч и затем выливают в 4N раствор HCl (100 мл) и экстрагируют EtOAc (50 мл х 2). Затем водную фазу подщелачивают насыщ. водн. Na2CO3 до pH>12 и экстрагируют раствором (ДХМ/MeOH=5:1) (100 мл х 3). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением неочищенного 6-тиазол-2-илтетрагидропиран-3-амина (3 г, неочищенное) в виде желтого масла. ИЭР[M+H]=185,2
Получение соединения 157
Общий способ D, транс-изопропил N-(6-тиазол-2-илтетрагидропиран-3-ил)карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,74 (д, J=3,3 Гц, 1H), 7,55 (д, J=3,3 Гц, 1H), 4,86-4,77 (м, 2H), 4,64 (дд, J=2,4, 10,8 Гц, 1H), 4,12 (ддд, J=2,0, 4,6, 10,8 Гц, 1H), 3,75-3,55 (м, 1H), 2,32-2,20 (м, 1H), 2,16-2,03 (м, 1H), 1,81-1,54 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H). ИЭР[M+H]=271,2
Примечание: соед.157 очищают преп-ТСХ и затем преп-ВЭЖХ для отделения других изомеров.
Получение соединения 158
Общий способ J, транс-изопропил N-[6-(5-бромтиазол-2-ил)тетрагидропиран-3-ил]карбамат. ИЭР[M+H]=351,1/349,1
Получение соединения Пр. 59
Общий способ B, транс-изопропил N-[6-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]тетрагидропиран-3-ил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,74 (с, 1H), 7,68 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,37-7,29 (м, 5H), 7,27-7,19 (м, 1H), 4,84-4,78 (м, 2H), 4,64 (дд, J=2,0, 11,0 Гц, 1H), 4,40 (с, 2H), 4,12 (шдд, J=3,2, 10,7 Гц, 1H), 3,69-3,58 (м, 1H), 2,33-2,26 (м, 1H), 2,13 (шд, J=10,4 Гц, 1H), 1,82-1,71 (м, 1H), 1,69-1,57 (м, 1H), 1,26-1,19 (м, 6H), 1,10 (с, 9H). ИЭР [M+H] =630,3
Получение соединения Пр. 59A и Пр. 59B
Пр. 59 далее разделяют СЖХ (условия: инструмент: Thar SFC80 для препаративной СЖХ; колонка: Chiralpak IC-H 250 х 30 мм в.д. 5 мк; подвижная фаза: A для CO2 и B для MeOH (0,1% NH3.H2O); градиент: B%=42%; скорость потока 70 г/мин; длина волны: 220 нм; температура колонки: 40°С; противодавление системы: 100 бар с получением Пр. 59A. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,27 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,77 (с, 1H), 7,72 (дд, J=2,3, 8,3 Гц, 1H), 7,40-7,33 (м, 5H), 7,30-7,23 (м, 1H), 4,89-4,79 (м, 2H), 4,67 (дд, J=2,3, 11,0 Гц, 1H), 4,43 (с, 2H), 4,16 (шдд, J=3,0, 10,9 Гц, 1H), 3,67 (шт, J=10,9 Гц, 1H), 2,33 (шдд, J=2,6, 13,1 Гц, 1H), 2,16 (шд, J=10,6 Гц, 1H), 1,88-1,58 (м, 2H), 1,31-1,22 (м, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] =630,2
Пр. 59B: 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,25 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,76 (с, 1H), 7,70 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,37 (с, 1H), 7,36-7,31 (м, 4H), 7,28-7,18 (м, 1H), 4,87-4,74 (м, 1H), 4,65 (шд, J=9,2 Гц, 1H), 4,41 (с, 2H), 4,19-4,04 (м, 1H), 3,63 (шд, J=10,5 Гц, 1H), 3,34 (шс, 1H), 2,31 (шд, J=13,2 Гц, 1H), 2,13 (шд, J=10,1 Гц, 1H), 1,84-1,72 (м, 1H), 1,71-1,58 (м, 1H), 1,22 (д, J=6,1 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 630,3
Пример 60. Синтез транс-изопропил N-[6-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]тетрагидропиран-3-ил]карбамата
Схема 21:
Получение пр. 60
Общий способ B, транс-изопропил N-[6-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]тетрагидропиран-3-ил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,37 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,79 (с, 1H), 7,70 (дд, J=2,4, 8,3 Гц, 1H), 7,40 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,01 (спт, J=6,3 Гц, 1H), 4,87-4,79 (м, 1H), 4,68 (дд, J=2,4, 11,2 Гц, 1H), 4,16 (дд, J=2,9, 10,8 Гц, 1H), 3,72-3,60 (м, 1H), 3,38-3,34 (м, 1H), 2,39-2,29 (м, 1H), 2,16 (шд, J=12,2 Гц, 1H), 1,89-1,74 (м, 1H), 1,72-1,59 (м, 1H), 1,39-1,21 (м, 12H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 583,3
Получение соединения Пр. 60A и Пр. 60B
Пр. 60 дополнительно разделяют СЖХ (условия: инструмент: Thar SFC80 для препаративной СЖХ; колонка: Chiralpak IC-H 250 х 30 мм в.д. 5 мк; подвижная фаза: A для CO2 и B для MeOH (0,1% NH3.H2O); градиент: B%=38%; скорость потока: 65 г/мин; длина волны: 220 нм; температура колонки: 40°С; противодавление системы: 100 бар) с получением Пр. 60A: 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,37 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,78 (с, 1H), 7,70 (дд, J=2,0, 8,4 Гц, 1H), 7,40 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,05-4,95 (м, 1H), 4,90-4,81 (м, 1H), 4,67 (дд, J=2,4, 11,1 Гц, 1H), 4,70-4,64 (м, 1H), 4,16 (шдд, J=2,9, 10,9 Гц, 1H), 3,73-3,62 (м, 1H), 2,33 (шдд, J=2,8, 13,2 Гц, 1H), 2,16 (шд, J=11,9 Гц, 1H), 1,86-1,74 (м, 1H), 1,70-1,61 (м, 1H), 1,34 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,25 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 583,3
Пр. 60B : 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,34 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,80-7,72 (м, 1H), 7,67 (дд, J=2,0, 8,6 Гц, 1H), 7,36 (д, J=8,3 Гц, 1H), 4,98 (спт, J=6,2 Гц, 1H), 4,85-4,75 (м, 1H), 4,65 (дд, J=2,4, 11,2 Гц, 1H), 4,13 (шдд, J=3,1, 11,0 Гц, 1H), 3,72-3,56 (м, 1H), 3,33 (с, 1H), 2,30 (шдд, J=2,6, 13,2 Гц, 1H), 2,13 (шд, J=11,4 Гц, 1H), 1,85-1,71 (м, 1H), 1,69-1,57 (м, 1H), 1,31 (д, J=6,1 Гц, 6H), 1,27-1,17 (м, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 583,2
Пример 61. Синтез [1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-бицикло[2,2,2]октанил] N-изопропилкарбамат.
Схема 22:
Получение соединения 160.
К раствору метил 4-гидроксибицикло[2,2,2]октан-1-карбоксилата (0,4 г, 2,17 ммоль, 1 экв.) в ДХМ (10 мл) добавляют TMSCl (23,59 мг, 217,12 мкмоль, 0,1 экв.) и 2-изоцианатопропан (554,33 мг, 6,51 ммоль, 3 экв.). Смесь перемешивают при 25°C в течение 12 ч и затем промывают 1 N HCl (20 мл) и насыщ. водн. Na2CO3 (20 мл). Органический слой сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением метил 4-(изопропилкарбамоилокси)бицикло[2,2,2]октан-1-карбоксилата (0,45 г, неочищенное) в виде желтой камеди. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=4,34 (шс, 1H), 3,72-3,61 (м, 1H), 3,56 (с, 3H), 1,94 (шд, J=7,7 Гц, 6H), 1,90-1,81 (м, 6H), 1,08-1,00 (м, 6H). ИЭР [M+H] = 269,9
Получение соединения 161.
Общий способ O, 4-(изопропилкарбамоилокси)бицикло[2,2,2]октан-1-карбоновая кислота. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=4,32 (шс, 1H), 3,71-3,60 (м, 1H), 1,93 (шс, 6H), 1,88 (шд, J=9,3 Гц, 6H), 1,05 (д, J=6,5 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 256,0
Получение соединения 162.
Общий способ N, (1-карбамоил-4-бицикло[2,2,2]октанил) N-изопропилкарбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=5,56-5,31 (м, 2H), 4,34 (шс, 1H), 3,72-3,57 (м, 1H), 1,96 (шс, 6H), 1,97-1,93 (м, 1H), 1,92-1,80 (м, 6H), 1,05 (д, J=6,6 Гц, 6H). ИЭР [M+H] = 255,3
Получение соединения 163.
Общий способ L, (1-карбамотиоил-4-бицикло[2,2,2]октанил) N-изопропилкарбамат. ИЭР [M+H] = 271,3
Получение соединения 164.
Общий способ M, (1-тиазол-2-ил-4-бицикло[2,2,2]октанил) N-изопропилкарбамат. ИЭР [M+H] = 295,0
Получение соединения 165
Общий способ J, [1-(5-бромтиазол-2-ил)-4-бицикло[2,2,2]октанил] N-изопропилкарбамат. ИЭР [M+H] = 372,8/374,8
Получение пр. 61.
Общий способ K, [1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-бицикло[2,2,2]октанил] N-изопропилкарбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,26 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,74-7,68 (м, 2H), 7,38-7,32 (м, 4H), 7,30-7,23 (м, 1H), 4,43 (с, 2H), 3,71-3,61 (м, 1H), 2,18 (с, 12H), 1,16-1,09 (м, 15H). ИЭР [M+H] = 654,3
Пример 62. Синтез 4-(5-(2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)-4-(3-(пиридин-2-илметил)уреидо)фенил)тиазол-2-ил)бицикло[2,2,2]октан-1-ил изопропилкарбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 165.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,77 (шс, 1H), 8,62-8,52 (м, 1H), 8,34 (шс, 1H), 8,12-8,03 (м, 1H), 7,96 (шд, J=5,5 Гц, 1H), 7,79-7,66 (м, 2H), 7,43-7,35 (м, 1H), 4,78 (шс, 2H), 3,67 (шдд, J=6,2, 13,0 Гц, 1H), 2,19 (шс, 12H), 1,17-1,09 (м, 15H). ИЭР [M/2+H] = 328,2
Пример 63. Синтез транс-изопропил N-[6-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]-3-пиперидил]карбамата
Схема 23:
Общий способ I получения соединения 167.
