Перекрестная ссылка на родственные заявки

[0001] Данная заявка испрашивает преимущество по предварительной заявке на патент США №62/454476, поданной 3 февраля 2017 года, содержание которой тем самым включено посредством ссылки во всей своей полноте.

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

[0002] Настоящая заявка содержит перечень последовательностей, который был подан в электронном виде в формате ASCII и тем самым включен посредством ссылки во всей своей полноте. Указанная ASCII-копия, созданная 10 января 2018 года, имеет название PAT057594-WO-PCT_SL.txt и размер 387054 байта.

Область техники, к которой относится изобретение

[0003] Настоящее изобретение относится к антителам к CCR7, фрагментам антител и их иммуноконъюгатам, а также путям их применения для лечения или предупреждения рака.

Предпосылки изобретения

[0004] CC‑хемокиновый рецептор 7 (CCR7) впервые был идентифицирован в 1993 году в качестве специфического для лимфоцитов рецептора (см., например, Birkenbach et al., J Virol. 1993 Apr;67(4):2209-20). Его экспрессия ограничена субпопуляциями иммунных клеток, таких как наивные T-клетки, T-клетки центральной памяти (Tcm), регуляторные T-клетки (Treg), наивные B-клетки, NK-клетки и зрелые антигенпрезентирующие дендритные клетки (DC). CCR7 регулирует хоминг иммунных клеток в лимфоидные органы и миграцию в пределах них и, таким образом, играет ключевую роль в балансе иммунитета и переносимости (см., например, Förster et al., Nat Rev Immunol. 2008 May;8(5):362-71).

[0005] CCR7 представляет собой родопсин-подобный рецептор, сопряженный с G-белком (GPCR), класса A с двумя лигандами, CCL21 и CCL19. Структура CCR7 еще не полностью выяснена, однако, были обнаружены некоторые мотивы, необходимые для активности рецептора (см., например, Legler et al., Int J Biochem Cell Biol. 2014 Jul 1).

CCR7 и рак

[0006] Также известно, что CCR7 (также называемый EBI1, BLR2, CC-CKR-7, CMKBR7, CD197 и CDw197) сверхэкспрессируется на целом ряде злокачественных опухолей, включая, среди прочего, B-клеточные злокачественные новообразования (например, CLL, MCL, лимфому Беркитта), T-клеточные злокачественные новообразования (например, ATLL), HNSCC, ESCC, карциному желудка, NSCLC, колоректальную карциному, рак поджелудочной железы, рак щитовидной железы, рак молочной железы и рак шейки матки. Например, сверхэкспрессия CCR7 на клетках колоректальной карциномы, ESCC, рака поджелудочной железы, HNSCC и рака желудка была ассоциирована с поздней стадией опухоли, метастазированием в лимфатические узлы и неблагоприятным прогнозом в отношении выживания (см., например, Malietzis et al., Journal of Surgical Oncology 2015;112:86-92; Irino et al., BMC Cancer 2014, 14:291; Guo et al., Oncology Letters 5: 1572-1578, 2013; Xia et al., Oral Dis. 2015 Jan;21(1):123-31; Du et al., Gastric Cancer. 2016 Mar 16).

[0007] Кроме того, было показано, например, что экспрессия CCR7 на клетках HNSCC играет роль в резистентности к химиотерапии (см., например, Wang et al., JNCI J Natl Cancer Inst (2008) 100 (7): 502-512.). При некоторых типах рака, таких как рак поджелудочной железы и носоглоточная карцинома (NPC), как известно, CCR7 стимулирует метастазирование раковых стволовых клеток и образование сфер (см., например, Zhang et al., PLOS ONE 11 (8); Lun et al., PLOS ONE 7(12)). Роль CCR7 в миграции клеток, инвазивности и EMT (эпителиально-мезенхимальном переходе) описана у различных типов рака, таких как рак молочной железы и поджелудочной железы in vitro и in vivo (см., например, Pang et al., Oncogene (2015), 1-13); Sperveslage et al., Int. J. Cancer: 131, E371-E381 (2012)). Ключевые пути, которые были описаны как необходимые для передачи сигнала с помощью CCR7, включают путь передачи сигнала p38/ERK1/2, опосредованный b-аррестином, и путь передачи сигнала Rho (см., например, Noor et al., J Neuroinflammation 2012 Apr 25; 9:77).

[0008] Известны многочисленные сопряженные с раком процессы, которые индуцируют экспрессию CCR7. Показано, что при HNSCC экспрессия CCR7 индуцируется факторами транскрипции NF-kB и AP1 за счет прямого связывания с сайтами в промоторе CCR7 (Mburu et al., J. Biol. Chem. 2012, 287:3581-3590). В частности, экспрессия CCR7 регулируется различными факторами в микроокружении опухоли. В данном контексте, известно, что экспрессия CCR7 индуцируется за счет пути b-дефензин 3/NF-kB в HNSCC (см., например, Mburu et al., Carcinogenesis vol.32 no.2 pp.168-174, 2010) и рецептора A эндотелина и индуцируемого гипоксией фактора-1 в клетках опухоли молочной железы (см., например, Wilson et al., Cancer Res 2006;66:11802-11807).

Конъюгаты антитела и лекарственного средства

[0009] Конъюгаты антитела и лекарственного средства ("ADC") нашли применение в местной доставке цитотоксических средств при лечении рака (см., например, Lambert, Curr. Opinion In Pharmacology 5:543-549, 2005). ADC обеспечивают возможность нацеленной доставки фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, при которой может достигаться максимальная эффективность при минимальной токсичности. ADC включают антитело, выбранное за его способность связываться с клеткой, на которую нацелено терапевтическое вмешательство, соединенное с лекарственным средством, выбранным за его цитостатическую или цитотоксическую активность. Тем самым, при связывании антитела с целевой клеткой лекарственное средство доставляется в сайт, в котором требуется его терапевтический эффект.

[0010] Для применения в ADC было раскрыто множество антител, которые распознают и селективно связываются с целевыми клетками, например, раковыми клетками. Несмотря на масштабную работу над ADC, связывания антитела с конкретной мишенью, представляющей интерес, недостаточно для предсказания успеха в применениях ADC. Примеры факторов, которые могут воздействовать на терапевтическую эффективность ADC (кроме особенностей, присущих мишени), включают различные аспекты, которые необходимо модифицировать путем тонкой настройки, такие как оптимальная аффинность антитела как баланс между мишень-опосредованным распределением (TMDD) и управляющим эффективностью воздействием, оценка Fc-опосредованных функций (антителозависимая клеточноопосредованная цитотоксичность, ADCC), способ конъюгации (сайт-специфическая или нет), отношение молекул лекарственного средства/полезной нагрузки у такого конъюгата с каждым антителом ("DAR" или "соотношение лекарственного средства и антитела"), расщепляемость или стабильность линкера, стабильность ADC и склонность ADC к образованию агрегатов.

[0011] Остается потребность в антителах, способах прикрепления и цитотоксических полезных нагрузках с улучшенными свойствами для применения в качестве эффективных терапевтических композиций на основе ADC и способов, связанных с ними.

Краткое описание настоящего изобретения

[0012] В настоящей заявке раскрыты антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с белком CCR7 человека, где антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуются сниженной или незначительной эффекторной функцией по сравнению с антителом дикого типа того же изотипа. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуются сниженным или незначительным уровнем активности антителозависимой клеточноопосредованной цитотоксичности (ADCC). В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат "молчащую" область Fc. В некоторых вариантах осуществления антитело содержит в области Fc мутацию, выбранную из: D265A; P329A; P329G; N297A; D265A и P329A; D265A и N297A; L234 и L235A; P329A, L234A и L235A; а также P329G, L234A и L235A. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент характеризуются незначительной активностью цитолиза клеток. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с большей аффинностью с клетками, экспрессирующими более высокие уровни CCR7, чем с клетками, экспрессирующими более низкие уровни CCR7. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с большей аффинностью с раковыми клетками, которые экспрессируют более высокие уровни CCR7, чем с нормальными клетками, которые экспрессируют более низкие уровни CCR7. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент в незначительной степени истощают нормальные гемопоэтические клетки, которые экспрессируют CCR7.

[0013] В одном варианте осуществления настоящей заявки раскрыты антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают CCR7, содержащие:

a. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 (определяющая комплементарность область 1 тяжелой цепи) под SEQ ID NO:1, HCDR2 (определяющая комплементарность область 2 тяжелой цепи) под SEQ ID NO:2 и HCDR3 (определяющая комплементарность область 3 тяжелой цепи) под SEQ ID NO:3; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 (определяющая комплементарность область 1 легкой цепи) под SEQ ID NO:17, LCDR2 (определяющая комплементарность область 2 легкой цепи) под SEQ ID NO:18 и LCDR3 (определяющая комплементарность область 3 легкой цепи) под SEQ ID NO:19;

b. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:4, HCDR2 под SEQ ID NO:5 и HCDR3 под SEQ ID NO:6; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:20, LCDR2 под SEQ ID NO:21 и LCDR3 под SEQ ID NO:22;

c. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:7, HCDR2 под SEQ ID NO:8 и HCDR3 под SEQ ID NO:9; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:23, LCDR2 под SEQ ID NO:24 и LCDR3 под SEQ ID NO:25;

d. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:10, HCDR2 под SEQ ID NO:11 и HCDR3 под SEQ ID NO:12; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:26, LCDR2 под SEQ ID NO:27 и LCDR3 под SEQ ID NO:28;

e. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:33, HCDR2 под SEQ ID NO:34 и HCDR3 под SEQ ID NO:35; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:49, LCDR2 под SEQ ID NO:50 и LCDR3 под SEQ ID NO:51;

f. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:36, HCDR2 под SEQ ID NO:37 и HCDR3 под SEQ ID NO:38; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:52, LCDR2 под SEQ ID NO:53 и LCDR3 под SEQ ID NO:54;

g. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:39, HCDR2 под SEQ ID NO:40 и HCDR3 под SEQ ID NO:41; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:55, LCDR2 под SEQ ID NO:56 и LCDR3 под SEQ ID NO:57;

h. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:42, HCDR2 под SEQ ID NO:43 и HCDR3 под SEQ ID NO:44; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:58, LCDR2 под SEQ ID NO:59 и LCDR3 под SEQ ID NO:60;

i. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:65, HCDR2 под SEQ ID NO:66 и HCDR3 под SEQ ID NO:67; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:81, LCDR2 под SEQ ID NO:82 и LCDR3 под SEQ ID NO:83;

j. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:68, HCDR2 под SEQ ID NO:69 и HCDR3 под SEQ ID NO:70; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:84, LCDR2 под SEQ ID NO:85 и LCDR3 под SEQ ID NO:86;

k. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:71, HCDR2 под SEQ ID NO:72 и HCDR3 под SEQ ID NO:73; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:87, LCDR2 под SEQ ID NO:88 и LCDR3 под SEQ ID NO:89;

l. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:74, HCDR2 под SEQ ID NO:75 и HCDR3 под SEQ ID NO:76; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:90, LCDR2 под SEQ ID NO:91 и LCDR3 под SEQ ID NO:92;

m. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:596, HCDR2 под SEQ ID NO:597 и HCDR3 под SEQ ID NO:598; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:612, LCDR2 под SEQ ID NO:613 и LCDR3 под SEQ ID NO:614;

n. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:599, HCDR2 под SEQ ID NO:600 и HCDR3 под SEQ ID NO:601; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:615, LCDR2 под SEQ ID NO:616 и LCDR3 под SEQ ID NO:617;

o. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:602, HCDR2 под SEQ ID NO:603 и HCDR3 под SEQ ID NO:604; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:618, LCDR2 под SEQ ID NO:619 и LCDR3 под SEQ ID NO:620; или

p. вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:605, HCDR2 под SEQ ID NO:606 и HCDR3 под SEQ ID NO:607; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:621, LCDR2 под SEQ ID NO:622 и LCDR3 под SEQ ID NO:623.

[0014] Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают CCR7 по настоящей заявке, также могут содержать:

a. вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:13, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:29;

b. вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:45, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:61;

c. вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:77, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:93; или

d. вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:608, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:624.

[0015] В другом варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связывают CCR7, содержат:

a. тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:15, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:31;

b. тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:47, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:63;

c. тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:79, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:95; или

d. тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:610, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:626.

[0016] Антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, описанные в данном документе, могут содержать одну или несколько цистеиновых замен. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент содержат одну или несколько цистеиновых замен, выбранных из S152C, S375C или обеих S152C и S375C, в тяжелой цепи антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, где нумерация положения соответствует системе EU. Антитело, раскрытое в данном документе, может представлять собой моноклональное антитело.

[0017] В настоящей заявке раскрыт конъюгат антитела и лекарственного средства, предусматривающий формулу:

Ab-(L-(D)_m)_n,

или ее фармацевтически приемлемую соль; где

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий антигенсвязывающий фрагмент, раскрытые в данном документе;

L представляет собой линкер;

D представляет собой фрагмент, представляющий собой лекарственное средство;

m составляет целое число от 1 до 8; и

n составляет целое число от 1 до 12.

В некоторых вариантах осуществления m составляет 1. В одном варианте осуществления n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4. В одном варианте осуществления линкер выбран из группы, состоящей из расщепляемого линкера, нерасщепляемого линкера, гидрофильного линкера, предварительно заряженного линкера и линкера на основе дикарбоновой кислоты.

[0018] В одном варианте осуществления линкер происходит из сшивающего реагента, выбранного из группы, состоящей из N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионата (SPDP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноата (SPP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноата (SPDB), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфо-бутаноата (сульфо-SPDB), N-сукцинимидилйодацетата (SIA), N-сукцинимидил(4-йодацетил)аминобензоата (SIAB), малеимид-PEG-NHS, N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилата (SMCC), N-сульфосукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилата (сульфо-SMCC) и 2,5-диоксопирролидин-1-ил-17-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)-5,8,11,14-тетраоксо-4,7,10,13-тетраазагептадекан-1-оата (CX1-1).

[0019] В других вариантах осуществления линкер имеет следующую формулу (IIA):

(IIA);

где * соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство; и где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11;

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; а алкилен является линейным или разветвленным.

[0020] В другом варианте осуществления линкер имеет следующую формулу:

где y составляет от 1 до 11; * соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство.

[0021] В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, выбран из группы, состоящей из ингибитора V-АТФазы, проапоптического средства, ингибитора Bcl2, ингибитора MCL1, ингибитора HSP90, ингибитора IAP, ингибитора mTor, стабилизатора микротрубочек, дестабилизатора микротрубочек, ауристатина, аманитина, пирролобензодиазепина, ингибитора РНК-полимеразы, доластатина, майтанзиноида, MetAP (метионинаминопептидазы), ингибитора ядерного экспорта белков CRM1, ингибитора DPPIV, ингибиторов протеасомы, ингибиторов реакций переноса фосфорила в митохондриях, ингибитора синтеза белка, ингибитора киназ, ингибитора CDK2, ингибитора CDK9, ингибитора кинезина, ингибитора HDAC, ДНК-повреждающего средства, ДНК-алкилирующего средства, ДНК-интеркалятора, средства, связывающего малую бороздку ДНК, и ингибитора DHFR. В некоторых вариантах осуществления цитотоксическое средство представляет собой майтанзиноид, где майтанзиноид представляет собой N(2')-деацетил-N(2')-(3-меркапто-l-оксопропил)-майтанзин (DM1), N(2')-деацетил-N(2')-(4-меркапто-1-оксопентил)-майтанзин (DM3) или N(2')-деацетил-N2-(4-меркапто-4-метил-1-оксопентил)-майтанзин (DM4).

[0022] В одном варианте осуществления конъюгаты антитела и лекарственного средства, раскрытые в данном документе, предусматривают следующую формулу (VIII):

где L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна метиленовая группа может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11;

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; и алкилен является линейным или разветвленным; и где n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4; или ее фармацевтически приемлемую соль.

[0023] В одном варианте осуществления конъюгаты антитела и лекарственного средства, раскрытые в данном документе, имеют следующую формулу:

где n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4, и Ab представляет собой антитело, содержащее тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:47, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:63; или ее фармацевтически приемлемую соль.

[0024] В настоящей заявке также раскрыта фармацевтическая композиция, содержащая антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, раскрытые в данном документе, и фармацевтически приемлемый носитель. В настоящей заявке также раскрыта фармацевтическая композиция, содержащая конъюгаты антитела и лекарственного средства, раскрытые в данном документе.

[0025] В настоящей заявке также раскрыты способы лечения или предупреждения рака у пациента, нуждающегося в этом, предусматривающие введение указанному пациенту конъюгатов антитела и лекарственного средства или фармацевтических композиций, раскрытых в данном документе, где рак экспрессирует CCR7.

[0026] В некоторых вариантах осуществления способов лечения или предупреждения рака конъюгат антитела и лекарственного средства или фармацевтическую композицию вводят пациенту в комбинации с одним или несколькими дополнительными терапевтическими соединениями. В одном варианте осуществления одно или несколько дополнительных терапевтических соединений выбраны из стандартного химиотерапевтического средства, костимулируюшей молекулы или ингибитора контрольных точек. В одном варианте осуществления костимулирующая молекула выбрана из агониста OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3, STING или лиганда CD83. В другом варианте осуществления ингибитор контрольных точек выбран из ингибитора PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGFR-бета.

[0027] В настоящей заявке также раскрыты конъюгаты антитела и лекарственного средства или фармацевтические композиции, раскрытые в данном документе, для применения в качестве лекарственного препарата. В одном варианте осуществления конъюгаты антитела и лекарственного средства или фармацевтические композиции, раскрытые в данном документе, предназначены для применения в лечении или предупреждении рака, экспрессирующего CCR7, у пациента, нуждающегося в этом.

[0028] В одном варианте осуществления настоящей заявки раскрыто применение антител или их антигенсвязывающих фрагментов, конъюгатов антитела и лекарственного средства или фармацевтических композиций, раскрытых в данном документе, для лечения или предупреждения рака, экспрессирующего CCR7, у пациента, нуждающегося в этом.

[0029] В одном варианте осуществления настоящей заявки раскрыто применение антител или их антигенсвязывающих фрагментов, конъюгатов антитела и лекарственного средства или фармацевтических композиций, раскрытых в данном документе, в изготовлении лекарственного препарата.

[0030] В одном варианте осуществления рак выбран из группы, состоящей из хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), периферических T-клеточных лимфом (PTCL), таких как T-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинской лимфомы (NHL), такой как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), карциномы желудка, немелкоклеточного рака легкого, мелкоклеточного рака легкого, рака головы и шеи, носоглоточной карциномы (NPC), рака пищевода, колоректальной карциномы, рака поджелудочной железы, рака щитовидной железы, рака молочной железы, почечноклеточного рака и рака шейки матки. В конкретных вариантах осуществления рак выбран из группы, состоящей из хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), периферических T-клеточных лимфом (PTCL), таких как T-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинской лимфомы (NHL), такой как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), и немелкоклеточного рака легкого.

[0031] В настоящей заявке также раскрыты нуклеиновые кислоты, которые кодируют антитела или антигенсвязывающие фрагменты, раскрытые в данном документе. В одном варианте осуществления нуклеиновая кислота содержит нуклеотидную последовательность под SEQ ID NO: 14, 16, 30, 32, 46, 48, 62, 64, 78, 80, 94, 96, 481, 483, 497 или 499. В данной заявке также раскрыты векторы, содержащие нуклеиновые кислоты, и клетки-хозяева, содержащие векторы или нуклеиновые кислоты. В данной заявке также раскрыт способ получения антител или антигенсвязывающих фрагментов, раскрытых в данном документе, предусматривающий культивирование клетки-хозяина и извлечения антитела из культуры клеток. В одном варианте осуществления способ извлечения антитела из культуры клеток предусматривает стадии:

a) удаления клеток и фильтрования культуры;

b) проведения очистки культуры с помощью аффинной хроматографии;

c) инактивации любых вирусов в культуре путем доведения pH до 3,4-3,6, затем повторного доведения pH до 5,8-6,2 и фильтрования культуры;

d) проведения очистки культуры с помощью катионообменной хроматографии и осуществления восстановления культуры на колонке;

e) осуществления анионообменной хроматографии в отношении культуры;

f) удаления вирусов с помощью нанофильтрации;

g) фильтрования культуры, содержащей антитело; и

h) получения очищенного антитела.

[0032] В еще одном варианте осуществления в данном документе раскрыт способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства, предусматривающий:

(a) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:

где:

фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM1, DM3 или DM4, и фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, прикреплен к линкеру посредством своей тиольной функциональной группы;

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11;

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; а алкилен является линейным или разветвленным;

(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом, извлеченным из культуры клеток, раскрытой в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и

(c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.

В одном варианте осуществления способ предусматривает:

(a) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:

, и

(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом, извлеченным из культуры клеток, раскрытой в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и

(c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.

В другом варианте осуществления способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства предусматривает:

(a) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:

где:

фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM1, DM3 или DM4, и фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, прикреплен к линкеру посредством своей тиольной функциональной группы;

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11;

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол; а алкилен является линейным или разветвленным;

(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом, раскрытым в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и

(c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.

В другом варианте осуществления способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства предусматривает:

(a) предварительное образование фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, следующей формулы:

(b) конъюгирование указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, раскрытыми в данном документе, с получением конъюгата антитела и лекарственного средства; и

(c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.

В другом варианте осуществления стадия предварительного образования указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, предусматривает:

a) осуществление реакции фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, посредством его тиольной функциональной группы с:

;

с образованием:

;

b) осуществление реакции образованного

с:

;

с образованием фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство:

;

где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным; и

RG1 и RG2 представляют собой 2 реакционноспособные группы, образующие группу X.

В другом варианте осуществления стадия предварительного образования указанного фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, предусматривает:

a) осуществление реакции фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, посредством его тиольной функциональной группы с:

;

с образованием:

;

b) осуществление реакции образованного

с образованием фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство:

В некоторых вариантах осуществления конъюгат антитела и лекарственного средства, полученный согласно вышеуказанным способам, характеризуется средним DAR, измеренным с помощью УФ-спектрофотометра, составляющим от приблизительно 3 до приблизительно 4.

[0033] В другом варианте осуществления данной заявки раскрыт способ получения конъюгата антитела к CCR7 и лекарственного средства, предусматривающий:

(a) химическое соединение SMCC или MPET с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, DM-1 или DM-4, с образованием линкера-лекарственного средства;

(b) конъюгирование указанного линкера-лекарственного средства с антителом или его антигенсвязывающим фрагментом, раскрытыми в данном документе; и

(c) проведение очистки конъюгата антитела и лекарственного средства.

В одном варианте осуществления конъюгат антитела и лекарственного средства, полученный согласно данному способу, характеризуется средним DAR, измеренным с помощью УФ-спектрофотометра, составляющим от приблизительно 3 до приблизительно 4.

[0034] В настоящей заявке также раскрыт диагностический реагент, содержащий антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, раскрытые в данном документе. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент являются меченными с помощью радиоактивной метки, флуорофора, хромофора, средства для визуализации или иона металла.

Краткое описание графических материалов

[0035] На фигуре 1 изображены экспериментальные данные по in vitro активности ADCC негуманизированного и гуманизированного антител к CCR7 антител в формате CysMab с применением суррогатного репортерного анализа ADCC.

[0036] На фигуре 2 изображены экспериментальные данные по in vitro активности ADCC у негуманизированных антител к CCR7, содержащих варианты Fc с мутацией DAPA, с применением суррогатного репортерного анализа ADCC.

[0037] На фигуре 3 изображены экспериментальные данные по связыванию с рекомбинантным hCCR7 антител к CCR7 в формате CysMab.DAPA с применением анализа на основе ELISA.

[0038] На фигуре 4A-C изображены экспериментальные данные по функциональности исходных антител к CCR7 с применением анализа с β-аррестином в режиме агониста (фигура 4A) и режиме антагониста (фигура 4B, фигура 4C).

[0039] На фигуре 5 изображены экспериментальные данные по конкуренции с лигандом CCR7 антител к CCR7 в формате CysMab.DAPA с применением FACS-анализа.

[0040] На фигуре 6 изображены экспериментальные данные по картированию эпитопов исходных антител к CCR7 с применением мутантных белков CCR7.

[0041] На фигуре 7A-B изображены экспериментальные данные по анализам с применением piggyback ADC (pgADC) исходных антител к CCR7 в комплексе с фрагментом, представляющим собой вторичное антитело, конъюгированное с полезной нагрузкой.

[0042] На фигуре 8 изображены экспериментальные данные по анализам цитолиза с применением "piggyback" ADC (pgADC) цитотоксических эффектов исходного Ab 121G12 в комплексе с фрагментом, представляющим собой вторичное антитело, конъюгированное с полезной нагрузкой, с применением клеточных линий, отрицательных по наличию мишени.

[0043] На фигуре 9 изображены графики, иллюстрирующие истощение CD4+ и CD8a+ T-клеток с помощью мышиного исходного Ab 121G12, характеризующегося перекрестной реактивностью к CCR7, в формате CysMab с Fc дикого типа, либо в виде антитела отдельно, либо конъюгированного с цитотоксином ауристатином, при этом от данных эффектов избавляются путем переключения на формат "молчащей" Fc с мутациями DAPA.

[0044] На фигуре 10 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективность конъюгатов антитела и лекарственного средства, 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4, в отношении ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97.

[0045] На фигуре 11 изображен график, иллюстрирующий активность конъюгатов антитела и лекарственного средства, 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.sSPDB.DM4, на модели множественной миеломы KE97 с началом введения дозы при большей первоначальной опухолевой массе, чем на фиг. 10.

[0046] На фигуре 12 изображен график, иллюстрирующий in vivo активность конъюгата 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 на модели первичной немелкоклеточной опухоли легкого HLUX1934.

[0047] На фигуре 13 изображен график, иллюстрирующий активность конъюгированного исходного антитела 684E12.SMCC.DM1 на ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97.

[0048] На фигуре 14A-B изображены фотографии IHC для выявления фосфо-гистона H3 (фигура 14A) и количественная оценка сигнала фосфо-гистона H3 (фигура 14B) для опухолей KE97 через 48 часов после обработки однократной дозой либо 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 при 2, 5 или 10 мг/кг, либо изотипического контроля, IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4, при 10 мг/кг, демонстрирующие индукцию митотического блока (фосфо-гистон H3) после обработки с помощью ADC к CCR7.

[0049] На фигуре 15 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели ABC-DLBCL OCI-LY3.

[0050] На фигуре 16 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели GCB-DLBCL Toledo.

[0051] На фигуре 17 изображен график, иллюстрирующий эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели ALCL DEL.

[0052] На фигуре 18 изображен график, иллюстрирующий дозозависимую эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели NSCLC на основе полученного от пациента ксенотрансплантата HLUX1787.

Подробное описание изобретения

Определения

[0053] Если не указано иное, подразумевается, что следующие термины и фразы, используемые в данном документе, имеют следующие значения.

[0054] Термин "алкил" относится к одновалентной насыщенной углеводородной цепи, содержащей указанное число атомов углерода. Например, C_1-6алкил относится к алкильной группе, содержащей от 1 до 6 атомов углерода. Алкильная группа может быть прямой или разветвленной. Типичная разветвленная алкильная группа содержит одну, две или три ветви. Примеры алкильных групп включают без ограничения, метил, этил, пропил (н-пропил и изопропил), бутил (н-бутил, изобутил, втор-бутил и трет-бутил), пентил (н-пентил, изопентил и неопентил) и гексил. Термин "алкилен" обозначает двухвалентную форму "алкила".

[0055] Используемый в данном документе термин "антитело" относится к полипептиду из семейства иммуноглобулинов, который способен к связыванию соответствующего антигена нековалентным, обратимым и специфическим образом. Например, встречающееся в природе антитело IgG представляет собой тетрамер, содержащий по меньшей мере две тяжелые (H) цепи и две легкие (L) цепи, соединенные между собой посредством дисульфидных связей. Каждая тяжелая цепь состоит из вариабельной области тяжелой цепи (сокращенно обозначаемой в данном документе как VH) и константной области тяжелой цепи. Константная область тяжелой цепи состоит из трех доменов, CH1, CH2 и CH3. Каждая легкая цепь состоит из вариабельной области легкой цепи (сокращенно обозначаемой в данном документе как VL) и константной области легкой цепи. Константная область легкой цепи состоит из одного домена, CL. Области VH и VL могут быть дополнительно подразделены на области гипервариабельности, называемые определяющими комплементарность областями (CDR), которые чередуются с более консервативными областями, называемыми каркасными областями (FR). Каждая VH и VL состоит из трех CDR и четырех FR, расположенных от амино-конца к карбокси-концу в следующем порядке: FR1, CDR1, FR2, CDR2, FR3, CDR3 и FR4. Вариабельные области тяжелой и легкой цепей содержат связывающий домен, который взаимодействует с антигеном. Константные области антител могут опосредовать связывание иммуноглобулина с тканями или факторами хозяина, которые включают различные клетки иммунной системы (например, эффекторные клетки) и первый компонент (Clq) классической системы комплемента.

[0056] Термин "антитело" предусматривает без ограничения моноклональные антитела, человеческие антитела, гуманизированные антитела, химерные антитела и антиидиотипические (анти-Id) антитела (включая, например, анти-Id антитела к антителам по настоящему изобретению). Антител могут относиться к любому изотипу/классу (например, IgG, IgE, IgM, IgD, IgA и IgY) или подклассу (например, IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgA1 и IgA2).

[0057] "Определяющие комплементарность домены" или "определяющие комплементарность области" ("CDR") взаимозаменяемо относятся к гипервариабельным областям VL и VH. В цепях антитела CDR представляют собой сайт связывания белка-мишени, который обуславливает специфичность в отношении такого белка-мишени. В каждой человеческой VL или VH имеется по три CDR (CDR1-3, пронумерованные последовательно от N-конца), составляющие приблизительно 15-20% от вариабельных доменов. CDR являются структурно комплементарными эпитопу белка-мишени и, таким образом, непосредственно ответственны за специфичность связывания. Остальные отрезки VL или VH, так называемые каркасные области, проявляют меньшую изменчивость аминокислотной последовательности (Kuby, Immunology, 4th ed., Chapter 4. W.H. Freeman & Co., New York, 2000).

[0058] Положения CDR и каркасных областей могут быть определены с применением различных определений, широко известных из уровня техники, например, Kabat, Chothia, международной базы данных ImMunoGeneTics (IMGT) (во всемирной сети по адресу www.imgt.org/) и AbM (см., например, Johnson et al., Nucleic Acids Res., 29:205-206 (2001); Chothia and Lesk, J. Mol. Biol., 196:901-917 (1987); Chothia et al., Nature, 342:877-883 (1989); Chothia et al., J. Mol. Biol., 227:799-817 (1992); Al-Lazikani et al., J.Mol.Biol., 273:927-748 (1997)). Определения антигенсвязывающих активных центров также описаны в следующих источниках: Ruiz et al., Nucleic Acids Res., 28:219-221 (2000); и Lefranc, M.P., Nucleic Acids Res., 29:207-209 (2001); MacCallum et al., J. Mol. Biol., 262:732-745 (1996); и Martin et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 86:9268-9272 (1989); Martin et al., Methods Enzymol., 203:121-153 (1991); и Rees et al., в Sternberg M.J.E. (ed.), Protein Structure Prediction, Oxford University Press, Oxford, 141-172 (1996).

[0059] Как легкая, так и тяжелая цепи подразделяются на области структурной и функциональной гомологии. Термины "константный" и "вариабельный" применяются в функциональном смысле. В связи с этим следует понимать, что вариабельные домены из частей как легкой (VL), так и тяжелой (VH) цепей определяют распознавание антигена и специфичность в его отношении. Напротив, константные домены легкой цепи (CL) и тяжелой цепи (CH1, CH2 или CH3) придают важные биологические свойства, такие как секреция, перемещение через плаценту, связывание с рецептором Fc, связывание с комплементом и т. п. Принято, что номера доменов константной области увеличиваются по мере их удаления от антигенсвязывающего сайта или амино-конца антитела. N-конец представляет собой вариабельную область, а на C-конце находится константная область; домены CH3 и CL фактически содержат карбокси-концевые домены тяжелой и легкой цепи, соответственно.

[0060] Используемый в данном документе термин "антигенсвязывающий фрагмент" относится к одной или нескольким частям антитела, которые сохраняют способность специфически взаимодействовать (например, посредством связывания, стерического несоответствия, стабилизации/дестабилизации, пространственного распределения) с эпитопом антигена. Примеры связывающих фрагментов включают без ограничения одноцепочечные Fv (scFv), антитела верблюжьих, соединенные дисульфидными связями Fv (sdFv), Fab-фрагменты, F(ab')-фрагменты, одновалентный фрагмент, состоящий из доменов VL, VH, CL и CH1; F(ab)2-фрагмент, двухвалентный фрагмент, содержащий два Fab-фрагмента, соединенные дисульфидным мостиком в шарнирной области; Fd-фрагмент, состоящий из доменов VH и CH1; Fv-фрагмент, состоящий из доменов VL и VH одного плеча антитела; dAb-фрагмент (Ward et al., Nature 341:544-546, 1989), который состоит из домена VH; а также выделенную определяющую комплементарность область (CDR) или другие эпитопсвязывающие фрагменты антитела.

[0061] Кроме того, хотя два домена Fv-фрагмента, VL и VH, кодируются отдельными генами, они могут быть соединены с применением рекомбинантных способов с помощью синтетического линкера, что обеспечивает их получение в виде одной белковой цепи, в которой области VL и VH соединяются в пару с образованием одновалентной молекулы (известной как одноцепочечный Fv ("scFv"); см., например, Bird et al., Science 242:423-426, 1988; и Huston et al., Proc. Natl. Acad. Sci. 85:5879-5883, 1988). Предусматривается, что такие одноцепочечные антитела также охватываются термином "антигенсвязывающий фрагмент". Такие антигенсвязывающие фрагменты получают с применением традиционных методик, известных специалистам в данной области техники, и фрагменты подвергают скринингу на применимость таким же способом, что и интактные антитела.

[0062] Антигенсвязывающие фрагменты также могут быть включены в состав однодоменных антител, максител, минител, однодоменных антител, интрател, диател, триател, тетрател, v-NAR и бис-scFv (см., например, Hollinger and Hudson, Nature Biotechnology 23:1126-1136, 2005). Антигенсвязывающие фрагменты можно прививать на остовы на основе полипептидов, таких как фибронектин типа III (Fn3) (см. патент США № 6703199, в котором описаны монотела на основе полипептида фибронектина).

[0063] Антигенсвязывающие фрагменты можно вводить в состав одноцепочечных молекул, содержащих пару тандемных сегментов Fv (VH-CH1-VH-CH1), которые вместе с комплементарными полипептидами легкой цепи образуют пару антигенсвязывающих областей (Zapata et al., Protein Eng. 8:1057-1062, 1995; и патент США № 5641870).

[0064] Используемый в данном документе термин "моноклональное антитело" или "композиция на основе моноклонального антитела" относится к полипептидам, включающим антитела и антигенсвязывающие фрагменты, которые характеризуются практически идентичной аминокислотной последовательностью или происходят из одного генетического источника. Данный термин также охватывает препараты молекул антител одного молекулярного состава. Композиция на основе моноклонального антитела проявляет одну специфичность и аффинность связывания в отношении конкретного эпитопа.

[0065] Используемый в данном документе термин "человеческое антитело" охватывает антитела, имеющие вариабельные области, в которых как каркасные области, так и CDR получены из последовательностей, происходящих от человека. Кроме того, если антитело содержит константную область, то константная область также происходит из таких человеческих последовательностей, например, последовательностей зародышевой линии человека, или мутантных вариантов последовательностей зародышевой линии человека, или антитела, содержащего консенсусные каркасные последовательности, полученные за счет анализа человеческих каркасных последовательностей, например, как описано в Knappik et al., J. Mol. Biol. 296:57-86, 2000). Также подразумеваются антитела, происходящие из человеческих последовательностей, где одна или несколько CDR были подвергнуты мутированию в процессе созревания аффинности или для целей изготовления/конъюгации с полезной нагрузкой. См. Kilpatrick et al., "Rapid development of affinity matured monoclonal antibodies using RIMMS", Hybridoma. 1997 Aug;16(4):381-9.

[0066] Человеческие антитела по настоящему изобретению могут включать аминокислотные остатки, которые не закодированы в человеческих последовательностях (например, мутации, введенные посредством случайного или сайт-специфического мутагенеза in vitro или за счет соматических мутаций in vivo, или консервативная замена, которая содействует стабильности или облегчает изготовление).

[0067] Используемый в данном документе термин "распознавать" относится к антителу или его антигенсвязывающему фрагменту, которые отыскивают свой эпитоп и взаимодействуют (например, связываются) с ним, независимо от того является ли эпитоп линейным или конформационным. Термин "эпитоп" относится к сайту на антигене, с которым специфически связываются антитело или антигенсвязывающий фрагмент по настоящему изобретению. Эпитопы могут быть образованы как смежными аминокислотами, так и несмежными аминокислотами, размещаемыми рядом за счет третичной укладки белка. Эпитопы, образуемые из смежных аминокислот, как правило, сохраняются при воздействии денатуририрующих растворителей, в то время как эпитопы, образуемые за счет третичной укладки, как правило, утрачиваются при обработке денатурирующими растворителями. Эпитоп, как правило, содержит по меньшей мере 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9, 10, 11, 12, 13, 14 или 15 аминокислот в уникальной пространственной конформации. Способы определения пространственной конформации эпитопов включают методики из уровня техники, например, рентгеноструктурную кристаллографию и 2-мерный ядерный магнитный резонанс (см., например, Epitope Mapping Protocols в Methods in Molecular Biology, Vol. 66, G. E. Morris, Ed. (1996)).

[0068] Используемый в данном документе термин "аффинность" относится к силе взаимодействия между антителом и антигеном в отдельных антигенных сайтах. В пределах каждого антигенного сайта вариабельная область "плеча" антитела взаимодействует с антигеном посредством слабых нековалентных сил в многочисленных сайтах; при этом, чем больше взаимодействий, тем сильнее аффинность.

[0069] Термин "выделенное антитело" относится к антителу, которое практически не содержит других антител с отличающейся антигенной специфичностью. Однако выделенное антитело, которое специфически связывается с одним антигеном, может характеризоваться перекрестной реактивностью в отношении других антигенов. Более того, выделенное антитело может практически не содержать другого клеточного материала и/или химических веществ.

[0070] Термин "соответствующая последовательность зародышевой линии человека" относится к последовательности нуклеиновой кислоты, кодирующей аминокислотную последовательность или подпоследовательность человеческой вариабельной области, которые обладают самой высокой установленной идентичностью аминокислотной последовательности с эталонной аминокислотной последовательностью или подпоследовательностью вариабельной области в сравнении со всеми другими всеми другими известными аминокислотными последовательностями вариабельной области, закодированными в последовательностях вариабельной области иммуноглобулина зародышевой линии человека. Соответствующая последовательность зародышевой линии человека также может относиться к аминокислотной последовательности или подпоследовательности человеческой вариабельной области, характеризующимся самой высокой идентичностью аминокислотной последовательности с эталонной аминокислотной последовательностью или подпоследовательностью вариабельной области в сравнении со всеми другими подвергнутыми оценке аминокислотными последовательностями вариабельной области. Соответствующей последовательностью зародышевой линии человека могут быть только каркасные области, только определяющие комплементарность области, каркасные и определяющие комплементарность области, вариабельный сегмент (как определено выше) или другие комбинации последовательностей или подпоследовательностей, которые составляют вариабельную область. Идентичность последовательности может быть определена с применением способов, описанных в данном документе, например, выравнивания двух последовательностей с применением BLAST, ALIGN или другого алгоритма выравнивания, известного из уровня техники. Соответствующая последовательность нуклеиновой кислоты или аминокислотная последовательность зародышевой линии человека может характеризоваться по меньшей мере приблизительно 90%, 91, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99%, или 100% идентичностью последовательности с эталонной последовательностью нуклеиновой кислоты или аминокислотной последовательностью вариабельной области. Соответствующие последовательности зародышевой линии человека могут быть определены, например, с помощью международной базы данных ImMunoGeneTics (IMGT), находящейся в открытом доступе (во всемирной сети по адресу www.imgt.org/) и V-base (во всемирной сети по адресу vbase.mrc-cpe.cam.ac.uk).

[0071] Фраза "специфически связывает" или "селективно связывает", когда она применяется в контексте описания взаимодействия между антигеном (например, белком) и антителом, фрагментом антитела или связывающим средством, происходящим из антитела, относится к реакции связывания, которая является определяющей для установления присутствия антигена в неоднородной популяции белков и других биологических веществ, например, в биологическом образце, например, крови, сыворотке, плазме или образце ткани. Таким образом, при некоторых обозначенных условиях проведения иммунологического анализа антитела или связывающие средства, характеризующиеся конкретной специфичностью связывания, связываются с конкретным антигеном в по меньшей мере два раза сильнее, чем фоновый уровень, и практически не связываются в значительном количестве с другими антигенами, присутствующими в образце. В одном варианте осуществления при обозначенных условиях иммунологического анализа антитело или связывающее средство с конкретной специфичностью связывания связывается с конкретным антигеном в по меньшей мере десять (10) раз сильнее относительно фонового уровня, и практически не связывается в значительном количестве с другими антигенами, присутствующими в образце. Специфическое связывание с антителом или связывающим средством в таких условиях может предусматривать то, что антитело или средство должно отбираться за его специфичность в отношении конкретного белка. При желании или необходимости данный отбор можно проводить путем отбрасывания антител, которые вступают в перекрестные реакции с молекулами от другого вида (например, мыши или крысы) или других подтипов. В качестве альтернативы в некоторых вариантах осуществления отбирают антитела или фрагменты антител, которые вступают в перекрестные реакции с некоторыми требуемыми молекулами.

[0072] Целый ряд форматов иммунологического анализа может применяться для отбора антител, характеризующихся специфической иммунной реактивностью в отношении конкретного белка. Например, твердофазные иммунологические анализы ELISA традиционно применяются для отбора антител, характеризующихся специфической реактивностью в отношении белка (см., например, Harlow & Lane, Using Antibodies, A Laboratory Manual (1998), где описаны форматы и условия иммунологического анализа, которые можно применять для определения специфической иммунной реактивности). Как правило, реакция специфического или селективного связывания будет приводить к сигналу, в по меньшей мере два раза превышающему фоновый уровень, и, более типично, в по меньшей мере 10-100 раз превышающему фоновый уровень.

[0073] Термин "равновесная константа диссоциации (KD [M])" относится к константе скорости диссоциации (kd [время-1]), поделенной на константу скорости ассоциации (ka [время-1, M-1]). Равновесные константы диссоциации могут быть измерены с применением любого способа, известного из уровня техники. Обычно антитела по настоящему изобретению будут характеризоваться равновесной константой диссоциации, составляющей менее приблизительно 10^-7 или 10^-8 M, например, менее приблизительно 10^-9 M или 10^-10 M, в некоторых вариантах осуществления менее приблизительно 10^-11 M, 10^-12 M или 10^-13 M.

[0074] Термин "биодоступность" относится к системной доступности (т. е. уровням в крови/плазме) заданного количества лекарственного средства, вводимого пациенту. Биодоступность представляет собой абсолютный термин, обозначающий показатель как времени (скорости), в течение которого лекарственное средство достигает общего кровообращения из введенной лекарственной формы, так и общего количества (величины) лекарственного средства в нем.

[0075] Используемая в данном документе фраза "состоящий фактически из" относится к родам или видам активных фармацевтических средств, включенных в способ или композицию, а также любым вспомогательным веществам, не проявляющим активность в отношении намеченной цели применения способов или композиций. В некоторых вариантах осуществления фраза "состоящий фактически из" однозначно исключает включение одного или нескольких дополнительных активных средств, отличных от конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления фраза "состоящий фактически из" однозначно исключает включение одного или нескольких дополнительных активных средств, отличных от конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению и второго средства, вводимого совместно.

[0076] Термин "аминокислота" относится к встречающимся в природе, синтетическим и неприродным аминокислотам, а также аналогам аминокислот и миметикам аминокислот, которые функционируют подобно встречающимся в природе аминокислотам. Встречающиеся в природе аминокислоты представляют собой аминокислоты, закодированные в генетическом коде, а также такие аминокислоты, которые были впоследствии модифицированы, например, гидроксипролин, γ-карбоксиглутамат и O-фосфосерин. Аналоги аминокислот относятся к соединениям, которые характеризуются такой же основной химической структурой, что и встречающаяся в природе аминокислота, то есть имеют α-углерод, который связан с водородом, карбоксильной группой, аминогруппой и R-группой, например, к гомосерину, норлейцину, метионинсульфоксиду, метионинметилсульфонию. Такие аналоги имеют модифицированные R-группы (например, норлейцин) или модифицированные пептидные остовы, но сохраняют такую же основную химическую структуру, что и встречающаяся в природе аминокислота. Миметики аминокислот относятся к химическим соединениям, которые имеют структуру, отличающуюся от общей химической структуры аминокислоты, но которые функционируют подобно встречающейся в природе аминокислоте.

[0077] Термин "консервативно модифицированный вариант" применяется в отношении как аминокислотных последовательностей, так и последовательностей нуклеиновой кислоты. Применительно к конкретным последовательностям нуклеиновой кислоты, консервативно модифицированные варианты относятся к тем нуклеиновым кислотам, которые кодируют идентичные или фактически идентичные аминокислотные последовательности, или же, если нуклеиновая кислота не кодирует аминокислотную последовательность, к фактически идентичным последовательностям. Вследствие вырожденности генетического кода любой заданный белок кодируется большим количеством функционально идентичных нуклеиновых кислот. Например, все из кодонов GCA, GCC, GCG и GCU кодируют аминокислоту аланин. Таким образом, в каждом положении, в котором кодоном задан аланин, кодон может быть изменен на любой из соответствующих описанных кодонов без изменения кодируемого полипептида. Такие вариации нуклеиновой кислоты являются "молчащими вариациями", которые представляют собой одну разновидность вариаций с консервативными модификациями. В данном документе каждая последовательность нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, также описывает каждую возможную молчащую вариацию нуклеиновой кислоты. Специалист в данной области будет осознавать, что каждый кодон в нуклеиновой кислоте (за исключением AUG, который обычно является единственным кодоном для метионина, и TGG, который обычно является единственным кодоном для триптофана) может быть модифицирован с получением функционально идентичной молекулы. Соответственно, каждая молчащая вариация нуклеиновой кислоты, которая кодирует полипептид, неявно определена в каждой описанной последовательности.

[0078] В случае полипептидных последовательностей "консервативно модифицированные варианты" охватывают отдельные замены, делеции или добавления в полипептидной последовательности, которые приводят к замене аминокислоты на аналогичную по химическим свойствам аминокислоту. Таблицы консервативных замен, обеспечивающие функционально аналогичные аминокислоты, хорошо известны из уровня техники. Такие консервативно модифицированные варианты дополняют, а не исключают, полиморфные варианты, межвидовые гомологи и аллели по настоящему изобретению. Следующие восемь групп содержат аминокислоты, которые являются консервативными заменами друг для друга: 1) аланин (A), глицин (G); 2) аспарагиновая кислота (D), глутаминовая кислота (E); 3) аспарагин (N), глутамин (Q); 4) аргинин (R), лизин (K); 5) изолейцин (I), лейцин (L), метионин (M), валин (V); 6) фенилаланин (F), тирозин (Y), триптофан (W); 7) серин (S), треонин (T) и 8) цистеин (C), метионин (M) (см., например, Creighton, Proteins (1984)). В некоторых вариантах осуществления термин "консервативные модификации последовательности" используется для обозначения аминокислотных модификаций, которые не оказывают значительного влияния на характеристики связывания у антитела, содержащего аминокислотную последовательность, или не изменяют их.

[0079] Используемый в данном документе термин "оптимизированная" относится к нуклеотидной последовательности, кодирующей аминокислотную последовательность, которая была изменена с применением кодонов, предпочтительных в продуцирующих клетке или организме, обычно в эукариотической клетке, например, дрожжевой клетке, клетке Pichia, грибной клетке, клетке Trichoderma, клетке яичника китайского хомячка (CHO) или человеческой клетке. Оптимизированную нуклеотидную последовательность конструируют таким образом, чтобы полностью или насколько это возможно сохранить аминокислотную последовательность, изначально закодированную в первоначальной нуклеотидной последовательности, которая также известна как "исходная" последовательность.

[0080] Термины "процент идентичности" или "процентная идентичность", в контексте двух или более нуклеиновых кислот или полипептидных последовательностей, относятся к степени, в которой две или более последовательности или подпоследовательности являются одинаковыми. Две последовательности являются "идентичными", если они имеют одинаковую последовательность из аминокислот или нуклеотидов на протяжении области, подлежащей сравнению. Две последовательности являются "практически идентичными", если две последовательности имеют указанную процентную долю аминокислотных остатков или нуклеотидов, которые являются одинаковыми (т. е. 60% идентичность, необязательно 65%, 70%, 75%, 80%, 85%, 90%, 95% или 99% идентичность на протяжении указанной области или, если не указано, на протяжении всей последовательности), при сравнении и выравнивании для обеспечения максимального соответствия на протяжении окна сравнения или обозначенной области, как измерено с применением одного из следующих алгоритмов сравнения последовательности или посредством ручного выравнивания и визуального просмотра. Необязательно идентичность существует на протяжении области, длина которой составляет по меньшей мере приблизительно 30 нуклеотидов (или 10 аминокислот), или более предпочтительно на протяжении области, длина которой составляет 100-500 или 1000 или более нуклеотидов (или 20, 50, 200 или более аминокислот).

[0081] При сравнении последовательностей обычно одна последовательность выступает в качестве эталонной последовательности, с которой сравнивают тестируемые последовательности. При использовании алгоритма сравнения последовательностей тестируемую и эталонную последовательности вводят в компьютер, если необходимо, устанавливают координаты подпоследовательностей и устанавливают программные параметры алгоритма для анализа последовательностей. Могут применяться программные параметры по умолчанию или можно устанавливать альтернативные параметры. На основании программных параметров алгоритм сравнения последовательностей затем рассчитывает значения процента идентичности последовательностей для тестируемых последовательностей относительно эталонной последовательности.

[0082] Используемое в данном документе "окно сравнения" предусматривает ссылку на сегмент из любого количества смежных положений, выбранных из группы, состоящей из от 20 до 600, обычно от приблизительно 50 до приблизительно 200, чаще от приблизительно 100 до приблизительно 150, в котором последовательность можно сравнивать с эталонной последовательностью с таким же количеством смежных положений, после того как две последовательности подвергли оптимальному выравниванию. Способы выравнивания последовательностей для проведения сравнения хорошо известны из уровня техники. Оптимальное выравнивание последовательностей для сравнения можно проводить, например, с помощью алгоритма поиска локальной гомологии Смита-Уотермана, Adv. Appl. Math. 2:482c (1970), с помощью алгоритма выравнивания областей гомологии Нидлмана-Вунша, J. Mol. Biol. 48:443 (1970), с помощью способа поиска сходства Пирсона-Липмана, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 85:2444 (1988), с помощью компьютерных реализаций таких алгоритмов (GAP, BESTFIT, FASTA и TFASTA в составе пакета программного обеспечения Wisconsin Genetics, Genetics Computer Group, 575 Science Dr., Мэдисон, Висконсин) или с помощью ручного выравнивания и визуального просмотра (см., например, Brent et al., Current Protocols in Molecular Biology, 2003).

[0083] Два примера алгоритмов, которые подходят для определения процента идентичности последовательностей и сходства последовательностей, представляют собой алгоритмы BLAST и BLAST 2.0, которые описаны в Altschul et al., Nuc. Acids Res. 25:3389-3402, 1977; и Altschul et al., J. Mol. Biol. 215:403-410, 1990, соответственно. Программное обеспечение для осуществления анализов BLAST находится в открытом доступе от Национального центра биотехнологической информации. На первом этапе данный алгоритм предусматривает идентификацию пар последовательностей с высоким показателем сходства (HSP) за счет идентификации коротких слов длиной W в запрашиваемой последовательности, которые либо совпадают, либо удовлетворяют некоторому пороговому баллу T с положительным значением при выравнивании со словом такой же длины в последовательности из базы данных. T известен под названием пороговый балл соседних слов (Altschul et al., выше). Эти первоначальные совпадения соседних слов выступают в качестве "затравок" для начала поисков, предназначенных для нахождения более длинных HSP, содержащие их. Совпадения слов продлеваются в обоих направлениях вдоль каждой последовательности до тех пор, пока может увеличиваться суммарный балл выравнивания. В случае нуклеотидных последовательностей суммарные баллы рассчитывают с применением параметров M (вознаграждающий балл за пару совпадающих остатков; всегда >0) и N (штрафной балл за несовпадающие остатки; всегда <0). В случае аминокислотных последовательностей для подсчета суммарного балла применяют матрицу замен. Продление совпадений слов в каждом направлении останавливается, когда суммарный балл выравнивания уменьшается на величину X относительно своего максимального достигнутого значения; суммарный балл стремится к нулю или ниже вследствие накопления одного или нескольких выравниваний остатков с отрицательными баллами; или достигается конец любой из последовательностей. Параметры W, T и X алгоритма BLAST определяют чувствительность и скорость выравнивания. В программе BLASTN (для нуклеотидных последовательностей) в качестве параметров по умолчанию применяется длина слова (W), составляющая 11, ожидание (E), составляющее 10, M=5, N=-4 и сравнение обеих нитей. В случае аминокислотных последовательностей в программе BLASTP в качестве параметров по умолчанию применяется длина слова, составляющая 3, и ожидание (E), составляющее 10, и матрица замен BLOSUM62 (см. Henikoff and Henikoff (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 89:10915), выравнивания (B), составляющие 50, ожидание (E), составляющее 10, M=5, N=-4 и сравнение обеих нитей.

[0084] Алгоритм BLAST также осуществляет статистический анализ сходства между двумя последовательностями (см., например, Karlin and Altschul, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 90:5873-5787, 1993). Одной мерой сходства, предусмотренной в алгоритме BLAST, является наименьшая суммарная вероятность (P (N)), которая указывает на вероятность, с которой совпадение между двумя нуклеотидными или аминокислотными последовательностями возникло случайно. Например, нуклеиновая кислота считается схожей с эталонной последовательностью, если наименьшая суммарная вероятность при сравнении тестируемой нуклеиновой кислоты с эталонной нуклеиновой кислотой составляет менее приблизительно 0,2, более предпочтительно менее приблизительно 0,01 и наиболее предпочтительно менее приблизительно 0,001.

[0085] Процентную идентичность между двумя аминокислотными последовательностями также можно определить с использованием алгоритма из E. Meyers и W. Miller (Comput. Appl. Biosci. 4:11-17, (1988) который был включен в программу ALIGN (версия 2.0), с применением таблицы весов замен остатков PAM120, штрафа за продление гэпа, составляющего 12, и штрафа за открытие гэпа, составляющего 4. Кроме того, процентная идентичность между двумя аминокислотными последовательностями может быть определена с применением алгоритма Нидлмана-Вунша, J. Mol. Biol. 48:444-453, (1970), который был включен в программу GAP в составе пакета программного обеспечения GCG (доступного на www.gcg.com), с применением либо матрицы BLOSUM62, либо матрицы PAM250, и также штрафа за открытие гэпа, составляющего 16, 14, 12, 10, 8, 6 или 4, и штрафа за продление гэпа, составляющего 1, 2, 3, 4, 5 или 6.

[0086] Помимо процента идентичности последовательностей, упомянутого выше, еще одним показателем того, что две последовательности нуклеиновой кислоты или полипептида являются практически идентичными, является то, что полипептид, кодируемый первой нуклеиновой кислотой, является иммунологически перекрестно реактивным с антителами, выработка которых индуцирована полипептидом, кодируемым второй нуклеиновой кислотой, как описано ниже. Таким образом, полипептид, как правило, является практически идентичным второму полипептиду, например, если два пептида отличаются только консервативными заменами. Другим показателем того, что две последовательности нуклеиновой кислоты являются практически идентичными, является то, что две молекулы или их комплементарные цепи гибридизируются друг с другом в жестких условиях, как описано ниже. Еще одним показателем того, что две последовательности нуклеиновой кислоты являются практически идентичными, является то, что для амплификации последовательности могут применяться одни и те же праймеры.

[0087] Термин "нуклеиновая кислота" используется в данном документе взаимозаменяемо с термином "полинуклеотид" и относится к дезоксирибонуклеотидам или рибонуклеотидам и полимерам на их основе в одно- или двухнитевой форме. Термин охватывает нуклеиновые кислоты, содержащие известные аналоги нуклеотидов или модифицированные остатки или связи в остове, которые являются синтетическими, встречающимися в природе и не встречающимися в природе, которые характеризуются свойствами связывания, подобными эталонной нуклеиновой кислоте, и которые метаболизируются подобно эталонным нуклеотидам. Примеры таких аналогов включают без ограничения фосфоротиоаты, фосфорамидаты, метилфосфонаты, хиральные метилфосфонаты, 2-O-метилрибонуклеотиды, пептидонуклеиновые кислоты (PNA).

[0088] Если не указано иное, конкретная последовательность нуклеиновой кислоты также в неявном виде охватывает ее консервативно модифицированные варианты (например, замены на основе вырожденных кодонов) и комплементарные последовательности, а также последовательность, указанную явным образом. А именно, как подробно описано ниже, замены на основе вырожденных кодонов можно проводить за счет создания последовательностей, в которых третье положение в одном или нескольких выбранных (или всех) кодонах заменено на любой из канонических нуклеозидов и/или остаток дезоксиинозина (Batzer et al., Nucleic Acid Res. 19:5081, 1991; Ohtsuka et al., J. Biol. Chem. 260:2605-2608, 1985; и Rossolini et al., Mol. Cell. Probes 8:91-98, 1994).

[0089] В контексте нуклеиновых кислот термин "функционально связанный" относится к функциональной взаимосвязи двух или более сегментов полинуклеотида (например, ДНК). Как правило, он относится к функциональной взаимосвязи регулирующей транскрипцию последовательности с транскрибируемой последовательностью. Например, промоторная или энхансерная последовательность является функционально связанной с кодирующей последовательностью, если она стимулирует или модулирует транскрипцию кодирующей последовательности в соответствующей клетке-хозяине или другой системе экспрессии. Обычно регулирующие транскрипцию промоторные последовательности, которые являются функционально связанными с транскрибируемой последовательностью, являются физически смежными с транскрибируемой последовательностью, т.е. они функционируют в цис-положении. Однако некоторые регулирующие транскрипцию последовательности, такие как энхансеры, не обязательно должны быть физически смежными или располагаться в непосредственной близости от кодирующих последовательностей, транскрипцию которых они усиливают.

[0090] Термины "полипептид" и "белок" используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения полимера из аминокислотных остатков. Термины применимы к полимерам из аминокислот, в которых один или несколько аминокислотных остатков представляют собой искусственный химический миметик соответствующей встречающейся в природе аминокислоты, а также к полимерам из встречающихся в природе аминокислот и полимеру из не встречающихся в природе аминокислот. Если не указано иное, конкретная полипептидная последовательность также в неявном виде охватывает ее консервативно модифицированные варианты.

[0091] Используемый в данном документе термин "конъюгат антитела и лекарственного средства" или "иммуноконъюгат" относится к связи антитела или его антигенсвязывающего фрагмента с другим средством, таким как химиотерапевтическое средство, токсин, иммунотерапевтическое средство, зонд для визуализации и т.п. Связь может представлять собой ковалентные связи или нековалентные взаимодействия, такие как посредством электростатических сил. Для образования конъюгата антитела и лекарственного средства могут использоваться различные линкеры, известные из уровня техники. Кроме того, конъюгат антитела и лекарственного средства может предусматриваться в форме слитого белка, который может экспрессироваться с полинуклеотида, кодирующего иммуноконъюгат. Используемый в данном документе "слитый белок" относится к белкам, созданным за счет соединения двух или более генов или фрагментов генов, которые изначально кодировали отдельные белки (в том числе пептиды и полипептиды). Трансляция слитого гена приводит к единому белку с функциональными свойствами, происходящими из каждого из исходных белков.

[0092] Термин "субъект" охватывает человека и отличных от человека животных. Отличные от человека животные охватывают всех позвоночных, например, млекопитающих и отличных от млекопитающих животных, как, например, отличных от человека приматов, овцу, собаку, корову, кур, амфибий и рептилий. За исключением случаев, когда это отмечается, термины "пациент" или "субъект" используются в данном документе взаимозаменяемо.

[0093] Используемый в данном документе термин "цитотоксин" или "цитотоксическое средство" относится к любому средству, которое является вредным для роста и пролиферации клеток и которое может функционировать с уменьшением, ингибированием или разрушением клетки или злокачественной опухоли.

[0094] Используемый в данном документе термин "противораковое средство" относится к любому средству, которое может использоваться для лечения или предупреждения нарушения пролиферации клеток, такого как рак, в том числе без ограничения к цитотоксическим средствам, химиотерапевтическим средствам, лучевой терапии и средствам для лучевой терапии, нацеливающим противораковым средствам и иммунотерапевтическим средствам.

[0095] Используемый в данном документе термин "фрагмент, представляющий собой лекарственное средство" или "полезная нагрузка" относится к химическому фрагменту, который конъюгирован с антителом или антигенсвязывающим фрагментом по настоящему изобретению, и может охватывать любое терапевтическое или диагностическое средство, например, противораковое, противовоспалительное, противоинфекционное (например, противогрибковое, антибактериальное, антипаразитарное, противовирусное) или анестетическое средство. Например, фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, может представлять собой противораковое средство, такое как цитотоксин. В некоторых вариантах осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, выбран из ингибитора V-АТФазы, ингибитора HSP90, ингибитора IAP, ингибитора mTor, стабилизатора микротрубочек, дестабилизатора микротрубочек, ауристатина, доластатина, майтанзиноида, MetAP (метионинаминопептидазы), ингибитора РНК-полимеразы, пирролобензодиазепина (PBD), аманитина, ингибитора ядерного экспорта белков CRM1, ингибитора DPPIV, ингибитора реакций переноса фосфорила в митохондриях, ингибитора синтеза белка, ингибитора киназ, ингибитора CDK2, ингибитора CDK9, ингибитора протеасомы, ингибитора кинезина, ингибитора HDAC, ДНК-повреждающего средства, ДНК-алкилирующего средства, ДНК-интеркалятора, средства, связывающего малую бороздку ДНК, и ингибитора DHFR. Способы прикрепления каждого из них к линкеру, совместимому с антителами и способом по настоящему изобретению, известны из уровня техники. См., например, Singh et al., (2009) Therapeutic Antibodies: Methods and Protocols, vol. 525, 445-457. Кроме того, полезная нагрузка может представлять собой зонд для биофизического обнаружения, флуорофор, спиновую метку, зонд для инфракрасного обнаружения, зонд для обнаружения аффинности, хелатор, зонд для спектроскопического обнаружения, радиоактивный зонд, липидную молекулу, полиэтиленгликоль, полимер, спиновую метку, ДНК, РНК, белок, пептид, поверхность, антитело, фрагмент антитела, наночастицу, квантовую точку, липосому, частицу PLGA, сахарид или полисахарид.

