ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ
[0001] Настоящее изобретение относится к мультивалентной иммуногенной композиции для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с папилломавирусом человека (ПВЧ), и ее применения.
УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ
[0002] Папилломавирус (PV) принадлежит к семейству Papillomaviridae и вызывает папилломы у человека, крупного рогатого скота, собак и кроликов. Один из его представителей, папилломавирус человека (ПВЧ), представляет собой безоболочечный ДНК-вирус. Геном этого вируса представляет собой двухцепочечную замкнутую кольцевую ДНК размером примерно 7,2-8 т.п.н. с 8 открытыми рамками считывания, которые можно разделить на три области в зависимости от их функций: (1) начальная область (Е), примерно 4,5 т.п.н., кодирующая белки Е1, Е2, Е4-Е7, всего 6 неструктурных белков, связанных с репликацией, транскрипцией и трансформацией вируса; (2) конечная область (L), примерно 2,5 т.п.н., кодирующая основной капсидный белок L1 и минорный капсидный белок L2; (3) длинная регуляторная область (LCR), расположенная между концом L-области и началом E-области, имеет длину примерно 800-900 п.н. и не кодирует какие-либо белки, выполняя функции регуляции репликации ДНК и экспрессии элементов.
[0003] Белки L1 и белки L2 синтезируются в конце инфекционного цикла ПВЧ. Белок L1 является основным белком капсида и имеет молекулярную массу 55-60 кДа. Белок L2 является минорным капсидным белком. 72 пентамера белка L1 образуют внешнюю оболочку икосаэдрической частицы ПВЧ (диаметром 45-55 нм), которая заключает в себе замкнутую кольцевую двухцепочечную ДНК. Белок L2 расположен на внутренней стороне белка L1 (Structure of Small Virus-like Particles Assembled from the L1 Protein of Human Papillomavirus 16, Chen, X.S., R.L. Garcea, Mol. Cell. 5(3):557-567, 2000).
[0004] ORF белка L1, наиболее консервативного гена в геноме ПВ, может использоваться для идентификации новых типов ПВ. Новый тип ПВ идентифицируют, если его полный геном клонирован и его последовательность ДНК ORF L1 отличается от ближайшего известного типа ПВ более чем на 10%. Гомологии с различиями от 2% до 10% определяются как разные подтипы, а различия менее 2% определяются как разные варианты одного и того же подтипа (Е.-М. de Villiers и др. / Virology 324 (2004) 17-27).
[0005] На поздних стадиях инфекции ПВЧ вновь синтезированные белки L1 в цитоплазме транспортируются в ядро терминально дифференцированного кератина, где вместе с белками L2 упаковывают реплицированную геномную ДНК ПВЧ с образованием инфекционных вирусов (Nelson, L.M, и др. 2002. Nuclear import strategies of high risk HPV16 L1 major capsid protein. J. Biol. Chem. 277: 23958-23964). Это свидетельствует о том, что ядерный импорт белка L1 играет очень важную роль в инфицировании и продукции ПВЧ. Способность вируса проникать в ядро определяется сигналом ядерной локализации (СЯЛ) на С-конце белка ПВЧ L1, который характеризуется обилием в нем основных аминокислот (Garcia-Bustos, J., и др. 1991. Nuclear protein localization. Biochimica et Biophysica Acta 1071: 83-101).
[0006] 15 типов ПВЧ высокого риска (BP) могут приводить к раку шейки матки, ануса, полового члена, влагалища, вульвы и ротоглотки, среди которых ПВЧ-16 и ПВЧ-18 являются на сегодняшний день наиболее частыми причинами рака, составляя примерно 70% рака шейки матки, а остальные типы ВР-ПВЧ (типы 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, 59, 68, 73 и 82) вызывают остальные заболевания. На ПВЧ-16 приходится примерно 95% случаев ПВЧ-положительного рака ротоглотки (РРГ). Персистирующие генотипы низкого риска ПВЧ-6 и ПВЧ-11 вызывают большинство аногенитальных бородавок и респираторных папиллом, но редко связаны с раком (Human papillomavirus in Cervical Cancer and Oropharyngeal Cancer: One Cause, Two Diseases Tara A. Bermanand John T. Schiller, PhD2 Cancer 2017; 123:2219-29).
[0007] Белок L1 может быть рекомбинантно экспрессирован поксвирусными, бакуловирусными или дрожжевыми системами, а затем он самостоятельно собирается с образованием вирусоподобных частиц (VLP), содержащих примерно 72 белка L1, подобных капсиду вируса. VLP не имеют обозначения. VLP индуцирует нейтрализующие антитела у привитых животных и защищает экспериментальных животных от последующего заражения инфекционными вирусами. Соответственно, VLP представляется отличным кандидатом для вакцин против папилломавируса (Structure of Small Virus-like Particles Assembled from the L1 Protein of Human Papillomavirus 16 Chen, X.S., R.L. Garcea, Mol. Cell. 5(3):557-567, 2000).
[0008] CERVARIX® компании Glaxo, бивалентная рекомбинантная вакцина против ПВЧ, содержит рекомбинантный белок L1 ПВЧ тип 16 и рекомбинантный белок L1 ПВЧ тип 18. Белок L1 получают путем экспрессии векторной системы экспрессии рекомбинантного бакуловируса в клетках насекомых ночной бабочки (Trichoplusia ni). Белок L1 самостоятельно собирается в вирусоподобные частицы для профилактики рака шейки матки, цервикальной интраэпителиальной неоплазии 2 или 3 степени и аденокарциномы in situ, вызванной ПВЧ 16 и 18 типов, и цервикальной интраэпителиальной неоплазии 1 степени (онкогенной) у женщин в возрасте 9-25 лет (https://www.fda.gov/downloads/BiologicsBloodVaccines/Vaccines/ApprovedProducts/UCM18 6981.pdf).
[0009] GARDASIL® представляет собой четырехвалентную рекомбинантную вакцину против папилломавируса человека (типы 6, 11, 16 и 18) от Merck для профилактики рака шейки матки, остроконечных кондилом (condyloma acuminata) и предраковых или пролиферативных аномальных поражений, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16 и 18 у девочек и женщины в возрасте 9-26 лет; и для профилактики рака анального канала, остроконечных кондилом (condyloma acuminatum) и предраковых или аномалий развития, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16 и 18 у мальчиков и мужчин 9-26 лет (https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/vaccines/gardasil).
[0010] GARDASIL®9 представляет собой девятивалентную рекомбинантную вакцину против папилломавируса человека от Merck, которая содержит вирусоподобные частицы белка L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58, указанный белок L1 получают ферментацией Saccharomyces cerevisiae и он самостоятельно собирается в VLP. Ее применяют у девочек и женщин в возрасте 9-45 лет для профилактики рака шейки матки, рака вульвы, рака влагалища и рака анального канала, вызванных ПВЧ типов 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58, генитальных бородавок (остроконечных кондилом), вызванных ПВЧ типов 6 и 11, и предраковых или пролиферативных нарушений, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58; и у мальчиков и мужчин в возрасте 9-45 лет для профилактики рака анального канала, вызванного ПВЧ типов 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58, генитальных бородавок (остроконечных кондилом), вызванных ПВЧ типов 6 и 11 и предраковых состояний или аномалий развития, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58 (https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/vaccines/gardasil-9).
[0011] В инструкции для GARDASIL®9 отмечается, что ПВЧ типов 16 и 18 являются причиной примерно 70% случаев рака шейки матки, а остальные 20% случаев относятся к типам 31, 33, 45, 52 и 58, поэтому GARDASIL®9 предотвращает 90% рака шейки матки (https://www.fda.gov/BiologicsBloodVaccines/Vaccines/ApprovedProducts/ucm426445.htm).
[0012] Промышленное производство вирусоподобных частиц имеет решающее значение для разработки вакцины против ПВЧ. Общие системы для получения вирусоподобных частиц в основном подразделяются на эукариотические системы экспрессии и прокариотические системы экспрессии.
[0013] Обычно используемые эукариотические системы экспрессии включают системы экспрессии поксвирусов, системы экспрессии бакуловирусов насекомых и системы экспрессии дрожжей. Белок L1 ПВЧ, экспрессируемый в эукариотических экспрессионных системах, может спонтанно собираться в вирусоподобные частицы, так как его естественная конформация менее нарушена, но его выход невелик. Белок L1 ПВЧ, экспрессируемый в прокариотических системах экспрессии, в основном в системах экспрессии Е. coli, имеет высокие выходы, но в основном в форме телец включения, эта форма белка не может быть легко очищена, что усложняет производственный процесс.
[0014] Таким образом, по-прежнему существует потребность в получении высоких выходов вирусоподобных частиц ПВЧ, а также в получении мультивалентных вакцин против ПВЧ для профилактики широкого спектра заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ, в том числе вызванных типами ПВЧ, которые в настоящее время не охватываются имеющимися в продаже вакцинами.
Краткое описание
[0015] В одном из аспектов настоящего изобретения описана мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ для профилактики заболевания или инфекции, связанной с ПВЧ, содержащая: вирусоподобные частицы ПВЧ, собранные из белка L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58; и одну или более вирусоподобные частицы ПВЧ, собранные из белка L1 других патогенных типов вирусоподобных частиц ПВЧ.
[0016] В другом аспекте настоящего изобретения описан способ предотвращения заболевания или инфекции, связанной с ПВЧ, включающий: введение субъекту поливалентной иммуногенной композиции ПВЧ.
[0017] В другом аспекте настоящего изобретения описано применение поливалентной иммуногенной композиции ПВЧ в приготовлении вакцин или лекарственных средств для профилактики заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ.
КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ
[0018] На Фиг. 1А показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 6:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0019] На Фиг. 1В показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 11:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0020] На Фиг. 1С показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 16:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0021] На Фиг. 1D показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 18:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0022] На Фиг. 1Е показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 31:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0023] На Фиг. 1F показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 33. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0024] На Фиг. 1G показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 35:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0025] На Фиг. 1Н показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 39:59С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0026] На Фиг. 1I показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 45:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0027] На Фиг. 1J показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 51:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0028] На Фиг. 1K показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 52:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0029] На Фиг. 1L показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 56:33С. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0030] На Фиг. 1М показана экспрессия белка L1 ПВЧ 58 L1:33C. M: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0031] На Фиг. 1N показана экспрессия белка L1 ПВЧ типа 59. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.
[0032] На Фиг. 2А показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 6:33С.
[0033] На Фиг. 2В показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 11:33С.
[0034] На Фиг. 2С показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 16:33С.
[0035] На Фиг. 2D показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 18:33С.
[0036] На Фиг. 2Е показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 31:33С.
[0037] На Фиг. 2F показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 33.
[0038] На Фиг. 2G показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 35:33С.
[0039] На Фиг. 2Н показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 39:59С.
[0040] На Фиг. 2I показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 45:33С.
[0041] На Фиг. 2J показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 51:33С.
[0042] На Фиг. 2K показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 52:33С.
[0043] На Фиг. 2L показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 56:33С.
[0044] На Фиг. 2М показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 58:33С.
[0045] На Фиг. 2N показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц L1 ПВЧ типа 59.
[0046] На Фиг. 3 показаны титры, нейтрализующие псевдовирусы, у мышей, иммунизированных композициями из вирусоподобных частиц 14 типов ПВЧ. Количество мышей, N=10. СГТ: Средний геометрический титр.
[0047] На Фиг. 4 показана экспрессия С-концевого укороченного L1 ПВЧ типа 16 (1-474). М: Маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизатов.
ПОДРОБНОЕ ОПИСАНИЕ
[0048] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает мультивалентную иммуногенную композицию для предотвращения заболеваний или инфекций, связанный с папилломавирусом. В одном варианте реализации указанным папилломавирусом может быть папилломавирус человека. В другом варианте реализации указанным папилломавирусом может быть папилломавирус собаки или папилломавирус кролика.
[0049] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает мультивалентную иммуногенную композицию ПВЧ для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ, содержащая: вирусоподобные частицы ПВЧ, собранные из белков L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58; и одну или более вирусоподобные частицы ПВЧ, собранные из белков L1 других патогенных типов ПВЧ.
[0050] В одном варианте реализации указанный белок L1 каждого типа ПВЧ может быть встречающимся в природе белком L1 или не встречающимся в природе белком L1, или химерным белком L1 ПВЧ. В одном варианте реализации указанные вирусоподобные частицы ПВЧ могут быть собраны из белка L1 ПВЧ одного типа с образованием моновалентных вирусоподобных частиц ПВЧ, или могут быть собраны из белков L1 ПВЧ множества типов с образованием мультивалентных вирусоподобных частиц ПВЧ.
[0051] В одном варианте реализации указанный один или более других патогенных типов ПВЧ выбран из типов ПВЧ 35, 39, 51, 56 и 59.
[0052] В одном варианте реализации по меньшей мере одна из указанных вирусоподобных частиц ПВЧ представляет собой химерную вирусоподобную частицу ПВЧ, где указанная химерная вирусоподобная частица ПВЧ включает один или более химерный белок L1 ПВЧ; указанный химерный белок L1 ПВЧ включает, в направлении от его N-конца до С-конца: а. N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа, при этом указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 или 58, указанный N-концевой фрагмент сохраняет иммуногенность белка L1 соответствующего типа ПВЧ; и б. С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа, указанный белок L1 папилломавируса второго типа имеет лучший уровень экспрессии и лучшую растворимость по сравнению с белками L1 других типов; при этом указанный химерный белок L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 или 58 имеет иммуногенность белка L1 соответствующего типа ПВЧ.
[0053] В одном варианте реализации указанная химерная вирусоподобная частица ПВЧ может быть собрана из химерных белков L1 ПВЧ одного типа с образованием моновалентных вирусоподобных частиц ПВЧ, или может быть из химерных белков L1 ПВЧ множества типов с образованием мультивалентных вирусоподобных частиц ПВЧ.
[0054] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент и N-концевой фрагмент могут свободно комбинироваться по мере необходимости. В одном варианте реализации указанный химерный белок L1 ПВЧ может включать один или множество С-концевых фрагментов. Указанное множество С-концевых фрагментов может быть одинаковым или различным.
[0055] В одном варианте реализации указанный N-концевой фрагмент представляет собой фрагмент, полученный укорочением С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в любом положении аминокислоты внутри участка α5, и фрагмент, имеющий по меньшей мере 98% идентичность с ним; указанный С-концевой фрагмент представляет собой фрагмент, полученный укорочением N-конца природной последовательности белка L1 папилломавируса второго типа в любом положении аминокислоты внутри участка α5, и функциональные варианты, полученные в результате дальнейших мутаций, делеций и/или добавлений к фрагменту.
[0056] В другом варианте реализации указанный N-концевой фрагмент имеет по меньшей мере 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в любом положении аминокислоты внутри участка α5.
[0057] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент включает одну или множество последовательностей ядерной локализации.
[0058] В одном варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типов 1, 2, 3, 4, 6, 7, 10, 11, 13, 16, 18, 22, 26, 28, 31, 32, 33, 35, 39, 42, 44, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 60, 63, 66, 68, 73 или 82.
[0059] Предпочтительно, указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типов 16, 28, 33, 59 или 68.
[0060] Более предпочтительно, указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типа 33 или ПВЧ типа 59.
[0061] В одном варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса второго типа представляет собой белок L1 ПВЧ типа 33, указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 2; или фрагмент, имеющей длину из m1 аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий положения аминокислот 1-m1 SEQ ID No: 2; при этом m1 представляет собой целое число в диапазоне 8-26; или указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 135; или фрагмент, имеющий длину из m2 аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий положения аминокислот 1-m2 SEQ ID No: 135; при этом m2 представляет собой целое число в диапазоне 13-31.
[0062] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33 имеет последовательность ядерной локализации. В другом варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33 имеет две последовательности ядерной локализации. В одном варианте реализации указанная последовательность аминокислот из аминокислот No: 7-8 (KR) и указанная последовательность аминокислот из аминокислот No: 20-23 (KRKK) последовательности SEQ ID No: 2 представляют собой последовательности ядерной локализации указанного С-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ типа 33.
[0063] В одном варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса второго типа представляет собой белок L1 ПВЧ типа 59, указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 13; или фрагмент, имеющего длину из n аминокислот, предпочтительно включающий аминокислоты в положении 1-n SEQ ID No: 13; при этом n представляет собой целое число в диапазоне 16-38.
[0064] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 59 имеет последовательность ядерной локализации. В другом варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 59 имеет две последовательности ядерной локализации. В некоторых вариантах реализации указанный химерный белок L1 ПВЧ включает один или множество С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 59. Указанное множество С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 59 могут быть одинаковыми или различными. В одном варианте реализации указанная последовательность аминокислот (RKR) в положениях с 14-го по 16-ое SEQ ID No: 13 и указанная последовательность аминокислот (KRVKRRK) в положениях с 28-го по 34-е SEQ ID No: 13 являются последовательностями ядерной локализации указанного С-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ типа 59.
[0065] В одном варианте реализации указанный химерный белок L1 ПВЧ включает как С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33, так и С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 59.
[0066] В одном варианте реализации указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 6 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99%, или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 1, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0067] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 11 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательность, показанной в SEQ ID No: 14, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0068] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 16 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 27, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0069] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 18 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100%) идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 40 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0070] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 31 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 53, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0071] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 35 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 69, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0072] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 39 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 82, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0073] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 45 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 95, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0074] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 51 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 108, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0075] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 52 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 121, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0076] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 56 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 134, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5; и
[0077] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 58 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 147, в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
[0078] В одном варианте реализации С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного С-концевого фрагмента напрямую или посредством линкера.
[0079] Линкер не влияет на иммуногенность указанного N-концевого фрагмента и не влияет на уровень экспрессии или растворимость белка. В одном варианте реализации указанный N-концевой фрагмент и указанный С-концевой фрагмент соединены посредством линкера, содержащего 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 аминокислот. В одном варианте реализации указанный линкер представляет собой искусственную последовательность. В другом варианте реализации указанный линкер представляет собой природную последовательность, встречающуюся с белке L1 ПВЧ. В другом варианте реализации указанный линкер может представлять собой часть последовательности белка L1 ПВЧ типа 33. В другом варианте реализации указанный линкер может представлять собой часть последовательности белка L1 ПВЧ типа 59.
[0080] В одном варианте реализации внутри диапазона плюс или минус 4 аминокислоты от точки соединения, когда С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного С-концевого фрагмента, присутствует непрерывная последовательность аминокислот RKFL; предпочтительно, внутри диапазона плюс или минус 6 аминокислот от точки соединения, присутствует непрерывная последовательности аминокислот LGRKFL.
[0081] В некоторых вариантах реализации указанный химерный белок L1 ПВЧ химерного ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 и 58 имеют 98%, 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с SEQ ID No: 3, SEQ ID No: 16, SEQ ID No: 29, SEQ ID No: 42, SEQ ID No: 55, SEQ ID No: 71, SEQ ID No: 84, SEQ ID No: 97, SEQ ID No: 110, SEQ ID No: 123, SEQ ID No: 136 и SEQ ID No: 149, соответственно; и белок L1 ПВЧ типа 33 и белок L1 ПВЧ типа 59 имеют 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, или 100% идентичность с SEQ ID No: 66 и SEQ ID No: 160, соответственно.
[0082] В одном варианте реализации по меньшей мере одна из указанных вирусоподобных частиц ПВЧ состоит химерного белка L1 ПВЧ одного типа, предпочтительно состоит указанного химерного белка L1 ПВЧ одного типа, имеющего такую же последовательность аминокислот.
[0083] В одном варианте реализации химерная вирусоподобная частица ПВЧ представляет собой икосаэдр, содержащий 72 пентамеров указанного химерного белка L1 ПВЧ. В одном варианте реализации указанная вирусоподобная частица ПВЧ имеет правильно образованные дисульфидные связи и, таким образом, имеет хорошую природную конформацию. В одном варианте реализации указанная химерная вирусоподобная частица ПВЧ самостоятельно собирается в системе экспрессии in vivo.
[0084] В одном варианте реализации указанная мультивалентная ПВЧ иммуногенная композиция дополнительно включает физиологически приемлемый носитель и, необязательно, адъювант. В одном варианте реализации указанный адъювант включает одну или более из солей алюминия, производное липида А и ISCOM.
[0085] В одном варианте реализации указанный адъювант представляет собой адъювант фосфата алюминия.
[0086] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает способ предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ, включающий: введение субъекту мультивалентной иммуногенной композиции ПВЧ. Указанное предотвращение может быть расценено как лечение и эти термины могут использоваться взаимозаменяемо. В одном варианте реализации указанным субъектом является человек.
[0087] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает применение вышеуказанной мультивалентной иммуногенной композиции ПВЧ для получения вакцин или лекарственных средств для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ.
[0088] Белки L1 папилломавируса, экспрессированные эукариотическими системами экспрессии могут спонтанно собираться в вирусоподобные частицы, но низкий уровень их экспрессии делает их неподходящими для массового производства.
[0089] Последовательности белков L1 каждого типа ПВЧ могут быть легко получены на сайте https://www.uniprot.org. Для конкретного типа ПВЧ, белок L1 может быть получен из различных штаммов, так что указанная последовательность аминокислот может иметь множество версий, любая версия природной последовательности может применяться в настоящем изобретении. Возможно, что указанная последовательность белка L1 ПВЧ определенного типа, использованная в процессе разработки концепции и дизайна настоящего изобретения, может отличаться от последовательности, использованной в последующих примерах, но такие отличия не влияют на решения и выводы изобретателей.
[0090] Специалистами в данной области техники общепризнано, что С-конец белка L1 не содержит основной нейтрализующий антигенный эпитоп, и поэтому были предприняты попытки увеличить экспрессию путем укорачивания С-конца белка L1 ПВЧ, например, в патенте США US 6361778 B1 компании Glaxo, в котором С-конец белка L1 ПВЧ16 укорочен на 1-34 аминокислоты, предпочтительно на 26 аминокислот, говорится, что выход ВПЧ увеличивается во много раз, по меньшей мере в 10 раз, в частности от примерно 10 до 100 раз. Вдохновленные этим, изобретатели попытались укоротить С-конец белка L1 ПВЧ16 на 31 аминокислоту и назвали укороченный белок L1 ПВЧ16 (1-474). Белок имеет высокий уровень экспрессии, но плохую растворимость, его трудно экстрагировать и очищать (см. Сравнительный Пример).
[0091] Плохая растворимость белка из-за этого укорочения может быть вызвана делецией последовательности ядерной локализации, расположенной на С-конце, но настоящее изобретение не связано с данным предположением. В ходе исследований и производства авторы изобретения обнаружили, что белок L1 ПВЧ типа 16, белок L1 ПВЧ типа 28, белок L1 ПВЧ типа 33, белок L1 ПВЧ типа 59 и белок L1 ПВЧ типа 68 имеют лучшие уровни экспрессии и растворимости, чем белки L1 ПВЧ других типов. Вдохновленные этим открытием, авторы настоящего изобретения заменили С-концы белков L1 ПВЧ конкретных типов, которые менее экстрагируемы или менее растворимы, на С-концы белков L1 ПВЧ конкретных типов, имеющих лучшие уровни экспрессии и растворимости. То есть, авторы настоящего изобретения сконструировали химерный белок, содержащий, в ориентации от N-конца до С-конца., N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа (например, белка L1 ПВЧ), который обеспечивает иммуногенность папилломавируса первого типа (например, ПВЧ), и С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа (например, белка L1 ПВЧ), который обеспечивает характеристики лучших уровней экспрессии и растворимости. Эти два фрагмента могут быть соединены напрямую или посредством линкера.
[0092] Определили длину N-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ, подходящую для поддержания иммуногенности белка L1 первого типа и обеспечения образования VLP. Следующие отчеты относятся к исследованиям эпитопов распространенных типов ПВЧ.
[0093] Sunanda Baidya и др. сообщали, что эпитопы белка L1 48EEYDLQFIFQLCKITLTA65, 45RHGEEYDLQFIFQLCKITLTA65, 63LPDPNKF69, 79PETQRLVWAC88, 36PVPGQYDA43, 77YNPETQRLVWAC88, 188DTGYGAMD195, 36PVPGQYDATK45, 45KQDIPKVSAYQYRVFRV61, 130RDNVSVDYKQTQLCI144 и 49YSRHVEEYDLQFIF62 могут применяться в качестве инструментов для конструирования вакцин против ПВЧ 16 и 18 (см. Epitope design of protein L1 for vaccine production against Human papillomavirus types 16 and 18, Bioinformation 13(3): 86-93 March 2017, полностью включенную в настоящий документ посредством ссылки).
[0094] Katharina Slupetzky и др. сообщали, что участки рядом с аминокислотами 282-286 и 351-355 белка L1 ПВЧ-16 способствуют нейтрализации эпитопов и что последний является иммунодоминантным сайтом (см. Chimeric papillomavirus-like particles expressing a foreign epitope on capsid surface loops, Journal of General Virology (2001), 82, 2799-2804, полностью включенную в настоящий документ посредством ссылки).
[0095] Brooke Bishop и др. подготовили следующие три варианта белка L1 ПВЧ 11, 16, 18 и 35: делеция 9 аминокислот на его N-конце, деления α4 (соответствующего остаткам аминокислот 404-436 ПВЧ 16), и делеция 31 аминокислоты на его С-конце, соответственно, и сообщили, что первые два не собираются в VLP, но это явление не наблюдалось для последнего варианта (Crystal Structures of Four Types of Human Papillomavirus L1 Capsid Proteins/ UNDERSTANDING THE SPECIFICITY OF NEUTRALIZING MONOCLONAL ANTIBODY, The Journal of Biological Chemistry, 282, 31803-31811, полностью включена в настоящий документ посредством ссылки). Каждая α-спираль, β-складчатые листы и участок петли белка L1 ПВЧ каждого типа могут быть легко определены с помощью программного обеспечения для анализа последовательности, обычно используемого в данной области. При этом участок α-спирали включает участок α1, участок α2, участок α3, участок α4 и участок α5.
[0096] Авторы настоящего изобретения осуществили выравнивание последовательностей белков L1 ПВЧ 14 типов (типы 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58 и 59) и затем выполнили предсказание вторичной структуры в соответствии с цитированной выше литературой (Crystal Structures of Four Types of Human Papillomavirus L1 Capsid Proteins / UNDERSTANDING THE SPECIFICITY OF NEUTRALIZING MONOCLONAL ANTIBODY, The Journal of Biological Chemistry, 282, 31803-31811), результаты которого показаны ниже, где часть между стрелками, указывающими вниз, соответствует областям, которые были удалены для подготовки вариантов в этой литературе.
[0097] В дополнение к методам, используемым авторами настоящего изобретения для выравнивания последовательностей, программное обеспечение для прогнозирования вторичной структуры белка, которое может использоваться для прогнозирования, включает, но не ограничивается следующим:
[0098] 1. JPred: http://www.compbio.dundee.ac.uk/jpred/index.htrnl
[0099] 2. ProtPredicct: http://predictprotein.org
[00100] 3. PsiPred: http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred
[00101] 4. SCRATCH-1D: http://download.igb.uci.edu
[00102] 5. Nnpredict: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict
[00103] 6. Predictprotein: http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/SOPMA http://www.ibcp.fr/predict.html
[00104] 7. SSPRED: http://www.embl-heidelberg.de/sspred/ssprd_info.html.
[00105] В одном варианте реализации настоящего изобретения, авторы настоящего изобретения определили длину N-концевого фрагмента, полученного из белка L1 ПВЧ первого типа, следующим образом: природную последовательность белка L1 укоротили внутри участка α5 и близлежащих его участков, с сохранением указанной последовательности от ее N-конца к вновь сгенерированному С-концу в пределах области α5. Такая укороченная последовательность гарантирует, что она обладает иммуногенностью первого типа и способна образовывать VLP.
[00106] N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ, полученный из белка первого типа, может быть дополнительно модифицирован при условии, что он сохраняет иммуногенность белка первого типа и способен образовывать VLP.
[00107] Длину указанного С-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ, полученного из белка второго типа, определяют следующим образом: природную последовательность белка L1 укорачивают внутри участка а5 и близлежащих его участков, при этом указанная последовательность от вновь генерируемого N-конца внутри участка α5 до С-конца сохраняется. Такая укороченная последовательность не имеет основного нейтрализующего антигенного эпитопа, поэтому не влияет на иммуногенность полученного химического белка.
[00108] Указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ, полученный из белка второго типа, может быть дополнительно мутирован, делегирован и/или включать дополнения, предпочтительно сохраняя по меньшей мере одну из его последовательностей ядерной локализации. Yang и др. предсказали последовательности ядерной локализации 107 подтипов ПВЧ (Yang и др. Predicting the nuclear localization signals of 107 types of HPV Proteins L1 by bioinformatic analysis. Geno. Prot. Bioinfo. Vol.4 No. 1 2006, целиком включена в настоящее описание посредством ссылки). Последовательности ядерной локализации каждого типа белка L1 ПВЧ могут быть легко определены с помощью программного обеспечения для анализа последовательностей, обычно используемым в полевых условиях.
[00109] Вышеописанное соединение N-концевого фрагмента с указанным С-концевым фрагментом происходит на вновь сгенерированном С-конце первого фрагмента и на вновь сгенерированном N-конце последнего. Это может быть прямое соединение или соединение посредством линкера. Место, где происходит соединение, определяется как точка начала координат, N-концевая сторона начала координат рассматривается как минус, а указанная С-концевая сторона как плюс.
[00110] Ниже показана указанная последовательность аминокислот 453-469 белка L1 ПВЧ6 и соответствующая последовательность белков L1 ПВЧ других типов. Эти последовательности перекрываются с их областью α5, соответственно. Можно заметить, что эти последовательности очень похожи. Цифры в скобках указывают на положение последних остатков аминокислот из перечисленных последовательностей, где для ПВЧ типа 45 дополнительно 26 аминокислот присутствуют в составе N-конца белка L1 некоторых штаммов ПВЧ типа 45, а в составе N-конца белка L1 других штаммов ПВЧ типа 45 указанные дополнительные 26 аминокислот отсутствуют, поэтому номер указан как (478)+26.
[00111] ПВЧ6 ELDQYPLGRKFLLQSGY(469)
[00112] ПВЧ11 ELDQFPLGRKFLLQSGY(470)
[00113] ПВЧ16 DLDQFPLGRKFLLQAGL(474)
[00114] ПВЧ18 DLDQYPLGRKFLVQAGL(475)
[00115] ПВЧ31 DLDQFPLGRKFLLQAGY(475)
[00116] ПВЧ35 DLDQFPLGRKFLLQAGL(472)
[00117] ПВЧ39 ELDQFPLGRKFLLQARV(474)
[00118] ПВЧ45 DLDQYPLGRKFLVQAGL(478)+26
[00119] ПВЧ51 DLDQFALGRKFLLQVGV(474)
[00120] ПВЧ52 DLDQFPLGRKFLLQAGL(478)
[00121] ПВЧ56 DLDQFPLGRKFLMQLGTRS(474)
[00122] ПВЧ58 DLDQFPLGRKFLLQSGL(473)
[00123] ПВЧ33 DLDQFPLGRKFLLQAGL(473)KAKPKLKKAAPTSTRTSSAKRKKVKK при этом KR в положениях 480-481 и KRKK в положениях 493-496 являются последовательностями ядерной локализации.
[00124] ПВЧ59 DLDQFPLGRKFLLQLGA(475)RPKPTIGPRKRAAPAPTSTPSPKRVKRRKSSRK, при этом RKR в положениях 484-486 и KRVKRRK в положениях 498-504 являются последовательностями ядерной локализации.
[00125] В одном варианте реализации настоящего изобретения, авторы настоящего изобретения завершили замены С-конца белков L1 между типами ПВЧ, воспользовавшись сходством последовательностей области α5 и близлежащих областей между разными типами ПВЧ.