К раствору 5-гидроксипиридин-2-карбоновой кислоты (60 г, 431 ммоль, 1 экв.) в AcOH (200 мл)/H2O (600 мл) добавляют влажный Pd/C (2 г, содержание 10%) в атмосфере N2. Суспензию дегазируют в вакууме и продувают H2 несколько раз. Смесь перемешивают под H2 (50 ф./кв.д.) при 50°C в течение 12 ч, затем фильтруют и концентрируют с получением 5-гидроксипиперидин-2-карбоновой кислоты (62,61 г, неочищенное) в виде желтого масла. ИЭР [M+H] = 146,5
Получение соединения 168
К смеси 5-гидроксипиперидин-2-карбоновой кислоты (62 г, 427,13 ммоль, 1 экв.) и Boc2O (102,54 г, 469,84 ммоль, 107,94 мл, 1,1 экв.) в диоксане (500 мл) добавляют NaOH (34,17 г, 854,25 ммоль, 2 экв.) и смесь перемешивают при 25°C в течение 18 ч. Смесь затем концентрируют для удаления диоксана и pH доводят до 2-3 добавлением 1N раствора HCl. Водную фазу экстрагируют 2-Me-ТГФ (500 мл х 3). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 1-трет-бутоксикарбонил-5-гидроксипиперидин-2-карбоновой кислоты (40 г, неочищенное) в виде желтого масла. ИЭР [M+Na] = 267,9
Получение соединения 169
Общий способ A, O2-бензил O1-трет-бутил 5-гидроксипиперидин-1,2-дикарбоксилат. ИЭР [M+Na+] = 358,0
Получение соединения 170
Смесь O2-бензил O1-трет-бутил 5-гидроксипиперидин-1,2-дикарбоксилата (10 г, 29,82 ммоль, 1 экв.), ТЭА (3,62 г, 35,78 ммоль, 4,98 мл, 1,2 экв.) в ДХМ (100 мл) добавляют метансульфонилхлорид (4,10 г, 35,78 ммоль, 2,77 мл, 1,2 экв.) при 0°C и смесь перемешивают при 25°C в течение 1 ч. Смесь затем промывают H2O (50 мл), и органический слой сушат и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=40/1-5:1) с получением O2-бензил O1-трет-бутил 5-метилсульфонилоксипиперидин-1,2-дикарбоксилата (9,5 г, 18,98 ммоль, 63,65% выход, 82,6% чистота) в виде желтого масла.
Смесь O2-бензил O1-трет-бутил 5-метилсульфонилоксипиперидин-1,2-дикарбоксилата (9,5 г, 22,98 ммоль, 1 экв.), NaN3 (8,96 г, 137,85 ммоль, 6 экв.) в ДМФ (20 мл) перемешивают при 100°C в течение 4 ч. Затем смесь гасят насыщ. водн. Na2SO3 (30 мл) и экстрагируют EtOAc (100 мл х 3). Объединенные органические слои промывают насыщенным раствором соли (40 мл х 3), сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением O2-бензил O1-трет-бутил 5-азидопиперидин-1,2-дикарбоксилата (8,82 г, неочищенное) в виде желтого масла.
Получение соединения 171
Смесь O2-бензил O1-трет-бутил 5-азидопиперидин-1,2-дикарбоксилата (8 г, 22,20 ммоль, 1 экв.), трифенилфосфана (8,73 г, 33,30 ммоль, 1,5 экв.) в H2O (50 мл) и ТГФ (50 мл) перемешивают при 45°C в течение 4 ч. Смесь концентрируют для удаления ТГФ и pH доводят до 2-3 добавлением 1N раствора HCl. Водную фазу экстрагируют МТБЭ (30 мл), и затем водную фазу подщелачивают для доведения pH до 9 и экстрагируют EtOAc (50 мл х 3). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением O2-бензил O1-трет-бутил 5-аминопиперидин-1,2-дикарбоксилата (6 г, неочищенное) в виде желтого масла. ИЭР[M+H]=335,2
Получение соединения 172
Общий способ D, O2-бензил O1-трет-бутил 5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-1,2-дикарбоксилат. ИЭР [M+H] = 421,2
Получение соединения 173
Общий способ O, 1-трет-бутоксикарбонил-5-изопропоксикарбонилоксипиперидин-2-карбоновая кислота. ИЭР [M+H] = 331,2
Получение соединения 174
Смесь 1-трет-бутоксикарбонил-5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-2-карбоновой кислоты (1,3 г, 3,93 ммоль, 1 экв.), NH4Cl (315,73 мг, 5,90 ммоль, 1,5 экв.), ТЭА (1,19 г, 11,80 ммоль, 1,64 мл, 3 экв.) и ГБТУ (1,64 г, 4,33 ммоль, 1,1 экв.) в АЦН (10 мл) перемешивают при 25°C в течение 2 ч и затем концентрируют. Смесь затем выливают в H2O (20 мл) и экстрагируют EtOAc (20 мл х 3). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Смесь очищают преп-ВЭЖХ (колонка: Phenomenex Gemini C18 250*50 10 мк; подвижная фаза: [вода (0,05% гидроксид аммония об./об.)-АЦН]; B%: 10%-40%, 20 мин) с получением трет-бутил 2-карбамоил-5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-1-карбоксилата (1 г, 3,01 ммоль, 76,38% выход, 99% чистота) в виде белого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 330,2
Получение соединения 175
Общий способ L, транс-трет-бутил 2-карбамотиоил-5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 346,1
Получение соединения 176
К раствору транс-трет-бутил 2-карбамотиоил-5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-1-карбоксилата (650 мг, 1,88 ммоль, 1,0 экв.) в Тол. (20 мл) добавляют БУФЕР (784,76 мг, 2,82 ммоль, 1,5 экв.) и 2-хлорацетальдегид (3,69 г, 18,82 ммоль, 3,03 мл, 10 экв.). Смесь перемешивают при 100°C в течение 1,5 ч и затем выливают в воду (20 мл) и экстрагируют EtOAc (10 мл x 3). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают основной преп-ВЭЖХ с получением транс-трет-бутил 5-(изопропоксикарбониламино)-2-тиазол-2-ил-пиперидин-1-карбоксилата (80 мг, 216,52 мкмоль, 11,51% выход) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,75 (д, J=3,4 Гц, 1H), 7,58 (д, J=2,9 Гц, 1H), 5,60 (шс, 1H), 4,95-4,90 (м, 1H), 4,23 (шд, J=14,7 Гц, 1H), 3,68 (шс, 1H), 3,11-2,94 (м, 1H), 2,42-2,31 (м, 1H), 2,30-2,17 (м, 1H), 1,93-1,79 (м, 1H), 1,75-1,64 (м, 1H), 1,50 (с, 9H), 1,30-1,23 (м, 6H)
Получение соединения 177
Общий способ J, транс-трет-бутил 2-(5-бромтиазол-2-ил)-5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 450,2/448,2
Получение соединения 178
Общий способ B, транс-трет-бутил 2-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]-5-(изопропоксикарбониламино)пиперидин-1-карбоксилат. ИЭР [M+H] = 682,3
Получение пр. 63
Общий способ C, транс-изопропил N-[6-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]-3-пиперидил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,40 (д, J=2,0 Гц, 1H), 7,86 (с, 1H), 7,65 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,38 (д, J=8,4 Гц, 1H), 5,05-4,94 (м, 1H), 4,85-4,81 (м, 1H), 4,67 (дд, J=2,9, 11,9 Гц, 1H), 3,92-3,82 (м, 1H), 3,60 (шдд, J=3,6, 11,8 Гц, 1H), 2,92 (т, J=11,9 Гц, 1H), 2,48 (шдд, J=3,2, 14,2 Гц, 1H), 2,22-2,03 (м, 2H), 1,82-1,70 (м, 1H), 1,32 (д, J=6,4 Гц, 6H), 1,24 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,19 (с, 9H). ИЭР [M+H]=582,2
Пример 64. Синтез изопропил ((3R,6S)-6-(5-(4-(3-бензилуреидо)-2-(N-(трет-бутил)сульфамоил)фенил)тиазол-2-ил)пиперидин-3-ил)карбамата
Следующее соединение синтезируют тем же способом через ключевое промежуточное соединение 178.
1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,30 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,86 (с, 1H), 7,66 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,38-7,20 (м, 6H), 4,85-4,82 (м, 1H), 4,70 (дд, J=3,2, 12,0 Гц, 1H), 4,42 (с, 2H), 3,93-3,82 (м, 1H), 3,62 (шдд, J=3,5, 11,7 Гц, 1H), 3,00-2,90 (м, 1H), 2,52-2,44 (м, 1H), 2,23-2,04 (м, 2H), 1,84-1,70 (м, 1H), 1,26-1,21 (м, 6H), 1,18 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 629,2
Пример 65. Синтез изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[3-(изопропоксикарбониламино)циклобутил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат
Схема 24:
Получение соединения 180
К раствору транс-3-(трет-бутоксикарбониламино)циклобутанкарбоновой кислоты (500 мг, 2,32 ммоль, 1 экв.), ДИЭА (750,54 мг, 5,81 ммоль, 1,01 мл, 2,5 экв.) в ТГФ (10 мл) добавляют ЭТИЛХЛОРОФОРМИAT (277,29 мг, 2,56 ммоль, 1,1 экв.) и смесь перемешивают при 0°C в течение 1 ч. Затем его добавляют в NH3.H2O (1,30 г, 9,29 ммоль, 1,43 мл, 25% чистота, 4 экв.) в ТГФ (10 мл) и диоксане (10 мл) и смесь перемешивают при 25°C в течение 1 ч. Смесь промывают 1N HCl (20 мл), насыщ. водн. Na2CO3 (20 мл) и органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением транс-трет-бутил N-(3-карбамоилциклобутил)карбамата (0,39 г, неочищенное) в виде белого твердого вещества, 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=7,20-7,07 (м, 2H), 6,71 (шс, 1H), 4,09-4,00 (м, 1H), 2,72 (шт, J=9,3 Гц, 1H), 2,23 (шт, J=8,7 Гц, 2H), 2,01 (кв, J=9,8 Гц, 2H), 1,34 (с, 9H). ИЭР[M+Na]=237,1
Получение соединения 181
Общий способ L, транс-трет-бутил N-(3-карбамотиоилциклобутил)карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=9,33 (шс, 1H), 9,02 (шс, 1H), 7,18 (шд, J=5,5 Гц, 1H), 4,16-4,03 (м, 1H), 3,33 (шс, 1H), 2,45 (шд, J=12,2 Гц, 2H), 2,15 (шд, J=6,5 Гц, 2H), 1,37 (шс, 9H)
Получение соединения 182
Общий способ M, транс-трет-бутил N-(3-тиазол-2-илциклобутил)карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=7,62 (д, J=3,2 Гц, 1H), 7,14 (дд, J=3,3, 8,3 Гц, 1H), 4,79 (шс, 1H), 4,34 (шс, 1H), 3,47-3,36 (м, 1H), 2,81 (шд, J=8,8 Гц, 1H), 2,66 (ддд, J=4,5, 7,9, 12,8 Гц, 1H), 2,46-2,34 (м, 1H), 2,17-2,09 (м, 1H), 1,38 (с, 9H). ИЭР[M+H]=255,3
Получение соединения 183
Общий способ J, транс-трет-бутил N-[3-(5-бромтиазол-2-ил)циклобутил]карбамат. ИЭР[M+H]=335,1/333,1
Получение соединения 184
Общий способ K, транс-трет-бутил N-[3-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклобутил]карбамат. ИЭР[M+H]=481,0
Получение соединения 185
Общий способ F, транс-5-амино-2-[2-(3-аминоциклобутил)тиазол-5-ил]-N-трет-бутил-бензолсульфонамид. ИЭР[M+H]=381,2
Получение пр. 65
Общий способ D, изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[3-(изопропоксикарбониламино)циклобутил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,34 (д, J=1,5 Гц, 1H), 7,76-7,65 (м, 2H), 7,38 (т, J=8,5 Гц, 1H), 5,04-4,94 (м, 1H), 4,82 (шд, J=6,4 Гц, 1H), 4,42-4,32 (м, 0,5H), 4,13 (шт, J=8,0 Гц, 0,5H), 3,87-3,78 (м, 0,5H), 3,58-3,48 (м, 0,5H), 2,82 (дкв, J=2,6, 7,9 Гц, 1H), 2,72-2,64 (м, 1H), 2,60-2,50 (м, 1H), 2,34-2,23 (м, 1H), 1,31 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,22 (шд, J=6,0 Гц, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 553,4
Примеры 66A и 66B
Схема 25:
Получение соединения 31.
