Широко нейтрализующее антитело против SARS-CoV-2 Российский патент 2023 года по МПК C07K16/10 C12N15/13 C12P21/08 

Описание патента на изобретение RU2810476C1

Изобретение относится к иммунологии и биотехнологии, а именно: к получению широконейтрализующего рекомбинантного антитела человека (рчАт) против вируса SARS-CoV-2, которое может быть использовано для разработки иммунобиологических лекарственных препаратов на основе антител, что расширяет возможности терапии/диагностики вирусной инфекции SARS-CoV-2 в медицине.

Объектом изобретения является рчАт класса IgG, имеющее аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1 для вариабельного домена тяжелой цепи антитела и SEQ ID NO:2 для вариабельного домена легкой цепи антитела, специфически связывающееся с различными вариантами RBD домена белка S вируса SARS-CoV-2 (Wuhan-Hu-1, а также варианты Альфа, Гамма, Дельта и Омикрон) и обладающее широким спектром нейтрализующей активности.

Коронавирусная инфекция (COVID-19) - респираторное заболевание, вызываемое вирусом SARS-CoV-2, который появился в Китае в конце 2019 года и быстро распространился по всему миру, вызвав глобальную пандемию [Coronaviridae Study Group of the International Committee on Taxonomy of Viruses. The species Severe acute respiratory syndrome-related coronavirus: classifying 2019-nCoV and naming it SARS-CoV-2. Nat Microbiol. 2020; 5:536-544. doi: 10.1038/s41564-020-0695-z; World Health Organization. Coronavirus disease 2019 (COVID-19). 2020; Situation Report-51]. Заболевание может протекать как в лёгкой, так и в тяжёлой форме, в том числе, приводя к смертельным исходам. Пациентам с легкими и умеренными симптомами COVID-19 назначается поддерживающая терапия с симптоматическим лечением, как, например, прием жаропонижающих средств от лихорадки, обезболивающие препараты, и наблюдение за признаками обострения, которое требует стационарного лечения. Риск тяжелого течения COVID-19 или смерти от заболевания угрожает любому человеку независимо от возраста. Тем не менее, тяжелая форма заболевания чаще всего развивается у людей, относящихся к группе риска: люди старше 60 лет, а также с хроническими сердечно-сосудистыми, респираторными, онкологическими заболеваниями, диабетом и др. В разгар пандемии вируснейтрализующие антитела были одобрены Всемирной организацией здравоохранения (ВОЗ) для лечения инфицированных SARS-CoV-2, если для пациента существовал высокий риск госпитализации или для лечения пациентов с тяжелым течением COVID-19. Нейтрализующие антитела появляются после заражения вирусом SARS-CoV-2 [Suthar M.S. et al, Rapid Generation of Neutralizing Antibody Responses in COVID-19 Patients. Cell Rep Med. 2020; 1(3):100040. doi: 10.1016/j.xcrm.2020.10004]) или вакцинации [Jackson L.A. et al, mRNA-1273 Study Group. An mRNA Vaccine against SARS-CoV-2 - Preliminary Report. N Engl J Med. 2020; 383(20):1920-1931. doi: 10.1056/NEJMoa2022483] сохраняются в сыворотке крови в течение нескольких месяцев и коррелируют с уровнем защиты от инфекции [Addetia, A. et al, Neutralizing Antibodies Correlate with Protection from SARS-CoV-2 in Humans during a Fishery Vessel Outbreak with a High Attack Rate. J Clin Microbiol. 2020; 58(11):e02107-20. doi: 10.1128/JCM.02107-20]. По мере эволюции вируса SARS-CoV-2 под давлением отбора за счет естественного или индуцированного вакцинацией иммунитета, появляются его новые варианты, характеризующиеся повышенной трансмиссивностью, изменением течения заболевания или риском повторного инфицирования из-за изменения антигенного состава. Появление мутантных вариантов SARS-CoV-2 привело к снижению эффективности существующих нейтрализующих антител и ограничивает их использование на сегодняшний день. Поскольку мутации в значительной степени изменяют силу и/или кинетику связывания вируса с ACE2 рецептором, мутации, возникающие в рецептор-связывающем домене (RBD) S белка, представляют особый интерес [Amoutzias G.D. et al, The Remarkable Evolutionary Plasticity of Coronaviruses by Mutation and Recombination: Insights for the COVID-19 Pandemic and the Future Evolutionary Paths of SARS-CoV-2. Viruses. 2022; 14(1):78. doi: 10.3390/v14010078]. Альфа вариант коронавируса SARS-CoV-2 (линия B.1.1.7) был впервые обнаружен в начале декабря 2020 года во время пандемии COVID-19 в Великобритании, мутация N501Y в RBD привела к увеличению аффинности связывания вируса с клетками организма человека в 7 раз [Davies N.G. et al. Estimated Transmissibility and Impact of SARS-CoV-2 Lineage B.1.1.7 in England. Science. 2021; 372:eabg3055. doi: 10.1126/science.abg3055; Supasa P. et al. Reduced Neutralization of SARS-CoV-2 B.1.1.7 Variant by Convalescent and Vaccine Sera. Cell. 2021; 184:2201-11. doi: 10.1016/j.cell.2021.02.033]. Гамма вариант (P1) был идентифицирован в ноябре 2020 года Бразилии и вызвал резкую вспышку заболеваемости, данный вируса SARS-CoV-2 имеет 12 мутаций в S белке, включая K417T, E484K и N501Y в RBD [Wink P.L. et al. Genomic Surveillance of SARS-CoV-2 Lineages Indicates Early Circulation of P.1 (Gamma) Variant of Concern in Southern Brazil. Microbiol Spectr. 2022;10(1):e0151121. doi: 10.1128/spectrum.01511-21; Dejnirattisai W. et al. Antibody evasion by the P.1 strain of SARS-CoV-2. Cell. 2021; 184(11):2939-2954.e9. doi: 10.1016/j.cell.2021.03.055]. Дельта вариант SARS-CoV-2 (B.1.617.2) c мутациями L452R, T478K, ±E484Q в RBD был впервые идентифицирован в декабре 2020 года в Индии, его повышенная контагиозность привела к полному вытеснению исходного уханьского варианта (Wuhan-Hu-1) [Zhang L. et al. Analysis of SARS-CoV-2 variants B.1.617: host tropism, proteolytic activation, cell-cell fusion, and neutralization sensitivity. Emerg Microbes Infect. 2022; 11(1):1024-1036. doi: 10.1080/22221751]. Омикрон (B.1.1.529) впервые был идентифицирован в ноябре 2021 в Южно-Африканской Республике и Ботсване, содержал беспрецедентное количество мутаций, сконцентрированных в гене S белка (более 30 мутаций, в том числе 15 - в RBD), незамедлительно вытеснил вариант дельта и на сегодняшний день является преобладающим в России и во всем мире, продолжая мутировать.

