Антимикробные пептиды и способы их использования Российский патент 2022 года по МПК C07K7/08 C07K14/435 A61K38/10 A61K38/17 A61P31/04 

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ

[1] Настоящее изобретение относится к области антимикробных пептидов и их использования при лечении инфекций.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ ИЗОБРЕТЕНИЯ

[2] Антибиотики являют собой химические вещества, обладающие способностью уничтожать или ингибировать рост микроорганизмов в разбавленном растворе. Антибиотики, в достаточной степени нетоксичные для организма-хозяина, используются в качестве химиотерапевтических агентов при лечении инфекционных заболеваний людей, животных и растений. Данный термин первоначально описывал только вещества, продуцируемые микроорганизмами, однако его область применения была расширена для включения синтетических и полусинтетических соединений с аналогичной химической активностью.

[3] Широкое и повсеместное использование антимикробных препаратов привело к появлению устойчивых штаммов микроорганизмов. Доступные в настоящее время антимикробные препараты больше не воздействуют на эти микроорганизмы. В целях снижения или предотвращения возникновения смертельных инфекционных заболеваний и поддержания общественного здоровья необходимы новые антимикробные препараты.

[4] Антимикробные пептиды (АМП) являются важным компонентом системы защиты организма-хозяина повсеместно в природе и обеспечивают защиту от вторжения патогенных микроорганизмов. Они проявляют мощную антимикробную активность против грамположительных и грамотрицательных бактерий, грибов, паразитов и вирусов. АМП меньшего размера (обычно около 15-40 аминокислот) действуют в основном за счет нарушения структуры или функции мембран микробных клеток, они не поражают единичные определенные молекулярные структуры. Следовательно, в отличие от обычных антибиотиков, они эффективны независимо от метаболической активности бактерий. Человеческие АМП, такие как дефензины и кателицидин (LL-37), присутствуют в лейкоцитах и секретируются различными эпителиальными клетками на поверхности кожи и слизистой оболочки. В дополнение к их антимикробной активности, АМП являются важными эффекторными молекулами при воспалении, иммунной активации и заживлении ран. Последовательности и вторичные структуры АМП довольно разнообразны, но все они имеют некоторые общие свойства. Обычно они являются катионными, АМП ипатическими молекулами и проявляют свой микробицидный эффект, нарушая целостность бактериальной мембраны. Взаимодействие АМП с поверхностью анионной мембраны микробов-мишеней приводит к повышению проницаемости мембраны, лизису и гибели клеток.

СУЩНОСТЬ ИЗОБРЕТЕНИЯ

[5] В первом аспекте, изобретение является аминокислотной последовательностью длиной 17-22 аминокислоты, содержащей на N-конце SEQ ID №12 (X₀X₁X₂CX₃X₄X₅CX₆X₇X₈X₉CYX₁₀X₁₁CX₁₂X₁₃), где Х₀ обозначает отсутствие пролина; X₁ является лизином, аргинином, глицином или пролином; Х₂ является фенилаланином, триптофаном или аргинином; Х₃ является фенилаланином, валимом или триптофаном; Х₄ обозначает аргинин, тирозин или фенилаланин; Х₅ является валином или аланином; Х₆ является тирозином или аргинином, или лизином, или триптофаном; Х₇ является аргинином, фенилаланином или глицином; Х₈ является аргинином, фенилаланином или глицином; Х₉ является изолейцином, аланином, фенилаланином, тирозином или валином; X₁₀ является аргинином или гистидином; Х₁₁ является аргинином или лизином; Х₁₂ является аргинином, лизином или аспарагином; X₁₃ является полипептидом длиной 0-4 аминокислоты с условием, если X₀ является пролином, то X₁ не является пролином; если указанная аминокислотная последовательность включает SEQ ID №13 (KWCFRVCYRGICYRRCR), или SEQ ID №28 (KWCFRVCYRGICYRRCR), то Х₁₃ имеет длину 1-4 аминокислоты; если Х₁₃ имеет длину 1 аминокислоты или более, то N-концевая аминокислота Х₁₃ является аспартамовой или глутаминовой кислотой; если аминокислота в положении, соответствующему положению 1 SEQ ID №1 является глицином, то указанный глицин не является ацилом или пальмитиновой модифицированной; если аминокислота в Х₁₁ является лизином, то Х₆Х₇Х₈Х₉ (SEQ ID №14) не является RRRF (SEQ ID №15); и если аминокислота является GFCWYVCYRGICYRRCN (SEQ ID №16), то С-концевой аспарагин амидирован.

[6] В некоторых вариантах воплощения изобретения, Х₀ отсутствует и Х₆ является аргинином или лизином; и/или Х₇ является аргинином или лизином; Х₆Х₇Х₈Х₉ (SEQ ID №14) выбран из группы, состоящей из YRGI (SEQ ID №17), YRGV (SEQ ID №18), YRGF (SEQ ID №19); и/или X₁₀ является аргинином; и/или X₃X₄X₅ (SEQ ID №20) является FRV (SEQ ID №21), WYV (SEQ ID №22); и/или длина X₁₃ - одна аминокислота или более, и N-концевая аминокислота Х₁₃ является аспартамовой кислотой.

[7] В конкретном наборе вариантов воплощения изобретения аминокислотная последовательность имеет длину 17-21 аминокислоты и содержит на своем N-конце SEQ ID №12 (Х₀Х₁Х₂С X₃X₄X₅CX₆X₇X₈X₉CYX₁₀X₁₁CX₁₂X₁₃), где Х₀ отсутствует; X₁ обозначает лизин, аргинин или глицин; Х₂ является фенилаланином, триптофаном или аргинином; Х₃ является фенилаланином, валином или триптофаном; Х₄ является тирозином или фенилаланином; Х₅ является валином или аланином; Х₆ является тирозином или аргинином; Х₇ является аргинином или глицином; Х₈ является аргинином, фенилаланином или глицином; Х₉ является аланином, фенилаланином, тирозином или валином; Х₁₀ является аргинином или гистидином; Х₁₁ является аргинином или лизином; X_{12 является аргинином, лизином или аспарагином; X13 является полипептидом длиной 0-4 аминокислоты.}

[8] В другом наборе вариантов воплощения изобретения, согласно первому аспекту, аминокислотная последовательность имеет длину 18-21 аминокислоты и содержит на своем N-конце SEQ ID №1 (KWCFRVCYRGICYRRCRD) или пептид, который отличается от SEQ ID №1 по одной, двум, трем или четырем аминокислотам, при том, что аминокислоты, отличающиеся от аминокислот SEQ ID №1, независимо выбраны из группы, состоящей из аргинина или глицина, в положении, соответствующем положению 1 SEQ ID №1; фенилаланина или аргинина в положении, соответствующем положению 2 SEQ ID №1; валина или триптофана в положении, соответствующем положению 4 SEQ ID №1; тирозина в положении, соответствующем положению 5 SEQ ID №1; аргинина в положении, соответствующем положению 8 SEQ ID №1; глицина в положении, соответствующем положению 9 SEQ ID №1; аргинина в положении, соответствующем положению 10 SEQ ID №1; аланина, фенилаланина или валина в положении, соответствующем положению 11 SEQ ID №1; гистидина в положении, соответствующем положению 14 SEQ ID №1; лизина в положении, соответствующем положению 15 SEQ ID №1; аспарагина в положении, соответствующем положению 17 SEQ ID №1. [9] Точнее говоря, аминокислотная последовательность включает аспарагиновую кислоту в положении, соответствующем положению 18 SEQ ID №1; и/или аспарагин в положении, соответствующем положению 17 SEQ ID №1; и/или глицин в положении, соответствующем положению 1 SEQ ID №1; аланин в положении, соответствующем положению 11 SEQ ID №1; и/или аргинин в положении, соответствующем положению 14 SEQ ID №1, в положении, соответствующем положению 15 SEQ ID №1, или им обоим. [10] В ряде вариантов воплощения изобретения, аминокислотную последовательность выбирают из группы, состоящей из аминокислотных последовательностей, содержащих на соответствующем N-конце SEQ ID №1, SEQ ID №2 (RWCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №3 (GWCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №4 (KFCFRVCYRGICYRRCRD); SEQ ID №5 (KWCFYVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №6 (KWCFRVCRRGICYRRCRD), SEQ ID №7 (KWCFRVCYRGVCYRRCRD), SEQ ID №8 (KWCFRVCYRGACYRRCRD), SEQ ID №9 (KWCFRVCYRGFCYRRCRD), SQE ID №10 (KWCFRVCYRGICYHRCRD), или SEQ ID №11 (KWCFRVCYRGICYRRCND).