[0096] Термин "фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство", обозначает часть конъюгата антитела и лекарственного средства, которая имеет структуру майтанзиноидного соединения. Сначала майтанзин был выделен из куста Maytenus serrata, произрастающего в восточной Африке (патент США № 3896111). Впоследствии было установлено, что некоторые микроорганизмы также вырабатывают майтанзиноиды, такие как майтанзинол и сложные эфиры C-3-майтанзинола (патент США № 4151042). Сообщалось о синтетическом майтанзиноле и аналогах майтанзинола. См. патенты США №№ 4137230; 4248870; 4256746; 4260608; 4265814; 4294757; 4307016; 4308268; 4308269; 4309428; 4313946; 4315929; 4317821; 4322348; 4331598; 4361650; 4364866; 4424219; 4450254; 4362663 и 4371533, и Kawai et al., (1984) Chem. Pharm. Bull. 3441-3451), каждый из которых однозначно включен посредством ссылки. Примеры конкретных майтанзиноидов, применимых для конъюгации, включают DM1, DM3 и DM4.

[0097] "Опухоль" относится к росту и пролиферации неопластических клеток, неважно злокачественных или доброкачественных, а также всех предраковых и раковых клеток и тканей.

[0098] Термин "противоопухолевая активность" означает снижение скорости пролиферации, жизнеспособности или метастатической активности опухолевых клеток. Например, противоопухолевая активность может быть показана за счет падения скорости роста аномальных клеток, которое появляется во время терапии, или стабилизации или уменьшения размера опухоли, или более длительного выживания, обусловленного терапией, по сравнению с контролем без терапии. Такую активность можно оценить с применением принятых in vitro или in vivo моделей опухоли, в том числе без ограничения ксенотрансплантатных моделей, моделей с аллогенными трансплантатами, моделей MMTV и других известных моделей, известных из уровня техники для исследования противоопухолевой активности.

[0099] Термин "злокачественная опухоль" относится к недоброкачественной опухоли или раку. Используемый в данном документе термин "рак" охватывает злокачественную опухоль, которая характеризуется дерегулированным или неконтролируемым ростом клеток. Иллюстративные типы рака включают: карциномы, саркомы, лейкозы и лимфомы.

[00100] Термин "рак" охватывает первичные злокачественные опухоли (например, опухоли, клетки которых не мигрировали в локализации в организме субъекта, отличные от локализации исходной опухоли) и вторичные злокачественные опухоли (например, опухоли, развившиеся за счет метастазирования, миграции опухолевых клеток во вторичные локализации, которые отличны от локализации исходной опухоли).

[00101] Термин "CCR7" (также известный как BLR2, CC-CKR-7, CCR-7, CD197, CDw197, CMKBR7, EBI1 или хемокиновый рецептор 7 с C-C мотивом) относится к представителю семейства рецепторов, сопряженных с G белком. Последовательность нуклеиновой кислоты и аминокислотная последовательность CCR7 человек была опубликована в GenBank под следующими №№ доступа: NP_001829, NP_001288643, NP_001288645, NP_001288646, NP_001288647 (аминокислотные последовательности) и NM_001838, NM_001301714, NM_001301716, NM_001301717, NM_001301718 (нуклеотидные последовательности). Используемый в данном документе термин "CCR7" применяют для совместного обозначения всех встречающихся в природе изоформ белка CCR7 или его варианта.

[00102] Термин "вариант" относится к полипептиду, который имеет практически идентичную аминокислотную последовательность с эталонным полипептидом, или кодируется практически идентичной нуклеотидной последовательностью и может характеризоваться одной или несколькими активностями эталонного полипептида. Например, вариант может характеризоваться приблизительно 85%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или более высокой идентичностью последовательности с эталонным полипептидом, при этом он сохраняет одну или несколько активностей эталонного полипептида.

[00103] Используемые в данном документе термины "лечить", "осуществление лечения" или "лечение" любого заболевания или нарушения в одном варианте осуществления относятся к уменьшению тяжести заболевания или нарушения (т.е. замедлению, или остановке, или снижению развития заболевания или по меньшей мере одного из его клинических симптомов). В другом варианте осуществления "лечить", "осуществление лечения" или "лечение" относятся к облегчению или уменьшению тяжести по меньшей мере одного физического параметра, в том числе таких, которые могут быть неявными для пациента. В еще одном варианте осуществления "лечить", "осуществление лечения" или "лечение" означают модулирование заболевания или нарушения либо физически (например, стабилизацию явного симптома), либо физиологически (например, стабилизацию физического параметра), либо с помощью того и другого.

[00104] Используемый в данном документе термин "предупреждать", "осуществление предупреждения" или "предупреждение" любого заболевания или нарушения относится к профилактическому лечению заболевания или нарушения или замедлению начала или прогрессирования заболевания или нарушения.

[00105] Термин "терапевтически приемлемое количество" или "терапевтически эффективная доза" взаимозаменяемо относится к количеству, достаточному для произведения требуемого результата (т.е. уменьшения размера опухоли, ингибирования роста опухоли, предотвращения метастазирования, ингибирования или предупреждения вирусной, бактериальной, грибковой или паразитарной инфекции). В некоторых вариантах осуществления терапевтически приемлемое количество не индуцирует или не вызывает нежелательные побочные эффекты. В некоторых вариантах осуществления терапевтически приемлемое количество индуцирует или вызывает побочные эффекты, но только такие, которые являются допустимыми с точки зрения медицинских работников, учитывая состояние пациента. Терапевтически приемлемое количество можно определять, вводя вначале низкую дозу, а затем постепенно увеличивать данную дозу до тех пор, пока не будет достигнут требуемый эффект. "Профилактически эффективная доза" и "терапевтически эффективная доза" молекул по настоящему изобретению может предупреждать проявление или, соответственно, приводить к уменьшению тяжести симптомов заболевания, в том числе симптомов, ассоциированных с раком.

[00106] Термин "совместное введение" относится к присутствию двух активных средств в крови индивидуума. Активные средства, которые вводятся совместно, могут доставляться одновременно или последовательно.

[00107] В настоящем изобретении представлены антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и их конъюгаты с лекарственным средством, т.е. конъюгаты антитела и лекарственного средства или ADC, которые связываются с CCR7. В частности, в настоящем изобретении представлены антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые связываются с CCR7 и подвергаются интернализации после такого связывания. Антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) по настоящему изобретению могут применяться для получения конъюгатов антитела и лекарственного средства. Кроме того, в настоящем изобретении представлены конъюгаты антитела и лекарственного средства, которые характеризуются требуемыми фармакокинетическими характеристиками и другими требуемыми свойствами, и, таким образом, они могут применяться для лечения или предупреждения рака, экспрессирующего CCR7. В настоящем изобретении дополнительно предусмотрены фармацевтические композиции, содержащие конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению; а также способы изготовления и применения таких фармацевтических композиций для лечения или предупреждения рака.

Конъюгаты антитела и лекарственного средства

[00108] В настоящем изобретении предусмотрены конъюгаты антитела и лекарственного средства, также называемые иммуноконъюгатами, где антитело, антигенсвязывающий фрагмент или его функциональный эквивалент, которые специфически связываются с CCR7, соединены с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство. В одном аспекте антитела, антигенсвязывающие фрагменты или их функциональные эквиваленты по настоящему изобретению соединены посредством ковалентной связи за счет линкера с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, которое представляет собой противораковое средство. Конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению могут доставлять эффективную дозу противоракового средства (например, цитотоксического средства) в ткани опухоли, экспрессирующей CCR7, вследствие чего может достигаться большая селективность (и более низкая эффективная доза).

[00109] В одном аспекте настоящего изобретения представлен иммуноконъюгат формулы (I):

Ab-(L-(D)_m)_n,

где Ab представляет собой CCR7-связывающее антитело, описанное в данном документе;

L представляет собой линкер;

D представляет собой фрагмент, представляющий собой лекарственное средство;

m составляет целое число от 1 до 8; и

n составляет целое число от 1 до 20. В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 2, 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления m составляет 1; в других вариантах осуществления m составляет 2, 3 или 4.

[00110] Хотя в конкретной молекуле конъюгата отношение лекарственного средства к антителу имеет точное значение (например, n, умноженное на m в формуле (I)), известно, что зачастую значение будет представлять собой среднее значение, когда его применяют для описания образца, содержащего множество молекул, вследствие некоторой степени гетерогенности, обычно сопряженной со стадией конъюгации. Средняя нагрузка для образца иммуноконъюгата обозначается в данном документе как отношение лекарственного средства к антителу или "DAR". В некоторых вариантах осуществления, когда лекарственное средство представляет собой майтанзиноид, его называют "MAR." В некоторых вариантах осуществления DAR составляет от приблизительно 2 до приблизительно 6, и обычно составляет приблизительно 3, 3,5, 4, 4,5, 5, 5,5, 6, 6,5, 7,0, 7,5, 8,0. В некоторых вариантах осуществления по меньшей мере 50% образца по весу составляет соединение, характеризующееся средним DAR плюс или минус 2, и предпочтительно по меньшей мере 50% образца составляет конъюгат, который подразумевает среднее DAR плюс или минус 1. Варианты осуществления охватывают иммуноконъюгаты, у которых DAR составляет приблизительно 3,5, 3,6, 3,7, 3,8 или 3,9. В некоторых вариантах осуществления DAR, составляющее «приблизительно n», означает, что измеренное значение DAR находится в пределах 20% от n.

[00111] Настоящее изобретение также направлено на иммуноконъюгаты, содержащие антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и их функциональные эквиваленты, раскрытые в данном документе, соединенные или конъюгированные с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство. В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство D, представляет собой фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, в том числе характеризующиеся структурой:

где волнистая линия указывает на ковалентную связь атома серы майтанзиноида с линкером конъюгат антитела и лекарственного средства. R в каждом случае независимо представляет собой H или C₁-C₆алкил. Алкиленовая цепь, прикрепляющая амидную группу к атому серы, может представлять собой метанил, этанил или пропил, т.е. r составляет 1, 2 или 3. (Патент США № 633410, патент США № 5208020, Chari et al. (1992) Cancer Res. 52;127-131, Lui et al. (1996) Proc. Natl. Acad. Sci. 93:8618-8623).

[00112] Все стереоизомеры фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, предусмотрены для применения в иммуноконъюгатах по настоящему изобретению, т. е. любая комбинация R- и S-конфигураций по хиральным атомам углерода майтанзиноида. В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, характеризуется следующей стереохимией.

[00113] В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, представляет собой N²'-деацетил-N²'-(3-меркапто-1-оксопропил)-майтанзин (также известный как DM1). DM1 представлен следующей структурной формулой.

DM1

[00114] В другом варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, представляет собой N²'-деацетил-N²'-(4-меркапто-1-оксопентил)-майтанзин (также известный как DM3). DM3 представлен следующей структурной формулой.

DM3

[00115] В другом варианте осуществления фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, представляет собой N²'-деацетил-N²'-(4-метил-4-меркапто-1-оксопентил)-майтанзин (также известный как DM4). DM4 представлен следующей структурной формулой.

DM4

[00116] Фрагмент, представляющий собой лекарственное средство D, может быть соединен с антителом Ab с помощью линкера L. L представляет собой любой химический фрагмент, способный к соединению фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, с антителом за счет ковалентных связей. Сшивающий реагент представляет собой бифункциональный или мультифункциональный реагент, который может использоваться для соединения фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, и антитела с образованием конъюгатов антитела и лекарственного средства. Конъюгаты антитела и лекарственного средства могут быть получены с применением сшивающего реагента, имеющего реакционноспособные функциональные группы, способные к связывание как с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, так и с антителом. Например, цистеин, тиол или амин, например, на N-конце или боковой цепи аминокислоты, такой как лизин, в антителе могут образовать связь с функциональной группой сшивающего реагента. В качестве альтернативы конъюгаты антитела и лекарственного средства могут быть получены за счет предварительного образования фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство (или фрагмента, представляющего собой лекарственное средство-линкер, оба термина используются взаимозаменяемо), и осуществления реакции фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, с антителом. В некоторых случаях фрагмент, представляющий собой линкер, собирается на лекарственном средстве постепенно с помощью нескольких соединяющих фрагментов до тех пор, пока не получится требуемый фрагмент, представляющий собой линкер-лекарственное средство,.

[00117] В одном варианте осуществления L представляет собой расщепляемый линкер. В другом варианте осуществления L представляет собой нерасщепляемый линкер. В некоторых вариантах осуществления L представляет собой кислотолабильный линкер, фотолабильный линкер, расщепляемый пептидазами линкер, расщепляемый эстеразами линкер, линкер с расщепляемой дисульфидной связью, гидрофильный линкер, предварительно заряженный линкер, расщепляемый гликозидазами линкер, расщепляемый фосфодиэстеразами линкер, расщепляемый фосфатазами линкер или линкер на основе дикарбоновой кислоты.

[00118] Подходящие сшивающие реагенты, которые образуют нерасщепляемый линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, широко известны из уровня техники, и они могут образовывать нерасщепляемые линкеры, которые содержат атом серы (такие как SMCC), или линкеры, которые не содержат атом серы. Предпочтительные сшивающие реагенты, которые образуют нерасщепляемые линкеры между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, содержат фрагмент на основе малеимида или галогенацетила. В соответствии с настоящим изобретением про такие нерасщепляемые линкеры говорится, что они происходят из фрагментов на основе малеимида или галогенацетила.

[00119] Сшивающие реагенты, содержащие фрагмент на основе малеимида включают без ограничения N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилат (SMCC), сульфосукцинимидил-4-(N-малеимидометил)циклогексан-1-карбоксилат (сульфо-SMCC), N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексан-1-карбокси-(6-амидокапроат), который представляет собой "длинноцепочечный" аналог SMCC (LC-SMCC), N-сукцинимидильный сложный эфир κ-малеимидоундекановой кислоты (KMUA), N-сукцинимидильный сложный эфир γ-малеимидомасляной кислоты (GMBS), N-сукцинимидильный сложный эфир ε-малеимидокапроновой кислоты (EMCS), m-малеимидобензоил-N-гидроксисукцинимидный сложный эфир (MBS), N-(α-малеимидоацетокси)-сукцинимидный сложный эфир (AMSA), сукцинимидил-6-(β-малеимидопропионамидо)гексаноат (SMPH), N-сукцинимидил-4-(p-малеимидофенил)-бутират (SMPB), N-(-p-малеимидофенил)изоцианат (PMIP) и сшивающие реагенты на основе малеимида, содержащие полиэтиленгликольный спейсер, такие как MAL-PEG-NHS. Данные сшивающие реагенты образуют нерасщепляемые линкеры, происходящие из фрагментов на основе малеимида. Типичные структуры сшивающих реагентов на основе малеимида показаны ниже.

[00120] В другом варианте осуществления линкер L происходит из N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилата (SMCC), сульфосукцинимидил 4-(N-малеимидометил)циклогексан-1-карбоксилата (сульфо-SMCC) или MAL-PEG-NHS.

[00121] Сшивающие реагенты, содержащие фрагмент на основе галогенацетила, включают N-сукцинимидилйодацетат (SIA), N-сукцинимидил(4-йодацетил)аминобензоат (SIAB), N-сукцинимидилбромацетат (SBA) и N-сукцинимидил-3-(бромацетамидо)пропионат (SBAP). Данные сшивающие реагенты образуют нерасщепляемый линкер, происходящий из фрагментов на основе галогенацетила. Типичные структуры сшивающих реагентов на основе галогенацетила показаны ниже.

или

[00122] В одном варианте осуществления линкер L происходит из N-сукцинимидилйодацетата (SIA) или N-сукцинимидил(4-йодацетил)аминобензоата (SIAB).

[00123] Подходящие сшивающие реагенты, которые образуют расщепляемый линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, широко известны из уровня техники. Линкеры, содержащие дисульфид, представляют собой линкеры, расщепляемые посредством дисульфидного обмена, который может происходить при физиологических условиях. В соответствии с настоящим изобретением про такие расщепляемые линкеры говорится, что они происходят из фрагментов на основе дисульфида. Подходящие дисульфидные сшивающие реагенты включают N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионат (SPDP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноат (SPP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноат (SPDB) и N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфо-бутаноат (сульфо-SPDB), структуры которых показаны ниже. Данные дисульфидные сшивающие реагенты образуют расщепляемый линкер, происходящий из фрагментов на основе дисульфида.

N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионат (SPDP),

N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноат (SPP),

N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноат (SPDB) и

N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфо-бутаноат (сульфо-SPDB).

[00124] В одном варианте осуществления линкер L происходит из N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноата (SPDB).

[00125] Подходящие сшивающие реагенты, которые образуют заряженный линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например майтанзиноид, и антителом, известны как предварительно заряженные сшивающие реагенты. В одном варианте осуществления линкер L происходит из предварительно заряженного сшивающего реагента CX1-1. Структура CX1-1 приведена ниже.

2,5-диоксопирролидин-1-ил-17-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)-5,8,11,14-тетраоксо-4,7,10,13-тетраазагептадекан-1-оат (CX1-1)

[00126] Каждый из сшивающих реагентов, изображенных выше, на одном конце сшивающего реагента содержит NHS-сложный эфир, который реагирует с первичным амином антитела с образованием амидной связи, а на другом конце малеимидную группу или пиридинилдисульфидную группу, которая реагирует с сульфгидрилом фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, с образованием тиоэфирной или дисульфидной связи.

[00127] В другом варианте осуществления подходящие сшивающие фрагменты, которые образуют расщепляемый линкер между фрагментом, представляющим собой лекарственное средство (например, майтанзиноид), и антителом представлены следующей формулой (II):

(II);

где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным.

В одном аспекте данного варианта осуществления y составляет 5, 7, 9 или 11. В другом аспекте данного варианта осуществления y составляет меньше 5.

В еще одном варианте осуществления подходящие сшивающие фрагменты в соответствии с формулой I выбраны из группы, состоящей из:

;

где y составляет от 1 до 11.

[00128] В случае сшивающих фрагментов, изображенных выше (т. е. MBT, MPET, MEPET; MMTBT, MPPT, MPBT), малеимидная группа обеспечивает возможность реакции с сульфгидрилом (или тиолом) цистеина в антителе, с образованием, тем самым, тиоэфирной связи; а тиольная функциональная группа сшивающего фрагмента соединяется с тиолом фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, с образованием расщепляемой дисульфидной связи. В силу перекрестно-реакционноспособной природы соединяющего фрагмента формулы (I) (тиол и малеимид могут вступать в перекрестную реакцию), специалист в данной области техники будет осознавать, что соединяющий фрагмент должен собираться постепенно на фрагменте, представляющем собой лекарственное средство, как изображено на схеме 1.

[00129] В соответствии с вышеуказанным вариантом осуществления линкеры, полученные из сшивающих фрагментов (т.е. MBT, MPET, MEPET), могут быть изображены следующим образом:

(IIA);

где * соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство (например, фрагмента, представляющего собой майтанзиноидное лекарственное средство, DM1, DM3 или DM4).

[00130] В соответствии с вышеуказанным вариантом осуществления линкеры, полученные из сшивающих фрагментов (т.е. MBT, MPET, MEPET), могут быть изображены следующим образом:

где y составляет от 1 до 11; * соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, (например, майтанзиноидное лекарственное средство, DM1, DM3 или DM4).

[00131] В предпочтительном варианте осуществления линкер имеет следующую формулу:

;

где * соединен с тиольной функциональной группой на антителе, и ** соединен с тиольной функциональной группой майтанзиноидного лекарственного средства (DM1, DM3 или DM4).

[00132] В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к фрагменту, представляющему собой линкер-лекарственное средство, с формулой:

; где

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным.

[00133] В другом варианте осуществления настоящее изобретение связано с постепенным образованием вышеуказанного конъюгата линкера и лекарственного средства, раскрытым на схеме 1 в данном документе.

[00134] В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, имеющим одну из следующих формул (III), (IV) и (V):

где L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна метиленовая группа может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным.

[00135] В одном варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, которые выбраны из следующих формул:

;

и

.

[00136] В другом варианте осуществления настоящее изобретение относится к соединениям фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, которые выбраны из следующих формул:

[00137] В другом варианте осуществления линкер-лекарственное средство по настоящему изобретению представлены любой из следующих формул:

где y составляет от 1 до 11, предпочтительно от 1 до 5.

[00138] В одном варианте осуществления линкер-лекарственное средство по настоящему изобретению представлены любой из следующих структурных формул:

[00139] В одном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:

,

где:

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые специфически связывают CCR7;

n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20. В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4.

[00140] В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих формул (VI), (VII) и (VIII):

;

где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным; и

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20. В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00141] В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению имеет формулу (VIA) или (VIB), соответствующую открытым формам сукцинимида конъюгата формулы (VI):

где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным; и

Ab представляет собой антитело или антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20. В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00142] В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению имеет формулу (VIIA) или (VIIB), соответствующую открытым формам сукцинимида конъюгата формулы (VII):

где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным; и

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20. В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00143] В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению имеет формулу (VIIIA), (VIIIB), соответствующую открытым формам сукцинимида конъюгата формулы (VIII):

где:

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным; и

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп линкер-лекарственное средство (L-D-), связанных с Ab за счет образования амидной связи с первичным амином на Ab, составляет целое число от 1 до 20. В одном варианте осуществления n составляет целое число от 1 до 10, от 2 до 8 или от 2 до 5. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00144] В одном варианте осуществления каждый конъюгат антитела и лекарственного средства, раскрытый в данном документе, где фрагмент, представляющий собой линкер-лекарственное средство, присоединен к антителу с помощью сукцинимида, также может существовать в виде открытых форм сукцинимида, как в общем изображено в формулах (VIA), (VIB), (VIIA), (VIIB), (VIIIA) и (VIIIB).

[00145] В еще одном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:

где:

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00146] В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:

, и

;

а также соответствующими открытыми формами сукцинимида;

где:

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00147] В другом варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен любой из следующих структурных формул:

;

а также соответствующими открытыми формами сукцинимида;

где:

y составляет от 1 до 11, предпочтительно от 1 до 5;

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00148] В еще одном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен следующими формулами:

а также соответствующими открытыми формами сукцинимида;

где:

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 12, или от 1 до 8, или предпочтительно от 1 до 4. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00149] В предпочтительном варианте осуществления конъюгат по настоящему изобретению представлен следующей формулой:

где:

Ab представляет собой антитело или его антигенсвязывающий фрагмент;

n, который указывает на число групп D-L, связанных с Ab за счет образования тиоэфирной связи с сульфгидрилом Ab, составляет целое число от 1 до 20. В некоторых вариантах осуществления n составляет целое число от 1 до 12. В некоторых вариантах осуществления n составляет целое число от 1 до 8. В некоторых вариантах осуществления n составляет целое число от 1 до 4. В конкретном варианте осуществления n составляет 3 или 4. В другом варианте осуществления среднее значение n составляет от приблизительно 3 до приблизительно 4. В некоторых вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент связываются с антигеном, который экспрессируется на опухолевых клетках. В одном варианте осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают CCR7. В других вариантах осуществления антитело или его антигенсвязывающий фрагмент специфически связывают P-кадгерин, кадгерин 6, FGFR2 или FGFR4.

[00150] В одном варианте осуществления среднее молярное отношение лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) к антителу в конъюгате (т. е. среднее значение n, также известное как отношение майтанзиноида к антителу (MAR)) составляет от приблизительно 1 до приблизительно 10, от приблизительно 2 до приблизительно 8 (например, 1,9, 2,0, 2,1, 2,2, 2,3, 2,4, 2,5, 2,6, 2,7, 2,8, 2,9, 3,0, 3,1, 3,2, 3,3, 3,4, 3,5, 3,6, 3,7, 3,8, 3,9, 4,0, 4,1, 4,2, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6, 4,7, 4,8, 4,9, 5,0, 5,1, 5,2, 5,3, 5,4, 5,5, 5,6, 5,7, 5,8, 5,9, 6,0, 6,1, 6,2, 6,3, 6,4, 6,5, 6,6, 6,7, 6,8, 6,9, 7,0, 7,1, 7,2, 7,3, 7,4, 7,5, 7,6, 7,7, 7,8, 7,9, 8,0, или 8,1), от приблизительно 2,5 до приблизительно 7, от приблизительно 3 до приблизительно 5, от приблизительно 2,5 до приблизительно 4,5 (например, приблизительно 2,5, приблизительно 2,6, приблизительно 2,7, приблизительно 2,8, приблизительно 2,9, приблизительно 3,0, приблизительно 3,1, приблизительно 3,3, приблизительно 3,4, приблизительно 3,5, приблизительно 3,6, приблизительно 3,7, приблизительно 3,8, приблизительно 3,9, приблизительно 4,0, приблизительно 4,1, приблизительно 4,2, приблизительно 4,3, приблизительно 4,4, приблизительно 4,5), от приблизительно 3,0 до приблизительно 4,0, от приблизительно 3,2 до приблизительно 4,2 или от приблизительно 4,5 до 5,5 (например, приблизительно 4,5, приблизительно 4,6, приблизительно 4,7, приблизительно 4,8, приблизительно 4,9, приблизительно 5,0, приблизительно 5,1, приблизительно 5,2, приблизительно 5,3, приблизительно 5,4 или приблизительно 5,5).

[00151] В одном аспекте настоящего изобретения конъюгат по настоящему изобретению характеризуется в значительной степени высокой чистотой и имеет один или несколько из следующих признаков: (a) более приблизительно 90% (например, больше или равно приблизительно 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100%), предпочтительно более приблизительно 95% разновидностей конъюгата являются мономерными, (b) уровень неконъюгированного линкера в препарате конъюгата составляет менее приблизительно 10% (например, меньше или равно приблизительно 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% или 0%) (относительно общего количества линкера), (c) менее 10% разновидностей конъюгата являются сшитыми (например, меньше или равно приблизительно 9%, 8%, 7%, 6%, 5%, 4%, 3%, 2%, 1% или 0%), (d) уровень свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) в препарате конъюгата составляет менее приблизительно 2% (например, меньше или равно приблизительно 1,5%, 1,4%, 1,3%, 1,2%, 1,1%, 1,0%, 0,9%, 0,8%, 0,7%, 0,6%, 0,5%, 0,4%, 0,3%, 0,2%, 0,1%, или 0%) (моль/моль относительно общего количества цитотоксического средства); и/или (e) не происходит значительное повышение уровня свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) после хранения (например, после приблизительно 1 недели, приблизительно 2 недель, приблизительно 3 недель, приблизительно 1 месяца, приблизительно 2 месяцев, приблизительно 3 месяцев, приблизительно 4 месяцев, приблизительно 5 месяцев, приблизительно 6 месяцев, приблизительно 1 года, приблизительно 2 лет, приблизительно 3 лет, приблизительно 4 лет или приблизительно 5 лет). "Значительное повышение" уровня свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) означает, что после некоторого времени хранения (например, приблизительно 1 недели, приблизительно 2 недель, приблизительно 3 недель, приблизительно 1 месяца, приблизительно 2 месяцев, приблизительно 3 месяцев, приблизительно 4 месяцев, приблизительно 5 месяцев, приблизительно 6 месяцев, приблизительно 1 года, приблизительно 2 лет, приблизительно 3 лет, приблизительно 4 лет или приблизительно 5 лет) повышение уровня свободного лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) составляет менее приблизительно 0,1%, приблизительно 0,2%, приблизительно 0,3%, приблизительно 0,4%, приблизительно 0,5%, приблизительно 0,6%, приблизительно 0,7%, приблизительно 0,8%, приблизительно 0,9%, приблизительно 1,0%, приблизительно 1,1%, приблизительно 1,2%, приблизительно 1,3%, приблизительно 1,4%, приблизительно 1,5%, приблизительно 1,6%, приблизительно 1,7%, приблизительно 1,8%, приблизительно 1,9%, приблизительно 2,0%, приблизительно 2,2%, приблизительно 2,5%, приблизительно 2,7%, приблизительно 3,0%, приблизительно 3,2%, приблизительно 3,5%, приблизительно 3,7% или приблизительно 4,0%.

[00152] Применяемый в данном документе термин "неконъюгированный линкер" относится к антителу, которое ковалентно связано с линкером, происходящим из сшивающего реагента (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1), где антитело не присоединено ковалентной связью к лекарственному средству (например, DM1, DM3 или DM4) за счет линкера (т.е. "неконъюгированный линкер" может быть представлен как Ab-MCC, Ab-SPDB или Ab-CX1-1).

1. Фрагмент, представляющий собой лекарственное средство

[00153] В настоящем изобретении представлены иммуноконъюгаты, которые специфически связываются с CCR7. Конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению содержат антитела к CCR7, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты, которые конъюгированы с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, например, противораковым средством, средством лечения аутоиммунных заболеваний, противовоспалительным средством, противогрибковым средством, антибактериальным средством, антипаразитическим средством, противовирусным средством или анестетическим средством. Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению могут быть конъюгированы с несколькими идентичными или различными фрагментами, представляющими собой лекарственное средство, с применением любых способов, известных из уровня техники.

[00154] В некоторых вариантах осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, из иммуноконъюгатов по настоящему изобретению, выбран из группы, состоящей из ингибитора V-АТФазы, проапоптического средства, ингибитора Bcl2, ингибитора MCL1, ингибитора HSP90, ингибитора IAP, ингибитора mTor, стабилизатора микротрубочек, дестабилизатора микротрубочек, ингибитора РНК-полимеразы, аманитина, пирролобензодиазепина, ауристатина, доластатина, майтанзиноида, MetAP (метионинаминопептидазы), ингибитора ядерного экспорта белков CRM1, ингибитора DPPIV, ингибитора Eg5, ингибиторов протеасомы, ингибитора реакций переноса фосфорила в митохондриях, ингибитора синтеза белка, ингибитора киназ, ингибитора CDK2, ингибитора CDK9, ингибитора кинезина, ингибитора HDAC, ДНК-повреждающего средства, ДНК-алкилирующего средства, ДНК-интеркалятора, средства, связывающего малую бороздку ДНК, и ингибитора DHFR.

[00155] В определенном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, из иммуноконъюгатов по настоящему изобретению представляет собой ауристатин, раскрытый в PCT-публикациях под номерами: WO 2015/095301 и WO2015/189791, при этом обе заявки тем самым включены посредством ссылки. Неограничивающие примеры конструкций из фрагмента, представляющего собой ауристатиновое лекарственное средство, и линкера представляют собой:

(которая представляет собой AURIX2, как раскрыто в настоящей заявке) и

которая представляет собой AURIX1, как раскрыто в настоящей заявке).

[00156] В одном варианте осуществления фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, из иммуноконъюгатов по настоящему изобретению представляет собой фрагмент, представляющий собой майтанзиноидное лекарственное средство, такое как без ограничения DM1, DM3 или DM4.

[00157] Кроме того, антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению могут быть конъюгированы с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, модифицирующее заданный биологический ответ. Фрагменты, представляющие собой лекарственные средства, не следует рассматривать как ограниченные классическими химическими терапевтическими средствами. Например, фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, может представлять собой белок, пептид или полипептид, обладающие требуемой биологической активностью. Такие белки могут включать, например, токсин, такой как абрин, рицин A, экзотоксин Pseudomonas, холерный токсин или дифтерийный токсин; белок, такой как фактор некроза опухоли, α-интерферон, β-интерферон, фактор роста нервов, фактор роста тромбоцитов, тканевой активатор плазминогена, цитокин, апоптическое средство, антиангиогенное средство или модификатор биологического ответа, такой как, например, лимфокин.

[00158] В одном варианте осуществления антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению конъюгированы с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, таким как цитотоксин, лекарственное средство (например, иммуносупрессор) или радиотоксин. Примеры цитотоксинов включают без ограничения таксаны (см., например, международные (PCT) заявки на патент №№ WO 01/38318 и PCT/US03/02675), ДНК-алкилирующие средства (например, аналоги CC-1065), антрациклины, аналоги тубулизина, аналоги дуокармицина, ауристатин E, ауристатин F, майтанзиноиды и цитотоксические средства, содержащие фрагмент, представляющий собой реакционноспособный полиэтиленгликоль (см., например, Sasse et al., J. Antibiot. (Tokyo), 53, 879-85 (2000), Suzawa et al., Bioorg. Med. Chem., 8, 2175-84 (2000), Ichimura et al., J. Antibiot. (Tokyo), 44, 1045-53 (1991), Francisco et al., Blood (2003) (электронная публикация до печатной публикации), патенты США №№ 5475092, 6340701, 6372738 и 6436931, публикацию заявки на патент США № 2001/0036923 A1, находящиеся на рассмотрении заявки на патент США с порядковыми №№ 10/024290 и 10/116053, и международную (PCT) заявку на патент № WO 01/49698), таксон, цитохалазин B, грамицидин D, этидия бромид, эметин, митомицин, этопозид, тенопозид, винкристин, винбластин, t. колхицин, доксорубицин, даунорубицин, дигидроксиантрациндион, митоксантрон, митрамицин, актиномицин D, 1-дегидротестостерон, глюкокортикоиды, прокаин, тетракаин, лидокаин, пропранолол и пуромицин, а также их аналоги или гомологи. Терапевтические средства также включают, например, антиметаболиты (например, метотрексат, 6-меркаптопурин, 6-тиогуанин, цитарабин, 5-фторурацил, декарбазин), разрушающие средства (например, мехлорэтамин, тиотепу, хлорамбуцил, мелфалан, кармустин (BSNU) и ломустин (CCNU), циклофосфамид, бусульфан, дибромманнит, стрептозотоцин, митомицин C и цис-дихлордиаминплатину (II) (DDP), цисплатин, антрациклины (например, даунорубицин (ранее дауномицин) и доксорубицин), антибиотики (например, дактиномицин (ранее актиномицин), блеомицин, митрамицин и антрамицин (AMC)) и антимитотические средства (например, винкристин и винбластин). (См. например, US20090304721 от Seattle Genetics).

[00159] Другие примеры цитотоксинов, которые могут быть конъюгированы с антителами, фрагментами антител (антигенсвязывающими фрагментами) или функциональными эквивалентами по настоящему изобретению, включают дуокармицины, калихеамицины, майтанзины и ауристатины, а также их производные.

[00160] Различные типы цитотоксинов, линкеров и способы конъюгирования терапевтических средств с антителами известны из уровня техники, см., например, Saito et al., (2003) Adv. Drug Deliv. Rev. 55:199-215; Trail et al., (2003) Cancer Immunol. Immunother. 52:328-337; Payne, (2003) Cancer Cell 3:207-212; Allen, (2002) Nat. Rev. Cancer 2:750-763; Pastan and Kreitman, (2002) Curr. Opin. Investig. Drugs 3:1089-1091; Senter and Springer, (2001) Adv. Drug Deliv. Rev. 53:247-264.

[00161] Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению также можно конъюгировать с радиоактивным изотопом для создания цитотоксических радиофармацевтических препаратов, называемых радиоиммуноконъюгаты. Примеры радиоактивных изотопов, которые можно конъюгировать с антителами для применения в диагностических или терапевтических целях, включают без ограничения йод-131, индий-111, иттрий-90 и лютеций-177. Способы получения радиоиммуноконъюгатов определены в уровне техники. Примеры радиоиммуноконъюгатов являются доступными коммерчески, в том числе Zevalin^TM (DEC Pharmaceuticals) и Bexxar^TM (Corixa Pharmaceuticals), а также подобные способы можно использовать для получения радиоиммуноконъюгатов с применением антител по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления макроциклический хелатор представляет собой 1,4,7,10-тетраазациклододекан-N,N',N'',N'''-тетрауксусную кислоту (DOTA), которая может быть прикреплена к антителу через линкерную молекулу. Такие линкерные молекулы широко известны из уровня техники и описаны в Denardo et al., (1998) Clin Cancer Res. 4(10):2483-90; Peterson et al., (1999) Bioconjug. Chem. 10(4):553-7; и Zimmerman et al., (1999) Nucl. Med. Biol. 26(8):943-50, каждый из которых включен посредством ссылки во всей своей полноте.

[00162] Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению также можно конъюгировать с гетерологичным белком или полипептидом (или их фрагментом, предпочтительно с полипептидом из по меньшей мере 10, по меньшей мере 20, по меньшей мере 30, по меньшей мере 40, по меньшей мере 50, по меньшей мере 60, по меньшей мере 70, по меньшей мере 80, по меньшей мере 90 или по меньшей мере 100 аминокислот) для создания слитых белков. В частности, в настоящем изобретении представлены слитые белки, содержащие фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент), описанный в данном документе (например, Fab-фрагмент, Fd-фрагмент, Fv-фрагмент, F(ab)₂-фрагмент, домен VH, CDR VH, домен VL или CDR VL), и гетерологичный белок, полипептид или пептид.

[00163] Дополнительные слитые белки можно создавать за счет методик шаффлинга генов, шаффлинга мотивов, шаффлинга экзонов и/или шаффлинга кодонов (совокупно называемых "шаффлингом ДНК"). Шаффлинг ДНК можно использовать для изменения активности антител по настоящему изобретению или их фрагментов (например, получения антител или их фрагментов с более высокими уровнями аффинности и более низкими значениями скорости диссоциации). См., в целом, патенты США №№ 5605793, 5811238, 5830721, 5834252 и 5837458; Patten et al., (1997) Curr. Opinion Biotechnol. 8:724-33; Harayama, (1998) Trends Biotechnol. 16(2):76-82; Hansson et al., (1999) J. Mol. Biol. 287:265-76; и Lorenzo and Blasco, (1998) Biotechniques 24(2):308-313 (каждый из данных патентов и публикаций тем самым включен посредством ссылки во всей своей полноте). Антитела или их фрагменты, или кодируемые антитела или их фрагменты можно изменять путем воздействия на них случайного мутагенеза с помощью ПЦР с внесением ошибок, случайной вставки нуклеотидов или других способов до проведения рекомбинации. Полинуклеотид, кодирующий антитело или его фрагмент, которые специфически связываются с антигеном, может быть подвергнут рекомбинации с одним или несколькими компонентами, мотивами, секциями, частями, доменами, фрагментами и т. д. одной или нескольких гетерологичных молекул.

[00164] Более того, антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению могут быть конъюгированы с маркерными последовательностями, такими как пептид, для облегчения очистки. В предпочтительных вариантах осуществления маркерная аминокислотная последовательность представляет собой гексагистидиновый пептид (SEQ ID NO: 628), такой как метка, предусмотренная в векторе pQE (QIAGEN, Inc., 9259 Eton Avenue, Чатсворт, Калифорния, 91311), среди прочих, многие из которых являются коммерчески доступными. Как описано в Gentz et al., (1989) Proc. Natl. Acad. Sci. USA 86:821-824, например, гексагистидин (SEQ ID NO: 628) обеспечивает удобную очистку слитого белка. Другие пептидные метки, применимые для очистки, включают без ограничения гемагглютининовую ("HA") метку, которая соответствует эпитопу, происходящему из белка гемагглютинина вируса гриппа (Wilson et al., (1984) Cell 37:767), и метку "FLAG" (A. Einhauer et al., J. Biochem. Biophys. Methods 49: 455-465, 2001). Согласно настоящему изобретению для повышения эффективности антител или антигенсвязывающих фрагментов их также можно конъюгировать с проникающими в опухоль пептидами.

[00165] В других вариантах осуществления антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению конъюгируют с диагностическим или выявляемым средством. Такие иммуноконъюгаты могут быть применимыми для контроля или прогнозирования проявления, развития, прогрессирования и/или степени тяжести заболевания или нарушения в рамках процедуры клинического тестирования, такой как определение эффективности конкретной терапии. Такая диагностика и обнаружение могут осуществляться путем сопряжения антитела с выявляемыми веществами, в том числе без ограничения с различными ферментами, такими как без ограничения пероксидаза хрена, щелочная фосфатаза, бета-галактозидаза или ацетилхолинэстераза; простетическими группами, такими как без ограничения стрептавидин/биотин и авидин/биотин; флуоресцентными материалами, такими как без ограничения Alexa Fluor 350, Alexa Fluor 405, Alexa Fluor 430, Alexa Fluor 488, Alexa Fluor 500, Alexa Fluor 514, Alexa Fluor 532, Alexa Fluor 546, Alexa Fluor 555, Alexa Fluor 568, Alexa Fluor 594, Alexa Fluor 610, Alexa Fluor 633, Alexa Fluor 647, Alexa Fluor 660, Alexa Fluor 680, Alexa Fluor 700, Alexa Fluor 750, умбеллиферон, флуоресцеин, флуоресцеина изотиоцианат, родамин, дихлортриазиниламинфлуоресцеин, дансилхлорид или фикоэритрин; люминесцентными материалами, такими как без ограничения люминол; биолюминесцентными материалами, такими как без ограничения люцифераза, люциферин и экворин; радиоактивными материалами, такими как без ограничения йод (¹³¹I, ¹²⁵I, ¹²³I и ¹²¹I), углерод (¹⁴C), сера (³⁵S), тритий (³H), индий (¹¹⁵In, ¹¹³In, ¹¹²In и ¹¹¹In), технеций (⁹⁹Tc), таллий (²⁰¹Ti), галлий (⁶⁸Ga, ⁶⁷Ga), палладий (¹⁰³Pd), молибден (⁹⁹Mo), ксенон (¹³³Xe), фтор (¹⁸F), ¹⁵³Sm, ¹⁷⁷Lu, ¹⁵⁹Gd, ¹⁴⁹Pm, ¹⁴⁰La, ¹⁷⁵Yb, ¹⁶⁶Ho, ⁹⁰Y, ⁴⁷Sc, ¹⁸⁶Re, ¹⁸⁸Re, ¹⁴²Pr, ¹⁰⁵Rh, ⁹⁷Ru, ⁶⁸Ge, ⁵⁷Co, ⁶⁵Zn, ⁸⁵Sr, ³²P, ¹⁵³Gd, ¹⁶⁹Yb, ⁵¹Cr, ⁵⁴Mn, ⁷⁵Se, ⁶⁴Cu, ¹¹³Sn и ¹¹⁷Sn; и позитронно-активными металлами с применением различных видов позитронной эмиссионной томографии, и нерадиоактивными ионами парамагнитных металлов.

[00166] Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональные эквиваленты по настоящему изобретению также могут быть прикреплены к твердым подложкам, которые особенно применимы для иммунологических анализов или очистки целевого антигена. Такие твердые подложки включают без ограничения стекло, целлюлозу, полиакриламид, нейлон, полистирол, поливинилхлорид или полипропилен.

2. Линкер

[00167] Используемый в данном документе "линкер" представляет собой любой химический фрагмент, который способен соединить антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты) или функциональный эквивалент с другим фрагментом, таким как фрагмент, представляющий собой лекарственное средство. Линкеры могут поддаваться расщеплению (расщепляемый линкер), такому как индуцированное кислотами расщепление, фотоиндуцированное расщепление, индуцированное пептидазами расщепление, индуцированное эстеразами расщепление, индуцированное гликозидазами расщепление, индуцированное фосфодиэстеразами расщепление, индуцированное фосфатазами расщепление и расщепление дисульфидной связи, в условиях, при которых соединение или антитело остаются активными. В качестве альтернативы линкеры могут быть в значительной степени устойчивыми к расщеплению (например, стабильный линкер или нерасщепляемый линкер). В некоторых аспектах линкер представляет собой предварительно заряженный линкер, гидрофильный линкер или линкер на основе дикарбоновой кислоты.

[00168] В одном аспекте линкер, применяемый в настоящем изобретении, происходит из сшивающего реагента, такого как N-сукцинимидил-3-(2-пиридилдитио)пропионат (SPDP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)пентаноат (SPP), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)бутаноат (SPDB), N-сукцинимидил-4-(2-пиридилдитио)-2-сульфо-бутаноат (сульфо-SPDB), N-сукцинимидилйодацетат (SIA), N-сукцинимидил-(4-йодацетил)аминобензоат (SIAB), малеимид-PEG-NHS, N-сукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилат (SMCC), N-сульфосукцинимидил-4-(малеимидометил)циклогексанкарбоксилат (сульфо-SMCC) или 2,5-диоксопирролидин-1-ил-17-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)-5,8,11,14-тетраоксо-4,7,10,13-тетраазагептадекан-1-оат (CX1-1).

[00169] Нерасщепляемые линкеры представляют собой любой химический фрагмент, который способен соединить лекарственное средство, такое как майтанзиноид, с антителом с помощью устойчивой ковалентной связи и не попадает в категории, перечисленные выше для расщепляемых линкеров. Таким образом, нерасщепляемые линкеры являются в значительной степени устойчивыми к индуцированному кислотами расщеплению, фотоиндуцированному расщеплению, индуцированному пептидазами расщеплению, индуцированному эстеразами расщеплению и расщеплению дисульфидной связи. Кроме того, нерасщепляемый относится к способности химической связи в линкере или прикрепляемой к линкеру противостоять расщеплению, индуцированному кислотой, фотолабильным расщепляющим средством, пептидазой, эстеразой или химическим или физиологическим соединением, которое расщепляет дисульфидную связь, в условиях, при которых лекарственное средство, такое как майтанзиноид или антитело, не теряет свою активность.

[00170] Кислотолабильные линкеры представляют собой линкеры, расщепляемые при кислотном pH. Например, некоторые внутриклеточные компартменты, такие как эндосомы и лизосомы, имеют кислотный pH (pH 4-5) и обеспечивают условия, подходящие для расщепления кислотолабильных линкеров.

[00171] Фотолабильные линкеры представляют собой линкеры, которые применимы на поверхности тела и во многих полостях тела, которые доступны для воздействия света. Кроме того, инфракрасный свет может проникать внутрь ткани.

[00172] Некоторые линкеры могут расщепляться под действием пептидаз, т.е. являются расщепляемыми пептидазами линкерами. Только некоторые пептиды легко расщепляются внутри или за пределами клеток, см., например, Trout et al., 79 Proc. Natl. Acad. Sci. USA, 626-629 (1982) и Umemoto et al. 43 Int. J. Cancer, 677-684 (1989). Кроме того, пептиды состоят из α-аминокислот и пептидных связей, которые химически представляют собой амидные связи между карбоксильной группой одной аминокислоты и аминогруппой второй аминокислоты. Понятно, что другие амидные связи, такие как связь между карбоксильной группой и ε-аминогруппой лизина, не являются пептидными связями и считаются нерасщепляемыми.

[00173] Некоторые линкеры могут расщепляться под действием эстераз, т.е. являются расщепляемыми эстеразами линкерами. Опять-таки, только некоторые сложные эфиры могут расщепляться под действием эстераз, присутствующих внутри или за пределами клеток. Сложные эфиры образуются путем конденсации карбоновой кислоты и спирта. Простые сложные эфиры представляют собой сложные эфиры, полученные с помощью простых спиртов, таких как алифатические спирты, и небольших циклических и небольших ароматических спиртов.

[00174] Предварительно заряженные линкеры происходят из заряженных сшивающих реагентов, которые сохраняют свой заряд после введения в конъюгат антитела и лекарственного средства. Примеры предварительно заряженных линкеров можно найти в US 2009/0274713.

3. Конъюгация и получение ADC

[00175] Многочисленные способы конъюгирования линкеров-полезных нагрузок с антигенсвязывающим фрагментом известны из уровня техники (обзор приведен, например, в: Antibody-Drug Conjugate, Methods in Molecular Biology, Vol. 1045, Editor L. Ducry, Humana Press (2013)). Традиционно лекарственные средства конъюгируют с нативными лизиновыми или нативными цистеиновыми остатками антитела. Полученные препараты представляют собой сложные смеси. В последнее время для улучшения терапевтического индекса и гомогенности препаратов ADC используются способы сайт-специфической конъюгации (обзор приведен в: Panowski, S.; Bhakta, S.; Raab, H.; Polakis, P.; Junutula, J. R. mAbs 2014, 6, 34). Помимо применения гликоинжиниринга (Zhou, Q. et al. Bioconjugate chemistry 2014, 25, 510; Zhu, Z. et al. mAbs 2014, 6, 1190); некоторые более общеизвестные способы получения сайт-специфических ADC основаны на введении сконструированных цистеинов (Junutula, J. R. et al., Nature biotechnology 2008, 26, 925; Shinmi, D. et al., Bioconjugate chemistry 2016, 27, 1324), неканонических аминокислот (Tian, F. et al., Proceedings National Academy of Sciences USA 2014, 111, 1766; Axup, J. Y. et al., Proceedings National Academy of Sciences USA 2012, 109, 16101) или коротких пептидных последовательностей в остов антитела (Drake, P. M. et al., Bioconjugate chemistry 2014, 25, 1331; Strop, P. et al., Chemistry & biology 2013, 20, 161; Beerli, R. R. et al., PloS one 2015, 10, e0131177; Grunewald, J. et al., Bioconjugate chemistry 2015, 26, 2554). Данные способы обеспечивают контроль за стехиометрией и сайтом прикрепления цитотоксина, что приводит к лучшей фармакокинетике (PK), безопасности и профилям эффективности конъюгатов по сравнению с традиционно полученными ADC.

[00176] Конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены с помощью любых способов, известных из уровня техники, таких как описанные в патентах США №№ 7811572, 6411163, 7368565 и 8163888, публикациях заявок на патент США 2011/0003969, 2011/0166319, 2012/0253021 и 2012/0259100, и PCT-публикациях WO2014/124316 и WO2015/138615. Полное изложение идей данных патентов и публикаций заявок на патент включено в данный документ посредством ссылки.

Способ конъюгации с введенными путем конструирования цистеиновыми остатками антитела

[00177] Конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены с применением цистеиновых остатков, введенных путем конструирования в антитело, например, с помощью сайт-направленного мутагенеза. Такие сайт-специфические конъюгаты являются гомогенными и характеризуются улучшенными свойствами (Junutula JR, Raab H, Clark S, Bhakta S, Leipold DD, Weir S, Chen Y, Simpson M, Tsai SP, Dennis MS, Lu Y, Meng YG, Ng C, Yang J, Lee CC, Duenas E, Gorrell J, Katta V, Kim A, McDorman K, Flagella K, Venook R, Ross S, Spencer SD, Lee Wong W, Lowman HB, Vandlen R, Sliwkowski MX, Scheller RH, Polakis P, Mallet W. (2008) Nature Biotechnology 26:925-932.)

[00178] Поскольку введенные путем конструирования цистеины в антителах, экспрессируемых в клетках млекопитающих, во время биосинтеза модифицируются за счет аддуктов (дисульфидов), таких как глутатион (GSH) и/или цистеин (Chen et al. 2009), изначально экспрессированные введенные путем конструирования цистеиновые остатки в продукте не реагируют с реагентами, вступающими в реакцию с тиолами, такими как малеимидная или бром- или йод-ацетамидная группы. Для осуществления конъюгации полезной нагрузки с введенным путем конструирования цистеином после экспрессии глутатионовый или цистеиновый аддукты должны быть удалены путем восстановления данных дисульфидных аддуктов, что обычно вызывает также восстановление нативных дисульфидов в экспрессированном белке. Удаление аддуктов у введенных путем конструирования цистеинов можно осуществлять, вначале подвергая антитело воздействию восстановителя, например, дитиотреитола (DTT), TCEP, или восстановленного цистеина, с последующим проведением процедуры, которая обеспечивает возможность повторного окисления всех нативных дисульфидных связей антитела для восстановления и/или стабилизации функциональной структуры антитела.

[00179] Можно использовать несколько способов восстановления и повторного окисления антител с введенными путем конструирования Cys-остатками для получения конъюгатов антитела и лекарственного средства. Попытки следовать ранее описанным в литературе протоколам повторного окисления с применением высоких концентраций CuSO₄ приводили к осаждению белка (Junutula JR, Raab H, Clark S, Bhakta S, Leipold DD, Weir S, Chen Y, Simpson M, Tsai SP, Dennis MS, Lu Y, Meng YG, Ng C, Yang J, Lee CC, Duenas E, Gorrell J, Katta V, Kim A, McDorman K, Flagella K, Venook R, Ross S, Spencer SD, Lee Wong W, Lowman HB, Vandlen R, Sliwkowski MX, Scheller RH, Polakis P, Mallet W. (2008) Nature Biotechnology 26:925). Авторы настоящего изобретения успешно подготовили и получили конъюгаты антитела и лекарственного средства с помощью нескольких различных способов восстановления и повторного окисления антитела.

[00180] В одном примере свежеполученный DTT добавляют к очищенным антителам с Cys-мутацией до конечной концентрации, составляющей 10 мМ. После инкубации с DTT при комнатной температуре в течение 1 часа смесь диализировали против PBS при 4°C в течение трех дней с ежедневной заменой буфера для удаления DTT и повторного окисления нативных дисульфидных связей антитела. Альтернативный способ заключается в удалении восстанавливающих реагентов путем пропускания через обессоливающую колонку, такую как Sephadex G-25, уравновешенную с помощью PBS. После того как белок полностью восстановился, к обессоленным образцам необязательно добавляют 1 мМ окисленного аскорбата (дигидроаскорбиновая кислота) и инкубации для повторного окисления проводят в течение 20-24 часов.

[00181] В другом иллюстративном способе освобождение введенных путем конструирования Cys-остатков осуществляют путем добавления полностью восстановленного цистеина при концентрации 20 мМ к антителам, связанным со смолой на основе сефарозы с белком A. Восстановление аддуктов на Cys достигается путем инкубации в течение примерно 30-60 минут при комнатной температуре, затем восстановитель быстро удаляют путем промывания смолы с помощью 50 объемов слоя PBS. Повторное окисление восстановленного антитела достигается инкубацией промытой взвеси при комнатной температуре с добавлением или без добавления 50-2000 нМ CuCl₂ в качестве катализатора. За исключением применения сульфата меди, в примерах из данного документа применялся каждый из протоколов, описанных в данном документе, с получением аналогичных результатов. Повторное окисление восстанавливает внутрицепочечные дисульфиды, в то время как диализ, обессоливание или хроматография с белком A удаляет восстановитель, а также цистеины и глутатионы, изначально присоединенные к введенному(-ым) путем конструирования цистеину(-ам) антитела. Для отслеживания процесса повторного окисления обычно применяют HPLC-хроматографию с обращенной фазой: антитела загружают на колонку PLRP-S (4000 Å, 50 мм × 2,1 мм, Agilent), нагретую до 80°C и элюируют с применением линейного градиента 30-45% CH₃CN в воде, содержащей 0,1% TFA, при 1,5 мл/мин и пике обнаружения при 215, 254 и 280 нм.

[00182] После повторного окисления антитело конъюгируют с предварительно образованным фрагментом, представляющим собой линкер-лекарственное средство. В качестве примера предварительно образованный фрагмент, представляющий собой линкер-лекарственное средство (такой как, например, MMTBT-DM4; MPET-DM4; MBT-DM4; MEPET-DM4, MPBT-DM1; и другие фрагменты, представляющие собой линкер-лекарственное средство, описанные в данном документе) добавляют к повторно окисленному антителу с Cys-мутацией из расчета 10 молярных эквивалентов относительно антитела в буфере PBS (pH 7,2). Инкубации проводят в течение 1 часа. Процесс конъюгации отслеживают с помощью HPLC с обращенной фазой, которая может отделить конъюгированные антитела от неконъюгированных. Реакционные смеси в процессе конъюгации анализируют на колонке PRLP-S (4000 Å, 50 мм × 2,1 мм, Agilent), нагретой до 80°C, а элюирование колонки проводят с помощью линейного градиента 30-60% ацетонитрила в воде, содержащей 0,1% TFA при расходе 1,5 мл/мин. Элюирование белков из колонки отслеживают при 280 нм, 254 нм и 215 нм.

[00183] В одном варианте осуществления примеры фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, для конъюгации по цистеину могут быть получены в соответствии со схемами 1-3:

Схема 1.

где:

фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, прикреплен к линкеру посредством тиольной функциональной группы;

L¹ представляет собой C_1-6алкилен, при этом одна из метиленовых групп может быть заменена на кислород;

L² представляет собой C_1-6алкилен или представляет собой -(CH₂CH₂O)_y-CH₂-CH₂-, где y составляет от 1 до 11; и

X представляет собой -C(O)-NH-, -NHC(O)- или триазол;

где алкилен является линейным или разветвленным; и

RG1 и RG2 представляют собой 2 реакционноспособные группы, образующие группу X.

Осуществление реакции групп, которые образуют амид или триазол, широко известно из уровня техники.

Один пример предварительного образования фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, представлен на схеме 2, где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM4; RG1 представляет собой аминогруппу, а RG2 представляет собой активированную кислоту, которые приводят к образованию амидной связи (X):

Схема 2.

Другой пример предварительного образования фрагмента, представляющего собой линкер-лекарственное средство, представлен на схеме 3, где фрагмент, представляющий собой лекарственное средство, представляет собой DM4; RG1 представляет собой азидную группу, а RG2 представляет собой алкиновую группу, которые приводят к образованию тетразола (X):

Схема 3.

[00184] Эффективность конъюгации различных фрагментов, представляющих собой лекарственное средство, имеющих присоединенный малеимид, с антителом с Cys-мутацией, варьирует в зависимости от растворимости применяемого фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, однако, многие реакции приводят к более 90% конъюгата. Для оценки состояния агрегации полученные конъюгаты анализируют на колонке для эксклюзионной хроматографии (GE, Superdex200, 3,2/30) при расходе 0,1 мл/мин в PBS. Все конъюгаты являются преимущественно мономерными. Большая часть конъюгатов содержит менее 3% димерного и олигомерного материала, что указывает на то, что конъюгация фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, имеющего присоединенный малеимид, с антителом с Cys-мутацией не вызывает агрегацию.

[00185] Иммуноконъюгаты также характеризуют с точки зрения средней нагрузки фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, на фрагмент, представляющий собой антитело связывания, обычно называемой отношение лекарственного средства-к-антителу (DAR). Значение DAR экстраполируют, например, на основании данных LC-MS для восстановленных и дегликозилированных образцов. LC/MS обеспечивает возможность получения количественной оценки среднего числа молекул полезной нагрузки (фрагмент, представляющий собой лекарственное средство), прикрепленных к антителу в ADC. HPLC разделяет антитело на легкую и тяжелую цепи, а также разделяет тяжелую цепь (HC) и легкую цепь (LC) в соответствии с числом групп линкер-полезная нагрузка на цепь. Данные масс-спектров позволяют идентифицировать разновидности компонентов в смеси, например, LC, LC+1, LC+2, HC, HC+1, HC+2 и т.д. На основании средней нагрузки цепей LC и HC для ADC может быть рассчитано среднее DAR. DAR для данного образца иммуноконъюгата представляет собой среднее число молекул лекарственного средства (полезная нагрузка), прикрепленных к тетрамерному антителу, содержащему две легкие цепи и две тяжелые цепи.

Способ конъюгации с нативными цистеиновыми остатками антитела

[00186] Фрагменты, представляющие собой линкер-лекарственное средство, описанные в данном документе, также можно конъюгировать с нативными цистеиновыми остатками не подвергнутых конструированию антител с применением процедуры, которая предусматривает частичное восстановление антител (Doronina, S. O., Toki, B. E., Torgov, M. Y., Mendelsohn, B. A., Cerveny, C. G., Chace, D. F., DeBlanc, R. L., Gearing,R. P., Bovee, T. D., Siegall, C. B., Francisco, J. A., Wahl, A. F., Meyer, D. L., and Senter, P. D. (2003) Development of potent monoclonal antibody auristatin conjugates for cancer therapy. Nat. Biotechnol. 21, 778-784). Следующий протокол является неограничивающим примером того, как такие конъюгаты могут быть получены. Межцепочечные и внутрицепочечные дисульфидные связи антитела (обычно при концентрации 5-10 мг/мл) сначала частично восстанавливают в PBS, содержащем 2 мМ EDTA, путем добавления TCEP до конечной концентрации 10 мМ и инкубации смеси при 37°C в течение 1 часа. После обессоливания и добавления 1% вес/объем детергента PS-20 частично восстановленные антитела (1-2 мг/мл) подвергают реакции в течение ночи при 4°C с 0,5-1 мг соединения малеимидсодержащего линкера и полезной нагрузки на 10 мг антитела. Полученные конъюгаты очищают хроматографией с белком A посредством стандартных способов и проводят замену буфера на PBS, и их обычно анализируют с помощью масс-спектрометрии (MS), аналитической эксклюзионной хроматографии (AnSEC) и аналитической хроматографии гидрофобных взаимодействий (AnHIC) для определения отношения лекарственного средства-к-антителу, склонности к агрегации и гидрофобности, а также с помощью анализов активности.

Одностадийный способ для сшивания с лизиновыми остатками антитела

[00187] В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены с помощью одностадийного способа сшивания лекарственного средства с лизиновыми остатками на антителе. Способ предусматривает объединение антитела, лекарственного средства и сшивающего средства в значительной степени водной среде, необязательно содержащей один или несколько сорастворителей, при подходящем pH. В одном варианте осуществления способ предусматривает стадию приведения антитела по настоящему изобретению в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4) с образованием первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство, и затем приведение первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство, в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением смеси, содержащей (i) конъюгат (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1), (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1 или DM4) и (iii) побочные продукты реакции.

[00188] В одном варианте осуществления одностадийный способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) в растворе, характеризующемся pH приблизительно 6 или больше (например, от приблизительно 6 до приблизительно 9, от приблизительно 6 до приблизительно 7, от приблизительно 7 до приблизительно 9, от приблизительно 7 до приблизительно 8,5, от приблизительно 7,5 до приблизительно 8,5, от приблизительно 7,5 до приблизительно 8,0, от приблизительно 8,0 до приблизительно 9,0 или от приблизительно 8,5 до приблизительно 9,0). Например, способ по настоящему изобретению предусматривает приведение связывающего клетку средства в контакт с лекарственным средством (DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) в растворе, характеризующемся pH приблизительно 6,0, приблизительно 6,1, приблизительно 6,2, приблизительно 6,3, приблизительно 6,4, приблизительно 6,5, приблизительно 6,6, приблизительно 6,7, приблизительно 6,8, приблизительно 6,9, приблизительно 7,0, приблизительно 7,1, приблизительно 7,2, приблизительно 7,3, приблизительно 7,4, приблизительно 7,5, приблизительно 7,6, приблизительно 7,7, приблизительно 7,8, приблизительно 7,9, приблизительно 8,0, приблизительно 8,1, приблизительно 8,2, приблизительно 8,3, приблизительно 8,4, приблизительно 8,5, приблизительно 8,6, приблизительно 8,7, приблизительно 8,8, приблизительно 8,9, или приблизительно 9,0. В конкретном варианте осуществления способ по настоящему изобретению предусматривает приведение связывающего клетку средства в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) в растворе, характеризующемся pH приблизительно 7,8 (например, pH от 7,6 до 8,0 или pH от 7,7 до 7,9).