Обширная мутационная нагрузка на основной антиген снизила активность известных терапевтических нейтрализующих антител, что привело к увеличению доз или пересмотру вариантов терапии больных с тяжелой формой течения заболевания [Hoffmann M. et al. SARS-CoV-2 Variant B. 1.617 Is Resistant to Bamlanivimab and Evades Antibodies Induced by Infection and Vaccination. Cell Rep. 2021; 36:109415. doi: 10.1016/j.celrep.2021.109415; Cao Y. et al. Omicron escapes the majority of existing SARS-CoV-2 neutralizing antibodies. Nature. 2022; 602:657-663. doi: 10.1038/s41586-021-04385-3].

Моноклональные человеческие антитела, ранее разрешенные Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США (FDA) с экстренным решением для применения (EUA) - казиривимаб и имдевимаб (Ronapreve (REGN10933 и REGN10987), Regeneron, США), бамланивимаб и этесевимаб (LY-CoV555 и LY-CoV016, Eli Lilly, США), вводимые в виде коктейля, а также регданвимаб (CT-P59, Celltrion, Южная Корея) в экспериментах in vitro с использованием псевдовирусной системы и живых вирусов показали полную потерю нейтрализующей активности препаратов против варианта Омикрон и их использование было ограничено [VanBlargan L. A. et al. An infectious SARS-CoV-2 B.1.1.529 Omicron virus escapes neutralization by therapeutic monoclonal antibodies. Nat. Med. 2022; 28:490-495. doi: 10.1038/s41591-021-01678-y; Tatham, L. et al. Lack of Ronapreve (REGN-CoV; casirivimab and imdevimab) virological efficacy against the SARS-CoV-2 Omicron variant (B.1.1.529) in K18-hACE2 mice. bioRxiv. 2022; doi: org/10.1101/2022.01.23.477397]. Эффективность сотровимаба (S309, VIR-7831, GlaxoSmithKline, Великобритания) и бебтеловимаба (LY-CoV1404, Eli Lilly, США) в отношении различных вариантов Омикрона сохранялась [Zhou T. et al. Structural basis for potent antibody neutralization of SARS-CoV-2 variants including B.1.1.529. Science. 2022; 376:eabn8897. doi: 10.1126/science.abn889]. Необходимо отметить, что применение сотровимаба до недавнего времени было разрешено на территории России [https://grls.rosminzdrav.ru/PandemicPermissions.aspx?TorgName=сотровимаб], однако дальнейшее исследование эффективности препарата показало, что его использование стимулирует эволюцию вируса SARS-CoV-2 у пациентов с ослабленным иммунитетом [Rockett R. et al. Resistance mutations in SARS-CoV-2 delta variant after sotrovimab use. N Engl J Med. 2022; 386:1477-1479. doi: 10.1056/NEJMc2120219; Destras G. et al. Sotrovimab drives SARS-CoV-2 omicron variant evolution in immunocompromised patients. Lancet Microbe. 2022; 3(8):e559. doi: 10.1016/S2666-5247(22)00120-3], что привело к пересмотру решения о его использовании [WHO, Therapeutics and COVID-19: living guideline, 16/09/2022]. Бебтеловимаб также больше не разрешен FDA к применению в США из-за отсутствия активности в отношении циркулирующих вариантов [FDA, Fact sheet for healthcare providers: emergency use authorization for bebtelovimab, ID: 5072477, 30/11/2022]. Таким образом, в настоящее время в мире нет моноклональных антител, разрешенных для лечения острой инфекции.