К раствору 2-бромбензолсульфонилхлорида (100,00 г, 391,36 ммоль, 1,00 экв.) в H2SO4 (1,0 л) добавляют раствор HNO3 (79,95 г, 1,21 моль, 57,11 мл, 95% чистота, 3,08 экв.) в H2SO4 (0,50 л) по каплям при 0°C. Смесь перемешивают при 26°C в течение 2 ч. ТСХ (Петролейный эфир:EtOAc=10:1, Rf=0,40) показала завершение реакции. Смесь медленно добавляют в ледяную воду (5 л) при энергичном перемешивании и затем фильтруют. Фильтровальную лепешку промывают H2O (1 л х 3) и сушат с получением 2-бром-5-нитробензолсульфонилхлорида (105,00 г, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ХЛОРОФОРМ-d) δ=8,98 (д, J=2,4 Гц, 1H), 8,37 (дд, J=2,5, 8,7 Гц, 1H), 8,09 (д, J=8,6 Гц, 1H).
Получение соединения 32.
К смеси 2-метилпропан-2-амина (200 г, 2,73 моль, 287,36 мл, 3,29 экв.) и ДМАП (10 г, 81,85 ммоль, 0,1 экв.) в ДХМ (2 л) добавляют 2-бром-5-нитробензолсульфонилхлорид (250 г, 831,91 ммоль, 1 экв.) порциями при 0°C. Смесь нагревают до 15°C и перемешивают в течение 1 ч. ЖХМС показала завершение реакции. Смесь промывают HCl (1 N, 2 л), насыщ. водн. NaHCO3 (500 мл) и насыщенным раствором соли (500 мл), сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 2-бром-N-трет-бутил-5-нитробензолсульфонамида (240 г, неочищенное) в виде серого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 336,9/338,9.
Получение соединения 33.
К раствору 2-бром-N-трет-бутил-5-нитробензолсульфонамида (35 г, 103,80 ммоль, 1 экв.) в ДМА (300 мл), добавляют тиазол (26,51 г, 311,40 ммоль, 3 экв.), Pd(OAc)2 (2,33 г, 10,38 ммоль, 0,1 экв.) и KOAc (30,56 г, 311,40 ммоль, 3 экв.). Смесь перемешивают при 140°C в течение 16 ч в атмосфере N2. ЖХМС показала завершение реакции, смесь выливают в воду (3 л) и фильтруют. Фильтровальную лепешку промывают водой (200 мл x 3) и затем сушат с получением N-трет-бутил-5-нитро-2-тиазол-5-илбензолсульфонамида (25,1 г, неочищенное) в виде черно-коричневого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=9,30 (с, 1H), 8,81 (д, J=2,4 Гц, 1H), 8,46 (дд, J=2,4, 8,3 Гц, 1H), 8,12 (с, 1H), 7,83 (д, J=8,3 Гц, 1H), 7,60 (с, 1H), 1,07 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 342,0.
Получение соединения 34.
К раствору N-трет-бутил-5-нитро-2-тиазол-5-илбензолсульфонамида (15 г, 43,94 ммоль, 1 экв.) в AcOH (200 мл), добавляют KOAc (21,56 г, 219,68 ммоль, 5 экв.) и Br2 (35,11 г, 219,68 ммоль, 5 экв.). Смесь перемешивают при 80°C в течение 3 ч. ЖХМС показала завершение реакции, смесь гасят насыщ. водн. Na2CO3 (1 л) и экстрагируют EtOAc (300 мл x 3). Объединенную органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 2-(2-бромтиазол-5-ил)-N-трет-бутил-5-нитробензолсульфонамида (18 г, неочищенное) в виде зеленого твердого вещества, которое применяют без какой-либо очистки.
Получение соединения 35.
К раствору 2-(2-бромтиазол-5-ил)-N-трет-бутил-5-нитробензолсульфонамида (8,5 г, 20,22 ммоль, 1 экв.) в EtOH (70 мл), ТГФ (40 мл) и H2O (20 мл), добавляют Fe (3,39 г, 60,67 ммоль, 3 экв.) и NH4Cl (3,25 г, 60,67 ммоль, 2,12 мл, 3 экв.). Смесь перемешивают при 90°C в течение 1 ч. ЖХМС показала завершение реакции. Смесь фильтруют, фильтрат концентрируют для удаления органического растворителя и экстрагируют ДХМ (200 мл x 2). Органическую фазу сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 5-амино-2-(2-бромтиазол-5-ил)-N-трет-бутилбензолсульфонамида (6 г, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР показал правильную структуру. 1H ЯМР (400 МГц, ДМСО-d6) δ=7,58-7,52 (м, 1H), 7,30 (д, J=2,4 Гц, 1H), 7,11 (д, J=8,3 Гц, 1H), 6,99 (с, 1H), 6,73 (дд, J=2,4, 8,3 Гц, 1H), 5,94 (с, 2H), 1,07 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 390,0/392,0.
Получение соединения 36.
Общий способ D, (4-нитрофенил) N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат в виде раствора в ДХМ. ИЭР [M+H] = 555,0/557,0
Получение соединения 37.
Общий способ H, 1-бензил-3-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]мочевина. ИЭР [M+H] = 523,0/525,0.
Получение соединения 38.
Общий способ B (реакция Сузуки), трет-бутил-N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогекс-3-ен-1-ил]карбамат (Соединение 38).
К раствору Соединения 17 (1 экв.) в диоксане и H2O добавляют Pd(dppf)Cl2 (0,1 экв.), Соединение 37 (0,9 экв.) и Na2CO3 (3 экв.). Смесь перемешивают при 80°C в течение 12 ч в атмосфере N2. ЖХМС показала завершение реакции. Смесь концентрируют, и остаток очищают преп-ТСХ (ПЭ/EtOAc=1:1) с получением продукта 38. ИЭР [M+H] = 640,5
Получение соединения 39.
трет-бутил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат .
К раствору Соединения 38 (1 экв.) и AcOH (0,1 экв.) в EtOAc добавляют Pd/C (10% чистота, 1,00 экв.). Смесь перемешивают под H2 (15 ф./кв.д.) при 40°C в течение 1 ч. ЖХМС показала завершение реакции, и затем смесь фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир/Этилацетат=10/1-1:1) с получением Соединения 39. ИЭР [M+H] = 642,5
Получение соединения 40.
Общий способ F, 1-[4-[2-(4-аминоциклогексил)тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-3-бензилмочевина. ИЭР [M+H] = 542,5.
Получение соединения 41
Общий способ D, изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат, ИЭР [M+H] = 628,3.
Получение соединения Пр. 66A и Пр. 66B.
Соединение 41 разделяют СЖХ (инструмент: Thar SFC80 для препаративной СЖХ; колонка: Chiralpak AD-H 250*30 мм в.д. 5 мк; подвижная фаза: A для CO2 и B для ИПС (0,1% NH3H2O); градиент: B%=42%; скорость потока: 70 г/мин; длина волны: 220 нм; температура колонки: 40°С; обратное давление системы: 100 бар; время цикла: 20 мин; количество впрыска: 4 мг на впрыск) и затем очищают преп-ВЭЖХ (колонка: Luna C18 100*30 5 мк; подвижная фаза: [вода (0,1% ТФК)-АЦН]; B%: 35%-75%,5 мин). Получают транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат Пр. 66A (11,54 мг, 18,38 мкмоль, 5,53% выход, 100% чистота) и цис-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат Пр. 66B (9,38 мг, 14,94 мкмоль, 4,50% выход, 100% чистота).
Транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат , 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,72 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,6, 8,3 Гц, 1H), 7,37-7,30 (м, 5H), 7,27-7,22 (м, 1H), 4,85-4,78 (м, 1H), 4,41 (с, 2H), 3,50-3,39 (м, 1H), 3,06-2,96 (м, 1H), 2,22 (шд, J=11,8 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=10,1 Гц, 2H), 1,76-1,62 (м, 2H), 1,41 (дкв, J=3,1, 12,7 Гц, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,11 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 628,2.
Цис-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,25 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,74 (с, 1H), 7,70 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,38-7,30 (м, 5H), 7,28-7,22 (м, 1H), 4,82 (шд, J=6,1 Гц, 1H), 4,41 (с, 2H), 3,74 (шс, 1H), 3,20-3,13 (м, 1H), 2,03-1,95 (м, 4H), 1,86-1,72 (м, 4H), 1,23 (д, J=6,1 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 628,2.
Примеры 67A и 67B
Схема 26:
Получение соединения 42.
Общий способ D, изопропил N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 476,0/478,0.
Получение соединения 43
Общий способ B, изопропил N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)циклогексен-1-ил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 593,3.
Получение соединения 44.
Общий способ I, изопропил N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 595,3.
Получение соединения 45.
Общий способ F, изопропил N-[4-[2-(4-аминоциклогексил)тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 495,2.
Получение соединения 46.
Общий способ D, изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 581,2.
Получение Пр. 67A и Пр. 67B
Соединение 46 разделяют СЖХ (инструмент: Thar SFC80 для препаративной СЖХ; Колонка: ChiralpakAD-H 250*30 мм в.д. 5 мк; Подвижная фаза: A для CO2 и B для ИПС (0,1% NH3H2O); Градиент: B%=30%; Скорость потока: 70 г/мин; длина волны: 220 гм; температура колонки: 40°С; обратное давление системы: 100 бар; время цикла: 8 мин; количество впрыска: 3 мг на впрыск); и затем очищают преп-ВЭЖХ (Колонка: Agela Durashell C18 150*25 5 мк; подвижная фаза: [вода(0,1% ТФК)-АЦН]; B%: 55%-85%, 12 мин), транс-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат Пр. 67A (5,76 мг, 100% чистота) и цис-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат Пр. 67B (3,95 мг, 100% чистота) получают в виде бледно-желтого твердого вещества.
Транс-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат (соединение S12). 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,37 (д, J=2,3 Гц, 1H), 7,75 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,2, 8,4 Гц, 1H), 7,40 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,01 (тд, J=6,3, 12,5 Гц, 1H), 4,86-4,82 (м, 1H), 3,52-3,42 (м, 1H), 3,04 (тт, J=3,5, 12,0 Гц, 1H), 2,35-2,19 (м, 2H), 2,15-1,99 (м, 2H), 1,72 (дкв, J=3,0, 12,9 Гц, 2H), 1,43 (дкв, J=3,3, 12,6 Гц, 2H), 1,34 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,25 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 581,2.
