ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА Российский патент 2023 года по МПК C07K14/25 

ОБЛАСТЬ ТЕХНИКИ, К КОТОРОЙ ОТНОСИТСЯ НАСТОЯЩЕЕ ИЗОБРЕТЕНИЕ

[0001] Настоящее изобретение относится к белку L1 папилломавируса (ПВЧ) и к кодирующему его полинуклеотиду, а также к вирусоподобным частицам ПВЧ и способу их получения.

УРОВЕНЬ ТЕХНИКИ OF НАСТОЯЩЕЕ ИЗОБРЕТЕНИЕ

[0002] Папилломавирус (PV) принадлежит к семейству Papillomaviridae и вызывает папилломы у человека, крупного рогатого скота, собак и кроликов. Один из его представителей, папилломавирус человека (ПВЧ), представляет собой безоболочечный ДНК-вирус.Геном этого вируса представляет собой двухцепочечную замкнутую кольцевую ДНК размером примерно 7,2-8 т.п.н. с 8 открытыми рамками считывания, которые можно разделить на три области в зависимости от их функций: (1) начальная область (Е), примерно 4,5 т.п.н., кодирующая белки E1, Е2, Е4-Е7, всего 6 неструктурных белков, связанных с репликацией, транскрипцией и трансформацией вируса; (2) конечная область (L), примерно 2,5 т.п.н., кодирующая основной капсидный белок L1 и минорный капсидный белок L2; (3) длинная регуляторная область (LCR), расположенная между концом L-области и началом Е-области, имеет длину примерно 800-900 п. н. и не кодирует какие-либо белки, выполняя функции регуляции репликации ДНК и экспрессии элементов.

[0003] Белки L1 и белки L2 синтезируются в конце инфекционного цикла ПВЧ. Белок L1 является основным белком капсида и имеет молекулярную массу 55-60 кДа. Белок L2 является минорным капсидным белком. 72 пентамера белка L1 образуют внешнюю оболочку икосаэдрической частицы ПВЧ (диаметром 45-55 нм), которая заключает в себе замкнутую кольцевую двухцепочечную ДНК. Белок L2 расположен на внутренней стороне белка LI (Structure of Small Virus-like Particles Assembled from the LI Protein of Human Papillomavirus 16, Chen, X.S., R. L.Garcea, Mol.Cell. 5(3):557-567, 2000).

[0004] ORF белка LI, наиболее консервативного гена в геноме ПВ, может использоваться для идентификации новых типов ПВ. Новый тип ПВ идентифицируют, если его полный геном клонирован и его последовательность ДНК ORF L1 отличается от ближайшего известного типа ПВ более чем на 10%. Гомологии с различиями от 2% до 10% определяются как разные подтипы, а различия менее 2% определяются как разные варианты одного и того же подтипа (Е.-М. de Villiers и др. / Virology 324 (2004) 17-27).

[0005] На поздних стадиях инфекции ПВЧ вновь синтезированные белки L1 в цитоплазме транспортируются в ядро терминально дифференцированного кератина, где вместе с белками L2 упаковывают реплицированную геномную ДНК ПВЧ с образованием инфекционных вирусов (Nelson, L.M, и др. 2002. Nuclear import strategies of high risk HPV16 LI major capsid protein. J. Biol. Chem. 277: 23958-23964). Это свидетельствует о том, что ядерный импорт белка L1 играет очень важную роль в инфицировании и продукции ПВЧ. Способность вируса проникать в ядро определяется сигналом ядерной локализации (СЯЛ) на С-конце белка ПВЧ L1, который характеризуется обилием в нем основных аминокислот (Garcia-Bustos, J., и др. 1991. Nuclear protein localization. Biochimica et Biophysica Acta 1071: 83-101).

[0006] 15 типов ПВЧ высокого риска (BP) могут приводить к раку шейки матки, ануса, полового члена, влагалища, вульвы и ротоглотки, среди которых ПВЧ-16 и ПВЧ-18 являются на сегодняшний день наиболее частыми причинами рака, составляя примерно 70% рака шейки матки, а остальные типы ВР-ПВЧ (типы 31,33, 35, 39,45, 51,52,56,58, 59, 68, 73 и 82) вызывают остальные заболевания. На ПВЧ-16 приходится примерно 95% случаев ПВЧ-положительного рака ротоглотки (РРГ). Персистирующие генотипы низкого риска ПВЧ-6 и ПВЧ-11 вызывают большинство аногенитальных бородавок и респираторных папиллом, но редко связаны с раком (Human papillomavirus in Cervical Cancer and Oropharyngeal Cancer: One Cause, Two Diseases Тага A. Bermanand John T. Schiller, PhD2 Cancer 2017;123:2219-29).

[0007] Белок LI может быть рекомбинантно экспрессирован поксвирусными, бакуловирусными или дрожжевыми системами, а затем он самостоятельно собирается с образованием вирусоподобных частиц (VLP), содержащих примерно 72 белка L1, подобных капсиду вируса. VLP не имеют обозначения. VLP индуцирует нейтрализующие антитела у привитых животных и защищает экспериментальных животных от последующего заражения инфекционными вирусами. Соответственно, VLP представляется отличным кандидатом для вакцин против папилломавируса (Structure of Small Virus-like Particles Assembled from the LI Protein of Human Papillomavirus 16 Chen, X.S., R. L. Garcea, Mol. Cell. 5(3):557-567, 2000).

[0008] CERVARIX® компании Glaxo, бивалентная рекомбинантная вакцина против ПВЧ, содержит рекомбинантный белок L1 ПВЧ тип 16 и рекомбинантный белок L1 ПВЧ тип 18. Белок L1 получают путем экспрессии векторной системы экспрессии рекомбинантного бакуловируса в клетках насекомых ночной бабочки (Trichoplusia ni). Белок L1 самостоятельно собирается в вирусоподобные частицы для профилактики рака шейки матки, цервикальной интраэпителиальной неоплазии 2 или 3 степени и аденокарциномы in situ, вызванной ПВЧ 16 и 18 типов, и цервикальной интраэпителиальной неоплазии 1 степени (онкогенной) у женщин в возрасте 9-25 лет (https://www.fda.gov/downloads/BiologicsBloodVaccines/Vaccines/ApprovedProducts/UCM18 6981.pdf).

[0009] GARDASIL® представляет собой четырехвалентную рекомбинантную вакцину против папилломавируса человека (типы 6, 11, 16и18)от Merck для профилактики рака шейки матки, остроконечных кондилом (condyloma acuminata) и предраковых или пролиферативных аномальных поражений, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16и 18у девочек и женщины в возрасте 9-26 лет; и для профилактики рака анального канала, остроконечных кондилом (condyloma acuminatum) и предраковых или аномалий развития, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16 и 18 у мальчиков и мужчин 9-26 лет (https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/vaccines/gardasil).

[0010] GARDASIL®9 представляет собой девятивалентную рекомбинантную вакцину против папилломавируса человека от Merck, которая содержит вирусоподобные частицы белка L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58, указанный белок L1 получают ферментацией Saccharomyces cerevisiae и он самостоятельно собирается в VLP. Ее применяют у девочек и женщин в возрасте 9-45 лет для профилактики рака шейки матки, рака вульвы, рака влагалища и рака анального канала, вызванных ПВЧ типов 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58, генитальных бородавок (остроконечных кондилом), вызванных ПВЧ типов 6 и 11, и предраковых или пролиферативных нарушений, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58; и у мальчиков и мужчин в возрасте 9-45 лет для профилактики рака анального канала, вызванного ПВЧ типов 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58, генитальных бородавок (остроконечных кондилом), вызванных ПВЧ типов 6 и 11 и предраковых состояний или аномалий развития, вызванных ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 33, 45, 52 и 58 (https://www.fda.gov/vaccines-blood-biologics/vaccines/gardasil-9).

[0011] В инструкции для GARDASIL®9 отмечается, что ПВЧ типов 16 и 18 являются причиной примерно 70% случаев рака шейки матки, а остальные 20% случаев относятся к типам 31, 33, 45, 52 и 58, поэтому GARDASIL®9 предотвращает 90% рака шейки матки (https://www.fda.gov/ BiologicsBloodVaccines/Vaccines/ApprovedProducts/ucm426445.htm).

[0012] Промышленное производство вирусоподобных частиц имеет решающее значение для разработки вакцины против ПВЧ. Общие системы для получения вирусоподобных частиц в основном подразделяются на эукариотические системы экспрессии и прокариотические системы экспрессии.

[0013] Обычно используемые эукариотические системы экспрессии включают системы экспрессии поксвирусов, системы экспрессии бакуловирусов насекомых и системы экспрессии дрожжей. Белок L1 ПВЧ, экспрессируемый в эукариотических экспрессионных системах, может спонтанно собираться в вирусоподобные частицы, так как его естественная конформация менее нарушена, но его выход невелик. Белок L1 ПВЧ, экспрессируемый в прокариотических системах экспрессии, в основном в системах экспрессии Е. coli, имеет высокие выходы, но в основном в форме телец включения, эта форма белка не может быть легко очищена, что усложняет производственный процесс.

[0014] Таким образом, по-прежнему существует потребность в получении высоких выходов вирусоподобных частиц ПВЧ.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ НАСТОЯЩЕГО ИЗОБРЕТЕНИЯ

[0015] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает химерный белок L1 папилломавируса, содержащий, в направлении от его N-конца к С-концу, а). N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа, где указанный N-концевой фрагмент сохраняет иммуногенность белка L1 соответствующего типа папилломавируса человека; и б). С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа, где указанный белок L1 папилломавируса второго типа имеет лучший уровень экспрессии и растворимость по сравнению с белками L1 других типов; при этом указанный химерный белок L1 папилломавируса имеет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа.

[0016] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает вирусоподобную частицу папилломавируса, содержащую химерный белок L1 папилломавируса.

[0017] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает иммуногенную композицию для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с папилломавирусом, содержащую вирусоподобные частицы папилломавирусов, описанные ранее, и адъюванты.

[0018] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает выделенный полинуклеотид, кодирующий химерный белок L1 папилломавируса.

[0019] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает вектор, содержащий полинуклеотид, кодирующий химерный белок L1 папилломавируса.

[0020] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает бакуловирус, содержащий полинуклеотид, кодирующий химерный белок L1 папилломавируса.

[0021] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает клетку-хозяина, содержащую указанные полинуклеотиды, указанные векторы или указанные бакуловирусы, описанные ранее.

[0022] В другом аспекте настоящее изобретение обеспечивает способ получения вирусоподобных частиц папилломавируса, включающий выращивание клеток-хозяев, описанных ранее для экспрессии указанного химерного белка L1 папилломавируса и и сборки в вирусоподобные частицы; и очистку указанных вирусоподобных частиц папилломавируса.

КРАТКОЕ ОПИСАНИЕ ЧЕРТЕЖЕЙ

[0023] На Фиг. 1А показана экспрессия белка L1 ПВЧ 6 LI:33С.М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0024] На Фиг. 1В показана экспрессия белка L1 ПВЧ 11 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0025] На Фиг. 1С показана экспрессия белка L1 ПВЧ 16 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0026] На Фиг. 1D показана экспрессия белка L1 ПВЧ 18 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0027] На Фиг. 1Е показана экспрессия белка L1 ПВЧ 31 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0028] На Фиг. 1F показана экспрессия белка L1 ПВЧ 35 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0029] На Фиг. 1G показана экспрессия белка L1 ПВЧ 39 LI: 59С.М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0030] На Фиг. Ш показана экспрессия белка L1 ПВЧ 45 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0031] На Фиг. II показана экспрессия белка L1 ПВЧ 51 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток;

E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0032] На Фиг. 1J показана экспрессия белка L1 ПВЧ 52 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0033] На Фиг. 1К показана экспрессия белка L1 ПВЧ 56 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0034] На Фиг. 1L показана экспрессия белка L1 ПВЧ 58 L1:33C. М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

[0035] На Фиг. 2А показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 6 L1:33C.

[0036] На Фиг. 2В показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 11 L1:33С.

[0037] На Фиг. 2С показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 16 L1:33С.

[0038] На Фиг. 2D показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 18 L1:33С.

[0039] На Фиг. 2Е показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 31 L1:33С.

[0040] На Фиг. 2F показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ35L1:33С.

[0041] На Фиг. 2G показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 39 LI: 59С.

[0042] На Фиг. 2Н показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 45L1:33C.

[0043] На Фиг. 2I показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 51 L1:33C.

[0044] На Фиг. 2J показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 52L1:33С.

[0045] На Фиг. 2К показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ56L1:33С.

[0046] На Фиг. 2L показана трансмиссионная электронная микроскопия вирусоподобных частиц ПВЧ 58 L1:33C.

[0047] На Фиг. 3 показана экспрессия укороченного с С-конца ПВЧ 16L1 (1-474). М: маркер; L: лизат клеток; E-S: супернатант, собранный после центрифугирования лизата.

КОНКРЕТНЫЕ ВАРИАНТЫ ОСУЩЕСТВЛЕНИЯ

[0048] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает химерный белок L1 папилломавируса, содержащий, в направлении от его N-конца к С-концу: а). N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса человека первого типа, где указанный N-концевой фрагмент сохраняет иммуногенность белка L1 соответствующего типа ПВЧ; и б). С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа, где указанный белок L1 папилломавируса второго типа имеет лучший уровень экспрессии и растворимость по сравнению с белками L1 других типов; при этом указанный химерный белок L1 папилломавируса имеет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа

[0049] В одном варианте реализации указанный N-концевой фрагмент представляет собой фрагмент, полученный посредством укорочения С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в положении любой аминокислоты внутри его участка α5, и фрагмент, имеющий по меньшей мере 98% идентичность с ним; указанный С-концевой фрагмент представляет собой фрагмент, полученный посредством укорочения N-конца природной последовательности белка L1 папилломавируса второго типа в положении любой аминокислоты внутри его участка α5 и функциональные варианты полученные в результате дальнейших мутаций, делеций и/или добавлений к фрагменту.

[0050] В другом варианте реализации указанный N-концевой фрагмент имеет по меньшей мере 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с фрагментом, полученным посредством укорочения С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в положении любой аминокислоты внутри его участка α5.

[0051] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент включает одну или множество последовательностей ядерной локализации.

[0052] В одном варианте реализации said белок L1 папилломавируса представляет собой белок L1 ПВЧ.

[0053] В одном варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белков L1 ПВЧ типов 1, 2, 3, 4, 6, 7, 10, 11, 13, 16, 18, 22, 26, 28, 31, 32, 33, 35, 39, 42, 44, 45, 51, 52, 53, 56, 58, 59, 60, 63, 66, 68, 73 или 82.

[0054] Предпочтительно, указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белков L1 ПВЧ типов 16, 28, 33, 59 или 68.

[0055] Более предпочтительно, указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белка L1 ПВЧ типа 33 или ПВЧ типа 59.

[0056] В одном варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса второго типа представляет собой белок L1 ПВЧ типа 33, где указанный С-концевой фрагмент представлят собой SEQ ID No: 2; или фрагмент, имеющий длину ml аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий аминокислоты в положениях 1-ml последовательности SEQ ID No: 2; при этом ml представляет собой целое число в диапазоне 8-26; или указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 132; или фрагмент, имеющий длину т2 аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий аминокислоты в положениях 1-т2 последовательности SEQ ID No: 132; при этом т2 представляет собой целое число в диапазоне 13-31.

[0057] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33 содержит последовательность ядерной локализации. В другом варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33 содержит две последовательности ядерной локализации. В некоторых вариантах реализации химерный белок L1 папилломавируса включает один или множество С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 33. Указанное множество С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 33 могут быть одинаковыми или различгыми. В одном варианте реализации указанная последовательность аминокислот с аминокислотами No: 7-8 (KR) и указанная последовательность аминокислот с аминокислотами No: 20-23 (KRKK) последовательности SEQ ID No: 2 являются последовательностями ядерной локализации указанных С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 33.

[0058] В другом варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса второго типа представляет собой белок L1 ПВЧ типа 59, указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 13; или фрагмент, имеющий длину п аминокислот, предпочтительно включающий аминокислоты в положениях 1 -п последовательности SEQ ID No: 13; при этом п представляет собой целое число в диапазоне 16-38.

[0059] В одном варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 59 содержит последовательность ядерной локализации. В другом варианте реализации указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 59 содержит две последовательности ядерной локализации. В некоторых вариантах реализации химерный белок L1 папилломавируса включает один или множество С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 59. Указанное множество С-концевых фрагментов белка L1 ПВЧ типа 59 могут быт одинаковыми или различными.

[0060] В одном варианте реализации указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из белков L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39,45, 51, 52, 56 или 58.

[0061] В одном варианте реализации С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного С-концевого фрагмента напрямую или посредством линкера.

[0062] Указанный линкер не влияет на иммуногенность указанного N-концевого фрагмента и не влияет на уровень экспрессии или растворимость белка. В одном варианте реализации указанный N-концевой фрагмент и указанный С-концевой фрагмент соединены посредством линкера, содержащего 1, 2, 3, 4, 5, 6, 7, 8, 9 или 10 аминокислот. В одном варианте реализации указаный линкер представляет собой искусственную последовательность. В другом варианте реализации указанный линкер представляет собой последовательность белка L1 ПВЧ, встречающуюся в природе. В другом варианте реализации указанный линкер может представлять собой часть последовательности белка L1 ПВЧ типа 33. В другом варианте реализации указанный линкер может представлять собой часть последовательности белка L1 ПВЧ типа 59.

[0063] В одном варианте реализации в положениях плюс или минус 4 аминокислота от точки соединения, когда С-конец указанного N-концевого фрагмент соединен с N-концом указанного С-концевого фрагмента, присутствует следующая постоянная последовательность аминокислот: RKFL; предпочтительно, в положениях плюс или минус 6 аминокислот от точки соединения, присутствует следующая постоянная последовательность аминокислот: LGRKFL.

[0064] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает вирусоподобные частицы папилломавируса, содержащие химерный белок L1 папилломавируса, описанный ранее. В одном варианте реализации указанные вирусоподобные частицы папилломавируса представляют собой вирусоподобные частицы ПВЧ, и в одном варианте реализации указанные вирусоподобные частицы ПВЧ представляют собой икосаэдр, содержащий 72 пентамера указанного химерного белка L1 ПВЧ. В одном варианте реализации указанная вирусоподобная частица ПВЧ содержит правильно образованные дисульфидные связи и, таким образом, имеет хорошую природную конформацию. В одном варианте реализации указанные ПВЧ вирусоподобные частицы собираются сами в системе экспрессии in vivo.

[0065] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает иммуногенную композицию для предотвращения заболевания или инфекции, связанной с папилломавирусом, содержащую вирусоподобные частицы папилломавируса, описанные ранее, и адъюванты. Упомянутое предотвращение может рассматриваться как лечение и указанные термины могут использоваться взаимозаменяемо.

[0066] В одном аспекте вышеописанную иммуногенную композицию вводят субъекту. В одном варианте реализации указанный субъект представляет собой человека. В одном варианте реализации указанный субъект представляет собой кролика. В одном варианте реализации указанный представляет собой собаку.

[0067] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает выделенный полинуклеотид, кодирующий химерный белок L1 папилломавируса, описанный ранее. В одном варианте реализации полинуклеотид представляет собой полинуклеотид с кодонами, оптимизированными для различных систем экспрессии. В одном варианте реализации полинуклеотид представляет собой полинуклеотид с кодонами, оптимизированными для экспрессии в бакуловирусной системе насекомых.

[0068] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает вектор, содержащий полинуклеотид описанный ранее. В одном варианте реализации указанный вектор представляет собой бакуловирусный вектор. В одном варианте реализации указанны вектор может представлять собой вектор переноса для бакуловирусной системы экспрессии. В другом варианте реализации указанным вектором может быть вектор экспрессии для бакуловирусной системы экспрессии. В другом варианте реализации указанный вектор может представлять собой рекомбинантный вектор для бакуловирусной системы экспрессии.

[0069] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает бакуловирус, содержащий полинуклеотид, описанный ранее.

[0070] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает клетку-хозяина, содержащую полинуклеотид, вектор или бакуловирус, описанные ранее. В одном варианте реализации указанная клетка-хозяин представляет собой клетку насекомого, предпочтительно, указанная клетка насекомого выбрана из клеток Sf9, клеток Sf21, клеток Hi5 и клеток S2.

[0071] В одном аспекте настоящее изобретение обеспечивает способ получения вирусоподобных частиц папилломавируса, описанных ранее, включающий: выращивание клеток-хозяев, описанных ранее, для экспрессии указанного химерного белка L1 папилломавируса, который собирается в вирусоподобные частицы; и очистку указанных вирусоподобные частицы папилломавируса.

[0072] В одном варианте реализации указанные клетки-хозяева представляют собой клетки насекомого. В одном варианте реализации указаные клетки-хозяева представляют собой клетки Hi5. В одном варианте реализации химерные белки L1 папилломавируса представляют собой химерные белки L1 ПВЧ, которые сами собираются в вирусоподобные частицы ПВЧ в клетках-хозяевах. В одном варианте реализации указанные химерные белки L1 ПВЧ сами собираются в вирусоподобные частицы ПВЧ в клетках-хозяевах, имеющие форму икосаэдра, содержащенр 72 пентамера указанного химерного белка L1 ПВЧ. В одном варианте реализации вирусоподобные частицы ПВЧ содержат правильно образованные дисульфидные связи и, таким образом, имеют хорошую природную конформацию.

[0073] В одном варианте реализации очистку осуществляют с использованием катионообменной хроматографии. В одном варианте реализации очистку осуществляют с использованием сильной катионообменной хроматографии. В другом варианте реализации очистку осуществляют с использованием слабой катионообменной хроматографии. В одном варианте реализации очистку осуществляют с использованием комбинации нескольких катионообменных хроматографии. В одном варианте реализации очистку осуществляют с использованием сильной HS катионообменной хроматографии. В другом варианте реализации очистку осуществляют с использованием ММА ионообменной хроматографии. В другом варианте реализации очистку осуществляют с использованием HS-MMA двухстадийной хроматографии.

[0074] Белки L1 папилломавируса, экспрессированные в эукариотических системах экспрессии, могут сами собираться в вирусоподобные частицы, но низкий уровень их экспрессии делает их неподходящими для массового производства.

[0075] Указанные последовательности белков L1 каждого типа ПВЧ могут быть легко получены из https://www.uniprot.org. Для перечисленных типов ПВЧ, белок L1 может быть получен из различных штаммов, таким образом указанная последовательность аминокислот может быть представлена в множестве вариантов, любой вариант природной последовательности может применяться в настоящем изобретении. Вполне возможно, что указанная последовательность белка L1 ПВЧ конкретного типа, использованная в рамках концепции и дизайна настоящего изобретения, может отличаться от последовательности, использованной в последующих примерах, но такие различия не влияют на решения и выводы авторов настоящего изобретения.

[0076] Специалистами в данной области техники общепринято, что С-конец белка L1 не содержит основной нейтрализующий антигенный эпитоп и поэтому попытки, осуществленные для повышения экспрессии посредством укорочения С-конца белка L1 ПВЧ, например, в патенте США US 6361778 B1 компании Glaxo, в котором С-конец белка L1 ПВЧ16 укорочен на 1-34 аминокислот, предпочтительно 26 аминокислот, подтверждают, что выход VLP увеличивается в несколько раз, предпочтительно по меньшей мере в 10 раз, и, в частности, от примерно 10 до 100 раз. Вдохновленные этим, авторы настоящего изобретения попытались укоротить С-конец белка L1 ПВЧ 16 на 31 аминокислоту и назвали укороченный белок L1 как белок L1 ПВЧ 16 (1-474). Указанный белок имеет высокий уровень экспрессии, но плохую растворимость, его трудно экстрагировать и очищать (см. Сравнительный Пример).

[0077] Плохая растворимость белка из-за этого укорочения может быть связана с делецией последовательности ядерной локализации, расположенной в С-конце, но настоящее изобретение не имеет отношения к этому предположению. В ходе исследований и производства авторы настоящего изобретения обнаружили, что белок L1 ПВЧ типа 16, белок L1 ПВЧ типа 28, белок L1 ПВЧ типа 33, белок L1 ПВЧ типа 59 и белок L1 ПВЧ типа 68 имели лучший уровень экспрессии и лучшие растворимости, чем белки L1 ПВЧ других типов. Вдохновленные этим открытием, авторы настоящего изобретения заменили С-конец белка L1 ПВЧ определенных типов, которые менее экстрагируемы или менее растворимы, на С-конец белка L1 определенных типов ПВЧ, имеющих лучший уровень экспрессии и лучшую растворимость. Таким образом авторы настоящего изобретения сконструировали химерный белок: содержащий, в направлении с N-конца к С-концу, N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа (например, белок L1 ПВЧ), который обеспечивает иммуногенность папилломавируса первого типа (например, ПВЧ), и С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа (например, белок L1 ПВЧ), который обеспечивает признаки лучшего уровня экспрессии и лучшей растворимости. Эти два фрагмента могут быть соединены напрямую или посредством линкера.

[0078] Длина N-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ такова, что сохраняется иммуногенность белка L1 ПВЧ первого типа и обеспечивается образование VLP, как это происходит с природым белком. Следующие сообщения относятся к изучению эпитопов распространенных типов ПВЧ.

[0079] Sunanda Baidya и др. сообщили, что следующие эпитопы белка L1 48EEYDLQFIFQLCKJTLTА65, 45RHGEEYDLQFIFQLCKITLTA65, 63LPDPNKF69, 79PETQRLVWAC88, 36PVPGQYDA43, 77YNPETQRLVWAC88, 188DTGYGAMD195, 36PVPGQYDATK45, 45KQDIPKVSAYQYRVFRV61, 130RDNVSVDYKQTQLCI144 и 49YSRHVEEYDLQFIF62 могут применяться в качестве инструмента для конструирования вакцин ПВЧ 16 и 18 (см. Epitope design of protein LI for vaccine production against human papillomavirus types 16 and 18, Bioinformation 13(3): 86-93 March 2017, целиком включена в настоящее описание посредством ссылки).

[0080] Katharina Slupetzky и др. сообщили, что участки рядом с аа 282-286 и 351-355 ПВЧ-16 имеют отношение к нейтрализующим эпитопам и что последний является иммунодоминантным сайтом (см. Himeric viral-like particles of papillomaviruses expressing a foreign epitope on capsid surface loops, Journal of General Virology (2001), 82, 2799-2804, целиком включена в настоящее описание посредством ссылки).

[0081] Brooke Bishop и др. сконструировали три варианта белка L1 ПВЧ 11, 16, 18 и 35: делеция 9 аминокислот в N-конце, делеция α4 (соответствует остаткам аминокислот 404-436 ПВЧ 16) и делеция 31 аминокислот в С-конце, соответственно, и сообщили, что первые два не могли собираться в VLP, но это явление не наблюдалось в последнем варианте (Crystal Structures of Four Types of Human Papillomavirus LI Capsid Proteins. UNDERSTANDING THE SPECIFICITY OF NEUTRALIZING MONOCLONAL ANTIBODIES, The Journal of Biological Chemistry, 282, 31803-31811. целиком включена в настоящее описание посредством ссылки). Каждый из участков α-спирали, β-складчатого слоя и петли каждого типа белка L1 ПВЧ может быть довольно просто определен с помощью программного обеспечения для анализа последовательностей, обычно используемого в данной области техники. При этом, участки а-спирали содержат участок α1, участок α2, участок α3, участок α4 и участок α5.

[0082] Авторы настоящего изобретения осуществили выравнивания последовательностей белков L1 ПВЧ 14 типов (типы 6, 11, 16, 18, 31, 33, 35, 39, 45, 51, 52, 56, 58 и 59), а затем выполнили предсказание вторичной структуры в соответствии с литературными данными, процитированными выше (Crystal Structures of Four Types of Human Papillomavirus LI Capsid Proteins. UNDERSTANDING THE SPECIFICITY OF NEUTRALIZING MONOCLONAL ANTIBODIES, The Journal of Biological Chemistry, 282,31803-31811), результаты которого показаны ниже, где часть между стрелками, указывающими вниз, соответствует областям, которые были удалены для получения вариантов, описанных в этой литературе.

[0083] В дополнение к способам, использованным авторами настоящего изобретения для выравнивания последовательностей, для предсказания может применяться программное обеспечение предсказания вторичной структуры белка, которое включает, но не ограничивается, следующим:

[0084] 1. JPred: http://www.compbio.dundee.ac.uk/jpred/index.html

[0085] 2. ProtPredicct: http://predictprotein.org

[0086] 3. PsiPred: http://bioinf.cs.ucl.ac.uk/psipred

[0087] 4. SCRATCH-ID: http://download.igb.uci.edu

[0088] 5. Nnpredict: http://www.cmpharm.ucsf.edu/~nomi/nnpredict

[0089] 6. Predictprotein: http://www.embl-heidelberg.de/predictprotein/SOPMA

http://www.ibcp.fr/predict.html

[0090] 7. SSPRED: http://www.embl-heidelberg.de/sspred/ssprd_info.html.

[0091] В одном варианте реализации настоящего изобретения, авторы настоящего изобретения определили длину N-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ, полученного из белка первого типа, следующим образом: природную последовательность белка L1 укорачивали внутри его участка а5 и соседних с ним участках, при этом указанную последовательность от его N-конца до нового созданного С-конца внутри участка а5 сохраняли. Такая укороченная последовательность гарантирует, что она обладает иммуногенностью белка первого типа и способна образовывать VLP.

[0092] Указанный N-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ, полученный из белка первого типа, может быть модифицирован далее при условии, что он сохраняет иммуногенность белка первого типа и способен образовывать VLP.

[0093] Длину указанного С-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ, полученного из белка второго типа, определяли следующим образом: природную последовательность белка L1 укорачивали внутри его участка об и соседних с ним участках, а указанную последовательность от нового созданного N-конца внутри его участка а5 до С-конца сохраняли. Такая укороченная последовательность не имеет основного нейтрализующего антигенного эпитопа, что не влияет на иммуногенность полученного химерного белка.

[0094] Указанный С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ, полученного из белка второго типа, далее может содержать мутации, делеции и/или добавки, предпочтительно сохраняя по меньшей мере одну из его последовательностей ядерной локализации. Yang и др. предсказали последовательности ядерной локализации ПВЧ 107 подтипов (Yang и др. Predicting the nuclear localization signals of 107 types of HPV Protein L1 by bioinformatic analysis. Geno. Prot. Bioinfo. Vol. 4 No. 1 2006, целиком включена в настоящее описание посредством ссылки). Последовательности ядерной локализации каждого типа белка L1 ПВЧ могут быть легко определены с помощью программного обеспечения для анализа последовательностей, обычно используемого в данной области техники.

[0095] Вышеописанное соединение N-концевого фрагмента с указанным С-концевым фрагментом расположено между новым созданным С-концом первого и новым созданным N-концом последнего. Это может быть непосредственное соединение или соединение посредством линкера. Место, где происходит соединение, определяется как точка начала координат, N-концевая сторона от начала координат считается минусовой, а указанная С-концевая сторона - плюсовой.