[11] В дополнительных вариантах воплощения изобретения, аминокислотную последовательность выбирают из группы, состоящей из SEQ ID №97 (KRCFRVCYRGICYRRCRD); SEQ ID №98 (KWCVRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №99 (KWCFFVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №100 (KWCFWVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №102 (KWCFRACYRGICYRRCRD), SEQ ID №104 (KWCFRVCYFGICYRRCRD), SEQ ID №105 (KWCFRVCYRGICYRRCRN), SEQ ID №106 (KWCWRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №107 (KWCFRVCWRGICYRRCRD), SEQ ID №108 (KWCFRVCYGGICYRRCRD), SEQ ID №109 (KWCFRVCYRRICYRRCRD), SEQ ID №110 (KWCFRVCYRGYCYRRCRD), SEQ ID №112 (KWCFRVCYRGICYRRCKD), SEQ ID №113 (KWCFRVCYRGICYRRCAD), SEQ ID №114 (KWCFRVCYRGICYRRCRR), SEQ ID №115 (GWCFRVCYRGICYRRCND), SEQ ID №116 (KWCFYVCYRGICYRRCND), SEQ ID №117 (GWCFYVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №118 (GWCFYVCYRGICYRRCND).

[12] В других дополнительных вариантах воплощения изобретения аминокислотную последовательность выбирают из группы, состоящей из SEQ ID №28, 29, 30, 31.

[13] Во втором аспекте, изобретение относится к мультимеру, содержащему множество повторов аминокислотных последовательностей в соответствии с предыдущим аспектом изобретения, где, в дополнение, N-концевая аминокислота указанной последовательности является пролином, и С-концевая аминокислота указанной последовательности является аспарагиновой кислотой. Преимущественно, повторы аминокислотных последовательностей соединены непосредственно друг с другом, тем самым образуя D-P связи. В некоторых вариантах воплощения изобретения, множество составляет от 2 до 20. [14] Изобретение также обеспечивает способ получения аминокислотной последовательности, который подходит для получения мультимера, описанного во втором аспекте изобретения. Способ включает синтез мультимера и проведение контакта мультимера с мягкой кислотой (например, муравьиной), в результате чего происходит разрыв D-P связи.

[15] В третьем аспекте, изобретение является способом лечения инфекций нуждающегося в этом животного, включающий введение животному композиции, содержащей аминокислотную последовательность в соответствии с первым аспектом изобретения. В некоторых вариантах воплощения изобретения, инфекция представляет собой инфекцию кожи. В других вариантах воплощения изобретения, инфекция представляет собой мастит, респираторную инфекцию, инфекцию уха, инфекцию мочевыводящих путей или инфекцию репродуктивного тракта.

[16] В некоторых вариантах воплощения изобретения под животным подразумевается домашнее животное, например собака, кошка или лошадь. В конкретном варианте воплощения изобретения животное является собакой. В некоторых вариантах воплощения изобретения препарат составлен для наружного применения. В некоторых вариантах воплощения изобретения препарат является гелем, кремом, эмульсией или спреем.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

[17] На фиг. 1 показана токсичность SEQ ID №1 и 13 для эритроцитов человека, собаки - бигля и крысы.

ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ

Определения

[18] Для лучшего понимания изобретения ниже приведены следующие неограничивающие определения:

[19] «Около» или «приблизительно», при использовании в связи с измеряемой числовой переменной, относится к указанному значению переменной и ко всем значениям переменной, которые находятся в пределах экспериментальной ошибки указанного значения (например, в пределах 95% доверительного интервала для среднего значения) или в пределах 10% от указанного значения, в зависимости от того, какое из значений больше, кроме использования определения в отношении временных интервалов в неделях, где «около 3 недель» составляет от 17 до 25 дней и от около 2 до около 4 недель составляет от 10 до 40 дней.

[20] «Эмульсия» означает композицию из двух несмешивающихся жидкостей, в которой маленькие капли одной жидкости суспендированы в непрерывной фазе другой жидкости.

[21] «Парентеральное введение» относится к введению вещества, такого как вакцина, в организм субъекта посредством или путем, который не включает пищеварительный тракт. Парентеральное введение включает подкожное, внутримышечное, чрескожное, внутрикожное, внутрибрюшинное, внутриглазное и внутривенное введение.

[22] «Положение [в интересующей последовательности], соответствующее» обозначает некоторую позицию эталонной последовательности, определяемую таким выравниванием эталонной и интересующей последовательностей, где остатки цистеина интересующей и эталонной последовательности совпадают друг с другом, после чего определяют положение в интересующей последовательности, которое соответствует интересуемому положению в эталонной последовательности.

[23] «Фармацевтически приемлемый» относится к веществам, которые с медицинской точки зрения подходят для контактного использования с тканями субъектов без формирования чрезмерной токсичности, раздражения, аллергического ответа и тому подобных реакций, соразмерно с разумным соотношением пользы и риска, и эффективным в сфере целевого использования.

[24] «Терапевтически эффективное количество» относится к количеству аминокислотной последовательности и/или содержащей ее композиции, которая индуцирует ответ у субъекта, получающего аминокислоту или композицию, являющуюся адекватной для предотвращения или уменьшения признаков или симптомов инфекции.

[25] «Лечение» относится к предотвращению расстройства, состояния или заболевания, включая, в частности, инфекции, к которым применяется данный термин, или к предотвращению или уменьшению одного или более симптомов такого расстройства, состояния или заболевания.

[26] «Лечение» относится к действию «лечения», определенному выше.

Пептиды

[27] В общем, изобретение является аминокислотной последовательностью длиной 17-22 аминокислоты, содержащей на N-конце SEQ ID №12 (X₀X₁X₂CX₃X₄X₅CX₆X7X₈X₉CYX₁₀X₁₁CX₁₂X₁₃), где

X₀ отсутствует или является пролином;

X₁ является лизином, аргинином, глицином или пролином;

Х₂ является фенилаланином, триптофаном или аргинином;

Х₃ является фенилаланином, валином или триптофаном;

Х₄ является аргинином, тирозином или фенилаланином;

Х₅ является валином или аланином;

Х₆ является тирозином или аргинином;

Х₇ является аргинином, фенилаланином или глицином;

Х₈ является аргинином, фенилаланином или глицином;

Х₉ является изолейцином, аланином, фенилаланином, тирозином или валином;

Х₁₀ является аргинином или гистидином;

Х₁₁ является аргинином или лизином;

Х₁₂ является аргинином, лизином или аспарагином;

Х₁₃ является полипептидом длиной 0-4 аминокислоты;

при условии, что если Х₀ является пролином, то X₁ не является пролином; если указанная аминокислотная последовательность содержит SEQ ID №13 (KWCFRVCYRGICYRRCR) или SEQ ID №28 (KWCFRVCYRGICYRKCR), то Х₁₃ имеет длину 1-4 аминокислоты; если X₁₃ имеет длину 1 или более аминокислот, то N-концевой аминокислотой в X₁₃ является аспарагиновая кислота или глутаминовая кислота; если аминокислота в положении, соответствующем положению 1 SEQ ID №1, представляет собой глицин, то указанный глицин не является модифицированным ацилом или пальмитиновой кислотой; если аминокислотой Х₁₁ является лизин, то Х₆Х₇Х₈Х₉ (SEQ ID №14) не является RRRF (SEQ ID №15); и если аминокислота представляет собой GFCWYVCYRGICYRRCN (SEQ ID №16), то С-концевой аспарагин амидирован.