Цис-изопропил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат (Соединение S13) . 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,37 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,76 (с, 1H), 7,70 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,40 (д, J=8,3 Гц, 1H), 5,01 (тд, J=6,3, 12,5 Гц, 1H), 4,84 (шс, 1H), 3,77 (шс, 1H), 3,23-3,15 (м, 1H), 2,05-1,98 (м, 4H), 1,89-1,72 (м, 4H), 1,34 (д, J=6,2 Гц, 6H), 1,25 (д, J=6,1 Гц, 6H), 1,16 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 581,2
Пример 68. Синтез изопропил N-[1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил]карбамата
Схема 27:
Получение соединения 24.
Смесь 1-бензил-3-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]мочевины (0,06 г, 114,62 мкмоль, 1,0 экв.), трет-бутил N-(4-пиперидил)карбамата (40 мг, 199,72 мкмоль, 1,74 экв.), Xantphos (6,63 мг, 11,46 мкмоль, 0,1 экв.), Pd(OAc)2 (2,57 мг, 11,46 мкмоль, 0,1 экв.) и Cs2CO3 (112,04 мг, 343,86 мкмоль, 3,0 экв.) в АЦН (3 мл) нагревают до 80 C в течение 12 ч в атмосфере N2. ЖХМС показала завершение реакции, и смесь концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (Петролейный эфир:Этилацетат=1:1) с получением трет-бутил N-[1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил]карбамата (0,03 г, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 643,1.
Получение соединения 25.
Трет-бутил N-[1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил]карбамат (30 мг, 46,67 мкмоль, 1,0 экв.) растворяют в HCl/MeOH (4M, 1 мл) и смесь перемешивают при 20°C в течение 0,5 ч. ЖХМС показала завершение реакции, и смесь концентрируют с получением 1-[4-[2-(4-амино-1-пиперидил)тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]-3-бензилмочевины (27 мг, неочищенное, соль HCl) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 543,2.
Получение пр. 68.
Общий способ D, изопропил N-[1-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,69 (дд, J=2,4, 8,4 Гц, 1H), 7,39 (д, J=8,4 Гц, 1H), 7,36-7,19 (м, 6H), 4,82-4,73 (м, 1H), 4,40 (с, 2H), 3,92 (шд, J=13,7 Гц, 2H), 3,75-3,68 (м, 1H), 3,43 (шт, J=11,0 Гц, 2H), 2,10-2,02 (м, 2H), 1,71-1,60 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,18 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 629,2.
Пример 69. Синтез изопропил N-[1-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил]карбамата
Схема 28:
Получение соединения 26.
Общий способ D, изопропил N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат. ИЭР [M+H] = 478,0/476,0.
Получение соединения 27.
К раствору изопропил N-[4-(2-бромтиазол-5-ил)-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамата (0,05 г, 104,95 мкмоль, 1,0 экв.) в MeCN (2 мл) добавляют Cs2CO3 (102,59 мг, 314,86 мкмоль, 3,0 экв.), KI (17,42 мг, 104,95 мкмоль, 1,0 экв.) и трет-бутил N-(4-пиперидил)карбамат (105,10 мг, 524,76 мкмоль, 5,0 экв.). Смесь перемешивают при 95°C в течение 12 ч и затем концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=4:3) с получением N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)-1-пиперидил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамата (0,025 г, неочищенное) в виде белого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 596,2.
Получение соединения 28.
Изопропил N-[4-[2-[4-(трет-бутоксикарбониламино)-1-пиперидил]тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамат (0,025 г, 41,96 мкмоль, 1,0 экв.) растворяют в HCl/MeOH (4M, 1,5 мл) и смесь перемешивают при 20°C в течение 0,5 ч. ЖХМС показала завершение реакции, и смесь концентрируют с получением N-[4-[2-(4-амино-1-пиперидил)тиазол-5-ил]-3-(трет-бутилсульфамоил)фенил]карбамата (0,02 г, неочищенное, соль HCl) в виде белого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 496,2.
Получение пр. 69.
Общий способ D, изопропил N-[1-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-(изопропоксикарбониламино)фенил]тиазол-2-ил]-4-пиперидил]карбамат. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,35 (с, 1H), 7,66 (шд, J=8,4 Гц, 1H), 7,42 (д, J=8,4 Гц, 1H), 7,31 (с, 1H), 4,98 (тд, J=6,2, 12,5 Гц, 1H), 4,84-4,77 (м, 1H), 3,93 (шд, J=13,5 Гц, 2H), 3,77-3,67 (м, 1H), 3,44 (шт, J=12,3 Гц, 2H), 2,06 (шдд, J=3,1, 13,2 Гц, 2H), 1,71-1,61 (м, 2H), 1,31 (д, J=6,4 Гц, 6H), 1,23 (шд, J=6,2 Гц, 6H), 1,19 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 582,2.
Пример 70. Синтез транс-изопропил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[(2-фторфенил)метоксикарбониламино]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 29:
Получение соединения 2.
К смеси транс-4-(трет-бутоксикарбониламино)циклогексанкарбоновой кислоты (65,0 г, 267,2 ммоль, 1,0 экв.), NH4Cl (21,4 г, 400,7 ммоль, 1,5 экв.) и ТЭА (801,5 ммоль, 111,6 мл, 3 экв.) в MeCN (1,3 л) добавляют ГБТУ (111,5 г, 293,9 ммоль, 1,1 экв.) и смесь перемешивают при 25°C в течение 3 ч. Смесь фильтруют, и затем фильтровальную лепешку промывают петролейным эфиром (200 мл) и сушат с получением транс-трет-бутил N-(4-карбамоилциклогексил)карбамата (140 г, неочищенное, 2 партии) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (МЕТАНОЛ-d4, 400 МГц) δ=3,25-3,34 (м, 1H), 2,14 (тт, J=12,3, 3,5 Гц, 1H), 1,83-1,99 (м, 4H), 1,52 (квд, J=13,1, 2,9 Гц, 2H), 1,42 (с, 9H), 1,21 (квд, J=12,7, 3,5 Гц, 2H)
Получение соединения 3.
Смесь транс-трет-бутил N-(4-карбамоилциклогексил)карбамата (90,0 г, 371,4 ммоль, 1,0 экв.), Na2CO3 (39,4 г, 371,4 ммоль, 1,0 экв.) и реагента Ловессона (82,6 г, 204,3 ммоль, 0,55 экв.) в 2-Me-ТГФ (600 мл) перемешивают при 80°C в течение 2 ч, и затем реакционную смесь выливают в H2O (200 мл). Водную фазу экстрагируют EtOAc (500 мл x 2). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением транс-трет-бутил N-(4-карбамотиоилциклогексил)карбамата (180 г, неочищенное, 2 партии) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (МЕТАНОЛ-d4, 400 МГц) δ=3,35-3,46 (м, 1H), 2,87-3,00 (м, 1H), 2,09-2,20 (м, 2H), 1,99-2,09 (м, 2H), 1,54-1,68 (м, 2H), 1,26-1,45 (м, 2H), 1,14-1,25 (м, 9H)
Получение соединения 4.
Смесь транс-трет-бутил N-(4-карбамотиоилциклогексил)карбамата (180,0 г, 696,7 ммоль, 1,0 экв.), 2-бром-1,1-диэтоксиэтана (137,3 г, 696,7 ммоль, 1,0 экв.) и TsOH.H2O (265 г, 1,4 моль, 2 экв.) в EtOH (2,0 л) перемешивают при 80°C в течение 6 ч. Затем смесь охлаждают до КТ и доводят до рH=9 насыщ. водн. Na2CO3 и добавляют Boc2O (152 г, 696,7 ммоль, 1 экв.). Смесь перемешивают при 30°C в течение 3 ч, затем концентрируют и разбавляют H2O (2 л). Смесь экстрагируют EtOAc (800 мл x 3), и объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток растирают с петролейным эфиром (1,5 л) с получением транс-трет-бутил N-(4-тиазол-2-илциклогексил)карбамата (70 г, 247,87 ммоль, 35,58% выход) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (МЕТАНОЛ-d4, 400 МГц) δ=7,67 (д, J=3,1 Гц, 1H), 7,44 (д, J=3,5 Гц, 1H),3,33-3,44 (м, 1H), 2,93-3,06 (м, 1H), 2,12-2,21 (м, 2H), 2,00-2,09 (м, 2H), 1,57-1,71 (м, 2H), 1,41-1,48 (м, 9H), 1,29-1,38 (м, 1H), 1,13-1,28 (м, 1H).
Получение соединения 5.
Смесь транс-трет-бутил N-(4-тиазол-2-илциклогексил)карбамата (68 г, 240,8 ммоль, 1 экв.) и NBS (47,1 г, 264,9 ммоль, 1,1 экв.) в ДМФ (500 мл) перемешивают при 25°C в течение 10 ч и затем выливают в H2O (2 л) и экстрагируют EtOAc (500 мл x 3). Объединенные органические слои промывают насыщенным раствором соли (300 мл x 5), сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=20:1-10:1) с получением транс-трет-бутил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (78 г, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 363,0/361,0
Получение соединения 6.
Смесь транс-трет-бутил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (50 г, 138,4 ммоль, 1 экв.) в HCl/MeOH (4 M, 700 мл) перемешивают при 25°C в течение 0,5 ч и затем концентрируют с получением транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексанамина (45 г, неочищенное, соль HCl) в виде желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 263,0/261,0
Получение соединения 7.
К раствору транс-4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексанамина (45 г, соль HCl, 172,3 ммоль, 1 экв.), пиридина (61,5 ммоль, 69,5 мл, 5 экв.) и ДМАП (4,2 г, 34,5 ммоль, 0,2 экв.) в ДХМ (300 мл) добавляют изопропил хлорформиат (258,5 ммоль, 35,9 мл, 1,5 экв.) по каплям при 0°C. Смесь перемешивают при 25°C в течение 0,5 ч и затем промывают HCl (1N, 1л) и насыщ. водн. Na2CO3 (1л). Органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=15:1-10:1) с получением транс-изопропил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (37 г, 106,55 ммоль, 61,84% выход) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (МЕТАНОЛ-d4, 400 МГц) δ=7,60 (с, 1H), 4,81 (дт, J=12,2, 6,2 Гц, 1H), 3,41 (тт, J=11,6, 4,0 Гц, 1H), 2,88-3,00 (м, 1H), 2,10-2,20 (м, 2H), 1,98-2,07 (м, 2H), 1,55-1,68 (м, 2H), 1,30-1,43 (м, 2H), 1,21 (шд, J=6,2 Гц, 6H).
Получение соединения 8.