[0096] Далее показаны последовательности аминокислот 453-469 белка L1 ПВЧ6 и соответствующие последовательности белков L1 ПВЧ других типов. Эти последовательности перекрываются в их областях α5, соответственно. Можно видеть, что эти последовательности очень похожи. Цифры в скобках указывают на положение последних остатков аминокислот в перечисленных последовательностях, где для ПВЧ типа 45 дополнительно присутствуют 26 аминокислот на N-конце белка L1 некоторых штаммов ПВЧ типа 45, в то время как на N-конце белка L1 других штаммов ПВЧ типа 45 указанные дополнительные 26 аминокислот отсутствуют, поэтому номер указан как (478)+26.

[0097] ПВЧ6 ELDQYPLGRKFLLQSGY(469)

[0098] ПВЧ11 ELDQFPLGRKFLLQSGY(470)

[0099[ПВЧ16 DLDQFPLGRKFLLQAGL(474)

[00100] ПВЧ18 DLDQYPLGRKFLVQAGL(475)

[00101] ПВЧ31 DLDQFPLGRKFLLQAGY(475)

[00102] ПВЧ35 DLDQFPLGRKFLLQAGL(472)

[001031 ПВЧ39 ELDQFPLGRKFLLQARV (474)

[00104] ПВЧ45 DLDQYPLGRKFLVQAGL(478)+26

[00105] ПВЧ51 DLDQFALGRKFLLQVGV(474)

[00106] ПВЧ52 DLDQFPLGRKFLLQAGL(478)

[00107] ПВЧ56 DLDQFPLGRKFLMQLGTRS(474)

[00108] ПВЧ58 DLDQFPLGRKFLLQSGL(473)

[00109] ПВЧ33 DLDQFPLGRKFLLQAGL(473) KAKPKLKRAAPTSTRTSSAKRKKVKK, при этом KR в положениях 480-481 и KRKK положениях 493-496 представляют собой последовательности ядерной локализации.

[00110] ПВЧ59 DLDQFPLGRKFLLQLGA(475) RPKPTIGPRKRAAPAPTSTPSPKRVKRRKSSRK, при этом RKR в положениях 484-486 и KRVKRRK в положениях 498-504 представляют собой последовательности ядерной локализации.

[00111] В одном варианте реализации настоящего изобретения, авторы настоящего изобретения осуществили замены С-концов белков L1 между различными типами ПВЧ, воспользовавших преимуществом сходства последовательностей участка а5 и соседних участков между различными типами ПВЧ.

[00112] В наиболее предпочтительном варианте осуществления настоящего изобретения, авторы настоящего изобретения обнаружили, что белок L1 ПВЧ каждого типа содержит тетрапептид RKFL или, более предпочтительно, гексапептид LGRKFL, в похожих положениях. Авторы настоящего изобретения умело использовали эту высококонсервативную последовательность, чтобы найти точку соединения химерного белка в положении любой аминокислоты внутри этого олигопептида. С одной стороны, указанная последовательность, начиная с N-конца химерного белка, RKFL или LGRKFL идентична указанной последовательности N-концевого фрагмента, полученного из белка L1 ПВЧ первого типа, в то время как с другой стороны, указанная последовательность, начиная с RKFL или LGRKFL до С-конца химерного белка, идентична указанной последовательности указанного С-концевого фрагмента, полученного из белка L1 второго типа.

[00113[Полученный таким образом химерный белок сохраняет высокую степень сходства с природным белком L1 ПВЧ, и можно ожидать его хорошие характеристики при производстве и даже в последующих медицинских или профилактических процедурах.

[00114] Специалистам в данной области техники будет понятно, что существуют разные штаммы с разными природными последовательностями данного типа ПВЧ, а химерные белки, сконструированные с использованием разных штаммов, также подпадают под объем настоящего изобретения.

[00115] Для специалистов в данной области техники будет понятно, что из-за высокой степени сходства между белками L1 ПВЧ разных типов, если при конструировании химерного белка, N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 первого типа ПВЧ удлиняется за счет большего количества отатков аминокислот в сторону С-конца, или указанный С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 второго типа ПВЧ удлиняется за счет большего количества остатков аминокислот в сторону N-конца, также возможно образование химерных белков, которые структурно идентичны белкам согласно настоящему изобретению благодаря идентичным или сходным аминокислотам в соответствующих сайтах. Полученные таким образом химерные белки также входят в объем настоящего изобретения.

[00116] Специалистам в данной области техники будет понятно, что на основе химерных белков из вышеописанных вариантов осуществления путем мутаций, делеций и/или добавлений остатков аминокислот могут быть образованы варианты таких химерных белков. Такие варианты с большой вероятностью обладают иммуногенностью белка L1 ПВЧ первого типа, могут образовывать VLP и имеют высокий выход и растворимость. Полученные таким образом химерные белки также входят в объем настоящего изобретения.

[00117] Благоприятный эффект настоящего изобретения

[00118] Системы экспрессии, обычно используемые для получения вирусоподобных частиц, классифицируют на эукариотические системы экспрессии и прокариотические системы экспрессии. Белки L папилломавируса, экспрессированные в эукариотических системах экспрессии, могут самостоятельно собираться в вирусоподобные частицы, но имеют недостаток, прявляющийся в низком уровне экспрессии, который не подходит для массового производства. Белок L папилломавируса, экспрессированный в прокариотической системе экспрессии, требует осуществления процесса in vitro, в результате чего зачастую получают вирусоподобные частицы с нарушенной природной конформацией, а сампроцесс имеет низкий выход, что создает трудности для использования в промышленном масштабе.

[00119] В настоящем изобретении модифицирован С-конец белка L папилломавируса (например, папилломавируса человека), например, посредством его замены С-концевым фрагментом белка L1 ПВЧ типа 16, белка L1 ПВЧ типа 28, белка L1 ПВЧ типа 33, белка L1 ПВЧ типа 59 или белка L1 ПВЧ типа 68 так, что он может применяться в системах экспрессии (например, клетках-хозяевах, например, клетках насекомого) для улучшения уровня экспрессии и повышения растворимости белка L папилломавируса в системах экспрессии (например, клетках-хозяевах, например, клетках насекомого). Он может применяться для массового производства вакцин, таких как вакциниы против ПВЧ.

[00120] Авторы настоящего изобретения обнаружили, что белок L1 ПВЧ типа 16, белок L1 ПВЧ типа 28, белок L1 ПВЧ типа 33, белок L1 ПВЧ типа 59 и белок L1 ПВЧ типа 68 имеют повышенный уровень экспрессии и повышенную растворимость по сравнению с белками L1 ПВЧ других типов, и что повышенный уровень экспрессии и повышенная растворимость зависят от С-концевой последователльности белка L1 ПВЧ. Среди белков L1 ПВЧ 107 типов, большинство содержит последовательности ядерной локализации на их С-конце, и указанные С-концевые последовательности имеют определенное сходство.

[00121] Для белков L папилломавируса, которые в настоящее врем не экспрессируются, имеют очень низкий уровень экспрессии или нерастворимы после экспрессии, замена их С-концевого фрагмента С-концевым фрагментом белка L1 ПВЧ типа 16, белка L1 ПВЧ типа 28, белка L1 ПВЧ типа 33, белка L1 ПВЧ типа 59 или белка L1 ПВЧ типа 68 приводит к возможности высокой экспрессии, хорошей растворимости и последующей очистке. Эта стратегия может применяться для массового производства поливалентных вакцин (например, вакцин против ПВЧ), что позволяет обеспечить более комплексную защиту от широкого спектра папилломавирусных инфекций, особенно от ПВЧ.

[00122] Необходимо повысить уровень экспрессии и растворимость белка L1 ПВЧ в клетках насекомого для целей массового производства. Кроме того, вирусоподобные частицы, собранные из белка L ПВЧ, не обладают хорошей конформацией при получении в дрожжевых клетках вследствие невозможности образования правильных дисульфидных связей.

[00123] Для белков L1 ПВЧ, которые плохо экспрессируются и являются нерастворимыми при получении в клетках насекомого, значительное повышение уровня экспрессии и растворимости может быть получено после модификации его С-концевого фрагмента в С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33 или 59, что позволяет использовать их для массового производства вакцин против ПВЧ.

[00124] Для белков L1 ПВЧ, которые лучше экспрессируются и лучше растворимы при получении в клетках насекомого по сравнению с белками L1 ПВЧ других типов, таких как белок L1 ПВЧ типа 16, белок L1 ПВЧ типа 28, белок L1 ПВЧ типа 68 и т.д., необходимо дальнейшее улучшение уровня экспрессии и растворимости для достижения характеристик для массового производства вакцин. В настоящем изобретении, например, после модификации С-концевого фрагмента белка L1 ПВЧ типа 16 в С-концевой фрагмент белка L1 ПВЧ типа 33 улучшаются уровень экспрессии и растворимость модифицированного химического белка L1 ПВЧ типа 16, что способствует массовому производству вакцин против ПВЧ.

[00125] Подводя итог, можно сказать, что химерный белок L1 ПВЧ показал гораздо более высокий уровень экспрессии и растворимости при получении в клетках насекомого по сравнению с немодифицированным белком L1 ПВЧ. Он может применяться в массовом производстве вакцин ПВЧ. Кроме того, химерный белок L1 ПВЧ может правильно образовывать дисульфидные связи, таким образом, собираясь в ПВЧ вирусоподобные частицы с хорошими конформациями в клетках насекомого. Это повышает иммуногенность вирусоподобных частиц ПВЧ и вызвает лучшие иммунные ответы.

[00126] Определения

[00127] Если не указано иное, все технические и научные термины, используемые в настоящем документе, имеют значения, обычно понятные специалистам в данной области техники, к которой относится настоящее изобретение. Для удобства понимания настоящего изобретения следующие термины цитируются ниже в их обычном значении.

[00128] Используемые здесь и в прилагаемой формуле изобретения формы единственного числа, «другой» и «указанный» также включают обозначения объектов во множественном числе, если контекст явно не указывает иное. Если прямо не указано иное, термины «включают/содержат/имеют», «например» и т.д. предназначены для передачи включения, а не ограничения.

[00129] Термин «иммуногенность» относится к способности вещества, например, белка или пептида, вызывать иммунный ответ, т.е., способности запускать выработку антител, в частности, к способности запускать гуморально- или клеточно-опосредованный ответ.

[00130] Термин «антитело» относится к молекуле иммуноглобулина, которая связывает антиген. Антитела могут быть поликлональными смесями или моноклональными. Антитела могут представлять собой интактные иммуноглобулины природного происхождения или рекомбинантного происхождения или могут представлять собой иммунореактивные участки интактных иммуноглобулинов. Антитела может присутствовать в различных формах, включая: например, Fv, Fab', F(ab')2 и единичные цепи.

[00131] Термин «антигенность» относится к способности вещества, например, белка или пептида, запускать выработку антител, которые специфически связываются с ним.

[00132] Термин «эпитоп» включает любой кластер белковых детерминант, который специфически связывается с антителом или Т-клеточным рецептором. Эпитопные детерминанты обычно состоят из химически активных поверхностных групп (например, боковых цепей аминокислот или Сахаров или их комбинаций) молекулы и обычно имеют специфические трехмерные структурные характеристики, а также специфические характеристики заряда.

[00133] Термины «подтип» или «тип» используются в настоящем документе взаимозаменяемо для обозначения генетического варианта вируса, который позволяет иммунной системе распознавать его как антиген, отличающийся от типа к типу. Например, ПВЧ 16 иммунологически отличим от ПВЧ 33.

[00134] В настоящем тексте термин «белок L1 ПВЧ», термин «ПВЧ» и «папилломавирус человека» относятся к безоболочечным двухцепочечным ДНК-вирусам семейства папилломавирусов. Их геномы имеют кольцевую форму и имеют размер примерно 8 тысяч пар оснований. Большинство ПВЧ кодируют восемь мажорных белков, шесть в «ранней» области (Е1-Е2) и два в «поздней» области (L1 (мажорный капсидный белок) и L2 (минорный капсидный белок)). Выявлено более 120 типов ПВЧ и они пронумерованы (например, ПВЧ-16, ПВЧ-18 и т.д.).

[00135] Термин «ПВЧ» или «ПВЧ вирус» относится к папилломавирусам семейства Papillomaviridae, которые представляют собой ДНК-вирусы без оболочки с двухцепочечным замкнутым кольцевым геномом ДНК размером примерно 8 т.п.н., который обычно подразделяют на три области: (i) раннюю область (Е), которая содержит шесть открытых рамок считывания E1, Е2, Е4-Е7, кодирующие неструктурные белки, связанные с репликацией, транскрипцией и трансформацией вируса, а также открытые рамки считывания Е3 и Е8; (ii) поздняя область (L), содержащая рамки считывания, кодирующие основной капсидный белок L1 и минорный капсидный белок L2; и (iii) длинная регуляторная область (LCR), которая не кодирует никаких белков, но имеет точку начала репликации и множественные сайты связывания факторов транскрипции.

[00136] Термины «белок L1 ПВЧ» и «белок L2 ПВЧ» относятся к белкам, кодируемым поздней областью (L) гена ПВЧ и синтезируемым в конце инфекционного цикла ПВЧ. Белок L2 является минорным капсидным белком. 72 пентамера L1 образуют внешнюю оболочку икосаэдрических частиц ПВЧ, в которую заключена замкнутая кольцевая двухцепочечная микрохромосома ДНК.

[00137] Термин «вирусоподобная частица» относится к полой частице, содержащей один или множество структурных белков вируса, без вирусных нуклеиновых кислот.

[00138] «Псевдовирус ПВЧ» представляет собой идеальную модель для нейтрализации ПВЧ in vitro, за счет преимущества свойства инкапсуляции неспецифической нуклеиновой кислоты VLP ПВЧ, псевдовирус ПВЧ образуется путем сборки без ДНК или упаковки с введением в VLP экзогенной плазмиды, содержащей внутриклеточно экспрессируемые L1 и L2 ПВЧ.

[00139] «Анализ нейтрализации псевдовирусов» представляет собой способ оценки нейтрализующей активности антител. После инкубации сыворотки иммунизированных животных с определенным количеством псевдовируса и последующего инфицирования клеток количество клеток уменьшается, а количество нейтрализующих антител в сыворотке увеличивается, демонстрируя линейную отрицательную корреляцию в определенном диапазоне. Таким образом, нейтрализующую активность антител в сыворотке можно оценить путем измерения изменения количества клеток.

[00140] Термин «его фрагмент» или «его вариант» относится к делеции, вставке и/или замене нуклеотидов или аминокислотной последовательности настоящего изобретения. В измененной модификации фрагмент или вариант полипептида согласно настоящему изобретению способен вызывать гуморальный и/или клеточный иммунный ответ у животных или человека.

[00141] Термин «химерное» означает, что последовательность полипептидов или нуклеотидов, полученных из разных исходных молекул, соединены вместе -CO-NH- или 3', 5'-фосфодиэфирными связями, соответственно. В предпочтительном варианте они не отделены дополнительной линкерной последовательностью, а непосредственно примыкают друг к другу.

[00142] Термин «укорочение» относится к удалению одной или нескольких аминокислот с N- и/или С-конца полипептида или к удалению одной или нескольких аминокислот из внутренней части полипептида.

[00143] Термин «последовательность ядерной локализации» относится к последовательности аминокислот, которая направляет белок в ядро. В некоторых белках L1 ПВЧ два плотных кластера основных остатков (т.е., последовательности ядерной локализации) (например, один представляет собой KRKR, KRKK, KRKRK, KRKKRK, KRVKRRK и т.д., а другой представляет собой KR, RKR, KRK и т.д.) имют спейсерный участок из 10-14 аминокислот между ними. Вышеупомянутые кластеры основных остатков принадлежат к последовательности ядерной изоляции. В некоторых других белках L1 ПВЧ последовательность ядерной локализации представляет собой плотный кластер основных остатков, образованных аргининами и/или лизинами. Последовательности ядерной локализации включают примеры кластеров основных остатков, как описано выше, но не ограничиваются ими. Смотри Jun Yang и др., Predicting the Nuclear Localization Signals of 107 Types of HPV LI Proteins by Bioinformatic Analysis, Genomics, Proteomics & Bioinformatics, Volume 4, Issue 1, 2006, Pages 34-41, целиком включенную в настоящее описание посредством ссылки.

[00144] Термин «функциональный вариант» относится к варианту полипептида или белка, который сохраняет желаемую активность или характеристики после укорочения, мутации, делеций и/или добавления.

[00145] «Идентичность последовательностей» между двумя последовательностями полипептидов или нуклеиновых кислот указывает количество идентичных остатков между указанными последовательностями в процентах от общего числа остатков и рассчитывается на основе размера меньшей из сравниваемых молекул. При вычислении значения процента идентичности сравниваемые результаты последовательности сопоставляются таким образом, чтобы получить максимальное совпадение между указанными последовательностями, при этом вакантные позиции (если они есть) в совпадении разрешаются с помощью определенного алгоритма. Предпочтительные методы компьютерных программ для определения идентичности между двумя последовательностями включают пакеты программного обеспечения GCG, включая GAP, BLASTP, BLASTN и FASTA (Altschul и др., 1990, J. Mol. Biol. 215: 403-410), но не ограничиваются ими. Вышеуказанные программы находятся в открытом доступе на National Center of Biotechnology Information (NCBI) и на других ресурсах. Широко известный алгоритм Смита-Уотермана также может быть использован для определения значения идентичности.

[00146] Некритические аминокислоты могут быть консервативно заменены, не влияя на нормальную функцию белка. Консервативная замена означает замену аминокислот химически или функционально сходными аминокислотами. Таблицы для консервативных замен, которые содержат аналогичные аминокислоты, хорошо известны в данной области техники. Например, в некоторых вариантах реализации группы аминокислот, представленные в Таблицах 1-3, считаются консервативными заменами друг друга.

[00150] Термин «аминокислоты» относится к двадцати наиболее часто встречающимся в природе аминокислотам. Встречающиеся в природе аминокислот включают аланин (Ala; А), аргинин (Arg; R), аспарагин (Asn; N), аспарагиновую кислоту (Asp; D), цистеин (Cys; С), глутаминовую кислоту (Glu; Е), глутамин (Gin; Q), глицин (Gly; г), гистидин (His; Н), изолейцин (lie; I), лейцин (Leu; L), лизин (Lys; К), метионин (Met; М), фенилаланин (Phe; F), пролин (Pro; Р), серии (Ser; S), треонин (Thr; Т), триптофан (Trp; W), тирозин (Туr; Y) и валин (Val; V).

[00151] Термин «адъювант» относится к соединению или смеси, которые усиливают иммунные ответы. В частности, вакцина может включать адъювант.Адъюванты для применения в настоящем изобретении могут включатьодну или множество следующих композиций: минералосодержащие адъювантные композиции, масляно-эмульсионные адъюванты, сапониновые адъювантные композиции, производные бактерий или микробов, но не ограничиваются ими.

[00152] Термин «вектор» относится к молекуле нуклеиновой кислоты, способной к пролиферации другой связанной с ней нуклеиновой кислоты. Термин включает векторы как самовоспроизводящиеся структуры нуклеиновой кислоты и как векторы, интегрированные в геном клеток-хозяев, в которые был введен указанный вектор. Определенные векторы способны направлять экспрессию нуклеиновых кислот, с которыми такие векторы оперативно связаны.

[00153] Термин «клетка-хозяин» относится к клетке, в которую введена экзогенная нуклеиновая кислота, а также к потомству такой клетки. Клетки-хозяева включают «трансформанты» (или «трансформированные клетки»), «трансфектанты» (или «трансфицированные клетки») или «инфектанты» (или «инфицированные клетки»), каждый из которых включает первично трансформированные, трансфицированные или инфицированные клетки и потомство, производное от них. Такое потомство может не быть идентичным родительским клеткам с точки зрения содержания нуклеиновой кислоты и возможных мутаций.

[00154] Вводимое количество представляет собой «профилактически эффективное количество» (здесь профилактика может рассматриваться как лечение и два этих понятия могут рассматриваться как взаимозаменяемые), которое является достаточным для проявления пользы для индивидуума.

[00155] Примеры

[00156] Пример 1. Конструирование химерных генов

[00157] Пример 1.1: Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ6, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00158] 1.1.1 Конструирование pFB-ПВЧ6 L1 в качестве матрицы

[00159] Ген L1 ПВЧ6 с сайтами расщепления КрnI и XbaI на двух концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.], его последовательность показана в SEQ ID NO: 5. Плазмиду pcDNA3-nB46-L1, содержащую указанную последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-500 L1 ПВЧ6 получали посредством лигирования фрагмента синтезированного гена в вектор pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) по сайтам расщепления KpnII и XbaI.

[00160] Полученную плазмиду pcDNA3-nB46-L1 подвергали двойному ферментативному расщеплению с помощью КрnI и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ6 (1-500). Затем указанный фрагмент лигировали с расщепленным двумя рестриктазами KpnI / XbaI вектором pFastBac™1 (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена ПВЧ6 L1 (1-500), названный pFB-ПВЧ6 L1.

[00161] 1.1.2 Конструирование pFB-ПВЧ33 L1 в качестве матрицы

[00162] Ген L1 ПВЧ33 с сайтами расщепления KpnII и XbaI на двух концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.), его последовательность показана в SEQ ID NO: 6. Плазмиду pcDNA3-ПВЧ33-L1, содержащую указанную последовательность нуклеотидов, кодирующую аминокислоты 1-499 L1 ПВЧ33 получали посредством лигирования фрагмента синтезированного гена в вектор pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) по сайтам расщепления KpnI и XbaI.

[00163] Плазмиду pcDNA3-nB433-L1 подвергали двойному ферментативному расщеплению с помощью KpnIl и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ33 (1-499). Затем указанный фрагмент лигировали в расщепленный двумя рестриктазами KpnI и XbaI вектор pFastBac™1 (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ33 (1-499), названный pFB-ПВЧ33 L1.

[00164] 1.1.3 Конструирование pFB-ПВЧ6 LL33C

[00165] Химерный ген L1 ПВЧ6 с С-концом, замещенным С-концом ПВЧ33 L1: сконструированную рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ6 L1 использовали в качестве матрицы для амплификации фрагмента гена длиной 1426 п. о. с использованием праймеров F1 и R1, последовательность праймера F1 показана в SEQ ID No: 7, a R1 - в SEQ ID No: 8.

[00166] Этот фрагмент гена содержит фрагмент, кодирующий аминокислоты 1-469 L1 ПВЧ6, 10 п. о. перекрывающихся с фрагментом гена, кодирующим аминокислоты 474-499 L1 ПВЧ33, и фрагмент сайта расщепления KpnI (GGTACAC), амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 9.

[00167] Параметры ПЦР-амплификации: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин.; денатурация при 98°С в течение 10 s, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 КБ/1 мин при 72°С, в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.

[00168] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ33 L1 использовали в качестве матрицы для амплификации фрагмента гена длиной 101 п. о. с использованием праймеров F2 и R2, последовательность праймера F2 показана в SEQ ID No: 10, а последовательность праймера R2 показана в SEQ ID No: 11.

[00169] Этот фрагмент гена содержит фрагмент гена, кодирующий 26 С-концевых аминокислот (474-499) L1 ПВЧ33, 10 п. о., перекрывающихся с фрагментом гена, кодирующим С-концевые аминокислоты 1-469 L1 ПВЧ6, и сайт расщепления XbaI (TACTAGA), амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 12.

[00170] Параметры ПЦР-амплификации: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин.; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 КБ/1 мин при 72°С, в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин.; окончание при 16°С.

[00171] Последовательности, лигированные ПЦР:

[00172] Лигирующими праймерами были F1 и R2, и фрагменты, амплифицированные с использованием указанных выше праймеров (фрагменты, амплифицированные с использованием F1 и R1, фрагменты, амплифицированные с использованием F2 и R2), использовали в качестве матриц.

[00173] Параметры ПЦР-лигирования: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 52°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 КБ/1 мин, в течение 5 циклов; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 68°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 КБ/1 мин, в течение 25 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.

[00174] Результатом была SEQ ID NO: 4, последовательность нуклеотидов, кодирующая аминокислоты 1-469 L1 ПВЧ6 и 26 С-концевых аминокислот L1 ПВЧ33 (аа 474-499), ссайтами расщепления KpnI и ХbаI на двух концах (в дальнейшем упоминается как последовательность для лигирования).

[00175] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ6 L1:33C получали двойным расщеплением вектора pFastBac™1 и фрагмента последовательности для лигирования с помощью ферментов KpnIl+XbaI и клонировали последовательность для лигирования в вектор pFastBac™1, в результате чего получали плазмиду pFB-ПВЧ6 L1:33С, которая представляет собой химерное gene с С-концом L1 ПВЧ6, замененным С-концом L1 ПВЧ33.

[00176] Пример 1.2. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ11, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00177] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 2 для соответствующих последовательностей.

[00178] Пример 1.3 Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ16, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00179] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 3 для соответствующих последовательностей.

[00180] Пример 1.4 Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ18, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00181] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 4 для соответствующих последовательностей.

[00182] Пример 1.5 Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ31, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00183] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 5 для соответствующих последовательностей.

[00184] Пример 1.6 Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ35, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00185] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 6 для соответствующих последовательностей.

[00186] Пример 1.7. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ39, замененным С-концом L1 ПВЧ59

[00187] 1.7.1 Конструирование pFB-nB439 L1, использованной в качестве матрицы

[00188] Ген L1 ПВЧ39 с сайтами расщепления KpnI и XbaI на двух концах синтезированной последовательности синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.), его последовательность показана в SEQ ID NO: 83. Плазмиду pcDNA3-nB439-L1, содержаще, последовательность нуклеотидов, кодирующе. аминокислоте 1-505 L1 ПВЧ39 получали посредством лигирования фрагмента синтезированного гена в вектор pcDNA3 (поставщик: Thermo Fisher) по сайтам расщепления KpnIl и XbaI.

[00189] Плазмиду pcDNA3-nB439-L1 подвергали двойному расщеплению с помощью KpnIl и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ39 (1-505). Затем указанный фрагмент лигировали в вектор pFastBac™1, расщепленный двумя рестриктазами KpnI и XbaI, (поставщик: Thermo Fisher) в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ39 (1-505), названный pFB-nB439 L1.

[00190] 1.7.2 Конструирование pFB-nB459L1 в качестве матрицы

[00191] Ген L1 ПВЧ59 синтезировали с помощью Thermo Fisher [ранее Invitrogen (Shanghai) Trading Co.), в результате чего получали плазмиду pcDNA3-ITB459-L1, содержащую указанная последовательность нуклеотидов, кодирующий аминокислоты 1-508 L1 ПВЧ59.

[00192] Плазмиду pcDNA3-nB459-L1 расщелпяли двумя рестриктазами KpnIl и XbaI, в результате чего получали фрагмент гена L1 ПВЧ59 (1-508). Затем указанный фрагмент лигировали в вектор pFastBac™1, расщепленный двумя рестриктазами KpnIl I XbaI, (поставщик: Thermo Fisher), в результате чего получали линейный вектор, содержащий фрагмент гена L1 ПВЧ59 (1-508), названный pFB-nB459L1.

[00193] 1.7.3. Конструирование pFB-nB439 L1:59C

[00194] Химерный ген с С-концом L1 ПВЧ39, замещенный С-концом L1 ПВЧ59: сконструированную рекомбинантную плазмиду pFB-TIB439 L1 использовали в качестве матрицы для амплификации фрагмента гена длиной 1428 п. о., используя прайм еры F1 и R1, последовательность праймера F1 показана в SEQ ID No: 85, а последовательность праймера R1 показана в SEQ ID No: 86.

[00195] Этот фрагмент содержит фрагмент, кодирующий аминокислоты 1-469 L1 ПВЧ39, 12 п. о., перекрывающихся с фрагментом, кодирующим аминокислоты 471-508 L1 ГГВЧ59, и сегмент сайта расщепления KpnIl (GGTACAC), амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 87.

[00196] Параметры ПЦР-амплификации: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин.; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 КБ/1 мин при 72°С, в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин.; окончание при 16°С.

[00197] Рекомбинантную плазмиду pFB-nB459L1 использовали в качестве матрицы для амплификации фрагмента гена длиной 139 п. о., используя праймеры F2 и R2. Последовательность праймера F2 показана в SEQ ID No: 88, а последовательность праймера R2 показана в SEQ ID No: 89.

[00198] Этот фрагмент гена содержит фрагмент гена, кодирующий 38 С-концевых аминокислот (471-508) L1 ПВЧ59, 12 п. о., перекрывающихся с фрагментом гена, кодирующим аминокислоты 1-469 L1 ПВЧ39, и сайт расщепления XbaI (TACTAGA), а амплифицированная последовательность показана в SEQ ID No: 90.

[00199] Параметры ПЦР-амплификации: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин.; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 69°С в течение 15 с, 1 КБ/1 мин при 72°С в течение 30 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин.; окончание при 16°С.[00200] Последовательность для лигирования ПЦР

[00201] Праймерами для лигирования были Fin R2, и фрагменты, амплифицированные с помощью указанных выше праймеров, (фрагменты, амплифицированные с помощью F1 и R1, и фрагменты, амплифицированные с помощью F2 и R2) использовали в качестве матриц.

[00202] Параметры ПЦР-лигирования: предварительная денатурация при 94°С в течение 5 мин; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 52°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 КБ/1 мин, в течение 5 циклов; денатурация при 98°С в течение 10 с, отжиг при 68°С в течение 15 с, 72°С в течение 1 КБ/1 мин, в течение 25 циклов; удлинение при 72°С в течение 5 мин; окончание при 16°С.

[00203] Конечным результатом была последовательность SEQ ID NO: 82, последовательность нуклеотидов, кодирующая аминокислоты 1-469 L1 ПВЧ39 и 38 С-концевых аминокислот L1 ПВЧ59 (471-508) с сайтами расщепления рестриктаз KpnI и ХbaI на двух концах (в дальнейшем упоминается как последовательность для лигирования).

[00204] Рекомбинантную плазмиду pFB-IIB439 L1:59C получали двойным расщеплением вектора pFastBac™1 и фрагмента последовательности для лигирования с помощью ферментов KpnI+XbaI, и последовательность для лигирования клонировали в вектор pFastBac™1 с получением pFB-nB439 L1:59C, который представляет собой химерный ген с С-концом L1 ПВЧ39, замененным С-концом L1 ПВЧ59.

[00205] Пример 1.8. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ45, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00206] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 8 для соответствующих последовательностей.

[00207] Пример 1.9. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ51, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00208] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 9 для соответствующих последовательностей.

[00209] Пример 1.10. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ52, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00210] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 10 для соответствующих последовательностей.

[00211] Пример 1.11. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ56, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00212] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 11 для соответствующих последовательностей.

[00213] Пример 1.12. Конструирование химерного гена с С-концом L1 ПВЧ58, замененным С-концом L1 ПВЧ33

[00214] Экспреиментальные методы и процедуры были теми же самыми, что и в Примере 1.1, см. Приложение 12 для соответствующих последовательностей.

