Способ определения токсичности химических веществ, генерирующих активные формы кислорода Российский патент 2017 года по МПК C12Q1/66 C12N1/21 C12N15/52 

Изобретение относится к определению токсичности химических веществ, способных за счет генерации активных форм кислорода оказывать негативное воздействие на клетки, приводящее к повреждению генетической информации, в результате которого микрофлора в организме человека (например, принимающего содержащие данные вещества лекарства), может в результате действия их подпороговых концентраций приобрести ряд мутаций, повышающих ее патогенность либо увеличивающих резистентность. Изобретение может быть использовано для оценки побочных эффектов лекарственных препаратов и других химических веществ.

Увеличение внутриклеточной концентрации активных форм кислорода (АФК) выше уровня антиоксидантной защиты вызывает «окислительный стресс», который сопровождается негативными для жизнедеятельности клеток процессами, такими как перекисное окисление липидов, окислительная модификация белков и нуклеиновых кислот (Zenkov N.K., Lankin V.Z., Menshchikova E.B. 2001. Oxidativestress: biochemical and pathophysiological aspects. Moscow: Int. Acad. Publ. Comp., Science, Interperiodica. 343 P.).

Окислительные повреждения ДНК связаны с такими процессами, как мутагенез, канцерогенез, старение и ряд связанных с ним болезней пожилого возраста. Значительная часть (60-80%) повреждений ДНК, вызванных радиацией, также формируется за счет АФК, образованных при радиолизе воды. Повреждения молекул ДНК являются одной из основных причин пострадиационной гибели животных (Гудков СВ., Брусков В.И. Гуанозин и инозин (рибоксин). Антиоксидантныеи радиозащитные свойства. Lambert Academic Pulishing. 2011).

Известны способы определения токсичности химических веществ, вызывающих усиление образования АФК, на основе биосенсоров (культур клеток бактерий, в которых присутствуют гены, обеспечивающие свечение бактериальной клетки), свечение которых усиливается или подавляется под действием определенных химических веществ (Development of human cell biosensor system for genotoxicity detection based on DNA damage-induced gene expression. Zager V, Cemazar M, Hreljac I, Lah TT, Sersa G, Filipic M. RadiolOncol. 2010 Mar; 44(1):42-51; патент RU №2179581, МПК C12Q 1/02, C12Q 1/66, 2002 г.; патент RU №2297450, МПК C12N 1/21, 2007 г.; патент RU №2355760, МПК C12N 1/21, 2009 г.; патент RU №2179581, МПК C12Q 1/02, 2002 г.).

Наиболее близким по выполнению является способ определения генотоксичности химических веществ, включающий инкубацию тестируемого химического вещества с рекомбинантным штаммом Е. coli, несущим плазмиду, в котором lux оперон находится под контролем SOS-lux-промотора, измерение интенсивности биолюминесценции контрольных культур и содержащих тестируемое химическое вещество и определение генотоксичности по фактору индукции I=Lc/Lk, где I - фактор индукции; Lc - интенсивность свечения суспензии SOS-lux штамма, содержащего тестируемое химическое вещество; Lк - интенсивность свечения контрольной суспензии SOS-lux штамма (Анализ SOS-ответа клеток E. coli с помощью бактериальной люминесценции. Всесоюз. конф. "Генетические исследования действия биологических, химических и физических факторов окружающей среды", по проблеме "Человек и Биосфера ", Киев, 1988, с. 95).

Недостатком данного способа является недостаточно высокий фактор индукции, (усиление биолюминесценции тестируемой токсичной пробы по сравнению с биолюминесценцией контрольной пробы), а также неспецифичность в отношении генотоксического действия активных форм кислорода, которое является наиболее опасным проявлением токсичности.

Техническим результатом изобретения является увеличение фактора индукции.