Смесь транс-изопропил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (16,2 г, 46,7 ммоль, 1 экв.), 5-амино-N-трет-бутил-2-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензолсульфонамида (19,9 г, 56,1 ммоль, 1,2 экв.), KF (4,1 г, 70,1 ммоль, 1,5 экв.), Na2CO3 (14,9 г, 140,2 ммоль, 3 экв.) и Pd(PPh3)4 (1,6 г, 1,4 ммоль, 0,03 экв.) в толуоле (150 мл), EtOH (150 мл) и H2O (50 мл) перемешивают при 80°C в течение 6 ч в атмосфере N2. Реакционную смесь концентрируют, и остаток разбавляют H2O (100 мл) и экстрагируют EtOAc (100 мл x 2). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=20:1-1:1) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (13 г, 26,3 ммоль, 56,2% выход) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,65-7,60 (м, 1H), 7,43 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,13 (д, J=8,3 Гц, 1H), 6,83 (дд, J=2,6, 8,3 Гц, 1H), 4,81 (шс, 1H), 3,76-3,71 (м, 1H), 3,05-2,86 (м, 1H), 2,20 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,06 (шд, J=10,5 Гц, 2H), 1,75-1,60 (м, 2H), 1,47-1,34 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,09 (с, 9H).
Получение соединения 9.
К раствору транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-(трет-бутилсульфамоил)фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (250 мг, 505,4 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (4 мл) добавляют ДМАП (6,2 мг, 50,5 мкмоль, 0,1 экв.), пиридин (120 мг, 1,5 ммоль, 3 экв.) и (4-нитрофенил)хлорформиат (153 мг, 758 мкмоль, 1,5 экв.). Смесь перемешивают при 25°C в течение 0,5 ч и применяют сразу на следующей стадии. ИЭР [M+H] = 660,2
Получение соединения Пр. 70.
К раствору (2-фторфенил)метанола (45,9 мг, 363,8 мкмоль, 3 экв.) и ДИЭА (47 мг, 363,8 мкмоль, 3 экв.) в MeCN (1 мл) добавляют полученный выше раствор (1 мл). Смесь перемешивают при 80°C в течение 1 ч, затем концентрируют и остаток очищают преп-ВЭЖХ (Колонка: Waters Xbridge 150*25 5 мк; Подвижная фаза: [вода(10 мМ NH4HCO3)-АЦН]; B%: 42%-72%, 12 мин) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[(2-фторфенил)метоксикарбониламино]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (16,34 мг, 25,26 мкмоль, 20,83% выход, 100% чистота) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,36 (с, 1H), 7,77-7,63 (м, 2H), 7,52 (т, J=7,0 Гц, 1H), 7,44-7,31 (м, 2H), 7,23-7,08 (м, 2H), 5,29 (с, 2H), 4,83 (шс, 1H), 3,46 (шд, J=11,8 Гц, 1H), 3,00 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,22 (шд, J=12,7 Гц, 2H), 2,07 (шд, J=11,4 Гц, 2H), 1,76-1,62 (м, 2H), 1,47-1,35 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 647,2
Пример 71. Синтез транс-[(1S)-1-фенилэтил] N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 30:
Получение пр. 71.
К раствору (1S)-1-фенилэтанола (29,6 мг, 242,5 мкмоль, 2 экв.) и ДИЭА (47 мг, 363,8 мкмоль, 3 экв.) в MeCN (2 мл) добавляют раствор транс-(4-нитрофенил) N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата (80 мг, 121,25 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (1 мл). Смесь перемешивают при 80°C в течение 1 ч, затем концентрируют и остаток очищают преп-ВЭЖХ (Колонка: Nano-Micro UniSil 5-100 C18 ULTRA 100*250 мм 5 мкм; подвижная фаза: [вода (0,1% ТФК)-АЦН]; B%: 55%-80%, 11 мин) с получением транс-[(1S)-1-фенилэтил] N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата (12,19 мг, 18,77 мкмоль, 15,48% выход, 99% чистота) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,35 (шс, 1H), 7,81-7,65 (м, 2H), 7,48-7,36 (м, 5H), 7,31 (шд, J=6,8 Гц, 1H), 5,89 (шд, J=6,2 Гц, 1H), 4,85 (шд, J=5,5 Гц, 1H), 3,47 (шс, 1H), 3,03 (шс, 1H), 2,24 (шд, J=11,2 Гц, 2H), 2,08 (шд, J=11,0 Гц, 2H), 1,71 (кв, J=11,9 Гц, 2H), 1,61 (шд, J=6,4 Гц, 3H), 1,49-1,37 (м, 2H), 1,24 (шд, J=5,4 Гц, 6H), 1,13 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 643,2
Пример 72. Синтез N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата
Схема 31:
Получение пр. 72.
К раствору 2-пиридилметанола (26,5 мг, 242,5 мкмоль, 2 экв.) и ДИЭА (47 мг, 363,8 мкмоль, 3 экв.) в MeCN (2 мл) добавляют раствор транс-(4-нитрофенил) N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата (80 мг, 121,3 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (1 мл). Смесь перемешивают при 80°C в течение 1 ч, затем концентрируют и остаток очищают преп-ВЭЖХ (Колонка: Waters Xbridge 150*25 5 мк; Подвижная фаза: [вода (0,04% NH3H2O+10 мМ NH4HCO3)-АЦН]; B%: 35%-65%, 10 мин) с получением транс-2-пиридилметил N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата (18,59 мг, 28,82 мкмоль, 23,77% выход, 97,65% чистота) в виде бледно-желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,56 (шд, J=4,5 Гц, 1H), 8,38 (д, J=1,8 Гц, 1H), 7,94-7,87 (м, 1H), 7,78-7,72 (м, 2H), 7,59 (шд, J=7,8 Гц, 1H), 7,44-7,38 (м, 2H), 5,32 (с, 2H), 4,85 (тд, J=5,9, 12,0 Гц, 1H), 3,47 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 3,07-2,96 (м, 1H), 2,24 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,13-2,04 (м, 2H), 1,77-1,65 (м, 2H), 1,48-1,37 (м, 2H), 1,24 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,14 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 630,2
Пример 73. Синтез транс-изопропил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[(4-гидроксифенил)метилкарбамоиламино]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 32:
Получение пр. 73.
К раствору 4-(аминометил)фенола (74,7 мг, 606,5 мкмоль, 3 экв.) и ДИЭА (78,4 мг, 606,5 мкмоль,3 экв.) в ДХМ (2 мл) добавляют транс-(4-нитрофенил) N-[3-(трет-бутилсульфамоил)-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамат (133,4 мг, 202,2 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (2 мл). Смесь перемешивают при 25°C в течение 1 ч, затем концентрируют и остаток очищают преп-ВЭЖХ (ТФК условия) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[2-(трет-бутилсульфамоил)-4-[(4-гидроксифенил)метилкарбамоиламино]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (23,56 мг, 35,99 мкмоль, 17,80% выход, 98,357% чистота) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,24 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,77 (с, 1H), 7,69 (дд, J=2,2, 8,3 Гц, 1H), 7,36 (д, J=8,3 Гц, 1H), 7,16 (д, J=8,8 Гц, 2H), 6,75 (д, J=8,3 Гц, 2H), 4,85-4,74 (м, 1H), 4,30 (с, 2H), 3,45 (с, 1H), 3,15-2,97 (м, 1H), 2,23 (шд, J=12,3 Гц, 2H), 2,08 (шд, J=13,2 Гц, 2H), 1,79-1,63 (м, 2H), 1,48-1,34 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,12 (с, 9H). ИЭР [M+H] = 644,2
Пример 74. Синтез транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-[(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата
Схема 33:
Получение соединения 11.
К смеси 2-амино-2-метилпропан-1-ола (3 г, 33,7 ммоль, 5,1 экв.) и ДМАП (80 мг, 654,8 мкмоль, 0,98 экв.) в ДХМ (50 мл) добавляют 2-бром-5-нитробензолсульфонилхлорид (2 г, 6,66 ммоль, 1 экв.). Смесь перемешивают при 20°C в течение 30 мин, затем промывают 1N HCl (20 мл) и насыщ. водн. NaHCO3 (20 мл). Органический слой сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют с получением 2-бром-N-(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)-5-нитробензолсульфонамида (1,7 г, 4,8 ммоль, 72,3% выход) в виде желтой камеди. ИЭР [M+H] = 355,0/353,0
Получение соединения 12.
Смесь 2-бром-N-(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)-5-нитробензолсульфонамида (1,7 г, 4,8 ммоль, 1 экв.), Fe (1,5 г, 26,9 ммоль, 5,6 экв.) и NH4Cl (800 мг, 14,9 ммоль, 3,1 экв.) в EtOH (15 мл)/H2O (7,5 мл)/ТГФ (7,5 мл) перемешивают при 80°C в течение 2 ч. Реакционную смесь концентрируют для удаления EtOH, разбавляют H2O (100 мл) и экстрагируют EtOAc (100 мл x 3). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=100:1-1:1) с получением 5-амино-2-бром-N-(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)бензолсульфонамида (1,1 г, 3,4 ммоль, 70,7% выход) в виде бледно-желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 325,0/323,0
Получение соединения 13.
Смесь 5-амино-2-бром-N-(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)бензолсульфонамида (400 мг, 1,24 ммоль, 1 экв.), 4,4,5,5-тетраметил-2-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)-1,3,2-диоксаборолана (942,8 мг, 3,7 ммоль, 3 экв.), Pd(dppf)Cl2 (90,6 мг, 123,8 мкмоль, 0,1 экв.) и KOAc (364,4 мг, 3,7 ммоль, 3 экв.) в диоксане (4 мл) перемешивают при 80°C в течение 12 ч в атмосфере N2, и затем концентрируют. Остаток очищают хроматографией на колонке (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=50:1-3:1) с получением 5-амино-N-(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)-2-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензолсульфонамида (201 мг, неочищенное) в виде белого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,53 (д, J=8,0 Гц, 1H), 7,28 (д, J=2,4 Гц, 1H), 6,75 (дд, J=6,4 Гц, 1H), 3,35 (с, 2H), 1,36 (с, 12H), 1,10 (с, 6H).
Получение соединения 14.
Смесь 5-амино-N-(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)-2-(4,4,5,5-тетраметил-1,3,2-диоксаборолан-2-ил)бензолсульфонамида (140,7 мг, 380,1 мкмоль, 1,2 экв.), транс-изопропил N-[4-(5-бромтиазол-2-ил)циклогексил]карбамата (110 мг, 316,7 мкмоль, 1 экв.), Na2CO3 (100,7 мг, 950,3 мкмоль, 3 экв.), KF (27,6 мг, 475,1 мкмоль, 1,5 экв.) и Pd(PPh3)4 (36,6 мг, 31,7 мкмоль, 0,1 экв.) в толуоле (1 мл)/EtOH (1 мл)/H2O (0,3 мл) перемешивают при 80°C в течение 12 ч в атмосфере N2. Реакционную смесь концентрируют, разбавляют H2O (10 мл) и экстрагируют EtOAc (10 мл x 2). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (SiO2, Этилацетат) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-[(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (117 мг, неочищенное) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=7,63 (д, J=7,0 Гц, 1H), 7,44 (д, J=2,2 Гц, 1H), 7,15 (д, J=8,3 Гц, 1H), 6,83 (дд, J=2,4, 8,1 Гц, 1H), 4,85-4,78 (м, 1H), 3,50-3,39 (м, 1H), 3,25 (с, 2H), 3,03-2,91 (м, 1H), 2,21 (шт, J=6,1 Гц, 2H), 2,12-2,00 (м, 2H), 1,75-1,60 (м, 2H), 1,45-1,33 (м, 2H), 1,28-1,19 (с, 6H), 1,03 (с, 6H)
Получение соединения 15.
