Дезинтеграторе с амплитудой 18 мк в тече- ие 30 мин с 30 с паузами, охлаждая льдом, атем гомогенат центрифугируют для осаж- ,ения дебриса при 100000д 1,5 ч. В супер- атанте определяют активность НК-полимеразы, которая составляет 45 д/мг белка.
2.2.Супернатант после центрифугиро- t ания наносят на колонку с ДЭАЭ-целлюло- ой (Ук 50 мл). Элюцию проводят инейным градиентом (400x400 мл) 0,01- ,25 М NaCI в 10 мм трис-HCI, рН 7,8. Соби- ают фракцию, выходящую при 0,15 М NaCI. змеряют активность ДНК-полимеразы. алее белковую фракцию наносят на колон- у с фосфо-целлюлозной (VK 37,5 мл), урав- новешенную КФ буфером (10 мм 2НР04-КН2Р04 рН 7,0, 1 мм ЭДТА). Прово- ят элюцию градиентом (200х200/мл) 0,1- ,6 М NaCI на КФ.
Собирают фракцию, выходящую при 1,33 М NaCI, измеряют активность ДНК-пол- амеразы. Далее фракцию наносят на колон- i у с ГАПом (гидроксилаппатит) (VK 9,6 мл), равновешенную КФ, и проводят элюцию градиентом(50x50 мл)0,02-0,2 М КФ. Соби- ают фракцию, выходящую при 0,33 М NaCI,
(
змеряют активность ДНК-полимеразы. Да- ее фракцию наносят на колонку с ГАПом
идроксилаппатит) (VK 9,6 мл), уравнове- иенную КФ, и проводят элюцию градиен- (50x50 мл) 0,02-0,2 М КФ. Собирают кцию, выходящую при 0,15 М КФ, Измеряют активность ДНК-полимеразы. Далее ракцию диализуют в течение ночи при тем- ературе+4°С против буфера, содержащего О мм КФ рН 7,0, 100 мм NaCI, 0,5 мм ЭДТА, мм ДТТ, 50% глицерол. Измеряют актив- ость фермента, которая практически не из- еняется по сравнению с активностью осле очистки на ГАПе.
Стадии очистки и значения активности НК-полимеразы суммированы в табл.1.
3.Изучение термостабильности ДНК- олимеразы из Thermus thermophilus КТП. Фермент прогревали в течение различного времени при температурах 92 и 95°С и
измеряли его активность. Результаты приведены в табл.2.
Как видно из табл,2, фермент сохраняет свою активность в течение 1,5 ч при 92°С и в течение 1 ч при 95°С, что позволяет более эффективно использовать его в методе ПЦР.
Пример 2. Проверка температурного оптимума функционирования ДНК полиме- разы из Thermus thermophilus КТП. 010 г биомассы Thermus thermophilus КТП суспендируют в буфере, содержащем 25 мМ NaCI, 25 мМ трис-HCI, рН 7; 9,2 мМ 2-меркаптоэтанол, 0,001 М ЭДТА, клетки разрушают ультразвуком при охлаждении 5 льдом, клеточные стенки осаждают центрифугированием при 16000д. Из надосадоч- ной жидкости ДНК-полимеразу очищают хроматографией на ДЕАЕ-сефарозе, фосфо- целлюлозе, оксиапатите. Тестирование фермента во фракциях проводят по включению дезокси ( Н)д ТТФ в ДНК, активированную ультразвуком, в реакционной смеси (20 мкл), содержащей 0,25 о.е. ДНК, 1 мкм дезоксинуклеотидтрифосфатов, 5 пико- моль (3Н)д ТТФ, 25 мМ Трис-HCI рН 8.3, 10 мМ МдСЪ, 5 мМ ДТТ и фермент. После завершения реакции кислотонерастворимый продукт переносят на фильтры, радиоактивность подсчитывают в сцинтилляционном счетчике.
Результаты эксперимента изложены в табл.3.
Данные эксперимента показывают, что оптимум температуры функционирования ДНК-полимеразы лежит выше 70°С.
Таким образом, как показано, предлагаемый штамм Thermus thermophilus КТП не содержит рестриктазы, что облегчает выделение и очистку ДНК-полимеразы. (56) I.Eur.l.Biochem.- 1985, v.149, N; 1, р.41- 46.
2.FEBS Lett. - 1980, v.109, № t, p.156- 563.
5 3.Авторское свидетельство СССР Ms 1830944, кл. С 12 N 9/12. 1989.
5
0
5
0
Таблица 1
название | год | авторы | номер документа |
---|---|---|---|
Способ выделения ДНК-полимеразы TRU из биомассы бактерий микроорганизма JнеRмUS RUвеR ВКМ 1258 | 1988 |
|
SU1701112A3 |
СПОСОБ СИНТЕЗА кДНК С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ТЕРМОСТАБИЛЬНОЙ ДНК-ПОЛИМЕРАЗЫ | 1997 |
|
RU2198222C2 |
Способ получения эндонуклеазы рестрикции @ | 1988 |
|
SU1634713A1 |
Способ выделения эндонуклеазы рестрикции Ара 1 | 1989 |
|
SU1655986A1 |
СПОСОБ АМПЛИФИКАЦИИ ДНК, СПОСОБ КЛОНИРОВАНИЯ ВТОРОЙ кДНК И СПОСОБ ОБРАТНОЙ ТРАНСКРИПЦИИ ДНК | 1997 |
|
RU2297454C2 |
Способ определения генетический вариантов каппа-казеина у сельскохозяйственных животных | 1989 |
|
SU1659488A1 |
Штамм бактерий ТнеRмUS RUвеR-продуцент рестриктазы TRU 9 1 | 1989 |
|
SU1687614A1 |
Способ получения рестриктазы Т @ 201 @ | 1989 |
|
SU1703687A1 |
Способ получения собачьего @ -интерферона | 1987 |
|
SU1669402A3 |
Способ получения рестриктазы, способной узнавать и расщеплять последовательность нуклеотидов GTCGAC | 1989 |
|
SU1752769A1 |
Формула изобретения Штамм бактерий Thermus thermophilus
Таблица 2
Таблица 3
ВКПМ В-4892 - продуцент ДНК-полимера- зы.
Авторы
Даты
1993-12-30—Публикация
1989-08-31—Подача