[00126] В наиболее предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения авторы настоящего изобретения заметили, что белок L1 каждого типа ПВЧ имеет тетрапептид RKFL или, более предпочтительно, гексапептид LGRKFL, в сходном положении. Авторы настоящего изобретения умело использовали эту высококонсервативную последовательность, чтобы определить местонахождение указанной точки соединения химерного белка в составе этого олигопептида. С одной стороны, указанная последовательность, начинающаяся с N-конца указанного химерного белка до RKFL или LGRKFL, идентична указанной последовательности N-концевого фрагмента, полученного из белка L1 первого типа, а с другой стороны, указанная последовательность, начинающаяся с RKFL или LGRKFL и до С-конца указанного химерного белка, идентична указанной последовательности С-концевого фрагмента, полученного из белка L1 второго типа.
[00127] Полученный таким образом указанный химерный белок сохраняет высокую степень сходства с природным белком L1 ПВЧ, и можно ожидать, что он будет хорошо проявлять себя в производстве и даже в лечебных или профилактических процедурах после этого.
[00128] Специалистам в данной области техники будет понятно, что существуют различные штаммы с различными природными последовательностями данного типа ПВЧ, и химерные белки, сконструированное с использованием этих различных штаммов, также подпадают под объем настоящего изобретения.
[00129] Специалистам в данной области техники будет понятно, что из-за высокой степени сходства между белками L1 из различных типов ПВЧ, если при конструировании химического белка, N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 первого типа, расширен за счет большего количества остатков аминокислоты в сторону С-конца, или указанный С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 ПВЧ второго типа вируса расширен за счет большего количества остатков аминокислот в сторону N-конца, также возможно образование химерных белков, структурно идентичных белкам согласно настоящему изобретению благодаря идентичным или подобным аминокислотам в соответствующих сайтах. Образованные таким образом химерные белки также подпадают под объем настоящего изобретения.
[00130] Специалистам в данной области техники будет понятно, что на основе химерных белков вышеописанных вариантов осуществления другие варианты химерных белков могут быть образованы путем мутаций, делеций и/или добавлений остатков аминокислот. Эти варианты с большой вероятностью обладают иммуногенностью белка L1 первого типа, могут образовывать VLP, имеют хороший выход и растворимость. Химерные белки, полученные таким образом, также подпадают под объем настоящего изобретения.
[00131] Преимущественные эффекты настоящего изобретения
[00132] Системы экспрессии, обычно используемые для получения вирусоподобных частиц, классифицируют на эукариотические системы экспрессии и прокариотические системы экспрессии. Белки L папилломавируса, экспрессируемые эукариотическими системами экспрессии, могут спонтанно собираться в вирусоподобные частицы, но имеют недостаток, заключающийся в низком уровне экспрессии, поэтому не подходят для массового производства. Белки L папилломавируса, экспрессируемые прокариотическими системами экспрессии, требуют процессинга in vitro, в результате чего получают вирусоподобные частицы с часто разрушенной природной конформацией, и этот процесс имеет низкий выход, что затрудняет его использование в промышленных масштабах.
[00133] В рамках настоящего изобретения изменяют С-конец белка L папилломавируса (например, папилломавируса человека), например, заменяя его указанным С-концевым фрагментом белка L1 ПВЧ типа 16, белка L1 ПВЧ типа 28, белка L1 ПВЧ типа 33, белка L1 ПВЧ типа 59 или белка L1 ПВЧ типа 68, таким образом полученный белок может быть использован в системах экспрессии (например, клетках-хозяевах, например, клетках насекомых) для повышения уровня экспрессии и растворимости белка L1 папилломавируса в этих системах экспрессии (например, клетках-хозяевах, например, клетках насекомых). Поэтому он может применяться при массовом производстве вакцин, таких как вакцина против ПВЧ.
[00134] Авторы настоящего изобретения обнаружили, что белок L1 ПВЧ типа 16, белок L1 ПВЧ типа 28, белок L1 ПВЧ типа 33, белок L1 ПВЧ типа 59 и белок L1 ПВЧ типа 68 имеют повышенный уровень экспрессии и повышенную растворимость по сравнению с белками L1 других типов ПВЧ, и было обнаружено, что указанный повышенный уровень экспрессии белка и повышенная растворимость зависят от указанной С-концевой последовательности белков L1 ПВЧ. Среди белков L1 ПВЧ 107 типов, большинство имеет последовательность ядерной локализации на С-конце, и указанные С-концевые последовательности имеют некоторое сходство.
[00135] Для белков L папилломавируса, которые в настоящее время не экспрессируются, имеют очень низкий уровень экспрессии или являются нерастворимыми после экспрессии, замена их С-концевых фрагментов на С-концевые фрагменты белка L1 ПВЧ типа 16, белка L1 ПВЧ типа 28, белка L1 ПВЧ типа 33, белка L1 ПВЧ типа 59 или белка L1 ПВЧ типа 68 делает возможным хорошую экспрессию и растворимость, и последующую очистку. Эта стратегия может применяться для массового производства поливалентной вакцины (например, вакцины против ПВЧ), что позволяет обеспечить более комплексную защиту от широкого спектра папилломавирусных инфекций, особенно от ПВЧ.
[00136] Необходимо повысить уровень экспрессии и растворимость белка L1 ПВЧ в клетках насекомых для целей массового производства. Дополнительно вирусоподобные частицы, собранные из белка L ПВЧ в дрожжевых клетках, не имеют хорошей конформации из-за нарушения образования правильных дисульфидных связей.
[00137] Для белков L1 ПВЧ, которые плохо экспрессируются и нерастворимы в клетках насекомых, значительное повышение уровня экспрессии и растворимости может быть результатом модификации его С-концевой фрагмента в указанном С-концевом фрагменте белка L1 ПВЧ типа 33 или 59, поэтому их можно было использовать для массового производства вакцины против ПВЧ.
[00138] Для белков L1 ПВЧ, которые лучше экспрессируются в клетках насекомых и лучше растворимы по сравнению с белками L1 других типов ПВЧ, таких как белок L1 ПВЧ типа 16, белок L1 ПВЧ типа 28, белок L1 ПВЧ типа 68 и т.д., необходимо дополнительно повысить уровень экспрессии и растворимости для того, чтобы добиться массового производства вакцины. В настоящем изобретении, например, после модификации указанного С-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ типа 16 в указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33, улучшены уровень экспрессии и растворимость модифицированного химического белка ПВЧ типа 16, что способствует массовому производству вакцины против ПВЧ.
[00139] Таким образом, химерные белки L1 ПВЧ показали гораздо более высокий уровень экспрессии в клетках насекомых и растворимость по сравнению с немодифицированным белком L1 ПВЧ. Он может применяться в массовом производстве вакцины против ПВЧ. Кроме того, химерные белки L1 ПВЧ могут правильно образовывать дисульфидные связи и, таким образом, собираться в клетках насекомых в вирусоподобные частицы ПВЧ с хорошими конформациями. Это может повысить иммуногенность вирусоподобных частиц ПВЧ и вызвать лучшие иммунные реакции.
[00140] Мультивалентная вакцина согласно настоящему изобретению может использоваться для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с широким спектром ПВЧ, включая те типы ПВЧ, которые в настоящее время не поддаются профилактике.
[00141] Определения
[00142] Если не указано иное, все используемые здесь технические и научные термины имеют значения, обычно понятные специалистам в данной области техники, к которой относится настоящее изобретение. Для целей настоящего изобретения следующие термины определяются в соответствии со значениями, обычно понимаемыми в данной области техники.
[00143] При использовании в настоящем описании и в прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа «один», «другой» и «указанный» включают обозначение объекта во множественном числе, если контекст явно не указывает на иное. Если прямо не указано иное, термины «содержат/включают/имеют», «например» и т.д. предназначены для обозначения включения, а не ограничения.
[00144] Термин «иммуногенность» относится к способности вещества, например, белка или пептида, вызывать иммунный ответ, т.е., способности запускать выработку антител, в частности, способности запускать гуморальные реакции или клеточно-опосредованный ответ.
[00145] Термин «антитело» относится к молекуле иммуноглобулина, которая связывается с антигеном. Антитела могут быть поликлональной смесью антител или моноклональными. Антитела могут представлять собой интактные иммуноглобулины природного происхождения или рекомбинантного происхождения или могут представлять собой иммунореактивные участки интактных иммуноглобулинов. Антитела могут присутствовать в различных формах, включая, например, Fv, Fab', F(ab')2 и в виде отдельных цепей.
[00146] Термин «антигенность» относится к способности вещества, например белка или пептида, запускать выработку антител, которые специфически связываются с ним.
[00147] Термин «эпитоп» включает любой детерминантный кластер белка, который специфически связывается с антителом или Т-клеточным рецептором. Эпитопные детерминанты обычно состоят из химически активных поверхностных групп (например, боковых цепей аминокислот или Сахаров или их комбинаций) молекулы и обычно имеют специфические трехмерные структурные характеристики, а также специфические характеристики заряда.
[00148] Термины «подтип» или «тип» используются в данном документе взаимозаменяемо для обозначения генетического варианта вируса, который позволяет ему распознаваться иммунной системой как отдельный антиген от типа к типу. Например, ПВЧ 16 иммунологически отличим от ПВЧ 33.
[00149] В настоящем тексте термин «белок L1 ПВЧ», термин «ПВЧ» и «папилломавирус человека» относятся к безоболочечным ДНК-вирусам с двухцепочечной ДНК семейства папилломавирусов. Их геномы имеют кольцевую форму и имеют размер примерно 8 тысяч пар оснований. Большинство ПВЧ кодируют восемь основных белков, шесть в «ранней» области (Е1-Е2) и два в «поздней» области (L1 (основной капсидный белок) и L2 (минорный капсидный белок)). Выявлено более 120 типов ПВЧ и они пронумерованы (например, ПВЧ-16, ПВЧ-18 и т.д.).
[00150] Термин «ПВЧ» или «вирус ПВЧ» относится к папилломавирусам семейства Papillomaviridae, которые являются к безоболочечным ДНК-вирусам с геномом из двухцепочечной замкнутой кольцевой ДНК размером приблизительно 8 т.п.н., который обычно подразделяют на три области: (i) раннюю область (Е), которая содержит шесть открытых рамок считывания Е1, Е2, Е4-Е7, кодирующих неструктурные белки, связанные с репликацией, транскрипцией и трансформацией вируса, а также открытые рамки считывания Е3 и Е8; (ii) позднюю область (L), которая содержит рамки считывания, кодирующие главный белок капсида L1 и минорный белок капсида L2; и (iii) длинную регуляторную область (LCR), которая не кодирует никаких белков, но имеет точку начала репликации и множественные сайты связывания факторов транскрипции.
[00151] Термины «Белок L1 ПВЧ» и «белок L2 ПВЧ» относятся к белку, кодируемому поздней областью (L) гена ПВЧ и синтезируемому в конце инфекционного цикла ПВЧ. Белок L2 представляет собой минорный белок капсида. 72 пентамера L1 образуют внешнюю оболочку икосаэдрических частиц ПВЧ, в которую заключена замкнутая кольцевая двухцепочечная микрохромосома ДНК.
[00152] Термин «вирусоподобная частица» относится к полой частице, содержащей один или множество структурных белков вируса без вирусных нуклеиновых кислот.
[00153] «Псевдовирус ПВЧ» представляет собой идеальную модель для нейтрализации ПВЧ in vitro, используя преимущества свойства неспецифической инкапсуляции нуклеиновой кислоты VLP ПВЧ, псевдовирус ПВЧ образуется путем упаковки свободной ДНК или введения экзогенной плазмиды в VLP, состоящих из внутриклеточно экспрессируемых белков L1 и L2 ПВЧ.
[00154] «Анализ нейтрализации псевдовирусов» представляет собой способ оценки нейтрализующей активности антител. После инкубации сыворотки иммунизированных животных определенным количеством псевдовируса и последующего заражения клеток количество клеток уменьшается, а количество нейтрализующих антител сыворотки увеличивается, демонстрируя линейную отрицательную корреляцию в определенном диапазоне. Таким образом, нейтрализующую активность антител в сыворотке можно оценить путем измерения изменений количества клеток.
[00155] Термин «его фрагмент» или «его вариант» относится к делеции, вставке и/или замене последовательности нуклеотидов или аминокислот согласно настоящему изобретению. В измененной модификации фрагмент или вариант полипептида согласно настоящему изобретению способен вызывать гуморальный и/или клеточный иммунный ответ у животных или человека.
[00156] Термин «химерное» означает, что последовательности полипептидов или нуклеотидов, полученных из различных родительских молекул, соединены вместе связями -CO-NH- или 3',5'-фосфодиэфирными связями, соответственно. В предпочтительном варианте они не разнесены последовательностью дополнительного линкера, а непосредственно примыкают друг к другу.
[00157] Термин «укорочение» относится к удалению одной или множества аминокислот из N- и/или С-конца полипептида или к удалению одной или множества аминокислот из внутренней части полипептида.
[00158] Термин «последовательность ядерной локализации» относится к последовательности аминокислот, которая направляет белок в ядро. В некоторых белках L1 ПВЧ два плотных скопления основных остатков (т.е., последовательности ядерной локализации) (например, одного, выбранного из KRKR, KRKK, KRKRK, KRKKRK, KRVKRRK и т.д., и другого, выбранного из KR, RKR, KRK и т.д.) имеют спейсерную область из 10-14 аминокислот между ними. Вышеупомянутые кластеры основных остатков принадлежат к последовательностям ядерной локализации. В некоторых других белках L1 ПВЧ последовательность ядерной локализации представляет собой плотный кластер основных остатков, образованных аргининами и/или лизинами. Последовательность ядерной локализации включает примеры кластеров основных остатков, описанных выше, но не ограничивается ими. Смотри Jun Yang и др., Predicting the Nuclear Localization Signals of 107 Types of HPV L1 Proteins by Bioinformatic Analysis, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, Vol.4, Issue 1, 2006, Pages 34-41, полное содержание которого включено в настоящий документ посредством ссылки.
[00159] Термин «функциональный вариант» относится к варианту полипептида или белка, который сохраняет желаемую активность или характеристики после укорочения, мутации, делеции и/или добавления.
[00160] «Идентичность последовательности» между двумя последовательностями полипептидов или нуклеиновых кислот указывает количество идентичных остатков между указанными последовательностями в процентах от общего числа остатков и рассчитывается на основе размера меньшей из сравниваемых молекул. При вычислении процента идентичности сравниваемые последовательности сопоставляются таким образом, чтобы получить максимальное совпадение между указанными последовательностями, при этом вакантные позиции (если они есть) в совпадении разрешаются по определенному алгоритму. Предпочтительные компьютерные программы для определения идентичности между двумя последовательностями включают пакеты программ GCG, включая GAP, BLASTP, BLASTN и FASTA (Altschul и др., 1990, J. Mol. Biol. 215: 403-410), но не ограничиваются ими. Вышеуказанные программы находятся в открытом доступе в National Center of Biotechnology Information (NCBI) и на других ресурсах. Хорошо известный алгоритм Смита-Вотермана также может быть использован для определения указанной идентичности.
[00161] Некритические аминокислоты могут быть заменены консервативно, не влияя на нормальную функцию белка. Консервативная замена означает замену аминокислот химически или функционально сходными аминокислотами. Таблицы консервативных замен, дающих сходные аминокислоты, хорошо известны в данной области техники. Например, в некоторых вариантах реализации группы аминокислот, представленные в Таблицах 1-3, считаются консервативными заменами друг друга.
[00162] Термин «аминокислота» относится к двадцати распространенным природным аминокислотам. Природные аминокислоты включают аланин (Ala; А), аргинин (Arg; R), аспарагин (Asn; N), аспарагиновую кислоту (Asp; D), цистеин (Cys; С), глутаминовую кислоту (Glu; E), глутамин (Gln; Q), глицин (Gly; г), гистидин (His; H), изолейцин (Ile; I), лейцин (Leu; L), лизин (Lys; K), метионин (Met; M), фенилаланин (Phe; F), пролин (Pro; P), серии (Ser; S), треонин (Thr; T), триптофан (Trp; W), тирозин (Tyr; Y) и валин (Val; V).
[00163] В настоящем тексте «физиологически приемлемый носитель» представляет собой носитель, нетоксичный для клеток или млекопитающих в используемой дозе и концентрации. Обычно он представляет собой забуференный по рН водный раствор, неограничивающие примеры которого включают буферы; антиоксиданты; олигопептиды; белки; гидрофильные полимеры; аминокислоты; моносахариды, дисахариды и другие углеводы; хелатирующие агенты; сахарные спирты; противоионы, образующие соли, такие как натрий; и/или неионогенные поверхностно-активные вещества.
[00164] Термин «адъювант» относится к соединению или смеси, которые усиливают иммунные ответы. В частности, вакцина может включать адъювант. Адъюванты для применения в настоящем изобретении могут включать одно или множество из следующего: содержащие минералы композиции адъювантов, адъюванты в виде масляных эмульсий, препараты адъюванта сапонина, производные бактерий или микробов, но не ограничиваются ими.
[00165] Термин «вектор» относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной к пролиферации другой связанной с ней нуклеиновой кислоты. Термин включает векторы как самореплицирующиеся структуры нуклеиновой кислоты и как векторы, интегрированные в геном клеток-хозяев, в которые вектор был введен. Определенные векторы способны управлять экспрессией нуклеиновых кислот, с которыми такие векторы оперативно связаны.
[00166] Термин «клетка-хозяин» относится к клетке, в которую была введена экзогенная нуклеиновая кислота, а также к потомству такой клетки. Клетки-хозяева включают «трансформанты» (или «трансформированные клетки»), «трансфектанты» (или «трансфицированные клетки») или «инфектанты» (или «инфицированные клетки»), каждая из которых включает первично трансформированные, трансфицированные или инфицированные клетки и потомство, полученное из них. Такое потомство может не быть идентичным родительским клеткам с точки зрения содержания нуклеиновой кислоты и возможных мутаций.
[00167] Вводимое количество представляет собой «профилактически эффективное количество» (в данном случае профилактика может быть расценена как лечение и эти два термина могут быть взаимозаменяемы), которого достаточно, чтобы показать пользу для индивидуума.
[00168] Примеры
[00169] Пример 1. Конструирование химерных генов
[00170] Пример 1.1: Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ6, замененным С-концом L1 ПВЧ33.
[00171] 1.1.1 Конструирование pFB-ПВЧ6 L1 в качестве матрицы
[00172] Ген L1 ПВЧ6 с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.], его последовательность показана в SEQ ID NO: 5. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ6-L1, содержащую указанную последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-500 L1 ПВЧ6 получали лигированием фрагмента синтезированного гена в вектор pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) в места расщепления KpnI и XbaI.
[00173] Полученную плазмиду pcDNA3-ПВЧ6-L1 подвергали двойному ферментативному расщеплению с помощью KpnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ6 (1-500). Затем указанный фрагмент лигировали с вектором pFastBac™1, расщепленным KpnI/XbaI (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ6 (1-500), названый pFB-ПВЧ6 L1.
[00174] 1.1.2 Конструирование pFB-ПВЧ33 L1 в качестве матрицы
[00175] Ген L1 ПВЧ33 с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.), его последовательность показана в SEQ ID NO: 6. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ33-L1, содержащую указанную последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-499 белка L1 ПВЧ33, получали лигированием синтезированного гена фрагмент с вектором pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) в места расщепления KpnI и XbaI.
[00176] Плазмиду pcDNA3-ПВЧ33-L1 подвергали двойному ферментативному расщеплению с помощью KpnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ33 (1-499). Затем указанный фрагмент лигировали в вектор pFastBac™1, расщепленный KpnI и XbaI (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ33 (1-499), названый pFB-ПВЧ33 L1.
[00177] 1.1.3 Конструирование pFB-ПВЧ6 L1:33C
[00178] Химерный ген с С-концом ПВЧ6 L1, замещенным С-концом ПВЧ33 L1: сконструированную рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ6 L1 использовали в качестве матрицы гена для амплификации фрагмент гена 1426 п.о. с использованием праймеров F1 и R1, последовательность праймера F1 показана в SEQ ID No: 7, а последовательность праймера R1 показана в SEQ ID No: 8.
[00179] Этот фрагмент гена содержит фрагмент, кодирующий аминокислоты 1-469 белка L1 ПВЧ6, 10 оснований перекрываются с фрагментом гена, кодирующим аминокислоты 474-499 белка L1 ПВЧ33, и фрагментом сайта расщепления KpnI (GGTAC^C), амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 9.
[00180] Параметры амплификации ПЦР: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин.; денатурация при 98°С в течение 10 секунд, отжиг при 69°С в течение 15 секунд, 1 кб/1 мин при 72°С, в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 минут; конец при 16°С.
[00181] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ33 L1 использовали в качестве матрицы гена для амплификации фрагмента гена длиной 101 п.о. с использованием праймеров F2 и R2, последовательность праймера F2 показана в SEQ ID No: 10, а последовательность праймера R2 показана в SEQ ID No: 11.
[00182] Этот фрагмент гена содержит фрагмент гена, кодирующий 26 С-концевых аминокислот (474-499) белка L1 ПВЧ33, 10 п.о., перекрывающихся с фрагментом гена, кодирующим С-концевые аминокислоты 1-469 белка L1 ПВЧ6, и сайт расщепления XbaI (T^CTAGA), где амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 12.
[00183] Параметры амплификации ПЦР: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 кб/1 мин при 72°С, в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.
[00184] ПЦР для лигирования последовательностей:
[00185] Цитирующими праймерами были F1 и R2, и указанные фрагменты, амплифицированные с использованием указанных праймеров (амплифицировали фрагменты с помощью F1 и R1, амплифицировали фрагменты с помощью F2 и R2), использовали в качестве матриц.
[00186] Параметры ПЦР для лигирования: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 52°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 кб/1 мин, в течение 5 циклов; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 68°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 кб/1 мин, в течение 25 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.
[00187] Конечным результатом было получение SEQ ID NO: 4, последовательности нуклеотидов, кодирующей аминокислоты 1-469 белка L1 ПВЧ6 и 26 С-концевых аминокислот белка L1 ПВЧ33 (аа 474-499), с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах (здесь и далее указанной как последовательность лигирования).
[00188] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ6 L1:33C получали посредством двойного разрезания вектора pFastBac™1 и фрагмента последовательности лигирования с помощью ферментов KpnI+XbaI и клонирования последовательности лигирования в вектор pFastBac™1, в результате чего получали pFB-ПВЧ6 L1:33C, которая представляет собой химерный ген с С-концом белка L1 ПВЧ6, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33.
[00189] Пример 1.2. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ11, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00190] Экспериментальный метод и процедура были теми же, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 2 для соответствующей последовательности.
[00191] Пример 1.3. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ16, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00192] Экспериментальный метод и процедура были теми же, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 3 для соответствующей последовательности.
[00193] Пример 1.4. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ18 L1, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00194] Экспериментальный метод и процедура были теми же, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 4 для соответствующей последовательности.
[00195] Пример 1.5. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ31 L1, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00196] Экспериментальный метод и процедура были теми же, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 5 для соответствующей последовательности.
[00197] Пример 1.6. Конструирование гена белка L1 ПВЧ33
[00198] 1.6.1. Получение pFB-ПВЧ33 с геном L1
[00199] Ген L1 ПВЧ33 с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.], его последовательность показана в SEQ ID No: 68. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ33-L1, содержащую указанную последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-499 белка L1 ПВЧ33 получали лигированием синтезированного фрагмента гена с вектором pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) в места расщепления KpnI и XbaI.
[00200] Полученную плазмиду pcDNA3-ПВЧ33-L1 подвергали двойному ферментативному расщеплению с помощью KpnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена белка L1 ПВЧ33 (1-499). Затем указанный фрагмент лигировали с вектором pFastBac™1, расщепленным KpnVXbaI (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ33 (1-499), названый pFB-ПВЧ33 L1.
[00201] Пример 1.7. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ35 L1, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00202] Экспериментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 7 для соответствующей последовательности.
[00203] Пример 1.8. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ39 L1, замененным С-концом белка L1 ПВЧ59 L1
[00204] 1.8.1. Конструирование pFB-ПВЧ39 L1, использованной в качестве матрицы
[00205] Ген L1 ПВЧ39 с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.), его последовательность показана в SEQ ID NO: 86. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ39-L1, содержащую последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-505 белка L1 ПВЧ39 получали лигированием синтезированного фрагмента гена с вектором pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) в места расщепления KpnI и XbaI.
[00206] Плазмиду pcDNA3-ПВЧ39-L1 подвергали двойному расщеплению с помощью KpnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ39 (1-505). Затем указанный фрагмент лигировали в вектор pFastBacTM1, расщепленный KpnI и XbaI (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена ПВЧ39 L1 (1-505), названый pFB-ПВЧ39 L1.
[00207] 1.8.2. Конструирование pFB-ПВЧ59 L1 в качестве матрицы
[00208] Ген L1 ПВЧ59 с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.), его последовательность показана в SEQ ID NO: 87. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ59-L1, содержащую последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-508 белка L1 ПВЧ59 получали лигированием синтезированного фрагмента гена с вектором pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) в места расщепления KpnI и XbaI.
[00209] Плазмиду pcDNA3-ПВЧ59-L1 подвергали двойному расщеплению с помощью KpnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ59 (1-508). Затем указанный фрагмент лигировали в вектор pFastBacTM1, расщепленный KpnI и XbaI (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ59 (1-508), названый pFB-ПВЧ59 L1.
[00210] 1.8.3. Конструирование pFB-ПВЧ39 L1:59С
[00211] Химерный ген L1 ПВЧ39 с С-концом, замененным С-концом белка L1 ПВЧ59: сконструированную рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ39 L1 использовали в качестве матрицы гена для амплификации фрагмента гена длиной 1428 п.о. с использованием праймеров F1 и R1, последовательность праймера F1 показана в SEQ ID No: 88, а последовательность праймера R1 показана в SEQ ID No: 89.
[00212] Этот фрагмент содержит фрагмент, кодирующий аминокислоты 1-469 белка L1 ПВЧ39, 12 п.о., перекрывающихся с фрагментом, кодирующим аминокислоты 471-508 белка L1 ПВЧ59, и сегмент места расщепления KpnI (GGTAC^C); амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 90.
[00213] Параметры амплификации ПЦР: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 кб/1 мин при 72°С, в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.
[00214] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ59 L1 использовали в качестве матрицы гена для амплификации фрагмента гена длиной 139 п.о. с использованием праймеров F2 и R2. Последовательность праймера F2 показана в SEQ ID No: 91, а последовательность праймера R2 показана в SEQ ID No: 92.
[00215] Этот фрагмент гена содержит фрагмент гена, кодирующий 38 С-концевых аминокислот белка L1 ПВЧ59 (аа471-508), 12 п.о., перекрывающихся с фрагментом гена, кодирующим аминокислоты 1-469 белка L1 ПВЧ39, и место расщепления XbaI (T^CTAGA), где амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 93.
[00216] Параметры амплификации ПЦР: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 кб/1 мин при 72°С в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.
[00217] ПЦР для лигирования последовательностей
[00218] Праймерами для лигирования были F1 и R2, и указанные фрагменты, амплифицированные с использованием указанных праймеров (фрагменты, амплифицированные с помощью F1 и R1, фрагменты, амплифицированные с помощью F2 и R2), использовали в качестве матриц.
[00219] Параметры ПЦР для лигирования: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 52°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 кб/1 мин, в течение 5 циклов; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 68°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 кб/1 мин, в течение 25 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.
[00220] Окончательным результатом была последовательность SEQ ID NO: 85, последовательность нуклеотидов, кодирующая аминокислоты 1-469 белка L1 ПВЧ39 и 38 С-концевых аминокислот белка L1 ПВЧ59 L1 (471-508), с местами расщепления ферментами KpnI и XbaI на обоих концах (здесь и далее указанной как последовательность лигирования).
[00221] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ39 L1:59C получали посредством двойного разрезания вектора pFastBac™1 и последовательности фрагмента лигирования с помощью ферментов KpnI+XbaI и последовательность лигирования клонировали в вектор pFastBac™1 с получением pFB-ПВЧ39 L1:59C, который представляет собой химерный ген с С-концом белка L1 ПВЧ39, замененным С-концом белка L1 ПВЧ59.
[00222] Пример 1.9. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ45, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00223] Экспериментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 9 для соответствующей последовательности.
[00224] Пример 1.10. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ51, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00225] Экспериментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 10 для соответствующей последовательности.
[00226] Пример 1.11. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ52, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00227] Экспериментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 11 для соответствующей последовательности.
[00228] Пример 1.12. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ56, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00229] Экспериментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 12 для соответствующей последовательности.
[00230] Пример 1.13. Конструирование химерного гена с С-концом белка L1 ПВЧ58, замененным С-концом белка L1 ПВЧ33
[00231] Экспериментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, смотри Приложение 13 для соответствующей последовательности.
[00232] Пример 1.14. Конструирование гена L1 белка ПВЧ59
[00233] Пример 1.14.1. Получение гена L1 pFB-ПВЧ59
[00234] Ген L1 ПВЧ59 с местами расщепления KpnI и XbaI на обоих концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.], его последовательность показана в SEQ ID No: 162. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ59-L1, содержащую указанную последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-508 белка L1 ПВЧ59 получали лигированием синтезированного фрагмента гена с вектором pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) в места расщепления KpnI и XbaI.
[00235] Полученную плазмиду pcDNA3-ПВЧ59-L1 подвергали двойному ферментативному расщеплению с помощью KpnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена белка L1 ПВЧ59 (1-508). Затем указанный фрагмент лигировали в вектор pFastBac™1, расщепленный KpnI/XbaI (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ59 (1-508), названый pFB-ПВЧ59 L1.
[00236] Пример 2. Упаковка в рекомбинантный бакуловирус
[00237] Пример 2.1: Упаковка ПВЧ6 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00238] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ6 L1:33С, сконструированную в Примере 1, идентифицировали и секвенировали, чтобы подтвердить правильность последовательности, а затем трансформировали в компетентные клетки бактерий DH10Bac (набор Bac-to-Bac®, приобретенный у Thermo Fisher), выращивали при 37°С для роста и инкубировали в плоской чашке для посева. Отбирали белые колонии, инкубировали в течение ночи. Бактериальную культуру собирали и рекомбинантную ДНК бакуловируса экстрагировали с использованием метода щелочного лизиса.
[00239] ДНК рекомбинантного бакуловируса трансфицировали в клетки насекомых SF9 с использованием катионного реагента для трансфекции (приобретенного у Sino Biological) для упаковки вирулентных штаммов рекомбинантного бакуловируса. Процедура была следующей:
[00240] а. Клетки SF9 в логарифмической фазе роста инокулировали в чашки при плотности 0,6×106 клеток на чашку. Указанную чашку, инокулированую клетками SF9, оставляли при комнатной температуре на 2 часа для адгезии клеток к стенкам чашки.
[00241] б. 20 мкл экстрагированной плазмидной ДНК Bacmid добавляли к 200 мкл среду Грейса (без сыворотки, без добавок, приобретена у Gibico), смешивали и переворачивали 5 раз.
[00242] в. 25 мкл 0,2х TF1 (реагент для трансфекции, приобретенный у Sino Biological) добавляли по каплям к 200 мкл среды Грейса и аккуратно перемешивали.
[00243] г. Смешивали б. и в. Инкубировали при комнатной температуре в течение 15-45 мин.
[00244] д. В процессе инкубации ДНК с Cellfectin (приобретен у Sino Biological), клеточный супернатант удаляли и в чашку добавляли 0,8 мл среды Грейса (без сыворотки и добавок).
[00245] е. Инкубационную смесь ДНК и реагента для трансфекции г. добавляли на чашку по каплям.
[00246] ж. Инкубировали при 27°С в течение 2 часов.