К раствору транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-[(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (90 мг, 176,3 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (1 мл) добавляют ТЭА (53,5 мг, 528,7 мкмоль, 3 экв.), ДМАП (2,2 мг, 17,6 мкмоль, 0,1 экв.) и TBSCl (66,4 мг, 440,6 мкмоль, 2,5 экв.). Смесь перемешивают при 30°C в течение 12 ч, и затем концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (SiO2,Петролейный эфир:Этилацетат=2:1) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-[[2-[трет-бутил(диметил)силил]окси-1,1-диметилэтил]сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (120 мг, неочищенное) в виде бледно-желтого твердого вещества. ИЭР [M+H] = 625,2
Получение соединения 16.
К раствору транс-изопропил N-[4-[5-[4-амино-2-[[2-[трет-бутил(диметил)силил]окси-1,1-диметилэтил]сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (90 мг, 144 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (1 мл) добавляют ДМАП (1,8 мг, 14,4 мкмоль, 0,1 экв.), пиридин (34,2 мг, 432 мкмоль,3 экв.) и (4-нитрофенил)хлорформиат (43,5 мг, 216 мкмоль, 1,5 экв.). Смесь перемешивают при 25°C в течение 0,5 ч и применяют на следующей стадии сразу, без дальнейшей очистки. ИЭР [M+H] = 790,3
Получение соединения 17.
К раствору фенилметанамина (36 мг, 336 мкмоль, 3 экв.) в ДХМ (1 мл) добавляют раствор транс-(4-нитрофенил) N-[3-[[2-[трет-бутил(диметил)силил]окси-1,1-диметилэтил]сульфамоил]-4-[2-[4-(изопропоксикарбониламино)циклогексил]тиазол-5-ил]фенил]карбамата (88,5 мг, 112 мкмоль, 1 экв.) в ДХМ (1 мл), и смесь перемешивают при 25°C в течение 0,5 ч. Реакционную смесь разбавляют H2O (10 мл) и экстрагируют EtOAc (10 мл x 2). Объединенные органические слои сушат над Na2SO4, фильтруют и концентрируют. Остаток очищают преп-ТСХ (SiO2, Петролейный эфир:Этилацетат=1:1) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-[[2-[трет-бутил(диметил)силил]окси-1,1-диметилэтил]сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (93 мг, неочищенное) в виде желтой камеди. ИЭР [M+H] = 758,4
Получение пр. 74.
Смесь транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-[[2-[трет-бутил(диметил)силил]окси-1,1-диметилэтил]сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (84,9 мг, 112 мкмоль, 1 экв.) в AcOH (0,5 мл)/ТГФ (0,5 мл)/H2O (0,5 мл) перемешивают при 80°C в течение 0,5 ч. Затем смесь концентрируют и остаток очищают преп-ВЭЖХ (ТФК условия) с получением транс-изопропил N-[4-[5-[4-(бензилкарбамоиламино)-2-[(2-гидрокси-1,1-диметилэтил)сульфамоил]фенил]тиазол-2-ил]циклогексил]карбамата (5,86 мг, 9,10 мкмоль, 8,13% выход, 100% чистота) в виде желтого твердого вещества. 1H ЯМР (400 МГц, МЕТАНОЛ-d4) δ=8,25 (д, J=2,6 Гц, 1H), 7,81-7,66 (м, 2H), 7,40-7,30 (м, 5H), 7,28-7,22 (м, 1H), 4,82 (тд, J=6,0, 12,5 Гц, 1H), 4,41 (с, 2H), 3,45 (шт, J=11,6 Гц, 1H), 3,28 (с, 2H), 3,00 (шт, J=11,8 Гц, 1H), 2,23 (шд, J=13,2 Гц, 2H), 2,11-2,00 (м, 2H), 1,77-1,60 (м, 2H), 1,48-1,32 (м, 2H), 1,22 (шд, J=6,1 Гц, 6H), 1,05 (с, 6H). ИЭР [M+H] = 644,3
Пример 75. Первичный скриннинг соединения
1. УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
Первичным скринингом является фенотипический скрининг, в котором используют синтетическое летальное взаимодействие между AID и RAD51 для идентификации соединений, которые являются как эффективными, так и целевыми. Клетки, экспрессирующие AID, зависят от RAD51 для выживания; ингибирование RAD51 в AID-положительных клетках вызывает цитотоксическое действие. На основании такого действия идентифицируют соединения, которые эффективны в AID-положительных клетках и которые значительно менее эффективны в AID-отрицательных клетках.
2. МАТЕРИАЛЫ И ПОСТАВЩИКИ
Пластиковая посуда и расходные материалы, необходимые для этого эксперимента, включают: среду для культивирования клеток; испарительную буферную среду; 100% ДМСО; 96-луночные U-донные стерильные культуральные планшеты; 250 мл бутылку; 1,5 мл непрозрачные янтарные пробирки Epi; подставку для пробирок Epi; 300 мл резервуары; 25 мл резервуар; 25 мл наконечники для серологических пипеток; 5 мл наконечники для серологических пипеток P1000 Pipette Tips; и P200 Pipette Tips.
Оборудование, необходимое для этого эксперимента, включает: жидкостной манипулятор Viaflo 384; серологическая пипетка Eppendorf; пипетка Eppendorf P1000; и пипетка Eppendorf P200
Клеточные культуры Daudi и WI-38 также необходимы для этого эксперимента.
Наконец, необходимы соединения (например, соединения в соответствии с данным изобретением) для тестирования.
3. МЕТОДИКА
Все стадии проводят в стерильной среде внутри бокса биологической безопасности.
Первой стадия включает проведение анализа уничтожения клеток в колонии клеток Daudi (AID положительной). 96-луночный u-донный планшет готовят, надписывая номер эксперимента, номер планшета, дату и инициалы в верхнем правом углу крышки планшета. Используя стерильный 300 мл резервуар и 25 мл серологическую пипетку, испарительную буферную среду пипетируют в резервуар в 25 мл шагами. С помощью жидкостного манипулятора 150 мкл испарительной буферной среды пипетируют из резервуара в ряды A и H и колонки 1 и 12 96-луночного u-донного планшета. Клеточные культуры считают для получения плотности клеток на мл и жизнеспособности клеток. Информацию о платности клеток применяют для получения 1000000 клеток из культуры с применением 5 мл серологической пипетки в пробирку epi. Информацию о плотности клеток из культуры применяют для расчета количества клеток и объема среды, необходимых для анализа для высевания 1250 клеток в 130 мкл среды на доступную культуральную лунку в 96-луночном u-донном планшете. Ряды B-F применяют для клеток (50 лунок всего), где ряд G остается для пустого контроля со средой. Расчет переоценивают на 10 мл для учета мертвого объема в 300 мл резервуара. Как только рассчитан объем среды, подходящий объем среды пипетируют с 25 мл шагами в 250 мл бутылку с применением 25 мл серологической пипетки. 250 мл бутылку плотно закрывают и помещают в водяную баню с температурой 37°C на 2 минуты. Пока культуральную среду нагревают, 10 мл свежей среды пипетируют из 500 мл бутылки для культуральной среды в стерильный 25 мл резервуар. Применяя многоканальную пипетку Eppendorf, 130 мкл среды пипетируют из 25 мл резервуара в ряд G 96-луночного u-донного планшета. Как только 250 мл бутылка со средой нагреется, необходимый объем культуры пипетируют в бутылку и осторожно смешивают с 25 мл серологической пипеткой так, чтобы не образовывались пузырьки, и затем содержание бутылки пипетируют в новый 300 мл резервуар. С помощью жидкостного манипулятора, 130 мкл культуры пипетируют из 300 мл резервуара в ряды B-F 96-луночного u-донного планшета. Как только добавляют культуру, планшет помещают в 37°C инкубатор до приготовления главного планшета с соединением.
96-луночные u-донные планшеты готовят, записывая наименование шаблонного планшета в верхнем правом углу крышки планшета. Маркируют один главный с ДМСО и другой главный со средой. Исследуемые соединения получают из лабораторного холодильника и помещают в 25-луночную коробку для хранения с крышкой и откладывают коробку в сторону. Соединения встряхивают после оттаивания, но перед применением. Используя автоматическую многоканальную пипетку, 20 мкл 100% ДМСО пипетируют в лунки от B3-B11 до G3-G11 ДМСО главного планшета. Для каждого соединения на главном планшете, 50 мкл соединения пипетируют в соответствующую лунку ряда 2 (см. карту планшета для определения соответствующей лунки). Готовят серийное разведение, начиная с отсасывания 20 мкл из ряда 2 и смешивают с рядом 3, повторяя до достижения 11 ряда. С помощью жидкостного манипулятора, 194 мкл среды Daudi распределяют в лунки от B2-B11 до G2-G11 главного планшета со средой. С помощью жидкостного манипулятора, 6 мкл из главного планшета с ДМСО отсасывают и распределяют в главный планшет со средой, смешивая 100 мкл дважды.
Соединения из главного планшета затем добавляют в культуральный планшет. Культуральные планшеты удаляют из инкубатора и устанавливают внутри бокса биологической безопасности. С помощью жидкостного манипулятора, 20 мкл из лунок от B2-B11 до G2-G11 главного планшета отсасывают и распределяют в лунки от B2-B11 до G2-G11 культурального планшета. Это операцию проводят с каждым культуральным планшетом. Как только культуральные планшеты приобретают их 20 мкл разведений соединения, их помещают обратно в инкубатор до их считывания на 7 день эксперимента. Гибель клеток измеряют на 7 день эксперимента с применением Cell-Titer Glo и ридера Promega Plate.
Процент гибели клеток и значения EC50 рассчитывают сравнением жизнеспособности клеток в лунках, обработанных соединением, и в не обработанных лунках. Нормализованные значения ОСЕ получают вычитанием значений для лунок со средой из каждой из лунок в той же колонке с последующим делением этого значения на значения для клеток, обработанных ДМСО. Процент гибели затем рассчитывают вычитанием нормализованного значения ОСЕ из 1 и умножением на 100. Зачем рассчитывают значение среднего нормализованного процента гибели и стандартную ошибку среднего. Значения гибели затем вводят в Prism с соответствующими стандартными ошибками. В Prism строят кривую нелинейной регрессии с точками ввода данных с применением полулогарифмического масштаба, и рассчитывают значение EC50. Для соединений, которые показывают хорошую эффективность в колонии клеток Daudi, анализ повторяют с применением клеток WI-38 (AID отрицательных).
Данные скриннинга
Таблица 1:
Пример 76. Двусторонняя проницаемость Caco-2
Анализируют двустороннюю проницаемость Caco-2. Клетки Caco-2 высевают в проницаемые поликарбонатные подложки и позволяют дифференцировать в течение около 3 недель до применения в исследованиях. Затем клетки обрабатывают соединениями либо с апикальной, либо с базолатеральной сторон и инкубируют при 37°C в течение вплоть до 90 минут при перемешивании под светом. Затем измеряют перемещение соединения с применением ЖХ/МС/МС анализа в 30, 60 и 90 минут.
