Штамм бактерий BacILLUS SpecIeS 21-продуцент сайт-специфической эндонуклеазы RSe21 1 Советский патент 1989 года по МПК C12N9/14 C12N1/20 

Описание патента на изобретение SU1518372A1

.1

(21)4361460/28-13

(22)11.01.88

(46) 30.10.89 Бюл. № 40

(71)Научно-исследовательский кон- структорско-технологический институт биологически активных веществ и Тихоокеанский институт биоорганической химии Дальневосточного отделения

АН СССР

(72)С.Х. Дегтярев, В.Е, Репин, Н.И. Речкунова, Л.С, Певченко, Е.П. Иванова и В.А. Рассказов

(53)577.15(088.8)

(56) Catalog Biolabs, 1986/1987, Calleja F. de Marsac N.T,, Cowisin T. van Ormondt H. de Waard A. Nucl. Acid, Res, 1985, 13,18,

6745-675 .

Timko I. Horwits A., Zelinka I,

Wilcox G.-I. Bacteriol., 1981, 145,

873-877.

(54)DJTAMM БАКТЕРИЙ Bacillus species 21 - ПРОДУЦЕНТ САЙТ-СПЕЦИФИЧЕСКОЙ ЭН- ДОНУКЛЕАЗЫ Bse 21 I

Изобретение относится к микробиологической промьпиленности и генной инженерии н касается получения нового штамма, продуцирующего сайт- специфическую эндонуклеазу, способную узнавать и расщеплять последовательность нуклеотидов 5 -CCTNGG-3 .

Цель изобретения - выявление штамма-продуцента Bacillus species 21 (ВКПМ В-3672), селективно продуцирующего с высоким выходом сайт-спе(57) Изобретение относитя к микробиологической промьшшенности и генной инженерии. Цель изобретения - выявление штамма-продуцента Bacillus species ВКПМ В-3672, селективно продуцирующего с высоким выходом сайт- специфическую эндонуклеазу рестрикции, способную узнавать и расщеплять последовательность нуклеотидов CCTNAGG-З . Штамм выделен в результате поиска штаммов-продуцентов рест- риктаз из морской воды бухты Золотой Рог Петра Великого Японского моря. Предлагаемьй штамм нетребователен к питательным средам, легко разрушается ультразвуком, обеспечивает повы- выход целевого фермента, составляющий ЗОООр ед/г биомассы. Штамм Bacillus species В-3672 продуцирует сайт-специфическую эндонуклеазу Bse 211, имеет сайт узнавания 5- CCTNAGG-3 , идентичный сайту узнавания рестриктазы Sau Т, и может полностью заменить известный во всех генно-инженерных работах.

цифическую эндонуклеазу рестрикции, способную узнавать и расщеплять по- следовательность нуклеодитов 5 CCTNGG-3 . I

Предлагаемый штамм выделен в результате поиска штаммов-продуцентов рестриктаз из морской воды бухты Золотой Рог залива Петра Великого Японского моря, продуцируемая им рестриктаза названа Bse 21 согласно

ел

00

оо ю

общепринятой номенклатуре Натана и Смита,

111тамм Bacillus species 21 характеризуется следующими признаками о

Морфологические признаки.

Клетки палочковидные, прямые, 0,6 1,0 и 1,5-2,5 мкм (иногда до 5 мкм), подвижные о Образуют эндоспоры овальной формы (не более одной в спорангии Расположение спор преимущественно центральное, без отчетливой раздутости спорангии, Околоспоральных тел не обнаружено. Споры термоустойчивы Отмечается грамвариабельнссть„

Культуральные признаки.

Хорошо растут на обычных питательных средах (СПА, МПБ), нетребовательны к факторам роста,На агаризованных средах образуют круглые, плоские колонии беловатого цвета. Края ровные При росте в ферментерах пО14утнение равномерное. Оптимальная температура роста 30°С.

Культуру поддерживают пересевом на агаризованных чашках Петри. Хорош хранится под вазелиновым маслом, в растворе глицерина - при -70 С и в лиофильно высушенном состоянии.

Физиологические признаки,

Хемоорганотроф, Каталазоположи- телЬный, оксидазоотрицательный. Утилизирует лактозу, сахарозу, мальтозу арабинозу, глюкозу, галактозу, ман- нит. Не утилизирует раннозу, ксилозу дульцит сорбит. Реакция Фогео-Проска уэра отрицательная. Разжижает желатину и крахмал.