[00189] Одностадийный способ (т.е. приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) можно проводить при любой подходящей температуре, известной из уровня техники. Например, одностадийный способ может происходить при приблизительно 20°C или меньше (например, от приблизительно -10°C (при условии, что не допускается замерзание раствора, например, за счет присутствия органического растворителя, применяемого для растворения цитотоксического средства и бифункционального сшивающего реагента) до приблизительно 20°C, от приблизительно 0°C до приблизительно 18°C, от приблизительно 4°C до приблизительно 16°C), при комнатной температуре (например, от приблизительно 20°C до приблизительно 30°C или от приблизительно 20°C до приблизительно 25°C) или при повышенной температуре (например, от приблизительно 30°C до приблизительно 37°C). В одном варианте осуществления одностадийный способ происходит при температуре от приблизительно 16°C до приблизительно 24°C (например, приблизительно 16°C, приблизительно 17°C, приблизительно 18°C, приблизительно 19°C, приблизительно 20°C, приблизительно 21°C, приблизительно 22°C, приблизительно 23°C, приблизительно 24°C или приблизительно 25°C). В другом варианте осуществления одностадийный способ проводят при температуре приблизительно 15°C или меньше (например, от приблизительно -10°C до приблизительно 15°C или от приблизительно 0°C до приблизительно 15°C). Например, способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) при температуре приблизительно 15°C, приблизительно 14°C, приблизительно 13°C, приблизительно 12°C, приблизительно 11°C, приблизительно 10°C, приблизительно 9°C, приблизительно 8°C, приблизительно 7°C, приблизительно 6°C, приблизительно 5°C, приблизительно 4°C, приблизительно 3°C, приблизительно 2°C, приблизительно 1°C, приблизительно 0°C, приблизительно -1°C, приблизительно -2°C, приблизительно -3°C, приблизительно -4°C, приблизительно -5°C, приблизительно -6°C, приблизительно -7°C, приблизительно -8°C, приблизительно -9°C или приблизительно -10°C, при условии, что не допускается замерзание раствора, например, за счет присутствия органического(-их) растворителя(-ей), применяемого(-ых) для растворения сшивающего средства (например, SMCC, сульфо-SMCC, сульфо-SPDB, SPDB или CX1-1). В одном варианте осуществления способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) при температуре от приблизительно -10°C до приблизительно 15°C, от приблизительно 0°C до приблизительно 15°C, от приблизительно 0°C до приблизительно 10°C, от приблизительно 0°C до приблизительно 5°C, от приблизительно 5°C до приблизительно 15°C, от приблизительно 10°C до приблизительно 15°C или от приблизительно 5°C до приблизительно 10°C. В другом варианте осуществления способ предусматривает приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) при температуре приблизительно 10°C (например, температуре от 8°C до 12°C или температуре от 9°C до 11°C).

[00190] В одном варианте осуществления описанное выше приведение в контакт осуществляют путем внесения антитела, затем приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4) с образованием первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), а затем приведения первой смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4) в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1). Например, в одном варианте осуществления антитело вносится в реакционный сосуд, лекарственное средство (например, DM1 или DM4) добавляют в реакционный сосуд (тем самым приводя в контакт с антителом), а затем сшивающее средство (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) добавляют в смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4) (тем самым приводя в контакт со смесью, содержащей антитело и лекарственное средство). В одном варианте осуществления антитело вносится в реакционный сосуд, а лекарственное средство (например, DM1 или DM4) добавляют в реакционный сосуд непосредственно после внесения антитела в сосуд. В другом варианте осуществления антитело вносится в реакционный сосуд, а лекарственное средство (например, DM1 или DM4) добавляют в реакционный сосуд через некоторый временной интервал после внесения антитела в сосуд (например, через приблизительно 5 минут, приблизительно 10 минут, приблизительно 20 минут, приблизительно 30 минут, приблизительно 40 минут, приблизительно 50 минут, приблизительно 1 час, приблизительно 1 день или больше после внесения связывающего клетку средства в емкость). Лекарственное средство (например, DM1 или DM4) можно добавлять быстро (т.е. за короткий временной интервал, такой как приблизительно 5 минут, приблизительно 10 минут) или медленно (как, например, с применением насоса).

[00191] Смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), затем можно привести в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1), либо непосредственно после приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), либо немного позже (например, от приблизительно 5 минут до приблизительно 8 часов или больше) после приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4). Например, в одном варианте осуществления сшивающее средство (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) добавляют в смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), непосредственно после добавления лекарственного средства (например, DM1 или DM4) в реакционный сосуд, содержащий антитело. В качестве альтернативы смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), можно привести в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) через приблизительно 5 минут, приблизительно 10 минут, приблизительно 20 минут, приблизительно 30 минут, приблизительно 1 час, приблизительно 2 часа, приблизительно 3 часа, приблизительно 4 часа, приблизительно 5 часов, приблизительно 6 часов, приблизительно 7 часов, приблизительно 8 часов или больше после приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4).

[00192] После того, как смесь, содержащую антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), приводят в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1), обеспечивают возможность протекания реакции в течение приблизительно 1 часа, приблизительно 2 часов, приблизительно 3 часов, приблизительно 4 часов, приблизительно 5 часов, приблизительно 6 часов, приблизительно 7 часов, приблизительно 8 часов, приблизительно 9 часов, приблизительно 10 часов, приблизительно 11 часов, приблизительно 12 часов, приблизительно 13 часов, приблизительно 14 часов, приблизительно 15 часов, приблизительно 16 часов, приблизительно 17 часов, приблизительно 18 часов, приблизительно 19 часов, приблизительно 20 часов, приблизительно 21 часа, приблизительно 22 часов, приблизительно 23 часов, приблизительно 24 часов или больше (например, приблизительно 30 часов, приблизительно 35 часов, приблизительно 40 часов, приблизительно 45 часов или приблизительно 48 часов).

[00193] В одном варианте осуществления одностадийный способ дополнительно предусматривает стадию блокирования, чтобы заблокировать любое непрореагировавшее лекарственное средство (например, DM1 или DM4) и/или непрореагировавшее сшивающее средство (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1). Обычно стадию блокирования проводят до очистки конъюгата. В одном варианте осуществления смесь блокируют путем приведения смеси в контакт с блокирующим реагентом. Используемый в данном документе "блокирующий реагент" относится к реагенту, который реагирует со свободным лекарственным средством (например, DM1 или DM4) и/или сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1). В одном варианте осуществления можно применять малеимидные или галогенацетамидные блокирующие реагенты, такие как 4-малеимидомасляная кислота, 3-малеимидопропионовая кислота, N-этилмалеимид, йодацетамид или йодацетамидопропионовая кислота, чтобы гарантировать, что любая непрореагировавшая группа (такая как тиол) в лекарственном средстве (например, DM1 или DM4) заблокирована. Стадия блокирования может способствовать предупреждению димеризации лекарственного средства (например, DM1). Димеризованный DM1 может быть сложно удалить. После блокирования с помощью полярных, заряженных, блокирующих тиол реагентов (таких как 4-малеимидомасляная кислота или 3-малеимидопропионовая кислота) избыточный, непрореагировавший DM1 превращается в полярный, заряженный, водорастворимый аддукт, который можно легко отделить от конъюгата, соединенного ковалентной связью, во время стадии очистки. Также можно применять блокирование с помощью неполярных и нейтральных блокирующих тиол реагентов. В одном варианте осуществления смесь блокируют путем приведения смеси в контакт с блокирующим реагентом, который реагирует с непрореагировавшим сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1). Например, чтобы блокировать любой непрореагировавший SMCC, в смесь можно добавлять нуклеофилы. Предпочтительно нуклеофил представляет собой нуклеофил, содержащий аминогруппу, такой как лизин, таурин и гидроксиламин.

[00194] В предпочтительном варианте осуществления обеспечивают возможность протекания реакции (т.е. приведения антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1 или DM4), а затем со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1)) до ее завершения перед приведением смеси в контакт с блокирующим реагентом. В связи с этим блокирующий реагент добавляют в смесь через от приблизительно 1 часа до приблизительно 48 часов (например, через приблизительно 1 час, приблизительно 2 часа, приблизительно 3 часа, приблизительно 4 часа, приблизительно 5 часов, приблизительно 6 часов, приблизительно 7 часов, приблизительно 8 часов, приблизительно 9 часов, приблизительно 10 часов, приблизительно 11 часов, приблизительно 12 часов, приблизительно 13 часов, приблизительно 14 часов, приблизительно 15 часов, приблизительно 16 часов, приблизительно 17 часов, приблизительно 18 часов, приблизительно 19 часов, приблизительно 20 часов, приблизительно 21 час, приблизительно 22 часа, приблизительно 23 часа, приблизительно 24 часа или от приблизительно 25 часов до приблизительно 48 часов) после приведения смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1).

[00195] В качестве альтернативы смесь блокируют путем снижения pH смеси до приблизительно 5,0 (например, 4,8, 4,9, 5,0, 5,1 или 5,2). В другом варианте осуществления смесь блокируют путем снижения pH до менее 6,0, менее 5,5, менее 5,0, менее 4,8, менее 4,6, менее 4,4, менее 4,2, менее 4,0. В качестве альтернативы pH снижают до значения от приблизительно 4,0 (например, 3,8, 3,9, 4,0, 4,1 или 4,2) до приблизительно 6,0 (например, 5,8, 5,9, 6,0, 6,1 или 6,2), от приблизительно 4,0 до приблизительно 5,0, от приблизительно 4,5 (например, 4,3, 4,4, 4,5, 4,6 или 4,7) до приблизительно 5,0. В одном варианте осуществления смесь блокируют путем снижения pH смеси до 4,8. В другом варианте осуществления смесь блокируют путем снижения pH смеси до 5,5.

[00196] В одном варианте осуществления одностадийный способ дополнительно предусматривает стадию удерживания для высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из антитела. Стадия удерживания предусматривает удерживание смеси до очистки конъюгата (например, после стадии реакции, между стадией реакции и стадией блокирования или после стадии блокирования). Например, способ предусматривает (a) приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1, DM3 или DM4) с образованием смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4); а затем приведение смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением смеси, содержащей (i) конъюгат (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1), (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4) и (iii) побочные продукты реакции, (b) удержание смеси, полученной на стадии (a), до высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из связывающего клетку средства и (c) проведение очистки смеси с получением очищенного конъюгата.

[00197] В другом варианте осуществления способ предусматривает (a) приведение антитела в контакт с лекарственным средством (например, DM1, DM3 или DM4) с образованием смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4); и затем приведение смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением смеси, содержащей (i) конъюгат, (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4) и (iii) побочные продукты реакции, (b) блокирование смеси, полученной на стадии (a), для блокирования любого непрореагировавшего лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) и/или непрореагировавшего сшивающего средства (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1), (c) удержание смеси, полученной на стадии (b), до высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из связывающего клетку средства и (d) проведение очистки смеси с получением очищенного конъюгата (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1).

[00198] В качестве альтернативы стадию удерживания можно проводить после очистки конъюгата, с последующей дополнительной стадией очистки.

[00199] В предпочтительном варианте осуществления обеспечивают возможность протекания реакции до завершения перед стадией удерживания. В связи с этим стадию удерживания проводят через от приблизительно 1 часа до приблизительно 48 часов (например, через приблизительно 1 час, приблизительно 2 часа, приблизительно 3 часа, приблизительно 4 часа, приблизительно 5 часов, приблизительно 6 часов, приблизительно 7 часов, приблизительно 8 часов, приблизительно 9 часов, приблизительно 10 часов, приблизительно 11 часов, приблизительно 12 часов, приблизительно 13 часов, приблизительно 14 часов, приблизительно 15 часов, приблизительно 16 часов, приблизительно 17 часов, приблизительно 18 часов, приблизительно 19 часов, приблизительно 20 часов, приблизительно 21 час, приблизительно 22 часа, приблизительно 23 часа, приблизительно 24 часа или от приблизительно 24 часов до приблизительно 48 часов) после приведения смеси, содержащей антитело и лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4), в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1).

[00200] Стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при подходящей температуре (например, от приблизительно 0°C до приблизительно 37°C) в течение подходящего периода времени (например, от приблизительно 1 часа до приблизительно 1 недели, от приблизительно 1 часа до приблизительно 24 часов, от приблизительно 1 часа до приблизительно 8 часов или от приблизительно 1 часа до приблизительно 4 часов) для высвобождения нестабильно связавшихся линкеров из антитела, при этом не происходит значительного высвобождения стабильно связавшихся линкеров из антитела. В одном варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при приблизительно 20°C или меньше (например, от приблизительно 0°C до приблизительно 18°C, от приблизительно 4°C до приблизительно 16°C), при комнатной температуре (например, от приблизительно 20°C до приблизительно 30°C или от приблизительно 20°C до приблизительно 25°C) или при повышенной температуре (например, от приблизительно 30°C до приблизительно 37°C). В одном варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 16°C до приблизительно 24°C (например, приблизительно 15°C, приблизительно 16°C, приблизительно 17°C, приблизительно 18°C, приблизительно 19°C, приблизительно 20°C, приблизительно 21°C, приблизительно 22°C, приблизительно 23°C, приблизительно 24°C или приблизительно 25°C). В другом варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 2°C до приблизительно 8°C (например, приблизительно 0°C, приблизительно 1°C, приблизительно 2°C, приблизительно 3°C, приблизительно 4°C, приблизительно 5°C, приблизительно 6°C, приблизительно 7°C, приблизительно 8°C, приблизительно 9°C или приблизительно 10°C). В другом варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре приблизительно 37°C (например, приблизительно 34°C, приблизительно 35°C, приблизительно 36°C, приблизительно 37°C, приблизительно 38°C, приблизительно 39°C или приблизительно 40°C).

[00201] Продолжительность стадии удерживания зависит от температуры и pH, при которых проводят стадию удерживания. Например, продолжительность стадии удерживания может быть значительно уменьшена путем проведения стадии удерживания при повышенной температуре, при этом максимальная температура ограничивается стабильностью конъюгата связывающего клетку средства и цитотоксического средства. Стадия удерживания может предусматривать поддержание раствора в течение от приблизительно 1 часа до приблизительно 1 дня (например, приблизительно 1 часа, приблизительно 2 часов, приблизительно 3 часов, приблизительно 4 часов, приблизительно 5 часов, приблизительно 6 часов, приблизительно 7 часов, приблизительно 8 часов, приблизительно 9 часов, приблизительно 10 часов, приблизительно 12 часов, приблизительно 14 часов, приблизительно 16 часов, приблизительно 18 часов, приблизительно 20 часов, приблизительно 22 часов или приблизительно 24 часов), от приблизительно 10 часов до приблизительно 24 часов, от приблизительно 12 часов до приблизительно 24 часов, от приблизительно 14 часов до приблизительно 24 часов, от приблизительно 16 часов до приблизительно 24 часов, от приблизительно 18 часов до приблизительно 24 часов, от приблизительно 20 часов до приблизительно 24 часов, от приблизительно 5 часов до приблизительно 1 недели, от приблизительно 20 часов до приблизительно 1 недели, от приблизительно 12 часов до приблизительно 1 недели (например, приблизительно 12 часов, приблизительно 16 часов, приблизительно 20 часов, приблизительно 24 часов, приблизительно 2 дней, приблизительно 3 дней, приблизительно 4 дней, приблизительно 5 дней, приблизительно 6 дней или приблизительно 7 дней) или от приблизительно 1 дня до приблизительно 1 недели.

[00202] В одном варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 2°C до приблизительно 8°C в течение периода, составляющего от по меньшей мере приблизительно 12 часов вплоть до недели. В другом варианте осуществления стадия удерживания предусматривает поддержание раствора при температуре от приблизительно 2°C до приблизительно 8°C в течение ночи (например, от приблизительно 12 до приблизительно 24 часов, предпочтительно приблизительно 20 часов).

[00203] Значение pH для стадии удерживания предпочтительно составляет от приблизительно 4 до приблизительно 10. В одном варианте осуществления значение pH для стадии удерживания составляет приблизительно 4 или больше, но менее приблизительно 6 (например, от 4 до 5,9), или приблизительно 5 или больше, но менее приблизительно 6 (например, от 5 до 5,9). В другом варианте осуществления значения pH для стадии удерживания находятся в диапазоне от приблизительно 6 до приблизительно 10 (например, от приблизительно 6,5 до приблизительно 9, от приблизительно 6 до приблизительно 8). Например, значения pH для стадии удерживания могут составлять приблизительно 6, приблизительно 6,5, приблизительно 7, приблизительно 7,5, приблизительно 8, приблизительно 8,5, приблизительно 9, приблизительно 9,5, или приблизительно 10.

[00204] В конкретных вариантах осуществления стадия удерживания может предусматривать инкубирование смеси при 25°C при pH приблизительно 6-7,5 в течение от приблизительно 12 часов до приблизительно 1 недели, инкубирование смеси при 4°C при pH приблизительно 4,5-5,9 в течение от приблизительно 5 часов до приблизительно 5 дней или инкубирование смеси при 25°C при pH приблизительно 4,5-5,9 в течение от приблизительно 5 часов до приблизительно 1 дня.

[00205] Одностадийный способ необязательно может предусматривать добавление сахарозы на стадии реакции для повышения растворимости и извлечения конъюгатов. Желательно сахарозу добавляют при концентрации от приблизительно 0,1% (вес/объем) до приблизительно 20% (вес/объем) (например, приблизительно 0,1% (вес/объем), 1% (вес/объем), 5% (вес/объем), 10% (вес/объем), 15% (вес/объем) или 20% (вес/объем)). Предпочтительно сахарозу добавляют при концентрации от приблизительно 1% (вес/объем) до приблизительно 10% (вес/объем) (например, приблизительно 0,5% (вес/объем), приблизительно 1% (вес/объем), приблизительно 1,5% (вес/объем), приблизительно 2% (вес/объем), приблизительно 3% (вес/объем), приблизительно 4% (вес/объем), приблизительно 5% (вес/объем), приблизительно 6% (вес/объем), приблизительно 7% (вес/объем), приблизительно 8% (вес/объем), приблизительно 9% (вес/объем), приблизительно 10% (вес/объем) или приблизительно 11% (вес/объем)). Кроме того, стадия реакции также может предусматривать добавление буферного средства. Можно применять любое подходящее буферное средство, известное из уровня техники. Подходящие буферные средства включают, например, цитратный буфер, ацетатный буфер, сукцинатный буфер и фосфатный буфер. В одном варианте осуществления буферное средство выбрано из группы, состоящей из HEPPSO (N-(2-гидроксиэтил)пиперазин-N'-(2-гидроксипропансульфоновая кислота)), POPSO (дегидрат пиперазин-1,4-бис-(2-гидроксипропансульфоновой кислоты)), HEPES (4-(2-гидроксиэтил)пиперазин-1-этансульфоновая кислота), HEPPS (EPPS) (4-(2-гидроксиэтил)пиперазин-1-пропансульфоновая кислота), TES (N-[трис(гидроксиметил)метил]-2-аминоэтансульфоновая кислота) и их комбинации.

[00206] В одном варианте осуществления одностадийный способ может дополнительно предусматривать стадию проведения очистки смеси с получением очищенного конъюгата (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1). Любые способы очистки, известные из уровня техники, можно применять для очистки конъюгатов по настоящему изобретению. В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению очищают с применением тангенциальной поточной фильтрации (TFF), неадсорбционной хроматографии, адсорбционной хроматографии, адсорбционной фильтрации, селективного осаждения или любого другого подходящего способа очистки, а также их комбинации. В другом варианте осуществления перед воздействием на конъюгаты способа очистки, описанного выше, конъюгаты вначале фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF. В качестве альтернативы конъюгаты фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF после воздействия на конъюгаты способа очистки, описанного выше. Например, в одном варианте осуществления конъюгаты фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF, а затем очищают с применением тангенциальной поточной фильтрации. В качестве альтернативы конъюгаты очищают с применением тангенциальной поточной фильтрации, а затем фильтруют через одну или несколько мембран из PVDF.

[00207] Для очистки можно использовать любые подходящие TFF-системы, в том числе систему типа Pellicon (Millipore, Биллерика, Массачусетс), кассетную систему Sartocon (Sartorius AG, Эджвуд, Нью-Йорк) и систему типа Centrasette (Pall Corp., Ист-Хиллс, Нью-Йорк).

[00208] Для очистки можно использовать любую подходящую смолу для адсорбционной хроматографии. Предпочтительные смолы для адсорбционной хроматографии предусматривают хроматографию на гидроксиапатите, гидрофобную хроматографию с индуцированием заряда (HCIC), хроматографию гидрофобных взаимодействий (HIC), ионообменную хроматографию, ионообменную хроматографию с комбинированным режимом работы, аффинную хроматографию на иммобилизованных ионах металла (IMAC), хроматографию с лигандом красителем, аффинную хроматографию, хроматографию с обращенной фазой и их комбинации. Примеры подходящих гидроксиапатитных смол включают керамический гидроксиапатит (CHT типа I и типа II, Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния), гидроксиапатит HA Ultrogel (Pall Corp., Ист-Хиллс, Нью-Йорк) и керамический фторапатит (CFT типа I и типа II, Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примером подходящей смолы для HCIC является смола MEP Hypercel (Pall Corp., Ист-Хиллс, Нью-Йорк). Примеры подходящих смол для HIC включают смолы на основе бутил-сефарозы, гексил-сефарозы, фенил-сефарозы и октил-сефарозы (все от GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси), а также метиловую смолу Macro-prep и трет-бутиловую смолу Macro-Prep (Biorad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих ионообменных смол включают смолы на основе SP-сефарозы, CM-сефарозы и Q-сефарозы (все от GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолу Unosphere S (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих смолы для ионообменной хроматографии с комбинированным режимом работы включают смолу Bakerbond ABx (JT Baker, Филлипсбург, Нью-Джерси). Примеры подходящих смол для IMAC включают смолу Chelating Sepharose (GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолу Profinity IMAC (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих смол для хроматографии с лигандом красителем включают смолу Blue Sepharose (GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолу Affi-gel Blue (Bio-Rad Laboratories, Геркулес, Калифорния). Примеры подходящих смол для аффинной хроматографии включают смолу на основе сефарозы с белком A (например, MabSelect, GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси) и смолы для аффинной хроматографии с лектинами, например, смолу на основе сефарозы с лектином чечевицы (GE Healthcare, Пискатавей, Нью-Джерси), где антитело несет подходящие сайты связывания лектина. Примеры подходящих смол для хроматографии с обращенной фазой включают смолы C4, C8 и C18 (Grace Vydac, Хесперия, Калифорния).

[00209] Для очистки можно использовать любую подходящую смолу для неадсорбционной хроматографии. Примеры подходящих смол для неадсорбционной хроматографии включают без ограничения смолы SEPHADEX™ G-25, G-50, G-100, SEPHACRYL™ (например, S-200 и S-300), смолы SUPERDEX™ (например, SUPERDEX™ 75 и SUPERDEX™ 200), смолы BIO-GEL® (например, P-6, P-10, P-30, P-60 и P-100) и другие, известные рядовым специалистам в данной области техники.

Двухстадийный способ и способ в одном реакционном сосуде для сшивания с лизиновыми остатками антитела

[00210] В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены, как описано в патенте США № 7811572 и публикации заявки на патент США № 2006/0182750. Способ предусматривает стадии: (a) приведения антитела по настоящему изобретению в контакт со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1) с присоединением с помощью ковалентной связи линкера (т.е. Ab-SMCC, Ab-SPDB или Ab-CX1-1) к антителу и тем самым получения первой смеси, содержащей антитело, имеющее связанный с ним линкер; (b) необязательно воздействия на первую смесь способа очистки с получением очищенной первой смеси из антитела, имеющего связанный с ним линкер; (c) конъюгирования лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) с антителом, имеющим связанный с ним линкер, в первой смеси путем осуществления реакции антитела, имеющего связанный с ним линкер, с лекарственным средством (например, DM1, DM3 или DM4) в растворе, характеризующемся pH от приблизительно 4 до приблизительно 9, с получением второй смеси, содержащей (i) конъюгат (например, Ab-MCC-DM1, Ab-SPDB-DM4 или Ab-CX1-1-DM1), (ii) свободное лекарственное средство (например, DM1, DM3 или DM4) и (iii) промежуточные продукты реакции; и (d) воздействия на вторую смесь способа очистки с очисткой конъюгата от других компонентов второй смеси. В качестве альтернативы стадия (b) очистки может не проводиться. На стадиях (b) и (d) могут применяться любые способы очистки, описанные в данном документе. В одном варианте осуществления на обеих стадиях (b) и (d) применяется TFF. В другом варианте осуществления TFF применяется на стадии (b), а адсорбционная хроматография (например, CHT) применяется на стадии (d).

Реагент для одностадийного способа и in-situ способ для сшивания с лизиновыми остатками антитела

[00211] В одном варианте осуществления конъюгаты по настоящему изобретению могут быть получены путем конъюгирования предварительно образованного соединения линкер-лекарственное средство (например, SMCC-DM1, сульфо-SMCC-DM1, SPDB-DM4 или CX1-1-DM1) с антителом по настоящему изобретению, как описано в патенте США № 6441163 и публикации заявки на патент США №№ 2011/0003969 и 2008/0145374, с последующей стадией очистки. Можно применять любые способы очистки, описанные в данном документе. Соединение линкер-лекарственное средство получают путем осуществления реакции лекарственного средства (например, DM1, DM3 или DM4) со сшивающим средством (например, SMCC, сульфо-SMCC, SPDB, сульфо-SPDB или CX1-1). Соединение линкер-лекарственное средство (например, SMCC-DM1, сульфо-SMCC-DM1, SPDB-DM4 или CX1-1-DM1) необязательно подвергают очистке перед конъюгированием с антителом.

Антитела к CCR7

[00212] В настоящем изобретении представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7. Антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) по настоящему изобретению включают без ограничения человеческие моноклональные антитела или их фрагменты, выделенные, как описано в примерах.

[00213] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связывают CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат домен VH, имеющий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 13, 45, 77 или 608. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения также представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат CDR VH, имеющую аминокислотную последовательность любой из CDR VH, перечисленных в таблицах 1 и 4, ниже. В конкретных вариантах осуществления настоящего изобретения представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела содержат (или в качестве альтернативы состоят из) одну, две, три, четыре, пять или больше CDR VH, имеющих аминокислотную последовательность любой из CDR VH, перечисленных в таблицах 1 и 4, ниже.

[00214] В настоящем изобретении представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат домен VL, имеющий аминокислотную последовательность под SEQ ID NO: 29, 61, 93 или 624. В настоящем изобретении также представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат CDR VL, имеющую аминокислотную последовательность любой из CDR VL, перечисленных в таблицах 1 и 4 ниже. В частности, в настоящем изобретении представлены антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, при этом указанные антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) содержат (или в качестве альтернативы состоять из) одну, две, три или больше CDR VL, имеющих аминокислотную последовательность любой из CDR VL, перечисленных в таблицах 1 и 4, ниже.

[00215] Другие антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) по настоящему изобретению включают аминокислоты, которые были подвергнуты мутации, но при этом они характеризуются по меньшей мере 60, 70, 80, 90 или 95 процентной идентичностью в областях CDR с областями CDR, показанными в последовательностях, описанных в таблицах 1 и 4. В некоторых вариантах осуществления антитела содержат мутантные аминокислотные последовательности, в которых не более 1, 2, 3, 4 или 5 аминокислот были подвергнуты мутации в областях CDR в сравнении с областями CDR, показанными в последовательности, описанной в таблицах 1 и 4.

[00216] В настоящем изобретении также представлены последовательности нуклеиновой кислоты, которые кодируют VH, VL, полноразмерную тяжелую цепь и полноразмерную легкую цепь антител, которые специфически связываются с CCR7. Такие последовательности нуклеиновой кислоты могут быть оптимизированы для экспрессии в клетках млекопитающих.

[00217] На протяжении текста настоящей заявки может встречаться несоответствие между текстом описания и перечнем последовательностей, при этом текст описания имеет преимущественную силу.

Таблица 1. Примеры антител к CCR7 по настоящему изобретению

506E15 (гуманизированное CysMab-DAPA) SEQ ID NO: 1 HCDR1 (комбинированная) GFTFSSYAMS SEQ ID NO: 2 HCDR2 (комбинированная) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 3 HCDR3 (комбинированная) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 4 HCDR1 (Kabat) SYAMS SEQ ID NO: 5 HCDR2 (Kabat) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 6 HCDR3 (Kabat) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 7 HCDR1 (Chothia) GFTFSSY SEQ ID NO: 8 HCDR2 (Chothia) SSGGSF SEQ ID NO: 9 HCDR3 (Chothia) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 10 HCDR1 (IMGT) GFTFSSYA SEQ ID NO: 11 HCDR2 (IMGT) ISSGGSFT SEQ ID NO: 12 HCDR3 (IMGT) ARRASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 13 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWIRQAPGKGLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRASTVVGTDFDVWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 14 ДНК VH GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGCGGACTGGTCAAGCCTGGCGGCTCCCTGAGACTGTCTTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAGCTACGCCATGTCCTGGATCCGGCAGGCCCCTGGCAAGGGACTGGAGTGGGTGGCCACCATCTCCTCCGGCGGCAGCTTCACCTACTACCCCGACTCCGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTCCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGCCTCCACCGTCGTGGGCACCGATTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACAACCGTGACCGTGTCCTCC SEQ ID NO: 15 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWIRQAPGKGLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRASTVVGTDFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 16 ДНК тяжелой цепи GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGCGGACTGGTCAAGCCTGGCGGCTCCCTGAGACTGTCTTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAGCTACGCCATGTCCTGGATCCGGCAGGCCCCTGGCAAGGGACTGGAGTGGGTGGCCACCATCTCCTCCGGCGGCAGCTTCACCTACTACCCCGACTCCGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTCCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGCCTCCACCGTCGTGGGCACCGATTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACAACCGTGACCGTGTCCTCCGCCTCCACCAAGGGACCCTCCGTGTTCCCTCTGGCCCCTTCCAGCAAGTCCACCTCTGGCGGCACCGCCGCTCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCTGCCCTGTGACAGTGTCCTGGAACTCCGGCGCTCTGACCTCCGGCGTGCACACCTTCCCTGCCGTGCTGCAGTCCTCCGGCCTGTACTCCCTGTCCTCCGTCGTGACCGTGCCTTCCTCCAGCCTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCTCCAACACCAAAGTGGACAAGCGGGTGGAACCCAAGTCCTGCGACAAGACCCACACCTGTCCTCCCTGCCCTGCCCCTGAGCTGCTGGGAGGCCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCTCCAAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCTCCCGGACCCCTGAAGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGATCCCGAAGTGAAGTTCAATTGGTACGTGGACGGCGTGGAAGTGCACAATGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAACAGTACAACTCCACCTACCGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGCCCTGGCCGCTCCCATCGAAAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCCAGAGAGCCCCAAGTGTACACACTGCCTCCCAGCCGGGAAGAGATGACCAAGAACCAAGTGTCCCTGACCTGCCTCGTGAAGGGCTTCTACCCCTGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGTCCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCTCCCGTGCTGGACAGCGACGGCTCATTCTTCCTGTACTCCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCCGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCTCCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGTCCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 17 LCDR1 (комбинированная) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 18 LCDR2 (комбинированная) ATSSLDS SEQ ID NO: 19 LCDR3 (комбинированная) LQYASSPPT SEQ ID NO: 20 LCDR1 (Kabat) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 21 LCDR2 (Kabat) ATSSLDS SEQ ID NO: 22 LCDR3 (Kabat) LQYASSPPT SEQ ID NO: 23 LCDR1 (Chothia) SQDIGSS SEQ ID NO: 24 LCDR2 (Chothia) ATS SEQ ID NO: 25 LCDR3 (Chothia) YASSPP SEQ ID NO: 26 LCDR1 (IMGT) QDIGSS SEQ ID NO: 27 LCDR2 (IMGT) ATS SEQ ID NO: 28 LCDR3 (IMGT) LQYASSPPT SEQ ID NO: 29 VL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTLTCRASQDIGSSLNWLQQKPGKAIKRLIYATSSLDSGVPSRFSGSRSGTDYTLTISSLQPEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 30 ДНК VL GACATCCAGATGACCCAGAGCCCCTCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATAGAGTGACCCTGACCTGCCGGGCCTCCCAGGACATCGGCTCCTCCCTGAACTGGCTGCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCATCAAGCGGCTGATCTACGCCACCTCCTCCCTGGACTCCGGCGTGCCCTCCCGGTTCTCTGGCTCCAGATCCGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGTGGTGTACTACTGCCTGCAGTACGCCTCCAGCCCTCCCACCTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 31 Легкая цепь DIQMTQSPSSLSASVGDRVTLTCRASQDIGSSLNWLQQKPGKAIKRLIYATSSLDSGVPSRFSGSRSGTDYTLTISSLQPEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 32 ДНК легкой цепи GACATCCAGATGACCCAGAGCCCCTCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATAGAGTGACCCTGACCTGCCGGGCCTCCCAGGACATCGGCTCCTCCCTGAACTGGCTGCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCATCAAGCGGCTGATCTACGCCACCTCCTCCCTGGACTCCGGCGTGCCCTCCCGGTTCTCTGGCTCCAGATCCGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGTGGTGTACTACTGCCTGCAGTACGCCTCCAGCCCTCCCACCTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC 121G12 (гуманизированное CysMab, DAPA) SEQ ID NO: 33 HCDR1 (комбинированная) GFTFSTYAMS SEQ ID NO: 34 HCDR2 (комбинированная) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 35 HCDR3 (комбинированная) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 36 HCDR1 (Kabat) TYAMS SEQ ID NO: 37 HCDR2 (Kabat) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 38 HCDR3 (Kabat) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 39 HCDR1 (Chothia) GFTFSTY SEQ ID NO: 40 HCDR2 (Chothia) SDAGSY SEQ ID NO: 41 HCDR3 (Chothia) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 42 HCDR1 (IMGT) GFTFSTYA SEQ ID NO: 43 HCDR2 (IMGT) ISDAGSYS SEQ ID NO: 44 HCDR3 (IMGT) ARRGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 45 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMSWVRQAPGKGLEWVATISDAGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 46 ДНК VH GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGCGGACTGGTCAAGCCTGGCGGCTCCCTGAGACTGTCTTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCACCTACGCCATGTCCTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAGGGCCTGGAGTGGGTGGCCACCATCTCCGACGCCGGCTCCTACTCCTACTACCCCGACAACGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTCCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGACGGGGCTCCAGATACGAAGAGTACTACGTGATGGACTACTGGGGCCAGGGCACAACCGTGACCGTGTCCTCC SEQ ID NO: 47 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMSWVRQAPGKGLEWVATISDAGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 48 ДНК тяжелой цепи GAAGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGCGGACTGGTCAAGCCTGGCGGCTCCCTGAGACTGTCTTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCACCTACGCCATGTCCTGGGTCCGACAGGCCCCTGGAAAGGGCCTGGAGTGGGTGGCCACCATCTCCGACGCCGGCTCCTACTCCTACTACCCCGACAACGTGAAGGGCCGGTTCACCATCTCCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGCGCCAGACGGGGCTCCAGATACGAAGAGTACTACGTGATGGACTACTGGGGCCAGGGCACAACCGTGACCGTGTCCTCCGCCTCCACCAAGGGACCCTCCGTGTTCCCTCTGGCCCCTTCCAGCAAGTCCACCTCTGGCGGCACCGCCGCTCTGGGCTGCCTGGTCAAGGACTACTTCCCCTGCCCTGTGACAGTGTCCTGGAACTCCGGCGCTCTGACCTCCGGCGTGCACACCTTCCCTGCCGTGCTGCAGTCCTCCGGCCTGTACTCCCTGTCCTCCGTCGTGACCGTGCCTTCCTCCAGCCTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCTCCAACACCAAAGTGGACAAGCGGGTGGAACCCAAGTCCTGCGACAAGACCCACACCTGTCCTCCCTGCCCTGCCCCTGAGCTGCTGGGAGGCCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCTCCAAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCTCCCGGACCCCTGAAGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGATCCCGAAGTGAAGTTCAATTGGTACGTGGACGGCGTGGAAGTGCACAATGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAACAGTACAACTCCACCTACCGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGCCCTGGCCGCTCCCATCGAAAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCCAGAGAGCCCCAAGTGTACACACTGCCTCCCAGCCGGGAAGAGATGACCAAGAACCAAGTGTCCCTGACCTGCCTCGTGAAGGGCTTCTACCCCTGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGTCCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCATTCTTCCTGTACTCCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCCGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCTCCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGTCCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 49 LCDR1 (комбинированная) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 50 LCDR2 (комбинированная) YASQSIS SEQ ID NO: 51 LCDR3 (комбинированная) QQSSSWLT SEQ ID NO: 52 LCDR1 (Kabat) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 53 LCDR2 (Kabat) YASQSIS SEQ ID NO: 54 LCDR3 (Kabat) QQSSSWLT SEQ ID NO: 55 LCDR1 (Chothia) SQSISNN SEQ ID NO: 56 LCDR2 (Chothia) YAS SEQ ID NO: 57 LCDR3 (Chothia) SSSWL SEQ ID NO: 58 LCDR1 (IMGT) QSISNN SEQ ID NO: 59 LCDR2 (IMGT) YAS SEQ ID NO: 60 LCDR3 (IMGT) QQSSSWLT SEQ ID NO: 61 VL EIVLTQSPATLSVSPGERVTLSCRASQSISNNLHWYQQKPGQAPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFGVYFCQQSSSWLTFGQGTKLEIK SEQ ID NO: 62 ДНК VL GAGATCGTGCTGACACAGTCCCCTGCCACCCTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCCTGTCCTGCCGGGCCTCCCAGTCCATCTCCAACAACCTGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCCAGAGCATCTCCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCAGCGTGGAACCCGAGGACTTCGGCGTGTACTTCTGCCAGCAGTCCTCCTCCTGGCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 63 Легкая цепь EIVLTQSPATLSVSPGERVTLSCRASQSISNNLHWYQQKPGQAPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFGVYFCQQSSSWLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 64 ДНК легкой цепи GAGATCGTGCTGACACAGTCCCCTGCCACCCTGTCTGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCCTGTCCTGCCGGGCCTCCCAGTCCATCTCCAACAACCTGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCCAGAGCATCTCCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCAGCGTGGAACCCGAGGACTTCGGCGTGTACTTCTGCCAGCAGTCCTCCTCCTGGCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC 674J13 (гуманизированное, CysMab, DAPA) SEQ ID NO: 65 HCDR1 (комбинированная) GYSITSGYSWH SEQ ID NO: 66 HCDR2 (комбинированная) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 67 HCDR3 (комбинированная) GGVQAFAY SEQ ID NO: 68 HCDR1 (Kabat) SGYSWH SEQ ID NO: 69 HCDR2 (Kabat) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 70 HCDR3 (Kabat) GGVQAFAY SEQ ID NO: 71 HCDR1 (Chothia) GYSITSGY SEQ ID NO: 72 HCDR2 (Chothia) HSSGS SEQ ID NO: 73 HCDR3 (Chothia) GGVQAFAY SEQ ID NO: 74 HCDR1 (IMGT) GYSITSGYS SEQ ID NO: 75 HCDR2 (IMGT) IHSSGST SEQ ID NO: 76 HCDR3 (IMGT) ARGGVQAFAY SEQ ID NO: 77 VH DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSGYSWHWIRQHPGKGLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRITISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 78 ДНК VH GACGTGCAGCTGCAGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCCTCCCAGACCCTGTCCCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTACTCTATCACCTCCGGCTACAGCTGGCACTGGATCCGGCAGCACCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGATGGCCCACATCCACTCCTCCGGCTCCACCAACTACAACCCCAGCCTGAAGTCCCGGATCACCATCTCCCGGGACACCTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGTCCTCCGTGACCGCCGCTGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGAGGCGGCGTGCAGGCCTTCGCTTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCCTCC SEQ ID NO: 79 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSGYSWHWIRQHPGKGLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRITISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 80 ДНК тяжелой цепи GACGTGCAGCTGCAGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTCAAGCCCTCCCAGACCCTGTCCCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTACTCTATCACCTCCGGCTACAGCTGGCACTGGATCCGGCAGCACCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGATGGCCCACATCCACTCCTCCGGCTCCACCAACTACAACCCCAGCCTGAAGTCCCGGATCACCATCTCCCGGGACACCTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGTCCTCCGTGACCGCCGCTGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGAGGCGGCGTGCAGGCCTTCGCTTATTGGGGCCAGGGAACCCTGGTCACCGTGTCCTCCGCCAGCACCAAGGGACCCTCCGTGTTCCCTCTGGCCCCTTCCAGCAAGTCCACCTCTGGCGGCACCGCCGCTCTGGGCTGCCTCGTGAAGGACTACTTCCCCTGCCCCGTGACCGTGTCCTGGAACTCCGGCGCTCTGACCTCCGGCGTGCACACCTTCCCTGCCGTGCTGCAGTCCTCCGGCCTGTACTCCCTGTCCAGCGTCGTGACCGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGCACCCAGACCTACATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCTCCAACACCAAAGTGGACAAGCGGGTGGAACCCAAGTCCTGCGACAAGACCCACACCTGTCCTCCCTGCCCTGCCCCTGAGCTGCTGGGAGGCCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCTCCAAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCTCCCGGACCCCTGAAGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGATCCCGAAGTGAAGTTCAATTGGTACGTGGACGGCGTGGAAGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAACAGTACAACTCCACCTACCGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAGTACAAGTGCAAAGTGTCCAACAAGGCCCTGGCCGCTCCCATCGAAAAGACCATCTCCAAGGCCAAGGGCCAGCCCAGAGAGCCCCAAGTGTACACACTGCCTCCCAGCCGGGAAGAGATGACCAAGAATCAAGTGTCCCTGACCTGTCTGGTCAAGGGCTTCTACCCCTGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGTCCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCTCCCGTGCTGGACTCCGACGGCTCATTCTTCCTGTACTCCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCCGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCTCCTGCTCCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGTCCCCTGGCAAG SEQ ID NO: 81 LCDR1 (комбинированная) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 82 LCDR2 (комбинированная) DTSKLAS SEQ ID NO: 83 LCDR3 (комбинированная) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 84 LCDR1 (Kabat) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 85 LCDR2 (Kabat) DTSKLAS SEQ ID NO: 86 LCDR3 (Kabat) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 87 LCDR1 (Chothia) SSSVIY SEQ ID NO: 88 LCDR2 (Chothia) DTS SEQ ID NO: 89 LCDR3 (Chothia) WSSNPL SEQ ID NO: 90 LCDR1 (IMGT) SSVIY SEQ ID NO: 91 LCDR2 (IMGT) DTS SEQ ID NO: 92 LCDR3 (IMGT) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 93 VL EIVLTQSPATLSASPGERVTMSCSASSSVIYMHWYQQKPGQAPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYTLTISSMEPEDAAVYYCQQWSSNPLTFGQGTKLEIK SEQ ID NO: 94 ДНК VL GAGATCGTGCTGACACAGTCCCCTGCCACCCTGTCCGCCTCTCCAGGCGAGCGCGTGACAATGTCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCGTGATCTACATGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCGGTGGATCTACGATACCTCCAAGCTGGCCTCCGGCGTGCCCGCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCATGGAACCCGAGGACGCCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTCCAACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 95 Легкая цепь EIVLTQSPATLSASPGERVTMSCSASSSVIYMHWYQQKPGQAPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYTLTISSMEPEDAAVYYCQQWSSNPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 96 ДНК легкой цепи GAGATCGTGCTGACACAGTCCCCTGCCACCCTGTCCGCCTCTCCAGGCGAGCGCGTGACAATGTCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCGTGATCTACATGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCGGTGGATCTACGATACCTCCAAGCTGGCCTCCGGCGTGCCCGCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCATGGAACCCGAGGACGCCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTCCAACCCTCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGCGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC

[00218] Другие антитела по настоящему изобретению включают антитела, в которых аминокислоты или нуклеиновые кислоты, кодирующие аминокислоты, были подвергнуты мутации, но при этом они характеризуются по меньшей мере 60, 70, 80, 90 или 95 процентной идентичностью с последовательностями, описанными в таблицах 1 и 4. В некоторых вариантах осуществления 1, 2, 3, 4 или 5 аминокислот были подвергнуты мутации в вариабельных областях по сравнению с вариабельными областями, показанными в последовательности, описанной в таблицах 1 и 4, при этом они сохраняют практически такую же терапевтическую активность, что и антитела, перечисленные в таблицах 1 и 4.

[00219] Поскольку каждое из данных антител может связываться с CCR7 последовательности (аминокислотные последовательности и нуклеотидные последовательности, кодирующие аминокислотные последовательности) VH, VL, полноразмерной легкой цепи и полноразмерной тяжелой цепи можно подвергать "смешиванию и подбору" для создания других CCR7-связывающих антител по настоящему изобретению. Такие подвергнутые "смешиванию и подбору" CCR7-связывающие антитела можно тестировать с применением анализов связывания, известных из уровня техники (например, разновидностей ELISA и других анализов, описанных в разделе Примеры). Когда такие цепи подвергают смешиванию и подбору, последовательность VH из конкретной пары VH/VL следует заменить структурно подобной последовательностью VH. Аналогичным образом, последовательность полноразмерной тяжелой цепи из конкретной пары полноразмерная тяжелая цепь/полноразмерная легкая цепь следует заменить структурно подобной последовательностью полноразмерной тяжелой цепи. Аналогичным образом, последовательность VL из конкретной пары VH/VL следует заменить структурно подобной последовательностью VL. Аналогичным образом, последовательность полноразмерной легкой цепи из конкретной пары полноразмерная тяжелая цепь/полноразмерная легкая цепь следует заменить структурно подобной последовательностью полноразмерной легкой цепи. Соответственно, в одном аспекте настоящего изобретения представлены выделенные моноклональное антитело или его антигенсвязывающая область, имеющие: вариабельную область тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 13, 45, 77 и 608; и вариабельную область легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 29, 61, 93 и 624; где антитело специфически связывается с CCR7.

[00220] В другом аспекте настоящего изобретения представлены: (i) выделенное моноклональное антитело, имеющее: полноразмерную тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, которая была оптимизирована для экспрессии в системе экспрессии, представляющей собой клетку млекопитающего, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 15, 47, 79 и 610; и полноразмерную легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность, которая была оптимизирована для экспрессии в клетке млекопитающего, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 31, 63, 95 и 626; или (ii) функциональный белок, содержащий его антигенсвязывающую часть.

[00221] В другом аспекте настоящего изобретения представлены CCR7-связывающие антитела, которые содержат CDR1, CDR2 и CDR3 тяжелой цепи и легкой цепи, описанные в таблицах 1 и 4, или их комбинации. Аминокислотные последовательности CDR1 VH антител показаны, например, под SEQ ID NO: 1, 4, 7, 10, 33, 36, 39, 42, 65, 68, 71 и 74. Аминокислотные последовательности CDR2 VH антител показаны, например, под SEQ ID NO: 2, 5, 8, 11, 34, 37, 40, 43, 66, 69, 72 и 75. Аминокислотные последовательности CDR3 VH антител показаны, например, под SEQ ID NO: 3, 6, 9, 12, 35, 38, 41, 44, 67, 70, 73 и 76. Аминокислотные последовательности CDR1 VL антител показаны, например, под SEQ ID NO: 17, 20, 23, 26, 49, 52, 55, 58, 81, 84, 87 и 90. Аминокислотные последовательности CDR2 VL антител показаны, например, под SEQ ID NO: 18, 21, 24, 27, 50, 53, 56, 59, 82, 85, 88 и 91. Аминокислотные последовательности CDR3 VL антител показаны, например, под SEQ ID NO: 19, 22, 25, 28, 51, 54, 57, 60, 83, 86, 89 и 92.

[00222] С учетом того, что каждое из данных антител может связываться с CCR7, и что специфичность связывания антигена в первую очередь обеспечивается областями CDR1, 2 и 3, последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 VH и последовательности CDR1, CDR2 и CDR3 VL могут быть подвергнуты "смешиванию и подбору" (т.е. CDR из различных антител могут быть подвергнуты смешиванию и подбору. Такие подвергнутые "смешиванию и подбору" CCR7-связывающие антитела можно тестировать с применением анализов связывания, известных из уровня техники и описанных в Примерах (например, разновидностей ELISA). Когда последовательности CDR VH подвергают смешиванию и подбору, последовательность CDR1, CDR2 и/или CDR3 из конкретной последовательности VH следует заменить структурно подобной(-ыми) последовательностью(-ими) CDR. Аналогичным образом, когда последовательности CDR VL подвергают смешиванию и подбору, последовательность CDR1, CDR2 и/или CDR3 из конкретной последовательности VL следует заменить структурно подобной(-ыми) последовательностью(-ями) CDR. Рядовому специалисту в данной области техники будет совершенно очевидно, что новые последовательности VH и VL можно создавать путем замены одной или нескольких последовательностей областей CDR VH и/или VL структурно подобными последовательностями из последовательностей CDR, показанных в данном документе для моноклональных антител по настоящему изобретению.

[00223] Соответственно, в некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены выделенные моноклональное антитело или его антигенсвязывающая область, содержащие CDR1 тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 1, 4, 7, 10, 33, 36, 39, 42, 65, 68, 71, 74, 596, 599, 602 и 605; CDR2 тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 2, 5, 8, 11, 34, 37, 40, 43, 66, 69, 72, 75, 597, 600, 603 и 606; CDR3 тяжелой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 3, 6, 9, 12, 35, 38, 41, 44, 67, 70, 73, 76, 598, 601, 604 и 607; CDR1 легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 17, 20, 23, 26, 49, 52, 55, 58, 81, 84, 87, 90, 612, 615, 618 и 621; CDR2 легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 18, 21, 24, 27, 50, 53, 56, 59, 82, 85, 88, 91, 613, 616, 619 и 622; и CDR3 легкой цепи, содержащую аминокислотную последовательность, выбранную из группы, состоящей из SEQ ID NO: 19, 22, 25, 28, 51, 54, 57, 60, 83, 86, 89, 92, 614, 617, 620 и 623; где антитело специфически связывает CCR7.

[00224] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:1, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:2; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:3; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:17; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:18 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:19.

[00225] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:4, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:5; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:6; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:20; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:21 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:22.

[00226] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:7, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:8; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:9; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:23; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:24 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:25.

[00227] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:10, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:11; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:12; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:26; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:27 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:28.

[00228] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:33, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:34; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:35; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:49; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:50 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:51.

[00229] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:36, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:37; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:38; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:52; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:53 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:54.

[00230] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:39, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:40; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:41; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:55; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:56 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:57.

[00231] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:42, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:43; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:44; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:58; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:59 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:60.

[00232] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:65, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:66; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:67; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:81; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:82 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:83.

[00233] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:68, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:69; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:70; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:84; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:85 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:86.

[00234] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:71, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:72; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:73; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:87; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:88 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:89.

[00235] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат CDR1 тяжелой цепи под SEQ ID NO:74, CDR2 тяжелой цепи под SEQ ID NO:75; CDR3 тяжелой цепи под SEQ ID NO:76; CDR1 легкой цепи под SEQ ID NO:90; CDR2 легкой цепи под SEQ ID NO:91 и CDR3 легкой цепи под SEQ ID NO:92.

[00236] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:596, HCDR2 под SEQ ID NO:597 и HCDR3 под SEQ ID NO:598; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:612, LCDR2 под SEQ ID NO:613 и LCDR3 под SEQ ID NO:614.

[00237] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:599, HCDR2 под SEQ ID NO:600 и HCDR3 под SEQ ID NO:601; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:615, LCDR2 под SEQ ID NO:616 и LCDR3 под SEQ ID NO:617.

[00238] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:602, HCDR2 под SEQ ID NO:603 и HCDR3 под SEQ ID NO:604; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:618, LCDR2 под SEQ ID NO:619 и LCDR3 под SEQ ID NO:620.

[00239] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи, которая содержит HCDR1 под SEQ ID NO:605, HCDR2 под SEQ ID NO:606 и HCDR3 под SEQ ID NO:607; и вариабельную область легкой цепи, которая содержит LCDR1 под SEQ ID NO:621, LCDR2 под SEQ ID NO:622 и LCDR3 под SEQ ID NO:623.

[00240] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:13, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:29.

[00241] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:45, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:61.

[00242] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:77, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:93.

[00243] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат вариабельную область тяжелой цепи (VH), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:608, и вариабельную область легкой цепи (VL), содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:624.

[00244] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:15, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:31.

[00245] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:47, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:63.

[00246] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:79, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:95.

[00247] В конкретном варианте осуществления антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с CCR7, содержат тяжелую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:610, и легкую цепь, содержащую аминокислотную последовательность под SEQ ID NO:626

[00248] В некоторых вариантах осуществления антитело, которое специфически связывается с CCR7, представляет собой антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент), которые описаны в таблицах 1 и 4.

1. Идентификация эпитопов и антител, которые связываются с одним и тем же эпитопом

[00249] В настоящем изобретении также представлены антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), которые специфически связываются с тем же эпитопом, что и антитела к CCR7, описанные в таблицах 1 и 4, или вступает в перекрестную конкуренцию с антителами, описанными в таблицах 1 и 4. Следовательно, дополнительные антитела и фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) можно идентифицировать на основе их способности к перекрестной конкуренции (например, к конкурентному ингибированию связывания, статистически значимым образом) с другими антителами по настоящему изобретению в анализах связывания CCR7, например, с помощью BIACORE или анализов, известных специалистам в данной области техники для измерения связывания. Способность тестируемого антитела ингибировать связывание антител и фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) по настоящему изобретению с CCR7 (например, CCR7 человека) демонстрирует, что тестируемое антитело может конкурировать с таким антителом или фрагментом антитела (например, антигенсвязывающими фрагментами) за связывание с CCR7; при этом, согласно неограничивающей теории, такое антитело может связываться с тем же или родственным (например, структурно подобным или пространственно близким или перекрывающимся) эпитопом на белке CCR7, что и антитело или фрагмент антитела (например, антигенсвязывающие фрагменты), с которым оно конкурирует. В некоторых вариантах осуществления антитела, которые связываются с тем же эпитопом на CCR7, что и антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты), описанные в таблицах 1 и 4, представляют собой человеческие или гуманизированные моноклональные антитела. Такие человеческие или гуманизированные моноклональные антитела могут быть получены и выделены, как описано в данном документе.

2. Дополнительное изменение каркасной области в области Fc

[00250] Иммуноконъюгаты по настоящему изобретению могут содержать модифицированные антитела или их антигенсвязывающие фрагменты, которые дополнительно содержат модификации каркасных остатков в пределах VH и/или VL, например, для улучшения свойств антитела. В некоторых вариантах осуществления модификации каркасной области осуществляют для снижения иммуногенности антитела. Например, один подход заключается в том, что один или несколько каркасных остатков "мутируют к первоначальному виду" в направлении соответствующей последовательности зародышевой линии. Более конкретно, антитело, которое подверглось соматической мутации, может содержать каркасные остатки, которые отличаются от последовательности зародышевой линии, из которой происходит антитело. Такие остатки могут быть идентифицированы посредством сравнения каркасных последовательностей антитела с последовательностями зародышевой линии, из которых происходит антитело. Чтобы вернуть последовательности каркасной области в их конфигурацию зародышевой линии, соматические мутации можно вводить для "мутирования к первоначальному виду" в последовательности зародышевой линии, например, с помощью сайт-направленного мутагенеза. Подразумевается, что такие подвергнутые "мутации к первоначальному виду" антитела также охватываются настоящим изобретением.

[00251] Другой тип модификации каркасной области предусматривает мутацию одного или нескольких остатков в пределах каркасной области или даже в пределах одной или нескольких областей CDR, чтобы удалить T-клеточные эпитопы, со снижением тем самым потенциальной иммуногенности антитела. Данный подход также называют "деиммунизацией", и он более подробно описан в публикации заявки на патент США № 20030153043 от Carr et al.

[00252] В качестве дополнения или альтернативы модификациям, осуществляемым в пределах каркасных областей или областей CDR, антитела по настоящему изобретению можно конструировать таким образом, чтобы они включали модификации в пределах области Fc, как правило, для изменения одного или нескольких функциональных свойств антитела, таких как период полужизни в сыворотке крови, фиксация комплемента, связывание с Fc-рецептором и/или антигензависимая клеточная цитотоксичность (ADCC). Кроме того, антитело по настоящему изобретению может быть модифицировано химически (например, к антителу можно присоединять один или несколько химических фрагментов), или оно может быть модифицировано для изменения характера его гликозилирования, чтобы, опять-таки, изменить одно или несколько функциональных свойств антитела. Каждый из данных вариантов осуществления более подробно описан ниже.

[00253] В одном варианте осуществления шарнирную область CH1 модифицируют таким образом, что меняется число цистеиновых остатков в шарнирной области, например, увеличивается или уменьшается. Данный подход дополнительно описан в патенте США № 5677425 от Bodmer et al. Число цистеиновых остатков в шарнирной области CH1 изменяют, например, чтобы облегчить сборку легкой и тяжелой цепей, или чтобы увеличить или уменьшить стабильность антитела.

[00254] В некоторых вариантах осуществления антитело или фрагмент антитела, раскрытые в данном документе, содержат модифицированные или введенные путем конструирования аминокислотные остатки, например, один или несколько цистеиновых остатков, в качестве сайтов для конъюгации с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство (Junutula JR, et al., Nat Biotechnol 2008, 26:925-932). В одном варианте осуществления настоящего изобретения представлены модифицированные антитело или фрагмент антитела, содержащие замену одной или нескольких аминокислот на цистеин в положениях, описанных в данном документе. Сайты для цистеиновой замены расположены в константных областях антитела или фрагмента антитела и, таким образом, применимы к множеству антител или фрагментов антител, и сайты выбирают для обеспечения стабильных и однородных конъюгатов. Модифицированные антитело или фрагмент могут иметь одну, две или более цистеиновых замен, и такие замены могут применяться в комбинации с другими способами модификации и конъюгации, описанными в данном документе. Способы для вставки цистеина в специфические местоположения антитела известны из уровня техники, см., например, Lyons et al, (1990) Protein Eng., 3:703-708, WO 2011/005481, WO2014/124316, WO 2015/138615. В некоторых вариантах осуществления модифицированное антитело содержит замену одной или нескольких аминокислот на цистеин в своей константной области в положении, выбранном из положений 117, 119, 121, 124, 139, 152, 153, 155, 157, 164, 169, 171, 174, 189, 191, 195, 197, 205, 207, 246, 258, 269, 274, 286, 288, 290, 292, 293, 320, 322, 326, 333, 334, 335, 337, 344, 355, 360, 375, 382, 390, 392, 398, 400 и 422 тяжелой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU. В некоторых вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент антитела содержат замену одной или нескольких аминокислот на цистеин в своей константной области в положении, выбранном из положений 107, 108, 109, 114, 129, 142, 143, 145, 152, 154, 156, 159, 161, 165, 168, 169, 170, 182, 183, 197, 199, и 203 легкой цепи антитела или фрагмента антитела, где нумерация положений соответствует системе EU, и где легкая цепь представляет собой человеческую каппа-легкую цепь. В некоторых вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат комбинацию из замен двух или более аминокислот на цистеин в своих константных областях, где комбинации предусматривают замены в положениях 375 тяжелой цепи антитела, положении 152 тяжелой цепи антитела, положении 360 тяжелой цепи антитела или положении 107 легкой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU. В некоторых вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат замену одной аминокислоты на цистеин в своих константных областях, где замена находится в положении 375 тяжелой цепи антитела, положении 152 тяжелой цепи антитела, положении 360 тяжелой цепи антитела, положении 107 легкой цепи антитела, положении 165 легкой цепи антитела или положении 159 легкой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU, и где легкая цепь представляет собой каппа-цепь. В конкретных вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат комбинацию из замен двух аминокислот на цистеин в своих константных областях, где комбинации предусматривают замены в положениях 375 тяжелой цепи антитела и положении 152 тяжелой цепи антитела, где нумерация положений соответствует системе EU. В конкретных вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат замену одной аминокислоты на цистеин в положении 360 тяжелой цепи антитела, где нумерация положений соответствует системе EU. В других конкретных вариантах осуществления модифицированные антитело или фрагмент такого антитела содержат замену одной аминокислоты на цистеин в положении 107 легкой цепи антитела, и где нумерация положений соответствует системе EU, и где легкая цепь представляет собой каппа-цепь.

[00255] В дополнительных вариантах осуществления антитела или фрагменты антител (например, антигенсвязывающий фрагмент), применимые в иммуноконъюгатах по настоящему изобретению, включают модифицированные или сконструированные антитела, такие как антитело, модифицированное для введения одной или нескольких других реакционноспособных аминокислот (отличных от цистеина), в том числе Pcl, пирролизина, пептидных меток (таких как метки S6, A1 и ybbR) и неприродных аминокислот, вместо по меньшей мере одной аминокислоты из нативной последовательности, тем самым обеспечивая реакционноспособный сайт на антителе или антигенсвязывающем фрагменте для конъюгации с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, или фрагментом, представляющим собой линкер-лекарственное средство, с комплементарной реакционной группой. Например, антитела или фрагменты антител могут быть модифицированы для введения Pcl или пирролизина (W. Ou, et al., (2011) PNAS 108 (26), 10437-10442; WO2014124258) или неприродных аминокислот (J.Y. Axup, et al., Proc Natl Acad Sci U S A, 109 (2012), pp. 16101-16106; обзор см. в C.C. Liu and P.G. Schultz (2010) Annu Rev Biochem 79, 413-444; C.H. Kim, et al., (2013) Curr Opin Chem Biol. 17, 412-419) в качестве сайтов для конъюгации с лекарственным средством. Аналогичным образом в антитело могут быть введены пептидные метки для способов ферментативной конъюгации (Strop P., et al., Chem Biol. 2013, 20(2):161-7; Rabuka D., Curr Opin Chem Biol. 2010 Dec;14(6):790-6; Rabuka D, et al., Nat Protoc. 2012, 7(6):1052-67). Одним другим примером является применение 4'-фосфопантетеинилтрансфераз (PPTаза) для конъюгации аналогов кофермента A (WO2013184514) и (Grünewald et al., (2015) Bioconjugate Chem. 26 (12), 2554-62). Способы конъюгации таких модифицированных или сконструированных антител с полезными нагрузками или комбинациями линкер-полезная нагрузка известны из уровня техники.

[00256] В другом варианте осуществления для снижения биологического периода полужизни антитела подвергают мутации область Fc-шарнир антитела. Более конкретно, одну или несколько аминокислотных мутаций вводят в пограничную область между доменами CH2-CH3 фрагмента Fc-шарнир, вследствие чего антитело характеризуется нарушенным связыванием с белком A стафилококка (SpA) по сравнению со связыванием нативного домена Fc-шарнир с SpA. Данный подход более подробно описан в патенте США № 6165745 от Ward et al.