[00215] Пример 2. Упаковка рекомбинантного бакуловируса

[00216] Пример 2.1: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ6 L1:33С

[00217] Рекомбинантную плазмиду pFB-ПВЧ6 L1:33С, сконструированную в Примере 1, идентифицировали и секвенировали для проверки последовательности, и трансформировали в компетентные клетки бактерий DHlOBac (набор Bac-to-Bac®, приобретенный у Thermo Fisher), инкубировали при 37°С для пролиферации и выращивали на плоской чашке в виде културы, посеянной штрихом. Собирали белые колонии, выращивали в течение ночи. Бактериальную культуру собирали и рекомбинантную ДНК бакуловируса экстрагировали с помощью метода щелочного лизиса.

[00218] Рекомбинантную ДНК бакуловируса трансфицировали в клетки насекомого SF9 с использованием катионного реагента для трансфекции (приобретенный у Sino Biological) для упаковки в рекомбинантные вирулентные штаммы бакуловируса. Процедура была следующей:

[00219] а), клетки SF9 в логарифмической фазе роста инкубировали на чашках при плотности 0,6×10⁶ клеток на чашку. Чашку с клетками SF9 оставляли выращиваться при комнатной температуре в течение 2 часов для прилипания клеток к стенкам чашки.

[00220] б). 20 мкл экстрагированонй ДНК Bacmid добавляли к 200 мкл среды Грейса (без сыворотки, без добавок, приобретенная у Gibico), смешивали и переворачивали 5 раз.

[00221] в). 25 мкл 0,2х TF1 (реагент для трансфекции, приобретенный у Sino Biological) добавляли по каплям к 200 мкл среды Грейса и аккуратно перемешивали.

[00222] г). Смешивали б) и в). Инкубировали при комнатной температуре в течение 15-45 мин.

[00223] д). В ходе инкубации ДНК с селлфектином (приобретенным у Sino Biological), клеточный супернатант удаляли и добавляли в чашку 0,8 мл среды Грейса (без сыворотки и без добавок).

[00224] е). Инкубированную смесь ДНК и реагента для трансфекции из г) добавляли в чашку по каплям.

[00225] ж). Инкубировали при 27°С в течение 2 часов.

[00226] з). Среду для выращивания клеток удаляли и добавляли 2,5 мл полной среды для выращивания на чашку (SCD6 SF+10% ФБС) (SCD6 SF приобретали у Sino Biological, ФБС приобретали у Gibico).

[00227] и). Выращивание осуществляли при 27°С в течение 7 дней и наблюдали, произошло ли инфицирование вирусом.

[00228] Супернатант вируса собирали после обнаружения видимых повреждений в трансфицированных клетках, обычно после 7-11 суток выращивания. Супернатант вируса, т.е., поколение Р1 штамма вируса ПВЧ6 L1:33С, асептически отбирали пипеткой. Клетки SF9 при плотности 2 × 10⁶ клеток/мл инфицировали, используя поклоение Р1 штамма вируса ПВЧ6 L1:33C в соотношении 1:50 (об./об.), выращивали при 27°С в течение 3 суток и центрифугировали при 1000g±200g в течение 10 мин при комнатной температуре. Собранный супернатант вируса был поколением Р2 вируса и мог быть использован для инфицирования клеток-хозяев и продукции.

[00229] Пример 2.2: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ11 L1:33С

[00230] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00231] Пример 2.3: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ 16L1:33С

[00232] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00233] Пример 2.4: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ18 L1:33С

[00234] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00235] Пример 2.5: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ31 L1:33C

[00236] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00237] Пример 2.6: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ35 L1:33С

[00238] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00239] Пример 2.7: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ39 L1:59С

[00240] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00241] Пример 2.8: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ45 L1:33С

[00242] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00243] Пример 2.9: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВ451 L1:33C

[00244] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00245] Пример 2.10: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ52 L1:33С

[00246] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00247] Пример 2.11: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ56 L1:33C

[00248] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00249] Пример 2.12: Упаковка рекомбинантного бакуловируса ПВЧ58 L1:33C

[00250] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 2.1.

[00251] Пример 3. Экспрессия химерных белков

[00252] В Примере 3.1 показана экспрессия ПВЧ6 L1:33С

[00253] Клетки High Five инфицировали бакуловирусом, содержащим рекомбинантный ген ПВЧ6 L1:33С, полученный в Примере 2 в соотношении 1:200 (об./об.), и осадок клеток собирали центрифугированием при 1000g±100g при комнатной температуре. Клетки разрушали ультразвуком при низкой температуре в течение 3 мин, центрифугировали при >10,000g в течение 10 мин и супернатант собирали для ДСН-ПААГ. Дорожка 1: маркер (маркер представляет собой смесь 7 очищенных белков с молекулярными весами в диапазоне от 14,4 кДа до 116 кДа, полученных от Thermo Scientific); дорожка 2: лизат клеток; дорожка 3: супернатант лизата, собранный центрифугированием.

[00254] Результат показана на Фиг. 1А. Белок L1 ПВЧ6 L1:33С, полученный этим методом, имеет выход >100 мг/л, а размер белка составляет примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00255] В Примере 3.2 показана экспрессия и получение ПВЧ11 L1:33С

[00256] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00257] Результаты показаны на Фиг. 1 В. Белок L1 ПВЧ11 L1:33C, полученный этим способом, имел выход>100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00258] В Примере 3.3 показана экспрессия и получение ПВЧ 16L1:33C

[00259] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00260] Результаты показаны на Фиг. 1С. Белок L1ПВЧ 16L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00261] В Примере 3.4 показана экспрессия и получение ПВЧ18 L1:33С

[00262] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00263] Результаты показаны на Фиг. 1D. Белок L1 ПВЧ18 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00264] В Примере 3.5 показана экспрессия и получение ПВЧ31 L1:33C

[00265] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00266] Результаты показаны на Фиг. 1Е. Белок L1 ПВЧ31 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00267] В Примере 3.6 показана экспрессия и получение ПВЧ35 L1:33C

[00268] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00269] Результаты показаны на Фиг. 1F. Белок L1 ПВЧ35 L1:33С, полученный этим способом, имел выход>100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00270] В Примере 3.7 показана экспрессия и получение ПВЧ39 L1:59С

[00271] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00272] Результаты показаны на Фиг. 1G. Белок L1 ПВЧ39 L1:59C, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00273] В Примере 3.8 показана экспрессия и получение ПВЧ45 L1:33С

[00274] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00275] Результаты показаны на Фиг. 1Н. Белок L1 ПВЧ45 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00276] В Примере 3.9 показана экспрессия и получение ПВЧ51 L1:33С

[00277] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00278] Результаты показаны на Фиг. 1I. Белок L1 ПВЧ51 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00279] В Примере 3.10 показана экспрессия и получение ПВЧ52 L1:33С

[00280] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00281] Результаты показаны на Фиг. 1J. Белок L1 ПВЧ52 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00282] В Примере 3.11 показана экспрессия и получение ПВЧ56 L1:33С

[00283] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00284] Результаты показаны на Фиг. 1K. Белок L1 ПВЧ56 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00285] В Примере 3.12 показана экспрессия и получение ПВЧ58 L1:33С

[00286] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 3.1.

[00287] Результаты показаны на Фиг. 1L. Белок L1 ПВЧ58 L1:33С, полученный этим способом, имел выход >100 мг/л, а размер белка составлял примерно 56 кДа, и он может применяться для массового производства.

[00288] Пример 4. Получение очищенных вирусоподобных частиц

[00289] Пример 4.1: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ6 L1:33С

[00290] Вирусоподобные частицы ПВЧ6 L1:33С очищали двухстадийным хроматографическим методом, т.е., методом HS-MMA, супернатант, собранный в Примере, 3 очищали, и в конце концов получали вирусоподобные частицы высококй чистоты.

[00291] Первая стадия хроматографии:

[00292] Носитель: использовали сильный катионообменный носитель POROS® 50 HS, полученный от Thermo Fisher.

[00293] Объем носителя: объем носителя 150 мл, динейная скорость потока 30 мл/мин.

[00294] Условия хроматографии: уравновешивающий буфер (рН 6,2, концентрация солей -50 мМ фосфат, 0,5 MNaCl); промывочный буфер (концентрация солей - 50 мМ фосфат, 0,75 М NaCl, рН 6,2).

[00295] Хроматографическую колонку сначала уравновешивали 5 объемами колонки уравновешивающего буфера, а затем загружали образец. После загрузки колонку элюировали 5 объемами колонки уравновешивающего буфера и буфера для промывки, соответственно, для удаления примесей белка.

[00296] Условия элюции: использовали 50 мМ фосфатный буфер, содержащий 50 мМ аргинина гидрохлорид рН 6,2, концентрация элюирующей соли составляла 1,25 MNaCl.

[00297] Вторая стадия хроматографии.

[00298] Носитель: использовали ионообменный носитель ММА, произведенный Bestchrom (Shanghai) Biosciences Co., Ltd.

[00299] Объем носителья: объем носителя составлял 150 мл, линейная скорость потока составляла 30 мл/мин.

[00300] Условия хроматографии: уравновешивающий буфер: 50 мМ РВ, 1,25 М NaCl, рН 6,2. Хроматографическую колонку сначала уравновешивали 4 объемами колонки уравновешивающего буфера, а затем загружали образец. После загрузки примеси белка смывали 5 объемами колонки уравновешивающего буфера, а затем целевой белок элюировали буфером для элюции и собирали.

[00301] Условия элюции: 100 мМ NaAC, 150 мМ NaCl, 0,01% Твин 80, рН 4,5.

[00302] Пример 4.2: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ11 L1:33С

[00303] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00304] Пример 4.3: Очистка и получение вирусоподобных частиц ПВЧ 16L1:33С

[00305] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00306] Пример 4.4: Очистка и получение вирусоподобных частиц ПВЧ18 L1:33С

[00307] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00308] Пример 4.5: Очистка и получение вирусоподобных частиц ПВЧ31 L1:33C

[00309] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00310] Пример 4.6: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ35 L1:33С

[00311] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00312] Пример 4.7: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ39 L1:59С

[00313] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00314] Пример 4.8: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ45 L1:33С

[00315] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00316] Пример 4.9: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ51 L1:33С

[00317] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00318] Пример 4.10: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ52 L1:33C

[00319] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00320] Пример 4.11: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ56 L1:33C

[00321] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00322] Пример 4.12: Получение очищенных вирусоподобных частиц ПВЧ58 L1:33С

[00323] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 4.1.

[00324] Пример 5. Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц

[00325] Пример 5.1: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ6 L1:33С

[00326] 10 мкл образца брали для трансмиссионной электронной микроскопии. Образец фиксировали на медной сетке, покрытой углеродом, в течение 2 мин, остаток жидкости промакивали фильтровальной бумагой, а затем дважды красили фосфорно-вольфрамовой кислотой (Beijing Electron Microscopy China Technology Co., Ltd., концентрация 2%, pH 6,5) в течение 30 секунд каждый раз, остаток красящего раствора промакивали фильтровальной бумагой, оставляли образец сущиться, а затем проводили наблюдение с помощью трансмиссионной электронной микроскопии. Трансмиссионный электронный микроскоп (Brand: Hitachi, Model No.: H-7650) был 80KV с увеличением 80,000х.

[00327] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2А. Как можно увидеть на Фиг. 2А, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ6 LL33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00328] Пример 5.2: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ11 L1.33C

[00329] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00330] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2В. Как можно увидеть на Фиг. 2 В, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ11 L1:33С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера, со средним диаметром примерно 60 нм.

[00331] Пример 5.3: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ 16L1:33С

[00332] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00333] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2С. Как можно увидеть на Фиг. 2С, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ 16L1:33С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00334] Пример 5.4: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ18 L1:33С

[00335] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00336] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2D. Как можно увидеть на Фиг. 2D, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ18 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00337] Пример 5.5: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ31 L1:33С

[00338] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00339] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2Е. Как можно увидеть на Фиг. 2Е, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ31 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00340] Пример 5.6: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ35 L1:33C

[00341] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00342] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2F. Как можно увидеть на Фиг. 2F, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ35 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00343] Пример 5.7: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ39 L1:59С

[00344] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00345] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2G. Как можно увидеть на Фиг. 2G, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ39 L1:59С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00346] Пример 5.8: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ45 L1:33С

[00347] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00348] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2Н. Как можно увидеть на Фиг. 2Н, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ45 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00349] Пример 5.9: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ51 L1:33C

[00350] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00351] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 21. Как можно увидеть на Фиг. 21, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ51 L1:33C может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00352] Пример 5.10: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ52 L1:33C

[00353] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00354] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2J. Как можно увидеть на Фиг. 2J, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ52 L1:33С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00355] Пример 5.11: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ56 L1:33С

[00356] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00357] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2K. Как можно увидеть на Фиг. 2K, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ56 L1:33С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00358] Пример 5.12: Наблюдение морфологии вирусоподобных частиц ПВЧ58 L1:33С

[00359] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 5.1.

[00360] Изображение, полученное с помощью электронного микроскопа, показано на Фиг. 2L. Как можно увидеть на Фиг. 2L, указанный С-концевой модифицированный ПВЧ58 L1:33С может образовывать вирусоподобные частицы одного размера со средним диаметром примерно 60 нм.

[00361] Пример 6. Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц в животных

[00362] Пример 6.1: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ6 L1:33C в животных

[00363] 6.1.1 Моделирование клеток, нейтрализующих псевдовирус

[00364] Поскольку ПВЧ трудно культивировать in vitro и ПВЧ обладает сильной специфичностью к хозяину и его трудно репродуцировать в организмах, отличных от человека, подходящих моделей на животных нет.Поэтому существует необходимость в разработке подходящей и эффективной экспериментальной модели нейтрализации in vitro для оценки иммунной защиты вакцины.

[00365] Псевдовирус ПВЧ представляет собой идеальную модель ПВЧ по оценке нейтрализации in vitro: благодаря способности вирусоподобных частиц ПВЧ неспецифически инкапсулировать нуклеиновые кислоты, псевдовирус ПВЧ может быть образован из VLP, состоящих из L1 и L2 ПВЧ, экспрессированных в клетках, не одержащих ДНК или содержащих экзогенную плазмиду.

[00366] Иммуногенность образцов сыворотки иммунизированных животных анализировали с помощью теста по нейтрализации псевдовируса. Животные, иммунизированные вирусоподобными частицами ПВЧ6, могут производить нейтрализующие антитела против ПВЧ6, котрые могут нейтрализовать псевдовирус ПВЧ6. Когда сыворотку иммунизированных животных инкубируют с определенным количеством псевдовируса, а затем с инфицированными клетками, количество клеток, способных экспрессировать GFP и флюоресцировать снижается при повышении количества нейтрализующих антител в сыворотке, показывая линейную обратную корреляцию в определенном диапазоне, так что нейтрализующая активность антител в сыворотке может быть оценена путем измерения изменени количества клеток, экспрессирующих GFP.

[00367] Способ конструирования псевдовируса: плазмиду с последовательностью ПВЧ6 рСМУ3-3-ПВЧ6 L1+L2 (последовательность L1 была из Uniprot Р69898, последовательность L2 была из Uniprot Q84297) (приобретена у Sino Biological) и флуоресцентную плазмиду (PSEU-GFP Spark, приобретена у Sino Biological) одновременно трансфицировали в 293FT прилипшие клетки (приобретены у Thermo Fisher). Конкретные методы относятся к опубликованной литературе (Pastrana D V, Buck С В, Pang Y S, Thompson С D, Castle Р Е, FitzGerald Р С, Kjaer S К, Lowy D R, Schiller J Т. Reactivity of human sera in a sensitive, high-throughput pseudovirus-based papillomavirus neutralization assay for HPV16 and HPVI8. [J] Virology 2004,321:205-216.). Супернатант псевдовируса собирали, готовили аликвоты и хранили в морозильнике при -80°С.

[00368] 6.1.2 Оценка иммунопротекторных способностей вирусоподобных частиц ПВЧ6 L1:33С в животных

[00369] Процедуры иммунизации в мышах:

[00370] Вирусоподобные частицы ПВЧ6 L1:33C адсорбировали на адъювант фосфата алюминия, смешивали и использовали для иммунизации мышей в дозировке 0,15 мкг/200 мкл на мышь, в общем 10 мышей. Мышей иммунизировали разбавленными образцами на 0,7 и 21 сутки, контрольных мышей иммунизировали чистой сывороткой. Кровь собирали из глаза мышей на 28-е сутки и выделяли сыворотки для теста определения титров нейтрализации псевдовируса.

[00371] Тест по опрделению ЕС₅₀ в мышах:

[00372] Сыворотку мышей инактивировали при 56°С в течение 30 минут, центрифугировали при 6000g 5 минут и собирали супернатант для теста. За 4-8 ч перед тестом инокулировали клетки 293FT при плотности 15,000 клеток на лунку в 96-луночные планшеты и инкубировали при 37°С в СО₂ инкубаторе с 5% СО₂. Сыворотки мышей после иммунизации и контрольные сыворотки серийно разводили нейтрализующей средой, соответственно, затем смешивали с псевдовирусом ПВЧ6, полученным в Примере 6.1 в объемном соотношении 1:1, инкубировали при 2-8°С в течение 1 часа, затем добавляли 100 мкл на лунку смеси клеток 293FT, котрые заранее были инокулированы в течение 4-8 часов. Каждый образец имел повтор, использовали контрольную группу с чистой сывороткой, группу положительного контроля псевдовируса и группу отрицательного контроля псевдовируса. Клетки, инфицированные псевдовирусом, инкубировали при 37°С в СО₂ инкубаторе 5% СО₂ в течение 62-96 часов, флуоресценцию фотографировали и ее уровень обсчитывали с помощью анализатора ELISPOT (модель № S6 Universal-V Analyzer, Manufacturer: CTL). На основании ингибирования нейтрализации каждого образца сыворотки мыши рассчитывали максимальное разведение сыворотки при 50% ингибировании нейтрализации для каждого образца сыворотки мыши в соответствии с методом Рида-Мюнча, т.е., половину эффективности разведения ЕС₅₀.

[00373] Результаты теста титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ6 в сыворотке показаны в Таблице 4.

[00375] Замечания:

[00376] 1. колчество животных, N=10.

[00377] 2. GMT (Среднее геометрическое титра): среднее геометрическое титра.

[00378] 3. SEM (среднеквадратическая ошибка среднего): стандартная ошибка.

[00379] Указанные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ6 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, обладают хорошей иммуногенностью, могут вызывать образование нейтрализующих антител с высокими тирами в животных и могут может применяться для производства вакцин для предотвращения инфекций ПВЧ.

[00380] Пример 6.2: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ11 L1:33С в животных

[00381] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р04012, а последовательность L2 была из Uniprot Р04013.

[00382] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ11 в сыворотке приведены в Таблице 5.

[00385] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ11 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00386] Пример 6.3: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ 16L1:33C в животных

[00387] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot РО3101, а последовательность L2 была из Uniprot РО3107.

[00388] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ16 в сыворотке приведены в Таблице 6.

[00391] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ 16L1:33C, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность и могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00392] Пример 6.4: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ18 L1:33С в животных

[00393] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Q80B70, а последовательность L2 была из Uniprot Р06793.

[00394] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ18 в сыворотке приведены в Таблице 7.

[00397] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ18 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00398] Пример 6.5: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ31 L1:33C в животных

[00399] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot PI7388, а последовательность L2 была из Uniprot Р17389.

[00400] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ31 в сыворотке приведены в Таблице 8.

[00403] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ31 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00404] Пример 6.6: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ35 L1:33С в животных

[00405] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р27232, а последовательность L2 была из Uniprot Р27234.

[00406] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ35 в сыворотке приведены в Таблице 9.

[00409] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ35 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00410] Пример 6.7: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ39 L1:59С в животных

[00411] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р24838, а последовательность L2 была из Uniprot Р24839.

[00412] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ39 в сыворотке приведены в Таблице 10.

[00415] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ39 LI: 59С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00416] Пример 6.8: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ45 L1:33С в животных

[00417] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р36741, а последовательность L2 была из Uniprot Р36761.

[00418] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ45 в сыворотке приведены в Таблице 11.

[00421] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ45 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00422] Пример 6.9: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ51 L1:33С в животных

[00423] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р26536, а последовательность L2 была из Uniprot Р26539.

[00424] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ51 в сыворотке приведены в Таблице 12.

[00427] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ51 L1:33C, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00428] Пример 6.10: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ52 L1:33C в животных

[00429] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Q05138, а последовательность L2 была из Uniprot F8S4U2.

[00430] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ52 в сыворотке приведены в Таблице 13.

[00433] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ52 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00434] Пример 6.11: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ56 L1:33С в животных

[00435] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р36743, а последовательность L2 была из Uniprot Р36765.

[00436] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ56 в сыворотке приведены в Таблице 14.

[00439] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ56 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00440] Пример 6.12: Оценка иммуногенности вирусоподобных частиц ПВЧ58 L1:33С в животных

[00441] Экспериментальные методы и процедуры были такими же, как и в Примере 6.1. Последовательность L1 была из Uniprot Р26535, а последовательность L2 была из Uniprot B6ZB12.

[00442] Результаты анализа титра нейтрализации псевдовируса ПВЧ58 в сыворотке приведены в Таблице 15.

[00445] Приведенные выше результаты оценки показывают, что вирусоподобные частицы ПВЧ58 L1:33С, полученные в рамках настоящего изобретения, имеют хорошую иммуногенность, могут приводить к образованию высоких титров нейтрализующих антител в животных, и могут применяться в вакцинах для предотвращения инфекции ПВЧ.

[00446] Сравнительный Пример 1. Показана экспрессия укороченного с С-конца L1 ПВЧ16 (аа 1-474)

[00447] Авторы настоящего изобретения попытались укоротить С-конец L1 ПВЧ16 на 31 аминокислоту и назвали его L1 ПВЧ16 (1-474) (SEQ ID NO: 27). Однако, в ходе исследования было обнаружено, что указанный укороченный белок L1 ПВЧ16 (1-474) облдал высокой экспрессией, но имел очень плохую растворимость, и его было очень трудно экстрагировать и очистить, подробные результатыэкспрессии и экстракции показаны на Фиг. 3.

[00448] Несмотря на то, что настоящее изобретение было подробно описано в виде иллюстраций и вариантов осуществления выше, оно предназначено для облегчения понимания. Для специалистов в данной области техники очевидно, что различные модификации и улучшения технических решений настоящего изобретения возможны для специалистов с обычными навыками в области данной техники без отклонения от сути или объема настоящего изобретения, охарактеризованного прилагаемой формулой изобретения.

--->

ПЕРЕЧЕНЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЕЙ

110 SinoCellTech Ltd.

120 ХИМЕРНЫЙ БЕЛОК L1 ПАПИЛЛОМАВИРУСА

130 CIE200063PCT

160 156

170 BiSSAP 1.3.6

210 1

211 469

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 0601 Последовательность аминокислот aa 1-469 белка L1 ПВЧ типа 6

400 1

Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro

1 5 10 15

Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Thr Arg Thr Asn Ile

20 25 30

Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr

35 40 45

Phe Ser Ile Lys Arg Ala Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly

50 55 60

Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe

65 70 75 80

Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val

85 90 95

Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val

100 105 110

Gly Val Ser Gly His Pro Phe Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn

115 120 125

Ser Gly Ser Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val Gly

130 135 140

Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro Pro

145 150 155 160

Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Gln Cys Thr Asn Thr Pro Val

165 170 175

Gln Ala Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile Gln

180 185 190

Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala Asp

195 200 205

Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile Cys Gly Thr Thr

210 215 220

Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly Asp

225 230 235 240

Arg Leu Phe Phe Phe Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His Phe

245 250 255

Phe Asn Arg Ala Gly Glu Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Thr Leu Ile

260 265 270

Ile Lys Gly Ser Gly Asn Arg Thr Ser Val Gly Ser Ser Ile Tyr Val

275 280 285

Asn Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe Asn

290 295 300

Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys

305 310 315 320

Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr

325 330 335

Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Thr Thr Ser Ser Thr Tyr Thr Asn

340 345 350

Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln

355 360 365

Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met Ala

370 375 380

Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe Gly

385 390 395 400

Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr Val

405 410 415

Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu Lys

420 425 430

Pro Asp Pro Tyr Lys Asn Leu Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys Glu

435 440 445

Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu

450 455 460

Leu Gln Ser Gly Tyr

465

210 2

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 0602 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 2

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 3

211 495

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 0603 Последовательность аминокислот химерного белка L1 HPV типа 6

400 3

Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro

1 5 10 15

Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Thr Arg Thr Asn Ile

20 25 30

Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr

35 40 45

Phe Ser Ile Lys Arg Ala Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly

50 55 60

Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe

65 70 75 80

Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val

85 90 95

Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val

100 105 110

Gly Val Ser Gly His Pro Phe Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn

115 120 125

Ser Gly Ser Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val Gly

130 135 140

Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro Pro

145 150 155 160

Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Gln Cys Thr Asn Thr Pro Val

165 170 175

Gln Ala Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile Gln

180 185 190

Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala Asp

195 200 205

Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile Cys Gly Thr Thr

210 215 220

Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly Asp

225 230 235 240

Arg Leu Phe Phe Phe Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His Phe

245 250 255

Phe Asn Arg Ala Gly Glu Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Thr Leu Ile

260 265 270

Ile Lys Gly Ser Gly Asn Arg Thr Ser Val Gly Ser Ser Ile Tyr Val

275 280 285

Asn Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe Asn

290 295 300

Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys

305 310 315 320

Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr

325 330 335

Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Thr Thr Ser Ser Thr Tyr Thr Asn

340 345 350

Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln

355 360 365

Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met Ala

370 375 380

Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe Gly

385 390 395 400

Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr Val

405 410 415

Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu Lys

420 425 430

Pro Asp Pro Tyr Lys Asn Leu Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys Glu

435 440 445

Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu

450 455 460

Leu Gln Ser Gly Tyr Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro

465 470 475 480

Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

485 490 495

210 4

211 1488

212 DNA

213 Искусственная последовательность

220

223 0604 Последовательность нуклеотидов химерного белка L1 ПВЧ типа 6

400 4

atgtggagac catctgacag cacagtctat gtgcctcctc caaaccctgt gagcaaggtg

60

gtggctacag atgcctatgt gaccaggacc aacatcttct accatgcctc ctccagcaga

120

ctgctggctg tgggacaccc atacttcagc atcaagaggg ctaacaagac agtggtgcca

180

aaggtgtctg gctaccaata cagggtgttc aaggtggtgc tgcctgaccc aaacaagttt

240

gccctgcctg actcctccct gtttgaccca accacccaga gactggtgtg ggcttgtact

300

ggattggagg tgggcagggg acaaccactg ggagtgggag tgtctggaca cccattcctg

360

aacaaatatg atgatgtgga gaactctggc tctggaggca accctggaca agacaacagg

420

gtgaatgtgg ggatggacta caagcagacc caactttgta tggtgggctg tgcccctcca

480

ctgggagaac actggggcaa gggcaagcag tgtaccaaca cacctgtcca ggctggagac

540

tgtcctccat tggaactgat tacctctgtg attcaggatg gagatatggt ggacacaggc

600

tttggagcta tgaactttgc tgacctccaa accaacaagt ctgatgtgcc aattgacatc

660

tgtggcacca cttgtaaata ccctgactac ctccaaatgg ctgctgaccc atatggagac

720

agactgttct tcttcctgag gaaggaacag atgtttgcca gacacttctt caacagggct

780

ggagaggtgg gagaacctgt gcctgacacc ctgattatca agggctctgg caacaggacc

840

tctgtgggct ccagcatcta tgtgaacaca ccatctggct ccctggtgtc ctctgaggct

900

caacttttca acaagccata ctggctccaa aaggctcaag gacacaacaa tggcatctgt

960

tggggcaacc aactttttgt gacagtggtg gacaccacca ggagcaccaa tatgaccctg

1020

tgtgcctctg tgaccacctc cagcacctac accaactctg actacaagga atatatgagg

1080

catgtggagg aatatgacct ccaattcatc ttccaacttt gtagcatcac cctgtctgct

1140

gaggtgatgg cttacatcca cacaatgaac ccatctgtgt tggaggactg gaactttgga

1200

ctgagccctc ctccaaatgg caccttggag gacacctaca gatatgtcca gagccaggct

1260

atcacttgtc agaagccaac acctgagaag gagaagcctg acccatacaa gaacctgtcc

1320

ttctgggagg tgaacctgaa agagaagttc tcctctgaac tggaccaata cccactgggc

1380

aggaagttcc tgctccaatc tggctacaaa gccaagccaa aactgaaaag ggctgcccca

1440

accagcacca ggacctcctc tgccaagagg aagaaggtga agaagtaa

1488

210 5

211 1522

212 DNA

213 Искусственная последовательность

220

223 0605 Синтетический ген L1 ПВЧ6

400 5

ctgggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg

60

agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg accaggacca acatcttcta ccatgcctcc

120

tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tacttcagca tcaagagggc taacaagaca

180

gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca

240

aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg

300

gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac

360

ccattcctga acaaatatga tgatgtggag aactctggct ctggaggcaa ccctggacaa

420

gacaacaggg tgaatgtggg gatggactac aagcagaccc aactttgtat ggtgggctgt

480

gcccctccac tgggagaaca ctggggcaag ggcaagcagt gtaccaacac acctgtccag

540

gctggagact gtcctccatt ggaactgatt acctctgtga ttcaggatgg agatatggtg

600

gacacaggct ttggagctat gaactttgct gacctccaaa ccaacaagtc tgatgtgcca

660

attgacatct gtggcaccac ttgtaaatac cctgactacc tccaaatggc tgctgaccca

720

tatggagaca gactgttctt cttcctgagg aaggaacaga tgtttgccag acacttcttc

780

aacagggctg gagaggtggg agaacctgtg cctgacaccc tgattatcaa gggctctggc

840

aacaggacct ctgtgggctc cagcatctat gtgaacacac catctggctc cctggtgtcc

900

tctgaggctc aacttttcaa caagccatac tggctccaaa aggctcaagg acacaacaat

960

ggcatctgtt ggggcaacca actttttgtg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaat

1020

atgaccctgt gtgcctctgt gaccacctcc agcacctaca ccaactctga ctacaaggaa

1080

tatatgaggc atgtggagga atatgacctc caattcatct tccaactttg tagcatcacc

1140

ctgtctgctg aggtgatggc ttacatccac acaatgaacc catctgtgtt ggaggactgg

1200

aactttggac tgagccctcc tccaaatggc accttggagg acacctacag atatgtccag

1260

agccaggcta tcacttgtca gaagccaaca cctgagaagg agaagcctga cccatacaag

1320

aacctgtcct tctgggaggt gaacctgaaa gagaagttct cctctgaact ggaccaatac

1380

ccactgggca ggaagttcct gctccaatct ggctacaggg gcaggtccag catcaggaca

1440

ggagtgaaga gacctgctgt gagcaaggca tctgctgccc caaagaggaa gagggctaag

1500

accaagaggt aaactcgagc tc

1522

210 6

211 1519

212 DNA

213 Искусственная последовательность

220

223 0606 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 6

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 7

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 0607 ПВЧ6L1 F1

400 7

cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagt

35

210 8

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 0608 ПВЧ6L1 R1

400 8

gcttggcttt gtagccagat tggagcagga acttcc

36

210 9

211 1426

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 0609 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ6L1

400 9

cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg

60

agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg accaggacca acatcttcta ccatgcctcc

120

tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tacttcagca tcaagagggc taacaagaca