Лекарственный препарат на основе комбинации моноклональных антител тиксагевимаб и цилгавимаб (Эвушелд (AZD8895+AZD1061), AstraZeneca, Великобритания) одобрен для доконтактной профилактики COVID-19 у лиц c ослабленным иммунитетом (иммунодефицит или иммуносупрессивная терапия) или лицам, для которых вакцинация не рекомендована по причине тяжелой побочной реакции на вакцину или ее компоненты в анамнезе [Levin MJ, et al. Intramuscular AZD7442 (Tixagevimab-Cilgavimab) for Prevention of Covid-19. N Engl J Med. 2022.; 386:2188-2200. doi:10.1056/NEJMoa2116620; FDA, Fact sheet for healthcare providers: emergency use authorization for evusheld, ID: 5098106, 5/12/2022]. На территории России препарат также включен в «Реестр решений об обращении лекарственных препаратов во время пандемии» [https://grls.rosminzdrav.ru/PandemicPermissions.aspx?TorgName=эвушелд]. AZD8895 и AZD1061 сохраняют эффективность против Омикрона, несмотря на снижение нейтрализующей активности к его различным субвариантам [Otiniano A. et al. Tixagevimab/cilgavimab for Omicron SARS-CoV-2 infection in patients with haematologic diseases. Bone Marrow Transplant. 2022; doi: 10.1038/s41409-022-01894-1].

Комбинации антител к разными эпитопам S белка обеспечивают их синергетическое действие, а также снижают вероятность появления мутаций, придающих вирусу устойчивость против антител [Zost S.J. et al. Potently neutralizing and protective human antibodies against SARS-CoV-2. Nature. 2020; 584(7821):443-449. doi: 10.1038/s41586-020-2548-6; Yang, Y., Du, L. Neutralizing antibodies and their cocktails against SARS-CoV-2 Omicron and other circulating variants. Cell. Mol. Immunol. 2022; 19:962-964. doi: 10.1038/s41423-022-00890-1]. Таким образом, в связи с продолжающимся появлением новых вариантов вируса SARS-CoV-2, кодирующих все большее количество аминокислотных замен в S белке, требуется постоянный мониторинг эффективности действия уже существующих препаратов, а также поиск и расширение панели моноклональных антител, эффективных для лечения и профилактики COVID-19.

Технической задачей изобретения является расширения арсенала антител, обладающих широким спектром нейтрализующей активности против вариантов вируса SARS-CoV-2.

Технический результат заключается в создании антитела Т11, которое эффективно связывает варианты RBD домена S белка вируса SARS-CoV-2, нейтрализуют вирус SARS-CoV-2 дикого типа (Wuhan-Hu-1), а также штаммы Дельта (B.1.617.2) и Омикрон (B.1.1.529) и может быть использовано для разработки иммунобиологических лекарственных препаратов на основе антител для терапии вирусной инфекции SARS-CoV-2.

Указанный технический результат достигается:

созданием рекомбинантных плазмидных ДНК pFuse/T11/CH и pFuse/T11/CL, кодирующих, соответственно, гены тяжелой и легкой цепи рекомбинантного антитела Т11, и состоящих из плазмиды pFuse, которая содержит высокоэффективный синтетический промотор hEF/HTLV, сигнальную последовательность интерлейкина-2 (IL-2 signal), обеспечивающую эффективную секрецию продукта экспрессии генов в культуральную среду, нуклеотидную последовательность гена вариабельного домена тяжелой цепи в единой рамке считывания с геном константного домена тяжелой цепи (CH) иммуноглобулина человека IgG1 (SEQ ID NO:3) или нуклеотидную последовательность гена вариабельного домена легкой цепи в единой рамке считывания с геном константного домена лямбда легкой цепи (CL) иммуноглобулина человека (SEQ ID NO:4), сигнальную последовательность полиаденилирования вируса SV40; нуклеотидную последовательность гена BleoR, продукт которого обеспечивает устойчивость трансформантов к антибиотику зеоцин, нуклеотидную последовательность точки начала репликации плазмидной ДНК (ori) для ее наработки в бактериальных клетках E. coli;

получением полноразмерного антитела Т11, предусматривающим котрансфекцию рекомбинантными плазмидными ДНК pFuse/T11/CH и pFuse/T11/CL клеток линии HEK293F, культивирование клеток в условиях, при которых продуцируется антитело Т11, имеющее аминокислотную последовательность SEQ ID NO:1 для вариабельного домена тяжелой цепи антитела и SEQ ID NO:2 для вариабельного домена легкой цепи антитела;

выделением и хроматографической очисткой рекомбинантного антитела Т11.

Изобретение иллюстрируют следующими примерами.