[28] В некоторых вариантах воплощения изобретения Х₀ отсутствует, а Х₆ является аргинином или лизином; и/или Х₇ представляет собой аргинин или лизин; Х₆Х₇Х₈Х₉ (SEQ ID №14) выбирают из группы, состоящей из YRGI (SEQ ID №17), YRGV (SEQ ID №18), YRGF (SEQ ID №19); и/или X₁₀ представляет собой аргинин; и/или Х₃Х₄Х₅ (SEQ ID №20) является FRV (SEQ ID №21), WYV (SEQ ID №22); и/или длина X₁₃ - 1 аминокислота или более (например, 1, 2, 3 или 4 аминокислоты), и N-концевая аминокислота в X₁₃ является аспарагиновой кислотой.

[29] В конкретном наборе вариантов воплощения изобретения, согласно первому аспекту, аминокислотная последовательность имеет длину 18-21 аминокислоты и содержит на N-конце SEQ ID №1 (KWCFRVCYRGICYRRCRD) или пептид, который отличается от SEQ ID №1 одной, двумя, тремя или четырьмя аминокислотами, причем аминокислоты, отличающиеся от аминокислот SEQ ID №1, независимо выбраны из группы, состоящей из аргинина или глицина, в положении, соответствующем положению 1 SEQ ID №1; фенилаланина или аргинина в положении, соответствующем положению 2 SEQ ID №1; валина или триптофана в положении, соответствующем положению 4 SEQ ID №1; тирозина в положении, соответствующем положению 5 SEQ ID №1; аргинина в положении, соответствующем положению 8 SEQ ID №1; глицина в положении, соответствующем положению 9 SEQ ID №1; аргинина в положении, соответствующем положению 10 SEQ ID №1; аланина, фенилаланина или валина в положении, соответствующем положению 11 SEQ ID №1; гистидина в положении, соответствующем положению 14 SEQ ID №1; лизина в положении, соответствующем положению 15 SEQ ID №1; аспарагина в положении, соответствующем положению 17 SEQ ID №1.

[30] В различных вариантах воплощения изобретения аминокислотная последовательность отличается от SEQ ID №1 одной, двумя или тремя аминокислотами.

[31] В определенных вариантах воплощения изобретения аминокислотная последовательность содержит аспарагиновую кислоту в положении, соответствующем положению 18 SEQ ID №1; и/или аспарагин в положении, соответствующем положению 17 SEQ ID №1; и/или глицин в положении, соответствующем положению 1 SEQ ID №1; аланин в положении, соответствующем положению 11 SEQ ID №1; и/или аргинин в положении, соответствующем положению 14 SEQ ID №1, в положении, соответствующем положению 15 SEQ ID №1, или в обоих.

[32] В раде вариантов воплощения изобретения аминокислотную последовательность выбирают из группы, состоящей из аминокислотных последовательностей, содержащих на соответствующих N-концах, SEQ ID №1, SEQ ID №2 (RWCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №3 (GWCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №4 (KFCFRVCYRGICYRRCRD); SEQ ID №5 (KWCFYVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №6 (KWCFRVCRRGICYRRCRD), SEQ ID №7 (KWCFRVCYRGVCYRRCRD), SEQ ID №8 (KWCFRVCYRGACYRRCRD), SEQ ID №9 (KWCFRVCYRGFCYRRCRD), SEQ ID №10 (KWCFRVCYRGICYHRCRD), или SEQ ID №11 (KWCFRVCYRGICYRRCND).

[33] Дополнительные аминокислотные последовательности могут быть выбраны среди SEQ ID №97 (KRCFRVCYRGICYRRCRD); SEQ ID №98 (KWCVRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №99 (KWCFFVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №100 (KWCFWVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №101 (KWCFRVYCYRGICYRRCRD), SEQ ID №102 (KWCFRACYRGICYRRCRD), SEQ ID №103 (KWCFRVCRRGICYRRCRD), SEQ ID №104 (KWCFRVCYFGICYRRCRD), SEQ ID №105 (KWCFRVCYRGICYRRCRN), SEQ ID №106 (KWCWRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №107 (KWCFRVCWRGICYRRCRD), SEQ ID №108 (KWCFRVCYGGICYRRCRD), SEQ ID №109 (KWCFRVCYRRICYRRCRD), SEQ ID №110 (KWCFRVCYRGYCYRRCRD), SEQ ID №111 (KWCFRVCYRGICRYRRCRD), SEQ ID №112 (KWCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №113 (KWCFRVCYRGICYRRCAD), SEQ ID №114 (KWCFRVCYRGICYRRCRR), SEQ ID №115 (GWCFRVCYRGICYRRCND), SEQ ID №116 (KWCFYVCYRGICYRRCND), SEQ ID №117 (GWCFYVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №118 (GWCFYVCYRGICYRRCND).

[34] Таким образом, аминокислотная последовательность может быть выбрана из группы, состоящей из SEQ ID №97 (KRCFRVCYRGICYRRCRD); SEQ ID №98 (KWCVRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №99 (KWCFFVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №100 (KWCFWVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №102 (KWCFRACYRGICYRRCRD), SEQ ID №104 (KWCFRVCYFGICYRRCRD), SEQ ID №105 (KWCFRVCYRGICYRRCRN), SEQ ID №106 (KWCWRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №107 (KWCFRVCWRGICYRRCRD), SEQ ID №108 (KWCFRVCYGGICYRRCRD), SEQ ID №109 (KWCFRVCYRRICYRRCRD), SEQ ID №110 (KWCFRVCYRGYCYRRCRD), SEQ ID №112 (KWCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №113 (KWCFRVCYRGICYRRCAD), SEQ ID №114 (KWCFRVCYRGICYRRCRR), SEQ ID №115 (GWCFRVCYRGICYRRCND), SEQ ID №116 (KWCFYVCYRGICYRRCND), SEQ ID №117 (GWCFYVCYRGICYRRCRD), SEQ ID №118 (GWCFYVCYRGICYRRCND).

[35] Пептиды, согласно изобретению, могут быть получены способами, хорошо известными в данной области техники, включая, без ограничений, твердофазный пептидный синтез. Пептиды также могут быть синтезированы с использованием биоинженерных техник (например, ферментации) в грибковых, бактериальных или эукариотических системах.

[36] В некоторых вариантах воплощения изобретения, где N-концевой аминокислотой антимикробного пептида является пролин, а С-концевой аминокислотой является аспарагиновая кислота, способ получения антимикробного пептида может включать синтез мультимера антимикробного пептида. В различных вариантах воплощения изобретения количество мономеров в мультимере может составлять от 1 до приблизительно 20, например, приблизительно 5, приблизительно 10 или приблизительно 15. В целях удобства, мономеры антимикробного пептида соединены пептидной связью между С-концевой аспарагиновой кислотой вышестоящего мономера и N-концевым пролином нижестоящего мономера (D-P связь). Указанная D-P связь может быть легко расщеплена посредством гидролиза слабой кислотой (например, муравьиной или лимонной). Таким образом, молекула, описанная, например, как (SEQ ID №29)_n или (SEQ ID №31)_n, где n представляет собой целое число от 1 до 20, может использоваться в композициях и способах изобретения.

КОМПОЗИЦИИ

[37] Пептиды, соответствующие вышеуказанным вариантам воплощения изобретения, могут входить в композиции для доставки к целевому сайту (то есть участку, который инфицирован, или участку, который находится в опасности заражения из-за раны, раздражения и тому подобного). Без ограничения такие участки включают кожу, глаза, уши, молочные железы, репродуктивный тракт, мочевой пузырь, носовые и ротовые полости. Композиция, содержащая пептиды, указанные в настоящем изобретении, составляется в зависимости от интересующего сайта.