[00247] з. Среду для выращивания клеток удаляли и добавляли в чашку 2,5 мл полной среды для выращивания (SCD6 SF+10% ФБС) (SCD6 SF приобретали у Sino Biological, ФЬС приобретали у Gibico).
[00248] и. Выращивание осуществляли при 27°С в течение 7 суток и наблюдали, происходит ли вирусное заражение.
[00249] Вирусный супернатант собирали после того, как в трансфицированных клетках наблюдали видимые повреждения, как правило, после 7-11 дней выращивания. Вирусный супернатант, т.е. штамм вируса поколения Р1 белка L1 ПВЧ6:33С, собирали пипеткой в асептических условиях. Клетки SF9 при плотности 2×106 клеток/мл инфицировали с использованием штамма вируса поколения Р1 белка L1 ПВЧ6:33С в соотношении 1:50 (об./об.), выращивали при 27°С в течение 3 суток и центрифугировали при 1000g±200g в течение 10 мин при комнатной температуре. Собранный супернатант вируса представлял собой вирус поколения Р2 и мог быть использован для заражения клеток-хозяев и продукции.
[00250] Пример 2.2: Упаковка ПВЧ11 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00251] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00252] Пример 2.3: Упаковка ПВЧ 16L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00253] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00254] Пример 2.4: Упаковка ПВЧ18 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00255] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00256] Пример 2.5: Упаковка ПВЧ31 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00257] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00258] Пример 2.6: Упаковка ПВЧ33 L1 в рекомбинантный бакуловирус
[00259] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00260] Пример 2.7: Упаковка ПВЧ35 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00261] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00262] Пример 2.8: Упаковка ПВЧ39 L1:59С в рекомбинантный бакуловирус
[00263] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00264] Пример 2.9: Упаковка ПВЧ45 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00265] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00266] Пример 2.10: Упаковка ПВЧ51 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00267] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00268] Пример 2.11: Упаковка ПВЧ52 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00269] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00270] Пример 2.12: Упаковка ПВЧ56 L1:33С в рекомбинантный бакуловирус
[00271] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00272] Пример 2.13: Упаковка ПВЧ58 L1:33C в рекомбинантный бакуловирус
[00273] Экспериментальные методы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00274] Пример 2.14: Упаковка ПВЧ59 L1 в рекомбинантный бакуловирус
[00275] Экспериментальные методы и процедуры были такими же как в Примере 2.1.
[00276] Пример 3. Экспрессия химерных белков или белков
[00277] В Примере 3.1 показана экспрессия белка L1 ПВЧ6:33С
[00278] Клетки High Five инфицировали бакуловирусом, содержащим рекомбинантный ген ПВЧ6 L1:33C, полученный в Примере 2, в соотношении 1:200 (ОБ./ОБ.), и преципитат клеток собирали центрифугированием при 1000g±100g при комнатной температуре. Клетки разрушали ультразвуком при низкой температуре в течение 3 мин, центрифугировали при >10,000g в течение 10 мин и супернатант собирали для ДСН-ПААГ. Дорожка 1: Маркер (маркер представляет собой смесь 7 очищенных белков с молекулярными весами в диапазоне от 14,4 кДа до 116 кДа, приобретенных у Thermo Scientific); Дорожка 2: лизат клеток; Дорожка 3: супернатант лизата, полученный центрифугированием.
[00279] Результат показан на Фиг. 1А. Белок L1 ПВЧ6 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00280] В Примере 3.2 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ11 L1:33С
[00281] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00282] Результат показан на Фиг. 1В. Белок L1 ПВЧ11 L1:33С, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00283] В Примере 3.3 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ 16L1:33С
[00284] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00285] Результат показан на Фиг. 1С. Белок L1 ПВЧ 16L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00286] В Примере 3.4 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ18 L1:33С
[00287] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00288] Результат показан на Фиг. 1D. Белок L1, ПВЧ18 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00289] В Примере 3.5 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ31 L1:33С
[00290] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00291] Результат показан на Фиг. 1Е. Белок L1 ПВЧ31 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00292] В Примере 3.6 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ33
[00293] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00294] Результат показан на Фиг. 1F. Белок L1 ПВЧ33 L1, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00295] В Примере 3.7 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ35 L1:33С
[00296] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00297] Результат показан на Фиг. 1G. Белок L1 ПВЧ35 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00298] В Примере 3.8 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ39 L1:59С
[00299] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00300] Результат показан на Фиг. 1Н. Белок L1 ПВЧ39 L1:59C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00301] В Примере 3.9 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ45 L1:33С
[00302] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00303] Результат показан на Фиг. П. Белок L1 ПВЧ45 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00304] В Примере 3.10 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ51 L1:33С
[00305] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00306] Результат показан на Фиг. 1J. Белок L1 ПВЧ51 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00307] В Примере 3.11 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ52 L1:33С
[00308] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00309] Результат показан на Фиг. 1К. Белок L1 ПВЧ52 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00310] В Примере 3.12 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ56 L1:33С
[00311] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00312] Результат показан на Фиг. 1L. Белок L1 ПВЧ56 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00313] В Примере 3.13 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ58 L1:33С
[00314] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00315] Результат показан на Фиг. 1М. Белок L1 ПВЧ58 L1:33C, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.
[00316] В Примере 3.14 показана экспрессия и получение белка L1 ПВЧ59 L1
[00317] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 3.1.
[00318] Результат показан на Фиг. 1N. Белок L1 ПВЧ59 L1, полученный этим способом, имеет выход >100 мг/л и размер белка составляет примерно 56 КДА, и он может применяться для массового производства.
[00319] Пример 4. Получение очищенных вирусоподобных частиц
[00320] Пример 4.1: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ6 L1:33С
[00321] Вирусоподобные частицы ПВЧ6 L1:33C очищали методом двухстадийной хроматографии, т.е. способом HS-MM, супернатант, собранный в Примере 3, очищали, и в конце концов получали вирусоподобные частицы высокой степени очистки.
[00322] Первая стадия хроматографии:
[00323] Носитель: использовали сильный катионообменный носитель POROS® 50 HS, полученный от Thermo Fisher.
[00324] Объем носителя: объем носителя 150 мл, линейная скорость потока 30 мл/мин.
[00325] Условия хроматографии: уравновешивающий буфер (рН 6,2, концентрация соли -50 мМ фосфат, 0,5 M NaCl); промывочный буфер (концентрация соли - 50 мМ фосфат, 0,75 M NaCl, pH 6,2).
[00326] Хроматографическую колонку сначала уравновешивали с помощью 5 объемов колонки уравновешивающего буфера и затем загружали образец. После загрузки колонку элюировали 5 объемами колонки уравновешивающего буфера и промывочного буфера, соответственно, для удаления примесей белка.
[00327] Условия элюции: использовали 50 мМ фосфатный буфер, содержащий 50 мМ гидрохлорида аргинина, рН 6,2, с концентрацией соли элюции NaCl, равной 1,25 М.
[00328] Вторая стадия хроматографии.
[00329] Носитель: использовали ионообменный носитель ММА, производимый Bestchrom Biosciences Co., Ltd (Shanghai).
[00330] Объем носителя: объем носителя - 150 мл, с линейной скоростью потока - 30 мл/мин.
[00331] Условия хроматографии: уравновешивающий буфер: 50 мМ фосфатный буфер, 1,25 M NaCl, рН 6,2. Хроматографическую колонку сначала уравновешивали 4 объемами колонки уравновешивающего буфера и затем загружали образец. После загрузки примеси белка смывали 5 объемами колонки уравновешивающего буфера, а затем целевой белок элюировали буфером для элюции и собирали.
[00332] Условия элюции: 100 мМ NaAc, 150 мМ NaCl, 0,01% Твин 80, рН 4,5.
[00333] Пример 4.2: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ11 L1:33С
[00334] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00335] Пример 4.3: Очистка и получение вирусоподобных частиц ПВЧ 16L1:33С
[00336] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00337] Пример 4.4: Очистка и получение вирусоподобных частиц ПВЧ18 L1:33С
[00338] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00339] Пример 4.5: Очистка и получение вирусоподобных частиц ПВЧ31 L1:33С
[00340] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00341] Пример 4.6: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ33 L1
[00342] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00343] Пример 4.7: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ35 L1:33С
[00344] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00345] Пример 4.8: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ39 L1:59С
[00346] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00347] Пример 4.9: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ45 L1:33С
[00348] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00349] Пример 4.10: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ51 L1:33С
[00350] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00351] Пример 4.11: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ52 L1:33С
[00352] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00353] Пример 4.12: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ56 L1:33С
[00354] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00355] Пример 4.13: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ58 L1:33С
[00356] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00357] Пример 4.14: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ59 L1
[00358] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 4.1.
[00359] Пример 5. Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц
[00360] Пример 5.1: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ6:33С
[00361] 10 мкл образца брали для трансмиссионной электронной микроскопии. Образец фиксировали на медной сетке с углеродным покрытием в течение 2 мин, оставшуюся жидкость абсорбировали фильтровальной бумагой, а затем окрашивали фосфорно-вольфрамовой кислотой (Beijing Electron Microscopy China Technology Co., Ltd., концентрация 2%, рН 6,5) каждый раз в течение 30 секунд, остаток красящего раствора удаляли фильтровальной бумагой, оставляли образец для сушки, затем проводили наблюдение с помощью трансмиссионной электронной микроскопии. Трансмиссионный электронный микроскоп (торговая марка: Hitachi, номер модели: Н-7650) имел напряжение 80 кВ и увеличение в 80000 раз.
[00362] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2А. Как можно увидеть на Фиг. 2А, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ6 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00363] Пример 5.2: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ11 L1:33C
[00364] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00365] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2В. Как можно увидеть на Фиг. 2В, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ11 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00366] Пример 5.3: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ 16L1:33C
[00367] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00368] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2С. Как можно увидеть на Фиг. 2С, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ 16L1.33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00369] Пример 5.4: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ18 L1:33С
[00370] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00371] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2D. Как можно увидеть на Фиг. 2D, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ18 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00372] Пример 5.5: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ31 L1:33C
[00373] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00374] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2Е. Как можно увидеть на Фиг. 2Е, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ31 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00375] Пример 5.6: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ33
[00376] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00377] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2F. Как можно увидеть на Фиг. 2F, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ33 L1 может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00378] Пример 5.7: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ35 L1:33С
[00379] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00380] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2G. Как можно увидеть на Фиг. 2G, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ35 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00381] Пример 5.8: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ39 L1:59С
[00382] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00383] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2Н. Как можно увидеть на Фиг. 2Н, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ39 L1:59C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00384] Пример 5.9: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ45 L1:33С
[00385] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00386] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 21. Как можно увидеть на Фиг. 21, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ45 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00387] Пример 5.10: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ51 L1:33C
[00388] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00389] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2J. Как можно увидеть на Фиг. 2J, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ51 L1.33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00390] Пример 5.11: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ52 L1:33C
[00391] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00392] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2K. Как можно увидеть на Фиг. 2K, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ52 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00393] Пример 5.12: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ56 L1:33С
[00394] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00395] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2L. Как можно увидеть на Фиг. 2L, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ56 L1:33С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00396] Пример 5.13: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ58 L1:33С
[00397] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00398] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2М. Как можно увидеть на Фиг. 2М, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ58 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00399] Пример 5.14: Морфологическое наблюдение вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ59 L1
[00400] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 5.1.
[00401] Данные наблюдений электронной микроскопии показаны на Фиг. 2N. Как можно увидеть на Фиг. 2N, указанный модифицированный в С-конце ПВЧ59 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром, составляющим примерно 60 нм.
[00402] Пример 6. Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц в животных
[00403] Пример 6.1: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц белка L1 ПВЧ6:33С в животных
[00404] 6.1.1 Моделирование клеток, нейтрализующих псевдовирус
[00405] Поскольку ПВЧ трудно культивировать in vitro и он обладает сильной специфичностью к хозяину, его трудно воспроизвести в организмах, отличных от человека, поэтому подходящие модели на животных отсутствуют. Таким образом, возникает необходимость в создании подходящих и эффективных экспериментальных моделей нейтрализации in vitro для оценки иммунозащитного действия вакцин.
[00406] Псевдовирус ПВЧ представляет собой идеальную модель для нейтрализации ПВЧ in vitro: благодаря свойству VLP ПВЧ неспецифически инкапсулировать нуклеиновые кислоты, псевдовирус ПВЧ может образовываться из VLP, состоящих из белков ПВЧ L1 и L2, экспрессируемых в клетках, путем инкапсулирования свободной ДНК или введения экзогенной плазмиды.
[00407] Иммуногенность образцов сыворотки иммунизированных животных анализировали с помощью анализа нейтрализации псевдовируса. Животное, иммунизированное вирусоподобными частицами ПВЧ6, может продуцировать нейтрализующие антитела против ПВЧ6, которые могут нейтрализовать псевдовирус ПВЧ6. Когда сыворотку иммунизированного животного инкубируют с определенным количеством псевдовируса и затем заражают клетки, количество клеток, способных экспрессировать флуоресценцию GFP, уменьшается, а нейтрализация антитела в сыворотке увеличивается, демонстрируя линейную отрицательную корреляцию в определенном диапазоне, поэтому нейтрализующая активность антител в сыворотке можно оценить, выявляя изменение количества клеток, экспрессирующих GFP.
[00408] Способ конструирования псевдовируса: плазмиду ПВЧ6 pCMV3-3-ПВЧ6 L1+L2 (последовательность L1 была из Uniprot Р69898, последовательность L2 была из Uniprot Q84297) (полученную от Sino Biological) и флуоресцентную плазмиду (PSEU-GFP Spark, приобретенную у Sino Biological) совместно трансфицировали в клетки 293FT (приобретенные у Thermo Fisher) на подложке. Конкретные методы относятся к опубликованной литературе (Pastrana D V, Buck С В, Pang Y S, Thompson С D, Castle P E, FitzGerald P С, Kjaer S K, Lowy D R, Schiller J T. Reactivity of human sera in a sensitive, high-throughput pseudovirus-based papillomavirus neutralization assay for HPV16 and HPV18. [J] Virology 2004,321:205-216). Супернатант псевдовируса собирали и делили на аликвоты и хранили в холодильнике при температуре -80°С для запаса.
[00409] 6.1.2 Оценка способности к иммунной защите вирусоподобных частиц ПВЧ6:33С в животных
[00410] Процедуры иммунизации мышей:
[00411] Вирусоподобные частицы ПВЧ6 L1:33C наносили на адъювант фосфата алюминия, смешивали и использовали для иммунизации мышей в дозировке 0,15 мкг/200 мкл на мышь, всего 10 мышей. Мышей иммунизировали разведенными образцами в дни 0, 7 и 21, а контрольных мышей иммунизировали контрольной сывороткой. Кровь собирали из глаз мышей на 28-й день и выделяли сыворотку для определения титров нейтрализации псевдовируса.
[00412] Анализ ЕС50 у мышей:
[00413] Сыворотку мышей инактивировали при 56°С в течение 30 минут, центрифугировали при 6000g 5 минут и супернатант собирали для анализа. За 4-8 ч до анализа клетки 293FT инокулировали при плотности 15000 клеток на лунку в 96-луночные планшеты и инкубировали при 37°С в СО2 - инкубаторе с 5% СО2. Постиммунную сыворотку мышей и контрольную сыворотку серийно разбавляли нейтрализующими средами соответственно, затем смешивали с псевдовирусом ПВЧ6, приготовленным в разделе 6.1, в объемном соотношении 1:1, инкубировали при 2-8°С в течение 1 часа, затем 100 мкл на лунку смеси добавляли к клеткам 293FT, которые инокулировали в течение 4-8 часов. Каждый образец был в повторности, и использовали контрольную группу пустой сыворотки, псевдовирусную контрольную положительную группу и псевдовирусную отрицательную контрольную группу. Клетки, инфицированные псевдовирусом, инкубировали при 37°С в СО2 инкубаторе с 5% СО2 в течение 62-96 часов, флуоресценцию сканировали, фотографировали и подсчитывали в анализаторе ELISPOT (модель S6 Universal-V Analyzer, Manufacturer: CTL). На основе ингибирования нейтрализации каждого образца сыворотки мышей рассчитывали максимальное разведение сыворотки при 50% ингибировании нейтрализации для каждого образца сыворотки мыши по методу Рида-Мюнха, т.е. разведение половинной эффективности ЕС50.
[00414] Результаты анализа титра нейтрализации ПВЧ6 в сыворотке приведены в Таблице 4.
[00415]
[00416] Замечания:
[00417] 1. количество животных, N=10.
[00418] 2. GMT (Средний Геометрический Титр): средний геометрический титр.
[00419] 3. SEM (Стандартная Ошибка Среднего): стандартная ошибка.
[00420] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные образцы ПВЧ6 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, обладают хорошей иммуногенностью и могут продуцировать нейтрализующие антитела с высокими титрами у животных, и они могут быть применяться для получения вакцины для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00421] Пример 6.2: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ11 L1:33C в животных
[00422] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р04012, а последовательность L2 была из Uniprot Р04013.
[00423] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ11 в сыворотке приведены в Таблице 5.
[00424] Таблица 5. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00425]
[00426] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ11 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00427] Пример 6.3: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ 16L1:33C в животных
[00428] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р03101, а последовательность L2 была из Uniprot Р03107.
[00429] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ16 в сыворотке приведены в Таблице 6.
[00430] Таблица 6. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00431]
[00432] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ 16L1:33С, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность и могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных, и они могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00433] Пример 6.4: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ18 L1:33C в животных
[00434] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Q80B70, а последовательность L2 была из Uniprot Р06793.
[00435] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ18 в сыворотке приведены в Таблице 7.
[00436] Таблица 7. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00437]
[00438] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ18 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00439] Пример 6.5: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ31 L1:33C в животных
[00440] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р17388, а последовательность L2 была из Uniprot Р17389.
[00441] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ31 в сыворотке приведены в Таблице 8.
[00442] Таблица 8. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00443]
[00444] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ31 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00445] Пример 6.6: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ33 в животных
[00446] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р06416, а последовательность L2 была из Uniprot Р06418.
[00447] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ33 в сыворотке приведены в Таблице 9.
[00448] Таблица 9. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00449]
[00450] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ33 L1, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00451] Пример 6.7: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ35 L1:33C в животных
[00452] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р27232, а последовательность L2 была из Uniprot Р27234.
[00453] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ35 в сыворотке приведены в Таблице 10.
[00454] Таблица 10. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00455]
[00456] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ35 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00457] Пример 6.8: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ39 L1:59C в животных
[00458] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р24838, а последовательность L2 была из Uniprot Р24839.
[00459] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ39 в сыворотке приведены в Таблице 11.
[00460] Таблица 11. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00461]
[00462] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ39 L1:59C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00463] Пример 6.9: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ45 L1:33C в животных
[00464] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р36741, а последовательность L2 была из Uniprot Р36761.
[00465] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ45 в сыворотке приведены в Таблице 12.
[00466] Таблица 12. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00467]
[00468] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ45 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00469] Пример 6.10: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ51 L1:33C в животных
[00470] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р26536, а последовательность L2 была из Uniprot Р26539.
[00471] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ51 в сыворотке приведены в Таблице 13.
[00472] Таблица 13. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00473]
[00474] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ51 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00475] Пример 6.11: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ52 L1:33C в животных
[00476] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Q05138, а последовательность L2 была из Uniprot F8S4U2.
[00477] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ52 в сыворотке приведены в Таблице 14.
[00478] Таблица 14. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00479]
[00480] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ52 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00481] Пример 6.12: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ56 L1:33C в животных
[00482] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р36743, а последовательность L2 была из Uniprot Р36765.
[00483] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ56 в сыворотке приведены в Таблице 15.
[00484] Таблица 15. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00485]
[00486] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ56 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00487] Пример 6.13: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ58 L1:33C в животных
[00488] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р26535, а последовательность L2 была из Uniprot B6ZB12.
[00489] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ58 в сыворотке приведены в Таблице 16.
[00490] Таблица 16. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00491]
[00492] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ58 L1:33C, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00493] Пример 6.14: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ59 L1 в животных
[00494] Экспериментальные способы и процедуры были такими же как в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Q81971, а последовательность L2 была из Uniprot Q81970.
[00495] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ59 в сыворотке приведены в Таблице 17.
[00496] Таблица 17. EC50 по результатам анализа титра нейтрализации псевдовируса в сыворотке (GMT±SEM)
[00497]
[00498] Приведенные выше результаты оценки демонстрируют, что вирусоподобные частицы ПВЧ59 L1, полученные согласно настоящему изобретению, имеют хорошую иммуногенность, могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и могут применяться для получения вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00499] Пример 6.15: Оценка иммуногенности 14 валентной иммуногенной композиции вирусоподобных частиц в мышах
[00500] Процедуры иммунизации мышей:
[00501] Образец, состоящий из вышеуказанных вирусоподобных частиц 14 типов (типы ПВЧ 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58 и 59) разбавляли стерильным адъювантом фосфата алюминия (например, типы ПВЧ, которые присутствовали в образце в количестве 20 мкг, разбавляли в 80 раз до концентрации 0,5 мкг/мл, концентрация других типов ПВЧ в образцах, присутствовавших в различных соотношениях, варьировалась соответствующим образом), 200 мкл образца разбавленных вирусоподобных частиц использовали для иммунизации каждой мыши, а дозировки приведены в Таблице 18. Самок мышей Balb/c с класса SPF в возрасте 6-8 недель разделяли на группы по 10 мышей в каждой группе (экспериментальная группа и контрольная группа) и иммунизировали разведенными образцами на 0, 7 и 21 день, соответственно, контрольных мышей иммунизировали пустой сывороткой. Кровь собирали из глаз мышей на 28-й день и выделяли сыворотку для анализа титров нейтрализации псевдовируса.
[00502] Таблица 18. Дозировки каждого типа ПВЧ в указанной иммуногенной композиции для иммунизации каждой мыши (мкг)
[00503]
[00504] Анализ титра нейтрализации сыворотки у иммунизированных мышей с помощью анализа нейтрализации псевдовируса:
[00505] Мышиную сыворотку инактивировали при 56°С в течение 30 минут, центрифугировали при 6000g 5 минут и супернатант собирали для анализа. За 4-8 ч до анализа клетки 293FT инокулировали при плотности 15000 клеток на лунку в 96-луночные планшеты и инкубировали при 37°С в СО2 инкубаторе с 5% СО2. Сыворотку иммунизированных мышей и контрольную сыворотку серийно разбавляли нейтрализующими средами, соответственно, затем смешивали с разведенными образцами псевдовирусов 14 типов (14 типов псевдовируса белка L1 ПВЧ - это типы ПВЧ 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58 и 59, приготовленные в Примерах 6.1-6.14) в объемном соотношении 1:1, инкубировали при 2-8°С в течение 1 ч, затем добавляли 100 мкл на лунку смеси к клеткам 293FT, которые инокулировали в течение 4-8 часов. Каждый образец был в повторности; пустая контрольная группа сыворотки, псевдовирусная контрольная группа и псевдовирусная отрицательная контрольная группа. Клетки, инфицированные псевдовирусом, инкубировали при 37°С в СО2 инкубаторе с 5% СО2 в течение 62-96 ч, флуоресценцию сканировали, фотографировали и подсчитывали в анализаторе ELISPOT (модель: S6 Universal-V Analyzer, Manufacturer: CTL). На основании ингибирования нейтрализации каждого образца мышиной сыворотки рассчитывали максимальное разведение сыворотки при 50% ингибировании нейтрализации для каждого образца мышиной сыворотки по методу Рида-Мюнха, т.е., разведение половинной эффективности ЕС50. Результаты приведены на Фиг. 3.
[00506] Как показано на Фиг. 3, указанная 14-валентная иммуногенная композиция вирусоподобных частиц могут вызывать образование высокого титра нейтрализующих антител в животных и она может применяться для получения вакцины для предотвращения инфекций ПВЧ.
[00507] Пример сравнения 1: экспрессия ПВЧ16 L1 с вырезанным С-концом (аа 1-474)
[00508] Авторы настоящего изобретения попытались отрезать С-конец белка L1 ПВЧ16 L1 размером 31 аминокислота и назвали его ПВЧ16 L1 (1-474) (SEQ ID NO: 27). Однако в ходе исследования было обнаружено, что укороченный белок ПВЧ16 L1 (1-474) демонстрирует высокую экспрессию, но имеет очень плохую растворимость и его трудно экстрагировать и очищать, подробные результаты экспрессии и экстракции показаны на Фиг. 4.
[00509] Несмотря на то, что настоящее изобретение подробно описано посредством иллюстрации и вариантов осуществления выше, оно предназначено только для облегчения понимания. Для специалистов в данной области техники очевидно, что различные модификации и улучшения, которые могут быть сделаны в технических решениях настоящего изобретения, по-видимому, возможны для специалистов с обычными навыками в области данной техники без отклонения от сути или объема прилагаемой формулы изобретения.
Приложение 1: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 6
Приложение 2: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 11
Приложение 3: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 16
Приложение 4: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 18
Приложение 5: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 31
Приложение 6: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 33
Приложение 7: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 35
Приложение 8: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 39
Приложение 9: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 45
Приложение 10: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 51
Приложение 11: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 52
Приложение 12: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 56
Приложение 13: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 58
Приложение 14: ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ - БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА ТИПА 59
--->
ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ
<110> SinoCellTech Ltd.