Для культивирования Bacillus species 21 В-3672 применяют питательную среду следующего состава, г/л дистиллированной воды:

Гидролизат

кильки40,0

NaCl27,0

Вода дистиллированнаяОстальное

Культивирование проводят при и интенсивной аэрации до достижения стационарной фазы роста.

Выход биомассы: 2,0-3,0 г сырой биомассы с 1 л питательной среды.

Выход целевого фермента: 3000 ед/ биомассы с удельной активностью 20000 ед/нп.

Штамм выращивают в питательной среде следующего состава, г/л: гидро- лизат кильки 40; NaCl 27; остальное вода. Культивирование выполняют при

5

0

0

5

0

5

0

5

интеисииной аэрации (2 об./мин), перемеи ивании (150 об,/мин) при до конца фазы замедления роста (5 ч), Клетки собирают центрифугированием при lOOOg и температуре 4 С, Выход биомассы составляет 2,2 г/л, Биомассу весом 2,2 г суспендируют в 20 мл 0,02 С трис-НС буфера, рН 7,5, содержащего 10 М меркапэтанола и 0,1% тритона Х-100, и разрушают на ультразвуковом диспергаторе. Обломки клеток удаляют центрифугированием (12000g, 30 мин) и надосадочную жидкость наносят на колонну с биогелем А 0,5 М (Bio Rad) объемом 600 мл, уравновешенную 0,02 М г-талийфосфатным буфером, содержащим меркапэтанола, 5 ЭДТА, 0,8 М NaCl и 0,1% тритона Х-100 (буфер А). Фермент злю- ируют и тем же буфером со скоростью 20 мл/ч о Фракции объемом 10 мл собирают и анализируют на присутствие активного фермента. Фракции, содержащие максимальную рестриктазную активность, объединяют и диализуют против 2 л 0,02 М калийфосфатного буфера, рН 7,5, содержащего 10 М меркапзта- нола и 5-КГ м ЭДТА (буфер В), трижды меняя буфер. Диализат наносят на колонку с ДЕАЕ-цаллюлозой объемом 20 мл (ДЕ-52 VThatman), уравновешенную буфером В, Колонку проглшают буфером В до исчезновения УФ-поглощаю- щего материала в элюате. Фгрмент не сорбируется на ДЕАЕ-целлюлоэе.

Раствор фермента наносят на колон-- ку с фосфоцеллюлозой (Р-11, Uliatman) объемом 5 мл, уравновешеннук; буфером В, и промывают колонку тем же 5у- (Ьером, Элюирование фермента проводят (100 мл) градиентом NaCl JOT 0,0 до 1,0 М в буфере Bt Объем каждой фракции 5 мл. Фракции 8-10, содержащие рестриктазу, объединяют и диализуют против буфера В, содержащего 0,1 М NaCl и 50%-ный глицерин.

За единицу активности принимают минимальное количество фермента, необходимое для полного расщепления мкг ДНК фага в течение 1 ч при . Ферментный препарат хранится в глицерине при - , Выход фермента 30000 ед/1 г биомассы бактерий, уд, активность 20000 ед/нл.

Полученный штамм по сравнению с известным обеспечивает повышенньй выход целевого фермента, составляющий 30000 ед/г биомассы (в 30 раз

51518372,6

больше, чем известный штамм); не тре-она может заменить известную во всех

бует длительного культивирования,генно-И1шенерных работах,

легко разрушается ультразвуком Формула изобретения Поскольку рестриктаза Bie 21 имеет , Штамм бактерий Bacillus species 21

сайт узнавания 5 -CCTNAGG-3 , иден-ВКПМ В-3672 - продуцент сайт-специфитичный сайту узнав ания рестриктазы,ческой эндонуклеазы Bse 21 I.