[38] Также, для лечения или ослабления различных бактериальных инфекций, представленные композиции могут быть приготовлены путем смешивания одного или более антимикробных пептидов, описанных в данном изобретении, с фармацевтическими общепринятыми носителями, наполнителями, связующими веществами, разбавителями или тому подобным. Терапевтически эффективная доза или количество относится к такому количеству одного или более соединений, описанных в настоящем документе, которое достаточно для ослабления симптомов инфекции. Фармацевтические композиции, в рамках настоящего изобретения, могут быть изготовлены, среди прочего, способами, хорошо известными в данной области, такими как обычные процессы гранулирования, смешивания, растворения, капсулирования, лиофилизации или эмульгирования. Композиции могут быть представлены, например, в форме гранул, порошков, таблеток, капсульного сиропа, суппозиториев, инъекций, эмульсий, эликсиров, суспензий или растворов. Указанные композиции могут быть составлены для различных путей введения, например, перорального, накожного, трансмукозального, ректального или подкожного введения, а также интратекальной, внутривенной, интрамаммарной, внутримышечной, внутрибрюшинной, интраназальной, внутриглазной или внутрижелудочковой инъекции. Соединение или соединения, согласно настоящему изобретению, также можно вводить местным способом, таким как инъекция композиции с замедленным высвобождением. Указанные ниже лекарственные формы приведены в качестве примера, без ограничения.

[39] Порошки, суспензии, гранулы, таблетки, пилюли, капсулы, желатиновые капсулы и капсуловидные таблетки приемлемы в качестве твердых лекарственных форм для перорального, трансбуккального и сублингвального введения. Они могут быть получены, например, путем смешивания одного или более соединений, приведенных в настоящем изобретении, или их фармацевтически используемых солей или таутомеров, с по меньшей мере, одной добавкой или наполнителями, такой как крахмал или иная добавка. Подходящими добавками или наполнителями являются сахароза, лактоза, целлюлозный сахар, маннит, мальтит, декстран, сорбит, крахмал, агар, алы инаты, хитины, хитозаны, пектины, трагакантовая камедь, гуммиарабик, желатины, коллагены, казеин, альбумин, синтетические или полусинтетические полимеры или глицериды, метилцеллюлоза, гидроксипропилметилцеллюлоза и/или поливинилпирролидон. Необязательно пероральные лекарственные формы могут содержать и другие ингредиенты для облегчения употребления, такие как неактивный разбавитель или смазывающие вещества, например, стеарат магния, или консерванты, такие как парабен или сорбиновая кислота, или антиоксиданты, такие как аскорбиновая кислота, токоферол или цистеин, разрыхлители, связующие вещества, загустители, буферы, подсластители, ароматизаторы или отдушки. Кроме того, для идентификации могут быть добавлены красители или пигменты. Таблетки и пилюли могут быть дополнительно обработаны подходящими покровными материалами, известными в данной области техники.

[40] Жидкие лекарственные формы для перорального введения могут быть представлены в форме фармацевтически используемых эмульсий, сиропов, эликсиров, суспензий, кашиц и растворов, и могут содержать такой неактивный разбавитель как вода. Фармацевтические композиции могут быть приготовлены в виде жидких суспензий или растворов с использованием стерильных жидкостей, таких как масло, вода, спирт и их комбинации без ограничений. Для перорального или парентерального введения могут быть добавлены фармацевтически используемые поверхностно-активные вещества, суспендирующие агенты, эмульгирующие агенты.

[41] Как было отмечено выше, суспензии могут включать масла. Это могут быть такие масла как арахисовое, кунжутное, хлопковое, кукурузное, оливковое и смеси масел. Суспензионный препарат также может содержать сложные эфиры жирных кислот, такие как этилолеат, изопропилмиристат, глицериды жирных кислот и ацетилированные глицериды жирных кислот. Композиции суспензии могут включать, без ограниченийспирты, такие какэтанол, изопропиловый спирт, гексадециловый спирт, глицерин и пропиленгликоль. Также, суспензионные композиции могут включать без ограничений простые эфиры, поли (этиленгликоль) и другие, нефтяные углеводороды, такие как минеральное масло и вазелин; вода также может быть использована в суспензионных композициях.

[42] При некоторых способах использования фармацевтические композиции могут быть, без ограничений, аэрозолем или аэрозолями, содержащими соответствующие растворители и другие необязательные соединения, такие как, стабилизаторы, антимикробные агенты, антиоксиданты, модификаторы рН, поверхностно-активные вещества, модификаторы биодоступности и комбинации из этих препаратов. Пропеллент аэрозольной композиции может включать сжатый воздух, азот, диоксид углерода или низкокинящий растворитель на углеводородной основе. Соединение или соединения, указанные в настоящем изобретении, удобно доставлять в форме аэрозольного распыления из небулайзера или тому подобной.

[43] Инъекционные лекарственные формы обычно включают водные суспензии или масляные суспензии, которые могут быть получены с использованием подходящего диспергирующего вещества или увлажняющего агента и суспендирующего агента. Инъекционные формы могут быть в фазе раствора или в форме суспензии, которую готовят с растворителем или разбавителем. Приемлемые растворители или носители включают стерилизованную воду, раствор Рингера или изотонический водный солевой раствор. Стерильные масла могут быть использованы в качестве альтернативных растворителей или суспендирующих агентов. Как правило, масло или жирная кислота являются нелетучими, включая натуральные или синтетические масла, жирные кислоты, моно-, ди- или триглицериды.

[44] Фармацевтическая композиция для инъекции может быть порошком, подходящим для растворения в подходящем растворе, как описано выше. Например, это могут быть лиофилизированные, высушенные в сушильном барабане или высушенные с использованием распылителя порошки, аморфные порошки, гранулы, осажденные вещества или частицы. Композиции для инъекций могут необязательно содержать стабилизаторы, модификаторы рН, поверхностно-активные вещества, модификаторы биодоступности и их комбинации. Соединения могут быть составлены для парентерального введения путем инъекции, такой как болюсная инъекция или непрерывная инфузия. Однократная инъекционная дозировка лекарственной формы для инъекций может быть в ампулах или в многодозовых контейнерах.

[45] Для ректального введения фармацевтических композиций в кишечнике, сигмовидном изгибе и/или прямой кишке, фармацевтические препараты могут быть составлены в форме суппозиториев, мазей, клизм, таблеток или кремов. Суппозитории для ректального введения получают путем смешивания одного или более соединений, указанных в настоящем изобретении, или их фармацевтически приемлемых солей, или таутомеров с принятыми носителями, например, маслом какао или полиэтиленгликолем, который при стандартных температурах хранения находится в твердой фазе и переходит в жидкую фазу при температурах, подходящих для высвобождения лекарственного средства из организма, например, в прямой кишке. При приготовлении суппозиториев и композиций типа мягкого желатина могут быть использованы также масла. Вода, физиологический раствор, водные растворы декстрозы и родственных Сахаров, глицерины могут быть использованы при приготовлении суспензионных композиций, которые также могут содержать суспендирующие агенты, такие как пектины, карбомеры, метилцеллюлоза, гидроксипропилцеллюлоза или карбоксиметилцеллюлоза, а также буферы и консерванты.

[46] Помимо типичных лекарственных форм, описанных выше, фармацевтически используемые наполнители и носители, как правило, общеизвестны специалистам в данной области техники и, таким образом, включены в настоящее изобретение. Такие наполнители и носители описаны, например, в «Remington's Pharmaceutical Sciences», Mack Pub. Co., New Jersey (1991).

[47] Композиции согласно изобретению, могут быть предназначены как для кратковременного действия и быстрого высвобождения, так и длительного действия и длительного высвобождения. Таким образом, также могут быть составлены фармацевтические композиции контролируемого или замедленного высвобождения.