[00257] В других вариантах осуществления область Fc изменяют путем замены по меньшей мере одного аминокислотного остатка на отличный аминокислотный остаток для изменения эффекторных функций антитела. Например, одну или несколько аминокислот можно заменить на отличный аминокислотный остаток, вследствие чего антитело характеризуется измененной аффинностью в отношении эффекторного лиганда, но сохраняет способность к связыванию антигена исходного антитела. Эффекторный лиганд, аффинность в отношении которого изменяют, может представлять собой, например, Fc-рецептор или компонент C1 комплемента. Данный подход описан, например, в патентах США №№ 5624821 и 5648260, оба от Winter et al.

[00258] В другом варианте осуществления одну или несколько аминокислот, выбранных из аминокислотных остатков, можно заменить на отличный аминокислотный остаток, вследствие чего антитело характеризуется измененным связыванием C1q и/или сниженной или устраненной комплементзависимой цитотоксичностью (CDC). Данный подход описан, например, в патенте США № 6194551 от Idusogie et al.

[00259] В другом варианте осуществления один или несколько аминокислотных остатков изменяют, чтобы тем самым изменить способность антитела к фиксации комплемента. Данный подход описан, например, в PCT-публикации WO 94/29351 от Bodmer et al. Аллотипические аминокислотные остатки охватывают без ограничения константную область тяжелой цепи подклассов IgG1, IgG2 и IgG3, а также константную область легкой цепи изотипов каппа-цепи, как описано в Jefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009).

[00260] Комплексы на основе слитого белка с антителом, содержащим такие мутации, опосредуют сниженные антителозависимую клеточную цитотоксичность (ADCC) или комплементзависимую цитотоксичность (CDC) или их отсутствие. В некоторых вариантах осуществления аминокислотные остатки L234 и L235 в константной области IgG1 заменены на A234 и A235. В некоторых вариантах осуществления аминокислотный остаток N267 в константной области IgG1 заменен на A267. В некоторых вариантах осуществления аминокислотные остатки D265 и P329 в константной области IgG1 заменены на A265 и A329. В некоторых вариантах осуществления тяжелая цепь иммуноглобулина необязательно содержит мутацию или комбинацию мутаций, обусловливающих сниженную эффекторную функцию, выбранные из любой из D265A, P329A, P329G, N297A, D265A/P329A, D265A/N297A, L234/L235A, P329A/L234A/L235A и P329G/L234A/L235A. В конкретных вариантах осуществления иммуноконъюгат содержит тяжелую цепь иммуноглобулина, содержащую мутацию или комбинацию мутаций, обусловливающих сниженную эффекторную функцию, выбранных из любой из D265A, P329A, P329G, N297A, D265A/P329A, D265A/N297A, L234/L235A, P329A/L234A/L235A и P329G/L234A/L235A.

[00261] В другом варианте осуществления один или несколько аминокислотных остатков изменяют, чтобы тем самым изменить способность антитела к фиксации комплемента. Данный подход описан, например, в PCT-публикации WO 94/29351 от Bodmer et al. В конкретном варианте осуществления одна или несколько аминокислот антитела или его антигенсвязывающего фрагмента по настоящему изобретению заменены на один или несколько аллотипических аминокислотных остатков. Аллотипические аминокислотные остатки также включают без ограничения константную область тяжелой цепи подклассов IgG1, IgG2 и IgG3, а также константную область легкой цепи изотипа каппа-цепи, как описано в Jefferis et al., MAbs. 1:332-338 (2009).

[00262] В еще одном варианте осуществления модифицируют характер гликозилирования антитела. Например, можно получать aгликозилированное антитело (т. е. антитело, у которого отсутствует гликозилирование). Характер гликозилирования может быть изменен, например, для повышения аффинности антитела в отношении "антигена". Такие модификации углеводов можно осуществлять, например, посредством изменения одного или нескольких сайтов гликозилирования в пределах последовательности антитела. Например, можно произвести одну или несколько аминокислотных замен, которые приводят к устранению одного или нескольких сайтов гликозилирования в каркасной области вариабельной области, тем самым устраняя гликозилирования в этом сайте. Такое агликозилирование может повышать аффинность антитела в отношении антигена. Такой подход описан, например, патентах США №№ 5714350 и 6350861 от Co et al.

[00263] В другом варианте осуществления антитело модифицируют для увеличения его биологического периода полужизни. Возможны различные подходы. Например, можно вводить одну или несколько из следующих мутаций: T252L, T254S, T256F, как описано в патенте США № 6277375 от Ward. В качестве альтернативы для увеличения биологического периода полужизни антитело можно изменять в пределах области CH1 или CL таким образом, чтобы оно содержало эпитоп для связывания с рецептором реутилизации, взятый из двух петель домена CH2 из области Fc IgG, как описано в патентах США №№ 5869046 и 6121022 от Presta et al.

3. Выработка антител к CCR7

[00264] Антитела к CCR7 и фрагменты таких антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) могут быть получены с помощью любых средств, известных из уровня техники, в том числе без ограничения рекомбинантной экспрессии, химического синтеза и ферментативного расщепления тетрамеров антител, при этом полноразмерные моноклональные антитела можно получать, например, с помощью гибридом или рекомбинантного продуцирования. Рекомбинантная экспрессия может осуществляться в любых подходящих клетках-хозяевах, известных из уровня техники, например, в клетках-хозяевах, представляющих собой клетки млекопитающих, бактериальных клетках-хозяевах, дрожжевых клетках-хозяевах, клетках-хозяевах, представляющих собой клетки насекомых, и т.д.

[00265] В настоящем изобретении дополнительно представлены полинуклеотиды, кодирующие антитела, описанные в данном документе, например, полинуклеотиды, кодирующие вариабельные области или сегменты тяжелой или легкой цепей, содержащие определяющие комплементарность области, описанные в данном документе. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий вариабельные области тяжелой цепи, характеризуется по меньшей мере 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 14, 46, 78 и 609. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий вариабельные области легкой цепи, характеризуется по меньшей мере 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом, выбранным из группы, состоящей из SEQ ID NO: 30, 62, 94 и 625.

[00266] В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий тяжелую цепь, характеризуется по меньшей мере 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом под SEQ ID NO: 16, 48, 80 или 611. В некоторых вариантах осуществления полинуклеотид, кодирующий легкую цепь, характеризуется по меньшей мере 85%, 89%, 90%, 91%, 92%, 93%, 94%, 95%, 96%, 97%, 98%, 99% или 100% идентичностью последовательности нуклеиновой кислоты с полинуклеотидом под SEQ ID NO: 32, 64, 96 или 627.

[00267] Полинуклеотиды по настоящему изобретению могут кодировать только последовательность вариабельной области антитела к CCR7. Они также могут кодировать как вариабельную область, так и константную область антитела. Некоторые из полинуклеотидных последовательностей кодируют полипептид, который содержит вариабельные области как тяжелой цепи, так и легкой цепи одного из иллюстративных мышиных антител к CCR7. Некоторые другие полинуклеотиды кодируют два полипептидных сегмента, которые в значительной степени идентичны вариабельным областям тяжелой цепи и легкой цепи, соответственно, одного из мышиных антител.

[00268] Полинуклеотидные последовательности можно получать с помощью твердофазного синтеза ДНК de novo или с помощью ПЦР-мутагенеза существующей последовательности (например, последовательностей, которые описаны в Примерах ниже), кодирующей антитело к CCR7 или его связывающий фрагмент. Прямой химический синтез нуклеиновых кислот можно осуществлять с помощью способов, известных из уровня техники, таких как фосфотриэфирный способ из Narang et al., Meth. Enzymol. 68:90, 1979; фосфодиэфирный способ из Brown et al., Meth. Enzymol. 68:109, 1979; диэтилфосфорамидитный способ из Beaucage et al., Tetra Lett., 22:1859, 1981; и способ с использованием твердой подложки из патента США № 4458066. Введение мутаций в полинуклеотидную последовательность с помощью ПЦР можно осуществлять, как описано, например, в PCR Technology: Principles and Applications for DNA Amplification, H.A. Erlich (Ed.), Freeman Press, NY, NY, 1992; PCR Protocols: A Guide to Methods and Applications, Innis et al. (Ed.), Academic Press, San Diego, CA, 1990; Mattila et al., Nucleic Acids Res. 19:967, 1991; и Eckert et al., PCR Methods and Applications 1:17, 1991.

[00269] Также в настоящем изобретении представлены векторы экспрессии и клетки-хозяева для продуцирования антитела к CCR7, описанных выше. Различные векторы экспрессии можно использовать для экспрессии полинуклеотидов, кодирующих цепи или связывающие фрагменты антитела к CCR7. Как вирусные, так и невирусные векторы экспрессии можно применять для продуцирования антител в клетке-хозяине, представляющей собой клетку млекопитающего. Невирусные векторы и системы включают плазмиды, эписомные векторы, как правило, с кассетой экспрессии для экспрессии белка или РНК, а также искусственные человеческие хромосомы (см., например, Harrington et al., Nat Genet. 15:345, 1997). Например, невирусные векторы, применимые для экспрессии полинуклеотидов и полипептидов, связывающих CCR7, в клетках млекопитающих (например, человеческих), включают pThioHis A, B и C, pcDNA^TM3.1/His, pEBVHis A, B и C (Invitrogen, Сан-Диего, Калифорния), векторы MPSV и многочисленные другие векторы, известные из уровня техники для экспрессии других белков. Применимые вирусные векторы включают векторы на основе ретровирусов, аденовирусов, аденоассоциированных вирусов, вирусов герпеса, векторы на основе SV40, папилломавируса, вируса Эпштейна-Барр HBP, векторы на основе вируса коровьей оспы и вируса леса Семлики (SFV). См. Brent et al., выше; Smith, Annu. Rev. Microbiol. 49:807, 1995; и Rosenfeld et al., Cell 68:143, 1992.

[00270] Выбор вектора экспрессии зависит от предполагаемых клеток-хозяев, в которых следует экспрессировать вектор. Как правило, векторы экспрессии содержать промотор и другие регуляторные последовательности (например, энхансеры), которые функционально связаны с полинуклеотидами, кодирующими цепь или фрагмент антитела к CCR7. В некоторых вариантах осуществления индуцируемый промотор используют для предотвращения экспрессии встроенных последовательностей в условиях, отличающихся от индуцирующих. Индуцируемые промоторы включают, например, арабинозный, lacZ, металлотионеиновый промотор или промотор белка теплового шока. Культуры трансформированных организмов можно размножать в неиндуцирующих условиях без смещения популяции в направлении кодирующих последовательностей, продукты экспрессии которых лучше переносятся клетками-хозяевами. Для эффективной экспрессии цепи или фрагмента антитела к CCR7 кроме промоторов также могут быть необходимы или требоваться другие регуляторные элементы. Такие элементы, как правило, включают кодон инициации трансляции ATG и смежный сайт связывания рибосомы или другие последовательности. Кроме того, эффективность экспрессии можно повысить за счет включения энхансеров, соответствующих применяемой клеточной системе (см., например, Scharf et al., Results Probl. Cell Differ. 20:125, 1994; и Bittner et al., Meth. Enzymol., 153:516, 1987). Например, для повышения экспрессии в клетках-хозяевах, представляющих собой клетки млекопитающих, можно применять энхансер SV40 или энхансер CMV.

[00271] В векторах экспрессии также может быть предусмотрено положение сигнальной последовательности секреции для образования слитого белка с полипептидами, кодируемыми вставленными последовательностями антитела к CCR7. Чаще вставляемые последовательности антитела к CCR7 соединяют с сигнальными последовательностями до включения в вектор. Векторы, подлежащие применению для получения последовательностей, кодирующих вариабельные домены легкой и тяжелой цепей антитела к CCR7, иногда также кодируют константные области или их части. Такие векторы обеспечивают возможность экспрессии вариабельных областей в виде слитых белков с константными областями, приводя тем самым к получению интактных антител или их фрагментов. Как правило, такие константные области являются человеческими.

[00272] Клетки-хозяева, несущие и экспрессирующие цепи антитела к CCR7, могут быть или прокариотическими, или эукариотическими. E. coli является одним прокариотическим хозяином, применимым для клонирования и экспрессии полинуклеотидов по настоящему изобретению. Другие подходящие для применения микробные хозяева включают бацилл, таких как Bacillus subtilis, и других энтеробактерий, таких как Salmonella, Serratia и различные виды Pseudomonas. Для этих прокариотических хозяев также можно создать векторы экспрессии, которые, как правило, содержат последовательности для управления экспрессией, совместимые с клеткой-хозяином (например, точку начала репликации). Кроме того, будет присутствовать любое число разнообразных хорошо известных промоторов, как, например, лактозная промоторная система, триптофановая (trp) промоторная система, бета-лактамазная промоторная система или промоторная система из фага лямбда. Как правило, промоторы управляют экспрессией, необязательно с помощью операторной последовательности, и имеют последовательности сайта связывания рибосомы и т.п. для инициации и завершения транскрипции и трансляции. Для экспрессии полипептидов, связывающих CCR7, по настоящему изобретению также можно использовать других микроорганизмов, таких как дрожжи. Также можно применять клетки насекомых в сочетании с бакуловирусными векторами.

[00273] В некоторых предпочтительных вариантах осуществления для экспрессии и продуцирования полипептидов, связывающих CCR7, по настоящему изобретению применяют клетки-хозяева, представляющие собой клетки млекопитающих. Например, они могут представлять собой либо линию клеток гибридомы, экспрессирующих эндогенные гены иммуноглобулинов (например, клоны гибридомы из клеток миеломы, как описано в Примерах), либо линию клеток млекопитающих, несущих экзогенный вектор экспрессии (например, клетки миеломы SP2/0, приведенные в качестве примера ниже). Они охватывают любые нормальные мортальные или нормальные или аномальные иммортальные клетки животных или человека. Например, был разработан ряд подходящих линий клеток-хозяев, способных секретировать интактные иммуноглобулины, в том числе линии клеток CHO, различные линии клеток Cos, клетки HeLa, линии клеток миеломы, трансформированные B-клетки и гибридомы. Применение тканевой культуры клеток млекопитающих для экспрессии полипептидов в общих чертах обсуждается, например, в Winnacker, From Genes to Clones, VCH Publishers, N.Y., N.Y., 1987. Векторы экспрессии для клеток-хозяев, представляющих собой клетки млекопитающих, могут включать последовательности для управления экспрессией, такие как точка начала репликации, промотор и энхансер (см., например, Queen et al., Immunol. Rev. 89:49-68, 1986), и необходимые сайты, несущие информацию для процессинга, такие как сайты связывания рибосом, сайты сплайсинга РНК, сайты полиаденилирования и последовательности терминатора транскрипции. Такие векторы экспрессии обычно содержат промоторы, происходящие из генов млекопитающих или из вирусов млекопитающих. Подходящие промоторы могут быть конститутивными, специфическими в отношении типа клеток, специфическими в отношении стадии развития и/или модулируемыми или регулируемыми. Применимые промоторы включают без ограничения металлотионеиновый промотор, конститутивный большой поздний промотор аденовируса, индуцируемый дексаметазоном промотор MMTV, промотор SV40, промотор polIII MRP, конститутивный промотор MPSV, индуцируемый тетрациклином промотор CMV (такой как немедленно-ранний промотор CMV человека), конститутивный промотор CMV и комбинации промотор-энхансер, известные из уровня техники.

[00274] Способы введения векторов экспрессии, содержащих представляющие интерес полинуклеотидные последовательности, варьируют в зависимости от типа клетки-хозяина. Например, трансфекцию с использованием хлорида кальция обычно используют для прокариотических клеток, тогда как обработку фосфатом кальция или электропорацию можно применять для других клеток-хозяев (см. в общих чертах Sambrook et al., выше). A Laboratory Manual, 4^th ed.). Другие способы включают, например, электропорацию, обработку фосфатом кальция, трансформацию, опосредованную липосомами, инъекцию и микроинъекцию, баллистические способы, виросомы, иммунолипосомы, конъюгаты поликатион:нуклеиновая кислота, депротеинизированную ДНК, искусственные вирионы, слияние со структурным белком VP22 вируса герпеса (Elliot and O'Hare, Cell 88:223, 1997), усиленное средством поглощение ДНК и трансдукцию ex vivo. Чтобы обеспечить длительное получение рекомбинантных белков с высоким выходом, зачастую будет требоваться стабильная экспрессия. Например, линии клеток, которые стабильно экспрессируют цепи или связывающие фрагменты антитела к CCR7, можно получить с применением векторов экспрессии по настоящему изобретению, которые содержат вирусные точки начала репликации или эндогенные экспрессионные элементы и ген селектируемого маркера. После введения вектора клетки можно оставить расти в течение 1-2 дней в обогащенной среде перед их переносом на селективную среду. Задачей селектируемого маркера является придание устойчивости к факторам отбора, и его присутствие обеспечивает возможность роста клеток, которые успешно экспрессируют введенные последовательности, в селективных средах. Пролиферацию устойчивых стабильно трансфицированных клеток можно обеспечивать с применением методик тканевой культуры, соответствующих типу клеток.

Пути терапевтического применения

[00275] Антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению применимы в виде разнообразных применений, в том числе без ограничения лечения или предупреждения рака, такого как типы солидного рака или гемобластозы. В некоторых вариантах осуществления антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению применимы для ингибирования роста опухоли, индуцирования дифференцировки, уменьшения объема опухоли и/или снижения туморогенности опухоли. Способы применения могут представлять собой in vitro, ex vivo или in vivo способы.

[00276] В одном аспекте антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению применимы для выявления присутствия CCR7 в биологическом образце. Используемый в данном документе термин "осуществление обнаружения" охватывает количественное или качественное обнаружение. В некоторых вариантах осуществления биологический образец содержит клетку или ткань. В некоторых вариантах осуществления такие ткани включают нормальные и/или раковые ткани, которые экспрессируют CCR7 на более высоких уровнях по сравнению с другими тканями.

[00277] В одном аспекте настоящего изобретения представлен способ обнаружения присутствия CCR7 в биологическом образце. В некоторых вариантах осуществления способ предусматривает приведение биологического образца в контакт с антителом к CCR7 в условиях, допускающих связывание антитела с антигеном, и выявление того, формируется ли комплекс между антителом и антигеном.

[00278] В одном аспекте настоящего изобретения представлен способ диагностики нарушения, ассоциированного с повышенной экспрессией CCR7. В некоторых вариантах осуществления способ предусматривает приведение тестируемой клетки в контакт с антителом к CCR7; определение уровня экспрессии (или количественно, или качественно) CCR7 на тестируемой клетке путем обнаружения связывания антитела к CCR7 с антигеном CCR7 и сравнение уровня экспрессии CCR7 в тестируемой клетке с уровнем экспрессии CCR7 на контрольной клетке (например, нормальной клетке, происходящей из той же ткани, что и тестируемая клетка, или клетке, которая экспрессирует CCR7 на уровнях, сравнимых с таковыми у нормальной клетки), где более высокий уровень экспрессии CCR7 на тестируемой клетке по сравнению с контрольной клеткой указывает на присутствие нарушения, ассоциированного с повышенной экспрессией CCR7. В некоторых вариантах осуществления тестируемую клетку получают от индивидуума с подозрением на наличие нарушения, ассоциированного с повышенной экспрессией CCR7. В некоторых вариантах осуществления нарушение представляет собой нарушение пролиферации клеток, такое как рак или опухоль. В некоторых вариантах осуществления способ предусматривает измерение числа копий гена CCR7 в тестируемой клетке.

[00279] В некоторых вариантах осуществления способ диагностики или обнаружения, такой как описываемые выше, предусматривает обнаружение связывания антитела к CCR7 с CCR7, экспрессируемым на поверхности клетки или в препарате мембраны, полученном из клетки, экспрессирующей CCR7 на своей поверхности. Иллюстративным анализом для обнаружения связывания антитела к CCR7 с CCR7, экспрессируемым на поверхности клетки, является "FACS"-анализ.

[00280] Для обнаружения связывания антитела к CCR7 с CCR7 могут применяться некоторые другие способы. Такие способы включают без ограничения анализы связывания антигена, которые широко известны из уровня техники, такие как вестерн-блоттинг, радиоиммунологические анализы, ELISA (твердофазный иммуноферментный анализ), иммунологические "сэндвич"-анализы, анализы иммунопреципитации, флуоресцентные иммунологические анализы, иммунологические анализы с белком A и иммуногистохимическое исследование (IHC).

[00281] В некоторых вариантах осуществления антитела к CCR7 являются меченными. Метки включают без ограничения метки или фрагменты, которые обнаруживают непосредственно (такие как флуоресцентные, хромофорные, электронноплотные, хемилюминесцентные и радиоактивные метки), а также фрагменты, такие как ферменты или лиганды, которые обнаруживают опосредованно, например, за счет ферментативной реакции или молекулярного взаимодействия.

[00282] В некоторых вариантах осуществления антитела к CCR7 являются иммобилизированными на нерастворимой матрице. Иммобилизация приводит к отделению антитела к CCR7 от любого белка CCR7, который остается свободным в растворе. Традиционно это осуществляют либо посредством перевода антитела к CCR7 в нерастворимую форму перед процедурой анализа в результате адсорбции на нерастворимой в воде матрице или поверхности (Bennich et al., патент США № 3720760) или соединения ковалентной связью (например, с применением сшивания глутаральдегидом), либо посредством перевода антитела к CCR7 в нерастворимую форму после образования комплекса между антителом к CCR7 и белком CCR7, например, посредством иммунного осаждения.

[00283] Любой из вышеизложенных вариантов осуществления диагностики или обнаружения может проводиться с применением иммуноконъюгата по настоящему изобретению вместо или в дополнение к антителу к CCR7.

[00284] В одном варианте осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения заболевания, предусматривающий введение пациенту антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В настоящем изобретении также представлено применение антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению для лечения или предупреждения заболевания у пациента. В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) или конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению для применения в лечении или предупреждении заболевания у пациента. В дополнительных вариантах осуществления настоящего изобретения представлено применение антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению при изготовлении лекарственного препарата для лечения или предупреждения заболевания у пациента.

[00285] В некоторых вариантах осуществления заболевание, которое лечат с помощью антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) и конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению, представляет собой рак. В некоторых вариантах осуществления рак характеризуется наличием клеток, экспрессирующих CCR7, с которыми связываются антитела, фрагменты антител (например, антигенсвязывающие фрагменты) и конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления рак характеризуется повышением экспрессии CCR7 по сравнению с уровнем экспрессии у здорового пациента. В некоторых вариантах осуществления экспрессия CCR7 может быть измерена по повышению РНК CCR7. В других вариантах осуществления рак характеризуется повышением числа копий ДНК CCR7. Специалистам в данной области техники известны другие способы измерения или определения уровней экспрессии CCR7. Примеры заболеваний, которые можно лечить и/или предупреждать, включают без ограничения, хронический лимфоцитарный лейкоз (CLL), периферические T-клеточные лимфомы (PTCL), такие как T-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинскую лимфому (NHL), такую как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), карциному желудка, немелкоклеточный рак легкого, мелкоклеточный рак легкого, рак головы и шеи, носоглоточную карциному (NPC), рак пищевода, колоректальную карциному, рак поджелудочной железы, рак щитовидной железы, рак молочной железы, почечноклеточный рак и рак шейки матки.

[00286] В настоящем изобретении представлены способы лечения или предупреждения рака, предусматривающие введение терапевтически эффективного количества антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой солидный рак. В некоторых вариантах осуществления субъектом является человек. В некоторых вариантах осуществления рак представляет собой устойчивый рак и/или рецидивирующий рак. В определенных аспектах, например, устойчивый рак является устойчивым к ингибиторам тирозинкиназы, ингибиторам EGFR, ингибиторам Her2, ингибиторам Her3, ингибиторам IGFR и ингибиторам Met.

[00287] В некоторых вариантах осуществления настоящего изобретения представлены способы ингибирования роста опухоли, предусматривающие введение субъекту терапевтически эффективного количества антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению. В некоторых вариантах осуществления субъектом является человек. В некоторых вариантах осуществления субъект имеет опухоль или у него была удалена опухоль. В некоторых вариантах осуществления опухоль является устойчивой к другим ингибиторам тирозинкиназы, в том числе без ограничения к ингибиторам EGFR, ингибиторам Her2, ингибиторам Her3, ингибиторам IGFR и ингибиторам Met.

[00288] В некоторых вариантах осуществления опухоль экспрессирует CCR7, с которым связываются антитела к CCR7. В некоторых вариантах осуществления опухоль сверхэкспрессирует CCR7 человека. В некоторых вариантах осуществления опухоль характеризуется повышенным числом копий гена CCR7.

[00289] В настоящем изобретении также представлены способы отбора пациентов для лечения антителами, фрагментами антител (например, антигенсвязывающими фрагментами) или конъюгатами антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению, предусматривающие введение терапевтически эффективного количества указанных антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства. В определенных аспектах способ предусматривает отбор пациентов с раком, устойчивым к ингибиторам тирозинкиназы. В определенных аспектах предполагается, что рак, устойчивый к ингибиторам тирозинкиназы, является устойчивым к ингибиторам EGFR, ингибиторам Her2, ингибиторам Her3, ингибиторам IGFR и/или ингибиторам Met. В определенных аспектах предполагается, что устойчивый рак представляет собой рак, устойчивый к Her2. В определенных аспектах предполагается, что рак представляет собой de novo устойчивый рак, а в еще аспектах предполагается, что рак представляет собой рецидивирующий рак. В определенных аспектах настоящего изобретения способы предусматривают отбор пациента с de novo устойчивым или рецидивирующим раком и измерение экспрессии CCR7. Предполагается, что в определенных аспектах рецидивирующий рак или опухоль изначально не были раком или опухолью, экспрессирующими CCR7, но становятся CCR7 положительным раком, который представляет собой устойчивые к тирозинкиназе или рецидивирующие рак или опухоль, после лечения ингибиторами тирозинкиназы.

[00290] В случае лечения или предупреждения заболеваний подходящая доза антител, фрагментов антител (например, антигенсвязывающих фрагментов) или конъюгатов антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению зависит от различных факторов, таких как тип заболевания, подлежащего лечению, тяжесть и течение заболевания, ответная реакция заболевания, предыдущая терапия, клинический анамнез пациента и т. д. Антитело или средство могут вводиться один раз или на протяжении курса лечения, длящегося от нескольких дней до нескольких месяцев, или до осуществления излечения, или до достижения ослабления болезненного состояния (например, уменьшения размера опухоли). Оптимальные схемы приема можно рассчитать на основании измерений накопления лекарственного средства в организме пациента, и они будут варьироваться в зависимости от относительной активности индивидуальных антитела, фрагментов антитела (например, антигенсвязывающего фрагмента) или конъюгатов антитела и лекарственного средства. Лечащий врач может оценить частоту повторения введения дозы на основании измеренного времени удержания и концентраций лекарственного средства в физиологических жидкостях или тканях.

Комбинированная терапия

[00291] В определенных случаях антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент) или конъюгат антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению объединяют с другими терапевтическими средствами, такими как другие противораковые средства, противоаллергические средства, средства против тошноты (или противорвотные средства), обезболивающие средства, цитопротекторные средства и их комбинации.

[00292] В одном варианте осуществления антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент) или конъюгат антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению объединяют в фармацевтическом комбинированном составе со вторым соединением, характеризующимся противораковыми свойствами, или схема введения доз предусматривает комбинированную терапию с ним. Второе соединение фармацевтического комбинированного состава или схемы введения доз может характеризоваться видами активности, которые взаимно дополняют антитело или иммуноконъюгат из комбинации, вследствие чего они не оказывают неблагоприятного эффекта друг на друга. Например, антитело, фрагмент антитела (например, антигенсвязывающий фрагмент) или конъюгат антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению могут вводиться в комбинации без ограничения с химиотерапевтическим средством, ингибитором тирозинкиназы, ингибитором пути передачи нисходящего сигнала с участием CCR7, ингибиторами IAP, ингибиторами Bcl2, ингибиторами Mcl1 и другими ингибиторами CCR7.

[00293] Используемый в данном документе термин "фармацевтическая комбинация" относится либо к фиксированной комбинации в форме единицы дозирования, либо к нефиксированной комбинации или набору из частей для комбинированного введения, где два или более терапевтических средств могут вводиться независимо в одно и то же время или по отдельности в пределах временных интервалов, в частности, когда такие временные интервалы обеспечивают возможность демонстрации кооперативного, например синергетического, эффекта партнеров по комбинации.

[00294] Термин "комбинированная терапия" относится к введению двух или более терапевтических средств для лечения или предупреждения терапевтического состояния или нарушения, описанного в настоящем изобретении. Такое введение охватывает совместное введение этих терапевтических средств практически одновременно, например, в одной капсуле, имеющей фиксированное отношение активных ингредиентов. В качестве альтернативы такое введение охватывает совместное введение в виде нескольких или отдельных контейнеров (например, капсулы, порошки и жидкости) для каждого активного ингредиента. Порошки и/или жидкости могут быть восстановлены или разбавлены до требуемой дозы перед введением. Кроме того, такое введение также охватывает применение каждого типа терапевтического средства последовательным образом, либо приблизительно в одно и то же время, либо в разное время. В любом случае схема лечения будет обеспечивать приносящие пользу эффекты комбинации лекарственных средств при лечении или предупреждении состояний или нарушений, описанных в данном документе.

[00295] Комбинированная терапия может обеспечивать "синергию" и оказаться "синергетической", т.e. эффект, достигаемый, когда активные ингредиенты применяются вместе, превышает сумму эффектов, которые являются результатом применения соединений по отдельности. Синергетический эффект может быть достигнут, когда активные ингредиенты: (1) составлены вместе и вводятся или доставляются одновременно в виде комбинированного состава с однократной дозой; (2) доставляются по очереди или параллельно как отдельные составы или (3) применяется какая-либо другая схема. При доставке в виде терапии с чередованием синергетический эффект может достигаться, когда соединения вводят или доставляют одно за другим, например, посредством различных инъекций в отдельных шприцах. В целом, во время терапии с чередованием эффективную дозу каждого активного ингредиента вводят одну за другой, т.е. сериями, в то время как при комбинированной терапии эффективную дозу двух или более активных ингредиентов вводят вместе.

[00296] Распространенные химиотерапевтические средства, рассматриваемые для применения в видах комбинированной терапии, включают анастрозол (Arimidex^®), бикалутамид (Casodex^®), блеомицина сульфат (Blenoxane^®), бусульфан (Myleran^®), бусульфан в виде инъекции (Busulfex^®), капецитабин (Xeloda^®), N4-пентоксикарбонил-5-дезокси-5-фторцитидин, карбоплатин (Paraplatin^®), кармустин (BiCNU^®), хлорамбуцил (Leukeran^®), цисплатин (Platinol^®), кладрибин (Leustatin^®), циклофосфамид (Cytoxan^® или Neosar^®), цитарабин, цитозина арабинозид (Cytosar-U^®), цитарабин в виде липосомной инъекции (DepoCyt^®), дакарбазин (DTIC-Dome^®), дактиномицин (актиномицин D, Cosmegan), даунорубицина гидрохлорид (Cerubidine^®), даунорубицина цитрат в виде липосомной инъекции (DaunoXome^®), дексаметазон, доцетаксел (Taxotere^®), доксорубицина гидрохлорид (Adriamycin^®, Rubex^®), этопозид (Vepesid^®), флударабина фосфат (Fludara^®), 5-фторурацил (Adrucil^®, Efudex^®), флутамид (Eulexin^®), тезацитибин, гемцитабин (дифтордезоксицитидин), гидроксимочевину (Hydrea^®), идарубицин (Idamycin^®), ифосфамид (IFEX^®), иринотекан (Camptosar^®), L-аспарагиназу (ELSPAR^®), лейковорин кальция, мелфалан (Alkeran^®), 6-меркаптопурин (Purinethol^®), метотрексат (Folex^®), митоксантрон (Novantrone^®), милотарг, паклитаксел (Taxol^®), феникс (иттрий 90/MX-DTPA), пентостатин, полифероспан 20 с имплантатом кармустина (Gliadel^®), тамоксифена цитрат (Nolvadex^®), тенипозид (Vumon^®), 6-тиогуанин, тиотепу, тирапазамин (Tirazone^®), топотекана гидрохлорид для инъекции (Hycamptin^®), винбластин (Velban^®), винкристин (Oncovin^®) и винорелбин (Navelbine^®), а также пеметрексед.

[00297] В одном аспекте настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими ингибиторами тирозинкиназы, в том числе без ограничения ингибиторами BTK, ингибиторами EGFR, ингибиторами Her2, ингибиторами Her3, ингибиторами IGFR и ингибиторами Met.

[00298] Например, ингибиторы тирозинкиназы включают без ограничения ибрутиниб (PCI-32765); эрлотиниба гидрохлорид (Tarceva®); линифаниб (N-[4-(3-амино-1H-индазол-4-ил)фенил]-N'-(2-фтор-5-метилфенил)мочевина, также известный как ABT 869, доступный от Genentech); сунитиниба малат (Sutent®); босутиниб (4-[(2,4-дихлор-5-метоксифенил)амино]-6-метокси-7-[3-(4-метилпиперазин-1-ил)пропокси]хинолин-3-карбонитрил, также известный как SKI-606 и описанный в патенте США № 6780996); дазатиниб (Sprycel®); пазопаниб (Votrient®); сорафениб (Nexavar®); зактима (ZD6474) и иматиниб или иматиниба мезилат (Gilvec® и Gleevec®).

[00299] Ингибиторы рецептора эпидермального фактора роста рецептор (EGFR) ингибиторы включают без ограничения, эрлотиниба гидрохлорид (Tarceva®), гефитиниб (Iressa®); N-[4-[(3-хлор-4-фторфенил)амино]-7-[[(3''S'')-тетрагидро-3-фуранил]окси]-6-хиназолинил]-4(диметиламино)-2-бутенамид, Tovok®); вандетаниб (Caprelsa®); лапатиниб (Tykerb®); (3R,4R)-4-амино-1-((4-((3-метоксифенил)амино)пирроло[2,1-f][1,2,4]триазин-5-ил)метил)пиперидин-3-ол (BMS690514); канертиниба дигидрохлорид (CI-1033); 6-[4-[(4-этил-1-пиперазинил)метил]фенил]-N-[(1R)-1-фенилэтил]- 7H-пирроло[2,3-d]пиримидин-4-амин (AEE788, CAS 497839-62-0); мубритиниб (TAK165); пелитиниб (EKB569); афатиниб (BIBW2992); нератиниб (HKI-272); N-[4-[[1-[(3-фторфенил)метил]-1H-индазол-5-ил]амино]-5-метилпирроло[2,1-f][1,2,4]триазин-6-ил]-карбаминовую кислоту, (3S)-3-морфолинилметиловый сложный эфир (BMS599626); N-(3,4-дихлор-2-фторфенил)-6-метокси-7-[[(3aα,5β,6aα)-октагидро-2-метилциклопента[c]пиррол-5-ил]метокси]-4-хиназолинамин (XL647, CAS 781613-23-8) и 4-[4-[[(1R)-1-фенилэтил]амино]-7H-пирроло[2,3-d]пиримидин-6-ил]-фенол (PKI166, CAS 187724-61-4).

[00300] Антитела, связывающие EGFR, включают без ограничения, цетуксимаб (Erbitux®); панитумумаб (Vectibix®); матузумаб (EMD-72000); нимотузумаб (hR3); залутумумаб; TheraCIM h-R3; MDX0447 (CAS 339151-96-1) и ch806 (mAb-806, CAS 946414-09-1).

[00301] Ингибиторы рецептора эпидермального фактора роста 2 (рецептора Her2) человека (также известного как Neu, ErbB-2, CD340 или p185) включают без ограничения трастузумаб (Herceptin®); пертузумаб (Omnitarg®); трастузумаб эмтанзин (Kadcyla®); нератиниб (HKI-272, (2E)-N-[4-[[3-хлор-4-[(пиридин-2-ил)метокси]фенил]амино]-3-циано-7-этоксихинолин-6-ил]-4-(диметиламино)бут-2-енамид и описанный в PCT-публикации № WO 05/028443); лапатиниб или лапатиниба дитозилат (Tykerb®); (3R,4R)-4-амино-1-((4-((3-метоксифенил)амино)пирроло[2,1-f][1,2,4]триазин-5-ил)метил)пиперидин-3-ол (BMS690514); (2E)-N-[4-[(3-хлор-4-фторфенил)амино]-7-[[(3S)-тетрагидро-3-фуранил]окси]-6-хиназолинил]-4-(диметиламино)-2-бутенамид (BIBW-2992, CAS 850140-72-6); N-[4-[[1-[(3-фторфенил)метил]-1H-индазол-5-ил]амино]-5-метилпирроло[2,1-f][1,2,4]триазин-6-ил]-карбаминовую кислоту, (3S)-3-морфолинилметиловый сложный эфир (BMS 599626, CAS 714971-09-2); канертиниба дигидрохлорид (PD183805 или CI-1033) и N-(3,4-дихлор-2-фторфенил)-6-метокси-7-[[(3aα,5β,6aα)-октагидро-2-метилциклопента[c]пиррол-5-ил]метокси]-4-хиназолинамин (XL647, CAS 781613-23-8).

[00302] Ингибиторы Her3 включают без ограничения LJM716, MM-121, AMG-888, RG7116, REGN-1400, AV-203, MP-RM-1, MM-111 и MEHD-7945A.

[00303] Ингибиторы Met включают без ограничения кабозатиниб (XL184, CAS 849217-68-1); форетиниб (GSK1363089, ранее XL880, CAS 849217-64-7); тивантиниб (ARQ197, CAS 1000873-98-2); 1-(2-гидрокси-2-метилпропил)-N-(5-(7-метоксихинолин-4-илокси)пиридин-2-ил)-5-метил-3-оксо-2-фенил-2,3-дигидро-1H-пиразол-4-карбоксамид (AMG 458); кризотиниб (Xalkori®, PF-02341066); (3Z)-5-(2,3-дигидро-1H-индол-1-илсульфонил)-3-({3,5-диметил-4-[(4-метилпиперазин-1-ил)карбонил]-1H-пиррол-2-ил}метилен)-1,3-дигидро-2H-индол-2-он (SU11271); (3Z)-N-(3-хлорфенил)-3-({3,5-диметил-4-[(4-метилпиперазин-1-ил)карбонил]-1H-пиррол-2-ил}метилен)-N-метил-2-оксоиндолин-5-сульфонамид (SU11274); (3Z)-N-(3-хлорфенил)-3-{[3,5-диметил-4-(3-морфолин-4-илпропил)-1H-пиррол-2-ил]метилен}-N-метил-2-оксоиндолин-5-сульфонамид (SU11606); 6-[дифтор[6-(1-метил-1H-пиразол-4-ил)-1,2,4-триазоло[4,3-b]пиридазин-3-ил]метил]-хинолин (JNJ38877605, CAS 943540-75-8); 2-[4-[1-(хинолин-6-илметил)-1H-[1,2,3]триазоло[4,5-b]пиразин-6-ил]-1H-пиразол-1-ил]этанол (PF04217903, CAS 956905-27-4); N-((2R)-1,4-диоксан-2-илметил)-N-метил-N'-[3-(1-метил-1H-пиразол-4-ил)-5-оксо-5H-бензо[4,5]циклогепта[1,2-b]пиридин-7-ил]сульфамид (MK2461, CAS 917879-39-1); 6-[[6-(1-метил-1H-пиразол-4-ил)-1,2,4-триазоло[4,3-b]пиридазин-3-ил]тио]-хинолин (SGX523, CAS 1022150-57-7) и (3Z)-5-[[(2,6-дихлорфенил)метил]сульфонил]-3-[[3,5-диметил-4-[[(2R)-2-(1-пирролидинилметил)-1-пирролидинил]карбонил]-1H-пиррол-2-ил]метилен]-1,3-дигидро-2H-индол-2-он (PHA665752, CAS 477575-56-7).

[00304] Ингибиторы IGF1R включают без ограничения, BMS-754807, XL-228, OSI-906, GSK0904529A, A-928605, AXL1717, KW-2450, MK0646, AMG479, IMCA12, MEDI-573 и BI836845. Обзор см., например, в Yee, JNCI, 104; 975 (2012).

[00305] В другом аспекте настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими ингибиторами пути передачи нисходящего сигнала с участием CCR7, в том числе без ограничения ингибиторами β-аррестина, ингибиторами GRK, ингибиторами MAPK, ингибиторами PI3K, ингибиторами JAK и т.д.

[00306] Например, ингибиторы фосфоинозитид 3-киназы (PI3K) включают без ограничения иделалисиб (Zydelig, GS-1101, Cal-101), 4-[2-(1H-индазол-4-ил)-6-[[4-(метилсульфонил)пиперазин-1-ил]метил]тиено[3,2-d]пиримидин-4-ил]морфолин (также известный как GDC 0941 и описанный в PCT-публикациях №№ WO 09/036082 и WO 09/055730); 2-метил-2-[4-[3-метил-2-оксо-8-(хинолин-3-ил)-2,3-дигидроимидазо[4,5-c]хинолин-1-ил]фенил]пропионитрил (также известный как BEZ 235 или NVP-BEZ 235 и описанный в PCT-цубликации № WO 06/122806); 4-(трифторметил)-5-(2,6-диморфолинoпиримидин-4-ил)пиридин-2-амин (также известный как BKM120 или NVP-BKM120 и описанный в PCT-публикации № WO2007/084786); тозасертиб (VX680 или MK-0457, CAS 639089-54-6); (5Z)-5-[[4-(4-пиридинил)-6-хинолинил]метилен]-2,4-тиазолидиндион (GSK1059615, CAS 958852-01-2); (1E,4S,4aR,5R,6aS,9aR)-5-(ацетилокси)-1-[(ди-2-пропениламино)метилен]-4,4a,5,6,6a,8,9,9a-октагидро-11-гидрокси-4-(метоксиметил)-4a,6a-диметил-циклопента[5,6]нафто[1,2-c]пиран-2,7,10(1H)-трион (PX866, CAS 502632-66-8) и 8-фенил-2-(морфолин-4-ил)-хромен-4-он (LY294002, CAS 154447-36-6).

[00307] В еще одном аспекте настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими проапоптотическими средствами, в том числе без ограничения ингибиторами IAP, ингибиторами Bcl2, ингибиторами MCl1, средствами Trail, ингибиторами Chk.

[00308] Например, ингибиторы IAP включают без ограничения LCL161, GDC-0917, AEG-35156, AT406 и TL32711. Другие примеры ингибиторов IAP включают без ограничения раскрытые в WO04/005284, WO 04/007529, WO05/097791, WO 05/069894, WO 05/069888, WO 05/094818, US2006/0014700, US2006/0025347, WO 06/069063, WO 06/010118, WO 06/017295 и WO08/134679, все из которых включены в данный документ посредством ссылки.

[00309] Ингибиторы BCL-2 включают без ограничения венетоклакс (также известный как GDC-0199, ABT-199, RG7601); 4-[4-[[2-(4-хлорфенил)-5,5-диметил-1-циклогексен-1-ил]метил]-1-пиперазинил]-N-[[4-[[(1R)-3-(4-морфолинил)-1-[(фенилтио)метил]пропил]амино]-3-[(трифторметил)сульфонил]фенил]сульфонил]бензамид (также известный как ABT-263 и описанный в PCT-публикации № WO 09/155386); тетрокарцин A; антимицин; госсипол ((-)BL-193); обатоклакс; этил-2-амино-6-циклопентил-4-(1-циано-2-этокси-2-оксоэтил)-4H-хромон-3-карбоксилат (HA14-1); облимерсен (G3139, Genasense®); пептид Bak BH3; (-)-госсипол-уксусную кислоту (AT-101); 4-[4-[(4'-хлор[1,1'-бифенил]-2-ил)метил]-1-пиперазинил]-N-[[4-[[(1R)-3-(диметиламино)-1-[(фенилтио)метил]пропил]амино]-3-нитрофенил]сульфонил]-бензамид (ABT-737, CAS 852808-04-9) и навитоклакс (ABT-263, CAS 923564-51-6).

[00310] Агонисты проапоптических рецепторов (PARA), в том числе DR4 (TRAILR1) и DR5 (TRAILR2), включают без ограничения дуланермин (AMG-951, RhApo2L/TRAIL); мапатумумаб (HRS-ETR1, CAS 658052-09-6); лексатумумаб (HGS-ETR2, CAS 845816-02-6); апомаб (Apomab®); конатумумаб (AMG655, CAS 896731-82-1) и тигатузумаб (CS1008, CAS 946415-34-5, доступен от Daiichi Sankyo).

[00311] Ингибиторы киназы контрольных точек (CHK) включают без ограничения 7-гидроксистауроспорин (UCN-01); 6-бром-3-(1-метил-1H-пиразол-4-ил)-5-(3R)-3-пиперидинил-пиразолo[1,5-a]пиримидин-7-амин (SCH900776, CAS 891494-63-6); 5-(3-фторфенил)-3-уреидотиофен-2-карбоновой кислоты N-[(S)-пиперидин-3-ил]амид (AZD7762, CAS 860352-01-8); 4-[((3S)-1-азабицикло[2.2.2]окт-3-ил)амино]-3-(1H-бензимидазол-2-ил)-6-хлорхинолин-2(1H)-он (CHIR 124, CAS 405168-58-3); 7-аминодактиномицин (7-AAD), изогранулатимид, дебромгимениалдизин; N-[5-бром-4-метил-2-[(2S)-2-морфолинилметокси]-фенил]-N'-(5-метил-2-пиразинил)мочевину (LY2603618, CAS 911222-45-2); сульфорафан (CAS 4478-93-7, 4-метилсульфинилбутилизотиоцианат); 9,10,11,12-тетрагидро- 9,12-эпокси-1H-дииндолo[1,2,3-fg:3',2',1'-kl]пирроло[3,4-i][1,6]бензодиазоцин-1,3(2H)-дион (SB-218078, CAS 135897-06-2) и TAT-S216A (YGRKKRRQRRRLYRSPAMPENL (SEQ ID NO: 629)), а также CBP501 ((d-Bpa)sws(d-Phe-F5)(d-Cha)rrrqrr).

[00312] В дополнительном варианте осуществления настоящего изобретения представлен способ лечения или предупреждения рака путем введения субъекту, нуждающемуся в этом, конъюгата антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению в комбинации с одним или несколькими иммуномодуляторами (например, одним или несколькими из активатора костимулирующей молекулы или ингибитора молекулы иммунных контрольных точек).

[00313] В некоторых вариантах осуществления иммуномодулятор представляет собой активатор костимулирующей молекулы. В одном варианте осуществления агонист костимулирующей молекулы выбран из агониста (например, агонистического антитела или его антигенсвязывающего фрагмента, или растворимого слитого белка) OX40, CD2, CD27, CDS, ICAM-1, LFA-1 (CD11a/CD18), ICOS (CD278), 4-1BB (CD137), GITR, CD30, CD40, BAFFR, HVEM, CD7, LIGHT, NKG2C, SLAMF7, NKp80, CD160, B7-H3, STING или лиганда CD83.

[00314] В некоторых вариантах осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор молекулы иммунных контрольных точек. В одном варианте осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGFR-бета. В одном варианте осуществления ингибитор молекулы иммунных контрольных точек ингибирует PD-1, PD-L1, LAG-3, TIM-3 или CTLA4 или любую их комбинацию. Термин "ингибирование" или "ингибитор" подразумевает снижение определенного параметра, например, активности данной молекулы, например, ингибитора контрольных точек. Например, данный термин подразумевает ингибирование активности, например, активности PD-1 или PD-L1, на по меньшей мере 5%, 10%, 20%, 30%, 40%, 50% или больше. Таким образом, ингибирование не обязательно должно составлять 100%.

[00315] Ингибирование ингибирующей молекулы может происходить на уровне ДНК, РНК или белка. В некоторых вариантах осуществления для подавления экспрессии ингибирующей молекулы может применяться ингибирующая нуклеиновая кислота (например, dsRNA, siRNA или shRNA). В других вариантах осуществления ингибитор ингибирующего сигнала представляет собой полипептид, например, растворимый лиганд (например, Ig, связывающий PD-1, или Ig, связывающий CTLA-4) или антитело или его антигенсвязывающий фрагмент, которые связываются с ингибирующей молекулой; например, антитело или его фрагмент (также обозначаемые в данном документе как "молекула антитела"), которые связываются с PD-1, PD-L1, PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGFR-бета или их комбинацией.

[00316] В одном варианте осуществления молекула антитела представляет собой полное антитело или его фрагмент (например, Fab, F(ab')₂, Fv или одноцепочечный Fv-фрагмент (scFv)). В других вариантах осуществления молекула антитела имеет константную область тяжелой цепи (Fc), выбранную, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3, IgG4, IgM, IgA1, IgA2, IgD и IgE; в частности, выбранную, например, из константных областей тяжелой цепи IgG1, IgG2, IgG3 и IgG4, более конкретно, константной области тяжелой цепи IgG1 или IgG4 (например, IgG1 или IgG4 человека). В одном варианте осуществления константной область тяжелой цепи получена из IgG1 человека или IgG4 человека. В одном варианте осуществления константная область изменена, например, подвергнута мутации для модификации свойств молекулы антитела (например, повышения или снижения одного или нескольких из связывания с рецептором Fc, гликозилирования антител, числа цистеиновых остатков, функции эффекторных клеток или функции комплемента).

[00317] В некоторых вариантах осуществления молекула антитела находится в форме биспецифической или полиспецифической молекулы антитела. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела характеризуется первой специфичностью связывания с PD-1 или PD-L1 и второй специфичностью связывания, например, второй специфичностью связывания с TIM-3, LAG-3 или PD-L2. В одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 или PD-L1 и TIM-3. В другом варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 или PD-L1 и LAG-3. В другом варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 и PD-L1. В еще одном варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с PD-1 и PD-L2. В другом варианте осуществления молекула биспецифического антитела связывается с TIM-3 и LAG-3. Любая комбинация вышеуказанных молекул может быть составлена в молекулу полиспецифического антитела, например, триспецифическое антитело, которое предусматривает первую специфичность связывания с PD-1 или PD-1, а также вторую и третью специфичности связывания с двумя или более из TIM-3, LAG-3 или PD-L2.

[00318] В некоторых вариантах осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-1, например PD-1 человека. В другом варианте осуществления иммуномодулятор представляет собой ингибитор PD-L1, например PD-L1 человека. В одном варианте осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1 представляет собой молекулу антитела к PD-1 или PD-L1. Ингибитор PD-1 или PD-L1 может вводиться отдельно или в комбинации с другими иммуномодуляторами, например, в комбинации с ингибитором LAG-3, TIM-3 или CTLA4. В иллюстративном варианте осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1, например, молекулу антитела к PD-1 или PD-L1, вводят в комбинации с ингибитором LAG-3, например, молекулой антитела к LAG-3. В другом варианте осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1, например, молекулу антитела к PD-1 или PD-L1, вводят в комбинации ингибитором TIM-3, например, молекулой антитела к TIM-3. В других вариантах осуществления ингибитор PD-1 или PD-L1, например, молекулу антитела к PD-1, вводят в комбинации с ингибитором LAG-3, например, молекулой антитела к LAG-3, и ингибитором TIM-3, например, молекулой антитела к TIM-3. Другие комбинации иммуномодуляторов с ингибитором PD-1 (например, с одним или несколькими из PD-L2, CTLA4, TIM3, LAG3, VISTA, BTLA, TIGIT, LAIR1, CD160, 2B4 и/или TGFR) также предусмотрены в пределах настоящего изобретения. Любая из молекул антитела, известная из уровня техники или раскрытая в данном документе, может использоваться в вышеуказанной комбинации ингибиторов молекулы контрольных точек.

[00319] В одном варианте осуществления ингибитор PD-1 представляет собой антитело к PD-1, выбранное из ниволумаба, пембролизумаба или пидилизумаба. В некоторых вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой ниволумаб. К альтернативным названиям ниволумаба относятся MDX-1106, MDX-1106-04, ONO-4538 или BMS-936558. В некоторых вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой ниволумаб (регистрационный номер CAS: 946414-94-4). Ниволумаб представляет собой полностью человеческое моноклональное антитело IgG4, которое специфически блокирует PD1. Ниволумаб (клон 5C4) и другие человеческие моноклональные антитела, которые специфически связываются с PD1, раскрыты в патенте США № 8008449 и PCT-публикации № WO2006/121168.

[00320] В других вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой пембролизумаб. Пембролизумаб (торговое наименование KEYTRUDA, ранее ламбролизумаб, также известный как Merck 3745, MK-3475 или SCH-900475) представляет собой гуманизированное моноклональное антитело IgG4, которое связывается с PD1. Пембролизумаб раскрыт, например, в Hamid, O. et al. (2013) New England Journal of Medicine 369 (2): 134-44, PCT-публикации № WO2009/114335 и патенте США № 8354509.

[00321] В некоторых вариантах осуществления антитело к PD-1 представляет собой пидилизумаб. Пидилизумаб (CT-011; Cure Tech) представляет собой гуманизированное моноклональное антитело IgG1k, которое связывается с PD1. Пидилизумаб и другие гуманизированные моноклональные антитела к PD-1 раскрыты в PCT-публикации № WO2009/101611. Другие антитела к PD1 раскрыты в патенте США № 8609089, публикации заявки на патент США № 2010028330 и/или публикации заявки на патент США № 20120114649. Другие антитела к PD1 включают AMP 514 (Amplimmune).

[00322] В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой PDR001 или любое другое антитело к PD-1, раскрытое в WO2015/112900.

[00323] В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой иммуноадгезин (например, иммуноадгезин, содержащий внеклеточную или PD-1-связывающую часть PD-L1 или PD-L2, слитую с константной областью (например, областью Fc последовательности иммуноглобулина). В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-1 представляет собой AMP-224.

[00324] В некоторых вариантах осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой антитело к PD-L1. В некоторых вариантах осуществления ингибитор на основе антитела к PD-L1 выбран из YW243.55.S70, MPDL3280A, MEDI-4736 или MDX-1105MSB-0010718C (также называемого A09-246-2), раскрытого, например, WO 2013/0179174, и имеет последовательность, раскрытую в данном документе (или последовательность практически идентичную или сходную с ней, например, последовательность, которая характеризуется по меньшей мере 85%, 90%, 95% или более высокой идентичностью с указанной последовательностью).

[00325] В одном варианте осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой MDX-1105. MDX-1105, также известный как BMS-936559, представляет собой антитело к PD-L1, описанное в PCT-публикации № WO2007/005874.

[00326] В одном варианте осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой YW243.55.S70. Антитело YW243.55.S70 представляет собой антитело к PD-L1, описанное в PCT-публикации № WO 2010/077634 (последовательности вариабельных областей тяжелой и легкой цепей показаны под SEQ ID No: 20 и 21, соответственно).

[00327] В одном варианте осуществления ингибитор PD-L1 представляет собой MDPL3280A (Genentech/Roche). MDPL3280A представляет собой человеческое моноклональное антитело IgG1 с оптимизированной Fc, которое связывается с PD-L1. MDPL3280A и другие человеческие моноклональные антитела к PD-L1 раскрыты в патенте США № 7943743 и публикации заявки на патент США № 20120039906.

[00328] В других вариантах осуществления ингибитор PD-L2 представляет собой AMP-224. AMP-224 представляет собой растворимый рецептор на основе слитого белка PD-L2 и Fc, который блокирует взаимодействие между PD1 и B7-H1 (B7-DCIg; Amplimmune; например, раскрытый в PCT-публикациях №№ WO2010/027827 и WO2011/066342).

[00329] В одном варианте осуществления ингибитор LAG-3 представляет собой молекулу антитела к LAG-3. В одном варианте осуществления ингибитор LAG-3 представляет собой BMS-986016.

Фармацевтические композиции

[00330] Для получения фармацевтических или стерильных композиций, содержащих иммуноконъюгаты, иммуноконъюгаты по настоящему изобретению смешивают с фармацевтически приемлемым носителем или вспомогательным веществом. Композиции могут дополнительно содержать один или несколько других терапевтических средств, которые подходят для лечения или предупреждения рака, экспрессирующего CCR7 (в том числе без ограничения хронического лимфоцитарного лейкоза (CLL), периферических T-клеточных лимфом (PTCL), таких как T-клеточный лейкоз/лимфома взрослых (ATLL) и анапластическая крупноклеточная лимфома (ALCL), неходжкинской лимфомы (NHL), такой как лимфома из клеток мантийной зоны (MCL), лимфома Беркитта и диффузная В-крупноклеточная лимфома (DLBCL), карциномы желудка, немелкоклеточного рака легкого, мелкоклеточного рака легкого, рака головы и шеи, носоглоточной карциномы (NPC), рака пищевода, колоректальной карциномы, рака поджелудочной железы, рака щитовидной железы, рака молочной железы, почечноклеточного рака и рака шейки матки).

[00331] Составы терапевтических и диагностических средств могут быть получены путем смешивания с физиологически приемлемыми носителями, вспомогательными веществами или стабилизаторами в форме, например, лиофилизированных порошков, взвесей, водных растворов, лосьонов или суспензий (см., например, Hardman et al., Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, McGraw-Hill, New York, N.Y., 2001; Gennaro, Remington: The Science and Practice of Pharmacy, Lippincott, Williams, and Wilkins, New York, N.Y., 2000; Avis, et al. (eds.), Pharmaceutical Dosage Forms: Parenteral Medications, Marcel Dekker, NY, 1993; Lieberman, et al. (eds.), Pharmaceutical Dosage Forms: tablets, Marcel Dekker, NY, 1990; Lieberman, et al. (eds.) Pharmaceutical Dosage Forms: Disperse Systems, Marcel Dekker, NY, 1990; Weiner and Kotkoskie, Excipient Toxicity and Safety, Marcel Dekker, Inc., New York, N.Y., 2000).

[00332] Выбор схемы введения для терапевтического средства зависит от нескольких факторов, в том числе интенсивности метаболизма сыворотки или ткани для объекта, уровня симптомов, иммуногенности объекта и доступности клеток-мишеней в биологической матрице. В некоторых вариантах осуществления схема введения максимизирует количество терапевтического средства, доставляемого пациенту, в соответствии с приемлемым уровнем побочных эффектов. Соответственно, количество доставляемого биологического средства частично зависит от конкретного объекта и тяжести состояния, подлежащего лечению. Руководства по подбору подходящих доз антител, цитокинов и малых молекул являются доступными (см., например, Wawrzynczak, Antibody Therapy, Bios Scientific Pub. Ltd, Oxfordshire, UK, 1996; Kresina (ed.), Monoclonal Antibodies, Cytokines and Arthritis, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1991; Bach (ed.), Monoclonal Antibodies and Peptide Therapy in Autoimmune Diseases, Marcel Dekker, New York, N.Y., 1993; Baert et al., New Engl. J. Med. 348:601-608, 2003; Milgrom et al., New Engl. J. Med. 341:1966-1973, 1999; Slamon et al., New Engl. J. Med. 344:783-792, 2001; Beniaminovitz et al., New Engl. J. Med. 342:613-619, 2000; Ghosh et al., New Engl. J. Med. 348:24-32, 2003; Lipsky et al., New Engl. J. Med. 343:1594-1602, 2000).

[00333] Определение подходящей дозы выполняет лечащий врач, например, с применением параметров или факторов, которые, как известно или ожидаемо из уровня техники, воздействуют на лечение или предупреждение или, как прогнозируют, воздействуют на лечение или предупреждение. Обычно начинают дозирование с количества, несколько меньшего, чем оптимальная доза, и после этого ее повышают небольшими шагами до тех пор, пока не достигается требуемый или оптимальный эффект по сравнению с любыми отрицательными побочными эффектами. Важные диагностические показатели включают, например, показатели, являющиеся симптомами воспаления, или уровень продуцируемых воспалительных цитокинов.

[00334] Фактические уровни дозы активных ингредиентов в фармацевтических композициях по настоящему изобретению могут варьироваться для того, чтобы получить количество активного ингредиента, которое является эффективным для достижения требуемого терапевтического ответа у конкретного пациента, эффективным в отношении композиции и способа введения, при этом не токсично для пациента. Выбранный уровень дозы будет зависеть от ряда фармакокинетических факторов, в том числе активности конкретных используемых композиций по настоящему изобретению или их сложного эфира, соли или амида, пути введения, времени введения, скорости выведения конкретного используемого соединения, длительности лечения, других лекарственных средств, соединений и/или материалов, применяемых в комбинации с конкретными используемыми композициями, возраста, пола, массы тела, состояния, общего состояния здоровья и анамнеза пациента, подлежащего лечению, и аналогичных факторов, известных в области техники медицины.

[00335] Композиции, содержащие антитела или их фрагменты по настоящему изобретению, могут вводиться в помощью непрерывной инфузии или с помощью доз с интервалами, составляющими, например, один день, одну неделю, или вводиться 1-7 раз в неделю, раз в две недели, раз в три недели, раз в четыре недели, раз в пять недель, раз в шесть недель, раз в семь недель или раз в восемь недель. Дозы могут вводиться внутривенно, подкожно, местно, перорально, назально, ректально, внутримышечно, внутрь мозга или посредством ингаляции. Специфический протокол введения доз является таким, который предусматривает максимальную дозу или частоту введения доз, позволяющие избежать значительных нежелательных побочных эффектов.

[00336] Для иммуноконъюгатов по настоящему изобретению доза, вводимая пациенту, может составлять от 0,0001 мг/кг до 100 мг/кг массы тела пациента. Доза может быть составлять от 0,0001 мг/кг до 30 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 20 мг/кг, от 0,0001 мг/кг и 10 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 5 мг/кг, от 0,0001 до 2 мг/кг, от 0,0001 до 1 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 0,75 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 0,5 мг/кг, от 0,0001 мг/кг до 0,25 мг/кг, от 0,0001 до 0,15 мг/кг, от 0,0001 до 0,10 мг/кг, от 0,001 до 0,5 мг/кг, от 0,01 до 0,25 мг/кг или от 0,01 до 0,10 мг/кг массы тела пациента. Доза антител или их фрагментов по настоящему изобретению может быть рассчитана с применением массы пациента в килограммах (кг), умноженной на подлежащую введению дозу в мг/кг.

[00337] Дозы иммуноконъюгатов по настоящему изобретению могут быть повторными, а введения могут быть разделены менее чем 1 днем, по меньшей мере 1 днем, 2 днями, 3 днями, 5 днями, 10 днями, 15 днями, 30 днями, 45 днями, 2 месяцами, 75 днями, 3 месяцами, 4 месяцами, 5 месяцами или по меньшей мере 6 месяцами. В некоторых вариантах осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению можно давать два раза в неделю, раз в неделю, раз в две недели, раз в три недели, раз в четыре недели или менее часто. В конкретном варианте осуществления дозы иммуноконъюгатов по настоящему изобретению вводятся повторно через каждые 2 недели.