180

gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca

240

aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg

300

gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac

360

ccattcctga acaaatatga tgatgtggag aactctggct ctggaggcaa ccctggacaa

420

gacaacaggg tgaatgtggg gatggactac aagcagaccc aactttgtat ggtgggctgt

480

gcccctccac tgggagaaca ctggggcaag ggcaagcagt gtaccaacac acctgtccag

540

gctggagact gtcctccatt ggaactgatt acctctgtga ttcaggatgg agatatggtg

600

gacacaggct ttggagctat gaactttgct gacctccaaa ccaacaagtc tgatgtgcca

660

attgacatct gtggcaccac ttgtaaatac cctgactacc tccaaatggc tgctgaccca

720

tatggagaca gactgttctt cttcctgagg aaggaacaga tgtttgccag acacttcttc

780

aacagggctg gagaggtggg agaacctgtg cctgacaccc tgattatcaa gggctctggc

840

aacaggacct ctgtgggctc cagcatctat gtgaacacac catctggctc cctggtgtcc

900

tctgaggctc aacttttcaa caagccatac tggctccaaa aggctcaagg acacaacaat

960

ggcatctgtt ggggcaacca actttttgtg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaat

1020

atgaccctgt gtgcctctgt gaccacctcc agcacctaca ccaactctga ctacaaggaa

1080

tatatgaggc atgtggagga atatgacctc caattcatct tccaactttg tagcatcacc

1140

ctgtctgctg aggtgatggc ttacatccac acaatgaacc catctgtgtt ggaggactgg

1200

aactttggac tgagccctcc tccaaatggc accttggagg acacctacag atatgtccag

1260

agccaggcta tcacttgtca gaagccaaca cctgagaagg agaagcctga cccatacaag

1320

aacctgtcct tctgggaggt gaacctgaaa gagaagttct cctctgaact ggaccaatac

1380

ccactgggca ggaagttcct gctccaatct ggctacaaag ccaagc

1426

210 10

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 0610 ПВЧ6L1 F2

400 10

atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 11

211 37

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 0611 ПВЧ6L1 R2

400 11

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggc

37

210 12

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 0612 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ6L1

400 12

atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 13

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 0613 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 13

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 14

211 470

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1101 Последовательность аминокислот aa 1-470 белка L1 ПВЧ типа 11

400 14

Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro

1 5 10 15

Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Lys Arg Thr Asn Ile

20 25 30

Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr

35 40 45

Tyr Ser Ile Lys Lys Val Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly

50 55 60

Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe

65 70 75 80

Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val

85 90 95

Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val

100 105 110

Gly Val Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn

115 120 125

Ser Gly Gly Tyr Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val

130 135 140

Gly Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro

145 150 155 160

Pro Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Gln Cys Ser Asn Thr Ser

165 170 175

Val Gln Asn Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile

180 185 190

Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala

195 200 205

Asp Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Cys Gly Thr

210 215 220

Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly

225 230 235 240

Asp Arg Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His

245 250 255

Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Asp Leu

260 265 270

Leu Val Lys Gly Gly Asn Asn Arg Ser Ser Val Ala Ser Ser Ile Tyr

275 280 285

Val His Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe

290 295 300

Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile

305 310 315 320

Cys Trp Gly Asn His Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser

325 330 335

Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Ser Lys Ser Ala Thr Tyr Thr

340 345 350

Asn Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Phe Asp Leu

355 360 365

Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met

370 375 380

Ala Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe

385 390 395 400

Gly Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr

405 410 415

Val Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu

420 425 430

Lys Gln Asp Pro Tyr Lys Asp Met Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys

435 440 445

Glu Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe

450 455 460

Leu Leu Gln Ser Gly Tyr

465 470

210 15

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1102 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 15

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 16

211 496

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 1103 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

11

400 16

Met Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Val Pro Pro Pro Asn Pro

1 5 10 15

Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ala Tyr Val Lys Arg Thr Asn Ile

20 25 30

Phe Tyr His Ala Ser Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro Tyr

35 40 45

Tyr Ser Ile Lys Lys Val Asn Lys Thr Val Val Pro Lys Val Ser Gly

50 55 60

Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Lys Val Val Leu Pro Asp Pro Asn Lys Phe

65 70 75 80

Ala Leu Pro Asp Ser Ser Leu Phe Asp Pro Thr Thr Gln Arg Leu Val

85 90 95

Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu Gly Val

100 105 110

Gly Val Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Tyr Asp Asp Val Glu Asn

115 120 125

Ser Gly Gly Tyr Gly Gly Asn Pro Gly Gln Asp Asn Arg Val Asn Val

130 135 140

Gly Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Met Val Gly Cys Ala Pro

145 150 155 160

Pro Leu Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Gln Cys Ser Asn Thr Ser

165 170 175

Val Gln Asn Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Thr Ser Val Ile

180 185 190

Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asn Phe Ala

195 200 205

Asp Leu Gln Thr Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Cys Gly Thr

210 215 220

Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ala Ala Asp Pro Tyr Gly

225 230 235 240

Asp Arg Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Lys Glu Gln Met Phe Ala Arg His

245 250 255

Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Pro Val Pro Asp Asp Leu

260 265 270

Leu Val Lys Gly Gly Asn Asn Arg Ser Ser Val Ala Ser Ser Ile Tyr

275 280 285

Val His Thr Pro Ser Gly Ser Leu Val Ser Ser Glu Ala Gln Leu Phe

290 295 300

Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Lys Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile

305 310 315 320

Cys Trp Gly Asn His Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser

325 330 335

Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Ser Val Ser Lys Ser Ala Thr Tyr Thr

340 345 350

Asn Ser Asp Tyr Lys Glu Tyr Met Arg His Val Glu Glu Phe Asp Leu

355 360 365

Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Ser Ile Thr Leu Ser Ala Glu Val Met

370 375 380

Ala Tyr Ile His Thr Met Asn Pro Ser Val Leu Glu Asp Trp Asn Phe

385 390 395 400

Gly Leu Ser Pro Pro Pro Asn Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Tyr

405 410 415

Val Gln Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Pro Thr Pro Glu Lys Glu

420 425 430

Lys Gln Asp Pro Tyr Lys Asp Met Ser Phe Trp Glu Val Asn Leu Lys

435 440 445

Glu Lys Phe Ser Ser Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe

450 455 460

Leu Leu Gln Ser Gly Tyr Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala

465 470 475 480

Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

485 490 495

210 17

211 1492

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1104 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 11

400 17

atgtggagac catctgacag cacagtctat gtgcctcctc caaaccctgt gagcaaggtg

60

gtggctacag atgcctatgt gaagaggacc aacatcttct accatgcctc ctccagcaga

120

ctgctggctg tgggacaccc atactacagc atcaagaagg tgaacaagac agtggtgcca

180

aaggtgtctg gctaccaata cagggtgttc aaggtggtgc tgcctgaccc aaacaagttt

240

gccctgcctg actcctccct gtttgaccca accacccaga gactggtgtg ggcttgtact

300

ggattggagg tgggcagggg acaaccactg ggagtgggag tgtctggaca cccactgctg

360

aacaaatatg atgatgtgga gaactctgga ggctatggag gcaaccctgg acaagacaac

420

agggtgaatg tggggatgga ctacaagcag acccaacttt gtatggtggg ctgtgcccct

480

ccactgggag aacactgggg caagggcacc cagtgtagca acacctctgt ccagaatgga

540

gactgtcctc cattggaact gattacctct gtgattcagg atggagatat ggtggacaca

600

ggctttggag ctatgaactt tgctgacctc caaaccaaca agtctgatgt gccactggac

660

atctgtggca cagtgtgtaa ataccctgac tacctccaaa tggctgctga cccatatgga

720

gacagactgt tcttctacct gaggaaggaa cagatgtttg ccagacactt cttcaacagg

780

gctggcacag tgggagaacc tgtgcctgat gacctgctgg tgaagggagg caacaacagg

840

tcctctgtgg catccagcat ctatgtgcat acaccatctg gctccctggt gtcctctgag

900

gctcaacttt tcaacaagcc atactggctc caaaaggctc aaggacacaa caatggcatc

960

tgttggggca accacctgtt tgtgacagtg gtggacacca ccaggagcac caatatgacc

1020

ctgtgtgcct ctgtgagcaa gtctgccacc tacaccaact ctgactacaa ggaatatatg

1080

aggcatgtgg aggagtttga cctccaattc atcttccaac tttgtagcat caccctgtct

1140

gctgaggtga tggcttacat ccacacaatg aacccatctg tgttggagga ctggaacttt

1200

ggactgagcc ctcctccaaa tggcaccttg gaggacacct acagatatgt ccagagccag

1260

gctatcactt gtcagaagcc aacacctgag aaggagaagc aggacccata caaggatatg

1320

agtttctggg aggtgaacct gaaagagaag ttctcctctg aactggacca gtttccactg

1380

ggcaggaagt tcctgctcca atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc

1440

ccaaccagca ccaggacctc ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aa

1492

210 18

211 1525

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1105 Синтетический ген L1 ПВЧ11

400 18

ctgggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg

60

agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg aagaggacca acatcttcta ccatgcctcc

120

tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tactacagca tcaagaaggt gaacaagaca

180

gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca

240

aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg

300

gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac

360

ccactgctga acaaatatga tgatgtggag aactctggag gctatggagg caaccctgga

420

caagacaaca gggtgaatgt ggggatggac tacaagcaga cccaactttg tatggtgggc

480

tgtgcccctc cactgggaga acactggggc aagggcaccc agtgtagcaa cacctctgtc

540

cagaatggag actgtcctcc attggaactg attacctctg tgattcagga tggagatatg

600

gtggacacag gctttggagc tatgaacttt gctgacctcc aaaccaacaa gtctgatgtg

660

ccactggaca tctgtggcac agtgtgtaaa taccctgact acctccaaat ggctgctgac

720

ccatatggag acagactgtt cttctacctg aggaaggaac agatgtttgc cagacacttc

780

ttcaacaggg ctggcacagt gggagaacct gtgcctgatg acctgctggt gaagggaggc

840

aacaacaggt cctctgtggc atccagcatc tatgtgcata caccatctgg ctccctggtg

900

tcctctgagg ctcaactttt caacaagcca tactggctcc aaaaggctca aggacacaac

960

aatggcatct gttggggcaa ccacctgttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc

1020

aatatgaccc tgtgtgcctc tgtgagcaag tctgccacct acaccaactc tgactacaag

1080

gaatatatga ggcatgtgga ggagtttgac ctccaattca tcttccaact ttgtagcatc

1140

accctgtctg ctgaggtgat ggcttacatc cacacaatga acccatctgt gttggaggac

1200

tggaactttg gactgagccc tcctccaaat ggcaccttgg aggacaccta cagatatgtc

1260

cagagccagg ctatcacttg tcagaagcca acacctgaga aggagaagca ggacccatac

1320

aaggatatga gtttctggga ggtgaacctg aaagagaagt tctcctctga actggaccag

1380

tttccactgg gcaggaagtt cctgctccaa tctggctaca ggggcaggac ctctgccagg

1440

acaggcatca agagacctgc tgtgagcaag ccaagcacag ccccaaagag gaagaggacc

1500

aagaccaaga agtaaactcg agctc

1525

210 19

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1106 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 19

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 20

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1107 ПВЧ11L1 F1

400 20

cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagt

35

210 21

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1108 ПВЧ11L1 R1

400 21

gcttggcttt gtagccagat tggagcagga acttcc

36

210 22

211 1429

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1109 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ11L1

400 22

cttggtacca tgtggagacc atctgacagc acagtctatg tgcctcctcc aaaccctgtg

60

agcaaggtgg tggctacaga tgcctatgtg aagaggacca acatcttcta ccatgcctcc

120

tccagcagac tgctggctgt gggacaccca tactacagca tcaagaaggt gaacaagaca

180

gtggtgccaa aggtgtctgg ctaccaatac agggtgttca aggtggtgct gcctgaccca

240

aacaagtttg ccctgcctga ctcctccctg tttgacccaa ccacccagag actggtgtgg

300

gcttgtactg gattggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggagt gtctggacac

360

ccactgctga acaaatatga tgatgtggag aactctggag gctatggagg caaccctgga

420

caagacaaca gggtgaatgt ggggatggac tacaagcaga cccaactttg tatggtgggc

480

tgtgcccctc cactgggaga acactggggc aagggcaccc agtgtagcaa cacctctgtc

540

cagaatggag actgtcctcc attggaactg attacctctg tgattcagga tggagatatg

600

gtggacacag gctttggagc tatgaacttt gctgacctcc aaaccaacaa gtctgatgtg

660

ccactggaca tctgtggcac agtgtgtaaa taccctgact acctccaaat ggctgctgac

720

ccatatggag acagactgtt cttctacctg aggaaggaac agatgtttgc cagacacttc

780

ttcaacaggg ctggcacagt gggagaacct gtgcctgatg acctgctggt gaagggaggc

840

aacaacaggt cctctgtggc atccagcatc tatgtgcata caccatctgg ctccctggtg

900

tcctctgagg ctcaactttt caacaagcca tactggctcc aaaaggctca aggacacaac

960

aatggcatct gttggggcaa ccacctgttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc

1020

aatatgaccc tgtgtgcctc tgtgagcaag tctgccacct acaccaactc tgactacaag

1080

gaatatatga ggcatgtgga ggagtttgac ctccaattca tcttccaact ttgtagcatc

1140

accctgtctg ctgaggtgat ggcttacatc cacacaatga acccatctgt gttggaggac

1200

tggaactttg gactgagccc tcctccaaat ggcaccttgg aggacaccta cagatatgtc

1260

cagagccagg ctatcacttg tcagaagcca acacctgaga aggagaagca ggacccatac

1320

aaggatatga gtttctggga ggtgaacctg aaagagaagt tctcctctga actggaccag

1380

tttccactgg gcaggaagtt cctgctccaa tctggctaca aagccaagc

1429

210 23

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1110 ПВЧ11L1 F2

400 23

atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 24

211 37

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1111 ПВЧ11L1 R2

400 24

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggc

37

210 25

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1112 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ11L1

400 25

atctggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 26

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1113 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 26

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 27

211 474

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1601 Последовательность аминокислот aa 1-474 белка L1 ПВЧ типа 16

400 27

Met Ser Leu Trp Leu Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ala Arg Thr Asn

20 25 30

Ile Tyr Tyr His Ala Gly Thr Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Pro Ile Lys Lys Pro Asn Asn Asn Lys Ile Leu Val Pro Lys

50 55 60

Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile His Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Asn Ala Ser Ala Tyr Ala Ala Asn Ala Gly Val Asp Asn Arg

130 135 140

Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly

145 150 155 160

Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys Thr

165 170 175

Asn Val Ala Val Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Asn

180 185 190

Thr Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met

195 200 205

Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile

210 215 220

Cys Thr Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Ile Lys Met Val Ser Glu

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe

245 250 255

Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Ala Val Gly Glu Asn Val Pro

260 265 270

Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Asn Leu Ala Ser

275 280 285

Ser Asn Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala

290 295 300

Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Leu Cys Ala Ala Ile Ser Thr Ser Glu

340 345 350

Thr Thr Tyr Lys Asn Thr Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu

355 360 365

Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr

370 375 380

Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Thr Ile Leu Glu

385 390 395 400

Asp Trp Asn Phe Gly Leu Gln Pro Pro Pro Gly Gly Thr Leu Glu Asp

405 410 415

Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Ala Cys Gln Lys His Thr

420 425 430

Pro Pro Ala Pro Lys Glu Asp Pro Leu Lys Lys Tyr Thr Phe Trp Glu

435 440 445

Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu

450 455 460

Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu

465 470

210 28

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1602 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 28

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 29

211 500

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 1603 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

16

400 29

Met Ser Leu Trp Leu Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ala Arg Thr Asn

20 25 30

Ile Tyr Tyr His Ala Gly Thr Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Pro Ile Lys Lys Pro Asn Asn Asn Lys Ile Leu Val Pro Lys

50 55 60

Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile His Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Asn Ala Ser Ala Tyr Ala Ala Asn Ala Gly Val Asp Asn Arg

130 135 140

Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly

145 150 155 160

Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys Thr

165 170 175

Asn Val Ala Val Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Ile Asn

180 185 190

Thr Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met

195 200 205

Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile

210 215 220

Cys Thr Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Ile Lys Met Val Ser Glu

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe

245 250 255

Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Ala Val Gly Glu Asn Val Pro

260 265 270

Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Asn Leu Ala Ser

275 280 285

Ser Asn Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala

290 295 300

Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Leu Cys Ala Ala Ile Ser Thr Ser Glu

340 345 350

Thr Thr Tyr Lys Asn Thr Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu

355 360 365

Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr

370 375 380

Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Thr Ile Leu Glu

385 390 395 400

Asp Trp Asn Phe Gly Leu Gln Pro Pro Pro Gly Gly Thr Leu Glu Asp

405 410 415

Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Ala Cys Gln Lys His Thr

420 425 430

Pro Pro Ala Pro Lys Glu Asp Pro Leu Lys Lys Tyr Thr Phe Trp Glu

435 440 445

Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu

450 455 460

Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu

465 470 475 480

Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys

485 490 495

Lys Val Lys Lys

500

210 30

211 1504

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1604 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1ПВЧ

типа 16

400 30

atgagtctgt ggctgccatc tgaggctaca gtctacctgc ctcctgtgcc tgtgagcaag

60

gtggtgagca cagatgaata tgtggcaagg accaacatct actaccatgc tggcaccagc

120

agactgctgg ctgtgggaca cccatacttt ccaatcaaga agccaaacaa caacaagatt

180

ctggtgccaa aggtgtctgg actccaatac agggtgttca ggattcacct gcctgaccca

240

aacaagtttg gctttcctga cacctccttc tacaaccctg acacccagag actggtgtgg

300

gcttgtgtgg gagtggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggcat ctctggacac

360

ccactgctga acaaactgga tgacacagag aatgcctctg cctatgctgc caatgctgga

420

gtggacaaca gggagtgtat cagtatggac tacaagcaga cccaactttg tctgattggc

480

tgtaagcctc caattggaga acactggggc aagggcagcc catgtaccaa tgtggctgtg

540

aaccctggag actgtcctcc attggaactg ataaacacag tgattcagga tggagatatg

600

gtggacacag gctttggagc tatggacttc accaccctcc aagccaacaa gtctgaggtg

660

ccactggaca tctgtaccag catctgtaaa taccctgact acatcaagat ggtgtctgaa

720

ccatatggag actccctgtt cttctacctg aggagggaac agatgtttgt gagacacctg

780

ttcaacaggg ctggagcagt gggagagaat gtgcctgatg acctctacat caagggctct

840

ggcagcacag ccaacctggc atccagcaac tactttccaa caccatctgg cagtatggtg

900

acctctgatg cccagatttt caacaagcca tactggctcc aaagggctca aggacacaac

960

aatggcatct gttggggcaa ccaacttttt gtgacagtgg tggacaccac caggagcacc

1020

aatatgagtc tgtgtgctgc catcagcacc tctgagacca cctacaagaa caccaacttc

1080

aaggaatacc tgagacatgg agaggaatat gacctccaat tcatcttcca actttgtaag

1140

attaccctga cagcagatgt gatgacctac atccacagta tgaacagcac catcttggag

1200

gactggaact ttggactcca acctcctcct ggaggcacct tggaggacac ctacaggttt

1260

gtgaccagcc aggctattgc ctgtcagaaa cacacacctc ctgccccaaa ggaggaccca

1320

ctgaaaaaat acaccttctg ggaggtgaac ctgaaagaga agttctctgc tgacctggac

1380

cagtttccac tgggcaggaa gttcctgctc caagcaggac tgaaagccaa gccaaaactg

1440

aaaagggctg ccccaaccag caccaggacc tcctctgcca agaggaagaa ggtgaagaag

1500

taaa

1504

210 31

211 1537

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1605 Синтетический ген L1 ПВЧ16

400 31

ctgggtacca tgagtctgtg gctgccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtggcaagga ccaacatcta ctaccatgct

120

ggcaccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactttc caatcaagaa gccaaacaac

180

aacaagattc tggtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag gattcacctg

240

cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct acaaccctga cacccagaga

300

ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc

360

tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga atgcctctgc ctatgctgcc

420

aatgctggag tggacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt

480

ctgattggct gtaagcctcc aattggagaa cactggggca agggcagccc atgtaccaat

540

gtggctgtga accctggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacagt gattcaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag

660

tctgaggtgc cactggacat ctgtaccagc atctgtaaat accctgacta catcaagatg

720

gtgtctgaac catatggaga ctccctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacctgt tcaacagggc tggagcagtg ggagagaatg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcagcacagc caacctggca tccagcaact actttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgatgc ccagattttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caactttttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgagtct gtgtgctgcc atcagcacct ctgagaccac ctacaagaac

1080

accaacttca aggaatacct gagacatgga gaggaatatg acctccaatt catcttccaa

1140

ctttgtaaga ttaccctgac agcagatgtg atgacctaca tccacagtat gaacagcacc

1200

atcttggagg actggaactt tggactccaa cctcctcctg gaggcacctt ggaggacacc

1260

tacaggtttg tgaccagcca ggctattgcc tgtcagaaac acacacctcc tgccccaaag

1320

gaggacccac tgaaaaaata caccttctgg gaggtgaacc tgaaagagaa gttctctgct

1380

gacctggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aagcaggact gaaagccaag

1440

ccaaagttca ccctgggcaa gaggaaggct acaccaacca cctccagcac cagcaccaca

1500

gccaagagga agaagaggaa actgtaaact cgagctc

1537

210 32

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1606 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 32

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 33

211 34

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1607 ПВЧ16L1 F1

400 33

cttggtacca tgagtctgtg gctgccatct gagg

34

210 34

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1608 ПВЧ16L1 R1

400 34

gcttggcttt cagtcctgct tggagcagga acttcc

36

210 35

211 1441

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1609 ПВЧ16L1 амплифицированная последовательность 1

400 35

cttggtacca tgagtctgtg gctgccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtggcaagga ccaacatcta ctaccatgct

120

ggcaccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactttc caatcaagaa gccaaacaac

180

aacaagattc tggtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag gattcacctg

240

cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct acaaccctga cacccagaga

300

ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc

360

tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga atgcctctgc ctatgctgcc

420

aatgctggag tggacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt

480

ctgattggct gtaagcctcc aattggagaa cactggggca agggcagccc atgtaccaat

540

gtggctgtga accctggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacagt gattcaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag

660

tctgaggtgc cactggacat ctgtaccagc atctgtaaat accctgacta catcaagatg

720

gtgtctgaac catatggaga ctccctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacctgt tcaacagggc tggagcagtg ggagagaatg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcagcacagc caacctggca tccagcaact actttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgatgc ccagattttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caactttttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgagtct gtgtgctgcc atcagcacct ctgagaccac ctacaagaac

1080

accaacttca aggaatacct gagacatgga gaggaatatg acctccaatt catcttccaa

1140

ctttgtaaga ttaccctgac agcagatgtg atgacctaca tccacagtat gaacagcacc

1200

atcttggagg actggaactt tggactccaa cctcctcctg gaggcacctt ggaggacacc

1260

tacaggtttg tgaccagcca ggctattgcc tgtcagaaac acacacctcc tgccccaaag

1320

gaggacccac tgaaaaaata caccttctgg gaggtgaacc tgaaagagaa gttctctgct

1380

gacctggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aagcaggact gaaagccaag

1440

c

1441

210 36

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1610 ПВЧ16L1 F2

400 36

agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 37

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1611 ПВЧ16L1 R2

400 37

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 38

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1612 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ16L1

400 38

agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 39

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1613 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 39

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 40

211 470

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1801 Последовательность аминокислот aa 1-470 белка L1 ПВЧ типа 18

400 40

Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Asn Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro

1 5 10 15

Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro

35 40 45

Tyr Phe Arg Val Pro Ala Gly Gly Gly Asn Lys Gln Asp Ile Pro Lys

50 55 60

Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Ser Ile Tyr Asn Pro Glu Thr Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Ala Gly Val Glu Ile Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Ser Ser His Ala Ala Thr Ser Asn Val Ser Glu Asp Val Arg

130 135 140

Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu Gly

145 150 155 160

Cys Ala Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Ala Cys Lys

165 170 175

Ser Arg Pro Leu Ser Gln Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys Asn

180 185 190

Thr Val Leu Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met

195 200 205

Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp Ile

210 215 220

Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe

245 250 255

Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Thr Met Gly Asp Thr Val Pro

260 265 270

Gln Ser Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Gly Met Arg Ala Ser Pro Gly Ser

275 280 285

Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Asp Ser

290 295 300

Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Val Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Cys Ala Ser Thr Gln Ser Pro Val

340 345 350

Pro Gly Gln Tyr Asp Ala Thr Lys Phe Lys Gln Tyr Ser Arg His Val

355 360 365

Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Ile Thr Leu

370 375 380

Thr Ala Asp Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Ser Ile Leu

385 390 395 400

Glu Asp Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr Ser Leu Val

405 410 415

Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp

420 425 430

Ala Ala Pro Ala Glu Asn Lys Asp Pro Tyr Asp Lys Leu Lys Phe Trp

435 440 445

Asn Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Tyr Pro

450 455 460

Leu Gly Arg Lys Phe Leu

465 470

210 41

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1802 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 41

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 42

211 496

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 1803 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

18

400 42

Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Asn Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro

1 5 10 15

Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro

35 40 45

Tyr Phe Arg Val Pro Ala Gly Gly Gly Asn Lys Gln Asp Ile Pro Lys

50 55 60

Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Ser Ile Tyr Asn Pro Glu Thr Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Ala Gly Val Glu Ile Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Ser Ser His Ala Ala Thr Ser Asn Val Ser Glu Asp Val Arg

130 135 140

Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu Gly

145 150 155 160

Cys Ala Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Ala Cys Lys

165 170 175

Ser Arg Pro Leu Ser Gln Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys Asn

180 185 190

Thr Val Leu Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met

195 200 205

Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp Ile

210 215 220

Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe

245 250 255

Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Thr Met Gly Asp Thr Val Pro

260 265 270

Gln Ser Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Gly Met Arg Ala Ser Pro Gly Ser

275 280 285

Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Asp Ser

290 295 300

Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Val Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Cys Ala Ser Thr Gln Ser Pro Val

340 345 350

Pro Gly Gln Tyr Asp Ala Thr Lys Phe Lys Gln Tyr Ser Arg His Val

355 360 365

Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Ile Thr Leu

370 375 380

Thr Ala Asp Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser Ser Ile Leu

385 390 395 400

Glu Asp Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr Ser Leu Val

405 410 415

Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp

420 425 430

Ala Ala Pro Ala Glu Asn Lys Asp Pro Tyr Asp Lys Leu Lys Phe Trp

435 440 445

Asn Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Tyr Pro

450 455 460

Leu Gly Arg Lys Phe Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala

465 470 475 480

Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

485 490 495

210 43

211 1492

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1804 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 18

400 43

atggccctct ggagaccatc cgataacaca gtgtacttgc ccccacccag cgtcgcccgg

60

gtggtgaaca cagacgacta cgtcaccaga acctcaatct tctaccacgc cgggtccagc

120

cggctgctga ccgtgggcaa cccctacttc cgcgtgcccg ccggcggcgg aaacaaacaa

180

gacatcccca aagtcagcgc ctatcagtac cgggtgttcc gcgtccaact gcccgatccc

240

aacaagttcg gcctgcccga cacctccatc tacaaccccg agacccagag gctggtctgg

300

gcttgcgccg gcgtcgagat cgggaggggc caacccctgg gcgtggggtt gtccggccac

360

cccttctaca acaagctgga cgataccgag tccagccacg cagcaaccag caacgtctcc

420

gaagatgtgc gcgataacgt cagcgtggac tacaaacaaa cccaactgtg catcctggga

480

tgcgcacccg ccatcggcga gcattgggcc aaggggaccg cctgcaagag caggcccctg

540

agccaagggg actgtccacc cctggagttg aagaataccg tgctcgagga cggcgacatg

600

gtggacaccg gctacggcgc tatggatttc tccaccctcc aggacaccaa gtgcgaagtg

660

cccctcgaca tctgccaaag catctgcaag taccccgact acctccagat gagcgccgac

720

ccctacggcg acagcatgtt cttctgtctc agaagggaac aattgttcgc ccgccacttc

780

tggaaccggg ccggcacaat gggagataca gtcccccaga gcctgtacat caaggggacc

840

ggaatgaggg ccagccccgg gtcctgcgtc tacagcccaa gcccctccgg gagcatcgtc

900

acaagcgata gccaactctt caacaagccc tactggctcc acaaagccca aggccacaat

960

aacggggtgt gttggcacaa ccagctgttc gtgaccgtcg tggacacaac caggtccaca

1020

aacctgacca tctgcgccag cacccaaagc cccgtgcccg gccagtacga cgccacaaag

1080

ttcaaacaat actctcggca cgtggaagag tacgacctcc aattcatctt ccaactctgc

1140

accatcaccc tcaccgccga cgtgatgagc tacatccact ccatgaactc ctccatcctg

1200

gaagactgga atttcggcgt gccaccaccc cctaccacct ccctcgtcga cacctacaga

1260

ttcgtgcaga gcgtggccat cacatgccag aaagacgccg cccccgccga gaacaaagac

1320

ccatacgaca aactgaaatt ctggaacgtc gacctgaaag agaaattcag cctggatctg

1380

gaccagtacc cattgggcag gaagttcctc aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc

1440

ccaaccagca ccaggacctc ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aa

1492

210 44

211 1543

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1805 Синтетический ген L1 ПВЧ18

400 44

ctgggtacca tggccctctg gagaccatcc gataacacag tgtacttgcc cccacccagc

60

gtcgcccggg tggtgaacac agacgactac gtcaccagaa cctcaatctt ctaccacgcc

120

gggtccagcc ggctgctgac cgtgggcaac ccctacttcc gcgtgcccgc cggcggcgga

180

aacaaacaag acatccccaa agtcagcgcc tatcagtacc gggtgttccg cgtccaactg

240

cccgatccca acaagttcgg cctgcccgac acctccatct acaaccccga gacccagagg

300

ctggtctggg cttgcgccgg cgtcgagatc gggaggggcc aacccctggg cgtggggttg

360

tccggccacc ccttctacaa caagctggac gataccgagt ccagccacgc agcaaccagc

420

aacgtctccg aagatgtgcg cgataacgtc agcgtggact acaaacaaac ccaactgtgc

480

atcctgggat gcgcacccgc catcggcgag cattgggcca aggggaccgc ctgcaagagc

540

aggcccctga gccaagggga ctgtccaccc ctggagttga agaataccgt gctcgaggac

600

ggcgacatgg tggacaccgg ctacggcgct atggatttct ccaccctcca ggacaccaag

660

tgcgaagtgc ccctcgacat ctgccaaagc atctgcaagt accccgacta cctccagatg

720

agcgccgacc cctacggcga cagcatgttc ttctgtctca gaagggaaca attgttcgcc

780

cgccacttct ggaaccgggc cggcacaatg ggagatacag tcccccagag cctgtacatc

840

aaggggaccg gaatgagggc cagccccggg tcctgcgtct acagcccaag cccctccggg

900

agcatcgtca caagcgatag ccaactcttc aacaagccct actggctcca caaagcccaa

960

ggccacaata acggggtgtg ttggcacaac cagctgttcg tgaccgtcgt ggacacaacc

1020

aggtccacaa acctgaccat ctgcgccagc acccaaagcc ccgtgcccgg ccagtacgac

1080

gccacaaagt tcaaacaata ctctcggcac gtggaagagt acgacctcca attcatcttc

1140

caactctgca ccatcaccct caccgccgac gtgatgagct acatccactc catgaactcc

1200

tccatcctgg aagactggaa tttcggcgtg ccaccacccc ctaccacctc cctcgtcgac

1260

acctacagat tcgtgcagag cgtggccatc acatgccaga aagacgccgc ccccgccgag

1320

aacaaagacc catacgacaa actgaaattc tggaacgtcg acctgaaaga gaaattcagc

1380

ctggatctgg accagtaccc attgggcagg aagttcctcg tgcaagccgg cctcaggaga

1440

aaaccaacaa tcgggcccag gaagaggagc gcccccagcg caaccaccag cagcaagccc

1500

gcaaaaaggg tcagagtgag ggcacgcaaa taaactcgag ctc

1543

210 45

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1806 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 45

