Способ идентификации микроорганизмов Советский патент 1979 года по МПК C12K1/04 

Описание патента на изобретение SU649751A1

Изобретение относится к облаети микробиологии и может быть использовано нри проведении массовы.х эиидемиологических исследований, при лнквидации очагов инфекцио.нных заболеваний, при разработке эффективных поливакцин, а также в различных областях микробиологической промышленности. Известен способ идентификации микроорганизмов путем «X культивИрования, отделения выросших клеток с последующим их лизисом, выделения из лизата ДН1, очистки, гибр.идмзации полученной ДНК с ДНК реперного штамма и учета процента гомологии в нуклеотидной последовательно сти. Однако известный способ является трудоемким и длительным (50-60 ч). Цель изобретения - ускорить и упростить способ. Эта цель достигается тем, что лизие клеток проводят при 37-50° С в течение 30-60 мин, ДНК из лизата выделяют 1,5- 2,5-кратным объемом этилового спирта, очистку проводят 0,54-0,6%-ным объемом изопропилового спирта, а гибридизацию ведут в течение 8-10 ч. Пример 1. Суспензию бактериальных клеток Е. соИ ВЗТ, полученную в жидкой глюкозо-минеральной среде, содержащей 6 г NasHPOi, 3 г КН2РО4, 3 г ХН.;С1, 1 лг.; 1 М раствора MgSO4, 4 г глюкозы, 2 ли тимидииа и до 1 л Н2О, фиксируют после осаждения клеток 2-3 объемами 96%-кого этилового спирта, затем суспензию центрпфугируют в течение 10 мин при 3000-5000 об/мин и из осадка отбирают навеску 1 г сырой биомассы. Клетки рес}спендируют в 50 мл солевого раствора (0,3 М NaCl, 0,03/М цитрата натрия), центрифугируют повторно 10 мин при 3000-5000 об/мин и осадок ресуспеидпруют в 20 M.I буфера, содержащего 0,15 MNaCl + 0,1 М ЭДТА-1-0,015 М цитрата натрия +0,1 М триса, рН 8,0 и лизируют добавлением 1 л/л 20%-ного раствора додецилсульфата натрия в прис тствии 100 мкг/мл нроназы в течение 30 мин при 37° С. После завернюния лизиса и просветления лизата добавляют XaCI до конечной концентрации 2 Л1 и осаждают ДНК из лизата 2 объемами этилового спирта. Выпавший осадок ДНК переносят в 10 л(л 1 М ацетата натрия рН 7,0 и поеле растворения ДНК осаждают 1,54%-пым объемом изопропплового спирта (по отношенпю к исходному раствору Юлгл). Выпавший медузообразпый осадок переносят в 10 мл солевого раствора (0,015 М NaCl+ 0,0015 М цитрата натрия). После растворешш ДНК денатурируют, добавляя в раствор по каплям 10 М NaOH до рН 12,0 и прогревая в течение 30 мин при 60° С, нейтрализуют 0,1 н. НС и доводят концентрацию солей в растворе до 0,9 Л1 NaCl + 0,09 Л- цитрата натрия. После этого раствор денатурированной ДНК иронускают через мембранные фильтры, промывают каждый фильтр 10 мл раствора 0,3 М NaCl + 0,03 М цитрата натрия и