Похожие патенты SU1518372A1

название год авторы номер документа
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS PUMILUS, ПРОДУЦИРУЮЩИЙ ЭНДОНУКЛЕАЗУ РЕСТРИКЦИИ, УЗНАЮЩУЮ И РАСЩЕПЛЯЮЩУЮ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5` = CCTNAGC-3` 1992
  • Дегтярев С.Х.
  • Речкунова Н.И.
  • Репин В.Е.
RU2021373C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS SPECIES - ПРОДУЦЕНТ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ, СПОСОБНОЙ УЗНАВАТЬ И РАСЩЕПЛЯТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5`-(A/G) CCGG (T/C)-3` 1992
  • Репин Владимир Евгеньевич
RU2037522C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS COAGULANS - ПРОДУЦЕНТ САЙТ - СПЕЦИФИЧЕСКОЙ ЭНДОНУКЛАЗЫ, СПОСОБНОЙ УЗНАВАТЬ И РАСЩЕПЛЯТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5′-CTCTTC-3′ 1993
  • Репин В.Е.
  • Терещенко Т.А.
  • Лебедев Л.Р.
RU2054040C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS COAGULANS - ПРОДУЦЕНТ САЙТ - СПЕЦИФИЧЕСКОЙЙ ЭНДОКУКЛАЗЫ, СПОСОБНОЙ УЗНАТЬ И РАСЩЕПЛЯТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5'- CT (A/G) (T/C)AG - 3' 1993
  • Репин В.Е.
RU2040540C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS PUMILUS - ПРОДУЦЕНТ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ ВРИ 19 1 1993
  • Репин В.Е.
  • Дегтярев С.Х.
  • Речкунова Н.И.
RU2046142C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS SCHLEGELII - ПРОДУЦЕНТ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ, УЗНАЮЩЕЙ И РАСЩЕПЛЯЮЩЕЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5' - CCNNNNNNN GG-3' 1994
  • Репин В.Е.
  • Терещенко Т.А.
  • Лебедев Л.Р.
RU2073717C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS COAGULANS - ПРОДУЦЕНТ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ, УЗНАЮЩЕЙ И РАСЩЕПЛЯЮЩЕЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5'-GATNNNNATC-3' 1994
  • Репин В.Е.
  • Терещенко Т.А.
  • Лебедев Л.Р.
RU2057806C1
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS BADIUS - ПРОДУЦЕНТ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ, УЗНАЮЩЕЙ И РАСЩЕПЛЯЮЩЕЙ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5'-(A/T)CCGG(A/T)-3' 1993
  • Дегтярев С.Х.
  • Репин В.Е.
  • Речкунова Н.И.
  • Шевченко А.В.
  • Абдурашитов М.А.
RU2053299C1
СПОСОБ ПОЛУЧЕНИЯ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ BSE 21 I 1999
  • Михайлова В.К.
  • Пучкова Л.И.
  • Кувшинов В.Н.
  • Ушакова Т.А.
  • Репин В.Е.
RU2184777C2
ШТАММ БАКТЕРИЙ BACILLUS STEAROTHERMOPHILUS - ПРОДУЦЕНТ ЭНДОНУКЛЕАЗЫ РЕСТРИКЦИИ, СПОСОБНОЙ УЗНАВАТЬ И РАСЩЕПЛЯТЬ ПОСЛЕДОВАТЕЛЬНОСТЬ НУКЛЕОТИДОВ 5`- CC (A / T) GG - 3` 1992
  • Репин Владимир Евгеньевич
RU2038380C1

Реферат патента 1989 года Штамм бактерий BacILLUS SpecIeS 21-продуцент сайт-специфической эндонуклеазы RSe21 1

Изобретение относится к микробиологической промышленности и генной инженерии. Целью изобретения является выявление штамма-продуцента BACILLUS SPECIES ВКПМ В-3672, селективно продуцирующего с высоким выходом сайт-специфическую эндонуклеазу рестрикции, способную узнавать и расщеплять последовательность нуклеотидов 5Ъ-CCTNAGG-3Ъ. штамм выделен в результате поиска штаммов-продуцентов рестриктаз из морской воды бухты Золотой Рог залива Петра Великого Японского моря. Предлагаемый штамм нетребователен к питательным средам, легко разрушается ультразвуком, обеспечивает повышенный выход целевого фермента, составляющий 30000 ед/г биомассы. Штамм BACILLUS SPECIES В-3672 продуцирует сайт-специфическую эндонуклеазу BSE 21 1, имеет сайт узнавания 5Ъ-CCTNAGG-3Ъ, идентичный сайту узнавания рестриктазы SAU 1, и может полностью заменить известный во всех генно-инженерных работах.

Формула изобретения SU 1 518 372 A1

SU 1 518 372 A1

Авторы

Дегтярев Сергей Харитонович

Репин Владимир Евгеньевич

Речкунова Надежда Ивановна

Шевченко Людмила Сергеевна

Иванова Елена Петровна

Рассказов Валерий Александрович

Даты

1989-10-30Публикация

1988-01-11Подача