[48] Настоящие композиции также могут содержать, например, мицеллы или липосомы, или какую-либо другую инкапсулированную форму, или же могут вводиться в форме с пролонгированным высвобождением для обеспечения длительного хранения и/или длительного эффекта доставки. Следовательно, фармацевтические препараты могут быть спрессованы в таблетки или цилиндры и имплантированы внутримышечно или подкожно в виде инъекций замедленного всасывания или в виде имплантатов, таких как стенты. Такие имплантаты могут быть произведены из известных материалов, таких как силиконы и биоразлагаемые полимеры.

[49] Композиция также может содержать противозудные лекарственные средства, включая, без ограничения, оклатиниб и его соли (например, APOQUEL® и анти-IL-31 антитела (например, CYTOPOINT™).

[50] Композиция также может содержать стероид или противогрибковое лекарственное средство. Подходящими стероидами являются бетаметазон, триамцинолона ацетонид, гидрокортизона ацетонат, гидрокортизон, триамцинолон, метилпреднизолона ацетат и тому подобные вещества без ограничений. Подходящие противогрибковые лекарственные средства включают хлотримазол, эконазол, итраконазол, кетоконазол, миконазол.

[51] Как пример, композиции могут содержать антимикробный пептид от приблизительно 0,1 до приблизительно 90 мас. % или более в зависимости от способа введения. В случае, когда композиции содержат дозированные единицы, каждая единица может содержать, например, от приблизительно 0,5 до приблизительно 10 мг на дозу антимикробного пептида. Например, одна доза композиции может содержать приблизительно 1 мг, 1,5 мг, 2 мг, 2,5 мг, 3 мг, 3,5 мг, 4 мг, 4,5 мг, 5 мг, 5,5 мг, 6 мг, 6,5 мг, 7 мг, 7,5 мг, 8 мг, 8,5 мг, 9 мг, 9,5 мг. Композиция может содержать от приблизительно 1 до приблизительно 5 мг антимикробного пептида на дозу, или от приблизительно 1,5 до приблизительно 5 мг антимикробного пептида на дозу, или от приблизительно 2,5 до приблизительно 7,5 мг на дозу, или от приблизительно 1,5 до приблизительно 2,5 мг на дозу, в зависимости от тяжести раны и размера животного.

СПОСОБЫ

[52] В еще одном аспекте изобретение также относится к способам лечения или профилактики бактериальной инфекции субъекта, включающим введение субъекту эффективного количества одного или более соединений, описанных в данном изобретении. Субъекты, подлежащие лечению, включают собак, кошек, лошадей, крупный рогатый скот, овец, свиней, домашнюю птицу, приматов (например, макак-резус и яванских макак (также известных как макаки-крабоеды или длиннохвостые макаки), обезьян, мартышек, тамаринов, шимпанзе, макак), кроликов и грызунов (крыс, мышей, морских свинок и тому подобных). В одном варианте воплощения изобретения субъект представляет собой собаку, и антимикробный пептид, согласно изобретению, может быть доставлен местно, интраназально, внутриглазно или интраурально. Антимикробный пептид может быть доставлен в форме капель, спрея, крема, геля, мази и тому подобных форм.

[53] Инфекции, которые могут подвергаться лечению описанными соединениями, включают инфекции наружного уха, инфекции среднего уха, такие как острый средний отит, инфекции черепных пазух, инфекции глаз, инфекции полости рта, такие как инфекции зубов, десны и слизистых оболочек, инфекции верхних дыхательных путей, инфекции нижних дыхательных путей, инфекции мочеполовой системы, желудочно-кишечные инфекции, гинекологические инфекции, сепсис, инфекции костей и суставов, инфекции кожи и ее структуры, ожоги, антибактериальная профилактика в хирургии и антибактериальная профилактика пациентов с иммунодефицитом, например, находящихся под действием химиотерапии рака, или после трансплантации органов. Эти инфекции можно лечить в больничных условиях или в сообществах с помощью различных способов введения, описанных в данном изобретении.

[54] Соединения или композиции, описанные в настоящем документе, также могут быть использованы в целях профилактики. Соответственно, одно или более настоящих соединений или композиций могут быть введены субъекту, потенциально подверженному риску развития микробной инфекции. Субъекты, подверженные риску развития микробной инфекции, включают индивидуумов, подвергнутых воздействию определенного микроорганизма, принадлежащего к патогенным видам бактерий; индивидуумов с нарушениями иммунной системы, или субъектов, особенно уязвимых для инфекций из-за нарушения естественной защиты (например, кожа, подверженная риску из-за ожогов или порезов). [55] Описанные в данном изобретении антимикробные пептиды могут быть использованы для лечения или профилактики инфекционных заболеваний, вызванных различными бактериальными организмами, включая инфицирование видами патогенных бактерий. Примеры бактериальной инфекции, без ограничений, включают грамположительные и грамотрицательные аэробные и анаэробные бактерии, такие как стафилококки, например, S. aureus; энтерококки, например, E. faecalis; стрептококки, например, S. pyogenes и S. pneumoniae; виды эшерихий, например, E.coli, включая энтеротокси генные, энтеропатогенные, энтероинвазивные, энтерогеморрагические и энтероагрегационные штаммы E.coli; штаммы пропионовых бактерий, например, P. acnes; гемофиллезы, например, Н. influenza; моракселлы, например, М. catarrhalis. Другие примеры включают микобактерии, например, М. tuberculosis, М. avian-intracellulare, М. kansasii, М. bovis, М. africanum, М. genavense, М. leprae, М. xenopi, М. simiae, М. scrofulaceum, М. malmoense, М. celatum, М. abscessus, М. chelonae, М. szulgai, М. gordonae, М. haemophilum, М. fortuni и М. marinum; коринебактерии, например, С. diphtheriae; виды псевдомонад, например, P. aeruginosa; виды боррелий, например, В. burgdorferi; виды листерий, например, L. Monocytogenes, виды бацилл, например, В. cereus; виды бордетелл, например, В. bronchiseptica; виды клебсиелл, виды клостридий, например, С. perfringens, С.tetani; виды хламидий, например, С. psittaci,; виды риккетсий, например, R. rickettsii и R. prowazekii; виды сальмонелл, например, S. typhimurium; виды ерсиний, например, Y. enterocolitica и Y. pseudotuberculosis; виды клебсиелл, например, K. pneumoniae; и микоплазм, например, М. pneumonia, виды актинобактерий, H. parasuis; и Trueperella pyogenes.

[56] В определенных аспектах изобретения, были выбраны стафиллококковые бактерии, например, S. pseudintermedius, S. aureus, S. schleiferi, S. chromogenes, S. simulans, S. xylosus. Также, могут быть выбраны стрептококковые бактерии, например, S. uberis, S. agalactiae, S. dysgalactiae, S. suis. Кроме того, бактерии семейства Pasteurellaceae также подходят для лечения композициями, описанными в данном изобретении. Подходящие бактерии семейства Pasteur ellaceae включают М. haemolytica, P. multocida, H. somni, виды рода Escherichia, например, E.coli и виды рода Klebsiella.

[57] В определенных вариантах воплощения изобретения бактериями являются S. pseudintermedius и/или P. aeruginosa.

[58] Композиции, описанные в настоящем изобретении, могут быть введены при разных режимах дозирования. Например, подходящие режимы включают от 4 раз в день до одного раза в неделю, например, три раза в день, два раза в день, один раз в день, каждые два дня, каждые три дня, два раза в неделю, каждые пять дней и так далее. Аналогично изобретения, описанные здесь, можно применять для различных режимов длительности, например, за одно применение, в течение двух дней, в течение трех дней, в течение четырех дней, в течение недели, в течение двух недель, в течение месяца, в течение шести недель, и так далее. Длительность, частота и количество антимикробного пептида на дозу, а также вид и состояние раны и/или состояние инфекции могут быть совместно учтены при определении подходящей частотно-временной схемы для введения антимикробных композиций, заявляемых в данном изобретении.