высушивают нри 60° С в течение 2 ч. ДНК, выделенной на 1 г бактериальной массы, достаточно для нанесения на 10 фильтров. После нанесения фильтры помещают в тефлоновые или стеклянные биксы, содер;кагцие 2 мл раствора 0,3 М NaCl-f 0,03 М цитрата натрия и меченые С-тимидинО М фрагменты ДПК Е. соИ ВЗТ в соотношенни 1: 100 к количеству немеченной ДНК, и смесь инкубируют при 60° С в течение 8 ч. Затем определяют радиоактивность с помощью изотопного счетчика «Marki. Количество реассоцинрованной ДНК (в процента.х) нодсчитываю-т как количество импульсов связавшейся ДНК и эту цифру принимают за 100% в гомологичной реакции (ДНК Е. соИ ВЗТХДНК Е. соИ ВЗТ). Процент гомологии рассчитывают как количество )1 шульсов связавшейся ДНК (в процентах) в гетерологичной реакции, например ДНК Е. соИ 761ХДНК Е. соИ ВЗТ (ренерный штамм) имеет 89% гомологии. Пример 2. Спиртовую суспензию бактериальных клеток Е. coli ВЗТ, соответствующую 1 г сырой биомассы, фильтруют через мембранный фильтр диаметром 10 см с размером пор 0,23-0,45 ммк в течение 2-3 мин под вакуумом, фильтр переносят Б 100 мл солевого раствора (0,15 М NaCl + -i-G,01 М ЭДТА, рН 7), встряхивают 1 - 2мин и повторно фильтруют суспензию через новый фильтр, затем ресуспендируют в 10 мл солевого раствора, содержащего 0.5 М NaCl + 0,1 /И ЭДТА, рН 7,0-8,0. К сус ензпи добавляют 10 мл 1 н. МаОН и выдерживают при ЗТО С в течение 1 ч. К щелочному лизату добавляют 1 каплю универсального индикатора и нейтрализуют смесь оследовательным приливанием 5 мл 1,5 н. IIC1, 5 мл 1 М трис-UCi буфера рН 7,4- 7,8 с 0,05 М ЭДТА н по каплям 2 мл 1,5 н. НС до рН 7,0-7,5. После этого к лизату добавляют 50 мкг.мл панкреатической рибонуклеазы, инкубируют 30 мин нрн 37° С, затем вносят 100 м.кг1мл проназы И инкубацию продолжают в течение 1 ч. Вязкий лизат пропускают 3-5 раз через шпвиц на 50-100 л(л и наносят на мембранные ф.ильтры. Дальнейшие операции после нанесения на фильтры проводят, как в примере 1. Предлагаемый способ прост, так как в нем отсутствуют трудоемкие онерации, сокращает время до 11 -13 ч и обеспечивает высокую точность. Формула изобретения Способ идентификации микроорганизмов путем их культивирования, отделения выросших клеток с последующим их лизисом, выделения из лизата ДНК, очистки, гибридизации полученной ДНК с ДНК реперного штамма и учета процента гомологии в нуклеотидной носледовательности, отличающийся тем, что, с целью ускорения и упрощения способа, лйзис клеток проводят при температуре 37-50 С в течение 30-60 мин, ДНК из лнзата выделяют 1,5-2,5-кратным объемом этилового снирта, очистку проводят обработкой 0,54- 0,6%-ным объемом изопропилового спирта, а гибридизацию ведут в течение 8-10 ч.