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 46

211 34

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1807 ПВЧ18L1 F1

400 46

cttggtacca tggccctctg gagaccatcc gata

34

210 47

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1808 ПВЧ18L1 R1

400 47

gcttggcttt gaggaacttc ctgcccaatg ggtac

35

210 48

211 1429

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1809 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ18L1

400 48

cttggtacca tggccctctg gagaccatcc gataacacag tgtacttgcc cccacccagc

60

gtcgcccggg tggtgaacac agacgactac gtcaccagaa cctcaatctt ctaccacgcc

120

gggtccagcc ggctgctgac cgtgggcaac ccctacttcc gcgtgcccgc cggcggcgga

180

aacaaacaag acatccccaa agtcagcgcc tatcagtacc gggtgttccg cgtccaactg

240

cccgatccca acaagttcgg cctgcccgac acctccatct acaaccccga gacccagagg

300

ctggtctggg cttgcgccgg cgtcgagatc gggaggggcc aacccctggg cgtggggttg

360

tccggccacc ccttctacaa caagctggac gataccgagt ccagccacgc agcaaccagc

420

aacgtctccg aagatgtgcg cgataacgtc agcgtggact acaaacaaac ccaactgtgc

480

atcctgggat gcgcacccgc catcggcgag cattgggcca aggggaccgc ctgcaagagc

540

aggcccctga gccaagggga ctgtccaccc ctggagttga agaataccgt gctcgaggac

600

ggcgacatgg tggacaccgg ctacggcgct atggatttct ccaccctcca ggacaccaag

660

tgcgaagtgc ccctcgacat ctgccaaagc atctgcaagt accccgacta cctccagatg

720

agcgccgacc cctacggcga cagcatgttc ttctgtctca gaagggaaca attgttcgcc

780

cgccacttct ggaaccgggc cggcacaatg ggagatacag tcccccagag cctgtacatc

840

aaggggaccg gaatgagggc cagccccggg tcctgcgtct acagcccaag cccctccggg

900

agcatcgtca caagcgatag ccaactcttc aacaagccct actggctcca caaagcccaa

960

ggccacaata acggggtgtg ttggcacaac cagctgttcg tgaccgtcgt ggacacaacc

1020

aggtccacaa acctgaccat ctgcgccagc acccaaagcc ccgtgcccgg ccagtacgac

1080

gccacaaagt tcaaacaata ctctcggcac gtggaagagt acgacctcca attcatcttc

1140

caactctgca ccatcaccct caccgccgac gtgatgagct acatccactc catgaactcc

1200

tccatcctgg aagactggaa tttcggcgtg ccaccacccc ctaccacctc cctcgtcgac

1260

acctacagat tcgtgcagag cgtggccatc acatgccaga aagacgccgc ccccgccgag

1320

aacaaagacc catacgacaa actgaaattc tggaacgtcg acctgaaaga gaaattcagc

1380

ctggatctgg accagtaccc attgggcagg aagttcctca aagccaagc

1429

210 49

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1810 ПВЧ18L1 F2

400 49

gaagttcctc aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 50

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1811 ПВЧ18L1 R2

400 50

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 51

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 1812 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ18L1

400 51

gaagttcctc aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 52

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 1813 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 52

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 53

211 475

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3101 Последовательность аминокислот aa 1-475 белка L1 ПВЧ типа 31

400 53

Met Ser Leu Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn

20 25 30

Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ala Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Tyr Ser Ile Pro Lys Ser Asp Asn Pro Lys Lys Ile Val Val Pro

50 55 60

Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp

65 70 75 80

Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Glu Thr

85 90 95

Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln

100 105 110

Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Phe Asp

115 120 125

Asp Thr Glu Asn Ser Asn Arg Tyr Ala Gly Gly Pro Gly Thr Asp Asn

130 135 140

Arg Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Leu

145 150 155 160

Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys

165 170 175

Ser Asn Asn Ala Ile Thr Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys

180 185 190

Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala

195 200 205

Met Asp Phe Thr Ala Leu Gln Asp Thr Lys Ser Asn Val Pro Leu Asp

210 215 220

Ile Cys Asn Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ala

225 230 235 240

Glu Pro Tyr Gly Asp Thr Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met

245 250 255

Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ser Gly Thr Val Gly Glu Ser Val

260 265 270

Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Thr Leu Ala

275 280 285

Asn Ser Thr Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp

290 295 300

Ala Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Met Gln Arg Ala Gln Gly His

305 310 315 320

Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp

325 330 335

Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ala Ala Ile Ala Asn Ser

340 345 350

Asp Thr Thr Phe Lys Ser Ser Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly

355 360 365

Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu

370 375 380

Ser Ala Asp Ile Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ala Ile Leu

385 390 395 400

Glu Asp Trp Asn Phe Gly Leu Thr Thr Pro Pro Ser Gly Ser Leu Glu

405 410 415

Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Ser

420 425 430

Ala Pro Gln Lys Pro Lys Glu Asp Pro Phe Lys Asp Tyr Val Phe Trp

435 440 445

Glu Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro

450 455 460

Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Tyr

465 470 475

210 54

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3102 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 54

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 55

211 501

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 3103 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

31

400 55

Met Ser Leu Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn

20 25 30

Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ala Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Tyr Ser Ile Pro Lys Ser Asp Asn Pro Lys Lys Ile Val Val Pro

50 55 60

Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp

65 70 75 80

Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Glu Thr

85 90 95

Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln

100 105 110

Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Phe Asp

115 120 125

Asp Thr Glu Asn Ser Asn Arg Tyr Ala Gly Gly Pro Gly Thr Asp Asn

130 135 140

Arg Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Leu

145 150 155 160

Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Ser Pro Cys

165 170 175

Ser Asn Asn Ala Ile Thr Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys

180 185 190

Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala

195 200 205

Met Asp Phe Thr Ala Leu Gln Asp Thr Lys Ser Asn Val Pro Leu Asp

210 215 220

Ile Cys Asn Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ala

225 230 235 240

Glu Pro Tyr Gly Asp Thr Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met

245 250 255

Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ser Gly Thr Val Gly Glu Ser Val

260 265 270

Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Ser Thr Ala Thr Leu Ala

275 280 285

Asn Ser Thr Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp

290 295 300

Ala Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Met Gln Arg Ala Gln Gly His

305 310 315 320

Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp

325 330 335

Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ala Ala Ile Ala Asn Ser

340 345 350

Asp Thr Thr Phe Lys Ser Ser Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly

355 360 365

Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu

370 375 380

Ser Ala Asp Ile Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ala Ile Leu

385 390 395 400

Glu Asp Trp Asn Phe Gly Leu Thr Thr Pro Pro Ser Gly Ser Leu Glu

405 410 415

Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Ser

420 425 430

Ala Pro Gln Lys Pro Lys Glu Asp Pro Phe Lys Asp Tyr Val Phe Trp

435 440 445

Glu Val Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro

450 455 460

Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Tyr Lys Ala Lys Pro Lys

465 470 475 480

Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg

485 490 495

Lys Lys Val Lys Lys

500

210 56

211 1507

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3104 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 31

400 56

atgagcctgt ggaggcccag cgaggccacc gtgtacctgc cccccgtgcc cgtgagcaag

60

gtggtgagca ccgacgagta cgtgaccagg accaacatct actaccacgc cggcagcgcc

120

aggctgctga ccgtgggcca cccctactac agcatcccca agagcgacaa ccccaagaag

180

atcgtggtgc ccaaggtgag cggcctgcag tacagggtgt tcagggtgag gctgcccgac

240

cccaacaagt tcggcttccc cgacaccagc ttctacaacc ccgagaccca gaggctggtg

300

tgggcctgcg tgggcctgga ggtgggcagg ggccagcccc tgggcgtggg catcagcggc

360

caccccctgc tgaacaagtt cgacgacacc gagaacagca acaggtacgc cggcggcccc

420

ggcaccgaca acagggagtg catcagcatg gactacaagc agacccagct gtgcctgctg

480

ggctgcaagc cccccatcgg cgagcactgg ggcaagggca gcccctgcag caacaacgcc

540

atcacccccg gcgactgccc ccccctggag ctgaagaaca gcgtgatcca ggacggcgac

600

atggtggaca ccggcttcgg cgccatggac ttcaccgccc tgcaggacac caagagcaac

660

gtgcccctgg acatctgcaa cagcatctgc aagtaccccg actacctgaa gatggtggcc

720

gagccctacg gcgacaccct gttcttctac ctgaggaggg agcagatgtt cgtgaggcac

780

ttcttcaaca ggagcggcac cgtgggcgag agcgtgccca ccgacctgta catcaagggc

840

agcggcagca ccgccaccct ggccaacagc acctacttcc ccacccccag cggcagcatg

900

gtgaccagcg acgcccagat cttcaacaag ccctactgga tgcagagggc ccagggccac

960

aacaacggca tctgctgggg caaccagctg ttcgtgaccg tggtggacac caccaggagc

1020

accaacatga gcgtgtgcgc cgccatcgcc aacagcgaca ccaccttcaa gagcagcaac

1080

ttcaaggagt acctgaggca cggcgaggag ttcgacctgc agttcatctt ccagctgtgc

1140

aagatcaccc tgagcgccga catcatgacc tacatccaca gcatgaaccc cgccatcctg

1200

gaggactgga acttcggcct gaccaccccc cccagcggca gcctggagga cacctacagg

1260

ttcgtgacca gccaggccat cacctgccag aagtccgccc cccagaagcc caaggaggac

1320

cccttcaagg actacgtgtt ctgggaggtg aacctgaagg agaagttcag cgccgacctg

1380

gaccagttcc ccctgggcag gaagttcctg ctgcaggccg gctacaaagc caagccaaaa

1440

ctgaaaaggg ctgccccaac cagcaccagg acctcctctg ccaagaggaa gaaggtgaag

1500

aagtaaa

1507

210 57

211 1534

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3105 Синтетический ген L1 ПВЧ31

400 57

ctgggtacca tgagcctgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc

60

gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgaccagga ccaacatcta ctaccacgcc

120

ggcagcgcca ggctgctgac cgtgggccac ccctactaca gcatccccaa gagcgacaac

180

cccaagaaga tcgtggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg

240

ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgagacccag

300

aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag gtgggcaggg gccagcccct gggcgtgggc

360

atcagcggcc accccctgct gaacaagttc gacgacaccg agaacagcaa caggtacgcc

420

ggcggccccg gcaccgacaa cagggagtgc atcagcatgg actacaagca gacccagctg

480

tgcctgctgg gctgcaagcc ccccatcggc gagcactggg gcaagggcag cccctgcagc

540

aacaacgcca tcacccccgg cgactgcccc cccctggagc tgaagaacag cgtgatccag

600

gacggcgaca tggtggacac cggcttcggc gccatggact tcaccgccct gcaggacacc

660

aagagcaacg tgcccctgga catctgcaac agcatctgca agtaccccga ctacctgaag

720

atggtggccg agccctacgg cgacaccctg ttcttctacc tgaggaggga gcagatgttc

780

gtgaggcact tcttcaacag gagcggcacc gtgggcgaga gcgtgcccac cgacctgtac

840

atcaagggca gcggcagcac cgccaccctg gccaacagca cctacttccc cacccccagc

900

ggcagcatgg tgaccagcga cgcccagatc ttcaacaagc cctactggat gcagagggcc

960

cagggccaca acaacggcat ctgctggggc aaccagctgt tcgtgaccgt ggtggacacc

1020

accaggagca ccaacatgag cgtgtgcgcc gccatcgcca acagcgacac caccttcaag

1080

agcagcaact tcaaggagta cctgaggcac ggcgaggagt tcgacctgca gttcatcttc

1140

cagctgtgca agatcaccct gagcgccgac atcatgacct acatccacag catgaacccc

1200

gccatcctgg aggactggaa cttcggcctg accacccccc ccagcggcag cctggaggac

1260

acctacaggt tcgtgaccag ccaggccatc acctgccaga agtccgcccc ccagaagccc

1320

aaggaggacc ccttcaagga ctacgtgttc tgggaggtga acctgaagga gaagttcagc

1380

gccgacctgg accagttccc cctgggcagg aagttcctgc tgcaggccgg ctacagggcc

1440

aggcccaagt tcaaggccgg caagaggagc gcccccagcg ccagcaccac cacccccgcc

1500

aagaggaaga agaccaagaa gtaaactcga gctc

1534

210 58

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3106 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 58

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 59

211 33

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3107 ПВЧ31L1 F1

400 59

cttggtacca tgagcctgtg gaggcccagc gag

33

210 60

211 38

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3108 ПВЧ31L1 R1

400 60

gcttggcttt gtagccggcc tgcagcagga acttcctg

38

210 61

211 1444

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3109 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ31L1

400 61

cttggtacca tgagcctgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc

60

gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgaccagga ccaacatcta ctaccacgcc

120

ggcagcgcca ggctgctgac cgtgggccac ccctactaca gcatccccaa gagcgacaac

180

cccaagaaga tcgtggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg

240

ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgagacccag

300

aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag gtgggcaggg gccagcccct gggcgtgggc

360

atcagcggcc accccctgct gaacaagttc gacgacaccg agaacagcaa caggtacgcc

420

ggcggccccg gcaccgacaa cagggagtgc atcagcatgg actacaagca gacccagctg

480

tgcctgctgg gctgcaagcc ccccatcggc gagcactggg gcaagggcag cccctgcagc

540

aacaacgcca tcacccccgg cgactgcccc cccctggagc tgaagaacag cgtgatccag

600

gacggcgaca tggtggacac cggcttcggc gccatggact tcaccgccct gcaggacacc

660

aagagcaacg tgcccctgga catctgcaac agcatctgca agtaccccga ctacctgaag

720

atggtggccg agccctacgg cgacaccctg ttcttctacc tgaggaggga gcagatgttc

780

gtgaggcact tcttcaacag gagcggcacc gtgggcgaga gcgtgcccac cgacctgtac

840

atcaagggca gcggcagcac cgccaccctg gccaacagca cctacttccc cacccccagc

900

ggcagcatgg tgaccagcga cgcccagatc ttcaacaagc cctactggat gcagagggcc

960

cagggccaca acaacggcat ctgctggggc aaccagctgt tcgtgaccgt ggtggacacc

1020

accaggagca ccaacatgag cgtgtgcgcc gccatcgcca acagcgacac caccttcaag

1080

agcagcaact tcaaggagta cctgaggcac ggcgaggagt tcgacctgca gttcatcttc

1140

cagctgtgca agatcaccct gagcgccgac atcatgacct acatccacag catgaacccc

1200

gccatcctgg aggactggaa cttcggcctg accacccccc ccagcggcag cctggaggac

1260

acctacaggt tcgtgaccag ccaggccatc acctgccaga agtccgcccc ccagaagccc

1320

aaggaggacc ccttcaagga ctacgtgttc tgggaggtga acctgaagga gaagttcagc

1380

gccgacctgg accagttccc cctgggcagg aagttcctgc tgcaggccgg ctacaaagcc

1440

aagc

1444

210 62

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3110 ПВЧ31L1 F2

400 62

ggccggctac aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 63

211 41

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3111 ПВЧ31L1 R2

400 63

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggcaga g

41

210 64

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3112 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ31L1

400 64

ggccggctac aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 65

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3113 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 65

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 66

211 472

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3501 Последовательность аминокислот ПВЧ типа 35 белка L1 aa 1-472

400 66

Met Ser Leu Trp Arg Ser Asn Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Ser Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn

20 25 30

Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Tyr Ala Ile Lys Lys Gln Asp Ser Asn Lys Ile Ala Val Pro Lys

50 55 60

Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Lys Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asp Pro Ala Ser Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Asn Ser Asn Lys Tyr Val Gly Asn Ser Gly Thr Asp Asn Arg

130 135 140

Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly

145 150 155 160

Cys Arg Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Pro Cys Asn

165 170 175

Ala Asn Gln Val Lys Ala Gly Glu Cys Pro Pro Leu Glu Leu Leu Asn

180 185 190

Thr Val Leu Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met

195 200 205

Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile

210 215 220

Cys Ser Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ser Glu

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Met Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe

245 250 255

Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Thr Val Pro

260 265 270

Ala Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Thr Gly Thr Leu Pro Ser Thr Ser

275 280 285

Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala Gln Ile

290 295 300

Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn Gly

305 310 315 320

Ile Cys Trp Ser Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg

325 330 335

Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ser Ala Val Ser Ser Ser Asp Ser Thr

340 345 350

Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu Glu Tyr

355 360 365

Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala Asp

370 375 380

Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ser Ile Leu Glu Asp Trp

385 390 395 400

Asn Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr

405 410 415

Arg Tyr Val Thr Ser Gln Ala Val Thr Cys Gln Lys Pro Ser Ala Pro

420 425 430

Lys Pro Lys Asp Asp Pro Leu Lys Asn Tyr Thr Phe Trp Glu Val Asp

435 440 445

Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg

450 455 460

Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu

465 470

210 67

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3502 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 67

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 68

211 498

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 3503 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

35

400 68

Met Ser Leu Trp Arg Ser Asn Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Ser Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Thr Arg Thr Asn

20 25 30

Ile Tyr Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Tyr Ala Ile Lys Lys Gln Asp Ser Asn Lys Ile Ala Val Pro Lys

50 55 60

Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Lys Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asp Pro Ala Ser Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys Leu Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Asn Ser Asn Lys Tyr Val Gly Asn Ser Gly Thr Asp Asn Arg

130 135 140

Glu Cys Ile Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile Gly

145 150 155 160

Cys Arg Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr Pro Cys Asn

165 170 175

Ala Asn Gln Val Lys Ala Gly Glu Cys Pro Pro Leu Glu Leu Leu Asn

180 185 190

Thr Val Leu Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met

195 200 205

Asp Phe Thr Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile

210 215 220

Cys Ser Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Val Ser Glu

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Met Leu Phe Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe

245 250 255

Val Arg His Leu Phe Asn Arg Ala Gly Thr Val Gly Glu Thr Val Pro

260 265 270

Ala Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Thr Gly Thr Leu Pro Ser Thr Ser

275 280 285

Tyr Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ala Gln Ile

290 295 300

Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn Gly

305 310 315 320

Ile Cys Trp Ser Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr Arg

325 330 335

Ser Thr Asn Met Ser Val Cys Ser Ala Val Ser Ser Ser Asp Ser Thr

340 345 350

Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Leu Arg His Gly Glu Glu Tyr

355 360 365

Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala Asp

370 375 380

Val Met Thr Tyr Ile His Ser Met Asn Pro Ser Ile Leu Glu Asp Trp

385 390 395 400

Asn Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Gly Thr Leu Glu Asp Thr Tyr

405 410 415

Arg Tyr Val Thr Ser Gln Ala Val Thr Cys Gln Lys Pro Ser Ala Pro

420 425 430

Lys Pro Lys Asp Asp Pro Leu Lys Asn Tyr Thr Phe Trp Glu Val Asp

435 440 445

Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg

450 455 460

Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg

465 470 475 480

Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val

485 490 495

Lys Lys

210 69

211 1498

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3504 Последовательность нуклеотидов химерного белка L1 ПВЧ типа

35

400 69

atgagtctgt ggaggagcaa tgaggctaca gtctacctgc ctcctgtgtc tgtgagcaag

60

gtggtgagca cagatgaata tgtgaccagg accaacatct actaccatgc tggctccagc

120

agactgctgg ctgtgggaca cccatactat gccatcaaga agcaggacag caacaagatt

180

gctgtgccaa aggtgtctgg actccaatac agggtgttca gggtgaaact gcctgaccca

240

aacaagtttg gctttcctga cacctccttc tatgaccctg ccagccagag actggtgtgg

300

gcttgtactg gagtggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggcat ctctggacac

360

ccactgctga acaaactgga tgacacagag aacagcaaca aatatgtggg caactctggc

420

acagacaaca gggagtgtat cagtatggac tacaagcaga cccaactttg tctgattggc

480

tgtagacctc caattggaga acactggggc aagggcacac catgtaatgc caaccaggtg

540

aaggctggag agtgtcctcc attggaactg ctgaacacag tgctccaaga tggagatatg

600

gtggacacag gctttggagc tatggacttc accaccctcc aagccaacaa gtctgatgtg

660

ccactggaca tctgttccag catctgtaaa taccctgact acctgaaaat ggtgtctgaa

720

ccatatggag atatgctgtt cttctacctg aggagggaac agatgtttgt gagacacctg

780

ttcaacaggg ctggcacagt gggagagaca gtgcctgctg acctctacat caagggcacc

840

acaggcaccc tgccaagcac ctcctacttt ccaacaccat ctggcagtat ggtgacctct

900

gatgcccaga ttttcaacaa gccatactgg ctccaaaggg ctcaaggaca caacaatggc

960

atctgttgga gcaaccaact ttttgtgaca gtggtggaca ccaccaggag caccaatatg

1020

agtgtgtgtt ctgctgtgtc ctcctctgac agcacctaca agaatgacaa cttcaaggaa

1080

tacctgagac atggagagga atatgacctc caattcatct tccaactttg taagattacc

1140

ctgacagcag atgtgatgac ctacatccac agtatgaacc caagcatctt ggaggactgg

1200

aactttggac tgacacctcc tccatctggc accttggagg acacctacag atatgtgacc

1260

agccaggctg tgacttgtca gaagccatct gccccaaagc caaaggatga cccactgaaa

1320

aactacacct tctgggaggt ggacctgaaa gagaagttct ctgctgacct ggaccagttt

1380

ccactgggca ggaagttcct gctccaagca ggactgaaag ccaagccaaa actgaaaagg

1440

gctgccccaa ccagcaccag gacctcctct gccaagagga agaaggtgaa gaagtaaa

1498

210 70

211 1528

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3505 Синтетический ген L1 ПВЧ35

400 70

ctgggtacca tgagtctgtg gaggagcaat gaggctacag tctacctgcc tcctgtgtct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccaacatcta ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactatg ccatcaagaa gcaggacagc

180

aacaagattg ctgtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag ggtgaaactg

240

cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct atgaccctgc cagccagaga

300

ctggtgtggg cttgtactgg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc

360

tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga acagcaacaa atatgtgggc

420

aactctggca cagacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt

480

ctgattggct gtagacctcc aattggagaa cactggggca agggcacacc atgtaatgcc

540

aaccaggtga aggctggaga gtgtcctcca ttggaactgc tgaacacagt gctccaagat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc cactggacat ctgttccagc atctgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

gtgtctgaac catatggaga tatgctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacctgt tcaacagggc tggcacagtg ggagagacag tgcctgctga cctctacatc

840

aagggcacca caggcaccct gccaagcacc tcctactttc caacaccatc tggcagtatg

900

gtgacctctg atgcccagat tttcaacaag ccatactggc tccaaagggc tcaaggacac

960

aacaatggca tctgttggag caaccaactt tttgtgacag tggtggacac caccaggagc

1020

accaatatga gtgtgtgttc tgctgtgtcc tcctctgaca gcacctacaa gaatgacaac

1080

ttcaaggaat acctgagaca tggagaggaa tatgacctcc aattcatctt ccaactttgt

1140

aagattaccc tgacagcaga tgtgatgacc tacatccaca gtatgaaccc aagcatcttg

1200

gaggactgga actttggact gacacctcct ccatctggca ccttggagga cacctacaga

1260

tatgtgacca gccaggctgt gacttgtcag aagccatctg ccccaaagcc aaaggatgac

1320

ccactgaaaa actacacctt ctgggaggtg gacctgaaag agaagttctc tgctgacctg

1380

gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc cagaccaaac

1440

ttcagactgg gcaagagggc tgcccctgcc agcaccagca agaagtccag caccaagagg

1500

aggaaggtga agagctaaac tcgagctc

1528

210 71

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3506 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 71

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 72

211 34

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3507 ПВЧ35L1 F1

400 72

cttggtacca tgagtctgtg gaggagcaat gagg

34

210 73

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3508 ПВЧ35L1 R1

400 73

gcttggcttt cagtcctgct tggagcagga acttcc

36

210 74

211 1435

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3509 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ35L1

400 74

cttggtacca tgagtctgtg gaggagcaat gaggctacag tctacctgcc tcctgtgtct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccaacatcta ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactatg ccatcaagaa gcaggacagc

180

aacaagattg ctgtgccaaa ggtgtctgga ctccaataca gggtgttcag ggtgaaactg

240

cctgacccaa acaagtttgg ctttcctgac acctccttct atgaccctgc cagccagaga

300

ctggtgtggg cttgtactgg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc

360

tctggacacc cactgctgaa caaactggat gacacagaga acagcaacaa atatgtgggc

420

aactctggca cagacaacag ggagtgtatc agtatggact acaagcagac ccaactttgt

480

ctgattggct gtagacctcc aattggagaa cactggggca agggcacacc atgtaatgcc

540

aaccaggtga aggctggaga gtgtcctcca ttggaactgc tgaacacagt gctccaagat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggagct atggacttca ccaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc cactggacat ctgttccagc atctgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

gtgtctgaac catatggaga tatgctgttc ttctacctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacctgt tcaacagggc tggcacagtg ggagagacag tgcctgctga cctctacatc

840

aagggcacca caggcaccct gccaagcacc tcctactttc caacaccatc tggcagtatg

900

gtgacctctg atgcccagat tttcaacaag ccatactggc tccaaagggc tcaaggacac

960

aacaatggca tctgttggag caaccaactt tttgtgacag tggtggacac caccaggagc

1020

accaatatga gtgtgtgttc tgctgtgtcc tcctctgaca gcacctacaa gaatgacaac

1080

ttcaaggaat acctgagaca tggagaggaa tatgacctcc aattcatctt ccaactttgt

1140

aagattaccc tgacagcaga tgtgatgacc tacatccaca gtatgaaccc aagcatcttg

1200

gaggactgga actttggact gacacctcct ccatctggca ccttggagga cacctacaga

1260

tatgtgacca gccaggctgt gacttgtcag aagccatctg ccccaaagcc aaaggatgac

1320

ccactgaaaa actacacctt ctgggaggtg gacctgaaag agaagttctc tgctgacctg

1380

gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc caagc

1435

210 75

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3510 ПВЧ35L1 F2

400 75

agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 76

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3511 ПВЧ35L1 R2

400 76

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 77

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 351 амплифицированная последовательность 22 ПВЧ35L1

400 77

agcaggactg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 78

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3513 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 78

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 79

211 469

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3901 Последовательность аминокислот aa 1-469 белка L1 ПВЧ типа 39

400 79

Met Ala Met Trp Arg Ser Ser Asp Ser Met Val Tyr Leu Pro Pro Pro

1 5 10 15

Ser Val Ala Lys Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Gly

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Lys Val Gly Met Asn Gly Gly Arg Lys Gln Asp Ile Pro Lys

50 55 60

Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Thr Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Ser Ile Pro Asp Ala Ser Leu Tyr Asn Pro Glu Thr Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Tyr Asn Arg Gln Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Asn Ser Pro Phe Ser Ser Thr Thr Asn Lys Asp Ser Arg Asp

130 135 140

Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys

145 150 155 160

Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Ala Cys Lys Pro

165 170 175

Asn Asn Val Ser Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Asn Thr

180 185 190

Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met Asp

195 200 205

Phe Gly Ala Leu Gln Glu Thr Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile Cys

210 215 220

Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp Val

225 230 235 240

Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala

245 250 255

Arg His Phe Trp Asn Arg Gly Gly Met Val Gly Asp Ala Ile Pro Ala

260 265 270

Gln Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Asp Ile Arg Ala Asn Pro Gly Ser Ser

275 280 285

Val Tyr Cys Pro Ser Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ser Gln

290 295 300

Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn Asn

305 310 315 320

Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Leu Thr Val Val Asp Thr Thr

325 330 335

Arg Ser Thr Asn Phe Thr Leu Ser Thr Ser Ile Glu Ser Ser Ile Pro

340 345 350

Ser Thr Tyr Asp Pro Ser Lys Phe Lys Glu Tyr Thr Arg His Val Glu

355 360 365

Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Val Thr Leu Thr

370 375 380

Thr Asp Val Met Ser Tyr Ile His Thr Met Asn Ser Ser Ile Leu Asp

385 390 395 400

Asn Trp Asn Phe Ala Val Ala Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Val Asp

405 410 415

Thr Tyr Arg Tyr Leu Gln Ser Ala Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp Ala

420 425 430

Pro Ala Pro Glu Lys Lys Asp Pro Tyr Asp Gly Leu Lys Phe Trp Asn

435 440 445

Val Asp Leu Arg Glu Lys Phe Ser Leu Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu

450 455 460

Gly Arg Lys Phe Leu

465

210 80

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3902 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 80

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 81

211 507

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 3903 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

39

400 81

Met Ala Met Trp Arg Ser Ser Asp Ser Met Val Tyr Leu Pro Pro Pro

1 5 10 15

Ser Val Ala Lys Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Thr Arg Thr Gly

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Lys Val Gly Met Asn Gly Gly Arg Lys Gln Asp Ile Pro Lys

50 55 60

Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Thr Leu Pro Asp Pro

65 70 75 80

Asn Lys Phe Ser Ile Pro Asp Ala Ser Leu Tyr Asn Pro Glu Thr Gln

85 90 95

Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro

100 105 110

Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Tyr Asn Arg Gln Asp Asp

115 120 125

Thr Glu Asn Ser Pro Phe Ser Ser Thr Thr Asn Lys Asp Ser Arg Asp

130 135 140

Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys

145 150 155 160

Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Lys Ala Cys Lys Pro

165 170 175

Asn Asn Val Ser Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Asn Thr

180 185 190

Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Tyr Gly Ala Met Asp

195 200 205

Phe Gly Ala Leu Gln Glu Thr Lys Ser Glu Val Pro Leu Asp Ile Cys

210 215 220

Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala Asp Val

225 230 235 240

Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala

245 250 255

Arg His Phe Trp Asn Arg Gly Gly Met Val Gly Asp Ala Ile Pro Ala

260 265 270

Gln Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Asp Ile Arg Ala Asn Pro Gly Ser Ser

275 280 285

Val Tyr Cys Pro Ser Pro Ser Gly Ser Met Val Thr Ser Asp Ser Gln

290 295 300

Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln Gly His Asn Asn

305 310 315 320

Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Leu Thr Val Val Asp Thr Thr

325 330 335

Arg Ser Thr Asn Phe Thr Leu Ser Thr Ser Ile Glu Ser Ser Ile Pro

340 345 350

Ser Thr Tyr Asp Pro Ser Lys Phe Lys Glu Tyr Thr Arg His Val Glu

355 360 365

Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr Val Thr Leu Thr

370 375 380

Thr Asp Val Met Ser Tyr Ile His Thr Met Asn Ser Ser Ile Leu Asp

385 390 395 400

Asn Trp Asn Phe Ala Val Ala Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Val Asp