<120> ПОЛИВАЛЕНТНАЯ ИММУНОГЕННАЯ КОМПОЗИЦИЯ ДЛЯ ПАПИЛЛОМАВИРУСА ЧЕЛОВЕКА
<130> CIE200062PCT
<160> 162
<170> BiSSAP 1.3.6
<210> 1
<211> 469
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 0601 Последовательность аминокислот aa 1-469 белка L1 ПВЧ типа 6
<400> 1
Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro
1 5 10 15
Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Thr Arg Thr Asn Ile
20 25 30
Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr
35 40 45
Phe Ser Ile Lys Arg Ala Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly
50 55 60
Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe
65 70 75 80
Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val
85 90 95
Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val
100 105 110
Gly Val Ser Gly His Pro Phe Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn
115 120 125
Ser Gly Ser Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val Gly
130 135 140
Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro Pro
145 150 155 160
Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Gln Cys Thr Asn Thr Pro Val
165 170 175
Gln Ala Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile Gln
180 185 190
Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala Asp
195 200 205
Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile Cys Gly Thr Thr
210 215 220
Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly Asp
225 230 235 240
Arg Leu Phe Phe Phe Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His Phe
245 250 255
Phe Asn Arg Ala Gly Glu Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Thr Leu Ile
260 265 270
Ile Lys Gly Ser Gly Asn Arg Thr Ser Val Gly Ser Ser Ile Tyr Val
275 280 285
Asn Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe Asn
290 295 300
Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys
305 310 315 320
Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr
325 330 335
Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Thr Thr Ser Ser Thr Tyr Thr Asn
340 345 350
Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln
355 360 365
Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met Ala
370 375 380
Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe Gly
385 390 395 400
Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr Val
405 410 415
Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu Lys
420 425 430
Pro Asp Pro Tyr Lys Asn Leu Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys Glu
435 440 445
Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu
450 455 460
Leu Gln Ser Gly Tyr
465
<210> 2
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 0602 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 2
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 3
<211> 495
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0603 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 6
<400> 3
Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro
1 5 10 15
Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Thr Arg Thr Asn Ile
20 25 30
Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr
35 40 45
Phe Ser Ile Lys Arg Ala Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly
50 55 60
Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe
65 70 75 80
Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val
85 90 95
Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val
100 105 110
Gly Val Ser Gly His Pro Phe Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn
115 120 125
Ser Gly Ser Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val Gly
130 135 140
Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro Pro
145 150 155 160
Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Gln Cys Thr Asn Thr Pro Val
165 170 175
Gln Ala Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile Gln
180 185 190
Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala Asp
195 200 205
Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile Cys Gly Thr Thr
210 215 220
Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly Asp
225 230 235 240
Arg Leu Phe Phe Phe Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His Phe
245 250 255
Phe Asn Arg Ala Gly Glu Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Thr Leu Ile
260 265 270
Ile Lys Gly Ser Gly Asn Arg Thr Ser Val Gly Ser Ser Ile Tyr Val
275 280 285
Asn Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe Asn
290 295 300
Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys
305 310 315 320
Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr
325 330 335
Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Thr Thr Ser Ser Thr Tyr Thr Asn
340 345 350
Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln
355 360 365
Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met Ala
370 375 380
Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe Gly
385 390 395 400
Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr Val
405 410 415
Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu Lys
420 425 430
Pro Asp Pro Tyr Lys Asn Leu Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys Glu
435 440 445
Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu
450 455 460
Leu Gln Ser Gly Tyr Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro
465 470 475 480
Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
485 490 495
<210> 4
<211> 1488
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0604 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 6
<400> 4
atgtggagac catctgacag cacagtctat gtgcctcctc caaaccctgt gagcaaggtg 60
gtggctacag atgcctatgt gaccaggacc aacatcttct accatgcctc ctccagcaga 120
ctgctggctg tgggacaccc atacttcagc atcaagaggg ctaacaagac agtggtgcca 180
aaggtgtctg gctaccaata cagggtgttc aaggtggtgc tgcctgaccc aaacaagttt 240
gccctgcctg actcctccct gtttgaccca accacccaga gactggtgtg ggcttgtact 300
ggattggagg tgggcagggg acaaccactg ggagtgggag tgtctggaca cccattcctg 360
aacaaatatg atgatgtgga gaactctggc tctggaggca accctggaca agacaacagg 420
gtgaatgtgg ggatggacta caagcagacc caactttgta tggtgggctg tgcccctcca 480
ctgggagaac actggggcaa gggcaagcag tgtaccaaca cacctgtcca ggctggagac 540
tgtcctccat tggaactgat tacctctgtg attcaggatg gagatatggt ggacacaggc 600
tttggagcta tgaactttgc tgacctccaa accaacaagt ctgatgtgcc aattgacatc 660
tgtggcacca cttgtaaata ccctgactac ctccaaatgg ctgctgaccc atatggagac 720
agactgttct tcttcctgag gaaggaacag atgtttgcca gacacttctt caacagggct 780
ggagaggtgg gagaacctgt gcctgacacc ctgattatca agggctctgg caacaggacc 840
tctgtgggct ccagcatcta tgtgaacaca ccatctggct ccctggtgtc ctctgaggct 900
caacttttca acaagccata ctggctccaa aaggctcaag gacacaacaa tggcatctgt 960
tggggcaacc aactttttgt gacagtggtg gacaccacca ggagcaccaa tatgaccctg 1020
tgtgcctctg tgaccacctc cagcacctac accaactctg actacaagga atatatgagg 1080
catgtggagg aatatgacct ccaattcatc ttccaacttt gtagcatcac cctgtctgct 1140
gaggtgatgg cttacatcca cacaatgaac ccatctgtgt tggaggactg gaactttgga 1200
ctgagccctc ctccaaatgg caccttggag gacacctaca gatatgtcca gagccaggct 1260
atcacttgtc agaagccaac acctgagaag gagaagcctg acccatacaa gaacctgtcc 1320
ttctgggagg tgaacctgaa agagaagttc tcctctgaac tggaccaata cccactgggc 1380
aggaagttcc tgctccaatc tggctacaaa gccaagccaa aactgaaaag ggctgcccca 1440
accagcacca ggacctcctc tgccaagagg aagaaggtga agaagtaa 1488
<210> 5
<211> 1522
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0605 Синтетический ген L1 ПВЧ6
<400> 5
ctgggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg 60
agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg accaggacca acatcttcta ccatgcctcc 120
tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tacttcagca tcaagagggc taacaagaca 180
gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca 240
aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg 300
gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac 360
ccattcctga acaaatatga tgatgtggag aactctggct ctggaggcaa ccctggacaa 420
gacaacaggg tgaatgtggg gatggactac aagcagaccc aactttgtat ggtgggctgt 480
gcccctccac tgggagaaca ctggggcaag ggcaagcagt gtaccaacac acctgtccag 540
gctggagact gtcctccatt ggaactgatt acctctgtga ttcaggatgg agatatggtg 600
gacacaggct ttggagctat gaactttgct gacctccaaa ccaacaagtc tgatgtgcca 660
attgacatct gtggcaccac ttgtaaatac cctgactacc tccaaatggc tgctgaccca 720
tatggagaca gactgttctt cttcctgagg aaggaacaga tgtttgccag acacttcttc 780
aacagggctg gagaggtggg agaacctgtg cctgacaccc tgattatcaa gggctctggc 840
aacaggacct ctgtgggctc cagcatctat gtgaacacac catctggctc cctggtgtcc 900
tctgaggctc aacttttcaa caagccatac tggctccaaa aggctcaagg acacaacaat 960
ggcatctgtt ggggcaacca actttttgtg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaat 1020
atgaccctgt gtgcctctgt gaccacctcc agcacctaca ccaactctga ctacaaggaa 1080
tatatgaggc atgtggagga atatgacctc caattcatct tccaactttg tagcatcacc 1140
ctgtctgctg aggtgatggc ttacatccac acaatgaacc catctgtgtt ggaggactgg 1200
aactttggac tgagccctcc tccaaatggc accttggagg acacctacag atatgtccag 1260
agccaggcta tcacttgtca gaagccaaca cctgagaagg agaagcctga cccatacaag 1320
aacctgtcct tctgggaggt gaacctgaaa gagaagttct cctctgaact ggaccaatac 1380
ccactgggca ggaagttcct gctccaatct ggctacaggg gcaggtccag catcaggaca 1440
ggagtgaaga gacctgctgt gagcaaggca tctgctgccc caaagaggaa gagggctaag 1500
accaagaggt aaactcgagc tc 1522
<210> 6
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0606 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 6
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 7
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0607 Праймер F1 ПВЧ6L1
<400> 7
cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagt 35
<210> 8
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0608 Праймер R1 ПВЧ6L1
<400> 8
gcttggcttt gtagccagat tggagcagga acttcc 36
<210> 9
<211> 1426
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0609 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ6L1
<400> 9
cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg 60
agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg accaggacca acatcttcta ccatgcctcc 120
tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tacttcagca tcaagagggc taacaagaca 180
gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca 240
aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg 300
gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac 360
ccattcctga acaaatatga tgatgtggag aactctggct ctggaggcaa ccctggacaa 420
gacaacaggg tgaatgtggg gatggactac aagcagaccc aactttgtat ggtgggctgt 480
gcccctccac tgggagaaca ctggggcaag ggcaagcagt gtaccaacac acctgtccag 540
gctggagact gtcctccatt ggaactgatt acctctgtga ttcaggatgg agatatggtg 600
gacacaggct ttggagctat gaactttgct gacctccaaa ccaacaagtc tgatgtgcca 660
attgacatct gtggcaccac ttgtaaatac cctgactacc tccaaatggc tgctgaccca 720
tatggagaca gactgttctt cttcctgagg aaggaacaga tgtttgccag acacttcttc 780
aacagggctg gagaggtggg agaacctgtg cctgacaccc tgattatcaa gggctctggc 840
aacaggacct ctgtgggctc cagcatctat gtgaacacac catctggctc cctggtgtcc 900
tctgaggctc aacttttcaa caagccatac tggctccaaa aggctcaagg acacaacaat 960
ggcatctgtt ggggcaacca actttttgtg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaat 1020
atgaccctgt gtgcctctgt gaccacctcc agcacctaca ccaactctga ctacaaggaa 1080
tatatgaggc atgtggagga atatgacctc caattcatct tccaactttg tagcatcacc 1140
ctgtctgctg aggtgatggc ttacatccac acaatgaacc catctgtgtt ggaggactgg 1200
aactttggac tgagccctcc tccaaatggc accttggagg acacctacag atatgtccag 1260
agccaggcta tcacttgtca gaagccaaca cctgagaagg agaagcctga cccatacaag 1320
aacctgtcct tctgggaggt gaacctgaaa gagaagttct cctctgaact ggaccaatac 1380
ccactgggca ggaagttcct gctccaatct ggctacaaag ccaagc 1426
<210> 10
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0610 Праймер F2 ПВЧ6L1
<400> 10
atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 11
<211> 37
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0611 Праймер R2 ПВЧ6L1
<400> 11
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggc 37
<210> 12
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 0612 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ6L1
<400> 12
atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 13
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 0613 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 13
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 14
<211> 470
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1101 Последовательность аминокислот aa 1-470 белка L1 ПВЧ типа 11
<400> 14
Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro
1 5 10 15
Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Lys Arg Thr Asn Ile
20 25 30
Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr
35 40 45
Tyr Ser Ile Lys Lys Val Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly
50 55 60
Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe
65 70 75 80
Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val
85 90 95
Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val
100 105 110
Gly Val Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn
115 120 125
Ser Gly Gly Tyr Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val
130 135 140
Gly Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro
145 150 155 160
Pro Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Gln Cys Ser Asn Thr Ser
165 170 175
Val Gln Asn Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile
180 185 190
Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala
195 200 205
Asp Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Cys Gly Thr
210 215 220
Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly
225 230 235 240
Asp Arg Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His
245 250 255
Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Asp Leu
260 265 270
Leu Val Lys Gly Gly Asn Asn Arg Ser Ser Val Ala Ser Ser Ile Tyr
275 280 285
Val His Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe
290 295 300
Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile
305 310 315 320
Cys Trp Gly Asn His Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser
325 330 335
Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Ser Lys Ser Ala Thr Tyr Thr
340 345 350
Asn Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Phe Asp Leu
355 360 365
Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met
370 375 380
Ala Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe
385 390 395 400
Gly Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr
405 410 415
Val Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu
420 425 430
Lys Gln Asp Pro Tyr Lys Asp Met Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys
435 440 445
Glu Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe
450 455 460
Leu Leu Gln Ser Gly Tyr
465 470
<210> 15
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1102 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 15
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 16
<211> 496
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1103 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 11
<400> 16
Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro
1 5 10 15
Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Lys Arg Thr Asn Ile
20 25 30
Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr
35 40 45
Tyr Ser Ile Lys Lys Val Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly
50 55 60
Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe
65 70 75 80
Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val
85 90 95
Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val
100 105 110
Gly Val Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn
115 120 125
Ser Gly Gly Tyr Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val
130 135 140
Gly Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro
145 150 155 160
Pro Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Gln Cys Ser Asn Thr Ser
165 170 175
Val Gln Asn Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile
180 185 190
Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala
195 200 205
Asp Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Cys Gly Thr
210 215 220
Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly
225 230 235 240
Asp Arg Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His
245 250 255
Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Asp Leu
260 265 270
Leu Val Lys Gly Gly Asn Asn Arg Ser Ser Val Ala Ser Ser Ile Tyr
275 280 285
Val His Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe
290 295 300
Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile
305 310 315 320
Cys Trp Gly Asn His Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser
325 330 335
Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Ser Lys Ser Ala Thr Tyr Thr
340 345 350
Asn Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Phe Asp Leu
355 360 365
Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met
370 375 380
Ala Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe
385 390 395 400
Gly Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr
405 410 415
Val Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu
420 425 430
Lys Gln Asp Pro Tyr Lys Asp Met Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys
435 440 445
Glu Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe
450 455 460
Leu Leu Gln Ser Gly Tyr Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala
465 470 475 480
Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
485 490 495
<210> 17
<211> 1492
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1104 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 11
<400> 17
atgtggagac catctgacag cacagtctat gtgcctcctc caaaccctgt gagcaaggtg 60
gtggctacag atgcctatgt gaagaggacc aacatcttct accatgcctc ctccagcaga 120
ctgctggctg tgggacaccc atactacagc atcaagaagg tgaacaagac agtggtgcca 180
aaggtgtctg gctaccaata cagggtgttc aaggtggtgc tgcctgaccc aaacaagttt 240
gccctgcctg actcctccct gtttgaccca accacccaga gactggtgtg ggcttgtact 300
ggattggagg tgggcagggg acaaccactg ggagtgggag tgtctggaca cccactgctg 360
aacaaatatg atgatgtgga gaactctgga ggctatggag gcaaccctgg acaagacaac 420
agggtgaatg tggggatgga ctacaagcag acccaacttt gtatggtggg ctgtgcccct 480
ccactgggag aacactgggg caagggcacc cagtgtagca acacctctgt ccagaatgga 540
gactgtcctc cattggaact gattacctct gtgattcagg atggagatat ggtggacaca 600
ggctttggag ctatgaactt tgctgacctc caaaccaaca agtctgatgt gccactggac 660
atctgtggca cagtgtgtaa ataccctgac tacctccaaa tggctgctga cccatatgga 720
gacagactgt tcttctacct gaggaaggaa cagatgtttg ccagacactt cttcaacagg 780
gctggcacag tgggagaacc tgtgcctgat gacctgctgg tgaagggagg caacaacagg 840
tcctctgtgg catccagcat ctatgtgcat acaccatctg gctccctggt gtcctctgag 900
gctcaacttt tcaacaagcc atactggctc caaaaggctc aaggacacaa caatggcatc 960
tgttggggca accacctgtt tgtgacagtg gtggacacca ccaggagcac caatatgacc 1020
ctgtgtgcct ctgtgagcaa gtctgccacc tacaccaact ctgactacaa ggaatatatg 1080
aggcatgtgg aggagtttga cctccaattc atcttccaac tttgtagcat caccctgtct 1140
gctgaggtga tggcttacat ccacacaatg aacccatctg tgttggagga ctggaacttt 1200
ggactgagcc ctcctccaaa tggcaccttg gaggacacct acagatatgt ccagagccag 1260
gctatcactt gtcagaagcc aacacctgag aaggagaagc aggacccata caaggatatg 1320
agtttctggg aggtgaacct gaaagagaag ttctcctctg aactggacca gtttccactg 1380
ggcaggaagt tcctgctcca atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc 1440
ccaaccagca ccaggacctc ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aa 1492
<210> 18
<211> 1525
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1105 Синтетический ген L1 ПВЧ11
<400> 18
ctgggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg 60
agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg aagaggacca acatcttcta ccatgcctcc 120
tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tactacagca tcaagaaggt gaacaagaca 180
gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca 240
aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg 300
gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac 360
ccactgctga acaaatatga tgatgtggag aactctggag gctatggagg caaccctgga 420
caagacaaca gggtgaatgt ggggatggac tacaagcaga cccaactttg tatggtgggc 480
tgtgcccctc cactgggaga acactggggc aagggcaccc agtgtagcaa cacctctgtc 540
cagaatggag actgtcctcc attggaactg attacctctg tgattcagga tggagatatg 600
gtggacacag gctttggagc tatgaacttt gctgacctcc aaaccaacaa gtctgatgtg 660
ccactggaca tctgtggcac agtgtgtaaa taccctgact acctccaaat ggctgctgac 720
ccatatggag acagactgtt cttctacctg aggaaggaac agatgtttgc cagacacttc 780
ttcaacaggg ctggcacagt gggagaacct gtgcctgatg acctgctggt gaagggaggc 840
aacaacaggt cctctgtggc atccagcatc tatgtgcata caccatctgg ctccctggtg 900
tcctctgagg ctcaactttt caacaagcca tactggctcc aaaaggctca aggacacaac 960
aatggcatct gttggggcaa ccacctgttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc 1020
aatatgaccc tgtgtgcctc tgtgagcaag tctgccacct acaccaactc tgactacaag 1080
gaatatatga ggcatgtgga ggagtttgac ctccaattca tcttccaact ttgtagcatc 1140
accctgtctg ctgaggtgat ggcttacatc cacacaatga acccatctgt gttggaggac 1200
tggaactttg gactgagccc tcctccaaat ggcaccttgg aggacaccta cagatatgtc 1260
cagagccagg ctatcacttg tcagaagcca acacctgaga aggagaagca ggacccatac 1320
aaggatatga gtttctggga ggtgaacctg aaagagaagt tctcctctga actggaccag 1380
tttccactgg gcaggaagtt cctgctccaa tctggctaca ggggcaggac ctctgccagg 1440
acaggcatca agagacctgc tgtgagcaag ccaagcacag ccccaaagag gaagaggacc 1500
aagaccaaga agtaaactcg agctc 1525
<210> 19
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1106 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 19
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 20
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1107 Праймер F1 ПВЧ11L1
<400> 20
cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagt 35
<210> 21
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1108 Праймер R1 ПВЧ11L1
<400> 21
gcttggcttt gtagccagat tggagcagga acttcc 36
<210> 22
<211> 1429
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1109 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ11L1
<400> 22
cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg 60
agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg aagaggacca acatcttcta ccatgcctcc 120
tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tactacagca tcaagaaggt gaacaagaca 180
gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca 240
aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg 300
gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac 360
ccactgctga acaaatatga tgatgtggag aactctggag gctatggagg caaccctgga 420
caagacaaca gggtgaatgt ggggatggac tacaagcaga cccaactttg tatggtgggc 480
tgtgcccctc cactgggaga acactggggc aagggcaccc agtgtagcaa cacctctgtc 540
cagaatggag actgtcctcc attggaactg attacctctg tgattcagga tggagatatg 600
gtggacacag gctttggagc tatgaacttt gctgacctcc aaaccaacaa gtctgatgtg 660
ccactggaca tctgtggcac agtgtgtaaa taccctgact acctccaaat ggctgctgac 720
ccatatggag acagactgtt cttctacctg aggaaggaac agatgtttgc cagacacttc 780
ttcaacaggg ctggcacagt gggagaacct gtgcctgatg acctgctggt gaagggaggc 840
aacaacaggt cctctgtggc atccagcatc tatgtgcata caccatctgg ctccctggtg 900
tcctctgagg ctcaactttt caacaagcca tactggctcc aaaaggctca aggacacaac 960
aatggcatct gttggggcaa ccacctgttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc 1020
aatatgaccc tgtgtgcctc tgtgagcaag tctgccacct acaccaactc tgactacaag 1080
gaatatatga ggcatgtgga ggagtttgac ctccaattca tcttccaact ttgtagcatc 1140
accctgtctg ctgaggtgat ggcttacatc cacacaatga acccatctgt gttggaggac 1200
tggaactttg gactgagccc tcctccaaat ggcaccttgg aggacaccta cagatatgtc 1260
cagagccagg ctatcacttg tcagaagcca acacctgaga aggagaagca ggacccatac 1320
aaggatatga gtttctggga ggtgaacctg aaagagaagt tctcctctga actggaccag 1380
tttccactgg gcaggaagtt cctgctccaa tctggctaca aagccaagc 1429
<210> 23
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1110 Праймер F2 ПВЧ11L1
<400> 23
atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 24
<211> 37
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1111 Праймер R2 ПВЧ11L1
<400> 24
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggc 37
<210> 25
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1112 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ11L1
<400> 25
atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 26
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1113 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 26
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 27
<211> 474
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1601 Последовательность аминокислот aa 1-474 белка L1 ПВЧ типа 16
<400> 27
Met Ser Leu Trp Leu Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ala Arg Thr Asn
20 25 30
Ile Tyr Tyr His Ala Gly Thr Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Pro Ile Lys Lys Pro Asn Asn Asn Lys Ile Leu Val Pro Lys
50 55 60
Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile His Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ala Ser Ala Tyr Ala Ala Asn Ala Gly Val Asp Asn Arg
130 135 140
Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly
145 150 155 160
Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys Thr
165 170 175
Asn Val Ala Val Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Asn
180 185 190
Thr Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Thr Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Ile Lys Met Val Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Ala Val Gly Glu Asn Val Pro
260 265 270
Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Asn Leu Ala Ser
275 280 285
Ser Asn Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala
290 295 300
Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Leu Cys Ala Ala Ile Ser Thr Ser Glu
340 345 350
Thr Thr Tyr Lys Asn Thr Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu
355 360 365
Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr
370 375 380
Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Thr Ile Leu Glu
385 390 395 400
Asp Trp Asn Phe Gly Leu Gln Pro Pro Pro Gly Gly Thr Leu Glu Asp
405 410 415
Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Ala Cys Gln Lys His Thr
420 425 430
Pro Pro Ala Pro Lys Glu Asp Pro Leu Lys Lys Tyr Thr Phe Trp Glu
435 440 445
Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu
450 455 460
Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu
465 470
<210> 28
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1602 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 28
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 29
<211> 500
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1603 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 16
<400> 29
Met Ser Leu Trp Leu Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ala Arg Thr Asn
20 25 30
Ile Tyr Tyr His Ala Gly Thr Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Pro Ile Lys Lys Pro Asn Asn Asn Lys Ile Leu Val Pro Lys
50 55 60
Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile His Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ala Ser Ala Tyr Ala Ala Asn Ala Gly Val Asp Asn Arg
130 135 140
Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly
145 150 155 160
Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys Thr
165 170 175
Asn Val Ala Val Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Asn
180 185 190
Thr Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Thr Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Ile Lys Met Val Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Ala Val Gly Glu Asn Val Pro
260 265 270
Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Asn Leu Ala Ser
275 280 285
Ser Asn Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala
290 295 300
Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Leu Cys Ala Ala Ile Ser Thr Ser Glu
340 345 350
Thr Thr Tyr Lys Asn Thr Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu
355 360 365
Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr
370 375 380
Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Thr Ile Leu Glu
385 390 395 400
Asp Trp Asn Phe Gly Leu Gln Pro Pro Pro Gly Gly Thr Leu Glu Asp
405 410 415
Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Ala Cys Gln Lys His Thr
420 425 430
Pro Pro Ala Pro Lys Glu Asp Pro Leu Lys Lys Tyr Thr Phe Trp Glu
435 440 445
Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu
450 455 460
Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu
465 470 475 480
Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys
485 490 495
Lys Val Lys Lys
500
<210> 30
<211> 1504
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1604 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 16
<400> 30
atgagtctgt ggctgccatc tgaggctaca gtctacctgc ctcctgtgcc tgtgagcaag 60
gtggtgagca cagatgaata tgtggcaagg accaacatct actaccatgc tggcaccagc 120
agactgctgg ctgtgggaca cccatacttt ccaatcaaga agccaaacaa caacaagatt 180
ctggtgccaa aggtgtctgg actccaatac agggtgttca ggattcacct gcctgaccca 240
aacaagtttg gctttcctga cacctccttc tacaaccctg acacccagag actggtgtgg 300
gcttgtgtgg gagtggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggcat ctctggacac 360
ccactgctga acaaactgga tgacacagag aatgcctctg cctatgctgc caatgctgga 420
gtggacaaca gggagtgtat cagtatggac tacaagcaga cccaactttg tctgattggc 480
tgtaagcctc caattggaga acactggggc aagggcagcc catgtaccaa tgtggctgtg 540
aaccctggag actgtcctcc attggaactg ataaacacag tgattcagga tggagatatg 600
gtggacacag gctttggagc tatggacttc accaccctcc aagccaacaa gtctgaggtg 660
ccactggaca tctgtaccag catctgtaaa taccctgact acatcaagat ggtgtctgaa 720
ccatatggag actccctgtt cttctacctg aggagggaac agatgtttgt gagacacctg 780
ttcaacaggg ctggagcagt gggagagaat gtgcctgatg acctctacat caagggctct 840
ggcagcacag ccaacctggc atccagcaac tactttccaa caccatctgg cagtatggtg 900
acctctgatg cccagatttt caacaagcca tactggctcc aaagggctca aggacacaac 960
aatggcatct gttggggcaa ccaacttttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc 1020
aatatgagtc tgtgtgctgc catcagcacc tctgagacca cctacaagaa caccaacttc 1080
aaggaatacc tgagacatgg agaggaatat gacctccaat tcatcttcca actttgtaag 1140
attaccctga cagcagatgt gatgacctac atccacagta tgaacagcac catcttggag 1200
gactggaact ttggactcca acctcctcct ggaggcacct tggaggacac ctacaggttt 1260
gtgaccagcc aggctattgc ctgtcagaaa cacacacctc ctgccccaaa ggaggaccca 1320
ctgaaaaaat acaccttctg ggaggtgaac ctgaaagaga agttctctgc tgacctggac 1380
cagtttccac tgggcaggaa gttcctgctc caagcaggac tgaaagccaa gccaaaactg 1440
aaaagggctg ccccaaccag caccaggacc tcctctgcca agaggaagaa ggtgaagaag 1500
taaa 1504
<210> 31
<211> 1537
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1605 Синтетический ген L1 ПВЧ16
<400> 31
ctgggtacca tgagtctgtg gctgccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtggcaagga ccaacatcta ctaccatgct 120
ggcaccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactttc caatcaagaa gccaaacaac 180
aacaagattc tggtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag gattcacctg 240
cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct acaaccctga cacccagaga 300
ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc 360
tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga atgcctctgc ctatgctgcc 420
aatgctggag tggacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt 480
ctgattggct gtaagcctcc aattggagaa cactggggca agggcagccc atgtaccaat 540
gtggctgtga accctggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacagt gattcaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag 660
tctgaggtgc cactggacat ctgtaccagc atctgtaaat accctgacta catcaagatg 720
gtgtctgaac catatggaga ctccctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacctgt tcaacagggc tggagcagtg ggagagaatg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcagcacagc caacctggca tccagcaact actttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgatgc ccagattttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caactttttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgagtct gtgtgctgcc atcagcacct ctgagaccac ctacaagaac 1080
accaacttca aggaatacct gagacatgga gaggaatatg acctccaatt catcttccaa 1140
ctttgtaaga ttaccctgac agcagatgtg atgacctaca tccacagtat gaacagcacc 1200
atcttggagg actggaactt tggactccaa cctcctcctg gaggcacctt ggaggacacc 1260
tacaggtttg tgaccagcca ggctattgcc tgtcagaaac acacacctcc tgccccaaag 1320
gaggacccac tgaaaaaata caccttctgg gaggtgaacc tgaaagagaa gttctctgct 1380
gacctggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aagcaggact gaaagccaag 1440
ccaaagttca ccctgggcaa gaggaaggct acaccaacca cctccagcac cagcaccaca 1500
gccaagagga agaagaggaa actgtaaact cgagctc 1537
<210> 32
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1606 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 32
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 33
<211> 34
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1607 Праймер F1 ПВЧ16L1
<400> 33
cttggtacca tgagtctgtg gctgccatct gagg 34
<210> 34
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1608 Праймер R1 ПВЧ16L1
<400> 34
gcttggcttt cagtcctgct tggagcagga acttcc 36
<210> 35
<211> 1441
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1609 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ16L1
<400> 35
cttggtacca tgagtctgtg gctgccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtggcaagga ccaacatcta ctaccatgct 120
ggcaccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactttc caatcaagaa gccaaacaac 180
aacaagattc tggtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag gattcacctg 240
cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct acaaccctga cacccagaga 300
ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc 360
tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga atgcctctgc ctatgctgcc 420
aatgctggag tggacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt 480
ctgattggct gtaagcctcc aattggagaa cactggggca agggcagccc atgtaccaat 540
gtggctgtga accctggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacagt gattcaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag 660
tctgaggtgc cactggacat ctgtaccagc atctgtaaat accctgacta catcaagatg 720