Технический результат достигается тем, что в культуру Escherichia coli К12 MG1655, содержащую плазмиду PkatG-lux, в которой lux оперон биолюминесценции морских фотобактерий Photobacterium leiognathi, Vibrio fischeri или Photorabdus luminescens поставлен под контроль промотора PkatG (выделенного из регулона, отвечающего за реакцию клетки на активные формы кислорода), добавляют рибофлавин до конечной концентрации 1⋅10^-5 мг/мл - 1⋅10^-3 мг/мл, добавляют анализируемое вещество в концентрации, не подавляющей жизнедеятельность Escherichia coli, определяют интенсивность люминесценции полученной суспензии и контроля, а о повреждающем действии исследуемого вещества судят по отклонению интенсивности люминесценции суспензии от контроля (повреждающее действие отсутствует, если нет отклонения от контроля).

Культуру предварительно выращивают предпочтительно на жидкой питательной полноценной среде Луриа-Бертани.

После выращивания плотность культуры доводят предпочтительно до 0,01-0,1 единицы Мак-Фарланда и концентрации 3⋅10⁷-3⋅10⁶ клеток/мл.

Контроль содержит в качестве вещества сравнения (контрольного вещества) предпочтительно деионизированную воду в эквивалентном объеме.

Отличием предлагаемого способа является добавление в культуру клеток Е. coli, несущей плазмиду PkatG-lux, в которой lux оперон поставлен под контроль промотора PkatG, рибофлавина в концентрации 1⋅10^-5 мг/мл - 1⋅10^-3 мг/мл.

Рибофлавин известен в качестве кофактора фермента люциферазы, монооксигеназы КФ 144413 (J.W. Hastings. 1983 "Biological diversity, chemical mechanisms, and the evolutionary origins of bioluminescent systems." Journal of Molecular Evolution, v. 19: p. 309-321). Однако неизвестен характер влияния рибофлавина (усиление или ослабление люминесценции) и неизвестны пределы концентраций, способствующие увеличению фактора индукции в отношении бактерий Escherichia coli 12К MG1655, содержащей плазмиду PkatG-lux, с опероном Photobacterium leiognathi, Vibriofischeri или Photorabdusluminescens.

Ниже приведены примеры осуществления способа.

Пример 1

Определение токсичности перекиси водорода по способу прототипа

В качестве тестируемого вещества взята перекись водорода концентрацией 10^-3 М. Культуру Е. coli выращивают на среде LBP (пептон - 10 г, дрожжевой экстракт - 5 г, хлористый натрий - 10 г на 1 л раствора; pH 7.0) в присутствии 50 мкг/мл ампициллина. В 50 мл среды вносят 0,1 мл ночной культуры Е. coli С 600 и инкубируют в термостате в течение одного часа при t=37°C. Затем добавляют среду LBP до достижения оптической плотности культуры 0,1 (550 нм). Аликвоты этой культуры по 1 мл переносят в стерильные пробирки и добавляют в них по 10 мкл тестируемого химического вещества. Содержимое пробирок тщательно перемешивают. Пробирки помещают на 1 час в термостат при t=37°C. В процессе инкубации пробирки несколько раз встряхивают.

По окончании инкубации культуры охлаждают до комнатной температуры. На люминометре LM-01T (Immunotech, Чехия), измеряют интенсивности биолюминесценции контрольных культур и содержащих анализируемое химическое вещество. Получают следующие данные. Интенсивность люминесценции для перекиси водорода составляет 14680,3 у.е., для контроля 1366,7 у.е. То есть фактор индукции равен 10,7.

Пример 2

В качестве тестируемого вещества взята перекись водорода.

Культуру клеток Е. coli К12 MG1655 с плазмидой PkatG-lux, в которой оперон биолюминесценции морских фотобактерий Photobacterium leiognathi поставлен под контроль промотора PkatG, растят на жидкой питательной полноценной среде Луриа-Бертани (Маниатис Т., Фрич Э., Сэмбрук Дж. Методы генетической инженерии. Молекулярное клонирование. // -М.: Мир, 1984, 480 стр.) при постоянной аэрации на круговой качалке при 37°C. В среду добавляют антибиотик ампициллин (100 мкг/мл).