ПРИМЕР 1

Создание генетических конструкций pFuse/T11/CH и pFuse/T11/CL

Антитело Т11 отобрано из библиотеки одноцепочечных антител человека, получившего полный курс вакцинации препаратом PfizerBioNTech с использованием дрожжевого дисплея. Последовательность гена, кодирующего вариабельный домен тяжелой цепи (VH), амплифицируют с помощью ПЦР с использованием олигонуклеотидов 5’-tcacgaattcgcaggtgcagctggtggagtc-3’ и 5’-ggtgcttgctgaggagacggtgacc-3’ и далее клонируют в вектор pFuse-IgG1 с использованием эндонуклеаз рестрикции EcoRI и BsmBI с получением генетической конструкции pFuse/T11/CH (Рис. 1а). Последовательность гена, кодирующего вариабельный домен легкой цепи (VL), амплифицируют с помощью ПЦР с использованием олигонуклеотидов 5’- tcacgaattcgcaggttgtgctgactcag-3’ и 5’-gctgacctaggacggtcagcttg-3’ и далее клонируют в вектор pFuse-Lambda с использованием эндонуклеаз рестрикции EcoRI и AvrII, с получением генетической конструкции pFuse/T11/CL (Рис. 1б).

ПРИМЕР 2

Получение полноразмерного рекомбинантного антитела Т11

Полученные генетические конструкциии pFuse/T11/CH и pFuse/T11/CL используют для временной трансфекций клеток линии HEK-293 с использованием среды FreeStyle 293 и полиэтиленимина (PEI) [N. Portolano et al. J. Vis. Exp. 2014]. Далее клетки культивируют на орбитальном шейкере, вращающемся со скоростью 130 об/мин, в СО2-инкубаторе, содержащем влажную атмосферу с 8% CO2 в воздухе при температуре 37°C в течение 7-10 дней для наработки белка. При показателе жизнеспособности клеток менее 70% культуральную жидкость последовательно центрифугируют при скорости 900 об/мин и в течение 10 минут, а затем при скорости 13000 об/мин и в течение 15 минут и используют для выделения белка. Рекомбинантное антитело Т11 очищают с использованием аффинной хроматографии на колонке HiTrap Protein G HP в соответствии с инструкцией производителя и гель-фильтрации на колонке Superdex 200 (GE Healthcare, USA) в фосфатно-солевом буфере. Чистоту полученного препарата рчАТ Т11 анализируют электрофоретически (Рис.2).

ПРИМЕР 3

Определение аффинности взаимодействия антитела Т11 с RBD WT и его вариантами - альфа, гамма, дельта, омикрон

Константы диссоциации комплекса антитела Т11 с RBDWT (Wuhan-Hu-1), а также с вариантами RBD Альфа (B.1.1.7), Гамма (P1), Дельта (B.1.617.2) и Омикрон (B.1.1.529) определяют c использованием метода поверхностного плазмонного резонанса. Для иммобилизации антигена RBD используют стандартные чипы BiaCore CM5. Иммобилизацию проводят по методике производителя, концентрации вариантов RBD варируют в диапазоне 1-10 мкг/мл. Для оценки связывания готовят разведения антитела Т11 в диапазоне концентраций 1 - 16 нМ. Эксперимент проводят на приборе BiaCore T200 в условиях одного цикла, где время ассоциации составляет 120 секунд, время диссоциации - 3600 секунд. Анализ кинетики проводят с использованием встроенного ПО, результаты представлены в Таблице 1.

Таблица 1. Константы диссоциации комплекса антитела Т11 с RBDWT (Wuhan-Hu-1), а также с вариантами RBD Альфа (B.1.1.7), Гамма (P1), Дельта (B.1.617.2) и Омикрон (B.1.1.529), измеренные с помощью метода поверхностного плазмонного резонанса. RBD WT Альфа Гамма Дельта Омикрон K D, М 2.4×10-10 3.1×10-10 5.3×10-10 9.4×10-10 <1.4×10-14

ПРИМЕР 4

Определение вируснейтрализующей активности антитела Т11

Для определения вируснейтрализующей активности антитела Т11 используют псевдотипированные вирусные частицы, несущих на поверхности S-белок SARS-CoV2 дикого типа (Wuhan-Hu-1), варианта Дельта (B.1.617.2) или Омикрон (B.1.1.529). Клетки линии HEK293T-ACE2 рассевают в 96-луночный планшет и растят в течение 18-24 часов до достижения конфлюентности 50-80%. В стерильном планшете проводят разведения антитела Т11 в среде (DMEM+10%FBS) в диапазоне концентраций 0.003-100 нМ, смешивают с 50 мкл псевдовирусов и добавляют в 96-луночный планшет с клетками HEK293T-ACE2, содержащими по 50 кондиционной среды. Через 72 часа инкубации клетки лизируют и используют для оценки люминесценции по методике производителя Luciferase Assay System Bright Glo (Promega) и прибора VarioScan (Thermo). Обработку данных осуществляют с использованием ПО Origin Pro. Рассчитанные IC50 (концентрации полумаксимального ингибирования) антитела Т11 в отношении вируса SARS-CoV-2 дикого типа (Wuhan-Hu-1) и Дельта (B.1.617.2) и Омикрон (B.1.1.529) представлена в таблице 2.