gtgtctgaac catatggaga ctccctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacctgt tcaacagggc tggagcagtg ggagagaatg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcagcacagc caacctggca tccagcaact actttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgatgc ccagattttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caactttttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgagtct gtgtgctgcc atcagcacct ctgagaccac ctacaagaac 1080
accaacttca aggaatacct gagacatgga gaggaatatg acctccaatt catcttccaa 1140
ctttgtaaga ttaccctgac agcagatgtg atgacctaca tccacagtat gaacagcacc 1200
atcttggagg actggaactt tggactccaa cctcctcctg gaggcacctt ggaggacacc 1260
tacaggtttg tgaccagcca ggctattgcc tgtcagaaac acacacctcc tgccccaaag 1320
gaggacccac tgaaaaaata caccttctgg gaggtgaacc tgaaagagaa gttctctgct 1380
gacctggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aagcaggact gaaagccaag 1440
c 1441
<210> 36
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1610 Праймер F2 ПВЧ16L1
<400> 36
agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 37
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1611 Праймер R2 ПВЧ16L1
<400> 37
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 38
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1612 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ16L1
<400> 38
agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 39
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1613 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 39
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 40
<211> 470
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1801 Последовательность аминокислот aa 1-470 белка L1 ПВЧ типа 18
<400> 40
Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Asn Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro
35 40 45
Tyr Phe Arg Val Pro Ala Gly Gly Gly Asn Lys Gln Asp Ile Pro Lys
50 55 60
Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Ser Ile Tyr Asn Pro Glu Thr Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Ala Gly Val Glu Ile Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Ser Ser His Ala Ala Thr Ser Asn Val Ser Glu Asp Val Arg
130 135 140
Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu Gly
145 150 155 160
Cys Ala Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Ala Cys Lys
165 170 175
Ser Arg Pro Leu Ser Gln Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys Asn
180 185 190
Thr Val Leu Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe
245 250 255
Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Thr Met Gly Asp Thr Val Pro
260 265 270
Gln Ser Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Gly Met Arg Ala Ser Pro Gly Ser
275 280 285
Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Asp Ser
290 295 300
Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Val Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Cys Ala Ser Thr Gln Ser Pro Val
340 345 350
Pro Gly Gln Tyr Asp Ala Thr Lys Phe Lys Gln Tyr Ser Arg His Val
355 360 365
Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Ile Thr Leu
370 375 380
Thr Ala Asp Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Ser Ile Leu
385 390 395 400
Glu Asp Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr Ser Leu Val
405 410 415
Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp
420 425 430
Ala Ala Pro Ala Glu Asn Lys Asp Pro Tyr Asp Lys Leu Lys Phe Trp
435 440 445
Asn Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Tyr Pro
450 455 460
Leu Gly Arg Lys Phe Leu
465 470
<210> 41
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1802 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 41
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 42
<211> 496
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1803 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 18
<400> 42
Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Asn Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro
35 40 45
Tyr Phe Arg Val Pro Ala Gly Gly Gly Asn Lys Gln Asp Ile Pro Lys
50 55 60
Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Ser Ile Tyr Asn Pro Glu Thr Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Ala Gly Val Glu Ile Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Ser Ser His Ala Ala Thr Ser Asn Val Ser Glu Asp Val Arg
130 135 140
Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu Gly
145 150 155 160
Cys Ala Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Ala Cys Lys
165 170 175
Ser Arg Pro Leu Ser Gln Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys Asn
180 185 190
Thr Val Leu Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe
245 250 255
Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Thr Met Gly Asp Thr Val Pro
260 265 270
Gln Ser Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Gly Met Arg Ala Ser Pro Gly Ser
275 280 285
Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Asp Ser
290 295 300
Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Val Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Cys Ala Ser Thr Gln Ser Pro Val
340 345 350
Pro Gly Gln Tyr Asp Ala Thr Lys Phe Lys Gln Tyr Ser Arg His Val
355 360 365
Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Ile Thr Leu
370 375 380
Thr Ala Asp Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Ser Ile Leu
385 390 395 400
Glu Asp Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr Ser Leu Val
405 410 415
Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp
420 425 430
Ala Ala Pro Ala Glu Asn Lys Asp Pro Tyr Asp Lys Leu Lys Phe Trp
435 440 445
Asn Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Tyr Pro
450 455 460
Leu Gly Arg Lys Phe Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala
465 470 475 480
Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
485 490 495
<210> 43
<211> 1492
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1804 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 18
<400> 43
atggccctct ggagaccatc cgataacaca gtgtacttgc ccccacccag cgtcgcccgg 60
gtggtgaaca cagacgacta cgtcaccaga acctcaatct tctaccacgc cgggtccagc 120
cggctgctga ccgtgggcaa cccctacttc cgcgtgcccg ccggcggcgg aaacaaacaa 180
gacatcccca aagtcagcgc ctatcagtac cgggtgttcc gcgtccaact gcccgatccc 240
aacaagttcg gcctgcccga cacctccatc tacaaccccg agacccagag gctggtctgg 300
gcttgcgccg gcgtcgagat cgggaggggc caacccctgg gcgtggggtt gtccggccac 360
cccttctaca acaagctgga cgataccgag tccagccacg cagcaaccag caacgtctcc 420
gaagatgtgc gcgataacgt cagcgtggac tacaaacaaa cccaactgtg catcctggga 480
tgcgcacccg ccatcggcga gcattgggcc aaggggaccg cctgcaagag caggcccctg 540
agccaagggg actgtccacc cctggagttg aagaataccg tgctcgagga cggcgacatg 600
gtggacaccg gctacggcgc tatggatttc tccaccctcc aggacaccaa gtgcgaagtg 660
cccctcgaca tctgccaaag catctgcaag taccccgact acctccagat gagcgccgac 720
ccctacggcg acagcatgtt cttctgtctc agaagggaac aattgttcgc ccgccacttc 780
tggaaccggg ccggcacaat gggagataca gtcccccaga gcctgtacat caaggggacc 840
ggaatgaggg ccagccccgg gtcctgcgtc tacagcccaa gcccctccgg gagcatcgtc 900
acaagcgata gccaactctt caacaagccc tactggctcc acaaagccca aggccacaat 960
aacggggtgt gttggcacaa ccagctgttc gtgaccgtcg tggacacaac caggtccaca 1020
aacctgacca tctgcgccag cacccaaagc cccgtgcccg gccagtacga cgccacaaag 1080
ttcaaacaat actctcggca cgtggaagag tacgacctcc aattcatctt ccaactctgc 1140
accatcaccc tcaccgccga cgtgatgagc tacatccact ccatgaactc ctccatcctg 1200
gaagactgga atttcggcgt gccaccaccc cctaccacct ccctcgtcga cacctacaga 1260
ttcgtgcaga gcgtggccat cacatgccag aaagacgccg cccccgccga gaacaaagac 1320
ccatacgaca aactgaaatt ctggaacgtc gacctgaaag agaaattcag cctggatctg 1380
gaccagtacc cattgggcag gaagttcctc aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc 1440
ccaaccagca ccaggacctc ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aa 1492
<210> 44
<211> 1543
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1805 Синтетический ген L1 ПВЧ18
<400> 44
ctgggtacca tggccctctg gagaccatcc gataacacag tgtacttgcc cccacccagc 60
gtcgcccggg tggtgaacac agacgactac gtcaccagaa cctcaatctt ctaccacgcc 120
gggtccagcc ggctgctgac cgtgggcaac ccctacttcc gcgtgcccgc cggcggcgga 180
aacaaacaag acatccccaa agtcagcgcc tatcagtacc gggtgttccg cgtccaactg 240
cccgatccca acaagttcgg cctgcccgac acctccatct acaaccccga gacccagagg 300
ctggtctggg cttgcgccgg cgtcgagatc gggaggggcc aacccctggg cgtggggttg 360
tccggccacc ccttctacaa caagctggac gataccgagt ccagccacgc agcaaccagc 420
aacgtctccg aagatgtgcg cgataacgtc agcgtggact acaaacaaac ccaactgtgc 480
atcctgggat gcgcacccgc catcggcgag cattgggcca aggggaccgc ctgcaagagc 540
aggcccctga gccaagggga ctgtccaccc ctggagttga agaataccgt gctcgaggac 600
ggcgacatgg tggacaccgg ctacggcgct atggatttct ccaccctcca ggacaccaag 660
tgcgaagtgc ccctcgacat ctgccaaagc atctgcaagt accccgacta cctccagatg 720
agcgccgacc cctacggcga cagcatgttc ttctgtctca gaagggaaca attgttcgcc 780
cgccacttct ggaaccgggc cggcacaatg ggagatacag tcccccagag cctgtacatc 840
aaggggaccg gaatgagggc cagccccggg tcctgcgtct acagcccaag cccctccggg 900
agcatcgtca caagcgatag ccaactcttc aacaagccct actggctcca caaagcccaa 960
ggccacaata acggggtgtg ttggcacaac cagctgttcg tgaccgtcgt ggacacaacc 1020
aggtccacaa acctgaccat ctgcgccagc acccaaagcc ccgtgcccgg ccagtacgac 1080
gccacaaagt tcaaacaata ctctcggcac gtggaagagt acgacctcca attcatcttc 1140
caactctgca ccatcaccct caccgccgac gtgatgagct acatccactc catgaactcc 1200
tccatcctgg aagactggaa tttcggcgtg ccaccacccc ctaccacctc cctcgtcgac 1260
acctacagat tcgtgcagag cgtggccatc acatgccaga aagacgccgc ccccgccgag 1320
aacaaagacc catacgacaa actgaaattc tggaacgtcg acctgaaaga gaaattcagc 1380
ctggatctgg accagtaccc attgggcagg aagttcctcg tgcaagccgg cctcaggaga 1440
aaaccaacaa tcgggcccag gaagaggagc gcccccagcg caaccaccag cagcaagccc 1500
gcaaaaaggg tcagagtgag ggcacgcaaa taaactcgag ctc 1543
<210> 45
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1806 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 45
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 46
<211> 34
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1807 Праймер F1 ПВЧ18L1
<400> 46
cttggtacca tggccctctg gagaccatcc gata 34
<210> 47
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1808 Праймер R1 ПВЧ18L1
<400> 47
gcttggcttt gaggaacttc ctgcccaatg ggtac 35
<210> 48
<211> 1429
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1809 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ18L1
<400> 48
cttggtacca tggccctctg gagaccatcc gataacacag tgtacttgcc cccacccagc 60
gtcgcccggg tggtgaacac agacgactac gtcaccagaa cctcaatctt ctaccacgcc 120
gggtccagcc ggctgctgac cgtgggcaac ccctacttcc gcgtgcccgc cggcggcgga 180
aacaaacaag acatccccaa agtcagcgcc tatcagtacc gggtgttccg cgtccaactg 240
cccgatccca acaagttcgg cctgcccgac acctccatct acaaccccga gacccagagg 300
ctggtctggg cttgcgccgg cgtcgagatc gggaggggcc aacccctggg cgtggggttg 360
tccggccacc ccttctacaa caagctggac gataccgagt ccagccacgc agcaaccagc 420
aacgtctccg aagatgtgcg cgataacgtc agcgtggact acaaacaaac ccaactgtgc 480
atcctgggat gcgcacccgc catcggcgag cattgggcca aggggaccgc ctgcaagagc 540
aggcccctga gccaagggga ctgtccaccc ctggagttga agaataccgt gctcgaggac 600
ggcgacatgg tggacaccgg ctacggcgct atggatttct ccaccctcca ggacaccaag 660
tgcgaagtgc ccctcgacat ctgccaaagc atctgcaagt accccgacta cctccagatg 720
agcgccgacc cctacggcga cagcatgttc ttctgtctca gaagggaaca attgttcgcc 780
cgccacttct ggaaccgggc cggcacaatg ggagatacag tcccccagag cctgtacatc 840
aaggggaccg gaatgagggc cagccccggg tcctgcgtct acagcccaag cccctccggg 900
agcatcgtca caagcgatag ccaactcttc aacaagccct actggctcca caaagcccaa 960
ggccacaata acggggtgtg ttggcacaac cagctgttcg tgaccgtcgt ggacacaacc 1020
aggtccacaa acctgaccat ctgcgccagc acccaaagcc ccgtgcccgg ccagtacgac 1080
gccacaaagt tcaaacaata ctctcggcac gtggaagagt acgacctcca attcatcttc 1140
caactctgca ccatcaccct caccgccgac gtgatgagct acatccactc catgaactcc 1200
tccatcctgg aagactggaa tttcggcgtg ccaccacccc ctaccacctc cctcgtcgac 1260
acctacagat tcgtgcagag cgtggccatc acatgccaga aagacgccgc ccccgccgag 1320
aacaaagacc catacgacaa actgaaattc tggaacgtcg acctgaaaga gaaattcagc 1380
ctggatctgg accagtaccc attgggcagg aagttcctca aagccaagc 1429
<210> 49
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1810 Праймер F2 ПВЧ18L1
<400> 49
gaagttcctc aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 50
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1811 Праймер R2 ПВЧ18L1
<400> 50
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 51
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 1812 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ18L1
<400> 51
gaagttcctc aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 52
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 1813 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 52
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 53
<211> 475
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3101 Последовательность аминокислот aa 1-475 белка L1 ПВЧ типа 31
<400> 53
Met Ser Leu Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn
20 25 30
Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ala Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Tyr Ser Ile Pro Lys Ser Asp Asn Pro Lys Lys Ile Val Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Glu Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Phe Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Asn Ser Asn Arg Tyr Ala Gly Gly Pro Gly Thr Asp Asn
130 135 140
Arg Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Leu
145 150 155 160
Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys
165 170 175
Ser Asn Asn Ala Ile Thr Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys
180 185 190
Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala
195 200 205
Met Asp Phe Thr Ala Leu Gln Asp Thr Lys Ser Asn Val Pro Leu Asp
210 215 220
Ile Cys Asn Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ala
225 230 235 240
Glu Pro Tyr Gly Asp Thr Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met
245 250 255
Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ser Gly Thr Val Gly Glu Ser Val
260 265 270
Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Thr Leu Ala
275 280 285
Asn Ser Thr Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp
290 295 300
Ala Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Met Gln Arg Ala Gln Gly His
305 310 315 320
Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp
325 330 335
Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ala Ala Ile Ala Asn Ser
340 345 350
Asp Thr Thr Phe Lys Ser Ser Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly
355 360 365
Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu
370 375 380
Ser Ala Asp Ile Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ala Ile Leu
385 390 395 400
Glu Asp Trp Asn Phe Gly Leu Thr Thr Pro Pro Ser Gly Ser Leu Glu
405 410 415
Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Ser
420 425 430
Ala Pro Gln Lys Pro Lys Glu Asp Pro Phe Lys Asp Tyr Val Phe Trp
435 440 445
Glu Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro
450 455 460
Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Tyr
465 470 475
<210> 54
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3102 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 54
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 55
<211> 501
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3103 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 31
<400> 55
Met Ser Leu Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn
20 25 30
Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ala Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Tyr Ser Ile Pro Lys Ser Asp Asn Pro Lys Lys Ile Val Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Glu Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Phe Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Asn Ser Asn Arg Tyr Ala Gly Gly Pro Gly Thr Asp Asn
130 135 140
Arg Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Leu
145 150 155 160
Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys
165 170 175
Ser Asn Asn Ala Ile Thr Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys
180 185 190
Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala
195 200 205
Met Asp Phe Thr Ala Leu Gln Asp Thr Lys Ser Asn Val Pro Leu Asp
210 215 220
Ile Cys Asn Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ala
225 230 235 240
Glu Pro Tyr Gly Asp Thr Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met
245 250 255
Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ser Gly Thr Val Gly Glu Ser Val
260 265 270
Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Thr Leu Ala
275 280 285
Asn Ser Thr Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp
290 295 300
Ala Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Met Gln Arg Ala Gln Gly His
305 310 315 320
Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp
325 330 335
Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ala Ala Ile Ala Asn Ser
340 345 350
Asp Thr Thr Phe Lys Ser Ser Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly
355 360 365
Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu
370 375 380
Ser Ala Asp Ile Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ala Ile Leu
385 390 395 400
Glu Asp Trp Asn Phe Gly Leu Thr Thr Pro Pro Ser Gly Ser Leu Glu
405 410 415
Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Ser
420 425 430
Ala Pro Gln Lys Pro Lys Glu Asp Pro Phe Lys Asp Tyr Val Phe Trp
435 440 445
Glu Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro
450 455 460
Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Tyr Lys Ala Lys Pro Lys
465 470 475 480
Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg
485 490 495
Lys Lys Val Lys Lys
500
<210> 56
<211> 1507
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3104 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 31
<400> 56
atgagcctgt ggaggcccag cgaggccacc gtgtacctgc cccccgtgcc cgtgagcaag 60
gtggtgagca ccgacgagta cgtgaccagg accaacatct actaccacgc cggcagcgcc 120
aggctgctga ccgtgggcca cccctactac agcatcccca agagcgacaa ccccaagaag 180
atcgtggtgc ccaaggtgag cggcctgcag tacagggtgt tcagggtgag gctgcccgac 240
cccaacaagt tcggcttccc cgacaccagc ttctacaacc ccgagaccca gaggctggtg 300
tgggcctgcg tgggcctgga ggtgggcagg ggccagcccc tgggcgtggg catcagcggc 360
caccccctgc tgaacaagtt cgacgacacc gagaacagca acaggtacgc cggcggcccc 420
ggcaccgaca acagggagtg catcagcatg gactacaagc agacccagct gtgcctgctg 480
ggctgcaagc cccccatcgg cgagcactgg ggcaagggca gcccctgcag caacaacgcc 540
atcacccccg gcgactgccc ccccctggag ctgaagaaca gcgtgatcca ggacggcgac 600
atggtggaca ccggcttcgg cgccatggac ttcaccgccc tgcaggacac caagagcaac 660
gtgcccctgg acatctgcaa cagcatctgc aagtaccccg actacctgaa gatggtggcc 720
gagccctacg gcgacaccct gttcttctac ctgaggaggg agcagatgtt cgtgaggcac 780
ttcttcaaca ggagcggcac cgtgggcgag agcgtgccca ccgacctgta catcaagggc 840
agcggcagca ccgccaccct ggccaacagc acctacttcc ccacccccag cggcagcatg 900
gtgaccagcg acgcccagat cttcaacaag ccctactgga tgcagagggc ccagggccac 960
aacaacggca tctgctgggg caaccagctg ttcgtgaccg tggtggacac caccaggagc 1020
accaacatga gcgtgtgcgc cgccatcgcc aacagcgaca ccaccttcaa gagcagcaac 1080
ttcaaggagt acctgaggca cggcgaggag ttcgacctgc agttcatctt ccagctgtgc 1140
aagatcaccc tgagcgccga catcatgacc tacatccaca gcatgaaccc cgccatcctg 1200
gaggactgga acttcggcct gaccaccccc cccagcggca gcctggagga cacctacagg 1260
ttcgtgacca gccaggccat cacctgccag aagtccgccc cccagaagcc caaggaggac 1320
cccttcaagg actacgtgtt ctgggaggtg aacctgaagg agaagttcag cgccgacctg 1380
gaccagttcc ccctgggcag gaagttcctg ctgcaggccg gctacaaagc caagccaaaa 1440
ctgaaaaggg ctgccccaac cagcaccagg acctcctctg ccaagaggaa gaaggtgaag 1500
aagtaaa 1507
<210> 57
<211> 1534
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3105 Синтетический ген L1 ПВЧ31
<400> 57
ctgggtacca tgagcctgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc 60
gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgaccagga ccaacatcta ctaccacgcc 120
ggcagcgcca ggctgctgac cgtgggccac ccctactaca gcatccccaa gagcgacaac 180
cccaagaaga tcgtggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg 240
ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgagacccag 300
aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag gtgggcaggg gccagcccct gggcgtgggc 360
atcagcggcc accccctgct gaacaagttc gacgacaccg agaacagcaa caggtacgcc 420
ggcggccccg gcaccgacaa cagggagtgc atcagcatgg actacaagca gacccagctg 480
tgcctgctgg gctgcaagcc ccccatcggc gagcactggg gcaagggcag cccctgcagc 540
aacaacgcca tcacccccgg cgactgcccc cccctggagc tgaagaacag cgtgatccag 600
gacggcgaca tggtggacac cggcttcggc gccatggact tcaccgccct gcaggacacc 660
aagagcaacg tgcccctgga catctgcaac agcatctgca agtaccccga ctacctgaag 720
atggtggccg agccctacgg cgacaccctg ttcttctacc tgaggaggga gcagatgttc 780
gtgaggcact tcttcaacag gagcggcacc gtgggcgaga gcgtgcccac cgacctgtac 840
atcaagggca gcggcagcac cgccaccctg gccaacagca cctacttccc cacccccagc 900
ggcagcatgg tgaccagcga cgcccagatc ttcaacaagc cctactggat gcagagggcc 960
cagggccaca acaacggcat ctgctggggc aaccagctgt tcgtgaccgt ggtggacacc 1020
accaggagca ccaacatgag cgtgtgcgcc gccatcgcca acagcgacac caccttcaag 1080
agcagcaact tcaaggagta cctgaggcac ggcgaggagt tcgacctgca gttcatcttc 1140
cagctgtgca agatcaccct gagcgccgac atcatgacct acatccacag catgaacccc 1200
gccatcctgg aggactggaa cttcggcctg accacccccc ccagcggcag cctggaggac 1260
acctacaggt tcgtgaccag ccaggccatc acctgccaga agtccgcccc ccagaagccc 1320
aaggaggacc ccttcaagga ctacgtgttc tgggaggtga acctgaagga gaagttcagc 1380
gccgacctgg accagttccc cctgggcagg aagttcctgc tgcaggccgg ctacagggcc 1440
aggcccaagt tcaaggccgg caagaggagc gcccccagcg ccagcaccac cacccccgcc 1500
aagaggaaga agaccaagaa gtaaactcga gctc 1534
<210> 58
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3106 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 58
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 59
<211> 33
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3107 Праймер F1 ПВЧ31L1
<400> 59
cttggtacca tgagcctgtg gaggcccagc gag 33
<210> 60
<211> 38
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3108 Праймер R1 ПВЧ31L1
<400> 60
gcttggcttt gtagccggcc tgcagcagga acttcctg 38
<210> 61
<211> 1444
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3109 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ31L1
<400> 61
cttggtacca tgagcctgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc 60
gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgaccagga ccaacatcta ctaccacgcc 120
ggcagcgcca ggctgctgac cgtgggccac ccctactaca gcatccccaa gagcgacaac 180
cccaagaaga tcgtggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg 240
ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgagacccag 300
aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag gtgggcaggg gccagcccct gggcgtgggc 360
atcagcggcc accccctgct gaacaagttc gacgacaccg agaacagcaa caggtacgcc 420
ggcggccccg gcaccgacaa cagggagtgc atcagcatgg actacaagca gacccagctg 480
tgcctgctgg gctgcaagcc ccccatcggc gagcactggg gcaagggcag cccctgcagc 540
aacaacgcca tcacccccgg cgactgcccc cccctggagc tgaagaacag cgtgatccag 600
gacggcgaca tggtggacac cggcttcggc gccatggact tcaccgccct gcaggacacc 660
aagagcaacg tgcccctgga catctgcaac agcatctgca agtaccccga ctacctgaag 720
atggtggccg agccctacgg cgacaccctg ttcttctacc tgaggaggga gcagatgttc 780
gtgaggcact tcttcaacag gagcggcacc gtgggcgaga gcgtgcccac cgacctgtac 840
atcaagggca gcggcagcac cgccaccctg gccaacagca cctacttccc cacccccagc 900
ggcagcatgg tgaccagcga cgcccagatc ttcaacaagc cctactggat gcagagggcc 960
cagggccaca acaacggcat ctgctggggc aaccagctgt tcgtgaccgt ggtggacacc 1020
accaggagca ccaacatgag cgtgtgcgcc gccatcgcca acagcgacac caccttcaag 1080
agcagcaact tcaaggagta cctgaggcac ggcgaggagt tcgacctgca gttcatcttc 1140
cagctgtgca agatcaccct gagcgccgac atcatgacct acatccacag catgaacccc 1200
gccatcctgg aggactggaa cttcggcctg accacccccc ccagcggcag cctggaggac 1260
acctacaggt tcgtgaccag ccaggccatc acctgccaga agtccgcccc ccagaagccc 1320
aaggaggacc ccttcaagga ctacgtgttc tgggaggtga acctgaagga gaagttcagc 1380
gccgacctgg accagttccc cctgggcagg aagttcctgc tgcaggccgg ctacaaagcc 1440
aagc 1444
<210> 62
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3110 Праймер F2 ПВЧ31L1
<400> 62
ggccggctac aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 63
<211> 41
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3111 Праймер R2 ПВЧ31L1
<400> 63
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggcaga g 41
<210> 64
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3112 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ31L1
<400> 64
ggccggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 65
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3113 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 65
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 66
<211> 499
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3301 Последовательность аминокислот белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 66
Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Ser Ile Lys Asn Pro Thr Asn Ala Lys Lys Leu Leu Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Ile Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Phe Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Thr Gly Asn Lys Tyr Pro Gly Gln Pro Gly Ala Asp Asn
130 135 140
Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Leu
145 150 155 160
Gly Cys Lys Pro Pro Thr Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Val Ala Cys
165 170 175
Thr Asn Ala Ala Pro Ala Asn Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Asn
180 185 190
Thr Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Cys Met
195 200 205
Asp Phe Lys Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile
210 215 220
Cys Gly Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Thr Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Leu Gly Glu Ala Val Pro
260 265 270
Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Thr Thr Ala Ser Ile Gln Ser
275 280 285
Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Glu Ser
290 295 300
Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Val Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Thr Gln Val Thr Ser Asp Ser
340 345 350
Thr Tyr Lys Asn Glu Asn Phe Lys Glu Tyr Ile Arg His Val Glu Glu
355 360 365
Tyr Asp Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Val Thr Leu Thr Ala
370 375 380
Glu Val Met Thr Tyr Ile His Ala Met Asn Pro Asp Ile Leu Glu Asp
385 390 395 400
Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Gln Asp Thr
405 410 415
Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Thr Val Pro
420 425 430
Pro Lys Glu Lys Glu Asp Pro Leu Gly Lys Tyr Thr Phe Trp Glu Val
435 440 445
Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly
450 455 460
Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys
465 470 475 480
Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys
485 490 495
Val Lys Lys
<210> 67
<211> 1501
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3302 Последовательность нуклеотидов гена белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 67
atgagtgtgt ggagaccatc tgaggctaca gtctacctgc ctcctgtgcc tgtgagcaag 60
gtggtgagca cagatgaata tgtgagcagg accagcatct actactatgc tggctccagc 120
agactgctgg ctgtgggaca cccatacttc agcatcaaga acccaaccaa tgccaagaaa 180
ctgctggtgc caaaggtgtc tggactccaa tacagggtgt tcagggtgag actgcctgac 240
ccaaacaagt ttggctttcc tgacacctcc ttctacaacc ctgacaccca gagactggtg 300
tgggcttgtg tgggattgga gattggcagg ggacaaccac tgggagtggg catctctgga 360
cacccactgc tgaacaagtt tgatgacaca gagacaggca acaaataccc tggacaacct 420
ggagcagaca acagggagtg tctgagtatg gactacaagc agacccaact ttgtctgctg 480
ggctgtaagc ctccaacagg agaacactgg ggcaagggag tggcttgtac caatgctgcc 540
cctgccaatg actgtcctcc attggaactg ataaacacca tcattgagga tggagatatg 600
gtggacacag gctttggctg tatggacttc aagaccctcc aagccaacaa gtctgatgtg 660
ccaattgaca tctgtggcag cacttgtaaa taccctgact acctgaaaat gacctctgaa 720
ccatatggag actccctgtt cttcttcctg aggagggaac agatgtttgt gagacacttc 780
ttcaacaggg ctggcaccct gggagaggct gtgcctgatg acctctacat caagggctct 840
ggcaccacag ccagcatcca gtcctctgcc ttctttccaa caccatctgg cagtatggtg 900
acctctgaga gccaactttt caacaagcca tactggctcc aaagggctca aggacacaac 960
aatggcatct gttggggcaa ccaggtgttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc 1020
aatatgaccc tgtgtaccca ggtgacctct gacagcacct acaagaatga gaacttcaag 1080
gaatacatca ggcatgtgga ggaatatgac ctccaatttg tgttccaact ttgtaaggtg 1140
accctgacag cagaggtgat gacctacatc catgctatga accctgacat cttggaggac 1200
tggcagtttg gactgacacc tcctccatct gcctccctcc aagacaccta caggtttgtg 1260
accagccagg ctatcacttg tcagaagaca gtgcctccaa aggagaagga ggacccactg 1320
ggcaaataca ccttctggga ggtggacctg aaagagaagt tctctgctga cctggaccag 1380
tttccactgg gcaggaagtt cctgctccaa gcaggactga aagccaagcc aaaactgaaa 1440
agggctgccc caaccagcac caggacctcc tctgccaaga ggaagaaggt gaagaagtaa 1500
a 1501
<210> 68
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3303 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 68
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 69
<211> 472
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3501 Последовательность аминокислот aa 1-472 белка L1 ПВЧ типа 35
<400> 69
Met Ser Leu Trp Arg Ser Asn Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Ser Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn
20 25 30
Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Tyr Ala Ile Lys Lys Gln Asp Ser Asn Lys Ile Ala Val Pro Lys
50 55 60
Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Lys Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asp Pro Ala Ser Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ser Asn Lys Tyr Val Gly Asn Ser Gly Thr Asp Asn Arg
130 135 140
Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly
145 150 155 160
Cys Arg Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Pro Cys Asn
165 170 175
Ala Asn Gln Val Lys Ala Gly Glu Cys Pro Pro Leu Glu Leu Leu Asn
180 185 190
Thr Val Leu Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Ser Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Met Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Thr Val Pro
260 265 270
Ala Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Thr Gly Thr Leu Pro Ser Thr Ser
275 280 285
Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala Gln Ile
290 295 300
Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn Gly
305 310 315 320
Ile Cys Trp Ser Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg
325 330 335
Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ser Ala Val Ser Ser Ser Asp Ser Thr
340 345 350
Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu Glu Tyr
355 360 365
Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala Asp
370 375 380
Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ser Ile Leu Glu Asp Trp
385 390 395 400
Asn Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr
405 410 415
Arg Tyr Val Thr Ser Gln Ala Val Thr Cys Gln Lys Pro Ser Ala Pro
420 425 430
Lys Pro Lys Asp Asp Pro Leu Lys Asn Tyr Thr Phe Trp Glu Val Asp
435 440 445
Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg
450 455 460
Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu
465 470
<210> 70
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3502 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 70
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 71
<211> 498
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3503 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 35
<400> 71
Met Ser Leu Trp Arg Ser Asn Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Ser Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn
20 25 30
Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Tyr Ala Ile Lys Lys Gln Asp Ser Asn Lys Ile Ala Val Pro Lys
50 55 60
Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Lys Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asp Pro Ala Ser Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ser Asn Lys Tyr Val Gly Asn Ser Gly Thr Asp Asn Arg
130 135 140
Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly
145 150 155 160
Cys Arg Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Pro Cys Asn
165 170 175
Ala Asn Gln Val Lys Ala Gly Glu Cys Pro Pro Leu Glu Leu Leu Asn
180 185 190
Thr Val Leu Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Ser Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Met Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Thr Val Pro
260 265 270
Ala Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Thr Gly Thr Leu Pro Ser Thr Ser
275 280 285
Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala Gln Ile
290 295 300
Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn Gly
305 310 315 320
Ile Cys Trp Ser Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg
325 330 335
Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ser Ala Val Ser Ser Ser Asp Ser Thr
340 345 350
Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu Glu Tyr
355 360 365
Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala Asp
370 375 380
Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ser Ile Leu Glu Asp Trp
385 390 395 400
Asn Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr
405 410 415
Arg Tyr Val Thr Ser Gln Ala Val Thr Cys Gln Lys Pro Ser Ala Pro
420 425 430
Lys Pro Lys Asp Asp Pro Leu Lys Asn Tyr Thr Phe Trp Glu Val Asp
435 440 445
Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg
450 455 460
Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg
465 470 475 480
Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val
485 490 495
Lys Lys
<210> 72
<211> 1498
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3504 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 35
<400> 72
atgagtctgt ggaggagcaa tgaggctaca gtctacctgc ctcctgtgtc tgtgagcaag 60
gtggtgagca cagatgaata tgtgaccagg accaacatct actaccatgc tggctccagc 120
agactgctgg ctgtgggaca cccatactat gccatcaaga agcaggacag caacaagatt 180
gctgtgccaa aggtgtctgg actccaatac agggtgttca gggtgaaact gcctgaccca 240
aacaagtttg gctttcctga cacctccttc tatgaccctg ccagccagag actggtgtgg 300
gcttgtactg gagtggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggcat ctctggacac 360
ccactgctga acaaactgga tgacacagag aacagcaaca aatatgtggg caactctggc 420