[00338] Эффективное количество для конкретного пациента может варьироваться в зависимости от таких факторов, как подлежащее лечению состояние, общее состояние здоровья пациента, способ, путь и доза введения и тяжесть побочных эффектов (см., например, Maynard et al., A Handbook of SOPs for Good Clinical Practice, Interpharm Press, Boca Raton, Fla., 1996; Dent, Good Laboratory and Good Clinical Practice, Urch Publ., London, UK, 2001).

[00339] Путем введения может быть, например, местное нанесение или нанесение на кожу, инъекция или инфузия посредством подкожного, внутривенного, внутрибрюшинного, внутримозгового, внутримышечного, внутриглазного, внутриартериального, внутриспинномозгового, внутриочагового введения, или системы замедленного высвобождения или имплантат (см., например, Sidman et al., Biopolymers 22:547-556, 1983; Langer et al., J. Biomed. Mater. Res. 15:167-277, 1981; Langer, Chem. Tech. 12:98-105, 1982; Epstein et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 82:3688-3692, 1985; Hwang et al., Proc. Natl. Acad. Sci. USA 77:4030-4034, 1980; патенты США №№ 6350466 и 6316024). При необходимости композиция может также содержать солюбилизирующее средство и местный анестетик, такой как лидокаин, для облегчения боли в месте инъекции, или их оба. Кроме того, также можно использовать ингаляционное введение, например, за счет применения ингалятора или распылителя и состава со средством в виде аэрозоля. См., например, патенты США №№ 6019968, 5985320, 5985309, 5934272, 5874064, 5855913, 5290540 и 4880078; и публикации согласно PCT №№ WO 92/19244, WO 97/32572, WO 97/44013, WO 98/31346 и WO 99/66903, каждый из которых включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.

[00340] Композицию по настоящему изобретению также вводят с помощью одного или нескольких путей введения с применением одного или нескольких из целого ряда способов, известных из уровня техники. Как будет понятно специалисту в данной области техники, путь и/или способ введения будут варьироваться в зависимости от необходимых результатов. Выбранные пути введения иммуноконъюгатов по настоящему изобретению включают внутривенный, внутримышечный, внутрикожный, внутрибрюшинный, подкожный пути введения, введение в спинной мозг или другие парентеральные пути введения, например, с помощью инъекции или инфузии. Парентеральное введение может представлять способы введения, отличные от энтерального и местного введения, обычно производимые с помощью инъекции, и оно охватывает без ограничения внутривенные, внутримышечные, внутриартериальные, интратекальные, внутрикапсульные, интраорбитальные, внутрисердечные, внутрикожные, внутрибрюшинные, транстрахеальные, подкожные, субкутикулярные, внутрисуставные, подкапсулярные, субарахноидальные, интраспинальные, эпидуральные и интрастернальные инъекцию и инфузию. В качестве альтернативы композицию по настоящему изобретению можно вводить посредством отличного от парентерального пути, такого как местный, эпидермальный пути введения или введение через слизистые оболочки, например, интраназально, перорально, вагинально, ректально, сублингвально или местно. В одном варианте осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводят с помощью инфузии. В другом варианте осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводят подкожно.

[00341] Если иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводятся в системе контролируемого высвобождения или замедленного высвобождения, для осуществления контролируемого или замедленного высвобождения может применяться насос (см. Langer, выше; Sefton, CRC Crit. Ref Biomed. Eng. 14:20, 1987; Buchwald et al., Surgery 88:507, 1980; Saudek et al., N. Engl. J. Med. 321:574, 1989). Для осуществления контролируемого или замедленного высвобождения видов терапии по настоящему изобретению могут применяться полимерные материалы (см., например, Medical Applications of Controlled Release, Langer and Wise (eds.), CRC Pres., Boca Raton, Fla., 1974; Controlled Drug Bioavailability, Drug Product Design and Performance, Smolen and Ball (eds.), Wiley, New York, 1984; Ranger and Peppas, J. Macromol. Sci. Rev. Macromol. Chem. 23:61, 1983; см. также Levy et al., Science 228:190, 1985; During et al., Ann. Neurol. 25:351, 1989; Howard et al., J. Neurosurg. 7 1:105, 1989; патент США № 5679377; патент США № 5916597; патент США № 5912015; патент США № 5989463; патент США № 5128326; PCT-публикацию № WO 99/15154 и PCT-публикацию № WO 99/20253. Примеры полимеров, используемых в составах с замедленным высвобождением, включают без ограничения поли(2-гидроксиэтилметакрилат), поли(метилметакрилат), поли(акриловую кислоту), сополимер(этилена и винилацетата), поли(метакриловую кислоту), полигликолиды (PLG), полиангидриды, поли(N-винилпирролидон), поли(виниловый спирт), полиакриламид, поли(этиленгликоль), полилактиды (PLA), сополимеры(лактида и гликолидов) (PLGA) и сложные полиортоэфиры. В одном варианте осуществления полимер, используемый в составе с замедленным высвобождением, является инертным, не содержит выщелачиваемых примесей, стабильный при хранении, стерильный и биологически разлагаемый. Систему контролируемого или замедленного высвобождения можно поместить вблизи профилактической или терапевтической мишени, при этом требуется только часть системной дозы (см., например, Goodson, в Medical Applications of Controlled Release, выше, vol. 2, pp. 115-138, 1984).

[00342] Системы контролируемого высвобождения рассмотрены в обзоре Langer, Science 249:1527-1533, 1990). Любую методику, известную специалисту в данной области техники, можно применять для получения составов с замедленным высвобождением, содержащих один или несколько иммуноконъюгатов по настоящему изобретению. См., например, патент США № 4526938, PCT-публикацию WO 91/05548, PCT-публикацию WO 96/20698, Ning et al., Radiotherapy & Oncology 39:179-189, 1996; Song et al., PDA Journal of Pharmaceutical Science & Technology 50:372-397, 1995; Cleek et al., Pro. Int'l. Symp. Control. Rel. Bioact. Mater. 24:853-854, 1997; и Lam et al., Proc. Int'l. Symp. Control Rel. Bioact. Mater. 24:759-760, 1997, каждый из которых включен в данный документ посредством ссылки во всей своей полноте.

[00343] Если иммуноконъюгаты по настоящему изобретению вводятся местно, они могут быть составлены в форме мази, крема, трансдермального пластыря, лосьона, геля, спрея, аэрозоля, раствора, эмульсии или другой формы, широко известной специалисту в данной области техники. См., например, Remington's Pharmaceutical Sciences and Introduction to Pharmaceutical Dosage Forms, 19th ed., Mack Pub. Co., Easton, Pa. (1995). В случае нераспыляемых местных лекарственных форм обычно используются вязкие-полутвердые или твердые формы, содержащие носитель или одно или несколько вспомогательных веществ, совместимые с местным нанесением и, в некоторых случаях, характеризующиеся динамической вязкостью больше, чем у воды. Подходящие составы включают без ограничения растворы, суспензии, эмульсии, кремы, мази, порошки, линименты, бальзамы и т. п., которые при необходимости стерилизуют или смешивают со вспомогательными средствами (например, консервантами, стабилизаторами, смачивающими средствами, буферами или солями) для воздействия на различные свойства, такие как, например, осмотическое давление. Другие подходящие местные лекарственные формы охватывают распыляемые аэрозольные препараты, где активный ингредиент, в некоторых случаях в комбинации с твердым или жидким инертным носителем, упакован в смеси с летучим веществом под давлением (например, газообразным пропеллентом, таким как фреон) или в бутылке-пульверизаторе. При необходимости в фармацевтические композиции и лекарственные формы также можно добавлять увлажнители или увлажняющие средства. Примеры таких дополнительных ингредиентов широко известны из уровня техники.

[00344] Если композиции, содержащие иммуноконъюгаты, вводят интраназально, они могут быть составлены в форме аэрозоля, спрея, тумана или в форме капель. В частности, в целях удобства профилактические или терапевтические средства для применения согласно настоящему изобретению можно доставлять в форме спрея-аэрозоля из пакетов под давлением или с помощью небулайзера с применением подходящего пропеллента (например, дихлордифторметана, трихлорфторметана, дихлортетрафторэтана, диоксида углерода или другого подходящего газа). В случае аэрозоля под давлением единица дозирования может определяться за счет обеспечения клапана для доставки отмеренного количества. Капсулы и картриджи (например, состоящие из желатина) для применения в ингаляторе или инсуффляторе можно составлять содержащими порошковую смесь соединения и подходящей порошковой основы, такой как лактоза или крахмал.

[00345] Способы совместного введения или лечения с применением второго терапевтического средства, например, цитокина, стероида, химиотерапевтического средства, антибиотика, или облучения, известны из уровня техники (см., например, Hardman et al., (eds.) (2001) Goodman and Gilman's The Pharmacological Basis of Therapeutics, 10^th ed., McGraw-Hill, New York, N.Y.; Poole and Peterson (eds.) (2001) Pharmacotherapeutics for Advanced Practice:A Practical Approach, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.; Chabner and Longo (eds.) (2001) Cancer Chemotherapy and Biotherapy, Lippincott, Williams & Wilkins, Phila., Pa.). Эффективное количество терапевтического средства может снижать симптомы на по меньшей мере 10%; по меньшей мере 20%; по меньшей мере приблизительно 30%; по меньшей мере 40% или по меньшей мере 50%.

[00346] Дополнительные виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства), которые можно применять в комбинации с иммуноконъюгатами по настоящему изобретению, можно применять с интервалом менее 5 минут, с интервалом менее 30 минут, с интервалом 1 час, с интервалом приблизительно 1 час, с интервалом от приблизительно 1 до приблизительно 2 часов, с интервалом от приблизительно 2 часов до приблизительно 3 часов, с интервалом от приблизительно 3 часов до приблизительно 4 часов, с интервалом от приблизительно 4 часов до приблизительно 5 часов, с интервалом от приблизительно 5 часов до приблизительно 6 часов, с интервалом от приблизительно 6 часов до приблизительно 7 часов, с интервалом от приблизительно 7 часов до приблизительно 8 часов, с интервалом от приблизительно 8 часов до приблизительно 9 часов, с интервалом от приблизительно 9 часов до приблизительно 10 часов, с интервалом от приблизительно 10 часов до приблизительно 11 часов, с интервалом от приблизительно 11 часов до приблизительно 12 часов, с интервалом от приблизительно 12 часов до 18 часов, с интервалом от 18 часов до 24 часов, с интервалом от 24 часов до 36 часов, с интервалом от 36 часов до 48 часов, с интервалом от 48 часов до 52 часов, с интервалом от 52 часов до 60 часов, с интервалом от 60 часов до 72 часов, с интервалом от 72 часов до 84 часов, с интервалом от 84 часов до 96 часов или с интервалом от 96 часов до 120 часов от введения иммуноконъюгатов по настоящему изобретению. Два или более видов терапии могут применяться во время одного и того же визита пациента.

[00347] В некоторых вариантах осуществления иммуноконъюгаты по настоящему изобретению могут составляться, чтобы гарантировать точное распределение in vivo. Например, гематоэнцефалический барьер (BBB) не пропускает множество высокогидрофильных соединений. Чтобы гарантировать то, что терапевтические соединения по настоящему изобретению пересекают BBB (при необходимости), их можно составлять, например, в липосомах. Способы изготовления липосомы, см., например, в патентах США №№ 4522811; 5374548 и 5399331. Липосомы могут содержать один или несколько фрагментов, которые селективно транспортируются в специфические клетки или органы, с улучшением тем самым нацеленной доставки лекарственного средства (см., например, Ranade, (1989) J. Clin. Pharmacol. 29:685). Иллюстративные нацеливающие фрагменты включают фолат или биотин (см., например, патент США № 5416016 от Low et al.); маннозиды (Umezawa et al., (1988) Biochem. Biophys. Res. Commun. 153:1038); антитела (Bloeman et al., (1995) FEBS Lett. 357:140; Owais et al., (1995) Antimicrob. Agents Chemother. 39:180); рецептор поверхностно-активного белка A (Briscoe et al., (1995) Am. J. Physiol. 1233:134); p 120 (Schreier et al., (1994) J. Biol. Chem. 269:9090); см. также K. Keinanen; M. L. Laukkanen (1994) FEBS Lett. 346:123; J. J. Killion; I. J. Fidler (1994) Immunomethods 4:273.

[00348] В настоящем изобретении предусмотрены протоколы для введения субъекту, нуждающемуся в этом, фармацевтической композиции, содержащей иммуноконъюгаты по настоящему изобретению, отдельно или в комбинации с другими видами терапии. Виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства) из видов комбинированной терапии по настоящему изобретению могут применяться в отношении субъекта одновременно или последовательно. Терапия (например, профилактические или терапевтические средства) из видов комбинированной терапии по настоящему изобретению также можно вводить циклически. Циклическая терапия предусматривает введение первого средства терапии (например, первого профилактического или терапевтического средства) в течение некоторого периода времени, а затем введение второго средства терапии (например, второго профилактического или терапевтического средства) в течение некоторого периода времени и повторение такого последовательного введения, т. е. цикла, с целью снижения развития устойчивости к одному из видов терапии (например, средствам), для недопущения или снижения побочных эффектов одного из видов терапии (например, средств) и/или для улучшения эффективности видов терапии.

[00349] Виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства) из видов комбинированной терапии по настоящему изобретению могут применяться в отношении субъекта одновременно.

[00350] Термин "одновременно" не ограничивается применением видов терапии (например, профилактических или терапевтических средств) точно в одно и то же время, а скорее означает, что фармацевтическую композицию, содержащую антитела или их фрагменты по настоящему изобретению, вводят субъекту последовательно и в течение временного интервала таким образом, чтобы конъюгаты антитела и лекарственного средства по настоящему изобретению могли действовать вместе с другим(-и) видом(-ами) терапии для обеспечения большей пользы, чем если бы их вводили иным способом. Например, каждый вид терапии может применяться в отношении субъекта в одно и то же время или последовательно в любом порядке в различные моменты времени; однако, если их не применяют в одно и то же время, их следует применять достаточно близко по времени, чтобы обеспечить требуемый терапевтический или профилактический эффект. Каждый вид терапии можно применять в отношении субъекта по отдельности, в любой подходящей форме и с помощью любого подходящего пути. В различных вариантах осуществления виды терапии (например, профилактические или терапевтические средства) применяют в отношении субъекта с интервалом менее 5 минут, с интервалом менее 15 минут, с интервалом менее 30 минут, с интервалом менее 1 часа, с интервалом приблизительно 1 час, с интервалом от приблизительно 1 часа до приблизительно 2 часов, с интервалом от приблизительно 2 часов до приблизительно 3 часов, с интервалом от приблизительно 3 часов до приблизительно 4 часов, с интервалом от приблизительно 4 часов до приблизительно 5 часов, с интервалом от приблизительно 5 часов до приблизительно 6 часов, с интервалом от приблизительно 6 часов до приблизительно 7 часов, с интервалом от приблизительно 7 часов до приблизительно 8 часов, с интервалом от приблизительно 8 часов до приблизительно 9 часов, с интервалом от приблизительно 9 часов до приблизительно 10 часов, с интервалом от приблизительно 10 часов до приблизительно 11 часов, с интервалом от приблизительно 11 часов до приблизительно 12 часов, с интервалом 24 часа, с интервалом 48 часов, с интервалом 72 часа или с интервалом 1 неделя. В других вариантах осуществления два или более видов терапии (например, профилактические или терапевтические средства) применяются во время одного и того же визита пациента.

[00351] Профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту в одной и той же фармацевтической композиции. В качестве альтернативы профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту одновременно в отдельных фармацевтических композициях. Профилактические или терапевтические средства могут вводиться субъекту с помощью одного и того же или различных путей введения. Профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту в одной и той же фармацевтической композиции. В качестве альтернативы профилактические или терапевтические средства из видов комбинированной терапии могут вводиться субъекту одновременно в отдельных фармацевтических композициях. Профилактические или терапевтические средства могут вводиться субъекту с помощью одного и того же или различных путей введения.

Примеры

Пример 1. Получение антител к CCR7

Получение конструкций для экспрессии CCR7 человека, крысы, мыши и яванского макака

[00352] Полноразмерные гены CCR7 человека, яванского макака и мыши синтезировали на основе аминокислотных последовательностей из баз данных GenBank или Uniprot (SEQ ID NO: 97, SEQ ID NO: 99, SEQ ID NO: 101). кДНК-матрицу CCR7 крысы получали посредством генного синтеза на основе сведений об аминокислотной последовательности, полученной с применением мРНК, выделенной из различных тканей крысы (SEQ ID NO: 103). Все синтезированные фрагменты ДНК клонировали в подходящие векторы экспрессии.

Таблица 2. Сведения об аминокислотной и нуклеотидной последовательности CCR7

CCR7 человека SEQ ID NO: 97 mdlgkpmksvlvvallvifqvclcqdevtddyigdnttvdytlfeslcskkdvrnfkawflpimysiicfvgllgnglvvltyiyfkrlktmtdtyllnlavadilflltlpfwaysaakswvfgvhfcklifaiykmsffsgmllllcisidryvaivqavsahrhrarvllisklscvgiwilatvlsipellysdlqrssseqamrcslitehveafitiqvaqmvigflvpllamsfcylviirtllqarnfernkaikviiavvvvfivfqlpyngvvlaqtvanfnitsstcelskqlniaydvtyslacvrccvnpflyafigvkfrndlfklfkdlgclsqeqlrqwsscrhirrssmsveaettttfsp SEQ ID NO: 98 ATGGACCTGGGGAAACCAATGAAAAGCGTGCTGGTGGTGGCTCTCCTTGTCATTTTCCAGGTATGCCTGTGTCAAGATGAGGTCACGGACGATTACATCGGAGACAACACCACAGTGGACTACACTTTGTTCGAGTCTTTGTGCTCCAAGAAGGACGTGCGGAACTTTAAAGCCTGGTTCCTCCCTATCATGTACTCCATCATTTGTTTCGTGGGCCTACTGGGCAATGGGCTGGTCGTGTTGACCTATATCTATTTCAAGAGGCTCAAGACCATGACCGATACCTACCTGCTCAACCTGGCGGTGGCAGACATCCTCTTCCTCCTGACCCTTCCCTTCTGGGCCTACAGCGCGGCCAAGTCCTGGGTCTTCGGTGTCCACTTTTGCAAGCTCATCTTTGCCATCTACAAGATGAGCTTCTTCAGTGGCATGCTCCTACTTCTTTGCATCAGCATTGACCGCTACGTGGCCATCGTCCAGGCTGTCTCAGCTCACCGCCACCGTGCCCGCGTCCTTCTCATCAGCAAGCTGTCCTGTGTGGGCATCTGGATACTAGCCACAGTGCTCTCCATCCCAGAGCTCCTGTACAGTGACCTCCAGAGGAGCAGCAGTGAGCAAGCGATGCGATGCTCTCTCATCACAGAGCATGTGGAGGCCTTTATCACCATCCAGGTGGCCCAGATGGTGATCGGCTTTCTGGTCCCCCTGCTGGCCATGAGCTTCTGTTACCTTGTCATCATCCGCACCCTGCTCCAGGCACGCAACTTTGAGCGCAACAAGGCCATCAAGGTGATCATCGCTGTGGTCGTGGTCTTCATAGTCTTCCAGCTGCCCTACAATGGGGTGGTCCTGGCCCAGACGGTGGCCAACTTCAACATCACCAGTAGCACCTGTGAGCTCAGTAAGCAACTCAACATCGCCTACGACGTCACCTACAGCCTGGCCTGCGTCCGCTGCTGCGTCAACCCTTTCTTGTACGCCTTCATCGGCGTCAAGTTCCGCAACGATCTCTTCAAGCTCTTCAAGGACCTGGGCTGCCTCAGCCAGGAGCAGCTCCGGCAGTGGTCTTCCTGTCGGCACATCCGGCGCTCCTCCATGAGTGTGGAGGCCGAGACCACCACCACCTTCTCCCCA CCR7 яванского макака SEQ ID NO: 99 MDLGKPMKSVLVVALLVIFQVCLCQDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVRNFKAWFLPIMYSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLTLPFWAYSAAKSWVFGVHFCKLIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWILATVLSIPELLYSGLQRSSSEQAMRCSLITEHVEAFITIQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITSSTCELSKQLNIAYDVTYSLACVRCCVNPFLYAFIGVKFRNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQWSSCRHIRRSSMSVEAETTTTFSP SEQ ID NO: 100 ATGGACCTGGGGAAACCAATGAAAAGCGTGCTGGTGGTGGCTCTCCTTGTCATTTTCCAGGTATGCCTGTGTCAAGATGAGGTCACGGACGATTACATCGGAGACAACACCACAGTGGACTACACTTTGTTCGAGTCTTTGTGCTCCAAGAAGGACGTGCGGAACTTTAAAGCCTGGTTCCTCCCTATCATGTACTCCATCATTTGTTTCGTGGGCCTACTGGGCAATGGGCTGGTCGTGTTGACCTATATCTATTTCAAGAGGCTCAAGACCATGACCGATACCTACCTGCTCAACCTGGCGGTGGCAGACATCCTCTTCCTCCTGACCCTTCCCTTCTGGGCCTACAGCGCGGCCAAGTCCTGGGTCTTCGGTGTCCACTTTTGCAAGCTCATCTTTGCCATCTACAAGATGAGCTTCTTCAGTGGCATGCTCCTACTTCTTTGCATCAGCATTGACCGCTACGTGGCCATCGTCCAGGCTGTCTCAGCTCACCGCCACCGTGCCCGCGTCCTTCTCATCAGCAAGCTGTCCTGTGTGGGCATCTGGATACTAGCCACAGTGCTCTCCATCCCAGAGCTCCTGTACAGTGGCCTCCAGAGGAGCAGCAGTGAGCAAGCGATGCGATGCTCTCTCATCACAGAGCATGTGGAGGCCTTTATCACCATCCAGGTGGCCCAGATGGTGATCGGCTTTCTGGTCCCCCTGCTGGCCATGAGCTTCTGTTACCTTGTCATCATCCGCACCCTGCTCCAGGCACGCAACTTTGAGCGCAACAAGGCCATCAAGGTGATCATCGCTGTGGTCGTGGTCTTCATAGTCTTCCAGCTGCCCTACAATGGGGTGGTCCTGGCCCAGACGGTGGCCAACTTCAACATCACCAGTAGCACCTGTGAGCTCAGTAAGCAACTCAACATCGCCTACGACGTCACCTACAGCCTGGCCTGCGTCCGCTGCTGCGTCAACCCTTTCTTGTACGCCTTCATCGGCGTCAAGTTCCGCAACGATCTCTTCAAGCTCTTCAAGGACCTGGGCTGCCTCAGCCAGGAGCAGCTCCGGCAGTGGTCTTCCTGTCGGCACATCCGGCGCTCCTCCATGAGTGTGGAGGCCGAGACCACCACCACCTTCTCCCCA CCR7 мыши SEQ ID NO: 101 MDPGKPRKNVLVVALLVIFQVCFCQDEVTDDYIGENTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPLMYSVICFVGLLGNGLVILTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLLILPFWAYSEAKSWIFGVYLCKGIFGIYKLSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCVGIWMLALFLSIPELLYSGLQKNSGEDTLRCSLVSAQVEALITIQVAQMVFGFLVPMLAMSFCYLIIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFIVFQLPYNGVVLAQTVANFNITNSSCETSKQLNIAYDVTYSLASVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRHWSSCRHVRNASVSMEAETTTTFSP SEQ ID NO: 102 ATGGACCCAGGGAAACCCAGGAAAAACGTGCTGGTGGTGGCTCTCCTTGTCATTTTCCAGGTGTGCTTCTGCCAAGATGAGGTCACCGATGACTACATCGGCGAGAATACCACGGTGGACTACACCCTGTACGAGTCGGTGTGCTTCAAGAAGGATGTGCGGAACTTTAAGGCCTGGTTCCTGCCTCTCATGTATTCTGTCATCTGCTTCGTGGGCCTGCTCGGCAACGGGCTGGTGATACTGACGTACATCTATTTCAAGAGGCTCAAGACCATGACGGATACCTACCTGCTCAACCTGGCCGTGGCAGACATCCTTTTCCTCCTGATTCTTCCCTTCTGGGCCTACAGCGAAGCCAAGTCCTGGATCTTTGGCGTCTACCTGTGTAAGGGCATCTTTGGCATCTATAAGTTAAGCTTCTTCAGCGGGATGCTGCTGCTCCTATGCATCAGCATTGACCGCTACGTAGCCATCGTCCAGGCCGTGTCGGCTCATCGCCACCGCGCCCGCGTGCTTCTCATCAGCAAGCTGTCCTGTGTGGGCATCTGGATGCTGGCCCTCTTCCTCTCCATCCCGGAGCTGCTCTACAGCGGCCTCCAGAAGAACAGCGGCGAGGACACGCTGAGATGCTCACTGGTCAGTGCCCAAGTGGAGGCCTTGATCACCATCCAAGTGGCCCAGATGGTTTTTGGGTTCCTAGTGCCTATGCTGGCTATGAGTTTCTGCTACCTCATTATCATCCGTACCTTGCTCCAGGCACGCAACTTTGAGCGGAACAAGGCCATCAAGGTGATCATTGCCGTGGTGGTAGTCTTCATAGTCTTCCAGCTGCCCTACAATGGGGTGGTCCTGGCTCAGACGGTGGCCAACTTCAACATCACCAATAGCAGCTGCGAAACCAGCAAGCAGCTCAACATTGCCTATGACGTCACCTACAGCCTGGCCTCCGTCCGCTGCTGCGTCAACCCTTTCTTGTATGCCTTCATCGGCGTCAAGTTCCGCAGCGACCTCTTCAAGCTCTTCAAGGACTTGGGCTGTCTCAGCCAGGAACGGCTCCGGCACTGGTCTTCCTGCCGGCATGTACGGAACGCGTCGGTGAGCATGGAGGCGGAGACCACCACAACCTTCTCCCCG CCR7 крысы SEQ ID NO: 103 MDLGKPTKNVLVVALLVIFQVCFCQDEVTDDYIGENTTVDYTLYESVCFKKDVRNFKAWFLPLMYSVICFVGLLGNGLVVLTYIYFKRLKTMTDTYLLNLAVADILFLMILPFWAYSEAKSWIFGAYLCKSIFGIYKLSFFSGMLLLLCISIDRYVAIVQAVSAHRHRARVLLISKLSCIGIWTLAFFLSIPELLYSGLQKNSGEDTWRCSLVSAQVEALIAIQVAQMVVGFVLPMLAMSFCYLVIIRTLLQARNFERNKAIKVIIAVVVVFVVFQLPYNGVVLAQTVANFNITNSSCEASKQLNIAYDVTYSLASVRCCVNPFLYAFIGVKFRSDLFKLFKDLGCLSQERLRQWSSCRHVRHTSVSMEAETTTTFSP SEQ ID NO: 104 ATGGACCTGGGGAAGCCCACGAAAAACGTGCTGGTGGTGGCTCTCCTGGTCATTTTCCAGGTGTGCTTCTGCCAAGATGAGGTCACAGACGACTACATCGGCGAGAACACCACCGTGGACTACACCCTGTATGAGTCGGTGTGCTTCAAGAAGGATGTGCGGAACTTTAAGGCCTGGTTCCTCCCTCTCATGTACTCAGTCATTTGCTTCGTGGGCCTGCTAGGCAATGGGCTGGTGGTGCTGACATACATCTATTTCAAGAGACTGAAGACCATGACGGATACCTACCTGCTCAACCTGGCCGTGGCAGACATCCTCTTCCTCATGATCCTTCCCTTCTGGGCCTACAGCGAAGCCAAGTCCTGGATCTTTGGTGCCTACCTGTGTAAGAGCATCTTTGGCATCTACAAGTTAAGCTTCTTCAGCGGGATGTTGCTGCTCCTGTGTATCAGCATTGACCGCTATGTGGCCATCGTCCAGGCCGTGTCAGCCCACCGGCACCGCGCCCGCGTGCTTCTCATCAGCAAGCTGTCCTGTATAGGCATCTGGACGCTGGCCTTTTTCCTTTCTATCCCTGAGCTGCTCTACAGCGGCCTCCAGAAGAACAGCGGCGAGGACACGTGGAGATGCTCCCTGGTCAGTGCCCAAGTGGAGGCCTTGATCGCCATCCAAGTGGCCCAGATGGTTGTTGGGTTTGTACTGCCTATGCTGGCTATGAGTTTCTGCTACCTGGTTATCATCCGCACTCTGCTCCAGGCGCGAAACTTCGAGCGGAACAAGGCCATCAAGGTGATCATCGCTGTGGTCGTAGTGTTCGTCGTCTTCCAGCTGCCCTACAATGGGGTGGTCCTGGCCCAGACCGTGGCCAATTTCAACATCACCAATAGCAGCTGCGAAGCCAGCAAGCAGCTCAACATTGCCTATGACGTCACCTACAGCCTGGCCTCCGTCCGCTGCTGTGTCAACCCTTTCTTGTATGCCTTCATCGGCGTCAAGTTCCGCAGCGACCTCTTCAAGCTCTTCAAGGACTTGGGCTGCCTCAGCCAGGAACGGCTCCGGCAGTGGTCTTCCTGCCGCCATGTACGGCACACGTCCGTGAGCATGGAGGCGGAGACTACCACCACCTTCTCCCCG

Получение линий клеток, стабильно экспрессирующих CCR7

[00353] Линии клеток, стабильно экспрессирующих CCR7, получали с применением ретровирусной трансдукции. Клетки 293T подвергали совместной трансфекции ретровирусным вектором экспрессии CCR7 и упаковывающим вектором pCL-Eco или pCL-10A1 (Novus, США, № по кат. NBP2-29540 или NBP2-2952) с применением реагента трансфекции Fugene 6 (Promega, США, № по кат. E2692), следуя рекомендациям производителя. Клетки инкубировали при 37°C в увлажненном CO₂-инкубаторе и вирусный супернатант собирали через 48 часов после трансфекции. Клетки NIH/3T3 и 300.19 выращивали до практически конфлюэнтного монослоя. У клеток удаляли ростовую среду и добавляли вирусный супернатант в присутствии 8 мкг полибрена/мл (конечная концентрация) (EMD Millipore, № по кат. TR-1003-G). После инкубации в течение 3-6 часов при 37°C добавляли свежую среду. Затем клетки культивировали в условиях, подходящих для отбора, с получением линий клеток, стабильно экспрессирующих CCR7.

Получение, экспрессия и очистка вирусоподобных частиц (VLP)

[00354] Клетки HEK293T или NIH/3T3 поддерживали в DMEM с 10% FBS. Для получения VLP клеткам меняли среду на DMEM с 4% FBS, затем подвергали совместной трансфекции плазмидой экспрессии CCR7 и ретровирусной плазмидой экспрессии Gag при соотношении 3:2 в мкг. Через сорок восемь часов после трансфекции клеточный супернатант собирали и просветляли центрифугированием при 2500 × g в течение 5 мин в настольной центрифуге и держали на льду. VLP очищали ультрацентрифугированием при 100000 × g через 20% сахарозную подушку в 38-мл центрифужных пробирках Beckman Ultra-Clear (№ по каталогу 344058) на Ti-роторе Beckman Coulter SW 32 на ультрацентрифуге Sorvall RC 6+. Полученные осадки ресуспендировали в 300 мкл холодного стерильный PBS и подвергали количественной оценке с применением BCA-анализа (Pierce, № по каталогу 23225).

Создание иммуногенного остова CCR7 на основании структуры

[00355] Члены семейства рецепторов, сопряженных с G-белком, представляют собой мембранные белки, которые содержат семь трансмембранных спиральных областей (TM1…TM7), каждая из которых соединена связывающими последовательностями варьирующей длины. Амино-конец белка расположен на внешней стороне клеточной поверхности, это означает, что 4 области белка потенциально находятся на поверхности клетки, амино-конец (N-конец) и 3 области внеклеточных петель (EC1, EC2 и EC3). Таким образом, такие области доступны в качестве антигенов для антител.

[00356] Предполагалось, что комбинацию из одного или нескольких таких 4 элементов, можно будет вставить в остов растворимого белка, чтобы он структурно приблизился к области CCR7, находящейся за пределами клетки.

[00357] Для определения оптимальных внеклеточных областей CCR7 строили модель с применением кристаллической структуры близкого гомолога CXCR4 (Wu et al., "Structures of the CXCR4 chemokine GPCR with small-molecule и cyclic peptide antagonists". (2010) Science 330: 1066-1071), применяя комбинирование структуры CXCR4 записями в базе данных структуры белков (3ODU, 3OE0, 3OE6, 3OE8, 3OE9) и программное обеспечение для моделирования. На основании модели сделали вывод, что аминокислоты, которые расположены между связывающими трансмембранными спиральными областями, находятся на поверхности белка. Данные области идентифицированы в таблице 3 ниже.

Таблица 3. Сведения об аминокислотной и нуклеотидной последовательности иммуногенного остова CCR7

SEQ ID NO: Описание Комментарии 105 CCR7
(NP_001829.1| хемокиновый рецептор типа 7 с мотивом C-C) MDLGKPMKSVLVVALLVIFQV CLCQDEVTDDYIGDNTTVDYT LFESLCSKKDVRNFKAWFLPIM YSIICFVGLLGNGLVVLTYIYFK RLKTMTDTYLLNLAVADILFLL TLPFWAYSAAKSWVFGVHFCK LIFAIYKMSFFSGMLLLLCISIDR YVAIVQAVSAHRHRARVLLISK LSCVGIWILATVLSIPELLYSDL QRSSSEQAMRCSLITEHVEAFIT IQVAQMVIGFLVPLLAMSFCYL VIIRTLLQARNFERNKAIKVIIA VVVVFIVFQLPYNGVVLAQTV ANFNITSSTCELSKQLNIAYDVT YSLACVRCCVNPFLYAFIGVKF RNDLFKLFKDLGCLSQEQLRQ WSSCRHIRRSSMSVEAETTTTF SP CCR7, предшественник.
Внеклеточные области выделены жирным шрифтом.
Области вставки или их производные обозначены жирным шрифтом и подчеркнуты. 106 N-конец QDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVR N-концевая внеклеточная последовательность CCR7 107 EC1 KSWVFGVH Внеклеточная петля 1 CCR7 108 EC2 YSDLQRSSSEQAMRCSLIT Внеклеточная петля 2 CCR7 109 EC3 FNITSST Внеклеточная петля 3 CCR7 110 EC2_C24S YSDLQRSSSEQAMRSSLIT 111 H_MGFTX1 EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSDYGMLWVRQAPEKGLEWIAYISSGSSTIYYADRVKGRFTISRDNAKNTLFLQMTSLRSEDTAMYYCSTGTFAYWGQGTPVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDC Тяжелая цепь остова мышиного Fab 112 L_MGFTX1 DVVMTQNPLSLPVSLGDQASISCRSSQSLIYNNGNTYLHWYRQKPGQSPKLLIYKVSNRFSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYFCSQSTHVPFTFGSGTKLEIKRADAAPTVSIFPPSSEQLTSGGASVVCFLNNFYPKDINVKWKIDGSERQNGVLNSWTDQDSKDSTYSMSSTLTLTKDEYERHNSYTCEATHKTSTSPIVKSFNRNEC Легкая цепь остова мышиного Fab 113 H_FabCCR7M1 QDEVTDDYIGDNTTVDYTLFESLCSKKDVREVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSDYGMLWVRQAPEKGLEWIAYISSGSSTIYYADRVKGRFTISRDNAKNTLFLQMTSLRSEDTAMYYCSTGTYSDLQRSSSEQAMRSSLITFAYWGQGTPVTVSSAKTTPPSVYPLAPGSAAQTNSMVTLGCLVKGYFPEPVTVTWNSGSLSSGVHTFPAVLQSDLYTLSSSVTVPSSTWPSETVTCNVAHPASSTKVDKKIVPRDC Тяжелая цепь Fab с вставленными N-концом и EC2
Вставленные последовательности подчеркнуты и обозначены жирным шрифтом 114 H_FabCCR7M1 CAAGATGAGGTCACGGACGATTACATCGGAGACAACACCACAGTGGACTACACTTTGTTCGAGTCTTTGTGCTCCAAGAAGGACGTGCGGgaggtgcagctggtggagtctggtggtggtctggtcaagcctggaggttccctgaaactgagttgtgccgcatctgggtttacattctctgactacggaatgctgtgggtgaggcaggcaccagagaagggcctggaatggatcgcttatatttccagcggatctagtactatctactatgcagacagggtcaagggccggttcaccattagcagagataacgccaaaaataccctgtttctgcagatgacatcactgaggtccgaggataccgctatgtattattgctccacagggactTACAGTGACCTCCAGAGGAGCAGCAGTGAGCAAGCGATGCGATCCTCTCTCATCACAtttgcttactggggacaggggacacccgtgaccgtcagctcagccaagaccaccccccccagcgtgtaccctctggcccctggctctgccgcccagaccaacagcatggtgaccctgggctgcctggtgaagggctacttccccgagcccgtgaccgtgacctggaacagcggcagcctgagcagcggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcgacctgtacaccctgagcagctctgtgaccgtgcccagcagcacctggcccagcgagaccgtgacatgcaacgtggcccaccccgccagctccaccaaggtggacaagaaaatcgtgccccgggactgc ДНК-последовательность тяжелой цепи HFabCCR7M1. Вставленная последовательность обозначена верхним регистром 115 L_MGFTX1 atgtcgtgatgactcagaatccactgtccctgcctgtgtccctgggcgatcaggcttccattagctgtcgttcctctcagtccctgatctacaacaatggtaacacctacctgcactggtatagacagaagcccggccagtcccctaagctgctgatctacaaagtgagtaataggttctcaggagtcccagaccggttttccggcagcggatctgggaccgatttcacactgaaaatctctagggtggaggccgaagacctgggcgtctacttttgtagtcagagcactcacgtccccttcaccttcggcagcggaacaaaactggaaatcaagcgcgctgatgccgcccctaccgtgagcatcttcccccccagcagcgagcagctgaccagcggcggagccagcgtggtgtgcttcctgaacaacttctaccccaaggacatcaacgtgaagtggaagatcgacggcagcgagcggcagaacggcgtgctgaacagctggaccgaccaggacagcaaggactccacctacagcatgagcagcaccctgaccctgaccaaggacgagtacgagcggcacaacagctacacctgcgaggccacccacaagaccagcaccagccccatcgtgaagagcttcaaccggaacgagtgc ДНК-последовательность L_MGFTX1

[00358] Малый размер петель EC1 и EC3 и пространственное отделение EC3 от остальных трех областей делает приоритетным применение N-конца и петли EC2 в качестве эпитопов-кандидатов.

[00359] Моделирование слияния последовательности N-конца с кристаллической структурой мышиного Fab с последовательностью EC2, вставленной в различные области петель Fab, как, например, в каркасную область 1, CDR-H3 или CDR3-H1, показало, что если степень гибкости для данных двух последовательностей является допустимой, то они могут представлять собой обоснованные приближения для структуры данных областей в CCR7.

Создание иммуногенного остова для иммунизации мышей

[00360] Привитые конструкции для иммунизации мышей создавали путем слияния N-концевой последовательности из таблицы 3 с N-концом тяжелой цепи остова мышиного Fab (обозначенного как MGFTX1) и прививания модифицированного варианта последовательности EC2 с мутацией цистеинового остатка в положении 24 на серин (таблица 3 и подчеркнутые+обозначенные жирным шрифтом последовательности в SEQ ID NO: 113) в CDR3 из остова MGFTX1, затем продуцировали обе тяжелую и легкую цепи из цепей иммуноглобулин для создания конечных белковых конструкций. Таким образом, конструкции, обозначенные как FabCCR7M1, содержали мышиную каркасную область, которая должна характеризоваться иммунной толерантностью при объединении с человеческой последовательностью, на которую был направлен иммунный ответ мыши.

[00361] Последовательность N-конца напрямую сливали с тяжелой цепью остова MGFTX1. Точки для вставки EC2 выбирали так, чтобы она находилась посередине петли CDR, исходя из доступных данных для структурной или гомологичной модели. Белки с привитым Fab получали с применением стандартных методик молекулярной биологии путем использования рекомбинантной ДНК, кодирующей соответствующие последовательности.

[00362] Например, синтезировали вариабельную область каждого антитела, содержащего EC2, вставленную в CDR3 тяжелой цепи. ДНК, кодирующую вариабельную область, амплифицировали с помощью ПЦР и полученный фрагмент субклонировали в вектор, содержащий или константную область легкой цепи, или константную область и область Fc тяжелой цепи. Таким способом получали белки FabCCR7M1 с соответствующим слиянием N-конца и вставкой EC2 в H3. Полученные конструкции показаны в таблице 3. Трансфекции с применением подходящих комбинаций векторов, содержащих тяжелую и легкую цепь, приводят к экспрессии рекомбинантного Fab, содержащего одну молекулу N-конца и одну молекулу EC2.

[00363] Выбор того, какую CDR отбирают для прививания, определяется, исходя из параметров наружного расположения петли и близости к N-концу. В настоящее время программное обеспечение для моделирования только частично применимо для предсказания того, какая CDR и какое местоположение в пределах CDR будут обеспечивать требуемые параметры, что связано с гибкостью петель после проведения слияния и прививания. Структура остова MGFTX1 в комбинации с EC2_C24S (таблица 3, SEQ ID NO: 110) показала, что последовательность находится снаружи и является гибкой, о чем свидетельствует отсутствие электронной плотности у большей части последовательности.

[00364] Подводя итог, точку вставки в CDR выбирали на основе структуры, исходя из предположения, что прививание в CDR будет обеспечивать некоторый уровень структурного подобия с нативным антигеном.

Создание гибридомы

[00365] Трансгенных мышей Bcl-2 (линия C57BL/6-Tgn (bcl-2) 22 WEHI) иммунизировали антигеном с применением процедуры, которая называется "Повторная иммунизация в несколько сайтов" (RIMMS) (McIntyre GD. Hybridoma 1997). Вкратце, мышам инъецировали по 1-3 мкг иммуногена CCR7 в 8 специфических сайтов, близких к периферическим лимфатическим узлам (PLN). Данную процедуру повторяли 8 раз в течение 12-дневного периода. В день 12 собирали образцы крови и титр сывороточных антител анализировали с помощью FACS. В некоторых случаях мышей BALB/c и/или C57Bl/6 иммунизировали с помощью клеток NIH3T3 или 300.19, стабильно свехэкспрессирующих CCR7 человека (SEQ ID NO: 97). Животным инъецировали подкожно 5×10⁶ клеток в PBS один раз в месяц в течение 3 месяцев с последующей внутривенной бустер-инъекцией 25 мкг VLP, экспрессирующих CCR7 человека. Через два дня после бустер-инъекции собирали образцы крови и титр сывороточных антител анализировали с помощью FACS. Селезенки и объединенные PLN извлекали у мышей с высокими титрами. Для сбора лимфоцитов селезенки и PLN промывали дважды с помощью DMEM, а затем разделяли на клетки за счет пропускания через сито с размером ячеек 70 микрон (Falcon, № 352350). Полученные лимфоциты промывали еще 2 раза перед проведением слияния в среде Cytofusion (среда для электропорации BTXpress Cytofusion®, № по кат. 47001).

[00366] Для проведения слияния клетки миеломы F0 смешивали с лимфоцитами при соотношении 1:4. Смесь клеток центрифугировали, суспендировали в среде Cytofusion и затем вносили в камеру для электрослияния (коаксиальная камера 9ML от Harvard Apparatus, изделие № 470020). Электрослияние проводили с соответствии с инструкциями производителя с применением системы для получения гибридом Hybrimune модели CEEF-50B (Cyto Pulse Sciences, Inc). Слитые клетки оставляли для восстановления в течение 5 мин в камере, разбавляли 1/10 в среде для слияния без HAT (DMEM+20% FBS, 1% пенициллина/стрептомицина/глутамина, 1X NEAA, 0,5X HFCS) и помещали при 37°C на один час. Добавляли 4X среду HAT (DMEM+20% FBS, 1% пенициллина/стрептомицина/глутамина, 1X NEAA, 4X HAT, 0,5X HFCS) с получением 1X раствора и плотность доводили до 1,67×10⁴ клеток/мл. Клетки высевали в 384-луночные планшеты из расчета 60 мкл/лунка.

Скрининг с помощью FACS

[00367] Через десять дней после слияния планшеты с гибридомами подвергали скринингу на присутствие CCR7-специфических антител с применением проточной цитометрии для подтверждения специфического связывания антител-кандидатов с линиями клеток, стабильно сверхэкспрессирующими или экспрессирующими эндогенный CCR7. Клетки тщательно ополаскивали PBS и обрабатывали аккутазой (Millipore, № SCR005) для отделения от ростовых планшетов и ресуспендировали в холодном PBS. Клетки метили биотином с флуоресцентным красителем согласно инструкциям производителя (набор для биотинилирования клеточной поверхности FluoReporter, Thermo Fisher Scientific, № по кат. F-20650; стрептавидин PE-Cy7, ThermoFisher Scientific, № по кат. SA1012). Клетки ресуспендировали из расчета примерно 1×10⁶ клеток/мл в буфере FACS (1X DPBS, 3% FBS, 5 мМ EDTA, 0,1% азида натрия). В 384-луночный планшет предварительно вносили по 20 мкл супернатанта гибридом и добавляли 20 мкл клеточной суспензии. Клетки инкубировали в течение 1 часа при 4°C, промывали дважды с помощью холодного буфера FACS и ресуспендировали в 20 мкл вторичного антитела, разведенного 1:400 в буфере FACS (конъюгированный с аллофикоцианином F(ab')2 козы к IgG человека, Fcγ-специфический; Jackson Immunoresearch, № по кат. 109-136-098). После дополнительной инкубации в течение 45 мин при 4°C, клетки промывали дважды с помощью буфера FACS и ресуспендировали в 20 мкл буфера FACS+2 мкг/мл пропидия йодида (Sigma Aldrich, № по кат. P4864-10ML). Геометрическое среднее интенсивности флуоресценции рассчитывали на живых одиночных клетках с применением программного обеспечения FlowJo™.

Очистка антител

[00368] Получали химерные антитела, содержащие мышиные вариабельные области и человеческие константные области. Кроме того, разрабатывали химерные варианты, содержащие цистеиновые мутации (например, цистеины в положении K36°C или в положениях E152C и S375C тяжелой цепи) для конъюгации с фрагментом, представляющим собой лекарственное средство, и получения ADC, описанных более подробно в данном документе. В случае каждой из отобранных гибридом, mAb121G12, mAb506E15, mAb674J13 и mAb684E12, получали ДНК-последовательности вариабельных областей (VH и VL) антител, производимых гибридомами, для создания оптимизированных последовательностей (например, гуманизации, придания предпочтительных характеристик). ДНК вариабельной области из мышиных моноклональных антител амплифицировали с помощью RACE на основе РНК, полученной из каждой отобранной линии клеток гибридомы, с применением стандартных способов. Полипептидные последовательности каждой из мышиных вариабельных областей тяжелой/легкой цепей показаны под SEQ ID NO: 128/SEQ ID NO: 144, SEQ ID NO: 160/SEQ ID NO: 176, SEQ ID NO: 192/SEQ ID NO: 208 и SEQ ID NO: 224/SEQ ID NO: 240, соответственно, для каждой из гибридом 674J13, 121G12, 506E15 и 684E12. Соответствующие производные нуклеотидные последовательности вариабельных областей тяжелой/легкой цепей для каждой из гибридом показаны под SEQ ID NO: 129/SEQ ID NO: 145, SEQ ID NO: 161/SEQ ID NO: 177, SEQ ID NO: 193/SEQ ID NO: 209 и SEQ ID NO: 225/SEQ ID NO: 241. Для получения химерных антител ДНК-последовательности, кодирующие домен VL и VH антитела из гибридомы субклонировали в векторы экспрессии, содержащие соответствующие последовательности человеческой тяжелой цепи дикого типа, или тяжелой цепи с введенным путем конструирования Cys, или тяжелой цепи с мутацией D265A/P329A (DAPA) и последовательность константной области человеческой легкой цепи (IgG1, каппа-цепь).

Гуманизация антител

[00369] Конструкции вариабельных областей подвергали разработке для гуманизации и оптимизации последовательностей (например, удаления посттрансляционных модификаций, нежелательных сайтов и т.д.), для включения цистеиновых мутаций (например, цистеинов в положении K36°C или в положениях E152C и S375C тяжелой цепи), предназначенных для конъюгации фрагмента, представляющего собой лекарственное средство, и получения ADC, описанных более подробно в данном документе; а также для модификации с помощью мутаций эффекторной области Fc (например, мутаций D265A/P329A в области Fc), чтобы обеспечить конструкции, характеризующиеся сниженной эффекторной функцией Fc, и обеспечения их комбинаций.

[00370] ДНК-последовательности, кодирующие гуманизированные домены VL и VH, заказывали в GeneArt (Life Technologies Inc., Регенсбург, Германия), включая оптимизацию кодонов для Cricetulus griseus. Последовательности, кодирующие домены VL и VH, субклонировали из векторов, взятых из GeneArt, в векторы экспрессии, подходящие для продуцирования белка в клетках млекопитающих. Тяжелые и легкие цепи клонировали в отдельные векторы экспрессии для обеспечения возможности совместной трансфекции.

[00371] Рекомбинантные антитела (IgG1, каппа-цепь) получали за счет совместной трансфекции векторов в экспрессирующие клетки Freestyle™ 293 (Invitrogen, США) с применением PEI (полиэтиленимин, MW 25000, линейный, Polysciences, США, № по кат. 23966) в качестве реагента для трансфекции. Исходный раствор PEI готовили растворением 1 г PEI в 900 мл воды, подходящей для культивирования клеток, при комнатной температуре (RT). Для облегчения растворения PEI раствор подкисляли добавлением HCl до pH 3-5 с последующей нейтрализацией с помощью NaOH с получением конечного pH, составляющего 7,05. Наконец, объем доводили до 1 л и раствор стерилизовали фильтрацией через фильтр с размером пор 0,22 мкм, разделяли на аликвоты и замораживали при -80°C до дальнейшего применения.

[00372] Клетки Freestyle™ 293 (Gibco™, ThermoFisher scientific, USA, № по кат. R79007) культивировали в среде Freestyle™ 293 (Gibco™, ThermoFisher scientific, США, № по кат. 12338018) во встряхиваемых колбах (Corning, Тьюксбери, Массачусетс) на орбитальном шейкере (100-120 об/мин) при 37°C в увлажненном инкубаторе при 5% CO₂. В случае временных трансфекций клетки выращивали до плотности примерно 3×10⁶ клеток/мл, а затем 1 мкг стерилизованной фильтрацией ДНК/мл культуры (0,5 мкг тяжелой цепи+0,5 мкг легкой цепи) добавляли в раствор 2 мкг PEI/1 мкг ДНК в OptiMem (ThermoFisher Scientific, США, #11058021) и инкубировали при RT в течение 8 минут. Смесь добавляли к клеткам Freestyle™ 293 по каплям с аккуратным перемешиванием круговыми движениями. После трансфекции клетки культивировали в течение одной-двух недель до проведения очистки антитела от супернатанта. Чтобы создать стабильные линии клеток для продуцирования антител, векторы трансфицировали совместно с помощью нуклеофекции (Nucleofector™ 96-well shuttle™; Lonza) в клетки CHO с применением рекомендаций производителя и их культивировали в условиях отбора в течение не более четырех недель во встряхиваемых колбах. Клетки собирали центрифугированием, а супернатант извлекали для очистки антитела. Антитело очищали с применением колонок с белком A, белком G или MabSelect SuRe (GE Healthcare Life Sciences). Перед загрузкой супернатанта смолу уравновешивали с помощью PBS. После связывания образца колонку промывали с помощью PBS и антитело элюировали с помощью буфера для элюирования IgG Thermo (Pierce), pH 2,8 (№ по кат. 21004). Элюированные фракции нейтрализовали с помощью буфера на основе дегидрата трехосновного цитрата натрия, pH 8,5 (Sigma Aldrich, № по кат. S4641-1Kg), и затем диализировали в течение ночи в PBS, pH 7,2.

Краткое описание антител

[00373] В таблице 4 изложены соответствующие сведения о последовательности исходных и гуманизированных антител к CCR7, происходящих из мышиных гибридомных антител. На всем протяжении данной заявки при описании антител термины "гибридомное" и "исходное" используются взаимозаменяемо и относятся к Ab, которые происходят из гибридомы.

Таблица 4. Сведения об аминокислотной и нуклеотидной последовательности для гибридомных и гуманизированных антител к CCR7