Таблица 2. Вируснейтрализующая активность антитела Т11 в отношении вируса SARS-CoV-2 дикого типа (Wuhan-Hu-1) и Дельта (B.1.617.2) и Омикрон (B.1.1.529). RBD WT Дельта Омикрон IC50, нМ 10.3±2.1 17±4.5 0.2±0.05

--->

<?xml version="1.0" encoding="UTF-8"?>

<!DOCTYPE ST26SequenceListing PUBLIC "-//WIPO//DTD Sequence Listing

1.3//EN" "ST26SequenceListing_V1_3.dtd">

<ST26SequenceListing dtdVersion="V1_3" fileName="Широко

нейтрализующее антитело против SARS-CoV-2 full.xml"

softwareName="WIPO Sequence" softwareVersion="2.2.0"

productionDate="2022-12-28">

<ApplicantFileReference>11</ApplicantFileReference>

<ApplicantName languageCode="ru">ИБХ РАН</ApplicantName>

<ApplicantNameLatin>IBCh RAS</ApplicantNameLatin>

<InventionTitle languageCode="ru">Широко нейтрализующее антитело

против SARS-CoV-2</InventionTitle>

<SequenceTotalQuantity>4</SequenceTotalQuantity>

<SequenceData sequenceIDNumber="1">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>127</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>AA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..127</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>protein</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q2">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>synthetic construct</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>QVQLVESGAEVKKPGSSVKVSCKAPGGTFSSYAISWVRQAPGQGLEWMG

GIIPIFGTPNYAQKFQGRVTITADESTSTAYMELSSLRSEDTAVYYCARGYCGGDCYSLELVWYFDLWGR

GTLVTVSS</INSDSeq_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

<SequenceData sequenceIDNumber="2">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>111</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>AA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..111</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>protein</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q4">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>synthetic construct</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>QVVLTQPPSVSGAPGQRVTISCTGSSSNIGAGYDVQWYQQLPGTAPKLL

IYGNSNRPSGVPDRFSGSKSGTSASLAITGLQAEDEADYYCQSYDSSLSGWVFGGGTKLTVL</INSDSe

q_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

<SequenceData sequenceIDNumber="3">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>1377</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..1377</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q6">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>synthetic construct</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>caggtgcagctggtggagtctggggctgaggtgaagaagcctgggtcct

cggtgaaggtctcctgcaaggctcctggaggcaccttcagcagctatgctatcagctgggtgcgacaggc

ccctggacaagggcttgagtggatgggagggatcatccctatctttggtacaccaaactacgcacagaag

ttccagggcagagtcacgattaccgcggacgaatccacgagcacagcctacatggagctgagcagcctga

gatctgaggacacggccgtgtattactgtgcgaggggatattgtggtggtgattgctattcattagaact

cgtctggtacttcgatctctggggccgtggcaccctggtcaccgtctcctcagcaagcaccaagggccca

tcggtcttccccctggcaccctcctccaagagcacctctgggggcacagcggccctgggctgcctggtca

aggactacttccccgaaccggtgacggtgtcgtggaactcaggcgccctgaccagcggcgtgcacacctt

cccggctgtcctacagtcctcaggactctactccctcagcagcgtggtgactgtgccctctagcagcttg

ggcacccagacctacatctgcaacgtgaatcacaagcccagcaacaccaaggtggacaagaaagttgagc

ccccgaaatcttgtgacaaaactcacacatgcccaccgtgcccagcacctgaactcctggggggaccgtc

agtcttcctcttccccccaaaacccaaggacaccctcatgatctcccggacccctgaggtcacatgcgtg

gtggtggacgtgagccacgaagaccctgaggtcaagttcaactggtacgtggacggcgtggaggtgcata

atgccaagacaaagccgcgggaggagcagtacaacagcacgtaccgtgtggtcagcgtcctcaccgtcct

gcaccaggactggctgaatggcaaggagtacaagtgcaaggtctccaacaaagccctcccagcccccatc

gagaaaaccatctccaaagccaaagggcagccccgagaaccacaggtgtacaccctgcccccatcccggg

atgagctgaccaagaaccaggtcagcctgacctgcctggtcaaaggcttctatcccagcgacatcgccgt

ggagtgggagagcaatgggcagccggagaacaactacaagaccacgcctcccgtgctggactccgacggc

tccttcttcctctacagcaagctcaccgtggacaagagcaggtggcagcaggggaacgtcttctcatgct

ccgtgatgcatgaggctctgcacaaccactacacgcagaagagcctctccctgtctccgggtaaatga</

INSDSeq_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

<SequenceData sequenceIDNumber="4">

<INSDSeq>

<INSDSeq_length>654</INSDSeq_length>

<INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>

<INSDSeq_division>PAT</INSDSeq_division>

<INSDSeq_feature-table>

<INSDFeature>

<INSDFeature_key>source</INSDFeature_key>

<INSDFeature_location>1..654</INSDFeature_location>

<INSDFeature_quals>

<INSDQualifier>

<INSDQualifier_name>mol_type</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>other DNA</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