405 410 415

Thr Tyr Arg Tyr Leu Gln Ser Ala Ala Ile Thr Cys Gln Lys Asp Ala

420 425 430

Pro Ala Pro Glu Lys Lys Asp Pro Tyr Asp Gly Leu Lys Phe Trp Asn

435 440 445

Val Asp Leu Arg Glu Lys Phe Ser Leu Glu Leu Asp Gln Phe Pro Leu

450 455 460

Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile

465 470 475 480

Gly Pro Arg Lys Arg Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro

485 490 495

Lys Arg Val Lys Arg Arg Lys Ser Ser Arg Lys

500 505

210 82

211 1525

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3904 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 39

400 82

atggctatgt ggaggtcctc tgacagtatg gtctacctgc ctcctccatc tgtggctaag

60

gtggtgaaca cagatgacta tgtgaccagg acaggcatct actactatgc tggctccagc

120

agactgctga cagtgggaca cccatacttc aaggtgggga tgaatggagg caggaagcag

180

gacatcccaa aggtgtctgc ctaccaatac agggtgttca gggtgaccct gcctgaccca

240

aacaagttca gcatccctga tgcctccctc tacaaccctg agacccagag actggtgtgg

300

gcttgtgtgg gagtggaggt gggcagggga caaccactgg gagtgggcat ctctggacac

360

ccactctaca acagacagga tgacacagag aacagcccat tctccagcac caccaacaag

420

gacagcaggg acaatgtgtc tgtggactac aagcagaccc aactttgtat cattggctgt

480

gtgcctgcca ttggagaaca ctggggcaag ggcaaggctt gtaagccaaa caatgtgagc

540

acaggagact gtcctccatt ggaactggtg aacacaccaa ttgaggatgg agatatgatt

600

gacacaggct atggagctat ggactttgga gccctccaag agaccaagtc tgaggtgcca

660

ctggacatct gtcagagcat ctgtaaatac cctgactacc tccaaatgag tgctgatgtc

720

tatggagaca gtatgttctt ctgtctgagg agggaacaac tttttgccag acacttctgg

780

aacaggggag ggatggtggg agatgccatc cctgcccaac tctacatcaa gggcacagac

840

atcagggcta accctggctc ctctgtctac tgtccaagcc catctggcag tatggtgacc

900

tctgacagcc aacttttcaa caagccatac tggctgcaca aggctcaagg acacaacaat

960

ggcatctgtt ggcacaacca acttttcctg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaac

1020

ttcaccctga gcaccagcat tgagtccagc atcccaagca cctatgaccc aagcaagttc

1080

aaggaataca ccaggcatgt ggaggaatat gacctccaat tcatcttcca actttgtact

1140

gtgaccctga ccacagatgt gatgagttac atccacacaa tgaactccag catcctggac

1200

aactggaact ttgctgtggc tcctcctcca tctgcctccc tggtggacac ctacagatac

1260

ctccaatctg ctgccatcac ttgtcagaag gatgcccctg cccctgagaa gaaggaccca

1320

tatgatggac tgaagttctg gaatgtggac ctgagggaga agttctcctt ggaactggac

1380

cagtttccac tgggcaggaa gttcctgctc caacttggag ccagaccaaa gccaaccatt

1440

ggaccaagga agagggctgc ccctgcccca accagcacac caagcccaaa gagggtgaag

1500

aggaggaagt ccagcaggaa gtaaa

1525

210 83

211 1537

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3905 Синтетический ген L1 ПВЧ39

400 83

ctgggtacca tggctatgtg gaggtcctct gacagtatgg tctacctgcc tcctccatct

60

gtggctaagg tggtgaacac agatgactat gtgaccagga caggcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtggggat gaatggaggc

180

aggaagcagg acatcccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaccctg

240

cctgacccaa acaagttcag catccctgat gcctccctct acaaccctga gacccagaga

300

ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc

360

tctggacacc cactctacaa cagacaggat gacacagaga acagcccatt ctccagcacc

420

accaacaagg acagcaggga caatgtgtct gtggactaca agcagaccca actttgtatc

480

attggctgtg tgcctgccat tggagaacac tggggcaagg gcaaggcttg taagccaaac

540

aatgtgagca caggagactg tcctccattg gaactggtga acacaccaat tgaggatgga

600

gatatgattg acacaggcta tggagctatg gactttggag ccctccaaga gaccaagtct

660

gaggtgccac tggacatctg tcagagcatc tgtaaatacc ctgactacct ccaaatgagt

720

gctgatgtct atggagacag tatgttcttc tgtctgagga gggaacaact ttttgccaga

780

cacttctgga acaggggagg gatggtggga gatgccatcc ctgcccaact ctacatcaag

840

ggcacagaca tcagggctaa ccctggctcc tctgtctact gtccaagccc atctggcagt

900

atggtgacct ctgacagcca acttttcaac aagccatact ggctgcacaa ggctcaagga

960

cacaacaatg gcatctgttg gcacaaccaa cttttcctga cagtggtgga caccaccagg

1020

agcaccaact tcaccctgag caccagcatt gagtccagca tcccaagcac ctatgaccca

1080

agcaagttca aggaatacac caggcatgtg gaggaatatg acctccaatt catcttccaa

1140

ctttgtactg tgaccctgac cacagatgtg atgagttaca tccacacaat gaactccagc

1200

atcctggaca actggaactt tgctgtggct cctcctccat ctgcctccct ggtggacacc

1260

tacagatacc tccaatctgc tgccatcact tgtcagaagg atgcccctgc ccctgagaag

1320

aaggacccat atgatggact gaagttctgg aatgtggacc tgagggagaa gttctccttg

1380

gaactggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aagccagggt gaggaggaga

1440

ccaaccattg gaccaaggaa gagacctgct gccagcacct cctcctcctc tgccaccaaa

1500

cacaagagga agagggtgag caagtaaact cgagctc

1537

210 84

211 1546

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3906 Синтетический ген L1 ПВЧ59

400 84

ctgggtacca tggctctgtg gaggtcctct gacaacaagg tctacctgcc tcctccatct

60

gtggctaagg tggtgagcac agatgaatat gtgaccagga ccagcatctt ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtgccaaa gggaggcaat

180

ggcagacagg atgtgccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaaactg

240

cctgacccaa acaagtttgg actgcctgac aacacagtct atgacccaaa cagccagaga

300

ctggtgtggg cttgtgtggg agtggagatt ggcaggggac aaccactggg agtgggactg

360

tctggacacc cactctacaa caaactggat gacacagaga actctcatgt ggcatctgct

420

gtggacacca aggacaccag ggacaatgtg tctgtggact acaagcagac ccaactttgt

480

atcattggct gtgtgcctgc cattggagaa cactggacca agggcacagc ctgtaagcca

540

accacagtgg tccagggaga ctgtcctcca ttggaactga taaacacacc aattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctatggagct atggacttca aactgctcca agacaacaag

660

tctgaggtgc cactggacat ctgtcagagc atctgtaaat accctgacta cctccaaatg

720

agtgctgatg cctatggaga cagtatgttc ttctgtctga ggagggaaca ggtgtttgcc

780

agacacttct ggaacaggtc tggcacaatg ggagaccaac ttcctgagtc cctctacatc

840

aagggcacag acatcagggc taaccctggc tcctacctct acagcccaag cccatctggc

900

tctgtggtga cctctgacag ccaacttttc aacaagccat actggctgca caaggctcaa

960

ggactgaaca atggcatctg ttggcacaac caacttttcc tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca acctgtctgt gtgtgccagc accacctcca gcatcccaaa tgtctacaca

1080

ccaacctcct tcaaggaata tgccaggcat gtggaggagt ttgacctcca attcatcttc

1140

caactttgta agattaccct gaccacagag gtgatgagtt acatccacaa tatgaacacc

1200

accatcttgg aggactggaa ctttggagtg acacctcctc caacagcctc cctggtggac

1260

acctacaggt ttgtccagtc tgctgctgtg acttgtcaga aggacacagc ccctcctgtg

1320

aagcaggacc catatgacaa actgaagttc tggcctgtgg acctgaaaga gaggttctct

1380

gctgacctgg accagtttcc actgggcagg aagttcctgc tccaacttgg agccagacca

1440

aagccaacca ttggaccaag gaagagggct gcccctgccc caaccagcac accaagccca

1500

aagagggtga agaggaggaa gtccagcagg aagtaaactc gagctc

1546

210 85

211 38

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3907 ПВЧ39L1 F1

400 85

cttggtacca tggctatgtg gaggtcctct gacagtat

38

210 86

211 38

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3908 ПВЧ39L1 R1

400 86

tccaagttgg agcaggaact tcctgcccag tggaaact

38

210 87

211 1428

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3909 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ39L1

400 87

cttggtacca tggctatgtg gaggtcctct gacagtatgg tctacctgcc tcctccatct

60

gtggctaagg tggtgaacac agatgactat gtgaccagga caggcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctgac agtgggacac ccatacttca aggtggggat gaatggaggc

180

aggaagcagg acatcccaaa ggtgtctgcc taccaataca gggtgttcag ggtgaccctg

240

cctgacccaa acaagttcag catccctgat gcctccctct acaaccctga gacccagaga

300

ctggtgtggg cttgtgtggg agtggaggtg ggcaggggac aaccactggg agtgggcatc

360

tctggacacc cactctacaa cagacaggat gacacagaga acagcccatt ctccagcacc

420

accaacaagg acagcaggga caatgtgtct gtggactaca agcagaccca actttgtatc

480

attggctgtg tgcctgccat tggagaacac tggggcaagg gcaaggcttg taagccaaac

540

aatgtgagca caggagactg tcctccattg gaactggtga acacaccaat tgaggatgga

600

gatatgattg acacaggcta tggagctatg gactttggag ccctccaaga gaccaagtct

660

gaggtgccac tggacatctg tcagagcatc tgtaaatacc ctgactacct ccaaatgagt

720

gctgatgtct atggagacag tatgttcttc tgtctgagga gggaacaact ttttgccaga

780

cacttctgga acaggggagg gatggtggga gatgccatcc ctgcccaact ctacatcaag

840

ggcacagaca tcagggctaa ccctggctcc tctgtctact gtccaagccc atctggcagt

900

atggtgacct ctgacagcca acttttcaac aagccatact ggctgcacaa ggctcaagga

960

cacaacaatg gcatctgttg gcacaaccaa cttttcctga cagtggtgga caccaccagg

1020

agcaccaact tcaccctgag caccagcatt gagtccagca tcccaagcac ctatgaccca

1080

agcaagttca aggaatacac caggcatgtg gaggaatatg acctccaatt catcttccaa

1140

ctttgtactg tgaccctgac cacagatgtg atgagttaca tccacacaat gaactccagc

1200

atcctggaca actggaactt tgctgtggct cctcctccat ctgcctccct ggtggacacc

1260

tacagatacc tccaatctgc tgccatcact tgtcagaagg atgcccctgc ccctgagaag

1320

aaggacccat atgatggact gaagttctgg aatgtggacc tgagggagaa gttctccttg

1380

gaactggacc agtttccact gggcaggaag ttcctgctcc aacttgga

1428

210 88

211 37

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3910 ПВЧ39L1 F2

400 88

aggaagttcc tgctccaact tggagccaga ccaaagc

37

210 89

211 40

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3911 ПВЧ39L1 R2

400 89

ctgtctagat ttacttcctg ctggacttcc tcctcttcac

40

210 90

211 139

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 3912 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ39L1

400 90

aggaagttcc tgctccaact tggagccaga ccaaagccaa ccattggacc aaggaagagg

60

gctgcccctg ccccaaccag cacaccaagc ccaaagaggg tgaagaggag gaagtccagc

120

aggaagtaaa tctagacag

139

210 91

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 3913 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 91

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 92

211 478

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 4501 Последовательность аминокислот aa 1-478 белка L1 ПВЧ типа 45

400 92

Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro

1 5 10 15

Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Ser Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro

35 40 45

Tyr Phe Arg Val Val Pro Ser Gly Ala Gly Asn Lys Gln Ala Val Pro

50 55 60

Lys Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Ala Leu Pro Asp

65 70 75 80

Pro Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Ser Thr Ile Tyr Asn Pro Glu Thr

85 90 95

Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Met Glu Ile Gly Arg Gly Gln

100 105 110

Pro Leu Gly Ile Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp

115 120 125

Asp Thr Glu Ser Ala His Ala Ala Thr Ala Val Ile Thr Gln Asp Val

130 135 140

Arg Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu

145 150 155 160

Gly Cys Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Leu Cys

165 170 175

Lys Pro Ala Gln Leu Gln Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys

180 185 190

Asn Thr Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala

195 200 205

Met Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp

210 215 220

Ile Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala

225 230 235 240

Asp Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu

245 250 255

Phe Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Val Met Gly Asp Thr Val

260 265 270

Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Ser Ala Asn Met Arg Glu Thr

275 280 285

Pro Gly Ser Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Thr Thr

290 295 300

Ser Asp Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln

305 310 315 320

Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val

325 330 335

Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Leu Cys Ala Ser Thr Gln

340 345 350

Asn Pro Val Pro Asn Thr Tyr Asp Pro Thr Lys Phe Lys His Tyr Ser

355 360 365

Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr

370 375 380

Ile Thr Leu Thr Ala Glu Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser

385 390 395 400

Ser Ile Leu Glu Asn Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr

405 410 415

Ser Leu Val Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Val Thr Cys

420 425 430

Gln Lys Asp Thr Thr Pro Pro Glu Lys Gln Asp Pro Tyr Asp Lys Leu

435 440 445

Lys Phe Trp Thr Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ser Asp Leu Asp

450 455 460

Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Val Gln Ala Gly Leu

465 470 475

210 93

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 4502 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 93

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 94

211 504

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 4503 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

45

400 94

Met Ala Leu Trp Arg Pro Ser Asp Ser Thr Val Tyr Leu Pro Pro Pro

1 5 10 15

Ser Val Ala Arg Val Val Asn Thr Asp Asp Tyr Val Ser Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly Asn Pro

35 40 45

Tyr Phe Arg Val Val Pro Ser Gly Ala Gly Asn Lys Gln Ala Val Pro

50 55 60

Lys Val Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Ala Leu Pro Asp

65 70 75 80

Pro Asn Lys Phe Gly Leu Pro Asp Ser Thr Ile Tyr Asn Pro Glu Thr

85 90 95

Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Met Glu Ile Gly Arg Gly Gln

100 105 110

Pro Leu Gly Ile Gly Leu Ser Gly His Pro Phe Tyr Asn Lys Leu Asp

115 120 125

Asp Thr Glu Ser Ala His Ala Ala Thr Ala Val Ile Thr Gln Asp Val

130 135 140

Arg Asp Asn Val Ser Val Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Leu

145 150 155 160

Gly Cys Val Pro Ala Ile Gly Glu His Trp Ala Lys Gly Thr Leu Cys

165 170 175

Lys Pro Ala Gln Leu Gln Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Lys

180 185 190

Asn Thr Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Tyr Gly Ala

195 200 205

Met Asp Phe Ser Thr Leu Gln Asp Thr Lys Cys Glu Val Pro Leu Asp

210 215 220

Ile Cys Gln Ser Ile Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met Ser Ala

225 230 235 240

Asp Pro Tyr Gly Asp Ser Met Phe Phe Cys Leu Arg Arg Glu Gln Leu

245 250 255

Phe Ala Arg His Phe Trp Asn Arg Ala Gly Val Met Gly Asp Thr Val

260 265 270

Pro Thr Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Thr Ser Ala Asn Met Arg Glu Thr

275 280 285

Pro Gly Ser Cys Val Tyr Ser Pro Ser Pro Ser Gly Ser Ile Thr Thr

290 295 300

Ser Asp Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Lys Ala Gln

305 310 315 320

Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp His Asn Gln Leu Phe Val Thr Val

325 330 335

Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Leu Cys Ala Ser Thr Gln

340 345 350

Asn Pro Val Pro Asn Thr Tyr Asp Pro Thr Lys Phe Lys His Tyr Ser

355 360 365

Arg His Val Glu Glu Tyr Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Thr

370 375 380

Ile Thr Leu Thr Ala Glu Val Met Ser Tyr Ile His Ser Met Asn Ser

385 390 395 400

Ser Ile Leu Glu Asn Trp Asn Phe Gly Val Pro Pro Pro Pro Thr Thr

405 410 415

Ser Leu Val Asp Thr Tyr Arg Phe Val Gln Ser Val Ala Val Thr Cys

420 425 430

Gln Lys Asp Thr Thr Pro Pro Glu Lys Gln Asp Pro Tyr Asp Lys Leu

435 440 445

Lys Phe Trp Thr Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ser Asp Leu Asp

450 455 460

Gln Tyr Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Val Gln Ala Gly Leu Lys Ala

465 470 475 480

Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser

485 490 495

Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

500

210 95

211 1516

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4504 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 45

400 95

atggctctgt ggagaccatc tgacagcaca gtctacctgc ctcctccatc tgtggcaagg

60

gtggtgaaca cagatgacta tgtgagcagg accagcatct tctaccatgc tggctccagc

120

agactgctga cagtgggcaa cccatacttc agggtggtgc caagtggagc aggcaacaag

180

caggctgtgc caaaggtgtc tgcctaccaa tacagggtgt tcagggtggc tctgcctgac

240

ccaaacaagt ttggactgcc tgacagcacc atctacaacc ctgagaccca gagactggtg

300

tgggcttgtg tggggatgga gattggcagg ggacaaccac tgggcattgg actgtctgga

360

cacccattct acaacaaact ggatgacaca gagtctgccc atgctgccac agcagtgatt

420

acccaggatg tgagggacaa tgtgtctgtg gactacaagc agacccaact ttgtatcctg

480

ggctgtgtgc ctgccattgg agaacactgg gctaagggca ccctgtgtaa gcctgcccaa

540

ctccaacctg gagactgtcc tccattggaa ctgaaaaaca ccatcattga ggatggagat

600

atggtggaca caggctatgg agctatggac ttcagcaccc tccaagacac caagtgtgag

660

gtgccactgg acatctgtca gagcatctgt aaataccctg actacctcca aatgagtgct

720

gacccatatg gagacagtat gttcttctgt ctgaggaggg aacaactttt tgccagacac

780

ttctggaaca gggctggagt gatgggagac acagtgccaa cagacctcta catcaagggc

840

acctctgcca atatgaggga gacacctggc tcctgtgtct acagcccaag cccatctggc

900

agcatcacca cctctgacag ccaacttttc aacaagccat actggctgca caaggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggcacaac caactttttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca acctgaccct gtgtgccagc acccagaacc ctgtgccaaa cacctatgac

1080

ccaaccaagt tcaagcacta cagcaggcat gtggaggaat atgacctcca attcatcttc

1140

caactttgta ccatcaccct gacagcagag gtgatgagtt acatccacag tatgaactcc

1200

agcatcttgg agaactggaa ctttggagtg cctcctcctc caaccacctc cctggtggac

1260

acctacaggt ttgtccagtc tgtggctgtg acttgtcaga aggacaccac acctcctgag

1320

aagcaggacc catatgacaa actgaagttc tggacagtgg acctgaaaga gaagttctcc

1380

tctgacctgg accaataccc actgggcagg aagttcctgg tccaggctgg actgaaagcc

1440

aagccaaaac tgaaaagggc tgccccaacc agcaccagga cctcctctgc caagaggaag

1500

aaggtgaaga agtaaa

1516

210 96

211 1552

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4505 Синтетический ген L1 ПВЧ45

400 96

ctgggtacca tggctctgtg gagaccatct gacagcacag tctacctgcc tcctccatct

60

gtggcaaggg tggtgaacac agatgactat gtgagcagga ccagcatctt ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctgac agtgggcaac ccatacttca gggtggtgcc aagtggagca

180

ggcaacaagc aggctgtgcc aaaggtgtct gcctaccaat acagggtgtt cagggtggct

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggactgcct gacagcacca tctacaaccc tgagacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt ggggatggag attggcaggg gacaaccact gggcattgga

360

ctgtctggac acccattcta caacaaactg gatgacacag agtctgccca tgctgccaca

420

gcagtgatta cccaggatgt gagggacaat gtgtctgtgg actacaagca gacccaactt

480

tgtatcctgg gctgtgtgcc tgccattgga gaacactggg ctaagggcac cctgtgtaag

540

cctgcccaac tccaacctgg agactgtcct ccattggaac tgaaaaacac catcattgag

600

gatggagata tggtggacac aggctatgga gctatggact tcagcaccct ccaagacacc

660

aagtgtgagg tgccactgga catctgtcag agcatctgta aataccctga ctacctccaa

720

atgagtgctg acccatatgg agacagtatg ttcttctgtc tgaggaggga acaacttttt

780

gccagacact tctggaacag ggctggagtg atgggagaca cagtgccaac agacctctac

840

atcaagggca cctctgccaa tatgagggag acacctggct cctgtgtcta cagcccaagc

900

ccatctggca gcatcaccac ctctgacagc caacttttca acaagccata ctggctgcac

960

aaggctcaag gacacaacaa tggcatctgt tggcacaacc aactttttgt gacagtggtg

1020

gacaccacca ggagcaccaa cctgaccctg tgtgccagca cccagaaccc tgtgccaaac

1080

acctatgacc caaccaagtt caagcactac agcaggcatg tggaggaata tgacctccaa

1140

ttcatcttcc aactttgtac catcaccctg acagcagagg tgatgagtta catccacagt

1200

atgaactcca gcatcttgga gaactggaac tttggagtgc ctcctcctcc aaccacctcc

1260

ctggtggaca cctacaggtt tgtccagtct gtggctgtga cttgtcagaa ggacaccaca

1320

cctcctgaga agcaggaccc atatgacaaa ctgaagttct ggacagtgga cctgaaagag

1380

aagttctcct ctgacctgga ccaataccca ctgggcagga agttcctggt ccaggctgga

1440

ctgaggagga gaccaaccat tggaccaagg aagagacctg ctgccagcac cagcacagcc

1500

agcagacctg ccaagagggt gaggattagg agcaagaagt aaactcgagc tc

1552

210 97

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4506 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 97

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 98

211 33

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4507 ПВЧ45L1 F1

400 98

cttggtacca tggctctgtg gagaccatct gac

33

210 99

211 32

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4508 ПВЧ45L1 R1

400 99

gcttggcttt cagtccagcc tggaccagga ac

32

210 100

211 1453

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4509 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ45L1

400 100

cttggtacca tggctctgtg gagaccatct gacagcacag tctacctgcc tcctccatct

60

gtggcaaggg tggtgaacac agatgactat gtgagcagga ccagcatctt ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctgac agtgggcaac ccatacttca gggtggtgcc aagtggagca

180

ggcaacaagc aggctgtgcc aaaggtgtct gcctaccaat acagggtgtt cagggtggct

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggactgcct gacagcacca tctacaaccc tgagacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt ggggatggag attggcaggg gacaaccact gggcattgga

360

ctgtctggac acccattcta caacaaactg gatgacacag agtctgccca tgctgccaca

420

gcagtgatta cccaggatgt gagggacaat gtgtctgtgg actacaagca gacccaactt

480

tgtatcctgg gctgtgtgcc tgccattgga gaacactggg ctaagggcac cctgtgtaag

540

cctgcccaac tccaacctgg agactgtcct ccattggaac tgaaaaacac catcattgag

600

gatggagata tggtggacac aggctatgga gctatggact tcagcaccct ccaagacacc

660

aagtgtgagg tgccactgga catctgtcag agcatctgta aataccctga ctacctccaa

720

atgagtgctg acccatatgg agacagtatg ttcttctgtc tgaggaggga acaacttttt

780

gccagacact tctggaacag ggctggagtg atgggagaca cagtgccaac agacctctac

840

atcaagggca cctctgccaa tatgagggag acacctggct cctgtgtcta cagcccaagc

900

ccatctggca gcatcaccac ctctgacagc caacttttca acaagccata ctggctgcac

960

aaggctcaag gacacaacaa tggcatctgt tggcacaacc aactttttgt gacagtggtg

1020

gacaccacca ggagcaccaa cctgaccctg tgtgccagca cccagaaccc tgtgccaaac

1080

acctatgacc caaccaagtt caagcactac agcaggcatg tggaggaata tgacctccaa

1140

ttcatcttcc aactttgtac catcaccctg acagcagagg tgatgagtta catccacagt

1200

atgaactcca gcatcttgga gaactggaac tttggagtgc ctcctcctcc aaccacctcc

1260

ctggtggaca cctacaggtt tgtccagtct gtggctgtga cttgtcagaa ggacaccaca

1320

cctcctgaga agcaggaccc atatgacaaa ctgaagttct ggacagtgga cctgaaagag

1380

aagttctcct ctgacctgga ccaataccca ctgggcagga agttcctggt ccaggctgga

1440

ctgaaagcca agc

1453

210 101

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4510 ПВЧ45L1 F2

400 101

ggctggactg aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 102

211 37

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4511 ПВЧ45L1 R2

400 102

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttggc

37

210 103

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 4512 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ45L1

400 103

ggctggactg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 104

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 4513 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 104

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 105

211 474

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5101 Последовательность аминокислот aa 1-474 белка L1 ПВЧ типа 51

400 105

Met Ala Leu Trp Arg Thr Asn Asp Ser Lys Val Tyr Leu Pro Pro Ala

1 5 10 15

Pro Val Ser Arg Ile Val Asn Thr Glu Glu Tyr Ile Thr Arg Thr Gly

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Ile Thr Leu Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Pro Ile Pro Lys Thr Ser Thr Arg Ala Ala Ile Pro Lys Val

50 55 60

Ser Ala Phe Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro Asn

65 70 75 80

Lys Phe Gly Leu Pro Asp Pro Asn Leu Tyr Asn Pro Asp Thr Asp Arg

85 90 95

Leu Val Trp Gly Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu

100 105 110

Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Lys Tyr Asp Asp Thr

115 120 125

Glu Asn Ser Arg Ile Ala Asn Gly Asn Ala Gln Gln Asp Val Arg Asp

130 135 140

Asn Thr Ser Val Asp Asn Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys

145 150 155 160

Ala Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Ile Gly Thr Thr Cys Lys Asn

165 170 175

Thr Pro Val Pro Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Ser Ser

180 185 190

Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp

195 200 205

Phe Ala Ala Leu Gln Ala Thr Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Ser

210 215 220

Gln Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Thr

225 230 235 240

Tyr Gly Asn Ser Met Phe Phe His Leu Arg Arg Glu Gln Ile Phe Ala

245 250 255

Arg His Tyr Tyr Asn Lys Leu Val Gly Val Gly Glu Asp Ile Pro Asn

260 265 270

Asp Tyr Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Gly Arg Asp Pro Ile Glu Ser

275 280 285

Tyr Ile Tyr Ser Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Asp Ser

290 295 300

Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Arg Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Ile Cys Trp Asn Asn Gln Leu Phe Ile Thr Cys Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Ser Thr Ala Thr Ala Ala Val Ser

340 345 350

Pro Thr Phe Thr Pro Ser Asn Phe Lys Gln Tyr Ile Arg His Gly Glu

355 360 365

Glu Tyr Glu Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr

370 375 380

Thr Glu Val Met Ala Tyr Leu His Thr Met Asp Pro Thr Ile Leu Glu

385 390 395 400

Gln Trp Asn Phe Gly Leu Thr Leu Pro Pro Ser Ala Ser Leu Glu Asp

405 410 415

Ala Tyr Arg Phe Val Arg Asn Ala Ala Thr Ser Cys Gln Lys Asp Thr

420 425 430

Pro Pro Gln Ala Lys Pro Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp

435 440 445

Val Asp Leu Lys Glu Arg Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Phe Ala Leu

450 455 460

Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Val Gly Val

465 470

210 106

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5102 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 106

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 107

211 500

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 5103 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

51

400 107

Met Ala Leu Trp Arg Thr Asn Asp Ser Lys Val Tyr Leu Pro Pro Ala

1 5 10 15

Pro Val Ser Arg Ile Val Asn Thr Glu Glu Tyr Ile Thr Arg Thr Gly

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Ile Thr Leu Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Pro Ile Pro Lys Thr Ser Thr Arg Ala Ala Ile Pro Lys Val

50 55 60

Ser Ala Phe Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Gln Leu Pro Asp Pro Asn

65 70 75 80

Lys Phe Gly Leu Pro Asp Pro Asn Leu Tyr Asn Pro Asp Thr Asp Arg

85 90 95

Leu Val Trp Gly Cys Val Gly Val Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu

100 105 110

Gly Val Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Lys Tyr Asp Asp Thr

115 120 125

Glu Asn Ser Arg Ile Ala Asn Gly Asn Ala Gln Gln Asp Val Arg Asp

130 135 140

Asn Thr Ser Val Asp Asn Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Ile Gly Cys

145 150 155 160

Ala Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Ile Gly Thr Thr Cys Lys Asn

165 170 175

Thr Pro Val Pro Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Val Ser Ser

180 185 190

Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp

195 200 205

Phe Ala Ala Leu Gln Ala Thr Lys Ser Asp Val Pro Leu Asp Ile Ser

210 215 220

Gln Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Thr

225 230 235 240

Tyr Gly Asn Ser Met Phe Phe His Leu Arg Arg Glu Gln Ile Phe Ala

245 250 255

Arg His Tyr Tyr Asn Lys Leu Val Gly Val Gly Glu Asp Ile Pro Asn

260 265 270

Asp Tyr Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Gly Arg Asp Pro Ile Glu Ser

275 280 285

Tyr Ile Tyr Ser Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Asp Ser

290 295 300

Gln Ile Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu His Arg Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Ile Cys Trp Asn Asn Gln Leu Phe Ile Thr Cys Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Leu Thr Ile Ser Thr Ala Thr Ala Ala Val Ser

340 345 350

Pro Thr Phe Thr Pro Ser Asn Phe Lys Gln Tyr Ile Arg His Gly Glu

355 360 365

Glu Tyr Glu Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr

370 375 380

Thr Glu Val Met Ala Tyr Leu His Thr Met Asp Pro Thr Ile Leu Glu

385 390 395 400

Gln Trp Asn Phe Gly Leu Thr Leu Pro Pro Ser Ala Ser Leu Glu Asp

405 410 415

Ala Tyr Arg Phe Val Arg Asn Ala Ala Thr Ser Cys Gln Lys Asp Thr

420 425 430

Pro Pro Gln Ala Lys Pro Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp

435 440 445

Val Asp Leu Lys Glu Arg Phe Ser Leu Asp Leu Asp Gln Phe Ala Leu

450 455 460

Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Val Gly Val Lys Ala Lys Pro Lys Leu

465 470 475 480

Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys

485 490 495

Lys Val Lys Lys

500

210 108

211 1504

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5104 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 51