Исходное 674J13, hIgG1 SEQ ID NO: 116 HCDR1 (комбинированная) GYSITSGYSWH SEQ ID NO: 117 HCDR2 (комбинированная) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 118 HCDR3 (комбинированная) GGVQAFAY SEQ ID NO: 119 HCDR1 (Kabat) SGYSWH SEQ ID NO: 120 HCDR2 (Kabat) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 121 HCDR3 (Kabat) GGVQAFAY SEQ ID NO: 122 HCDR1 (Chothia) GYSITSGY SEQ ID NO: 123 HCDR2 (Chothia) HSSGS SEQ ID NO: 124 HCDR3 (Chothia) GGVQAFAY SEQ ID NO: 125 HCDR1 (IMGT) GYSITSGYS SEQ ID NO: 126 HCDR2 (IMGT) IHSSGST SEQ ID NO: 127 HCDR3 (IMGT) ARGGVQAFAY SEQ ID NO: 128 VH DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSGYSWHWIRQFPGNKLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRISIIRDTSKNLFFLQLNSVTTEDTATYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSA SEQ ID NO: 129 ДНК VH GATGTGCAGCTTCAGGAGTCAGGACCTGACCTGGTGAAACCTTCTCAGTCACTTTCACTCACCTGCACTGTCACTGGCTACTCCATCACCAGTGGTTATAGCTGGCACTGGATCCGGCAGTTTCCAGGAAACAAACTGGAGTGGATGGCCCACATCCACTCCAGTGGTAGCACTAACTACAACCCATCTCTCAAAAGTCGCATCTCTATCATTCGAGACACATCCAAGAACCTGTTCTTCCTGCAGTTGAATTCTGTGACTACTGAGGACACAGCCACATATTACTGTGCAAGAGGGGGGGTACAGGCCTTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTCACTGTCTCTGCA SEQ ID NO: 130 Тяжелая цепь (Fc WT) DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSGYSWHWIRQFPGNKLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRISIIRDTSKNLFFLQLNSVTTEDTATYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 131 ДНК тяжелой цепи gatgtgcagcttcaggagtcaggacctgacctggtgaaaccttctcagtcactttcactcacctgcactgtcactggctactccatcaccagtggttatagctggcactggatccggcagtttccaggaaacaaactggagtggatggcccacatccactccagtggtagcactaactacaacccatctctcaaaagtcgcatctctatcattcgagacacatccaagaacctgttcttcctgcagttgaattctgtgactactgaggacacagccacatattactgtgcaagagggggggtacaggcctttgcttactggggccaagggactctggtcactgtctctgcaGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGACGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGCCAGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 132 LCDR1 (комбинированная) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 133 LCDR2 (комбинированная) DTSKLAS SEQ ID NO: 134 LCDR3 (комбинированная) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 135 LCDR1 (Kabat) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 136 LCDR2 (Kabat) DTSKLAS SEQ ID NO: 137 LCDR3 (Kabat) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 138 LCDR1 (Chothia) SSSVIY SEQ ID NO: 139 LCDR2 (Chothia) DTS SEQ ID NO: 140 LCDR3 (Chothia) WSSNPL SEQ ID NO: 141 LCDR1 (IMGT) SSVIY SEQ ID NO: 142 LCDR2 (IMGT) DTS SEQ ID NO: 143 LCDR3 (IMGT) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 144 VL QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSVIYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSSNPLTFGAGTTLELK SEQ ID NO: 145 ДНК VL CAAATTGTCCTCACCCAGTCTCCAGCAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTCACCATGACCTGCAGTGCCAGTTCAAGTGTAATTTACATGCACTGGTACCAGCAGAAGTCAGGCACCTCCCCCAAAAGATGGATTTATGACACATCCAAACTGGCTTCTGGAGTCCCTGCTCGCTTCAGTGGTAGTGGGTCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCAGCATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAGTGGAGTAGTAACCCGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCACGTTGGAGCTGAAA SEQ ID NO: 146 Легкая цепь QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSVIYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSSNPLTFGAGTTLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 147 ДНК легкой цепи CAAATTGTCCTCACCCAGTCTCCAGCAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTCACCATGACCTGCAGTGCCAGTTCAAGTGTAATTTACATGCACTGGTACCAGCAGAAGTCAGGCACCTCCCCCAAAAGATGGATTTATGACACATCCAAACTGGCTTCTGGAGTCCCTGCTCGCTTCAGTGGTAGTGGGTCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCAGCATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAGTGGAGTAGTAACCCGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCACGTTGGAGCTGAAACGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 121G12, hIgG1 SEQ ID NO: 148 HCDR1 (комбинированная) GFTFSTYAMS SEQ ID NO: 149 HCDR2 (комбинированная) TISDGGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 150 HCDR3 (комбинированная) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 151 HCDR1 (Kabat) TYAMS SEQ ID NO: 152 HCDR2 (Kabat) TISDGGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 153 HCDR3 (Kabat) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 154 HCDR1 (Chothia) GFTFSTY SEQ ID NO: 155 HCDR2 (Chothia) SDGGSY SEQ ID NO: 156 HCDR3 (Chothia) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 157 HCDR1 (IMGT) GFTFSTYA SEQ ID NO: 158 HCDR2 (IMGT) ISDGGSYS SEQ ID NO: 159 HCDR3 (IMGT) ARRGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 160 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSTYAMSWVRQTPEKRLEWVATISDGGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNNLYLQMSHLKSEDTAMYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTSVTVSS SEQ ID NO: 161 ДНК VH GAAGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTACCTATGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAAAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTGATGGTGGTAGTTATTCGTACTATCCAGACAATGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACAACCTATACCTGCAAATGAGCCATCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACGAGGTAGTAGGTACGAAGAGTACTATGTTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCA SEQ ID NO: 162 Тяжелая цепь
(Fc WT) EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSTYAMSWVRQTPEKRLEWVATISDGGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNNLYLQMSHLKSEDTAMYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTSVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 163 ДНК тяжелой цепи GAAGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTACCTATGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAAAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTGATGGTGGTAGTTATTCGTACTATCCAGACAATGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACAACCTATACCTGCAAATGAGCCATCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACGAGGTAGTAGGTACGAAGAGTACTATGTTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCAGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGACGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGCCAGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 164 LCDR1 (комбинированная) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 165 LCDR2 (комбинированная) YASQSIS SEQ ID NO: 166 LCDR3 (комбинированная) QQSNSWLT SEQ ID NO: 167 LCDR1 (Kabat) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 168 LCDR2 (Kabat) YASQSIS SEQ ID NO: 169 LCDR3 (Kabat) QQSNSWLT SEQ ID NO: 170 LCDR1 (Chothia) SQSISNN SEQ ID NO: 171 LCDR2 (Chothia) YAS SEQ ID NO: 172 LCDR3 (Chothia) SNSWL SEQ ID NO: 173 LCDR1 (IMGT) QSISNN SEQ ID NO: 174 LCDR2 (IMGT) YAS SEQ ID NO: 175 LCDR3 (IMGT) QQSNSWLT SEQ ID NO: 176 VL DIVLTQSPATLSVTPGDSVSLSCRASQSISNNLHWYQQKSHESPKLLIKYASQSISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVETEDFGMYFCQQSNSWLTFGAGTKLGLK SEQ ID NO: 177 ДНК VL GATATTGTGCTAACTCAGTCTCCAGCCACCCTGTCTGTGACTCCAGGAGATAGCGTCAGTCTTTCCTGCAGGGCCAGCCAAAGTATTAGCAACAACCTACACTGGTATCAACAGAAATCACATGAGTCTCCAAAACTTCTCATCAAGTATGCTTCCCAGTCCATCTCTGGGATCCCCTCCAGGTTCAGTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACTCTCAGTATCAACAGTGTGGAGACTGAAGATTTTGGAATGTATTTCTGTCAACAGAGTAACAGCTGGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGGGCTGAAA SEQ ID NO: 178 Легкая цепь DIVLTQSPATLSVTPGDSVSLSCRASQSISNNLHWYQQKSHESPKLLIKYASQSISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVETEDFGMYFCQQSNSWLTFGAGTKLGLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 179 ДНК легкой цепи GATATTGTGCTAACTCAGTCTCCAGCCACCCTGTCTGTGACTCCAGGAGATAGCGTCAGTCTTTCCTGCAGGGCCAGCCAAAGTATTAGCAACAACCTACACTGGTATCAACAGAAATCACATGAGTCTCCAAAACTTCTCATCAAGTATGCTTCCCAGTCCATCTCTGGGATCCCCTCCAGGTTCAGTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACTCTCAGTATCAACAGTGTGGAGACTGAAGATTTTGGAATGTATTTCTGTCAACAGAGTAACAGCTGGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGGGCTGAAACGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 506E15, hIgG1 SEQ ID NO: 180 HCDR1 (комбинированная) GFTFSSYAMS SEQ ID NO: 181 HCDR2 (комбинированная) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 182 HCDR3 (комбинированная) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 183 HCDR1 (Kabat) SYAMS SEQ ID NO: 184 HCDR2 (Kabat) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 185 HCDR3 (Kabat) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 186 HCDR1 (Chothia) GFTFSSY SEQ ID NO: 187 HCDR2 (Chothia) SSGGSF SEQ ID NO: 188 HCDR3 (Chothia) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 189 HCDR1 (IMGT) GFTFSSYA SEQ ID NO: 190 HCDR2 (IMGT) ISSGGSFT SEQ ID NO: 191 HCDR3 (IMGT) ARRASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 192 VH EVMLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSYAMSWIRQTPEKRLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNVKNTLYLQMSSLRSEDTAMYYCARRASTVVGTDFDVWGAGTTVTVSS SEQ ID NO: 193 ДНК VH GAAGTGATGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAGCTATGCCATGTCTTGGATTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATCAGTAGTGGTGGTAGTTTCACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATTTCTAGAGACAATGTCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAAGACACGGCCATGTATTACTGTGCAAGACGGGCTTCTACGGTAGTAGGTACGGACTTCGATGTCTGGGGCGCAGGGACCACGGTCACCGTCTCCTCA SEQ ID NO: 194 Тяжелая цепь
(Fc WT) EVMLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSYAMSWIRQTPEKRLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNVKNTLYLQMSSLRSEDTAMYYCARRASTVVGTDFDVWGAGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 195 ДНК тяжелой цепи GAAGTGATGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAGCTATGCCATGTCTTGGATTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATCAGTAGTGGTGGTAGTTTCACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATTTCTAGAGACAATGTCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAAGACACGGCCATGTATTACTGTGCAAGACGGGCTTCTACGGTAGTAGGTACGGACTTCGATGTCTGGGGCGCAGGGACCACGGTCACCGTCTCCTCAGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGACGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGCCAGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 196 LCDR1 (комбинированная) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 197 LCDR2 (комбинированная) ATSSLDS SEQ ID NO: 198 LCDR3 (комбинированная) LQYASSPPT SEQ ID NO: 199 LCDR1 (Kabat) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 200 LCDR2 (Kabat) ATSSLDS SEQ ID NO: 201 LCDR3 (Kabat) LQYASSPPT SEQ ID NO: 202 LCDR1 (Chothia) SQDIGSS SEQ ID NO: 203 LCDR2 (Chothia) ATS SEQ ID NO: 204 LCDR3 (Chothia) YASSPP SEQ ID NO: 205 LCDR1 (IMGT) QDIGSS SEQ ID NO: 206 LCDR2 (IMGT) ATS SEQ ID NO: 207 LCDR3 (IMGT) LQYASSPPT SEQ ID NO: 208 VL DIQMTQSPSSLSASLGERVSLTCRASQDIGSSLNWLQQEPDGTIKRLIYATSSLDSGVPKRFSGSRSGSDYSLTISSLESEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 209 ДНК VL GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCTTATCTGCCTCTCTGGGAGAAAGAGTCAGTCTCACTTGTCGGGCAAGTCAGGACATTGGTAGTAGCTTAAACTGGCTTCAGCAGGAACCAGATGGAACTATTAAACGCCTGATCTATGCCACATCCAGTTTAGATTCTGGTGTCCCCAAAAGGTTCAGTGGCAGTAGGTCTGGGTCAGATTATTCTCTCACCATCAGCAGCCTTGAGTCTGAAGATTTTGTAGTCTATTACTGTCTACAATATGCTAGTTCGCCTCCGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAA SEQ ID NO: 210 Легкая цепь DIQMTQSPSSLSASLGERVSLTCRASQDIGSSLNWLQQEPDGTIKRLIYATSSLDSGVPKRFSGSRSGSDYSLTISSLESEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 211 ДНК легкой цепи GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCTTATCTGCCTCTCTGGGAGAAAGAGTCAGTCTCACTTGTCGGGCAAGTCAGGACATTGGTAGTAGCTTAAACTGGCTTCAGCAGGAACCAGATGGAACTATTAAACGCCTGATCTATGCCACATCCAGTTTAGATTCTGGTGTCCCCAAAAGGTTCAGTGGCAGTAGGTCTGGGTCAGATTATTCTCTCACCATCAGCAGCCTTGAGTCTGAAGATTTTGTAGTCTATTACTGTCTACAATATGCTAGTTCGCCTCCGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAACGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 684E12, hIgG1 SEQ ID NO: 212 HCDR1 (комбинированная) GFTFSNFAMS SEQ ID NO: 213 HCDR2 (комбинированная) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 214 HCDR3 (комбинированная) RGYDGVDK SEQ ID NO: 215 HCDR1 (Kabat) SNFAMS SEQ ID NO: 216 HCDR2 (Kabat) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 217 HCDR3 (Kabat) RGYDGVDK SEQ ID NO: 218 HCDR1 (Chothia) GFTFSNF SEQ ID NO: 219 HCDR2 (Chothia) STGGTY SEQ ID NO: 220 HCDR3 (Chothia) RGYDGVDK SEQ ID NO: 221 HCDR1 (IMGT) GFTFSNFA SEQ ID NO: 222 HCDR2 (IMGT) ISTGGTYT SEQ ID NO: 223 HCDR3 (IMGT) TRRGYDGVDK SEQ ID NO: 224 VH EVHLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSNFAMSWVRQTPEKRLEWVATISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKKTLYLQMSSLRSEDTAMYYCTRRGYDGVDKWGQGTTLTVSS SEQ ID NO: 225 ДНК VH gaagtgcatctggtggagtctgggggaggcttagtgaagcctggagggtccctgaaactctcctgtgcagcctctggattcactttcagtaactttgccatgtcttgggttcgccagactccggagaagagactggagtgggtcgcaaccattagtactggtggtacttacacctactatccagacagtgtgaagggtcgattcaccatctccagagacaatgccaagaaaaccctgtacctgcaaatgagcagtctgaggtctgaggacacggccatgtattactgtacaagacgggggtacgacggcgtggacaaatggggccaaggcaccactctcacagtctcctca SEQ ID NO: 226 Тяжелая цепь
(Fc WT) EVHLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSNFAMSWVRQTPEKRLEWVATISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKKTLYLQMSSLRSEDTAMYYCTRRGYDGVDKWGQGTTLTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 227 ДНК тяжелой цепи GAAGTGCATCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTACTGGTGGTACTTACACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGTCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAAAACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACACGGCCATGTATTACTGTACAAGACGGGGGTACGACGGCGTGGACAAATGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttccccgagcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggacgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctgccagccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctaccccagcgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 228 LCDR1 (комбинированная) KSGQSLLDSDGKTYLN SEQ ID NO: 229 LCDR2 (комбинированная) LVSKLDS SEQ ID NO: 230 LCDR3 (комбинированная) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 231 LCDR1 (Kabat) KSGQSLLDSDGKTYLN SEQ ID NO: 232 LCDR2 (Kabat) LVSKLDS SEQ ID NO: 233 LCDR3 (Kabat) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 234 LCDR1 (Chothia) GQSLLDSDGKTY SEQ ID NO: 235 LCDR2 (Chothia) LVS SEQ ID NO: 236 LCDR3 (Chothia) GTHFPQ SEQ ID NO: 237 LCDR1 (IMGT) QSLLDSDGKTY SEQ ID NO: 238 LCDR2 (IMGT) LVS SEQ ID NO: 239 LCDR3 (IMGT) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 240 VL DVVMTQTPLTLSVTIGQPASISCKSGQSLLDSDGKTYLNWFLQRPGQSPKRLIYLVSKLDSGVPDRFTGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 241 ДНК VL gatgttgtgatgacccagactccactcactttgtcggttaccattggacaaccagcctccatctcttgcaagtcaggtcagagcctcttagatagtgatggaaagacatatttgaattggtttttacagaggccaggccagtctccaaagcgcctaatctatctggtgtctaaactggactctggagtccctgacaggttcactggcagtggatcagggacagatttcacactgaaaatcagcagagtggaggctgaggatttgggagtttattattgctggcaaggtacacattttcctcagacgttcggtggaggcaccaagctggaaatcaaa SEQ ID NO: 242 Легкая цепь DVVMTQTPLTLSVTIGQPASISCKSGQSLLDSDGKTYLNWFLQRPGQSPKRLIYLVSKLDSGVPDRFTGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 243 ДНК легкой цепи GATGTTGTGATGACCCAGACTCCACTCACTTTGTCGGTTACCATTGGACAACCAGCCTCCATCTCTTGCAAGTCAGGTCAGAGCCTCTTAGATAGTGATGGAAAGACATATTTGAATTGGTTTTTACAGAGGCCAGGCCAGTCTCCAAAGCGCCTAATCTATCTGGTGTCTAAACTGGACTCTGGAGTCCCTGACAGGTTCACTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACACTGAAAATCAGCAGAGTGGAGGCTGAGGATTTGGGAGTTTATTATTGCTGGCAAGGTACACATTTTCCTCAGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagtggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc Исходное 674J13, hIgG1, CysMab SEQ ID NO: 244 HCDR1 (комбинированная) GYSITSGYSWH SEQ ID NO: 245 HCDR2 (комбинированная) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 246 HCDR3 (комбинированная) GGVQAFAY SEQ ID NO: 247 HCDR1 (Kabat) SGYSWH SEQ ID NO: 248 HCDR2 (Kabat) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 249 HCDR3 (Kabat) GGVQAFAY SEQ ID NO: 250 HCDR1 (Chothia) GYSITSGY SEQ ID NO: 251 HCDR2 (Chothia) HSSGS SEQ ID NO: 252 HCDR3 (Chothia) GGVQAFAY SEQ ID NO: 253 HCDR1 (IMGT) GYSITSGYS SEQ ID NO: 254 HCDR2 (IMGT) IHSSGST SEQ ID NO: 255 HCDR3 (IMGT) ARGGVQAFAY SEQ ID NO: 256 VH DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSGYSWHWIRQFPGNKLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRISIIRDTSKNLFFLQLNSVTTEDTATYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSA SEQ ID NO: 257 ДНК VH GATGTGCAGCTTCAGGAGTCAGGACCTGACCTGGTGAAACCTTCTCAGTCACTTTCACTCACCTGCACTGTCACTGGCTACTCCATCACCAGTGGTTATAGCTGGCACTGGATCCGGCAGTTTCCAGGAAACAAACTGGAGTGGATGGCCCACATCCACTCCAGTGGTAGCACTAACTACAACCCATCTCTCAAAAGTCGCATCTCTATCATTCGAGACACATCCAAGAACCTGTTCTTCCTGCAGTTGAATTCTGTGACTACTGAGGACACAGCCACATATTACTGTGCAAGAGGGGGGGTACAGGCCTTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTCACTGTCTCTGCA SEQ ID NO: 258 Тяжелая цепь
(CysMab, мутации подчеркнуты) DVQLQESGPDLVKPSQSLSLTCTVTGYSITSGYSWHWIRQFPGNKLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRISIIRDTSKNLFFLQLNSVTTEDTATYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSAASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVDVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALPAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 259 ДНК тяжелой цепи GATGTGCAGCTTCAGGAGTCAGGACCTGACCTGGTGAAACCTTCTCAGTCACTTTCACTCACCTGCACTGTCACTGGCTACTCCATCACCAGTGGTTATAGCTGGCACTGGATCCGGCAGTTTCCAGGAAACAAACTGGAGTGGATGGCCCACATCCACTCCAGTGGTAGCACTAACTACAACCCATCTCTCAAAAGTCGCATCTCTATCATTCGAGACACATCCAAGAACCTGTTCTTCCTGCAGTTGAATTCTGTGACTACTGAGGACACAGCCACATATTACTGTGCAAGAGGGGGGGTACAGGCCTTTGCTTACTGGGGCCAAGGGACTCTGGTCACTGTCTCTGCAgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttcccctgtcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggacgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctgccagccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctacccctgtgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 260 LCDR1 (комбинированная) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 261 LCDR2 (комбинированная) DTSKLAS SEQ ID NO: 262 LCDR3 (комбинированная) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 263 LCDR1 (Kabat) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 264 LCDR2 (Kabat) DTSKLAS SEQ ID NO: 265 LCDR3 (Kabat) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 266 LCDR1 (Chothia) SSSVIY SEQ ID NO: 267 LCDR2 (Chothia) DTS SEQ ID NO: 268 LCDR3 (Chothia) WSSNPL SEQ ID NO: 269 LCDR1 (IMGT) SSVIY SEQ ID NO: 270 LCDR2 (IMGT) DTS SEQ ID NO: 271 LCDR3 (IMGT) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 272 VL QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSVIYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSSNPLTFGAGTTLELK SEQ ID NO: 273 ДНК VL CAAATTGTCCTCACCCAGTCTCCAGCAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTCACCATGACCTGCAGTGCCAGTTCAAGTGTAATTTACATGCACTGGTACCAGCAGAAGTCAGGCACCTCCCCCAAAAGATGGATTTATGACACATCCAAACTGGCTTCTGGAGTCCCTGCTCGCTTCAGTGGTAGTGGGTCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCAGCATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAGTGGAGTAGTAACCCGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCACGTTGGAGCTGAAA SEQ ID NO: 274 Легкая цепь QIVLTQSPAIMSASPGEKVTMTCSASSSVIYMHWYQQKSGTSPKRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTSYSLTISSMEAEDAATYYCQQWSSNPLTFGAGTTLELKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 275 ДНК легкой цепи CAAATTGTCCTCACCCAGTCTCCAGCAATCATGTCTGCATCTCCAGGGGAGAAGGTCACCATGACCTGCAGTGCCAGTTCAAGTGTAATTTACATGCACTGGTACCAGCAGAAGTCAGGCACCTCCCCCAAAAGATGGATTTATGACACATCCAAACTGGCTTCTGGAGTCCCTGCTCGCTTCAGTGGTAGTGGGTCTGGGACCTCTTACTCTCTCACAATCAGCAGCATGGAGGCTGAAGATGCTGCCACTTATTACTGCCAGCAGTGGAGTAGTAACCCGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCACGTTGGAGCTGAAACGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 674J13, hIgG1, DAPA, CysMab SEQ ID NO: 276 HCDR1 (комбинированная) GYSITSGYSWH SEQ ID NO: 277 HCDR2 (комбинированная) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 278 HCDR3 (комбинированная) GGVQAFAY SEQ ID NO: 279 HCDR1 (Kabat) SGYSWH SEQ ID NO: 280 HCDR2 (Kabat) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 281 HCDR3 (Kabat) GGVQAFAY SEQ ID NO: 282 HCDR1 (Chothia) GYSITSGY SEQ ID NO: 283 HCDR2 (Chothia) HSSGS SEQ ID NO: 284 HCDR3 (Chothia) GGVQAFAY SEQ ID NO: 285 HCDR1 (IMGT) GYSITSGYS SEQ ID NO: 286 HCDR2 (IMGT) IHSSGST SEQ ID NO: 287 HCDR3 (IMGT) ARGGVQAFAY SEQ ID NO: 288 VH DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSGYSWHWIRQHPGKGLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRITISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 289 ДНК VH GACGTGCAGCTGCAGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTGAAACCCTCCCAGACCCTGTCCCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTACTCCATCACCTCCGGCTACAGCTGGCACTGGATCCGGCAGCACCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGATGGCCCACATCCACTCCTCCGGCTCCACCAACTACAACCCCAGCCTGAAGTCCAGAATCACCATCAGCCGGGACACCTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGTCCTCCGTGACCGCCGCTGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGAGGCGGCGTGCAGGCCTTCGCTTATTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 290 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSGYSWHWIRQHPGKGLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRITISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 291 ДНК тяжелой цепи GACGTGCAGCTGCAGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTGAAACCCTCCCAGACCCTGTCCCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTACTCCATCACCTCCGGCTACAGCTGGCACTGGATCCGGCAGCACCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGATGGCCCACATCCACTCCTCCGGCTCCACCAACTACAACCCCAGCCTGAAGTCCAGAATCACCATCAGCCGGGACACCTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGTCCTCCGTGACCGCCGCTGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGAGGCGGCGTGCAGGCCTTCGCTTATTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCTGTCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGGCTGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCTGTGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 292 LCDR1 (комбинированная) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 293 LCDR2 (комбинированная) DTSKLAS SEQ ID NO: 294 LCDR3 (комбинированная) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 295 LCDR1 (Kabat) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 296 LCDR2 (Kabat) DTSKLAS SEQ ID NO: 297 LCDR3 (Kabat) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 298 LCDR1 (Chothia) SSSVIY SEQ ID NO: 299 LCDR2 (Chothia) DTS SEQ ID NO: 300 LCDR3 (Chothia) WSSNPL SEQ ID NO: 301 LCDR1 (IMGT) SSVIY SEQ ID NO: 302 LCDR2 (IMGT) DTS SEQ ID NO: 303 LCDR3 (IMGT) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 304 VL EIVLTQSPATLSASPGERVTMSCSASSSVIYMHWYQQKPGQAPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYTLTISSMEPEDAAVYYCQQWSSNPLTFGQGTKLEIK SEQ ID NO: 305 ДНК VL GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCTGCTAGCCCTGGCGAGCGCGTGACAATGTCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCGTGATCTACATGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCGGTGGATCTACGATACCTCCAAGCTGGCCTCCGGCGTGCCCGCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCATGGAACCCGAGGACGCCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTCCAACCCCCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 306 Легкая цепь EIVLTQSPATLSASPGERVTMSCSASSSVIYMHWYQQKPGQAPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYTLTISSMEPEDAAVYYCQQWSSNPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 307 ДНК легкой цепи GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCTGCTAGCCCTGGCGAGCGCGTGACAATGTCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCGTGATCTACATGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCGGTGGATCTACGATACCTCCAAGCTGGCCTCCGGCGTGCCCGCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCATGGAACCCGAGGACGCCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTCCAACCCCCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 121G12, hIgG1, CysMab SEQ ID NO: 308 HCDR1 (комбинированная) GFTFSTYAMS SEQ ID NO: 309 HCDR2 (комбинированная) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 310 HCDR3 (комбинированная) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 311 HCDR1 (Kabat) TYAMS SEQ ID NO: 312 HCDR2 (Kabat) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 313 HCDR3 (Kabat) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 314 HCDR1 (Chothia) GFTFSTY SEQ ID NO: 315 HCDR2 (Chothia) SDAGSY SEQ ID NO: 316 HCDR3 (Chothia) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 317 HCDR1 (IMGT) GFTFSTYA SEQ ID NO: 318 HCDR2 (IMGT) ISDAGSYS SEQ ID NO: 319 HCDR3 (IMGT) ARRGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 320 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSTYAMSWVRQTPEKRLEWVATISDGGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNNLYLQMSHLKSEDTAMYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTSVTVSS SEQ ID NO: 321 ДНК VH
(CysMab, мутации подчеркнуты) GAAGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTACCTATGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAAAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTGATGGTGGTAGTTATTCGTACTATCCAGACAATGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACAACCTATACCTGCAAATGAGCCATCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACGAGGTAGTAGGTACGAAGAGTACTATGTTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCA SEQ ID NO: 322 Тяжелая цепь
(CysMab, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSTYAMSWVRQTPEKRLEWVATISDGGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNNLYLQMSHLKSEDTAMYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTSVTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpCpvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsreemtknqvsltclvkgfypCdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk SEQ ID NO: 323 ДНК тяжелой цепи GAAGTGCAGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTACCTATGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAAAAGAGGCTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTGATGGTGGTAGTTATTCGTACTATCCAGACAATGTAAAGGGCCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAACAACCTATACCTGCAAATGAGCCATCTGAAGTCTGAGGACACAGCCATGTATTACTGTGCAAGACGAGGTAGTAGGTACGAAGAGTACTATGTTATGGACTACTGGGGTCAAGGAACCTCAGTCACCGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttcccctgtcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggacgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctgccagccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctacccctgtgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 324 LCDR1 (комбинированная) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 325 LCDR2 (комбинированная) YASQSIS SEQ ID NO: 326 LCDR3 (комбинированная) QQSSSWLT SEQ ID NO: 327 LCDR1 (Kabat) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 328 LCDR2 (Kabat) YASQSIS SEQ ID NO: 329 LCDR3 (Kabat) QQSSSWLT SEQ ID NO: 330 LCDR1 (Chothia) SQSISNN SEQ ID NO: 331 LCDR2 (Chothia) YAS SEQ ID NO: 332 LCDR3 (Chothia) SSSWL SEQ ID NO: 333 LCDR1 (IMGT) QSISNN SEQ ID NO: 334 LCDR2 (IMGT) YAS SEQ ID NO: 335 LCDR3 (IMGT) QQSSSWLT SEQ ID NO: 336 VL DIVLTQSPATLSVTPGDSVSLSCRASQSISNNLHWYQQKSHESPKLLIKYASQSISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVETEDFGMYFCQQSNSWLTFGAGTKLGLK SEQ ID NO: 337 ДНК VL GATATTGTGCTAACTCAGTCTCCAGCCACCCTGTCTGTGACTCCAGGAGATAGCGTCAGTCTTTCCTGCAGGGCCAGCCAAAGTATTAGCAACAACCTACACTGGTATCAACAGAAATCACATGAGTCTCCAAAACTTCTCATCAAGTATGCTTCCCAGTCCATCTCTGGGATCCCCTCCAGGTTCAGTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACTCTCAGTATCAACAGTGTGGAGACTGAAGATTTTGGAATGTATTTCTGTCAACAGAGTAACAGCTGGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGGGCTGAAA SEQ ID NO: 338 Легкая цепь DIVLTQSPATLSVTPGDSVSLSCRASQSISNNLHWYQQKSHESPKLLIKYASQSISGIPSRFSGSGSGTDFTLSINSVETEDFGMYFCQQSNSWLTFGAGTKLGLKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 339 ДНК легкой цепи GATATTGTGCTAACTCAGTCTCCAGCCACCCTGTCTGTGACTCCAGGAGATAGCGTCAGTCTTTCCTGCAGGGCCAGCCAAAGTATTAGCAACAACCTACACTGGTATCAACAGAAATCACATGAGTCTCCAAAACTTCTCATCAAGTATGCTTCCCAGTCCATCTCTGGGATCCCCTCCAGGTTCAGTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACTCTCAGTATCAACAGTGTGGAGACTGAAGATTTTGGAATGTATTTCTGTCAACAGAGTAACAGCTGGCTCACGTTCGGTGCTGGGACCAAGCTGGGGCTGAAACGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 121G12, hIgG1, DAPA, CysMab SEQ ID NO: 340 HCDR1 (комбинированная) GFTFSTYAMS SEQ ID NO: 341 HCDR2 (комбинированная) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 342 HCDR3 (комбинированная) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 343 HCDR1 (Kabat) TYAMS SEQ ID NO: 344 HCDR2 (Kabat) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 345 HCDR3 (Kabat) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 346 HCDR1 (Chothia) GFTFSTY SEQ ID NO: 347 HCDR2 (Chothia) SDAGSY SEQ ID NO: 348 HCDR3 (Chothia) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 349 HCDR1 (IMGT) GFTFSTYA SEQ ID NO: 350 HCDR2 (IMGT) ISDAGSYS SEQ ID NO: 351 HCDR3 (IMGT) ARRGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 352 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMSWVRQAPGKGLEWVATISDAGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 353 ДНК VH GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCACCTACGCCATGTCCTGGGTGCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCGACGCCGGCTCCTACTCCTACTACCCCGACAACGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGGCTCCAGATACGAAGAGTACTACGTGATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 354 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMSWVRQAPGKGLEWVATISDAGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 355 ДНК тяжелой цепи GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCACCTACGCCATGTCCTGGGTGCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCGACGCCGGCTCCTACTCCTACTACCCCGACAACGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGGCTCCAGATACGAAGAGTACTACGTGATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCTGTCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGGCTGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCTGTGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 356 LCDR1 (комбинированная) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 357 LCDR2 (комбинированная) YASQSIS SEQ ID NO: 358 LCDR3 (комбинированная) QQSSSWLT SEQ ID NO: 359 LCDR1 (Kabat) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 360 LCDR2 (Kabat) YASQSIS SEQ ID NO: 361 LCDR3 (Kabat) QQSSSWLT SEQ ID NO: 362 LCDR1 (Chothia) SQSISNN SEQ ID NO: 363 LCDR2 (Chothia) YAS SEQ ID NO: 364 LCDR3 (Chothia) SSSWL SEQ ID NO: 365 LCDR1 (IMGT) QSISNN SEQ ID NO: 366 LCDR2 (IMGT) YAS SEQ ID NO: 367 LCDR3 (IMGT) QQSSSWLT SEQ ID NO: 368 VL EIVLTQSPATLSVSPGERVTLSCRASQSISNNLHWYQQKPGQAPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFGVYFCQQSSSWLTFGQGTKLEIK SEQ ID NO: 369 ДНК VL GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCCGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCCTGTCCTGCCGGGCCTCCCAGTCCATCTCCAACAACCTGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCCAGAGCATCTCCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCAGCGTGGAACCCGAGGACTTCGGCGTGTACTTCTGCCAGCAGTCCTCATCCTGGCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 370 Легкая цепь EIVLTQSPATLSVSPGERVTLSCRASQSISNNLHWYQQKPGQAPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFGVYFCQQSSSWLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 371 ДНК легкой цепи GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCCGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCCTGTCCTGCCGGGCCTCCCAGTCCATCTCCAACAACCTGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCCAGAGCATCTCCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCAGCGTGGAACCCGAGGACTTCGGCGTGTACTTCTGCCAGCAGTCCTCATCCTGGCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 506E15, hIgG1, CysMab SEQ ID NO: 372 HCDR1 (комбинированная) GFTFSSYAMS SEQ ID NO: 373 HCDR2 (комбинированная) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 374 HCDR3 (комбинированная) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 375 HCDR1 (Kabat) SYAMS SEQ ID NO: 376 HCDR2 (Kabat) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 377 HCDR3 (Kabat) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 378 HCDR1 (Chothia) GFTFSSY SEQ ID NO: 379 HCDR2 (Chothia) SSGGSF SEQ ID NO: 380 HCDR3 (Chothia) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 381 HCDR1 (IMGT) GFTFSSYA SEQ ID NO: 382 HCDR2 (IMGT) ISSGGSFT SEQ ID NO: 383 HCDR3 (IMGT) ARRASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 384 VH EVMLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSYAMSWIRQTPEKRLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNVKNTLYLQMSSLRSEDTAMYYCARRASTVVGTDFDVWGAGTTVTVSS SEQ ID NO: 385 ДНК VH GAAGTGATGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAGCTATGCCATGTCTTGGATTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATCAGTAGTGGTGGTAGTTTCACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATTTCTAGAGACAATGTCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAAGACACGGCCATGTATTACTGTGCAAGACGGGCTTCTACGGTAGTAGGTACGGACTTCGATGTCTGGGGCGCAGGGACCACGGTCACCGTCTCCTCA SEQ ID NO: 386 Тяжелая цепь
(CysMab, мутации подчеркнуты) EVMLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSSYAMSWIRQTPEKRLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNVKNTLYLQMSSLRSEDTAMYYCARRASTVVGTDFDVWGAGTTVTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpCpvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsreemtknqvsltclvkgfypCdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk SEQ ID NO: 387 ДНК тяжелой цепи GAAGTGATGCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAGCTATGCCATGTCTTGGATTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATCAGTAGTGGTGGTAGTTTCACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGGCGATTCACCATTTCTAGAGACAATGTCAAGAACACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAAGACACGGCCATGTATTACTGTGCAAGACGGGCTTCTACGGTAGTAGGTACGGACTTCGATGTCTGGGGCGCAGGGACCACGGTCACCGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttcccctgtcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggacgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctgccagccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctacccctgtgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 388 LCDR1 (комбинированная) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 389 LCDR2 (комбинированная) ATSSLDS SEQ ID NO: 390 LCDR3 (комбинированная) LQYASSPPT SEQ ID NO: 391 LCDR1 (Kabat) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 392 LCDR2 (Kabat) ATSSLDS SEQ ID NO: 393 LCDR3 (Kabat) LQYASSPPT SEQ ID NO: 394 LCDR1 (Chothia) SQDIGSS SEQ ID NO: 395 LCDR2 (Chothia) ATS SEQ ID NO: 396 LCDR3 (Chothia) YASSPP SEQ ID NO: 397 LCDR1 (IMGT) QDIGSS SEQ ID NO: 398 LCDR2 (IMGT) ATS SEQ ID NO: 399 LCDR3 (IMGT) LQYASSPPT SEQ ID NO: 400 VL DIQMTQSPSSLSASLGERVSLTCRASQDIGSSLNWLQQEPDGTIKRLIYATSSLDSGVPKRFSGSRSGSDYSLTISSLESEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 401 ДНК VL GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCTTATCTGCCTCTCTGGGAGAAAGAGTCAGTCTCACTTGTCGGGCAAGTCAGGACATTGGTAGTAGCTTAAACTGGCTTCAGCAGGAACCAGATGGAACTATTAAACGCCTGATCTATGCCACATCCAGTTTAGATTCTGGTGTCCCCAAAAGGTTCAGTGGCAGTAGGTCTGGGTCAGATTATTCTCTCACCATCAGCAGCCTTGAGTCTGAAGATTTTGTAGTCTATTACTGTCTACAATATGCTAGTTCGCCTCCGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAA SEQ ID NO: 402 Легкая цепь DIQMTQSPSSLSASLGERVSLTCRASQDIGSSLNWLQQEPDGTIKRLIYATSSLDSGVPKRFSGSRSGSDYSLTISSLESEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 403 ДНК легкой цепи GACATCCAGATGACCCAGTCTCCATCCTCCTTATCTGCCTCTCTGGGAGAAAGAGTCAGTCTCACTTGTCGGGCAAGTCAGGACATTGGTAGTAGCTTAAACTGGCTTCAGCAGGAACCAGATGGAACTATTAAACGCCTGATCTATGCCACATCCAGTTTAGATTCTGGTGTCCCCAAAAGGTTCAGTGGCAGTAGGTCTGGGTCAGATTATTCTCTCACCATCAGCAGCCTTGAGTCTGAAGATTTTGTAGTCTATTACTGTCTACAATATGCTAGTTCGCCTCCGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAACGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 506E15, hIgG1, DAPA, CysMab SEQ ID NO: 404 HCDR1 (комбинированная) GFTFSSYAMS SEQ ID NO: 405 HCDR2 (комбинированная) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 406 HCDR3 (комбинированная) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 407 HCDR1 (Kabat) SYAMS SEQ ID NO: 408 HCDR2 (Kabat) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 409 HCDR3 (Kabat) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 410 HCDR1 (Chothia) GFTFSSY SEQ ID NO: 411 HCDR2 (Chothia) SSGGSF SEQ ID NO: 412 HCDR3 (Chothia) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 413 HCDR1 (IMGT) GFTFSSYA SEQ ID NO: 414 HCDR2 (IMGT) ISSGGSFT SEQ ID NO: 415 HCDR3 (IMGT) ARRASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 416 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWIRQAPGKGLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRASTVVGTDFDVWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 417 ДНК VH GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAGCTACGCCATGTCCTGGATCCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCTCCGGCGGCAGCTTCACCTACTACCCCGACAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGCCTCCACCGTCGTGGGAACCGACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 418 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWIRQAPGKGLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRASTVVGTDFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 419 ДНК тяжелой цепи GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAGCTACGCCATGTCCTGGATCCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCTCCGGCGGCAGCTTCACCTACTACCCCGACAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGCCTCCACCGTCGTGGGAACCGACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCTGTCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGGCTGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCTGTGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 420 LCDR1 (комбинированная) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 421 LCDR2 (комбинированная) ATSSLDS SEQ ID NO: 422 LCDR3 (комбинированная) LQYASSPPT SEQ ID NO: 423 LCDR1 (Kabat) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 424 LCDR2 (Kabat) ATSSLDS SEQ ID NO: 425 LCDR3 (Kabat) LQYASSPPT SEQ ID NO: 426 LCDR1 (Chothia) SQDIGSS SEQ ID NO: 427 LCDR2 (Chothia) ATS SEQ ID NO: 428 LCDR3 (Chothia) YASSPP SEQ ID NO: 429 LCDR1 (IMGT) QDIGSS SEQ ID NO: 430 LCDR2 (IMGT) ATS SEQ ID NO: 431 LCDR3 (IMGT) LQYASSPPT SEQ ID NO: 432 VL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTLTCRASQDIGSSLNWLQQKPGKAIKRLIYATSSLDSGVPSRFSGSRSGTDYTLTISSLQPEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 433 ДНК VL GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATAGAGTGACCCTGACCTGCCGGGCCTCCCAGGACATCGGCTCCTCCCTGAACTGGCTGCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCATCAAGCGGCTGATCTACGCCACCTCCTCCCTGGACTCCGGCGTGCCCTCCCGGTTCTCCGGCTCTAGATCCGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGTGGTGTACTACTGCCTGCAGTACGCCTCCAGCCCCCCCACCTTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 434 Легкая цепь DIQMTQSPSSLSASVGDRVTLTCRASQDIGSSLNWLQQKPGKAIKRLIYATSSLDSGVPSRFSGSRSGTDYTLTISSLQPEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 435 ДНК легкой цепи GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATAGAGTGACCCTGACCTGCCGGGCCTCCCAGGACATCGGCTCCTCCCTGAACTGGCTGCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCATCAAGCGGCTGATCTACGCCACCTCCTCCCTGGACTCCGGCGTGCCCTCCCGGTTCTCCGGCTCTAGATCCGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGTGGTGTACTACTGCCTGCAGTACGCCTCCAGCCCCCCCACCTTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Исходное 684E12, hIgG1, CysMab SEQ ID NO: 436 HCDR1 (комбинированная) GFTFSNFAMS SEQ ID NO: 437 HCDR2 (комбинированная) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 438 HCDR3 (комбинированная) RGYDGVDK SEQ ID NO: 439 HCDR1 (Kabat) SNFAMS SEQ ID NO: 440 HCDR2 (Kabat) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 441 HCDR3 (Kabat) RGYDGVDK SEQ ID NO: 442 HCDR1 (Chothia) GFTFSNF SEQ ID NO: 443 HCDR2 (Chothia) STGGTY SEQ ID NO: 444 HCDR3 (Chothia) RGYDGVDK SEQ ID NO: 445 HCDR1 (IMGT) GFTFSNFA SEQ ID NO: 446 HCDR2 (IMGT) ISTGGTYT SEQ ID NO: 447 HCDR3 (IMGT) TRRGYDGVDK SEQ ID NO: 448 VH EVHLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSNFAMSWVRQTPEKRLEWVATISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKKTLYLQMSSLRSEDTAMYYCTRRGYDGVDKWGQGTTLTVSS SEQ ID NO: 449 ДНК VH GAAGTGCATCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTACTGGTGGTACTTACACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGTCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAAAACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACACGGCCATGTATTACTGTACAAGACGGGGGTACGACGGCGTGGACAAATGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCA SEQ ID NO: 450 Тяжелая цепь
(CysMab, мутации подчеркнуты) EVHLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSNFAMSWVRQTPEKRLEWVATISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKKTLYLQMSSLRSEDTAMYYCTRRGYDGVDKWGQGTTLTVSSastkgpsvfplapsskstsggtaalgclvkdyfpCpvtvswnsgaltsgvhtfpavlqssglyslssvvtvpssslgtqtyicnvnhkpsntkvdkrvepkscdkthtcppcpapellggpsvflfppkpkdtlmisrtpevtcvvvdvshedpevkfnwyvdgvevhnaktkpreeqynstyrvvsvltvlhqdwlngkeykckvsnkalpapiektiskakgqprepqvytlppsreemtknqvsltclvkgfypCdiavewesngqpennykttppvldsdgsfflyskltvdksrwqqgnvfscsvmhealhnhytqkslslspgk SEQ ID NO: 451 ДНК тяжелой цепи
(CysMab, мутации подчеркнуты) GAAGTGCATCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTACTGGTGGTACTTACACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGTCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAAAACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACACGGCCATGTATTACTGTACAAGACGGGGGTACGACGGCGTGGACAAATGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttcccctgtcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggacgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctgccagccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctacccctgtgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 452 LCDR1 (комбинированная) KSGQSLLDSDGKTYLN SEQ ID NO: 453 LCDR2 (комбинированная) LVSKLDS SEQ ID NO: 454 LCDR3 (комбинированная) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 455 LCDR1 (Kabat) KSGQSLLDSDGKTYLN SEQ ID NO: 456 LCDR2 (Kabat) LVSKLDS SEQ ID NO: 457 LCDR3 (Kabat) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 458 LCDR1 (Chothia) GQSLLDSDGKTY SEQ ID NO: 459 LCDR2 (Chothia) LVS SEQ ID NO: 460 LCDR3 (Chothia) GTHFPQ SEQ ID NO: 461 LCDR1 (IMGT) QSLLDSDGKTY SEQ ID NO: 462 LCDR2 (IMGT) LVS SEQ ID NO: 463 LCDR3 (IMGT) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 464 VL DVVMTQTPLTLSVTIGQPASISCKSGQSLLDSDGKTYLNWFLQRPGQSPKRLIYLVSKLDSGVPDRFTGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 465 ДНК VL gatgttgtgatgacccagactccactcactttgtcggttaccattggacaaccagcctccatctcttgcaagtcaggtcagagcctcttagatagtgatggaaagacatatttgaattggtttttacagaggccaggccagtctccaaagcgcctaatctatctggtgtctaaactggactctggagtccctgacaggttcactggcagtggatcagggacagatttcacactgaaaatcagcagagtggaggctgaggatttgggagtttattattgctggcaaggtacacattttcctcagacgttcggtggaggcaccaagctggaaatcaaa SEQ ID NO: 466 Легкая цепь DVVMTQTPLTLSVTIGQPASISCKSGQSLLDSDGKTYLNWFLQRPGQSPKRLIYLVSKLDSGVPDRFTGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 467 ДНК легкой цепи GATGTTGTGATGACCCAGACTCCACTCACTTTGTCGGTTACCATTGGACAACCAGCCTCCATCTCTTGCAAGTCAGGTCAGAGCCTCTTAGATAGTGATGGAAAGACATATTTGAATTGGTTTTTACAGAGGCCAGGCCAGTCTCCAAAGCGCCTAATCTATCTGGTGTCTAAACTGGACTCTGGAGTCCCTGACAGGTTCACTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACACTGAAAATCAGCAGAGTGGAGGCTGAGGATTTGGGAGTTTATTATTGCTGGCAAGGTACACATTTTCCTCAGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagtggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc Исходное 684E12, hIgG1, DAPA, CysMab SEQ ID NO: 468 HCDR1 (комбинированная) GFTFSNFAMS SEQ ID NO: 469 HCDR2 (комбинированная) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 470 HCDR3 (комбинированная) RGYDGVDK SEQ ID NO: 471 HCDR1 (Kabat) SNFAMS SEQ ID NO: 472 HCDR2 (Kabat) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 473 HCDR3 (Kabat) RGYDGVDK SEQ ID NO: 474 HCDR1 (Chothia) GFTFSNF SEQ ID NO: 475 HCDR2 (Chothia) STGGTY SEQ ID NO: 476 HCDR3 (Chothia) RGYDGVDK SEQ ID NO: 477 HCDR1 (IMGT) GFTFSNFA SEQ ID NO: 478 HCDR2 (IMGT) ISTGGTYT SEQ ID NO: 479 HCDR3 (IMGT) TRRGYDGVDK SEQ ID NO: 480 VH EVHLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSNFAMSWVRQTPEKRLEWVATISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKKTLYLQMSSLRSEDTAMYYCTRRGYDGVDKWGQGTTLTVSS SEQ ID NO: 481 ДНК VH GAAGTGCATCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTACTGGTGGTACTTACACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGTCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAAAACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACACGGCCATGTATTACTGTACAAGACGGGGGTACGACGGCGTGGACAAATGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCA SEQ ID NO: 482 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) EVHLVESGGGLVKPGGSLKLSCAASGFTFSNFAMSWVRQTPEKRLEWVATISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKKTLYLQMSSLRSEDTAMYYCTRRGYDGVDKWGQGTTLTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 483 ДНК тяжелой цепи GAAGTGCATCTGGTGGAGTCTGGGGGAGGCTTAGTGAAGCCTGGAGGGTCCCTGAAACTCTCCTGTGCAGCCTCTGGATTCACTTTCAGTAACTTTGCCATGTCTTGGGTTCGCCAGACTCCGGAGAAGAGACTGGAGTGGGTCGCAACCATTAGTACTGGTGGTACTTACACCTACTATCCAGACAGTGTGAAGGGTCGATTCACCATCTCCAGAGACAATGCCAAGAAAACCCTGTACCTGCAAATGAGCAGTCTGAGGTCTGAGGACACGGCCATGTATTACTGTACAAGACGGGGGTACGACGGCGTGGACAAATGGGGCCAAGGCACCACTCTCACAGTCTCCTCAgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttcccctgtcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggccgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctggctgccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctacccctgtgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 484 LCDR1 (комбинированная) KSGQSLLDSDGKTYLN SEQ ID NO: 485 LCDR2 (комбинированная) LVSKLDS SEQ ID NO: 486 LCDR3 (комбинированная) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 487 LCDR1 (Kabat) KSGQSLLDSDGKTYLN SEQ ID NO: 488 LCDR2 (Kabat) LVSKLDS SEQ ID NO: 489 LCDR3 (Kabat) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 490 LCDR1 (Chothia) GQSLLDSDGKTY SEQ ID NO: 491 LCDR2 (Chothia) LVS SEQ ID NO: 492 LCDR3 (Chothia) GTHFPQ SEQ ID NO: 493 LCDR1 (IMGT) QSLLDSDGKTY SEQ ID NO: 494 LCDR2 (IMGT) LVS SEQ ID NO: 495 LCDR3 (IMGT) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 496 VL DVVMTQTPLTLSVTIGQPASISCKSGQSLLDSDGKTYLNWFLQRPGQSPKRLIYLVSKLDSGVPDRFTGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 497 ДНК VL gatgttgtgatgacccagactccactcactttgtcggttaccattggacaaccagcctccatctcttgcaagtcaggtcagagcctcttagatagtgatggaaagacatatttgaattggtttttacagaggccaggccagtctccaaagcgcctaatctatctggtgtctaaactggactctggagtccctgacaggttcactggcagtggatcagggacagatttcacactgaaaatcagcagagtggaggctgaggatttgggagtttattattgctggcaaggtacacattttcctcagacgttcggtggaggcaccaagctggaaatcaaa SEQ ID NO: 498 Легкая цепь DVVMTQTPLTLSVTIGQPASISCKSGQSLLDSDGKTYLNWFLQRPGQSPKRLIYLVSKLDSGVPDRFTGSGSGTDFTLKISRVEAEDLGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 499 ДНК легкой цепи GATGTTGTGATGACCCAGACTCCACTCACTTTGTCGGTTACCATTGGACAACCAGCCTCCATCTCTTGCAAGTCAGGTCAGAGCCTCTTAGATAGTGATGGAAAGACATATTTGAATTGGTTTTTACAGAGGCCAGGCCAGTCTCCAAAGCGCCTAATCTATCTGGTGTCTAAACTGGACTCTGGAGTCCCTGACAGGTTCACTGGCAGTGGATCAGGGACAGATTTCACACTGAAAATCAGCAGAGTGGAGGCTGAGGATTTGGGAGTTTATTATTGCTGGCAAGGTACACATTTTCCTCAGACGTTCGGTGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAAcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagtggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc Гуманизированное 674J13, hIgG1, DAPA SEQ ID NO: 500 HCDR1 (комбинированная) GYSITSGYSWH SEQ ID NO: 501 HCDR2 (комбинированная) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 502 HCDR3 (комбинированная) GGVQAFAY SEQ ID NO: 503 HCDR1 (Kabat) SGYSWH SEQ ID NO: 504 HCDR2 (Kabat) HIHSSGSTNYNPSLKS SEQ ID NO: 505 HCDR3 (Kabat) GGVQAFAY SEQ ID NO: 506 HCDR1 (Chothia) GYSITSGY SEQ ID NO: 507 HCDR2 (Chothia) HSSGS SEQ ID NO: 508 HCDR3 (Chothia) GGVQAFAY SEQ ID NO: 509 HCDR1 (IMGT) GYSITSGYS SEQ ID NO: 510 HCDR2 (IMGT) IHSSGST SEQ ID NO: 511 HCDR3 (IMGT) ARGGVQAFAY SEQ ID NO: 512 VH DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSGYSWHWIRQHPGKGLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRITISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSS SEQ ID NO: 513 ДНК VH GACGTGCAGCTGCAGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTGAAACCCTCCCAGACCCTGTCCCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTACTCCATCACCTCCGGCTACAGCTGGCACTGGATCCGGCAGCACCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGATGGCCCACATCCACTCCTCCGGCTCCACCAACTACAACCCCAGCCTGAAGTCCAGAATCACCATCAGCCGGGACACCTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGTCCTCCGTGACCGCCGCTGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGAGGCGGCGTGCAGGCCTTCGCTTATTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 514 Тяжелая цепь
(DAPA, мутации подчеркнуты) DVQLQESGPGLVKPSQTLSLTCTVSGYSITSGYSWHWIRQHPGKGLEWMAHIHSSGSTNYNPSLKSRITISRDTSKNQFSLKLSSVTAADTAVYYCARGGVQAFAYWGQGTLVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVaVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALaAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 515 ДНК тяжелой цепи GACGTGCAGCTGCAGGAATCTGGCCCTGGCCTGGTGAAACCCTCCCAGACCCTGTCCCTGACCTGCACCGTGTCCGGCTACTCCATCACCTCCGGCTACAGCTGGCACTGGATCCGGCAGCACCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGATGGCCCACATCCACTCCTCCGGCTCCACCAACTACAACCCCAGCCTGAAGTCCAGAATCACCATCAGCCGGGACACCTCCAAGAACCAGTTCTCCCTGAAGCTGTCCTCCGTGACCGCCGCTGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGAGGCGGCGTGCAGGCCTTCGCTTATTGGGGCCAGGGCACCCTGGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGGCTGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 516 LCDR1 (комбинированная) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 517 LCDR2 (комбинированная) DTSKLAS SEQ ID NO: 518 LCDR3 (комбинированная) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 519 LCDR1 (Kabat) SASSSVIYMH SEQ ID NO: 520 LCDR2 (Kabat) DTSKLAS SEQ ID NO: 521 LCDR3 (Kabat) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 522 LCDR1 (Chothia) SSSVIY SEQ ID NO: 523 LCDR2 (Chothia) DTS SEQ ID NO: 524 LCDR3 (Chothia) WSSNPL SEQ ID NO: 525 LCDR1 (IMGT) SSVIY SEQ ID NO: 526 LCDR2 (IMGT) DTS SEQ ID NO: 527 LCDR3 (IMGT) QQWSSNPLT SEQ ID NO: 528 VL EIVLTQSPATLSASPGERVTMSCSASSSVIYMHWYQQKPGQAPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYTLTISSMEPEDAAVYYCQQWSSNPLTFGQGTKLEIK SEQ ID NO: 529 ДНК VL GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCTGCTAGCCCTGGCGAGCGCGTGACAATGTCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCGTGATCTACATGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCGGTGGATCTACGATACCTCCAAGCTGGCCTCCGGCGTGCCCGCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCATGGAACCCGAGGACGCCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTCCAACCCCCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 530 Легкая цепь EIVLTQSPATLSASPGERVTMSCSASSSVIYMHWYQQKPGQAPRRWIYDTSKLASGVPARFSGSGSGTDYTLTISSMEPEDAAVYYCQQWSSNPLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 531 ДНК легкой цепи GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCTGCTAGCCCTGGCGAGCGCGTGACAATGTCCTGCTCCGCCTCCTCCTCCGTGATCTACATGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCGGTGGATCTACGATACCTCCAAGCTGGCCTCCGGCGTGCCCGCCAGATTCTCCGGCTCTGGCTCTGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCATGGAACCCGAGGACGCCGCCGTGTACTACTGCCAGCAGTGGTCCTCCAACCCCCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Гуманизированное 121G12, hIgG1, DAPA SEQ ID NO: 532 HCDR1 (комбинированная) GFTFSTYAMS SEQ ID NO: 533 HCDR2 (комбинированная) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 534 HCDR3 (комбинированная) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 535 HCDR1 (Kabat) TYAMS SEQ ID NO: 536 HCDR2 (Kabat) TISDAGSYSYYPDNVKG SEQ ID NO: 537 HCDR3 (Kabat) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 538 HCDR1 (Chothia) GFTFSTY SEQ ID NO: 539 HCDR2 (Chothia) SDAGSY SEQ ID NO: 540 HCDR3 (Chothia) RGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 541 HCDR1 (IMGT) GFTFSTYA SEQ ID NO: 542 HCDR2 (IMGT) ISDAGSYS SEQ ID NO: 543 HCDR3 (IMGT) ARRGSRYEEYYVMDY SEQ ID NO: 544 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMSWVRQAPGKGLEWVATISDAGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 545 ДНК VH GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCACCTACGCCATGTCCTGGGTGCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCGACGCCGGCTCCTACTCCTACTACCCCGACAACGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGGCTCCAGATACGAAGAGTACTACGTGATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 546 Тяжелая цепь
(DAPA, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSTYAMSWVRQAPGKGLEWVATISDAGSYSYYPDNVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGSRYEEYYVMDYWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVaVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALaAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 547 ДНК тяжелой цепи GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCACCTACGCCATGTCCTGGGTGCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCGACGCCGGCTCCTACTCCTACTACCCCGACAACGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGGCTCCAGATACGAAGAGTACTACGTGATGGACTATTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGGCTGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 548 LCDR1 (комбинированная) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 549 LCDR2 (комбинированная) YASQSIS SEQ ID NO: 550 LCDR3 (комбинированная) QQSSSWLT SEQ ID NO: 551 LCDR1 (Kabat) RASQSISNNLH SEQ ID NO: 552 LCDR2 (Kabat) YASQSIS SEQ ID NO: 553 LCDR3 (Kabat) QQSSSWLT SEQ ID NO: 554 LCDR1 (Chothia) SQSISNN SEQ ID NO: 555 LCDR2 (Chothia) YAS SEQ ID NO: 556 LCDR3 (Chothia) SSSWL SEQ ID NO: 557 LCDR1 (IMGT) QSISNN SEQ ID NO: 558 LCDR2 (IMGT) YAS SEQ ID NO: 559 LCDR3 (IMGT) QQSSSWLT SEQ ID NO: 560 VL EIVLTQSPATLSVSPGERVTLSCRASQSISNNLHWYQQKPGQAPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFGVYFCQQSSSWLTFGQGTKLEIK SEQ ID NO: 561 ДНК VL GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCCGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCCTGTCCTGCCGGGCCTCCCAGTCCATCTCCAACAACCTGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCCAGAGCATCTCCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCAGCGTGGAACCCGAGGACTTCGGCGTGTACTTCTGCCAGCAGTCCTCATCCTGGCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 562 Легкая цепь EIVLTQSPATLSVSPGERVTLSCRASQSISNNLHWYQQKPGQAPRLLIKYASQSISGIPARFSGSGSGTDFTLTISSVEPEDFGVYFCQQSSSWLTFGQGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 563 ДНК легкой цепи GAGATCGTGCTGACCCAGTCCCCTGCCACCCTGTCCGTGTCTCCCGGCGAGAGAGTGACCCTGTCCTGCCGGGCCTCCCAGTCCATCTCCAACAACCTGCACTGGTATCAGCAGAAGCCCGGCCAGGCCCCTCGGCTGCTGATTAAGTACGCCTCCCAGAGCATCTCCGGCATCCCTGCCAGATTCTCCGGCTCCGGCAGCGGCACCGACTTCACCCTGACCATCTCCAGCGTGGAACCCGAGGACTTCGGCGTGTACTTCTGCCAGCAGTCCTCATCCTGGCTGACCTTCGGCCAGGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Гуманизированное 506E15, hIgG1, DAPA SEQ ID NO: 564 HCDR1 (комбинированная) GFTFSSYAMS SEQ ID NO: 565 HCDR2 (комбинированная) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 566 HCDR3 (комбинированная) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 567 HCDR1 (Kabat) SYAMS SEQ ID NO: 568 HCDR2 (Kabat) TISSGGSFTYYPDSVKG SEQ ID NO: 569 HCDR3 (Kabat) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 570 HCDR1 (Chothia) GFTFSSY SEQ ID NO: 571 HCDR2 (Chothia) SSGGSF SEQ ID NO: 572 HCDR3 (Chothia) RASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 573 HCDR1 (IMGT) GFTFSSYA SEQ ID NO: 574 HCDR2 (IMGT) ISSGGSFT SEQ ID NO: 575 HCDR3 (IMGT) ARRASTVVGTDFDV SEQ ID NO: 576 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWIRQAPGKGLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRASTVVGTDFDVWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 577 ДНК VH GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAGCTACGCCATGTCCTGGATCCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCTCCGGCGGCAGCTTCACCTACTACCCCGACAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGCCTCCACCGTCGTGGGAACCGACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 578 Тяжелая цепь
(DAPA, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSSYAMSWIRQAPGKGLEWVATISSGGSFTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRASTVVGTDFDVWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPEPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVaVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALaAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPSDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 579 ДНК тяжелой цепи GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAGCTACGCCATGTCCTGGATCCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGGCCACCATCTCCTCCGGCGGCAGCTTCACCTACTACCCCGACAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGCCTCCACCGTCGTGGGAACCGACTTCGATGTGTGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCCGCTAGCACCAAGGGCCCAAGTGTGTTTCCCCTGGCCCCCAGCAGCAAGTCTACTTCCGGCGGAACTGCTGCCCTGGGTTGCCTGGTGAAGGACTACTTCCCCGAGCCCGTGACAGTGTCCTGGAACTCTGGGGCTCTGACTTCCGGCGTGCACACCTTCCCCGCCGTGCTGCAGAGCAGCGGCCTGTACAGCCTGAGCAGCGTGGTGACAGTGCCCTCCAGCTCTCTGGGAACCCAGACCTATATCTGCAACGTGAACCACAAGCCCAGCAACACCAAGGTGGACAAGAGAGTGGAGCCCAAGAGCTGCGACAAGACCCACACCTGCCCCCCCTGCCCAGCTCCAGAACTGCTGGGAGGGCCTTCCGTGTTCCTGTTCCCCCCCAAGCCCAAGGACACCCTGATGATCAGCAGGACCCCCGAGGTGACCTGCGTGGTGGTGGCCGTGTCCCACGAGGACCCAGAGGTGAAGTTCAACTGGTACGTGGACGGCGTGGAGGTGCACAACGCCAAGACCAAGCCCAGAGAGGAGCAGTACAACAGCACCTACAGGGTGGTGTCCGTGCTGACCGTGCTGCACCAGGACTGGCTGAACGGCAAAGAATACAAGTGCAAAGTCTCCAACAAGGCCCTGGCTGCCCCAATCGAAAAGACAATCAGCAAGGCCAAGGGCCAGCCACGGGAGCCCCAGGTGTACACCCTGCCCCCCAGCCGGGAGGAGATGACCAAGAACCAGGTGTCCCTGACCTGTCTGGTGAAGGGCTTCTACCCCAGCGATATCGCCGTGGAGTGGGAGAGCAACGGCCAGCCCGAGAACAACTACAAGACCACCCCCCCAGTGCTGGACAGCGACGGCAGCTTCTTCCTGTACAGCAAGCTGACCGTGGACAAGTCCAGGTGGCAGCAGGGCAACGTGTTCAGCTGCAGCGTGATGCACGAGGCCCTGCACAACCACTACACCCAGAAGTCCCTGAGCCTGAGCCCCGGCAAG SEQ ID NO: 580 LCDR1 (комбинированная) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 581 LCDR2 (комбинированная) ATSSLDS SEQ ID NO: 582 LCDR3 (комбинированная) LQYASSPPT SEQ ID NO: 583 LCDR1 (Kabat) RASQDIGSSLN SEQ ID NO: 584 LCDR2 (Kabat) ATSSLDS SEQ ID NO: 585 LCDR3 (Kabat) LQYASSPPT SEQ ID NO: 586 LCDR1 (Chothia) SQDIGSS SEQ ID NO: 587 LCDR2 (Chothia) ATS SEQ ID NO: 588 LCDR3 (Chothia) YASSPP SEQ ID NO: 589 LCDR1 (IMGT) QDIGSS SEQ ID NO: 590 LCDR2 (IMGT) ATS SEQ ID NO: 591 LCDR3 (IMGT) LQYASSPPT SEQ ID NO: 592 VL DIQMTQSPSSLSASVGDRVTLTCRASQDIGSSLNWLQQKPGKAIKRLIYATSSLDSGVPSRFSGSRSGTDYTLTISSLQPEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 593 ДНК VL GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATAGAGTGACCCTGACCTGCCGGGCCTCCCAGGACATCGGCTCCTCCCTGAACTGGCTGCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCATCAAGCGGCTGATCTACGCCACCTCCTCCCTGGACTCCGGCGTGCCCTCCCGGTTCTCCGGCTCTAGATCCGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGTGGTGTACTACTGCCTGCAGTACGCCTCCAGCCCCCCCACCTTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 594 Легкая цепь DIQMTQSPSSLSASVGDRVTLTCRASQDIGSSLNWLQQKPGKAIKRLIYATSSLDSGVPSRFSGSRSGTDYTLTISSLQPEDFVVYYCLQYASSPPTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 595 ДНК легкой цепи GACATCCAGATGACCCAGTCCCCCTCCAGCCTGTCCGCCTCCGTGGGCGATAGAGTGACCCTGACCTGCCGGGCCTCCCAGGACATCGGCTCCTCCCTGAACTGGCTGCAGCAGAAGCCCGGCAAGGCCATCAAGCGGCTGATCTACGCCACCTCCTCCCTGGACTCCGGCGTGCCCTCCCGGTTCTCCGGCTCTAGATCCGGCACCGACTACACCCTGACCATCTCCAGCCTGCAGCCCGAGGACTTCGTGGTGTACTACTGCCTGCAGTACGCCTCCAGCCCCCCCACCTTTGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAGCGTACGGTGGCCGCTCCCAGCGTGTTCATCTTCCCCCCCAGCGACGAGCAGCTGAAGAGTGGCACCGCCAGCGTGGTGTGCCTGCTGAACAACTTCTACCCCCGGGAGGCCAAGGTGCAGTGGAAGGTGGACAACGCCCTGCAGAGCGGCAACAGCCAGGAGAGCGTCACCGAGCAGGACAGCAAGGACTCCACCTACAGCCTGAGCAGCACCCTGACCCTGAGCAAGGCCGACTACGAGAAGCATAAGGTGTACGCCTGCGAGGTGACCCACCAGGGCCTGTCCAGCCCCGTGACCAAGAGCTTCAACAGGGGCGAGTGC Гуманизированное 684E12, hIgG1, DAPA, CysMab SEQ ID NO: 596 HCDR1 (комбинированная) GFTFSNFAMS SEQ ID NO: 597 HCDR2 (комбинированная) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 598 HCDR3 (комбинированная) RGYSGVDK SEQ ID NO: 599 HCDR1 (Kabat) SNFAMS SEQ ID NO: 600 HCDR2 (Kabat) TISTGGTYTYYPDSVKG SEQ ID NO: 601 HCDR3 (Kabat) RGYSGVDK SEQ ID NO: 602 HCDR1 (Chothia) GFTFSNF SEQ ID NO: 603 HCDR2 (Chothia) STGGTY SEQ ID NO: 604 HCDR3 (Chothia) RGYSGVDK SEQ ID NO: 605 HCDR1 (IMGT) GFTFSNFA SEQ ID NO: 606 HCDR2 (IMGT) ISTGGTYT SEQ ID NO: 607 HCDR3 (IMGT) TRRGYSGVDK SEQ ID NO: 608 VH EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNFAMSWVRQAPGKGLEWVSTISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGYSGVDKWGQGTTVTVSS SEQ ID NO: 609 ДНК VH GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAACTTCGCCATGTCCTGGGTGCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGTCCACCATCTCCACCGGCGGCACCTACACCTACTACCCCGACAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGGCTACTCAGGCGTGGACAAATGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCC SEQ ID NO: 610 Тяжелая цепь
(DAPA, CysMab, мутации подчеркнуты) EVQLVESGGGLVKPGGSLRLSCAASGFTFSNFAMSWVRQAPGKGLEWVSTISTGGTYTYYPDSVKGRFTISRDNAKNSLYLQMNSLRAEDTAVYYCARRGYSGVDKWGQGTTVTVSSASTKGPSVFPLAPSSKSTSGGTAALGCLVKDYFPCPVTVSWNSGALTSGVHTFPAVLQSSGLYSLSSVVTVPSSSLGTQTYICNVNHKPSNTKVDKRVEPKSCDKTHTCPPCPAPELLGGPSVFLFPPKPKDTLMISRTPEVTCVVVAVSHEDPEVKFNWYVDGVEVHNAKTKPREEQYNSTYRVVSVLTVLHQDWLNGKEYKCKVSNKALAAPIEKTISKAKGQPREPQVYTLPPSREEMTKNQVSLTCLVKGFYPCDIAVEWESNGQPENNYKTTPPVLDSDGSFFLYSKLTVDKSRWQQGNVFSCSVMHEALHNHYTQKSLSLSPGK SEQ ID NO: 611 ДНК тяжелой цепи GAGGTGCAGCTGGTGGAATCTGGCGGAGGCCTGGTGAAACCCGGCGGATCCCTGAGACTGTCCTGCGCCGCCTCCGGCTTCACCTTCTCCAACTTCGCCATGTCCTGGGTGCGGCAGGCTCCCGGCAAGGGCCTGGAATGGGTGTCCACCATCTCCACCGGCGGCACCTACACCTACTACCCCGACAGCGTGAAGGGCAGATTCACCATCAGCCGGGACAACGCCAAGAACTCCCTGTACCTGCAGATGAACTCCCTGCGGGCCGAGGACACCGCCGTGTACTACTGTGCCAGACGGGGCTACTCAGGCGTGGACAAATGGGGCCAGGGCACCACCGTGACAGTGTCCTCCgctagcaccaagggcccaagtgtgtttcccctggcccccagcagcaagtctacttccggcggaactgctgccctgggttgcctggtgaaggactacttcccctgtcccgtgacagtgtcctggaactctggggctctgacttccggcgtgcacaccttccccgccgtgctgcagagcagcggcctgtacagcctgagcagcgtggtgacagtgccctccagctctctgggaacccagacctatatctgcaacgtgaaccacaagcccagcaacaccaaggtggacaagagagtggagcccaagagctgcgacaagacccacacctgccccccctgcccagctccagaactgctgggagggccttccgtgttcctgttcccccccaagcccaaggacaccctgatgatcagcaggacccccgaggtgacctgcgtggtggtggccgtgtcccacgaggacccagaggtgaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcacaacgccaagaccaagcccagagaggagcagtacaacagcacctacagggtggtgtccgtgctgaccgtgctgcaccaggactggctgaacggcaaagaatacaagtgcaaagtctccaacaaggccctggctgccccaatcgaaaagacaatcagcaaggccaagggccagccacgggagccccaggtgtacaccctgccccccagccgggaggagatgaccaagaaccaggtgtccctgacctgtctggtgaagggcttctacccctgtgatatcgccgtggagtgggagagcaacggccagcccgagaacaactacaagaccacccccccagtgctggacagcgacggcagcttcttcctgtacagcaagctgaccgtggacaagtccaggtggcagcagggcaacgtgttcagctgcagcgtgatgcacgaggccctgcacaaccactacacccagaagtccctgagcctgagccccggcaag SEQ ID NO: 612 LCDR1 (комбинированная) KSGQSLLDSTGKTYLN SEQ ID NO: 613 LCDR2 (комбинированная) LVSKLDS SEQ ID NO: 614 LCDR3 (комбинированная) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 615 LCDR1 (Kabat) KSGQSLLDSTGKTYLN SEQ ID NO: 616 LCDR2 (Kabat) LVSKLDS SEQ ID NO: 617 LCDR3 (Kabat) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 618 LCDR1 (Chothia) GQSLLDSTGKTY SEQ ID NO: 619 LCDR2 (Chothia) LVS SEQ ID NO: 620 LCDR3 (Chothia) GTHFPQ SEQ ID NO: 621 LCDR1 (IMGT) QSLLDSTGKTY SEQ ID NO: 622 LCDR2 (IMGT) LVS SEQ ID NO: 623 LCDR3 (IMGT) WQGTHFPQT SEQ ID NO: 624 VL DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCKSGQSLLDSTGKTYLNWFLQRPGQSPRRLIYLVSKLDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIK SEQ ID NO: 625 ДНК VL GACGTGGTGATGACCCAGTCCCCCCTGTCCCTGCCTGTGACCCTGGGCCAGCCTGCCTCCATCTCCTGCAAGTCCGGCCAGTCCCTGCTGGACTCCACTGGCAAGACCTACCTGAACTGGTTCCTGCAGCGGCCTGGCCAGTCCCCTCGGCGGCTGATCTACCTGGTGTCCAAGCTGGACAGCGGCGTGCCCGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCCGGCACCGACTTCACCCTGAAGATCTCCCGGGTGGAAGCCGAGGACGTGGGCGTGTACTACTGCTGGCAGGGCACCCACTTCCCCCAGACCTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAG SEQ ID NO: 626 Легкая цепь DVVMTQSPLSLPVTLGQPASISCKSGQSLLDSTGKTYLNWFLQRPGQSPRRLIYLVSKLDSGVPDRFSGSGSGTDFTLKISRVEAEDVGVYYCWQGTHFPQTFGGGTKLEIKRTVAAPSVFIFPPSDEQLKSGTASVVCLLNNFYPREAKVQWKVDNALQSGNSQESVTEQDSKDSTYSLSSTLTLSKADYEKHKVYACEVTHQGLSSPVTKSFNRGEC SEQ ID NO: 627 ДНК легкой цепи GACGTGGTGATGACCCAGTCCCCCCTGTCCCTGCCTGTGACCCTGGGCCAGCCTGCCTCCATCTCCTGCAAGTCCGGCCAGTCCCTGCTGGACTCCACTGGCAAGACCTACCTGAACTGGTTCCTGCAGCGGCCTGGCCAGTCCCCTCGGCGGCTGATCTACCTGGTGTCCAAGCTGGACAGCGGCGTGCCCGACAGATTCTCCGGCTCTGGCTCCGGCACCGACTTCACCCTGAAGATCTCCCGGGTGGAAGCCGAGGACGTGGGCGTGTACTACTGCTGGCAGGGCACCCACTTCCCCCAGACCTTCGGCGGAGGCACCAAGCTGGAAATCAAGcgtacggtggccgctcccagcgtgttcatcttcccccccagcgacgagcagctgaagagtggcaccgccagcgtggtgtgcctgctgaacaacttctacccccgggaggccaaggtgcagtggaaggtggacaacgccctgcagagcggcaacagccaggagagcgtcaccgagcaggacagcaaggactccacctacagcctgagcagcaccctgaccctgagcaaggccgactacgagaagcataaggtgtacgcctgcgaggtgacccaccagggcctgtccagccccgtgaccaagagcttcaacaggggcgagtgc

Пример 2. In vitro оценка активности ADCC, индуцированной антителом

[00374] Способность антител-кандидатов опосредовать ADCC оценивали с применением суррогатного репортерного анализа ADCC. В качестве клеток-мишеней использовали клетки JVM2, экспрессирующие CCR7 и CD20. Клетки JVM2 промывали и ресуспендировали из расчета 8×10⁴ клеток/мл клеток/мл. Эффекторными клетками в данном анализе была линия клеток Jurkat, стабильно экспрессирующих CD16V158 и NFAT-зависимый люциферазный репортер (Jurkat-V158); экспрессия люциферазы является заменителем канонической передачи сигнала ADCC через CD16. Вкратце, клетки Jurkat-V158, выращенные в суспензионной культуре, центрифугировали для удаления истощенной среды, осадок ресуспендировали в среде для анализа и доводили до 1,6×10⁶ клеток/мл клеток/мл. Смешивали равные объемы эффекторных клеток и клеток-мишеней с получением основной смеси клеток, в которой отношение клеток-мишеней к эффекторным клеткам составляет 1:5 или 1:20. Титр антитела разбавляли в среде для анализа при конечной наибольшей концентрации, составляющей 50 мкг/мл в лунке для анализа. 12,5 мкл раствора Ab добавляли в 384-луночный круглодонный планшет и затем добавляли 12,5 мкл основной смеси клеток. Антитело и клетки тщательно смешивали за счет пипетирования и инкубировали в течение 4 часов при 37°C в 5% CO₂. После инкубации в каждую лунку добавляли по 15 мкл субстрата Bright Glo (Promega № G7572) и встряхивали в течение 5 мин при RT при 1050 об/мин. Люминесцентный сигнал считывали на планшет-ридере Envision (Perkin Elmer).