Таблица 2
Пример 77. Стабильность в микросомах печени человека
Стабильность заявленных соединений определяют в присутствии микросом печени человека. Соединения инкубируют с микросомами при 37°C в течение 45 минут. Образцы анализируют с применением ЖХ-МС/МС. Анализ данных включает период полувыведения, скорость клиренса и процент печеночного кровотока (% QH) для каждого соединения в различных видах. Ниже представлены данные анализа микросом печени для типовых соединений, которые показывают, что заявленные соединения имеют превосходную метаболическую стабильность.
Таблица 3
Пример 78. Скриннинг колонии клеток
Активность заявленных соединений измеряют во множестве колоний клеток с различными уровнями экспрессии вызванной активацией цитидиндеаминазы (AICDA). Анализ эффективности повторяют во всех перечисленных колониях клеток и записывают значения EC50.
Таблица 4
Пр. 29
Пр. 31
Пр. 66A
Пр. 67A
(головы и шеи)
(желудка)
(лейкоз)
(головы и шеи)
(желудка)
(яичников)
н.о. - не определено
Пример 79. Фармакокинетика (ФК)
Исследования ФК у мышей применяют для определения метаболического пути соединений во всем организме. Крысам дают соединения либо перорально, либо ВВ в указанных дозах и отслеживают в течение вплоть до 24 часов. Образцы плазмы берут в разные моменты времени и анализируют ЖХ-МС.
Таблица 5
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
БЕНЗАМИДНЫЕ СОЕДИНЕНИЯ | 2019 |
|
RU2801647C2 |
ИНГИБИТОРЫ ТРАНСГЛУТАМИНАЗЫ 2 (TG2) | 2019 |
|
RU2781370C2 |
МОДУЛЯТОРЫ ИНТЕГРИРОВАННОГО СИГНАЛЬНОГО ПУТИ СТРЕССА | 2017 |
|
RU2769327C2 |
ЗАМЕЩЕННЫЕ 1,2-ДИГИДРО-3Н-ПИРАЗОЛО[3,4-D]ПИРИМИДИН-3-ОНЫ | 2019 |
|
RU2812726C2 |
ГЕТЕРОЦИКЛИЧЕСКИЕ ПРОИЗВОДНЫЕ И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ | 2015 |
|
RU2734390C2 |
ИНГИБИТОРЫ ФЕРМЕНТА ДИАЦИЛГЛИЦЕРИН О-АЦИЛТРАНСФЕРАЗЫ ТИПА 1 | 2008 |
|
RU2497816C2 |
БИЦИКЛИЧЕСКИЕ ГЕТЕРОЦИКЛИЛЬНЫЕ СОЕДИНЕНИЯ И ИХ ПРИМЕНЕНИЯ | 2020 |
|
RU2811612C2 |
ПРОИЗВОДНЫЕ 1,5-НАФТИРИДИНА И ИНГИБИТОРЫ MELK, СОДЕРЖАЩИЕ ИХ | 2012 |
|
RU2645339C1 |
Новое тетерагидропиримидиновое соединение или его соль | 2015 |
|
RU2636310C1 |
ИНГИБИТОРЫ АКТИВНОСТИ ПРОТЕИНТИРОЗИНКИНАЗЫ | 2009 |
|
RU2533827C2 |
Изобретение относится к области органической химии, а именно к гетероциклическому соединению указанной ниже формулы, его фармацевтически приемлемой соли, где тиазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl; Cy является -(C3-C7)циклоалкилом, мостиковым (C6-C12)циклоалкилом или 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, каждое из которых необязательно замещено галогеном, -OH, (C1-C4)алкилом или (C1-C4)алкокси; если X5 соединен с атомом азота Cy, X5 отсутствует; если X5 соединен с атомом углерода Cy, X5 является NRa или O; X6 является NRa или O; R1 является (C1-C5)алкилом, необязательно замещенным -OH; R3 является (C1-C5)алкилом, -CH2-фенилом, -(C3-C7)циклоалкилом, -CH2-(C3-C7)циклоалкилом, -CH2-моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, где -(C3-C7)циклоалкил, фенил или моноциклическое 4-5-членное гетероциклическое кольцо, представленное R3 или в группе, представленной R3, необязательно замещены галогеном, -OH, (C1-C4)алкилом, галометилом, галометокси или (C1-C4)алкокси; R2 является -NRaC(O)O(C1-C4)алкилом, -NRaC(O)NRa(C1-C4)алкилом, -NRaC(O)O-(C3-C6)циклоалкилом, -NRaC(O)NRa-(C3-C6)циклоалкилом, -NRaC(O)O-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или -NRaC(O)NRa-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O; где (C1-C4)алкил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O; где (C3-C6)циклоалкил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa; где фенил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa; где гетероциклическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено галогеном, -ORa или -CH3; где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено галогеном, -CH3 или -ORa; и каждый Ra независимо является -H или -CH3. Также изобретение относится к фармацевтической композиции на основе указанного выше соединения, способу лечения заболеваний, связанных с ингибированием RAD51. Технический результат: эффективное ингибирование RAD51 соединением указанной структуры при лечении рака, аутоиммунных заболеваний, иммунодефицитов или нейродегенеративных болезней. 3 н. и 54 з.п. ф-лы, 5 табл., 79 пр.
1. Соединение, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
тиазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl;
Cy является -(C3-C7)циклоалкилом, мостиковым (C6-C12)циклоалкилом или 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, каждое из которых необязательно замещено галогеном, -OH, (C1-C4)алкилом или (C1-C4)алкокси;
если X5 соединен с атомом азота Cy, X5 отсутствует;
если X5 соединен с атомом углерода Cy, X5 является NRa или O;
X6 является NRa или O;
R1 является (C1-C5)алкилом, необязательно замещенным -OH;
R3 является (C1-C5)алкилом, -CH2-фенилом, -(C3-C7)циклоалкилом, -CH2-(C3-C7)циклоалкилом, -CH2-моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, где -(C3-C7)циклоалкил, фенил или моноциклическое 4-5-членное гетероциклическое кольцо, представленное R3 или в группе, представленной R3, необязательно замещены галогеном, -OH, (C1-C4)алкилом, галометилом, галометокси или (C1-C4)алкокси;
R2 является -NRaC(O)O(C1-C4)алкилом, -NRaC(O)NRa(C1-C4)алкилом, -NRaC(O)O-(C3-C6)циклоалкилом, -NRaC(O)NRa-(C3-C6)циклоалкилом, -NRaC(O)O-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или -NRaC(O)NRa-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где фенил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероциклическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено галогеном, -ORa или -CH3;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено галогеном, -CH3 или -ORa; и
каждый Ra независимо является -H или -CH3.
2. Соединение по п. 1,
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
триазольное кольцо необязательно замещено -F или -Cl;
Cy является циклогексилом или 6-членным моноциклическим гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
X5 и X6 каждый независимо является NRa или O;
R1 является (C1-C5)алкилом;
R3 является (C1-C5)алкилом или моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
R2 является -NRaC(O)O(C1-C4)алкилом, -NRaC(O)NRa(C1-C4)алкилом, -NRaC(O)-O(C3-C6)циклоалкилом, -NRaC(O)NRa-(C3-C6)циклоалкилом, -NRaC(O)O-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или -NRaC(O)NRa-моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где -(C3-C6)циклоалкил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где фенил в группе, представленной R2, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероциклическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено галогеном, -ORa или-CH3;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R2, необязательно замещено галогеном, -CH3 или -ORa; и
каждый Ra независимо является -H или -CH3.
3. Соединение по п. 1, или его фармацевтически приемлемая соль, где Cy является
циклопропилом, циклобутилом, циклопентилом, циклогексилом, циклогептилом;
азетидинилом, дигидроимидазолом, дигидрофуранилом, дигидропиранилом, дигидропиридинилом, дигидропиримидинилом, гексагидропиридазинилом, гексагидропиримидинилом, морфолинилом, оксетанилом, пиперидинилом, пиперазинилом, пирролидинилом, тетрагидрофуранилом, тетрагидропиранилом, тетрагидропиридинилом, тетрагидропиримидинилом;
бицикло[2,1,1]гексилом, бицикло[2,2,1]гептилом, бицикло[2,2,2]октилом, бицикло[3,2,1]октилом, бицикло[4,3,1]децилом, бицикло[3,3,1]нонилом, борнилом, норборнилом, 6,6-диметилбицикло[3,1,1]гептилом, трициклобутилом или адамантилом.
4. Соединение по любому из пп. 1-3 или его фармацевтически приемлемая соль, где Cy является циклогексилом, морфолинилом, пиперидинилом, пиперазинилом, гексагидропиридазинилом, гексагидропиримидинилом, дигидропиранилом, дигидропиридинилом, дигидропиримидинилом, тетрагидропиранилом, тетрагидропиридинилом или тетрагидропиримидинилом.
5. Соединение по п. 1, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, и моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4 необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
6. Соединение по п. 5 или его фармацевтически приемлемая соль, где
X7 является NH или O;
R3 является (C1-C5)алкилом; и
R4 является (C1-C4)алкилом, необязательно замещенным галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O.
7. Соединение по п. 5, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa:
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
8. Соединение по п. 5, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
9. Соединение по п. 5, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленный R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
10. Соединение по п. 5, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
11. Соединение по п. 5, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
12. Соединение по п. 5, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
13. Соединение по любому из пп. 1, 3, 5 или 6 или его фармацевтически приемлемая соль, где Cy является азетидинилом или пирролидинилом, и атом азота кольца соединен с тиазольным кольцом.
14. Соединение по любому из пп. 5 и 7-13 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1-C3)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, где -(C1-C3)алкил необязательно замещен (i) фенилом, необязательно замещенным галогеном или -CH3; (ii) моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, необязательно замещенным галогеном или -CH3; или (iii) моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, необязательно замещенным галогеном или -CH3.
15. Соединение по любому из пунктов 5 и 7-13 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1-C3)алкилом, -CHRa-фенилом, -CHRa-5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или -CHRa-5-6-членным моноциклическим гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, где фенил, 5-6-членное гетероароматическое кольцо или 5-6-членное моноциклическое гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном или -CH3.
16. Соединение по любому из пп. 5-13 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является -(C1-C3)алкилом, необязательно замещенным (i) фенилом, необязательно замещенным галогеном, -CH3, галометилом, галометокси или ORa; (ii) моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, необязательно замещенным галогеном или -CH3; или (iii) моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, необязательно замещенным -CH3.
17. Соединение по п. 16 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является (i) -(C1-C3)алкилом; (ii) -CH2-фенилом, необязательно замещенным галогеном, -CH3, галометилом, галометокси или ORa; (iii) -CH(CH3)-фенилом, необязательно замещенным галогеном, -CH3, галометилом, галометокси или ORa; (iv) -CH2-5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, необязательно замещенным галогеном или -CH3; или (v) -CH2-5-6-членным моноциклическим гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, необязательно замещенным -CH3.
18. Соединение по любому из пп. 1, 3-5, 7-13 и 14-17 или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является (C1-C4)алкилом, -(C4-C6)циклоалкилом, -CH2-фенилом, -CH2-моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 4-5-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, где фенил или моноциклическое 4-5-членное гетероциклическое кольцо, представленное R3, или в группе, представленной R3, необязательно замещены галогеном, (C1-C4)алкокси или -CH3.