Похожие патенты SU649751A1

название год авторы номер документа
Способ выделения дезоксирибонуклеиновой кислоты 1982
  • Трохименко Елена Петровна
  • Кейсевич Людвиг Владиславович
  • Пеньковская Наталья Петровна
  • Лозинский Мирон Онуфриевич
  • Середа Анатолий Григорьевич
SU1081171A1
Способ маркирования 11-й хромосомы человека,рекомбинантная плазмидная ДНК @ 53 для маркирования,фрагмент геномной ДНК @ 53 для маркирования и способ получения фрагмента ДНК @ 53 1984
  • Гиндилис Виктор Миронович
  • Зайцев Игорь Закванович
  • Яковлев Александр Георгиевич
  • Юров Юрий Борисович
  • Шапиро Юрий Абрамович
SU1203108A1
СПОСОБ ВЫДЕЛЕНИЯ ДНК 1991
  • Дрожденюк Анатолий Павлович[By]
  • Голубев Виктор Петрович[By]
  • Беспалов Иван Александрович[By]
  • Усанов Сергей Александрович[By]
  • Чижов Владимир Всеволодович[By]
  • Просняк Михаил Иванович[Ru]
  • Тарасевич Василий Николаевич[By]
  • Рахманько Евгений Михайлович[By]
  • Лещев Сергей Михайлович[By]
  • Кутас Иван Михайлович[By]
RU2026864C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК PZAT1, ИСПОЛЬЗУЕМАЯ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ ДНК-ЗОНДА, С ПОМОЩЬЮ КОТОРОГО ИДЕНТИФИЦИРУЮТ ТОКСИГЕННЫЕ ШТАММЫ ВОЗБУДИТЕЛЯ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ, СПОСОБ КОНСТРУИРОВАНИЯ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК PZAT1 И ШТАММ БАКТЕРИЙ ESCHERICHIA COLI, ИСПОЛЬЗУЕМЫЙ ДЛЯ ПОЛУЧЕНИЯ РЕКОМБИНАНТНОЙ ПЛАЗМИДНОЙ ДНК PZAT1 И ДНК-ЗОНДА, С ПОМОЩЬЮ КОТОРОГО ИДЕНТИФИЦИРУЮТ ТОКСИГЕННЫЕ ШТАММЫ ВОЗБУДИТЕЛЯ СИБИРСКОЙ ЯЗВЫ 1992
  • Тимошин В.Б.
  • Замараев В.С.
  • Антонов В.А.
RU2037520C1
СПОСОБ МАРКИРОВАНИЯ 7-Й ХРОМОСОМЫ ЧЕЛОВЕКА В МЕТАФАЗНЫХ И ИНТЕРФАЗНЫХ КЛЕТКАХ 2009
  • Юров Юрий Борисович
  • Александров Иван Александрович
  • Соловьев Илья Владимирович
  • Юров Иван Юрьевич
  • Ворсанова Светлана Григорьевна
RU2425890C2
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК АЛЬФА R-12, ПРЕДНАЗНАЧЕННАЯ ДЛЯ МАРКИРОВАНИЯ 6-Й ХРОМОСОМЫ ЧЕЛОВЕКА В МЕТАФАЗНЫХ И ИНТЕРФАЗНЫХ КЛЕТКАХ 2004
  • Юров Ю.Б.
  • Яковлев А.Г.
  • Ворсанова С.Г.
  • Соловьев И.В.
RU2265060C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК рYA11-39, ПРЕДНАЗНАЧЕННАЯ ДЛЯ МАРКИРОВАНИЯ 4-Й И 9-Й ХРОМОСОМ ЧЕЛОВЕКА В МЕТАФАЗНЫХ И ИНТЕРФАЗНЫХ КЛЕТКАХ 2006
  • Юров Юрий Борисович
  • Александров Иван Александрович
  • Ворсанова Светлана Григорьевна
  • Соловьев Илья Владимирович
RU2325441C1
СПОСОБ ОБНАРУЖЕНИЯ ГЕНОВ КАТАБОЛИЗМА ГЕРБИЦИДА 2,4-Д В ГЕНОМАХ ЭУКАРИОТ 1997
  • Маркушева Т.В.
  • Журенко Е.Ю.
  • Кусова И.В.
  • Чураев Р.Н.
RU2125263C1
ФРАГМЕНТ ДНК CFB, ИСПОЛЬЗУЕМЫЙ ДЛЯ ВЫЯВЛЕНИЯ ЭНТЕРОБАКТЕРИЙ, ОБЛАДАЮЩИХ ФАКТОРОМ КОЛОНИЗАЦИИ CFA 1 1992
  • Уланова Т.И.
  • Мазепа В.Н.
  • Пузырев В.Ф.
  • Бруснигина Н.Ф.
  • Бессараб Д.А.
  • Барышева Н.Н.
RU2049822C1
РЕКОМБИНАНТНАЯ ПЛАЗМИДНАЯ ДНК PYAI 960, ПРЕДНАЗНАЧЕННАЯ ДЛЯ МАРКИРОВАНИЯ 18-Й ХРОМОСОМЫ ЧЕЛОВЕКА 2000
  • Юров Ю.Б.
  • Ворсанова С.Г.
  • Александров И.А.
RU2161199C1

Реферат патента 1979 года Способ идентификации микроорганизмов

Формула изобретения SU 649 751 A1

SU 649 751 A1

Авторы

Антонов Андрей Сергеевич

Белоусова Алла Александровна

Лысенко Анатолий Михайлович

Турова Татьяна Павловна

Даты

1979-02-28Публикация

1977-06-14Подача