[00375] В качестве контроля включали антитело, нацеливающееся на CD20, и оно показывало значительную передачу сигнала с помощью NFAT, измеренную по активности люциферазы. Аналогично, антитела-кандидаты к CCR7 индуцировали значительную активность ADCC (фигура 1).

[00376] В таблице ниже обобщены типичные результаты для антител различных форматов, включенных в анализ ADCC с применением клеток JVM2 и Jurkat-V158.

Таблица 5. Активность ADCC у негуманизированных и гуманизированных антител к CCR7

Активность ADCC; IC50 (нМ) 121G12, негуманизированное, CysMab 0,077 506E15, негуманизированное, CysMab 0,131 674J13, негуманизированное, CysMab 1,09 684E12, негуманизированное, CysMab 2,63 121G12, гуманизированное, CysMab Присутствует, но недостаточная для аппроксимации кривой 506E15, гуманизированное, CysMab 0,054 674J13, гуманизированное, CysMab Присутствует, но недостаточная для аппроксимации кривой Контроль ADCC, антитело к CD20 0,132

[00377] Анализ ADCC проводили с негуманизированным антителом 506E15 в качестве типичного антитела к CCR7, способного опосредовать ADCC, на различных линиях клеток с разным числом CCR7-рецепторов для определения минимальной плотности рецепторов, необходимой для активности ADCC, и наличие надлежащей границы безопасности по сравнению с нормальными CCR7+ T-клетками. В таблице ниже обобщены некоторые из данных.

Таблица 6. Активность ADCC у негуманизированного антитела 506E15

Линия клеток Число CCR7-рецепторов 506E15, IC50 (нМ) 506E15 (максимальное значение RLU) JVM2 66,500 0,046 5840 MOTN-1 64,600 0,077 5387 DEL 62,000 0,074 6480 CMLT-1 29,000 0,011 4400 SR786 27,800 0,011 4067 PEER 8,700 0,038 3360 ALL-SIL 6,200 0,008 3720 Jurkat V158 3,400 0,004 3267 DND-41 1,700 0,002 3733 Нормальные T-клетки < 1,5 тыс. клеток истощение in vivo n.a.

[00378] Данные показывают, что даже очень низких уровней CCR7-рецепторов, сравнимых с уровнями CCR7-рецепторов на нормальных T клетках, было достаточно для обеспечения значительной активности ADCC. ADCC также оценивали с применением анализа жизнеспособности при совместном культивировании NK-клеток с CCR7+ раковыми клетками и получали аналогичные результаты (не обсуждаются в данном документе).

[00379] Это согласуется с описанным ниже наблюдением, согласно которому отмечали истощение T-клеток in vivo и обнаружили, что оно основано на механизме ADCC. Эти результаты демонстрируют, что механизм ADCC делает CCR7 неприменимым с точки зрения безопасности. В связи с этим, всех кандидатов переключали в формат с "молчащей" Fc (DAPA) для улучшения общей безопасности с точки зрения мишени.

[00380] Репортерный in vitro анализ ADCC повторяли, и он подтвердил отсутствие активности ADCC у негуманизированных антител к CCR7, содержащих варианты Fc с мутацией DAPA (фигура 2).

Пример 3. Определение биохимических характеристик антител

Аффинность антител к CCR7 в отношении CCR7

[00381] Аффинность различных антител и ADC в отношении CCR7 и его видовых ортологов определяли с применением FACS. Очищенные IgG титровали, чтобы определить значения EC50 для связывания с CCR7, экспрессированным на поверхности клеток.

[00382] Для этого CCR7-положительные клетки собирали (адгезивные клетки отделяли с помощью аккутазы), промывали дважды с помощью буфера FACS (PBS/3% FCS/0,02% азида натрия) и разбавляли до примерно 2×10⁶ клеток/мл в буфере FACS. Все последующие стадии проводили на льду, чтобы предотвратить интернализацию рецептора. По 100 мкл клеточной суспензии/лунка переносили в 96-луночные планшеты с U-образным дном (Falcon). 2×10⁵ клеток/лунка инкубировали с последовательным разведением представляющего интерес антитела к CCR7, при этом концентрация антитела варьировала в диапазоне нескольких порядков, начиная от самой высокой 100 нМ, в течение 60 минут при 4°C с аккуратным встряхиванием. После инкубации клетки центрифугировали (1200 об/мин, 2 мин, 4°C) и трижды промывали буфером FACS. Антитело обнаружения, конъюгированное с флуорофором APC антитело к hFc-гамма (Jackson Immunoresearch), добавляли из расчета 1:400 и образцы инкубировали в течение 1 ч на льду в темноте с аккуратным встряхиванием. После финальной промывки клетки ресуспендировали в 100 мкл буфера FACS, содержащего 0,2 мкг/мл DAPI, с последующим считыванием на устройстве для проточной цитометрии (анализатор клеток BD LSRFortessa; № по кат. 647177). Среднюю интенсивность флуоресценции (MFI) живых одиночных клеток рассчитывали в Flowjo 10.0.8 и результаты экспортировали в Graphpad Prism6 для определения EC₅₀.

[00383] Селективность оценивали путем измерения наблюдаемых аффинностей связывания с изогенной парой клеток, сконструированных для сверхэкспрессии CCR7, а также с линиями клеток, экспрессирующих паралоги CCR7, например, CCR9, CCR6, CXCR4 и CCR8. Все антитела к CCR7 связывались специфически образом только с клетками, экспрессирующими CCR7, как показано в таблице 7 ниже.

Таблица 7. Связывание различных антител к CCR7 с клетками, экспрессирующими CCR7

Наблюдаемое связывание при FACS (при 5 мкг/мл) Гуманизированное антитело CysMab (с Fc дикого типа) 121G12 506E15 674J13 684E12 Клетки NIH3T3 Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания NIH3T3.hCCR7 Связывание Связывание Связывание Связывание Клетки PF382
(CCR7-/ CCR9+/ CCR6+) Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания HEK293-CXCR4 Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания CHO-CCR8 Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания

[00384] В аналогичном эксперименте антитела тестировали на перекрестную реактивность с применением наборов сконструированных изогенно-совпадающих линий клеток (серия NIH3T3) и CD4+ T клеток, которые очищали из нескольких партий PBMC от здоровых доноров, а также яванских макаков, крыс Вистар и мышей CD-1. Обнаружили, что все антитела специфически связывают CCR7 человека и яванского макака при аналогичных наблюдаемых аффинностях, как показано в таблицах 8 и 9 ниже. Только негуманизированное антитело 121G12 характеризуется перекрестной реактивностью в отношении молекулы грызунов.

Таблица 8. Перекрестная реактивность различных негуманизированных антител к CCR7

Наблюдаемая аффинность при FACS; EC₅₀ (нМ) Негуманизированное антитело CysMab 121G12 506E15 674J13 684E12 CD4+ T клетки человека 22-30 4,6-9,7 0,39-1,4 n.d. CD4+ T клетки яванского макака 5,8-12 6,6 0,45 n.d. CD4+ T клетки мыши 48-51 Отсутствие связывания Отсутствие связывания n.d. CD4+ T клетки крысы 18-31 Отсутствие связывания Отсутствие связывания n.d. NIH3T3 с CCR7 человека 1,3 n.d. 3,6 >30 NIH3T3 с CCR7 яванского макака 1,3 n.d. n.d. Связывание NIH3T3 с CCR7 мыши 2,5 Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания NIH3T3 с CCR7 крысы 2,4 Отсутствие связывания Отсутствие связывания Отсутствие связывания Раковые клетки Jeko-1 (CCR7+) 1,5 n.d. n.d. 12

Таблица 9. Перекрестная реактивность различных гуманизированных антитела к CCR7

Наблюдаемая аффинность при FACS; EC₅₀ (нМ) Гуманизированное антитело CysMab 121G12 506E15 674J13 684E12 CD4+ T клетки человека 30-34 7,8-11 0,87-2,7 6,7 CD4+ T клетки яванского макака 12 7 0,5 n.d. NIH3T3 с CCR7 человека 1 n.d. n.d. n.d. NIH3T3 с CCR7 яванского макака 0,9 n.d. n.d. n.d.

[00385] Чтобы определить влияние плотности рецепторов на наблюдаемую аффинность, и, следовательно, вклада авидности в связывание антитела с клеткой, проводили титриметрические эксперименты FACS на линиях раковых клеток, экспрессирующих CCR7 человека на различных уровнях экспрессии, и нормальных CCR7-положительных T клетках, происходящих из PBMC. Количественное определение рецепторов проводили с помощью FACS с применением микросфер от Bangs Laboratories в качестве стандартов подсчета импульсов и следовали инструкциям производителя. Иллюстративные результаты показаны в таблице 10 ниже.

Таблица 10. Вклад авидности в наблюдаемую аффинность в зависимости от плотности рецепторов

Наблюдаемая аффинность при FACS; EC₅₀ (нМ) Гуманизированное антитело CysMab.DAPA Плотность CCR7-рецепторов 121G12 506E15 674J13 684E12 Клетки NIH3T3.hCCR7 >1,000,000 2,5 1,8 0,64 n.d. Раковые клетки DEL ~100,000 1,78 3,09 0,47 n.d. CD4+ T клетки человека <2,000 ~30 ~10 ~2 ~7

[00386] Для всех антител к CCR7 показан значительный вклад авидности в наблюдаемую аффинность, и сила связывания снижалась в зависимости от плотности рецепторов. В частности, для 121G12 показано значительно более слабое связывание на клетках с низким уровнем экспрессии CCR7, представленных нормальными CD4+ T клетками, по сравнению с раковыми клетками DEL, являющимися представителями клеток, для которых показано его применение.

[00387] Относительно низкая аффинность конкретного 121G12, которое продемонстрировало самый сильный эффект авидности среди всех антител к CCR7, является оптимальной для использования отличия в плотности рецепторов между нормальными и раковыми клетками в качестве метода для смещения связывания антитела в направлении раковых клеток.

Связывание с рекомбинантным hCCR7 в ELISA

[00388] Связывание и аффинность также оценивали в анализе на основе ELISA с применением рекомбинантного CCR7 (Origene, № TP306614). 384-луночные планшеты Maxisorp™ (Thermo Nunc) покрывали с помощью 3,5 мкг/мл рекомбинантного CCR7, разведенного в PBS. После блокирования с помощью 3% BSA (бычий сывороточный альбумин) в PBS в течение 1 часа при комнатной температуре, промывки планшетов 3x с помощью PBS-T (0,01% Tween 20 в PBS), добавляли последовательные разведения первичных антител и инкубировали в течение 1 часа при комнатной температуре. Планшеты промывали вновь и связавшиеся антитела обнаруживали посредством инкубации с 1:5000 антителом к hFc-гамма, конъюгированным с пероксидазой хрена (HRP; Jackson Immunoresearch, № по кат. 115-035-098), в течение 1 часа при комнатной температуре с последующей промывкой помощью PBS-T и последующего добавления субстрата для пероксидазы SureBlue (KPL, № 52-00-03). Спустя 15 мин регистрировали поглощение при 650 нм и анализировали в GraphPad Prism6.

[00389] Все протестированные антитела к CCR7 способны к связыванию рекомбинантного hCCR7 (таблица 11; фигура 3).

Таблица 11. Аффинность связывания гуманизированных антител к CCR7 с рекомбинантным hCCR7

Гуманизированное антитело CysMab Аффинность, Kd (нМ) 121G12.DAPA 0,677 506E15.DAPA 5,731 674J13.DAPA 0,006

Связывание с двойными FabGraft

[00390] FabGraft ELISA проводили для оценки связывания с эпитопом минимальной протяженности, который содержит N-конец и EC2 из CCR7. Вкратце, 384-луночные планшеты Maxisorp™ (Thermo Nunc) покрывали с помощью 5 мкг/мл FabGraft. Во всем остальном следовали общей инструкции для протокола ELISA, как описано выше. Все антитела к CCR7 способны к связыванию с двойными FabGraft, как показано в таблице 12 ниже.

Таблица 12. Аффинность связывания гуманизированных антител к CCR7 с FabGraft

Гуманизированное антитело CysMab ELISA; Kd (нМ) 121G12.DAPA 0,023 506E15.DAPA 0,025 674J13.DAPA 0,023

Оценка pH-зависимости в ELISA с применением VLP

[00391] Известно, что CCL19, связавшийся с CCR7, подвергается интернализации как комплекс рецептор-лиганд. Однако в то время как CCR7 рециклируется обратно на поверхность клетки, CCL19 сортируется в лизосому для разложения, что показывает противоположную "судьбу" CCR7 и его лиганда, подвергнутых эндоцитозу (Otero et al., J Immunol 2006; 177:2314-2323). Для приводящего к нужному эффекту ADC к CCR7 предпочтительно, чтобы антитело вело себя аналогично лиганду, например, подвергалось быстрой интернализации, но не рециклировалось обратно вместе с CCR7. Чтобы достичь этого, авторы настоящего изобретения обеспечивали отбор pH-зависимых антител, которые будут проявлять более слабое связывание с CCR7 в условиях низкого pH.

[00392] Для оценки pH-зависимости антител к CCR7 проводили ELISA с применением вирусоподобных частиц (VLP), экспрессирующих CCR7. Вкратце, 384-луночные планшеты Maxisorp™ (Thermo Nunc) покрывали с помощью 25 мкг/мл VLP. Первичные антитела инкубировали либо в буфере с pH 5,8 (1:1; dH₂O:0,1 M цитратный буфер, 150 мМ NaCl) или буфере с pH 7,4. Во всем остальном следовали общей инструкции для протокола ELISA, как описано выше.

[00393] При использовании целого ряда гуманизированных вариантов для каждого кандидата сравнение связывания антител при нейтральном (7,4) и кислом (5,8) pH показало, что все антитела-кандидаты к CCR7 характеризуются улучшенной аффинностью при pH 7,4 (таблица 13). Нижеприведенные объекты были выбраны на основании их самой большой pH-зависимости, в числе других признаков.

Таблица 13. pH-зависимость связывания гуманизированных антител к CCR7 с VLP, экспрессирующими CCR7

ELISA; Kd (нМ) Гуманизированное антитело CysMab Буфер с pH 7,4 Буфер с pH 5,8 Кратное изменение (pH 5,8/7,4) 121G12 0,1411 0,5207 4 506E15 0,0571 0,4942 9 674J13 0,0162 0,1657 10 684E12 0,0374 0,5041 13

Анализ с b-аррестином

[00394] Чтобы определить функциональность антител к CCR7 проводили анализ с β-аррестином с применением набора для обнаружения импульса PathHunter от DiscoverX (№ 93-0247) либо в режиме агониста для оценки агонистической функции, либо в режиме антагониста для оценки антагонистической функции.

[00395] В случае режима агониста CHO-flpin-hCCR7 (разработанная DiscoverX линия клеток, экспрессирующих hCCR7 с меткой ProLink, β-аррестин-EA) высевали из расчета 8×10⁴ клеток/лунка в 20 мкл/лунка ростовой среды (среда F-12 Хэма/Glutamax; Invitrogen+10% FBS+0,5 мг/мл G418+0,2 мг/мл гигромицина B; Invitrogen+5 мкг/мл бластицидина; Gibco) с 100 нг/мл Dox в 384-луночные планшеты, покрытые металлическими крышками, инкубировали при 37°C, 5% CO₂ в течение ночи. На следующий день последовательное разведение 5x рабочего раствора в 1x буфере для анализа (20 мМ HEPES/0,1% BSA/1x HBSS, pH 7,4) выполняли для тестируемых антител или положительного контроля с применением лиганда hCCL19 (R&D, 361/MI-025/CF). В каждую лунку добавляли по 5 мкл 5x рабочего раствора антител или лиганда, проводили быстрое центрифугирование и инкубировали при 37°C/5% CO₂ в течение 2 ч. После инкубации в каждую лунку добавляли по 25 мкл реагента для обнаружения, инкубировали при комнатной температуре в темноте при встряхивании в течение 20 мин. Затем измеряли сигнал люминесценции на приборе Envision, чтобы определить активность фермента. Наконец, активность фермента анализировали с применением Excel.

[00396] В режиме антагониста клетки CHO-flpin-hCCR7 высевали, как описано выше. На следующий день 6x рабочий раствор (0,5 мкМ x 6=3,0 мкМ) в 1x буфере для анализа получали для каждого тестируемого антитела или MAB197 положительного контроля (эталонное антитело; лиганд-антагонист от R&D) или hIgG отрицательного контроля. В каждую лунку добавляли по 5 мкл 6x рабочего раствора антител или контролей, проводили быстрое центрифугирование и инкубировали при 37°C/5% CO₂ в течение 30 мин. Во время инкубация выполняли последовательные разведения 6x рабочего раствора hCCL19 в 1x буфере для анализа. После инкубации в каждую лунку добавляли по 5 мкл 6x рабочего раствора hCCL19, проводили быстрое центрифугирование и инкубировали при 37°C/5% CO₂ в течение 90 мин. После инкубации в каждую лунку добавляли по 25 мкл реагента для обнаружения, инкубировали при комнатной температуре в темноте при встряхивании в течение 20 мин. Затем измеряли сигнал люминесценции на приборе Envision, чтобы определить активность фермента, и анализировали с помощью Excel.

[00397] Ни одно из исходных антител к CCR7 не продемонстрировало активность в модели агониста (фигура 4A). Однако при анализе в формате антагониста 506E15 и 121G12 идентифицировали как сильных антагонистов, например, антител, блокирующих связывание с лигандом (фигуры 4B, 4C). 674J12 представляет собой нейтральное антитело, не блокирующее связывание с лигандом. 684E12 представляет собой слабого антагониста.

Анализ конкурентного связывания в FACS с применением лиганда

[00398] Чтобы подтвердить то, что антитело конкурирует с лигандом CCR7, проводили FACS-анализ в присутствии избыточной концентрации лиганда. FACS-анализ проводили, как описано выше. В протокол вносили некоторые изменения, например, CCL19 поддерживали при постоянной концентрации 1 мкМ, в то время как концентрация первичного антитела, которое одновременно применяли к клеткам DEL, варьировала в диапазоне нескольких порядков, начиная с самой высокой концентрации 100 нМ. После 30-минутного периода инкубации в ледяном буфере FACS клетки промывали, в течение 15 мин применяли вторичное антитело к hFc, конъюгированное с PE, и MFI определяли, как описано выше.

[00399] На фигуре 5 показано, что на гуманизированное CysMab.DAPA 674J13 не влияло присутствие избытка CCL19, что подтверждает его нейтральную функциональность. На аффинность связывания гуманизированных CysMab.DAPA 121G12 и 506E15 действительно сильно влияло присутствие избытка лиганда.

Способность к интернализации в различных линиях клеток, характеризующихся диапазоном плотности рецепторов

[00400] Другим аспектом приводящего к нужному эффекту ADC к CCR7 является гарантия оптимального использования дифференциального распределение экспрессии CCR7. В качестве представителя нормальных клеток, экспрессирующих CCR7, CD4+ T-клетки выделяли из PBMC здоровых доноров. Кроме того, отобрали целый ряд CCR7-положительных линий раковых клеток, проявляющих диапазон плотностей рецепторов. Авторы настоящего изобретения специально выбрали антитела с более слабой наблюдаемой аффинностью связывания при FACS с CCR7+ T-клетками относительно CCR7+ раковых клеток. Кроме того, в данном документе описан анализ pHrodo, в котором флуорофорная метка, активируемая низким pH, на антителах к CCR7 используется для оценки того, как измеренный по флуоресценции захват антитела клетками коррелирует с плотностью рецепторов. Предпочтительно свести к минимуму захват антитела нормальными клетками, чтобы получить максимальное терапевтическое окно.

[00401] Вкратце, мечение антитела к CCR7 в формате CysMab с помощью малеимида-pHrodo (ThermoFisher) проводили следуя инструкциям производителя с получением объектов с DAR=4 (отношение лекарственного средства, например, флуорофора, к антителу). FACS-анализ проводили, как описано выше. В протокол вносили некоторые изменения, например, чтобы обеспечить возможность интернализации, первичное антитело инкубировали из расчета 5 мкг/мл с клетками при 37°C в среде для культивирования в течение 6 ч, затем промывали с помощью ледяного буфера FACS, содержащего азид натрия, для прекращения реакции.

[00402] В таблице 14 ниже обобщена способность к интернализации у трех антител с применением целого ряда из линий клеток. В качестве контроля применяли ненацеленное антитело, меченное с помощью pHrodo, и было установлено, что сигнал фонового шума составляет до 400 MFI, например, опосредованный нецелевым взаимодействием захват конъюгата антитела. Данные показывают, что для всех трех антител к CCR7 требуются уровни рецептора CCR7 в диапазоне, который является типичным для большинства CCR7+ линий раковых клеток, например более 20000 рецепторов, чтобы эффективно подвергаться интернализации и накапливать конъюгированное вещества, в то же время не попадать в нормальные CD4+ T-клетки.

Таблица 14. Способность к интернализации у различных антител к CCR7

Линия клеток Число рецепторов pHrodo (6 ч, MFI) Гуманизированное 121G12.CysMab.
DAPA Гуманизированное 506E15.CysMab.
DAPA Гуманизированное 617J13.CysMab.
DAPA CD4+ T-клетки 2000 278 429 402 JVM3 8717 148 238 146 CMLT1 19583 301 465 561 Jeko-1 28852 450 908 1389 Mec2 50840 1340 3089 3004 L1236 61602 1237 3126 5824 MOTN1 84200 1026 2899 2539 DEL 110685 1913 3058 3777 MJ 111121 1649 3870 3259 KE97 152093 1567 2723 4416 L540 167549 6836 16117 11800

Эпитоп-специфическая сортировка с применением системы Octet Red96

[00403] Эпитоп-специфическую сортировку исходных антител к hCCR7 проводили с применением системы Octet Red96 (ForteBio, США), которая проводит биослойную интерферометрию (BLI). Иммуногенный остов CCR7 биотинилировали с помощью AviTag™ с использованием биотинлигазы BirA в соответствии с рекомендациями производителя (Avidity, LLC, США № по кат. BirA500). Биотинилированный иммуногенный остов загружали из расчета 1,5 мкг/мл на предварительно уравновешенные стрептавидиновые сенсоры (ForteBio, США). Затем сенсоры переносили в раствор, содержащий 100 нМ антитела A в 1X буфере для кинетического анализа (ForteBio, США). Сенсоры быстро промывали в 1X буфере для кинетического анализа и переносили во второй раствор, содержащий 100 нМ антитела-конкурента. Кинетику связывания определяли на основании необработанных данных с применением программного обеспечения для анализа системы Octet Red96 (версия 6.3, ForteBio, США). Антитела тестировали во всех попарных комбинациях в качестве как антитела A, так и антитела-конкурента.

Таблица 15. Результаты сортировки антител

Категория Антитело 1 684E12; MAB197 2 674J13 3 506E15 4 121G12

Картирование эпитопов с применением мутаций CCR7

[00404] Дополнительное картирование эпитопов проводили с использованием линий клеток с мутантным CCR7. Создавали линии клеток NIH/3T3, экспрессирующих варианты CCR7 человека с мутациями. Мутации вводили в специфические положения для замены остатка CCR7 человека на соответствующий остаток CCR7 мыши. Введенные мутации охватывали D35E, F44Y, L47V, S49F, D198G, R201K, S202N, S204G, Q206D, A207T, M208L, I213V, T214S, E215A и H216Q. Конструкции плазмид с мутантным CCR7 создавали посредством сайт-направленного мутагенеза и вводили в клетки NIH/3T3 с получением линий клеток со стабильной экспрессией. Специфическое связывание антител-кандидатов с каждой линией клеток с мутантным CCR7 оценивали посредством проточной цитометрии. Клетки тщательно ополаскивали PBS и обрабатывали аккутазой (Millipore, № SCR005) для отделения от ростовых планшетов и ресуспендировали из расчета примерно 1×10⁵ клеток/90 мкл в 1x буфере FACS (2% FBS+0,1% NaN₃ в PBS). 10 мкл 10x раствора антитела в буфере FACS предварительно вносили в 96-луночный планшет с U-образным дном и добавляли 90 мкл клеточной суспензии. Клетки инкубировали в течение 30 минут при 4°C, промывали 1x с помощью холодного PBS и ресуспендировали в 100 мкл вторичного антитела, разведенного 1:500 в 1x буфере FACS (конъюгированный с аллофикоцианином F(ab')2 козы к IgG человека, Fcγ-специфический; Jackson Immunoresearch, № по кат. 109-136-098). После дополнительной инкубации в течение 15 мин при 4°C, клетки промывали дважды с помощью PBS и ресуспендировали в 100 мкл 1x буфера FACS+4 мкг/мл пропидия йодида (Life Technologies, № по кат. P3566). Геометрическое среднее интенсивности флуоресценции рассчитывали на живых одиночных клетках с применением FlowJo и наносили на график как % от геометрического среднего интенсивности флуоресценции при CCR7 WT.

[00405] Измеренные на основе EC50 показатели аффинности в отношении CCR7 с точковыми мутациями показали, что все протестированные антитела характеризуются различными профилями связывания, что свидетельствует о различном использовании конформационного эпитопа (фигура 6). Из всех показанных антител 506E15 характеризуется характером связывания, наиболее сходным с таковым MAB197, например, для обоих показано значимое резкое снижение аффинности связывания, когда остатки F44 или L47 на N-конце CCR7 мутированы, и отсутствие снижения, когда мутированы M208 или I213 в петле EC2. По-видимому, 121G12 и 674J13 используют различный набор критических точек контакта в пределах пространства конформационного эпитопа, поскольку они отличаются от MAB197 по меньшей мере 4 из 8 протестированных точковых мутаций.

Пример 4. Создание и определение характеристик конъюгатов антитела к CCR7 и лекарственного средства

В нижеприведенном разделе, мкл используется для обозначения микролитра. Аналогичным образом мкМ используется для микромоль/л; а мкм используется для обозначения микрометра.

[00406] Пример 4A. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4

[00407] Конъюгация очищенных 121G12.CysMab.DAPA и MPET.DM4

[00408] Исходным материалом служило антитело 121G12.CysMab.DAPA при 127 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в буфере на основе 10 мМ гидрохлорида гистидина. К 7,9 мл антитела (1003 мг) добавляли 16 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8 (Teknova S1280), проверяли, чтобы pH составлял >7, затем антитело абсорбировали на 100,3 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) в течение 25 минут с аккуратным перемешиванием круговыми движениями при комнатной температуре. Смолу, загруженную из расчета 10 мг Ab/мл слоя, промывали с помощью 15 объемов слоя 1x буфера PBS (Hyclone SH30256.02) посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм (Nalgene 567-0020), помещаемое на горлышко бутылки, затем ресуспендировали в 100,3 мл 1x PBS с получением 50% взвеси.

[00409] К взвеси добавляли 4329 мкл 0,5 M цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 M фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 минут, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 100,3 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 1003 мкл 100 мкМ CuCl₂ (Aldrich 751944) (суммарно 500 нМ Cu2⁺) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, страница 110 в WO2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00410] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 60 минут), добавляли 3010 мкл 20 мМ исходного раствора MPET.DM4 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00411] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (201 мл) нейтрализовали с помощью 20,1 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, затем концентрировали до 60 мл с применением центрифужных концентраторов (Amicon UFC905024) при 3000 × g. Затем концентрат наносили на буферообменные колонки 24 x PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя.

[00412] Для исследований стабильности материал объединяли с партией, полученной идентичным образом, для обеспечения 2 граммов исходного материала. Объединенный материал интенсивно диализировали (колба Slidealyzer, Thermo Scientific 87762) против буфера на основе 10 мМ хлорида гистидина, pH 5 (гистидин от JTBaker 2080-05), концентрировали до ~30 мг/мл, затем добавляли сахарозу (Millipore 1.00892.1003) и Tween 20 (JTBaker 4116-04) до 240 мМ и 0,02% (объем/объем), соответственно. Для избытка материала, который не требовался для исследований стабильности, проводили обратную замену буфера на 1x PBS. Образцы разделяли на аликвоты, подвергали быстрому замораживанию с помощью жидкого азота и хранили при -80°C. Конечные концентрации составляли 23,9 мг/мл для материала, составленного для тестирования стабильности, и 18,9 мг/мл для материала, составленного в 1x PBS.

[00413] Анализ полученных образцов выглядит следующим образом.

Параметр Образец для оценки стабильности Образец в 1x PBS Концентрация (мг/мл) 23,9 18,9 Пироген (ЕЭ/мл) 0,1 0,05 % агрегатов <1 <1 DAR 3,79 3,79

[00414] Методы анализа. Концентрацию определяли на основании того, что для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7 Пироген определяли с применением анализа Kinetic QCL (Lonza Walkersville 50-650H) со считыванием на планшет-ридере TECAN Safire. Процент агрегатов определяли с помощью аналитической эксклюзионной хроматографии на предколонке Shodex KW-G (Thomson Instrument Company, № по кат. 6960955) и колонке KW-803 (TIC, № по кат. 6960940), уравновешенных подвижной фазой [20 мМ Tris, ~pH 7,65 (приготовленный с помощью 10 мМ Tris, pH 7,4, 10 мМ Tris, pH 8), 200 мМ NaCl, 0,02% азида натрия], с получением данных при 280 нм. Для определения DAR готовили аликвоту образца, которую получали разбавлением образца до 2 мг/мл в 1x PBS, дегликозилированием образца с помощью PNGазы F (получена в лаборатории) в течение 10 минут при 50°C, удалением PNGазы F за счет связывание с белком A, промывкой с помощью 1x PBS и элюированием с помощью 1% муравьиной кислоты. Затем образец вводили в колонку 2,1×50 мм PLRP-S (частицы 8 мкм, размер пор 1000 Å), уравновешенную 0,1% муравьиной кислотой в 20% CH₃CN/в воде (Invitrogen) при расходе 0,5 мл/мин. Колонку промывали с помощью 20% CH₃CN/в воде в течение 3 минут, затем элюировали с помощью 0,1-минутного градиента до 0,1% муравьиной кислоты в 90% CH₃CN/в воде, при этом данную концентрацию поддерживали в течение 1,9 минуты. Данные масс-спектров получали на устройстве Agilent 1260, и деконволюцию проводили с помощью программного обеспечения для качественного анализа MassHunter версии B.05.00 в диапазоне 110-180 кДа. Площади пиков, соответствующих различным рассчитанным состояниям DAR, взвешивали в соответствии с DAR каждого пика, затем суммировали и взвешенную площадь пика DAR4 делили на сумму всех взвешенных пиков с получением значения DAR.

[00415] Получение линкера-полезной нагрузки MPET.DM4

[00416] Аналитические способы

Если не указано иное, в Получении промежуточных соединений и Примерах применяли следующие способы HPLC и HPLC/MS.

Анализ LC/MS осуществляли на системе Agilent 1200sl/6140.

Колонка: Waters Acquity HSS T3 C18, 50×2,0, 1,8 мкм

Подвижная фаза: A) H₂O+0,05% TFA; B: ацетонитрил+0,035% TFA

Параметры работы насоса:

Время A% B% Расход (мл/мин) 0 90 10 0,9 1,35 0 100 0,9 1,36 0 100 0,9 1,95 0 100 0,9 1,96 90 10 0,9 2,0 90 10 0,9

Обнаружение: Диодно-матричный УФ-детектор при 190 нм - 400 нм

Сканирование при MS: 200-1350 amu

ELSD: 60°C

Параметры MS:

Полярность Положительная Сушильный газ 12 Давление распылителя 50 Температура сушильного газа 350 Напряжение на капилляре 3000

[00417] (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси-33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)-оксазинана-3(2,3)-оксиранa-8(1,3)-бензолaциклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил N-(4-((2-(3-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)пропанамидо)этил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-аланинат

[00418] Стадия 1. Получение (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси-33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)-оксазинана-3(2,3)-оксиранa-8(1,3)-бензолaциклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил N-(4-((2-аминоэтил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-аланината

[00419] К DM4 (480 мг, 0,62 ммоль), растворенному в буфере PBS (10,5 мл) и безводном THF (21 мл), добавляли 2-(пиридин-2-илдисульфанил)этан-1-амин (151 мг, 0,68 ммоль) и DIEA (0,27 мл, 1,54 ммоль) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 30 мин и концентрировали под вакуумом. Водный остаток разбавляли с помощью CH₃CN (1 мл) и H₂O (2 мл) и очищали посредством ISCO с обращенной фазой, элюировали с помощью 10-60% ацетонитрила в H₂O, содержащей 0,05% TFA. Фракции, содержащие требуемый продукт, лиофилизировали с получением требуемого продукта (555 мг, выход 93%). ¹H ЯМР (400 МГц, MeOD-d₄) δ ppm 0,83 (s, 3 H) 1,21 (d, J=5,0 Гц, 3 H) 1,25 (s, 3 H) 1,28 (s, 3 H) 1,30 (d, J=5,0 Гц, 3 H) 1,45-1,55 (m, 3 H) 1,67 (s, 3 H) 1,84-1,88 (m, 1 H) 1,95-2,01 (m, 1 H) 2,14 (dd, J=5,0 и 15,0 Гц, 1 H) 2,37-2,43 (m, 1 H) 2,53-2,59 (m, 1 H) 2,64 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1 H) 2,82-2,89 (m, 5 H) 2,91 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 3,16 (dd, J=5,0 и 10,0 Гц, 2 H) 3,20 (s, 3 H) 3,23 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 3,35 (s, 3 H) 3,55 (d, J=5,0 Гц, 1 H) 3,58 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 4,15-4,20 (m, 1 H) 4,64 (dd, J=5,0 и 10,0 Гц, 1 H) 5,43 (q, J=5,0 Гц, 2 H) 5,66 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1 H) ) 6,58 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1 H) 6,65 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 6,66 (s, 1 H) 7,11 (bs, 1H) 7,28 (bs, 1H); MS масса/заряд 855,3 (M+H), Время удерживания 0,988 минуты.

[00420] Стадия 2. Получение (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси-33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)-оксазинана-3(2,3)-оксиранa-8(1,3)-бензолaциклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил N-(4-((2-(3-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)пропанамидо)этил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-аланината

[00421] К (14S,16S,32S,33S,2R,4S,10E,12E,14R)-86-хлор-14-гидрокси-85,14-диметокси-33,2,7,10-тетраметил-12,6-диоксо-7-аза-1(6,4)-оксазинана-3(2,3)-оксиранa-8(1,3)-бензолaциклотетрадекафан-10,12-диен-4-ил-N-(4-((2-аминоэтил)дисульфанил)-4-метилпентаноил)-N-метил-L-аланинату (555 мг, 0,57 ммоль), растворенному в безводном DMSO (7 мл), добавляли 2,5-диоксопирролидин-1-ил-3-(2,5-диоксо-2,5-дигидро-1H-пиррол-1-ил)пропаноат (171 мг, 0,63 ммоль) и DIEA (249 мл, 1,43 ммоль) при комнатной температуре. Реакционную смесь перемешивали при комнатной температуре в течение 15 мин и нейтрализовали с применением TFA. Смесь охлаждали до 0°C с помощью бани со льдом, с последующим добавлением CH₃CN (2 мл) и H₂O (7 мл), а затем очищали посредством ISCO с обращенной фазой, при этом элюировали с помощью 10-70% ацетонитрила в H₂O, содержащей 0,05% TFA. Фракции, содержащие требуемый продукт, лиофилизировали с получением требуемого продукта (430 мг, выход 66%). ¹H ЯМР (400 МГц, CDCl₃) δ ppm 0,81 (s, 3 H) 1,23 (s, 3 H) 1,24 (s, 3 H) 1,25 (s, 1 H) 1,28 (d, J=5,0 Гц, 3 H) 1,31 (d, J=5,0 Гц, 3 H) 1,43-1,49 (m, 1 H) 1,61 (d, J=15,0 Гц, 1 H) 1,64 (s, 3 H) 1,81-1,87 (m, 1 H) 1,94-2,01 (m, 1 H) 2,19 (dd, J=5,0 и 15,0 Гц, 1 H) 2,30-2,36 (m, 1 H) 2,54 (t, J=5,0 Гц, 2 H) 2,61 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1 H) 2,70 (t, J=5,0 Гц, 2 H) 2,88 (s, 3 H) 3,00 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 3,13 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 3,21 (s, 3 H) 3,55 (s, 3 H) 3,45 (q, J=5,0 Гц, 2 H) 3,49 (d, J=5,0 Гц, 1 H) 3,62 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 3,83 (t, J=5,0 Гц, 1 H) 3,98 (s, 3 H) 4,32 (m, 1 H) 4,80 (dd, J=5,0 и 10,0 Гц, 1 H) 5,28 (d, J=5,0 Гц, 1 H) 5,66 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1 H) ) 6,22 (bs, 1 H) 6,42 (dd, J=10,0 и 15,0 Гц, 1 H) 6,50 (s, 1 H) 6,63 (s, 1 H) 6,66 (d, J=10,0 Гц, 1 H) 6,70 (s, 2H) 6,83(s, 1H); MS масса/заряд 988,3 (M+H-H₂O), Время удерживания 1,145 минуты.

[00422] Пример 4B. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 121G12.DAPA.sSPDB.DM4

[00423] К перемешиваемому раствору 25 мМ буфера HEPES, pH 7,6 (3 мл; стерильный) и диметилацетамида (DMAc; 0,12 мл) при 22°C добавляли раствор (1,695 мл) 121G12.DAPA; MW ~145546 г/моль; 62 мг (0,426 мкмоль)) в буфере на основе фосфата калия (10 мМ, pH6; стерильный). Добавляли майтанзиноид DM4 (2,42 мг (3,101 мкмоль), растворенный в 0,242 мл DMAc. Добавляли линкер сульфо-SPDB (0,970 мг (2,386 мкмоль, скорректирован для анализа), растворенный в 0,970 мл DMAc. Спустя 18 ч реакционную смесь анализировали на завершенность реакции с помощью SEC-UV и HPLC.

[00424] Реакционную смесь очищали от низкомолекулярных побочных продуктов и проводили замену буфера путем фильтрации через мембранные ячейки Amicon; отсекаемая молекулярная масса 30 кДа, с применением 10 мМ буфера PBS, pH 7,4 (стерильный) для промывки. Полученные после применения Amicon ультраконцентраты объединяли и разбавляли до 10 мг/мл (УФ) с получением 2,9 мл раствора конъюгата антитела и лекарственного средства, 121G12.DAPA.sSPDB-DM4, в 10 мМ буфере PBS, pH 7,4 (извлечение белка 49%).

[00425] С помощью SEC-UV определили, что соотношение лекарственного средства и антитела составляет n= 3,6, а мономерная чистота составляет 98,7%. Уровень эндотоксинов составлял 0,14 ЕЭ/мг (тест BET Endosafe).

[00426] Пример 4C. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 684E12.SMCC.DM1

(n=3,6)

[00427] К раствору антитела (исходное 684E12) (7,1 мг/мл, 3,4 мл, приблизительно 47 мкМ, PBS, pH 7,4) добавляли 100 мкл 2 мМ DM1 (0,17 мг) в DMA и 50 мкл 4 мМ сульфо-SMCC (0,15 мг) в DMA и смесь инкубировали и аккуратно перемешивали при 4°C в течение ночи. После инкубации реакционную смесь очищали путем обессоливания на обессоливающей колонке HiPrep 26/10 (GE Healthcare) с применением PBS, pH 7,4, в качестве подвижного буфера, и стерилизовали фильтрацией. Очищенный конъюгат анализировали с помощью MALDI-MS, и, согласно оценкам, DAR составило 2,6. Аналитическая SEC показала, что в образце присутствует 3,7% агрегация (или 96,3% мономеров), а тестирование LAL (PTS, Charles River Laboratories) определило, что показатель эндотоксинов составляет 0,36 ЕЭ/мг.

[00428] Пример 4D. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 506E15.AURIX1

Исходным материалом служило антитело 506E15.CysMab (Fc WT) при 18,8 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1x забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 1,76 мл антитела абсорбировали на 3 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) и к полученной взвеси добавляли 240 мкл 0,5 M цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 M фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 минут, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 60 мкл 100 мкМ CuCl2 (Aldrich 751944) (суммарно 100 нМ Cu2⁺) для инициирования повторного окисления. Спустя 420 минут добавляли дополнительные 90 мкл 100 мкМ CuCl₂ для дополнительного ускорения повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, страница 110 в WO2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00429] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 565 минут), добавляли 220 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 70 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00430] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (6 мл) нейтрализовали с помощью 0,6 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 2,5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000 × g, наносили на буферообменную колонку PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенную 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 22 мг (66%).

[00431] Пример 4E. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 506E15.CysMab.DAPA.AURIX2

Исходным материалом служило антитело 506E15.CysMab.DAPA при 10 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1x забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 2,0 мл антитела абсорбировали на 2 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) и к полученной взвеси добавляли 160 мкл 0,5 M цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 M фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 30 минут, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 10 мкл 100 мкМ CuCl₂ (Aldrich 751944) (суммарно 250 нМ Cu2⁺) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, страница 110 в WO2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00432] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 295 минут), добавляли 80 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX2 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 85 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00433] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (4 мл) нейтрализовали с помощью 0,4 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, наносили на 2 буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1x PBS, при загрузке 2,5 мл элюата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 13,3 мг (67%).

[00434] Пример 4F. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 674J13.CysMab.AURIX1

[00435] Исходным материалом служило антитело 674J13.CysMab (Fc WT) при 9 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1x забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). К 57,6 мл антитела добавляли DTT до 200 мМ (Invitrogen 15508-013) и раствор инкубировали в течение 75 минут для сильного восстановления Ab. Затем восстановленные Ab наносили на буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Элюаты из колонок PD10 объединяли, затем вновь наносили на свежие колонки PD10 для более полного удаления DTT. Обратите внимание, что в отдельных экспериментах колонки PD10 являются более эффективными в удалении DTT, чем можно было бы наблюдать при использовании только механизма эксклюзионной хроматографии, при условии, что колонки используют только один раз.

[00436] Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1, который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00437] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 180 минут), добавляли 290 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO вместе с 6 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I). Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 40 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00438] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (11,5 мл) нейтрализовали с помощью 1,2 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 2,5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000 × g, наносили на буферообменную колонку PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенную 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 26 мг (41%).

[00439] Пример 4G. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 674J13.CysMab.DAPA.AURIX2

[00440] Исходным материалом служило антитело 674J13.CysMab.DAR4.DAPA при 31,7 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1x забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 9,5 мл антитела абсорбировали на 30,1 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) и к полученной взвеси добавляли 1800 мг DTT (Invitrogen 15508-013) для сильного восстановления Ab (суммарно 200 мМ DTT). Взвесь перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 20 минут, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS и перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре, при этом не добавляли медь (она ускоряла повторное окисление слишком сильно). Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора эталонного малеимида (пример 3, страница 110 в WO2015/095301), который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00441] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 80 минут), добавляли 903 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX2 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 50 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00442] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (60,2 мл) нейтрализовали с помощью 6,0 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 17,5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000 × g, наносили на 7 буферообменных колонок PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенных 1x PBS, при загрузке 2,5 мл концентрата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 243 мг (81%)

[00443] Пример 4H. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 121G12.CysMab.DAPA.AURIX1

[00444] Исходным материалом служило антитело 121G12.CysMab.DAPA при 16,7 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1x забуференном фосфатом солевом растворе (1x PBS). 3,6 мл антитела абсорбировали на 6 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) и полученную взвесь перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 125 минут, затем добавляли 544 мкл 0,5 M цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 M фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 60 минут, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 16 мкл 100 мкМ CuCl₂ (Aldrich 751944) (суммарно 250 нМ Cu2⁺) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1, который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00445] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 170 минут), добавляли 67 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 120 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00446] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (15 мл) нейтрализовали с помощью 1,5 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000 x g, наносили на 2 буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1x PBS, при загрузке 2,5 мл элюата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 54 мг (92%).

[00447] Пример 4I. Получение конъюгата антитела и лекарственного средства 121G12.CysMab.AURIX1

Исходным материалом служило антитело 121G12.CysMab (Fc WT) при 12,5 мг/мл (для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7) в 1x забуференном фосфатом солевом растворе (1xPBS). 4,8 мл антитела абсорбировали на 6 мл смолы RMP с белком A (GE Healthcare 1-223BPO/I) и полученную взвесь перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 125 минут, затем добавляли 592 мкл 0,5 M цистеина (Sigma G121-03), составленного в 0,5 M фосфате, pH 8, в который был добавлен NaOH (Alfa Aesar A16037) при соотношении 13,6 г/л. Взвесь изредка перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 60 минут, затем промывали посредством вакуум-фильтрации через фильтрующее устройство с размером пор 0,2 мкм, помещаемое на горлышко бутылки, с помощью 50 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления. Промытую смолу ресуспендировали в 2 мл 1x PBS (50% взвесь) и добавляли 16 мкл 100 мкМ CuCl₂ (Aldrich 751944) (суммарно 250 нМ Cu2⁺) для инициирования повторного окисления. Повторное окисление антитела тестировали путем изъятия 30-мкл аликвоты взвеси, добавления 1 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1, который, как известно, сдвигает пик антитела при RPLC, смешивания в течение 1 минуты, центрифугирования при 7000 × g в течение 10 секунд, удаления супернатанта, добавления 60 мкл буфера для элюирования IgG Thermo (Thermo Scientific 21009), центрифугирования при 14000 × g в течение 10 секунд, отбора образцов супернатанта и анализа продуктов с помощью RPLC следующим образом: 2-мкл образец вводили в нагретую (80°C) колонку 4,6×50 мм Agilent PLRP-S (частицы 5 мкм, размер пор 4000 Å), уравновешенную 0,1% трифторуксусной кислотой в 29,5% CH₃CN/в воде (Millipore TX1280P-1, Burdick and Jackson 407-4) при расходе 1,5 мл/мин. Колонку элюировали с помощью 5-минутного градиента до 44,5% CH₃CN/в воде, поддерживали данную концентрацию в течение 1,9 минуты и пики определяли при 280 нм. Оптимальное время для конъюгации определяется как время, при котором максимального значения достигает пик основного продукта, сокращены до минимума пики с более поздним элюированием, и более не возрастают пики с более ранним элюированием.

[00448] Когда анализ RPLC показывал, что повторное окисление было оптимальным (в данном случае 160 минут), добавляли 67 мкл 20 мМ исходного раствора AURIX1 в DMSO и взвесь изредка аккуратно перемешивали путем вращения сосуда при комнатной температуре в течение 120 минут. Затем взвесь промывали с помощью 20 объемов слоя 1x PBS за по меньшей мере 10 циклов фильтрации и добавления.

[00449] Затем взвесь переносили в колонку с пористым стеклянным фильтром (Pierce 7375021), предварительно элюировали с помощью 0,5 объема слоя буфера для элюирования IgG Thermo (отбрасывали), затем элюировали с помощью 2 объемов слоя того же буфера. Весь элюат (15 мл) нейтрализовали с помощью 1,5 мл 0,5 M фосфата натрия, pH 8, концентрировали до 5 мл с применением центрифужного концентратора (Amicon UFC905024) при 3000 x g, наносили на 2 буферообменные колонки PD-10 (GE Healthcare 17-0851-01), уравновешенные 1x PBS, при загрузке 2,5 мл элюата и элюировании с помощью 3,5 мл 1x PBS согласно рекомендациям изготовителя. Выход составил 52 мг (89%).

Методы анализа. Концентрацию определяли на основании того, что для 10 мг/мл раствора IgG коэффициент экстинкции при OD280 составляет 13,7 Пироген определяли с применением анализа Kinetic QCL (Lonza Walkersville 50-650H) со считыванием на планшет-ридере TECAN Safire. Процент агрегатов определяли с помощью аналитической эксклюзионной хроматографии на предколонке Shodex KW-G (Thomson Instrument Company, № по кат. 6960955) и колонке KW-803 (TIC, № по кат. 6960940), уравновешенных подвижной фазой [20 мМ Tris, ~pH 7,65 (приготовленный с помощью 10 мМ Tris, pH 7,4, 10 мМ Tris, pH 8), 200 мМ NaCl, 0,02% азида натрия], с получением данных при 280 нм. Для определения DAR получали аликвоту образца посредством разбавления образца до 2 мг/мл в 1x PBS, дегликозилирования образца с помощью PNGазы F (получена в лаборатории) в течение 10 минут при 50°C, удаления PNGазы F за счет связывание с белком A, промывки с помощью 1x PBS и элюирования с помощью 1% муравьиной кислоты. Образец восстанавливали добавлением 1/4 объема 5 M ацетата аммония, pH 5,0, содержащего 0,5 M TCEP, и инкубирования при комнатной температуре в течение 30 минут. Затем образец вводили в колонку 2,1×50 мм PLRP-S (частицы 8 мкм, размер пор 1000 Å), уравновешенную 0,1% муравьиной кислотой в 20% CH₃CN/в воде (Invitrogen) при расходе 0,5 мл/мин. Колонку промывали с помощью 20% CH₃CN/в воде в течение 3 минут, затем элюировали с помощью 0,1-минутного градиента до 0,1% муравьиной кислоты в 90% CH₃CN/в воде, при этом данную концентрацию поддерживали в течение 1,9 минуты. Данные масс-спектров получали на устройстве Agilent 1260, и деконволюцию проводили с помощью программного обеспечения для качественного анализа MassHunter версии B.05.00 в диапазоне 15-60 кДа. Площади пиков, соответствующих различным рассчитанным состояниям DAR, взвешивали в соответствии с DAR каждого пика, затем суммировали и взвешенную площадь пика DAR4 делили на сумму всех взвешенных пиков с получением значения DAR.

Анализ полученного образца выглядит следующим образом.

Параметр 506E15.DAPA.
AURIX2 506E15.
AURIX1 674J13.DAPA.
AURIX2 674J13.
AURIX1 121G12.
AURIX1 121G12.DAPA
AURIX1 Концентрация (мг/мл) 1,9 6,7 9 8,4 7,5 7,8 Пироген (ЕЭ/мл) 0,05 0,42 0,05 <0,5 0,05 0,05 % агрегатов <1 <1 2,8 <1 1,2 1,9 DAR 3,80 3,78 HC 3,93
LC 0,03 HC 3,8 3,80 3,80

[00450] Пример 4J. Получение дополнительных конъюгатов с применением других антител CysMab

[00451] Способы, описанные в примере 4A, также применяли для получения конъюгатов MPET.DM4 с другими антителами с цистеинами, введенными путем конструирования.

[00452] Способы применяют для получения конъюгатов Ab.CysMab.MPET.DM4, связывающих P-кадгерин,с применением антител NOV169N31Q(E152C-S375C), NEG0012(E152C-S375C), NEG0013(E152C-S375C), NEG0016(E152C-S375C), NEG0064(E152C-S375C), NEG0067(E152C-S375C), NOV169N31Q(K360C(HC)-K107C(LC)), NEG0012(K360C(HC)-K107C(LC)), NEG0013(K360C(HC)-K107C(LC)), NEG0016(K360C(HC)-K107C(LC)), NEG0064(K360C(HC)-K107C(LC)) и NEG0067(K360C(HC)-K107C(LC)), раскрытых в PCT-публикации № WO2016/203432.

Пример 5. In vitro определение характеристик ADC

[00453] Характеристики конъюгатов антитела и лекарственного средства (ADC) определяли с помощью различных функциональных и аналитических методов. По результатам оценки с помощью FACS ADC сохраняли связывание с белком-мишенью CCR7 на клетках. В случае всех ADC геометрическое среднее интенсивности флуоресценции в анализе связывания FACS находилось в пределах 20% от значения для неконъюгированного антитела. По результатам аналитической SEC было показано, что >95% материала ADC характеризовались требуемой молекулярной массой; в случаях, где это не наблюдалось для исходных продуктов реакции, применение препаративной SEC позволяло достичь необходимой спецификации. Соотношение лекарственного средства и антитела (DAR) оценивали с помощью LCMS образца дегликозилированного восстановленного антитела, при суммировании встречаемости различных разновидностей DAR и уравновешивания числа молекул лекарственного средства на каждой разновидности DAR (например, один ион с DAR2 считался как 2, один ион с DAR1 считался как 1). Конъюгаты, содержащие константные области, содержащие две цистеиновые мутации, характеризовались по меньшей мере DAR 3,4 или выше и наиболее обычно DAR 3,8 или выше. Для всех зарегистрированных конъюгатов данные были согласованы.

Пример 6. Ингибирование пролиферации клеток/анализ жизнеспособности клеток

[00454] Выше авторы настоящего изобретения показали, что конъюгированные с флуорофором варианты всех трех антител к CCR7 могли приводить к интернализации CCR7 и эффективному накоплению конъюгированного флуорофора в компартментах клеток с низким pH для целого набора линий клеток. В данном примере авторы настоящего изобретения показывают способность антитела к интернализации и накоплению конъюгированного вещества внутри клетки в режиме, при котором конъюгированное вещество представляет собой токсичную полезную нагрузку.

[00455] В режиме "piggyback" ADC (pgADC) цитотоксические эффекты антител к CCR7 в комплексе с фрагментом вторичного антитела, конъюгированного с полезной нагрузкой, изучали путем оценки жизнеспособности клеток после четырех дней обработки. Получали трехкратные разбавления CCR7-специфических IgG и смешивали их с постоянным количеством Fab-фрагмента, сопряженного с полезной нагрузкой. Конечная концентрация Fab-фрагмента, сопряженного с полезной нагрузкой, составляла 0,5 мкг/мл. Реагент Fab представляет собой направленный на Fc мыши Fab, конъюгированный или с MMAF, или с сапорином (Advanced Targeting Systems, Fab-Zap). После предварительной инкубации в течение 30 мин при комнатной температуре по 10 мкл/лунка комплекса антитело-полезная нагрузка добавляли в 384-луночные планшеты с белым дном в трех повторностях. Соответствующие CCR7(+) клетки высевали таким образом, чтобы их плотность составляла менее 1×10⁶/мл в случае клеток из суспензионных культур и достигалась 80% конфлюэнтность в случае адгезивных клеток. Клетки собирали (адгезивные клетки отделяли с помощью аккутазы) и ресуспендировали до примерно 2×10⁴ клеток/мл. Клетки добавляли в 384-луночные планшеты поверх комплекса антитело-полезная нагрузка (20 мкл/лунка). Планшет инкубировали в течение четырех дней при 37°C и 5% CO₂. Затем готовили раствор CellTiter-Glo (CellTiter-Glo® люминесцентный анализ жизнеспособности клеток; Promega, № G7571) и добавляли к клеткам из расчета 20 мкл/лунка. Только жизнеспособные клетки продуцируют АТФ, необходимый для люциферазной реакции (предоставленной CellTiter-Glo), которая приводит к люминесценции. В соответствии с этим жизнеспособность клеток определяли по сигналу люминесценции, который измеряли после 10 мин инкубации при 22°C и 400 об/мин с помощью ридера для нескольких меток Envision 2104. Значения IC50 рассчитывали с применением программного обеспечения Graphpad Prism.

[00456] На фигуре 7A и фигуре 7B показано, что все четыре антитела к CCR7 способны к зависимому от концентрации цитолизу клеток при использовании CCR7+ KE97 клеток в анализе формата "piggyback" с применением MMAF-конъюгированного реагента. В таблице ниже обобщены результаты экспериментов с применением MMAF или сапорина в качестве инструмента-полезной нагрузки при формате "piggy-back".

Таблица 16. IC₅₀ и AMAX антител к CCR7 в цитотоксическом анализе с применением pgADC

Антитело к mFc.MMAF Fab-ZAP IC50 (нM) AMAX (%) IC50 (нM) AMAX (%) Исходное 121G12 0,055 104 0,064 43 Исходное 506E15 0,070 95 0,135 60 Исходное 674J13 0,137 102 6,12 31 Исходное 684E12 0,214 80 2,60 33 MAB197 (R&D) 0,142 85 0,155 40

[00457] Специфичность цитолиза под действием pgADC оценивали с применением линий клеток, отрицательный по мишени. На фигуре 8 показан пример с использованием реагента FabZap. Специфическое CCR7-зависимое повышение активности 121G12 pgADC наблюдали в случае клеток KE97 и NIH3T3.hCCR7 в отличие от CCR7-отрицательных исходных клеток NIH3T3 или контрольного антитела mIgG.

Пример 7. Воздействие перекрестно реактивных для мыши неконъюгированных или конъюгированных с AURIX1 антител к CCR7 на нормальные гемопоэтические клетки мыши in vivo

[00458] Экспрессия в нормальных тканях в пределах вида ограничена клетками гемопоэтического происхождения, включая CD4+ и CD8+ T клетки в крови и лимфоидных органах, что делает ADC, нацеливающийся на CCR7, потенциально небезопасным, особенно в формате Fc дикого типа, который мог бы приводить к ADCC и истощению лимфоидных клеток.

[00459] Чтобы определить воздействие нацеливания ADC на CCR7, находящийся на нормальных гемопоэтических клетках in vivo, на здоровых самках мышей CD-1 возраста 6-8 недель оценивали перекрестно реактивное для мыши исходное Ab 121G12 как в неконъюгированном состоянии, так и конъюгированное с AURIX1, при этом формат Fc был дикого типа или "молчащий" (DAPA). Мышей обрабатывали путем введения однократной IV инъекции, содержащей исходное 121G12.Cys-Mab.Fc дикого типа.hIgG1 (121G12.wt.Fc), исходное 121G12.Cys-Mab.DAPA.hIgG1 (121G12.DAPA.Fc), исходное 121G12.Cys-Mab.Fc дикого типа.hIgG1.AURIX1 (121G12.wt.Fc.AURIX1) или исходное 121G12.Cys-Mab.DAPA.hIgG1.AURIX1 (121G12.DAPA.Fc.AURIX1) при конечной дозе, составляющей 10 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.

[00460] В день 25 после обработки селезенки извлекали и разделяли на суспензию из отдельных клеток с применением gentleMACS Dissociator (Miltenyi Biotec Inc, Сан-Диего, Калифорния). Затем 1 миллион клеток в каждом образце окрашивали с помощью смеси Ab, которая содержала крысиное антитело к CD8a мыши BUV737, клон 53-6.7 (1:100) (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния, № по кат. 564297), и крысиное антитело к CD4 мыши BV510, клон RM4-5 (1:200) (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния, № по кат. 563106), чтобы определить воздействие отдельных обработок на CD4+ и CD8a+ T-клетки. Образцы инкубировали при 4°C в течение 30 мин, промывали в ледяном забуференном фосфатом солевом растворе HyClone (Hyclone Laboratories, Логан, Юта) и оценивали на клеточном анализаторе BD LSRFortessaTM (BD Biosciences, Сан-Хосе, Калифорния). Подсчет общего количества спленоцитов использовали для определения истощения CD4+ или CD8a+ T-клеток. T-критерий использовали для определения значимости различий между группами.