Ночную культуру разбавляют свежей средой до плотности 0,01 единица Мак-Фарланда (концентрация 3⋅10⁷ клеток/мл), и добавляют рибофлавин до конечной концентрации 1⋅10^-4 мг/мл. Аликвоты этой культуры (по 90 мкл) переносят в ячейки (стрипы) планшета и добавляют в них по 10 мкл перекиси водорода концентрацией 10^-3 М. Указанная концентрация подобрана в соответствии с предварительно исследованной зависимостью доза-эффект, согласно которой данная концентрация является максимально эффективной. В контрольные ячейки добавляют 10 мкл деионизированной воды.

После обработки планшет с пробами помещают в люминометр, инкубируют при 30°C и измеряют интенсивность биолюминесценции (Люминесценцию измеряют на люминометре LM-01T (Immunotech, Чехия). Интенсивность люминесценции для пробы с перекисью водорода составляет 27296.3 у.е., а для контроля 1822,7 у.е. То есть фактор индукции как их соотношение равен 14,98. Интенсивность люминесценции пробы с перекисью водорода без добавления рибофлавина (положительный контроль) составляет 18114,1 у.е. То есть фактор индукции равен 9,94.

Аналогично ночную культуру разбавляют свежей средой до плотности 0,1 единица Мак-Фарланда (концентрация 3⋅10⁶ клеток/мл).

Аналогично в качестве lux оперона используют оперон биолюминесценции морских фотобактерий Vibriofischeri и Photorabdusluminescens.

Результаты по показателям интенсивности свечения аналогичны.

На рис. 1 приведены значения фактора индукции анализируемого вещества - перекиси водорода концентрацией 10^-3 М при различных концентрациях рибофлавина и без добавления рибофлавина к культуре. Как видно из рис. 1, при заявляемых концентрациях (1⋅10^-5-1⋅10^-3 мг/мл) фактор индукции превышает таковой без добавления рибофлавина. То есть добавление рибофлавина в концентрациях 1⋅10^-5-1⋅10^-3 мг/мл позволяет увеличить интенсивность свечения анализируемой пробы.

Таким образом, способ позволяет увеличить фактор индукции по сравнению со способом прототипа (для которого фактор индукции в соответствии с примером 1 составляет 10,7) и может быть использован для определения токсичности химических веществ, генерирующих активные формы кислорода (в частности, перекиси водорода).

Изобретение относится к способу определения токсичности химических веществ, генерирующих активные формы кислорода. Способ предусматривает добавление рибофлавина до конечной концентрации 1⋅10^-5 мг/мл - 1⋅10^-3 мг/мл в культуру Escherichia coli К12 MG1655 с плазмидой PkatG-lux, в которой lux оперон биолюминесценции морских фотобактерий Photobacterium leiognathi, Vibrio fischeri или Photorabdus luminescens поставлен под контроль промотора PkatG. Осуществляют добавление тестируемого вещества и определение интенсивности люминесценции полученной суспензии и контроля. О повреждающем действии тестируемого вещества судят по отклонению интенсивности люминесценции суспензии от контроля. Изобретение обеспечивает увеличение фактора индукции. 3 з.п. ф-лы, 1 ил., 2 пр.

1. Способ определения токсичности химических веществ, генерирующих активные формы кислорода, характеризующийся тем, что в культуру Escherichia col К12 MG1655, содержащую плазмиду PkatG-lux, в которой lux оперон биолюминесценции морских фотобактерий Photobacterium leiognathi, Vibrio fischeri или Photorabdus luminescens поставлен под контроль промотора PkatG, добавляют рибофлавин до конечной концентрации 1⋅10^-3 мг/мл - 1⋅10^-5 мг/мл, добавляют тестируемое вещество и определяют интенсивность люминесценции полученной суспензии и контроля, а о повреждающем действии тестируемого вещества судят по отклонению интенсивности люминесценции суспензии от контроля.

2. Способ по п.1, характеризующийся тем, что культуру Escherichia coli предварительно выращивают на жидкой питательной полноценной среде Луриа-Бертани.

3. Способ по п.1, характеризующийся тем, что культуру Escherichia coli после предварительного выращивания доводят до плотности 0,01-0,1 единица Мак-Фарланда и концентрация 3⋅10⁷-3⋅10⁶ клеток/мл.

4. Способ по п.1, характеризующийся тем, что контроль в качестве вещества сравнения содержит деионизированную воду в эквивалентном объеме.