acagacaaca gggagtgtat cagtatggac tacaagcaga cccaactttg tctgattggc 480
tgtagacctc caattggaga acactggggc aagggcacac catgtaatgc caaccaggtg 540
aaggctggag agtgtcctcc attggaactg ctgaacacag tgctccaaga tggagatatg 600
gtggacacag gctttggagc tatggacttc accaccctcc aagccaacaa gtctgatgtg 660
ccactggaca tctgttccag catctgtaaa taccctgact acctgaaaat ggtgtctgaa 720
ccatatggag atatgctgtt cttctacctg aggagggaac agatgtttgt gagacacctg 780
ttcaacaggg ctggcacagt gggagagaca gtgcctgctg acctctacat caagggcacc 840
acaggcaccc tgccaagcac ctcctacttt ccaacaccat ctggcagtat ggtgacctct 900
gatgcccaga ttttcaacaa gccatactgg ctccaaaggg ctcaaggaca caacaatggc 960
atctgttgga gcaaccaact ttttgtgaca gtggtggaca ccaccaggag caccaatatg 1020
agtgtgtgtt ctgctgtgtc ctcctctgac agcacctaca agaatgacaa cttcaaggaa 1080
tacctgagac atggagagga atatgacctc caattcatct tccaactttg taagattacc 1140
ctgacagcag atgtgatgac ctacatccac agtatgaacc caagcatctt ggaggactgg 1200
aactttggac tgacacctcc tccatctggc accttggagg acacctacag atatgtgacc 1260
agccaggctg tgacttgtca gaagccatct gccccaaagc caaaggatga cccactgaaa 1320
aactacacct tctgggaggt ggacctgaaa gagaagttct ctgctgacct ggaccagttt 1380
ccactgggca ggaagttcct gctccaagca ggactgaaag ccaagccaaa actgaaaagg 1440
gctgccccaa ccagcaccag gacctcctct gccaagagga agaaggtgaa gaagtaaa 1498
<210> 73
<211> 1528
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3505 Синтетический ген L1 ПВЧ35
<400> 73
ctgggtacca tgagtctgtg gaggagcaat gaggctacag tctacctgcc tcctgtgtct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccaacatcta ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactatg ccatcaagaa gcaggacagc 180
aacaagattg ctgtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag ggtgaaactg 240
cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct atgaccctgc cagccagaga 300
ctggtgtggg cttgtactgg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc 360
tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga acagcaacaa atatgtgggc 420
aactctggca cagacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt 480
ctgattggct gtagacctcc aattggagaa cactggggca agggcacacc atgtaatgcc 540
aaccaggtga aggctggaga gtgtcctcca ttggaactgc tgaacacagt gctccaagat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc cactggacat ctgttccagc atctgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
gtgtctgaac catatggaga tatgctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacctgt tcaacagggc tggcacagtg ggagagacag tgcctgctga cctctacatc 840
aagggcacca caggcaccct gccaagcacc tcctactttc caacaccatc tggcagtatg 900
gtgacctctg atgcccagat tttcaacaag ccatactggc tccaaagggc tcaaggacac 960
aacaatggca tctgttggag caaccaactt tttgtgacag tggtggacac caccaggagc 1020
accaatatga gtgtgtgttc tgctgtgtcc tcctctgaca gcacctacaa gaatgacaac 1080
ttcaaggaat acctgagaca tggagaggaa tatgacctcc aattcatctt ccaactttgt 1140
aagattaccc tgacagcaga tgtgatgacc tacatccaca gtatgaaccc aagcatcttg 1200
gaggactgga actttggact gacacctcct ccatctggca ccttggagga cacctacaga 1260
tatgtgacca gccaggctgt gacttgtcag aagccatctg ccccaaagcc aaaggatgac 1320
ccactgaaaa actacacctt ctgggaggtg gacctgaaag agaagttctc tgctgacctg 1380
gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc cagaccaaac 1440
ttcagactgg gcaagagggc tgcccctgcc agcaccagca agaagtccag caccaagagg 1500
aggaaggtga agagctaaac tcgagctc 1528
<210> 74
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3506 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 74
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 75
<211> 34
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3507 Праймер F1 ПВЧ35L1
<400> 75
cttggtacca tgagtctgtg gaggagcaat gagg 34
<210> 76
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3508 Праймер R1 ПВЧ35L1
<400> 76
gcttggcttt cagtcctgct tggagcagga acttcc 36
<210> 77
<211> 1435
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3509 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ35L1
<400> 77
cttggtacca tgagtctgtg gaggagcaat gaggctacag tctacctgcc tcctgtgtct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccaacatcta ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactatg ccatcaagaa gcaggacagc 180
aacaagattg ctgtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag ggtgaaactg 240
cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct atgaccctgc cagccagaga 300
ctggtgtggg cttgtactgg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc 360
tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga acagcaacaa atatgtgggc 420
aactctggca cagacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt 480
ctgattggct gtagacctcc aattggagaa cactggggca agggcacacc atgtaatgcc 540
aaccaggtga aggctggaga gtgtcctcca ttggaactgc tgaacacagt gctccaagat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc cactggacat ctgttccagc atctgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
gtgtctgaac catatggaga tatgctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacctgt tcaacagggc tggcacagtg ggagagacag tgcctgctga cctctacatc 840
aagggcacca caggcaccct gccaagcacc tcctactttc caacaccatc tggcagtatg 900
gtgacctctg atgcccagat tttcaacaag ccatactggc tccaaagggc tcaaggacac 960
aacaatggca tctgttggag caaccaactt tttgtgacag tggtggacac caccaggagc 1020
accaatatga gtgtgtgttc tgctgtgtcc tcctctgaca gcacctacaa gaatgacaac 1080
ttcaaggaat acctgagaca tggagaggaa tatgacctcc aattcatctt ccaactttgt 1140
aagattaccc tgacagcaga tgtgatgacc tacatccaca gtatgaaccc aagcatcttg 1200
gaggactgga actttggact gacacctcct ccatctggca ccttggagga cacctacaga 1260
tatgtgacca gccaggctgt gacttgtcag aagccatctg ccccaaagcc aaaggatgac 1320
ccactgaaaa actacacctt ctgggaggtg gacctgaaag agaagttctc tgctgacctg 1380
gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc caagc 1435
<210> 78
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3510 Праймер F2 ПВЧ35L1
<400> 78
agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 79
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3511 Праймер R2 ПВЧ35L1
<400> 79
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 80
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3512 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ35L1
<400> 80
agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 81
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3513 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 81
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 82
<211> 469
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3901 Последовательность аминокислот aa 1-469 белка L1 ПВЧ типа 39
<400> 82
Met Ala Met Trp Arg Ser Ser Asp Ser Met Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Lys Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Gly
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Lys Val Gly Met Asn Gly Gly Arg Lys Gln Asp Ile Pro Lys
50 55 60
Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Thr Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Ser Ile Pro Asp Ala Ser Leu Tyr Asn Pro Glu Thr Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Tyr Asn Arg Gln Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ser Pro Phe Ser Ser Thr Thr Asn Lys Asp Ser Arg Asp
130 135 140
Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys
145 150 155 160
Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Ala Cys Lys Pro
165 170 175
Asn Asn Val Ser Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Asn Thr
180 185 190
Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met Asp
195 200 205
Phe Gly Ala Leu Gln Glu Thr Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile Cys
210 215 220
Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp Val
225 230 235 240
Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala
245 250 255
Arg His Phe Trp Asn Arg Gly Gly Met Val Gly Asp Ala Ile Pro Ala
260 265 270
Gln Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Asp Ile Arg Ala Asn Pro Gly Ser Ser
275 280 285
Val Tyr Cys Pro Ser Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ser Gln
290 295 300
Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn Asn
305 310 315 320
Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Leu Thr Val Val Asp Thr Thr
325 330 335
Arg Ser Thr Asn Phe Thr Leu Ser Thr Ser Ile Glu Ser Ser Ile Pro
340 345 350
Ser Thr Tyr Asp Pro Ser Lys Phe Lys Glu Tyr Thr Arg His Val Glu
355 360 365
Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Val Thr Leu Thr
370 375 380
Thr Asp Val Met Ser Tyr Ile His Thr Met Asn Ser Ser Ile Leu Asp
385 390 395 400
Asn Trp Asn Phe Ala Val Ala Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Val Asp
405 410 415
Thr Tyr Arg Tyr Leu Gln Ser Ala Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp Ala
420 425 430
Pro Ala Pro Glu Lys Lys Asp Pro Tyr Asp Gly Leu Lys Phe Trp Asn
435 440 445
Val Asp Leu Arg Glu Lys Phe Ser Leu Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu
450 455 460
Gly Arg Lys Phe Leu
465
<210> 83
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3902 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 83
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 84
<211> 507
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3903 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 39
<400> 84
Met Ala Met Trp Arg Ser Ser Asp Ser Met Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Lys Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Gly
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Lys Val Gly Met Asn Gly Gly Arg Lys Gln Asp Ile Pro Lys
50 55 60
Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Thr Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Ser Ile Pro Asp Ala Ser Leu Tyr Asn Pro Glu Thr Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Tyr Asn Arg Gln Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ser Pro Phe Ser Ser Thr Thr Asn Lys Asp Ser Arg Asp
130 135 140
Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys
145 150 155 160
Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Ala Cys Lys Pro
165 170 175
Asn Asn Val Ser Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Asn Thr
180 185 190
Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met Asp
195 200 205
Phe Gly Ala Leu Gln Glu Thr Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile Cys
210 215 220
Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp Val
225 230 235 240
Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala
245 250 255
Arg His Phe Trp Asn Arg Gly Gly Met Val Gly Asp Ala Ile Pro Ala
260 265 270
Gln Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Asp Ile Arg Ala Asn Pro Gly Ser Ser
275 280 285
Val Tyr Cys Pro Ser Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ser Gln
290 295 300
Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn Asn
305 310 315 320
Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Leu Thr Val Val Asp Thr Thr
325 330 335
Arg Ser Thr Asn Phe Thr Leu Ser Thr Ser Ile Glu Ser Ser Ile Pro
340 345 350
Ser Thr Tyr Asp Pro Ser Lys Phe Lys Glu Tyr Thr Arg His Val Glu
355 360 365
Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Val Thr Leu Thr
370 375 380
Thr Asp Val Met Ser Tyr Ile His Thr Met Asn Ser Ser Ile Leu Asp
385 390 395 400
Asn Trp Asn Phe Ala Val Ala Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Val Asp
405 410 415
Thr Tyr Arg Tyr Leu Gln Ser Ala Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp Ala
420 425 430
Pro Ala Pro Glu Lys Lys Asp Pro Tyr Asp Gly Leu Lys Phe Trp Asn
435 440 445
Val Asp Leu Arg Glu Lys Phe Ser Leu Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu
450 455 460
Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile
465 470 475 480
Gly Pro Arg Lys Arg Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro
485 490 495
Lys Arg Val Lys Arg Arg Lys Ser Ser Arg Lys
500 505
<210> 85
<211> 1525
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3904 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 39
<400> 85
atggctatgt ggaggtcctc tgacagtatg gtctacctgc ctcctccatc tgtggctaag 60
gtggtgaaca cagatgacta tgtgaccagg acaggcatct actactatgc tggctccagc 120
agactgctga cagtgggaca cccatacttc aaggtgggga tgaatggagg caggaagcag 180
gacatcccaa aggtgtctgc ctaccaatac agggtgttca gggtgaccct gcctgaccca 240
aacaagttca gcatccctga tgcctccctc tacaaccctg agacccagag actggtgtgg 300
gcttgtgtgg gagtggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggcat ctctggacac 360
ccactctaca acagacagga tgacacagag aacagcccat tctccagcac caccaacaag 420
gacagcaggg acaatgtgtc tgtggactac aagcagaccc aactttgtat cattggctgt 480
gtgcctgcca ttggagaaca ctggggcaag ggcaaggctt gtaagccaaa caatgtgagc 540
acaggagact gtcctccatt ggaactggtg aacacaccaa ttgaggatgg agatatgatt 600
gacacaggct atggagctat ggactttgga gccctccaag agaccaagtc tgaggtgcca 660
ctggacatct gtcagagcat ctgtaaatac cctgactacc tccaaatgag tgctgatgtc 720
tatggagaca gtatgttctt ctgtctgagg agggaacaac tttttgccag acacttctgg 780
aacaggggag ggatggtggg agatgccatc cctgcccaac tctacatcaa gggcacagac 840
atcagggcta accctggctc ctctgtctac tgtccaagcc catctggcag tatggtgacc 900
tctgacagcc aacttttcaa caagccatac tggctgcaca aggctcaagg acacaacaat 960
ggcatctgtt ggcacaacca acttttcctg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaac 1020
ttcaccctga gcaccagcat tgagtccagc atcccaagca cctatgaccc aagcaagttc 1080
aaggaataca ccaggcatgt ggaggaatat gacctccaat tcatcttcca actttgtact 1140
gtgaccctga ccacagatgt gatgagttac atccacacaa tgaactccag catcctggac 1200
aactggaact ttgctgtggc tcctcctcca tctgcctccc tggtggacac ctacagatac 1260
ctccaatctg ctgccatcac ttgtcagaag gatgcccctg cccctgagaa gaaggaccca 1320
tatgatggac tgaagttctg gaatgtggac ctgagggaga agttctcctt ggaactggac 1380
cagtttccac tgggcaggaa gttcctgctc caacttggag ccagaccaaa gccaaccatt 1440
ggaccaagga agagggctgc ccctgcccca accagcacac caagcccaaa gagggtgaag 1500
aggaggaagt ccagcaggaa gtaaa 1525
<210> 86
<211> 1537
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3905 Синтетический ген L1 ПВЧ39
<400> 86
ctgggtacca tggctatgtg gaggtcctct gacagtatgg tctacctgcc tcctccatct 60
gtggctaagg tggtgaacac agatgactat gtgaccagga caggcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtggggat gaatggaggc 180
aggaagcagg acatcccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaccctg 240
cctgacccaa acaagttcag catccctgat gcctccctct acaaccctga gacccagaga 300
ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc 360
tctggacacc cactctacaa cagacaggat gacacagaga acagcccatt ctccagcacc 420
accaacaagg acagcaggga caatgtgtct gtggactaca agcagaccca actttgtatc 480
attggctgtg tgcctgccat tggagaacac tggggcaagg gcaaggcttg taagccaaac 540
aatgtgagca caggagactg tcctccattg gaactggtga acacaccaat tgaggatgga 600
gatatgattg acacaggcta tggagctatg gactttggag ccctccaaga gaccaagtct 660
gaggtgccac tggacatctg tcagagcatc tgtaaatacc ctgactacct ccaaatgagt 720
gctgatgtct atggagacag tatgttcttc tgtctgagga gggaacaact ttttgccaga 780
cacttctgga acaggggagg gatggtggga gatgccatcc ctgcccaact ctacatcaag 840
ggcacagaca tcagggctaa ccctggctcc tctgtctact gtccaagccc atctggcagt 900
atggtgacct ctgacagcca acttttcaac aagccatact ggctgcacaa ggctcaagga 960
cacaacaatg gcatctgttg gcacaaccaa cttttcctga cagtggtgga caccaccagg 1020
agcaccaact tcaccctgag caccagcatt gagtccagca tcccaagcac ctatgaccca 1080
agcaagttca aggaatacac caggcatgtg gaggaatatg acctccaatt catcttccaa 1140
ctttgtactg tgaccctgac cacagatgtg atgagttaca tccacacaat gaactccagc 1200
atcctggaca actggaactt tgctgtggct cctcctccat ctgcctccct ggtggacacc 1260
tacagatacc tccaatctgc tgccatcact tgtcagaagg atgcccctgc ccctgagaag 1320
aaggacccat atgatggact gaagttctgg aatgtggacc tgagggagaa gttctccttg 1380
gaactggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aagccagggt gaggaggaga 1440
ccaaccattg gaccaaggaa gagacctgct gccagcacct cctcctcctc tgccaccaaa 1500
cacaagagga agagggtgag caagtaaact cgagctc 1537
<210> 87
<211> 1546
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3906 Синтетический ген L1 ПВЧ59
<400> 87
ctgggtacca tggctctgtg gaggtcctct gacaacaagg tctacctgcc tcctccatct 60
gtggctaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccagcatctt ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtgccaaa gggaggcaat 180
ggcagacagg atgtgccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaaactg 240
cctgacccaa acaagtttgg actgcctgac aacacagtct atgacccaaa cagccagaga 300
ctggtgtggg cttgtgtggg agtggagatt ggcaggggac aaccactggg agtgggactg 360
tctggacacc cactctacaa caaactggat gacacagaga actctcatgt ggcatctgct 420
gtggacacca aggacaccag ggacaatgtg tctgtggact acaagcagac ccaactttgt 480
atcattggct gtgtgcctgc cattggagaa cactggacca agggcacagc ctgtaagcca 540
accacagtgg tccagggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacacc aattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctatggagct atggacttca aactgctcca agacaacaag 660
tctgaggtgc cactggacat ctgtcagagc atctgtaaat accctgacta cctccaaatg 720
agtgctgatg cctatggaga cagtatgttc ttctgtctga ggagggaaca ggtgtttgcc 780
agacacttct ggaacaggtc tggcacaatg ggagaccaac ttcctgagtc cctctacatc 840
aagggcacag acatcagggc taaccctggc tcctacctct acagcccaag cccatctggc 900
tctgtggtga cctctgacag ccaacttttc aacaagccat actggctgca caaggctcaa 960
ggactgaaca atggcatctg ttggcacaac caacttttcc tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca acctgtctgt gtgtgccagc accacctcca gcatcccaaa tgtctacaca 1080
ccaacctcct tcaaggaata tgccaggcat gtggaggagt ttgacctcca attcatcttc 1140
caactttgta agattaccct gaccacagag gtgatgagtt acatccacaa tatgaacacc 1200
accatcttgg aggactggaa ctttggagtg acacctcctc caacagcctc cctggtggac 1260
acctacaggt ttgtccagtc tgctgctgtg acttgtcaga aggacacagc ccctcctgtg 1320
aagcaggacc catatgacaa actgaagttc tggcctgtgg acctgaaaga gaggttctct 1380
gctgacctgg accagtttcc actgggcagg aagttcctgc tccaacttgg agccagacca 1440
aagccaacca ttggaccaag gaagagggct gcccctgccc caaccagcac accaagccca 1500
aagagggtga agaggaggaa gtccagcagg aagtaaactc gagctc 1546
<210> 88
<211> 38
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3907 Праймер F1 ПВЧ39L1
<400> 88
cttggtacca tggctatgtg gaggtcctct gacagtat 38
<210> 89
<211> 38
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3908 Праймер R1 ПВЧ39L1
<400> 89
tccaagttgg agcaggaact tcctgcccag tggaaact 38
<210> 90
<211> 1428
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3909 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ39L1
<400> 90
cttggtacca tggctatgtg gaggtcctct gacagtatgg tctacctgcc tcctccatct 60
gtggctaagg tggtgaacac agatgactat gtgaccagga caggcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtggggat gaatggaggc 180
aggaagcagg acatcccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaccctg 240
cctgacccaa acaagttcag catccctgat gcctccctct acaaccctga gacccagaga 300
ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc 360
tctggacacc cactctacaa cagacaggat gacacagaga acagcccatt ctccagcacc 420
accaacaagg acagcaggga caatgtgtct gtggactaca agcagaccca actttgtatc 480
attggctgtg tgcctgccat tggagaacac tggggcaagg gcaaggcttg taagccaaac 540
aatgtgagca caggagactg tcctccattg gaactggtga acacaccaat tgaggatgga 600
gatatgattg acacaggcta tggagctatg gactttggag ccctccaaga gaccaagtct 660
gaggtgccac tggacatctg tcagagcatc tgtaaatacc ctgactacct ccaaatgagt 720
gctgatgtct atggagacag tatgttcttc tgtctgagga gggaacaact ttttgccaga 780
cacttctgga acaggggagg gatggtggga gatgccatcc ctgcccaact ctacatcaag 840
ggcacagaca tcagggctaa ccctggctcc tctgtctact gtccaagccc atctggcagt 900
atggtgacct ctgacagcca acttttcaac aagccatact ggctgcacaa ggctcaagga 960
cacaacaatg gcatctgttg gcacaaccaa cttttcctga cagtggtgga caccaccagg 1020
agcaccaact tcaccctgag caccagcatt gagtccagca tcccaagcac ctatgaccca 1080
agcaagttca aggaatacac caggcatgtg gaggaatatg acctccaatt catcttccaa 1140
ctttgtactg tgaccctgac cacagatgtg atgagttaca tccacacaat gaactccagc 1200
atcctggaca actggaactt tgctgtggct cctcctccat ctgcctccct ggtggacacc 1260
tacagatacc tccaatctgc tgccatcact tgtcagaagg atgcccctgc ccctgagaag 1320
aaggacccat atgatggact gaagttctgg aatgtggacc tgagggagaa gttctccttg 1380
gaactggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aacttgga 1428
<210> 91
<211> 37
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3910 Праймер F2 ПВЧ39L1
<400> 91
aggaagttcc tgctccaact tggagccaga ccaaagc 37
<210> 92
<211> 40
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3911 Праймер R2 ПВЧ39L1
<400> 92
ctgtctagat ttacttcctg ctggacttcc tcctcttcac 40
<210> 93
<211> 139
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 3912 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ39L1
<400> 93
aggaagttcc tgctccaact tggagccaga ccaaagccaa ccattggacc aaggaagagg 60
gctgcccctg ccccaaccag cacaccaagc ccaaagaggg tgaagaggag gaagtccagc 120
aggaagtaaa tctagacag 139
<210> 94
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 3913 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 94
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 95
<211> 478
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 4501 Последовательность аминокислот aa 1-478 белка L1 ПВЧ типа 45
<400> 95
Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro
35 40 45
Tyr Phe Arg Val Val Pro Ser Gly Ala Gly Asn Lys Gln Ala Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Ala Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Ser Thr Ile Tyr Asn Pro Glu Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Met Glu Ile Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Ile Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Ser Ala His Ala Ala Thr Ala Val Ile Thr Gln Asp Val
130 135 140
Arg Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu
145 150 155 160
Gly Cys Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Leu Cys
165 170 175
Lys Pro Ala Gln Leu Gln Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys
180 185 190
Asn Thr Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala
195 200 205
Met Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp
210 215 220
Ile Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala
225 230 235 240
Asp Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu
245 250 255
Phe Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Val Met Gly Asp Thr Val
260 265 270
Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Ser Ala Asn Met Arg Glu Thr
275 280 285
Pro Gly Ser Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Thr Thr
290 295 300
Ser Asp Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln
305 310 315 320
Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val
325 330 335
Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Leu Cys Ala Ser Thr Gln
340 345 350
Asn Pro Val Pro Asn Thr Tyr Asp Pro Thr Lys Phe Lys His Tyr Ser
355 360 365
Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr
370 375 380
Ile Thr Leu Thr Ala Glu Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser
385 390 395 400
Ser Ile Leu Glu Asn Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr
405 410 415
Ser Leu Val Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Val Thr Cys
420 425 430
Gln Lys Asp Thr Thr Pro Pro Glu Lys Gln Asp Pro Tyr Asp Lys Leu
435 440 445
Lys Phe Trp Thr Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ser Asp Leu Asp
450 455 460
Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Val Gln Ala Gly Leu
465 470 475
<210> 96
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 4502 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 96
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 97
<211> 504
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4503 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 45
<400> 97
Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro
35 40 45
Tyr Phe Arg Val Val Pro Ser Gly Ala Gly Asn Lys Gln Ala Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Ala Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Ser Thr Ile Tyr Asn Pro Glu Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Met Glu Ile Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Ile Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Ser Ala His Ala Ala Thr Ala Val Ile Thr Gln Asp Val
130 135 140
Arg Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu
145 150 155 160
Gly Cys Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Leu Cys
165 170 175
Lys Pro Ala Gln Leu Gln Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys
180 185 190
Asn Thr Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala
195 200 205
Met Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp
210 215 220
Ile Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala
225 230 235 240
Asp Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu
245 250 255
Phe Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Val Met Gly Asp Thr Val
260 265 270
Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Ser Ala Asn Met Arg Glu Thr
275 280 285
Pro Gly Ser Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Thr Thr
290 295 300
Ser Asp Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln
305 310 315 320
Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val
325 330 335
Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Leu Cys Ala Ser Thr Gln
340 345 350
Asn Pro Val Pro Asn Thr Tyr Asp Pro Thr Lys Phe Lys His Tyr Ser
355 360 365
Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr
370 375 380
Ile Thr Leu Thr Ala Glu Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser
385 390 395 400
Ser Ile Leu Glu Asn Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr
405 410 415
Ser Leu Val Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Val Thr Cys
420 425 430
Gln Lys Asp Thr Thr Pro Pro Glu Lys Gln Asp Pro Tyr Asp Lys Leu
435 440 445
Lys Phe Trp Thr Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ser Asp Leu Asp
450 455 460
Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Val Gln Ala Gly Leu Lys Ala
465 470 475 480
Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser
485 490 495
Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
500
<210> 98
<211> 1516
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4504 Последовательность нуклеотидов химерного белка L1 ПВЧ типа 45
<400> 98
atggctctgt ggagaccatc tgacagcaca gtctacctgc ctcctccatc tgtggcaagg 60
gtggtgaaca cagatgacta tgtgagcagg accagcatct tctaccatgc tggctccagc 120
agactgctga cagtgggcaa cccatacttc agggtggtgc caagtggagc aggcaacaag 180
caggctgtgc caaaggtgtc tgcctaccaa tacagggtgt tcagggtggc tctgcctgac 240
ccaaacaagt ttggactgcc tgacagcacc atctacaacc ctgagaccca gagactggtg 300
tgggcttgtg tggggatgga gattggcagg ggacaaccac tgggcattgg actgtctgga 360
cacccattct acaacaaact ggatgacaca gagtctgccc atgctgccac agcagtgatt 420
acccaggatg tgagggacaa tgtgtctgtg gactacaagc agacccaact ttgtatcctg 480
ggctgtgtgc ctgccattgg agaacactgg gctaagggca ccctgtgtaa gcctgcccaa 540
ctccaacctg gagactgtcc tccattggaa ctgaaaaaca ccatcattga ggatggagat 600
atggtggaca caggctatgg agctatggac ttcagcaccc tccaagacac caagtgtgag 660
gtgccactgg acatctgtca gagcatctgt aaataccctg actacctcca aatgagtgct 720
gacccatatg gagacagtat gttcttctgt ctgaggaggg aacaactttt tgccagacac 780
ttctggaaca gggctggagt gatgggagac acagtgccaa cagacctcta catcaagggc 840
acctctgcca atatgaggga gacacctggc tcctgtgtct acagcccaag cccatctggc 900
agcatcacca cctctgacag ccaacttttc aacaagccat actggctgca caaggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggcacaac caactttttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca acctgaccct gtgtgccagc acccagaacc ctgtgccaaa cacctatgac 1080
ccaaccaagt tcaagcacta cagcaggcat gtggaggaat atgacctcca attcatcttc 1140
caactttgta ccatcaccct gacagcagag gtgatgagtt acatccacag tatgaactcc 1200
agcatcttgg agaactggaa ctttggagtg cctcctcctc caaccacctc cctggtggac 1260
acctacaggt ttgtccagtc tgtggctgtg acttgtcaga aggacaccac acctcctgag 1320
aagcaggacc catatgacaa actgaagttc tggacagtgg acctgaaaga gaagttctcc 1380
tctgacctgg accaataccc actgggcagg aagttcctgg tccaggctgg actgaaagcc 1440
aagccaaaac tgaaaagggc tgccccaacc agcaccagga cctcctctgc caagaggaag 1500
aaggtgaaga agtaaa 1516
<210> 99
<211> 1552
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4505 Синтетический ген L1 ПВЧ45
<400> 99
ctgggtacca tggctctgtg gagaccatct gacagcacag tctacctgcc tcctccatct 60
gtggcaaggg tggtgaacac agatgactat gtgagcagga ccagcatctt ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctgac agtgggcaac ccatacttca gggtggtgcc aagtggagca 180
ggcaacaagc aggctgtgcc aaaggtgtct gcctaccaat acagggtgtt cagggtggct 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggactgcct gacagcacca tctacaaccc tgagacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt ggggatggag attggcaggg gacaaccact gggcattgga 360
ctgtctggac acccattcta caacaaactg gatgacacag agtctgccca tgctgccaca 420
gcagtgatta cccaggatgt gagggacaat gtgtctgtgg actacaagca gacccaactt 480
tgtatcctgg gctgtgtgcc tgccattgga gaacactggg ctaagggcac cctgtgtaag 540
cctgcccaac tccaacctgg agactgtcct ccattggaac tgaaaaacac catcattgag 600
gatggagata tggtggacac aggctatgga gctatggact tcagcaccct ccaagacacc 660
aagtgtgagg tgccactgga catctgtcag agcatctgta aataccctga ctacctccaa 720
atgagtgctg acccatatgg agacagtatg ttcttctgtc tgaggaggga acaacttttt 780
gccagacact tctggaacag ggctggagtg atgggagaca cagtgccaac agacctctac 840
atcaagggca cctctgccaa tatgagggag acacctggct cctgtgtcta cagcccaagc 900
ccatctggca gcatcaccac ctctgacagc caacttttca acaagccata ctggctgcac 960
aaggctcaag gacacaacaa tggcatctgt tggcacaacc aactttttgt gacagtggtg 1020
gacaccacca ggagcaccaa cctgaccctg tgtgccagca cccagaaccc tgtgccaaac 1080
acctatgacc caaccaagtt caagcactac agcaggcatg tggaggaata tgacctccaa 1140
ttcatcttcc aactttgtac catcaccctg acagcagagg tgatgagtta catccacagt 1200
atgaactcca gcatcttgga gaactggaac tttggagtgc ctcctcctcc aaccacctcc 1260
ctggtggaca cctacaggtt tgtccagtct gtggctgtga cttgtcagaa ggacaccaca 1320
cctcctgaga agcaggaccc atatgacaaa ctgaagttct ggacagtgga cctgaaagag 1380
aagttctcct ctgacctgga ccaataccca ctgggcagga agttcctggt ccaggctgga 1440
ctgaggagga gaccaaccat tggaccaagg aagagacctg ctgccagcac cagcacagcc 1500
agcagacctg ccaagagggt gaggattagg agcaagaagt aaactcgagc tc 1552
<210> 100
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4506 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 100
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 101
<211> 33
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4507 Праймер F1 ПВЧ45L1
<400> 101
cttggtacca tggctctgtg gagaccatct gac 33
<210> 102
<211> 32
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4508 Праймер R1 ПВЧ45L1
<400> 102
gcttggcttt cagtccagcc tggaccagga ac 32
<210> 103
<211> 1453
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4509 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ45L1
<400> 103
cttggtacca tggctctgtg gagaccatct gacagcacag tctacctgcc tcctccatct 60
gtggcaaggg tggtgaacac agatgactat gtgagcagga ccagcatctt ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctgac agtgggcaac ccatacttca gggtggtgcc aagtggagca 180
ggcaacaagc aggctgtgcc aaaggtgtct gcctaccaat acagggtgtt cagggtggct 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggactgcct gacagcacca tctacaaccc tgagacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt ggggatggag attggcaggg gacaaccact gggcattgga 360
ctgtctggac acccattcta caacaaactg gatgacacag agtctgccca tgctgccaca 420
gcagtgatta cccaggatgt gagggacaat gtgtctgtgg actacaagca gacccaactt 480
tgtatcctgg gctgtgtgcc tgccattgga gaacactggg ctaagggcac cctgtgtaag 540
cctgcccaac tccaacctgg agactgtcct ccattggaac tgaaaaacac catcattgag 600
gatggagata tggtggacac aggctatgga gctatggact tcagcaccct ccaagacacc 660
aagtgtgagg tgccactgga catctgtcag agcatctgta aataccctga ctacctccaa 720
atgagtgctg acccatatgg agacagtatg ttcttctgtc tgaggaggga acaacttttt 780
gccagacact tctggaacag ggctggagtg atgggagaca cagtgccaac agacctctac 840
atcaagggca cctctgccaa tatgagggag acacctggct cctgtgtcta cagcccaagc 900
ccatctggca gcatcaccac ctctgacagc caacttttca acaagccata ctggctgcac 960
aaggctcaag gacacaacaa tggcatctgt tggcacaacc aactttttgt gacagtggtg 1020
gacaccacca ggagcaccaa cctgaccctg tgtgccagca cccagaaccc tgtgccaaac 1080
acctatgacc caaccaagtt caagcactac agcaggcatg tggaggaata tgacctccaa 1140
ttcatcttcc aactttgtac catcaccctg acagcagagg tgatgagtta catccacagt 1200
atgaactcca gcatcttgga gaactggaac tttggagtgc ctcctcctcc aaccacctcc 1260
ctggtggaca cctacaggtt tgtccagtct gtggctgtga cttgtcagaa ggacaccaca 1320
cctcctgaga agcaggaccc atatgacaaa ctgaagttct ggacagtgga cctgaaagag 1380
aagttctcct ctgacctgga ccaataccca ctgggcagga agttcctggt ccaggctgga 1440
ctgaaagcca agc 1453
<210> 104
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4510 Праймер F2 ПВЧ45L1
<400> 104
ggctggactg aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 105
<211> 37
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4511 Праймер R2 ПВЧ45L1
<400> 105
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggc 37
<210> 106
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 4512 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ45L1
<400> 106
ggctggactg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 107
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 4513 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 107
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 108
<211> 474
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5101 Последовательность аминокислот aa 1-474 белка L1 ПВЧ типа 51
<400> 108
Met Ala Leu Trp Arg Thr Asn Asp Ser Lys Val Tyr Leu Pro Pro Ala
1 5 10 15
Pro Val Ser Arg Ile Val Asn Thr Glu Glu Tyr Ile Thr Arg Thr Gly
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Ile Thr Leu Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Pro Ile Pro Lys Thr Ser Thr Arg Ala Ala Ile Pro Lys Val
50 55 60
Ser Ala Phe Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro Asn
65 70 75 80
Lys Phe Gly Leu Pro Asp Pro Asn Leu Tyr Asn Pro Asp Thr Asp Arg
85 90 95
Leu Val Trp Gly Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu
100 105 110
Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Lys Tyr Asp Asp Thr
115 120 125
Glu Asn Ser Arg Ile Ala Asn Gly Asn Ala Gln Gln Asp Val Arg Asp
130 135 140
Asn Thr Ser Val Asp Asn Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys
145 150 155 160
Ala Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Ile Gly Thr Thr Cys Lys Asn
165 170 175
Thr Pro Val Pro Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Ser Ser
180 185 190
Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp
195 200 205
Phe Ala Ala Leu Gln Ala Thr Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Ser
210 215 220
Gln Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Thr
225 230 235 240
Tyr Gly Asn Ser Met Phe Phe His Leu Arg Arg Glu Gln Ile Phe Ala
245 250 255
Arg His Tyr Tyr Asn Lys Leu Val Gly Val Gly Glu Asp Ile Pro Asn
260 265 270
Asp Tyr Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Gly Arg Asp Pro Ile Glu Ser
275 280 285
Tyr Ile Tyr Ser Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Asp Ser
290 295 300
Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Asn Asn Gln Leu Phe Ile Thr Cys Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Ser Thr Ala Thr Ala Ala Val Ser
340 345 350
Pro Thr Phe Thr Pro Ser Asn Phe Lys Gln Tyr Ile Arg His Gly Glu
355 360 365
Glu Tyr Glu Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr
370 375 380
Thr Glu Val Met Ala Tyr Leu His Thr Met Asp Pro Thr Ile Leu Glu
385 390 395 400
Gln Trp Asn Phe Gly Leu Thr Leu Pro Pro Ser Ala Ser Leu Glu Asp
405 410 415
Ala Tyr Arg Phe Val Arg Asn Ala Ala Thr Ser Cys Gln Lys Asp Thr
420 425 430
Pro Pro Gln Ala Lys Pro Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp
435 440 445
Val Asp Leu Lys Glu Arg Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Phe Ala Leu
450 455 460
Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Val Gly Val
465 470
<210> 109
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5102 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 109
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 110
<211> 500
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5103 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 51
<400> 110
Met Ala Leu Trp Arg Thr Asn Asp Ser Lys Val Tyr Leu Pro Pro Ala
1 5 10 15
Pro Val Ser Arg Ile Val Asn Thr Glu Glu Tyr Ile Thr Arg Thr Gly
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Ile Thr Leu Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Pro Ile Pro Lys Thr Ser Thr Arg Ala Ala Ile Pro Lys Val
50 55 60
Ser Ala Phe Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro Asn
65 70 75 80
Lys Phe Gly Leu Pro Asp Pro Asn Leu Tyr Asn Pro Asp Thr Asp Arg
85 90 95
Leu Val Trp Gly Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu
100 105 110
Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Lys Tyr Asp Asp Thr
115 120 125
Glu Asn Ser Arg Ile Ala Asn Gly Asn Ala Gln Gln Asp Val Arg Asp
130 135 140
Asn Thr Ser Val Asp Asn Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys
145 150 155 160
Ala Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Ile Gly Thr Thr Cys Lys Asn
165 170 175
Thr Pro Val Pro Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Ser Ser
180 185 190
Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp
195 200 205
Phe Ala Ala Leu Gln Ala Thr Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Ser
210 215 220
Gln Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Thr
225 230 235 240
Tyr Gly Asn Ser Met Phe Phe His Leu Arg Arg Glu Gln Ile Phe Ala
245 250 255
Arg His Tyr Tyr Asn Lys Leu Val Gly Val Gly Glu Asp Ile Pro Asn
260 265 270
Asp Tyr Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Gly Arg Asp Pro Ile Glu Ser
275 280 285
Tyr Ile Tyr Ser Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Asp Ser
290 295 300
Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Asn Asn Gln Leu Phe Ile Thr Cys Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Ser Thr Ala Thr Ala Ala Val Ser
340 345 350
Pro Thr Phe Thr Pro Ser Asn Phe Lys Gln Tyr Ile Arg His Gly Glu
355 360 365
Glu Tyr Glu Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr
370 375 380
Thr Glu Val Met Ala Tyr Leu His Thr Met Asp Pro Thr Ile Leu Glu
385 390 395 400
Gln Trp Asn Phe Gly Leu Thr Leu Pro Pro Ser Ala Ser Leu Glu Asp
405 410 415
Ala Tyr Arg Phe Val Arg Asn Ala Ala Thr Ser Cys Gln Lys Asp Thr
420 425 430
Pro Pro Gln Ala Lys Pro Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp
435 440 445
Val Asp Leu Lys Glu Arg Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Phe Ala Leu
450 455 460
Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Val Gly Val Lys Ala Lys Pro Lys Leu
465 470 475 480
Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys
485 490 495
Lys Val Lys Lys
500
<210> 111
<211> 1504
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5104 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 51
<400> 111
atggctctgt ggaggaccaa tgacagcaag gtctacctgc ctcctgcccc tgtgagcagg 60
attgtgaaca cagaggaata catcaccagg acaggcatct actactatgc tggctccagc 120
agactgatta ccctgggaca cccatacttt ccaatcccaa agaccagcac cagggctgcc 180
atcccaaagg tgtctgcctt ccaatacagg gtgttcaggg tccaacttcc tgacccaaac 240
aagtttggac tgcctgaccc aaacctctac aaccctgaca cagacagact ggtgtggggc 300
tgtgtgggag tggaggtggg caggggacaa ccactgggag tgggactgtc tggacaccca 360
ctgttcaaca aatatgatga cacagagaac agcaggattg ccaatggcaa tgcccaacag 420
gatgtgaggg acaacacctc tgtggacaac aagcagaccc aactttgtat cattggctgt 480
gcccctccaa ttggagaaca ctggggcatt ggcaccactt gtaagaacac acctgtgcct 540
cctggagact gtcctccatt ggaactggtg tcctctgtga ttcaggatgg agatatgatt 600
gacacaggct ttggagctat ggactttgct gccctccaag ccaccaagtc tgatgtgcca 660
ctggacatca gccagtctgt gtgtaaatac cctgactacc tgaaaatgag tgctgacacc 720
tatggcaaca gtatgttctt ccacctgagg agggaacaga tttttgccag acactactac 780
aacaaactgg tgggagtggg agaggacatc ccaaatgact actacatcaa gggctctggc 840
aatggcaggg acccaattga gtcctacatc tactctgcca caccatctgg cagtatgatt 900
acctctgaca gccagatttt caacaagcca tactggctgc acagggctca aggacacaac 960
aatggcatct gttggaacaa ccaacttttc atcacttgtg tggacaccac caggagcacc 1020
aacctgacca tcagcacagc cacagcagca gtgagcccaa ccttcacacc aagcaacttc 1080
aagcaataca tcagacatgg agaggaatat gaactccaat tcatcttcca actttgtaag 1140
attaccctga ccacagaggt gatggcttac ctgcacacaa tggacccaac catcttggaa 1200
cagtggaact ttggactgac cctgcctcca tctgcctcct tggaggatgc ctacaggttt 1260
gtgaggaatg ctgccacctc ctgtcagaag gacacacctc cacaggctaa gcctgaccca 1320
ctggctaaat acaagttctg ggatgtggac ctgaaagaga ggttctccct ggacctggac 1380
cagtttgccc tgggcaggaa gttcctgctc caagtgggag tcaaagccaa gccaaaactg 1440
aaaagggctg ccccaaccag caccaggacc tcctctgcca agaggaagaa ggtgaagaag 1500
taaa 1504
<210> 112
<211> 1534
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5105 Синтетический ген L1 ПВЧ51
<400> 112
ctgggtacca tggctctgtg gaggaccaat gacagcaagg tctacctgcc tcctgcccct 60
gtgagcagga ttgtgaacac agaggaatac atcaccagga caggcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgattac cctgggacac ccatactttc caatcccaaa gaccagcacc 180
agggctgcca tcccaaaggt gtctgccttc caatacaggg tgttcagggt ccaacttcct 240
gacccaaaca agtttggact gcctgaccca aacctctaca accctgacac agacagactg 300
gtgtggggct gtgtgggagt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagt gggactgtct 360
ggacacccac tgttcaacaa atatgatgac acagagaaca gcaggattgc caatggcaat 420
gcccaacagg atgtgaggga caacacctct gtggacaaca agcagaccca actttgtatc 480
attggctgtg cccctccaat tggagaacac tggggcattg gcaccacttg taagaacaca 540
cctgtgcctc ctggagactg tcctccattg gaactggtgt cctctgtgat tcaggatgga 600
gatatgattg acacaggctt tggagctatg gactttgctg ccctccaagc caccaagtct 660
gatgtgccac tggacatcag ccagtctgtg tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt 720
gctgacacct atggcaacag tatgttcttc cacctgagga gggaacagat ttttgccaga 780
cactactaca acaaactggt gggagtggga gaggacatcc caaatgacta ctacatcaag 840
ggctctggca atggcaggga cccaattgag tcctacatct actctgccac accatctggc 900
agtatgatta cctctgacag ccagattttc aacaagccat actggctgca cagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggaacaac caacttttca tcacttgtgt ggacaccacc 1020
aggagcacca acctgaccat cagcacagcc acagcagcag tgagcccaac cttcacacca 1080
agcaacttca agcaatacat cagacatgga gaggaatatg aactccaatt catcttccaa 1140
ctttgtaaga ttaccctgac cacagaggtg atggcttacc tgcacacaat ggacccaacc 1200
atcttggaac agtggaactt tggactgacc ctgcctccat ctgcctcctt ggaggatgcc 1260
tacaggtttg tgaggaatgc tgccacctcc tgtcagaagg acacacctcc acaggctaag 1320
cctgacccac tggctaaata caagttctgg gatgtggacc tgaaagagag gttctccctg 1380
gacctggacc agtttgccct gggcaggaag ttcctgctcc aagtgggagt ccagaggaag 1440
ccaagacctg gactgaaaag acctgcctcc tctgcctcct cctcctcctc ctcctctgcc 1500
aagaggaaga gggtgaagaa gtaaactcga gctc 1534
<210> 113
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5106 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 113
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 114
<211> 34
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5107 Праймер F1 ПВЧ51L1
<400> 114
cttggtacca tggctctgtg gaggaccaat gaca 34
<210> 115
<211> 32
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5108 Праймер R1 ПВЧ51L1
<400> 115
gcttggcttt gactcccact tggagcagga ac 32
<210> 116
<211> 1441
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5109 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ51L1
<400> 116
cttggtacca tggctctgtg gaggaccaat gacagcaagg tctacctgcc tcctgcccct 60
gtgagcagga ttgtgaacac agaggaatac atcaccagga caggcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgattac cctgggacac ccatactttc caatcccaaa gaccagcacc 180
agggctgcca tcccaaaggt gtctgccttc caatacaggg tgttcagggt ccaacttcct 240
gacccaaaca agtttggact gcctgaccca aacctctaca accctgacac agacagactg 300
gtgtggggct gtgtgggagt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagt gggactgtct 360
ggacacccac tgttcaacaa atatgatgac acagagaaca gcaggattgc caatggcaat 420
gcccaacagg atgtgaggga caacacctct gtggacaaca agcagaccca actttgtatc 480
attggctgtg cccctccaat tggagaacac tggggcattg gcaccacttg taagaacaca 540
cctgtgcctc ctggagactg tcctccattg gaactggtgt cctctgtgat tcaggatgga 600
gatatgattg acacaggctt tggagctatg gactttgctg ccctccaagc caccaagtct 660
gatgtgccac tggacatcag ccagtctgtg tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt 720
gctgacacct atggcaacag tatgttcttc cacctgagga gggaacagat ttttgccaga 780
cactactaca acaaactggt gggagtggga gaggacatcc caaatgacta ctacatcaag 840
ggctctggca atggcaggga cccaattgag tcctacatct actctgccac accatctggc 900
agtatgatta cctctgacag ccagattttc aacaagccat actggctgca cagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggaacaac caacttttca tcacttgtgt ggacaccacc 1020
aggagcacca acctgaccat cagcacagcc acagcagcag tgagcccaac cttcacacca 1080
agcaacttca agcaatacat cagacatgga gaggaatatg aactccaatt catcttccaa 1140
ctttgtaaga ttaccctgac cacagaggtg atggcttacc tgcacacaat ggacccaacc 1200
atcttggaac agtggaactt tggactgacc ctgcctccat ctgcctcctt ggaggatgcc 1260
tacaggtttg tgaggaatgc tgccacctcc tgtcagaagg acacacctcc acaggctaag 1320
cctgacccac tggctaaata caagttctgg gatgtggacc tgaaagagag gttctccctg 1380
gacctggacc agtttgccct gggcaggaag ttcctgctcc aagtgggagt caaagccaag 1440
c 1441
<210> 117
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5110 Праймер F2 ПВЧ51L1
<400> 117
agtgggagtc aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 118
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5111 Праймер R2 ПВЧ51L1
<400> 118
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 119
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5112 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ51L1
<400> 119
agtgggagtc aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 120
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5113 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 120
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 121
<211> 478
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5201 Последовательность аминокислот aa 1-478 белка L1 ПВЧ типа 52
<400> 121
Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Ser Ile Lys Asn Thr Ser Ser Gly Asn Gly Lys Lys Val Leu
50 55 60
Val Pro Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile Lys Leu
65 70 75 80
Pro Asp Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro
85 90 95
Glu Thr Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Ile Gly Arg
100 105 110
Gly Gln Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys
115 120 125
Phe Asp Asp Thr Glu Thr Ser Asn Lys Tyr Ala Gly Lys Pro Gly Ile
130 135 140
Asp Asn Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys
145 150 155 160
Ile Leu Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr
165 170 175
Pro Cys Asn Asn Asn Ser Gly Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Gln
180 185 190
Leu Ile Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe
195 200 205
Gly Cys Met Asp Phe Asn Thr Leu Gln Ala Ser Lys Ser Asp Val Pro
210 215 220
Ile Asp Ile Cys Ser Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met
225 230 235 240
Ala Ser Glu Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu
245 250 255
Gln Met Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Leu Gly Asp
260 265 270
Pro Val Pro Gly Asp Leu Tyr Ile Gln Gly Ser Asn Ser Gly Asn Thr
275 280 285
Ala Thr Val Gln Ser Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met
290 295 300
Val Thr Ser Glu Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg
305 310 315 320
Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val
325 330 335
Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Glu
340 345 350
Val Lys Lys Glu Ser Thr Tyr Lys Asn Glu Asn Phe Lys Glu Tyr Leu
355 360 365
Arg His Gly Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys
370 375 380
Ile Thr Leu Thr Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Lys Met Asp Ala
385 390 395 400
Thr Ile Leu Glu Asp Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala
405 410 415
Ser Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Thr Ala Ile Thr Cys
420 425 430
Gln Lys Asn Thr Pro Pro Lys Gly Lys Glu Asp Pro Leu Lys Asp Tyr
435 440 445
Met Phe Trp Glu Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp
450 455 460
Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu
465 470 475
<210> 122
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5202 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 122
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 123
<211> 504
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5203 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 52
<400> 123
Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Ser Ile Lys Asn Thr Ser Ser Gly Asn Gly Lys Lys Val Leu
50 55 60
Val Pro Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile Lys Leu
65 70 75 80
Pro Asp Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro
85 90 95
Glu Thr Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Ile Gly Arg
100 105 110
Gly Gln Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys
115 120 125
Phe Asp Asp Thr Glu Thr Ser Asn Lys Tyr Ala Gly Lys Pro Gly Ile
130 135 140
Asp Asn Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys
145 150 155 160
Ile Leu Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr
165 170 175
Pro Cys Asn Asn Asn Ser Gly Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Gln
180 185 190
Leu Ile Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe
195 200 205
Gly Cys Met Asp Phe Asn Thr Leu Gln Ala Ser Lys Ser Asp Val Pro
210 215 220
Ile Asp Ile Cys Ser Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met
225 230 235 240
Ala Ser Glu Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu
245 250 255
Gln Met Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Leu Gly Asp
260 265 270
Pro Val Pro Gly Asp Leu Tyr Ile Gln Gly Ser Asn Ser Gly Asn Thr
275 280 285
Ala Thr Val Gln Ser Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met
290 295 300
Val Thr Ser Glu Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg
305 310 315 320
Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val
325 330 335
Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Glu
340 345 350
Val Lys Lys Glu Ser Thr Tyr Lys Asn Glu Asn Phe Lys Glu Tyr Leu
355 360 365
Arg His Gly Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys
370 375 380
Ile Thr Leu Thr Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Lys Met Asp Ala
385 390 395 400
Thr Ile Leu Glu Asp Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala
405 410 415
Ser Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Thr Ala Ile Thr Cys
420 425 430
Gln Lys Asn Thr Pro Pro Lys Gly Lys Glu Asp Pro Leu Lys Asp Tyr
435 440 445
Met Phe Trp Glu Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp
450 455 460
Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala
465 470 475 480
Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser
485 490 495
Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
500
<210> 124
<211> 1516
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5204 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 52
<400> 124
atgagcgtgt ggaggcccag cgaggccacc gtgtacctgc cccccgtgcc cgtgagcaag 60
gtggtgagca ccgacgagta cgtgagcagg accagcatct actactacgc cggcagcagc 120
aggctgctga ccgtgggcca cccctacttc agcatcaaga acaccagcag cggcaacggc 180
aagaaggtgc tggtgcccaa ggtgagcggc ctgcagtaca gggtgttcag gatcaagctg 240
cccgacccca acaagttcgg cttccccgac accagcttct acaaccccga gacccagagg 300
ctggtgtggg cctgcaccgg cctggagatc ggcaggggcc agcccctggg cgtgggcatc 360
agcggccacc ccctgctgaa caagttcgac gacaccgaga ccagcaacaa gtacgccggc 420
aagcccggca tcgacaacag ggagtgcctg agcatggact acaagcagac ccagctgtgc 480
atcctgggct gcaagccccc catcggcgag cactggggca agggcacccc ctgcaacaac 540
aacagcggca accccggcga ctgccccccc ctgcagctga tcaacagcgt gatccaggac 600
ggcgacatgg tggacaccgg cttcggctgc atggacttca acaccctgca ggccagcaag 660
agcgacgtgc ccatcgacat ctgcagcagc gtgtgcaagt accccgacta cctgcagatg 720
gccagcgagc cctacggcga cagcctgttc ttcttcctga ggagggagca gatgttcgtg 780
aggcacttct tcaacagggc cggcaccctg ggcgaccccg tgcccggcga cctgtacatc 840
cagggcagca acagcggcaa caccgccacc gtgcagagca gcgccttctt ccccaccccc 900
agcggcagca tggtgaccag cgagagccag ctgttcaaca agccctactg gctgcagagg 960
gcccagggcc acaacaacgg catctgctgg ggcaaccagc tgttcgtgac cgtggtggac 1020
accaccagga gcaccaacat gaccctgtgc gccgaggtga agaaggagag cacctacaag 1080
aacgagaact tcaaggagta cctgaggcac ggcgaggagt tcgacctgca gttcatcttc 1140
cagctgtgca agatcaccct gaccgccgac gtgatgacct acatccacaa gatggacgcc 1200
accatcctgg aggactggca gttcggcctg accccccccc ccagcgccag cctggaggac 1260
acctacaggt tcgtgaccag caccgccatc acctgccaga agaacacccc ccccaagggc 1320
aaggaggacc ccctgaagga ctacatgttc tgggaggtgg acctgaagga gaagttcagc 1380
gccgacctgg accagttccc cctgggcagg aagttcctgc tgcaggccgg cctgaaagcc 1440
aagccaaaac tgaaaagggc tgccccaacc agcaccagga cctcctctgc caagaggaag 1500
aaggtgaaga agtaaa 1516
<210> 125
<211> 1531
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5205 Синтетический ген L1 ПВЧ52
<400> 125
ctgggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc 60
gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc 120
ggcagcagca ggctgctgac cgtgggccac ccctacttca gcatcaagaa caccagcagc 180
ggcaacggca agaaggtgct ggtgcccaag gtgagcggcc tgcagtacag ggtgttcagg 240
atcaagctgc ccgaccccaa caagttcggc ttccccgaca ccagcttcta caaccccgag 300
acccagaggc tggtgtgggc ctgcaccggc ctggagatcg gcaggggcca gcccctgggc 360
gtgggcatca gcggccaccc cctgctgaac aagttcgacg acaccgagac cagcaacaag 420
tacgccggca agcccggcat cgacaacagg gagtgcctga gcatggacta caagcagacc 480
cagctgtgca tcctgggctg caagcccccc atcggcgagc actggggcaa gggcaccccc 540
tgcaacaaca acagcggcaa ccccggcgac tgcccccccc tgcagctgat caacagcgtg 600
atccaggacg gcgacatggt ggacaccggc ttcggctgca tggacttcaa caccctgcag 660
gccagcaaga gcgacgtgcc catcgacatc tgcagcagcg tgtgcaagta ccccgactac 720
ctgcagatgg ccagcgagcc ctacggcgac agcctgttct tcttcctgag gagggagcag 780
atgttcgtga ggcacttctt caacagggcc ggcaccctgg gcgaccccgt gcccggcgac 840
ctgtacatcc agggcagcaa cagcggcaac accgccaccg tgcagagcag cgccttcttc 900
cccaccccca gcggcagcat ggtgaccagc gagagccagc tgttcaacaa gccctactgg 960
ctgcagaggg cccagggcca caacaacggc atctgctggg gcaaccagct gttcgtgacc 1020
gtggtggaca ccaccaggag caccaacatg accctgtgcg ccgaggtgaa gaaggagagc 1080
acctacaaga acgagaactt caaggagtac ctgaggcacg gcgaggagtt cgacctgcag 1140
ttcatcttcc agctgtgcaa gatcaccctg accgccgacg tgatgaccta catccacaag 1200
atggacgcca ccatcctgga ggactggcag ttcggcctga cccccccccc cagcgccagc 1260
ctggaggaca cctacaggtt cgtgaccagc accgccatca cctgccagaa gaacaccccc 1320
cccaagggca aggaggaccc cctgaaggac tacatgttct gggaggtgga cctgaaggag 1380
aagttcagcg ccgacctgga ccagttcccc ctgggcagga agttcctgct gcaggccggc 1440
ctgcaggcca ggcccaagct gaagaggccc gccagcagcg cccccaggac cagcaccaag 1500
aagaagaagg tgaagaggta aactcgagct c 1531
<210> 126
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5206 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 126
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 127
<211> 34
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5207 Праймер F1 ПВЧ52L1
<400> 127
cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gagg 34
<210> 128
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5208 Праймер R1 ПВЧ52L1
<400> 128
gcttggcttt caggccggcc tgcagcagga acttc 35
<210> 129
<211> 1453
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5209 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ52L1
<400> 129
cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc 60
gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc 120
ggcagcagca ggctgctgac cgtgggccac ccctacttca gcatcaagaa caccagcagc 180
ggcaacggca agaaggtgct ggtgcccaag gtgagcggcc tgcagtacag ggtgttcagg 240
atcaagctgc ccgaccccaa caagttcggc ttccccgaca ccagcttcta caaccccgag 300
acccagaggc tggtgtgggc ctgcaccggc ctggagatcg gcaggggcca gcccctgggc 360
gtgggcatca gcggccaccc cctgctgaac aagttcgacg acaccgagac cagcaacaag 420
tacgccggca agcccggcat cgacaacagg gagtgcctga gcatggacta caagcagacc 480
cagctgtgca tcctgggctg caagcccccc atcggcgagc actggggcaa gggcaccccc 540
tgcaacaaca acagcggcaa ccccggcgac tgcccccccc tgcagctgat caacagcgtg 600
atccaggacg gcgacatggt ggacaccggc ttcggctgca tggacttcaa caccctgcag 660
gccagcaaga gcgacgtgcc catcgacatc tgcagcagcg tgtgcaagta ccccgactac 720
ctgcagatgg ccagcgagcc ctacggcgac agcctgttct tcttcctgag gagggagcag 780
atgttcgtga ggcacttctt caacagggcc ggcaccctgg gcgaccccgt gcccggcgac 840
ctgtacatcc agggcagcaa cagcggcaac accgccaccg tgcagagcag cgccttcttc 900
cccaccccca gcggcagcat ggtgaccagc gagagccagc tgttcaacaa gccctactgg 960
ctgcagaggg cccagggcca caacaacggc atctgctggg gcaaccagct gttcgtgacc 1020
gtggtggaca ccaccaggag caccaacatg accctgtgcg ccgaggtgaa gaaggagagc 1080
acctacaaga acgagaactt caaggagtac ctgaggcacg gcgaggagtt cgacctgcag 1140
ttcatcttcc agctgtgcaa gatcaccctg accgccgacg tgatgaccta catccacaag 1200
atggacgcca ccatcctgga ggactggcag ttcggcctga cccccccccc cagcgccagc 1260
ctggaggaca cctacaggtt cgtgaccagc accgccatca cctgccagaa gaacaccccc 1320
cccaagggca aggaggaccc cctgaaggac tacatgttct gggaggtgga cctgaaggag 1380
aagttcagcg ccgacctgga ccagttcccc ctgggcagga agttcctgct gcaggccggc 1440
ctgaaagcca agc 1453
<210> 130
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5210 Праймер F2 ПВЧ52L1
<400> 130
ggccggcctg aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 131
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5211 Праймер R2 ПВЧ52L1
<400> 131
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 132
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5212 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ52L1
<400> 132
ggccggcctg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 133
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5213 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 133
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 134
<211> 467
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5601 Последовательность аминокислот aa 1-467 белка L1 ПВЧ типа 56
<400> 134
Met Ala Thr Trp Arg Pro Ser Glu Asn Lys Val Tyr Leu Pro Pro Thr
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ser Tyr Val Lys Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Tyr Ser Val Thr Lys Asp Asn Thr Lys Thr Asn Ile Pro Lys Val
50 55 60
Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp Pro Asn
65 70 75 80
Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Asn Ile Tyr Asn Pro Asp Gln Glu Arg
85 90 95
Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu
100 105 110
Gly Ala Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Arg Leu Asp Asp Thr
115 120 125
Glu Ser Ser Asn Leu Ala Asn Asn Asn Val Ile Glu Asp Ser Arg Asp
130 135 140
Asn Ile Ser Val Asp Gly Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Val Gly Cys
145 150 155 160
Thr Pro Ala Met Gly Glu His Trp Thr Lys Gly Ala Val Cys Lys Ser
165 170 175
Thr Gln Val Thr Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Ala Leu Ile Asn Thr
180 185 190
Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp
195 200 205
Phe Lys Val Leu Gln Glu Ser Lys Ala Glu Val Pro Leu Asp Ile Val
210 215 220
Gln Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Ala
225 230 235 240
Tyr Gly Asp Ser Met Trp Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala
245 250 255
Arg His Tyr Phe Asn Arg Ala Gly Lys Val Gly Glu Thr Ile Pro Ala
260 265 270
Glu Leu Tyr Leu Lys Gly Ser Asn Gly Arg Glu Pro Pro Pro Ser Ser
275 280 285
Val Tyr Val Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Glu Ala Gln
290 295 300
Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn
305 310 315 320
Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr
325 330 335
Arg Ser Thr Asn Met Thr Ile Ser Thr Ala Thr Glu Gln Leu Ser Lys
340 345 350
Tyr Asp Ala Arg Lys Ile Asn Gln Tyr Leu Arg His Val Glu Glu Tyr
355 360 365
Glu Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Ser Ala Glu
370 375 380
Val Met Ala Tyr Leu His Asn Met Asn Ala Asn Leu Leu Glu Asp Trp
385 390 395 400
Asn Ile Gly Leu Ser Pro Pro Val Ala Thr Ser Leu Glu Asp Lys Tyr
405 410 415
Arg Tyr Val Arg Ser Thr Ala Ile Thr Cys Gln Arg Glu Gln Pro Pro
420 425 430
Thr Glu Lys Gln Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp Val Asn
435 440 445
Leu Gln Asp Ser Phe Ser Thr Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg
450 455 460
Lys Phe Leu
465
<210> 135
<211> 31
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5602 Последовательность аминокислот aa 469-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 135
Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro
1 5 10 15
Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25 30
<210> 136
<211> 498
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5603 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 56
<400> 136
Met Ala Thr Trp Arg Pro Ser Glu Asn Lys Val Tyr Leu Pro Pro Thr
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ser Tyr Val Lys Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Tyr Ser Val Thr Lys Asp Asn Thr Lys Thr Asn Ile Pro Lys Val
50 55 60
Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp Pro Asn
65 70 75 80
Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Asn Ile Tyr Asn Pro Asp Gln Glu Arg
85 90 95
Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu
100 105 110
Gly Ala Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Arg Leu Asp Asp Thr
115 120 125
Glu Ser Ser Asn Leu Ala Asn Asn Asn Val Ile Glu Asp Ser Arg Asp
130 135 140
Asn Ile Ser Val Asp Gly Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Val Gly Cys
145 150 155 160
Thr Pro Ala Met Gly Glu His Trp Thr Lys Gly Ala Val Cys Lys Ser
165 170 175
Thr Gln Val Thr Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Ala Leu Ile Asn Thr
180 185 190
Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp
195 200 205
Phe Lys Val Leu Gln Glu Ser Lys Ala Glu Val Pro Leu Asp Ile Val
210 215 220
Gln Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Ala
225 230 235 240
Tyr Gly Asp Ser Met Trp Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala
245 250 255
Arg His Tyr Phe Asn Arg Ala Gly Lys Val Gly Glu Thr Ile Pro Ala
260 265 270
Glu Leu Tyr Leu Lys Gly Ser Asn Gly Arg Glu Pro Pro Pro Ser Ser
275 280 285
Val Tyr Val Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Glu Ala Gln
290 295 300
Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn
305 310 315 320
Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr
325 330 335
Arg Ser Thr Asn Met Thr Ile Ser Thr Ala Thr Glu Gln Leu Ser Lys
340 345 350
Tyr Asp Ala Arg Lys Ile Asn Gln Tyr Leu Arg His Val Glu Glu Tyr
355 360 365
Glu Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Ser Ala Glu
370 375 380
Val Met Ala Tyr Leu His Asn Met Asn Ala Asn Leu Leu Glu Asp Trp
385 390 395 400
Asn Ile Gly Leu Ser Pro Pro Val Ala Thr Ser Leu Glu Asp Lys Tyr
405 410 415
Arg Tyr Val Arg Ser Thr Ala Ile Thr Cys Gln Arg Glu Gln Pro Pro
420 425 430
Thr Glu Lys Gln Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp Val Asn
435 440 445
Leu Gln Asp Ser Phe Ser Thr Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg
450 455 460
Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg
465 470 475 480
Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val
485 490 495
Lys Lys
<210> 137
<211> 1498
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5604 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 56
<400> 137
atggctacct ggagaccatc tgagaacaag gtctacctgc ctccaacacc tgtgagcaag 60
gtggtggcta cagactccta tgtgaagagg accagcatct tctaccatgc tggctccagc 120
agactgctgg ctgtgggaca cccatactac tctgtgacca aggacaacac caagaccaac 180
atcccaaagg tgtctgccta ccaatacagg gtgttcaggg tgagactgcc tgacccaaac 240
aagtttggac tgcctgacac caacatctac aaccctgacc aggagagact ggtgtgggct 300
tgtgtgggat tggaggtggg caggggacaa ccactgggag caggactgtc tggacaccca 360
ctgttcaaca gactggatga cacagagtcc agcaacctgg ctaacaacaa tgtgattgag 420
gacagcaggg acaacatctc tgtggatggc aagcagaccc aactttgtat tgtgggctgt 480
actcctgcta tgggagaaca ctggaccaag ggagcagtgt gtaagagcac ccaggtgacc 540
acaggagact gtcctccact ggctctgata aacacaccaa ttgaggatgg agatatgatt 600
gacacaggct ttggagctat ggacttcaag gtgctccaag agagcaaggc tgaggtgcca 660
ctggacattg tccagagcac ttgtaaatac cctgactacc tgaaaatgag tgctgatgcc 720
tatggagaca gtatgtggtt ctacctgagg agggaacaac tttttgccag acactacttc 780
aacagggctg gcaaggtggg agagaccatc cctgctgaac tctacctgaa aggcagcaat 840
ggcagggaac ctcctccatc ctctgtctat gtggctacac catctggcag tatgattacc 900
tctgaggctc aacttttcaa caagccatac tggctccaaa gggctcaagg acacaacaat 960
ggcatctgtt ggggcaacca actttttgtg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaat 1020
atgaccatca gcacagccac agaacaactt agcaaatatg atgccaggaa gataaaccaa 1080
tacctgaggc atgtggagga atatgaactc caatttgtgt tccaactttg taagattacc 1140
ctgtctgctg aggtgatggc ttacctgcac aatatgaatg ccaacctgtt ggaggactgg 1200
aacattggac tgagccctcc tgtggctacc tccttggagg acaaatacag atatgtgagg 1260
agcacagcca tcacttgtca gagggaacaa cctccaacag agaagcagga cccactggct 1320
aaatacaagt tctgggatgt gaacctccaa gactccttca gcacagacct ggaccagttt 1380
ccactgggca ggaagttcct gctccaagca ggactgaaag ccaagccaaa actgaaaagg 1440
gctgccccaa ccagcaccag gacctcctct gccaagagga agaaggtgaa gaagtaaa 1498
<210> 138
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5605 Синтетический ген L1 ПВЧ56
<400> 138
ctgggtacca tggctacctg gagaccatct gagaacaagg tctacctgcc tccaacacct 60
gtgagcaagg tggtggctac agactcctat gtgaagagga ccagcatctt ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactact ctgtgaccaa ggacaacacc 180
aagaccaaca tcccaaaggt gtctgcctac caatacaggg tgttcagggt gagactgcct 240
gacccaaaca agtttggact gcctgacacc aacatctaca accctgacca ggagagactg 300
gtgtgggctt gtgtgggatt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagc aggactgtct 360
ggacacccac tgttcaacag actggatgac acagagtcca gcaacctggc taacaacaat 420
gtgattgagg acagcaggga caacatctct gtggatggca agcagaccca actttgtatt 480
gtgggctgta ctcctgctat gggagaacac tggaccaagg gagcagtgtg taagagcacc 540
caggtgacca caggagactg tcctccactg gctctgataa acacaccaat tgaggatgga 600
gatatgattg acacaggctt tggagctatg gacttcaagg tgctccaaga gagcaaggct 660
gaggtgccac tggacattgt ccagagcact tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt 720
gctgatgcct atggagacag tatgtggttc tacctgagga gggaacaact ttttgccaga 780
cactacttca acagggctgg caaggtggga gagaccatcc ctgctgaact ctacctgaaa 840
ggcagcaatg gcagggaacc tcctccatcc tctgtctatg tggctacacc atctggcagt 900
atgattacct ctgaggctca acttttcaac aagccatact ggctccaaag ggctcaagga 960
cacaacaatg gcatctgttg gggcaaccaa ctttttgtga cagtggtgga caccaccagg 1020
agcaccaata tgaccatcag cacagccaca gaacaactta gcaaatatga tgccaggaag 1080
ataaaccaat acctgaggca tgtggaggaa tatgaactcc aatttgtgtt ccaactttgt 1140
aagattaccc tgtctgctga ggtgatggct tacctgcaca atatgaatgc caacctgttg 1200
gaggactgga acattggact gagccctcct gtggctacct ccttggagga caaatacaga 1260
tatgtgagga gcacagccat cacttgtcag agggaacaac ctccaacaga gaagcaggac 1320
ccactggcta aatacaagtt ctgggatgtg aacctccaag actccttcag cacagacctg 1380
gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg atgcaacttg gcaccaggag caagcctgct 1440
gtggctacca gcaagaagag gtctgcccca accagcacca gcacacctgc caagaggaag 1500
aggaggtaaa ctcgagctc 1519
<210> 139
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5606 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 139
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 140
<211> 33
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5607 Праймер F1 ПВЧ56L1
<400> 140
cttggtacca tggctacctg gagaccatct gag 33
<210> 141
<211> 31
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5608 Праймер R1 ПВЧ56L1
<400> 141
ctgcttggag caggaacttc ctgcccagtg g 31
<210> 142
<211> 1420
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5609 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ56L1
<400> 142
cttggtacca tggctacctg gagaccatct gagaacaagg tctacctgcc tccaacacct 60
gtgagcaagg tggtggctac agactcctat gtgaagagga ccagcatctt ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactact ctgtgaccaa ggacaacacc 180
aagaccaaca tcccaaaggt gtctgcctac caatacaggg tgttcagggt gagactgcct 240
gacccaaaca agtttggact gcctgacacc aacatctaca accctgacca ggagagactg 300
gtgtgggctt gtgtgggatt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagc aggactgtct 360
ggacacccac tgttcaacag actggatgac acagagtcca gcaacctggc taacaacaat 420
gtgattgagg acagcaggga caacatctct gtggatggca agcagaccca actttgtatt 480
gtgggctgta ctcctgctat gggagaacac tggaccaagg gagcagtgtg taagagcacc 540
caggtgacca caggagactg tcctccactg gctctgataa acacaccaat tgaggatgga 600