<INSDQualifier id="q8">

<INSDQualifier_name>organism</INSDQualifier_name>

<INSDQualifier_value>synthetic construct</INSDQualifier_value>

</INSDQualifier>

</INSDFeature_quals>

</INSDFeature>

</INSDSeq_feature-table>

<INSDSeq_sequence>caggttgtgctgactcagccgccctcagtgtctggggccccagggcaga

gggtcaccatctcctgcactgggagcagctccaacatcggggcaggttatgatgtacagtggtaccagca

gcttccaggaacagcccccaaactcctcatctatggtaacagcaatcggccctcaggggtccctgaccga

ttctctggctccaagtctggcacctcagcctccctggccatcactgggctccaggctgaggatgaggctg

attattactgccagtcctatgacagcagcctgagtggttgggtgttcggcggagggaccaagctgaccgt

cctaggtcagcccaaggctgccccctcggtcactctgttcccgccctcctctgaggagcttcaagccaac

aaggccacactggtgtgtctcataagtgacttctacccgggagccgtgacagtggcctggaaggcagata

gcagccccgtcaaggcgggagtggagaccaccacaccctccaaacaaagcaacaacaagtacgcggccag

cagctacctgagcctgacgcctgagcagtggaagtcccacaaaagctacagctgccaggtcacgcatgaa

gggagcaccgtggagaagacagtggcccctacagaatgttcatag</INSDSeq_sequence>

</INSDSeq>

</SequenceData>

</ST26SequenceListing>

<---

Похожие патенты RU2810476C1

название год авторы номер документа
Интегративный плазмидный вектор pVEAL3-RBDdel, обеспечивающий синтез и секрецию рекомбинантного белка рецепторсвязывающего домена RBDdelta коронавируса SARS-CoV-2 в клетках млекопитающих, рекомбинантный штамм клеточной линии CHO-K1- RBDdelta и рекомбинантный белок RBDdelta SARS-CoV-2, продуцируемый штаммом клеточной линии 2023
  • Несмеянова Валентина Сергеевна
  • Меркульева Юлия Александровна
  • Исаева Анастасия Александровна
  • Щербаков Дмитрий Николаевич
  • Волкова Наталья Вячеславовна
  • Беленькая Светлана Валерьевна
  • Боргояркова Мария Борисовна
  • Волосникова Екатерина Александровна
  • Есина Татьяна Игоревна
  • Зайковская Анна Владимировна
  • Пьянков Олег Викторович
  • Ильичев Александр Алексеевич
RU2816175C1
ПОЛИПЕПТИДНЫЙ МОДУЛЬ ДЛЯ СВЯЗЫВАНИЯ КОНСЕРВАТИВНОГО ЭПИТОПА РЕЦЕПТОР-СВЯЗЫВАЮЩЕГО ДОМЕНА БЕЛКА SPIKE КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 2022
  • Тиллиб Сергей Владимирович
  • Воробьев Павел Олегович
RU2809183C1
СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ НЕЙТРАЛИЗУЮЩИХ АНТИТЕЛ К SARS-CoV-2 В СЫВОРОТКЕ ИЛИ ПЛАЗМЕ КРОВИ ЛЮДЕЙ, ПЕРЕНЕСШИХ COVID-19 ИЛИ ПРИВИТЫХ ВАКЦИНАМИ ДЛЯ ПРОФИЛАКТИКИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ COVID-19, С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ НАБОРА РЕАГЕНТОВ ДЛЯ ИММУНОФЕРМЕНТНОГО АНАЛИЗА, СОДЕРЖАЩЕГО РЕКОМБИНАНТНЫЙ РЕЦЕПТОР-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН (RBD) ПОВЕРХНОСТНОГО ГЛИКОПРОТЕИНА S КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ РЕЦЕПТОР АСЕ2 2021
  • Костин Никита Николаевич
  • Бобик Татьяна Владимировна
  • Скрябин Георгий Андреевич
  • Симонова Мария Александровна
  • Балмасова Ирина Петровна
  • Абрикосова Виктория Александровна
  • Мокрушина Юлиана Анатольевна
  • Смирнов Иван Витальевич
  • Алешенко Наталья Леонидовна
  • Никитин Алексей Эдуардович
  • Чехонин Владимир Павлович
  • Габибов Александр Габибович
RU2784655C1
Моноклональное антитело к RBD фрагменту в составе S белка вируса SARS-CoV-2 2020
  • Шахпаронов Михаил Иванович
  • Павлюков Марат Самвелович
  • Антипова Надежда Викторовна
RU2744274C1
Рекомбинантная плазмида pVBL-RBDomik, обеспечивающая синтез и секрецию рекомбинантного рецептор-связывающего домена (RBD) коронавируса SARS-CoV-2 линии B.1.1.529 в клетках млекопитающих. 2021
  • Викторов Денис Александрович
  • Тороповский Андрей Николаевич
  • Щербаков Дмитрий Николаевич
  • Никитин Алексей Георгиевич
RU2772905C1
Иммунобиологическое средство и способ его использования для индукции специфического иммунитета против вирусов SARS-CoV-2 вариант B.1.617.2 (Delta) и SARS-CoV-2 вариант B.1.1.529 (Omicron) (варианты) 2022
  • Зубкова Ольга Вадимовна
  • Ожаровская Татьяна Андреевна
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Попова Ольга
  • Зрелкин Денис Игоревич