400 108

atggctctgt ggaggaccaa tgacagcaag gtctacctgc ctcctgcccc tgtgagcagg

60

attgtgaaca cagaggaata catcaccagg acaggcatct actactatgc tggctccagc

120

agactgatta ccctgggaca cccatacttt ccaatcccaa agaccagcac cagggctgcc

180

atcccaaagg tgtctgcctt ccaatacagg gtgttcaggg tccaacttcc tgacccaaac

240

aagtttggac tgcctgaccc aaacctctac aaccctgaca cagacagact ggtgtggggc

300

tgtgtgggag tggaggtggg caggggacaa ccactgggag tgggactgtc tggacaccca

360

ctgttcaaca aatatgatga cacagagaac agcaggattg ccaatggcaa tgcccaacag

420

gatgtgaggg acaacacctc tgtggacaac aagcagaccc aactttgtat cattggctgt

480

gcccctccaa ttggagaaca ctggggcatt ggcaccactt gtaagaacac acctgtgcct

540

cctggagact gtcctccatt ggaactggtg tcctctgtga ttcaggatgg agatatgatt

600

gacacaggct ttggagctat ggactttgct gccctccaag ccaccaagtc tgatgtgcca

660

ctggacatca gccagtctgt gtgtaaatac cctgactacc tgaaaatgag tgctgacacc

720

tatggcaaca gtatgttctt ccacctgagg agggaacaga tttttgccag acactactac

780

aacaaactgg tgggagtggg agaggacatc ccaaatgact actacatcaa gggctctggc

840

aatggcaggg acccaattga gtcctacatc tactctgcca caccatctgg cagtatgatt

900

acctctgaca gccagatttt caacaagcca tactggctgc acagggctca aggacacaac

960

aatggcatct gttggaacaa ccaacttttc atcacttgtg tggacaccac caggagcacc

1020

aacctgacca tcagcacagc cacagcagca gtgagcccaa ccttcacacc aagcaacttc

1080

aagcaataca tcagacatgg agaggaatat gaactccaat tcatcttcca actttgtaag

1140

attaccctga ccacagaggt gatggcttac ctgcacacaa tggacccaac catcttggaa

1200

cagtggaact ttggactgac cctgcctcca tctgcctcct tggaggatgc ctacaggttt

1260

gtgaggaatg ctgccacctc ctgtcagaag gacacacctc cacaggctaa gcctgaccca

1320

ctggctaaat acaagttctg ggatgtggac ctgaaagaga ggttctccct ggacctggac

1380

cagtttgccc tgggcaggaa gttcctgctc caagtgggag tcaaagccaa gccaaaactg

1440

aaaagggctg ccccaaccag caccaggacc tcctctgcca agaggaagaa ggtgaagaag

1500

taaa

1504

210 109

211 1534

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5105 Синтетический ген L1 ПВЧ51

400 109

ctgggtacca tggctctgtg gaggaccaat gacagcaagg tctacctgcc tcctgcccct

60

gtgagcagga ttgtgaacac agaggaatac atcaccagga caggcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgattac cctgggacac ccatactttc caatcccaaa gaccagcacc

180

agggctgcca tcccaaaggt gtctgccttc caatacaggg tgttcagggt ccaacttcct

240

gacccaaaca agtttggact gcctgaccca aacctctaca accctgacac agacagactg

300

gtgtggggct gtgtgggagt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagt gggactgtct

360

ggacacccac tgttcaacaa atatgatgac acagagaaca gcaggattgc caatggcaat

420

gcccaacagg atgtgaggga caacacctct gtggacaaca agcagaccca actttgtatc

480

attggctgtg cccctccaat tggagaacac tggggcattg gcaccacttg taagaacaca

540

cctgtgcctc ctggagactg tcctccattg gaactggtgt cctctgtgat tcaggatgga

600

gatatgattg acacaggctt tggagctatg gactttgctg ccctccaagc caccaagtct

660

gatgtgccac tggacatcag ccagtctgtg tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt

720

gctgacacct atggcaacag tatgttcttc cacctgagga gggaacagat ttttgccaga

780

cactactaca acaaactggt gggagtggga gaggacatcc caaatgacta ctacatcaag

840

ggctctggca atggcaggga cccaattgag tcctacatct actctgccac accatctggc

900

agtatgatta cctctgacag ccagattttc aacaagccat actggctgca cagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggaacaac caacttttca tcacttgtgt ggacaccacc

1020

aggagcacca acctgaccat cagcacagcc acagcagcag tgagcccaac cttcacacca

1080

agcaacttca agcaatacat cagacatgga gaggaatatg aactccaatt catcttccaa

1140

ctttgtaaga ttaccctgac cacagaggtg atggcttacc tgcacacaat ggacccaacc

1200

atcttggaac agtggaactt tggactgacc ctgcctccat ctgcctcctt ggaggatgcc

1260

tacaggtttg tgaggaatgc tgccacctcc tgtcagaagg acacacctcc acaggctaag

1320

cctgacccac tggctaaata caagttctgg gatgtggacc tgaaagagag gttctccctg

1380

gacctggacc agtttgccct gggcaggaag ttcctgctcc aagtgggagt ccagaggaag

1440

ccaagacctg gactgaaaag acctgcctcc tctgcctcct cctcctcctc ctcctctgcc

1500

aagaggaaga gggtgaagaa gtaaactcga gctc

1534

210 110

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5106 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 110

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 111

211 34

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5107 ПВЧ51L1 F1

400 111

cttggtacca tggctctgtg gaggaccaat gaca

34

210 112

211 32

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5108 ПВЧ51L1 R1

400 112

gcttggcttt gactcccact tggagcagga ac

32

210 113

211 1441

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5109 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ51L1

400 113

cttggtacca tggctctgtg gaggaccaat gacagcaagg tctacctgcc tcctgcccct

60

gtgagcagga ttgtgaacac agaggaatac atcaccagga caggcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgattac cctgggacac ccatactttc caatcccaaa gaccagcacc

180

agggctgcca tcccaaaggt gtctgccttc caatacaggg tgttcagggt ccaacttcct

240

gacccaaaca agtttggact gcctgaccca aacctctaca accctgacac agacagactg

300

gtgtggggct gtgtgggagt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagt gggactgtct

360

ggacacccac tgttcaacaa atatgatgac acagagaaca gcaggattgc caatggcaat

420

gcccaacagg atgtgaggga caacacctct gtggacaaca agcagaccca actttgtatc

480

attggctgtg cccctccaat tggagaacac tggggcattg gcaccacttg taagaacaca

540

cctgtgcctc ctggagactg tcctccattg gaactggtgt cctctgtgat tcaggatgga

600

gatatgattg acacaggctt tggagctatg gactttgctg ccctccaagc caccaagtct

660

gatgtgccac tggacatcag ccagtctgtg tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt

720

gctgacacct atggcaacag tatgttcttc cacctgagga gggaacagat ttttgccaga

780

cactactaca acaaactggt gggagtggga gaggacatcc caaatgacta ctacatcaag

840

ggctctggca atggcaggga cccaattgag tcctacatct actctgccac accatctggc

900

agtatgatta cctctgacag ccagattttc aacaagccat actggctgca cagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggaacaac caacttttca tcacttgtgt ggacaccacc

1020

aggagcacca acctgaccat cagcacagcc acagcagcag tgagcccaac cttcacacca

1080

agcaacttca agcaatacat cagacatgga gaggaatatg aactccaatt catcttccaa

1140

ctttgtaaga ttaccctgac cacagaggtg atggcttacc tgcacacaat ggacccaacc

1200

atcttggaac agtggaactt tggactgacc ctgcctccat ctgcctcctt ggaggatgcc

1260

tacaggtttg tgaggaatgc tgccacctcc tgtcagaagg acacacctcc acaggctaag

1320

cctgacccac tggctaaata caagttctgg gatgtggacc tgaaagagag gttctccctg

1380

gacctggacc agtttgccct gggcaggaag ttcctgctcc aagtgggagt caaagccaag

1440

c

1441

210 114

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5110 ПВЧ51L1 F2

400 114

agtgggagtc aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 115

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5111 ПВЧ51L1 R2

400 115

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 116

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5112 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ51L1

400 116

agtgggagtc aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 117

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5113 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 117

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 118

211 478

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5201 Последовательность аминокислот aa 1-478 белка L1 ПВЧ типа 52

400 118

Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Ser Ile Lys Asn Thr Ser Ser Gly Asn Gly Lys Lys Val Leu

50 55 60

Val Pro Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile Lys Leu

65 70 75 80

Pro Asp Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro

85 90 95

Glu Thr Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Ile Gly Arg

100 105 110

Gly Gln Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys

115 120 125

Phe Asp Asp Thr Glu Thr Ser Asn Lys Tyr Ala Gly Lys Pro Gly Ile

130 135 140

Asp Asn Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys

145 150 155 160

Ile Leu Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr

165 170 175

Pro Cys Asn Asn Asn Ser Gly Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Gln

180 185 190

Leu Ile Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe

195 200 205

Gly Cys Met Asp Phe Asn Thr Leu Gln Ala Ser Lys Ser Asp Val Pro

210 215 220

Ile Asp Ile Cys Ser Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met

225 230 235 240

Ala Ser Glu Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu

245 250 255

Gln Met Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Leu Gly Asp

260 265 270

Pro Val Pro Gly Asp Leu Tyr Ile Gln Gly Ser Asn Ser Gly Asn Thr

275 280 285

Ala Thr Val Gln Ser Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met

290 295 300

Val Thr Ser Glu Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg

305 310 315 320

Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val

325 330 335

Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Glu

340 345 350

Val Lys Lys Glu Ser Thr Tyr Lys Asn Glu Asn Phe Lys Glu Tyr Leu

355 360 365

Arg His Gly Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys

370 375 380

Ile Thr Leu Thr Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Lys Met Asp Ala

385 390 395 400

Thr Ile Leu Glu Asp Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala

405 410 415

Ser Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Thr Ala Ile Thr Cys

420 425 430

Gln Lys Asn Thr Pro Pro Lys Gly Lys Glu Asp Pro Leu Lys Asp Tyr

435 440 445

Met Phe Trp Glu Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp

450 455 460

Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu

465 470 475

210 119

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5202 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 119

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 120

211 504

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 5203 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

52

400 120

Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Thr Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Phe Ser Ile Lys Asn Thr Ser Ser Gly Asn Gly Lys Lys Val Leu

50 55 60

Val Pro Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Ile Lys Leu

65 70 75 80

Pro Asp Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro

85 90 95

Glu Thr Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Thr Gly Leu Glu Ile Gly Arg

100 105 110

Gly Gln Pro Leu Gly Val Gly Ile Ser Gly His Pro Leu Leu Asn Lys

115 120 125

Phe Asp Asp Thr Glu Thr Ser Asn Lys Tyr Ala Gly Lys Pro Gly Ile

130 135 140

Asp Asn Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys

145 150 155 160

Ile Leu Gly Cys Lys Pro Pro Ile Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Thr

165 170 175

Pro Cys Asn Asn Asn Ser Gly Asn Pro Gly Asp Cys Pro Pro Leu Gln

180 185 190

Leu Ile Asn Ser Val Ile Gln Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe

195 200 205

Gly Cys Met Asp Phe Asn Thr Leu Gln Ala Ser Lys Ser Asp Val Pro

210 215 220

Ile Asp Ile Cys Ser Ser Val Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Gln Met

225 230 235 240

Ala Ser Glu Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu

245 250 255

Gln Met Phe Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Thr Leu Gly Asp

260 265 270

Pro Val Pro Gly Asp Leu Tyr Ile Gln Gly Ser Asn Ser Gly Asn Thr

275 280 285

Ala Thr Val Gln Ser Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Met

290 295 300

Val Thr Ser Glu Ser Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg

305 310 315 320

Ala Gln Gly His Asn Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val

325 330 335

Thr Val Val Asp Thr Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Ala Glu

340 345 350

Val Lys Lys Glu Ser Thr Tyr Lys Asn Glu Asn Phe Lys Glu Tyr Leu

355 360 365

Arg His Gly Glu Glu Phe Asp Leu Gln Phe Ile Phe Gln Leu Cys Lys

370 375 380

Ile Thr Leu Thr Ala Asp Val Met Thr Tyr Ile His Lys Met Asp Ala

385 390 395 400

Thr Ile Leu Glu Asp Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala

405 410 415

Ser Leu Glu Asp Thr Tyr Arg Phe Val Thr Ser Thr Ala Ile Thr Cys

420 425 430

Gln Lys Asn Thr Pro Pro Lys Gly Lys Glu Asp Pro Leu Lys Asp Tyr

435 440 445

Met Phe Trp Glu Val Asp Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp

450 455 460

Gln Phe Pro Leu Gly Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala

465 470 475 480

Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser

485 490 495

Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

500

210 121

211 1516

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5204 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 52

400 121

atgagcgtgt ggaggcccag cgaggccacc gtgtacctgc cccccgtgcc cgtgagcaag

60

gtggtgagca ccgacgagta cgtgagcagg accagcatct actactacgc cggcagcagc

120

aggctgctga ccgtgggcca cccctacttc agcatcaaga acaccagcag cggcaacggc

180

aagaaggtgc tggtgcccaa ggtgagcggc ctgcagtaca gggtgttcag gatcaagctg

240

cccgacccca acaagttcgg cttccccgac accagcttct acaaccccga gacccagagg

300

ctggtgtggg cctgcaccgg cctggagatc ggcaggggcc agcccctggg cgtgggcatc

360

agcggccacc ccctgctgaa caagttcgac gacaccgaga ccagcaacaa gtacgccggc

420

aagcccggca tcgacaacag ggagtgcctg agcatggact acaagcagac ccagctgtgc

480

atcctgggct gcaagccccc catcggcgag cactggggca agggcacccc ctgcaacaac

540

aacagcggca accccggcga ctgccccccc ctgcagctga tcaacagcgt gatccaggac

600

ggcgacatgg tggacaccgg cttcggctgc atggacttca acaccctgca ggccagcaag

660

agcgacgtgc ccatcgacat ctgcagcagc gtgtgcaagt accccgacta cctgcagatg

720

gccagcgagc cctacggcga cagcctgttc ttcttcctga ggagggagca gatgttcgtg

780

aggcacttct tcaacagggc cggcaccctg ggcgaccccg tgcccggcga cctgtacatc

840

cagggcagca acagcggcaa caccgccacc gtgcagagca gcgccttctt ccccaccccc

900

agcggcagca tggtgaccag cgagagccag ctgttcaaca agccctactg gctgcagagg

960

gcccagggcc acaacaacgg catctgctgg ggcaaccagc tgttcgtgac cgtggtggac

1020

accaccagga gcaccaacat gaccctgtgc gccgaggtga agaaggagag cacctacaag

1080

aacgagaact tcaaggagta cctgaggcac ggcgaggagt tcgacctgca gttcatcttc

1140

cagctgtgca agatcaccct gaccgccgac gtgatgacct acatccacaa gatggacgcc

1200

accatcctgg aggactggca gttcggcctg accccccccc ccagcgccag cctggaggac

1260

acctacaggt tcgtgaccag caccgccatc acctgccaga agaacacccc ccccaagggc

1320

aaggaggacc ccctgaagga ctacatgttc tgggaggtgg acctgaagga gaagttcagc

1380

gccgacctgg accagttccc cctgggcagg aagttcctgc tgcaggccgg cctgaaagcc

1440

aagccaaaac tgaaaagggc tgccccaacc agcaccagga cctcctctgc caagaggaag

1500

aaggtgaaga agtaaa

1516

210 122

211 1531

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5205 Синтетический ген L1 ПВЧ52

400 122

ctgggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc

60

gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc

120

ggcagcagca ggctgctgac cgtgggccac ccctacttca gcatcaagaa caccagcagc

180

ggcaacggca agaaggtgct ggtgcccaag gtgagcggcc tgcagtacag ggtgttcagg

240

atcaagctgc ccgaccccaa caagttcggc ttccccgaca ccagcttcta caaccccgag

300

acccagaggc tggtgtgggc ctgcaccggc ctggagatcg gcaggggcca gcccctgggc

360

gtgggcatca gcggccaccc cctgctgaac aagttcgacg acaccgagac cagcaacaag

420

tacgccggca agcccggcat cgacaacagg gagtgcctga gcatggacta caagcagacc

480

cagctgtgca tcctgggctg caagcccccc atcggcgagc actggggcaa gggcaccccc

540

tgcaacaaca acagcggcaa ccccggcgac tgcccccccc tgcagctgat caacagcgtg

600

atccaggacg gcgacatggt ggacaccggc ttcggctgca tggacttcaa caccctgcag

660

gccagcaaga gcgacgtgcc catcgacatc tgcagcagcg tgtgcaagta ccccgactac

720

ctgcagatgg ccagcgagcc ctacggcgac agcctgttct tcttcctgag gagggagcag

780

atgttcgtga ggcacttctt caacagggcc ggcaccctgg gcgaccccgt gcccggcgac

840

ctgtacatcc agggcagcaa cagcggcaac accgccaccg tgcagagcag cgccttcttc

900

cccaccccca gcggcagcat ggtgaccagc gagagccagc tgttcaacaa gccctactgg

960

ctgcagaggg cccagggcca caacaacggc atctgctggg gcaaccagct gttcgtgacc

1020

gtggtggaca ccaccaggag caccaacatg accctgtgcg ccgaggtgaa gaaggagagc

1080

acctacaaga acgagaactt caaggagtac ctgaggcacg gcgaggagtt cgacctgcag

1140

ttcatcttcc agctgtgcaa gatcaccctg accgccgacg tgatgaccta catccacaag

1200

atggacgcca ccatcctgga ggactggcag ttcggcctga cccccccccc cagcgccagc

1260

ctggaggaca cctacaggtt cgtgaccagc accgccatca cctgccagaa gaacaccccc

1320

cccaagggca aggaggaccc cctgaaggac tacatgttct gggaggtgga cctgaaggag

1380

aagttcagcg ccgacctgga ccagttcccc ctgggcagga agttcctgct gcaggccggc

1440

ctgcaggcca ggcccaagct gaagaggccc gccagcagcg cccccaggac cagcaccaag

1500

aagaagaagg tgaagaggta aactcgagct c

1531

210 123

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5206 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 123

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 124

211 34

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5207 ПВЧ52L1 F1

400 124

cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gagg

34

210 125

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5208 ПВЧ52L1 R1

400 125

gcttggcttt caggccggcc tgcagcagga acttc

35

210 126

211 1453

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5209 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ52L1

400 126

cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc

60

gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc

120

ggcagcagca ggctgctgac cgtgggccac ccctacttca gcatcaagaa caccagcagc

180

ggcaacggca agaaggtgct ggtgcccaag gtgagcggcc tgcagtacag ggtgttcagg

240

atcaagctgc ccgaccccaa caagttcggc ttccccgaca ccagcttcta caaccccgag

300

acccagaggc tggtgtgggc ctgcaccggc ctggagatcg gcaggggcca gcccctgggc

360

gtgggcatca gcggccaccc cctgctgaac aagttcgacg acaccgagac cagcaacaag

420

tacgccggca agcccggcat cgacaacagg gagtgcctga gcatggacta caagcagacc

480

cagctgtgca tcctgggctg caagcccccc atcggcgagc actggggcaa gggcaccccc

540

tgcaacaaca acagcggcaa ccccggcgac tgcccccccc tgcagctgat caacagcgtg

600

atccaggacg gcgacatggt ggacaccggc ttcggctgca tggacttcaa caccctgcag

660

gccagcaaga gcgacgtgcc catcgacatc tgcagcagcg tgtgcaagta ccccgactac

720

ctgcagatgg ccagcgagcc ctacggcgac agcctgttct tcttcctgag gagggagcag

780

atgttcgtga ggcacttctt caacagggcc ggcaccctgg gcgaccccgt gcccggcgac

840

ctgtacatcc agggcagcaa cagcggcaac accgccaccg tgcagagcag cgccttcttc

900

cccaccccca gcggcagcat ggtgaccagc gagagccagc tgttcaacaa gccctactgg

960

ctgcagaggg cccagggcca caacaacggc atctgctggg gcaaccagct gttcgtgacc

1020

gtggtggaca ccaccaggag caccaacatg accctgtgcg ccgaggtgaa gaaggagagc

1080

acctacaaga acgagaactt caaggagtac ctgaggcacg gcgaggagtt cgacctgcag

1140

ttcatcttcc agctgtgcaa gatcaccctg accgccgacg tgatgaccta catccacaag

1200

atggacgcca ccatcctgga ggactggcag ttcggcctga cccccccccc cagcgccagc

1260

ctggaggaca cctacaggtt cgtgaccagc accgccatca cctgccagaa gaacaccccc

1320

cccaagggca aggaggaccc cctgaaggac tacatgttct gggaggtgga cctgaaggag

1380

aagttcagcg ccgacctgga ccagttcccc ctgggcagga agttcctgct gcaggccggc

1440

ctgaaagcca agc

1453

210 127

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5210 ПВЧ52L1 F2

400 127

ggccggcctg aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 128

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5211 ПВЧ52L1 R2

400 128

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 129

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5212 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ52L1

400 129

ggccggcctg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 130

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5213 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 130

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 131

211 467

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5601 Последовательность аминокислот aa 1-467 белка L1 ПВЧ типа 56

400 131

Met Ala Thr Trp Arg Pro Ser Glu Asn Lys Val Tyr Leu Pro Pro Thr

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ser Tyr Val Lys Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Tyr Ser Val Thr Lys Asp Asn Thr Lys Thr Asn Ile Pro Lys Val

50 55 60

Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp Pro Asn

65 70 75 80

Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Asn Ile Tyr Asn Pro Asp Gln Glu Arg

85 90 95

Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu

100 105 110

Gly Ala Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Arg Leu Asp Asp Thr

115 120 125

Glu Ser Ser Asn Leu Ala Asn Asn Asn Val Ile Glu Asp Ser Arg Asp

130 135 140

Asn Ile Ser Val Asp Gly Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Val Gly Cys

145 150 155 160

Thr Pro Ala Met Gly Glu His Trp Thr Lys Gly Ala Val Cys Lys Ser

165 170 175

Thr Gln Val Thr Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Ala Leu Ile Asn Thr

180 185 190

Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp

195 200 205

Phe Lys Val Leu Gln Glu Ser Lys Ala Glu Val Pro Leu Asp Ile Val

210 215 220

Gln Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Ala

225 230 235 240

Tyr Gly Asp Ser Met Trp Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala

245 250 255

Arg His Tyr Phe Asn Arg Ala Gly Lys Val Gly Glu Thr Ile Pro Ala

260 265 270

Glu Leu Tyr Leu Lys Gly Ser Asn Gly Arg Glu Pro Pro Pro Ser Ser

275 280 285

Val Tyr Val Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Glu Ala Gln

290 295 300

Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn

305 310 315 320

Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr

325 330 335

Arg Ser Thr Asn Met Thr Ile Ser Thr Ala Thr Glu Gln Leu Ser Lys

340 345 350

Tyr Asp Ala Arg Lys Ile Asn Gln Tyr Leu Arg His Val Glu Glu Tyr

355 360 365

Glu Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Ser Ala Glu

370 375 380

Val Met Ala Tyr Leu His Asn Met Asn Ala Asn Leu Leu Glu Asp Trp

385 390 395 400

Asn Ile Gly Leu Ser Pro Pro Val Ala Thr Ser Leu Glu Asp Lys Tyr

405 410 415

Arg Tyr Val Arg Ser Thr Ala Ile Thr Cys Gln Arg Glu Gln Pro Pro

420 425 430

Thr Glu Lys Gln Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp Val Asn

435 440 445

Leu Gln Asp Ser Phe Ser Thr Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg

450 455 460

Lys Phe Leu

465

210 132

211 31

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5602 Последовательность аминокислот aa 469-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 132

Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro

1 5 10 15

Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25 30

210 133

211 498

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 5603 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

56

400 133

Met Ala Thr Trp Arg Pro Ser Glu Asn Lys Val Tyr Leu Pro Pro Thr

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ala Thr Asp Ser Tyr Val Lys Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Phe Tyr His Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly His Pro

35 40 45

Tyr Tyr Ser Val Thr Lys Asp Asn Thr Lys Thr Asn Ile Pro Lys Val

50 55 60

Ser Ala Tyr Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp Pro Asn

65 70 75 80

Lys Phe Gly Leu Pro Asp Thr Asn Ile Tyr Asn Pro Asp Gln Glu Arg

85 90 95

Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Val Gly Arg Gly Gln Pro Leu

100 105 110

Gly Ala Gly Leu Ser Gly His Pro Leu Phe Asn Arg Leu Asp Asp Thr

115 120 125

Glu Ser Ser Asn Leu Ala Asn Asn Asn Val Ile Glu Asp Ser Arg Asp

130 135 140

Asn Ile Ser Val Asp Gly Lys Gln Thr Gln Leu Cys Ile Val Gly Cys

145 150 155 160

Thr Pro Ala Met Gly Glu His Trp Thr Lys Gly Ala Val Cys Lys Ser

165 170 175

Thr Gln Val Thr Thr Gly Asp Cys Pro Pro Leu Ala Leu Ile Asn Thr

180 185 190

Pro Ile Glu Asp Gly Asp Met Ile Asp Thr Gly Phe Gly Ala Met Asp

195 200 205

Phe Lys Val Leu Gln Glu Ser Lys Ala Glu Val Pro Leu Asp Ile Val

210 215 220

Gln Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ser Ala Asp Ala

225 230 235 240

Tyr Gly Asp Ser Met Trp Phe Tyr Leu Arg Arg Glu Gln Leu Phe Ala

245 250 255

Arg His Tyr Phe Asn Arg Ala Gly Lys Val Gly Glu Thr Ile Pro Ala

260 265 270

Glu Leu Tyr Leu Lys Gly Ser Asn Gly Arg Glu Pro Pro Pro Ser Ser

275 280 285

Val Tyr Val Ala Thr Pro Ser Gly Ser Met Ile Thr Ser Glu Ala Gln

290 295 300

Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn Asn

305 310 315 320

Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr Thr

325 330 335

Arg Ser Thr Asn Met Thr Ile Ser Thr Ala Thr Glu Gln Leu Ser Lys

340 345 350

Tyr Asp Ala Arg Lys Ile Asn Gln Tyr Leu Arg His Val Glu Glu Tyr

355 360 365

Glu Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Ser Ala Glu

370 375 380

Val Met Ala Tyr Leu His Asn Met Asn Ala Asn Leu Leu Glu Asp Trp

385 390 395 400

Asn Ile Gly Leu Ser Pro Pro Val Ala Thr Ser Leu Glu Asp Lys Tyr

405 410 415

Arg Tyr Val Arg Ser Thr Ala Ile Thr Cys Gln Arg Glu Gln Pro Pro

420 425 430

Thr Glu Lys Gln Asp Pro Leu Ala Lys Tyr Lys Phe Trp Asp Val Asn

435 440 445

Leu Gln Asp Ser Phe Ser Thr Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly Arg

450 455 460

Lys Phe Leu Leu Gln Ala Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg

465 470 475 480

Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val

485 490 495

Lys Lys

210 134

211 1498

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5604 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 56

400 134

atggctacct ggagaccatc tgagaacaag gtctacctgc ctccaacacc tgtgagcaag

60

gtggtggcta cagactccta tgtgaagagg accagcatct tctaccatgc tggctccagc

120

agactgctgg ctgtgggaca cccatactac tctgtgacca aggacaacac caagaccaac

180

atcccaaagg tgtctgccta ccaatacagg gtgttcaggg tgagactgcc tgacccaaac

240

aagtttggac tgcctgacac caacatctac aaccctgacc aggagagact ggtgtgggct

300

tgtgtgggat tggaggtggg caggggacaa ccactgggag caggactgtc tggacaccca

360

ctgttcaaca gactggatga cacagagtcc agcaacctgg ctaacaacaa tgtgattgag

420

gacagcaggg acaacatctc tgtggatggc aagcagaccc aactttgtat tgtgggctgt

480

actcctgcta tgggagaaca ctggaccaag ggagcagtgt gtaagagcac ccaggtgacc

540

acaggagact gtcctccact ggctctgata aacacaccaa ttgaggatgg agatatgatt

600

gacacaggct ttggagctat ggacttcaag gtgctccaag agagcaaggc tgaggtgcca

660

ctggacattg tccagagcac ttgtaaatac cctgactacc tgaaaatgag tgctgatgcc

720

tatggagaca gtatgtggtt ctacctgagg agggaacaac tttttgccag acactacttc

780

aacagggctg gcaaggtggg agagaccatc cctgctgaac tctacctgaa aggcagcaat

840

ggcagggaac ctcctccatc ctctgtctat gtggctacac catctggcag tatgattacc

900

tctgaggctc aacttttcaa caagccatac tggctccaaa gggctcaagg acacaacaat

960

ggcatctgtt ggggcaacca actttttgtg acagtggtgg acaccaccag gagcaccaat

1020

atgaccatca gcacagccac agaacaactt agcaaatatg atgccaggaa gataaaccaa

1080

tacctgaggc atgtggagga atatgaactc caatttgtgt tccaactttg taagattacc

1140

ctgtctgctg aggtgatggc ttacctgcac aatatgaatg ccaacctgtt ggaggactgg

1200

aacattggac tgagccctcc tgtggctacc tccttggagg acaaatacag atatgtgagg

1260

agcacagcca tcacttgtca gagggaacaa cctccaacag agaagcagga cccactggct

1320

aaatacaagt tctgggatgt gaacctccaa gactccttca gcacagacct ggaccagttt

1380

ccactgggca ggaagttcct gctccaagca ggactgaaag ccaagccaaa actgaaaagg

1440

gctgccccaa ccagcaccag gacctcctct gccaagagga agaaggtgaa gaagtaaa

1498

210 135

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5605 Синтетический ген L1 ПВЧ56

400 135

ctgggtacca tggctacctg gagaccatct gagaacaagg tctacctgcc tccaacacct

60

gtgagcaagg tggtggctac agactcctat gtgaagagga ccagcatctt ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactact ctgtgaccaa ggacaacacc

180

aagaccaaca tcccaaaggt gtctgcctac caatacaggg tgttcagggt gagactgcct

240

gacccaaaca agtttggact gcctgacacc aacatctaca accctgacca ggagagactg

300

gtgtgggctt gtgtgggatt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagc aggactgtct

360

ggacacccac tgttcaacag actggatgac acagagtcca gcaacctggc taacaacaat

420

gtgattgagg acagcaggga caacatctct gtggatggca agcagaccca actttgtatt

480

gtgggctgta ctcctgctat gggagaacac tggaccaagg gagcagtgtg taagagcacc

540

caggtgacca caggagactg tcctccactg gctctgataa acacaccaat tgaggatgga

600

gatatgattg acacaggctt tggagctatg gacttcaagg tgctccaaga gagcaaggct

660

gaggtgccac tggacattgt ccagagcact tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt

720

gctgatgcct atggagacag tatgtggttc tacctgagga gggaacaact ttttgccaga

780

cactacttca acagggctgg caaggtggga gagaccatcc ctgctgaact ctacctgaaa

840

ggcagcaatg gcagggaacc tcctccatcc tctgtctatg tggctacacc atctggcagt

900

atgattacct ctgaggctca acttttcaac aagccatact ggctccaaag ggctcaagga

960

cacaacaatg gcatctgttg gggcaaccaa ctttttgtga cagtggtgga caccaccagg

1020

agcaccaata tgaccatcag cacagccaca gaacaactta gcaaatatga tgccaggaag

1080

ataaaccaat acctgaggca tgtggaggaa tatgaactcc aatttgtgtt ccaactttgt

1140

aagattaccc tgtctgctga ggtgatggct tacctgcaca atatgaatgc caacctgttg

1200

gaggactgga acattggact gagccctcct gtggctacct ccttggagga caaatacaga

1260

tatgtgagga gcacagccat cacttgtcag agggaacaac ctccaacaga gaagcaggac

1320

ccactggcta aatacaagtt ctgggatgtg aacctccaag actccttcag cacagacctg

1380

gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg atgcaacttg gcaccaggag caagcctgct