[59] В качестве иллюстративных вариантов воплощения изобретения ниже предоставлены следующие примеры, но их не следует рассматривать как ограничивающие объем изобретения. Для специалистов в данной области техники многие изменения, вариации, модификации и другие использования и применения этого изобретения будут очевидны.

ПРИМЕРЫ

[60] Пример 1. Антимикробная активность и безопасность in vitro

[61] Пептиды в соответствии с указанными в Таблице 1 SEQ ID NO были приготовлены коммерческим производителем (CS Bio, Menlo Park, Калифорния) с использованием твердофазного синтеза. Антимикробную активность оценивали путем определения минимальной подавляющей концентрации (МПК) в отношении S. aureus и Е. coli. Вкратце, проводили микроразведения МПК в бульоне с применением методологии Института клинических и лабораторных стандартов (VET01-S2). Для штаммов АТСС S. aureus и Е. coli использовали триптиказо-соевый агар с 5% лизированной лошадиной крови для культивирования в течение ночи при температуре воздушной окружающей среды 37°С. Для каждого пептида готовили исходный 0,5 мМ раствор с культуральной водой и 0,01% уксусной кислоты, проводили серийные разведения и наносили по 10 мкл концентрации от 50 мкМ до 0,05 мкМ в 96-луночный планшет для анализа титрования дозы. Разводили стандарт мутности по МакФарланду 0,5 для каждого штамма в соотношении 1:250 на бульоне Мюллера-Хинтона (БМХ). Затем в 96-луночный планшет на препарат добавляли 90 мкл культуральной суспензии для инкубации в течение ночи на 18-20 часов. МПК определяли визуально в первой лунке без видимого роста при соответствующей концентрации

[62] Результаты данных экспериментов приведены в Таблице 1.

[63] SEQ ID №1 был выбран для дальнейшего исследования. Токсичность SEQ ID №1 для эукариотических клеток крови сравнивали с токсичностью тахиплезина (SEQ ID №13). Для проверки потенциала лизиса пептидов у нескольких видов применяли стандартный, поверенный анализ гемолиза эритроцитов. Красные кровяные клетки (эритроциты) подготавливали и выделяли с помощью нескольких этапов центрифугирования и отмывки для удаления фракции плазмы. Для титрование дозы (от 50 мкМ до 0,05 мкМ) тестируемый пептид и контрольный пептид мелиттин вносили из стокового 50 мМ раствора в 384-луночный планшет. Подготовленные эритроциты инкубировали с пептидом в течение одного часа при 37°С. Процент гемолиза измеряли по оптической плотности при 405 им и использовании 1% Triton X-100 в качестве калибратора для 100% эффективности (СПЭ) и чистого фосфатного буфера в качестве калибратора для 0% эффективности (НПЭ).

[64] Авторы изобретения неожиданно обнаружили, что SEQ ID №1 обладает не только улучшенной антимикробной активностью, но также снижает токсический эффект для эритроцитов. Результаты экспериментов с использованием эритроцитов человека, бигля и крысы показаны на Фиг. 1. Вкратце, SEQ ID №1 был в 2-4 раза менее токсичен для эритроцитов человека, бигля или крысы, чем SEQ ID №13. Для мышиных или бычьих эритроцитов различия были незначительными.

[65] Дополнительные производные SEQ ID №1 были синтезированы методом твердофазного синтеза, как было описано выше. Антимикробную активность оценивали путем определения МИК для S. aureus и E. coli, как было описано выше. Результаты этих экспериментов представлены в Таблице 2.

[66] Далее оценивали антимикробную активность пептидов, перечисленных в Таблице 2, в отношении различных штаммов MSSP (метициллин-чувствительного Staphylococcus pseudintermedius) и MRSP (метициллин-резистентного Staphylococcus pseudintermedius). Результаты представлены, соответственно, в Таблице 3 и Таблице 4.

(0067) Дополнительные пептиды были синтезированы как было описано выше. Антимикробные свойства этих пептидов определены и суммированы ниже.

(0068) Безопасность пептидов, перечисленных в Таблице 2, определяли путем измерения жизнеспособности клеток. Клетки эпителиальных кератиноцитов, выделенные от собак (CPEK), наращивали для определения жизнеспособности клеток в присутствии пептидов. Клетки выращивали из замороженного исходного материала в предварительно нагретой среде CnT-09-5 (с добавками) на матрасе Т75 и инкубировали в течение ночи при 37°С, 5% CO₂. Клетки промывали фосфатным буфером и снова добавляли предварительно нагретую среду CnT-05-9, этот процесс повторяли в течение нескольких дней до достижения клетками плотности 6,6×10⁴ клеток/мл. Затем клетки переносили в 384-луночный планшет, давали возможность осесть и титровали пептиды и контрольный пептид мелиттин (от 50 мкМ до 0,05 мкМ), после чего проводили ночную инкубацию при 37°С, 5% CO₂. В планшеты добавляли 0,1% Triton X-100 (СПЭ) и чистый фосфатный буфер (НПЭ) для расчета процентного эффекта после остановки анализа с помощью добавления 10 мкл реагентов анализа CELLTITER-GLO® для люминесцентного считывания. Результаты представлены в Таблице 7.

(0069) Безопасность пептидов, перечисленных в Таблице 6, определяли путем измерения жизнеспособности клеток, как было описано выше. Результаты представлены в Таблице 8.

(0070) Приведенные данные демонстрируют, что антимикробные пептиды, указанные в настоящем изобретении, не только эффективны против тестируемых штаммов бактерий, но также и безопасны, особенно при несистемном, например, местном применении.

(0071) Все публикации, цитируемые в данной спецификации, включая патентные и непатентные публикации, демонстрируют уровень квалификации специалистов в области техники, к которой относится данное изобретение. Все эти публикации полностью включены в настоящее описание посредством ссылок в том же объеме, как если бы каждая отдельная публикация была конкретно и индивидуально указана как включенная посредством ссылки.

(0072) Несмотря на то, что изобретение, приведенное в данном документе, было описано со ссылками на конкретные варианты воплощения, следует понимать, что эти варианты воплощения являются просто иллюстрацией принципов и применений настоящего изобретения. Следовательно, следует понимать, что в приведенные иллюстративные варианты воплощения могут быть внесены многочисленные модификации и что могут быть разработаны другие варианты воплощения, не выходящие за пределы сущности и объема настоящего изобретения, определенного в следующей формуле изобретения.

--->

SEQUENCE LISTING

<110> ZOETIS SERVICES LLC

ZOOK, Christopher A

KUHN, Michael

SHEEHAN, Derek J

PHELPS, Hilary J

BAIMA, Eric J

EWIN, Richard A

<120> ANTIMICROBIAL PEPTIDES AND METHOD OF USING SAME

<130> ZP000218A

<140> PCT/US2018/064029

<141> 2018-12-05

<150> 62/595,725

<151> 2017-12-07

<160> 117

<170> PatentIn version 3.5

<210> 1

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Antimicrobial peptide

<400> 1

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 2

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial antimicrobial peptide

<400> 2

Arg Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 3

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 3

Gly Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 4

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial antimicrobial peptide

<400> 4

Lys Phe Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 5

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 5

Lys Trp Cys Phe Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 6

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 6

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Arg Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 7

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 7

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Val Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 8

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 8

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ala Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 9

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 9

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 10

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 10

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr His Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 11

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 11

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn Asp

<210> 12

<211> 19

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> misc_feature

<222> (1)..(1)

<223> Absent or Proline

<220>

<221> misc_feature

<222> (2)..(2)

<223> Lysine, Arginine, Glycine, or Proline

<220>

<221> misc_feature

<222> (3)..(3)

<223> Phenylalanine, Tryptophan or Arginine

<220>

<221> misc_feature

<222> (5)..(5)

<223> phenylalanine, valine or tryptophan

<220>

<221> misc_feature

<222> (6)..(6)

<223> arginine, tyrosine or phenylalanine

<220>

<221> misc_feature

<222> (7)..(7)