  • Воронина Дарья Владимировна
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Гроусова Дарья Михайловна
  • Джаруллаева Алина Шахмировна
  • Тухватулин Амир Ильдарович
  • Тухватулина Наталья Михайловна
  • Щербинин Дмитрий Николаевич
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Токарская Елизавета Александровна
  • Ботиков Андрей Геннадьевич
  • Ерохова Алина Сергеевна
  • Ижаева Фатима Магометовна
  • Никитенко Наталья Анатольевна
  • Лубенец Надежда Леонидовна
  • Семихин Александр Сергеевич
  • Гущин Владимир Алексеевич
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
  • Борисевич Сергей Владимирович
  • Чернецов Владимир Александрович
  • Крюков Евгений Владимирович
  • Бабира Владимир Федорович
  • Кутаев Дмитрий Анатольевич
  • Логинова Светлана Яковлевна
RU2779634C1
Однодоменное антитело ламы Н5 и его производное H5-Fc, специфически связывающие RBD-домен S-белка вируса SARS-CoV-2, обладающие вируснейтрализующей активностью 2022
  • Баранов Константин Олегович
  • Беловежец Татьяна Николаевна
  • Волкова Ольга Юрьевна
  • Горчаков Андрей Александрович
  • Гусельников Сергей Владимирович
  • Кулемзин Сергей Викторович
  • Мечетина Людмила Васильевна
  • Наякшин Александр Матвеевич
  • Солодков Павел Павлович
  • Таранин Александр Владимирович
  • Чикаев Антон Николаевич
  • Чикаев Николай Андреевич
RU2793967C1
СПОСОБ ИСПОЛЬЗОВАНИЯ РЕКОМБИНАНТНЫХ БЕЛКОВ SARS-COV-2 В СОСТАВЕ ТЕСТ-СИСТЕМЫ ДЛЯ ИММУНОФЕРМЕНТНОГО АНАЛИЗА С ОПРЕДЕЛЕНИЕМ УРОВНЕЙ АНТИТЕЛ КЛАССОВ IgM, IgG, IgA В СЫВОРОТКЕ/ПЛАЗМЕ КРОВИ БОЛЬНЫХ COVID-19 2020
  • Костин Никита Николаевич
  • Бобик Татьяна Владимировна
  • Цабай Полина Николаевна
  • Скрябин Георгий Андреевич
  • Балмасова Ирина Петровна
  • Симонова Мария Александровна
  • Мокрушина Юлиана Анатольевна
  • Смирнов Иван Витальевич
  • Алешенко Наталья Леонидовна
  • Никитин Алексей Эдуардович
  • Быков Андрей Юрьевич
  • Чехонин Владимир Павлович
  • Габибов Александр Габибович
RU2730897C1
Рекомбинантная плазмида pVBL-RBDdelta, обеспечивающая синтез и секрецию рекомбинантного рецептор-связывающего домена (RBD) коронавируса SARS-CoV-2 линии B.1.617.2 в клетках млекопитающих 2021
  • Тороповский Андрей Николаевич
  • Викторов Денис Александрович
  • Щербаков Дмитрий Николаевич
  • Никитин Алексей Георгиевич
RU2772904C1
Средство и способ терапии и экстренной профилактики заболеваний, вызываемых вирусом SARS-CoV-2 на основе рекомбинантного антитела и гуманизированного моноклонального антитела 2021
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Фаворская Ирина Алексеевна
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Лебедин Юрий Степанович
  • Деркаев Артем Алексеевич
  • Рябова Екатерина Игоревна
  • Прокофьев Владимир Владимирович
  • Алексеева Ирина Александровна
  • Воронина Дарья Владимировна
  • Зорков Илья Дмитриевич
  • Ковыршина Анна Витальевна
  • Илюхина Анна Алексеевна
  • Ботиков Андрей Геннадьевич
  • Карпов Андрей Павлович
  • Лубенец Надежда Леонидовна
  • Зубкова Ольга Вадимовна
  • Семихин Александр Сергеевич
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
RU2769223C1

Иллюстрации к изобретению RU 2 810 476 C1

Реферат патента 2023 года Широко нейтрализующее антитело против SARS-CoV-2

Изобретение относится к области биотехнологии. Описано рекомбинантное антитело человека T11 класса IgG против вируса SARS-CoV-2, обладающее свойством селективно связываться с RBD доменом S белка вируса SARS-CoV-2 и нейтрализовать активность вируса SARS-CoV-2 и способ его получения. Антитело содержит вариабельный домен тяжелой цепи (VH) с последовательностью аминокислот, представленных на SEQ ID NO: 1 и вариабельный домен легкой цепи (VL) с последовательностью аминокислот, представленных на SEQ ID NO: 2. Изобретение расширяет арсенал антител, обладающих нейтрализующей активностью против вируса SARS-CoV-2. 2 н.п. ф-лы, 2 ил., 4 пр., 2 табл.