[00461] Как показано в таблице 17 и на фигуре 9, сильное сокращение числа CD4+ (FC 0,5-0,6) и CD8a+ T-клеток (FC 0,3-0,5) в селезенке наблюдали на день 3 обработки с помощью Ab 121G12.wt.FC или 121G12.wt.Fc.AURIX1 при 10 мг/кг, это позволяет предположить, что воздействие в виде истощения T-клеток не зависело от присутствия полезной нагрузки AURIX1. От таких эффектов избавляются путем получения "молчащей" Fc за счет введения мутаций DAPA. Как 121G12.DAPA.Fc, так и 121G12.DAPA.Fc.AURIX1 не оказывали воздействия на популяции T-клеток в сравнении с группой без обработки. Эти данные указывают на то, что ADC к CCR7 могут быть небезопасными с точки зрения истощения T-клеток, что можно предотвратить путем получения "молчащей" Fc за счет мутаций DAPA.

Таблица 17. Воздействие антитела 121G12 на популяции CD4+ и CD8a+ T-клеток у мышей CD-1

Эксперимент оценивали в день 25 после обработки. Кратное изменение (FC)=среднее количество спленоцитов в день 25 для указанной группы обработки/среднее количество спленоцитов для контрольной группы без обработки в день 3. T-критерий использовали для определения значимости в сравнении с группой без обработки (*p<0,05, ***p<0,001; NS=не значимо).

Пример 8. Активность ADC к CCR7 в формате прямых конъюгатов

[00462] Цитотоксические эффекты после связывания антител (ADC), напрямую конъюгированных с различными полезными нагрузками, и их интернализацию в CCR7(+) клетки исследовали путем оценки жизнеспособности клеток после четырех дней обработки. Трехкратные разбавления ADC вносили в 384-луночные планшеты с белым дном в трех повторностях (10 мкл/мл). Соответствующие CCR7(+) клетки высевали таким образом, чтобы их плотность составляла менее 1×10⁶/мл в случае клеток из суспензионных культур и достигалась 80% конфлюэнтность в случае адгезивных клеток. Клетки собирали (адгезивные клетки отделяли с помощью аккутазы) и ресуспендировали до примерно 2×10⁴ клеток/мл. Клетки добавляли в 384-луночные планшеты поверх антитела (20 мкл/лунка). Планшеты инкубировали в течение четырех дней при 37°C и 5% CO₂. Затем готовили раствор CellTiter-Glo (CellTiter-Glo® люминесцентный анализ жизнеспособности клеток; Promega, № G7571) и добавляли к клеткам из расчета 20 мкл/лунка. Жизнеспособность клеток определяли по сигналу люминесценции, который измеряли после 10 мин инкубации при 22°C и 400 об/мин, с помощью ридера Envision. Значения IC50 рассчитывали с применением программного обеспечения Graphpad Prism.

[00463] В таблице ниже показаны примеры эффектов в отношении жизнеспособности клеток, измеренных для антител CysMab к CCR7 в формате Fc дикого типа или "молчащей" (DAPA) Fc, конъюгированных с AURIX1 или AURIX2.

Таблица 18. IC₅₀ для ADC к CCR7 в цитотоксическом анализе

Активность ADC в анализе жизнеспособности клеток; IC₅₀ (нМ) Линия клеток Тип рака 506E15.CysMab.AURIX1 674J13.
CysMab. AURIX1 506E15.
CysMab.DAPA.
AURIX2 674J13.
CysMab.DAPA.AURIX2 DEL ALCL 0,0029 0,0741 0,0084 0,1167 KE97 Множественная миелома 0,0031 0,03 0,0131 0,0658

[00464] Чтобы оценить ADC на специфичность в отношении мишени и зависимость от уровня рецепторов, активность ADC тестировали на линиях клеток с различными уровнями CCR7-рецепторов. В таблице ниже показан пример гуманизированного антитела 674J13 в формате CysMab.DAPA и конъюгированного с AURIX2. Линии клеток отбирали на основании сходной чувствительности к полезной нагрузке.

Таблица 19. IC₅₀ гуманизированного антитела 674J13 в формате DAPA и конъюгированного с AURIX2

Активность ADC в анализе жизнеспособности клеток; IC50 (нМ) Линия клеток Тип рака Уровни CCR7-рецепторов 674J13.CysMab.DAPA.AURIX2 DEL ALCL ~100,000 0,2417 (>95% от AMAX) KE97 Множественная миелома ~100,000 0,1018 (>95% от AMAX) SR786 Анапластическая крупноклеточная T-клеточная лимфома ~28,000 2,737 (90% от AMAX) CML-T1 T-клеточный лейкоз ~29,000 3,779 (60% от AMAX) DND-41 T-клеточный лейкоз 1,700 < 20% от AMAX NCI-H82 Мелкоклеточный рак легкого 0 Отсутствие цитолиза

[00465] Как видно из эксперимента pHrodo, для активности ADC требуется более высокая степень числа рецепторов, чем для механизма ADCC. Точное граничное значение числа рецепторов зависит от различных параметров (например, авидности антитела, активности полезной нагрузки), а данные, показанные в данном примере, описывают общие принципы. Применение зависимого от авидности антитела к CCR7 в формате DAPA сдвигает активность ADC в направлении раковых клеток, а не нормальных CCR7+ PBMC, которые в данном примере представлены линиями раковых клеток с менее 2000 CCR7-рецепторов.

Пример 9. Сайт-специфическое введение MPET.DM4 в ADC

[00466] ADC, конъюгированные с DM4, являются общепринятыми в области техники ADC. В данном примере авторы настоящего изобретения описывают создание и применение сайт-специфически конъюгированного MPET.DM4 с использованием варианта CysMab антител, что обеспечивает преимущество получения воспроизводимо однородной партии ADC с контролируемым DAR, в которой DAR (отношение лекарственного средства к антителу) составляет приблизительно 4. Было описано, что конъюгаты, полученные без использования сайт-специфической конъюгации, зачастую содержат значительные популяции с высоким DAR, которые связывали с нежелательными биофизическими особенностями, в том числе повышенной гидрофобностью и, следовательно, более быстрым клиренсом, неудовлетворительным PK-профилем и повышенной токсичностью. Ниже авторы настоящего изобретения показывают различные in vitro и in vivo оценки ADC к CCR7 на основе MPET.DM4 в сравнении с его аналогом на основе sSPDB.DM4.

Пример 10. Аффинность связывания ADC с MPET.DM4 в сравнении с ADC с sSPDB.DM4 в анализе FACS

[00467] Другим потенциальным благоприятным эффектом сайт-специфической конъюгации в сравнении с отсутствием сайт-специфической конъюгации могла быть потенциальная интерференция сайтов конъюгации с лизином, которые структурно расположены вблизи важных CSD-остатков. Можно ожидать, что конъюгация полезной нагрузки с такими лизиновыми сайтами будет воздействовать на аффинность связывания ADC. Чтобы протестировать аффинности связывания ADC с применением описанных в данном примере CysMab, конъюгированных с MPET.DM4, в сравнении с антителами, конъюгированными с sSPDB.DM4 через эндогенный лизин, аффинность связывания определяли с помощью FACS, как описано выше. В таблице ниже обобщены некоторые типичные данные аффинности, которые показывают умеренное снижение аффинности связывания sSPDB.DM4 ADC в сравнении с MPET.DM4 ADC.

Таблица 20. Аффинность связывания ADC к CCR7

Аффинность ADC в анализе FACS; EC50 (нМ) Линия клеток Уровни CCR7-рецепторов 121G12.
CysMab.DAR4, неконъюгированное 121G12.
CysMab.DAPA.
MPET.DM4
(DAR 3,8) 121G12.
DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) DEL ≥100,000 5,24 5,61 8,42

Пример 11. In vitro активность ADC с MPET.DM4 в сравнении с ADC с sSPDB.DM4

[00468] Цитотоксические эффекты ADC 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) оценивали в in vitro анализе жизнеспособности, как описано выше. В таблице ниже показана аналогичная, слегка улучшенная активность конъюгата с MPET.DM4 по сравнению с конъюгатом с sSPDB.DM4. Это может быть следствием лучше сохраненной аффинности или других факторов.

Таблица 21. In vitro цитотоксическая активность ADC к CCR7

Активность ADC в анализе жизнеспособности клеток; IC50 (нМ) Линия клеток 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) L540 2,944 3,905 DEL 2,286 2,983 KE97 2,171 3,177

[00469] ADC 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 дополнительно тестировали на ряде линий раковых клеток, охватывающих различные показания, где он достигал значительного цитолиза клеток, который коррелировал с плотностью рецепторов.

Таблица 22. In vitro цитотоксическая активность ADC к CCR7 у линий клеток

Линия клеток Тип рака Относительная плотность рецепторов (%) IC50 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (нМ) SUPHD1 Лимфома Ходжкина 310 1,69 L540 Лимфома Ходжкина 175 4,90 KE97 Множественная миелома 100 2,24 JVM2 MCL 79 4,62 MOTN1 CLL 67 4,24 DEL ALCL 67 2,28 OCI-Ly3 ABC-DLBCL 43 6,42 Toledo DLBCL 20 n.d. Mec-2 CLL 15 >20 PEER T-ALL 2 >20

Пример 12. Дозозависимая in vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97 у мышей SCID-Beige

[00470] Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 и 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 in vivo, ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 135 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=8 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе, составляющей 0,5, 2 или 5 мг/кг, 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR 3,9) из расчета 0,5, 2 или 5 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.

[00471] Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки (таблица 23).

Таблица 23. Дозозависимая эффективность ADC к CCR7 в отношении ксенотрансплантатной модели KE97

Реакция опухоли Реакция хозяина обработка Доза, схема введения ΔT/ΔC (%) Регрессия (%) Δ массы тела (%) Выживание (живые/общее коли
чество) Без обработки Отсутствует 100 - 2,09 8/8 IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 5 мг/кг
Однократная доза 92,94 - 3,02 8/8 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 0,5 мг/кг
Однократная доза 78,62 - 1,05 8/8 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 2 мг/кг
Однократная доза - 33,07* 2,74 8/8 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 5 мг/кг
Однократная доза - 53,66* 0,46 8/8 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 0,5 мг/кг
Однократная доза 85,38 - 1,84 8/8 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 2 мг/кг
Однократная доза 13,77* - 0,59 8/8 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 5 мг/кг
Однократная доза - 32,63* 3,63 8/8

Эксперимент оценивали в день 9 после обработки (день 23 после имплантации), * p<0,001 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений). % ΔT/ΔC=100 ΔT/ΔC, где: ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D23 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы; ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D23 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы D14. % регрессии=(1-T конечный/T начальный)×100, где T конечный представляет собой средний объем опухоли в D23, а T начальный определяется как объем опухоль в D14 после имплантации. Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D23-средняя масса тела в D14) *100/средняя масса тела в D14 обработки.

[00472] Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к дозозависимой противоопухолевой эффективности со значением ΔT/ΔC, составляющим 78,62% (0,5 мг/кг), в тоже время дозы 2 и 5 мг/кг приводили к средней регрессии на 33% и 54%, соответственно, ко D9 после введения первой дозы (D23 после имплантации). Обработка 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 также продемонстрировала дозозависимую противоопухолевую эффективность со значениями ΔT/ΔC, составляющими 85,38% (0,5 мг/кг) и 13,77% (2 мг/кг), в то же время доза 5 мг/кг приводила к средней регрессии, составляющей 33%, ко D9 после введения первой дозы (D23 после имплантации). Ко D23-D25 после имплантации мышей контрольных групп и групп обработки дозой 0,5 мг/кг умерщвляли, а оставшиеся группы обрабатывали второй дозой в D28 после имплантации одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 или 5 мг/кг или 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 2 или 5 мг/кг. Устойчивую регрессию опухоли наблюдали в случае введения 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 и 5 мг/кг, а также в случае 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 5 мг/кг вплоть до конца исследования в D42 после имплантации. В случае 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 2 мг/кг реакция была более гетерогенной, причем у примерно 25% мышей проявлялась устойчивая регрессия опухоли, в то же время у остальной группы показаны или стабилизация заболевания, или прогрессирование опухоли (фигура 10, таблица 23).

Пример 13. Оценка эффективности 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в сравнении с 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 в отношении модели множественной миеломы KE97 при больших начальных объемах опухоли

[00473] In vivo модель c более высокими требованиями обеспечивали с применением линии клеток множественной миеломы KE97, чтобы провести дополнительное различие в противоопухолевой эффективности, обусловленной разными расщепляемыми линкерами, путем сравнения эффективности 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 (DAR3,9) в отношении опухолей с большими начальными объемами опухоли при введении первой дозы. Ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 450 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в две группы обработки (n=8). Мышей обрабатывали путем IV введения 2 мг/кг одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 или 121G12.DAPA.sSPDB.DM4.

[00474] Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 из расчета 2 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к частичной регрессии/продолжительной остановке роста у 75% (6 из 8) мышей с обработкой однократной дозой (фигура 11). 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 сильно превосходило 121G12.DAPA.sSPDB.DM4 в данной модели (в D25 средний объем опухоли составлял 524,83 ± 143,20 в сравнении с 1337,13 ± 35,13, соответственно, p<0,001; непарный T-критерий).

Пример 14. In vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели опухоли на основе полученного от пациента первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1934

[00475] Противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 оценивали на ксенотрансплантатной модели первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1934, экспрессирующего CCR7. Самкам бестимусных "голых" мышей имплантировали подкожно фрагменты опухоли в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 100 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=8). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) из расчета 10 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 10 мг/кг. Вторую дозу каждого антитела вводили спустя 2 недели. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.

[00476] Неспецифическое изотипическое контрольное IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 10 мг/кг, по-видимому, приводило к небольшой задержке роста опухоли по сравнению с группой без обработки (значение ΔT/ΔC составляло 53,07%), потенциально вследствие неспецифического связывания антитела с нецелевой мишенью в модели HLUX1934. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к более выраженной эффективности, которая была устойчивой при введении второй дозы. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 при дозе 10 мг/кг хорошо переносилась, при этом отсутствовала явная потеря массы тела, а значение ΔT/ΔC составляло 18,83% в D34 после имплантации (фигура 12, таблица 24).

Таблица 24. Эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели полученного от пациента NSCLC HLUX1934. Эксперимент оценивали в день 34 после имплантации (D23 после обработки)

Реакция опухоли Реакция хозяина Обработка Доза ΔT/ΔC (%) Δ массы тела (%) Выживание (живые/общее количество) Без обработки Отсутствует 100 5,12 5/8** IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 10 мг/кг 53,07 2,81 8/8 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 10 мг/кг 18,83* 0,61 8/8

* p<0,001 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений). % ΔT/ΔC=100 ΔT/ΔC, где: ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D34 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы; ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D34 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы. Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D34-средняя масса тела в D11) *100/средняя масса тела в D11 обработки. ** В группе без обработки мышей умерщвляли из-за избыточной опухолевой массы в D25-D27 после обработки.

Пример 15. In vivo эффективность 684E12.SMCC.DM1 в отношении ксенотрансплантатной модели множественной миеломы KE97 у мышей SCID-Beige

[00477] Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 684E12.SMCC.DM1 in vivo, ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 200 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=8 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из исходного 684E12.SMCC.DM1 (DAR2,6) при конечной дозе 2 или 6 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.SMCC.DM1 из расчета 6 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.

[00478] Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки. Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным IgG1.SMCC.DM1 или исходным 684E12.SMCC.DM1 из расчета 2 мг/кг. Обработка исходным 684E12.SMCC.DM1 из расчета 6 мг/кг приводила к значению ΔT/ΔC, составляющему 6,72% в D11 после введения дозы (p<0,0001, однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений) (фигура 13).

Пример 16. In vivo целевая модуляция фармакодинамических маркеров под действием 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в модели опухоли KE97

[00479] Накопление опухолевых клеток, положительных по маркеру фосфо-гистон H3, после обработки 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 применяли для оценки способности ADC к CCR7 индуцировать остановку на стадии G2/M in vivo.

[00480] Проводили исследование, при котором ксенотрансплантатную модель KE97 приживляли самкам мышей SCID-beige посредством подкожной инъекции 3×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 140 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=3 на группу). Мышей обрабатывали путем однократного IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 при конечной дозе 2, 5 или 10 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 10 мг/кг. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей. Через 48 часов после обработки опухоли собирали для оценки уровней фосфо-гистона H3 с помощью иммунного гистохимического окрашивания, описанного ниже.

[00481] Чтобы измерить накопление ядер, положительных по фосфо-гистону H3, с помощью иммуногистохимического исследования, поликлональное антитело кролика, нацеливающееся на остатки, окружающие фосфорилированный серин 10 гистона H3 человека, получали от Ventana Medical Systems (Тусон, Аризона, № по кат. 760-4591). Протокол IHC предусматривал нагревание и умеренное воздействие (32 мин) реагента для демаскирования антигена Ventana Discovery Cell Conditioner 1. Образцы инкубировали в течение 60 мин при комнатной температуре с первичным антителом (предварительно разведенным согласно рекомендациям производителя). Последующую инкубацию в течение 12 мин проводили с конъюгированным HRP вторичным Ab к кролику OmniMap (Ventana, Тусон, Аризона, № по кат. 760-4311) (предварительно разведенным согласно рекомендациям производителя).

[00482] Хотя на фигуре 14A на препаратах, полученных у представителей группы без обработки и группы изотипического контрольного IgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4, показаны редкие опухолевые клетки, положительные по фосфо-гистону H3, устойчивое дозозависимое повышение иммунного окрашивания фосфо-гистона H3 обнаружено через 48 часов после введения 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4. Количественное определение сигнала выполняли с применением MatLab (MathWorks, Натик, Массачусетс), где общую площадь сигнала фосфо-гистона H3 (мкм²) нормализовали по общей площади ядер (мкм²), что давало значения относительного показателя фосфо-гистона H3 (%), показанные ниже для каждой из групп обработки. Данные на фигуре 14B указывают на то, что 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 способен вызывать сильно выраженную остановку на стадии G2/M на ксенотрансплантатах опухоли, что соответствует ожидаемому механизму действия полезной нагрузки.

Пример 17. Способ получения антитела 121G12.CysMab.DAPA

[00483] В данном примере описан способ получения антитела к CCR7, 121G12.CysMab.DAPA, с помощью культуры клеток, где Ab экспрессируется с вектора, который кодирует Ab. После того как Ab экспрессировался в культуре клеток, Ab очищали из культуры клеток следующим образом.

[00484] Первая стадия способа очистки промежуточного вещества лекарственной субстанции антитела 121G12.CysMab.DAPA заключалась в удалении клеток с помощью поточной глубокой фильтрации, с последующей фильтрацией через фильтр с размером пор 0,2 мкм.

[00485] Вторая стадия заключается в стадии аффинной жидкостной хроматографии с белком A. В зависимости от общего количества нерасфасованного продукта данную стадию проводят за несколько циклов. Каждый цикл допускает максимальную загрузку, составляющую примерно 20 г/л объема колонки. Элюирование проводят с помощью 50 мМ уксусной кислоты с примерным pH 3,0. Рабочая температура составляет 18-28°C. Все элюаты объединяют и хранят при 2-8°C до проведения стадии инактивации вируса.

[00486] Третья стадия представляет собой инактивацию вируса с помощью "обработки при низком pH". Температуру раствора промежуточного вещества из стадии 2 доводят до 18-28°C и корректируют pH до 3,5 (диапазон 3,4-3,6). Затем раствор промежуточного вещества продукта выдерживают для инактивации вируса в течение 70 минут (диапазон 60-90 минут). После завершения времени выдерживания раствор доводят до pH 6,0 (диапазон 5,8-6,2). В конце стадии раствор подвергают глубокой поточной фильтрации с помощью фильтра с размером пор 0,2 мкм и хранят при 2-8°C.

[00487] Четвертая стадия представляет собой катионообменную хроматографию в режиме связывание/элюирование, которая предусматривает интегрированное восстановление на колонке. В зависимости от титра данную стадию проводят за несколько циклов. Каждый цикл допускает загрузку, составляющую примерно 30 г/л объема колонки. Колонку уравновешивают с помощью буфера A, содержащего 20 мМ сукцинат натрия, pH 6,0. Восстановление на колонке проводят с применением 20 мМ фосфата натрия, 1 мМ EDTA, 7 мМ L-цистеина, pH 7,1, в качестве буфера для восстановления. Буфер для восстановления удаляют с помощью буфера A и элюирование проводят с линейным градиентом от 10% до 90% с помощью буфера A и буфера B, содержащего 10 мМ сукцината натрия, 300 мМ хлорида натрия, pH 6,0. Элюаты и объединенные элюаты можно хранить при 2-8°C до стадии анионообменной хроматографии на мультимодальных разделительных матрицах.

[00488] Пятая стадия способа представляет собой анионообменную хроматографию в режиме "с непрерывным потоком". В зависимости от титра данную стадию проводят за несколько циклов. Каждый цикл допускает максимальную загрузку, составляющую примерно 350 г/л объема колонки. Рабочая температура составляет 18-28°C. Уравновешивание проводят с помощью 20 мМ сукцината натрия, 119 мМ хлорида натрия, pH 6,0. Конечный продукт фильтрации хранят при 2-8°C перед стадией удаления вируса.

[00489] Вирусная фильтрация, шестая стадия, состоит из префильтрации с помощью фильтра с размером пор 0,1 мкм, с последующей вирусной фильтрацией с помощью нанофильтра Planova 20N. Температуру раствора промежуточного вещества из стадия 5 доводят до 18-28°C перед вирусной фильтрацией. Рабочая температура составляет 18-28°C. После нанофильтрации промежуточное вещество хранят при 2-8°C или 18-28°C.

[00490] Седьмая стадия, ультрафильтрация/диафильтрация, состоит из стадии концентрирования до примерно 70 г/л с последующей стадией 1^ой диафильтрации с помощью 10 мМ фосфата калия, pH 6,0. При диафильтрации планируется получить коэффициент обмена, составляющий по меньшей мере 7, с последующим разбавлением до примерно 50 г/л. Конечное промежуточное вещество лекарственной субстанции пропускают через фильтр с размером пор 0,2 мкм и хранят при 2-8°C.

[00491] На восьмой и последней стадии конечным нерасфасованным промежуточным соединением лекарственной субстанции заполняют в виде аликвот подходящие контейнеры и хранят при температуре ниже -60°C после замораживания.

Таблица 25. Блок-схема способа очистки и восстановления

Стадия Операция Стадия 1 Сбор, удаление клеток и фильтрация Стадия 2 Аффинная хроматография
(MabSelect SuRE) Стадия 3 Инактивация вируса при pH 3,5 Стадия 4 Катионообменная хроматография
и
восстановление на колонке
(Fractogel EMD SO3 (M)) Стадия 5 Анионообменная хроматография на мультимодальных разделительных матрицах
(Capto adhere) Стадия 6 Удаление вируса с помощью нанофильтрации
(Planova 20N) Стадия 7 Ультрафильтрация/диафильтрация и конечная фильтрация Стадия 8 Заполнение и глубокое замораживание

Пример 18. Дозозависимая in vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели ABC-DLBCL OCI-LY3 у мышей NSG.

[00492] Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in vivo на модели ABC-DLBCL, ксенотрансплантатную модель OCI-LY3 приживляли самкам мышей NSG посредством подкожной инъекции 10×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 140 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=6 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе 0,5, 1 или 2 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг в день 1 и день 15 исследования. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей. Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки (таблица 26).

[00493] Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к дозозависимой противоопухолевой эффективности со значением ΔT/ΔC, составляющим 74,6% (0,5 мг/кг) и 10,7% (1 мг/кг), в то же время доза 2 мг/кг приводила к средней регрессии, составляющей 65,9%, ко дню 28 исследования. У 3 из 6 мышей в группе 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг проявлялась полная регрессия (фигура 15).

Таблица 26. Дозозависимая эффективность ADC к CCR7 в отношении ксенотрансплантатной модели OCI-LY3 в день 28 обработки.

Реакция опухоли Реакция хозяина Обработка Доза, схема введения ΔT/ΔC (%) Регрессия (%) Δ массы тела (%) Выживание (живые/
общее количество) Без обработки Отсутствует 100,0 - 5,6 6/6 hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 2 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 119,7 - 1,8 5/6 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 0,5 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 74,6 - 3,5 5/6 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 1 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 10,7** 2,9 6/6 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 2 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 - 65,9** -0,8 6/6

Эксперимент оценивали в день 28 после обработки, ** p<0,005 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений). % ΔT/ΔC=100 ΔT/ΔC, где: ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D28 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы; ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D28 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы D1. % регрессии=(1- T _{конечный}/T _{начальный}) x100 рассчитывали, если ΔT<0, где T _{конечный} представляет собой средний объем опухоли в D28, а T _{начальный}определяется как объем опухоли в D1 обработки. Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D28-средняя масса тела в D1) *100/средняя масса тела в D1 обработки.

Пример 19. Дозозависимая in vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении ксенотрансплантатной модели GCB-DLBCL Toledo у мышей SCID-bg.

[00494] Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in vivo на модели GCB-DLBCL, ксенотрансплантатную модель Toledo приживляли самкам мышей Scid-bg посредством подкожной инъекции 3×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 100 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=4 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе 2 или 5 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг в день 1 и день 15 исследования. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей. Все тестируемые средства хорошо переносились на протяжении исследования, и выраженных клинических симптомов токсичности или потери массы тела не наблюдали ни в одной из групп обработки (таблица 27).

[00495] Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 приводила к дозозависимой противоопухолевой эффективности со значением ΔT/ΔC, составляющим 52,7% (2 мг/кг) и 20,6% (5 мг/кг) (фигура 16, таблица 27).

Таблица 27. Дозозависимая эффективность ADC к CCR7 в отношении ксенотрансплантатной модели Toledo в день 20 обработки.

Реакция опухоли Реакция хозяина Обработка Доза, схема введения ΔT/ΔC (%) Δ массы тела (%) Выживание (живые/общее количество) Без обработки Отсутствует 100,0 4,9 3/6 hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 5 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 94,5 1,0 3/6 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 2 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 52,7* 3,2 4/6 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 5 мг/кг
при введении дозы в D1 и D15 20,6 ** 0,1 4/6

Эксперимент оценивали в день 20 после обработки, * p<0,05, ** p<0,005 в сравнении с контрольной группой без обработки (однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений). % ΔT/ΔC=100 ΔT/ΔC, где: ΔT=средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в D20 исследования - средний объем опухоли в обработанной лекарственным средством группе в начальный день при введении дозы; ΔC=средний объем опухоли в контрольной группе в D20 исследования - средний объем опухоли в контрольной группе в начальный день введения дозы D1. Δ массы тела (%)=(средняя масса тела в D20-средняя масса тела в D1) *100/средняя масса тела в D1 обработки.

Пример 20. In vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 на ксенотрансплантатной модели DEL ALCL у мышей SCID-bg.

[00496] Чтобы продемонстрировать нацеленную противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 in vivo на модели CCR7-положительной ALCL, ксенотрансплантатную модель DEL приживляли самкам мышей Scid-bg посредством подкожной инъекции 3×10⁶ клеток в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 100 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=4 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при конечной дозе 2 мг/кг или неспецифического изотипического контрольного изотип.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг в день 1 и день 15 исследования. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.

[00497] Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали после обработки неспецифическим изотипическим контрольным hIgG1.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг. Обработка 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 2 мг/кг приводила к средней регрессии, составляющей 40,2%, ко дню 14 исследования после введения однократной дозы (p<0,01). Мышам вводили вторую дозу в день 15 и за ними наблюдали в течение еще трех недель. Одно животное-исключение не проявило реакцию на обработку второй дозой, и его пришлось подвергнуть умерщвлению в день 28 из-за опухолевой массы. Еще одно животное продемонстрировало медленное прогрессирование заболевания и его также исключили в день 28 из последующего наблюдения за экспрессией мишени. У двух из четырех мышей продолжали наблюдать устойчивое воздействие на рост опухоли (фигура 17). Все обработки хорошо переносились с отсутствием явной потери массы тела.

Пример 21. In vivo эффективность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 в отношении модели опухоли на основе полученного от пациента первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1787

[00498] Противоопухолевую активность 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 оценивали на ксенотрансплантатной модели первичного немелкоклеточного рака легкого HLUX1787, экспрессирующего CCR7. Самкам NSG мышей имплантировали подкожно фрагменты опухоли в правый бок каждой мыши. После того как опухоли достигали примерно 150 мм³, мышей рандомизировали в соответствии с объемом опухоли в группы обработки (n=6 на группу). Мышей обрабатывали путем IV введения одного из 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 (DAR4) при 0,5, 2 или 5 мг/кг в день 1, а вторую дозу вводили спустя 2 недели в день 15. Все дозы корректировали в соответствии с индивидуальной массой тела мышей.

[00499] Незначительную противоопухолевую эффективность наблюдали в случае низких доз конъюгированного Ab, однако частичную регрессию или стабилизацию заболевания наблюдали в случае обработки 121G12.CysMab.DAPA.MPET.DM4 из расчета 5 мг/кг. Устойчивую эффективность воздействия на опухоли наблюдали через две недели после введения второй дозы, что привело к значению ΔT/ΔC, составляющему 1,3% в D30 обработки (p<0,001; однофакторный ANOVA/критерий Тьюки для множественных сравнений) (фигура 18). Все обработки хорошо переносились с отсутствием явной потери массы тела.

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

<110> NOVARTIS AG

<120> КОНЪЮГАТЫ АНТИТЕЛА К CCR7 И ЛЕКАРСТВЕННОГО СРЕДСТВА

<130> PAT057594-WO-PCT

<140>

<141>

<150> 62/454,476

<151> 2017-02-03

<160> 629

<170> PatentIn версия 3.5

<210> 1

<211> 10

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 1

Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala Met Ser

1. 5 10

<210> 2

<211> 17

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 2

Thr Ile Ser Ser Gly Gly Ser Phe Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys

1. 5 10 15

Gly

<210> 3

<211> 12

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 3

Arg Ala Ser Thr Val Val Gly Thr Asp Phe Asp Val

1. 5 10

<210> 4

<211> 5

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 4

Ser Tyr Ala Met Ser

1. 5

<210> 5

<211> 17

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 5

Thr Ile Ser Ser Gly Gly Ser Phe Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val Lys

1. 5 10 15

Gly

<210> 6

<211> 12

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 6

Arg Ala Ser Thr Val Val Gly Thr Asp Phe Asp Val

1. 5 10

<210> 7

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 7

Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

1. 5

<210> 8

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 8

Ser Ser Gly Gly Ser Phe

1. 5

<210> 9

<211> 12

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 9

Arg Ala Ser Thr Val Val Gly Thr Asp Phe Asp Val

1. 5 10

<210> 10

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 10

Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr Ala

1. 5

<210> 11

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 11

Ile Ser Ser Gly Gly Ser Phe Thr

1. 5

<210> 12

<211> 14

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 12

Ala Arg Arg Ala Ser Thr Val Val Gly Thr Asp Phe Asp Val

1. 5 10

<210> 13

<211> 121

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 13

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly

1. 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Thr Ile Ser Ser Gly Gly Ser Phe Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Arg Ala Ser Thr Val Val Gly Thr Asp Phe Asp Val Trp Gly

100 105 110

Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 14

<211> 363

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 14

gaagtgcagc tggtggaatc tggcggcgga ctggtcaagc ctggcggctc cctgagactg 60

tcttgcgccg cctccggctt caccttctcc agctacgcca tgtcctggat ccggcaggcc 120

cctggcaagg gactggagtg ggtggccacc atctcctccg gcggcagctt cacctactac 180

cccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctccctgtac 240

ctgcagatga actccctgcg ggccgaggac accgccgtgt actactgtgc cagacgggcc 300

tccaccgtcg tgggcaccga tttcgatgtg tggggccagg gcacaaccgt gaccgtgtcc 360

tcc 363

<210> 15

<211> 451

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 15

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly

1. 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Ser Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Ile Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Thr Ile Ser Ser Gly Gly Ser Phe Thr Tyr Tyr Pro Asp Ser Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Arg Ala Ser Thr Val Val Gly Thr Asp Phe Asp Val Trp Gly

100 105 110

Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser

115 120 125

Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala

130 135 140

Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Cys Pro Val Thr Val

145 150 155 160

Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala

165 170 175

Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val

180 185 190

Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His

195 200 205

Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys

210 215 220

Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly

225 230 235 240

Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met

245 250 255

Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Ala Val Ser His

260 265 270

Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val

275 280 285

His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr

290 295 300

Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly

305 310 315 320

Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Ala Ala Pro Ile

325 330 335

Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val

340 345 350

Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser

355 360 365

Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Cys Asp Ile Ala Val Glu

370 375 380

Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro

385 390 395 400

Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val

405 410 415

Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met

420 425 430

His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser

435 440 445

Pro Gly Lys

450

<210> 16

<211> 1353

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 16

gaagtgcagc tggtggaatc tggcggcgga ctggtcaagc ctggcggctc cctgagactg 60

tcttgcgccg cctccggctt caccttctcc agctacgcca tgtcctggat ccggcaggcc 120

cctggcaagg gactggagtg ggtggccacc atctcctccg gcggcagctt cacctactac 180

cccgactccg tgaagggccg gttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctccctgtac 240

ctgcagatga actccctgcg ggccgaggac accgccgtgt actactgtgc cagacgggcc 300

tccaccgtcg tgggcaccga tttcgatgtg tggggccagg gcacaaccgt gaccgtgtcc 360

tccgcctcca ccaagggacc ctccgtgttc cctctggccc cttccagcaa gtccacctct 420

ggcggcaccg ccgctctggg ctgcctggtc aaggactact tcccctgccc tgtgacagtg 480

tcctggaact ccggcgctct gacctccggc gtgcacacct tccctgccgt gctgcagtcc 540

tccggcctgt actccctgtc ctccgtcgtg accgtgcctt cctccagcct gggcacccag 600

acctacatct gcaacgtgaa ccacaagccc tccaacacca aagtggacaa gcgggtggaa 660

cccaagtcct gcgacaagac ccacacctgt cctccctgcc ctgcccctga gctgctggga 720

ggcccttccg tgttcctgtt ccctccaaag cccaaggaca ccctgatgat ctcccggacc 780

cctgaagtga cctgcgtggt ggtggccgtg tcccacgagg atcccgaagt gaagttcaat 840

tggtacgtgg acggcgtgga agtgcacaat gccaagacca agcccagaga ggaacagtac 900

aactccacct accgggtggt gtccgtgctg accgtgctgc accaggactg gctgaacggc 960

aaagagtaca agtgcaaagt gtccaacaag gccctggccg ctcccatcga aaagaccatc 1020

tccaaggcca agggccagcc cagagagccc caagtgtaca cactgcctcc cagccgggaa 1080

gagatgacca agaaccaagt gtccctgacc tgcctcgtga agggcttcta cccctgcgat 1140

atcgccgtgg agtgggagtc caacggccag cccgagaaca actacaagac cacccctccc 1200

gtgctggaca gcgacggctc attcttcctg tactccaagc tgaccgtgga caagtcccgg 1260

tggcagcagg gcaacgtgtt ctcctgctcc gtgatgcacg aggccctgca caaccactac 1320

acccagaagt ccctgtccct gagccccggc aag 1353

<210> 17

<211> 11

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 17

Arg Ala Ser Gln Asp Ile Gly Ser Ser Leu Asn

1. 5 10

<210> 18

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 18

Ala Thr Ser Ser Leu Asp Ser

1. 5

<210> 19

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 19

Leu Gln Tyr Ala Ser Ser Pro Pro Thr

1. 5

<210> 20

<211> 11

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 20

Arg Ala Ser Gln Asp Ile Gly Ser Ser Leu Asn

1. 5 10

<210> 21

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 21

Ala Thr Ser Ser Leu Asp Ser

1. 5

<210> 22

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 22

Leu Gln Tyr Ala Ser Ser Pro Pro Thr

1. 5

<210> 23

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 23

Ser Gln Asp Ile Gly Ser Ser

1. 5

<210> 24

<211> 3

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 24

Ala Thr Ser

1

<210> 25

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 25

Tyr Ala Ser Ser Pro Pro

1. 5

<210> 26

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 26

Gln Asp Ile Gly Ser Ser

1. 5

<210> 27

<211> 3

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 27

Ala Thr Ser

1

<210> 28

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 28

Leu Gln Tyr Ala Ser Ser Pro Pro Thr

1. 5

<210> 29

<211> 107

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 29

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1. 5 10 15

Asp Arg Val Thr Leu Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Gly Ser Ser

20 25 30

Leu Asn Trp Leu Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Ile Lys Arg Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Thr Ser Ser Leu Asp Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Arg Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Val Val Tyr Tyr Cys Leu Gln Tyr Ala Ser Ser Pro Pro

85 90 95

Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys

100 105

<210> 30

<211> 321

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 30

gacatccaga tgacccagag cccctccagc ctgtccgcct ccgtgggcga tagagtgacc 60

ctgacctgcc gggcctccca ggacatcggc tcctccctga actggctgca gcagaagccc 120

ggcaaggcca tcaagcggct gatctacgcc acctcctccc tggactccgg cgtgccctcc 180

cggttctctg gctccagatc cggcaccgac tacaccctga ccatctccag cctgcagccc 240

gaggacttcg tggtgtacta ctgcctgcag tacgcctcca gccctcccac cttcggcgga 300

ggcaccaagc tggaaatcaa g 321

<210> 31

<211> 214

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 31

Asp Ile Gln Met Thr Gln Ser Pro Ser Ser Leu Ser Ala Ser Val Gly

1. 5 10 15

Asp Arg Val Thr Leu Thr Cys Arg Ala Ser Gln Asp Ile Gly Ser Ser

20 25 30

Leu Asn Trp Leu Gln Gln Lys Pro Gly Lys Ala Ile Lys Arg Leu Ile

35 40 45

Tyr Ala Thr Ser Ser Leu Asp Ser Gly Val Pro Ser Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Arg Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Leu Gln Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Val Val Tyr Tyr Cys Leu Gln Tyr Ala Ser Ser Pro Pro

85 90 95

Thr Phe Gly Gly Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala

100 105 110

Pro Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly

115 120 125

Thr Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala

130 135 140

Lys Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln

145 150 155 160

Glu Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser

165 170 175

Ser Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr

180 185 190

Ala Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser

195 200 205

Phe Asn Arg Gly Glu Cys

210

<210> 32

<211> 642

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 32

gacatccaga tgacccagag cccctccagc ctgtccgcct ccgtgggcga tagagtgacc 60

ctgacctgcc gggcctccca ggacatcggc tcctccctga actggctgca gcagaagccc 120

ggcaaggcca tcaagcggct gatctacgcc acctcctccc tggactccgg cgtgccctcc 180

cggttctctg gctccagatc cggcaccgac tacaccctga ccatctccag cctgcagccc 240

gaggacttcg tggtgtacta ctgcctgcag tacgcctcca gccctcccac cttcggcgga 300

ggcaccaagc tggaaatcaa gcgtacggtg gccgctccca gcgtgttcat cttccccccc 360

agcgacgagc agctgaagag cggcaccgcc agcgtggtgt gcctgctgaa caacttctac 420

ccccgggagg ccaaggtgca gtggaaggtg gacaacgccc tgcagagcgg caacagccag 480

gagagcgtca ccgagcagga cagcaaggac tccacctaca gcctgagcag caccctgacc 540

ctgagcaagg ccgactacga gaagcataag gtgtacgcct gcgaggtgac ccaccagggc 600

ctgtccagcc ccgtgaccaa gagcttcaac aggggcgagt gc 642

<210> 33

<211> 10

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 33

Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ala Met Ser

1. 5 10

<210> 34

<211> 17

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 34

Thr Ile Ser Asp Ala Gly Ser Tyr Ser Tyr Tyr Pro Asp Asn Val Lys

1. 5 10 15

Gly

<210> 35

<211> 13

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 35

Arg Gly Ser Arg Tyr Glu Glu Tyr Tyr Val Met Asp Tyr

1. 5 10

<210> 36

<211> 5

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 36

Thr Tyr Ala Met Ser

1. 5

<210> 37

<211> 17

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 37

Thr Ile Ser Asp Ala Gly Ser Tyr Ser Tyr Tyr Pro Asp Asn Val Lys

1. 5 10 15

Gly

<210> 38

<211> 13

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 38

Arg Gly Ser Arg Tyr Glu Glu Tyr Tyr Val Met Asp Tyr

1. 5 10

<210> 39

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 39

Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

1. 5

<210> 40

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 40

Ser Asp Ala Gly Ser Tyr

1. 5

<210> 41

<211> 13

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 41

Arg Gly Ser Arg Tyr Glu Glu Tyr Tyr Val Met Asp Tyr

1. 5 10

<210> 42

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 42

Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr Ala

1. 5

<210> 43

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 43

Ile Ser Asp Ala Gly Ser Tyr Ser

1. 5

<210> 44

<211> 15

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 44

Ala Arg Arg Gly Ser Arg Tyr Glu Glu Tyr Tyr Val Met Asp Tyr

1. 5 10 15

<210> 45

<211> 122

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 45

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly

1. 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Thr Ile Ser Asp Ala Gly Ser Tyr Ser Tyr Tyr Pro Asp Asn Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Arg Gly Ser Arg Tyr Glu Glu Tyr Tyr Val Met Asp Tyr Trp

100 105 110

Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser

115 120

<210> 46

<211> 366

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 46

gaagtgcagc tggtggaatc tggcggcgga ctggtcaagc ctggcggctc cctgagactg 60

tcttgcgccg cctccggctt caccttctcc acctacgcca tgtcctgggt ccgacaggcc 120

cctggaaagg gcctggagtg ggtggccacc atctccgacg ccggctccta ctcctactac 180

cccgacaacg tgaagggccg gttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctccctgtac 240

ctgcagatga actccctgcg ggccgaggac accgccgtgt actactgcgc cagacggggc 300

tccagatacg aagagtacta cgtgatggac tactggggcc agggcacaac cgtgaccgtg 360

tcctcc 366

<210> 47

<211> 452

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 47

Glu Val Gln Leu Val Glu Ser Gly Gly Gly Leu Val Lys Pro Gly Gly

1. 5 10 15

Ser Leu Arg Leu Ser Cys Ala Ala Ser Gly Phe Thr Phe Ser Thr Tyr

20 25 30

Ala Met Ser Trp Val Arg Gln Ala Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp Val

35 40 45

Ala Thr Ile Ser Asp Ala Gly Ser Tyr Ser Tyr Tyr Pro Asp Asn Val

50 55 60

Lys Gly Arg Phe Thr Ile Ser Arg Asp Asn Ala Lys Asn Ser Leu Tyr

65 70 75 80

Leu Gln Met Asn Ser Leu Arg Ala Glu Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Arg Gly Ser Arg Tyr Glu Glu Tyr Tyr Val Met Asp Tyr Trp

100 105 110

Gly Gln Gly Thr Thr Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro

115 120 125

Ser Val Phe Pro Leu Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr

130 135 140

Ala Ala Leu Gly Cys Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Cys Pro Val Thr

145 150 155 160

Val Ser Trp Asn Ser Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro

165 170 175

Ala Val Leu Gln Ser Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr

180 185 190

Val Pro Ser Ser Ser Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn

195 200 205

His Lys Pro Ser Asn Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser

210 215 220

Cys Asp Lys Thr His Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu

225 230 235 240

Gly Gly Pro Ser Val Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu

245 250 255

Met Ile Ser Arg Thr Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Ala Val Ser

260 265 270

His Glu Asp Pro Glu Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu

275 280 285

Val His Asn Ala Lys Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr

290 295 300

Tyr Arg Val Val Ser Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn

305 310 315 320

Gly Lys Glu Tyr Lys Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Ala Ala Pro

325 330 335

Ile Glu Lys Thr Ile Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln

340 345 350

Val Tyr Thr Leu Pro Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val

355 360 365

Ser Leu Thr Cys Leu Val Lys Gly Phe Tyr Pro Cys Asp Ile Ala Val

370 375 380

Glu Trp Glu Ser Asn Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro

385 390 395 400

Pro Val Leu Asp Ser Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr

405 410 415

Val Asp Lys Ser Arg Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val

420 425 430

Met His Glu Ala Leu His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu

435 440 445

Ser Pro Gly Lys

450

<210> 48

<211> 1356

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 48

gaagtgcagc tggtggaatc tggcggcgga ctggtcaagc ctggcggctc cctgagactg 60

tcttgcgccg cctccggctt caccttctcc acctacgcca tgtcctgggt ccgacaggcc 120

cctggaaagg gcctggagtg ggtggccacc atctccgacg ccggctccta ctcctactac 180

cccgacaacg tgaagggccg gttcaccatc tcccgggaca acgccaagaa ctccctgtac 240

ctgcagatga actccctgcg ggccgaggac accgccgtgt actactgcgc cagacggggc 300

tccagatacg aagagtacta cgtgatggac tactggggcc agggcacaac cgtgaccgtg 360

tcctccgcct ccaccaaggg accctccgtg ttccctctgg ccccttccag caagtccacc 420

tctggcggca ccgccgctct gggctgcctg gtcaaggact acttcccctg ccctgtgaca 480

gtgtcctgga actccggcgc tctgacctcc ggcgtgcaca ccttccctgc cgtgctgcag 540

tcctccggcc tgtactccct gtcctccgtc gtgaccgtgc cttcctccag cctgggcacc 600

cagacctaca tctgcaacgt gaaccacaag ccctccaaca ccaaagtgga caagcgggtg 660

gaacccaagt cctgcgacaa gacccacacc tgtcctccct gccctgcccc tgagctgctg 720

ggaggccctt ccgtgttcct gttccctcca aagcccaagg acaccctgat gatctcccgg 780

acccctgaag tgacctgcgt ggtggtggcc gtgtcccacg aggatcccga agtgaagttc 840

aattggtacg tggacggcgt ggaagtgcac aatgccaaga ccaagcccag agaggaacag 900

tacaactcca cctaccgggt ggtgtccgtg ctgaccgtgc tgcaccagga ctggctgaac 960

ggcaaagagt acaagtgcaa agtgtccaac aaggccctgg ccgctcccat cgaaaagacc 1020

atctccaagg ccaagggcca gcccagagag ccccaagtgt acacactgcc tcccagccgg 1080

gaagagatga ccaagaacca agtgtccctg acctgcctcg tgaagggctt ctacccctgc 1140

gatatcgccg tggagtggga gtccaacggc cagcccgaga acaactacaa gaccacccct 1200

cccgtgctgg actccgacgg ctcattcttc ctgtactcca agctgaccgt ggacaagtcc 1260

cggtggcagc agggcaacgt gttctcctgc tccgtgatgc acgaggccct gcacaaccac 1320

tacacccaga agtccctgtc cctgagcccc ggcaag 1356

<210> 49

<211> 11

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 49

Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Asn Asn Leu His

1. 5 10

<210> 50

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 50

Tyr Ala Ser Gln Ser Ile Ser

1. 5

<210> 51

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 51

Gln Gln Ser Ser Ser Trp Leu Thr

1. 5

<210> 52

<211> 11

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 52

Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Asn Asn Leu His

1. 5 10

<210> 53

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 53

Tyr Ala Ser Gln Ser Ile Ser

1. 5

<210> 54

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 54

Gln Gln Ser Ser Ser Trp Leu Thr

1. 5

<210> 55

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 55

Ser Gln Ser Ile Ser Asn Asn

1. 5

<210> 56

<211> 3

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 56

Tyr Ala Ser

1

<210> 57

<211> 5

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 57

Ser Ser Ser Trp Leu

1. 5

<210> 58

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 58

Gln Ser Ile Ser Asn Asn

1. 5

<210> 59

<211> 3

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 59

Tyr Ala Ser

1

<210> 60

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 60

Gln Gln Ser Ser Ser Trp Leu Thr

1. 5

<210> 61

<211> 106

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 61

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly

1. 5 10 15

Glu Arg Val Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Asn Asn

20 25 30

Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile

35 40 45

Lys Tyr Ala Ser Gln Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Val Glu Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Gly Val Tyr Phe Cys Gln Gln Ser Ser Ser Trp Leu Thr

85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys

100 105

<210> 62

<211> 318

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 62

gagatcgtgc tgacacagtc ccctgccacc ctgtctgtgt ctcccggcga gagagtgacc 60

ctgtcctgcc gggcctccca gtccatctcc aacaacctgc actggtatca gcagaagccc 120

ggccaggccc ctcggctgct gattaagtac gcctcccaga gcatctccgg catccctgcc 180

agattctccg gctccggcag cggcaccgac ttcaccctga ccatctccag cgtggaaccc 240

gaggacttcg gcgtgtactt ctgccagcag tcctcctcct ggctgacctt cggccagggc 300

accaagctgg aaatcaag 318

<210> 63

<211> 213

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 63

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Val Ser Pro Gly

1. 5 10 15

Glu Arg Val Thr Leu Ser Cys Arg Ala Ser Gln Ser Ile Ser Asn Asn

20 25 30

Leu His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Leu Leu Ile

35 40 45

Lys Tyr Ala Ser Gln Ser Ile Ser Gly Ile Pro Ala Arg Phe Ser Gly

50 55 60

Ser Gly Ser Gly Thr Asp Phe Thr Leu Thr Ile Ser Ser Val Glu Pro

65 70 75 80

Glu Asp Phe Gly Val Tyr Phe Cys Gln Gln Ser Ser Ser Trp Leu Thr

85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro

100 105 110

Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr

115 120 125

Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys

130 135 140

Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu

145 150 155 160

Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser

165 170 175

Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala

180 185 190

Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe

195 200 205

Asn Arg Gly Glu Cys

210

<210> 64

<211> 639

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 64

gagatcgtgc tgacacagtc ccctgccacc ctgtctgtgt ctcccggcga gagagtgacc 60

ctgtcctgcc gggcctccca gtccatctcc aacaacctgc actggtatca gcagaagccc 120

ggccaggccc ctcggctgct gattaagtac gcctcccaga gcatctccgg catccctgcc 180

agattctccg gctccggcag cggcaccgac ttcaccctga ccatctccag cgtggaaccc 240

gaggacttcg gcgtgtactt ctgccagcag tcctcctcct ggctgacctt cggccagggc 300

accaagctgg aaatcaagcg tacggtggcc gctcccagcg tgttcatctt cccccccagc 360

gacgagcagc tgaagagcgg caccgccagc gtggtgtgcc tgctgaacaa cttctacccc 420

cgggaggcca aggtgcagtg gaaggtggac aacgccctgc agagcggcaa cagccaggag 480

agcgtcaccg agcaggacag caaggactcc acctacagcc tgagcagcac cctgaccctg 540

agcaaggccg actacgagaa gcataaggtg tacgcctgcg aggtgaccca ccagggcctg 600

tccagccccg tgaccaagag cttcaacagg ggcgagtgc 639

<210> 65

<211> 11

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 65

Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Gly Tyr Ser Trp His

1. 5 10

<210> 66

<211> 16

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 66

His Ile His Ser Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser

1. 5 10 15

<210> 67

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 67

Gly Gly Val Gln Ala Phe Ala Tyr

1. 5

<210> 68

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 68

Ser Gly Tyr Ser Trp His

1. 5

<210> 69

<211> 16

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 69

His Ile His Ser Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu Lys Ser

1. 5 10 15

<210> 70

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 70

Gly Gly Val Gln Ala Phe Ala Tyr

1. 5

<210> 71

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 71

Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Gly Tyr

1. 5

<210> 72

<211> 5

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 72

His Ser Ser Gly Ser

1. 5

<210> 73

<211> 8

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 73

Gly Gly Val Gln Ala Phe Ala Tyr

1. 5

<210> 74

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 74

Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Gly Tyr Ser

1. 5

<210> 75

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 75

Ile His Ser Ser Gly Ser Thr

1. 5

<210> 76

<211> 10

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 76

Ala Arg Gly Gly Val Gln Ala Phe Ala Tyr

1. 5 10

<210> 77

<211> 117

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 77

Asp Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln

1. 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Gly

20 25 30

Tyr Ser Trp His Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp

35 40 45

Met Ala His Ile His Ser Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu

50 55 60

Lys Ser Arg Ile Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser

65 70 75 80

Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Gly Gly Val Gln Ala Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu

100 105 110

Val Thr Val Ser Ser

115

<210> 78

<211> 351

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 78

gacgtgcagc tgcaggaatc tggccctggc ctggtcaagc cctcccagac cctgtccctg 60

acctgcaccg tgtccggcta ctctatcacc tccggctaca gctggcactg gatccggcag 120

caccccggca agggcctgga atggatggcc cacatccact cctccggctc caccaactac 180

aaccccagcc tgaagtcccg gatcaccatc tcccgggaca cctccaagaa ccagttctcc 240

ctgaagctgt cctccgtgac cgccgctgac accgccgtgt actactgtgc cagaggcggc 300

gtgcaggcct tcgcttattg gggccaggga accctggtca ccgtgtcctc c 351

<210> 79

<211> 447

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 79

Asp Val Gln Leu Gln Glu Ser Gly Pro Gly Leu Val Lys Pro Ser Gln

1. 5 10 15

Thr Leu Ser Leu Thr Cys Thr Val Ser Gly Tyr Ser Ile Thr Ser Gly

20 25 30

Tyr Ser Trp His Trp Ile Arg Gln His Pro Gly Lys Gly Leu Glu Trp

35 40 45

Met Ala His Ile His Ser Ser Gly Ser Thr Asn Tyr Asn Pro Ser Leu

50 55 60

Lys Ser Arg Ile Thr Ile Ser Arg Asp Thr Ser Lys Asn Gln Phe Ser

65 70 75 80

Leu Lys Leu Ser Ser Val Thr Ala Ala Asp Thr Ala Val Tyr Tyr Cys

85 90 95

Ala Arg Gly Gly Val Gln Ala Phe Ala Tyr Trp Gly Gln Gly Thr Leu

100 105 110

Val Thr Val Ser Ser Ala Ser Thr Lys Gly Pro Ser Val Phe Pro Leu

115 120 125

Ala Pro Ser Ser Lys Ser Thr Ser Gly Gly Thr Ala Ala Leu Gly Cys

130 135 140

Leu Val Lys Asp Tyr Phe Pro Cys Pro Val Thr Val Ser Trp Asn Ser

145 150 155 160

Gly Ala Leu Thr Ser Gly Val His Thr Phe Pro Ala Val Leu Gln Ser

165 170 175

Ser Gly Leu Tyr Ser Leu Ser Ser Val Val Thr Val Pro Ser Ser Ser

180 185 190

Leu Gly Thr Gln Thr Tyr Ile Cys Asn Val Asn His Lys Pro Ser Asn

195 200 205

Thr Lys Val Asp Lys Arg Val Glu Pro Lys Ser Cys Asp Lys Thr His

210 215 220

Thr Cys Pro Pro Cys Pro Ala Pro Glu Leu Leu Gly Gly Pro Ser Val

225 230 235 240

Phe Leu Phe Pro Pro Lys Pro Lys Asp Thr Leu Met Ile Ser Arg Thr

245 250 255

Pro Glu Val Thr Cys Val Val Val Ala Val Ser His Glu Asp Pro Glu

260 265 270

Val Lys Phe Asn Trp Tyr Val Asp Gly Val Glu Val His Asn Ala Lys

275 280 285

Thr Lys Pro Arg Glu Glu Gln Tyr Asn Ser Thr Tyr Arg Val Val Ser

290 295 300

Val Leu Thr Val Leu His Gln Asp Trp Leu Asn Gly Lys Glu Tyr Lys

305 310 315 320

Cys Lys Val Ser Asn Lys Ala Leu Ala Ala Pro Ile Glu Lys Thr Ile

325 330 335

Ser Lys Ala Lys Gly Gln Pro Arg Glu Pro Gln Val Tyr Thr Leu Pro

340 345 350

Pro Ser Arg Glu Glu Met Thr Lys Asn Gln Val Ser Leu Thr Cys Leu

355 360 365

Val Lys Gly Phe Tyr Pro Cys Asp Ile Ala Val Glu Trp Glu Ser Asn

370 375 380

Gly Gln Pro Glu Asn Asn Tyr Lys Thr Thr Pro Pro Val Leu Asp Ser

385 390 395 400

Asp Gly Ser Phe Phe Leu Tyr Ser Lys Leu Thr Val Asp Lys Ser Arg

405 410 415

Trp Gln Gln Gly Asn Val Phe Ser Cys Ser Val Met His Glu Ala Leu

420 425 430

His Asn His Tyr Thr Gln Lys Ser Leu Ser Leu Ser Pro Gly Lys

435 440 445

<210> 80

<211> 1341

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 80

gacgtgcagc tgcaggaatc tggccctggc ctggtcaagc cctcccagac cctgtccctg 60

acctgcaccg tgtccggcta ctctatcacc tccggctaca gctggcactg gatccggcag 120

caccccggca agggcctgga atggatggcc cacatccact cctccggctc caccaactac 180

aaccccagcc tgaagtcccg gatcaccatc tcccgggaca cctccaagaa ccagttctcc 240

ctgaagctgt cctccgtgac cgccgctgac accgccgtgt actactgtgc cagaggcggc 300

gtgcaggcct tcgcttattg gggccaggga accctggtca ccgtgtcctc cgccagcacc 360

aagggaccct ccgtgttccc tctggcccct tccagcaagt ccacctctgg cggcaccgcc 420

gctctgggct gcctcgtgaa ggactacttc ccctgccccg tgaccgtgtc ctggaactcc 480

ggcgctctga cctccggcgt gcacaccttc cctgccgtgc tgcagtcctc cggcctgtac 540

tccctgtcca gcgtcgtgac cgtgccctcc agctctctgg gcacccagac ctacatctgc 600

aacgtgaacc acaagccctc caacaccaaa gtggacaagc gggtggaacc caagtcctgc 660

gacaagaccc acacctgtcc tccctgccct gcccctgagc tgctgggagg cccttccgtg 720

ttcctgttcc ctccaaagcc caaggacacc ctgatgatct cccggacccc tgaagtgacc 780

tgcgtggtgg tggccgtgtc ccacgaggat cccgaagtga agttcaattg gtacgtggac 840

ggcgtggaag tgcacaacgc caagaccaag cccagagagg aacagtacaa ctccacctac 900

cgggtggtgt ccgtgctgac cgtgctgcac caggactggc tgaacggcaa agagtacaag 960

tgcaaagtgt ccaacaaggc cctggccgct cccatcgaaa agaccatctc caaggccaag 1020

ggccagccca gagagcccca agtgtacaca ctgcctccca gccgggaaga gatgaccaag 1080

aatcaagtgt ccctgacctg tctggtcaag ggcttctacc cctgcgatat cgccgtggag 1140

tgggagtcca acggccagcc cgagaacaac tacaagacca cccctcccgt gctggactcc 1200

gacggctcat tcttcctgta ctccaagctg accgtggaca agtcccggtg gcagcagggc 1260

aacgtgttct cctgctccgt gatgcacgag gccctgcaca accactacac ccagaagtcc 1320

ctgagcctgt cccctggcaa g 1341

<210> 81

<211> 10

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 81

Ser Ala Ser Ser Ser Val Ile Tyr Met His

1. 5 10

<210> 82

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 82

Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser

1. 5

<210> 83

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 83

Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr

1. 5

<210> 84

<211> 10

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 84

Ser Ala Ser Ser Ser Val Ile Tyr Met His

1. 5 10

<210> 85

<211> 7

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 85

Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser

1. 5

<210> 86

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 86

Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr

1. 5

<210> 87

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 87

Ser Ser Ser Val Ile Tyr

1. 5

<210> 88

<211> 3

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 88

Asp Thr Ser

1

<210> 89

<211> 6

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 89

Trp Ser Ser Asn Pro Leu

1. 5

<210> 90

<211> 5

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 90

Ser Ser Val Ile Tyr

1. 5

<210> 91

<211> 3

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 91

Asp Thr Ser

1

<210> 92

<211> 9

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

пептид"

<400> 92

Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr

1. 5

<210> 93

<211> 106

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 93

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Ala Ser Pro Gly

1. 5 10 15

Glu Arg Val Thr Met Ser Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Ile Tyr Met

20 25 30

His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Arg Trp Ile Tyr

35 40 45

Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser

50 55 60

Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu Pro Glu

65 70 75 80

Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr

85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys

100 105

<210> 94

<211> 318

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 94

gagatcgtgc tgacacagtc ccctgccacc ctgtccgcct ctccaggcga gcgcgtgaca 60

atgtcctgct ccgcctcctc ctccgtgatc tacatgcact ggtatcagca gaagcccggc 120

caggcccctc ggcggtggat ctacgatacc tccaagctgg cctccggcgt gcccgccaga 180

ttctccggct ctggctctgg caccgactac accctgacca tctccagcat ggaacccgag 240

gacgccgccg tgtactactg ccagcagtgg tcctccaacc ctctgacctt cggccagggc 300

accaagctgg aaatcaag 318

<210> 95

<211> 213

<212> БЕЛОК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полипептид"

<400> 95

Glu Ile Val Leu Thr Gln Ser Pro Ala Thr Leu Ser Ala Ser Pro Gly

1. 5 10 15

Glu Arg Val Thr Met Ser Cys Ser Ala Ser Ser Ser Val Ile Tyr Met

20 25 30

His Trp Tyr Gln Gln Lys Pro Gly Gln Ala Pro Arg Arg Trp Ile Tyr

35 40 45

Asp Thr Ser Lys Leu Ala Ser Gly Val Pro Ala Arg Phe Ser Gly Ser

50 55 60

Gly Ser Gly Thr Asp Tyr Thr Leu Thr Ile Ser Ser Met Glu Pro Glu

65 70 75 80

Asp Ala Ala Val Tyr Tyr Cys Gln Gln Trp Ser Ser Asn Pro Leu Thr

85 90 95

Phe Gly Gln Gly Thr Lys Leu Glu Ile Lys Arg Thr Val Ala Ala Pro

100 105 110

Ser Val Phe Ile Phe Pro Pro Ser Asp Glu Gln Leu Lys Ser Gly Thr

115 120 125

Ala Ser Val Val Cys Leu Leu Asn Asn Phe Tyr Pro Arg Glu Ala Lys

130 135 140

Val Gln Trp Lys Val Asp Asn Ala Leu Gln Ser Gly Asn Ser Gln Glu

145 150 155 160

Ser Val Thr Glu Gln Asp Ser Lys Asp Ser Thr Tyr Ser Leu Ser Ser

165 170 175

Thr Leu Thr Leu Ser Lys Ala Asp Tyr Glu Lys His Lys Val Tyr Ala

180 185 190

Cys Glu Val Thr His Gln Gly Leu Ser Ser Pro Val Thr Lys Ser Phe

195 200 205

Asn Arg Gly Glu Cys

210

<210> 96

<211> 639

<212> ДНК

<213> Искусственная последовательность

<220>

<221> источник

<223> /примечание="Описание искусственной последовательности: синтетический

полинуклеотид"

<400> 96