<223> valine or alanine

<220>

<221> misc_feature

<222> (9)..(9)

<223> tyrosine, arginine, lysine or tryptophan

<220>

<221> misc_feature

<222> (10)..(10)

<223> arginine, phenylalanine, or glycine

<220>

<221> misc_feature

<222> (11)..(11)

<223> arginine or glycine

<220>

<221> misc_feature

<222> (12)..(12)

<223> isoleucine, alanine, phenylalanine, tyrosine or valine

<220>

<221> misc_feature

<222> (15)..(15)

<223> arginine or histidine

<220>

<221> misc_feature

<222> (16)..(16)

<223> arginine or lysine

<220>

<221> misc_feature

<222> (18)..(18)

<223> arginine, lysine, alanine, or asparagine

<220>

<221> misc_feature

<222> (19)..(19)

<223> Any amino acid, may be 0-4 amino acids long

<400> 12

Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Cys Xaa Xaa Xaa Xaa Cys Tyr Xaa Xaa

1 5 10 15

Cys Xaa Xaa

<210> 13

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 13

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg

<210> 14

<211> 4

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> PEPTIDE

<222> (1)..(4)

<223> Not Arg Arg Arg Phe

<400> 14

Xaa Xaa Xaa Xaa

1

<210> 15

<211> 4

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 15

Arg Arg Arg Phe

1

<210> 16

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 16

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 17

<211> 4

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 17

Tyr Arg Gly Ile

1

<210> 18

<211> 4

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide fragment

<400> 18

Tyr Arg Gly Val

1

<210> 19

<211> 4

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide fragment

<400> 19

Tyr Arg Gly Phe

1

<210> 20

<211> 3

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide fragment

<220>

<221> peptide

<222> (1)..(3)

<223> Phe Arg Val or Trp Tyr Val

<400> 20

Xaa Xaa Xaa

1

<210> 21

<211> 3

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide fragment

<400> 21

Phe Arg Val

1

<210> 22

<211> 3

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide fragment

<400> 22

Trp Tyr Val

1

<210> 23

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 23

Lys Phe Cys Val Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 24

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 24

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Val Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg

<210> 25

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 25

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg

<210> 26

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> Mod_res

<222> (17)..(17)

<223> Amidated

<400> 26

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 27

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> MOD_RES

<222> (17)..(17)

<223> Amidated

<400> 27

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 28

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 28

Pro Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg

1 5 10 15

Cys Arg

<210> 29

<211> 19

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 29

Pro Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg

1 5 10 15

Cys Arg Asp

<210> 30

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 30

Pro Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg

<210> 31

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 31

Pro Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 32

<400> 32

000

<210> 33

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 33

Pro Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg

1 5 10 15

Cys Asn

<210> 34

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 34

Pro Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 35

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 35

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 36

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 36

Gly Val Cys Val Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 37

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 37

Gly Val Cys Val Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 38

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> MOD_RES

<222> (17)..(17)

<223> Amidation

<400> 38

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 39

<211> 19

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 39

Pro Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg

1 5 10 15

Cys Asn Asp

<210> 40

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 40

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg His Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 41

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 41

Lys Phe Cys Val Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 42

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 42

Gly His Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 43

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 43

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Ser

<210> 44

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> MOD_RES

<222> (1)..(1)

<223> N-Acetylated

<220>

<221> MOD_RES

<222> (17)..(17)

<223> Amidated

<400> 44

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 45

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> Mod-res

<222> (1)..(1)

<223> N-Acetylated

<220>

<221> Mod-res

<222> (17)..(17)

<223> Amidated

<400> 45

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 46

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 46

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 47

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 47

Lys Phe Cys Trp Arg Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 48

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 48

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 49

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 49

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Arg Asn Gly Val Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg

<210> 50

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 50

Gly Phe Cys Trp Tyr Thr Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 51

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 51

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 52

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 52

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 53

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> mod-res

<222> (1)..(1)

<223> N-Palmitoylated

<400> 53

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 54

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 54

Lys Phe Cys Trp Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 55

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 55

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 56

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 56

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 57

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 57

Gly Phe Cys Trp Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 58

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 58

Lys Phe Cys Val Asn Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 59

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 59

Lys Phe Cys Val Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 60

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 60

Lys Phe Cys Val Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 61

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 61

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Gln Gln Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 62

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 62

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Asp Asp Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 63

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 63

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Pro Lys Gly Tyr Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 64

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 64

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Lys Asn Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 65

<211> 14

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<220>

<221> mod_res

<222> (14)..(14)

<223> Amidated

<400> 65

Arg Lys Gly Cys Lys Cys Lys Asn Gly Phe Cys Val Cys Arg

1 5 10

<210> 66

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 66

Gly Phe Cys Trp Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 67

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 67

Gly Phe Cys Trp Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 68

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 68

Gly Phe Cys Trp Asn Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 69

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 69

Lys Val Cys Val Asn Val Cys Lys Gln Gly Ile Cys Arg Lys Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 70

<211> 16

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 70

Gly Cys Trp Tyr Val Cys Arg Asn Gly Val Cys Tyr Arg Arg Cys Asn

1 5 10 15

<210> 71

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 71

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Asn Gly Val Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 72

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 72

Gly Phe Cys Trp Asn Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 73

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 73

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr His His Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 74

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 74

Asn Val Cys Val Val Arg Cys Arg Arg Gly Phe Cys Asn Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 75

<211> 16

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 75

Lys Cys Val Arg Val Cys Arg Arg Arg Ala Cys Arg Arg Arg Cys Lys

1 5 10 15

<210> 76

<211> 16

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 76

Lys Cys Val Arg Val Cys Arg Arg Gly Phe Cys Asn Arg Arg Cys Lys

1 5 10 15

<210> 77

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 77

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Lys Asn Gly Tyr Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 78

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 78

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Asn Gly Tyr Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 79

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 79

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Asn Gly Tyr Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 80

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 80

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 81

<211> 16

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 81

Lys Cys Val Arg Val Cys Arg Arg Gly Phe Cys Asn Arg Arg Cys Lys

1 5 10 15

<210> 82

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 82

Gly Phe Cys Arg Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 83

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 83

Lys Phe Cys Val Asn Val Cys Arg Asn Gly Ile Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 84

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 84

Gly Val Cys Val Asn Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 85

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 85

Lys Lys Val Cys Val Asn Val Cys Lys Gln Gly Ile Cys His Lys Arg

1 5 10 15

Cys Lys

<210> 86

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 86

Lys Lys Val Cys Val Asn Val Cys Arg Gln Gly Ile Cys His Arg Arg

1 5 10 15

Cys Lys

<210> 87

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 87

Gly Phe Cys Arg Tyr Val Cys Arg Arg Gly Ile Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 88

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 88

Lys Phe Cys Val Asn Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Arg Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys

<210> 89

<211> 16

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 89

Lys Cys Arg Arg Val Cys Arg Arg Gly Phe Cys Tyr Val Val Cys Asn

1 5 10 15

<210> 90

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 90

Gly His Cys His His Val Cys Arg Arg Arg His Cys His Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 91

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 91

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 92

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 92

Arg Gly Gly Arg Leu Cys Tyr Cys Arg Arg Arg Phe Cys Val Cys Val

1 5 10 15

Gly Arg

<210> 93

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 93

Arg Arg Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Phe Cys Tyr Arg Lys

1 5 10 15

Cys Arg

<210> 94

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 94

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 95

<211> 17

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 95

Gly Phe Cys Trp Tyr Val Cys Arg Arg Arg Phe Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn

<210> 96

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 96

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Gly Arg Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 97

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 97

Lys Arg Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 98

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 98

Lys Trp Cys Val Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 99

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 99

Lys Trp Cys Phe Phe Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 100

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 100

Lys Trp Cys Phe Trp Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 101

<211> 19

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 101

Lys Trp Cys Phe Arg Val Tyr Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg

1 5 10 15

Cys Arg Asp

<210> 102

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 102

Lys Trp Cys Phe Arg Ala Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 103

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 103

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Lys Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 104

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 104

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Phe Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 105