19. Соединение по любому из пп. 1-7 и 14-18, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
20. Соединение по п. 19, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
21. Соединение по любому из пп. 1-6, 8 и 14-18, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
22. Соединение по п. 21, представленное следующей структурной формулой:
или
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, (C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном, -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
23. Соединение по любому из пп. 1-6, 10 и 14-18, представленное следующей структурной формулой:
;
или его фармацевтически приемлемая соль, где:
X7 является NH или O;
R4 является (C1-C4)алкилом, (C3-C6)циклоалкилом или моноциклическим 4-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C1-C4)алкил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -(C3-C6)циклоалкилом, фенилом, моноциклическим 5-6-членным гетероциклическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O, или моноциклическим 5-6-членным гетероароматическим кольцом, содержащим 1-2 гетероатома, выбранных из N и O;
где (C3-C6)циклоалкил или моноциклическое 4-6-членное гетероциклическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещены галогеном -ORa или -CH3,
где фенил в группе, представленной R4, необязательно замещен галогеном, -CH3 или -ORa;
где гетероароматическое кольцо в группе, представленной R4, необязательно замещено галогеном или -CH3.
24. Соединение по любому из пп. 1, 3-5, 7-13 и 14-23 или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является изопропилом, трет-бутилом, циклобутилом, циклопентилом, бензилом, оксетанилом или .
25. Соединение по любому из пп. 1-13 и 14-24 или его фармацевтически приемлемая соль, где R1 является трет-бутилом.
26. Соединение по любому из пп. 1, 3-5, 7-13 и 14-25 или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является изопропилом или оксетанилом.
27. Соединение по п. 26 или его фармацевтически приемлемая соль, где R3 является изопропилом.
28. Соединение по любому из пп. 5-13 и 14-27 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является
29. Соединение по п. 28 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является
30. Соединение по п. 28 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является
31. Соединение по п. 28 или его фармацевтически приемлемая соль, где R4 является
.
32. Соединение по п. 1, выбранное из:
,
или их фармацевтически приемлемая соль.
33. Соединение по п. 1 или его фармацевтически приемлемая соль, где соединение является
.
34. Фармацевтическая композиция, ингибирующая RAD51, содержащая фармацевтически приемлемый носитель или разбавитель и соединение по любому из пп. 1-33 в эффективном количестве, или его фармацевтически приемлемую соль.
35. Способ лечения заболеваний, связанных с ингибированием RAD51, выбранных из группы, состоящей из рака, аутоиммунной болезни, иммунодефицита или нейродегенеративного заболевания, включающий введение субъекту, нуждающемуся в таковом, эффективного количества соединения по любому из пп. 1-33 или его фармацевтически приемлемой соли или фармацевтической композиции по п. 34.
36. Способ по п. 35, где рак выбирают из группы, состоящей из лимфомы, лейкоза и новообразования в клетках плазмы.
37. Способ по п. 36, где лимфому выбирают из группы, состоящей из В-клеточной лимфомы, неходжкинской лимфомы, лимфомы Беркитта, малой лимфоцитарной лимфомы, лимфоплазмацитарной лимфомы, ЛТСО-лимфомы, фолликулярной лимфомы, диффузной В-крупноклеточной лимфомы и Т-клеточной лимфомы.
38. Способ по п. 36, где лейкоз выбирают из группы, состоящей из острого лимфобластного лейкоза (ОЛЛ), лейкоза Беркитта, В-клеточного лейкоза, В-клеточного острого лимфобластного лейкоза, хронического лимфолейкоза (ХЛЛ), острого миелогенного лейкоза (ОМЛ), хронического миелогенного лейкоза (ХМЛ) и Т-клеточного острого лимфобластного лейкоза (T-ОЛЛ).
39. Способ по п. 36, где новообразование клеток плазмы выбирают из группы, состоящей из множественной миеломы, миеломы клеток плазмы, лейкоза клеток плазмы и плазмоцитомы.
40. Способ по п. 35, где рак выбирают из группы, состоящей из карциномы и саркомы.
41. Способ по п. 40, где карциному выбирают из группы, состоящей из рака толстой кишки, рака печени, рака желудка, рака кишечника, рака пищевода, рака молочной железы, рака яичников, рака головы и шеи, рака легких и рака щитовидной железы.
42. Способ по п. 35, где рак выбирают из группы, состоящей из рака толстой кишки, рака эндометрия, рака желудка, рака поджелудочной железы, рака почки/мочеточника, рака гепатобилиарного тракта, рака желудка, рака простаты, рака яичников, рака желчного пузыря, рака мозга, рака тонкой кишки, рака молочной железы и рака кожи.
43. Способ по любому из пп. 35-42, где рак отличается мутациями в mutS гомологе 6 (MSH6).
44. Способ по п. 35, где аутоиммунное заболевание выбирают из группы, состоящей из красной волчанки, синдрома Вискотта-Олдрича, аутоиммунного лимфопролиферативного синдрома, миастении гравис, ревматоидного артрита (РА), волчаночного нефрита, системной красной волчанки, дискоидной волчанки, подострой кожной красной волчанки, кожной красной волчанки, в том числе ознобленной волчанки, синдрома Шегрена, воспалительного хронического риносинусита, колита, целиакии, воспалительного заболевания кишечника, пищевода Барретта, воспалительного гастрита, аутоиммунного нефрита, аутоиммунного васкулита, аутоиммунного гепатита, аутоиммунного кардита, аутоиммунного энцефалита, аутоиммунного диабета, аутоиммунного диабета нефрита, псориаза, болезни «трансплантат против хозяина» (GvHD) и аутоиммунного медиированного гематологического заболевания.
45. Способ по п. 35, где иммунодефицит выбирают из группы, состоящей из аутоиммунного лимфопролиферативного синдрома (ALPS), аутоиммунного полигландулярного синдрома типа 1 (APS-1), болезни BENTA, состояния дефицита каспазы восемь (CEDS), хронической гранулематозной болезни (CGD), общего вариабельного иммунодефицита (CVID), синдромов наследственного агранулоцитоза, дефицита CTLA4, дефицита DOCK8, дефицита GATA2, нарушений гликозилирования с иммунодефицитом, синдрома гипериммуноглобулина E (HIES), синдромов гиперимуноглобулина M (Hyper-IgM), нарушения адгезии лейкоцитов (LAD), дефицита LRBA, PI3 киназной болезни, дефицита PLCG2-ассоциированного антитела и иммунной дисрегуляции (PLAID), тяжелого комбинированного иммунодефицита (SCID), болезни мутации с приобретением функции STAT3, кожных наростов, гипогаммаглобулинемии, инфекций и синдрома миелокатексиса (WHIMS), X-связанной агаммаглобулинемии (XLA), X-связанной лимфопролиферативной болезни (XLP) и XMEN болезни.
46. Способ по п. 35, где нейродегенеративное расстройство выбирают из группы, состоящей из рассеянного склероза, болезни Паркинсона (БП), болезни Альцгеймера (БА), дентаторубро-паллидолюисовой атрофии (DRPLA), болезни Хантингтона (БХ), спинально-церебеллярной атаксии типа 1 (SCA1), спинально-церебеллярной атаксии типа 2 (SCA2), спинально-церебеллярной атаксии типа 3 (SCA3), спинально-церебеллярной атаксии типа 6 (SCA6), спинально-церебеллярной атаксии типа 7 (SCA7), спинально-церебеллярной атаксии типа 8 (SCA8), спинально-церебеллярной атаксии типа 12 (SCA12), спинально-церебеллярной атаксии типа 17 (SCA17), спинобульбарной мышечной атаксии/болезни Кеннеди (SBMA), синдрома хрупкой Х-хромосомы (FRAXA), олигофрения хрупкой XE-хромосомы (FRAXE) и миотонической дистрофии (DM).
47. Способ по любому из пп. 35-46, дополнительно включающий совведение субъекту ингибитора восстановления ДНК, ингибитора ответа на повреждение ДНК (DDR), ДНК-повреждающего агента или иммуномодулирующего агента.
48. Способ по п. 47, где ДНК-повреждающий агент выбирают из группы, состоящей из: воздействия химического вещества, повреждающего ДНК, воздействия химиотерапевтического агента, воздействия радиохимиотерапии и воздействия ионизирующего или ультрафиолетового излучения.
49. Способ по любому из пп. 35-48, где субъект определен как имеющий повышенный уровень и/или активность процесса повреждения ДНК или фермента редактирования ДНК.
50. Способ по п. 47, где иммуномодулирующий агент выбирают из группы, состоящей из модуляторов иммунной контрольной точки, агонистов Toll-подобного рецептора (TLR), клеточных терапий, цитокинов и противораковых вакцин.
51. Способ по п. 49, где фермент редактирования ДНК выбирают из группы, состоящей из индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID или AICDA), APOBEC2, APOBEC3A, APOBEC3C, APOBEC3D, APOBEC3F, APOBEC3G, APOBEC3H, APOBEC4, топоизомеразы типа 1, топоизомеразы типа 2, активирующего рекомбинацию гена 1 (RAG 1) и активирующего рекомбинацию гена 2 (RAG2).
52. Способ по любому из пп. 35-51, где было установлено, что клетки крови, полученные от субъекта, имеют обнаруживаемый уровень индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID).
53. Способ по любому из пп. 35-51, где было установлено, что В-клетки, полученные от субъекта, имеют обнаруживаемый уровень индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID).
54. Способ по п. 52 или 53, где обнаруживаемый уровень индуцированной активацией цитидиндеаминазы (AID) статистически значительно выше, чем уровень AID, экспрессируемый в неактивированных B-клетках или нормальных неиммунных клетках здорового субъекта.
55. Способ по п. 36, где лимфома представляет собой В-клеточную лимфому.
56. Способ по п. 55, где В-клеточная лимфома представляет собой диффузную В-крупноклеточную лимфому.
57. Способ по п. 36, где лимфома представляет собой неходжкинскую лимфому.
WO 2016196955 A1, 08.12.2016 | |||
WO 2016140971 A1, 09.09.2016 | |||
WO 2014085545 A1, 05.06.2014 | |||
FEI HUANG et al., "A Small Molecule Inhibitor of Human RAD51 Potentiates Breast Cancer Cell Killing by Therapeutic Agents in Mouse Xenografts", PLOS ONE, 9(6), 27.06.2014, с.e100993 | |||
WO 2008082856 A1, 10.07.2008 | |||
ПРОИЗВОДНЫЕ ТИАЗОЛА, СПОСОБ ИХ ПОЛУЧЕНИЯ И ПРИМЕНЕНИЕ, ФАРМАЦЕВТИЧЕСКАЯ КОМПОЗИЦИЯ, ОБЛАДАЮЩАЯ СВОЙСТВАМИ АНТАГОНИСТОВ РЕЦЕПТОРОВ NPY | 2003 |
|
RU2324685C2 |
ПРОИЗВОДНЫЕ ПИРАЗИНА, ИСПОЛЬЗУЕМЫЕ В КАЧЕСТВЕ ИНГИБИТОРОВ КИНАЗЫ ATR | 2009 |
|
RU2604066C2 |
Авторы
Даты
2023-05-12—Публикация
2018-09-11—Подача