1440

gtggctacca gcaagaagag gtctgcccca accagcacca gcacacctgc caagaggaag

1500

aggaggtaaa ctcgagctc

1519

210 136

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5606 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 136

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 137

211 33

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5607 ПВЧ56L1 F1

400 137

cttggtacca tggctacctg gagaccatct gag

33

210 138

211 31

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5608 ПВЧ56L1 R1

400 138

ctgcttggag caggaacttc ctgcccagtg g

31

210 139

211 1420

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5609 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ56L1

400 139

cttggtacca tggctacctg gagaccatct gagaacaagg tctacctgcc tccaacacct

60

gtgagcaagg tggtggctac agactcctat gtgaagagga ccagcatctt ctaccatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatactact ctgtgaccaa ggacaacacc

180

aagaccaaca tcccaaaggt gtctgcctac caatacaggg tgttcagggt gagactgcct

240

gacccaaaca agtttggact gcctgacacc aacatctaca accctgacca ggagagactg

300

gtgtgggctt gtgtgggatt ggaggtgggc aggggacaac cactgggagc aggactgtct

360

ggacacccac tgttcaacag actggatgac acagagtcca gcaacctggc taacaacaat

420

gtgattgagg acagcaggga caacatctct gtggatggca agcagaccca actttgtatt

480

gtgggctgta ctcctgctat gggagaacac tggaccaagg gagcagtgtg taagagcacc

540

caggtgacca caggagactg tcctccactg gctctgataa acacaccaat tgaggatgga

600

gatatgattg acacaggctt tggagctatg gacttcaagg tgctccaaga gagcaaggct

660

gaggtgccac tggacattgt ccagagcact tgtaaatacc ctgactacct gaaaatgagt

720

gctgatgcct atggagacag tatgtggttc tacctgagga gggaacaact ttttgccaga

780

cactacttca acagggctgg caaggtggga gagaccatcc ctgctgaact ctacctgaaa

840

ggcagcaatg gcagggaacc tcctccatcc tctgtctatg tggctacacc atctggcagt

900

atgattacct ctgaggctca acttttcaac aagccatact ggctccaaag ggctcaagga

960

cacaacaatg gcatctgttg gggcaaccaa ctttttgtga cagtggtgga caccaccagg

1020

agcaccaata tgaccatcag cacagccaca gaacaactta gcaaatatga tgccaggaag

1080

ataaaccaat acctgaggca tgtggaggaa tatgaactcc aatttgtgtt ccaactttgt

1140

aagattaccc tgtctgctga ggtgatggct tacctgcaca atatgaatgc caacctgttg

1200

gaggactgga acattggact gagccctcct gtggctacct ccttggagga caaatacaga

1260

tatgtgagga gcacagccat cacttgtcag agggaacaac ctccaacaga gaagcaggac

1320

ccactggcta aatacaagtt ctgggatgtg aacctccaag actccttcag cacagacctg

1380

gaccagtttc cactgggcag gaagttcctg ctccaagcag

1420

210 140

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5610 ПВЧ56L1 F2

400 140

gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc caagcc

36

210 141

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5611 ПВЧ56L1 R2

400 141

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 142

211 116

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5612 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ56L1

400 142

gaagttcctg ctccaagcag gactgaaagc caagccaaaa ctgaaaaggg ctgccccaac

60

cagcaccagg acctcctctg ccaagaggaa gaaggtgaag aagtaaatct agacag

116

210 143

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5613 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 143

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

210 144

211 473

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5801 Последовательность аминокислот aa 1-473 белка L1 ПВЧ типа 58

400 144

Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly Asn Pro

35 40 45

Tyr Phe Ser Ile Lys Ser Pro Asn Asn Asn Lys Lys Val Leu Val Pro

50 55 60

Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp

65 70 75 80

Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr

85 90 95

Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Ile Gly Arg Gly Gln

100 105 110

Pro Leu Gly Val Gly Val Ser Gly His Pro Tyr Leu Asn Lys Phe Asp

115 120 125

Asp Thr Glu Thr Ser Asn Arg Tyr Pro Ala Gln Pro Gly Ser Asp Asn

130 135 140

Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile

145 150 155 160

Gly Cys Lys Pro Pro Thr Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Val Ala Cys

165 170 175

Asn Asn Asn Ala Ala Ala Thr Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Phe Asn

180 185 190

Ser Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Cys Met

195 200 205

Asp Phe Gly Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile

210 215 220

Cys Asn Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ala Ser Glu

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe

245 250 255

Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Lys Leu Gly Glu Ala Val Pro

260 265 270

Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Thr Ala Val Ile Gln Ser

275 280 285

Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Glu Ser

290 295 300

Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Thr Glu Val Thr Lys Glu Gly

340 345 350

Thr Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Val Arg His Val Glu Glu

355 360 365

Tyr Asp Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala

370 375 380

Glu Ile Met Thr Tyr Ile His Thr Met Asp Ser Asn Ile Leu Glu Asp

385 390 395 400

Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Gln Asp Thr

405 410 415

Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Thr Ala Pro

420 425 430

Pro Lys Glu Lys Glu Asp Pro Leu Asn Lys Tyr Thr Phe Trp Glu Val

435 440 445

Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly

450 455 460

Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ser Gly Leu

465 470

210 145

211 26

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5802 Последовательность аминокислот aa 474-499 белка L1 ПВЧ типа

33

400 145

Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr

1 5 10 15

Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys Val Lys Lys

20 25

210 146

211 499

212 PRT

213 Искусственная последовательность

220

223 5803 Последовательность аминокислот химерного белка L1 ПВЧ типа

58

400 146

Met Ser Val Trp Arg Pro Ser Glu Ala Thr Val Tyr Leu Pro Pro Val

1 5 10 15

Pro Val Ser Lys Val Val Ser Thr Asp Glu Tyr Val Ser Arg Thr Ser

20 25 30

Ile Tyr Tyr Tyr Ala Gly Ser Ser Arg Leu Leu Ala Val Gly Asn Pro

35 40 45

Tyr Phe Ser Ile Lys Ser Pro Asn Asn Asn Lys Lys Val Leu Val Pro

50 55 60

Lys Val Ser Gly Leu Gln Tyr Arg Val Phe Arg Val Arg Leu Pro Asp

65 70 75 80

Pro Asn Lys Phe Gly Phe Pro Asp Thr Ser Phe Tyr Asn Pro Asp Thr

85 90 95

Gln Arg Leu Val Trp Ala Cys Val Gly Leu Glu Ile Gly Arg Gly Gln

100 105 110

Pro Leu Gly Val Gly Val Ser Gly His Pro Tyr Leu Asn Lys Phe Asp

115 120 125

Asp Thr Glu Thr Ser Asn Arg Tyr Pro Ala Gln Pro Gly Ser Asp Asn

130 135 140

Arg Glu Cys Leu Ser Met Asp Tyr Lys Gln Thr Gln Leu Cys Leu Ile

145 150 155 160

Gly Cys Lys Pro Pro Thr Gly Glu His Trp Gly Lys Gly Val Ala Cys

165 170 175

Asn Asn Asn Ala Ala Ala Thr Asp Cys Pro Pro Leu Glu Leu Phe Asn

180 185 190

Ser Ile Ile Glu Asp Gly Asp Met Val Asp Thr Gly Phe Gly Cys Met

195 200 205

Asp Phe Gly Thr Leu Gln Ala Asn Lys Ser Asp Val Pro Ile Asp Ile

210 215 220

Cys Asn Ser Thr Cys Lys Tyr Pro Asp Tyr Leu Lys Met Ala Ser Glu

225 230 235 240

Pro Tyr Gly Asp Ser Leu Phe Phe Phe Leu Arg Arg Glu Gln Met Phe

245 250 255

Val Arg His Phe Phe Asn Arg Ala Gly Lys Leu Gly Glu Ala Val Pro

260 265 270

Asp Asp Leu Tyr Ile Lys Gly Ser Gly Asn Thr Ala Val Ile Gln Ser

275 280 285

Ser Ala Phe Phe Pro Thr Pro Ser Gly Ser Ile Val Thr Ser Glu Ser

290 295 300

Gln Leu Phe Asn Lys Pro Tyr Trp Leu Gln Arg Ala Gln Gly His Asn

305 310 315 320

Asn Gly Ile Cys Trp Gly Asn Gln Leu Phe Val Thr Val Val Asp Thr

325 330 335

Thr Arg Ser Thr Asn Met Thr Leu Cys Thr Glu Val Thr Lys Glu Gly

340 345 350

Thr Tyr Lys Asn Asp Asn Phe Lys Glu Tyr Val Arg His Val Glu Glu

355 360 365

Tyr Asp Leu Gln Phe Val Phe Gln Leu Cys Lys Ile Thr Leu Thr Ala

370 375 380

Glu Ile Met Thr Tyr Ile His Thr Met Asp Ser Asn Ile Leu Glu Asp

385 390 395 400

Trp Gln Phe Gly Leu Thr Pro Pro Pro Ser Ala Ser Leu Gln Asp Thr

405 410 415

Tyr Arg Phe Val Thr Ser Gln Ala Ile Thr Cys Gln Lys Thr Ala Pro

420 425 430

Pro Lys Glu Lys Glu Asp Pro Leu Asn Lys Tyr Thr Phe Trp Glu Val

435 440 445

Asn Leu Lys Glu Lys Phe Ser Ala Asp Leu Asp Gln Phe Pro Leu Gly

450 455 460

Arg Lys Phe Leu Leu Gln Ser Gly Leu Lys Ala Lys Pro Lys Leu Lys

465 470 475 480

Arg Ala Ala Pro Thr Ser Thr Arg Thr Ser Ser Ala Lys Arg Lys Lys

485 490 495

Val Lys Lys

210 147

211 1501

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5804 Последовательность нуклеотидов гена химерного белка L1 ПВЧ

типа 58

400 147

atgagcgtgt ggaggcccag cgaggccacc gtgtacctgc cccccgtgcc cgtgagcaag

60

gtggtgagca ccgacgagta cgtgagcagg accagcatct actactacgc cggcagcagc

120

aggctgctgg ccgtgggcaa cccctacttc agcatcaaga gccccaacaa caacaagaag

180

gtgctggtgc ccaaggtgag cggcctgcag tacagggtgt tcagggtgag gctgcccgac

240

cccaacaagt tcggcttccc cgacaccagc ttctacaacc ccgacaccca gaggctggtg

300

tgggcctgcg tgggcctgga gatcggcagg ggccagcccc tgggcgtggg cgtgagcggc

360

cacccctacc tgaacaagtt cgacgacacc gagaccagca acaggtaccc cgcccagccc

420

ggcagcgaca acagggagtg cctgagcatg gactacaagc agacccagct gtgcctgatc

480

ggctgcaagc cccccaccgg cgagcactgg ggcaagggcg tggcctgcaa caacaacgcc

540

gccgccaccg actgcccccc cctggagctg ttcaacagca tcatcgagga cggcgacatg

600

gtggacaccg gcttcggctg catggacttc ggcaccctgc aggccaacaa gagcgacgtg

660

cccatcgaca tctgcaacag cacctgcaag taccccgact acctgaagat ggccagcgag

720

ccctacggcg acagcctgtt cttcttcctg aggagggagc agatgttcgt gaggcacttc

780

ttcaacaggg ccggcaagct gggcgaggcc gtgcccgacg acctgtacat caagggcagc

840

ggcaacaccg ccgtgatcca gagcagcgcc ttcttcccca cccccagcgg cagcatcgtg

900

accagcgaga gccagctgtt caacaagccc tactggctgc agagggccca gggccacaac

960

aacggcatct gctggggcaa ccagctgttc gtgaccgtgg tggacaccac caggagcacc

1020

aacatgaccc tgtgcaccga ggtgaccaag gagggcacct acaagaacga caacttcaag

1080

gagtacgtga ggcacgtgga ggagtacgac ctgcagttcg tgttccagct gtgcaagatc

1140

accctgaccg ccgagatcat gacctacatc cacaccatgg acagcaacat cctggaggac

1200

tggcagttcg gcctgacccc cccccccagc gccagcctgc aggacaccta caggttcgtg

1260

accagccagg ccatcacctg ccagaagacc gcccccccca aggagaagga ggaccccctg

1320

aacaagtaca ccttctggga ggtgaacctg aaggagaagt tcagcgccga cctggaccag

1380

ttccccctgg gcaggaagtt cctgctgcag agcggcctga aagccaagcc aaaactgaaa

1440

agggctgccc caaccagcac caggacctcc tctgccaaga ggaagaaggt gaagaagtaa

1500

a

1501

210 148

211 1516

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5805 Синтетический ген L1 ПВЧ58

400 148

ctgggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc

60

gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc

120

ggcagcagca ggctgctggc cgtgggcaac ccctacttca gcatcaagag ccccaacaac

180

aacaagaagg tgctggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg

240

ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgacacccag

300

aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag atcggcaggg gccagcccct gggcgtgggc

360

gtgagcggcc acccctacct gaacaagttc gacgacaccg agaccagcaa caggtacccc

420

gcccagcccg gcagcgacaa cagggagtgc ctgagcatgg actacaagca gacccagctg

480

tgcctgatcg gctgcaagcc ccccaccggc gagcactggg gcaagggcgt ggcctgcaac

540

aacaacgccg ccgccaccga ctgccccccc ctggagctgt tcaacagcat catcgaggac

600

ggcgacatgg tggacaccgg cttcggctgc atggacttcg gcaccctgca ggccaacaag

660

agcgacgtgc ccatcgacat ctgcaacagc acctgcaagt accccgacta cctgaagatg

720

gccagcgagc cctacggcga cagcctgttc ttcttcctga ggagggagca gatgttcgtg

780

aggcacttct tcaacagggc cggcaagctg ggcgaggccg tgcccgacga cctgtacatc

840

aagggcagcg gcaacaccgc cgtgatccag agcagcgcct tcttccccac ccccagcggc

900

agcatcgtga ccagcgagag ccagctgttc aacaagccct actggctgca gagggcccag

960

ggccacaaca acggcatctg ctggggcaac cagctgttcg tgaccgtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca acatgaccct gtgcaccgag gtgaccaagg agggcaccta caagaacgac

1080

aacttcaagg agtacgtgag gcacgtggag gagtacgacc tgcagttcgt gttccagctg

1140

tgcaagatca ccctgaccgc cgagatcatg acctacatcc acaccatgga cagcaacatc

1200

ctggaggact ggcagttcgg cctgaccccc ccccccagcg ccagcctgca ggacacctac

1260

aggttcgtga ccagccaggc catcacctgc cagaagaccg ccccccccaa ggagaaggag

1320

gaccccctga acaagtacac cttctgggag gtgaacctga aggagaagtt cagcgccgac

1380

ctggaccagt tccccctggg caggaagttc ctgctgcaga gcggcctgaa ggccaagccc

1440

aggctgaaga ggagcgcccc caccaccagg gcccccagca ccaagaggaa gaaggtgaag

1500

aagtaaactc gagctc

1516

210 149

211 1519

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5806 Синтетический ген L1 ПВЧ33

400 149

ctgggtacca tgagtgtgtg gagaccatct gaggctacag tctacctgcc tcctgtgcct

60

gtgagcaagg tggtgagcac agatgaatat gtgagcagga ccagcatcta ctactatgct

120

ggctccagca gactgctggc tgtgggacac ccatacttca gcatcaagaa cccaaccaat

180

gccaagaaac tgctggtgcc aaaggtgtct ggactccaat acagggtgtt cagggtgaga

240

ctgcctgacc caaacaagtt tggctttcct gacacctcct tctacaaccc tgacacccag

300

agactggtgt gggcttgtgt gggattggag attggcaggg gacaaccact gggagtgggc

360

atctctggac acccactgct gaacaagttt gatgacacag agacaggcaa caaataccct

420

ggacaacctg gagcagacaa cagggagtgt ctgagtatgg actacaagca gacccaactt

480

tgtctgctgg gctgtaagcc tccaacagga gaacactggg gcaagggagt ggcttgtacc

540

aatgctgccc ctgccaatga ctgtcctcca ttggaactga taaacaccat cattgaggat

600

ggagatatgg tggacacagg ctttggctgt atggacttca agaccctcca agccaacaag

660

tctgatgtgc caattgacat ctgtggcagc acttgtaaat accctgacta cctgaaaatg

720

acctctgaac catatggaga ctccctgttc ttcttcctga ggagggaaca gatgtttgtg

780

agacacttct tcaacagggc tggcaccctg ggagaggctg tgcctgatga cctctacatc

840

aagggctctg gcaccacagc cagcatccag tcctctgcct tctttccaac accatctggc

900

agtatggtga cctctgagag ccaacttttc aacaagccat actggctcca aagggctcaa

960

ggacacaaca atggcatctg ttggggcaac caggtgtttg tgacagtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca atatgaccct gtgtacccag gtgacctctg acagcaccta caagaatgag

1080

aacttcaagg aatacatcag gcatgtggag gaatatgacc tccaatttgt gttccaactt

1140

tgtaaggtga ccctgacagc agaggtgatg acctacatcc atgctatgaa ccctgacatc

1200

ttggaggact ggcagtttgg actgacacct cctccatctg cctccctcca agacacctac

1260

aggtttgtga ccagccaggc tatcacttgt cagaagacag tgcctccaaa ggagaaggag

1320

gacccactgg gcaaatacac cttctgggag gtggacctga aagagaagtt ctctgctgac

1380

ctggaccagt ttccactggg caggaagttc ctgctccaag caggactgaa agccaagcca

1440

aaactgaaaa gggctgcccc aaccagcacc aggacctcct ctgccaagag gaagaaggtg

1500

aagaagtaaa ctcgagctc

1519

210 150

211 34

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5807 ПВЧ58L1 F1

400 150

cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gagg

34

210 151

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5808 ПВЧ58L1 R1

400 151

gcttggcttt caggccgctc tgcagcagga acttcc

36

210 152

211 1438

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5809 амплифицированная последовательность 1 ПВЧ58L1

400 152

cttggtacca tgagcgtgtg gaggcccagc gaggccaccg tgtacctgcc ccccgtgccc

60

gtgagcaagg tggtgagcac cgacgagtac gtgagcagga ccagcatcta ctactacgcc

120

ggcagcagca ggctgctggc cgtgggcaac ccctacttca gcatcaagag ccccaacaac

180

aacaagaagg tgctggtgcc caaggtgagc ggcctgcagt acagggtgtt cagggtgagg

240

ctgcccgacc ccaacaagtt cggcttcccc gacaccagct tctacaaccc cgacacccag

300

aggctggtgt gggcctgcgt gggcctggag atcggcaggg gccagcccct gggcgtgggc

360

gtgagcggcc acccctacct gaacaagttc gacgacaccg agaccagcaa caggtacccc

420

gcccagcccg gcagcgacaa cagggagtgc ctgagcatgg actacaagca gacccagctg

480

tgcctgatcg gctgcaagcc ccccaccggc gagcactggg gcaagggcgt ggcctgcaac

540

aacaacgccg ccgccaccga ctgccccccc ctggagctgt tcaacagcat catcgaggac

600

ggcgacatgg tggacaccgg cttcggctgc atggacttcg gcaccctgca ggccaacaag

660

agcgacgtgc ccatcgacat ctgcaacagc acctgcaagt accccgacta cctgaagatg

720

gccagcgagc cctacggcga cagcctgttc ttcttcctga ggagggagca gatgttcgtg

780

aggcacttct tcaacagggc cggcaagctg ggcgaggccg tgcccgacga cctgtacatc

840

aagggcagcg gcaacaccgc cgtgatccag agcagcgcct tcttccccac ccccagcggc

900

agcatcgtga ccagcgagag ccagctgttc aacaagccct actggctgca gagggcccag

960

ggccacaaca acggcatctg ctggggcaac cagctgttcg tgaccgtggt ggacaccacc

1020

aggagcacca acatgaccct gtgcaccgag gtgaccaagg agggcaccta caagaacgac

1080

aacttcaagg agtacgtgag gcacgtggag gagtacgacc tgcagttcgt gttccagctg

1140

tgcaagatca ccctgaccgc cgagatcatg acctacatcc acaccatgga cagcaacatc

1200

ctggaggact ggcagttcgg cctgaccccc ccccccagcg ccagcctgca ggacacctac

1260

aggttcgtga ccagccaggc catcacctgc cagaagaccg ccccccccaa ggagaaggag

1320

gaccccctga acaagtacac cttctgggag gtgaacctga aggagaagtt cagcgccgac

1380

ctggaccagt tccccctggg caggaagttc ctgctgcaga gcggcctgaa agccaagc

1438

210 153

211 35

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5810 ПВЧ58L1 F2

400 153

gagcggcctg aaagccaagc caaaactgaa aaggg

35

210 154

211 36

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5811 ПВЧ58L1 R2

400 154

ctgtctagat ttacttcttc accttcttcc tcttgg

36

210 155

211 101

212 ДНК

213 Искусственная последовательность

220

223 5812 амплифицированная последовательность 2 ПВЧ58L1

400 155

gagcggcctg aaagccaagc caaaactgaa aagggctgcc ccaaccagca ccaggacctc

60

ctctgccaag aggaagaagg tgaagaagta aatctagaca g

101

210 156

211 38

212 PRT

213 Homo sapiens

220

223 5813 Последовательность аминокислот aa 471-508 белка L1 ПВЧ типа

59

400 156

Leu Gln Leu Gly Ala Arg Pro Lys Pro Thr Ile Gly Pro Arg Lys Arg

1 5 10 15

Ala Ala Pro Ala Pro Thr Ser Thr Pro Ser Pro Lys Arg Val Lys Arg

20 25 30

Arg Lys Ser Ser Arg Lys

35

<---

Изобретение относится к области биотехнологии. Описана группа изобретений, включающая химерный белок L1 папилломавируса в качестве компонента вакцины против папилломавируса, вирусоподобную частицу папилломавируса для получения иммуногенной композиции, иммуногенную композицию для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с папилломавирусом, выделенный полинуклеотид, кодирующий химерный белок L1 папилломавируса, вектор, используемый для получения вирусоподобной частицы папилломавируса или иммуногенной композиции на базе нуклеиновой кислоты, бакуловирус, используемый для получения вирусоподобной частицы папилломавируса или иммуногенной композиции на базе нуклеиновой кислоты, клетку-хозяин для получения химерного белка L1 папилломавируса и вирусоподобной частицы папилломавируса и способ получения вирусоподобной частицы папилломавируса. Изобретение расширяет арсенал средств-компонентов вакцины против папилломавируса. 8 н. и 15 з.п. ф-лы, 25 ил., 28 табл., 62 пр.

1. Химерный белок L1 папилломавируса в качестве компонента вакцины против папилломавируса, содержащий, в направлении от его N-конца к С-концу,

а) N-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса первого типа посредством укорочения С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в положении любой аминокислоты внутри его участка α5 или соседнем с ним участке, или фрагмент, имеющий по меньшей мере 98% идентичность с ним, где указанный N-концевой фрагмент сохраняет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа; и

б) С-концевой фрагмент, полученный из белка L1 папилломавируса второго типа посредством укорочения N-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса второго типа в положении любой аминокислоты внутри его участка α5 или соседнем с ним участке, или его функциональный вариант, полученный в результате дальнейших мутаций, делеций и/или добавлений к указанному фрагменту, где указанный белок L1 папилломавируса второго типа имеет лучший уровень экспрессии и лучшую растворимость по сравнению с белками L1 других типов;

при этом указанный химерный белок L1 папилломавируса имеет иммуногенность белка L1 папилломавируса первого типа.

2. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 1, отличающийся тем, что указанный N-концевой фрагмент имеет по меньшей мере 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с фрагментом, полученным укорочением С-конца природной последовательности указанного белка L1 папилломавируса первого типа в любом положении аминокилот в его участке α5 или соседнем с ним участке.

3. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 1, отличающийся тем, что указанный C-концевой фрагмент содержит одну или множество последовательностей ядерной локализации.

4. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 1, отличающийся тем, что указанный белок L1 папилломавируса представляет собой белок L1 ПВЧ.

5. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 1, отличающийся тем, что указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белков L1 ПВЧ типов 16, 28, 33, 59, или 68;

предпочтительно указанный белок L1 папилломавируса второго типа выбран из белков L1 ПВЧ типа 33 или ПВЧ типа 59.

6. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 5, отличающийся тем, что указанный C-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 2; или фрагмент, имеющий длину m1 аминокислот, предпочтительно фрагмент, включающий аминокислоты в положениях 1-m1 последовательности SEQ ID No: 2; при этом ml представляет собой целое число в диапазоне 8-26; или указанный С-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 132; или фрагмент, имеющий длину m2 аминокислот, предпочтительно включающий аминокислоты в положениях 1-m2 последовательности SEQ ID No: 132; при этом m2 представляет собой целое число в диапазоне 13-31.

7. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 6, отличающийся тем, что указанный C-концевой фрагмент представляет собой SEQ ID No: 13; или его фрагмент, имеющий n аминокислот в длину, предпочтительно фрагмент, включающий аминокислоты l-n последовательности SEQ ID No: 13; при этом n представляет собой целое число в диапазоне 16-38.

8. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 1, отличающийся тем, что указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из белков L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 или 58,

предпочтительно выбран из

белка L1 ПВЧ типа 6, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 5,

белка L1 ПВЧ типа 11, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 18,

белка L1 ПВЧ типа 16, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 31,

белка L1 ПВЧ типа 18, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 44,

белка L1 ПВЧ типа 31, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 57,

белка L1 ПВЧ типа 35, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 70,

белка L1 ПВЧ типа 39, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 83,

белка L1 ПВЧ типа 45, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 96,

белка L1 ПВЧ типа 51, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 109,

белка L1 ПВЧ типа 52, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 122,

белка L1 ПВЧ типа 56, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 135, или

белка L1 ПВЧ типа 58, кодируемого его геном, показанным в SEQ ID No: 148.

9. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 8, отличающийся тем, что указанный белок L1 папилломавируса первого типа выбран из

белка L1 ПВЧ типа 6, показанного в SEQ ID No: 1,

белка L1 ПВЧ типа 11, показанного в SEQ ID No: 14,

белка L1 ПВЧ типа 16, показанного в SEQ ID No: 27,

белка L1 ПВЧ типа 18, показанного в SEQ ID No: 40,

белка L1 ПВЧ типа 31, показанного в SEQ ID No: 53,

белка L1 ПВЧ типа 35, показанного в SEQ ID No: 66

белка L1 ПВЧ типа 39, показанного в SEQ ID No: 79,

белка L1 ПВЧ типа 45, показанного в SEQ ID No: 92,

белка L1 ПВЧ типа 51, показанного в SEQ ID No: 105,

белка L1 ПВЧ типа 52, показанного в SEQ ID No: 118,

белка L1 ПВЧ типа 56, показанного в SEQ ID No: 131,

или белка L1 ПВЧ типа 58, показанного в SEQ ID No: 144.

10. Химерный белок L1 папилломавируса по любому из пп. 1-9, отличающийся тем, что С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного C-концевого фрагмента напрямую или посредством линкера.

11. Химерный белок L1 папилломавируса по любому из пп. 1-10, отличающийся тем, что, когда С-конец указанного N-концевого фрагмента соединен с N-концом указанного C-концевого фрагмента, постоянная последовательность аминокислот RKFL присутствует в положениях плюс или минус 4 аминокислоты от точки соединения,

предпочтительно постоянная последовательность аминокислот LGRKFL присутствует в положениях плюс или минус 6 аминокислот от точки соединения.

12. Химерный белок L1 папилломавируса по п. 11, отличающийся тем, что указанный химерный белок L1 ПВЧ типов 6, 11, 16, 18, 31, 35, 39, 45, 51, 52, 56 и 58 имеет 98%, 98,5%, 99%, 99,5% или 100% идентичность с SEQ ID No: 3, SEQ ID No: 16, SEQ ID No: 29, SEQ ID No: 42, SEQ ID No: 55, SEQ ID No: 68, SEQ Ю No: 81, SEQ ID No: 94, SEQ ID No: 107, SEQ ID No: 120, SEQ ID No: 133 и SEQ ID No: 146 соответственно.

13. Вирусоподобная частица папилломавируса для получения иммуногенной композиции, используемой для предотвращения заболеваний или инфекций, ассоциированных с папилломавирусом, содержащая химерный белок L1 папилломавируса по любому из пп. 1-12.

14. Иммуногенная композиция для предотвращения заболеваний или инфекций, связанных с папилломавирусом, содержащая вирусоподобные частицы папилломавируса по п. 13 и адъюванты.

15. Выделенный полинуклеотид, кодирующий химерный белок L1 папилломавируса по любому из пп. 1-12.

16. Полинуклеотид по п. 15, выбранный из

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 6, показанной в SEQ ID No: 4,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 11, показанной в SEQ ID No: 17,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 16, показанной в SEQ ID No: 30,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 18, показанной в SEQ ID No: 43,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 31, показанной в SEQ ID No: 56,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 35, показанной в SEQ ID No: 69,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 39, показанной в SEQ ID No: 82,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 45, показанной в SEQ ID No: 95,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 51, показанной в SEQ ID No: 108,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 52, показанной в SEQ ID No: 121,

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 56, показанной в SEQ ID No: 134, или

последовательности нуклеотидов, кодирующей химерный белок L1 ПВЧ типа 58, показанной в SEQ ID No: 147.

17. Вектор, используемый для получения вирусоподобной частицы папилломавируса по п. 13 или иммуногенной композиции на базе нуклеиновой кислоты, содержащий полинуклеотид по п. 15 или 16.

18. Вектор по п. 17, отличающийся тем, что указанный вектор представляет собой бакуловирусный вектор.

19. Бакуловирус, используемый для получения вирусоподобной частицы папилломавируса по п. 13 или иммуногенной композиции на базе нуклеиновой кислоты, содержащий полинуклеотид по п. 15 или 16.

20. Клетка-хозяин, содержащая полинуклеотид по п. 15 или 16, вектор по п. 17 или 18 или бакуловирус по п. 19 для получения химерного белка L1 папилломавируса по любому из пп. 1-12 и вирусоподобной частицы папилломавируса по п. 13.

21. Клетка-хозяин по п. 20, отличающаяся тем, что указанная клетка-хозяин представляет собой клетку насекомого, предпочтительно выбранную из клеток Sf9, клеток Sf21, клеток Hi5 и клеток S2.

22. Способ получения вирусоподобной частицы папилломавируса по п. 13, включающий

выращивание клетки-хозяина по любому из пп. 20, 21 для экспрессии химерного белка L1 папилломавируса и сборки его в вирусоподобную частицу; и

очистку указанной вирусоподобной частицы папилломавируса.

23. Способ по п. 22, отличающийся тем, что указанную очистку осуществляют с использованием катионообменной хроматографии, предпочтительно катионообменной хроматографии, представляющей собой двухстадийную хроматографию HS-MMA.