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 105

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asn

<210> 106

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 106

Lys Trp Cys Trp Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 107

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 107

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Trp Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 108

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 108

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Gly Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 109

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 109

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Arg Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 110

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 110

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Tyr Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<210> 111

<211> 19

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 111

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Arg Tyr Arg Arg

1 5 10 15

Cys Arg Asp

<210> 112

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 112

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Lys Asp

<210> 113

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 113

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Ala Asp

<210> 114

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 114

Lys Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Arg

<210> 115

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 115

Gly Trp Cys Phe Arg Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn Asp

<210> 116

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 116

Lys Trp Cys Phe Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Asn Asp

<210> 117

<211> 18

<212> PRT

<213> Artificial Sequence

<220>

<223> Artificial Antimicrobial peptide

<400> 117

Gly Trp Cys Phe Tyr Val Cys Tyr Arg Gly Ile Cys Tyr Arg Arg Cys

1 5 10 15

Arg Asp

<---

Группа изобретений относится к биотехнологии, в частности к области антимикробных пептидов и их использованию при лечении инфекций. Предложен антимикробный пептид, имеющий аминокислотную последовательность длиной 18-21 аминокислот и содержащий на ее N-конце SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 29, или пептид, отличающийся от SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 29 одной, двумя или тремя аминокислотами. Если аминокислота в позиции, соответствующей позиции 1 SEQ ID NO: 1, представляет собой глицин, то тогда этот глицин не является модифицированным ацилом или пальмитиновой кислотой. Также предложены мультимер для получения пептида, композиция и способ для лечения бактериальной инфекции, вызванной бактериями рода Escherichia, Pseudomonas, Streptococcus или Staphylococcus. Пептид обладает улучшенной антимикробной активностью, снижает токсический эффект для эритроцитов, безопасен, особенно при несистемном, например местном применении. 4 н. и 23 з.п. ф-лы, 1 ил., 8 табл., 1 пр.

1. Антимикробный пептид, имеющий аминокислотную последовательность длиной 18-21 аминокислот и содержащий на ее N-конце SEQ ID NO: 1 (KWCFRVCYRGICYRRCRD) или SEQ ID NO: 29 (PKWCFRVCYRGICYRRCRD), или пептид, отличающийся от SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 29 одной, двумя или тремя аминокислотами, при этом аминокислоты, отличающиеся от аминокислот SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 29, независимо выбраны из группы, состоящей из:

глицина в позиции, соответствующей позиции 1 SEQ ID NO: 1;

фенилаланина в позиции, соответствующей позиции 2 SEQ ID NO: 1;

валина или триптофана в позиции, соответствующей позиции 4 SEQ ID NO: 1;

тирозина в позиции, соответствующей позиции 5 SEQ ID NO: 1;

аланина в позиции, соответствующей позиции 6 SEQ ID NO: 1;

лизина, триптофана или аргинина в позиции, соответствующей позиции 8 SEQ ID NO: 1;

глицина или фенилаланина в позиции, соответствующей позиции 9 SEQ ID NO: 1;

аргинина в позиции, соответствующей позиции 10 SEQ ID NO: 1;

аланина или тирозина в позиции, соответствующей позиции 11 SEQ ID NO: 1;

гистидина в позиции, соответствующей позиции 14 SEQ ID NO: 1;

лизина, аланина или аспарагина в позиции, соответствующей позиции 17 SEQ ID NO: 1;

аспарагина или аргинина в позиции, соответствующей позиции 18 SEQ ID NO: 1;

при условии, что если аминокислота в позиции, соответствующей позиции 1 SEQ ID NO: 1, представляет собой глицин, то тогда этот глицин не является модифицированным ацилом или пальмитиновой кислотой.

2. Антимикробный пептид по п. 1, где указанная аминокислотная последовательность содержит аспарагиновую кислоту в позиции, соответствующей позиции 18 SEQ ID NO: 1.

3. Антимикробный пептид по любому из пп. 1, 2, где указанная аминокислотная последовательность содержит аспарагин в позиции, соответствующей позиции 17 SEQ ID NO: 1.

4. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-3, где указанная аминокислотная последовательность содержит глицин в позиции, соответствующей позиции 1 SEQ ID NO: 1.

5. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-4, где указанная аминокислотная последовательность содержит аланин в позиции, соответствующей позиции 11 SEQ ID NO: 1.

6. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-5, где аргинин находится в позиции, соответствующей позиции 14 SEQ ID NO: 1, в позиции, соответствующей позиции 15 SEQ ID NO: 1, или в обеих позициях.

7. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-6, где указанная аминокислотная последовательность содержит аргинин в позиции, соответствующей позиции 14 SEQ ID NO: 1, и в позиции, соответствующей позиции 15 SEQ ID NO: 1.

8. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-7, где длина указанной аминокислотной последовательности составляет 18 аминокислот.

9. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-8, где пептид отличается от SEQ ID NO: 1 или SEQ ID NO: 29 одной аминокислотой.

10. Антимикробный пептид по п. 1, где указанная аминокислотная последовательность содержит на ее N-конце SEQ ID NO: 1, SEQ ID NO: 4 (KFCFRVCYRGICYRRCRD), SEQ ID NO: 5 (KWCFYVCYRGICYRRCRD), SEQ ID NO: 6 (KWCFRVCRRGICYRRCRD), SEQ ID NO: 8 (KWCFRVCYRGACYRRCRD), SEQ ID NO: 10 (KWCFRVCYRGICYHRCRD) или SEQ ID NO: 11 (KWCFRVCYRGICYRRCND).

11. Антимикробный пептид по п. 10, где указанная аминокислотная последовательность содержит SEQ ID NO: 1.

12. Антимикробный пептид по п. 10, где указанная аминокислотная последовательность содержит SEQ ID NO: 4, или SEQ ID NO: 5, или SEQ ID NO: 6, или SEQ ID NO: 8.

13. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-8, где указанная аминокислотная последовательность содержит SEQ ID NO: 17 (YRGI).

14. Антимикробный пептид по п. 1, где указанная аминокислотная последовательность содержит на своем N-конце одну из SEQ ID NO: 97-100, 102-110, 112-118.

15. Антимикробный пептид по п. 14, где указанная аминокислотная последовательность содержит на своем N-конце SEQ ID NO: 102, 103, 108.

16. Антимикробный пептид по любому из пп. 1-12, где C-концевая аминокислота указанной последовательности является аспарагиновой кислотой.

17. Мультимер для получения пептида по п. 16, где указанный мультимер содержит множество повторов аминокислотной последовательности, как она определена в п. 16, которые соединены посредством пептидной D-P связи между C-концевой аспарагиновой кислотой вышестоящего мономера и N-концевым пролином нижестоящего мономера.

18. Мультимер по п. 17, где указанные повторы соединены друг с другом напрямую.

19. Мультимер по п. 17 или 18, где множество составляет от 2 до 20.

20. Композиция для лечения бактериальной инфекции, содержащая терапевтически эффективное количество антимикробного пептида, имеющего аминокислотную последовательность согласно любому из пп. 1-16.

21. Композиция по п. 20, которая адаптирована для местного введения.

22. Композиция по п. 21, которая изготовлена в виде крема, мази, спрея или эмульсии.

23. Способ лечения бактериальной инфекции у нуждающегося в этом субъекта, включающий введение указанному субъекту композиции по любому из пп. 20-22, где указанная бактериальная инфекция вызвана бактериями рода, выбранного из Escherichia, Pseudomonas, Streptococcus и Staphylococcus.

24. Способ по п. 23, где указанная бактериальная инфекция вызвана S. aureus, E. coli, P. aeruginosa или S. pseudintermedius.

25. Способ по п. 23 или 24, где указанная бактериальная инфекция представляет собой респираторную инфекцию, кожную инфекцию или мастит.

26. Способ по п. 25, где указанная инфекция представляет собой кожную инфекцию и композицию наносят местно.

27. Способ по п. 26, где нуждающимся субъектом является собака.