Формула изобретения RU 2 810 476 C1

1. Рекомбинантное антитело человека T11 класса IgG против вируса SARS-CoV-2, содержащее вариабельный домен тяжелой цепи с последовательностью аминокислот, представленных на SEQ ID NO: 1 и вариабельный домен легкой цепи с последовательностью аминокислот, представленных на SEQ ID NO: 2, обладающее свойством селективно связываться с RBD доменом S белка вируса SARS-CoV-2 и нейтрализовать активность вируса SARS-CoV-2.

2. Способ получения полноразмерного рекомбинантного антитела человека Т11 по п.1, предусматривающий котрансфекцию рекомбинантными плазмидными ДНК pFuse/T11/CH и pFuse/T11/CL клеток линии HEK293F, при этом плазмидная ДНК pFuse/T11/CH содержит нуклеотидную последовательность гена вариабельного домена тяжелой цепи в единой рамке считывания с геном константного домена тяжелой цепи иммуноглобулина человека IgG1, представленную на SEQ ID NO:3, плазмидная ДНК pFuse/T11/CL содержит нуклеотидную последовательность гена вариабельного домена легкой цепи в единой рамке считывания с геном константного домена лямбда легкой цепи иммуноглобулина человека, представленную на SEQ ID NO:4, наработку рекомбинантного антитела Т11 и его хроматографическую очистку из культуральной среды.

Документы, цитированные в отчете о поиске Патент 2023 года RU2810476C1

Иммунобиологическое средство и способ его использования для индукции специфического иммунитета против вируса тяжелого острого респираторного синдрома SARS-CoV-2 (варианты) 2020
  • Зубкова Ольга Вадимовна
  • Ожаровская Татьяна Андреевна
  • Должикова Инна Вадимовна
  • Попова Ольга
  • Щебляков Дмитрий Викторович
  • Гроусова Дарья Михайловна
  • Джаруллаева Алина Шахмировна
  • Тухватулин Амир Ильдарович
  • Тухватулина Наталья Михайловна
  • Щербинин Дмитрий Николаевич
  • Есмагамбетов Ильяс Булатович
  • Токарская Елизавета Александровна
  • Ботиков Андрей Геннадьевич
  • Борисевич Сергей Владимирович
  • Народицкий Борис Савельевич
  • Логунов Денис Юрьевич
  • Гинцбург Александр Леонидович
RU2720614C1
Моноклональное антитело к RBD фрагменту в составе S белка вируса SARS-CoV-2 2020
  • Шахпаронов Михаил Иванович
  • Павлюков Марат Самвелович
  • Антипова Надежда Викторовна
RU2744274C1
СПОСОБ ОПРЕДЕЛЕНИЯ АКТИВНОСТИ НЕЙТРАЛИЗУЮЩИХ АНТИТЕЛ К SARS-CoV-2 В СЫВОРОТКЕ ИЛИ ПЛАЗМЕ КРОВИ ЛЮДЕЙ, ПЕРЕНЕСШИХ COVID-19 ИЛИ ПРИВИТЫХ ВАКЦИНАМИ ДЛЯ ПРОФИЛАКТИКИ НОВОЙ КОРОНАВИРУСНОЙ ИНФЕКЦИИ COVID-19, С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ НАБОРА РЕАГЕНТОВ ДЛЯ ИММУНОФЕРМЕНТНОГО АНАЛИЗА, СОДЕРЖАЩЕГО РЕКОМБИНАНТНЫЙ РЕЦЕПТОР-СВЯЗЫВАЮЩИЙ ДОМЕН (RBD) ПОВЕРХНОСТНОГО ГЛИКОПРОТЕИНА S КОРОНАВИРУСА SARS-COV-2 И РЕКОМБИНАНТНЫЙ ЧЕЛОВЕЧЕСКИЙ РЕЦЕПТОР АСЕ2 2021
  • Костин Никита Николаевич
  • Бобик Татьяна Владимировна
  • Скрябин Георгий Андреевич
  • Симонова Мария Александровна
  • Балмасова Ирина Петровна
  • Абрикосова Виктория Александровна
  • Мокрушина Юлиана Анатольевна
  • Смирнов Иван Витальевич
  • Алешенко Наталья Леонидовна
  • Никитин Алексей Эдуардович
  • Чехонин Владимир Павлович
  • Габибов Александр Габибович
RU2784655C1
US 11312760 B1 26.04.2022
WO 2021222935 A2 04.11.2021.

RU 2 810 476 C1

Авторы

Мокрушина Юлиана Анатольевна

Терехов Станислав Сергеевич

Малабуйок Диана Максиминовна

Овчинникова Лейла Александровна

Абрикосова Виктория Александровна

Ломакин Яков Анатольевич

Баранова Маргарита Николаевна

Костин Никита Николаевич

Калинин Роман Сергеевич

Бобик Татьяна Владимировна

Смирнов Иван Витальевич

Габибов Александр Габибович

Даты

2023-12-27Публикация

2022-12-29Подача