gatatgattg acacaggctt tggagctatg gacttcaagg tgctccaaga gagcaaggct 660
gaggtgccac tggacattgt ccagagcact tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt 720
gctgatgcct atggagacag tatgtggttc tacctgagga gggaacaact ttttgccaga 780
cactacttca acagggctgg caaggtggga gagaccatcc ctgctgaact ctacctgaaa 840
ggcagcaatg gcagggaacc tcctccatcc tctgtctatg tggctacacc atctggcagt 900
atgattacct ctgaggctca acttttcaac aagccatact ggctccaaag ggctcaagga 960
cacaacaatg gcatctgttg gggcaaccaa ctttttgtga cagtggtgga caccaccagg 1020
agcaccaata tgaccatcag cacagccaca gaacaactta gcaaatatga tgccaggaag 1080
ataaaccaat acctgaggca tgtggaggaa tatgaactcc aatttgtgtt ccaactttgt 1140
aagattaccc tgtctgctga ggtgatggct tacctgcaca atatgaatgc caacctgttg 1200
gaggactgga acattggact gagccctcct gtggctacct ccttggagga caaatacaga 1260
tatgtgagga gcacagccat cacttgtcag agggaacaac ctccaacaga gaagcaggac 1320
ccactggcta aatacaagtt ctgggatgtg aacctccaag actccttcag cacagacctg 1380
gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaagcag 1420
<210> 143
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5610 Праймер F2 ПВЧ56L1
<400> 143
gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc caagcc 36
<210> 144
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5611 Праймер R2 ПВЧ56L1
<400> 144
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 145
<211> 116
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5612 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ56L1
<400> 145
gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc caagccaaaa ctgaaaaggg ctgccccaac 60
cagcaccagg acctcctctg ccaagaggaa gaaggtgaag aagtaaatct agacag 116
<210> 146
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5613 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 146
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 147
<211> 473
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5801 Последовательность аминокислот aa 1-473 белка L1 ПВЧ типа 58
<400> 147
Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly Asn Pro
35 40 45
Tyr Phe Ser Ile Lys Ser Pro Asn Asn Asn Lys Lys Val Leu Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Ile Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Val Gly Val Ser Gly His Pro Tyr Leu Asn Lys Phe Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Thr Ser Asn Arg Tyr Pro Ala Gln Pro Gly Ser Asp Asn
130 135 140
Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile
145 150 155 160
Gly Cys Lys Pro Pro Thr Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Val Ala Cys
165 170 175
Asn Asn Asn Ala Ala Ala Thr Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Phe Asn
180 185 190
Ser Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Cys Met
195 200 205
Asp Phe Gly Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile
210 215 220
Cys Asn Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ala Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Lys Leu Gly Glu Ala Val Pro
260 265 270
Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Thr Ala Val Ile Gln Ser
275 280 285
Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Glu Ser
290 295 300
Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Thr Glu Val Thr Lys Glu Gly
340 345 350
Thr Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Val Arg His Val Glu Glu
355 360 365
Tyr Asp Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala
370 375 380
Glu Ile Met Thr Tyr Ile His Thr Met Asp Ser Asn Ile Leu Glu Asp
385 390 395 400
Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Gln Asp Thr
405 410 415
Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Thr Ala Pro
420 425 430
Pro Lys Glu Lys Glu Asp Pro Leu Asn Lys Tyr Thr Phe Trp Glu Val
435 440 445
Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly
450 455 460
Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ser Gly Leu
465 470
<210> 148
<211> 26
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5802 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа 33
<400> 148
Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr
1 5 10 15
Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys
20 25
<210> 149
<211> 499
<212> PRT
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5803 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа 58
<400> 149
Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val
1 5 10 15
Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly Asn Pro
35 40 45
Tyr Phe Ser Ile Lys Ser Pro Asn Asn Asn Lys Lys Val Leu Val Pro
50 55 60
Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp
65 70 75 80
Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr
85 90 95
Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Ile Gly Arg Gly Gln
100 105 110
Pro Leu Gly Val Gly Val Ser Gly His Pro Tyr Leu Asn Lys Phe Asp
115 120 125
Asp Thr Glu Thr Ser Asn Arg Tyr Pro Ala Gln Pro Gly Ser Asp Asn
130 135 140
Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile
145 150 155 160
Gly Cys Lys Pro Pro Thr Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Val Ala Cys
165 170 175
Asn Asn Asn Ala Ala Ala Thr Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Phe Asn
180 185 190
Ser Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Cys Met
195 200 205
Asp Phe Gly Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile
210 215 220
Cys Asn Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ala Ser Glu
225 230 235 240
Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe
245 250 255
Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Lys Leu Gly Glu Ala Val Pro
260 265 270
Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Thr Ala Val Ile Gln Ser
275 280 285
Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Glu Ser
290 295 300
Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Thr Glu Val Thr Lys Glu Gly
340 345 350
Thr Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Val Arg His Val Glu Glu
355 360 365
Tyr Asp Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala
370 375 380
Glu Ile Met Thr Tyr Ile His Thr Met Asp Ser Asn Ile Leu Glu Asp
385 390 395 400
Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Gln Asp Thr
405 410 415
Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Thr Ala Pro
420 425 430
Pro Lys Glu Lys Glu Asp Pro Leu Asn Lys Tyr Thr Phe Trp Glu Val
435 440 445
Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly
450 455 460
Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ser Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys
465 470 475 480
Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys
485 490 495
Val Lys Lys
<210> 150
<211> 1501
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5804 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ типа 58
<400> 150
atgagcgtgt ggaggcccag cgaggccacc gtgtacctgc cccccgtgcc cgtgagcaag 60
gtggtgagca ccgacgagta cgtgagcagg accagcatct actactacgc cggcagcagc 120
aggctgctgg ccgtgggcaa cccctacttc agcatcaaga gccccaacaa caacaagaag 180
gtgctggtgc ccaaggtgag cggcctgcag tacagggtgt tcagggtgag gctgcccgac 240
cccaacaagt tcggcttccc cgacaccagc ttctacaacc ccgacaccca gaggctggtg 300
tgggcctgcg tgggcctgga gatcggcagg ggccagcccc tgggcgtggg cgtgagcggc 360
cacccctacc tgaacaagtt cgacgacacc gagaccagca acaggtaccc cgcccagccc 420
ggcagcgaca acagggagtg cctgagcatg gactacaagc agacccagct gtgcctgatc 480
ggctgcaagc cccccaccgg cgagcactgg ggcaagggcg tggcctgcaa caacaacgcc 540
gccgccaccg actgcccccc cctggagctg ttcaacagca tcatcgagga cggcgacatg 600
gtggacaccg gcttcggctg catggacttc ggcaccctgc aggccaacaa gagcgacgtg 660
cccatcgaca tctgcaacag cacctgcaag taccccgact acctgaagat ggccagcgag 720
ccctacggcg acagcctgtt cttcttcctg aggagggagc agatgttcgt gaggcacttc 780
ttcaacaggg ccggcaagct gggcgaggcc gtgcccgacg acctgtacat caagggcagc 840
ggcaacaccg ccgtgatcca gagcagcgcc ttcttcccca cccccagcgg cagcatcgtg 900
accagcgaga gccagctgtt caacaagccc tactggctgc agagggccca gggccacaac 960
aacggcatct gctggggcaa ccagctgttc gtgaccgtgg tggacaccac caggagcacc 1020
aacatgaccc tgtgcaccga ggtgaccaag gagggcacct acaagaacga caacttcaag 1080
gagtacgtga ggcacgtgga ggagtacgac ctgcagttcg tgttccagct gtgcaagatc 1140
accctgaccg ccgagatcat gacctacatc cacaccatgg acagcaacat cctggaggac 1200
tggcagttcg gcctgacccc cccccccagc gccagcctgc aggacaccta caggttcgtg 1260
accagccagg ccatcacctg ccagaagacc gcccccccca aggagaagga ggaccccctg 1320
aacaagtaca ccttctggga ggtgaacctg aaggagaagt tcagcgccga cctggaccag 1380
ttccccctgg gcaggaagtt cctgctgcag agcggcctga aagccaagcc aaaactgaaa 1440
agggctgccc caaccagcac caggacctcc tctgccaaga ggaagaaggt gaagaagtaa 1500
a 1501
<210> 151
<211> 1516
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5805 Синтетический ген L1 ПВЧ58
<400> 151
ctgggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc 60
gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc 120
ggcagcagca ggctgctggc cgtgggcaac ccctacttca gcatcaagag ccccaacaac 180
aacaagaagg tgctggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg 240
ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgacacccag 300
aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag atcggcaggg gccagcccct gggcgtgggc 360
gtgagcggcc acccctacct gaacaagttc gacgacaccg agaccagcaa caggtacccc 420
gcccagcccg gcagcgacaa cagggagtgc ctgagcatgg actacaagca gacccagctg 480
tgcctgatcg gctgcaagcc ccccaccggc gagcactggg gcaagggcgt ggcctgcaac 540
aacaacgccg ccgccaccga ctgccccccc ctggagctgt tcaacagcat catcgaggac 600
ggcgacatgg tggacaccgg cttcggctgc atggacttcg gcaccctgca ggccaacaag 660
agcgacgtgc ccatcgacat ctgcaacagc acctgcaagt accccgacta cctgaagatg 720
gccagcgagc cctacggcga cagcctgttc ttcttcctga ggagggagca gatgttcgtg 780
aggcacttct tcaacagggc cggcaagctg ggcgaggccg tgcccgacga cctgtacatc 840
aagggcagcg gcaacaccgc cgtgatccag agcagcgcct tcttccccac ccccagcggc 900
agcatcgtga ccagcgagag ccagctgttc aacaagccct actggctgca gagggcccag 960
ggccacaaca acggcatctg ctggggcaac cagctgttcg tgaccgtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca acatgaccct gtgcaccgag gtgaccaagg agggcaccta caagaacgac 1080
aacttcaagg agtacgtgag gcacgtggag gagtacgacc tgcagttcgt gttccagctg 1140
tgcaagatca ccctgaccgc cgagatcatg acctacatcc acaccatgga cagcaacatc 1200
ctggaggact ggcagttcgg cctgaccccc ccccccagcg ccagcctgca ggacacctac 1260
aggttcgtga ccagccaggc catcacctgc cagaagaccg ccccccccaa ggagaaggag 1320
gaccccctga acaagtacac cttctgggag gtgaacctga aggagaagtt cagcgccgac 1380
ctggaccagt tccccctggg caggaagttc ctgctgcaga gcggcctgaa ggccaagccc 1440
aggctgaaga ggagcgcccc caccaccagg gcccccagca ccaagaggaa gaaggtgaag 1500
aagtaaactc gagctc 1516
<210> 152
<211> 1519
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5806 Синтетический ген L1 ПВЧ33
<400> 152
ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct 60
gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct 120
ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat 180
gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga 240
ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag 300
agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc 360
atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct 420
ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt 480
tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc 540
aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag 660
tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg 720
acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg 780
agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc 840
aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc 900
agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa 960
ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag 1080
aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt 1140
tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc 1200
ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac 1260
aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag 1320
gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac 1380
ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca 1440
aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg 1500
aagaagtaaa ctcgagctc 1519
<210> 153
<211> 34
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5807 Праймер F1 ПВЧ58L1
<400> 153
cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gagg 34
<210> 154
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5808 Праймер R1 ПВЧ58L1
<400> 154
gcttggcttt caggccgctc tgcagcagga acttcc 36
<210> 155
<211> 1438
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5809 Амплифицированная последовательность 1 ПВЧ58L1
<400> 155
cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc 60
gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc 120
ggcagcagca ggctgctggc cgtgggcaac ccctacttca gcatcaagag ccccaacaac 180
aacaagaagg tgctggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg 240
ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgacacccag 300
aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag atcggcaggg gccagcccct gggcgtgggc 360
gtgagcggcc acccctacct gaacaagttc gacgacaccg agaccagcaa caggtacccc 420
gcccagcccg gcagcgacaa cagggagtgc ctgagcatgg actacaagca gacccagctg 480
tgcctgatcg gctgcaagcc ccccaccggc gagcactggg gcaagggcgt ggcctgcaac 540
aacaacgccg ccgccaccga ctgccccccc ctggagctgt tcaacagcat catcgaggac 600
ggcgacatgg tggacaccgg cttcggctgc atggacttcg gcaccctgca ggccaacaag 660
agcgacgtgc ccatcgacat ctgcaacagc acctgcaagt accccgacta cctgaagatg 720
gccagcgagc cctacggcga cagcctgttc ttcttcctga ggagggagca gatgttcgtg 780
aggcacttct tcaacagggc cggcaagctg ggcgaggccg tgcccgacga cctgtacatc 840
aagggcagcg gcaacaccgc cgtgatccag agcagcgcct tcttccccac ccccagcggc 900
agcatcgtga ccagcgagag ccagctgttc aacaagccct actggctgca gagggcccag 960
ggccacaaca acggcatctg ctggggcaac cagctgttcg tgaccgtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca acatgaccct gtgcaccgag gtgaccaagg agggcaccta caagaacgac 1080
aacttcaagg agtacgtgag gcacgtggag gagtacgacc tgcagttcgt gttccagctg 1140
tgcaagatca ccctgaccgc cgagatcatg acctacatcc acaccatgga cagcaacatc 1200
ctggaggact ggcagttcgg cctgaccccc ccccccagcg ccagcctgca ggacacctac 1260
aggttcgtga ccagccaggc catcacctgc cagaagaccg ccccccccaa ggagaaggag 1320
gaccccctga acaagtacac cttctgggag gtgaacctga aggagaagtt cagcgccgac 1380
ctggaccagt tccccctggg caggaagttc ctgctgcaga gcggcctgaa agccaagc 1438
<210> 156
<211> 35
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5810 Праймер F2 ПВЧ58L1
<400> 156
gagcggcctg aaagccaagc caaaactgaa aaggg 35
<210> 157
<211> 36
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5811 Праймер R2 ПВЧ58L1
<400> 157
ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg 36
<210> 158
<211> 101
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5812 Амплифицированная последовательность 2 ПВЧ58L1
<400> 158
gagcggcctg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc 60
ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g 101
<210> 159
<211> 38
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5813 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 159
Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg
1 5 10 15
Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg
20 25 30
Arg Lys Ser Ser Arg Lys
35
<210> 160
<211> 508
<212> PRT
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5901 Последовательность аминокислот белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 160
Met Ala Leu Trp Arg Ser Ser Asp Asn Lys Val Tyr Leu Pro Pro Pro
1 5 10 15
Ser Val Ala Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Ser
20 25 30
Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro
35 40 45
Tyr Phe Lys Val Pro Lys Gly Gly Asn Gly Arg Gln Asp Val Pro Lys
50 55 60
Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Lys Leu Pro Asp Pro
65 70 75 80
Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Asn Thr Val Tyr Asp Pro Asn Ser Gln
85 90 95
Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Ile Gly Arg Gly Gln Pro
100 105 110
Leu Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Tyr Asn Lys Leu Asp Asp
115 120 125
Thr Glu Asn Ser His Val Ala Ser Ala Val Asp Thr Lys Asp Thr Arg
130 135 140
Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly
145 150 155 160
Cys Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Thr Lys Gly Thr Ala Cys Lys
165 170 175
Pro Thr Thr Val Val Gln Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Asn
180 185 190
Thr Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met
195 200 205
Asp Phe Lys Leu Leu Gln Asp Asn Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile
210 215 220
Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp
225 230 235 240
Ala Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Val Phe
245 250 255
Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ser Gly Thr Met Gly Asp Gln Leu Pro
260 265 270
Glu Ser Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Asp Ile Arg Ala Asn Pro Gly Ser
275 280 285
Tyr Leu Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Val Val Thr Ser Asp Ser
290 295 300
Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly Leu Asn
305 310 315 320
Asn Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Leu Thr Val Val Asp Thr
325 330 335
Thr Arg Ser Thr Asn Leu Ser Val Cys Ala Ser Thr Thr Ser Ser Ile
340 345 350
Pro Asn Val Tyr Thr Pro Thr Ser Phe Lys Glu Tyr Ala Arg His Val
355 360 365
Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu
370 375 380
Thr Thr Glu Val Met Ser Tyr Ile His Asn Met Asn Thr Thr Ile Leu
385 390 395 400
Glu Asp Trp Asn Phe Gly Val Thr Pro Pro Pro Thr Ala Ser Leu Val
405 410 415
Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Ala Ala Val Thr Cys Gln Lys Asp
420 425 430
Thr Ala Pro Pro Val Lys Gln Asp Pro Tyr Asp Lys Leu Lys Phe Trp
435 440 445
Pro Val Asp Leu Lys Glu Arg Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro
450 455 460
Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr
465 470 475 480
Ile Gly Pro Arg Lys Arg Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser
485 490 495
Pro Lys Arg Val Lys Arg Arg Lys Ser Ser Arg Lys
500 505
<210> 161
<211> 1528
<212> ДНК
<213> Homo sapiens
<220>
<223> 5902 Последовательность нуклеотидов гена белка L1 ПВЧ типа 59
<400> 161
atggctctgt ggaggtcctc tgacaacaag gtctacctgc ctcctccatc tgtggctaag 60
gtggtgagca cagatgaata tgtgaccagg accagcatct tctaccatgc tggctccagc 120
agactgctga cagtgggaca cccatacttc aaggtgccaa agggaggcaa tggcagacag 180
gatgtgccaa aggtgtctgc ctaccaatac agggtgttca gggtgaaact gcctgaccca 240
aacaagtttg gactgcctga caacacagtc tatgacccaa acagccagag actggtgtgg 300
gcttgtgtgg gagtggagat tggcagggga caaccactgg gagtgggact gtctggacac 360
ccactctaca acaaactgga tgacacagag aactctcatg tggcatctgc tgtggacacc 420
aaggacacca gggacaatgt gtctgtggac tacaagcaga cccaactttg tatcattggc 480
tgtgtgcctg ccattggaga acactggacc aagggcacag cctgtaagcc aaccacagtg 540
gtccagggag actgtcctcc attggaactg ataaacacac caattgagga tggagatatg 600
gtggacacag gctatggagc tatggacttc aaactgctcc aagacaacaa gtctgaggtg 660
ccactggaca tctgtcagag catctgtaaa taccctgact acctccaaat gagtgctgat 720
gcctatggag acagtatgtt cttctgtctg aggagggaac aggtgtttgc cagacacttc 780
tggaacaggt ctggcacaat gggagaccaa cttcctgagt ccctctacat caagggcaca 840
gacatcaggg ctaaccctgg ctcctacctc tacagcccaa gcccatctgg ctctgtggtg 900
acctctgaca gccaactttt caacaagcca tactggctgc acaaggctca aggactgaac 960
aatggcatct gttggcacaa ccaacttttc ctgacagtgg tggacaccac caggagcacc 1020
aacctgtctg tgtgtgccag caccacctcc agcatcccaa atgtctacac accaacctcc 1080
ttcaaggaat atgccaggca tgtggaggag tttgacctcc aattcatctt ccaactttgt 1140
aagattaccc tgaccacaga ggtgatgagt tacatccaca atatgaacac caccatcttg 1200
gaggactgga actttggagt gacacctcct ccaacagcct ccctggtgga cacctacagg 1260
tttgtccagt ctgctgctgt gacttgtcag aaggacacag cccctcctgt gaagcaggac 1320
ccatatgaca aactgaagtt ctggcctgtg gacctgaaag agaggttctc tgctgacctg 1380
gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaacttg gagccagacc aaagccaacc 1440
attggaccaa ggaagagggc tgcccctgcc ccaaccagca caccaagccc aaagagggtg 1500
aagaggagga agtccagcag gaagtaaa 1528
<210> 162
<211> 1546
<212> ДНК
<213> Искусственная последовательность
<220>
<223> 5903 Синтетический ген L1 ПВЧ59
<400> 162
ctgggtacca tggctctgtg gaggtcctct gacaacaagg tctacctgcc tcctccatct 60
gtggctaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccagcatctt ctaccatgct 120
ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtgccaaa gggaggcaat 180
ggcagacagg atgtgccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaaactg 240
cctgacccaa acaagtttgg actgcctgac aacacagtct atgacccaaa cagccagaga 300
ctggtgtggg cttgtgtggg agtggagatt ggcaggggac aaccactggg agtgggactg 360
tctggacacc cactctacaa caaactggat gacacagaga actctcatgt ggcatctgct 420
gtggacacca aggacaccag ggacaatgtg tctgtggact acaagcagac ccaactttgt 480
atcattggct gtgtgcctgc cattggagaa cactggacca agggcacagc ctgtaagcca 540
accacagtgg tccagggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacacc aattgaggat 600
ggagatatgg tggacacagg ctatggagct atggacttca aactgctcca agacaacaag 660
tctgaggtgc cactggacat ctgtcagagc atctgtaaat accctgacta cctccaaatg 720
agtgctgatg cctatggaga cagtatgttc ttctgtctga ggagggaaca ggtgtttgcc 780
agacacttct ggaacaggtc tggcacaatg ggagaccaac ttcctgagtc cctctacatc 840
aagggcacag acatcagggc taaccctggc tcctacctct acagcccaag cccatctggc 900
tctgtggtga cctctgacag ccaacttttc aacaagccat actggctgca caaggctcaa 960
ggactgaaca atggcatctg ttggcacaac caacttttcc tgacagtggt ggacaccacc 1020
aggagcacca acctgtctgt gtgtgccagc accacctcca gcatcccaaa tgtctacaca 1080
ccaacctcct tcaaggaata tgccaggcat gtggaggagt ttgacctcca attcatcttc 1140
caactttgta agattaccct gaccacagag gtgatgagtt acatccacaa tatgaacacc 1200
accatcttgg aggactggaa ctttggagtg acacctcctc caacagcctc cctggtggac 1260
acctacaggt ttgtccagtc tgctgctgtg acttgtcaga aggacacagc ccctcctgtg 1320
aagcaggacc catatgacaa actgaagttc tggcctgtgg acctgaaaga gaggttctct 1380
gctgacctgg accagtttcc actgggcagg aagttcctgc tccaacttgg agccagacca 1440
aagccaacca ttggaccaag gaagagggct gcccctgccc caaccagcac accaagccca 1500
aagagggtga agaggaggaa gtccagcagg aagtaaactc gagctc 1546
<---
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА | 2020 |
|
RU2808002C2 |
РЕКОМБИНАНТНЫЕ ВАКЦИНЫ ОТ FMDV И ИХ ПРИМЕНЕНИЕ | 2015 |
|
RU2745373C2 |
МУЛЬТИВАЛЕНТНЫЕ PD-L1-СВЯЗЫВАЮЩИЕ СОЕДИНЕНИЯ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ ЗЛОКАЧЕСТВЕННЫХ НОВООБРАЗОВАНИЙ | 2020 |
|
RU2816646C2 |
МУЛЬТИМЕРИЗУЮЩИЕСЯ ПОЛИПЕПТИДЫ, ПРОИСХОДЯЩИЕ ОТ ДОМЕНА С УКЛАДКОЙ ТИПА РУЛЕТ ОСНОВАНИЯ ПЕНТОНА АДЕНОВИРУСА | 2019 |
|
RU2820522C2 |
МОНОСПЕЦИФИЧЕСКИЕ И БИСПЕЦИФИЧЕСКИЕ БЕЛКИ С РЕГУЛИРОВАНИЕМ ИММУННОЙ КОНТРОЛЬНОЙ ТОЧКИ ДЛЯ ЛЕЧЕНИЯ РАКА | 2018 |
|
RU2793167C2 |
БИФУНКЦИОНАЛЬНЫЕ БЕЛКИ, КОМБИНИРУЮЩИЕ БЛОКАДУ КОНТРОЛЬНОЙ ТОЧКИ, ДЛЯ ТАРГЕТНОЙ ТЕРАПИИ | 2019 |
|
RU2756899C1 |
НОВЫЙ СЛИТЫЙ БЕЛОК, СПЕЦИФИЧНЫЙ ДЛЯ CD137 И PD-L1 | 2019 |
|
RU2818349C2 |
СЛИТЫЕ БЕЛКИ С АЛЬБУМИН-СВЯЗЫВАЮЩИМИ ДОМЕНАМИ | 2018 |
|
RU2786444C2 |
ВИРУСОПОДОБНЫЕ ЧАСТИЦЫ С ВЫСОКОПЛОТНЫМ ПОКРЫТИЕМ ДЛЯ ИНДУКЦИИ ЭКСПРЕССИИ АНТИТЕЛ | 2017 |
|
RU2813282C2 |
АНТИТЕЛО-ПОДОБНЫЕ СВЯЗЫВАЮЩИЕ БЕЛКИ С ДВОЙНЫМИ ВАРИАБЕЛЬНЫМИ ОБЛАСТЯМИ, ИМЕЮЩИЕ ОРИЕНТАЦИЮ СВЯЗЫВАЮЩИХ ОБЛАСТЕЙ КРЕСТ-НАКРЕСТ | 2012 |
|
RU2823693C2 |
Изобретение относится к биотехнологии. Описана мультивалентная иммуногенная композиция папилломавируса человека (ПВЧ) для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ, содержащая: вирусоподобные частицы ПВЧ, собранные из белка L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 52, 56, 58 и 59, отличающаяся тем, что по меньшей мере одна из указанных вирусоподобных частиц ПВЧ представляет собой химерную вирусоподобную частицу ПВЧ, где химерный белок L1 ПВЧ включает по направлению с его N-конца до С-конца: а. N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа, где указанный N-концевой фрагмент сохраняет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа, при этом указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58 и одного или более других патогенных типов ПВЧ; и б. С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа, где указанный белок L1 папилломавируса второго типа имеет лучший уровень экспрессии и растворимость по сравнению с белками L1 других типов; при этом указанный химерный белок L1 ПВЧ имеет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа. Также описан способ предотвращения заболевания или инфекции, связанной с ПВЧ, включающий введение субъекту указанной мультивалентной иммуногенной композиции ПВЧ. Представлено применение указанной мультивалентной иммуногенной композиции ПВЧ для получения вакцин или лекарственных средств для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ. Изобретение направлено на расширение арсенала средств для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ. 3 н. и 12 з.п. ф-лы, 4 ил., 18 табл., 6 пр.
1. Мультивалентная иммуногенная композиция папилломавируса человека (ПВЧ) для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ, содержащая:
вирусоподобные частицы ПВЧ, собранные из белка L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 52, 56, 58 и 59, отличающаяся тем, что по меньшей мере одна из указанных вирусоподобных частиц ПВЧ представляет собой химерную вирусоподобную частицу ПВЧ, где химерный белок L1 ПВЧ включает по направлению с его N-конца до С-конца:
а. N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа, где указанный N-концевой фрагмент сохраняет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа, при этом указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58, и одного или более других патогенных типов ПВЧ; и
б. С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа, где указанный белок L1 папилломавируса второго типа имеет лучший уровень экспрессии и растворимость по сравнению с белками L1 других типов;
при этом указанный химерный белок L1 ПВЧ имеет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа.
2. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 1, отличающаяся тем, что указанный N-концевой фрагмент представляет собой фрагмент, полученный укорочением С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в любом положении аминокислоты внутри участка α5, и фрагмента, имеющего по меньшей мере 98% идентичность с ним; и
указанный С-концевой фрагмент представляет собой фрагмент, полученный укорочением N-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса второго типа в любом положении аминокислоты внутри участка α5, и функциональные варианты, полученные в результате дальнейших мутаций, делеций и/или добавлений к фрагменту.
3. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 2, отличающаяся тем, что указанный С-концевой фрагмент содержит одну или более последовательностей ядерной локализации.
4. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 1, отличающаяся тем, что указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из белка L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 или 58,
предпочтительно выбранного из
белка L1 ПВЧ типа 6, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 5,
белка L1 ПВЧ типа 11, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 18,
белка L1 ПВЧ типа 16, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 31,
белка L1 ПВЧ типа 18, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 44,
белка L1 ПВЧ типа 31, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 57,
белка L1 ПВЧ типа 35, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 73,
белка L1 ПВЧ типа 39, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 86,
белка L1 ПВЧ типа 45, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 99,
белка L1 ПВЧ типа 51, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 112,
белка L1 ПВЧ типа 52, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 125,
белка L1 ПВЧ типа 56, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 138, или
белка L1 ПВЧ типа 58, кодируемого геном, приведенным в SEQ ID No: 151,
предпочтительно указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типов 1, 2, 3, 4, 6, 7, 10, 11, 13, 16, 18, 22, 26, 28, 31, 32, 33, 35, 39, 42, 44, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 60, 63, 66, 68, 73 или 82;
предпочтительно указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типов 16, 28, 33, 59 или 68;
более предпочтительно указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типа 33 или ПВЧ типа 59.
5. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 4, отличающаяся тем, что указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 2; или фрагмент, имеющий длину из m1 аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий положения аминокислот 1-m1 SEQ ID No: 2; при этом m1 представляет собой целое число в диапазоне 8-26; или указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 135; или фрагмент, имеющий длину из m2 аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий аминокислоты в положениях 1-m2 SEQ ID No: 135; при этом m2 представляет собой целое число в диапазоне 13-31.
6. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 5, отличающаяся тем, что указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 13; или фрагмент, имеющий длину из n аминокислот, предпочтительно включающий аминокислоты в положениях 1-n SEQ ID No: 13; при этом n представляет собой целое число в диапазоне 16-38.
7. Мультивалентная ПВЧ иммуногенная композиция по п. 1, отличающаяся тем, что
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 6 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 1 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 11 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 14 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 16 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 27 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 18 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 40 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 31 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 53 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 35 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 69 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 39 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 82 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 45 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 95 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 51 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 108 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 52 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 121 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5;
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 56 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 134 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5; и
указанный N-концевой фрагмент указанного белка L1 ПВЧ типа 58 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5%, 99% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца последовательности, показанной в SEQ ID No: 147 в месте любой аминокислоты внутри ее участка альфа 5.
8. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 1, отличающаяся тем, что С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного С-концевого фрагмента напрямую или посредством линкера.
9. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 1, отличающаяся тем, что, когда С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного С-концевого фрагмента, непрерывная последовательность аминокислот RKFL присутствует внутри диапазона положений плюс или минус 4 аминокислоты от точки соединения, предпочтительно непрерывная последовательность аминокислот LGRKFL присутствует внутри диапазона положений плюс или минус 6 аминокислот от точки соединения.
10. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 1, отличающаяся тем, что
указанный химерный белок L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 и 58 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с SEQ ID No: 3, SEQ ID No: 16, SEQ ID No: 29, SEQ ID No: 42, SEQ ID No: 55, SEQ ID No: 71, SEQ ID No: 84, SEQ ID No: 97, SEQ ID No: 110, SEQ ID No: 123, SEQ ID No: 136 и SEQ ID No: 149 соответственно; и
белок L1 ПВЧ типа 33 и белок L1 ПВЧ типа 59 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с SEQ ID No: 66 и SEQ ID No: 160 соответственно,
предпочтительно включающая
химерный белок L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 и 58, белок L1 ПВЧ типа 33 и белок L1 ПВЧ типа 55,
при этом химерные белки L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 и 58 приведены в SEQ ID No: 3, SEQ ID No: 16, SEQ ID No: 29, SEQ ID No: 42, SEQ ID No: 55, SEQ ID No: 71, SEQ ID No: 84, SEQ ID No: 97, SEQ ID No: 110, SEQ ID No: 123, SEQ ID No: 136 и SEQ ID No: 149 соответственно, a
белок L1 ПВЧ типа 33 и белок L1 ПВЧ типа 55 приведены в SEQ ID No: 66 и SEQ ID No: 160 соответственно.
11. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 1, отличающаяся тем, что по меньшей мере одна из указанных вирусоподобных частиц ПВЧ состоит из химерного белка L1 ПВЧ одного типа, предпочтительно состоит из указанного химерного белка L1 ПВЧ одного типа, имеющего такую же последовательность аминокислот.
12. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по любому из пп. 1-11, отличающаяся тем, что указанная мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ дополнительно включает физиологически приемлемый носитель и, необязательно, адъювант.
13. Мультивалентная иммуногенная композиция ПВЧ по п. 12, отличающаяся тем, что указанный адъювант представляет собой адъювант фосфата алюминия.
14. Способ предотвращения заболевания или инфекции, связанной с ПВЧ, включающий введение субъекту мультивалентной иммуногенной композиции ПВЧ по любому из пп. 1-13.
15. Применение мультивалентной иммуногенной композиции ПВЧ по любому из пп. 1-13 для получения вакцин или лекарственных средств для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с ПВЧ.
US 20050244432 A1, 03.11.2005 | |||
ХИМЕРНАЯ ЧАСТИЦА HPV | 2012 |
|
RU2642287C2 |
УСТРОЙСТВО ДЛЯ УСТАНОВКИ ПЛАСТЫРЕЙ В ОБСАДНОЙ ТРУБЕ | 1998 |
|
RU2154149C2 |
Авторы
Даты
2023-10-31—Публикация
2020-07-17—Подача